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Alignment Overview

Query: NF7431_low_2 (Length: 295)

Name: NF7431_low_2
Description: NF7431
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7431_low_2
NF7431_low_2
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (35-277)||(19704921-19705163)
chr6 (35-277)||(18317753-18317993)
chr6 (35-234)||(2629278-2629477)
chr6 (35-234)||(5275727-5275926)
chr6 (35-234)||(12195903-12196102)
chr6 (35-234)||(26932957-26933156)
chr6 (35-234)||(30034995-30035194)
chr6 (35-234)||(30966925-30967124)
chr6 (35-230)||(17011781-17011973)
chr6 (41-230)||(17852275-17852463)
chr6 (35-234)||(22858343-22858534)
chr6 (35-199)||(20526548-20526708)
chr6 (113-199)||(30445318-30445404)
chr6 (113-199)||(30443111-30443195)
chr6 (47-90)||(12158532-12158575)
chr6 (43-88)||(30443022-30443069)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-277)||(31735874-31736147)
chr1 (1-233)||(27337332-27337564)
chr1 (35-234)||(15295238-15295437)
chr1 (35-234)||(47905958-47906157)
chr1 (35-234)||(24325349-24325548)
chr1 (35-277)||(39931764-39932003)
chr1 (35-277)||(17324985-17325225)
chr1 (35-231)||(48664854-48665050)
chr1 (35-234)||(9463639-9463838)
chr1 (38-231)||(2949617-2949810)
chr1 (65-277)||(21948540-21948751)
chr1 (35-234)||(9459812-9460011)
chr1 (35-233)||(27339526-27339728)
chr1 (35-218)||(6115532-6115716)
chr1 (35-234)||(28998643-28998842)
chr1 (35-234)||(29004359-29004558)
chr1 (35-223)||(45693834-45694022)
chr1 (35-225)||(4131690-4131880)
chr1 (1-221)||(6997182-6997395)
chr1 (71-231)||(6996067-6996221)
chr1 (145-234)||(46432118-46432207)
chr1 (35-148)||(46432521-46432634)
chr1 (35-186)||(16561133-16561284)
chr1 (113-199)||(11693580-11693666)
chr1 (155-234)||(2510722-2510801)
chr1 (113-199)||(13785662-13785748)
chr1 (116-199)||(14352759-14352842)
chr1 (167-231)||(26520516-26520580)
chr1 (172-234)||(6115479-6115541)
chr1 (116-199)||(10115572-10115653)
chr1 (113-163)||(32260833-32260883)
chr1 (43-92)||(32260746-32260795)
chr1 (106-152)||(13112047-13112093)
chr1 (43-90)||(11693706-11693753)
chr1 (43-92)||(13785786-13785835)
chr1 (43-83)||(10115466-10115506)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (1-234)||(20299123-20299356)
chr7 (1-234)||(7092567-7092800)
chr7 (1-234)||(28487217-28487450)
chr7 (1-234)||(31156299-31156532)
chr7 (1-234)||(38395954-38396187)
chr7 (35-234)||(1849667-1849866)
chr7 (35-277)||(7094773-7095013)
chr7 (1-234)||(7470420-7470653)
chr7 (35-234)||(1606173-1606372)
chr7 (1-277)||(7349626-7349899)
chr7 (35-277)||(3035417-3035659)
chr7 (35-277)||(11756927-11757166)
chr7 (38-277)||(20625739-20625976)
chr7 (38-277)||(20629630-20629867)
chr7 (38-277)||(20642049-20642286)
chr7 (35-233)||(47865330-47865528)
chr7 (35-234)||(28485263-28485462)
chr7 (35-277)||(7472331-7472572)
chr7 (35-277)||(37412475-37412714)
chr7 (35-277)||(18345239-18345479)
chr7 (41-234)||(24258166-24258358)
chr7 (35-234)||(21470682-21470881)
chr7 (35-277)||(7352005-7352244)
chr7 (35-277)||(21989855-21990093)
chr7 (35-234)||(42331392-42331591)
chr7 (35-232)||(38393685-38393882)
chr7 (105-277)||(13099823-13099993)
chr7 (113-234)||(43253914-43254035)
chr7 (35-277)||(3676999-3677222)
chr7 (35-181)||(443328-443474)
chr7 (137-277)||(20297163-20297300)
chr7 (36-199)||(40281824-40281989)
chr7 (113-199)||(12310442-12310528)
chr7 (43-92)||(20297108-20297157)
chr7 (43-91)||(10690684-10690732)
chr7 (113-160)||(12484976-12485023)
chr7 (113-160)||(12506407-12506454)
chr7 (41-87)||(43254023-43254069)
chr7 (127-208)||(10690773-10690854)
chr7 (113-160)||(12657600-12657647)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-277)||(27912187-27912462)
chr5 (1-234)||(18468666-18468899)
chr5 (1-234)||(18509706-18509939)
chr5 (35-234)||(25803709-25803908)
chr5 (1-234)||(26098640-26098873)
chr5 (33-277)||(18511561-18511802)
chr5 (29-234)||(27910131-27910336)
chr5 (35-277)||(3373388-3373628)
chr5 (35-234)||(15551927-15552126)
chr5 (53-277)||(10586549-10586771)
chr5 (35-277)||(26097423-26097665)
chr5 (35-277)||(18596328-18596579)
chr5 (35-216)||(21288531-21288713)
chr5 (113-234)||(18466453-18466574)
chr5 (40-185)||(17415748-17415893)
chr5 (113-231)||(15143262-15143373)
chr5 (35-137)||(6661929-6662031)
chr5 (166-234)||(40221340-40221408)
chr5 (35-92)||(40221284-40221341)
chr5 (35-87)||(18466413-18466465)
chr5 (38-87)||(15143225-15143274)
chr5 (157-199)||(6661594-6661636)
chr5 (43-92)||(5779168-5779217)
chr5 (113-186)||(32520241-32520316)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-277)||(22132746-22133019)
chr4 (1-277)||(14787780-14788053)
chr4 (1-234)||(5100711-5100944)
chr4 (35-277)||(22134977-22135217)
chr4 (35-234)||(56030191-56030390)
chr4 (35-234)||(24347961-24348159)
chr4 (35-234)||(44600227-44600426)
chr4 (35-234)||(17662625-17662824)
chr4 (49-277)||(30136331-30136557)
chr4 (35-183)||(47211158-47211306)
chr4 (35-234)||(38890517-38890699)
chr4 (35-199)||(10112628-10112787)
chr4 (140-277)||(19322547-19322684)
chr4 (35-199)||(9022062-9022225)
chr4 (35-187)||(9863501-9863650)
chr4 (113-199)||(54929094-54929180)
chr4 (113-192)||(10979676-10979755)
chr4 (164-234)||(53405001-53405071)
chr4 (35-92)||(14789512-14789569)
chr4 (35-134)||(19322410-19322510)
chr4 (43-199)||(38209098-38209259)
chr4 (116-175)||(29609838-29609897)
chr4 (113-164)||(5516701-5516752)
chr4 (113-152)||(14647175-14647214)
chr4 (47-82)||(29609948-29609983)
chr4 (43-92)||(54929220-54929267)
chr4 (1-57)||(16455017-16455074)
chr4 (49-89)||(5516793-5516833)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (1-234)||(35215983-35216216)
chr2 (35-234)||(42452451-42452650)
chr2 (35-234)||(23452628-23452827)
chr2 (35-234)||(35218364-35218563)
chr2 (35-234)||(42923893-42924092)
chr2 (35-234)||(27583713-27583905)
chr2 (43-199)||(28568584-28568740)
chr2 (113-199)||(15693669-15693755)
chr2 (35-163)||(27136367-27136503)
chr2 (40-128)||(34575608-34575696)
chr2 (114-199)||(7502638-7502723)
chr2 (113-184)||(39286971-39287042)
chr2 (113-192)||(41304806-41304884)
chr2 (138-234)||(34575528-34575617)
chr2 (113-191)||(41303457-41303535)
chr2 (43-92)||(28568346-28568395)
chr2 (43-89)||(15693583-15693629)
chr2 (43-92)||(41303573-41303623)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (35-277)||(1737-1977)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (1-277)||(457918-458192)
chr3 (35-234)||(4104282-4104481)
chr3 (1-234)||(42991921-42992154)
chr3 (5-277)||(53915841-53916110)
chr3 (35-277)||(746424-746663)
chr3 (35-234)||(25533109-25533308)
chr3 (35-277)||(10621887-10622125)
chr3 (35-277)||(51943044-51943283)
chr3 (35-234)||(455575-455774)
chr3 (35-230)||(41848806-41849001)
chr3 (35-277)||(27635973-27636210)
chr3 (35-234)||(1313084-1313283)
chr3 (35-234)||(42989954-42990153)
chr3 (38-277)||(53918009-53918245)
chr3 (116-199)||(11066346-11066429)
chr3 (35-92)||(6561615-6561672)
chr3 (116-188)||(54287487-54287559)
chr3 (118-183)||(53974011-53974077)
chr3 (113-183)||(11072731-11072801)
chr3 (43-92)||(53974148-53974197)
chr3 (43-89)||(11072644-11072690)
chr3 (113-160)||(5535882-5535929)
chr3 (243-277)||(6561689-6561723)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-277)||(51677-51950)
scaffold0005 (35-92)||(50161-50218)
scaffold0005 (113-152)||(170076-170115)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (35-234)||(608472-608671)
chr8 (1-277)||(41384461-41384733)
chr8 (38-277)||(15808967-15809203)
chr8 (35-234)||(43529873-43530072)
chr8 (35-234)||(28283612-28283811)
chr8 (35-234)||(3873752-3873952)
chr8 (35-277)||(41382421-41382661)
chr8 (35-191)||(32339096-32339252)
chr8 (35-150)||(3265635-3265750)
chr8 (184-277)||(181434-181525)
chr8 (113-199)||(11701364-11701447)
chr8 (116-187)||(13986214-13986285)
chr8 (43-89)||(13986328-13986374)
chr8 (43-87)||(11701435-11701479)
chr8 (43-92)||(30679208-30679256)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (35-277)||(11820-12059)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (35-277)||(78885-79126)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (28-181)||(4541-4694)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (1-127)||(1-127)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (35-148)||(2070-2183)
scaffold0468 (176-234)||(2022-2080)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (116-186)||(57836-57905)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (137-184)||(1971-2018)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (43-92)||(10443-10492)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19705163 - 19704921
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705163 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 19705064  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705063 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 19704964  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
            |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19704963 aaaaaaaagaaacgtatcttaagtgtgatattcgttccaaatt 19704921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 18317753 - 18317993
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317753 ttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 18317852  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317853 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 18317952  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18317953 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 18317993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2629477 - 2629278
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629477 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 2629378  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2629377 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 2629278  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5275926 - 5275727
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275926 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 5275827  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5275826 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 5275727  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12196102 - 12195903
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12196102 ttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 12196003  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12196002 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 12195903  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26933156 - 26932957
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  26933156 ttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatattattatggac 26933057  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26933056 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 26932957  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30035194 - 30034995
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30035194 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatagac 30035095  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30035094 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggag 30034995  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 30966925 - 30967124
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966925 ttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 30967024  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30967025 aataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 30967124  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 230
Target Start/End: Original strand, 17011781 - 17011973
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||         ||   |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17011781 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattattgctaaaaatataaaagtttgttttaaa---tattttgtgtagaaaatatatttatggac 17011877  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaa 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17011878 aataaatatatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 17011973  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Original strand, 17852275 - 17852463
Alignment:
Q  41 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgt--tgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaata 138  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||       ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17852275 tatgactcaaaatttgatg-atggagaatattgtgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaa--tattttatgctgaaaatatatttatggacaata 17852371  T
Q  139 aatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaa 230  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17852372 aatatatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattatttcactgaa 17852463  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22858534 - 22858343
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22858534 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttaataaaaatataaaagatttgttttaaatatactttgtgctgaaaatatatttatggac 22858435  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22858434 aataaatatatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaa--------ttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 22858343  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 199
Target Start/End: Original strand, 20526548 - 20526708
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| |||||||||||||||||||       
T  20526548 ttgtagtatgactcaaaatttgatgggtgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaatatatttatg--- 20526644  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatata-ttttgaaagggaatatt 199  Q
      || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20526645 --tacatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttgaaagagaatatt 20526708  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Original strand, 30445318 - 30445404
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445318 tgctgaaaatatatttatgaacaataaatatatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Original strand, 30443111 - 30443195
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  30443111 tgctgaaaatatatttatggacaa--aatatatgtttgtaccgtataaaggaagatttgatgcaaatgtatttttaaaagaaatatt 30443195  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Original strand, 12158532 - 12158575
Alignment:
Q  47 tcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaa 90  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12158532 tcaaaatttgatgaatgaagaagattgttgctaaaaatataaaa 12158575  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Original strand, 30443022 - 30443069
Alignment:
Q  43 tgactcaaaattt--gatggaagaagaatattgttgctaaaaatataa 88  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30443022 tgactcaaaatttatgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataa 30443069  T

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Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31736147 - 31735874
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  31736147 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggaaggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 31736048  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736047 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 31735948  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31735947 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 31735874  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27337564 - 27337332
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||       |    
T  27337564 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactccaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttc 27337465  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337464 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 27337365  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaagga 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27337364 tatttttgatgcaaatattctttaactgaagga 27337332  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15295437 - 15295238
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295437 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 15295338  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15295337 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 15295238  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 47905958 - 47906157
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47905958 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 47906057  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47906058 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 47906157  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 24325349 - 24325548
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24325349 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 24325448  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24325449 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 24325548  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 39931764 - 39932003
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931764 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 39931863  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  39931864 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaatattcttttattgaaggag 39931963  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39931964 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtagtattcgttccaaatt 39932003  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17325225 - 17324985
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17325225 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgagttgaaaatatatttatggac 17325126  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17325125 aataaatatatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 17325026  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17325025 aaaaaaa--aaacgtatcttcagggtgatattcgttccaaatt 17324985  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 231
Target Start/End: Original strand, 48664854 - 48665050
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664854 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 48664953  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48664954 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 48665050  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9463838 - 9463639
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463838 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 9463739  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9463738 aataaatatatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 9463639  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2949810 - 2949617
Alignment:
Q  38 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949810 tagtatgactcaaaatttcatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 2949711  T
Q  138 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2949710 aaatatatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaatattctttcactgaag 2949617  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21948751 - 21948540
Alignment:
Q  65 agaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagga 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21948751 agaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaa 21948652  T
Q  165 cgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgtta 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||| ||    
T  21948651 cgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcacagaaggaggaaaaaaa-aaacgtatcttcagtgtggta 21948553  T
Q  265 ttcgttccaaatt 277  Q
    |||||||||||||    
T  21948552 ttcgttccaaatt 21948540  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9460011 - 9459812
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460011 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 9459912  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9459911 aataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 9459812  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27339728 - 27339526
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatat----ttat 130  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||    ||||    
T  27339728 ttgtagtatgactccaaatttgacggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatatatttat 27339629  T
Q  131 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27339628 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 27339529  T
Q  231 gga 233  Q
    |||    
T  27339528 gga 27339526  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6115716 - 6115532
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaa-tttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgga 133  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115716 ttgtaggatgactcaaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 6115617  T
Q  134 caataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115616 caataaatatatttttgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 6115532  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28998842 - 28998643
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998842 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 28998743  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28998742 aataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 28998643  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29004558 - 29004359
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004558 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 29004459  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29004458 aataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 29004359  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45694022 - 45693834
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45694022 ttgtactatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatggac 45693923  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattcttt 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45693922 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatattcttt 45693834  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4131880 - 4131690
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4131880 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatggac 4131781  T
Q  135 aa-taaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttca 225  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4131780 aaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatattctttca 4131690  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 6997182 - 6997395
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |    
T  6997182 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttc 6997281  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||      ||||||| ||||||||    
T  6997282 aaatatattttgtgctaaaaatata-ttatggacaataaatatatttttataccgtatgaagaacgatttgatgcaaa------ttgaaagagaatatta 6997374  T
Q  201 tattttttatgcaaatattct 221  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  6997375 tatttttgatgcaaatattct 6997395  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Original strand, 6996067 - 6996221
Alignment:
Q  71 ttgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgattt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6996067 ttgttgctaaaaatataaaagacttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaatacatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 6996166  T
Q  171 gatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 231  Q
    |||| |||      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6996167 gatgtaaa------ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaatattctttcactgaag 6996221  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46432118
Alignment:
Q  145 tttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 46432118  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 46432634 - 46432521
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432634 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 46432535  T
Q  135 aataaatatatttt 148  Q
    ||||||||||||||    
T  46432534 aataaatatatttt 46432521  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Original strand, 16561133 - 16561284
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |       |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16561133 ttgttgtatgattcaaaatttgttggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttattgac 16561232  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatttt 186  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  16561233 aataaatatctttttgtaccgtatgaaggaatatttgaaacaaatatatttt 16561284  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11693666 - 11693580
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11693666 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2510801 - 2510722
Alignment:
Q  155 gtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2510801 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 2510722  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13785748 - 13785662
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785748 tgctgaaaatatatttatagatagtaaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 199
Target Start/End: Original strand, 14352759 - 14352842
Alignment:
Q  116 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14352759 tgaaaatatatttatgaatagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26520580 - 26520516
Alignment:
Q  167 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26520580 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaag 26520516  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6115541 - 6115479
Alignment:
Q  172 atgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115541 atgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 6115479  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 199
Target Start/End: Original strand, 10115572 - 10115653
Alignment:
Q  116 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10115572 tgaaaatatatttatggacaataaatat--ttttatcccgtatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaacggaatatt 10115653  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Original strand, 32260833 - 32260883
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagg 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32260833 tgctgaaaatatatttatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaagg 32260883  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Original strand, 32260746 - 32260795
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32260746 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaaaga 32260795  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13112093 - 13112047
Alignment:
Q  106 tattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 152  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112093 tattttatgctgaaaatatattcatggacaataaatatatttttgta 13112047  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11693753 - 11693706
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaa 90  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  11693753 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattattgctaaaattataaaa 11693706  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 13785835 - 13785786
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13785835 tgactcaaaaattgatggatggagaatattgtcgctaaaaatatgaaaga 13785786  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 83
Target Start/End: Original strand, 10115466 - 10115506
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaa 83  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10115466 tgactcaaaatttgatggattaagaatattgttgcaaaaaa 10115506  T

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Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20299123 - 20299356
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  20299123 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttc 20299222  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299223 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 20299322  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20299323 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 20299356  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7092800 - 7092567
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  7092800 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 7092701  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092700 aaatatattttgtgctgaagatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 7092601  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7092600 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 7092567  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 28487217 - 28487450
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  28487217 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgcttc 28487316  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487317 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatataattttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 28487416  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28487417 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 28487450  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31156532 - 31156299
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  31156532 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 31156433  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156432 aaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 31156333  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31156332 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 31156299  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38395954 - 38396187
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  38395954 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 38396053  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396054 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatgtacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 38396153  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38396154 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 38396187  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 1849667 - 1849866
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849667 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 1849766  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1849767 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggag 1849866  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7095013 - 7094773
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7095013 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 7094914  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094913 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 7094814  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7094813 gaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 7094773  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7470653 - 7470420
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |       |    
T  7470653 catcatcacaaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaacatttgtttc 7470554  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470553 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 7470454  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7470453 tatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 7470420  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 1606173 - 1606372
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606173 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 1606272  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1606273 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 1606372  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7349899 - 7349626
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  7349899 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 7349800  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7349799 aaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatatta 7349700  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||         |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7349699 tatttttgaggcaaatattctttcactgaatgagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatt 7349626  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 3035417 - 3035659
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035417 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 3035516  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3035517 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 3035616  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  3035617 aaagaaaaaaaacgtatcttcagtatggtatttgttccaaatt 3035659  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 11756927 - 11757166
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756927 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 11757026  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11757027 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 11757126  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11757127 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 11757166  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Original strand, 20625739 - 20625976
Alignment:
Q  38 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625739 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20625838  T
Q  138 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||       
T  20625839 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20625938  T
Q  238 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20625939 aaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 20625976  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Original strand, 20629630 - 20629867
Alignment:
Q  38 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629630 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20629729  T
Q  138 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||       
T  20629730 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20629829  T
Q  238 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20629830 aaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 20629867  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Original strand, 20642049 - 20642286
Alignment:
Q  38 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642049 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20642148  T
Q  138 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||       
T  20642149 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20642248  T
Q  238 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20642249 aaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 20642286  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Original strand, 47865330 - 47865528
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865330 ttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 47865429  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47865430 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 47865528  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 28485263 - 28485462
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485263 ttgtagtatgattcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 28485362  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28485363 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggag 28485462  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7472572 - 7472331
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472572 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 7472473  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7472472 aataaatatattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 7472373  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7472372 aaaaaaaa-aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 7472331  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37412714 - 37412475
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412714 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 37412615  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37412614 aataaatataattatgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttccactgaaggag 37412515  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412514 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 37412475  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 18345239 - 18345479
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18345239 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttattgac 18345338  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18345339 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 18345438  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18345439 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 18345479  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Original strand, 24258166 - 24258358
Alignment:
Q  41 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258166 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 24258265  T
Q  141 tatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24258266 tatatttttgtacagtatgaaggacga-ttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcactgaaggag 24258358  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21470881 - 21470682
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470881 ttgtagtttgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 21470782  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21470781 aataaatatatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 21470682  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7352244 - 7352005
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7352244 ttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 7352145  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  7352144 aataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatgag 7352045  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7352044 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatt 7352005  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 21989855 - 21990093
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21989855 ttgtagtatgacccaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattgtgt--tgaaaatatatttatggac 21989952  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21989953 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 21990052  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21990053 gaaaaaa--aaacgtatcttctgtgtggtattcgttccaaatt 21990093  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42331591 - 42331392
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331591 ttgtagtatgacttaaaatttgatgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 42331492  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42331491 aataagtatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 42331392  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 232
Target Start/End: Original strand, 38393685 - 38393882
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||       |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38393685 ttgtagtatgattctaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatttatttatggac 38393784  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38393785 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 38393882  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13099993 - 13099823
Alignment:
Q  105 atattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099993 atattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatt 13099894  T
Q  205 ttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13099893 tttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 13099823  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 113 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43254035 - 43253914
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43254035 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 43253936  T
Q  213 aaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43253935 aaatattctttcactgaaggag 43253914  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 3676999 - 3677222
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||                
T  3676999 ttgtagtatgactcaaaatttgatagatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaat------------ 3677086  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3677087 -------atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 3677179  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3677180 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatt 3677222  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 443328 - 443474
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443328 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 443427  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatat 181  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  443428 aataaatatatttttgtaccgtctgaagaacaatttgatgcaaatat 443474  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Original strand, 20297163 - 20297300
Alignment:
Q  137 taaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnn 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      
T  20297163 taaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggagaa 20297262  T
Q  237 nnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
           |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20297263 aaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 20297300  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40281989 - 40281824
Alignment:
Q  36 tgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaata--ttgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgga 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |       |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40281989 tgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaagaatttgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgga 40281890  T
Q  134 caataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||    
T  40281889 aaataaatatatttttgtaccgtatgaaagaatatttgatacggatatatttttaaaaggaatatt 40281824  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12310528 - 12310442
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310528 tgctgaaattatacttaaggacagttaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Original strand, 20297108 - 20297157
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297108 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaga 20297157  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Original strand, 10690684 - 10690732
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaag 91  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10690684 tgactcaaaatttgatggagggagaagattgttgctaaaaatataaaag 10690732  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12485023 - 12484976
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 160  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12485023 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12484976  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12506454 - 12506407
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 160  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12506454 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12506407  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 43254069 - 43254023
Alignment:
Q  41 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatata 87  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43254069 tatgtctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 43254023  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 208
Target Start/End: Original strand, 10690773 - 10690854
Alignment:
Q  127 ttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | |||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  10690773 ttatgtacaataaatatatttttgtaccatgtgacagaatatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatattttatatttt 10690854  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12657647 - 12657600
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12657647 tgctgaaaatatattcatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12657600  T

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Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 27912187 - 27912462
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  27912187 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 27912286  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912287 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 27912386  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27912387 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaa-aaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatt 27912462  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 18468666 - 18468899
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |    
T  18468666 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttc 18468765  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468766 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 18468865  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18468866 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 18468899  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18509939 - 18509706
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  18509939 catcatcactaatttaaagtcaaggtggagaatggtgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttc 18509840  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509839 gaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 18509740  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509739 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 18509706  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 25803709 - 25803908
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803709 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 25803808  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25803809 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 25803908  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26098873 - 26098640
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |    
T  26098873 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttc 26098774  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098773 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 26098674  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  26098673 tatttttgatacaaaaattctttcattgaaggag 26098640  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18511802 - 18511561
Alignment:
Q  33 ttttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511802 ttttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18511703  T
Q  133 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18511702 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 18511603  T
Q  233 agnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||         ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18511602 agaaaaaa---aaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatt 18511561  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 27910131 - 27910336
Alignment:
Q  29 agaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatattt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27910131 agaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 27910230  T
Q  129 atggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27910231 atggacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactg 27910330  T
Q  229 aaggag 234  Q
    ||||||    
T  27910331 aaggag 27910336  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3373628 - 3373388
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3373628 ttgtagtatgactcagaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 3373529  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3373528 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggag 3373429  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3373428 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 3373388  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 15551927 - 15552126
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15551927 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatggac 15552026  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15552027 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 15552126  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 53 - 277
Target Start/End: Original strand, 10586549 - 10586771
Alignment:
Q  53 tttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 152  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586549 tttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 10586648  T
Q  153 tcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatc 252  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  10586649 tcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatc 10586746  T
Q  253 ttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||    
T  10586747 ttcagtgtggtatttgttccaaatt 10586771  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 26097423 - 26097665
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26097423 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtactgaaaatatatttatggac 26097522  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttga--aagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26097523 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 26097622  T
Q  233 agnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||         ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26097623 aggaaaaaa--aaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 26097665  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 18596328 - 18596579
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18596328 ttgtactatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggac 18596427  T
Q  135 aataa-----------atatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattcttt 223  Q
    |||||           ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  18596428 aataaatataccataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaatattctat 18596527  T
Q  224 cactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    |||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18596528 cactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 18596579  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 21288531 - 21288713
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288531 ttgtagtataactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaataaaaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 21288630  T
Q  135 aataaatatatttttg-tatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaat 216  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21288631 aataaatatattttcggtaccgtatgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 234
Target Start/End: Original strand, 18466453 - 18466574
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466453 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 18466552  T
Q  213 aaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18466553 aaatattctttcactaaaggag 18466574  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17415893 - 17415748
Alignment:
Q  40 gtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17415893 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaataa 17415794  T
Q  140 atatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattt 185  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17415793 atatatttttgtactgtatgaaggaaaatttgatgcaaatatattt 17415748  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Original strand, 15143262 - 15143373
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgc 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||    
T  15143262 tgctaaaaatatatttatggacaataaatacatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgc 15143354  T
Q  213 aaatattctttcactgaag 231  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15143355 aaatattctttcactgaag 15143373  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6662031 - 6661929
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |       |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6662031 ttgtagtatgacttaaaacttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggac 6661932  T
Q  135 aat 137  Q
    |||    
T  6661931 aat 6661929  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 234
Target Start/End: Original strand, 40221340 - 40221408
Alignment:
Q  166 gatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40221340 gatttgtttcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgcaggag 40221408  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 92
Target Start/End: Original strand, 40221284 - 40221341
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221284 ttgtagtatgactcaaaatttaattgatgaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 40221341  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 18466413 - 18466465
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatata 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18466413 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 18466465  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 87
Target Start/End: Original strand, 15143225 - 15143274
Alignment:
Q  38 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatata 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15143225 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 15143274  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6661636 - 6661594
Alignment:
Q  157 atgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6661636 atgaaggaagatttgaagtaaatatattttgaaagggaatatt 6661594  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5779217 - 5779168
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5779217 tgacttaaaatttgatagatgaagaagattattgctaaaaatataaaaga 5779168  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 32520241 - 32520316
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaa--tatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatttt 186  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||| |||||||    
T  32520241 tgctgaaaatatatttatgtagagtaaaaatatatttttgtaccgtacgaagaaaaatttgatgcaaacatatttt 32520316  T

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Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22133019 - 22132746
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  22133019 catcatcacaaatttggagtcaaggtggagaatgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 22132920  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132919 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 22132820  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22132819 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 22132746  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14788053 - 14787780
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||       |    
T  14788053 catcatcgctaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 14787954  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787953 aaatatattttgtggtgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 14787854  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14787853 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 14787780  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 5100711 - 5100944
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||            
T  5100711 catcatcgctaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttt 5100810  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100811 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 5100910  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5100911 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 5100944  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22135217 - 22134977
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135217 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 22135118  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22135117 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaatattctttcactgaaggag 22135018  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22135017 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 22134977  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 56030191 - 56030390
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030191 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 56030290  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  56030291 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaatattctttcactgaaggag 56030390  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 24347961 - 24348159
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24347961 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-gaaaatatatttatggac 24348059  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24348060 aataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 24348159  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44600426 - 44600227
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44600426 ttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 44600327  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44600326 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 44600227  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17662824 - 17662625
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662824 ttgtagtatgactacaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 17662725  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17662724 aataaatatatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 17662625  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 277
Target Start/End: Original strand, 30136331 - 30136557
Alignment:
Q  49 aaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 148  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136331 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 30136430  T
Q  149 tgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacg 248  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||         |||||    
T  30136431 tgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaatattctttcattgaaggagaaaaaaa--aaacg 30136528  T
Q  249 tatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30136529 tatcttcagtgtgatattcgttctaaatt 30136557  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47211306 - 47211158
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47211306 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctcaaaatatatttatggac 47211207  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47211206 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38890699 - 38890517
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                |||||  |  ||||||||||||||||    
T  38890699 ttgtagcatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaga----------------tttgt--ttcaaatatatttatggac 38890618  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaaggg-aatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagga 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38890617 aataaatatatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaagga 38890518  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 199
Target Start/End: Original strand, 10112628 - 10112787
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10112628 ttgtagtatgacttaaaatttgttgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaag----gtttcaaatatattttgtgctgaaactatatttatggac 10112723  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10112724 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgtaaatata-tttgaaagagaatatt 10112787  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 277
Target Start/End: Original strand, 19322547 - 19322684
Alignment:
Q  140 atatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnn 239  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         
T  19322547 atatatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa 19322646  T
Q  240 nnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
       |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  19322647 aaagaaatgtatcttcaatgtgatattcattccaaatt 19322684  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 199
Target Start/End: Original strand, 9022062 - 9022225
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||||| ||       |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9022062 ttgtagtatgattcaaaattttatggatgagaaatattgttgttgaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatg-ac 9022160  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9022161 aataaatatatttttctaccgtatgaagaaagatttgatgcaaatatattttaaaagggaatatt 9022225  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 187
Target Start/End: Original strand, 9863501 - 9863650
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||       |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9863501 ttgtaatatgactcaaaatttgttggatgaaatatattgttactaaaaatataaatgatttgtttcaaacatattttgtgctaaaaatatatttatgaac 9863600  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttg 187  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9863601 aataaatatatttttgt---gcatgaaggaagatttgatgcaaatatattttg 9863650  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54929180 - 54929094
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929180 tgctgaaaatatatttatggacaaaaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 192
Target Start/End: Original strand, 10979676 - 10979755
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10979676 tgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtgctgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 10979755  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 53405001 - 53405071
Alignment:
Q  164 acgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  53405001 acgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggag 53405071  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14789569 - 14789512
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14789569 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaaga 14789512  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 19322410 - 19322510
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaata-ttgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgga 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||        ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19322410 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattttttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttatactgaaaatatatttatgga 19322509  T
Q  134 c 134  Q
    |    
T  19322510 c 19322510  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38209259 - 38209098
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatg--gacaata-- 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||        ||| ||||||||||||  ||  | |||  ||  || ||||      
T  38209259 tgactcaaaatttgatggatgaaaaatattgttgttaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgcttcaagaagattgttgttgaaaatata 38209160  T
Q  139 aatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatat-tttgaaagggaatatt 199  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38209159 aatatatttttgtactgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatatttgaaaaggaatatt 38209098  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29609897 - 29609838
Alignment:
Q  116 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgc 175  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29609897 tgaaaatatatttatgaagagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgc 29609838  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5516752 - 5516701
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagga 164  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5516752 tgctaaaaatatatttatagataataaatatatttttttatcgtatgaagga 5516701  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14647214 - 14647175
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647214 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgta 14647175  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 29609983 - 29609948
Alignment:
Q  47 tcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaa 82  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29609983 tcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaa 29609948  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 54929267 - 54929220
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  54929267 tgacttaaaatttgatggaa--ataatattgttgctaaaaatataaaaga 54929220  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16455017 - 16455074
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagta-tgactcaaaatttga 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | |||||||| ||||||    
T  16455017 catcatcactaatttggagtcaaggtggagattgttgtagaagtgactcaatatttga 16455074  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5516833 - 5516793
Alignment:
Q  49 aaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaa 89  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  5516833 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaa 5516793  T

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Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35216216 - 35215983
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  35216216 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 35216117  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216116 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 35216017  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35216016 tatttttgatgcagatattctttcactgaaggag 35215983  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 42452451 - 42452650
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452451 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 42452550  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42452551 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42452650  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23452827 - 23452628
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23452827 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaataaatttatggac 23452728  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23452727 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 23452628  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35218563 - 35218364
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218563 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 35218464  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35218463 aataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 35218364  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42924092 - 42923893
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42924092 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 42923993  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42923992 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42923893  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27583905 - 27583713
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27583905 ttgtagtatgactcaaattttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatgaac 27583806  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27583805 aataaatatatttttataccatatgaaggaatatttgatgcaaatatattttgaaaaggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 27583713  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28568740 - 28568584
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaata 142  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28568740 tgactcaaaatttgatagatgaagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttcaaatatattttgttttgaaaatatatttatggacaataaata 28568641  T
Q  143 tatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568640 tatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 28568584  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Original strand, 15693669 - 15693755
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15693669 tgctgaaaatatatttatgggcaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27136503 - 27136367
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctga--------aaatatat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||        ||||||||    
T  27136503 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattggtgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatataaatatat 27136404  T
Q  127 ttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagg 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27136403 ttatggaaaataaatatatttttgtaccgtatgaagg 27136367  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34575696 - 34575608
Alignment:
Q  40 gtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatattt 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34575696 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttctaaatatattttgtgctgaaaatatattt 34575608  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 199
Target Start/End: Original strand, 7502638 - 7502723
Alignment:
Q  114 gctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7502638 gctgaaaatatatttatgaacaataaaaatatttttgtattgtatgacagaagatttgatgcaaatatatttttaaaggaaatatt 7502723  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Original strand, 39286971 - 39287042
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatt 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  39286971 tgcttaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccatatgaatgaagatttgatgcaaatatatt 39287042  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41304884 - 41304806
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagg 192  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41304884 tgctgacaatatatttatggatagtaaatatatttttgta-catatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 41304806  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34575617 - 34575528
Alignment:
Q  138 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34575617 aaatatatttttgtaccatataaaggaaaatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 34575528  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41303535 - 41303457
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaag 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  41303535 tgctgaaaatatatttatggacagtaaatataattttgtaccgtgtgaaggaagaattgattcaaatatatttttaaag 41303457  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Original strand, 28568346 - 28568395
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28568346 tgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataaaaga 28568395  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693629
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaa 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15693583 tgacttaaaatttgatggatgaataatattgttgctaaaaatataaa 15693629  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 41303623 - 41303573
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgcta-aaaatataaaaga 92  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41303623 tgactcagaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaaatataaaaga 41303573  T

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Target: scaffold0511 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 1737 - 1977
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1737 ttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 1836  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 1936  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1937 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 1977  T

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Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 457918 - 458192
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||       |    
T  457918 catcattactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 458017  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458018 aaatatattttgtgctgaaaatatatttgtggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 458117  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  458118 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 458192  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4104481 - 4104282
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4104481 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatactttatgctgaaaatatatttatggac 4104382  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104381 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 4104282  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 42991921 - 42992154
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||        |    
T  42991921 catcatcactaatttagagtcaaggtgaagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaaggtttgtttc 42992020  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992021 aaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 42992120  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42992121 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42992154  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53916110 - 53915841
Alignment:
Q  5 atcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaag 104  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||       ||||     
T  53916110 atcactaatttagagtcaaggcgaagaatgttgtagtatgactcaaaatttgagggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 53916011  T
Q  105 atattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53916010 atattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatt 53915911  T
Q  205 ttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  53915910 tttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttgagtgtggtattcgttccaaatt 53915841  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 746424 - 746663
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746424 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 746523  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  746524 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 746623  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  746624 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 746663  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 25533109 - 25533308
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25533109 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggac 25533208  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25533209 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 25533308  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10622125 - 10621887
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10622125 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatggac 10622026  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10622025 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 10621926  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10621925 aaaaa----aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 10621887  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 51943044 - 51943283
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943044 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 51943143  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51943144 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcattgaaggag 51943243  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51943244 aaagaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 51943283  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 455575 - 455774
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  455575 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtggac 455674  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  455675 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 455774  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 230
Target Start/End: Original strand, 41848806 - 41849001
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848806 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 41848905  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41848906 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaa 41849001  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27636210 - 27635973
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636210 ttgtagtatgatttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaatattagtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 27636111  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27636110 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 27636011  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27636010 aaaa-----aaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 27635973  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 1313084 - 1313283
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||       |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313084 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggac 1313183  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313184 aataaatatatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 1313283  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 42989954 - 42990153
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42989954 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttttgctgaaagtatatttatggac 42990053  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42990054 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42990153  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 53918245 - 53918009
Alignment:
Q  38 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  53918245 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatggacaat 53918146  T
Q  138 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 237  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       
T  53918145 aaatatatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 53918046  T
Q  238 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
          |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53918045 aaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgtttcaaatt 53918009  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 199
Target Start/End: Original strand, 11066346 - 11066429
Alignment:
Q  116 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11066346 tgaaaatacatttatggacaataaatatatttttttaccatatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaagagaatatt 11066429  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 92
Target Start/End: Original strand, 6561615 - 6561672
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561615 ttgtagtatgactcgaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 6561672  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 54287559 - 54287487
Alignment:
Q  116 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttga 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54287559 tgaaaatatatttatggataataaatacatttttgtactgtatgaaggaatatttgatgcaaatatattttga 54287487  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53974077 - 53974011
Alignment:
Q  118 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg-aaggacgatttgatgcaaatatat 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53974077 aaaatatatttatagacaataaatatatttttgtaccgtatgaaaggaagatttgatgcaaatatat 53974011  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 183
Target Start/End: Original strand, 11072731 - 11072801
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatat 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  11072731 tgctgaaaatacatttatggacaacaaatagatttttgtaccgtattacggaagatttgatgcaaatatat 11072801  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 53974197 - 53974148
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  53974197 tgactcaaaatttgatggatgaagaatgttgttgttaaaaatataaaaga 53974148  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Original strand, 11072644 - 11072690
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaa 89  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11072644 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgcaaaaaatataaa 11072690  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5535929 - 5535882
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  5535929 tgctgaaaatatatttatggacagaaaagatatatttgtatcgtatga 5535882  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Original strand, 6561689 - 6561723
Alignment:
Q  243 gaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6561689 gaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatt 6561723  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 51677 - 51950
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||       |    
T  51677 catcatcgctaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 51776  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51777 aaatatattttgtggtgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 51876  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51877 tatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 51950  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 92
Target Start/End: Original strand, 50161 - 50218
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50161 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaaga 50218  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 152
Target Start/End: Original strand, 170076 - 170115
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170076 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgta 170115  T

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Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 608472 - 608671
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608472 ttgtagtatcactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 608571  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608572 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaatattctttcactgaaggag 608671  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 41384461 - 41384733
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  41384461 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 41384560  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 200  Q
     || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384561 gaatatattttatactgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatta 41384660  T
Q  201 tattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41384661 ta-tttttatgcaaatattctttcattgaagga---aaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 41384733  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Original strand, 15808967 - 15809203
Alignment:
Q  38 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15808967 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggacaat 15809066  T
Q  138 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  15809067 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 15809166  T
Q  238 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
          |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15809167 aaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatt 15809203  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 43529873 - 43530072
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529873 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 43529972  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43529973 aataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaatattctttcactgaaggag 43530072  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28283811 - 28283612
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283811 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 28283712  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28283711 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 28283612  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 234
Target Start/End: Original strand, 3873752 - 3873952
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873752 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 3873851  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaagga-cgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3873852 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 3873951  T
Q  234 g 234  Q
    |    
T  3873952 g 3873952  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 41382421 - 41382661
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       | || ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41382421 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatggac 41382520  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41382521 aataaatatatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaatgag 41382620  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41382621 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 41382661  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Original strand, 32339096 - 32339252
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339096 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 32339195  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339196 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3265750 - 3265635
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3265750 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 3265651  T
Q  135 aataaatatatttttg 150  Q
    ||||||||||| ||||    
T  3265650 aataaatatatgtttg 3265635  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 277
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181525
Alignment:
Q  184 tttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaagaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 181525  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11701447 - 11701364
Alignment:
Q  113 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 199  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11701447 tgctgaaaatatatttatggtcagtaaatatatttttgtaccgtat---ggaagaattgatgtaaatatatttttaaagggaatatt 11701364  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13986285 - 13986214
Alignment:
Q  116 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttg 187  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13986285 tgaaaatatatttatggatagttaataaatttttgtaccgcatgaaagaagatttgatgcaaatatattttg 13986214  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13986374 - 13986328
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaa 89  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13986374 tgactcaaaattttatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaa 13986328  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11701479 - 11701435
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatata 87  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11701479 tgactcaaaatttgatggacgaagaagattgttgctgaaaatata 11701435  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 30679256 - 30679208
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30679256 tgactcaaaatttgatggatgaagaata-tgttggtaaaaataaaaaaga 30679208  T

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Target: scaffold0154 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12059 - 11820
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12059 ttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 11960  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11959 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 11860  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11859 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 11820  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 277
Target Start/End: Original strand, 78885 - 79126
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  78885 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtctcaaatatattttctgctaaaaatatatttatggat 78984  T
Q  135 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  78985 aataaatatatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 79084  T
Q  235 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatt 277  Q
             ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  79085 gaaaaaaa-aaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatt 79126  T

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Target: scaffold0133 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 4541 - 4694
Alignment:
Q  28 gagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatt 127  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       | || |||||| ||||||||||||||||    
T  4541 gagaatgttgcagtataactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatatttcgtgctgaaaatatatt 4640  T
Q  128 tatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4641 tatggacaatatatatatttttgtactgtatgaaggacaatttgatgcaaatat 4694  T

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Target: scaffold1674 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 127 - 1
Alignment:
Q  1 catcatcactaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnnc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  127 catcatcactaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttc 28  T
Q  101 aaagatattttgtgctgaaaatatatt 127  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27 aaatatattttgtgctgaaaatatatt 1  T

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Target: scaffold0468 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2183 - 2070
Alignment:
Q  35 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2183 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 2084  T
Q  135 aataaatatatttt 148  Q
    ||||||||||||||    
T  2083 aataaatatatttt 2070  T

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Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 2022
Alignment:
Q  176 aaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 2022  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 57905 - 57836
Alignment:
Q  116 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatttt 186  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  57905 tgaaaatatatgtatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaa-gaaaatttgatgcaaatatatttt 57836  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2018 - 1971
Alignment:
Q  137 taaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatt 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2018 taaatatatttttgtatcatatgaaggaatatttgatacaaatatatt 1971  T

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Target: scaffold0474 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Original strand, 10443 - 10492
Alignment:
Q  43 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 92  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||    
T  10443 tgactcaaaatttgatggataaaaaagattgttgttaaaaatataaaaga 10492  T

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