View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7443_low_1 (Length: 685)

Name: NF7443_low_1
Description: NF7443
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7443_low_1
NF7443_low_1
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (4-525)||(15284680-15285201)
chr4 (4-525)||(15227868-15228389)
chr4 (4-525)||(1900255-1900776)
chr4 (5-525)||(24460358-24460878)
chr4 (1-524)||(14235274-14235797)
chr4 (4-521)||(15391090-15391607)
chr4 (1-524)||(17013999-17014522)
chr4 (1-525)||(24592063-24592587)
chr4 (1-524)||(14665017-14665540)
chr4 (1-524)||(14763053-14763576)
chr4 (1-521)||(6569855-6570375)
chr4 (1-524)||(5005872-5006395)
chr4 (1-502)||(18800362-18800863)
chr4 (1-502)||(36344264-36344765)
chr4 (1-524)||(31126267-31126790)
chr4 (1-524)||(40105387-40105910)
chr4 (25-524)||(14098540-14099039)
chr4 (1-500)||(33673547-33674046)
chr4 (1-500)||(30753777-30754276)
chr4 (1-525)||(24112660-24113184)
chr4 (1-524)||(21969700-21970223)
chr4 (1-524)||(27163066-27163589)
chr4 (1-500)||(39850661-39851160)
chr4 (1-525)||(34188709-34189233)
chr4 (25-502)||(54833408-54833885)
chr4 (531-670)||(24593792-24593931)
chr4 (533-670)||(24461410-24461547)
chr4 (531-645)||(1898936-1899050)
chr4 (533-670)||(33678827-33678964)
chr4 (531-643)||(15286388-15286500)
chr4 (531-642)||(17012679-17012790)
chr4 (572-670)||(14097192-14097290)
chr4 (533-670)||(30752393-30752530)
chr4 (538-642)||(15392804-15392908)
chr4 (531-642)||(14663697-14663808)
chr4 (572-670)||(21968352-21968450)
chr4 (572-670)||(31128040-31128138)
chr4 (572-670)||(40107160-40107258)
chr4 (531-645)||(14236988-14237102)
chr4 (611-670)||(5004539-5004598)
chr4 (611-670)||(14764847-14764906)
chr4 (611-670)||(36346055-36346114)
chr4 (611-670)||(54832059-54832118)
chr4 (563-645)||(15222721-15222803)
chr4 (617-670)||(39849292-39849345)
chr4 (611-670)||(6568522-6568581)
chr4 (611-670)||(19371930-19371989)
chr4 (628-670)||(18801504-18801546)
chr4 (611-670)||(34190500-34190559)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (4-525)||(19456162-19456683)
chr2 (4-525)||(21702905-21703426)
chr2 (5-525)||(27118667-27119187)
chr2 (5-525)||(3784633-3785153)
chr2 (5-525)||(34156990-34157509)
chr2 (5-525)||(34303045-34303565)
chr2 (4-525)||(16163578-16164102)
chr2 (5-525)||(31891070-31891590)
chr2 (4-524)||(22925769-22926289)
chr2 (173-521)||(27392952-27393300)
chr2 (1-524)||(28882194-28882717)
chr2 (1-524)||(27434182-27434705)
chr2 (1-524)||(12655522-12656045)
chr2 (1-524)||(20837898-20838421)
chr2 (1-524)||(23128304-23128827)
chr2 (1-500)||(9349720-9350219)
chr2 (1-524)||(34286334-34286857)
chr2 (1-524)||(34291394-34291917)
chr2 (25-500)||(40233515-40233990)
chr2 (1-525)||(13936282-13936809)
chr2 (25-524)||(11634948-11635447)
chr2 (25-524)||(21676944-21677443)
chr2 (25-524)||(11641137-11641636)
chr2 (1-500)||(12586814-12587313)
chr2 (1-500)||(27777226-27777725)
chr2 (1-500)||(27816984-27817483)
chr2 (1-502)||(37375163-37375664)
chr2 (1-524)||(32049778-32050301)
chr2 (1-524)||(34861660-34862183)
chr2 (1-524)||(37685647-37686170)
chr2 (1-524)||(37700912-37701435)
chr2 (1-524)||(37925473-37925996)
chr2 (1-524)||(27803687-27804210)
chr2 (1-524)||(16829076-16829599)
chr2 (1-524)||(16891882-16892405)
chr2 (1-524)||(12716340-12716863)
chr2 (1-500)||(39051560-39052059)
chr2 (1-524)||(31876261-31876784)
chr2 (1-524)||(39890054-39890577)
chr2 (1-491)||(260491-260981)
chr2 (1-524)||(19416237-19416760)
chr2 (533-670)||(31892122-31892259)
chr2 (289-524)||(34279429-34279664)
chr2 (531-645)||(21704631-21704745)
chr2 (531-645)||(27435913-27436027)
chr2 (533-670)||(34156321-34156458)
chr2 (533-670)||(3783964-3784101)
chr2 (533-670)||(12718077-12718214)
chr2 (533-670)||(16162909-16163046)
chr2 (531-645)||(34304077-34304191)
chr2 (531-642)||(27118044-27118155)
chr2 (538-642)||(27391672-27391776)
chr2 (531-642)||(23136863-23136974)
chr2 (531-642)||(28880874-28880985)
chr2 (572-670)||(11636699-11636797)
chr2 (572-670)||(11642888-11642986)
chr2 (531-645)||(19457870-19457984)
chr2 (572-670)||(21678693-21678791)
chr2 (572-670)||(22927539-22927637)
chr2 (572-670)||(31874913-31875011)
chr2 (572-670)||(34860312-34860410)
chr2 (572-670)||(37687420-37687518)
chr2 (572-670)||(37702685-37702783)
chr2 (572-670)||(37924125-37924223)
chr2 (531-642)||(20836578-20836689)
chr2 (572-670)||(16830849-16830947)
chr2 (572-670)||(16890534-16890632)
chr2 (572-670)||(19418010-19418108)
chr2 (572-670)||(32048430-32048528)
chr2 (538-670)||(37373811-37373943)
chr2 (531-642)||(12654202-12654313)
chr2 (538-670)||(34278099-34278231)
chr2 (538-670)||(39053288-39053420)
chr2 (611-670)||(40232149-40232208)
chr2 (611-670)||(9351526-9351585)
chr2 (611-670)||(40191084-40191143)
chr2 (628-670)||(262312-262354)
chr2 (628-670)||(12585451-12585493)
chr2 (628-670)||(27802342-27802384)
chr2 (617-670)||(13938082-13938135)
chr2 (611-670)||(27775857-27775916)
chr2 (611-670)||(27815624-27815683)
chr2 (628-670)||(39888712-39888754)
[»] chr3 (125 HSPs)
chr3 (4-525)||(16626299-16626820)
chr3 (4-518)||(18530339-18530853)
chr3 (4-642)||(32292576-32293217)
chr3 (4-642)||(31033910-31034551)
chr3 (5-525)||(5652331-5652851)
chr3 (5-525)||(4625888-4626408)
chr3 (5-525)||(17993578-17994098)
chr3 (5-524)||(5713172-5713691)
chr3 (5-524)||(5724082-5724601)
chr3 (5-524)||(5767767-5768286)
chr3 (1-524)||(18051207-18051730)
chr3 (1-525)||(8295916-8296440)
chr3 (1-524)||(6192261-6192784)
chr3 (1-524)||(15740884-15741407)
chr3 (1-524)||(15892496-15893019)
chr3 (1-524)||(4721576-4722099)
chr3 (1-524)||(18330614-18331137)
chr3 (1-524)||(29148545-29149068)
chr3 (1-525)||(8301057-8301581)
chr3 (1-524)||(4796443-4796966)
chr3 (35-524)||(5756907-5757395)
chr3 (1-524)||(7073157-7073680)
chr3 (1-524)||(35880711-35881234)
chr3 (1-525)||(22387368-22387892)
chr3 (1-524)||(10396078-10396601)
chr3 (1-524)||(28115744-28116267)
chr3 (1-524)||(4416864-4417387)
chr3 (1-524)||(18276842-18277365)
chr3 (1-524)||(18307444-18307967)
chr3 (1-524)||(18292143-18292666)
chr3 (1-500)||(11110139-11110638)
chr3 (1-524)||(5609112-5609635)
chr3 (1-524)||(20576637-20577160)
chr3 (1-524)||(21674638-21675161)
chr3 (1-525)||(28021219-28021743)
chr3 (1-524)||(28339247-28339770)
chr3 (1-500)||(29664760-29665259)
chr3 (1-500)||(48465896-48466395)
chr3 (1-491)||(8211716-8212206)
chr3 (1-500)||(36996867-36997366)
chr3 (1-440)||(51782052-51782491)
chr3 (25-502)||(6542276-6542753)
chr3 (27-524)||(31964289-31964786)
chr3 (1-524)||(47023398-47023921)
chr3 (60-501)||(5466953-5467394)
chr3 (27-524)||(17984772-17985269)
chr3 (130-524)||(50133990-50134384)
chr3 (60-525)||(4346536-4347001)
chr3 (1-524)||(18225136-18225659)
chr3 (25-524)||(18242684-18243183)
chr3 (1-502)||(5596147-5596648)
chr3 (1-525)||(32439098-32439622)
chr3 (1-524)||(5013657-5014180)
chr3 (1-524)||(24328104-24328627)
chr3 (1-524)||(7996507-7997030)
chr3 (1-524)||(10643015-10643538)
chr3 (60-503)||(22870705-22871148)
chr3 (60-503)||(22885764-22886207)
chr3 (27-502)||(20066010-20066485)
chr3 (533-670)||(4625219-4625356)
chr3 (121-440)||(51797141-51797461)
chr3 (535-645)||(15894232-15894342)
chr3 (533-670)||(4720228-4720365)
chr3 (533-670)||(6190913-6191050)
chr3 (533-670)||(5712499-5712636)
chr3 (533-670)||(5723409-5723546)
chr3 (533-670)||(5757919-5758056)
chr3 (533-670)||(5768822-5768959)
chr3 (533-670)||(18329271-18329408)
chr3 (531-645)||(5649461-5649575)
chr3 (531-645)||(15335489-15335603)
chr3 (531-641)||(15728337-15728447)
chr3 (533-663)||(17994630-17994760)
chr3 (533-670)||(29150279-29150415)
chr3 (533-670)||(36998613-36998750)
chr3 (531-645)||(4686664-4686778)
chr3 (531-645)||(4886132-4886246)
chr3 (531-645)||(18529014-18529128)
chr3 (557-670)||(50135619-50135732)
chr3 (531-642)||(8302783-8302894)
chr3 (531-642)||(35879391-35879502)
chr3 (572-670)||(5012309-5012407)
chr3 (572-670)||(5610885-5610983)
chr3 (532-642)||(8294600-8294710)
chr3 (572-670)||(24326756-24326854)
chr3 (572-670)||(28337900-28337998)
chr3 (572-670)||(31966036-31966134)
chr3 (531-642)||(4798175-4798286)
chr3 (599-670)||(7995159-7995230)
chr3 (599-670)||(10641667-10641738)
chr3 (531-642)||(18049887-18049998)
chr3 (572-670)||(4415513-4415611)
chr3 (572-670)||(17986519-17986617)
chr3 (572-670)||(18223788-18223886)
chr3 (534-642)||(15742599-15742707)
chr3 (531-645)||(16628006-16628119)
chr3 (534-642)||(14448442-14448550)
chr3 (304-525)||(4893154-4893375)
chr3 (538-670)||(4348195-4348327)
chr3 (611-670)||(28117541-28117600)
chr3 (538-670)||(7071827-7071959)
chr3 (538-670)||(28019893-28020025)
chr3 (611-670)||(18278636-18278695)
chr3 (611-670)||(18293937-18293996)
chr3 (611-670)||(18309238-18309297)
chr3 (533-670)||(22389081-22389218)
chr3 (585-670)||(32437772-32437857)
chr3 (585-670)||(51780608-51780693)
chr3 (585-670)||(51795695-51795780)
chr3 (538-670)||(6543985-6544117)
chr3 (538-670)||(18241342-18241474)
chr3 (538-670)||(22872385-22872517)
chr3 (538-670)||(22887444-22887576)
chr3 (611-670)||(5597950-5598009)
chr3 (611-670)||(8210356-8210415)
chr3 (611-670)||(10394751-10394810)
chr3 (611-670)||(20578446-20578505)
chr3 (585-667)||(4891831-4891913)
chr3 (628-670)||(29666586-29666628)
chr3 (628-670)||(47022068-47022110)
chr3 (538-670)||(5465600-5465732)
chr3 (611-670)||(11111945-11112004)
chr3 (611-670)||(21673308-21673367)
chr3 (611-670)||(48464530-48464589)
chr3 (595-645)||(16467862-16467912)
[»] chr6 (93 HSPs)
chr6 (4-670)||(26787776-26788445)
chr6 (4-668)||(14142980-14143647)
chr6 (4-668)||(27196151-27196818)
chr6 (4-668)||(27252422-27253089)
chr6 (1-645)||(27290062-27290706)
chr6 (4-524)||(22456638-22457149)
chr6 (4-525)||(13521768-13522289)
chr6 (5-525)||(8892007-8892526)
chr6 (5-525)||(8903242-8903761)
chr6 (5-525)||(28162637-28163157)
chr6 (5-525)||(33373952-33374472)
chr6 (1-524)||(13298643-13299166)
chr6 (1-525)||(22934572-22935096)
chr6 (1-525)||(23857017-23857541)
chr6 (1-524)||(26918361-26918884)
chr6 (1-524)||(27272272-27272795)
chr6 (24-525)||(20160681-20161182)
chr6 (24-525)||(22171649-22172150)
chr6 (1-524)||(26988982-26989506)
chr6 (1-524)||(16749835-16750358)
chr6 (277-524)||(22477241-22477488)
chr6 (1-524)||(24304310-24304833)
chr6 (1-524)||(24863698-24864221)
chr6 (1-524)||(15424009-15424532)
chr6 (1-525)||(29549455-29549979)
chr6 (1-296)||(17092132-17092427)
chr6 (1-524)||(29572994-29573517)
chr6 (1-500)||(34463038-34463537)
chr6 (1-502)||(4773009-4773510)
chr6 (4-500)||(3696086-3696582)
chr6 (184-524)||(27000054-27000394)
chr6 (1-500)||(16674144-16674643)
chr6 (1-524)||(30557708-30558231)
chr6 (1-491)||(4545467-4545957)
chr6 (25-502)||(4757767-4758244)
chr6 (1-491)||(4723826-4724316)
chr6 (1-502)||(4525289-4525790)
chr6 (1-491)||(28207468-28207958)
chr6 (1-502)||(27007730-27008231)
chr6 (1-524)||(27359684-27360207)
chr6 (1-524)||(27450027-27450550)
chr6 (25-524)||(27485110-27485609)
chr6 (1-502)||(26116102-26116603)
chr6 (1-502)||(29501418-29501919)
chr6 (1-521)||(16943719-16944239)
chr6 (1-502)||(27044390-27044892)
chr6 (533-670)||(27631135-27631272)
chr6 (130-502)||(17025280-17025652)
chr6 (1-524)||(26777302-26777830)
chr6 (533-670)||(26917014-26917151)
chr6 (533-670)||(28161968-28162105)
chr6 (533-670)||(8893058-8893195)
chr6 (533-670)||(8904293-8904430)
chr6 (533-670)||(13522821-13522958)
chr6 (533-670)||(33375004-33375141)
chr6 (531-645)||(22477886-22478000)
chr6 (533-670)||(16748488-16748624)
chr6 (531-642)||(13300375-13300486)
chr6 (531-642)||(15425741-15425852)
chr6 (531-642)||(24306042-24306153)
chr6 (572-670)||(16945492-16945590)
chr6 (572-670)||(29571646-29571744)
chr6 (531-642)||(22936284-22936395)
chr6 (531-642)||(23858729-23858840)
chr6 (572-670)||(30559481-30559579)
chr6 (535-642)||(24862378-24862485)
chr6 (531-642)||(26987665-26987776)
chr6 (531-642)||(26998733-26998844)
chr6 (1-180)||(27019461-27019640)
chr6 (535-645)||(27278885-27278995)
chr6 (535-645)||(27303776-27303886)
chr6 (538-670)||(4725556-4725688)
chr6 (538-670)||(4523940-4524072)
chr6 (538-670)||(4547197-4547329)
chr6 (538-670)||(26117832-26117964)
chr6 (538-670)||(26779041-26779173)
chr6 (538-670)||(27006363-27006495)
chr6 (538-670)||(27483768-27483900)
chr6 (538-670)||(28206093-28206225)
chr6 (611-670)||(27043040-27043099)
chr6 (538-669)||(29548130-29548261)
chr6 (538-670)||(3694753-3694885)
chr6 (538-670)||(34464774-34464906)
chr6 (611-670)||(29500057-29500116)
chr6 (538-644)||(20159396-20159502)
chr6 (538-644)||(22173329-22173435)
chr6 (585-670)||(4756412-4756497)
chr6 (585-670)||(4771648-4771733)
chr6 (617-670)||(17023913-17023966)
chr6 (611-670)||(16672778-16672837)
chr6 (1-254)||(27629392-27629645)
chr6 (538-670)||(27361423-27361555)
chr6 (538-670)||(27451766-27451898)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (4-670)||(39210661-39211330)
chr7 (4-642)||(26484558-26485199)
chr7 (4-525)||(16449636-16450157)
chr7 (4-525)||(16041307-16041828)
chr7 (5-645)||(2108644-2109287)
chr7 (4-642)||(2775223-2775864)
chr7 (5-525)||(31088103-31088623)
chr7 (5-525)||(45733444-45733964)
chr7 (4-374)||(26682638-26683008)
chr7 (5-374)||(4200682-4201051)
chr7 (1-642)||(18540663-18541307)
chr7 (1-524)||(5127977-5128500)
chr7 (1-525)||(10916503-10917027)
chr7 (1-524)||(11424412-11424934)
chr7 (1-524)||(16518051-16518574)
chr7 (1-524)||(2154558-2155081)
chr7 (1-524)||(16503015-16503538)
chr7 (1-524)||(5146975-5147498)
chr7 (1-524)||(26435242-26435765)
chr7 (1-524)||(26274729-26275252)
chr7 (1-524)||(4144758-4145281)
chr7 (1-524)||(26319504-26320027)
chr7 (1-500)||(3445315-3445814)
chr7 (1-524)||(16736095-16736618)
chr7 (1-524)||(16751149-16751672)
chr7 (1-524)||(17523517-17524040)
chr7 (1-524)||(17529175-17529698)
chr7 (1-500)||(26537505-26538004)
chr7 (1-524)||(9618636-9619159)
chr7 (25-524)||(26669573-26670072)
chr7 (1-502)||(31564025-31564526)
chr7 (1-524)||(24592176-24592699)
chr7 (1-524)||(45387328-45387851)
chr7 (60-491)||(11441590-11442021)
chr7 (25-524)||(31124905-31125404)
chr7 (1-525)||(5159503-5160027)
chr7 (531-670)||(5126629-5126768)
chr7 (533-670)||(31089155-31089292)
chr7 (531-645)||(16039988-16040102)
chr7 (531-645)||(16519782-16519896)
chr7 (533-670)||(11440197-11440334)
chr7 (533-670)||(45732775-45732912)
chr7 (531-645)||(16451362-16451476)
chr7 (533-670)||(3443931-3444068)
chr7 (531-642)||(10918232-10918343)
chr7 (572-670)||(4146531-4146629)
chr7 (572-670)||(9617288-9617386)
chr7 (531-645)||(16504746-16504860)
chr7 (572-670)||(24593949-24594047)
chr7 (572-670)||(26276502-26276600)
chr7 (572-670)||(26321277-26321375)
chr7 (572-670)||(26671322-26671420)
chr7 (572-670)||(45385980-45386078)
chr7 (572-670)||(16737868-16737966)
chr7 (572-670)||(16752922-16753020)
chr7 (572-670)||(17522169-17522267)
chr7 (572-670)||(17530948-17531046)
chr7 (533-642)||(2153237-2153346)
chr7 (533-642)||(11426145-11426254)
chr7 (1-160)||(26513130-26513289)
chr7 (538-670)||(26539229-26539361)
chr7 (538-670)||(26487100-26487232)
chr7 (611-670)||(5148769-5148828)
chr7 (611-670)||(31565828-31565887)
chr7 (538-670)||(26433912-26434044)
chr7 (538-670)||(31123566-31123698)
chr7 (585-670)||(5120115-5120200)
[»] chr5 (99 HSPs)
chr5 (4-525)||(22888462-22888983)
chr5 (5-645)||(29888732-29889372)
chr5 (4-525)||(25199021-25199542)
chr5 (5-525)||(13184299-13184818)
chr5 (4-525)||(33877239-33877760)
chr5 (5-525)||(11325786-11326306)
chr5 (5-525)||(13440144-13440664)
chr5 (1-524)||(23892199-23892722)
chr5 (5-524)||(9548193-9548712)
chr5 (1-524)||(24687803-24688326)
chr5 (1-524)||(23717634-23718157)
chr5 (1-524)||(23752096-23752619)
chr5 (1-524)||(33777480-33778003)
chr5 (1-525)||(30934625-30935149)
chr5 (1-524)||(22998760-22999283)
chr5 (8-524)||(11549347-11549863)
chr5 (1-521)||(24970014-24970534)
chr5 (1-524)||(15658406-15658929)
chr5 (1-502)||(18500376-18500877)
chr5 (1-524)||(6874298-6874821)
chr5 (1-502)||(28649250-28649751)
chr5 (1-524)||(12132148-12132671)
chr5 (3-524)||(41674702-41675223)
chr5 (1-524)||(2511044-2511567)
chr5 (1-524)||(9317444-9317967)
chr5 (1-524)||(18375058-18375581)
chr5 (1-524)||(30152011-30152534)
chr5 (25-524)||(8665145-8665644)
chr5 (1-524)||(15758503-15759026)
chr5 (1-500)||(31826053-31826552)
chr5 (1-500)||(43078269-43078768)
chr5 (1-524)||(5637903-5638426)
chr5 (1-491)||(31431466-31431956)
chr5 (1-502)||(37671129-37671630)
chr5 (1-524)||(26480385-26480907)
chr5 (1-524)||(33516349-33516872)
chr5 (1-524)||(37358289-37358812)
chr5 (1-502)||(13324475-13324976)
chr5 (1-524)||(30029408-30029931)
chr5 (1-524)||(30168462-30168985)
chr5 (1-502)||(3789556-3790057)
chr5 (1-500)||(24681457-24681956)
chr5 (1-500)||(24723984-24724483)
chr5 (25-502)||(37770657-37771134)
chr5 (1-525)||(32599118-32599642)
chr5 (1-525)||(34616510-34617034)
chr5 (1-500)||(40473195-40473694)
chr5 (25-502)||(37754995-37755472)
chr5 (1-525)||(33292517-33293041)
chr5 (95-524)||(29966806-29967235)
chr5 (1-524)||(28959432-28959955)
chr5 (533-670)||(9549923-9550060)
chr5 (531-670)||(23000492-23000631)
chr5 (531-645)||(24950780-24950894)
chr5 (533-670)||(33776132-33776269)
chr5 (533-670)||(11325117-11325254)
chr5 (533-670)||(13185350-13185487)
chr5 (533-670)||(13441196-13441333)
chr5 (533-670)||(33876570-33876707)
chr5 (534-670)||(24680082-24680218)
chr5 (534-670)||(24722609-24722745)
chr5 (531-642)||(23719361-23719472)
chr5 (531-645)||(23890894-23891008)
chr5 (533-670)||(31827799-31827936)
chr5 (533-645)||(25197702-25197814)
chr5 (572-670)||(2509696-2509794)
chr5 (572-670)||(5636555-5636653)
chr5 (572-670)||(6872947-6873045)
chr5 (572-670)||(8666894-8666992)
chr5 (572-670)||(9316096-9316194)
chr5 (572-670)||(12130800-12130898)
chr5 (572-670)||(15760276-15760374)
chr5 (572-670)||(18376831-18376929)
chr5 (572-670)||(26479037-26479135)
chr5 (572-670)||(30150663-30150761)
chr5 (585-670)||(30167114-30167199)
chr5 (531-642)||(24689535-24689646)
chr5 (572-670)||(29968485-29968583)
chr5 (572-670)||(30028060-30028158)
chr5 (572-670)||(33515001-33515099)
chr5 (531-642)||(30933309-30933420)
chr5 (538-670)||(34615184-34615316)
chr5 (533-642)||(11548027-11548136)
chr5 (538-670)||(13326211-13326343)
chr5 (538-670)||(15660127-15660259)
chr5 (538-670)||(31430091-31430223)
chr5 (538-670)||(37772366-37772498)
chr5 (538-670)||(41673372-41673504)
chr5 (538-670)||(3788189-3788321)
chr5 (538-670)||(28961166-28961298)
chr5 (585-669)||(33291196-33291280)
chr5 (538-670)||(37360022-37360154)
chr5 (538-670)||(37672859-37672991)
chr5 (538-670)||(43076912-43077044)
chr5 (611-670)||(18502188-18502247)
chr5 (611-670)||(40474992-40475051)
chr5 (538-670)||(37753631-37753763)
chr5 (628-670)||(28647889-28647931)
chr5 (628-670)||(32600926-32600968)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (4-518)||(20461070-20461584)
chr1 (4-642)||(28151724-28152365)
chr1 (4-521)||(16207783-16208300)
chr1 (4-525)||(20340087-20340608)
chr1 (3-524)||(41793059-41793580)
chr1 (1-524)||(10962653-10963176)
chr1 (1-524)||(28584964-28585487)
chr1 (1-524)||(51638201-51638724)
chr1 (532-645)||(20459768-20459881)
chr1 (531-645)||(16209505-16209619)
chr1 (531-645)||(20341120-20341234)
chr1 (572-670)||(10961305-10961403)
chr1 (572-670)||(28583616-28583714)
chr1 (572-670)||(41794830-41794928)
chr1 (572-670)||(51636853-51636951)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (5-645)||(33244525-33245168)
chr8 (5-525)||(19658752-19659271)
chr8 (4-525)||(44563084-44563603)
chr8 (4-521)||(22080589-22081106)
chr8 (4-524)||(18710570-18711090)
chr8 (1-524)||(16283433-16283956)
chr8 (1-525)||(9354605-9355130)
chr8 (1-524)||(16277538-16278061)
chr8 (5-524)||(19688082-19688601)
chr8 (1-524)||(27608613-27609136)
chr8 (1-525)||(14557607-14558131)
chr8 (1-524)||(2136967-2137490)
chr8 (1-524)||(19674425-19674948)
chr8 (1-524)||(19208068-19208591)
chr8 (1-524)||(31489458-31489981)
chr8 (27-524)||(31354508-31355005)
chr8 (1-524)||(28361663-28362186)
chr8 (25-502)||(3329239-3329716)
chr8 (1-502)||(12092432-12092933)
chr8 (1-502)||(29829328-29829829)
chr8 (25-502)||(19286468-19286945)
chr8 (1-524)||(33258707-33259230)
chr8 (81-346)||(189256-189521)
chr8 (531-645)||(16282113-16282227)
chr8 (533-670)||(44562415-44562552)
chr8 (533-670)||(9353936-9354073)
chr8 (531-642)||(21374979-21375090)
chr8 (531-642)||(27610345-27610456)
chr8 (531-645)||(19659783-19659897)
chr8 (531-642)||(14556291-14556402)
chr8 (531-642)||(2138699-2138810)
chr8 (531-642)||(16276218-16276329)
chr8 (572-670)||(19209841-19209939)
chr8 (572-670)||(31491231-31491329)
chr8 (572-670)||(33257359-33257457)
chr8 (601-670)||(18709222-18709291)
chr8 (538-642)||(22082301-22082405)
chr8 (572-670)||(28363436-28363534)
chr8 (585-670)||(31353158-31353243)
chr8 (531-642)||(19686762-19686873)
chr8 (1-108)||(18791107-18791214)
chr8 (538-670)||(3330949-3331081)
chr8 (538-670)||(12094162-12094294)
chr8 (611-670)||(19279989-19280048)
chr8 (611-670)||(19285119-19285178)
chr8 (617-670)||(29827967-29828020)
chr8 (628-670)||(19519662-19519704)
chr8 (628-670)||(19673092-19673134)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (4-525)||(2410-2931)
scaffold0260 (531-645)||(3443-3557)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (225-645)||(1-421)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (5-520)||(21549-22064)
scaffold0109 (538-642)||(20249-20353)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (165-521)||(20375-20730)
scaffold0124 (1-524)||(30437-30960)
scaffold0124 (532-642)||(29117-29227)
scaffold0124 (533-643)||(19073-19184)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (165-438)||(1831-2103)
scaffold0415 (1-440)||(6080-6521)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (1-524)||(46734-47257)
scaffold0089 (5-524)||(39822-40341)
scaffold0089 (1-524)||(29747-30270)
scaffold0089 (531-645)||(28424-28538)
scaffold0089 (531-642)||(48466-48577)
scaffold0089 (531-642)||(41550-41661)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-362)||(370-728)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-524)||(27276-27800)
scaffold0143 (531-642)||(25956-26067)
scaffold0143 (611-670)||(17658-17717)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (1-525)||(9549-10073)
scaffold0336 (538-670)||(6886-7018)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (130-524)||(7-402)
scaffold0029 (533-642)||(1613-1722)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-524)||(8815-9338)
scaffold0159 (27-524)||(19999-20496)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (1-524)||(6988-7511)
scaffold0350 (572-670)||(8761-8859)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-524)||(25950-26474)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (1-524)||(14679-15202)
scaffold0237 (572-670)||(16452-16550)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (1-491)||(7966-8456)
scaffold0038 (538-670)||(6591-6723)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (531-645)||(49681-49798)
scaffold0099 (59-422)||(46604-46981)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (551-645)||(40322-40416)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (5-60)||(119651-119706)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 15284680 - 15285201
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  15284680 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgat 15284779  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15284780 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 15284879  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15284880 aatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 15284979  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  15284980 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcag 15285079  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285080 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15285179  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  15285180 ttgttgctgctgttgttgttga 15285201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15228389 - 15227868
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  15228389 ctgacagtcaaataactgtcgttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 15228290  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  15228289 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatatacccc 15228190  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  15228189 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 15228090  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  15228089 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcag 15227990  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227989 gtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15227890  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  15227889 ttgttgctgctgttgttgttga 15227868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1900776 - 1900255
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  1900776 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggt 1900677  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1900676 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 1900577  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  1900576 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 1900477  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||    
T  1900476 atgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcag 1900377  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900376 gtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 1900277  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||||||| ||||| ||||||    
T  1900276 ttgttgatgttgttgctgttga 1900255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 24460358 - 24460878
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24460358 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 24460457  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  24460458 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 24460557  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24460558 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 24460657  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  24460658 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 24460757  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24460758 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 24460857  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  24460858 tgttgctgctgtcgttgttga 24460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 14235274 - 14235797
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  | |||  |||||    
T  14235274 tcactaacaatcagatatttgttgtccatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacggcat 14235373  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||       
T  14235374 ggtcatggtcaaacaaggaagcttggcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcataggt 14235473  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  14235474 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttcttt 14235573  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  14235574 acaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggt 14235673  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14235674 taggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 14235773  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  14235774 agcttgttgttgctgctgttgttg 14235797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 4 - 521
Target Start/End: Original strand, 15391090 - 15391607
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15391090 ctgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgat 15391189  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  15391190 tatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctc 15391289  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||    
T  15391290 gatcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttaca 15391389  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15391390 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttag 15391489  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  15391490 gtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggt 15391589  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttg 521  Q
    |||||| |||||||||||    
T  15391590 ttgttgctgctgttgttg 15391607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 17014522 - 17013999
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  17014522 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 17014423  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  17014422 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 17014323  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  17014322 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 17014223  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  17014222 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 17014123  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  17014122 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 17014023  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  17014022 agcttgctgattttgttgttgttg 17013999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 24592063 - 24592587
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  24592063 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 24592162  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24592163 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24592262  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24592263 ttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24592362  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24592363 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24592462  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  24592463 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24592562  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  24592563 agcttgctgattttgttgttgttga 24592587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 14665540 - 14665017
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  14665540 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 14665441  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14665440 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 14665341  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  14665340 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 14665241  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  14665240 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 14665141  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14665140 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 14665041  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  14665040 agcttgctgattttgttgttgttg 14665017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 14763053 - 14763576
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  14763053 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 14763152  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  14763153 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 14763252  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  14763253 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 14763352  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  14763353 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 14763452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  14763453 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 14763552  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  14763553 agcttgctgattttgttgttgttg 14763576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 6570375 - 6569855
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  6570375 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 6570276  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
     |||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  6570275 aatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 6570176  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  6570175 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 6570076  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  6570075 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 6569976  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6569975 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtct 6569876  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttg 521  Q
    |||||| ||||  ||||||||    
T  6569875 agcttgctgattttgttgttg 6569855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 5006395 - 5005872
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||| ||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  5006395 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaatccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 5006296  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  5006295 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5006196  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || || || ||||| |  |||||||| ||     
T  5006195 ttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttcttc 5006096  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5006095 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5005996  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  5005995 caggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5005896  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  5005895 agcttgctgattttgttgttgttg 5005872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 18800362 - 18800863
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  18800362 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 18800461  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18800462 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18800561  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18800562 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 18800661  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18800662 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18800761  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  18800762 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 18800861  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  18800862 ag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 36344264 - 36344765
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  36344264 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 36344363  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  36344364 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 36344463  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  36344464 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 36344563  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  36344564 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggat 36344663  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  36344664 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 36344763  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  36344764 ag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 31126267 - 31126790
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  31126267 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 31126366  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31126367 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31126466  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31126467 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31126566  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  31126567 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 31126666  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31126667 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 31126766  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  31126767 agcttgctgattttgttgttgttg 31126790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 40105387 - 40105910
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  40105387 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 40105486  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  40105487 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 40105586  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  40105587 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 40105686  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  40105687 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 40105786  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  40105787 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 40105886  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  40105887 agcttgctgattttgttgttgttg 40105910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 14099039 - 14098540
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  14099039 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 14098940  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  14098939 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 14098840  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  14098839 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 14098740  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  14098739 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 14098640  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14098639 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14098540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 33673547 - 33674046
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  33673547 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 33673646  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  33673647 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 33673746  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  33673747 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 33673846  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  33673847 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 33673946  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33673947 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 30754276 - 30753777
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  30754276 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 30754177  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  30754176 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 30754077  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  30754076 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 30753977  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30753976 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30753877  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  30753876 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24113184 - 24112660
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||  | ||||    
T  24113184 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttagcat 24113085  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  24113084 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 24112985  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 24112685  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  24112684 agcatattgctgctgctgctgttga 24112660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 21970223 - 21969700
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  21970223 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 21970124  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | |     
T  21970123 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacat 21970024  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  21970023 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 21969924  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  21969923 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 21969824  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21969823 ccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 21969724  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  21969723 agcttgctgattttgttgttgttg 21969700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 27163066 - 27163589
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  27163066 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 27163165  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27163166 gatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27163265  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  27163266 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 27163365  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27163366 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27163465  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  27163466 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 27163565  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  27163566 agcttgctgattttgttgttgttg 27163589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39851160 - 39850661
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | |||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39851160 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39851061  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39851060 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39850961  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  39850960 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 39850861  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  39850860 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 39850761  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  39850760 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 34188709 - 34189233
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    ||||    
T  34188709 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcat 34188808  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34188809 gatcatgttcaaacaacaaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34188908  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34189208  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  34189209 agcatattgctgctgctgctgttga 34189233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 54833885 - 54833408
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  54833885 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 54833786  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  54833785 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 54833686  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  54833685 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 54833586  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  54833585 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctag 54833486  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  54833485 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 670
Target Start/End: Original strand, 24593792 - 24593931
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24593792 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 24593891  T
Q  631 ctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24593892 ctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 24593931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 24461410 - 24461547
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24461410 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtgcgaagctgagcgttct 24461509  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24461510 cttcttccatagcccttttccttcttctgtactctctg 24461547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1899050 - 1898936
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||    
T  1899050 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgtgcatt 1898951  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  1898950 ttcctcttccatagc 1898936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 33678827 - 33678964
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33678827 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 33678926  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33678927 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 33678964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 643
Target Start/End: Original strand, 15286388 - 15286500
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15286388 tggctgattgttcctgggcagccaacagagcagtcatggtgtcgttggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 15286487  T
Q  631 ctcttcttccata 643  Q
     ||||||||||||    
T  15286488 ttcttcttccata 15286500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 17012790 - 17012679
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17012790 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 17012691  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  17012690 ctcttcttccat 17012679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 14097290 - 14097192
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14097290 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 14097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 30752530 - 30752393
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30752530 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 30752431  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30752430 cttcttccatagcccttttccttcttctgtactctctg 30752393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 538 - 642
Target Start/End: Original strand, 15392804 - 15392908
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15392804 ttgttcctgggtggctagcagagcagtcatggtctcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttct 15392903  T
Q  638 tccat 642  Q
    |||||    
T  15392904 tccat 15392908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 14663808 - 14663697
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14663808 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 14663709  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  14663708 ttcttcttccat 14663697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 21968450 - 21968352
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21968450 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 21968352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 31128040 - 31128138
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128040 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31128138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 40107160 - 40107258
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40107160 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgctctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 40107258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 14236988 - 14237102
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14236988 tggctgcttgttcctgggcggccagcagagcaatcatagtgtcatgagccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 14237087  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  14237088 ttcctcttccatagc 14237102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5004598 - 5004539
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5004598 tcggtacggagctgcgagttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 5004539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 14764847 - 14764906
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764847 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 14764906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 36346055 - 36346114
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36346055 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 36346114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 54832118 - 54832059
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54832118 tcggtacggagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 54832059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 563 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15222803 - 15222721
Alignment:
Q  563 gtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 645  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  15222803 gtcatggtatcattggctttagccaattcttcccttagagaagctaactcggtacggagctgaacattttcttcttccatagc 15222721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 617 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 39849345 - 39849292
Alignment:
Q  617 cggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39849345 cggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 39849292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 6568581 - 6568522
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6568581 tcggtacgaagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 6568522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 19371989 - 19371930
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19371989 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 19371930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Original strand, 18801504 - 18801546
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18801504 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18801546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 34190500 - 34190559
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34190500 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccataacctttttctttcttctgtattctctg 34190559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 19456162 - 19456683
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  19456162 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgat 19456261  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19456262 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 19456361  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19456362 aatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 19456461  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19456462 atgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 19456561  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456562 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 19456661  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  19456662 ttgttgctgctgttgttgttga 19456683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 21702905 - 21703426
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  21702905 ctgacagtcaaataattgccgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgat 21703004  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21703005 cgtggttaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 21703104  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  21703105 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 21703204  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21703205 atgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 21703304  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21703305 gtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 21703404  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21703405 ttgttgatgctgttgttgttga 21703426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27119187 - 27118667
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27119187 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 27119088  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27119087 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 27118988  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27118987 atcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 27118888  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  27118887 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 27118788  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27118787 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagct 27118688  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  27118687 tgttgctgctgtcgttgttga 27118667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 3785153 - 3784633
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3785153 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 3785054  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3785053 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 3784954  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3784953 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 3784854  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  3784853 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 3784754  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3784753 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 3784654  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| | |||| ||||||||    
T  3784653 tgttgctactgtcgttgttga 3784633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34157509 - 34156990
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34157509 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 34157410  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  34157409 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 34157310  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34157309 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 34157211  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  34157210 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 34157111  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  34157110 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 34157011  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  34157010 tgttgctgctgtcgttgttga 34156990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 34303045 - 34303565
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||    
T  34303045 tgacagtcagataattgtcgttgatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatc 34303144  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303145 attgtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 34303244  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34303245 atcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 34303344  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  34303345 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 34303444  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34303445 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 34303544  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  34303545 tgttgctgctgtcgttgttga 34303565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16164102 - 16163578
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||    
T  16164102 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgat 16164003  T
Q  104 catggtcaaacaaagagg---cttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16164002 catggtcaaacagagaggaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatac 16163903  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16163902 ctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttt 16163803  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||    
T  16163802 acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggat 16163703  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16163702 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtct 16163603  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  16163602 agcctgttgctgctgtcgttgttga 16163578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 31891070 - 31891590
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31891070 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31891169  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31891170 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31891269  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31891270 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31891369  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  31891370 tgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 31891469  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31891470 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 31891569  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  31891570 tgttgctgctgtcgttgttga 31891590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Original strand, 22925769 - 22926289
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22925769 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgat 22925868  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22925869 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 22925968  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||     
T  22925969 aatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacg 22926068  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||    
T  22926069 atatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcag 22926168  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22926169 gtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 22926268  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||| ||||  |||||||||||    
T  22926269 ttgctgattttgttgttgttg 22926289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 173 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 27393300 - 27392952
Alignment:
Q  173 cgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 272  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  27393300 cgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagt 27393201  T
Q  273 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 372  Q
    ||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27393200 taactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgagg 27393101  T
Q  373 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatata 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||| |    
T  27393100 tcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcataca 27393001  T
Q  473 acattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 521  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  27393000 tcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttgttg 27392952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 28882717 - 28882194
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  28882717 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 28882618  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28882617 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 28882518  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  28882517 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 28882418  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  28882417 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 28882318  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28882317 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 28882218  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  28882217 agcttgctgattttgttgttgttg 28882194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 27434182 - 27434705
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27434182 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27434281  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27434282 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 27434381  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  27434382 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 27434481  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  27434482 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggat 27434581  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  27434582 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27434681  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  27434682 agcttgctgattttgttgttgttg 27434705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 12656045 - 12655522
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | | || |||||||  ||||||    
T  12656045 tcactcacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttggcat 12655946  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12655945 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 12655846  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  12655845 ttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 12655746  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  12655745 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 12655646  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12655645 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 12655546  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  12655545 agcttgctgattttgttgttgttg 12655522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 20838421 - 20837898
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  20838421 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 20838322  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20838321 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 20838222  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  20838221 ttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 20838122  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||||||| |||    
T  20838121 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagat 20838022  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20838021 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 20837922  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  20837921 agcttgctgattttgttgttgttg 20837898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 23128304 - 23128827
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||| |   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23128304 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatatcatcttgaatagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23128403  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23128404 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23128503  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23128504 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23128603  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  23128604 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 23128703  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23128704 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23128803  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  23128804 agcttgctgattttgttgttgttg 23128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 9349720 - 9350219
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  9349720 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttggcat 9349819  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9349820 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcatatac 9349919  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9349920 ctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 9350019  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  9350020 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 9350119  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  9350120 ccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 34286857 - 34286334
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34286857 tcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 34286758  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34286757 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34286658  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  34286657 ctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 34286558  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34286557 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34286458  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  34286457 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 34286358  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  34286357 agcttgctgattttgttgttgttg 34286334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 34291917 - 34291394
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34291917 tcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 34291818  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34291817 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34291718  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  34291717 ctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 34291618  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34291617 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34291518  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  34291517 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 34291418  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  34291417 agcttgctgattttgttgttgttg 34291394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40233990 - 40233515
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | |||||||||||||||||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  40233990 ttcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 40233891  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| || ||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  40233890 tgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatg 40233791  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  40233790 atttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 40233691  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  40233690 ccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 40233591  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  40233590 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 13936282 - 13936809
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||||||    
T  13936282 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttggcat 13936381  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  13936382 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 13936481  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  13936482 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 13936581  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  13936582 acgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 13936681  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  13936682 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13936781  T
Q  501 agcttgttga---tgctgttgttgttga 525  Q
     ||||| |||   |||||||||||||||    
T  13936782 ggcttgctgactttgctgttgttgttga 13936809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Original strand, 11634948 - 11635447
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  11634948 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11635047  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  11635048 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 11635147  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  11635148 atttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 11635247  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  11635248 ccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 11635347  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11635348 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11635447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Original strand, 21676944 - 21677443
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  21676944 ttcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 21677043  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  21677044 tgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 21677143  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  21677144 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 21677243  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21677244 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 21677343  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  21677344 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 21677443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Original strand, 11641137 - 11641636
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  11641137 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11641236  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  11641237 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 11641336  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  11641337 atttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 11641436  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  11641437 ccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 11641536  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11641537 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11641636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12587313 - 12586814
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  12587313 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 12587214  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  12587213 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 12587114  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  12587113 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 12587014  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  12587013 acgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 12586914  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  12586913 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27777725 - 27777226
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27777725 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27777626  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27777625 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27777526  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27777525 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27777426  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27777425 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27777326  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27777325 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27817483 - 27816984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27817483 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27817384  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27817383 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27817284  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27817283 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27817184  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27817183 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27817084  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27817083 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 37375664 - 37375163
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  37375664 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 37375565  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||| || | ||    
T  37375564 gttcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacac 37375465  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  37375464 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 37375365  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37375364 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37375265  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  37375264 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 37375165  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  37375164 ag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 32050301 - 32049778
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  32050301 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 32050202  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  32050201 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 32050102  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  32050101 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 32050002  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  32050001 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 32049902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  32049901 ccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 32049802  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  32049801 agcttgctgattttgttgttgttg 32049778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 34862183 - 34861660
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  34862183 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 34862084  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  34862083 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcacacac 34861984  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  34861983 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 34861884  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34861883 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34861784  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  34861783 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 34861684  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  34861683 agcttgctgattttgttgttgttg 34861660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 37685647 - 37686170
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37685647 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37685746  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37685747 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37685846  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37685847 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37685946  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37685947 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37686046  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  37686047 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 37686146  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  37686147 agcttgctgattttgttgttgttg 37686170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 37700912 - 37701435
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37700912 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37701011  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37701012 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37701111  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37701112 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37701211  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37701212 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37701311  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  37701312 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 37701411  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  37701412 agcttgctgattttgttgttgttg 37701435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 37925996 - 37925473
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37925996 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37925897  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37925896 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37925797  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37925796 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37925697  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  37925696 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 37925597  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  37925596 cgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcct 37925497  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  37925496 agcttgctgattttgttgttgttg 37925473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 27804210 - 27803687
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27804210 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27804111  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27804110 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacac 27804011  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27804010 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27803911  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27803910 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27803811  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27803810 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     |  | ||| ||||| ||||||||    
T  27803710 ggtatattgctgctgntgttgttg 27803687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 16829076 - 16829599
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16829076 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16829175  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16829176 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16829275  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  16829276 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 16829375  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16829376 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16829475  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16829476 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 16829575  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  16829576 agcttgctgattttgttgttgttg 16829599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 16892405 - 16891882
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16892405 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16892306  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16892305 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16892206  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  16892205 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 16892106  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16892105 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16892006  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16892005 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 16891906  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  16891905 agcttgctgattttgttgttgttg 16891882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 12716340 - 12716863
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  12716340 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 12716439  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12716440 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 12716539  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  12716540 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 12716639  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  12716640 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 12716739  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  12716740 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12716839  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     |  | ||| ||||||||||||||    
T  12716840 ggtatattgctgctgttgttgttg 12716863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 39051560 - 39052059
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39051560 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39051659  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   | || ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39051660 gatcatggctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39051759  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  39051760 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 39051859  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  39051860 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 39051959  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  39051960 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 31876784 - 31876261
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||| | |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  31876784 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttggcat 31876685  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| |||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31876684 gatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31876585  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31876584 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 31876485  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31876484 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31876385  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31876384 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 31876285  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  31876284 agcttgctgattttgttgttgttg 31876261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 39890577 - 39890054
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39890577 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39890478  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39890477 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39890378  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  39890377 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 39890278  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    |||||| |||||||||||||    
T  39890277 acgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggat 39890178  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  39890177 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 39890078  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||| | ||| ||||| || |||||    
T  39890077 agcatattgctgctgctgctgttg 39890054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 260491 - 260981
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  260491 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 260590  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||| |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| ||| |||||||  | ||    
T  260591 gatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcacac 260690  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  260691 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 260790  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  260791 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagat 260890  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaa 491  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  260891 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaa 260981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 19416237 - 19416760
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  19416237 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 19416336  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  19416337 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 19416436  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  19416437 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttc 19416536  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19416537 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19416636  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  19416637 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaagttggcct 19416736  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     ||||| ||||  |||||||||||    
T  19416737 ggcttgctgattttgttgttgttg 19416760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 31892122 - 31892259
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31892122 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 31892221  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31892222 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 31892259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279429
Alignment:
Q  289 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 388  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  389 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggagg 488  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  489 aaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 34279429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 21704631 - 21704745
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21704631 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 21704730  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  21704731 ttcttcttccatagc 21704745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 27435913 - 27436027
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27435913 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctgagagtagctaactcggtacggagctgagcgtt 27436012  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  27436013 ttcttcttccatagc 27436027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 34156458 - 34156321
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34156458 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 34156359  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34156358 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 34156321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 3784101 - 3783964
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3784101 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 3784002  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  3784001 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 3783964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 12718077 - 12718214
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12718077 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 12718176  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718177 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 12718214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 16163046 - 16162909
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16163046 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 16162947  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16162946 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 16162909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 34304077 - 34304191
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  34304077 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 34304176  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  34304177 ttcctcttccatagc 34304191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 27118155 - 27118044
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27118155 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 27118056  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     || ||||||||    
T  27118055 ttcctcttccat 27118044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 538 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 27391776 - 27391672
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  27391776 ttgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttct 27391677  T
Q  638 tccat 642  Q
    |||||    
T  27391676 tccat 27391672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 23136863 - 23136974
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23136863 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 23136962  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  23136963 ctcttcttccat 23136974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 28880985 - 28880874
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28880985 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 28880886  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  28880885 ctcttcttccat 28880874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 11636699 - 11636797
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11636699 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 11636797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 11642888 - 11642986
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11642888 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 11642986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 19457870 - 19457984
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19457870 tggctgattgttcctgggcagccaacagagcagtcatggtgtcgttggtcttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 19457969  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  19457970 ttcttcttccatagc 19457984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 21678693 - 21678791
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678693 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 21678791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 22927539 - 22927637
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22927539 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 22927637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 31875011 - 31874913
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31875011 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31874913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 34860410 - 34860312
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34860410 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 34860312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 37687420 - 37687518
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37687420 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37687518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 37702685 - 37702783
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702685 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37702783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 37924223 - 37924125
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37924223 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37924125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 20836689 - 20836578
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20836689 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 20836590  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  20836589 ttcttcttccat 20836578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 16830849 - 16830947
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16830849 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16830947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 16890632 - 16890534
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16890632 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16890534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 19418010 - 19418108
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418010 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19418108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 32048528 - 32048430
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32048528 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 32048430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 37373943 - 37373811
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37373943 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagatgccaattcggtgcggagctgagcgttctcttct 37373844  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373843 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37373811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 12654313 - 12654202
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12654313 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaatacttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 12654214  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  12654213 ttcttcttccat 12654202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 34278231 - 34278099
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  34278231 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagctgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 34278132  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34278131 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 34278099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 39053288 - 39053420
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  39053288 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagttgcgcgttctcttct 39053387  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053388 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 39053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 40232208 - 40232149
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40232208 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 40232149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 9351526 - 9351585
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9351526 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 9351585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 40191084 - 40191143
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40191084 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 40191143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Original strand, 262312 - 262354
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  262312 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 262354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 12585493 - 12585451
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12585493 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 12585451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27802384 - 27802342
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27802384 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27802342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 670
Target Start/End: Original strand, 13938082 - 13938135
Alignment:
Q  617 cggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13938082 cggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 13938135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27775916 - 27775857
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27775916 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 27775857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27815683 - 27815624
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27815683 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 27815624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 39888754 - 39888712
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39888754 gttctcttcctccatagcccttttctttcttctgtattctctg 39888712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 125)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 16626299 - 16626820
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  16626299 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgat 16626398  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626399 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 16626498  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16626499 aatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 16626598  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16626599 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16626698  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626699 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16626798  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  16626799 ttgttgctgctgttgttgttga 16626820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18530853 - 18530339
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  18530853 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 18530754  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18530753 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctc 18530654  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18530653 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 18530554  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18530553 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 18530454  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530453 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 18530354  T
Q  504 ttgttgatgctgttg 518  Q
    |||||| ||||||||    
T  18530353 ttgttgctgctgttg 18530339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 32293217 - 32292576
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  32293217 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 32293118  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32293117 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 32293018  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  32293017 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 32292918  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  32292917 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 32292818  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32292817 gtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 32292718  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32292717 ttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctaggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcag 32292618  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 642  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  32292617 agaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 32292576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 642
Target Start/End: Original strand, 31033910 - 31034551
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  31033910 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 31034009  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31034010 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 31034109  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  31034110 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 31034209  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  31034210 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcag 31034309  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31034310 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
     ||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31034410 ctgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagctaattcttccctcag 31034509  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 642  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  31034510 agaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 31034551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5652851 - 5652331
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5652851 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5652752  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5652751 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctca 5652652  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5652651 atcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 5652552  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||    
T  5652551 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 5652452  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  5652451 tgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 5652352  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  5652351 tgttgctgctgtcgttgttga 5652331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4626408 - 4625888
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4626408 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 4626309  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  4626308 atggtcaaacagagaggctcggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctca 4626209  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4626208 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 4626109  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  4626108 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 4626009  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4626008 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 4625909  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  4625908 tgttgctgctgtcgttgttga 4625888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 17993578 - 17994098
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||    
T  17993578 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatc 17993677  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17993678 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 17993777  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17993778 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 17993877  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  17993878 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 17993977  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17993978 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 17994077  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  17994078 tgttgctgctgtcgttgttga 17994098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 5713691 - 5713172
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5713691 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5713592  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5713591 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5713492  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5713491 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5713392  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5713391 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5713292  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  5713291 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5713192  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  5713191 tgctgattttgttgttgttg 5713172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 5724601 - 5724082
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5724601 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5724502  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5724501 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5724402  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5724401 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5724302  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5724301 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5724202  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  5724201 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5724102  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  5724101 tgctgattttgttgttgttg 5724082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 524
Target Start/End: Original strand, 5767767 - 5768286
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5767767 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5767866  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5767867 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5767966  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5767967 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5768066  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5768067 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5768166  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  5768167 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5768266  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  5768267 tgctgattttgttgttgttg 5768286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18051730 - 18051207
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||    
T  18051730 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattgacat 18051631  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18051630 gatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacatac 18051531  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  18051530 ttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 18051431  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||| |||||    
T  18051430 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcggat 18051331  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18051330 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18051231  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  18051230 agcttgctgattttgttgttgttg 18051207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8296440 - 8295916
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  8296440 tcactgacagtcaaaaaatcatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 8296341  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  8296340 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 8296241  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| ||     
T  8296240 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttc 8296141  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||| |||    
T  8296140 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagat 8296041  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8296040 caggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 8295941  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  8295940 agcttgctgattttgttgttgttga 8295916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 6192784 - 6192261
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  6192784 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 6192685  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6192684 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 6192585  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  6192584 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 6192485  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | |||    
T  6192484 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagat 6192385  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  6192384 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 6192285  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  6192284 agcttgctgattttgttgttgttg 6192261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 15740884 - 15741407
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  15740884 tcactaacagtcaaaaaattatcatccatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 15740983  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15740984 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15741083  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15741084 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15741183  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||| ||    
T  15741184 acgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaat 15741283  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  15741284 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 15741383  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  15741384 agcttgctgattttgttgttgttg 15741407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 15892496 - 15893019
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  | |||| |||||||  ||||||    
T  15892496 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttggcat 15892595  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15892596 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15892695  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15892696 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15892795  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||||    
T  15892796 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaaggat 15892895  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15892896 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtct 15892995  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  15892996 agcttgttgatgttgttgttgttg 15893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 4722099 - 4721576
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  4722099 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 4722000  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||||||||| ||||    
T  4721999 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatac 4721900  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| || |  |||||||| |  ||||| |||||     
T  4721899 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttc 4721800  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| |||||    
T  4721799 acgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggat 4721700  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  4721699 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 4721600  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  4721599 agcttgctgattttgttgttgttg 4721576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18331137 - 18330614
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  18331137 tcactaacagtcaaaaaattttcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 18331038  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  18331037 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 18330938  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  18330937 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 18330838  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  18330837 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 18330738  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18330737 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18330638  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  18330637 agcttgctgattttgttgttgttg 18330614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 29148545 - 29149068
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  29148545 tcactgacagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 29148644  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  29148645 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 29148744  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  29148745 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29148844  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29148845 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29148944  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  29148945 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 29149044  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  29149045 agcttgctgattttgttgttgttg 29149068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 8301057 - 8301581
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    |||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  8301057 tcaccgacaatcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 8301156  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8301157 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8301256  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  8301257 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 8301356  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  8301357 acgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 8301456  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8301457 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 8301556  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  8301557 agcttgctgattttgttgttgttga 8301581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 4796443 - 4796966
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  4796443 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 4796542  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4796543 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 4796642  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  4796643 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 4796742  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  4796743 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 4796842  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  4796843 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 4796942  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  4796943 agcttgctgattttgttgttgttg 4796966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 524
Target Start/End: Original strand, 5756907 - 5757395
Alignment:
Q  35 tctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagctt 134  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||     |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  5756907 tctggatgtcattctgancacngtagcacnnncaaggattatggaagcattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactc 5757005  T
Q  135 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5757006 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 5757105  T
Q  235 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||    
T  5757106 ggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 5757205  T
Q  335 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 434  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  5757206 catgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatg 5757305  T
Q  435 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  5757306 ccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttg 5757395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 7073680 - 7073157
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||    
T  7073680 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggcat 7073581  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  7073580 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 7073481  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  7073480 ttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 7073381  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7073380 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7073281  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7073280 caggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 7073181  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  7073180 agcttgctgattttgttgttgttg 7073157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 35881234 - 35880711
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  35881234 tcactaacagtcaaaaaaatttcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 35881135  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  35881134 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 35881035  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  35881034 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 35880935  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||| |||||    
T  35880934 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggat 35880835  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  35880834 caggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 35880735  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  35880734 agcttgctgattttgttgttgttg 35880711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 22387368 - 22387892
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  22387368 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcat 22387467  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22387468 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22387567  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22387568 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 22387667  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  22387668 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 22387767  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  22387768 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtct 22387867  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  22387868 agcatattgttgctgctgctgttga 22387892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 10396601 - 10396078
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  10396601 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 10396502  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  10396501 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 10396402  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10396401 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 10396302  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10396301 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10396202  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  10396201 caggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtct 10396102  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  10396101 agcttgctgattttgttgttgttg 10396078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 28115744 - 28116267
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  28115744 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 28115843  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | ||    
T  28115844 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 28115943  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  28115944 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 28116043  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28116044 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28116143  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28116144 caagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 28116243  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  28116244 agcttgctgattttgttgttgttg 28116267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 4417387 - 4416864
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  4417387 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagttttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatccgagacacttggcat 4417288  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4417287 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4417188  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  4417187 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 4417088  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4417087 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4416988  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  4416987 caggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 4416888  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  4416887 agcttgctgattttgttgttgttg 4416864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 18276842 - 18277365
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18276842 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18276941  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18276942 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18277041  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18277042 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18277141  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18277142 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18277241  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18277242 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18277341  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  18277342 agcttgctgattttgttgttgttg 18277365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 18307444 - 18307967
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18307444 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18307543  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18307544 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18307643  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18307644 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18307743  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18307744 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18307843  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18307844 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18307943  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  18307944 agcttgctgattttgttgttgttg 18307967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 18292143 - 18292666
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18292143 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18292242  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18292243 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18292342  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18292343 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18292442  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18292443 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18292542  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18292543 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18292642  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  18292643 agcttgctgattttgttgttgttg 18292666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 11110139 - 11110638
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||| | |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  11110139 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 11110238  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  11110239 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacac 11110338  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  11110339 ttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 11110438  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  11110439 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 11110538  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11110539 caggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 5609112 - 5609635
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5609112 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5609211  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  5609212 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 5609311  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5609312 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5609411  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5609412 acgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5609511  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  5609512 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5609611  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  5609612 agcttgctgattttgttgttgttg 5609635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 20576637 - 20577160
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  20576637 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 20576736  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  20576737 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 20576836  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  20576837 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 20576936  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  20576937 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 20577036  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  20577037 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     |  | ||||||||| ||||||||    
T  20577137 ggtatattgatgctgctgttgttg 20577160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 21675161 - 21674638
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  21675161 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 21675062  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  21675061 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 21674962  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  21674961 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 21674862  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  21674861 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 21674762  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  21674761 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 21674662  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  21674661 agcttgctgattttgttgttgttg 21674638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28021743 - 28021219
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  28021743 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 28021644  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28021643 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 28021544  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28021543 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 28021444  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || ||||    
T  28021443 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggat 28021344  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28021343 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28021244  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  28021243 agcatattgctgctgctgctgttga 28021219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 28339770 - 28339247
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  28339770 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 28339671  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28339670 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28339571  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28339570 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28339471  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28339470 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28339371  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  28339370 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28339271  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  28339270 agcttgctgattttgttgttgttg 28339247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 29664760 - 29665259
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  29664760 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 29664859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29664860 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29664959  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  29664960 ttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 29665059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  29665060 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 29665159  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  29665160 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 48466395 - 48465896
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  48466395 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 48466296  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  48466295 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 48466196  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  48466195 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 48466096  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  48466095 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 48465996  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  48465995 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 8212206 - 8211716
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  8212206 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8212107  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8212106 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8212007  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  8212006 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 8211907  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  8211906 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 8211807  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaa 491  Q
     |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8211806 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaa 8211716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 36996867 - 36997366
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  36996867 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 36996966  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  36996967 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 36997066  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  36997067 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 36997166  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  36997167 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 36997266  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  36997267 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51782491 - 51782052
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  51782491 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 51782392  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  51782391 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 51782292  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  51782291 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttc 51782192  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  51782191 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 51782092  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782091 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 6542276 - 6542753
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  6542276 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 6542375  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||    
T  6542376 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatg 6542475  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  6542476 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 6542575  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  6542576 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 6542675  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    |||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  6542676 ttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 524
Target Start/End: Original strand, 31964289 - 31964786
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || |||| |    
T  31964289 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31964388  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31964389 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31964488  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31964489 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31964588  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31964589 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31964688  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  31964689 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31964786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 47023921 - 47023398
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  47023921 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 47023822  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  47023821 gatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 47023722  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  47023721 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 47023622  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  47023621 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 47023522  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  47023521 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 47023422  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  47023421 agcttgctgattttgttgttgttg 47023398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 5467394 - 5466953
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5467394 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 5467295  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  5467294 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacat 5467195  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  5467194 tattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 5467095  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  5467094 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagg 5466995  T
Q  460 aactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtcta 501  Q
    |  || ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||||    
T  5466994 agttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 524
Target Start/End: Original strand, 17984772 - 17985269
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    |||| ||| ||||      
T  17984772 catcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagcttta 17984871  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  17984872 cacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 17984971  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  17984972 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 17985071  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17985072 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 17985171  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17985172 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 17985269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 524
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134384
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 50134089  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    | || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  50134090 gtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 50134189  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  50134190 gacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgta 50134289  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  50134290 caatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 50134384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 525
Target Start/End: Original strand, 4346536 - 4347001
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4346536 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 4346635  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  |    
T  4346636 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacat 4346735  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  4346736 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 4346835  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  4346836 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 4346935  T
Q  460 aactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||    
T  4346936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttga 4347001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18225659 - 18225136
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | ||||||    || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  18225659 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacggtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 18225560  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  18225559 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcttcacacac 18225460  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18225459 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 18225360  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18225359 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18225260  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  18225259 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcct 18225160  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||||||||  |||||||||||    
T  18225159 agcttgttgattttgttgttgttg 18225136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18243183 - 18242684
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  18243183 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18243084  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18243083 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18242984  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  18242983 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18242884  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18242883 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 18242784  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  18242783 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 18242684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 5596147 - 5596648
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  5596147 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 5596246  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  5596247 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5596346  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  5596347 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 5596446  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5596447 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5596546  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5596547 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtct 5596646  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  5596647 ag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 32439622 - 32439098
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  32439622 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcat 32439523  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | || ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  32439522 gatcatgttcaaacaataaagcctggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 32439423  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32439123  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  32439122 agcatattgctgctgctgctgttga 32439098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 5014180 - 5013657
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  5014180 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 5014081  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  5014080 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 5013981  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5013980 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5013881  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5013880 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5013781  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || ||||||||||| |||||||| || || ||    
T  5013780 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggcct 5013681  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     ||||| ||||  |||||||||||    
T  5013680 ggcttgctgattttgttgttgttg 5013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 24328627 - 24328104
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24328627 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24328528  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  24328527 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 24328428  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  24328427 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 24328328  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  24328327 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 24328228  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  24328227 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcct 24328128  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     ||||| ||||  |||||||||||    
T  24328127 ggcttgctgattttgttgttgttg 24328104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 7997030 - 7996507
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  7997030 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 7996931  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  7996930 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 7996831  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  7996830 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 7996731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7996730 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7996631  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  7996630 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 7996531  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  7996530 agcttgctgattttgttgttgttg 7996507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 10643538 - 10643015
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  10643538 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 10643439  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  10643438 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 10643339  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10643338 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 10643239  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10643238 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10643139  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  10643138 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 10643039  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  10643038 agcttgctgattttgttgttgttg 10643015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 503
Target Start/End: Original strand, 22870705 - 22871148
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22870705 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 22870804  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  22870805 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 22870904  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22870905 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 22871004  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22871005 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22871104  T
Q  460 aactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22871105 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 503
Target Start/End: Original strand, 22885764 - 22886207
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22885764 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 22885863  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  22885864 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 22885963  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22885964 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 22886063  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22886064 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22886163  T
Q  460 aactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22886164 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20066485 - 20066010
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||     |||||||||| ||||||||  | ||||||    
T  20066485 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcattcaacatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 20066386  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || | |||||| || ||||| ||||||||||||||||  || || || || ||   |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20066385 cacaacttgatatggagtggtaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 20066286  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  20066285 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 20066186  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||| || ||     
T  20066185 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccggtggaggcttgccctgcctagtc 20066086  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  20066085 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 4625356 - 4625219
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4625356 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 4625257  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4625256 cttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 4625219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51797461 - 51797141
Alignment:
Q  121 gcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcag 220  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |    
T  51797461 gctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcgg 51797362  T
Q  221 cgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgta 320  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| ||    
T  51797361 catgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcata 51797262  T
Q  321 gcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctg 419  Q
     || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51797261 acacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctg 51797162  T
Q  420 tctggttgtgcagtgccctct 440  Q
    ||| ||||| || ||||||||    
T  51797161 tctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 535 - 645
Target Start/End: Original strand, 15894232 - 15894342
Alignment:
Q  535 tgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctct 634  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15894232 tgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagtagctaactcggtacggagctgagcgttttct 15894331  T
Q  635 tcttccatagc 645  Q
    |||||||||||    
T  15894332 tcttccatagc 15894342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 4720365 - 4720228
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4720365 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 4720266  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4720265 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 4720228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 6191050 - 6190913
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6191050 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 6190951  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6190950 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 6190913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5712636 - 5712499
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5712636 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 5712537  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5712536 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 5712499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5723546 - 5723409
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5723546 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 5723447  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5723446 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 5723409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 5757919 - 5758056
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5757919 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 5758018  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5758019 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 5758056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 5768822 - 5768959
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5768822 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 5768921  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5768922 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 5768959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 18329408 - 18329271
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18329408 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 18329309  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  18329308 cttcttccatagcctttttccttcttctatattctctg 18329271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5649575 - 5649461
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  5649575 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 5649476  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  5649475 ttcctcttccatagc 5649461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 15335489 - 15335603
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15335489 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttggccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 15335588  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  15335589 ttcttcttccatagc 15335603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 641
Target Start/End: Original strand, 15728337 - 15728447
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  15728337 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgaacatt 15728436  T
Q  631 ctcttcttcca 641  Q
     ||||||||||    
T  15728437 ttcttcttcca 15728447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 533 - 663
Target Start/End: Original strand, 17994630 - 17994760
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17994630 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 17994729  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgta 663  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17994730 cttcttccatagcctttttccttcttctgta 17994760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 29150279 - 29150415
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29150279 gctgattgttcttgagcggctagtagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 29150378  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29150379 cttcttccatag-ccttttttttcttctgtattctctg 29150415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 36998613 - 36998750
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36998613 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 36998712  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36998713 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 36998750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4686778 - 4686664
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  4686778 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtattattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 4686679  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  4686678 ttcctcttccatagc 4686664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4886246 - 4886132
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4886246 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 4886147  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  4886146 ttcttcttccatagc 4886132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 18529128 - 18529014
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18529128 tggctgattattcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 18529029  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  18529028 ttcctcttccatagc 18529014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 557 - 670
Target Start/End: Original strand, 50135619 - 50135732
Alignment:
Q  557 agagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttc 656  Q
    ||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50135619 agagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttc 50135718  T
Q  657 ttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||    
T  50135719 ttctgtattctctg 50135732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 8302783 - 8302894
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8302783 tggctgattgttcctgagcggctagcagagctgtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 8302882  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  8302883 ttcttcttccat 8302894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 35879502 - 35879391
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35879502 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 35879403  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  35879402 ctcttcttccat 35879391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5012407 - 5012309
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5012407 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 5012309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 5610885 - 5610983
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5610885 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 5610983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 532 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 8294710 - 8294600
Alignment:
Q  532 ggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttc 631  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8294710 ggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttaaagtggctaactcggtacggagctgagcattc 8294611  T
Q  632 tcttcttccat 642  Q
    |||||||||||    
T  8294610 tcttcttccat 8294600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 24326854 - 24326756
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24326854 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 24326756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28337998 - 28337900
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28337998 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28337900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 31966036 - 31966134
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31966036 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31966134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 4798175 - 4798286
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4798175 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 4798274  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  4798275 ctcttcttccat 4798286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 599 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 7995230 - 7995159
Alignment:
Q  599 agagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7995230 agagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 7995159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 599 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 10641738 - 10641667
Alignment:
Q  599 agagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10641738 agagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 10641667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 18049998 - 18049887
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18049998 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 18049899  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  18049898 ctcttcttccat 18049887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 4415611 - 4415513
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4415611 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttttttcttctgtattctctg 4415513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 17986519 - 17986617
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17986519 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17986617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 18223886 - 18223788
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18223886 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18223788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 534 - 642
Target Start/End: Original strand, 15742599 - 15742707
Alignment:
Q  534 ctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctc 633  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15742599 ctgattgttcttgagcggctagcagggcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcattctc 15742698  T
Q  634 ttcttccat 642  Q
    |||||||||    
T  15742699 ttcttccat 15742707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 16628006 - 16628119
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||    
T  16628006 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatagtgtcattggcctt-atcaattcttccctcagagaagctaactcggtatggagctgagcatt 16628104  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  16628105 ttcctcttccatagc 16628119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 534 - 642
Target Start/End: Original strand, 14448442 - 14448550
Alignment:
Q  534 ctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctc 633  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14448442 ctgattgttcttgagcggctancagagcagtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcattctc 14448541  T
Q  634 ttcttccat 642  Q
    |||||||||    
T  14448542 ttcttccat 14448550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 304 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893154
Alignment:
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
     | ||| ||||| || ||||||    
T  4893175 atattgctgctgctgctgttga 4893154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 4348195 - 4348327
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  4348195 ttgttcctgagcagctaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 4348294  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4348295 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4348327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 28117541 - 28117600
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28117541 tcggtacggagctgagagttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28117600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 7071959 - 7071827
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  7071959 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagctgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 7071860  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071859 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 7071827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28020025 - 28019893
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  28020025 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 28019926  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28019925 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28019893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 18278636 - 18278695
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18278636 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18278695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 18293937 - 18293996
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18293937 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18293996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 18309238 - 18309297
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18309238 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18309297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 22389081 - 22389218
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||| |||||| || || || |||||||| ||||| | |||||  || ||| ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | |||||    
T  22389081 gctggttgttcttgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttagccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttct 22389180  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22389181 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 22389218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 32437857 - 32437772
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32437857 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 32437772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 51780693 - 51780608
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51780693 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 51780608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 51795780 - 51795695
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51795780 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 51795695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 6543985 - 6544117
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  6543985 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 6544084  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6544085 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 6544117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 18241474 - 18241342
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  18241474 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 18241375  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18241374 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18241342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 22872385 - 22872517
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  22872385 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 22872484  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22872485 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 22872517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 22887444 - 22887576
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  22887444 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 22887543  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22887544 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 22887576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 5597950 - 5598009
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5597950 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 5598009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 8210415 - 8210356
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8210415 tcggtacgaagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 8210356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 10394810 - 10394751
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394810 tcggtacgaagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 10394751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 20578446 - 20578505
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20578446 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 20578505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4891913 - 4891831
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattct 667  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4891913 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattct 4891831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Original strand, 29666586 - 29666628
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29666586 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 29666628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 47022110 - 47022068
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47022110 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 47022068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5465732 - 5465600
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  5465732 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 5465633  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5465632 tccatagcccttttctttcttctgtgttctctg 5465600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 11111945 - 11112004
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11111945 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 11112004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 21673367 - 21673308
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21673367 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 21673308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 48464589 - 48464530
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48464589 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 48464530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 595 - 645
Target Start/End: Original strand, 16467862 - 16467912
Alignment:
Q  595 cctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 645  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16467862 cctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttcttccatagc 16467912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 26788445 - 26787776
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26788445 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26788346  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26788345 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26788246  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26788245 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 26788146  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26788145 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 26788046  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26788045 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26787946  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26787945 ttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattgaccttagccaattcttccctcag 26787846  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26787845 agaagttaactcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 26787776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 14142980 - 14143647
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14142980 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 14143079  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14143080 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 14143179  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  14143180 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 14143279  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  14143280 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 14143379  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14143380 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14143479  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14143480 ttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattgaccttagccaattcttccctcag 14143579  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctc 668  Q
    ||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14143580 agaagttaactcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctc 14143647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 27196818 - 27196151
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27196818 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27196719  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27196718 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27196619  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  27196618 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 27196519  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27196518 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 27196419  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27196418 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27196319  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27196318 ttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattgaccttagccaattcttccctcag 27196219  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctc 668  Q
    ||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27196218 agaagttaactcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctc 27196151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 27252422 - 27253089
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27252422 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27252521  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27252522 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27252621  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  27252622 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 27252721  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27252722 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 27252821  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27252822 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27252921  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27252922 ttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattgaccttagccaattcttccctcag 27253021  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctc 668  Q
    ||  | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27253022 agaagttaactcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctc 27253089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 645
Target Start/End: Original strand, 27290062 - 27290706
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27290062 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27290161  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27290162 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatatac 27290261  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||     
T  27290262 ctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttc 27290361  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  27290362 acaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggat 27290461  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27290462 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtct 27290561  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290562 agcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 27290661  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 645  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  27290662 agaagctaactcggcacggagctgaacattttcttcttccatagc 27290706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Original strand, 22456638 - 22457149
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  22456638 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgat 22456737  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||         ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456738 catggtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 22456828  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  22456829 aatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcaca 22456928  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22456929 atgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcag 22457028  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22457029 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22457128  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| || ||| |||||||    
T  22457129 ttgttgctgttgtcgttgttg 22457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 13521768 - 13522289
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  13521768 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 13521867  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13521868 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 13521967  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  13521968 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 13522067  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  13522068 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 13522167  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13522168 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
     ||||| |||||| ||||||||    
T  13522268 ctgttgctgctgtcgttgttga 13522289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 8892007 - 8892526
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8892007 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8892106  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8892107 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8892206  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8892207 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 8892305  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  8892306 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 8892405  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8892406 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 8892505  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  8892506 tgttgctgctgtcgttgttga 8892526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 8903242 - 8903761
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8903242 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8903341  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8903342 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8903441  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8903442 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 8903540  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  8903541 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 8903640  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8903641 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 8903740  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  8903741 tgttgctgctgtcgttgttga 8903761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28163157 - 28162637
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28163157 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 28163058  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28163057 atggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 28162958  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28162957 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 28162858  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | |    
T  28162857 tgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaag 28162758  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28162757 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 28162658  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  28162657 tgttgctgctgtcgttgttga 28162637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 33373952 - 33374472
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33373952 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33374051  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33374052 gtggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 33374151  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33374152 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33374251  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  33374252 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 33374351  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33374352 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 33374451  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  33374452 tgttgctgctgtcgttgttga 33374472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 13298643 - 13299166
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  13298643 tcactgacagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 13298742  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13298743 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 13298842  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  13298843 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 13298942  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  13298943 acgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 13299042  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  13299043 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13299142  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  13299143 agcttgctgattttgttgttgttg 13299166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 22934572 - 22935096
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  22934572 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 22934671  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22934672 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22934771  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22934772 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 22934871  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  22934872 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 22934971  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22934972 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 22935071  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  22935072 agcttgctgattttgttgttgttga 22935096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 23857017 - 23857541
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23857017 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23857116  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23857117 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23857216  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23857217 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 23857316  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  23857317 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 23857416  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23857417 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23857516  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  23857517 agcttgctgattttgttgttgttga 23857541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26918884 - 26918361
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  26918884 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 26918785  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26918784 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 26918685  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||||||     
T  26918684 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttc 26918585  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26918584 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26918485  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26918484 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 26918385  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  26918384 agcttgctgattttgttgttgttg 26918361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 27272272 - 27272795
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||    
T  27272272 tcactaacagtcaaaaacttatcattcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggcat 27272371  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27272372 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatac 27272471  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||| |  || ||||| |  |||||||||||     
T  27272472 ttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttc 27272571  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| ||||||    
T  27272572 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggat 27272671  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  27272672 caggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
      |||| |||| ||||||||||||    
T  27272772 gacttgctgattctgttgttgttg 27272795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20161182 - 20160681
Alignment:
Q  24 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 123  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  20161182 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 20161083  T
Q  124 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 223  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |    
T  20161082 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcat 20160983  T
Q  224 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 323  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20160982 gattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagca 20160883  T
Q  324 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 423  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  20160882 cccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctg 20160783  T
Q  424 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgtt 523  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  20160782 gttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgtt 20160683  T
Q  524 ga 525  Q
    ||    
T  20160682 ga 20160681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Original strand, 22171649 - 22172150
Alignment:
Q  24 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 123  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  22171649 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 22171748  T
Q  124 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 223  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |    
T  22171749 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcat 22171848  T
Q  224 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 323  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22171849 gattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagca 22171948  T
Q  324 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 423  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  22171949 cccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctg 22172048  T
Q  424 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgtt 523  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  22172049 gttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgtt 22172148  T
Q  524 ga 525  Q
    ||    
T  22172149 ga 22172150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26989506 - 26988982
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  26989506 tcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 26989407  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  26989406 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 26989307  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||    
T  26989306 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 26989207  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||    
T  26989206 tacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 26989107  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  26989106 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 26989007  T
Q  500 tagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||    
T  26989006 tagcttgctgattttgttgatgttg 26988982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 16750358 - 16749835
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  16750358 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 16750259  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16750258 gatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacatac 16750159  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16750158 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16750059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16750058 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16749959  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16749958 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16749859  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  16749858 agcttgctgattttgttgttgttg 16749835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 277 - 524
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477488
Alignment:
Q  277 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 376  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  377 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacat 476  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  477 tggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttg 22477488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 24304310 - 24304833
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24304310 tcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24304409  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24304410 ggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24304509  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24304510 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24304609  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24304610 acgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24304709  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  24304710 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24304809  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  24304810 agcttgctgattttgttgttgttg 24304833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 24864221 - 24863698
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24864221 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24864122  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24864121 gatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24864022  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24864021 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24863922  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24863921 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24863822  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  24863821 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24863722  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  24863721 agcttgctgattttgttgttgttg 24863698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 15424009 - 15424532
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||||    
T  15424009 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcggcat 15424108  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15424109 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15424208  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  15424209 tttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 15424308  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  15424309 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 15424408  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  15424409 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 15424508  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  15424509 agcttgctgattttgttgttgttg 15424532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29549979 - 29549455
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  29549979 tcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 29549880  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  |||||||||||| | ||    
T  29549879 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacac 29549780  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  29549779 ttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29549680  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29549679 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29549580  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  29549579 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 29549480  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||    
T  29549479 agcgtattgctgctgctgttgttga 29549455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 17092132 - 17092427
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||  ||    
T  17092132 tcactaacagtcagatagttgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgctat 17092231  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | || || |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  17092232 gatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcacatac 17092331  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092332 ctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 29573517 - 29572994
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  29573517 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 29573418  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  29573417 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 29573318  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  29573317 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 29573218  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29573217 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29573118  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  29573117 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 29573018  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  29573017 agcttgctgattttgttgttgttg 29572994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 34463038 - 34463537
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34463038 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 34463137  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  34463138 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 34463237  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  34463238 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 34463337  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34463338 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34463437  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  34463438 caggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4773510 - 4773009
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4773510 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4773411  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4773410 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4773311  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4773310 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4773211  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4773210 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4773111  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4773110 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 4773011  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  4773010 ag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3696582 - 3696086
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  |||||||||    
T  3696582 ctgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgat 3696483  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |  ||    
T  3696482 cgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttc 3696383  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||     
T  3696382 gatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacg 3696283  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||    
T  3696282 atatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcag 3696183  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  3696182 gtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 184 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000054
Alignment:
Q  184 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 283  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  284 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 383  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  384 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatc 483  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  484 ggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 27000054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16674643 - 16674144
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16674643 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16674544  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  16674543 gatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 16674444  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16674443 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16674344  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16674343 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16674244  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  16674243 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 30557708 - 30558231
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  30557708 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 30557807  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  30557808 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 30557907  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  30557908 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 30558007  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30558008 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30558107  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30558108 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 30558207  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  30558208 agcttgctgattttgttgttgttg 30558231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 4545467 - 4545957
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4545467 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4545566  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4545567 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4545666  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4545667 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4545766  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4545767 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4545866  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaa 491  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4545867 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4758244 - 4757767
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  4758244 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 4758145  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  4758144 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 4758045  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  4758044 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 4757945  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  4757944 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 4757845  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4757844 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 4723826 - 4724316
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||| ||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||||||    
T  4723826 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttggcat 4723925  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4723926 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4724025  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||| || ||     
T  4724026 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttcttc 4724125  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4724126 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4724225  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaa 491  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4724226 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4525790 - 4525289
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  4525790 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 4525691  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4525690 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4525591  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4525590 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4525491  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||| | |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4525490 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4525391  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4525390 caggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 4525291  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  4525290 ag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 28207958 - 28207468
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  28207958 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 28207859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  28207858 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 28207759  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  28207758 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 28207659  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28207658 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28207559  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaa 491  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28207558 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27008231 - 27007730
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27008231 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27008132  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||| | | ||    
T  27008131 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacac 27008032  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| ||||  |||||||| ||     
T  27008031 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttc 27007932  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27007931 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27007832  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27007831 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 27007732  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  27007731 ag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 27359684 - 27360207
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27359684 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27359783  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27359784 gatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27359883  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27359884 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27359983  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27359984 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27360083  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27360084 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtct 27360183  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||  |  || ||||||||||||||    
T  27360184 agtatactgctgctgttgttgttg 27360207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 27450027 - 27450550
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27450027 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27450126  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27450127 gatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27450226  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27450227 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27450326  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27450327 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27450426  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  27450427 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtct 27450526  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||  |  || ||||||||||||||    
T  27450527 agtatactgctgctgttgttgttg 27450550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 27485609 - 27485110
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  27485609 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27485510  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  27485509 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 27485410  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  27485409 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 27485310  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  27485309 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 27485210  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27485209 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27485110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 26116102 - 26116603
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||| | || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  26116102 tcactgacagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 26116201  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26116202 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26116301  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  26116302 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 26116401  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26116402 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26116501  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| |||||| || |  || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  26116502 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtct 26116601  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  26116602 ag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29501919 - 29501418
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  29501919 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 29501820  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29501819 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29501720  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  29501719 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 29501620  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29501619 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29501520  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29501519 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtct 29501420  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  29501419 ag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 521
Target Start/End: Original strand, 16943719 - 16944239
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16943719 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16943818  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16943819 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16943918  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16943919 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 16944018  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16944019 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16944118  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  16944119 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcct 16944218  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttg 521  Q
     ||||| ||||  ||||||||    
T  16944219 ggcttgctgattttgttgttg 16944239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27044892 - 27044390
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  27044892 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttggcat 27044793  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27044792 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27044693  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  27044692 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 27044593  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgt-agcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
    || || ||||||||||| | | || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||     
T  27044592 acgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 27044493  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  27044492 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtc 27044393  T
Q  500 tag 502  Q
    |||    
T  27044392 tag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 27631135 - 27631272
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631135 gctgattgctcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 27631234  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631235 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27631272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17025652 - 17025280
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  17025652 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 17025553  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  17025552 gaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 17025453  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||    
T  17025452 gacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtg 17025353  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    ||||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17025352 cagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 26777302 - 26777830
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  26777302 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 26777401  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtg-----gcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |     ||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||  |||||||    
T  26777402 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctca 26777501  T
Q  196 tatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagct 295  Q
     | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| |    
T  26777502 cacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtt 26777601  T
Q  296 tttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaa 395  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||    
T  26777602 tcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaa 26777701  T
Q  396 cggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggta 495  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||     
T  26777702 cggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggtt 26777801  T
Q  496 ggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  26777802 ggtctagcatattgctgctgctgctgttg 26777830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 26917151 - 26917014
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26917151 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 26917052  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26917051 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 26917014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28162105 - 28161968
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28162105 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 28162006  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28162005 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 28161968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 8893058 - 8893195
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8893058 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 8893157  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8893158 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 8893195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 8904293 - 8904430
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904293 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 8904392  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8904393 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 8904430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 13522821 - 13522958
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13522821 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 13522920  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13522921 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 13522958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 33375004 - 33375141
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33375004 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 33375103  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33375104 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 33375141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 22477886 - 22478000
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22477886 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcaaggtatcattggccttagccaattattccctaagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 22477985  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  22477986 ttcttcttccatagc 22478000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 16748624 - 16748488
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16748624 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactct-tacggagctgagcgttct 16748526  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16748525 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 16748488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 13300375 - 13300486
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13300375 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 13300474  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  13300475 ctcttcttccat 13300486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 15425741 - 15425852
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15425741 tggctgattgttcttgagcggctagtaaagcggtcatgacatcattggccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 15425840  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  15425841 ctcttcttccat 15425852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 24306042 - 24306153
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24306042 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagccttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 24306141  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  24306142 ctcttcttccat 24306153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 16945492 - 16945590
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16945492 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16945590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 29571744 - 29571646
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29571744 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 29571646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 22936284 - 22936395
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22936284 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 22936383  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  22936384 ttcttcttccat 22936395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 23858729 - 23858840
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23858729 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 23858828  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  23858829 ttcttcttccat 23858840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 30559481 - 30559579
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30559481 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 30559579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 535 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 24862485 - 24862378
Alignment:
Q  535 tgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctct 634  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  24862485 tgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcattttct 24862386  T
Q  635 tcttccat 642  Q
    ||||||||    
T  24862385 tcttccat 24862378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 26987776 - 26987665
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  26987776 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctaagcatt 26987677  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  26987676 ctcttcttccat 26987665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 26998844 - 26998733
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26998844 tggctgattgttcttgagcggctagcatagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 26998745  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  26998744 ctcttcttccat 26998733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27019640 - 27019461
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || |||| ||||| |||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27019640 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27019541  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 180  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||    
T  27019540 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 535 - 645
Target Start/End: Original strand, 27278885 - 27278995
Alignment:
Q  535 tgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctct 634  Q
    ||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27278885 tgattgttcttgagcagctagcagagcagtcatggtatcatgggccttagccagctcttcccttagagtagccaactcggtgcgaagctgagtgttctct 27278984  T
Q  635 tcttccatagc 645  Q
    |||||||||||    
T  27278985 tcttccatagc 27278995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 535 - 645
Target Start/End: Original strand, 27303776 - 27303886
Alignment:
Q  535 tgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctct 634  Q
    ||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27303776 tgattgttcttgagcagctagcagagcagtcatggtatcatgggccttagccagctcttcccttagagtagccaactcggtgcgaagctgagtgttctct 27303875  T
Q  635 tcttccatagc 645  Q
    |||||||||||    
T  27303876 tcttccatagc 27303886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 4725556 - 4725688
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  4725556 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgtgtgttctcttct 4725655  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725656 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4725688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 4524072 - 4523940
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  4524072 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 4523973  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4523972 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4523940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 4547197 - 4547329
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  4547197 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 4547296  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4547297 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4547329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 26117832 - 26117964
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  26117832 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagctgtgtgttctcttct 26117931  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26117932 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26117964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 26779041 - 26779173
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  26779041 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 26779140  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26779141 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26779173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27006495 - 27006363
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  27006495 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 27006396  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27006395 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27006363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27483900 - 27483768
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  27483900 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 27483801  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27483800 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27483768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28206225 - 28206093
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  28206225 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 28206126  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206125 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28206093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 27043099 - 27043040
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27043099 tcggtacggagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 27043040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 29548261 - 29548130
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  29548261 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagctgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 29548162  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctct 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29548161 tccatagcccttttctttcttctgtattctct 29548130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 3694885 - 3694753
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  3694885 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 3694786  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3694785 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 3694753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 34464774 - 34464906
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  34464774 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 34464873  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34464874 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 34464906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 29500116 - 29500057
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29500116 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 29500057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 538 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 20159502 - 20159396
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    |||||| || || ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  20159502 ttgttcttgtgcagctaacagagcagccgtggtatcatgggccttagccaagtcttctttcagagaggccaattcggcgcggagctgagcattctcttct 20159403  T
Q  638 tccatag 644  Q
    |||||||    
T  20159402 tccatag 20159396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 538 - 644
Target Start/End: Original strand, 22173329 - 22173435
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    |||||| || || ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22173329 ttgttcttgtgcagctaacagagcagccgtggtatcatgggccttagccaagtcttctttcagagaggccaattcggcgcggagctgagcattctcttct 22173428  T
Q  638 tccatag 644  Q
    |||||||    
T  22173429 tccatag 22173435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 4756497 - 4756412
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4756497 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtactctctg 4756412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 4771733 - 4771648
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4771733 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtactctctg 4771648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 17023966 - 17023913
Alignment:
Q  617 cggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17023966 cggagctgtgtgttttcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17023913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 16672837 - 16672778
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16672837 tcggtacggagttgtgtgttctcttcttccatagcccttttcttccttctgtattctctg 16672778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27629392 - 27629645
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||  ||| ||   |||| || |||    
T  27629392 tcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaacgcggcaacccaagggattaagggcgcactcggagcaactgtcat 27629491  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| || || |  || || ||||||| |||||| ||||  ||||| || || ||| |||| ||||| |||||  |    
T  27629492 gatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcatacgc 27629591  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagg 254  Q
     ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||    
T  27629592 ttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgagg 27629645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 27361423 - 27361555
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  27361423 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 27361522  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27361523 tccatagcctttttccttcttctgtactctctg 27361555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 27451766 - 27451898
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  27451766 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 27451865  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27451866 tccatagcctttttccttcttctgtactctctg 27451898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 670
Target Start/End: Original strand, 39210661 - 39211330
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  39210661 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 39210760  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39210761 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 39210860  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  39210861 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 39210960  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  39210961 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 39211060  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39211061 gtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 39211160  T
Q  504 ttgttgatgc---tgttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    |||||| |||    ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39211161 ttgttgctgcggtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcag 39211260  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  39211261 agaagttaattcggtacggagctgagcgttctcttcttccatagcctttttccttcttatgtactctctg 39211330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 26485199 - 26484558
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26485199 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26485100  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26485099 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26485000  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26484999 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 26484900  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26484899 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 26484800  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26484799 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26484700  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26484699 ttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctaggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcag 26484600  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 642  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  26484599 agaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 26484558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 16449636 - 16450157
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16449636 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgat 16449735  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16449736 catggtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctc 16449835  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  16449836 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 16449935  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  16449936 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcag 16450035  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450036 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16450135  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  16450136 ttgttgctgctgttgctgttga 16450157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16041828 - 16041307
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16041828 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgat 16041729  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16041728 cgtgattaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctc 16041629  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||| |||    
T  16041628 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcaca 16041529  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16041528 atgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16041429  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16041428 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 16041329  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16041328 ttgttgatgctgttgttgttga 16041307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 645
Target Start/End: Original strand, 2108644 - 2109287
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2108644 tgacagttagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 2108743  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2108744 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctca 2108843  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  2108844 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 2108943  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||    
T  2108944 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 2109043  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2109044 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 2109143  T
Q  505 tgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcaga 601  Q
    ||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2109144 tgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcaga 2109243  T
Q  602 gtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 645  Q
    |  | ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  2109244 gaagttaactcggtacggagctgaacattttcttcttccatagc 2109287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 2775864 - 2775223
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  2775864 ctgatagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgat 2775765  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2775764 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 2775665  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  2775664 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 2775565  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  2775564 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 2775465  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2775464 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
     ||||| | ||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  2775364 ctgttgctactgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagctaattcttccctcat 2775265  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 642  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  2775264 agaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 2775223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 31088103 - 31088623
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31088103 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31088202  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31088203 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31088302  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31088303 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31088402  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  31088403 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 31088502  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  31088503 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 31088602  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  31088603 tgttgctgctgtcgttgttga 31088623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45733964 - 45733444
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45733964 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 45733865  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  45733864 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 45733765  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45733764 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 45733665  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  45733664 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 45733565  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  45733564 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 45733465  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  45733464 tgttgctgctgtcgttgttga 45733444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 26682638 - 26683008
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26682638 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26682737  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26682738 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26682837  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  26682838 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaa 26682937  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 374  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682938 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4201051 - 4200682
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  4201051 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 4200952  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200951 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctca 4200852  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4200851 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 4200752  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 374  Q
    |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200751 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 18541307 - 18540663
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  18541307 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcattcagcat 18541208  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  18541207 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 18541108  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtct 18540808  T
Q  501 agcttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccct 597  Q
    ||||||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18540807 agcttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccct 18540708  T
Q  598 cagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 642  Q
    |||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  18540707 cagagaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 18540663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 5128500 - 5127977
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  5128500 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 5128401  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| | || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5128400 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 5128301  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  5128300 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 5128201  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5128200 acgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5128101  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5128100 taggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 5128001  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  5128000 agcttgctgattttgttgttgttg 5127977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 10916503 - 10917027
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  10916503 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 10916602  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10916603 gatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 10916702  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  10916703 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 10916802  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  10916803 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 10916902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  10916903 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 10917002  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  10917003 agcttgctgattttgttgttgttga 10917027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 11424412 - 11424934
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  11424412 tcactaacagtcaaa-aattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 11424510  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11424511 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 11424610  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  11424611 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 11424710  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  11424711 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 11424810  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11424811 caggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 11424910  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  11424911 agcttgctgattttgttgttgttg 11424934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 16518051 - 16518574
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16518051 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16518150  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16518151 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16518250  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| ||     
T  16518251 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttc 16518350  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  16518351 acgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 16518450  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16518451 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16518550  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  16518551 agcttgctgattttgttgttgttg 16518574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 2155081 - 2154558
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  2155081 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 2154982  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  2154981 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 2154882  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  2154881 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 2154782  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  2154781 acgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 2154682  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||    
T  2154681 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtct 2154582  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  2154581 agcttgctgattttgttgttgttg 2154558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 16503015 - 16503538
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16503015 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16503114  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16503115 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16503214  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16503215 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16503314  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  16503315 acgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 16503414  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16503415 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16503514  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  16503515 agcttgctgattttgttgttgttg 16503538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 5146975 - 5147498
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5146975 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5147074  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||  | ||    
T  5147075 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 5147174  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  5147175 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 5147274  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5147275 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5147374  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5147375 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 5147474  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||||||||  |||||||||||    
T  5147475 agcttgttgattttgttgttgttg 5147498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26435765 - 26435242
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||    
T  26435765 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcggcat 26435666  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26435665 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26435566  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  26435565 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 26435466  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26435465 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26435366  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  26435365 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 26435266  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  26435265 agcttgctgattttgttgttgttg 26435242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 26274729 - 26275252
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  26274729 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 26274828  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26274829 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26274928  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26274929 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26275028  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26275029 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26275128  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  26275129 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26275228  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  26275229 agcttgctgattttgttgttgttg 26275252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 4144758 - 4145281
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| | ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4144758 tcactgacagtcagaagattatcattcattaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4144857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  4144858 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 4144957  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  4144958 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 4145057  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4145058 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4145157  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  4145158 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 4145257  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  4145258 agcttgctgattttgttgttgttg 4145281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 26319504 - 26320027
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  26319504 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttggcat 26319603  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26319604 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26319703  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26319704 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26319803  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26319804 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26319903  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  26319904 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26320003  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  26320004 agcttgctgattttgttgttgttg 26320027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3445814 - 3445315
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  3445814 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3445715  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  3445714 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 3445615  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  3445614 ttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 3445515  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  3445514 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 3445415  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  3445414 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 16736095 - 16736618
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16736095 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16736194  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  16736195 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 16736294  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16736295 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16736394  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  16736395 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 16736494  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  16736495 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 16736594  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  16736595 agcttgctgattttgttgttgttg 16736618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 16751149 - 16751672
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16751149 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16751248  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  16751249 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 16751348  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16751349 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16751448  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  16751449 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 16751548  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  16751549 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 16751648  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  16751649 agcttgctgattttgttgttgttg 16751672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 17524040 - 17523517
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  17524040 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 17523941  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  17523940 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 17523841  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  17523840 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 17523741  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  17523740 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 17523641  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  17523640 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 17523541  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  17523540 agcttgctgattttgttgttgttg 17523517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 17529175 - 17529698
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  17529175 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 17529274  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  17529275 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 17529374  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  17529375 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 17529474  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  17529475 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 17529574  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  17529575 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 17529674  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  17529675 agcttgctgattttgttgttgttg 17529698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 26537505 - 26538004
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  26537505 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcat 26537604  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26537605 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26537704  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26537705 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 26537804  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26537805 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26537904  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  26537905 caggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 9619159 - 9618636
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  9619159 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 9619060  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  9619059 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 9618960  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9618959 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9618860  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9618859 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9618760  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  9618759 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9618660  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  9618659 agcttgctgattttgttgttgttg 9618636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Original strand, 26669573 - 26670072
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  26669573 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 26669672  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  26669673 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 26669772  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26669773 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26669872  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  26669873 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 26669972  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26669973 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26670072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 31564025 - 31564526
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  31564025 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31564124  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  31564125 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31564224  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31564225 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31564324  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31564325 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31564424  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31564425 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31564524  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  31564525 ag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 24592176 - 24592699
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24592176 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24592275  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  24592276 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 24592375  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  24592376 ttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 24592475  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  24592476 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 24592575  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  24592576 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcct 24592675  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     ||||| ||||  |||||||||||    
T  24592676 ggcttgctgattttgttgttgttg 24592699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 45387851 - 45387328
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  45387851 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 45387752  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  45387751 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 45387652  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  45387651 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 45387552  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  45387551 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 45387452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  45387451 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 45387352  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  45387351 agcttgctgattttgttgttgttg 45387328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 11442021 - 11441590
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11442021 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 11441922  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || |  || || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  11441921 gcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacat 11441822  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  11441821 tattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 11441722  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  11441721 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 11441622  T
Q  460 aactcggcatataacattggtatcggaggaaa 491  Q
    |  || || || ||||||||||| ||||||||    
T  11441621 agttctgcgtacaacattggtataggaggaaa 11441590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 31125404 - 31124905
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  31125404 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 31125305  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  31125304 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 31125205  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  31125204 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 31125105  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  31125104 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 31125005  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  31125004 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 31124905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5160027 - 5159503
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  5160027 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcat 5159928  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  5159927 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 5159828  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  5159627 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 5159528  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  5159527 agcatattgctgctgctgctgttga 5159503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5126768 - 5126629
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5126768 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 5126669  T
Q  631 ctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5126668 ctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 5126629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 31089155 - 31089292
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31089155 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 31089254  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31089255 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 31089292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16040102 - 16039988
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16040102 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 16040003  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  16040002 ttcttcttccatagc 16039988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 16519782 - 16519896
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16519782 tggctgattgttcctgagcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagtagctaactcggtacggagctgagcatt 16519881  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  16519882 ttcttcttccatagc 16519896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 11440334 - 11440197
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11440334 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 11440235  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11440234 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 11440197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 45732912 - 45732775
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45732912 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 45732813  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  45732812 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 45732775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 16451362 - 16451476
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | ||    
T  16451362 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgcacatt 16451461  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  16451462 ttcttcttccatagc 16451476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 3444068 - 3443931
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3444068 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 3443969  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3443968 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 3443931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 10918232 - 10918343
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  10918232 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgatatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctaagcatt 10918331  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  10918332 ctcttcttccat 10918343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 4146531 - 4146629
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4146531 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 4146629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 9617386 - 9617288
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9617386 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 9617288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 16504746 - 16504860
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16504746 tggctgattgttcctgagtggctagaagagtagtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagtagctaactcggtacggagctgagcatt 16504845  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  16504846 ttcttcttccatagc 16504860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 24593949 - 24594047
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24593949 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 24594047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 26276502 - 26276600
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26276502 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26276600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 26321277 - 26321375
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321277 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26321375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 26671322 - 26671420
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26671322 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26671420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 45386078 - 45385980
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45386078 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 45385980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 16737868 - 16737966
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737868 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcagtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16737966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 16752922 - 16753020
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752922 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcagtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16753020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 17522267 - 17522169
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17522267 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcagtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17522169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 17530948 - 17531046
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17530948 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcagtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17531046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 533 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 2153346 - 2153237
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2153346 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcattct 2153247  T
Q  633 cttcttccat 642  Q
    ||||||||||    
T  2153246 cttcttccat 2153237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 533 - 642
Target Start/End: Original strand, 11426145 - 11426254
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11426145 gctgattgttcttgagcggctagcagggcagtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 11426244  T
Q  633 cttcttccat 642  Q
    ||||||||||    
T  11426245 cttcttccat 11426254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26513289 - 26513130
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  26513289 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 26513190  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttg 160  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26513189 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 26539229 - 26539361
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| ||||| || | ||||||||||    
T  26539229 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatggcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagttgcgtgttctcttct 26539328  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26539329 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26539361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 26487100 - 26487232
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  26487100 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 26487199  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487200 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26487232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 5148769 - 5148828
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5148769 tcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcccttttccttcttctgtattctctg 5148828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 31565828 - 31565887
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31565828 tcggtacgaagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31565887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 26434044 - 26433912
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  26434044 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 26433945  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26433944 tccatagcccttttctttcttctgtactctctg 26433912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 31123698 - 31123566
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  31123698 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttttcttct 31123599  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31123598 tccatagcccttttctttcttctgtactctctg 31123566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5120200 - 5120115
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5120200 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttccaccatagcctttttccttcttctgtattctctg 5120115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22888983 - 22888462
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  22888983 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgat 22888884  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22888883 catggtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctc 22888784  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  22888783 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 22888684  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22888683 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 22888584  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22888583 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 22888484  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22888483 ttgttgatgctgttgttgttga 22888462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 645
Target Start/End: Original strand, 29888732 - 29889372
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29888732 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 29888831  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    | ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29888832 acggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctca 29888931  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  29888932 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacga 29889031  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  29889032 tgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcagg 29889131  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29889132 tggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 29889231  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtg 604  Q
    ||||| |||||| |||||||| | |  |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||      
T  29889232 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgattgttcccaggcggctagcagagcagtcatggtatcattggcctttgccaattcttccctcagagaa 29889331  T
Q  605 gctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 645  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29889332 gccaactcggtgcgaagctgagtgttctcttcctccatagc 29889372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25199542 - 25199021
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  25199542 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgat 25199443  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25199442 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctc 25199343  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  25199342 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 25199243  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  25199242 atgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcag 25199143  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25199142 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagc 25199043  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25199042 ttgttgatgctgttgttgttga 25199021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 13184299 - 13184818
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13184299 tgacagtcagataattgtcgttcatcat-ctctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 13184397  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13184398 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13184497  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13184498 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13184597  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  13184598 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13184697  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13184698 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 13184797  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  13184798 tgttgctgctgtcgttgttga 13184818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33877760 - 33877239
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  33877760 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 33877661  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33877660 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 33877561  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  33877560 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 33877461  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  33877460 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 33877361  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33877360 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
     ||||| |||||| ||||||||    
T  33877260 ctgttgctgctgtcgttgttga 33877239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11326306 - 11325786
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11326306 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 11326207  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11326206 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 11326107  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  11326106 atcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 11326007  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  11326006 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 11325907  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11325906 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 11325807  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  11325806 tgttgctgctgtcgttgttga 11325786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 13440144 - 13440664
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13440144 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 13440243  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13440244 atggtcaaacagaaaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13440343  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13440344 atcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13440443  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  13440444 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13440543  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13440544 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 13440643  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  13440644 tgttgctgctgtcgttgttga 13440664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 23892722 - 23892199
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||| || ||||  ||||||    
T  23892722 tcactaacagttaaataattgtcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttggcat 23892623  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23892622 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 23892523  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||     
T  23892522 ctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttc 23892423  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  23892422 acgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggat 23892323  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23892322 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtct 23892223  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  23892222 agcttgttgatgttgttgttgttg 23892199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 524
Target Start/End: Original strand, 9548193 - 9548712
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  9548193 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatc 9548292  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || ||     
T  9548293 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcg 9548392  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  9548393 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 9548492  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  9548493 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 9548592  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  9548593 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagct 9548692  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  9548693 tgctgattttgttgttgttg 9548712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 24687803 - 24688326
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24687803 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatggcat 24687902  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24687903 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24688002  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  24688003 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 24688102  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  24688103 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 24688202  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  24688203 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtct 24688302  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  24688303 agcttgctgattttgttgttgttg 24688326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 23717634 - 23718157
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23717634 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23717733  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23717734 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23717833  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23717834 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23717933  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  23717934 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 23718033  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23718034 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23718133  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  23718134 agcttgctgattttgttgttgttg 23718157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 23752096 - 23752619
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  23752096 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 23752195  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23752196 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23752295  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23752296 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23752395  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  23752396 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggat 23752495  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23752496 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23752595  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  23752596 agcttgctgattttgttgttgttg 23752619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 33778003 - 33777480
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  33778003 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 33777904  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  33777903 gatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 33777804  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  33777803 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 33777704  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  33777703 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggat 33777604  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  33777603 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 33777504  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  33777503 agcttgctgattttgttgttgttg 33777480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 30935149 - 30934625
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  30935149 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 30935050  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  30935049 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 30934950  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  30934949 ttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 30934850  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  30934849 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 30934750  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  30934749 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 30934650  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  30934649 agcttgctgattttgttgttgttga 30934625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 22998760 - 22999283
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  22998760 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 22998859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22998860 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22998959  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22998960 ttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 22999059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  22999060 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 22999159  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22999160 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 22999259  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  22999260 agcttgctgattttgttgttgttg 22999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 11549863 - 11549347
Alignment:
Q  8 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatg 107  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    
T  11549863 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11549764  T
Q  108 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 207  Q
    |   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||  |||| || |||    
T  11549763 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatc 11549664  T
Q  208 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 307  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |    
T  11549663 atatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatat 11549564  T
Q  308 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 407  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11549563 acttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11549464  T
Q  408 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt 507  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  11549463 gggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgc 11549364  T
Q  508 tgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||  |||||||||||    
T  11549363 tgattttgttgttgttg 11549347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24970534 - 24970014
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24970534 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24970435  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||  |||    
T  24970434 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgtac 24970335  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    |||||||| |  |||||||| ||     
T  24970334 tttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttc 24970235  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24970234 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24970135  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  24970134 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24970035  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttg 521  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  24970034 agcttgttgatgttgttgttg 24970014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 15658406 - 15658929
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  15658406 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 15658505  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | |     
T  15658506 gatcatggctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacat 15658605  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15658606 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15658705  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  15658706 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15658805  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  15658806 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 15658905  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  15658906 agcttgctgattttgttgttgttg 15658929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 18500376 - 18500877
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18500376 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 18500475  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||||||| | ||    
T  18500476 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacac 18500575  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18500576 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18500675  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18500676 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18500775  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  18500776 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 18500875  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  18500876 ag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 6874821 - 6874298
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  6874821 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 6874722  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  6874721 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 6874622  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  || ||||| ||     
T  6874621 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttc 6874522  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  6874521 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 6874422  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  6874421 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 6874322  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  6874321 agcttgctgattttgttgttgttg 6874298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28649751 - 28649250
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||    |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  28649751 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 28649652  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  28649651 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 28649552  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28649551 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 28649452  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28649451 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28649352  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28649351 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28649252  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  28649251 ag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 12132671 - 12132148
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  ||||||    
T  12132671 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcat 12132572  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  12132571 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 12132472  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  12132471 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 12132372  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  12132371 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 12132272  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  12132271 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 12132172  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  12132171 agcttgctgattttgttgttgttg 12132148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 41675223 - 41674702
Alignment:
Q  3 actgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatga 102  Q
    ||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||    
T  41675223 actgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatga 41675124  T
Q  103 tcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacct 202  Q
    ||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| ||| ||    
T  41675123 tcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatct 41675024  T
Q  203 caatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttac 302  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| || ||    
T  41675023 caatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgac 41674924  T
Q  303 aatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggatta 402  Q
     |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |    
T  41674923 gatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatca 41674824  T
Q  403 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  41674823 ggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctag 41674724  T
Q  503 cttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| ||||  |||||||||||    
T  41674723 cttgctgattttgttgttgttg 41674702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 2511567 - 2511044
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  2511567 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 2511468  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  2511467 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 2511368  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  2511367 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 2511268  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  2511267 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 2511168  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  2511167 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 2511068  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  2511067 agcttgctgattttgttgttgttg 2511044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 9317967 - 9317444
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  9317967 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 9317868  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  9317867 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 9317768  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9317767 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9317668  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9317667 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9317568  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  9317567 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9317468  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  9317467 agcttgctgattttgttgttgttg 9317444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 18375058 - 18375581
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  18375058 tcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 18375157  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18375158 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18375257  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18375258 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 18375357  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18375358 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18375457  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18375458 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtct 18375557  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  18375558 agcttgctgattttgttgttgttg 18375581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 30152534 - 30152011
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  30152534 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 30152435  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  30152434 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 30152335  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30152334 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 30152235  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30152234 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30152135  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  30152134 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 30152035  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  30152034 agcttgctgattttgttgttgttg 30152011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 524
Target Start/End: Original strand, 8665145 - 8665644
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || ||||    
T  8665145 ttcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctt 8665244  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  8665245 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 8665344  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  8665345 atttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 8665444  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8665445 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 8665544  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  8665545 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 8665644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 15758503 - 15759026
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  15758503 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 15758602  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  15758603 gctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 15758702  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  15758703 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 15758802  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  15758803 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15758902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  15758903 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 15759002  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  15759003 agcttgctgattttgttgttgttg 15759026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 31826053 - 31826552
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  31826053 tcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31826152  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  31826153 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 31826252  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31826253 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 31826352  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31826353 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31826452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31826453 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 43078768 - 43078269
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  43078768 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 43078669  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  43078668 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 43078569  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  43078568 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 43078469  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  43078468 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 43078369  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  43078368 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 5638426 - 5637903
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5638426 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5638327  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  5638326 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 5638227  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || ||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5638226 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5638127  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5638126 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5638027  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  5638026 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5637927  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  5637926 agcttgctgattttgttgttgttg 5637903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 31431956 - 31431466
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  31431956 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 31431857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  31431856 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31431757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31431756 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31431657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31431656 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31431557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaa 491  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31431556 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 31431466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 37671129 - 37671630
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  37671129 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 37671228  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |   |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  37671229 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37671328  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  37671329 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 37671428  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37671429 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37671528  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  37671529 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 37671628  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  37671629 ag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26480907 - 26480385
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||   || | || ||  ||||||    
T  26480907 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttggcat 26480808  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26480807 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26480709  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26480708 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26480609  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26480608 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26480509  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  26480508 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26480409  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  26480408 agcttgctgattttgttgttgttg 26480385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 33516872 - 33516349
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  33516872 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 33516773  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  33516772 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 33516673  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  33516672 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 33516573  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  33516572 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 33516473  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33516472 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 33516373  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  33516372 agcttgctgattttgttgttgttg 33516349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 37358289 - 37358812
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  37358289 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 37358388  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  37358389 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37358488  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  37358489 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 37358588  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37358589 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37358688  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  37358689 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 37358788  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||  |  || ||||||||||||||    
T  37358789 agtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 13324475 - 13324976
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  13324475 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 13324574  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  13324575 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 13324674  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  13324675 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 13324774  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  13324775 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 13324874  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  13324875 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 13324974  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  13324975 ag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 30029931 - 30029408
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  30029931 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 30029832  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  30029831 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 30029732  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30029731 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 30029632  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30029631 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30029532  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  30029531 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggcct 30029432  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     ||||| ||||  |||||||||||    
T  30029431 ggcttgctgattttgttgttgttg 30029408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 30168985 - 30168462
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  | ||||    
T  30168985 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttagcat 30168886  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  30168885 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacatac 30168786  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30168785 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttc 30168686  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30168685 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30168586  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  30168585 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 30168486  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  30168485 agcttgctgattttgttgttgttg 30168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 3790057 - 3789556
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  3790057 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3789958  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  3789957 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 3789858  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  3789857 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 3789758  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  3789757 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 3789658  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  3789657 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3789558  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  3789557 ag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24681956 - 24681457
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24681956 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24681857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24681856 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24681757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  24681756 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 24681657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24681656 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24681557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  24681556 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24724483 - 24723984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24724483 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24724384  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24724383 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24724284  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  24724283 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 24724184  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24724183 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24724084  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  24724083 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 37770657 - 37771134
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  37770657 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaaagaagctt 37770756  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37770757 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37770856  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || ||     
T  37770857 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacac 37770956  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  37770957 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 37771056  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    | || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37771057 tcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Original strand, 32599118 - 32599642
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  32599118 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 32599217  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| || ||||||||| | ||    
T  32599218 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacac 32599317  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  32599318 ttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 32599417  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  32599418 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 32599517  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  32599518 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32599617  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  32599618 agcatattgctgctgctgctgttga 32599642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 34617034 - 34616510
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||    
T  34617034 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 34616935  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  34616934 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 34616835  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  34616834 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 34616735  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34616734 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34616635  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  34616634 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34616535  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  34616534 agcatattgctgctgctgctgttga 34616510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 40473195 - 40473694
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||| ||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  ||||||    
T  40473195 tcactgacagtcagaagattatcattcgtcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcat 40473294  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  40473295 ggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 40473394  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  40473395 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 40473494  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  40473495 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 40473594  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  40473595 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 37755472 - 37754995
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  37755472 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 37755373  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37755372 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37755273  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37755272 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37755173  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  37755172 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctag 37755073  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    | || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37755072 tcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33293041 - 33292517
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    ||||    
T  33293041 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcat 33292942  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  33292941 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 33292842  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33292542  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  33292541 agcatattgttgctgctgctgttga 33292517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 524
Target Start/End: Original strand, 29966806 - 29967235
Alignment:
Q  95 tggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 194  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||    
T  29966806 tggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttc 29966905  T
Q  195 atatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagc 294  Q
    | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||    
T  29966906 acacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagc 29967005  T
Q  295 ttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggca 394  Q
    || || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||    
T  29967006 ttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggca 29967105  T
Q  395 acggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggt 494  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  29967106 acggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggt 29967205  T
Q  495 aggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  29967206 tggcctggcttgctgattttgttgttgttg 29967235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 28959432 - 28959955
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  28959432 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 28959531  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| ||||  |||||| | ||    
T  28959532 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacacac 28959631  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  28959632 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 28959731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28959732 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28959831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  28959832 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28959931  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||| | ||| ||||| || |||||    
T  28959932 agcatattgctgctgctgctgttg 28959955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 9549923 - 9550060
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9549923 gctgattgctcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 9550022  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9550023 cttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 9550060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 670
Target Start/End: Original strand, 23000492 - 23000631
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23000492 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 23000591  T
Q  631 ctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23000592 ctcttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 23000631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 24950894 - 24950780
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24950894 tggctgattgttcctgagcggctagcagagctgtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagtagctaactcggtacggagctgagcgtt 24950795  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  24950794 ttcttcttccatagc 24950780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 33776269 - 33776132
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33776269 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 33776170  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33776169 cttcttccatagcctttttccttcttctgtattctctg 33776132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 11325254 - 11325117
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11325254 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 11325155  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11325154 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 11325117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 13185350 - 13185487
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13185350 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 13185449  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13185450 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 13185487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 13441196 - 13441333
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13441196 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 13441295  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13441296 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 13441333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 33876707 - 33876570
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33876707 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 33876608  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33876607 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 33876570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 534 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 24680218 - 24680082
Alignment:
Q  534 ctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctc 633  Q
    ||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24680218 ctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttctc 24680119  T
Q  634 ttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24680118 ttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 24680082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 534 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 24722745 - 24722609
Alignment:
Q  534 ctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctc 633  Q
    ||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24722745 ctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttctc 24722646  T
Q  634 ttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24722645 ttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 24722609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 23719361 - 23719472
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23719361 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattggctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtgcggagctgagcatt 23719460  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  23719461 ctcttcttccat 23719472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23891008 - 23890894
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23891008 tggctgattgttcttgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 23890909  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  23890908 ttcctcttccatagc 23890894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Original strand, 31827799 - 31827936
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||| || || || |||| |||||| ||||||   ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31827799 gctgattgctcttgagcagctagcagagcagtcatgacgtcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaattcggtgcgaagctgagcgttct 31827898  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31827899 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31827936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 533 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 25197814 - 25197702
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  25197814 gctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagctaattcttccctcaaagaagctaactcggtacggagctgagcatttt 25197715  T
Q  633 cttcttccatagc 645  Q
    | |||||||||||    
T  25197714 cctcttccatagc 25197702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 2509794 - 2509696
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2509794 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 2509696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5636653 - 5636555
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5636653 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 5636555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 6873045 - 6872947
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873045 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 6872947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 8666894 - 8666992
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8666894 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 8666992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 9316194 - 9316096
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9316194 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 9316096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 12130898 - 12130800
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130898 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 12130800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 15760276 - 15760374
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760276 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 15760374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 18376831 - 18376929
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18376831 tcattagctttagccaattcctcctttagagagactaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 18376929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 26479135 - 26479037
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479135 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 26479037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 30150761 - 30150663
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30150761 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 30150663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 30167199 - 30167114
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30167199 ccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 30167114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 24689535 - 24689646
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24689535 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 24689634  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  24689635 ttcttcttccat 24689646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 29968485 - 29968583
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29968485 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggccaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 29968583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 30028158 - 30028060
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028158 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggccaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 30028060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 33515099 - 33515001
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33515099 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctacctcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 33515001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 30933420 - 30933309
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || || |||| || ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30933420 tggctgattgttcttgagcagctagcaaagcggtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 30933321  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  30933320 ttcttcttccat 30933309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 34615316 - 34615184
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  34615316 ttgttcctgagcagctaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 34615217  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34615216 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 34615184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 533 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 11548136 - 11548027
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||| || ||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11548136 gctggttgttcttgagcggctagcagggcagtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaattcggtacggagctgagcgttct 11548037  T
Q  633 cttcttccat 642  Q
    ||||||||||    
T  11548036 cttcttccat 11548027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 13326211 - 13326343
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  13326211 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 13326310  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13326311 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 13326343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 15660127 - 15660259
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| | |||||  |||||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  15660127 ttgttcctgagcagccaatagagcagtcatagcatcatgagccttggccaattcctcctttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 15660226  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15660227 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 15660259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 31430223 - 31430091
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  31430223 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 31430124  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31430123 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31430091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 37772366 - 37772498
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  37772366 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 37772465  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37772466 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37772498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 41673504 - 41673372
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||| | ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  41673504 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcctttagagctgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 41673405  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41673404 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 41673372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 3788321 - 3788189
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  3788321 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 3788222  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788221 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 3788189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 28961166 - 28961298
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  28961166 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttttcttct 28961265  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28961266 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28961298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 33291280 - 33291196
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctct 669  Q
    ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33291280 ccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattctct 33291196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 37360022 - 37360154
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||   | || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  37360022 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagataccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 37360121  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37360122 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37360154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 37672859 - 37672991
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  37672859 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 37672958  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37672959 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 37672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 43077044 - 43076912
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  43077044 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 43076945  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076944 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 43076912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 18502188 - 18502247
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18502188 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 18502247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 40474992 - 40475051
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40474992 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctatattctctg 40475051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 37753763 - 37753631
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  37753763 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacgaagctgcgtgttctcttct 37753664  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37753663 tccatagcccttttctttcttttgtattctctg 37753631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28647931 - 28647889
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28647931 gttctcttcttccatagccctcttctttcttctgtattctctg 28647889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Original strand, 32600926 - 32600968
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32600926 gttctcttcttccatagcctttttctttcttctatattctctg 32600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20461584 - 20461070
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  20461584 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgat 20461485  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20461484 catggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctc 20461385  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20461384 aatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 20461285  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20461284 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 20461185  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20461184 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagc 20461085  T
Q  504 ttgttgatgctgttg 518  Q
    |||||| || |||||    
T  20461084 ttgttgctgttgttg 20461070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 28152365 - 28151724
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28152365 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 28152266  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28152265 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctc 28152166  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  28152165 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 28152066  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||    
T  28152065 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcag 28151966  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28151965 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28151866  T
Q  504 ttgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcag 600  Q
    |||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28151865 ttgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcag 28151766  T
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccat 642  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  28151765 agaagctaattcggtacggagctgagcattttcctcttccat 28151724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 521
Target Start/End: Original strand, 16207783 - 16208300
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16207783 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgat 16207882  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16207883 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctc 16207982  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  16207983 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 16208082  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16208083 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16208182  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208183 gtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16208282  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttg 521  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  16208283 ttgttgatgttgttgttg 16208300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 20340087 - 20340608
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||    
T  20340087 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 20340186  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340187 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 20340286  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  20340287 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcaca 20340386  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  20340387 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcag 20340486  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340487 gtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 20340586  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  20340587 ttgctgatgctgttgttgttga 20340608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 524
Target Start/End: Original strand, 41793059 - 41793580
Alignment:
Q  3 actgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatga 102  Q
    ||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||    
T  41793059 actgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatga 41793158  T
Q  103 tcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacct 202  Q
    |||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || |    
T  41793159 tcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacactt 41793258  T
Q  203 caatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttac 302  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || ||    
T  41793259 cgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcac 41793358  T
Q  303 aatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggatta 402  Q
     || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |    
T  41793359 gatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatca 41793458  T
Q  403 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  41793459 ggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctag 41793558  T
Q  503 cttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||| ||||  |||||||||||    
T  41793559 cttgctgattttgttgttgttg 41793580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 10963176 - 10962653
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||  ||  ||||||    
T  10963176 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttggcat 10963077  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |     
T  10963076 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacat 10962977  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10962976 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 10962877  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10962876 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10962777  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  10962776 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 10962677  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  10962676 agcttgctgattttgttgttgttg 10962653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 28585487 - 28584964
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  28585487 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 28585388  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28585387 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28585288  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28585287 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28585188  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28585187 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28585088  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  28585087 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28584988  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  28584987 agcttgctgattttgttgttgttg 28584964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 51638724 - 51638201
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  51638724 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 51638625  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  51638624 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 51638525  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  51638524 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 51638425  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  51638424 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 51638325  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||    
T  51638324 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcct 51638225  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  51638224 agcttgctgattttgttgttgttg 51638201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 532 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 20459881 - 20459768
Alignment:
Q  532 ggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  20459881 ggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcattt 20459782  T
Q  632 tcttcttccatagc 645  Q
    ||||||||||||||    
T  20459781 tcttcttccatagc 20459768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 16209505 - 16209619
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16209505 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 16209604  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  16209605 ttcctcttccatagc 16209619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 20341120 - 20341234
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20341120 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtattattagccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 20341219  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  20341220 ttcttcttccatagc 20341234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 10961403 - 10961305
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10961403 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 10961305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28583714 - 28583616
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28583714 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 28583616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 41794830 - 41794928
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794830 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 41794928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 51636951 - 51636853
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51636951 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 51636853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 33245168 - 33244525
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33245168 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33245069  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33245068 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctca 33244969  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33244968 atcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33244869  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | |||    
T  33244868 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcagg 33244769  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33244768 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 33244669  T
Q  505 tgttgatgct---gttgttgttgatccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcaga 601  Q
    ||||| ||||   ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33244668 tgttgctgctgtcgttgttggtgaaccggtggatgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtattattggccttagccaattcttccctcaga 33244569  T
Q  602 gtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 645  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33244568 gaagctaactcggtacggagctgagcattttcttcttccatagc 33244525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 525
Target Start/End: Original strand, 19658752 - 19659271
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19658752 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 19658851  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19658852 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 19658951  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19658952 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 19659050  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||    
T  19659051 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 19659150  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19659151 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 19659250  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  19659251 tgttgctgctgtcgttgttga 19659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 44563603 - 44563084
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  44563603 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 44563504  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44563503 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctc 44563404  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  44563403 aatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgag-ttttttaca 44563306  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  44563305 atgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 44563206  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44563205 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 44563106  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  44563105 ttgttgctgctgtcgttgttga 44563084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 4 - 521
Target Start/End: Original strand, 22080589 - 22081106
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| | ||| |||||||||    
T  22080589 ctgatagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgat 22080688  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  22080689 catggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctc 22080788  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  22080789 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttaca 22080888  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22080889 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttag 22080988  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22080989 gtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggt 22081088  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttg 521  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  22081089 ttgttgctgctgctgttg 22081106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18711090 - 18710570
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18711090 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 18710991  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18710990 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 18710891  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || ||     
T  18710890 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacg 18710791  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| ||    
T  18710790 atatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcag 18710691  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  18710690 gtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     | ||| ||||| || |||||    
T  18710590 atattgctgctgctgctgttg 18710570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 16283956 - 16283433
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||    
T  16283956 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggtat 16283857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  16283856 gatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatac 16283757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16283756 ttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16283657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  16283656 acgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 16283557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16283556 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtct 16283457  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  16283456 agcttgttgatgttgttgttgttg 16283433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9355130 - 9354605
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||    
T  9355130 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 9355031  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  9355030 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 9354931  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9354930 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttt 9354831  T
Q  301 -acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||    
T  9354830 tacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatgga 9354731  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtc 499  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9354730 tcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtc 9354631  T
Q  500 tagcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  9354630 tagcctgttgctgctgtcgttgttga 9354605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 16278061 - 16277538
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16278061 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16277962  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16277961 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16277862  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16277861 ttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16277762  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  16277761 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 16277662  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16277661 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16277562  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  16277561 agcttgctgattttgttgttgttg 16277538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 19688601 - 19688082
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||    
T  19688601 tgacattcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatc 19688502  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||  |||| ||     
T  19688501 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcg 19688402  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || |    
T  19688401 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacga 19688302  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  19688301 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 19688202  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  19688201 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagct 19688102  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  19688101 tgctgattttgttgttgttg 19688082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 27608613 - 27609136
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27608613 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27608712  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || |  || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27608713 gatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 27608812  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  27608813 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 27608912  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  27608913 acgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 27609012  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  27609013 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27609112  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  27609113 agcttgctgattttgttgttgttg 27609136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14558131 - 14557607
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  14558131 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 14558032  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14558031 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 14557932  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  14557931 ttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 14557832  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  14557831 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 14557732  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14557731 caggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtct 14557632  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  14557631 agcttgctgattttgttgttgttga 14557607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 2136967 - 2137490
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  2136967 tcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 2137066  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||| |||| || |    
T  2137067 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatgc 2137166  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  2137167 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 2137266  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  2137267 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 2137366  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  2137367 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 2137466  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  2137467 agcttgctgattttgttgttgttg 2137490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 19674948 - 19674425
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  19674948 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 19674849  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  19674848 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 19674749  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  19674748 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 19674649  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19674648 acaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19674549  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  19674548 caggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 19674449  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  19674448 agcttgctgattttgttgttgttg 19674425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 19208068 - 19208591
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  19208068 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 19208167  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  19208168 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 19208267  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  19208268 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 19208367  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19208368 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19208467  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  19208468 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 19208567  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  19208568 agcttgctgattttgttgttgttg 19208591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 31489458 - 31489981
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| ||||||||||  | || |||| |||| ||  ||||||    
T  31489458 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttggcat 31489557  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31489558 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31489657  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31489658 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 31489757  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31489758 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31489857  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  31489858 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 31489957  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  31489958 agcttgctgattttgttgttgttg 31489981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 31355005 - 31354508
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||| ||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || |||| |    
T  31355005 catcaggctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31354906  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31354905 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31354806  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31354805 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31354706  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31354705 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 31354606  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  31354605 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 31354508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 28361663 - 28362186
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  28361663 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 28361762  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28361763 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28361862  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28361863 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28361962  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28361963 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28362062  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  28362063 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28362162  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  28362163 agcttgctgattttgttgttgttg 28362186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 3329239 - 3329716
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  3329239 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 3329338  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||    
T  3329339 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatg 3329438  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  3329439 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 3329538  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  3329539 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 3329638  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  3329639 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 12092432 - 12092933
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    |||||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  12092432 tcactgacggtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 12092531  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  12092532 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 12092631  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  12092632 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 12092731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  12092732 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 12092831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  12092832 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 12092931  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  12092932 ag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29829829 - 29829328
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  29829829 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 29829730  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29829729 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29829630  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  29829629 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 29829530  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29829529 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggat 29829430  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || || || ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  29829429 caggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtct 29829330  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  29829329 ag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19286945 - 19286468
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  19286945 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 19286846  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  19286845 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 19286746  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  19286745 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 19286646  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  19286645 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctag 19286546  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctag 502  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  19286545 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 33259230 - 33258707
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  33259230 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 33259131  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  33259130 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 33259031  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  33259030 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 33258931  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  33258930 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 33258831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  33258830 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcct 33258731  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
     ||||| ||||  |||||||||||    
T  33258730 ggcttgctgattttgttgttgttg 33258707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 189521 - 189256
Alignment:
Q  81 gcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 180  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  189521 gcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagt 189422  T
Q  181 ctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttc 280  Q
    || |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||    
T  189421 ctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttc 189322  T
Q  281 cttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 346  Q
    |||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189321 cttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16282227 - 16282113
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16282227 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 16282128  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  16282127 ttcttcttccatagc 16282113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 44562552 - 44562415
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44562552 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtgcgaagctgagcgttct 44562453  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44562452 cttcttccatagcccttttccttcttctgtactctctg 44562415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 533 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 9354073 - 9353936
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9354073 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcctcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 9353974  T
Q  633 cttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9353973 cttcttccatagcctttttccttcttctgtactctctg 9353936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 21374979 - 21375090
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21374979 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 21375078  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  21375079 ctcttcttccat 21375090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 27610345 - 27610456
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27610345 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttccctcagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 27610444  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  27610445 ctcttcttccat 27610456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 19659783 - 19659897
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19659783 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaattcggtacggagctgagcatt 19659882  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     || |||||||||||    
T  19659883 ttcctcttccatagc 19659897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 14556402 - 14556291
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14556402 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 14556303  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  14556302 ctcttcttccat 14556291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 2138699 - 2138810
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2138699 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 2138798  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  2138799 ctcttcttccat 2138810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16276329 - 16276218
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16276329 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 16276230  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  16276229 ctcttcttccat 16276218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 19209841 - 19209939
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19209841 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19209939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 31491231 - 31491329
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31491231 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 31491329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 33257457 - 33257359
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33257457 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 33257359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 601 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 18709291 - 18709222
Alignment:
Q  601 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18709291 agtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcctttttctttcttctgtattctctg 18709222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 538 - 642
Target Start/End: Original strand, 22082301 - 22082405
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  22082301 ttgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcaaagaagctaactcggtacggagctgagcattttcttct 22082400  T
Q  638 tccat 642  Q
    |||||    
T  22082401 tccat 22082405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 28363436 - 28363534
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28363436 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagctcttttctttcttctgtattctctg 28363534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 585 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 31353243 - 31353158
Alignment:
Q  585 ccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31353243 ccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtactctctg 31353158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 19686873 - 19686762
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19686873 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagctaactcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 19686774  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  19686773 ctcttcttccat 19686762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18791214 - 18791107
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  18791214 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttggcat 18791115  T
Q  101 gatcatgg 108  Q
    ||||||||    
T  18791114 gatcatgg 18791107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 3330949 - 3331081
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| |||||||| | |||||||||     
T  3330949 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttcc 3331048  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3331049 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 3331081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Original strand, 12094162 - 12094294
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  12094162 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 12094261  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12094262 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 12094294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Original strand, 19279989 - 19280048
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19279989 tcggtacggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19280048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 19285178 - 19285119
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19285178 tcggtacggagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19285119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 617 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 29828020 - 29827967
Alignment:
Q  617 cggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29828020 cggagttgcgcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 29827967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Original strand, 19519662 - 19519704
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19519662 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19519704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 19673134 - 19673092
Alignment:
Q  628 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19673134 gttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 19673092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 525
Target Start/End: Original strand, 2410 - 2931
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||    
T  2410 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 2509  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 2609  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  2610 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcaca 2709  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  2710 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcag 2809  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2810 gtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 2909  T
Q  504 ttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  2910 ttgctgatgctgttgttgttga 2931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 3443 - 3557
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3443 tggctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtattattagccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctgagcatt 3542  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  3543 ttcttcttccatagc 3557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 225 - 645
Target Start/End: Original strand, 1 - 421
Alignment:
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttg 300  T
Q  525 atccgatggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctg 624  Q
    | | | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  301 agctggtggctgattgttcctgggcagctagcagagcagtcatggtatcattggccttagccaattcttccctcagagaagctaactcggtacggagctg 400  T
Q  625 agcgttctcttcttccatagc 645  Q
    | | || ||||||||||||||    
T  401 aacattttcttcttccatagc 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22064 - 21549
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22064 tgacaatcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatc 21965  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||| |||  |||||   |||     
T  21964 atggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcg 21865  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtt 21565  T
Q  505 tgttgatgctgttgtt 520  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  21564 tgttgttgctgctgtt 21549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 538 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 20249
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  20353 ttgttcttgggcggctagcagagcagtcatggtgtcattggccttagccaattcttccctcagagaagctcacttggtacggagctgagcattttcttct 20254  T
Q  638 tccat 642  Q
    |||||    
T  20253 tccat 20249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 165 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20730 - 20375
Alignment:
Q  165 gttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttc 264  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20730 gttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttc 20631  T
Q  265 tcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 364  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630 tcaaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 20532  T
Q  365 acttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactc 464  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531 acttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactc 20432  T
Q  465 ggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg 521  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20431 agcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttg 20375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 30960 - 30437
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataa-ttgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  30960 tcactgacagtcaaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 30861  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  30860 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 30761  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||    
T  30760 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 30661  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||    
T  30660 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 30561  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30560 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaa-gtaggtc 30462  T
Q  500 tagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||    
T  30461 tagcttgctgattttgttgttgttg 30437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 532 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 29227 - 29117
Alignment:
Q  532 ggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttc 631  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  ||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29227 ggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcgttagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttc 29128  T
Q  632 tcttcttccat 642  Q
    |||||||||||    
T  29127 tcttcttccat 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 533 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 19184 - 19073
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagc-gttc 631  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||  ||     
T  19184 gctgattgttcctgggcggctagcagagcagtcatggtatcattggctttagccaattcttccctcaaagaagctaactcggtacagagctgagctattt 19085  T
Q  632 tcttcttccata 643  Q
    ||||||||||||    
T  19084 tcttcttccata 19073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 165 - 438
Target Start/End: Original strand, 1831 - 2103
Alignment:
Q  165 gttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttc 264  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1831 gttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttc 1930  T
Q  265 tcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 364  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1931 tcaaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 2029  T
Q  365 acttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2030 acttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6080
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  6521 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 6422  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||||||| | ||    
T  6421 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacac 6322  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  6321 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 6222  T
Q  301 acaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgg 398  Q
    || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||    
T  6221 acgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgg 6122  T
Q  399 attaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
    || |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6121 atcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 46734 - 47257
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  46734 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 46833  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46834 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 46933  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  46934 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 47033  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  47034 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 47133  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  47134 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 47233  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  47234 agcttgctgattttgttgttgttg 47257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 524
Target Start/End: Original strand, 39822 - 40341
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||    
T  39822 tgacagtcaaaaaattatcattcgtcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatc 39921  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  39922 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcg 40021  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||  || || |    
T  40022 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacga 40121  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| |||||||||| |||    
T  40122 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcagg 40221  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  40222 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagct 40321  T
Q  505 tgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || ||||  |||||||||||    
T  40322 tgctgattttgttgttgttg 40341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 30270 - 29747
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||| || | |||| |||||||  |||| |    
T  30270 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttggcgt 30171  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  30170 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcacatac 30071  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  30070 ttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29971  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  29970 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 29871  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  29870 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 29771  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  29770 agcttgttgatgttgttgttgttg 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 28538 - 28424
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28538 tggctgattgttcctgagcggctagcagagtagtcatggtatcattggccttagccaattcttcccttagagtagctaactcggtacggagctgagcatt 28439  T
Q  631 ctcttcttccatagc 645  Q
     ||||||||||||||    
T  28438 ttcttcttccatagc 28424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 48466 - 48577
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48466 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 48565  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  48566 ctcttcttccat 48577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Original strand, 41550 - 41661
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41550 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagccttagccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcatt 41649  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
     |||||||||||    
T  41650 ttcttcttccat 41661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Original strand, 370 - 728
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  370 ctgacagtaagataattgtcattcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgat 469  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| |||||   |||    
T  470 catggtcaaacaaggagacttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctc 569  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||    
T  570 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttaca 669  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  670 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 27800 - 27276
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  27800 tcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 27701  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||| | ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| |||    
T  27700 tgatcatggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacata 27601  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||| ||    
T  27600 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttctt 27501  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||    
T  27500 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 27401  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27400 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 27301  T
Q  500 tagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||    
T  27300 tagcttgctgattttgttgttgttg 27276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 26067 - 25956
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgtt 630  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26067 tggctgattgttcttgagcggctagcagagcggtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgtt 25968  T
Q  631 ctcttcttccat 642  Q
    ||||||||||||    
T  25967 ctcttcttccat 25956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 17717 - 17658
Alignment:
Q  611 tcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17717 tcggtacggagctgtgtgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 17658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10073 - 9549
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  10073 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 9974  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  9973 gatcatggctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 9874  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9873 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 9774  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9773 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 9674  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  9673 caggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 9574  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttga 525  Q
    ||| | ||| ||||| || ||||||    
T  9573 agcatattgctgctgctgctgttga 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 7018 - 6886
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  7018 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttaaagatgccaattcggtacggagctgcgtgttctcttct 6919  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6918 tccatagcctttttctttcttctgtattctctg 6886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 130 - 524
Target Start/End: Original strand, 7 - 402
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |    
T  7 agcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttg 106  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||    
T  107 gaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctc 206  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  207 gacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgta 306  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaact-cggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || ||||||||  | |||| |||||| || ||||   ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  307 caatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 533 - 642
Target Start/End: Original strand, 1613 - 1722
Alignment:
Q  533 gctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttct 632  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||  |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1613 gctgattgttcttgagcggctagcagagcagtcatgacatcattagctttggccaattcttcccttagagtggctaactcggtacggagctgagcgttct 1712  T
Q  633 cttcttccat 642  Q
    ||||||||||    
T  1713 cttcttccat 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 8815 - 9338
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  8815 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8914  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  8915 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 9014  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9015 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9114  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9115 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9214  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  9215 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9314  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  9315 agcttgctgattttgttgttgttg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 20496 - 19999
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| |    
T  20496 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 20397  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20396 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 20297  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  20296 ttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 20197  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  20196 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 20097  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  20096 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 6988 - 7511
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  6988 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 7087  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  7088 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 7187  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  7188 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 7287  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7288 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7387  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  7388 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 7487  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  7488 agcttgctgattttgttgttgttg 7511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 8761 - 8859
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 8859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 25950 - 26474
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  25950 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 26049  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |     
T  26050 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacat 26149  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26150 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26249  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacgga 399  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| | ||||||||||||    
T  26250 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacgga 26349  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  26350 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcc 26449  T
Q  500 tagcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||    
T  26450 tagcttgctgattttgttgttgttg 26474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 14679 - 15202
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  14679 tcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 14778  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  14779 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 14878  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  14879 ttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 14978  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  14979 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15078  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15079 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtct 15178  T
Q  501 agcttgttgatgctgttgttgttg 524  Q
    |||||| ||||  |||||||||||    
T  15179 agcttgctgattttgttgttgttg 15202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 572 - 670
Target Start/End: Original strand, 16452 - 16550
Alignment:
Q  572 tcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452 tcattagctttagccaattcctcctttagagaggctaactcggtgcgaagctgagcgttctcttcttccatagcccttttctttcttctgtattctctg 16550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 8456 - 7966
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  8456 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 8357  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8356 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8257  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  8256 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 8157  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  8156 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 8057  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacattggtatcggaggaaa 491  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8056 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 538 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 6723 - 6591
Alignment:
Q  538 ttgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttct 637  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||  || ||  ||||||| ||||| ||||  || || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  6723 ttgttcctgagcagccaacagagcagtcatagcatcatgagctttggccaattcctcccttagagatgccaattcggtacgaagctgtgtgttctcttct 6624  T
Q  638 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6623 tccatagcccttttctttcttctgtattctctg 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 531 - 645
Target Start/End: Original strand, 49681 - 49798
Alignment:
Q  531 tggctgattgttcctgggcggctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctc-agagt--ggctaactcggtgcggagctgagc 627  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  | |||||||||| |||||||||||    
T  49681 tggctgattgttcctgagcggctagcagagctgtcatggtatcattggccttagccaattcttccctttagagttagtctaactcggtacggagctgagc 49780  T
Q  628 gttctcttcttccatagc 645  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  49781 gttttcttcttccatagc 49798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 422
Target Start/End: Original strand, 46604 - 46981
Alignment:
Q  59 agcaacccaaa-ggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat-catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagagga 156  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||  ||||||||| |||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  46604 agcaacccaaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgattcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagagga 46703  T
Q  157 gttgcaatgttacgaacgtcaagtc-tgggagctt-cctcatatac-ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgag 253  Q
    ||||  |||||||| || ||||||| | ||||||| |||||  |||  | | |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  46704 gttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcg 46803  T
Q  254 ggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagc 347  Q
    |||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| ||    
T  46804 ggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggc 46903  T
Q  348 accttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggc--ttgccctgtct 422  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  46904 gccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 551 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 40416 - 40322
Alignment:
Q  551 gctaacagagcggtcatggtatcattggccttaaccaattcttccctcagagtggctaactcggtgcggagctgagcgttctcttcttccatagc 645  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40416 gctaacaaagcagtcatggtatcatgggccttagccaactcttccctcaaagtagccaactcggtgcgaagctgagtgttctcttcctccatagc 40322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Original strand, 119651 - 119706
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtag 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  119651 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtag 119706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University