View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7428_low_34 (Length: 229)

Name: NF7428_low_34
Description: NF7428
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7428_low_34
NF7428_low_34
[»] chr5 (80 HSPs)
chr5 (18-213)||(6500441-6500635)
chr5 (28-210)||(40296292-40296473)
chr5 (20-213)||(6500815-6501007)
chr5 (20-210)||(27502013-27502202)
chr5 (20-182)||(18603124-18603286)
chr5 (20-186)||(32487386-32487551)
chr5 (21-186)||(41170627-41170792)
chr5 (25-185)||(36492218-36492378)
chr5 (31-213)||(25327938-25328120)
chr5 (28-186)||(15370099-15370257)
chr5 (20-211)||(624188-624379)
chr5 (28-199)||(3295002-3295172)
chr5 (31-186)||(3295345-3295498)
chr5 (28-197)||(13415750-13415918)
chr5 (30-210)||(42405574-42405752)
chr5 (28-208)||(41632782-41632961)
chr5 (20-186)||(9498655-9498820)
chr5 (28-210)||(26074122-26074304)
chr5 (30-208)||(26074614-26074792)
chr5 (30-211)||(1028492-1028673)
chr5 (30-198)||(6224198-6224366)
chr5 (35-186)||(11416977-11417128)
chr5 (28-210)||(36568545-36568725)
chr5 (29-186)||(299490-299647)
chr5 (38-182)||(34753029-34753173)
chr5 (28-186)||(12662652-12662810)
chr5 (30-179)||(26075168-26075318)
chr5 (28-187)||(35150007-35150165)
chr5 (20-186)||(623810-623976)
chr5 (54-199)||(15370428-15370573)
chr5 (40-182)||(33747783-33747925)
chr5 (25-163)||(29549278-29549416)
chr5 (20-166)||(5723811-5723957)
chr5 (30-198)||(24489194-24489360)
chr5 (30-160)||(26074807-26074938)
chr5 (33-178)||(38427553-38427697)
chr5 (28-178)||(26590918-26591068)
chr5 (30-184)||(300961-301107)
chr5 (30-186)||(35167838-35167994)
chr5 (31-197)||(2411010-2411176)
chr5 (31-186)||(35914852-35915007)
chr5 (20-103)||(7768842-7768925)
chr5 (29-160)||(36521922-36522053)
chr5 (114-196)||(26900007-26900089)
chr5 (30-123)||(42508614-42508707)
chr5 (31-146)||(36522277-36522392)
chr5 (30-108)||(26074320-26074398)
chr5 (28-146)||(31509623-31509742)
chr5 (31-165)||(41635212-41635346)
chr5 (30-185)||(13786002-13786157)
chr5 (42-153)||(31509745-31509857)
chr5 (95-146)||(13042606-13042657)
chr5 (115-186)||(38427306-38427377)
chr5 (30-109)||(39309686-39309764)
chr5 (86-187)||(13785631-13785732)
chr5 (112-164)||(795254-795306)
chr5 (99-166)||(9498343-9498410)
chr5 (85-164)||(36527117-36527196)
chr5 (30-123)||(42524719-42524811)
chr5 (86-146)||(32445943-32446003)
chr5 (95-142)||(13112604-13112651)
chr5 (19-68)||(5660289-5660338)
chr5 (31-88)||(6225047-6225104)
chr5 (65-153)||(19275566-19275653)
chr5 (108-146)||(13042784-13042822)
chr5 (108-146)||(13112782-13112820)
chr5 (28-70)||(35150747-35150789)
chr5 (28-70)||(35151038-35151080)
chr5 (86-184)||(42435486-42435583)
chr5 (130-182)||(24489583-24489635)
chr5 (95-146)||(36389016-36389067)
chr5 (110-140)||(5963765-5963795)
chr5 (82-160)||(9510546-9510624)
chr5 (20-77)||(22298956-22299014)
chr5 (126-162)||(795152-795189)
chr5 (118-182)||(5660340-5660405)
chr5 (99-140)||(34103625-34103666)
chr5 (133-186)||(35150810-35150863)
chr5 (31-63)||(13785732-13785764)
chr5 (96-140)||(41341523-41341567)
[»] chr1 (78 HSPs)
chr1 (20-213)||(44290797-44290991)
chr1 (20-186)||(44290458-44290624)
chr1 (20-186)||(41759475-41759641)
chr1 (20-197)||(3537589-3537765)
chr1 (28-186)||(41142372-41142531)
chr1 (28-197)||(41157375-41157545)
chr1 (20-213)||(48588460-48588654)
chr1 (30-186)||(26661522-26661678)
chr1 (28-210)||(41156991-41157175)
chr1 (28-213)||(31767135-31767319)
chr1 (20-182)||(3550712-3550871)
chr1 (30-183)||(17294579-17294733)
chr1 (28-213)||(34364507-34364691)
chr1 (30-177)||(37556113-37556260)
chr1 (20-212)||(45493949-45494145)
chr1 (28-186)||(29798199-29798357)
chr1 (20-213)||(50051998-50052189)
chr1 (30-186)||(34649440-34649596)
chr1 (32-213)||(9955911-9956093)
chr1 (28-187)||(34364925-34365084)
chr1 (28-186)||(5319965-5320123)
chr1 (36-186)||(14318875-14319025)
chr1 (18-210)||(32168674-32168855)
chr1 (29-178)||(40082408-40082556)
chr1 (30-186)||(11977282-11977438)
chr1 (22-154)||(32594748-32594880)
chr1 (28-210)||(45084382-45084557)
chr1 (28-197)||(22077484-22077653)
chr1 (28-184)||(3875333-3875489)
chr1 (28-199)||(37850588-37850758)
chr1 (25-171)||(38804370-38804516)
chr1 (30-163)||(26661921-26662054)
chr1 (28-214)||(66445-66630)
chr1 (31-177)||(37555733-37555878)
chr1 (28-179)||(24600321-24600472)
chr1 (28-186)||(39066201-39066358)
chr1 (28-213)||(41184380-41184583)
chr1 (34-210)||(5575110-5575284)
chr1 (20-107)||(3537226-3537313)
chr1 (28-210)||(24131965-24132143)
chr1 (20-148)||(44043810-44043943)
chr1 (53-195)||(22077101-22077243)
chr1 (29-180)||(22793279-22793431)
chr1 (28-175)||(66100-66247)
chr1 (38-212)||(5528728-5528902)
chr1 (28-197)||(22077818-22077986)
chr1 (28-213)||(30630611-30630796)
chr1 (28-208)||(19283434-19283613)
chr1 (30-176)||(45839629-45839779)
chr1 (28-211)||(21378035-21378199)
chr1 (99-186)||(11977015-11977102)
chr1 (28-176)||(44685456-44685605)
chr1 (28-199)||(1188574-1188746)
chr1 (98-186)||(50051689-50051776)
chr1 (28-199)||(1187349-1187522)
chr1 (99-210)||(47380143-47380254)
chr1 (43-185)||(44091909-44092051)
chr1 (70-146)||(10351202-10351278)
chr1 (55-175)||(4956218-4956340)
chr1 (18-60)||(50051777-50051819)
chr1 (28-75)||(35154150-35154197)
chr1 (28-87)||(50469180-50469239)
chr1 (28-94)||(4878803-4878869)
chr1 (77-122)||(41184152-41184197)
chr1 (127-186)||(4266798-4266855)
chr1 (28-188)||(5996870-5997029)
chr1 (83-143)||(35154046-35154106)
chr1 (19-93)||(4266875-4266949)
chr1 (69-185)||(9499020-9499136)
chr1 (110-146)||(12466365-12466401)
chr1 (28-60)||(22077248-22077280)
chr1 (37-96)||(30630912-30630972)
chr1 (28-80)||(47379891-47379943)
chr1 (101-147)||(9956212-9956258)
chr1 (121-198)||(30697310-30697387)
chr1 (168-210)||(45084576-45084617)
chr1 (110-146)||(31973375-31973411)
chr1 (28-164)||(50556451-50556587)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (20-186)||(29518495-29518661)
chr6 (20-186)||(29518912-29519078)
chr6 (20-186)||(32741171-32741337)
chr6 (20-186)||(2378118-2378284)
chr6 (20-213)||(35210196-35210387)
chr6 (20-176)||(3409251-3409407)
chr6 (20-210)||(3058218-3058409)
chr6 (20-186)||(3409652-3409818)
chr6 (28-213)||(2579847-2580030)
chr6 (20-186)||(14748342-14748504)
chr6 (30-186)||(2377756-2377912)
chr6 (20-197)||(3415450-3415629)
chr6 (21-186)||(1846741-1846906)
chr6 (30-186)||(2578443-2578598)
chr6 (28-197)||(10074352-10074521)
chr6 (34-199)||(16454913-16455078)
chr6 (20-176)||(26544041-26544197)
chr6 (30-213)||(16454577-16454759)
chr6 (20-198)||(1127352-1127530)
chr6 (28-188)||(10073989-10074149)
chr6 (30-177)||(16107680-16107827)
chr6 (34-186)||(2843560-2843713)
chr6 (29-199)||(2578822-2578991)
chr6 (30-208)||(5832007-5832182)
chr6 (33-200)||(2579478-2579645)
chr6 (28-198)||(10073604-10073772)
chr6 (31-183)||(6999799-6999951)
chr6 (30-214)||(2579083-2579261)
chr6 (28-199)||(593694-593867)
chr6 (31-171)||(1950200-1950340)
chr6 (33-136)||(32460630-32460733)
chr6 (28-182)||(10911565-10911720)
chr6 (30-185)||(16108065-16108208)
chr6 (34-153)||(9062383-9062501)
chr6 (28-213)||(12071665-12071849)
chr6 (28-199)||(12085021-12085191)
chr6 (28-198)||(12092470-12092640)
chr6 (23-180)||(5958613-5958766)
chr6 (28-160)||(6071132-6071264)
chr6 (28-209)||(31714671-31714849)
chr6 (28-147)||(8481927-8482045)
chr6 (32-197)||(17135058-17135223)
chr6 (35-213)||(30618592-30618766)
chr6 (43-144)||(2975567-2975668)
chr6 (48-101)||(35210498-35210551)
chr6 (96-140)||(22605301-22605345)
chr6 (132-179)||(3409405-3409452)
chr6 (96-147)||(11637760-11637811)
chr6 (65-111)||(14789279-14789325)
chr6 (96-140)||(21130103-21130147)
chr6 (120-178)||(10902438-10902496)
chr6 (153-213)||(2975296-2975355)
chr6 (104-146)||(11638053-11638095)
chr6 (162-211)||(35210554-35210602)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (28-213)||(1085590-1085774)
chr7 (28-210)||(7517580-7517762)
chr7 (22-212)||(29157559-29157749)
chr7 (20-186)||(37533011-37533176)
chr7 (19-213)||(37533338-37533531)
chr7 (28-186)||(23377-23535)
chr7 (35-211)||(11845198-11845373)
chr7 (30-186)||(30244272-30244428)
chr7 (30-186)||(6054562-6054718)
chr7 (30-198)||(45433243-45433411)
chr7 (28-186)||(40094774-40094932)
chr7 (28-213)||(22567012-22567196)
chr7 (28-178)||(36939741-36939891)
chr7 (28-157)||(7554025-7554154)
chr7 (30-175)||(45754718-45754862)
chr7 (20-183)||(14681502-14681663)
chr7 (36-176)||(19122740-19122879)
chr7 (30-211)||(30245079-30245255)
chr7 (28-186)||(24177435-24177593)
chr7 (34-184)||(34218036-34218186)
chr7 (30-186)||(45434638-45434794)
chr7 (30-213)||(47129097-47129278)
chr7 (28-210)||(118277-118459)
chr7 (28-213)||(8128414-8128599)
chr7 (28-209)||(36622960-36623140)
chr7 (28-147)||(22566702-22566820)
chr7 (33-186)||(30032572-30032725)
chr7 (31-184)||(9901648-9901799)
chr7 (28-148)||(16569196-16569316)
chr7 (28-148)||(16596346-16596466)
chr7 (28-182)||(40230295-40230449)
chr7 (31-163)||(24838724-24838857)
chr7 (28-154)||(1085280-1085407)
chr7 (31-183)||(20599317-20599471)
chr7 (28-177)||(36534795-36534942)
chr7 (28-186)||(41854635-41854792)
chr7 (49-184)||(37167808-37167937)
chr7 (70-186)||(30253534-30253646)
chr7 (74-210)||(28300229-28300366)
chr7 (31-180)||(41910592-41910749)
chr7 (109-211)||(47129450-47129550)
chr7 (28-149)||(43241495-43241616)
chr7 (28-116)||(28301613-28301701)
chr7 (28-101)||(30245494-30245567)
chr7 (28-101)||(30255339-30255412)
chr7 (111-185)||(28300569-28300644)
chr7 (28-98)||(30244701-30244771)
chr7 (28-96)||(36109007-36109075)
chr7 (116-184)||(37532753-37532821)
chr7 (129-210)||(30244453-30244533)
chr7 (129-210)||(30253671-30253751)
chr7 (33-133)||(44361517-44361616)
chr7 (129-213)||(30245256-30245339)
chr7 (95-146)||(21416181-21416232)
chr7 (138-210)||(7517767-7517839)
chr7 (138-210)||(7518033-7518105)
chr7 (97-145)||(23569043-23569091)
chr7 (28-146)||(4124128-4124246)
chr7 (22-65)||(14681281-14681324)
chr7 (96-175)||(40094424-40094503)
chr7 (28-78)||(40094502-40094552)
chr7 (111-173)||(45755010-45755072)
chr7 (95-140)||(21619091-21619136)
chr7 (83-186)||(37393114-37393216)
chr7 (30-80)||(36967335-36967385)
chr7 (28-146)||(37345916-37346036)
chr7 (70-186)||(15902342-15902457)
chr7 (96-140)||(27391815-27391859)
chr7 (123-177)||(4719305-4719359)
chr7 (164-210)||(7517982-7518028)
chr7 (95-135)||(27598052-27598092)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (19-212)||(41283449-41283642)
chr2 (20-186)||(36178605-36178771)
chr2 (20-184)||(37106180-37106344)
chr2 (20-186)||(14745667-14745833)
chr2 (20-186)||(5542625-5542791)
chr2 (24-186)||(37105920-37106082)
chr2 (30-213)||(6421387-6421569)
chr2 (20-182)||(5543002-5543164)
chr2 (28-183)||(962598-962753)
chr2 (30-180)||(15880265-15880415)
chr2 (28-213)||(42514649-42514833)
chr2 (35-186)||(15511495-15511646)
chr2 (28-186)||(35580724-35580881)
chr2 (46-186)||(36178171-36178311)
chr2 (28-213)||(38796590-38796778)
chr2 (44-186)||(6422126-6422268)
chr2 (30-211)||(6712978-6713160)
chr2 (30-179)||(36005887-36006035)
chr2 (20-179)||(14745300-14745460)
chr2 (33-210)||(33731653-33731831)
chr2 (28-183)||(40679632-40679787)
chr2 (28-210)||(37632575-37632755)
chr2 (30-186)||(40733519-40733675)
chr2 (20-212)||(1769884-1770075)
chr2 (32-167)||(28254258-28254391)
chr2 (20-196)||(7598601-7598769)
chr2 (28-184)||(28531316-28531472)
chr2 (20-135)||(36178320-36178435)
chr2 (39-196)||(40163362-40163520)
chr2 (41-210)||(23346250-23346417)
chr2 (30-186)||(40733885-40734040)
chr2 (28-187)||(7598228-7598387)
chr2 (30-172)||(5367457-5367599)
chr2 (28-185)||(29676903-29677065)
chr2 (90-209)||(6421793-6421911)
chr2 (28-135)||(16542449-16542556)
chr2 (36-186)||(29676543-29676687)
chr2 (28-136)||(31468800-31468904)
chr2 (82-210)||(3673122-3673249)
chr2 (28-176)||(12529038-12529186)
chr2 (28-210)||(16590888-16591065)
chr2 (28-213)||(30313178-30313361)
chr2 (31-116)||(31899496-31899581)
chr2 (100-209)||(3672773-3672882)
chr2 (30-186)||(29874023-29874179)
chr2 (36-140)||(37895107-37895211)
chr2 (31-144)||(31259658-31259774)
chr2 (28-146)||(33561491-33561609)
chr2 (28-106)||(38796298-38796376)
chr2 (90-182)||(6421688-6421780)
chr2 (28-145)||(30323464-30323581)
chr2 (81-173)||(36784273-36784365)
chr2 (28-198)||(29873525-29873695)
chr2 (28-146)||(37894732-37894850)
chr2 (28-85)||(36785664-36785721)
chr2 (31-186)||(9231252-9231407)
chr2 (29-159)||(31385738-31385868)
chr2 (44-133)||(28254165-28254254)
chr2 (28-136)||(33953821-33953929)
chr2 (31-184)||(3594180-3594333)
chr2 (118-199)||(31899090-31899170)
chr2 (92-182)||(35580443-35580534)
chr2 (31-135)||(12910231-12910335)
chr2 (28-135)||(41678419-41678527)
chr2 (30-76)||(6421306-6421352)
chr2 (28-169)||(33954279-33954419)
chr2 (70-146)||(30312831-30312907)
chr2 (82-141)||(25390313-25390372)
chr2 (95-146)||(28226404-28226455)
chr2 (43-90)||(42515031-42515078)
chr2 (70-127)||(2336666-2336723)
chr2 (28-64)||(3673085-3673121)
chr2 (98-146)||(8904498-8904546)
chr2 (99-146)||(28226726-28226772)
chr2 (132-210)||(2109988-2110066)
chr2 (95-144)||(13792536-13792585)
chr2 (28-64)||(3672719-3672755)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (28-213)||(25483336-25483520)
chr4 (20-208)||(50630731-50630919)
chr4 (30-209)||(36629239-36629418)
chr4 (20-186)||(41370349-41370515)
chr4 (20-195)||(55933113-55933288)
chr4 (28-213)||(10245920-10246104)
chr4 (28-183)||(54017596-54017751)
chr4 (28-213)||(3340807-3340991)
chr4 (28-185)||(1731646-1731803)
chr4 (30-199)||(39792845-39793014)
chr4 (25-186)||(50002423-50002584)
chr4 (28-211)||(22027935-22028117)
chr4 (30-213)||(39404020-39404203)
chr4 (30-185)||(39404400-39404555)
chr4 (28-198)||(36608647-36608817)
chr4 (28-176)||(52884695-52884844)
chr4 (28-199)||(44620660-44620830)
chr4 (28-213)||(22028339-22028527)
chr4 (43-176)||(54108928-54109060)
chr4 (30-185)||(34646648-34646803)
chr4 (20-166)||(49880152-49880297)
chr4 (31-185)||(50459724-50459878)
chr4 (38-186)||(54343006-54343147)
chr4 (37-186)||(44620362-44620511)
chr4 (30-186)||(36572021-36572177)
chr4 (28-176)||(52884887-52885038)
chr4 (28-195)||(22183253-22183420)
chr4 (28-169)||(4955332-4955473)
chr4 (37-186)||(44621011-44621160)
chr4 (28-213)||(49076804-49076986)
chr4 (47-212)||(54936215-54936378)
chr4 (46-186)||(18932747-18932887)
chr4 (34-213)||(20825842-20826021)
chr4 (29-196)||(16888804-16888971)
chr4 (28-179)||(32941128-32941279)
chr4 (31-187)||(49302907-49303065)
chr4 (27-186)||(54108537-54108694)
chr4 (28-199)||(2740700-2740869)
chr4 (29-185)||(16889535-16889691)
chr4 (34-181)||(20826223-20826370)
chr4 (43-157)||(45496820-45496934)
chr4 (28-187)||(3244448-3244607)
chr4 (28-183)||(4390102-4390257)
chr4 (28-137)||(2741071-2741180)
chr4 (82-186)||(23817679-23817783)
chr4 (30-199)||(43174508-43174677)
chr4 (28-213)||(54741151-54741334)
chr4 (18-151)||(6975489-6975622)
chr4 (30-146)||(41707503-41707618)
chr4 (28-183)||(34004586-34004739)
chr4 (28-186)||(49076449-49076604)
chr4 (28-186)||(3341128-3341286)
chr4 (30-174)||(19504707-19504842)
chr4 (30-185)||(45489331-45489485)
chr4 (28-183)||(51768061-51768216)
chr4 (28-183)||(3700365-3700512)
chr4 (74-184)||(18879852-18879962)
chr4 (68-186)||(43827480-43827597)
chr4 (79-180)||(31691203-31691306)
chr4 (41-136)||(54017750-54017845)
chr4 (30-165)||(40067045-40067181)
chr4 (28-186)||(28034229-28034387)
chr4 (49-186)||(48111696-48111833)
chr4 (50-186)||(3271806-3271947)
chr4 (33-197)||(760194-760356)
chr4 (70-169)||(15841383-15841482)
chr4 (28-117)||(10246347-10246436)
chr4 (20-80)||(50788087-50788147)
chr4 (36-94)||(44620304-44620362)
chr4 (28-160)||(23556890-23557022)
chr4 (34-186)||(45489712-45489864)
chr4 (120-186)||(43174233-43174299)
chr4 (28-94)||(44621426-44621492)
chr4 (95-146)||(11197293-11197344)
chr4 (31-146)||(34544107-34544225)
chr4 (91-213)||(11783525-11783646)
chr4 (53-184)||(39698944-39699077)
chr4 (30-94)||(44620946-44621011)
chr4 (141-212)||(23817429-23817498)
chr4 (108-182)||(41370738-41370812)
chr4 (28-116)||(11348396-11348484)
chr4 (34-146)||(15841023-15841134)
chr4 (95-146)||(10396198-10396249)
chr4 (95-146)||(10396483-10396534)
chr4 (95-147)||(922485-922537)
chr4 (96-135)||(1868119-1868158)
chr4 (138-177)||(19895406-19895445)
chr4 (86-144)||(11706584-11706641)
chr4 (94-140)||(51681604-51681650)
chr4 (142-199)||(11702284-11702341)
chr4 (20-57)||(18932887-18932924)
chr4 (18-51)||(18933103-18933136)
chr4 (156-213)||(45496678-45496735)
chr4 (82-142)||(2891864-2891924)
chr4 (28-76)||(45050601-45050649)
chr4 (106-182)||(50787996-50788072)
chr4 (95-146)||(11197003-11197054)
chr4 (83-126)||(45484774-45484817)
chr4 (72-146)||(31249896-31249970)
chr4 (104-146)||(41707279-41707321)
chr4 (28-69)||(11706636-11706677)
chr4 (139-176)||(19895533-19895570)
chr4 (91-124)||(29802604-29802637)
chr4 (20-65)||(41370693-41370738)
chr4 (156-196)||(1731581-1731621)
chr4 (110-146)||(34946151-34946187)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (20-186)||(3669679-3669845)
chr8 (20-198)||(3670052-3670229)
chr8 (20-223)||(30441073-30441278)
chr8 (30-213)||(3038262-3038446)
chr8 (30-196)||(34835211-34835377)
chr8 (30-178)||(34834878-34835026)
chr8 (20-210)||(20870550-20870741)
chr8 (30-213)||(30359273-30359457)
chr8 (28-176)||(45122067-45122215)
chr8 (20-178)||(1014253-1014411)
chr8 (28-198)||(45121898-45122068)
chr8 (30-189)||(25561812-25561972)
chr8 (28-186)||(6876862-6877021)
chr8 (28-187)||(9608745-9608904)
chr8 (30-185)||(33113368-33113523)
chr8 (30-196)||(34835476-34835643)
chr8 (30-196)||(34835742-34835909)
chr8 (30-186)||(40518071-40518229)
chr8 (20-178)||(1013879-1014037)
chr8 (30-184)||(40518584-40518738)
chr8 (28-212)||(9309355-9309537)
chr8 (30-186)||(37544490-37544646)
chr8 (42-186)||(45122638-45122782)
chr8 (31-186)||(147454-147609)
chr8 (35-182)||(9482608-9482755)
chr8 (53-199)||(9483174-9483320)
chr8 (30-186)||(1513915-1514071)
chr8 (35-183)||(70277-70425)
chr8 (28-186)||(8918764-8918922)
chr8 (22-180)||(40579512-40579670)
chr8 (28-186)||(5915872-5916025)
chr8 (28-184)||(5420651-5420807)
chr8 (38-213)||(18371967-18372142)
chr8 (30-182)||(30359611-30359763)
chr8 (28-183)||(41972158-41972316)
chr8 (28-186)||(45123006-45123164)
chr8 (20-188)||(6731896-6732055)
chr8 (28-186)||(9308977-9309139)
chr8 (31-176)||(32640542-32640682)
chr8 (30-179)||(45121663-45121811)
chr8 (32-185)||(18380020-18380171)
chr8 (35-186)||(6651510-6651652)
chr8 (35-182)||(18371665-18371807)
chr8 (22-186)||(32305478-32305635)
chr8 (28-176)||(4154678-4154824)
chr8 (28-176)||(147829-147968)
chr8 (28-179)||(9507777-9507933)
chr8 (51-165)||(9609108-9609222)
chr8 (20-106)||(41416251-41416335)
chr8 (31-141)||(43274824-43274934)
chr8 (106-199)||(41129066-41129159)
chr8 (30-146)||(8794113-8794229)
chr8 (28-198)||(9620666-9620834)
chr8 (103-186)||(40579269-40579352)
chr8 (32-132)||(18372988-18373085)
chr8 (28-177)||(12283873-12284021)
chr8 (31-100)||(18372785-18372854)
chr8 (110-186)||(8919144-8919220)
chr8 (30-136)||(18372656-18372758)
chr8 (28-197)||(4154270-4154438)
chr8 (31-100)||(18372342-18372411)
chr8 (31-118)||(3037776-3037865)
chr8 (32-177)||(43398077-43398225)
chr8 (38-101)||(25561729-25561792)
chr8 (33-133)||(20130454-20130553)
chr8 (28-160)||(5274775-5274907)
chr8 (105-198)||(20995404-20995497)
chr8 (31-195)||(40991756-40991920)
chr8 (122-186)||(43274635-43274699)
chr8 (139-213)||(3037941-3038016)
chr8 (109-166)||(16524446-16524503)
chr8 (31-72)||(18372485-18372526)
chr8 (64-120)||(18373236-18373292)
chr8 (82-169)||(40417733-40417820)
chr8 (128-182)||(18372288-18372342)
chr8 (99-136)||(12156708-12156745)
chr8 (28-85)||(20995502-20995559)
chr8 (28-105)||(33831978-33832055)
chr8 (86-127)||(11442911-11442952)
chr8 (28-60)||(18645713-18645745)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (20-205)||(22304561-22304747)
chr3 (30-210)||(37990615-37990795)
chr3 (30-213)||(37990950-37991133)
chr3 (30-184)||(43346793-43346947)
chr3 (28-213)||(15772854-15773038)
chr3 (28-213)||(42342361-42342546)
chr3 (30-186)||(35946524-35946680)
chr3 (28-198)||(29644890-29645060)
chr3 (28-213)||(54017790-54017974)
chr3 (28-198)||(12114550-12114720)
chr3 (28-186)||(32589704-32589861)
chr3 (28-186)||(33803252-33803410)
chr3 (20-178)||(39934963-39935123)
chr3 (28-186)||(54018198-54018356)
chr3 (28-186)||(29644581-29644739)
chr3 (20-177)||(39389062-39389219)
chr3 (28-186)||(41359765-41359919)
chr3 (30-214)||(52634678-52634860)
chr3 (28-186)||(25739425-25739583)
chr3 (30-183)||(32462903-32463057)
chr3 (28-186)||(21832345-21832501)
chr3 (28-184)||(42342092-42342248)
chr3 (20-186)||(50612447-50612618)
chr3 (30-178)||(22303963-22304104)
chr3 (28-180)||(15773192-15773346)
chr3 (28-187)||(31190017-31190168)
chr3 (28-186)||(53577364-53577522)
chr3 (20-169)||(4823647-4823796)
chr3 (30-186)||(25755396-25755552)
chr3 (28-210)||(1634291-1634473)
chr3 (28-183)||(45395656-45395811)
chr3 (35-160)||(3135099-3135224)
chr3 (30-186)||(3135454-3135617)
chr3 (30-187)||(45901715-45901873)
chr3 (29-186)||(53117975-53118131)
chr3 (28-188)||(39914252-39914412)
chr3 (28-187)||(8327904-8328067)
chr3 (30-186)||(32462558-32462715)
chr3 (19-186)||(37726495-37726654)
chr3 (30-178)||(49336694-49336843)
chr3 (19-187)||(51886552-51886714)
chr3 (31-185)||(11661954-11662108)
chr3 (86-210)||(22303634-22303759)
chr3 (30-210)||(33175635-33175820)
chr3 (28-179)||(9240149-9240300)
chr3 (28-186)||(44160547-44160702)
chr3 (38-210)||(42584800-42584970)
chr3 (102-210)||(41359467-41359575)
chr3 (28-160)||(47964544-47964676)
chr3 (54-152)||(33362327-33362425)
chr3 (28-198)||(39336219-39336387)
chr3 (20-135)||(3384317-3384432)
chr3 (20-83)||(22304238-22304301)
chr3 (98-212)||(54017522-54017636)
chr3 (28-186)||(47964915-47965073)
chr3 (31-120)||(7767380-7767469)
chr3 (137-213)||(22304302-22304379)
chr3 (30-146)||(11661537-11661638)
chr3 (31-136)||(46546375-46546480)
chr3 (28-84)||(43346650-43346706)
chr3 (70-156)||(39336000-39336086)
chr3 (70-175)||(12749211-12749316)
chr3 (78-138)||(52634990-52635050)
chr3 (132-185)||(8328374-8328427)
chr3 (31-160)||(25317161-25317290)
chr3 (30-146)||(25991405-25991521)
chr3 (95-146)||(53596027-53596078)
chr3 (95-146)||(53596342-53596393)
chr3 (83-140)||(17731950-17732007)
chr3 (83-140)||(19033181-19033238)
chr3 (108-186)||(43978865-43978947)
chr3 (95-146)||(53596542-53596593)
chr3 (110-186)||(7766783-7766857)
chr3 (95-142)||(48127859-48127906)
chr3 (155-212)||(9239940-9239996)
chr3 (28-60)||(12747878-12747910)
chr3 (96-140)||(16871005-16871049)
chr3 (96-140)||(17735037-17735081)
chr3 (96-140)||(19036306-19036350)
chr3 (159-213)||(41360110-41360164)
chr3 (95-140)||(16143505-16143550)
chr3 (99-140)||(16869843-16869884)
chr3 (33-94)||(36986040-36986101)
chr3 (33-94)||(37011479-37011540)
chr3 (91-127)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (30-186)||(514-670)
scaffold0702 (20-186)||(147-308)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (30-211)||(1082-1262)
scaffold0391 (75-213)||(1657-1802)
scaffold0391 (28-79)||(3092-3143)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (28-177)||(5396-5546)
scaffold0734 (28-177)||(5777-5931)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (28-186)||(47360-47518)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (28-148)||(5357-5477)
scaffold0078 (28-213)||(4982-5167)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (28-144)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (30-105)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (30-160)||(39459-39588)
scaffold0113 (30-153)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (22-106)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (66-106)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 80)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 6500441 - 6500635
Alignment:
Q  18 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6500441 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaa 6500539  T
Q  118 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6500540 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaacagtg 6500635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctca-tgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 6500815 - 6501007
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6500815 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaagg 6500913  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  6500914 ttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaatagtg 6501007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca-tgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  21 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 120  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  121 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  25 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  125 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328120
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctcagtgacccaacagtg 25328120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 624188 - 624379
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  624188 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgagg 624287  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  | |||||||||||    
T  624288 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctccccctagtgacccaacag 624379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3295172 - 3295002
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3295172 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggt 3295074  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3295073 atgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctca 3295002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13415918 - 13415750
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13415918 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggt 13415819  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  13415818 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgaaatgg-cggtccccgtggctcccct 13415750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405574
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccagtgacccaaca 42405574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632961
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca-gctccccttaatgacccaa 41632961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9498820 - 9498655
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9498820 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaga 9498721  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9498720 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26074304 - 26074122
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26074304 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggttttgggt 26074205  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  26074204 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccccaaagctcccctctctgacccaaca 26074122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Original strand, 26074614 - 26074792
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074614 caagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26074713  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 208  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  26074714 gagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccctaaagctcccctctctgacccaa 26074792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028492
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacccaacag 1028492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568545
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctcaatgacccaaca 36568545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299647
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccc 299647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  38 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 128  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150165
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct 35150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623976
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 623976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370573
Alignment:
Q  54 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 153  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  154 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctca 15370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  40 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  140 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  25 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  125 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 163  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 166  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24489360 - 24489194
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24489360 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaa 24489263  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  24489262 gagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcccctc 24489194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26074938 - 26074807
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  26074938 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaa 26074839  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074838 agagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Original strand, 38427553 - 38427697
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  38427553 gtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagag 38427651  T
Q  133 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    ||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427652 tgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167838
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915007
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccc 35915007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36522053 - 36521922
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36522053 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggta 36521954  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    ||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521953 agagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  114 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 123  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36522392 - 36522277
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36522392 aagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaag 36522293  T
Q  131 agtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522292 agtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 108
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 31509623 - 31509742
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttggg 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  31509623 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttgg 31509722  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  31509723 taagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 165  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786002
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtccc 13786002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 153
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  42 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  141 ctctcttgcttgt 153  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427377
Alignment:
Q  115 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccc 38427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785631
Alignment:
Q  86 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  186 ct 187  Q
    ||    
T  13785632 ct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  112 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  99 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 166  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  85 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 164  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 123  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 146
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  86 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 142
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Original strand, 5660289 - 5660338
Alignment:
Q  19 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 68  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660289 atgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 88
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 88  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 153
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  65 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 153  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 146
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  108 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 146
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  108 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 70
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 70
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  86 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 182
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 140
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  110 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  82 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 77  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  126 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  118 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 182  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  99 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  133 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13785764 - 13785732
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785764 aagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 78)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44290991 - 44290797
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290991 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 44290892  T
Q  120 ttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  44290891 ttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaacagtg 44290797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44290624 - 44290458
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290624 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 44290525  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290524 ttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537589
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccct 3537589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  128 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 41157375 - 41157545
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41157375 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagt 41157474  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41157475 aagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48588654 - 48588460
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  48588654 tgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaagg 48588555  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||||    
T  48588554 ttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgcccaaagttcccctcactgaaccaaaagtg 48588460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26661678 - 26661522
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26661678 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 26661579  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26661578 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157175
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaaca 41157175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767135
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctca-tgacccaacagtg 31767135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 183
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364691
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc-cagtgacccaacagtg 34364691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 37556113 - 37556260
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37556113 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggta 37556211  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556212 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45494145 - 45493949
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcct 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45494145 tgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcct 45494046  T
Q  115 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  45494045 taaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca-gctccccccaatgacccaacagt 45493949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50051998
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtg 50051998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649596
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956093
Alignment:
Q  32 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctc-gtgacccaacagtg 9956093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 34364925 - 34365084
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364925 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggt 34365024  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34365025 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  36 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 135  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  136 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32168855 - 32168674
Alignment:
Q  18 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |    
T  32168855 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttga 32168767  T
Q  118 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-aggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32168766 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccctaaggctcccct-agtgacccaaca 32168674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 11977282 - 11977438
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11977282 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 11977381  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977382 gagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  22 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  122 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22077653 - 22077484
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22077653 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggt 22077554  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22077553 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccct 22077484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875333
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850588
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctca 37850588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  25 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 124  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  125 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661921
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66445
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtga 214  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| ||||||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctca-tgacccaacagtga 66445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066201
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184380
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  119 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaac 209  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  210 agtg 213  Q
    ||||    
T  41184383 agtg 41184380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575284
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  134 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtcccccagactctcctcagtgacccaaca 5575284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3537313 - 3537226
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537313 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131965
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||| ||||||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctca-tgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44043943 - 44043810
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  44043943 tgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtc 44043845  T
Q  114 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043844 ttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22077243 - 22077101
Alignment:
Q  53 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 152  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||     
T  22077243 atcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcactta 22077144  T
Q  153 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 195  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22077143 tgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 180
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 180  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 66247 - 66100
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 125  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  66247 tgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgg 66148  T
Q  126 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 175  Q
    |||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66147 gtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528728
Alignment:
Q  38 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
     |||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |  ||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtggatgaccccccggactccccttcctgacccaacagt 5528728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30630796 - 30630611
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30630796 tgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 30630697  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||| || |||| || | || ||||||||||    
T  30630696 aagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtgagcagtcccccagactccacttagtgccccaacagtg 30630611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 208  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctca-tgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 176
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  125 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378035
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc-cagtgacccaacag 21378035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 186
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977102
Alignment:
Q  99 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188574
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta-ggctcccctca 199  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtccccaagggctcccctca 1188574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051689
Alignment:
Q  98 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187349
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctca 199  Q
    || ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtcccctagagctcccctca 1187349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380143
Alignment:
Q  99 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccctagactccccta 47380155  T
Q  199 actgacccaaca 210  Q
    | ||||||||||    
T  47380154 attgacccaaca 47380143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 185
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  43 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 142  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  143 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  70 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 175
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  55 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 152  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  153 tgtggttgttctagcctcgatgt 175  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 50051819 - 50051777
Alignment:
Q  18 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051819 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 50469239 - 50469180
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 87  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469239 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 94  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  77 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 122  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996870
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 188  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtccccta 5996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  83 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4266949 - 4266875
Alignment:
Q  19 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 93  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266949 atgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 185
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  69 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 168  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  169 tcgatgtggacggtccc 185  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  110 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22077280 - 22077248
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077280 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 22077248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  37 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 96  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 47379943 - 47379891
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 80  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  47379943 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  101 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 147  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 198
Target Start/End: Original strand, 30697310 - 30697387
Alignment:
Q  121 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30697310 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactttgcgtggttgctatggcctagatgtgggcggtcccc-aggctcccctc 30697387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Original strand, 45084576 - 45084617
Alignment:
Q  168 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45084576 ctcgatgtggacggtcccctaggcttccctca-tgacccaaca 45084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  110 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 164
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 164  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 29518912 - 29519078
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518912 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29519011  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519012 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 2378118 - 2378284
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2378118 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 2378217  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378218 ttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210387
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccc-cagtgacccaacagtg 35210387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058409
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| || ||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccccaaagctcccctcaccgaaccaaca 3058409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 3409652 - 3409818
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  3409652 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttatt 3409751  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409752 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579847
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc-aagctcccctca-ttacccaacagtg 2579847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377912
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2377912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 3415450 - 3415629
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415450 tgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 3415549  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3415550 tttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  21 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 120  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  121 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2578598 - 2578443
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2578598 caagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 2578500  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578499 gagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10074521 - 10074352
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10074521 tgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 10074422  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  10074421 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcccct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Original strand, 16454913 - 16455078
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454913 tgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagt 16455012  T
Q  134 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16455013 gtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 16455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 176
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454759
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtg 16454759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127530
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctc 1127530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10074149 - 10073989
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074149 tgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 10074050  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 188  Q
    || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10074049 aaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtccccta 10073989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 186
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  133 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2578991 - 2578822
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2578991 gcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggttttgggta 2578893  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578892 agagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 2578822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 208  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc-aggctcccctca-tgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2579645 - 2579478
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2579645 gtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaag 2579546  T
Q  133 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcac 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  2579545 tatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctcac 2579478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10073772 - 10073604
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10073772 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggt 10073675  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  10073674 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctc 10073604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2579261 - 2579083
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||    
T  2579261 caagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaa 2579166  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2579165 gagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctcccctca-tgacccaacagtga 2579083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  128 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 171  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  133 tgtg 136  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Original strand, 16108065 - 16108208
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  16108065 caagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg---------- 16108154  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16108155 --gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  134 gtggtgtctctcttgcttgt 153  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071665
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctca-tgacctaacagtg 12071665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085021
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctca 12085021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092470
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtccccttggcccccctc 12092470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  23 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 122  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  123 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 180  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Original strand, 6071132 - 6071264
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  6071132 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggat 6071231  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071232 aagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714849
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 209  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccagactcccctcaatgacccaac 31714849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 147
Target Start/End: Original strand, 8481927 - 8482045
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8481927 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggt 8482025  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctctt 147  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8482026 aagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135058
Alignment:
Q  32 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  132 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccccagactcccct 17135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618592
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aatgtgggtggtccccaaggctcccctc-gtgacccaacagtg 30618592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 144
Target Start/End: Original strand, 2975567 - 2975668
Alignment:
Q  43 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 142  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  2975567 tatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtct 2975666  T
Q  143 ct 144  Q
    ||    
T  2975667 ct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 101
Target Start/End: Original strand, 35210498 - 35210551
Alignment:
Q  48 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35210498 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  132 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  65 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 213
Target Start/End: Original strand, 2975296 - 2975355
Alignment:
Q  153 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| |||||||    
T  2975296 tgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcctct-gactcccctcagtgacctaacagtg 2975355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  104 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Original strand, 35210554 - 35210602
Alignment:
Q  162 tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  35210554 tctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaacag 35210602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085590
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctca-tgacccaacagtg 1085590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517762
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtaacccaaca 7517762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 212
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157749
Alignment:
Q  22 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  122 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctcactgacccaacagt 29157749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37533176 - 37533011
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37533176 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 37533077  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533076 ttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37533531 - 37533338
Alignment:
Q  19 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 118  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37533531 atgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaag 37533432  T
Q  119 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  37533431 gttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-gtgacccaacagtg 37533338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845373
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc-cagtgacccaacag 11845373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 30244272 - 30244428
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244272 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 30244371  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30244372 gagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094774
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567012
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||  ||||||| ||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcaacgacccaatagtg 22567012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Original strand, 7554025 - 7554154
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7554025 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggt 7554124  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7554125 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 14681502 - 14681663
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14681502 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaagg 14681601  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681602 ttttgggtaagagtgtggtgtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  36 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  136 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 30245079 - 30245255
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30245079 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 30245178  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  30245179 gagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 30245255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  134 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 45434638 - 45434794
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  45434638 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaa 45434737  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45434738 gagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129278
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctca-tgatccaacagtg 47129278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118277
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  128 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 118277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128414
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||| |||||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctcactaacccaacagtg 8128414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 209  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctca-tgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22566820 - 22566702
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566820 tgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 22566721  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctctt 147  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22566720 aagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  133 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 184
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttg 148  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttg 148  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 163  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1085407 - 1085280
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 126  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1085407 tgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttggg 1085308  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 154  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085307 taagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 183
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  49 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 148  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  149 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 186
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  70 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  170 cgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300229
Alignment:
Q  74 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  173 tgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||||| |  | ||||||| | ||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactccccttattgacccaaca 28300229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  123 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 180  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 211
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129550
Alignment:
Q  109 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtccccga-gctcccctca-tgacccaa 47129547  T
Q  209 cag 211  Q
    |||    
T  47129548 cag 47129550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgc 149  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 30245494 - 30245567
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245494 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 30255339 - 30255412
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30255339 tgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  111 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 30244701 - 30244771
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244701 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 96  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  116 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctca-tgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctca-tgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245339
Alignment:
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctcccctta-tgacccaacagtg 30245339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517839
Alignment:
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7517839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518105
Alignment:
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  97 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctct 146  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 65
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  22 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 175  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 40094552 - 40094502
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094552 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 173
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  111 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 173  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  83 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  183 cccc 186  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 80  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 37345916 - 37346036
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 125  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  37345916 tgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttga 37346015  T
Q  126 gtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  37346016 gtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 186
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  70 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 169  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  170 cgatgtggacggtcccc 186  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  123 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 7517982 - 7518028
Alignment:
Q  164 tagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517982 tagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 135
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 135  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41283642 - 41283449
Alignment:
Q  19 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41283642 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 41283543  T
Q  119 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  41283542 gttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctcacttacccaacagt 41283449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36178771 - 36178605
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178771 tgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 36178672  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36178671 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccc 36178605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 37106180 - 37106344
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37106180 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagg 37106279  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106280 ttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745667
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 14745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5542791 - 5542625
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5542791 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagg 5542692  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542691 tttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106082
Alignment:
Q  24 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  124 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421569
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtg 6421569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5543164 - 5543002
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  5543164 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaga 5543065  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543064 ttttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 180
Target Start/End: Original strand, 15880265 - 15880415
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880265 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 15880364  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 180  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880365 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514833
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtg 42514833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580724
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178171
Alignment:
Q  46 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  146 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796590
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  128 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc--cctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccctccaaggctcccc-caatgacccaacagtg 38796590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422268
Alignment:
Q  44 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 143  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctc 6422225  T
Q  144 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6422226 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713160
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||| |||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccctcactgatccaacag 6713160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14745460 - 14745300
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745460 tgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaagg 14745361  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745360 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731831
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  133 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||  ||||||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcctccaaagctcccctcggtgacccaaca 33731831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40679787 - 40679632
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40679787 tgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggt 40679688  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679687 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632575
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg-cccct-ggctcccctcagtgtcccaaca 37632575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 40733519 - 40733675
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||    
T  40733519 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaa 40733618  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  40733619 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770075
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgaacgatcctccta-gctcccc-caatgacccaacagt 1770075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  32 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  132 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 167  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Original strand, 7598601 - 7598769
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |    
T  7598601 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaacg 7598692  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  7598693 tttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacggcccactgggctcccc 7598769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28531472 - 28531316
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28531472 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggt 28531373  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531372 aagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36178435 - 36178320
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  36178435 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaagg 36178336  T
Q  120 ttttgggtaagagtgt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178335 ttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163362
Alignment:
Q  39 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  |||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctcccc 40163362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 210
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  41 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  141 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctca-tgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 40733885 - 40734040
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  40733885 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaa 40733983  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40733984 gagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598387
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccct 7598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 172
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Original strand, 29676903 - 29677065
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29676903 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctt 29677002  T
Q  123 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677003 taagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 209
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  90 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 189  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  190 gctcccctcactgacccaac 209  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6421893 gctcccctca-tgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  128 aagagtgt 135  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  36 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 135  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  136 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31468904 - 31468800
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31468904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 31468809  T
Q  128 aagagtgtg 136  Q
    |||||||||    
T  31468808 aagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673249
Alignment:
Q  82 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 3673221  T
Q  182 tcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||    
T  3673222 tccccctggctcccc-cagtgacccaaca 3673249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591065
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctcaatgacccaaca 16591065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 30313178 - 30313361
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30313178 tgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggt 30313276  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||    
T  30313277 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctcctc-gtgacccaacagtg 30313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672882
Alignment:
Q  100 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  |    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccccta 3672872  T
Q  200 ctgacccaac 209  Q
     |||||||||    
T  3672873 gtgacccaac 3672882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  36 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  136 ggtgt 140  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  128 aagagtgtggtgtctct 144  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33561609 - 33561491
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33561609 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggt 33561510  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  33561509 aagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 38796376 - 38796298
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796376 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 182
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  90 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 30323464 - 30323581
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30323464 tgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggt 30323563  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctc 145  Q
    |||||||||| |||||||    
T  30323564 aagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  81 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29873695 - 29873525
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  29873695 tgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagt 29873596  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| | || ||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  29873595 aagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggctcccctc 29873525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37894850 - 37894732
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  37894850 tgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggtt 37894751  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctct 146  Q
    || |||||||||| |||||    
T  37894750 aaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36785721 - 36785664
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785721 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 159  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  44 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33953929 - 33953821
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  33953929 tgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggt 33953830  T
Q  128 aagagtgtg 136  Q
    |||||||||    
T  33953829 aagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899090
Alignment:
Q  118 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc-aagctcccctca 31899090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  92 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  131 agtgt 135  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41678527 - 41678419
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  41678527 tgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttga 41678429  T
Q  126 gtaagagtgt 135  Q
    ||||||||||    
T  41678428 gtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 169  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  70 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  82 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 141  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 90
Target Start/End: Original strand, 42515031 - 42515078
Alignment:
Q  43 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 90  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515031 tatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 127
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  70 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Original strand, 3673085 - 3673121
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3673085 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaat 3673121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  98 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 146
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  99 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 210
Target Start/End: Original strand, 2109988 - 2110066
Alignment:
Q  132 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  2109988 gtgtggcgtccctctcgcttgtatgattgctctagtctcgatgtggacggtccccctgactcccctcagtaacccaaca 2110066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 144  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 64  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483520
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc-cagtgacccaacagtg 25483520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50630919 - 50630731
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630919 tgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 50630820  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50630819 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctag-ctcccctcactgacccaa 50630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 36629239 - 36629418
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36629239 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36629338  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  36629339 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctcaatgacccaac 36629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933113
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246104
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaacagtg 10246104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340991
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc-cagtgacccaacagtg 3340991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792845
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctca 39792845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  25 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  125 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22028117 - 22027935
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22028117 tgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggttttgggt 22028018  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22028017 aagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcccctca-tgacccaacag 22027935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404203
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaacagtg 39404203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Original strand, 39404400 - 39404555
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  39404400 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaa 39404499  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404500 gaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608647
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 36608647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Original strand, 44620660 - 44620830
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  44620660 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggt 44620758  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44620759 aagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 44620830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028339
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 125  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  126 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaacagtg 22028339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Original strand, 54108928 - 54109060
Alignment:
Q  43 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54108928 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtct 54109026  T
Q  143 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54109027 ctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 185
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  38 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  37 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  137 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 52884887 - 52885038
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884887 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggg 52884986  T
Q  127 taagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884987 taagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183253
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 195  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 169  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  37 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 136  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  137 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076804
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccctgagct-ccctca-tgacccaacagtg 49076804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936378
Alignment:
Q  47 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  147 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| || ||||||||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagt 54936378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18932887 - 18932747
Alignment:
Q  46 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18932887 gtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctc 18932788  T
Q  146 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932787 ttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826021
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  134 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| |||||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaacagtg 20826021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888804
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 196  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303065
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108694
Alignment:
Q  27 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  126 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccc 54108694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Original strand, 20826223 - 20826370
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20826223 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagt 20826322  T
Q  134 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 181  Q
    ||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20826323 gtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 157
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  43 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  143 ctcttgcttgtgtgg 157  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3244607 - 3244448
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3244607 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggt 3244508  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    |||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3244507 aagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccct 3244448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 2741071 - 2741180
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2741071 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggt 2741170  T
Q  128 aagagtgtgg 137  Q
    ||||||||||    
T  2741171 aagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  82 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 181  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  182 tcccc 186  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 199
Target Start/End: Original strand, 43174508 - 43174677
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| || |||||||    
T  43174508 caagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgaccttaaagtgttgggta 43174607  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43174608 agagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta-gctcccctca 43174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741151
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctcagtgacccaacagtg 54741151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 6975622 - 6975489
Alignment:
Q  18 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 117  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||    
T  6975622 aatgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaa 6975523  T
Q  118 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 151  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975522 gattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  130 gagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 49076604 - 49076449
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  49076604 tgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggt 49076506  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |  || | ||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076505 a--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 3341128 - 3341286
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||    
T  3341128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggt 3341227  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  3341228 aagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggtcccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 174  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45489485 - 45489331
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||    
T  45489485 caagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaa 45489387  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489386 gagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 184
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  74 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 173  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  174 gtggacggtcc 184  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 186
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  68 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 167  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  168 ctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  79 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  177 gacg 180  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  41 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 165  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111696
Alignment:
Q  49 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 148  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  149 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 186
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271947
Alignment:
Q  50 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 145  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  146 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760356
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  133 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||   || |||||||  |||||||| |||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctct-tactggatgtgggtggtcccctgggctcccct 760356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  70 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 169  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Original strand, 10246347 - 10246436
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 117  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10246347 tgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 94
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  36 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489712
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  134 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccc 45489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 186
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 44621426 - 44621492
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621426 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783525
Alignment:
Q  91 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg 190  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||  ||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  191 ctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  11783546 cacccctca-tgacccaacagtg 11783525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  53 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 150  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  151 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Original strand, 44620946 - 44621011
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 94  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620946 caagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817429
Alignment:
Q  141 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccc-aggctcccc-cagtgacccaacagt 23817429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  108 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 116  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  34 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 133  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  134 gtggtgtctctct 146  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 147  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 135
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 177
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  86 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 144  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 140
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  94 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702284
Alignment:
Q  142 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctca 11702284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18932924 - 18932887
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 57  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18932924 tgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcgg 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 18933136 - 18933103
Alignment:
Q  18 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933136 aatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 213
Target Start/End: Original strand, 45496678 - 45496735
Alignment:
Q  156 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||||    
T  45496678 ggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctccccttactgacccaacagtg 45496735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  82 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 76  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  106 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  83 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 126  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  72 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  104 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 69  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 176
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  139 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  91 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Original strand, 41370693 - 41370738
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 65  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370693 tgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1731621 - 1731581
Alignment:
Q  156 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 196  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1731621 ggttattctagcctcgatgtggatggtcccccaggctcccc 1731581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  110 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Original strand, 3669679 - 3669845
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3669679 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagg 3669778  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3669779 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 3669845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 198
Target Start/End: Original strand, 3670052 - 3670229
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3670052 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaagg 3670151  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3670152 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta-gctcccctc 3670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Original strand, 30441073 - 30441278
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30441073 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcctt 30441172  T
Q  116 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtgaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  30441173 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctc-gtgacccaaca-tgaa 30441270  T
Q  216 cgagcaga 223  Q
     |||||||    
T  30441271 ggagcaga 30441278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038262
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc-ctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctccctctcagtgacccaacagtg 3038262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 34835211 - 34835377
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34835211 caagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaa 34835310  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835311 gagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  118 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctca-tgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359457
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctcaatgacccaacagtg 30359457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014253
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1014253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561812
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 189  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccctag 25561812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608904
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 34835476 - 34835643
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835476 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835575  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835576 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 34835742 - 34835909
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835742 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835841  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835842 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518229
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1014037 - 1013879
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  1014037 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagag 1013938  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013937 ttttgagtaagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Original strand, 40518584 - 40518738
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40518584 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaa 40518683  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518684 gagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 9309355 - 9309537
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||    
T  9309355 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggt 9309454  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
    |||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||    
T  9309455 aagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagt 9309537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544490
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 186
Target Start/End: Original strand, 45122638 - 45122782
Alignment:
Q  42 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 141  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  45122638 atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtc 45122737  T
Q  142 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122738 tctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 186
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147609
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9482755 - 9482608
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  9482755 gtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtg 9482656  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482655 tggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  53 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  153 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8918922 - 8918764
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8918922 tgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggt 8918823  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918822 aagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  22 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 121  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  122 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 180  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371967
Alignment:
Q  38 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 137  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctca-tgacccaacagtg 18371967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 182
Target Start/End: Original strand, 30359611 - 30359763
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30359611 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaa 30359710  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  30359711 gagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  125 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 45123006 - 45123164
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45123006 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggt 45123103  T
Q  128 a--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123104 aagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Original strand, 6731896 - 6732055
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  6731896 tgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaacccataaattcattgccttaagg 6731986  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6731987 ttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgatccccta 6732055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309139
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  126 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640542
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45121811 - 45121663
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  45121811 caagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaa 45121713  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45121712 gagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  32 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  132 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Original strand, 6651510 - 6651652
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6651510 gtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtg 6651600  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651601 tggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18371807 - 18371665
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18371807 gtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtg 18371713  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    |||||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18371712 tggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggt 18371665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  22 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  122 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 147829 - 147968
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  147829 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa---------cccataaacctattgccttaaggttttgggt 147919  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147920 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  123 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 165
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  51 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 150  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  151 tgtgtggttgttcta 165  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 106  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  131 agtgtggtgtc 141  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 199
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129159
Alignment:
Q  106 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 41129159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  130 gagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620666
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctc 9620666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  103 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18373085 - 18372988
Alignment:
Q  32 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 131  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  18373085 agtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaaga 18372989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18372854 - 18372785
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372854 aagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  110 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  130 gagtgtg 136  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4154438 - 4154270
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  4154438 tgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggt 4154340  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    ||| ||||| |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||| || |||||||    
T  4154339 aagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgggtggtccccgagactcccct 4154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18372411 - 18372342
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372411 aagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  32 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  38 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 132  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995404
Alignment:
Q  105 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctc 20995404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 195
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991920
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aa 129  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggttaa 40991855  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 195  Q
    || |||||||||   ||  | |||||||||| ||||| | | ||||||| | ||||||||||||||    
T  40991856 ga-tgtggtgtccaactcacctgtgtggttgctctaggcccaatgtggatgatcccctaggctccc 40991920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  122 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037941
Alignment:
Q  139 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaacagtg 3037941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  109 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 166  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18372526 - 18372485
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372526 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  64 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  82 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 169  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  99 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 85  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 127
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  86 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 60  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 205
Target Start/End: Original strand, 22304561 - 22304747
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22304561 tgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaagg 22304660  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  22304661 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccctcactgacc 22304747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37990795 - 37990615
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37990795 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 37990696  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  37990695 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctcaatgacccaaca 37990615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990950
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctccccctca-tgacccaacagtg 37990950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773038
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctca-tgacccaacagtg 15773038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342361
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctccccttagtgacccaacagtg 42342361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54017974 - 54017790
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54017974 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggt 54017875  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||||||    
T  54017874 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccc-cagtgacccaacagtg 54017790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114550
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctc 12114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803252
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39935123 - 39934963
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39935123 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaa 39935024  T
Q  118 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935023 agttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018198
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29644739 - 29644581
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29644739 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644640  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  29644639 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41359919 - 41359765
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359919 tgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 41359824  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41359823 aagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41359765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634860
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtga 214  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| || ||||||||||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagtga 52634860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739425
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21832501 - 21832345
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21832501 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggt 21832402  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21832401 aaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42342248 - 42342092
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42342248 tgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggt 42342149  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342148 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  115 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22304104 - 22303963
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22304104 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 22304012  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304011 gagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 15773192 - 15773346
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15773192 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggt 15773291  T
Q  128 aagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 180  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773292 aagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190168
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577522
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 4823647 - 4823796
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  4823647 tgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaaga 4823746  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823747 ttttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634291
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacacaaca 1634291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 183  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3135224 - 3135099
Alignment:
Q  35 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3135224 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtg 3135125  T
Q  135 tggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  3135124 tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135454
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  123 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901873
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  29 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 188
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914412
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 188  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgtagacagcccccta 39914412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328067
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccct 8328067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32462715 - 32462558
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  32462715 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggata 32462616  T
Q  129 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462615 agagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Original strand, 37726495 - 37726654
Alignment:
Q  19 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| ||    
T  37726495 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttag 37726586  T
Q  119 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726587 gttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  130 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 178  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 51886552 - 51886714
Alignment:
Q  19 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||          
T  51886552 atgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------ 51886645  T
Q  119 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 187  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  51886646 gttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggtaccct 51886714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 185
Target Start/End: Original strand, 11661954 - 11662108
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11661954 aagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaa 11662053  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662054 gagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303634
Alignment:
Q  86 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-c 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtctc 22303660  T
Q  185 cctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||  || |||||||||| |||||    
T  22303659 cctagcttctcctcactgactcaaca 22303634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175635
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  127 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| || |||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctcagtggcccaaca 33175635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 9240149 - 9240300
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |    
T  9240149 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggat 9240248  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 179  Q
    |||| ||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240249 aagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584800
Alignment:
Q  38 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  138 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 210  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||  |||  | ||| ||||| ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacggctcccccgactctcctcaatgacccaaca 42584800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359467
Alignment:
Q  102 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcact 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcgct 41359476  T
Q  202 gacccaaca 210  Q
    |||||||||    
T  41359475 gacccaaca 41359467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 47964676 - 47964544
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47964676 tgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 47964577  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964576 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  54 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336219
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctc 198  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctc 39336219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3384432 - 3384317
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  3384432 tgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgccttaaag 3384333  T
Q  120 ttttgggtaagagtgt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  3384332 ttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 83
Target Start/End: Original strand, 22304238 - 22304301
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304238 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017522
Alignment:
Q  98 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    |||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccctaactcccct 54017537  T
Q  198 cactgacccaacagt 212  Q
    |  ||||||||||||    
T  54017536 ctatgacccaacagt 54017522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964915
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304379
Alignment:
Q  137 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaacagtg 22304379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  130 gagtgtggtgtctctct 146  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  131 agtgtg 136  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  70 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 156  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 175
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  70 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 169  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  170 cgatgt 175  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  78 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  132 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  31 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  131 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  130 gagtgtggtgtctctct 146  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  83 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  83 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978865
Alignment:
Q  108 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccc 43978865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  110 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 142  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Original strand, 9239940 - 9239996
Alignment:
Q  155 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  9239940 tggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca-tgatccaacagt 9239996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  96 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41360164 - 41360110
Alignment:
Q  159 tgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| || |||||||    
T  41360164 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctcgctgtcctaacagtg 41360110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 140
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  95 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  99 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  33 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  91 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 514
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 147
Alignment:
Q  20 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||    
T  308 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg 213  T
Q  120 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 -tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1082
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 1163  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 211  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||    
T  1162 gagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc-cagtgacccaacag 1082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1657
Alignment:
Q  75 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct--------tgtgtggttgttctag 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||         |||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctctctctctcacacaagtgtggttgttctag 1703  T
Q  167 cctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||| | ||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  1702 cctcgatgtgggcagtccccctagctcccctc-gtgacccaacagtg 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3092
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 79  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3143 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  127 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 5777 - 5931
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttt 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  5777 tgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattt 5876  T
Q  123 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 177  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5877 tgagtaagagtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 186  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Original strand, 5357 - 5477
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5357 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggat 5456  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttg 148  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5457 aagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5167
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  128 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggaccattcccttttctcccctaagtgacccaacagtg 5167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17614 - 17496
Alignment:
Q  28 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg--ttttgg 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17614 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgg 17515  T
Q  126 gtaagagtgtggtgtctct 144  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17514 gtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 160
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  130 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 160  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Original strand, 39840 - 39963
Alignment:
Q  30 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| |||    
T  39840 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaa 39939  T
Q  130 gagtgtggtgtctctcttgcttgt 153  Q
     | |||||||||||||| ||||||    
T  39940 aaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  22 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 106  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  66 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University