View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7430_low_9 (Length: 262)

Name: NF7430_low_9
Description: NF7430
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7430_low_9
NF7430_low_9
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (28-262)||(19674184-19674418)
chr8 (32-262)||(16277300-16277530)
chr8 (32-262)||(2137498-2137728)
chr8 (32-262)||(27609144-27609374)
chr8 (32-262)||(14557373-14557603)
chr8 (28-262)||(19518378-19518612)
chr8 (28-262)||(19208595-19208829)
chr8 (28-262)||(3329754-3329988)
chr8 (28-262)||(19687844-19688078)
chr8 (28-255)||(33258476-33258703)
chr8 (28-262)||(29829059-29829293)
chr8 (28-262)||(31489985-31490219)
chr8 (28-262)||(28362190-28362424)
chr8 (28-262)||(18710332-18710566)
chr8 (28-262)||(12092968-12093202)
chr8 (49-262)||(19286211-19286424)
chr8 (28-261)||(16283196-16283429)
chr8 (49-262)||(31354270-31354483)
chr8 (56-258)||(22081135-22081337)
chr8 (62-183)||(19659305-19659426)
chr8 (62-183)||(44562929-44563050)
chr8 (62-183)||(9354450-9354571)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (28-262)||(28116274-28116508)
chr3 (28-262)||(4796970-4797204)
chr3 (32-262)||(4721338-4721568)
chr3 (28-262)||(7072919-7073153)
chr3 (32-262)||(35880473-35880703)
chr3 (28-262)||(7996269-7996503)
chr3 (28-262)||(10642777-10643011)
chr3 (32-262)||(6192023-6192253)
chr3 (28-262)||(47023160-47023394)
chr3 (28-262)||(11110678-11110912)
chr3 (32-262)||(18050969-18051199)
chr3 (32-262)||(21674400-21674630)
chr3 (49-262)||(15741420-15741633)
chr3 (32-262)||(18330381-18330606)
chr3 (28-262)||(20577179-20577413)
chr3 (28-262)||(6542791-6543025)
chr3 (32-262)||(8295682-8295912)
chr3 (28-262)||(24327866-24328100)
chr3 (28-262)||(29149072-29149306)
chr3 (28-262)||(29665302-29665536)
chr3 (28-262)||(36997406-36997640)
chr3 (28-262)||(17985273-17985507)
chr3 (28-262)||(28339009-28339243)
chr3 (28-262)||(31964790-31965024)
chr3 (28-262)||(50134388-50134622)
chr3 (49-262)||(20065753-20065966)
chr3 (28-262)||(4416623-4416857)
chr3 (28-262)||(5013419-5013653)
chr3 (28-262)||(5609639-5609873)
chr3 (28-262)||(18224898-18225132)
chr3 (28-262)||(22871191-22871425)
chr3 (28-262)||(22886250-22886484)
chr3 (28-262)||(51781718-51781952)
chr3 (28-261)||(15893023-15893256)
chr3 (28-255)||(51796814-51797041)
chr3 (28-262)||(48465622-48465856)
chr3 (32-262)||(8301585-8301815)
chr3 (28-262)||(18242434-18242668)
chr3 (49-262)||(10395843-10396056)
chr3 (28-262)||(18277369-18277603)
chr3 (28-262)||(18292670-18292904)
chr3 (28-262)||(18307971-18308205)
chr3 (49-262)||(8211448-8211661)
chr3 (49-262)||(5466692-5466905)
chr3 (49-262)||(4347022-4347235)
chr3 (62-262)||(5596717-5596917)
chr3 (49-261)||(28020986-28021198)
chr3 (28-183)||(5713013-5713168)
chr3 (28-183)||(5723923-5724078)
chr3 (28-183)||(5757399-5757554)
chr3 (28-183)||(5768290-5768445)
chr3 (62-258)||(18530108-18530304)
chr3 (49-262)||(4892920-4893133)
chr3 (49-262)||(22387913-22388126)
chr3 (49-262)||(32438864-32439077)
chr3 (62-258)||(16626854-16627049)
chr3 (62-183)||(17994132-17994253)
chr3 (63-183)||(4625733-4625853)
chr3 (62-183)||(5652176-5652297)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (28-262)||(26918123-26918357)
chr6 (28-262)||(26999816-27000050)
chr6 (28-262)||(16749597-16749831)
chr6 (32-262)||(26988744-26988974)
chr6 (32-262)||(15424540-15424770)
chr6 (28-262)||(3695806-3696040)
chr6 (37-262)||(24304846-24305071)
chr6 (32-262)||(13299174-13299404)
chr6 (28-262)||(29572756-29572990)
chr6 (28-262)||(34463580-34463814)
chr6 (28-262)||(16944246-16944480)
chr6 (28-262)||(24863460-24863694)
chr6 (28-262)||(27007455-27007689)
chr6 (28-262)||(27360229-27360463)
chr6 (28-262)||(27450572-27450806)
chr6 (28-262)||(4546003-4546237)
chr6 (28-262)||(4724362-4724596)
chr6 (28-262)||(4757504-4757738)
chr6 (28-262)||(4772740-4772974)
chr6 (28-262)||(17025005-17025239)
chr6 (28-262)||(27484860-27485094)
chr6 (28-262)||(28207185-28207419)
chr6 (28-262)||(30558235-30558469)
chr6 (28-262)||(16673870-16674104)
chr6 (28-262)||(26777846-26778080)
chr6 (28-262)||(26116638-26116872)
chr6 (28-261)||(22935096-22935329)
chr6 (28-261)||(23857541-23857774)
chr6 (49-262)||(29549221-29549434)
chr6 (49-262)||(27044133-27044346)
chr6 (62-262)||(29501149-29501349)
chr6 (49-262)||(4525032-4525245)
chr6 (37-209)||(22477501-22477673)
chr6 (56-213)||(20160496-20160653)
chr6 (56-213)||(22172178-22172335)
chr6 (62-183)||(13522323-13522444)
chr6 (62-183)||(28162482-28162603)
chr6 (62-183)||(33374506-33374627)
chr6 (62-183)||(8892560-8892681)
chr6 (62-183)||(8903795-8903916)
chr6 (48-141)||(27629948-27630041)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (28-262)||(13936809-13937043)
chr2 (28-262)||(11635454-11635688)
chr2 (28-262)||(11641643-11641877)
chr2 (28-262)||(34279191-34279425)
chr2 (28-262)||(21677447-21677681)
chr2 (32-262)||(28881956-28882186)
chr2 (28-262)||(32049540-32049774)
chr2 (28-262)||(34286096-34286330)
chr2 (28-262)||(34291156-34291390)
chr2 (32-261)||(23128835-23129064)
chr2 (28-262)||(12716870-12717104)
chr2 (28-262)||(37925235-37925469)
chr2 (32-262)||(261034-261264)
chr2 (28-262)||(39889804-39890038)
chr2 (28-262)||(12586543-12586777)
chr2 (28-262)||(27803434-27803668)
chr2 (28-262)||(31876023-31876257)
chr2 (28-262)||(34861422-34861656)
chr2 (28-262)||(37686174-37686408)
chr2 (28-262)||(37701439-37701673)
chr2 (28-262)||(40233241-40233475)
chr2 (28-262)||(9350259-9350493)
chr2 (32-262)||(12655284-12655514)
chr2 (28-262)||(19416764-19416998)
chr2 (28-262)||(22926293-22926527)
chr2 (28-262)||(27776949-27777183)
chr2 (28-262)||(27816716-27816950)
chr2 (32-262)||(20837660-20837890)
chr2 (28-262)||(16829603-16829837)
chr2 (28-262)||(16891644-16891878)
chr2 (28-261)||(27434709-27434942)
chr2 (28-262)||(39052093-39052327)
chr2 (63-262)||(37374903-37375102)
chr2 (62-258)||(21703460-21703656)
chr2 (62-258)||(19456717-19456913)
chr2 (62-183)||(31891624-31891745)
chr2 (62-183)||(3784478-3784599)
chr2 (62-183)||(27118512-27118633)
chr2 (37-258)||(27392739-27392960)
chr2 (62-183)||(34156835-34156956)
chr2 (63-183)||(34303600-34303720)
chr2 (62-183)||(16163423-16163544)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (31-262)||(9548719-9548950)
chr5 (28-262)||(33777242-33777476)
chr5 (28-262)||(41674464-41674698)
chr5 (32-262)||(23718165-23718395)
chr5 (32-262)||(23752627-23752857)
chr5 (28-262)||(8665648-8665882)
chr5 (28-262)||(15658933-15659167)
chr5 (32-262)||(11549109-11549339)
chr5 (28-262)||(18500921-18501155)
chr5 (32-262)||(22999291-22999521)
chr5 (28-262)||(24681192-24681426)
chr5 (28-262)||(24723719-24723953)
chr5 (28-262)||(31431183-31431417)
chr5 (28-262)||(5637665-5637899)
chr5 (28-262)||(9317206-9317440)
chr5 (28-262)||(12131910-12132144)
chr5 (32-262)||(24688334-24688564)
chr5 (28-262)||(26480147-26480381)
chr5 (28-262)||(31826592-31826826)
chr5 (28-262)||(37358828-37359062)
chr5 (28-262)||(43078004-43078238)
chr5 (28-262)||(6874057-6874291)
chr5 (28-262)||(28648981-28649215)
chr5 (28-262)||(29967239-29967473)
chr5 (28-262)||(30029170-30029404)
chr5 (28-262)||(30168224-30168458)
chr5 (32-262)||(30934391-30934621)
chr5 (28-262)||(37671665-37671899)
chr5 (28-262)||(3789281-3789515)
chr5 (28-262)||(13325017-13325251)
chr5 (28-262)||(15759030-15759264)
chr5 (28-262)||(18375585-18375819)
chr5 (28-262)||(30151773-30152007)
chr5 (28-262)||(37754723-37754957)
chr5 (28-262)||(2510806-2511040)
chr5 (28-262)||(33516111-33516345)
chr5 (28-262)||(37771172-37771406)
chr5 (32-262)||(28959975-28960205)
chr5 (28-262)||(40473725-40473959)
chr5 (62-262)||(32599676-32599876)
chr5 (49-262)||(34616276-34616489)
chr5 (62-261)||(23891962-23892161)
chr5 (28-171)||(24969870-24970013)
chr5 (72-261)||(25198788-25198977)
chr5 (176-261)||(24951866-24951951)
chr5 (49-262)||(33292283-33292496)
chr5 (62-203)||(22888287-22888428)
chr5 (62-183)||(13184852-13184973)
chr5 (62-183)||(13440698-13440819)
chr5 (62-183)||(33877084-33877205)
chr5 (62-183)||(11325631-11325752)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (28-262)||(406-640)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (28-262)||(5127739-5127973)
chr7 (28-262)||(16736622-16736856)
chr7 (28-262)||(16751676-16751910)
chr7 (28-262)||(17523279-17523513)
chr7 (28-262)||(17529702-17529936)
chr7 (28-262)||(45387090-45387324)
chr7 (28-262)||(2154320-2154554)
chr7 (28-262)||(11441307-11441541)
chr7 (32-262)||(26435004-26435234)
chr7 (31-262)||(5147505-5147736)
chr7 (32-262)||(11424942-11425172)
chr7 (32-262)||(10917031-10917261)
chr7 (28-262)||(24592703-24592937)
chr7 (28-262)||(26275256-26275490)
chr7 (28-262)||(26320031-26320265)
chr7 (28-262)||(3445041-3445275)
chr7 (28-262)||(9618398-9618632)
chr7 (28-262)||(31564561-31564795)
chr7 (32-262)||(26485910-26486140)
chr7 (28-262)||(26538035-26538269)
chr7 (28-262)||(26670076-26670310)
chr7 (28-262)||(31124658-31124892)
chr7 (28-261)||(16503542-16503775)
chr7 (28-261)||(16518578-16518811)
chr7 (49-262)||(4145306-4145519)
chr7 (68-258)||(16041077-16041267)
chr7 (70-258)||(16450199-16450387)
chr7 (49-262)||(5159269-5159482)
chr7 (62-183)||(31088657-31088778)
chr7 (62-183)||(45733289-45733410)
chr7 (206-241)||(22143423-22143458)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (28-262)||(5005631-5005865)
chr4 (32-262)||(6569614-6569844)
chr4 (28-262)||(24592587-24592821)
chr4 (28-262)||(27163593-27163827)
chr4 (28-262)||(30753503-30753737)
chr4 (32-262)||(17013761-17013991)
chr4 (28-262)||(21969462-21969696)
chr4 (28-262)||(18800898-18801132)
chr4 (28-262)||(14098302-14098536)
chr4 (32-262)||(14664779-14665009)
chr4 (28-262)||(33674086-33674320)
chr4 (28-260)||(40105914-40106146)
chr4 (28-262)||(31126794-31127028)
chr4 (28-262)||(39850384-39850618)
chr4 (49-262)||(54833151-54833364)
chr4 (28-262)||(14763580-14763814)
chr4 (49-262)||(36344809-36345022)
chr4 (82-262)||(19373022-19373202)
chr4 (62-258)||(1900025-1900221)
chr4 (62-258)||(15227638-15227834)
chr4 (62-258)||(15285235-15285431)
chr4 (49-262)||(24112426-24112639)
chr4 (49-262)||(34189254-34189467)
chr4 (37-258)||(14235810-14236031)
chr4 (56-258)||(15391636-15391839)
chr4 (62-183)||(24460912-24461033)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (32-262)||(27038-27268)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (32-262)||(30199-30429)
scaffold0124 (62-258)||(20162-20358)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (28-262)||(41793584-41793818)
chr1 (28-262)||(10962415-10962649)
chr1 (28-262)||(51637963-51638197)
chr1 (28-262)||(28584726-28584960)
chr1 (62-258)||(20460857-20461053)
chr1 (62-183)||(20340642-20340763)
chr1 (176-258)||(16208449-16208531)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (28-262)||(7515-7749)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (32-262)||(47265-47495)
scaffold0089 (28-261)||(40345-40578)
scaffold0089 (28-261)||(29510-29743)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (28-262)||(9342-9576)
scaffold0159 (28-216)||(19807-19995)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (28-262)||(15206-15440)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (28-262)||(26478-26712)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-262)||(7683-7917)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (28-262)||(5735-5971)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (28-223)||(9-204)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (49-262)||(7978-8191)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (37-258)||(21317-21538)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (62-183)||(2965-3086)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (176-261)||(48572-48662)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19674418 - 19674184
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674418 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 19674319  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19674318 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacacca 19674219  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19674218 tccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtcca 19674184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16277530 - 16277300
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277530 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 16277431  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277430 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 16277331  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16277330 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 16277300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 2137498 - 2137728
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2137498 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggat 2137597  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137598 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 2137697  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2137698 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 2137728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 27609144 - 27609374
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609144 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 27609243  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609244 gctgagaatacgacacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 27609343  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27609344 tatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27609374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14557603 - 14557373
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14557603 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 14557504  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557503 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 14557404  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14557403 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 14557373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 19518378 - 19518612
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19518378 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 19518477  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19518478 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 19518577  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19518578 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 19518612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 19208595 - 19208829
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  19208595 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 19208694  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19208695 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 19208794  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19208795 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 19208829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 3329754 - 3329988
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  3329754 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaat 3329853  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329854 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacacca 3329953  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3329954 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 3329988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19688078 - 19687844
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19688078 aaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaa 19687979  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19687978 ggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacacca 19687879  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19687878 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 19687844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33258703 - 33258476
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  33258703 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 33258604  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33258603 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 33258504  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33258503 tccccacttccgtttctttcttcttgtg 33258476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29829293 - 29829059
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  29829293 aaccgacaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 29829194  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29829193 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 29829094  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29829093 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 29829059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 31489985 - 31490219
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31489985 aaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31490084  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31490085 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 31490184  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31490185 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 31490219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 28362190 - 28362424
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  28362190 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 28362289  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28362290 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 28362389  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28362390 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 28362424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18710566 - 18710332
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18710566 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18710467  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18710466 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 18710367  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18710366 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18710332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 12092968 - 12093202
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  12092968 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 12093067  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  12093068 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacacca 12093167  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12093168 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 12093202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19286424 - 19286211
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19286424 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 19286325  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286324 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 19286225  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  19286224 tcttgtggtgtcca 19286211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16283429 - 16283196
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  16283429 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaa 16283330  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16283329 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 16283230  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16283229 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 16283196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31354483 - 31354270
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31354483 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31354384  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31354383 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 31354284  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  31354283 tcttgtggtgtcca 31354270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Original strand, 22081135 - 22081337
Alignment:
Q  56 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 155  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||  | |    
T  22081135 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 22081234  T
Q  156 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 255  Q
    | | |||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| || ||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  22081235 acggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatg 22081334  T
Q  256 atg 258  Q
    |||    
T  22081335 atg 22081337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 19659305 - 19659426
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  19659305 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 19659404  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  19659405 gaggtagctgagcagcattgat 19659426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44563050 - 44562929
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  44563050 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 44562951  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  44562950 gaggtagctgagcagcattgat 44562929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9354571 - 9354450
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  9354571 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 9354472  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  9354471 gaggtagctgagcagcattgat 9354450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 28116274 - 28116508
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28116274 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 28116373  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28116374 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 28116473  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28116474 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 28116508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 4796970 - 4797204
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4796970 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 4797069  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4797070 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 4797169  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4797170 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4797204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4721568 - 4721338
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4721568 ggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagat 4721469  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721468 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 4721369  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4721368 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4721338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7073153 - 7072919
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7073153 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 7073054  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7073053 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacacca 7072954  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7072953 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 7072919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35880703 - 35880473
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880703 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 35880604  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880603 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 35880504  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35880503 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 35880473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7996503 - 7996269
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7996503 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 7996404  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7996403 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 7996304  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7996303 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 7996269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10643011 - 10642777
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10643011 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 10642912  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10642911 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 10642812  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10642811 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 10642777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6192253 - 6192023
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6192253 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggat 6192154  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  6192153 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatcca 6192054  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6192053 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 6192023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47023394 - 47023160
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  47023394 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 47023295  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47023294 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 47023195  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47023194 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 47023160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 11110678 - 11110912
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  11110678 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 11110777  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11110778 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 11110877  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11110878 tccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtcca 11110912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18051199 - 18050969
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18051199 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 18051100  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051099 gttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 18051000  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18050999 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18050969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21674630 - 21674400
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21674630 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggat 21674531  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21674530 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccc 21674431  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21674430 cacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 21674400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 15741420 - 15741633
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741420 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 15741519  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15741520 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 15741619  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  15741620 tcttgtggtgtcca 15741633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18330606 - 18330381
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||    
T  18330606 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg-----atgataaaatggtggaaagaaaggat 18330512  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330511 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 18330412  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18330411 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18330381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 20577179 - 20577413
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  20577179 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 20577278  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20577279 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 20577378  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20577379 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 20577413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 6542791 - 6543025
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  6542791 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 6542890  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6542891 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 6542990  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6542991 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 6543025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8295912 - 8295682
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295912 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 8295813  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8295812 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 8295713  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8295712 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 8295682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24328100 - 24327866
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  24328100 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 24328001  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24328000 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 24327901  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24327900 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24327866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 29149072 - 29149306
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  29149072 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 29149171  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149172 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 29149271  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29149272 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 29149306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 29665302 - 29665536
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  29665302 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 29665401  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29665402 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 29665501  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29665502 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 29665536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 36997406 - 36997640
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  36997406 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 36997505  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36997506 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 36997605  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36997606 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 36997640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 17985273 - 17985507
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  17985273 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 17985372  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985373 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 17985472  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17985473 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 17985507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28339243 - 28339009
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  28339243 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 28339144  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28339143 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 28339044  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28339043 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 28339009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 31964790 - 31965024
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31964790 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31964889  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31964890 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 31964989  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31964990 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 31965024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 50134388 - 50134622
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  50134388 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 50134487  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50134488 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 50134587  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50134588 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 50134622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20065966 - 20065753
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20065966 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 20065867  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20065866 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttct 20065767  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||    
T  20065766 tcttgtgatgtcca 20065753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4416857 - 4416623
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| || || |||||     
T  4416857 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaac 4416758  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4416757 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 4416658  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4416657 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4416623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5013653 - 5013419
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  5013653 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 5013554  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5013553 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 5013454  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5013453 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 5013419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 5609639 - 5609873
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  5609639 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 5609738  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5609739 ggatgctgagaatacgtcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 5609838  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5609839 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 5609873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18225132 - 18224898
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18225132 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18225033  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18225032 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 18224933  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18224932 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18224898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 22871191 - 22871425
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  22871191 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 22871290  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22871291 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacacca 22871390  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22871391 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 22871425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 22886250 - 22886484
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  22886250 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 22886349  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22886350 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacacca 22886449  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22886450 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 22886484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 51781952 - 51781718
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  51781952 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 51781853  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51781852 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 51781753  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51781752 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 51781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 15893023 - 15893256
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15893023 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaa 15893122  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15893123 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 15893222  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15893223 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 15893256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51797041 - 51796814
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  51797041 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 51796942  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51796941 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 51796842  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51796841 tccccacttccgtttctttcttcttgtg 51796814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48465856 - 48465622
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  48465856 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 48465757  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  48465756 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacca 48465657  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48465656 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 48465622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 8301585 - 8301815
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8301585 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 8301684  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  8301685 gctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatcca 8301784  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8301785 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 8301815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18242668 - 18242434
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||||| || || |||||     
T  18242668 aaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactgatgataaaacggtgggaagaac 18242569  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18242568 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacacca 18242469  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18242468 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18242434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10396056 - 10395843
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  10396056 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcata 10395957  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10395956 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 10395857  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  10395856 tcttgtggtgtcca 10395843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 18277369 - 18277603
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||  || |||| || |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18277369 aaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18277468  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18277469 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacca 18277568  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18277569 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18277603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 18292670 - 18292904
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||  || |||| || |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18292670 aaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18292769  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18292770 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacca 18292869  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18292870 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18292904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 18307971 - 18308205
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||  || |||| || |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18307971 aaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18308070  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18308071 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacca 18308170  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18308171 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18308205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8211661 - 8211448
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  8211661 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgca 8211562  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211561 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 8211462  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  8211461 tcttgtggtgtcca 8211448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5466905 - 5466692
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5466905 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5466806  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5466805 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttct 5466706  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  5466705 tcttgtggtgtcca 5466692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 4347022 - 4347235
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4347022 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4347121  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347122 catgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 4347221  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  4347222 tcttgtggtgtcca 4347235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 262
Target Start/End: Original strand, 5596717 - 5596917
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5596717 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacg 5596816  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5596817 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 5596916  T
Q  262 a 262  Q
    |    
T  5596917 a 5596917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28021198 - 28020986
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28021198 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28021099  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28021098 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttct 28020999  T
Q  249 tcttgtgatgtcc 261  Q
    ||||||| |||||    
T  28020998 tcttgtggtgtcc 28020986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5713168 - 5713013
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  5713168 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaag 5713069  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    ||||||||||| ||  || |||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5713068 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5713013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5724078 - 5723923
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  5724078 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaag 5723979  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    ||||||||||| ||  || |||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5723978 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5723923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 5757399 - 5757554
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  5757399 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaag 5757498  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    ||||||||||| ||  || |||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5757499 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5757554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 5768290 - 5768445
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  5768290 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaag 5768389  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    ||||||||||| ||  || |||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5768390 ggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5768445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18530304 - 18530108
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |    
T  18530304 gcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatg 18530205  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  | ||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18530204 gaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 18530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4893133 - 4892920
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  4893133 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 4893034  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||   | |||||| |  | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  4893033 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 4892934  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    | ||||||||||||    
T  4892933 ttttgtgatgtcca 4892920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 22387913 - 22388126
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || ||  ||    
T  22387913 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgca 22388012  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||   | |||||| |  | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  22388013 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 22388112  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||    
T  22388113 tcttgtgatgtcca 22388126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32439077 - 32438864
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  32439077 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 32438978  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||   | |||||| |  | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  32438977 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 32438878  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||    
T  32438877 tcttgtgatgtcca 32438864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Original strand, 16626854 - 16627049
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||  |  |||| ||||| ||||    
T  16626854 gcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacg 16626953  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16626954 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-ttcttcttatgatg 16627049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 17994132 - 17994253
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  17994132 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 17994231  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  17994232 gaggtagctgagcagcattgat 17994253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4625853 - 4625733
Alignment:
Q  63 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgg 162  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| |||||    
T  4625853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 4625754  T
Q  163 aggcatttgagctgcattgat 183  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
T  4625753 aggtagctgagcagcattgat 4625733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5652297 - 5652176
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  5652297 gcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 5652198  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  5652197 gaggtagctgagcagcattgat 5652176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26918357 - 26918123
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26918357 aaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 26918258  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918257 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 26918158  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26918157 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26918123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27000050 - 26999816
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27000050 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 26999951  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26999950 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 26999851  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26999850 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26999816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16749831 - 16749597
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16749831 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 16749732  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749731 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 16749632  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16749631 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 16749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26988974 - 26988744
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988974 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 26988875  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988874 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 26988775  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26988774 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26988744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 15424540 - 15424770
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424540 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 15424639  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424640 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 15424739  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15424740 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 15424770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3696040 - 3695806
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  3696040 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 3695941  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3695940 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 3695841  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3695840 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 3695806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 262
Target Start/End: Original strand, 24304846 - 24305071
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24304846 ctgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctga 24304945  T
Q  137 gaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccactt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24304946 gaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctactt 24305045  T
Q  237 ccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24305046 ccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24305071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 13299174 - 13299404
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299174 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 13299273  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  13299274 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccc 13299373  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13299374 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 13299404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29572990 - 29572756
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  29572990 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 29572891  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29572890 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 29572791  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29572790 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 29572756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 34463580 - 34463814
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  34463580 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 34463679  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34463680 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 34463779  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34463780 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 34463814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 16944246 - 16944480
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  16944246 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 16944345  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16944346 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 16944445  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16944446 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 16944480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24863694 - 24863460
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24863694 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaa 24863595  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24863594 ggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacacca 24863495  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24863494 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24863460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27007689 - 27007455
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  27007689 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaat 27007590  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27007589 ggatgctgagaatacggcatatataggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 27007490  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27007489 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27007455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 27360229 - 27360463
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  27360229 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 27360328  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27360329 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacca 27360428  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27360429 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27360463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 27450572 - 27450806
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  27450572 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 27450671  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27450672 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacca 27450771  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27450772 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27450806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 4546003 - 4546237
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  4546003 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 4546102  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4546103 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacca 4546202  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4546203 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4546237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 4724362 - 4724596
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  4724362 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 4724461  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4724462 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacca 4724561  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4724562 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4724596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4757738 - 4757504
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  4757738 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 4757639  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4757638 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacacca 4757539  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4757538 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4757504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4772974 - 4772740
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  4772974 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 4772875  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4772874 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacacca 4772775  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4772774 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4772740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17025239 - 17025005
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  17025239 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 17025140  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17025139 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacca 17025040  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17025039 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 17025005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27485094 - 27484860
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  27485094 aaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 27484995  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27484994 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 27484895  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27484894 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27484860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28207419 - 28207185
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  28207419 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 28207320  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28207319 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacca 28207220  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28207219 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 28207185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 30558235 - 30558469
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  30558235 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 30558334  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30558335 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 30558434  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30558435 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 30558469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16674104 - 16673870
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  16674104 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 16674005  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16674004 ggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacca 16673905  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16673904 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 16673870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26777846 - 26778080
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  26777846 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 26777945  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26777946 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 26778045  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26778046 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26778080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26116638 - 26116872
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26116638 aaccggcaactgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26116737  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  26116738 gaatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacacca 26116837  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26116838 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26116872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 22935096 - 22935329
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||     
T  22935096 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaag 22935195  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22935196 ggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacacca 22935295  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22935296 tccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 22935329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 23857541 - 23857774
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||     
T  23857541 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaag 23857640  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23857641 ggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacacca 23857740  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23857741 tccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 23857774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29549434 - 29549221
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29549434 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 29549335  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549334 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 29549235  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||    
T  29549234 tcttgtgatgtcca 29549221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27044346 - 27044133
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27044346 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 27044247  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044246 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27044147  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  27044146 tcttgtggtgtcca 27044133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29501349 - 29501149
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29501349 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacg 29501250  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29501249 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 29501150  T
Q  262 a 262  Q
    |    
T  29501149 a 29501149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4525245 - 4525032
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4525245 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4525146  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4525145 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 4525046  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  4525045 tcttgtggtgtcca 4525032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Original strand, 22477501 - 22477673
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  22477501 ctgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctga 22477600  T
Q  137 gaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgac 209  Q
    || ||| || |||| ||||| ||| |||| | ||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  22477601 gagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20160653 - 20160496
Alignment:
Q  56 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 155  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||  |  || |  |||    
T  20160653 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggt 20160554  T
Q  156 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 213  Q
    |||  ||||| | |||||  ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20160553 atggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggc 20160496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 213
Target Start/End: Original strand, 22172178 - 22172335
Alignment:
Q  56 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 155  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||  |  || |  |||    
T  22172178 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggt 22172277  T
Q  156 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 213  Q
    |||  ||||| | |||||  ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22172278 atggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggc 22172335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 13522323 - 13522444
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  13522323 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 13522422  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  13522423 gaggtagctgagcagcattgat 13522444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28162603 - 28162482
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |    
T  28162603 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatg 28162504  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  28162503 gaggtagctgagcagcattgat 28162482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 33374506 - 33374627
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  33374506 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 33374605  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  33374606 gaggtagctgagcagcattgat 33374627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 8892560 - 8892681
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  8892560 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 8892659  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  8892660 gaggtagctgagcagcattgat 8892681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 8903795 - 8903916
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  8903795 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 8903894  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  8903895 gaggtagctgagcagcattgat 8903916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 141
Target Start/End: Original strand, 27629948 - 27630041
Alignment:
Q  48 tctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaata 141  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  27629948 tctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaata 27630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 13936809 - 13937043
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13936809 aaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 13936908  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936909 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 13937008  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13937009 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 13937043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 11635454 - 11635688
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11635454 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 11635553  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11635554 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacacca 11635653  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11635654 tccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtcca 11635688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 11641643 - 11641877
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11641643 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 11641742  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11641743 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacacca 11641842  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11641843 tccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtcca 11641877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34279425 - 34279191
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34279425 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 34279326  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34279325 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 34279226  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34279225 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 34279191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 21677447 - 21677681
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21677447 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 21677546  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21677547 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 21677646  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21677647 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 21677681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28882186 - 28881956
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882186 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 28882087  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882086 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 28881987  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28881986 tatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 28881956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32049774 - 32049540
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32049774 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 32049675  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32049674 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 32049575  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32049574 tccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtcca 32049540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34286330 - 34286096
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34286330 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 34286231  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34286230 ggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacacca 34286131  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34286130 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 34286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34291390 - 34291156
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34291390 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 34291291  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34291290 ggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacacca 34291191  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34291190 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 34291156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 261
Target Start/End: Original strand, 23128835 - 23129064
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128835 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23128934  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128935 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23129034  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23129035 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 23129064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 12716870 - 12717104
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12716870 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 12716969  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12716970 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 12717069  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12717070 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 12717104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37925469 - 37925235
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37925469 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37925370  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37925369 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 37925270  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37925269 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 37925235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 261034 - 261264
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  261034 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 261133  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  261134 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 261233  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  261234 cacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 261264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39890038 - 39889804
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  39890038 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 39889939  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39889938 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 39889839  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39889838 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 39889804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12586777 - 12586543
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  12586777 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 12586678  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12586677 ggatgctgagaatacggcatgtatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacacca 12586578  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12586577 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 12586543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27803668 - 27803434
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  27803668 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 27803569  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27803568 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 27803469  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27803468 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27803434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31876257 - 31876023
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31876257 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31876158  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31876157 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 31876058  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31876057 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 31876023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34861656 - 34861422
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  34861656 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 34861557  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34861556 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 34861457  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34861456 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 34861422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 37686174 - 37686408
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37686174 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37686273  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37686274 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 37686373  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37686374 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 37686408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 37701439 - 37701673
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37701439 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37701538  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37701539 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 37701638  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37701639 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 37701673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40233475 - 40233241
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  40233475 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 40233376  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40233375 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 40233276  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40233275 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 40233241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 9350259 - 9350493
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  9350259 aaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 9350358  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9350359 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 9350458  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9350459 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 9350493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12655514 - 12655284
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655514 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 12655415  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  12655414 gctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcc 12655315  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12655314 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 12655284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 19416764 - 19416998
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  19416764 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 19416863  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19416864 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 19416963  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19416964 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 19416998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 22926293 - 22926527
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  22926293 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 22926392  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22926393 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 22926492  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22926493 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 22926527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27777183 - 27776949
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  27777183 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 27777084  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27777083 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 27776984  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27776983 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27776949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27816950 - 27816716
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||    
T  27816950 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaa 27816851  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27816850 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 27816751  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27816750 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27816716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20837890 - 20837660
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837890 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 20837791  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  20837790 gctgagaatacggcgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcc 20837691  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20837690 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 20837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 16829603 - 16829837
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  16829603 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 16829702  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829703 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 16829802  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16829803 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 16829837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16891878 - 16891644
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  16891878 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 16891779  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16891778 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 16891679  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16891678 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 16891644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 27434709 - 27434942
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  27434709 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaa 27434808  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27434809 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 27434908  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27434909 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 27434942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 39052093 - 39052327
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  39052093 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 39052192  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  39052193 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacacca 39052292  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39052293 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 39052327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37375102 - 37374903
Alignment:
Q  63 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgg 162  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37375102 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 37375003  T
Q  163 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37375002 aggcatttgagttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 37374903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Original strand, 21703460 - 21703656
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  21703460 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 21703559  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  |  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  21703560 gaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 21703656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Original strand, 19456717 - 19456913
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||||||||| ||||    
T  19456717 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacg 19456816  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  19456817 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 19456913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 31891624 - 31891745
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  31891624 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 31891723  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  31891724 gaggtagctgagcagcattgat 31891745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3784599 - 3784478
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  3784599 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 3784500  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  3784499 gaggtagctgagcagcattgat 3784478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27118633 - 27118512
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||  ||||| ||||    
T  27118633 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggtacgacg 27118534  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  27118533 gaggtagctgagcagcattgat 27118512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27392960 - 27392739
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27392960 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 27392861  T
Q  137 gaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccactt 236  Q
    || ||  |||  ||  |||| |  ||||| |  ||||| |||| ||| || |||||||| ||||  ||||||| || ||| || || |||||||| ||||    
T  27392860 gagtattgcatgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctactt 27392761  T
Q  237 ccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    | || ||||||||||| |||||    
T  27392760 ctgtctctttcttcttatgatg 27392739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34156956 - 34156835
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  34156956 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 34156857  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  34156856 gaggtagctgagcagcattgat 34156835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 183
Target Start/End: Original strand, 34303600 - 34303720
Alignment:
Q  63 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgg 162  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| |||||    
T  34303600 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacgg 34303699  T
Q  163 aggcatttgagctgcattgat 183  Q
    ||| |  ||||| ||||||||    
T  34303700 aggtagctgagcagcattgat 34303720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16163544 - 16163423
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  16163544 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 16163445  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  16163444 gaggtagctgagcagcattgat 16163423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 262
Target Start/End: Original strand, 9548719 - 9548950
Alignment:
Q  31 cggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaagga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9548719 cggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaagga 9548818  T
Q  131 tgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548819 tgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 9548918  T
Q  231 ccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9548919 ccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 9548950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33777476 - 33777242
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33777476 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 33777377  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33777376 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacacca 33777277  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33777276 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 33777242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41674698 - 41674464
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41674698 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaa 41674599  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674598 ggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 41674499  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41674498 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 41674464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 23718165 - 23718395
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718165 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23718264  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718265 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23718364  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23718365 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 23718395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 23752627 - 23752857
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752627 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23752726  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752727 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23752826  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23752827 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 23752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 8665648 - 8665882
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8665648 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 8665747  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8665748 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 8665847  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8665848 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 8665882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 15658933 - 15659167
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  15658933 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaa 15659032  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15659033 ggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 15659132  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15659133 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 15659167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11549339 - 11549109
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11549339 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggat 11549240  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549239 gctgtgaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 11549140  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11549139 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 11549109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 18500921 - 18501155
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  18500921 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 18501020  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18501021 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 18501120  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18501121 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18501155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 22999291 - 22999521
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999291 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 22999390  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999391 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 22999490  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22999491 tatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 22999521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24681426 - 24681192
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24681426 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 24681327  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681326 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 24681227  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24681226 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24681192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24723953 - 24723719
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24723953 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 24723854  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24723853 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 24723754  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24723753 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24723719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31431417 - 31431183
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31431417 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31431318  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  31431317 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgatacca 31431218  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31431217 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 31431183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5637899 - 5637665
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  5637899 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 5637800  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5637799 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 5637700  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5637699 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 5637665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9317440 - 9317206
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  9317440 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 9317341  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9317340 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 9317241  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9317240 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 9317206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12132144 - 12131910
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  12132144 aaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 12132045  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12132044 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 12131945  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12131944 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 12131910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 24688334 - 24688564
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24688334 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 24688433  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24688434 gttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 24688533  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24688534 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24688564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26480381 - 26480147
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26480381 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26480282  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26480281 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 26480182  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26480181 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 26480147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 31826592 - 31826826
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31826592 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31826691  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31826692 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 31826791  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31826792 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 31826826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 37358828 - 37359062
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37358828 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37358927  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37358928 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacca 37359027  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37359028 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 37359062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43078238 - 43078004
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  43078238 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 43078139  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  43078138 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacacca 43078039  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43078038 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 43078004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6874291 - 6874057
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  6874291 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 6874192  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6874191 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacacca 6874092  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6874091 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 6874057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28649215 - 28648981
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28649215 aaccggaaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 28649116  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28649115 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacca 28649016  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28649015 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 28648981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 29967239 - 29967473
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  29967239 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 29967338  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29967339 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 29967438  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29967439 tccccacttccgtttctttctttttgtggtgtcca 29967473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30029404 - 30029170
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  30029404 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 30029305  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30029304 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 30029205  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30029204 tccccacttccgtttctttctttttgtggtgtcca 30029170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30168458 - 30168224
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  30168458 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 30168359  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30168358 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgatacca 30168259  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30168258 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 30168224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30934621 - 30934391
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30934621 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 30934522  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  30934521 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccc 30934422  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30934421 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 30934391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 37671665 - 37671899
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37671665 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37671764  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37671765 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacacca 37671864  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37671865 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 37671899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3789515 - 3789281
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  3789515 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 3789416  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3789415 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 3789316  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3789315 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 3789281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 13325017 - 13325251
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  13325017 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 13325116  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13325117 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacacca 13325216  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13325217 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 13325251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 15759030 - 15759264
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  15759030 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 15759129  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15759130 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacacca 15759229  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15759230 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 15759264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 18375585 - 18375819
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  18375585 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 18375684  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18375685 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 18375784  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18375785 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 18375819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30152007 - 30151773
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  30152007 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 30151908  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30151907 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 30151808  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30151807 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 30151773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37754957 - 37754723
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37754957 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37754858  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37754857 ggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 37754758  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37754757 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 37754723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2511040 - 2510806
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  2511040 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 2510941  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2510940 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 2510841  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2510840 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 2510806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33516345 - 33516111
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  33516345 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 33516246  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516245 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacacca 33516146  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33516145 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 33516111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 37771172 - 37771406
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  37771172 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 37771271  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37771272 ggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 37771371  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37771372 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 37771406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 28959975 - 28960205
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  28959975 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 28960074  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28960075 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccc 28960174  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28960175 cacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 28960205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 40473725 - 40473959
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  40473725 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 40473824  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40473825 ggatgctgagagtacggcatgtgtgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 40473924  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40473925 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 40473959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 262
Target Start/End: Original strand, 32599676 - 32599876
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32599676 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 32599775  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32599776 gaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtcc 32599875  T
Q  262 a 262  Q
    |    
T  32599876 a 32599876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34616489 - 34616276
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34616489 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 34616390  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616389 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 34616290  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  34616289 tcttgtggtgtcca 34616276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23892161 - 23891962
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  23892161 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacg 23892062  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23892061 gaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgtcc 23891962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24970013 - 24969870
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  24970013 aaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaa 24969914  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24969913 ggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggaggcatttg 24969870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25198977 - 25198788
Alignment:
Q  72 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 171  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  25198977 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattg 25198878  T
Q  172 agctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
     |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  25198877 ggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttccttcttcttatgatgtcc 25198788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24951951 - 24951866
Alignment:
Q  176 gcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24951951 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 24951866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33292496 - 33292283
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  33292496 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 33292397  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||   | |||||| |  | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  33292396 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 33292297  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||    
T  33292296 tcttgtgatgtcca 33292283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22888428 - 22888287
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  22888428 gcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 22888329  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 203  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22888328 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 13184852 - 13184973
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  13184852 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 13184951  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  13184952 gaggtagctgagcagcattgat 13184973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 13440698 - 13440819
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  13440698 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 13440797  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  13440798 gaggtagctgagcagcattgat 13440819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33877205 - 33877084
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  33877205 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 33877106  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  33877105 gaggtagctgagcagcattgat 33877084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11325752 - 11325631
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  11325752 gcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 11325653  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  11325652 gaggtagctgagcagcattgat 11325631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 406 - 640
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  406 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 505  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  506 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacacca 605  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  606 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5127973 - 5127739
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5127973 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaa 5127874  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127873 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 5127774  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5127773 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 5127739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 16736622 - 16736856
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736622 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 16736721  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16736722 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 16736821  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16736822 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 16736856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 16751676 - 16751910
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751676 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 16751775  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16751776 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 16751875  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16751876 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 16751910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17523513 - 17523279
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523513 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 17523414  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17523413 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 17523314  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17523313 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 17523279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 17529702 - 17529936
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529702 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 17529801  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17529802 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 17529901  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17529902 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 17529936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45387324 - 45387090
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45387324 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 45387225  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45387224 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 45387125  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45387124 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 45387090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2154554 - 2154320
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2154554 aaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 2154455  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154454 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 2154355  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2154354 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 2154320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11441541 - 11441307
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  11441541 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaa 11441442  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11441441 ggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 11441342  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11441341 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 11441307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26435234 - 26435004
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26435234 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 26435135  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26435134 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccc 26435035  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26435034 cacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26435004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 262
Target Start/End: Original strand, 5147505 - 5147736
Alignment:
Q  31 cggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaagga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  5147505 cggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgga 5147604  T
Q  131 tgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 230  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147605 tgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 5147704  T
Q  231 ccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5147705 ccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 5147736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 11424942 - 11425172
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11424942 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 11425041  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425042 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 11425141  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11425142 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 11425172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 10917031 - 10917261
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10917031 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggat 10917130  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10917131 gctgagaatacggcacatatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 10917230  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10917231 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 10917261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 24592703 - 24592937
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  24592703 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 24592802  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24592803 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 24592902  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24592903 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24592937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26275256 - 26275490
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26275256 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26275355  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26275356 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 26275455  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26275456 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26275490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26320031 - 26320265
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26320031 aaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26320130  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26320131 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 26320230  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26320231 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26320265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3445275 - 3445041
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  3445275 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 3445176  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3445175 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 3445076  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3445075 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 3445041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9618632 - 9618398
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  9618632 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 9618533  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9618532 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 9618433  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9618432 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 9618398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 31564561 - 31564795
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31564561 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31564660  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31564661 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacacca 31564760  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31564761 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 31564795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 26485910 - 26486140
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  26485910 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 26486009  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486010 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccc 26486109  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26486110 cacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26486140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26538035 - 26538269
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  26538035 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 26538134  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  26538135 ggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacca 26538234  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26538235 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26538269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26670076 - 26670310
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26670076 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26670175  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  26670176 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacacca 26670275  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26670276 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26670310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31124892 - 31124658
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31124892 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31124793  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31124792 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 31124693  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31124692 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 31124658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 16503542 - 16503775
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  16503542 aaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaa 16503641  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16503642 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 16503741  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16503742 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 16503775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 16518578 - 16518811
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  16518578 aaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaa 16518677  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16518678 ggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 16518777  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16518778 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 16518811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 4145306 - 4145519
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4145306 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4145405  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4145406 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 4145505  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  4145506 tcttgtggtgtcca 4145519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16041267 - 16041077
Alignment:
Q  68 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 167  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |    
T  16041267 acgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggta 16041168  T
Q  168 tttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16041167 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 16041077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 258
Target Start/End: Original strand, 16450199 - 16450387
Alignment:
Q  70 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatt 169  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||| |||||||| |      
T  16450199 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaac 16450298  T
Q  170 tgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  16450299 tgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttcttcttatgatg 16450387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5159482 - 5159269
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  5159482 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 5159383  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||   | |||||| |  | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  5159382 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 5159283  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||    
T  5159282 tcttgtgatgtcca 5159269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 31088657 - 31088778
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  31088657 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 31088756  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  31088757 gaggtagctgagcagcattgat 31088778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45733410 - 45733289
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  45733410 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 45733311  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  45733310 gaggtagctgagcagcattgat 45733289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22143458 - 22143423
Alignment:
Q  206 tgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143458 tgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtt 22143423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5005865 - 5005631
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5005865 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 5005766  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5005765 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 5005666  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5005665 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 5005631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6569844 - 6569614
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6569844 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 6569745  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569744 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 6569645  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6569644 cacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 6569614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 24592587 - 24592821
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24592587 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaa 24592686  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592687 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacacca 24592786  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24592787 tccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 24592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 27163593 - 27163827
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27163593 aaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 27163692  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27163693 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 27163792  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27163793 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27163827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30753737 - 30753503
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30753737 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 30753638  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30753637 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatca 30753538  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30753537 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 30753503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17013991 - 17013761
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013991 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 17013892  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17013891 gctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccc 17013792  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17013791 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 17013761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21969696 - 21969462
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  21969696 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaa 21969597  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21969596 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 21969497  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21969496 tccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtcca 21969462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 18800898 - 18801132
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18800898 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 18800997  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18800998 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacacca 18801097  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18801098 tccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtcca 18801132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14098536 - 14098302
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  14098536 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 14098437  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14098436 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 14098337  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14098336 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 14098302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14665009 - 14664779
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665009 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 14664910  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14664909 gctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccc 14664810  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14664809 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 14664779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 33674086 - 33674320
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||     
T  33674086 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaac 33674185  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33674186 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacacca 33674285  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33674286 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 33674320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 40105914 - 40106146
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  40105914 aaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 40106013  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40106014 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 40106113  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtc 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40106114 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtc 40106146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 31126794 - 31127028
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  31126794 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 31126893  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31126894 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 31126993  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31126994 tccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtcca 31127028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39850618 - 39850384
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||     
T  39850618 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaac 39850519  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39850518 ggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 39850419  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39850418 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 39850384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 54833364 - 54833151
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54833364 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 54833265  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833264 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 54833165  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  54833164 tcttgtggtgtcca 54833151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 14763580 - 14763814
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||  || |||| || |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  14763580 aaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 14763679  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14763680 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacacca 14763779  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14763780 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 14763814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 36344809 - 36345022
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36344809 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcaca 36344908  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344909 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 36345008  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  36345009 tcttgtggtgtcca 36345022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373022
Alignment:
Q  82 ttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 181  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  182 ataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19373102 ataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 19373022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1900221 - 1900025
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  1900221 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 1900122  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  1900121 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 1900025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15227834 - 15227638
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  15227834 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 15227735  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15227734 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 15227638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Original strand, 15285235 - 15285431
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  | |    
T  15285235 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatg 15285334  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15285335 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctttcttcttatgatg 15285431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24112639 - 24112426
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  24112639 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 24112540  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||   | |||||| |  | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  24112539 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 24112440  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||    
T  24112439 tcttgtgatgtcca 24112426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Original strand, 34189254 - 34189467
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  34189254 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 34189353  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||   | |||||| |  | ||| ||||| ||||| |||||||    
T  34189354 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 34189453  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||||||||||    
T  34189454 tcttgtgatgtcca 34189467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Original strand, 14235810 - 14236031
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14235810 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 14235909  T
Q  137 gaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccactt 236  Q
    || ||  ||| |||  |||| | | |||| |  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||| ||||    
T  14235910 gagtattgcatatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctactt 14236009  T
Q  237 ccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    | || ||||||||||| |||||    
T  14236010 ctgtctctttcttcttatgatg 14236031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Original strand, 15391636 - 15391839
Alignment:
Q  56 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 155  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||  | |    
T  15391636 gcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 15391735  T
Q  156 atgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaa-cagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgt 254  Q
    | | |||||| |  |||||  ||||||| || |||| |||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15391736 acggcggaggtagctgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttat 15391835  T
Q  255 gatg 258  Q
    ||||    
T  15391836 gatg 15391839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 24460912 - 24461033
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| | ||| ||||    
T  24460912 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacg 24461011  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  24461012 gaggtagctgagcagcattgat 24461033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27268 - 27038
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27268 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 27169  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 27069  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27068 tacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30429 - 30199
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30429 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 30330  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30329 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 30230  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30229 tatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 30199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20358 - 20162
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  20358 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 20259  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  20258 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 20162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 41793584 - 41793818
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41793584 aaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaa 41793683  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41793684 ggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgatacca 41793783  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41793784 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 41793818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10962649 - 10962415
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  10962649 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 10962550  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10962549 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 10962450  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10962449 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 10962415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 51638197 - 51637963
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  51638197 aaccggcatctgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 51638098  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51638097 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 51637998  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51637997 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 51637963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28584960 - 28584726
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  28584960 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 28584861  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28584860 ggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacacca 28584761  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28584760 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 28584726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20461053 - 20460857
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| | ||    
T  20461053 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcg 20460954  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  20460953 gaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctttcttcttatgatg 20460857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 20340642 - 20340763
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || | || ||||| ||||    
T  20340642 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacg 20340741  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  20340742 gaggtagctgagcagcattgat 20340763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 16208449 - 16208531
Alignment:
Q  176 gcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16208449 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctttcttcttatgatg 16208531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 7515 - 7749
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  7515 aaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 7614  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7615 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 7714  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7715 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 7749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 262
Target Start/End: Original strand, 47265 - 47495
Alignment:
Q  32 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47265 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 47364  T
Q  132 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47365 gctgagaatacggcacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccc 47464  T
Q  232 cacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47465 tatttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 47495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 40345 - 40578
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  40345 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaa 40444  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40445 ggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 40544  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40545 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 40578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29743 - 29510
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29743 aaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaa 29644  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29643 ggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacacca 29544  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29543 tccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 29510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 9342 - 9576
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  9342 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 9441  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9442 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacacca 9541  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9542 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 9576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19995 - 19807
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  19995 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 19896  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcc 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  19895 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcc 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 15206 - 15440
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  15206 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 15305  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15306 ggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgatacca 15405  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15406 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 15440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 26478 - 26712
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || |||||     
T  26478 aaccggcaactgttgtttcctctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaac 26577  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26578 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacacca 26677  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678 tccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 26712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7917 - 7683
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  7917 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 7818  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacacca 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7817 ggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacacca 7718  T
Q  228 tccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7717 ttcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 7683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5971 - 5735
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa-ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaat-ggcggaaaga 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||    
T  5971 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaaga 5872  T
Q  126 aaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggcca-tggattgaccggctccagctgaca 224  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5871 aaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgaca 5772  T
Q  225 ccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5771 ccat-cccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 5735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 9 - 204
Alignment:
Q  28 aaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaa 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || |||||     
T  9 aaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 108  T
Q  128 ggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgac 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  109 ggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgac 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8191 - 7978
Alignment:
Q  49 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 148  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8191 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 8092  T
Q  149 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8091 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 7992  T
Q  249 tcttgtgatgtcca 262  Q
    ||||||| ||||||    
T  7991 tcttgtggtgtcca 7978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21538 - 21317
Alignment:
Q  37 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 136  Q
    |||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21538 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 21439  T
Q  137 gaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccactt 236  Q
    || ||  |||  ||  |||| | |||||| |  ||||  |||||||| || |||||||| |||| |||||||| || ||| || || |||||||| ||||    
T  21438 gagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctactt 21339  T
Q  237 ccgtttctttcttcttgtgatg 258  Q
    | || ||||||||||| |||||    
T  21338 ctgtctctttcttcttatgatg 21317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 183
Target Start/End: Original strand, 2965 - 3086
Alignment:
Q  62 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || | || ||||| ||||    
T  2965 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacg 3064  T
Q  162 gaggcatttgagctgcattgat 183  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  3065 gaggtagctgagcagcattgat 3086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 261
Target Start/End: Original strand, 48572 - 48662
Alignment:
Q  176 gcattgataggagcaacag-tggccatggattga--ccggctccagct-gacaccatcccc-acttccgtttctttcttcttgtgatgtcc 261  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48572 gcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 48662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University