View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7430_low_5 (Length: 342)

Name: NF7430_low_5
Description: NF7430
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7430_low_5
NF7430_low_5
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (91-342)||(34279426-34279677)
chr2 (91-342)||(34286331-34286582)
chr2 (91-342)||(34291391-34291642)
chr2 (91-338)||(34861657-34861904)
chr2 (91-338)||(37685926-37686173)
chr2 (91-338)||(37701191-37701438)
chr2 (91-338)||(21677199-21677446)
chr2 (91-342)||(12655519-12655770)
chr2 (91-338)||(22926045-22926292)
chr2 (91-342)||(23128579-23128830)
chr2 (91-342)||(28882191-28882442)
chr2 (91-342)||(32049775-32050026)
chr2 (85-338)||(11635203-11635456)
chr2 (85-338)||(11641392-11641645)
chr2 (91-338)||(37925470-37925717)
chr2 (91-342)||(20837895-20838146)
chr2 (91-342)||(27434457-27434708)
chr2 (91-342)||(16829351-16829602)
chr2 (91-342)||(16891879-16892130)
chr2 (91-338)||(19416516-19416763)
chr2 (91-338)||(31876258-31876505)
chr2 (91-338)||(13936561-13936808)
chr2 (116-342)||(37375163-37375389)
chr2 (124-342)||(260766-260984)
chr2 (115-338)||(39890075-39890298)
chr2 (91-342)||(12716615-12716869)
chr2 (118-342)||(27777226-27777450)
chr2 (118-342)||(27816984-27817208)
chr2 (118-338)||(40233515-40233735)
chr2 (118-338)||(9349999-9350219)
chr2 (118-342)||(27803711-27803935)
chr2 (118-342)||(39051835-39052059)
chr2 (118-338)||(12586814-12587034)
chr2 (7-342)||(21703177-21703506)
chr2 (7-341)||(31891342-31891670)
chr2 (94-341)||(19456435-19456682)
chr2 (112-290)||(27118686-27118864)
chr2 (112-290)||(34303368-34303546)
chr2 (118-342)||(27392973-27393197)
chr2 (115-290)||(3784655-3784830)
chr2 (115-290)||(34157012-34157187)
chr2 (115-286)||(16163600-16163771)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (91-342)||(9548464-9548715)
chr5 (91-342)||(15658681-15658932)
chr5 (91-338)||(9317441-9317688)
chr5 (91-338)||(12132145-12132392)
chr5 (91-338)||(30152008-30152255)
chr5 (91-338)||(2511041-2511288)
chr5 (91-338)||(5637900-5638147)
chr5 (91-338)||(8665400-8665647)
chr5 (91-338)||(15758782-15759029)
chr5 (91-342)||(23752371-23752622)
chr5 (91-342)||(11549344-11549595)
chr5 (91-342)||(22999035-22999286)
chr5 (91-342)||(23717909-23718160)
chr5 (91-338)||(26480382-26480629)
chr5 (91-338)||(30168459-30168706)
chr5 (85-338)||(6874289-6874542)
chr5 (91-338)||(41674699-41674946)
chr5 (94-342)||(30934626-30934874)
chr5 (91-342)||(33777477-33777728)
chr5 (91-338)||(18375337-18375584)
chr5 (97-342)||(24970014-24970259)
chr5 (91-342)||(24688078-24688329)
chr5 (116-342)||(18500651-18500877)
chr5 (91-342)||(33516346-33516597)
chr5 (116-338)||(28649250-28649472)
chr5 (91-338)||(29966991-29967238)
chr5 (91-338)||(30029405-30029652)
chr5 (115-338)||(34616532-34616755)
chr5 (116-342)||(37770908-37771134)
chr5 (118-342)||(43078269-43078493)
chr5 (116-342)||(37671404-37671630)
chr5 (116-342)||(37754995-37755221)
chr5 (124-342)||(31431463-31431681)
chr5 (118-338)||(31826332-31826552)
chr5 (115-338)||(28959711-28959934)
chr5 (115-342)||(32599393-32599620)
chr5 (116-338)||(3789556-3789778)
chr5 (91-338)||(37358568-37358815)
chr5 (118-342)||(24681457-24681681)
chr5 (118-342)||(24723984-24724208)
chr5 (118-342)||(40473470-40473694)
chr5 (7-342)||(23892115-23892447)
chr5 (116-342)||(13324750-13324976)
chr5 (7-342)||(22888382-22888711)
chr5 (112-342)||(29889003-29889233)
chr5 (94-342)||(25199022-25199270)
chr5 (115-342)||(11325808-11326035)
chr5 (115-342)||(33877261-33877488)
chr5 (115-338)||(33292539-33292762)
chr5 (115-290)||(13184621-13184796)
chr5 (115-290)||(13440467-13440642)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (13-338)||(27272551-27272876)
chr6 (91-342)||(16749832-16750083)
chr6 (91-342)||(24304585-24304836)
chr6 (91-342)||(24863695-24863946)
chr6 (91-342)||(27000051-27000302)
chr6 (92-342)||(15424284-15424534)
chr6 (91-342)||(13298918-13299169)
chr6 (91-342)||(26918358-26918609)
chr6 (91-342)||(26988979-26989230)
chr6 (94-342)||(22934847-22935095)
chr6 (94-342)||(23857292-23857540)
chr6 (91-338)||(29572991-29573238)
chr6 (115-342)||(29549477-29549704)
chr6 (91-342)||(30557983-30558234)
chr6 (116-342)||(4757767-4757993)
chr6 (91-338)||(16943998-16944245)
chr6 (118-338)||(3696086-3696306)
chr6 (118-342)||(34463313-34463537)
chr6 (91-342)||(27359959-27360210)
chr6 (91-342)||(27450302-27450553)
chr6 (124-342)||(4545742-4545960)
chr6 (116-342)||(4773009-4773235)
chr6 (115-338)||(26777586-26777809)
chr6 (116-338)||(27044390-27044613)
chr6 (116-342)||(4525289-4525515)
chr6 (116-342)||(26116377-26116603)
chr6 (116-342)||(27007730-27007956)
chr6 (118-338)||(16674144-16674364)
chr6 (91-338)||(27485107-27485354)
chr6 (124-342)||(4724101-4724319)
chr6 (116-338)||(29501418-29501640)
chr6 (124-338)||(28207465-28207679)
chr6 (1-342)||(27629667-27630014)
chr6 (116-342)||(17025280-17025506)
chr6 (1-329)||(22171914-22172236)
chr6 (94-329)||(20160682-20160917)
chr6 (112-342)||(14143252-14143482)
chr6 (112-342)||(26787943-26788173)
chr6 (112-342)||(27196316-27196546)
chr6 (112-342)||(27252694-27252924)
chr6 (113-342)||(27290337-27290566)
chr6 (13-342)||(22477240-22477566)
chr6 (115-342)||(13522040-13522267)
chr6 (91-342)||(22456901-22457152)
chr6 (115-290)||(8892329-8892504)
chr6 (115-290)||(8903564-8903739)
chr6 (7-289)||(28162557-28162833)
chr6 (115-290)||(33374275-33374450)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (91-342)||(14763328-14763579)
chr4 (85-338)||(5005863-5006116)
chr4 (91-338)||(27163345-27163592)
chr4 (91-342)||(14665014-14665265)
chr4 (91-338)||(40105666-40105913)
chr4 (94-342)||(24592338-24592586)
chr4 (91-338)||(6569849-6570096)
chr4 (91-342)||(17013996-17014247)
chr4 (91-338)||(14098537-14098784)
chr4 (91-342)||(31126542-31126793)
chr4 (116-338)||(18800641-18800863)
chr4 (116-338)||(54833408-54833630)
chr4 (118-338)||(30753777-30753997)
chr4 (116-342)||(36344539-36344765)
chr4 (118-342)||(33673822-33674046)
chr4 (91-342)||(21969697-21969948)
chr4 (118-342)||(39850661-39850885)
chr4 (7-342)||(15227788-15228117)
chr4 (7-342)||(1900175-1900504)
chr4 (94-341)||(15284953-15285200)
chr4 (115-338)||(34188988-34189211)
chr4 (115-338)||(24112682-24112905)
chr4 (115-290)||(24460681-24460856)
chr4 (112-342)||(14235549-14235779)
chr4 (118-332)||(15391372-15391586)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (85-342)||(28116019-28116276)
chr3 (91-338)||(5713169-5713416)
chr3 (91-338)||(5724079-5724326)
chr3 (91-338)||(5757151-5757398)
chr3 (91-338)||(5768042-5768289)
chr3 (91-342)||(7073154-7073405)
chr3 (91-342)||(18277117-18277368)
chr3 (91-342)||(18292418-18292669)
chr3 (91-342)||(18307719-18307970)
chr3 (91-342)||(29148820-29149071)
chr3 (91-338)||(47023395-47023642)
chr3 (85-342)||(4416855-4417112)
chr3 (91-338)||(7996504-7996751)
chr3 (91-338)||(10643012-10643259)
chr3 (91-342)||(6192258-6192509)
chr3 (91-338)||(31964542-31964789)
chr3 (91-338)||(50134140-50134387)
chr3 (91-342)||(4796718-4796969)
chr3 (91-338)||(5609391-5609638)
chr3 (91-338)||(28339244-28339491)
chr3 (91-342)||(35880708-35880959)
chr3 (91-338)||(10396075-10396322)
chr3 (91-342)||(15741159-15741410)
chr3 (91-342)||(18330611-18330862)
chr3 (94-342)||(8295917-8296165)
chr3 (94-342)||(8301332-8301580)
chr3 (91-342)||(4721573-4721824)
chr3 (91-338)||(21674635-21674882)
chr3 (91-342)||(18051204-18051455)
chr3 (91-342)||(15892771-15893022)
chr3 (91-338)||(5013654-5013901)
chr3 (91-338)||(18225133-18225380)
chr3 (91-338)||(24328101-24328348)
chr3 (91-338)||(17985025-17985272)
chr3 (115-342)||(22387643-22387870)
chr3 (118-342)||(48465896-48466120)
chr3 (115-342)||(22870921-22871148)
chr3 (115-342)||(22885980-22886207)
chr3 (115-342)||(4346752-4346979)
chr3 (116-342)||(6542527-6542753)
chr3 (124-338)||(8211713-8211927)
chr3 (117-338)||(5466953-5467174)
chr3 (118-342)||(11110414-11110638)
chr3 (91-338)||(18242681-18242928)
chr3 (115-338)||(28021241-28021464)
chr3 (116-338)||(5596426-5596648)
chr3 (118-338)||(36997146-36997366)
chr3 (124-342)||(51781998-51782216)
chr3 (124-342)||(51797087-51797306)
chr3 (118-342)||(20576912-20577136)
chr3 (118-342)||(29665035-29665259)
chr3 (115-342)||(31034182-31034409)
chr3 (112-342)||(32292715-32292945)
chr3 (112-341)||(18530351-18530580)
chr3 (94-341)||(16626572-16626819)
chr3 (115-338)||(32439120-32439343)
chr3 (116-338)||(20066010-20066232)
chr3 (115-290)||(5652353-5652528)
chr3 (115-290)||(17993901-17994076)
chr3 (115-290)||(4625910-4626085)
chr3 (115-326)||(4893176-4893387)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (91-342)||(5147250-5147501)
chr7 (91-338)||(4145037-4145284)
chr7 (91-338)||(26319783-26320030)
chr7 (91-338)||(16736374-16736621)
chr7 (91-338)||(16751428-16751675)
chr7 (91-338)||(17523514-17523761)
chr7 (91-338)||(17529454-17529701)
chr7 (91-338)||(26275008-26275255)
chr7 (91-338)||(45387325-45387572)
chr7 (91-338)||(9618633-9618880)
chr7 (91-338)||(26669828-26670075)
chr7 (91-342)||(5127974-5128225)
chr7 (91-342)||(11424686-11424937)
chr7 (94-342)||(10916778-10917026)
chr7 (91-342)||(2154555-2154806)
chr7 (91-342)||(16503290-16503541)
chr7 (91-342)||(16518326-16518577)
chr7 (91-342)||(26435239-26435490)
chr7 (91-338)||(24592455-24592702)
chr7 (116-342)||(31564300-31564526)
chr7 (118-338)||(26537784-26538004)
chr7 (118-338)||(3445315-3445535)
chr7 (91-338)||(31124902-31125149)
chr7 (124-338)||(11441587-11441801)
chr7 (112-342)||(2108915-2109145)
chr7 (112-342)||(26484697-26484927)
chr7 (94-342)||(16041308-16041556)
chr7 (112-342)||(16449908-16450138)
chr7 (112-342)||(39210933-39211163)
chr7 (115-342)||(2775365-2775592)
chr7 (112-338)||(18540802-18541028)
chr7 (115-338)||(5159525-5159748)
chr7 (115-290)||(31088426-31088601)
chr7 (115-290)||(45733466-45733641)
chr7 (118-219)||(26485756-26485857)
chr7 (247-342)||(4200685-4200780)
chr7 (247-308)||(26682944-26683005)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (91-338)||(7267-7514)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (91-338)||(28361942-28362189)
chr8 (91-338)||(31489737-31489984)
chr8 (91-338)||(19208347-19208594)
chr8 (85-338)||(19674416-19674669)
chr8 (91-342)||(16277535-16277786)
chr8 (91-342)||(19688079-19688330)
chr8 (91-342)||(27608888-27609139)
chr8 (91-338)||(31354505-31354752)
chr8 (94-342)||(14557608-14557856)
chr8 (91-342)||(2137242-2137493)
chr8 (115-342)||(18710591-18710818)
chr8 (91-338)||(33258704-33258951)
chr8 (91-342)||(16283430-16283681)
chr8 (91-342)||(12092707-12092958)
chr8 (116-338)||(19286468-19286690)
chr8 (116-338)||(3329494-3329716)
chr8 (116-342)||(29829328-29829554)
chr8 (115-290)||(9354627-9354802)
chr8 (180-342)||(22080861-22081023)
chr8 (112-290)||(44563103-44563281)
chr8 (7-290)||(19659074-19659351)
chr8 (115-290)||(33244670-33244845)
chr8 (277-342)||(189261-189326)
chr8 (118-182)||(19518280-19518344)
chr8 (7-53)||(44563004-44563050)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (91-338)||(10962650-10962897)
chr1 (91-338)||(28584961-28585208)
chr1 (91-338)||(41793336-41793583)
chr1 (91-338)||(51638198-51638445)
chr1 (97-342)||(16208055-16208300)
chr1 (94-342)||(20340359-20340607)
chr1 (112-342)||(28151863-28152093)
chr1 (112-341)||(20461082-20461311)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (91-338)||(9094-9341)
scaffold0159 (91-338)||(19996-20243)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (91-342)||(27273-27524)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (91-342)||(47009-47260)
scaffold0089 (91-342)||(40093-40344)
scaffold0089 (91-342)||(29744-29995)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (91-338)||(14958-15205)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (91-338)||(26229-26477)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (91-342)||(30434-30684)
scaffold0124 (112-341)||(20390-20619)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (91-342)||(153-405)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (115-338)||(9571-9794)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (116-342)||(6015-6246)
scaffold0415 (180-341)||(1942-2103)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (124-338)||(7963-8177)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (28-342)||(1-321)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (112-341)||(46829-47072)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (94-342)||(2682-2930)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (112-342)||(52-282)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (118-342)||(21569-21793)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (256-342)||(642-728)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 34279426 - 34279677
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279426 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 34279525  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279526 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 34279625  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279626 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 34279677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 34286331 - 34286582
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286331 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 34286430  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34286431 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcga 34286530  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286531 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 34286582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 34291391 - 34291642
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291391 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 34291490  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34291491 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcga 34291590  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291591 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 34291642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 34861657 - 34861904
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34861657 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 34861756  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861757 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 34861856  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34861857 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 34861904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37686173 - 37685926
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37686173 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 37686074  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686073 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 37685974  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37685973 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 37685926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37701438 - 37701191
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37701438 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 37701339  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701338 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 37701239  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37701238 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 37701191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21677446 - 21677199
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21677446 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 21677347  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677346 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 21677247  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21677246 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 21677199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 12655519 - 12655770
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12655519 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 12655618  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12655619 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 12655718  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655719 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 12655770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22926292 - 22926045
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22926292 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 22926193  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22926192 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 22926093  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22926092 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 22926045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23128830 - 23128579
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23128830 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 23128731  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23128730 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcga 23128631  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128630 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 23128579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 28882191 - 28882442
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28882191 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 28882290  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28882291 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 28882390  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882391 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 28882442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 32049775 - 32050026
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32049775 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 32049874  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049875 caactagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 32049974  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32049975 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 32050026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11635456 - 11635203
Alignment:
Q  85 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11635456 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 11635357  T
Q  185 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11635356 attgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatga 11635257  T
Q  285 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11635256 tgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagg 11635203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11641645 - 11641392
Alignment:
Q  85 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11641645 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 11641546  T
Q  185 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11641545 attgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatga 11641446  T
Q  285 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11641445 tgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagg 11641392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 37925470 - 37925717
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37925470 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 37925569  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925570 caactagacagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 37925669  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37925670 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 37925717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 20837895 - 20838146
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20837895 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 20837994  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20837995 caactagacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 20838094  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838095 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 20838146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27434708 - 27434457
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  27434708 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgta 27434609  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27434608 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 27434509  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434508 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 27434457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16829602 - 16829351
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16829602 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 16829503  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16829502 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 16829403  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16829402 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 16829351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 16891879 - 16892130
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16891879 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 16891978  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16891979 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 16892078  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16892079 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 16892130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19416763 - 19416516
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  19416763 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 19416664  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19416663 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 19416564  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19416563 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagg 19416516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 31876258 - 31876505
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31876258 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 31876357  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  31876358 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 31876457  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31876458 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 31876505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13936808 - 13936561
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  13936808 caacaacaacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgca 13936709  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13936708 cgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 13936609  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13936608 ggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagg 13936561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375389
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37375362  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37375363 gtgaagaagctcgttgatcagggaaag 37375389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 260984 - 260766
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  260984 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgt 260885  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  260884 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 260785  T
Q  324 gctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  260784 gctcattgatcagggaaag 260766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 39890075 - 39890298
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39890075 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 39890174  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39890175 ctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatat 39890274  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  39890275 cgtgaagaaactcattgatcaagg 39890298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12716869 - 12716615
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaa---gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcatt 187  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12716869 caacaacaacaacaacagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacact 12716770  T
Q  188 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgt 287  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12716769 gcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgt 12716670  T
Q  288 cgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12716669 cgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 12716615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 27777226 - 27777450
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27777226 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27777325  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27777326 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27777425  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  27777426 gaagaagctcattgatcagggaaag 27777450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 27816984 - 27817208
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27816984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27817083  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27817084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27817183  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  27817184 gaagaagctcattgatcagggaaag 27817208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233735
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 40233714  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40233715 gaagaagctcattgatcaagg 40233735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9350219 - 9349999
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| |    
T  9350219 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccgg 9350120  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9350119 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 9350020  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9350019 gaagaagctcattgatcaagg 9349999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 27803711 - 27803935
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27803711 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27803810  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27803811 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27803910  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  27803911 gaagaagctcattgatcagggaaag 27803935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39052059 - 39051835
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  39052059 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39051960  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39051959 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39051860  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  39051859 gaagaagctcattgatcagggaaag 39051835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Original strand, 12586814 - 12587034
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  12586814 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 12586913  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12586914 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 12587013  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12587014 gaagaagctcattgatcaagg 12587034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21703506 - 21703177
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || || || | || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||     
T  21703506 catcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaa- 21703408  T
Q  107 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaa 206  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||  ||    
T  21703407 -----caagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaa 21703313  T
Q  207 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttg 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || || || ||||||    
T  21703312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttg 21703213  T
Q  307 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21703212 aagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaag 21703177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31891670 - 31891342
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || ||| || || |||| ||| |||| ||| || |||     
T  31891670 catcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaa- 31891572  T
Q  107 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaa 206  Q
         |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||    
T  31891571 -----caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaa 31891477  T
Q  207 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttg 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||    
T  31891476 gcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttg 31891377  T
Q  307 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
    | ||| || || || || ||||| || ||||||||    
T  31891376 aggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 31891342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19456682 - 19456435
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  | |||||| || ||||    
T  19456682 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaa 19456583  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |     
T  19456582 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaga 19456483  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
     || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||    
T  19456482 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaa 19456435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 290
Target Start/End: Original strand, 27118686 - 27118864
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  27118686 caagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 27118785  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27118786 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcga 27118864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34303546 - 34303368
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  34303546 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 34303447  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  34303446 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 34303368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 27392973 - 27393197
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| || ||||| || |  | |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  27392973 agacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 27393072  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27393073 acccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 27393172  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||||||||| ||||||    
T  27393173 aaagaagctcattgatcagggaaag 27393197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Original strand, 3784655 - 3784830
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  3784655 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 3784754  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  3784755 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 3784830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Original strand, 34157012 - 34157187
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34157012 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 34157111  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  34157112 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 34157187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 286
Target Start/End: Original strand, 16163600 - 16163771
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  16163600 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16163699  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatg 286  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||    
T  16163700 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatg 16163771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9548715 - 9548464
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548715 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 9548616  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548615 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 9548516  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548515 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 9548464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15658932 - 15658681
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658932 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 15658833  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658832 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 15658733  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658732 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 15658681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 9317441 - 9317688
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9317441 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 9317540  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317541 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 9317640  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9317641 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 9317688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 12132145 - 12132392
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12132145 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 12132244  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132245 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 12132344  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12132345 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 12132392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 30152008 - 30152255
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30152008 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 30152107  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152108 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 30152207  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30152208 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 30152255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 2511041 - 2511288
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2511041 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 2511140  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2511141 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 2511240  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2511241 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 2511288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 5637900 - 5638147
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5637900 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 5637999  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5638000 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 5638099  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5638100 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 5638147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8665647 - 8665400
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8665647 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 8665548  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665547 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 8665448  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8665447 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 8665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15759029 - 15758782
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15759029 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 15758930  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758929 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 15758830  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15758829 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 15758782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23752622 - 23752371
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23752622 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 23752523  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752522 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 23752423  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752422 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 23752371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 11549344 - 11549595
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11549344 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 11549443  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11549444 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 11549543  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549544 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 11549595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22999286 - 22999035
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22999286 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgta 22999187  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999186 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 22999087  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999086 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 22999035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23718160 - 23717909
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23718160 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 23718061  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23718060 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 23717961  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717960 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 23717909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 26480382 - 26480629
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26480382 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 26480481  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26480482 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 26480581  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26480582 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 26480629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 30168459 - 30168706
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30168459 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 30168558  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30168559 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 30168658  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30168659 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 30168706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 6874289 - 6874542
Alignment:
Q  85 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6874289 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggc 6874388  T
Q  185 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6874389 attgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatga 6874488  T
Q  285 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6874489 cgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagg 6874542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 41674699 - 41674946
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674699 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 41674798  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41674799 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttga 41674898  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  41674899 ggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagg 41674946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 30934626 - 30934874
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30934626 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 30934725  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30934726 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 30934825  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934826 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 30934874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 33777477 - 33777728
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33777477 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 33777576  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33777577 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 33777676  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33777677 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 33777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18375584 - 18375337
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18375584 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgta 18375485  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18375484 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 18375385  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18375384 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 18375337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Original strand, 24970014 - 24970259
Alignment:
Q  97 caacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaacta 196  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24970014 caacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaacca 24970113  T
Q  197 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24970114 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtg 24970213  T
Q  297 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970214 ctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 24970259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24688329 - 24688078
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24688329 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 24688230  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  24688229 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcga 24688130  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24688129 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 24688078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500651
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18500678  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18500677 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 18500651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 33516346 - 33516597
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  33516346 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 33516445  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33516446 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 33516545  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33516546 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 33516597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649472
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 28649449  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28649450 gtgaagaagctcattgatcaagg 28649472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29967238 - 29966991
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  29967238 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 29967139  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29967138 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 29967039  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29967038 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 29966991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 30029405 - 30029652
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30029405 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 30029504  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  30029505 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 30029604  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30029605 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 30029652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34616755
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34616731  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  34616732 cgtgaagaaactcattgatcaagg 34616755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770908
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37770935  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37770934 atgaagaagctcattgatcagggaaag 37770908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 43078269 - 43078493
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43078269 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctg 43078368  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078369 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 43078468  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43078469 gaagaagctcgttgatcagggaaag 43078493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671404
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37671431  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37671430 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 37671404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755221
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37755194  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37755195 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 37755221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Original strand, 31431463 - 31431681
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31431463 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31431562  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431563 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31431662  T
Q  324 gctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  31431663 gctcattgatcagggaaag 31431681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31826552 - 31826332
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31826552 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 31826453  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 31826353  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31826352 gaagaagctcattgatcaagg 31826332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959711
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28959735  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  28959734 cgtgaagaaactcattgatcaagg 28959711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32599620 - 32599393
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  32599620 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 32599521  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599520 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32599421  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32599420 cgtgaagaagctcattgatcagggaaag 32599393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789778
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3789755  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  3789756 gtgaagaaactcattgatcaagg 3789778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37358815 - 37358568
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  37358815 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 37358716  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37358715 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcga 37358616  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37358615 ggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagg 37358568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681681
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24681556  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681557 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24681656  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  24681657 gaagaagctcattgatcagggaaag 24681681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724208
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24724083  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24724084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24724183  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  24724184 gaagaagctcattgatcagggaaag 24724208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40473694 - 40473470
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  40473694 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 40473595  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473594 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 40473495  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  40473494 gaagaagctcattgatcagggaaag 40473470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 23892115 - 23892447
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| || || ||||| | || ||| || ||||| |||||   |||||||||||||     
T  23892115 catcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttca---acaacaacaacaac 23892211  T
Q  107 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaa 206  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  23892212 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 23892311  T
Q  207 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttg 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | || |||||| ||    
T  23892312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctg 23892411  T
Q  307 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892412 aagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 23892447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324750
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
     || || || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 13324777  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13324776 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 13324750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 22888382 - 22888711
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||  | || ||||| | || ||| || ||||||||||| |||||||| || |||     
T  22888382 catcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaa- 22888480  T
Q  107 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaa 206  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||| || | |  |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  22888481 -----caagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 22888575  T
Q  207 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttg 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||||    
T  22888576 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 22888675  T
Q  307 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22888676 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 22888711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29889233 - 29889003
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||  | || |||||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||||| |    
T  29889233 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctc 29889134  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  29889133 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagta 29889034  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889033 catcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 29889003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 25199022 - 25199270
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  25199022 caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 25199121  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  25199122 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 25199221  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25199222 atgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 25199270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 11325808 - 11326035
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11325808 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 11325907  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  11325908 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 11326007  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||    
T  11326008 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 11326035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 33877261 - 33877488
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33877261 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33877360  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||    
T  33877361 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 33877460  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||    
T  33877461 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 33877488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 33292539 - 33292762
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  33292539 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 33292638  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  33292639 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 33292738  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| |||||||| || ||||||||    
T  33292739 cgtcaagaagcttatagatcaagg 33292762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13184796 - 13184621
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13184796 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13184697  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  13184696 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 13184621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13440642 - 13440467
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13440642 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13440543  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  13440542 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 13440467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27272876 - 27272551
Alignment:
Q  13 tatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaaatcagc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27272876 tatcctttgccatcaggaccacctcaagtacctgtgaatgctattgtgcagcagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacaacagaatcagc 27272777  T
Q  113 aagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccccc 212  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27272776 aagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagccccc 27272677  T
Q  213 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtat 312  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27272676 acctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtat 27272577  T
Q  313 atcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  27272576 atcgtgaaaaagctcatcgatcaagg 27272551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 16749832 - 16750083
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16749832 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 16749931  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16749932 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 16750031  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750032 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 16750083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24304836 - 24304585
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24304836 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 24304737  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24304736 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcga 24304637  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304636 ggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 24304585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 24863695 - 24863946
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24863695 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 24863794  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24863795 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 24863894  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863895 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 24863946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 27000051 - 27000302
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27000051 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 27000150  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27000151 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 27000250  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27000251 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 27000302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15424534 - 15424284
Alignment:
Q  92 aacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424534 aacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtac 15424435  T
Q  192 aactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgag 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15424434 aactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgag 15424335  T
Q  292 gggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15424334 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 15424284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13299169 - 13298918
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13299169 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 13299070  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13299069 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcga 13298970  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298969 gggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 13298918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 26918358 - 26918609
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26918358 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 26918457  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26918458 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 26918557  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26918558 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaag 26918609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 26988979 - 26989230
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26988979 caacaacatcaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgta 26989078  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26989079 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 26989178  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26989179 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaag 26989230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22935095 - 22934847
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22935095 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 22934996  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22934995 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 22934896  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934895 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 22934847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23857540 - 23857292
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23857540 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 23857441  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23857440 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 23857341  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857340 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 23857292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 29572991 - 29573238
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  29572991 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgca 29573090  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29573091 cgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 29573190  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29573191 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 29573238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 29549477 - 29549704
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549477 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 29549576  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549577 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29549676  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549677 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 29549704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30558234 - 30557983
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30558234 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 30558135  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30558134 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 30558035  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30558034 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 30557983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4757993
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 4757966  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4757967 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 4757993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16944245 - 16943998
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16944245 caacagcaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 16944146  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  16944145 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 16944046  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16944045 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 16943998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696306
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 3696285  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3696286 gaagaagctcattgatcaagg 3696306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34463537 - 34463313
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || |||||||||||||    
T  34463537 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctg 34463438  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34463338  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  34463337 gaagaagctcattgatcagggaaag 34463313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27360210 - 27359959
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  27360210 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 27360111  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27360110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 27360011  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27360010 gggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 27359959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27450553 - 27450302
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  27450553 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 27450454  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27450453 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 27450354  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27450353 gggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 27450302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4545960 - 4545742
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545960 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4545861  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545860 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4545761  T
Q  324 gctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  4545760 gctcattgatcagggaaag 4545742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773235
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4773208  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4773209 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 4773235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26777809 - 26777586
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26777809 gctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 26777710  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777709 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26777610  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  26777609 cgtgaagaaactcattgatcaagg 26777586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044613
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggt-gttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatat 27044589  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  27044590 cgtgaagaaactcattgatcaagg 27044613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525515
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 4525488  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4525489 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 4525515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116377
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 26116404  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26116403 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 26116377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27007956
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27007929  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||    
T  27007930 gtgaagaagctcattgaccagggaaag 27007956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674364
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16674343  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16674344 gaagaagctcattgatcaagg 16674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 27485107 - 27485354
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27485107 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 27485206  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27485207 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcga 27485306  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27485307 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagg 27485354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4724319 - 4724101
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4724319 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 4724220  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724219 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4724120  T
Q  324 gctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  4724119 actcattgatcagggaaag 4724101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 29501418 - 29501640
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29501418 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 29501517  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501518 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 29501617  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  29501618 gtgaagaaactcattgatcaagg 29501640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Original strand, 28207465 - 28207679
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  28207465 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 28207564  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28207565 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 28207664  T
Q  324 gctcattgatcaagg 338  Q
     ||||||||||||||    
T  28207665 actcattgatcaagg 28207679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27630014 - 27629667
Alignment:
Q  1 ttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27630014 ttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaac 27629915  T
Q  101 aacaaaatcagcaa------gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 194  Q
    | ||| | |||||       ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27629914 agcaacaacagcagcattttgctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgac 27629815  T
Q  195 tagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggg 294  Q
    ||| ||||||| ||| || || ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| || || ||| ||    
T  27629814 taggcagggtaggcctccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagagg 27629715  T
Q  295 tgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||| |||||||||    
T  27629714 tgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaag 27629667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025506
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
     || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 17025479  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17025480 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 17025506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22172236 - 22171914
Alignment:
Q  1 ttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaac 100  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || |  || || ||||||| ||| ||||||||||    
T  22172236 ttttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaac 22172137  T
Q  101 aacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagaca 200  Q
    | |||      ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||    
T  22172136 agcaa------caaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggca 22172043  T
Q  201 gggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttat 300  Q
     || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||    
T  22172042 aggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctat 22171943  T
Q  301 gctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 329  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22171942 gctttgaagtatattgtgaaaaagctcat 22171914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 20160682 - 20160917
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20160682 caacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaa 20160781  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | || || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  20160782 ccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagg 20160881  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 329  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20160882 gtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcat 20160917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14143482 - 14143252
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |    
T  14143482 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 14143383  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  14143382 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 14143283  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  14143282 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 14143252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Original strand, 26787943 - 26788173
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |    
T  26787943 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 26788042  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  26788043 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26788142  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  26788143 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 26788173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Original strand, 27196316 - 27196546
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |    
T  27196316 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27196415  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  27196416 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27196515  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  27196516 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 27196546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27252924 - 27252694
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |    
T  27252924 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27252825  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  27252824 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27252725  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  27252724 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 27252694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290337
Alignment:
Q  113 aagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccccc 212  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  213 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtat 312  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||     
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtac 27290367  T
Q  313 atcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27290366 attgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 27290337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22477566 - 22477240
Alignment:
Q  13 tatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaaatcagc 112  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || || | || ||| ||  |||| ||||| ||||||| ||||||    || |    
T  22477566 tatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacag---caac 22477470  T
Q  113 aagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccccc 212  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||| || || || || ||| |||| |  | | |||| || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  22477469 aagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctcc 22477370  T
Q  213 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtat 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| |||||     
T  22477369 acctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtac 22477270  T
Q  313 atcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||    
T  22477269 attgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13522267 - 13522040
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13522267 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13522168  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||    
T  13522167 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 13522068  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||    
T  13522067 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 13522040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22457152 - 22456901
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||| || || || || ||| |||| |  | | |||| || |    
T  22457152 caacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcactgca 22457053  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22457052 caaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcga 22456953  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  22456952 aggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22456901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8892504 - 8892329
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  8892504 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8892405  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8892404 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 8892329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8903739 - 8903564
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  8903739 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8903640  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8903639 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 8903564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Original strand, 28162557 - 28162833
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || ||| || || |||| ||| |||| ||| || |||     
T  28162557 catcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaa- 28162655  T
Q  107 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaa 206  Q
         |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||    
T  28162656 -----caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaa 28162750  T
Q  207 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 289  Q
    ||| |||| |||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||    
T  28162751 gcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcg 28162833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33374450 - 33374275
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33374450 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33374351  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  33374350 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 33374275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14763579 - 14763328
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763579 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 14763480  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14763479 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 14763380  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14763379 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 14763328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 5005863 - 5006116
Alignment:
Q  85 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5005863 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 5005962  T
Q  185 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 284  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5005963 attgtacaactagacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatga 5006062  T
Q  285 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5006063 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 5006116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27163592 - 27163345
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27163592 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 27163493  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163492 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 27163393  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27163392 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagg 27163345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 14665014 - 14665265
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14665014 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgta 14665113  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14665114 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 14665213  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665214 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 14665265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40105913 - 40105666
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40105913 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgta 40105814  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40105813 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 40105714  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40105713 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 40105666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24592586 - 24592338
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24592586 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 24592487  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24592486 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 24592387  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592386 gtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 24592338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 6569849 - 6570096
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6569849 caacagcaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 6569948  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6569949 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcga 6570048  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570049 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 6570096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 17013996 - 17014247
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17013996 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgta 17014095  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17014096 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 17014195  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014196 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 17014247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 14098537 - 14098784
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14098537 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 14098636  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14098637 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 14098736  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098737 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 14098784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31126793 - 31126542
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31126793 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgta 31126694  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31126693 caactagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 31126594  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31126593 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 31126542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800641
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18800664  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18800663 gtgaagaagctcattgatcaagg 18800641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833630
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 54833607  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  54833608 gtgaagaaactcattgatcaagg 54833630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30753997
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30753976  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  30753977 gaagaaactcattgatcaagg 30753997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344539
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 36344566  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36344565 gtgaagaagctcgttgatcagggaaag 36344539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33674046 - 33673822
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  33674046 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 33673947  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33673946 acccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 33673847  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  33673846 gaagaagctcattgatcagggaaag 33673822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 21969697 - 21969948
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21969697 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 21969796  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21969797 cgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 21969896  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21969897 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 21969948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 39850661 - 39850885
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  39850661 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39850760  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39850761 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39850860  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  39850861 gaagaagctcgttgatcagggaaag 39850885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 15227788 - 15228117
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| | || ||||| | || ||| || ||||||| |||      |||||||||      
T  15227788 catcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctca------acaacaacagc 15227881  T
Q  107 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaa 206  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15227882 agcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaa 15227981  T
Q  207 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttg 306  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||    
T  15227982 gcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttg 15228081  T
Q  307 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15228082 aagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaag 15228117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 342
Target Start/End: Original strand, 1900175 - 1900504
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||| | || ||| || ||||||||||| || |||||||| |||     
T  1900175 catcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaa- 1900273  T
Q  107 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaa 206  Q
         |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  1900274 -----caagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaa 1900368  T
Q  207 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttg 306  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||  |||||    
T  1900369 gcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttg 1900468  T
Q  307 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1900469 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 1900504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15285200 - 15284953
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  15285200 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 15285101  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  15285100 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 15285001  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
     || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||    
T  15285000 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaa 15284953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34189211 - 34188988
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  34189211 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 34189112  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  34189111 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 34189012  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| |||||||| || ||||||||    
T  34189011 cgtcaagaagcttatagatcaagg 34188988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 24112682 - 24112905
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  24112682 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 24112781  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  24112782 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 24112881  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| |||||||| || ||||||||    
T  24112882 cgtcaagaagcttatagatcaagg 24112905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24460856 - 24460681
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24460856 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 24460757  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  24460756 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 24460681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14235779 - 14235549
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||| | || |  | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  14235779 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctc 14235680  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||| | || |||||||| ||||||   |  || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||     
T  14235679 cacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagtt 14235580  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || || ||||||||||| || || ||||||    
T  14235579 cattgtaaagaagctcatagaccagggaaag 14235549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15391586 - 15391372
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| | || || || ||||| || ||||| || |  | |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  15391586 agacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccaccta 15391487  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  15391486 acccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 15391387  T
Q  318 gaagaagctcattga 332  Q
     ||||||||||||||    
T  15391386 aaagaagctcattga 15391372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28116276 - 28116019
Alignment:
Q  85 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28116276 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggc 28116177  T
Q  185 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28116176 attgtacaactagacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatga 28116077  T
Q  285 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28116076 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 28116019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 5713169 - 5713416
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713169 caacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5713268  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5713269 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5713368  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713369 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 5713416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 5724079 - 5724326
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724079 caacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5724178  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5724179 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5724278  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724279 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 5724326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5757398 - 5757151
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757398 caacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5757299  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5757298 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5757199  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757198 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 5757151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5768289 - 5768042
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768289 caacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5768190  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5768189 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5768090  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768089 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 5768042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 7073154 - 7073405
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073154 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 7073253  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073254 cgactagacaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 7073353  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073354 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 7073405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18277368 - 18277117
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277368 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 18277269  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18277268 caactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 18277169  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18277168 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 18277117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18292669 - 18292418
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292669 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 18292570  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18292569 caactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 18292470  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18292469 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 18292418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18307970 - 18307719
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307970 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 18307871  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18307870 caactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 18307771  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18307770 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 18307719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29149071 - 29148820
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29149071 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 29148972  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148971 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 29148872  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148871 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 29148820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 47023395 - 47023642
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47023395 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 47023494  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023495 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 47023594  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47023595 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 47023642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 4416855 - 4417112
Alignment:
Q  85 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4416855 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 4416954  T
Q  185 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 284  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4416955 attgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatga 4417054  T
Q  285 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4417055 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 4417112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 7996504 - 7996751
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7996504 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 7996603  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996604 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 7996703  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7996704 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 7996751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 10643012 - 10643259
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10643012 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 10643111  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643112 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 10643211  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10643212 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 10643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 6192258 - 6192509
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6192258 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 6192357  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192358 caaccagacagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 6192457  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192458 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 6192509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31964789 - 31964542
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31964789 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 31964690  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31964689 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 31964590  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31964589 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 31964542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 50134387 - 50134140
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50134387 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 50134288  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  50134287 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 50134188  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50134187 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 50134140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4796969 - 4796718
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4796969 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 4796870  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4796869 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 4796770  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4796769 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 4796718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5609638 - 5609391
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5609638 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 5609539  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5609538 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 5609439  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5609438 agggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 5609391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 28339244 - 28339491
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28339244 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 28339343  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  28339344 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcga 28339443  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28339444 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 28339491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 35880708 - 35880959
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35880708 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 35880807  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35880808 caaccaaacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcga 35880907  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35880908 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 35880959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 10396075 - 10396322
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  10396075 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgca 10396174  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396175 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 10396274  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396275 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 10396322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15741410 - 15741159
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15741410 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 15741311  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15741310 caaccagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcga 15741211  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741210 gggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 15741159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 18330611 - 18330862
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  18330611 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgta 18330710  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18330711 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 18330810  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330811 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 18330862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 8295917 - 8296165
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8295917 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaa 8296016  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8296017 ccagacagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggg 8296116  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296117 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 8296165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8301580 - 8301332
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8301580 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 8301481  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8301480 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggg 8301381  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301380 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 8301332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 4721573 - 4721824
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4721573 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 4721672  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4721673 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 4721772  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4721773 ggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaag 4721824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 21674635 - 21674882
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21674635 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgta 21674734  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21674735 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 21674834  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674835 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 21674882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 18051204 - 18051455
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  18051204 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgta 18051303  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18051304 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 18051403  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051404 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 18051455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15893022 - 15892771
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15893022 caacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 15892923  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15892922 caaccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 15892823  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892822 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 15892771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 5013654 - 5013901
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5013654 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 5013753  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5013754 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 5013853  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5013854 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 5013901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 18225133 - 18225380
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  18225133 caacaacaacaacaaaatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 18225232  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18225233 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 18225332  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18225333 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 18225380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 24328101 - 24328348
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  24328101 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 24328200  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328201 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 24328300  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24328301 ggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 24328348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17985272 - 17985025
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17985272 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgta 17985173  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17985172 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 17985073  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17985072 gggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 17985025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387643
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22387671  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387670 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 22387643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 48465896 - 48466120
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  48465896 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 48465995  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 48466095  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48466096 gaagaagctcattgatcaaggaaag 48466120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22870921
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22870949  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22870948 cgtgaagaagctcattgatcagggaaag 22870921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22885980
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22886008  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22886007 cgtgaagaagctcattgatcagggaaag 22885980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346752
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4346780  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4346779 cgtgaagaagctcattgatcagggaaag 4346752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542527
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 6542554  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6542553 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 6542527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Original strand, 8211713 - 8211927
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8211713 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 8211812  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211813 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8211912  T
Q  324 gctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||    
T  8211913 gctcattgatcaagg 8211927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 117 - 338
Target Start/End: Original strand, 5466953 - 5467174
Alignment:
Q  117 tagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacct 216  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5466953 tagaccaacttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacct 5467052  T
Q  217 gatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5467053 gatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcg 5467152  T
Q  317 tgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5467153 tgaagaagctcattgatcaagg 5467174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110414
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 11110439  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  11110438 gaagaagctcattgatcagggaaag 11110414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 18242681 - 18242928
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18242681 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 18242780  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18242781 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcga 18242880  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18242881 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagg 18242928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021464
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28021440  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28021441 cgtgaagaagctcattgatcaagg 28021464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5596648 - 5596426
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5596648 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 5596549  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596548 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 5596449  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  5596448 gtgaagaaactcattgatcaagg 5596426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36997366 - 36997146
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36997366 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 36997267  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 36997167  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36997166 gaagaagctcattgatcaagg 36997146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Original strand, 51781998 - 51782216
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51781998 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 51782097  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51782098 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 51782197  T
Q  324 gctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  51782198 gctcatcgatcagggaaag 51782216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Original strand, 51797087 - 51797306
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51797087 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 51797186  T
Q  224 tgcctc-caaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaaga 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51797187 tgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaaga 51797286  T
Q  323 agctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  51797287 agctcatcgatcagggaaag 51797306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20577136 - 20576912
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20577136 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 20577037  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20577036 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 20576937  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  20576936 gaagaagctcattgatcagggaaag 20576912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29665259 - 29665035
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  29665259 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 29665160  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29665159 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29665060  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  29665059 gaagaagctcattgatcagggaaag 29665035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31034409 - 31034182
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||    
T  31034409 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 31034310  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  31034309 ctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 31034210  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||    
T  31034209 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 31034182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Original strand, 32292715 - 32292945
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||| | |    
T  32292715 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctc 32292814  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  32292815 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 32292914  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  32292915 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 32292945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 341
Target Start/End: Original strand, 18530351 - 18530580
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |  ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  18530351 caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 18530450  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  18530451 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 18530550  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
     || || || |||||||| || ||||||||    
T  18530551 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaa 18530580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16626819 - 16626572
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16626819 caacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaa 16626720  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  16626719 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagg 16626620  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
     || || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||    
T  16626619 atgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaa 16626572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 32439120 - 32439343
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  32439120 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 32439219  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  32439220 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 32439319  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| |||||||| || ||||||||    
T  32439320 cgtcaagaagcttatagatcaagg 32439343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 20066010 - 20066232
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  20066010 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
     |  || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||    
T  20066110 gggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatc 20066209  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    || |||||||| || ||||||||    
T  20066210 gtcaagaagcttatagatcaagg 20066232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Original strand, 5652353 - 5652528
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||  | |||||| || ||||| |||||||| |||||  |||    
T  5652353 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcac 5652452  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5652453 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcga 5652528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17994076 - 17993901
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  17994076 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 17993977  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  17993976 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 17993901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Original strand, 4625910 - 4626085
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4625910 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 4626009  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  4626010 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 4626085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 326
Target Start/End: Original strand, 4893176 - 4893387
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||    
T  4893176 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccac 4893275  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    | || || || ||||||||||||   |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  4893276 cggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T
Q  315 cgtgaagaagct 326  Q
    ||| ||||||||    
T  4893376 cgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5147501 - 5147250
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147501 caacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 5147402  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5147401 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 5147302  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5147301 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 5147250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4145284 - 4145037
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4145284 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 4145185  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145184 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 4145085  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4145084 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 4145037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26320030 - 26319783
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26320030 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 26319931  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319930 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 26319831  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26319830 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 26319783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16736621 - 16736374
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736621 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 16736522  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16736521 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcga 16736422  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736421 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 16736374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16751675 - 16751428
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751675 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 16751576  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16751575 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcga 16751476  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751475 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 16751428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 17523514 - 17523761
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523514 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 17523613  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17523614 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcga 17523713  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523714 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 17523761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17529701 - 17529454
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529701 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgta 17529602  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17529601 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcga 17529502  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529501 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 17529454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26275255 - 26275008
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26275255 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 26275156  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275155 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 26275056  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26275055 gggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 26275008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 45387325 - 45387572
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45387325 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 45387424  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387425 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 45387524  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45387525 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 45387572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 9618633 - 9618880
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9618633 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 9618732  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9618733 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 9618832  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9618833 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 9618880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26670075 - 26669828
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26670075 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 26669976  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26669975 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 26669876  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26669875 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 26669828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 5127974 - 5128225
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5127974 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 5128073  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128074 caaccagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 5128173  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128174 gggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 5128225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11424937 - 11424686
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11424937 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgca 11424838  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11424837 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 11424738  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424737 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 11424686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10917026 - 10916778
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10917026 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 10916927  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10916926 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 10916827  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916826 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 10916778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 2154555 - 2154806
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2154555 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 2154654  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154655 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcga 2154754  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154755 gggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 2154806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16503541 - 16503290
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16503541 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 16503442  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16503441 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 16503342  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503341 ggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 16503290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16518577 - 16518326
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16518577 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 16518478  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16518477 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 16518378  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518377 ggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 16518326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 26435239 - 26435490
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26435239 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 26435338  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26435339 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 26435438  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26435439 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 26435490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24592702 - 24592455
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  24592702 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 24592603  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24592602 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 24592503  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24592502 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 24592455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564300
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31564327  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31564326 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 31564300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26538004 - 26537784
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  26538004 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctg 26537905  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26537904 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26537805  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26537804 gaagaagctcattgatcaagg 26537784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 118 - 338
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445535
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 3445514  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3445515 gaagaagctcattgatcaagg 3445535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 31124902 - 31125149
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||  | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31124902 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 31125001  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31125002 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcga 31125101  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31125102 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagg 31125149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Original strand, 11441587 - 11441801
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11441587 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 11441686  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11441687 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11441786  T
Q  324 gctcattgatcaagg 338  Q
    |||||| ||||||||    
T  11441787 gctcatcgatcaagg 11441801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2109145 - 2108915
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |    
T  2109145 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 2109046  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  2109045 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 2108946  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  2108945 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 2108915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Original strand, 26484697 - 26484927
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |    
T  26484697 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 26484796  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  26484797 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26484896  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  26484897 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 26484927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 16041308 - 16041556
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  16041308 caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaa 16041407  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||    
T  16041408 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaagg 16041507  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16041508 atgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaag 16041556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16450138 - 16449908
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  16450138 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16450039  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  16450038 cacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 16449939  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16449938 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaag 16449908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39211163 - 39210933
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||  |    
T  39211163 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttc 39211064  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  39211063 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 39210964  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  39210963 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 39210933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775592
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| | ||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | ||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 2775564  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||    
T  2775565 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 2775592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 338
Target Start/End: Original strand, 18540802 - 18541028
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |    
T  18540802 caagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 18540901  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    |||| || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||    
T  18540902 caccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagta 18541001  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||    
T  18541002 catcgtcaagaagcttatagatcaagg 18541028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 5159525 - 5159748
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  5159525 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 5159624  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    | || || || |||||||||||| | |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||| ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||    
T  5159625 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacat 5159724  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||| |||||||| || ||||||||    
T  5159725 cgtcaagaagcttatagatcaagg 5159748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31088601 - 31088426
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  31088601 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 31088502  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  31088501 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 31088426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Original strand, 45733466 - 45733641
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||   |||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  45733466 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 45733565  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  45733566 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 45733641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26485857 - 26485756
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  26485857 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 26485758  T
Q  218 at 219  Q
    ||    
T  26485757 at 26485756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Original strand, 4200685 - 4200780
Alignment:
Q  247 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||  | || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  4200685 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 4200780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26683005 - 26682944
Alignment:
Q  247 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaa 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  26683005 ctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaa 26682944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7514 - 7267
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7514 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 7415  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7414 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 7315  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7314 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28362189 - 28361942
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28362189 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 28362090  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28362089 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 28361990  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28361989 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 28361942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31489984 - 31489737
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31489984 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 31489885  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31489884 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 31489785  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31489784 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 31489737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19208594 - 19208347
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19208594 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 19208495  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19208494 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 19208395  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19208394 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 19208347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 19674416 - 19674669
Alignment:
Q  85 gttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggc 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19674416 gttcaacaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 19674515  T
Q  185 attgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatga 284  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19674516 attgtacaactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatga 19674615  T
Q  285 tgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19674616 tgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagg 19674669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 16277535 - 16277786
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16277535 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgta 16277634  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16277635 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 16277734  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277735 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 16277786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 19688079 - 19688330
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19688079 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 19688178  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19688179 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcga 19688278  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19688279 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 19688330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27609139 - 27608888
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27609139 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 27609040  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27609039 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 27608940  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608939 gggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 27608888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 31354505 - 31354752
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31354505 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 31354604  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31354605 caactagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 31354704  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31354705 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 31354752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Original strand, 14557608 - 14557856
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14557608 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 14557707  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14557708 ccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggg 14557807  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557808 gtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 14557856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2137493 - 2137242
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2137493 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 2137394  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  2137393 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcga 2137294  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2137293 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 2137242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 18710591 - 18710818
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18710591 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcac 18710690  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18710691 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 18710790  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710791 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 18710818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 33258704 - 33258951
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  33258704 caacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 33258803  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  33258804 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 33258903  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33258904 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 33258951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 16283430 - 16283681
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  16283430 caacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgta 16283529  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  16283530 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcga 16283629  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283630 agggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 16283681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12092958 - 12092707
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  12092958 caacaacaacagcaacagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 12092859  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12092858 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcga 12092759  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12092758 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 12092707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286690
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 19286667  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19286668 gtgaagaaactcattgatcaagg 19286690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329494
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3329517  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  3329516 gtgaagaagctcgttgatcaagg 3329494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 29829328 - 29829554
Alignment:
Q  116 ctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacc 215  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29829328 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacc 29829427  T
Q  216 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 315  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29829428 tgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 29829527  T
Q  316 gtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29829528 gtgaagaagctcattgatcagggaaag 29829554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Original strand, 9354627 - 9354802
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9354627 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 9354726  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||    
T  9354727 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcga 9354802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22081023 - 22080861
Alignment:
Q  180 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 279  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  22081023 agggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 22080924  T
Q  280 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||    
T  22080923 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaag 22080861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 290
Target Start/End: Original strand, 44563103 - 44563281
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  44563103 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 44563202  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||| | |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  44563203 cacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 44563281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19659351 - 19659074
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || ||| ||||| |||| ||| |||| ||| || |||     
T  19659351 catcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaa- 19659253  T
Q  107 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaa 206  Q
         || ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||  || ||||| |||||||| ||    
T  19659252 -----caggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaa 19659158  T
Q  207 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||| |||||||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  19659157 gcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcga 19659074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 290
Target Start/End: Original strand, 33244670 - 33244845
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| || || ||| |||| |  | |||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  33244670 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 33244769  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33244770 ctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcga 33244845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Original strand, 189261 - 189326
Alignment:
Q  277 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  189261 ggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaag 189326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19518344 - 19518280
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagg 182  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19518344 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 19518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Original strand, 44563004 - 44563050
Alignment:
Q  7 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 53  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  44563004 catcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgc 44563050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 10962650 - 10962897
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10962650 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgta 10962749  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10962750 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcga 10962849  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10962850 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 10962897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 28584961 - 28585208
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28584961 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 28585060  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  28585061 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcga 28585160  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28585161 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 28585208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41793583 - 41793336
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41793583 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 41793484  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41793483 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 41793384  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41793383 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagg 41793336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 51638198 - 51638445
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  51638198 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgta 51638297  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51638298 cgactaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 51638397  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51638398 ggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagg 51638445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16208300 - 16208055
Alignment:
Q  97 caacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaacta 196  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |    
T  16208300 caacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 16208201  T
Q  197 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 296  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  16208200 gacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 16208101  T
Q  297 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16208100 ctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 16208055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20340607 - 20340359
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||  | || |||||| |||| |  |||||||| |  ||||    
T  20340607 caacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaa 20340508  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  20340507 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 20340408  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  20340407 atgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 20340359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Original strand, 28151863 - 28152093
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |    
T  28151863 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 28151962  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  28151963 cacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 28152062  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  28152063 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 28152093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 341
Target Start/End: Original strand, 20461082 - 20461311
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  20461082 caagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20461181  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  20461182 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20461281  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
     || || || |||||||| || ||||||||    
T  20461282 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaa 20461311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9341 - 9094
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9341 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 9242  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 9142  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9141 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 9094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Original strand, 19996 - 20243
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19996 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 20095  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20096 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 20195  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20196 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 20243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 27273 - 27524
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27273 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 27372  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27373 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 27472  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27473 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaag 27524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47260 - 47009
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  47260 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgta 47161  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47160 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 47061  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47060 ggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 47009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40344 - 40093
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40344 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 40245  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40244 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcga 40145  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40144 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaag 40093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 29744 - 29995
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29744 caacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgta 29843  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29844 caaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcga 29943  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29944 ggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 29995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15205 - 14958
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15205 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgta 15106  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15105 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcga 15006  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15005 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 14958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 91 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26477 - 26229
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26477 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgta 26378  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaa-ggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 26278  T
Q  290 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26277 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagg 26229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Original strand, 30434 - 30684
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30434 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttcc-tcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgta 30532  T
Q  191 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcga 290  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30533 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcga 30632  T
Q  291 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30633 ggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 30684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 341
Target Start/End: Original strand, 20390 - 20619
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  20390 caagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20489  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  20490 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20589  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20590 cattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 20619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 405 - 153
Alignment:
Q  91 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaa-ttgcttccaactttactccaaagagggcattgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  405 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgt 306  T
Q  190 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 289  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  305 acaaccagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcg 206  T
Q  290 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  205 aggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 115 - 338
Target Start/End: Original strand, 9571 - 9794
Alignment:
Q  115 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 214  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  215 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9770  T
Q  315 cgtgaagaagctcattgatcaagg 338  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9771 tgtgaagaagctcattgatcaagg 9794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6246
Alignment:
Q  116 ctagaccta-ctttccctccgataccgatgtt-atatgctgaattgcttccaacttt-actccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccccc 212  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  6015 ctagacctaacttttcctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccacc 6114  T
Q  213 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtga-ttttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgc-tttgaagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagt 6214  T
Q  311 atatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6215 atatcgtgaagaagctcattgatcagggaaag 6246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1942
Alignment:
Q  180 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggt 279  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  280 catgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 1942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 338
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8177
Alignment:
Q  124 actttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  7963 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 8062  T
Q  224 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8063 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 8162  T
Q  324 gctcattgatcaagg 338  Q
     ||||||||||||||    
T  8163 actcattgatcaagg 8177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 342
Target Start/End: Original strand, 1 - 321
Alignment:
Q  28 ggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcagcaacaacaacaacaaaatcagcaa------gctagac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||       ||||| |    
T  1 ggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacagcaacaacagcagcattttgctaggc 100  T
Q  122 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 221  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  101 ctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatcc 200  T
Q  222 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 321  Q
     || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||    
T  201 attaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccag 300  T
Q  322 aagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    | ||| ||||| |||||||||    
T  301 aggcttattgaccaaggaaag 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47072 - 46829
Alignment:
Q  112 caagctagacctacttt-ccctccgatacc-gatgttatatgctgaattgcttccaac---tttactccaaagaggg-cattgtacaac-tagacagggt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||     
T  47072 caagctagacctacttttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggc 46973  T
Q  205 aa--gcccccacctgatccgttgcctccaaggttca-ggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtc--atg-atgtcgaggggtgt- 297  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||      
T  46972 aaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcg 46873  T
Q  298 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 46829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2930 - 2682
Alignment:
Q  94 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaa 193  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||  | || |||||| |||| |  |||||||| |  ||||    
T  2930 caacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaa 2831  T
Q  194 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggg 293  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  2830 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaagg 2731  T
Q  294 gtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  2730 atgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 2682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 282 - 52
Alignment:
Q  112 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccc 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| ||  |||| ||||| || ||||| |    
T  282 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaaccagacatggcaagcctc 183  T
Q  212 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 311  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  182 cacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 83  T
Q  312 tatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  82 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaag 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 21569 - 21793
Alignment:
Q  118 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 217  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||  |||| || ||||| || |  | ||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||     
T  21569 agacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 21668  T
Q  218 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 317  Q
    | | ||||||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  21669 acctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgt 21768  T
Q  318 gaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
     |||||||||||||| || ||||||    
T  21769 aaagaagctcattgaccagggaaag 21793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 642
Alignment:
Q  256 gattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaag 342  Q
    ||||| ||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaag 642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University