View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7453_high_4 (Length: 276)

Name: NF7453_high_4
Description: NF7453
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7453_high_4
NF7453_high_4
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (6-266)||(113727-113987)
scaffold0029 (30-161)||(108713-108844)
scaffold0029 (174-256)||(95048-95130)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (3-266)||(19880299-19880562)
chr6 (3-255)||(34644603-34644855)
chr6 (6-266)||(18795691-18795951)
chr6 (27-266)||(21563173-21563412)
chr6 (27-266)||(21569032-21569271)
chr6 (6-256)||(19454431-19454681)
chr6 (6-255)||(15460348-15460597)
chr6 (6-248)||(8761953-8762195)
chr6 (12-256)||(5296232-5296476)
chr6 (6-250)||(14378937-14379181)
chr6 (6-250)||(14380487-14380731)
chr6 (27-250)||(21472618-21472841)
chr6 (6-253)||(10467869-10468116)
chr6 (27-254)||(15897107-15897334)
chr6 (27-253)||(22434883-22435109)
chr6 (27-253)||(22443281-22443507)
chr6 (30-254)||(27188449-27188673)
chr6 (30-254)||(27260567-27260791)
chr6 (6-250)||(24365429-24365673)
chr6 (30-161)||(16926684-16926815)
chr6 (7-250)||(19436019-19436262)
chr6 (27-250)||(19488313-19488536)
chr6 (28-163)||(20636343-20636478)
chr6 (27-250)||(22761496-22761719)
chr6 (27-163)||(23079573-23079709)
chr6 (27-127)||(29590961-29591061)
chr6 (30-161)||(16962489-16962620)
chr6 (27-161)||(16625758-16625892)
chr6 (6-160)||(28281833-28281987)
chr6 (12-161)||(25113658-25113807)
chr6 (30-161)||(5838263-5838394)
chr6 (25-178)||(19865776-19865929)
chr6 (30-197)||(1542128-1542295)
chr6 (33-180)||(25608908-25609055)
chr6 (30-161)||(28262241-28262372)
chr6 (30-161)||(28340990-28341121)
chr6 (28-197)||(27564863-27565032)
chr6 (27-127)||(2873844-2873944)
chr6 (33-163)||(18406991-18407121)
chr6 (27-114)||(18196774-18196861)
chr6 (108-250)||(25769208-25769350)
chr6 (30-127)||(18449650-18449747)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (3-266)||(6560-6823)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (6-266)||(19613802-19614062)
chr7 (25-266)||(11387309-11387550)
chr7 (6-266)||(14263106-14263366)
chr7 (6-266)||(19148338-19148598)
chr7 (6-266)||(20747737-20747997)
chr7 (6-256)||(15101465-15101715)
chr7 (6-252)||(16071157-16071403)
chr7 (6-250)||(13022500-13022744)
chr7 (27-253)||(12205683-12205909)
chr7 (6-250)||(11305125-11305369)
chr7 (6-250)||(16949334-16949578)
chr7 (6-250)||(26117467-26117711)
chr7 (6-256)||(13666674-13666924)
chr7 (6-250)||(268-513)
chr7 (6-253)||(14285238-14285485)
chr7 (9-250)||(12457783-12458024)
chr7 (6-250)||(49153444-49153688)
chr7 (27-161)||(14955785-14955919)
chr7 (38-197)||(15147801-15147960)
chr7 (27-161)||(8708836-8708970)
chr7 (27-197)||(11771146-11771316)
chr7 (27-161)||(18550663-18550797)
chr7 (6-160)||(23504732-23504886)
chr7 (27-161)||(44790256-44790390)
chr7 (33-254)||(320948-321169)
chr7 (27-197)||(10872190-10872360)
chr7 (27-253)||(14333535-14333761)
chr7 (6-160)||(18052815-18052969)
chr7 (27-127)||(8199893-8199993)
chr7 (27-243)||(11236118-11236334)
chr7 (6-250)||(13967530-13967774)
chr7 (27-127)||(15159962-15160062)
chr7 (28-127)||(18179007-18179106)
chr7 (27-193)||(16223-16389)
chr7 (6-251)||(15341573-15341818)
chr7 (28-161)||(23202519-23202652)
chr7 (28-161)||(23508646-23508779)
chr7 (27-127)||(13687329-13687429)
chr7 (28-160)||(15204851-15204983)
chr7 (151-250)||(12456845-12456944)
chr7 (27-161)||(12688731-12688866)
chr7 (12-197)||(9597252-9597437)
chr7 (28-127)||(11552008-11552107)
chr7 (28-180)||(14212886-14213038)
chr7 (27-166)||(14040921-14041060)
chr7 (27-166)||(14350951-14351090)
chr7 (48-202)||(15625744-15625898)
chr7 (3-118)||(40027-40142)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (6-266)||(32555-32815)
scaffold0076 (6-250)||(55778-56022)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (6-266)||(49392-49652)
scaffold0028 (30-197)||(44388-44555)
scaffold0028 (28-127)||(9781-9880)
scaffold0028 (28-95)||(16275-16342)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (6-266)||(21679835-21680095)
chr5 (6-265)||(22463003-22463262)
chr5 (6-250)||(24619352-24619596)
chr5 (6-250)||(24715583-24715827)
chr5 (6-250)||(24748611-24748855)
chr5 (6-265)||(20822505-20822764)
chr5 (6-265)||(28893999-28894258)
chr5 (6-265)||(28915470-28915729)
chr5 (6-265)||(28922825-28923084)
chr5 (6-256)||(23079146-23079396)
chr5 (6-250)||(14886048-14886292)
chr5 (40-265)||(20774811-20775036)
chr5 (6-250)||(22234977-22235221)
chr5 (6-250)||(24797454-24797698)
chr5 (6-214)||(28930738-28930946)
chr5 (27-253)||(21563051-21563277)
chr5 (6-250)||(37542438-37542682)
chr5 (123-266)||(21889933-21890076)
chr5 (27-163)||(23472400-23472536)
chr5 (6-250)||(25849142-25849386)
chr5 (27-253)||(27667568-27667794)
chr5 (27-127)||(16357710-16357810)
chr5 (27-127)||(27519614-27519714)
chr5 (27-127)||(34567702-34567802)
chr5 (27-127)||(40709988-40710088)
chr5 (12-250)||(22503746-22503984)
chr5 (28-254)||(23574810-23575036)
chr5 (30-127)||(41772050-41772147)
chr5 (27-127)||(27611562-27611662)
chr5 (30-161)||(19771134-19771265)
chr5 (27-125)||(21872128-21872226)
chr5 (27-125)||(21876408-21876506)
chr5 (27-253)||(22331965-22332191)
chr5 (27-197)||(23441348-23441518)
chr5 (33-163)||(25427605-25427735)
chr5 (9-250)||(20343349-20343590)
chr5 (27-127)||(14998817-14998917)
chr5 (27-127)||(22135876-22135976)
chr5 (27-127)||(27684478-27684578)
chr5 (27-127)||(29475151-29475251)
chr5 (27-214)||(26737805-26737992)
chr5 (31-109)||(21497150-21497228)
chr5 (27-161)||(37290574-37290708)
chr5 (6-160)||(17268391-17268545)
chr5 (27-88)||(20467176-20467237)
chr5 (66-235)||(21830878-21831047)
chr5 (28-197)||(21882087-21882256)
chr5 (28-180)||(18776951-18777103)
chr5 (36-127)||(21338384-21338475)
chr5 (6-83)||(846-923)
chr5 (30-243)||(21408230-21408443)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (6-266)||(13971223-13971483)
chr3 (6-266)||(14087439-14087699)
chr3 (6-255)||(10419148-10419397)
chr3 (6-256)||(12359630-12359880)
chr3 (6-242)||(17187164-17187400)
chr3 (30-253)||(14574702-14574925)
chr3 (6-253)||(17493409-17493656)
chr3 (6-253)||(31694289-31694536)
chr3 (6-253)||(31939682-31939929)
chr3 (6-250)||(47124726-47124970)
chr3 (6-242)||(13319605-13319841)
chr3 (27-266)||(16827327-16827566)
chr3 (6-250)||(16337615-16337859)
chr3 (6-250)||(11960272-11960516)
chr3 (6-266)||(16835613-16835873)
chr3 (27-253)||(15228428-15228654)
chr3 (27-253)||(15234296-15234522)
chr3 (30-197)||(15347383-15347550)
chr3 (6-136)||(12179234-12179364)
chr3 (3-241)||(14580053-14580291)
chr3 (10-250)||(18133453-18133693)
chr3 (28-163)||(16491317-16491452)
chr3 (27-253)||(5424065-5424291)
chr3 (6-160)||(44778119-44778273)
chr3 (30-127)||(6601631-6601728)
chr3 (9-250)||(16328766-16329007)
chr3 (27-127)||(15588527-15588627)
chr3 (27-127)||(16636668-16636768)
chr3 (27-127)||(20061189-20061289)
chr3 (27-127)||(43163992-43164092)
chr3 (27-127)||(48426342-48426442)
chr3 (30-197)||(53384156-53384323)
chr3 (33-179)||(17490693-17490839)
chr3 (6-160)||(41178394-41178548)
chr3 (27-127)||(10006495-10006595)
chr3 (27-127)||(10907105-10907205)
chr3 (121-253)||(11302991-11303123)
chr3 (27-127)||(13253585-13253685)
chr3 (27-163)||(15260489-15260625)
chr3 (27-253)||(15401652-15401878)
chr3 (27-253)||(15340038-15340264)
chr3 (28-197)||(14125730-14125899)
chr3 (27-127)||(15724069-15724169)
chr3 (6-160)||(13942896-13943050)
chr3 (25-161)||(12499109-12499245)
chr3 (28-254)||(14875635-14875861)
chr3 (27-160)||(16693026-16693159)
chr3 (28-127)||(16411418-16411517)
chr3 (64-127)||(16755757-16755820)
chr3 (28-197)||(16806083-16806252)
chr3 (6-160)||(16380031-16380185)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (6-266)||(24179-24439)
scaffold0090 (6-266)||(20017-20277)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (25-266)||(20060918-20061159)
chr1 (6-256)||(19855467-19855717)
chr1 (6-253)||(19662084-19662331)
chr1 (6-253)||(23197193-23197440)
chr1 (6-265)||(20855707-20855966)
chr1 (6-256)||(20939010-20939260)
chr1 (6-255)||(20834847-20835096)
chr1 (6-250)||(24098550-24098794)
chr1 (6-250)||(31538944-31539188)
chr1 (27-241)||(16373707-16373921)
chr1 (6-214)||(21952113-21952321)
chr1 (6-134)||(21744499-21744627)
chr1 (28-163)||(431085-431220)
chr1 (36-254)||(21750104-21750322)
chr1 (27-253)||(51332461-51332687)
chr1 (6-250)||(20295580-20295824)
chr1 (33-197)||(41352636-41352800)
chr1 (27-127)||(16349564-16349664)
chr1 (30-197)||(33390000-33390167)
chr1 (27-127)||(21838241-21838341)
chr1 (27-163)||(22110277-22110413)
chr1 (27-163)||(22114126-22114262)
chr1 (27-161)||(19107625-19107759)
chr1 (27-253)||(21831468-21831694)
chr1 (33-197)||(16077630-16077794)
chr1 (27-253)||(19759841-19760067)
chr1 (27-197)||(21025394-21025564)
chr1 (3-180)||(21234675-21234852)
chr1 (28-103)||(22361213-22361288)
chr1 (27-106)||(24793585-24793664)
chr1 (27-103)||(17043983-17044059)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (28-266)||(23099455-23099693)
chr2 (9-266)||(27209590-27209847)
chr2 (6-250)||(23277560-23277804)
chr2 (6-253)||(24949371-24949618)
chr2 (6-250)||(1064535-1064779)
chr2 (27-253)||(23111517-23111743)
chr2 (6-250)||(20829043-20829287)
chr2 (6-242)||(31831450-31831686)
chr2 (6-250)||(23294719-23294963)
chr2 (6-250)||(19651465-19651709)
chr2 (27-254)||(24710814-24711041)
chr2 (27-127)||(16923796-16923896)
chr2 (27-127)||(16926267-16926367)
chr2 (27-127)||(16983059-16983159)
chr2 (27-127)||(16999907-17000007)
chr2 (27-127)||(17064624-17064724)
chr2 (27-127)||(22324292-22324392)
chr2 (27-127)||(27218923-27219023)
chr2 (34-197)||(24676326-24676489)
chr2 (6-160)||(12575227-12575381)
chr2 (33-163)||(23067262-23067391)
chr2 (27-161)||(27372142-27372276)
chr2 (27-127)||(44385005-44385105)
chr2 (28-163)||(23107167-23107302)
chr2 (6-160)||(27788615-27788768)
chr2 (28-161)||(21144478-21144611)
chr2 (27-127)||(10869757-10869857)
chr2 (27-127)||(41607821-41607921)
chr2 (28-127)||(24876186-24876285)
chr2 (27-125)||(24263279-24263377)
chr2 (30-229)||(45533150-45533349)
chr2 (36-161)||(21324711-21324836)
chr2 (25-197)||(24706916-24707088)
chr2 (225-266)||(27364713-27364754)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (6-266)||(1051-1311)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (6-253)||(2208-2455)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (6-256)||(68548-68798)
scaffold0034 (6-255)||(3831-4080)
scaffold0034 (6-256)||(12786-13029)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (6-253)||(20984865-20985112)
chr8 (27-266)||(21841620-21841859)
chr8 (27-250)||(19852630-19852853)
chr8 (27-250)||(19858666-19858889)
chr8 (30-256)||(23656140-23656366)
chr8 (25-250)||(22372150-22372375)
chr8 (6-256)||(20974974-20975219)
chr8 (6-250)||(14566361-14566605)
chr8 (27-241)||(20395471-20395685)
chr8 (6-250)||(31415789-31416036)
chr8 (6-250)||(29302744-29302988)
chr8 (28-253)||(19979183-19979408)
chr8 (25-250)||(22376791-22377016)
chr8 (25-250)||(22382966-22383191)
chr8 (6-250)||(6604877-6605121)
chr8 (6-214)||(21324587-21324794)
chr8 (27-250)||(20009260-20009482)
chr8 (27-251)||(20389317-20389541)
chr8 (34-133)||(21921082-21921181)
chr8 (33-250)||(6680330-6680547)
chr8 (6-250)||(16270542-16270786)
chr8 (33-197)||(19483409-19483573)
chr8 (33-197)||(23651313-23651477)
chr8 (28-163)||(21252250-21252385)
chr8 (6-160)||(31570160-31570314)
chr8 (27-161)||(17673362-17673496)
chr8 (27-253)||(20017602-20017828)
chr8 (27-241)||(23886252-23886466)
chr8 (28-253)||(21165878-21166103)
chr8 (6-250)||(12305977-12306221)
chr8 (27-127)||(19114032-19114132)
chr8 (27-115)||(22247772-22247860)
chr8 (79-250)||(803064-803235)
chr8 (28-163)||(21393205-21393340)
chr8 (28-163)||(21787699-21787834)
chr8 (27-197)||(22041131-22041301)
chr8 (28-161)||(21043753-21043886)
chr8 (27-127)||(18857919-18858019)
chr8 (3-253)||(22052079-22052329)
chr8 (28-180)||(30312484-30312636)
chr8 (6-81)||(27355924-27355999)
chr8 (33-163)||(1267544-1267674)
chr8 (3-163)||(15534689-15534849)
chr8 (27-180)||(32601433-32601586)
chr8 (3-118)||(19869044-19869159)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (6-256)||(430-680)
scaffold0120 (28-253)||(13239-13464)
scaffold0120 (28-163)||(7291-7426)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (27-253)||(10974-11200)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (6-256)||(27901533-27901783)
chr4 (6-256)||(15002239-15002489)
chr4 (6-253)||(15357995-15358242)
chr4 (6-250)||(29452412-29452656)
chr4 (27-253)||(15413922-15414148)
chr4 (6-250)||(3263669-3263913)
chr4 (6-250)||(33224076-33224320)
chr4 (7-241)||(16148873-16149107)
chr4 (7-241)||(16153019-16153253)
chr4 (30-253)||(15247074-15247297)
chr4 (27-222)||(15320317-15320512)
chr4 (7-250)||(11206107-11206350)
chr4 (120-253)||(15078785-15078918)
chr4 (27-235)||(8707088-8707296)
chr4 (25-197)||(16354079-16354251)
chr4 (27-250)||(14695266-14695489)
chr4 (25-160)||(15071602-15071737)
chr4 (27-178)||(15146521-15146672)
chr4 (27-127)||(8387688-8387788)
chr4 (27-127)||(12477876-12477976)
chr4 (27-127)||(18298481-18298581)
chr4 (27-127)||(19777429-19777529)
chr4 (27-127)||(29038040-29038140)
chr4 (30-197)||(23956953-23957120)
chr4 (7-257)||(1648153-1648403)
chr4 (27-253)||(8052259-8052485)
chr4 (6-160)||(51605667-51605821)
chr4 (6-163)||(14160710-14160867)
chr4 (6-214)||(20892171-20892379)
chr4 (30-161)||(27712578-27712709)
chr4 (3-250)||(44660738-44660985)
chr4 (28-161)||(12524918-12525051)
chr4 (36-161)||(14850011-14850136)
chr4 (27-103)||(14681867-14681943)
chr4 (28-161)||(40474282-40474415)
chr4 (27-243)||(14302614-14302830)
chr4 (3-163)||(18614436-18614596)
chr4 (27-214)||(18226082-18226269)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (6-256)||(323882-324132)
scaffold0004 (27-235)||(202367-202575)
scaffold0004 (27-183)||(118477-118633)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (6-254)||(5610-5858)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (6-265)||(111-370)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (6-266)||(1732-1992)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (6-266)||(29225-29485)
scaffold0026 (33-163)||(30216-30346)
scaffold0026 (6-76)||(50168-50238)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (27-250)||(27708-27931)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (6-253)||(46277-46524)
scaffold0010 (6-250)||(41211-41455)
scaffold0010 (34-250)||(3098-3314)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (6-256)||(28395-28645)
scaffold0139 (6-256)||(34648-34898)
scaffold0139 (65-142)||(95-172)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-253)||(24755-25001)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (6-255)||(13379-13628)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (6-266)||(47912-48172)
scaffold0053 (6-256)||(56725-56975)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (30-253)||(40879-41102)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (6-253)||(89323-89570)
scaffold0001 (6-253)||(90001-90248)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (6-256)||(15290-15540)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (6-255)||(149749-149997)
scaffold0011 (6-256)||(194582-194832)
scaffold0011 (34-163)||(25439-25568)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (6-266)||(4944-5204)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (30-266)||(48272-48508)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (6-250)||(43967-44211)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (6-253)||(182-429)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (30-266)||(5918-6154)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (6-250)||(10935-11179)
scaffold0298 (6-250)||(14705-14949)
scaffold0298 (6-253)||(21164-21411)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (6-250)||(42101-42345)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-266)||(50753-51013)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (6-250)||(249797-250041)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (27-266)||(146-385)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (6-253)||(2769-3016)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (27-243)||(5988-6206)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (6-251)||(6116-6361)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (3-256)||(2230-2483)
scaffold0222 (6-250)||(8244-8488)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (30-266)||(1037-1273)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (6-256)||(32589-32839)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (6-250)||(20578-20822)
scaffold0104 (6-250)||(23398-23642)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (6-250)||(100440-100684)
scaffold0020 (78-197)||(181436-181555)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (6-253)||(2363-2610)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (6-253)||(851-1098)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (6-253)||(27806-28052)
scaffold0067 (6-256)||(51058-51308)
scaffold0067 (6-256)||(60092-60342)
scaffold0067 (6-256)||(66480-66730)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (6-256)||(566-814)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (30-253)||(3357-3580)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (6-256)||(13177-13427)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (48-256)||(11911-12119)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (82-266)||(16448-16632)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (6-250)||(10335-10579)
scaffold0235 (6-250)||(20549-20793)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (62-266)||(6264-6468)
scaffold0149 (62-266)||(10695-10899)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (67-253)||(1-187)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (27-253)||(9707-9933)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (6-256)||(20298-20548)
scaffold0058 (30-83)||(58093-58146)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (27-243)||(18114-18330)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (27-235)||(16876-17084)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (6-250)||(4330-4574)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (6-253)||(3932-4177)
scaffold0035 (33-220)||(43012-43199)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (3-242)||(516-755)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (6-250)||(7023-7267)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (6-214)||(12405-12613)
scaffold0180 (27-163)||(31652-31788)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (25-197)||(79391-79563)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (6-205)||(108859-109058)
scaffold0031 (27-178)||(62930-63081)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (27-250)||(218316-218539)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (6-243)||(3150-3387)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (25-250)||(15379-15604)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (6-243)||(30163-30400)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (7-247)||(32198-32438)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (6-250)||(45701-45945)
scaffold0114 (28-127)||(19241-19340)
scaffold0114 (6-183)||(21138-21315)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (27-251)||(177161-177385)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (7-125)||(35422-35540)
scaffold0156 (132-256)||(28403-28527)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (27-163)||(16925-17061)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (30-266)||(18517-18753)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (6-250)||(15591-15835)
scaffold0089 (27-250)||(10621-10844)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (54-254)||(39685-39885)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (27-163)||(16148-16284)
scaffold0040 (36-163)||(112396-112523)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (27-250)||(13652-13875)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (27-163)||(10240-10376)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (36-163)||(7561-7688)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (27-178)||(29470-29621)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (27-250)||(23084-23307)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (27-161)||(8670-8804)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (27-197)||(102470-102640)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (45-250)||(5215-5420)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (25-214)||(5091-5280)
scaffold0270 (25-214)||(12221-12410)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (33-250)||(5241-5458)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (27-178)||(7270-7421)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (34-197)||(3431-3594)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (28-163)||(7643-7778)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (28-127)||(7356-7455)
scaffold0358 (53-139)||(3534-3620)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (28-163)||(14111-14246)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (28-163)||(37-172)
scaffold0319 (28-163)||(2540-2675)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (28-163)||(25845-25979)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (6-217)||(28150-28361)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (25-160)||(277727-277862)
scaffold0005 (7-251)||(261491-261735)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (28-178)||(50688-50838)
scaffold0081 (28-253)||(19783-20008)
scaffold0081 (28-253)||(35207-35432)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (6-250)||(142-390)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (28-163)||(7231-7366)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (27-178)||(26230-26381)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (6-253)||(80710-80957)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (27-253)||(2089-2315)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (27-253)||(8120-8346)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (6-160)||(14178-14331)
scaffold0261 (6-160)||(22357-22510)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (27-235)||(23978-24179)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (28-161)||(8639-8772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (36-197)||(7995-8156)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (33-162)||(38853-38982)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (28-253)||(4253-4478)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (27-163)||(966-1102)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (27-163)||(4383-4519)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (6-253)||(6394-6641)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (28-127)||(2200-2299)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (27-178)||(24723-24874)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (27-250)||(9915-10138)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (6-160)||(96438-96592)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (28-197)||(1655-1824)
scaffold0044 (28-197)||(15395-15564)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (30-250)||(85421-85641)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (27-250)||(6790-7013)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (28-115)||(32473-32560)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (28-161)||(38720-38853)
scaffold0042 (3-94)||(66745-66836)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (6-94)||(1712-1800)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (36-103)||(12900-12967)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (28-127)||(28268-28367)
scaffold0023 (27-163)||(3355-3491)
scaffold0023 (63-163)||(131377-131477)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (33-163)||(39828-39958)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (53-163)||(6492-6602)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (28-94)||(18967-19033)
scaffold0017 (27-103)||(196377-196453)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (27-103)||(23972-24048)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (6-160)||(11664-11818)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (27-202)||(115804-115979)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (27-97)||(13980-14050)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (30-88)||(343-401)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (30-155)||(16466-16591)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 113987 - 113727
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  113987 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 113888  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  113887 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 113788  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  113787 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 113727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 108713 - 108844
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  108713 aaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtca 108812  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  108813 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 108844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 256
Target Start/End: Original strand, 95048 - 95130
Alignment:
Q  174 tgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
    |||||||||| | | || ||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  95048 tgtgaattgtcatcgcaaagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagcatcagagaagcacaaca 95130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19880562 - 19880299
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19880562 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtagaaaga 19880463  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19880462 cgttgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagtt 19880363  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19880362 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgagtagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 19880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 255
Target Start/End: Original strand, 34644603 - 34644855
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34644603 agacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 34644702  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  34644703 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtgcagtt 34644802  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 255  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34644803 gggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtattagagaagcgcaac 34644855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18795951 - 18795691
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18795951 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 18795852  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18795851 tacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttgaatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagttggg 18795752  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18795751 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 18795691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 21563173 - 21563412
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21563173 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21563272  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21563273 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21563372  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  21563373 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21563412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 21569032 - 21569271
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21569032 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21569131  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21569132 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21569231  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  21569232 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19454681 - 19454431
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19454681 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19454582  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  19454581 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 19454482  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || || | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19454481 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaataatatcagagaagcacaaca 19454431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15460597 - 15460348
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  15460597 cagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 15460498  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || || || || |||||||||| | | || |||||||| |||||    
T  15460497 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttggg 15460398  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 255  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15460397 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaac 15460348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 248
Target Start/End: Original strand, 8761953 - 8762195
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  8761953 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 8762052  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8762053 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8762152  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaa 248  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  8762153 gatgctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaa 8762195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Original strand, 5296232 - 5296476
Alignment:
Q  12 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  5296232 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcaca 5296331  T
Q  112 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 211  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| |||||| | || ||||| ||| |    
T  5296332 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgagttatcacctcagagtatacaattggggatgct 5296431  T
Q  212 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
    || ||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5296432 gagaattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaaca 5296476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 14378937 - 14379181
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  14378937 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14379036  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  14379037 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14379136  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| | || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14379137 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 14379181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 14380487 - 14380731
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  14380487 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14380586  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  14380587 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14380686  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| | || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14380687 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 14380731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21472841 - 21472618
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  21472841 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 21472742  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  21472741 taaaagagtttgagttccttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 21472642  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||||    
T  21472641 tttcttgaacagtattagggaagc 21472618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 10467869 - 10468116
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  10467869 cagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacat 10467968  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  10467969 tgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtatacagttggg 10468068  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10468069 gatgctgaagattgatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 10468116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15897334 - 15897107
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  15897334 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgcgatgatga 15897235  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  15897234 tcaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 15897135  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcacaa 254  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  15897134 attcttgaacagtattaaagaagcacaa 15897107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22435109 - 22434883
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22435109 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22435010  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22435009 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 22434910  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22434909 atttctgaagagtatcaaagaagcaca 22434883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22443507 - 22443281
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22443507 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22443408  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22443407 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22443308  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22443307 atttctgaagagtatcaaagaagcaca 22443281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27188673 - 27188449
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  27188673 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtca 27188574  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
      || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| ||||||    
T  27188573 gagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatt 27188474  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcacaa 254  Q
      |||| || |||| ||||||||||    
T  27188473 tctgaaaagcatcaaagaagcacaa 27188449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Original strand, 27260567 - 27260791
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  27260567 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtca 27260666  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
      || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| ||||||    
T  27260667 gagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatt 27260766  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcacaa 254  Q
      |||| || |||| ||||||||||    
T  27260767 tctgaaaagcatcaaagaagcacaa 27260791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24365673 - 24365429
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  24365673 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacct 24365574  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  24365573 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacattagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 24365474  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24365473 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 24365429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 16926684 - 16926815
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16926684 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16926783  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16926784 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19436262 - 19436019
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  |||| |||||  | ||||| ||    
T  19436262 agaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacatt 19436163  T
Q  107 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 206  Q
     || ||||| ||  |||||||| ||||||| || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||  |     
T  19436162 gcatatgtctgctttgatggtggaggaattcgatttgctagagcagttcaaagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattcagg 19436063  T
Q  207 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19436062 atgctgaaaattcatagtgatttcttgaatagtatctgagaagc 19436019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 19488313 - 19488536
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || |||||||    
T  19488313 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatgg 19488412  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| |||| || |||||||| ||||  |  ||    
T  19488413 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagaga 19488512  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||||| | ||||||    
T  19488513 gttcttgaatagtattaaagaagc 19488536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 20636343 - 20636478
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||    
T  20636343 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgctatgatggt 20636442  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  20636443 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 20636478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 22761496 - 22761719
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22761496 ttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatgg 22761595  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||  | ||||||||| ||||| |  | |||||| || | || ||| |||| ||  |||||||    
T  22761596 taaaggagttcgagttgcttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgttatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatga 22761695  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||    
T  22761696 attcctgaagagtattaaagaagc 22761719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23079709 - 23079573
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23079709 ttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23079610  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  23079609 taaaagagtttaattttctggaacagtttagagattt 23079573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 29590961 - 29591061
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29590961 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29591060  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  29591061 t 29591061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 16962489 - 16962620
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16962489 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16962588  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16962589 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16962620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 16625758 - 16625892
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16625758 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16625857  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  16625858 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 16625892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 28281833 - 28281987
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  28281833 cagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 28281932  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  28281933 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 28281987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25113807 - 25113658
Alignment:
Q  12 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 111  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  25113807 agatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 25113708  T
Q  112 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    |||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  25113707 tgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 25113658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 5838263 - 5838394
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||| |||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  5838263 aaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtta 5838362  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
      || || |||||||| |||||||||||||||    
T  5838363 gagagttcgagttacttgagcagtttagagat 5838394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19865929 - 19865776
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||    
T  19865929 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatgat 19865830  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
    ||| || || || ||| | || || |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  19865829 ggttaaagagttcgagctgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtga 19865776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 1542128 - 1542295
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  1542128 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 1542227  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
      || || |||||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  1542228 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1542295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 180
Target Start/End: Original strand, 25608908 - 25609055
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  |    
T  25608908 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagag 25609007  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 180  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  25609008 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaat 25609055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 28262241 - 28262372
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  28262241 aaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtca 28262340  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28262341 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28262372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 28340990 - 28341121
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  28340990 aaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtca 28341089  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28341090 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28341121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 27564863 - 27565032
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  27564863 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 27564962  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
     |   | || || ||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  27564963 tagaaagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtg 27565032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 2873844 - 2873944
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  2873844 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 2873943  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  2873944 t 2873944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Original strand, 18406991 - 18407121
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  18406991 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 18407090  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  18407091 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 18407121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 114
Target Start/End: Original strand, 18196774 - 18196861
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18196774 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25769350 - 25769208
Alignment:
Q  108 cacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggca 207  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||| ||| |    
T  25769350 cacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtagggta 25769251  T
Q  208 tgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| || | |||||| |||||    
T  25769250 tgttgaagatcaatagtgatttcttaaacaatatcagggaagc 25769208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18449747 - 18449650
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18449747 aaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggt 18449650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 266
Target Start/End: Original strand, 6560 - 6823
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6560 agacagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtaggaaga 6659  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  6660 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgagttgtcgccccagagtgtgcagtt 6759  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6760 gggtatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19614062 - 19613802
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19614062 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 19613963  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19613962 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 19613863  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19613862 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 19613802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 11387309 - 11387550
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11387309 tattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgat 11387408  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 224  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  11387409 ggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagt 11387508  T
Q  225 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  11387509 gatttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 11387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 14263106 - 14263366
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14263106 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14263205  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    ||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  14263206 tacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttgaacagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagttggg 14263305  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14263306 tatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 14263366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19148598 - 19148338
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19148598 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19148499  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  19148498 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 19148399  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  19148398 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 19148338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20747997 - 20747737
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20747997 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 20747898  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  20747897 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 20747798  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  20747797 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 20747737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 15101465 - 15101715
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || |||||||    
T  15101465 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgt 15101564  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15101565 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15101664  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     |||||||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15101665 tatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaaca 15101715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 16071157 - 16071403
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  16071157 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacat 16071256  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  16071257 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 16071356  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcac 252  Q
     ||| |||| || |||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  16071357 tatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcac 16071403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13022744 - 13022500
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  13022744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 13022645  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||||    
T  13022644 tacatatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacaattggg 13022545  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  13022544 gatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 13022500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 12205683 - 12205909
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  12205683 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatgg 12205782  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  12205783 ttaaagaatttgagttgcttggtcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 12205882  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     || ||||||||||| | |||||||||    
T  12205883 gtttttgaatagtattaaagaagcaca 12205909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 11305125 - 11305369
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  11305125 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 11305224  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  11305225 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 11305324  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11305325 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11305369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 16949334 - 16949578
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  16949334 cagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 16949433  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  16949434 tgcatatgtctgctctgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 16949533  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||  || |||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  16949534 gatgctgaggattaatagtgacttctagaatagtatctgagaagc 16949578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 26117467 - 26117711
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| || || || |    
T  26117467 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactt 26117566  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || || |||||  | || ||||| |||||||||| |  ||||||| | || |||||    
T  26117567 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcattccagagtatacatttggg 26117666  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26117667 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 26117711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13666924 - 13666674
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  13666924 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgt 13666825  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||| ||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||  ||| || ||||| ||||||||    
T  13666824 tgcatatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagctttgtctgtgaattgacacctcaaagtgttcagttggg 13666725  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || || | | | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13666724 gatgctgaagattaacagttatttcttgaatagcatccgagaagcacaaca 13666674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 268 - 513
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgc-agatgccttgagtagaaagacg 104  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| | || |||||     
T  268 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagaca 367  T
Q  105 ttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgg 204  Q
    || || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||| |||||| | |||||||    
T  368 ttgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacctcagagtattcagttgg 467  T
Q  205 gcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    | ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  468 ggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 14285238 - 14285485
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  14285238 cagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacac 14285337  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | ||||| || ||||| ||||  || |||||| | ||||||||    
T  14285338 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagcctggtatgtgagttgtcgcctcagagtatacagttggg 14285437  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  14285438 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtattcgagaagcaca 14285485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12458024 - 12457783
Alignment:
Q  9 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  12458024 aggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgc 12457925  T
Q  109 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 208  Q
    | ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||  ||||||||| ||| |||||| |  ||||||| ||    
T  12457924 atatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagttggggat 12457825  T
Q  209 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    | |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  12457824 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 12457783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 49153688 - 49153444
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || |    
T  49153688 cagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactt 49153589  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  49153588 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttcagagacatgagccttgtctgtgaatggtcaccccagagtattcagttggg 49153489  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| | | || ||||| |||||| |||||||    
T  49153488 aatgttgaaaattgatagtaactttttgaacagtatccgagaagc 49153444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14955919 - 14955785
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14955919 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14955820  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  14955819 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 14955785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 15147801 - 15147960
Alignment:
Q  38 tgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaattt 137  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||| ||     
T  15147801 tgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttc 15147900  T
Q  138 gagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15147901 gagttgcttgaacagtttagtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15147960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8708970 - 8708836
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8708970 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 8708871  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  8708870 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 8708836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Original strand, 11771146 - 11771316
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || |||||||    
T  11771146 ttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatgg 11771245  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | || ||| |||| || || || || ||||||||||| ||| | || || || |||| ||| |||||||||    
T  11771246 taaaagaaattgaattgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtg 11771316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 18550663 - 18550797
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18550663 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 18550762  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  18550763 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 18550797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 23504732 - 23504886
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||     
T  23504732 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgc 23504831  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23504832 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 23504886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 44790256 - 44790390
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44790256 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44790355  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | || || || || || || || ||||||||||||    
T  44790356 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 44790390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 254
Target Start/End: Original strand, 320948 - 321169
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  320948 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaagg 321047  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 232  Q
    | || ||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| |||||| | |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| ||| |||||    
T  321048 agttcgagttgctggagtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtgaagttagggatgctgaagattgatagtgatttctt 321147  T
Q  233 gaatagtatcagagaagcacaa 254  Q
    ||| ||||| | ||||||||||    
T  321148 gaagagtattaaagaagcacaa 321169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10872360 - 10872190
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10872360 ttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10872261  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| |||||||||    
T  10872260 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtg 10872190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14333761 - 14333535
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  14333761 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 14333662  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14333661 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14333562  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  14333561 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 14333535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 18052815 - 18052969
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  18052815 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacac 18052914  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  18052915 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 18052969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8199993 - 8199893
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8199993 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8199894  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  8199893 t 8199893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 243
Target Start/End: Original strand, 11236118 - 11236334
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  11236118 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 11236217  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| |||    
T  11236218 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaaattgatagtga 11236317  T
Q  227 attcttgaatagtatca 243  Q
    |||| |||| |||||||    
T  11236318 attcctgaaaagtatca 11236334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 13967530 - 13967774
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | || || |    
T  13967530 cagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttaacccggaaaactt 13967629  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||  ||||| | ||||||||    
T  13967630 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccttagagtatacagttggg 13967729  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  13967730 gatgctgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 13967774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 15159962 - 15160062
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15159962 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15160061  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  15160062 t 15160062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18179106 - 18179007
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  18179106 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 18179007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 16223 - 16389
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  16223 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 16322  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagag 193  Q
    | |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||    
T  16323 ttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagag 16389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15341818 - 15341573
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||     
T  15341818 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgc 15341719  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | ||||||||    
T  15341718 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttggg 15341619  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 251  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  15341618 catgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagca 15341573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 23202519 - 23202652
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23202519 tgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23202618  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23202619 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23202652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 23508646 - 23508779
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23508646 tgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23508745  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23508746 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23508779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13687429 - 13687329
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13687429 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13687330  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  13687329 t 13687329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15204983 - 15204851
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15204983 tgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggt 15204884  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
     || || || ||| | |||||  ||||||||||    
T  15204883 taaagagttggagctgctcgaatagtttagaga 15204851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12456944 - 12456845
Alignment:
Q  151 agtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12456944 agtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagc 12456845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12688866 - 12688731
Alignment:
Q  27 ttgaaggatt-atgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 125  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  12688866 ttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 12688767  T
Q  126 gtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    || |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12688766 gttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9597437 - 9597252
Alignment:
Q  12 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 111  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || || |    
T  9597437 agatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcata 9597338  T
Q  112 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  9597337 tgtccgctttgatggttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 9597252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 11552008 - 11552107
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  11552008 tgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14213038 - 14212886
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  14213038 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 14212939  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 180  Q
     |  || ||||||||||| || || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  14212938 tagagagtttgagttacttgaacaattcagagatttgagcttggtttgtgaat 14212886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14041060 - 14040921
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14041060 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14040961  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 166  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14040960 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14040921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14351090 - 14350951
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14351090 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14350991  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 166  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14350990 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14350951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625744
Alignment:
Q  48 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 147  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||| || || || ||| | ||||    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcg 15625799  T
Q  148 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    | |||||||||||| | || || || |||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  15625798 aacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagtt 15625744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Original strand, 40027 - 40142
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    |||||| |||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  40027 agacagcggagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 40126  T
Q  103 cgttacacatgtcggc 118  Q
    | || |||||||||||    
T  40127 ccttgcacatgtcggc 40142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 32555 - 32815
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32555 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 32654  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32655 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 32754  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32755 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 32815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 55778 - 56022
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  55778 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 55877  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  55878 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 55977  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  55978 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 56022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 49392 - 49652
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49392 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 49491  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49492 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 49591  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49592 tatgtagaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 49652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44555 - 44388
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  44555 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 44456  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
      || || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  44455 gagagttcgagttactcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 44388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9880 - 9781
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  9880 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 16275
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagt 95  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16342 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagt 16275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 21679835 - 21680095
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21679835 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21679934  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21679935 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 21680034  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21680035 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 21680095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22463262 - 22463003
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22463262 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 22463163  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  22463162 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 22463063  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgt 265  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22463062 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 22463003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 24619352 - 24619596
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24619352 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24619451  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24619452 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24619551  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24619552 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24619596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 24715583 - 24715827
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24715583 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24715682  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24715683 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24715782  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24715783 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24715827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 24748611 - 24748855
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24748611 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24748710  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24748711 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24748810  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24748811 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24748855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20822764 - 20822505
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  20822764 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 20822665  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || | | | || ||||||||||||||    
T  20822664 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttaagtctagtgtgtgagttatcatctcaaagtgtgcagttggg 20822565  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgt 265  Q
     |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20822564 tatgttgaagatcaatagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 20822505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 28893999 - 28894258
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28893999 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28894098  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28894099 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28894198  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgt 265  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28894199 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28894258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 28915470 - 28915729
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28915470 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28915569  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28915570 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28915669  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgt 265  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28915670 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28915729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 28922825 - 28923084
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28922825 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28922924  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28922925 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28923024  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgt 265  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28923025 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28923084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 23079146 - 23079396
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || || || |    
T  23079146 cagaggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacat 23079245  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||||    
T  23079246 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacttcagagtatatagttggg 23079345  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     |||||||| || || | | | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23079346 gatgttgaagattaacagtaatttcttgaatagtatctgagaagctcaaca 23079396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 14886048 - 14886292
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  14886048 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 14886147  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14886148 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14886247  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14886248 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14886292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774811
Alignment:
Q  40 attttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 139  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcga 20774937  T
Q  140 gttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagt 239  Q
    ||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||    
T  20774936 gttgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgggtagt 20774837  T
Q  240 atcagagaagcacaacagtttgatgt 265  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  20774836 atcagagaagcacaacaagttgatgt 20774811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 22234977 - 22235221
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22234977 cagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 22235076  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  22235077 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 22235176  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| | || || || | ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  22235177 gatgctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagc 22235221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 24797454 - 24797698
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |    
T  24797454 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagactt 24797553  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  24797554 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 24797653  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  24797654 aatgttgaaaattgatagggatttcttgaacagtatccgagaagc 24797698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 28930738 - 28930946
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28930738 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28930837  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28930838 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28930937  T
Q  206 catgttgaa 214  Q
     ||||||||    
T  28930938 tatgttgaa 28930946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 21563051 - 21563277
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||    
T  21563051 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatgg 21563150  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||  | || || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  21563151 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 21563250  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21563251 gttcttgaacagtatcaaagaagcaca 21563277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 37542438 - 37542682
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || || |    
T  37542438 cagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaactt 37542537  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | ||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  37542538 tgcacgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 37542637  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| | | ||||| || |||||| |||||||    
T  37542638 aatgttgaaaattgatagtaacttcttaaacagtatccgagaagc 37542682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Original strand, 21889933 - 21890076
Alignment:
Q  123 atggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 222  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  21889933 atggtaaaggagtttgagttgctagagaagtttagagacttgagtcttgtttatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagatcaata 21890032  T
Q  223 atgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21890033 gtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21890076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23472536 - 23472400
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23472536 ttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 23472437  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  23472436 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 23472400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25849386 - 25849142
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  25849386 cagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactt 25849287  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  25849286 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 25849187  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| | || ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25849186 gatgctaaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 25849142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 27667568 - 27667794
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27667568 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27667667  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  27667668 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 27667767  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||  |||| || |||| |||||||||    
T  27667768 atttctgaaaagcatcaaagaagcaca 27667794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16357810 - 16357710
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16357810 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16357711  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  16357710 t 16357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27519714 - 27519614
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27519714 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27519615  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  27519614 t 27519614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 34567802 - 34567702
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  34567802 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 34567703  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  34567702 t 34567702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 40710088 - 40709988
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  40710088 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 40709989  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  40709988 t 40709988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22503984 - 22503746
Alignment:
Q  12 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |    
T  22503984 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcata 22503885  T
Q  112 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 211  Q
    |||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  22503884 tgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgct 22503785  T
Q  212 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  22503784 gaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 22503746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23575036 - 23574810
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||||||    
T  23575036 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggt 23574937  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  23574936 tagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 23574837  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcacaa 254  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  23574836 ttcctgaagagtatcaaagaagcacaa 23574810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41772147 - 41772050
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  41772147 aaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 41772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27611662 - 27611562
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27611662 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27611563  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  27611562 t 27611562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19771265 - 19771134
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  19771265 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 19771166  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19771165 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Original strand, 21872128 - 21872226
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21872128 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Original strand, 21876408 - 21876506
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21876408 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 22331965 - 22332191
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22331965 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22332064  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22332065 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22332164  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  22332165 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 22332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23441518 - 23441348
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  23441518 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 23441419  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | |  || || || ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| |||||||||    
T  23441418 ttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtg 23441348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25427735 - 25427605
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  25427735 gattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 25427636  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  25427635 agttcgagttgcttgaacagttcagaaattt 25427605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20343590 - 20343349
Alignment:
Q  9 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 108  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  20343590 aggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgc 20343491  T
Q  109 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 208  Q
    ||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| | |||||||| | | |||||| | |||||||| ||    
T  20343490 acatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctatgaattgtcatctcagagtatacagttggggat 20343391  T
Q  209 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    | |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  20343390 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 20343349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 14998817 - 14998917
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14998817 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14998916  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  14998917 t 14998917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22135976 - 22135876
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22135976 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22135877  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  22135876 t 22135876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 27684478 - 27684578
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  27684478 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 27684577  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  27684578 t 27684578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 29475151 - 29475251
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  29475151 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 29475250  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  29475251 t 29475251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 214
Target Start/End: Original strand, 26737805 - 26737992
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  26737805 ttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 26737904  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 214  Q
    | || || || |||||  | ||||||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  26737905 taaaagagttcgagttgttggagcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaa 26737992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21497228 - 21497150
Alignment:
Q  31 aggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21497228 aggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttaca 21497150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 37290574 - 37290708
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  37290574 ttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 37290673  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  37290674 tcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagat 37290708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 17268391 - 17268545
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  17268391 cagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 17268490  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| | || ||||| || || || || |||||||||||    
T  17268491 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagaga 17268545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Original strand, 20467176 - 20467237
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20467176 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgc 20467237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 235
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831047
Alignment:
Q  66 aaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaa 165  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||  | |    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  166 gccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 235  Q
    | || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 21831047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21882256 - 21882087
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||||||    
T  21882256 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggt 21882157  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
     |  || |||||||| || || ||||||| |||| | ||||| |||||||| | || ||| |||||||||    
T  21882156 tagagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 21882087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18777103 - 18776951
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  18777103 tgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 18777004  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 180  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  18777003 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 18776951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 127
Target Start/End: Original strand, 21338384 - 21338475
Alignment:
Q  36 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || |||| | | || ||||| || ||||||||    
T  21338384 tatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggt 21338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 83
Target Start/End: Original strand, 846 - 923
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 83  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  846 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21408443 - 21408230
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  21408443 aaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 21408344  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    | || || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || |||||| |  | ||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  21408343 aagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtctaaaattgggaatgtttaatatcaacattgaatt 21408244  T
Q  230 cttgaatagtatca 243  Q
     || ||||||||||    
T  21408243 ttttaatagtatca 21408230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 13971223 - 13971483
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13971223 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgt 13971322  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13971323 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 13971422  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||    
T  13971423 tatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcaaataagcgcaacaggttgatgtc 13971483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14087699 - 14087439
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  14087699 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacat 14087600  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  14087599 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgagaagttggg 14087500  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14087499 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 14087439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 10419148 - 10419397
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  10419148 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 10419247  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||||||||||||    
T  10419248 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttggg 10419347  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 255  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10419348 tatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagagaagcacaac 10419397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 12359630 - 12359880
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12359630 cagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagacgt 12359729  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  12359730 tgcatatgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 12359829  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12359830 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaaca 12359880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17187400 - 17187164
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  17187400 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 17187301  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  17187300 tgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctggtttgtgaattaacacctcagagtgtgcagttggg 17187201  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 242  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||    
T  17187200 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatc 17187164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14574925 - 14574702
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  14574925 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 14574826  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  14574825 atgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 14574726  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  14574725 cttgagtagtatccgagaagcaca 14574702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17493656 - 17493409
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  17493656 cagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgt 17493557  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || ||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || | ||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  17493556 tgcatatgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtacatttggg 17493457  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17493456 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 17493409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 31694289 - 31694536
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  31694289 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31694388  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  31694389 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgaaccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31694488  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31694489 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcaca 31694536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31939929 - 31939682
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  31939929 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31939830  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||  |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  31939829 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagactcgagccttgcctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31939730  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31939729 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcaca 31939682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 47124970 - 47124726
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  47124970 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 47124871  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  47124870 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 47124771  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  47124770 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 47124726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Original strand, 13319605 - 13319841
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |    
T  13319605 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagacct 13319704  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| |||    
T  13319705 tacatatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttaaagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcaaagtattcagtcggg 13319804  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 242  Q
     |||||||| || || | ||| |||||||||||||||    
T  13319805 gatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatc 13319841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Original strand, 16827327 - 16827566
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  16827327 ttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 16827426  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| | ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  16827427 taaaagagtttgagttgctagaccattttagagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 16827526  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  16827527 tttcttgaacagtatcagagaagcacatcaagttgatgtc 16827566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 16337615 - 16337859
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  16337615 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16337714  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  16337715 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 16337814  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||  ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16337815 aatgttgaggattgatagtgatttcttgaacagtatcagagaagc 16337859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 11960272 - 11960516
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  11960272 cagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacat 11960371  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  11960372 tgcatatgtctgctttgatggtaaaggaatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 11960471  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||  ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11960472 gatgatgaggattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11960516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 16835613 - 16835873
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  16835613 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagactt 16835712  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |  |||||||| || || || |||||||||||  | || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||    
T  16835713 tgcacatgtctgcattaatggtaagagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtcttgtgtgtgagttgacaccgaagagtgttcagttggg 16835812  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  16835813 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtc 16835873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15228654 - 15228428
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15228654 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15228555  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15228554 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15228455  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||||||||| | |||||||||    
T  15228454 gttcttgaatagtattaaagaagcaca 15228428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15234522 - 15234296
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15234522 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15234423  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15234422 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15234323  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||||||||| | |||||||||    
T  15234322 gttcttgaatagtattaaagaagcaca 15234296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 15347383 - 15347550
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||||||||| |    
T  15347383 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtccgccatgatggtca 15347482  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
      || || |||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15347483 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15347550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12179364 - 12179234
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  12179364 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgt 12179265  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatt 136  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  12179264 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatt 12179234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 14580053 - 14580291
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14580053 agacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 14580152  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
      ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | | ||||||||  || |    
T  14580153 atttacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagct 14580252  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 241  Q
     || |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||    
T  14580253 aggaatgttgaagattgataatgaatttttgaaaagtat 14580291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 18133453 - 18133693
Alignment:
Q  10 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || ||||| ||    
T  18133453 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgca 18133552  T
Q  110 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 209  Q
     ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||| ||||||||| || ||||| || |||||||||  ||| || ||||| |||||||  |||    
T  18133553 tatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagccgtttagagacttgagcctcgtctgtgaattgacacctcatagtgttcagttggcgatg 18133652  T
Q  210 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     | || || || | ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  18133653 ctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagc 18133693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 16491317 - 16491452
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16491317 tgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 16491416  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  16491417 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 16491452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 5424065 - 5424291
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  5424065 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 5424164  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  5424165 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 5424264  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  5424265 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 5424291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44778273 - 44778119
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  44778273 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 44778174  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44778173 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 44778119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6601728 - 6601631
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  6601728 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 6601631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Original strand, 16328766 - 16329007
Alignment:
Q  9 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 108  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||    
T  16328766 aggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattac 16328865  T
Q  109 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 208  Q
    | ||||| ||  | ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | | |||||| | |||||||| ||    
T  16328866 atatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggggat 16328965  T
Q  209 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
      |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16328966 aatgaagattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 16329007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 15588527 - 15588627
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15588527 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15588626  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  15588627 t 15588627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16636768 - 16636668
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16636768 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16636669  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  16636668 t 16636668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 20061189 - 20061289
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20061189 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20061288  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  20061289 t 20061289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 43164092 - 43163992
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  43164092 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 43163993  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  43163992 t 43163992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 48426442 - 48426342
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  48426442 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 48426343  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  48426342 t 48426342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 53384156 - 53384323
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  53384156 aaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 53384255  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
      || ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  53384256 gagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 53384323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17490839 - 17490693
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||     
T  17490839 gattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagt 17490740  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaa 179  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  17490739 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttgtgaa 17490693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41178548 - 41178394
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  41178548 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 41178449  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  41178448 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 41178394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10006595 - 10006495
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10006595 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10006496  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  10006495 t 10006495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10907205 - 10907105
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10907205 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10907106  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  10907105 t 10907105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 253
Target Start/End: Original strand, 11302991 - 11303123
Alignment:
Q  121 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 220  Q
    |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||    
T  11302991 tgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaa 11303090  T
Q  221 taatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11303091 cagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 11303123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13253685 - 13253585
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13253685 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13253586  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  13253585 t 13253585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15260625 - 15260489
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||    
T  15260625 ttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatgg 15260526  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15260525 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagattt 15260489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 15401652 - 15401878
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15401652 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15401751  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  15401752 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15401851  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  15401852 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15401878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15340264 - 15340038
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15340264 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15340165  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  15340164 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15340065  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  15340064 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 14125730 - 14125899
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  14125730 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14125829  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
     |  || || || ||||| || | |||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  14125830 tagagagttcgaattacttgaaccgtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 14125899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 15724069 - 15724169
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15724069 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15724168  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  15724169 t 15724169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13943050 - 13942896
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||      
T  13943050 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 13942951  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| | || ||||| || || || || |||||||||||    
T  13942950 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagaga 13942896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12499245 - 12499109
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  12499245 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 12499146  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    ||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  12499145 ggttagagagttcgatttacttgaacagtttagagat 12499109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 254
Target Start/End: Original strand, 14875635 - 14875861
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||    
T  14875635 tgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagt 14875734  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     |  || || ||||| || ||  ||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  14875735 tagagagttcgagttgcttgaatagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 14875834  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcacaa 254  Q
    || ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  14875835 tttttgaaaagtattaaagaggcacaa 14875861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16693159 - 16693026
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||    
T  16693159 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgccttgatgg 16693060  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| |||||    
T  16693059 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagaga 16693026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 16411418 - 16411517
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16411418 tgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 16411517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755820
Alignment:
Q  64 gtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16755820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 16806083 - 16806252
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  16806083 tgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16806182  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
     |  || || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16806183 tagagagttcgagttacttgaacagttcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16806252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 16380031 - 16380185
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  16380031 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 16380130  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  16380131 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagaga 16380185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24439 - 24179
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  24439 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 24340  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24339 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 24240  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24239 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20277 - 20017
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  20277 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 20178  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20177 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 20078  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20077 tatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 20017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Original strand, 20060918 - 20061159
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20060918 tattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgat 20061017  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20061018 ggtgaaggaatttgagttgcttgagcattttagagatttgagccttgtttgtgatttgttaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagt 20061117  T
Q  225 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20061118 gaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacagattgatgtc 20061159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19855717 - 19855467
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19855717 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19855618  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  19855617 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 19855518  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19855517 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaaca 19855467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 19662084 - 19662331
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  19662084 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 19662183  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  19662184 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacaccccagagtgtacagttggg 19662283  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19662284 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 19662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 23197193 - 23197440
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  23197193 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgt 23197292  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23197293 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 23197392  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  23197393 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgtgaagcaca 23197440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 20855707 - 20855966
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20855707 cagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 20855806  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  20855807 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 20855906  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgt 265  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  20855907 tatgctgaagatcaatagtgatttcttggatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgt 20855966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 20939010 - 20939260
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  20939010 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 20939109  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  20939110 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacaattggg 20939209  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20939210 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaaca 20939260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 20834847 - 20835096
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  20834847 cagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20834946  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||| |||||||| ||||||||    
T  20834947 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattaacacctcagagtgttcagttggg 20835046  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 255  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20835047 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 20835096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 24098550 - 24098794
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  24098550 cagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 24098649  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24098650 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 24098749  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24098750 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 31538944 - 31539188
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  31538944 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 31539043  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | ||| |||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  31539044 tgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 31539143  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31539144 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 31539188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16373921 - 16373707
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16373921 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16373822  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||||| || ||||| || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  16373821 ttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtga 16373722  T
Q  227 attcttgaatagtat 241  Q
    ||||||||| |||||    
T  16373721 attcttgaaaagtat 16373707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21952321 - 21952113
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21952321 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 21952222  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||||||||    
T  21952221 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggg 21952122  T
Q  206 catgttgaa 214  Q
     ||| ||||    
T  21952121 gatgctgaa 21952113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 134
Target Start/End: Original strand, 21744499 - 21744627
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21744499 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21744598  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaa 134  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  21744599 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaa 21744627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 431085 - 431220
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  431085 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 431184  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  431185 aaaagaattcgagttgcttgaacagttcagagattt 431220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21750322 - 21750104
Alignment:
Q  36 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 135  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  21750322 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 21750223  T
Q  136 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 235  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||||||||||  ||||    
T  21750222 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaa 21750123  T
Q  236 tagtatcagagaagcacaa 254  Q
     ||||| | ||||||||||    
T  21750122 gagtattaaagaagcacaa 21750104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 51332461 - 51332687
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  51332461 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 51332560  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || || || || || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  51332561 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 51332660  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  51332661 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 51332687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20295824 - 20295580
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |    
T  20295824 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactt 20295725  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || ||  | || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  20295724 tgcacatgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttagaatagtttagagacttgagtttggtctgtgaattgtcacctcagagtattcagttggg 20295625  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  20295624 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 20295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 41352636 - 41352800
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |    
T  41352636 gattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagag 41352735  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  41352736 agtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 41352800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 16349564 - 16349664
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16349564 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16349663  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  16349664 t 16349664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Original strand, 33390000 - 33390167
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  33390000 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 33390099  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  33390100 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 33390167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21838341 - 21838241
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  21838341 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 21838242  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  21838241 t 21838241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22110413 - 22110277
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22110413 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22110314  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22110313 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22110277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22114262 - 22114126
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22114262 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22114163  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22114162 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22114126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19107759 - 19107625
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||    
T  19107759 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgtatatgtccgctatgatgg 19107660  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19107659 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19107625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21831694 - 21831468
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21831694 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21831595  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  21831594 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 21831495  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  21831494 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 21831468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077794
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||| |  |    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 16077729  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16077730 agtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 19759841 - 19760067
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  19759841 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 19759940  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    |  | ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||  | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| |  ||| |||| ||  ||| |||    
T  19759941 tctaagaattggagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtga 19760040  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||  |||||||||| | |||||||||    
T  19760041 atttatgaatagtataaaagaagcaca 19760067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21025564 - 21025394
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21025564 ttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21025465  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  21025464 ttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 21025394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 180
Target Start/End: Original strand, 21234675 - 21234852
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  21234675 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 21234774  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 180  Q
    |||| || ||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  21234775 cgttgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 21234852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Original strand, 22361213 - 22361288
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 103  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22361213 tgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagac 22361288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 24793585 - 24793664
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24793585 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaaaacgtt 24793664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 17043983 - 17044059
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 103  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  17043983 ttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 17044059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 23099455 - 23099693
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23099455 tgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggt 23099554  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||     
T  23099555 aaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgat 23099654  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  23099655 ttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 23099693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 266
Target Start/End: Original strand, 27209590 - 27209847
Alignment:
Q  9 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 108  Q
    ||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  27209590 aggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgc 27209689  T
Q  109 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 208  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| ||    
T  27209690 acatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagtttagagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtat 27209789  T
Q  209 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27209790 gctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 27209847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23277804 - 23277560
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23277804 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 23277705  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23277704 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23277605  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||  |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23277604 gattctgaagattaacagtgacttcttgaatagtatccgagaagc 23277560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24949618 - 24949371
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  24949618 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 24949519  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||  |||||||| ||||||||    
T  24949518 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacttcagagtgttcagttggg 24949419  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |  | ||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  24949418 gatgctgaagattatcagtgatttcttagatagtatccgagaagcaca 24949371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1064779 - 1064535
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  1064779 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 1064680  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  1064679 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 1064580  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  1064579 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 1064535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23111743 - 23111517
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23111743 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23111644  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || ||| |||| || ||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  23111643 taaaagagttttagttgcttgaagagtttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 23111544  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  23111543 attcttgaacagtattaaagaagcaca 23111517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20829287 - 20829043
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  20829287 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 20829188  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  20829187 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 20829088  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20829087 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 20829043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31831686 - 31831450
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  31831686 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 31831587  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  31831586 tacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 31831487  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 242  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  31831486 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatc 31831450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23294963 - 23294719
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||    
T  23294963 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagacgt 23294864  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| |  |||||||    
T  23294863 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattaagttggg 23294764  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23294763 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23294719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 19651465 - 19651709
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  19651465 cagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 19651564  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || || ||  ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  19651565 tgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 19651664  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19651665 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 19651709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24711041 - 24710814
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24711041 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 24710942  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  24710941 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 24710842  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcacaa 254  Q
    |||  |||| |||||||  |||||||||    
T  24710841 atttctgaaaagtatcaaggaagcacaa 24710814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16923896 - 16923796
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16923896 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16923797  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  16923796 t 16923796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16926367 - 16926267
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16926367 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16926268  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  16926267 t 16926267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16983159 - 16983059
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16983159 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16983060  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  16983059 t 16983059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17000007 - 16999907
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17000007 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16999908  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  16999907 t 16999907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17064724 - 17064624
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17064724 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17064625  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  17064624 t 17064624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 22324292 - 22324392
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22324292 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 22324391  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  22324392 t 22324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27219023 - 27218923
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27219023 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27218924  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  27218923 t 27218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24676489 - 24676326
Alignment:
Q  34 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 133  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  ||    
T  24676489 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagaga 24676390  T
Q  134 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
     || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24676389 gttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24676326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12575381 - 12575227
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  12575381 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 12575282  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  12575281 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 12575227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23067391 - 23067262
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  23067391 gattatgattttgagttga-ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 23067293  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  23067292 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 23067262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27372276 - 27372142
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27372276 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27372177  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  27372176 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 27372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 44385005 - 44385105
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44385005 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44385104  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  44385105 t 44385105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 23107167 - 23107302
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  23107167 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 23107266  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  23107267 aaaagagttcgagttacttgaacagttcagagattt 23107302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27788768 - 27788615
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  27788768 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 27788669  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  27788668 t-catatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 27788615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 21144478 - 21144611
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21144478 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 21144577  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  21144578 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 21144611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10869857 - 10869757
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10869857 ttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10869758  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  10869757 t 10869757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 41607821 - 41607921
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  41607821 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 41607920  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  41607921 t 41607921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 24876186 - 24876285
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24876186 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 24876285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24263377 - 24263279
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  24263377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45533349 - 45533150
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| |    
T  45533349 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggtta 45533250  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
      || || ||||| || ||  |||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  45533249 gagagttggagttgcttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaatt 45533150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 21324711 - 21324836
Alignment:
Q  36 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 135  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  || |    
T  21324711 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagt 21324810  T
Q  136 ttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |||||||| || ||||||||||||    
T  21324811 tcgagttacttgaacagtttagagat 21324836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 24706916 - 24707088
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||    
T  24706916 tattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattgat 24707015  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    ||| |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24707016 ggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 266
Target Start/End: Original strand, 27364713 - 27364754
Alignment:
Q  225 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  27364713 gaattcttgaatagtatcaaagaagcgcaacaggttgatgtc 27364754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1311 - 1051
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1311 cagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagacat 1212  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  1211 tgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtgcagttggg 1112  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1111 tatattgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 2208 - 2455
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  2208 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 2307  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2308 tgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 2407  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2408 tatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtatccgagaagcaca 2455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 68798 - 68548
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  68798 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 68699  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  68698 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 68599  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  68598 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 68548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Original strand, 3831 - 4080
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3831 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgt 3930  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  3931 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacaccttagagtgtacagttggg 4030  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 255  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4031 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 4080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 12786 - 13029
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  12786 cagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 12885  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || |||||  |  ||||||||||| ||||||| || || || | ||||||       || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  12886 tgcatatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgtttag-------agtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 12978  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12979 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatacgagaagcacaaca 13029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 20984865 - 20985112
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20984865 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgt 20984964  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  20984965 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttggg 20985064  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20985065 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcaca 20985112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21841859 - 21841620
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21841859 ttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatgg 21841760  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  21841759 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 21841660  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21841659 tttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21841620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19852853 - 19852630
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19852853 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19852754  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  19852753 taaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtga 19852654  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19852653 tttcttgaatagtatcagagaagc 19852630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19858889 - 19858666
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19858889 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19858790  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  19858789 taaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtga 19858690  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19858689 tttcttgaatagtatcagagaagc 19858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23656366 - 23656140
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  23656366 aaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 23656267  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  23656266 aagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 23656167  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23656166 cttgagtagtatccgagaagcacaaca 23656140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22372375 - 22372150
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22372375 tattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 22372276  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 224  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||  | || |||||||||   |||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22372275 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtcttgtttgtttgttgtcatctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 22372176  T
Q  225 gaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    || ||||| || ||||||||||||||    
T  22372175 gatttcttaaacagtatcagagaagc 22372150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 20974974 - 20975219
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  20974974 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20975073  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || |||||     || ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20975074 tgcatatgtc-----tgctggtgaaagaattccattttctagaacagtttagagagttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 20975168  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20975169 gatgctgaagattaaaagtgatttcttgaatagtataagagaagcaaaaca 20975219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14566605 - 14566361
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  14566605 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 14566506  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14566505 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14566406  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14566405 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Original strand, 20395471 - 20395685
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||    
T  20395471 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatgg 20395570  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || || ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  20395571 ttaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 20395670  T
Q  227 attcttgaatagtat 241  Q
    ||| |||||||||||    
T  20395671 atttttgaatagtat 20395685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 31415789 - 31416036
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  31415789 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacat 31415888  T
Q  106 tacacatgtcggcca---tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    | || ||||| ||     ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || |||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  31415889 tgcatatgtctgctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtgagttgacacctcagagtgtgcagtt 31415988  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31415989 ggggatgctgaagattaatagtgaattcttgaatagtatccgagaagc 31416036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 29302744 - 29302988
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || || || |    
T  29302744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacat 29302843  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | | ||||||    
T  29302844 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacggttggg 29302943  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| ||||| || |||||| |||||||    
T  29302944 gatgctgaagattgatagtgatttcttaaacagtatccgagaagc 29302988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19979408 - 19979183
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19979408 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19979309  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     |  || |||||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  19979308 tagagagtttgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 19979209  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||    
T  19979208 tttttgaagagtatcaaagaagcaca 19979183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 22376791 - 22377016
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  22376791 tattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgat 22376890  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 224  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |    
T  22376891 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagt 22376990  T
Q  225 gaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22376991 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 22377016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 22382966 - 22383191
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  22382966 tattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgat 22383065  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 224  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |    
T  22383066 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagt 22383165  T
Q  225 gaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22383166 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 22383191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6605121 - 6604877
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  6605121 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 6605022  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  6605021 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 6604922  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  6604921 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 6604877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 21324587 - 21324794
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  21324587 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 21324686  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | ||  |||| | | |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  21324687 tgcatgtgtctg-cttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtttagttggg 21324785  T
Q  206 catgttgaa 214  Q
     ||| ||||    
T  21324786 gatgctgaa 21324794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 20009260 - 20009482
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  20009260 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 20009358  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||    
T  20009359 taaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagattaatagtga 20009458  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||| | ||||| ||||||    
T  20009459 tttcttgaacaatatcatagaagc 20009482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20389541 - 20389317
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  20389541 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 20389442  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || ||| | || || || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  20389441 ttaaagagttttatttgcttgaacagtttagggacttgagcctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 20389342  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagca 251  Q
     |||||||| | ||||| |||||||    
T  20389341 gttcttgaacaatatcaaagaagca 20389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Original strand, 21921082 - 21921181
Alignment:
Q  34 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21921082 attatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaagga 21921181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6680330
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| |    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaag 6680448  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 232  Q
    | || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||    
T  6680447 agttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttctt 6680348  T
Q  233 gaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  6680347 gaacagtatccgagaagc 6680330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 16270542 - 16270786
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  16270542 cagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16270641  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||||||    
T  16270642 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagttggg 16270741  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  16270742 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 16270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 19483409 - 19483573
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |    
T  19483409 gattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagag 19483508  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  19483509 agtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 19483573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23651477 - 23651313
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||    
T  23651477 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaggg 23651378  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23651377 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23651313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21252385 - 21252250
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21252385 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21252286  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21252285 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21252250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 31570160 - 31570314
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  31570160 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 31570259  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31570260 ttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 31570314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Original strand, 17673362 - 17673496
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17673362 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17673461  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    | |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  17673462 tcagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 17673496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 20017602 - 20017828
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20017602 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20017701  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  20017702 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 20017801  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  20017802 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 20017828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23886466 - 23886252
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||     
T  23886466 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatga 23886367  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || || ||| | || || || ||||||||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  23886366 tcaaagagttggagctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 23886267  T
Q  227 attcttgaatagtat 241  Q
    |||  ||||||||||    
T  23886266 atttctgaatagtat 23886252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 253
Target Start/End: Original strand, 21165878 - 21166103
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  21165878 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 21165977  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | || ||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  21165978 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 21166077  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  21166078 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 21166103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12306221 - 12305977
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || || |    
T  12306221 cagaggagatggttatagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacat 12306122  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  12306121 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 12306022  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  12306021 gatgttgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 12305977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19114132 - 19114032
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19114132 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19114033  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  19114032 t 19114032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 115
Target Start/End: Original strand, 22247772 - 22247860
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  22247772 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 22247860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 250
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803235
Alignment:
Q  79 ttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtga 803163  T
Q  179 attgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  803164 attgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 21393205 - 21393340
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21393205 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21393304  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21393305 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21393340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 21787699 - 21787834
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21787699 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21787798  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21787799 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21787834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22041301 - 22041131
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  22041301 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 22041202  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | |  || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  22041201 ttagagagtttgagttacttgaacagttcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 22041131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21043886 - 21043753
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21043886 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21043787  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    ||| || || ||||| || || ||||| ||||||    
T  21043786 gaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagat 21043753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18858019 - 18857919
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  18858019 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatgg 18857920  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  18857919 t 18857919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22052329 - 22052079
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  22052329 agacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaaga 22052230  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    |  | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || || ||  |  ||||    
T  22052229 cactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcaaagcatatagtt 22052130  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||||||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  22052129 gggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcaca 22052079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 30312484 - 30312636
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  30312484 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 30312583  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 180  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  30312584 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 30312636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 27355999 - 27355924
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttg 81  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27355999 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267544
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || || || || |||||| | || |    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaag 1267575  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  1267574 aatttgatttgctagagcagtttagagattt 1267544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15534849 - 15534689
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  15534849 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 15534750  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || |||||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15534749 cattgcacatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaatttagagattt 15534689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32601586 - 32601433
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  32601586 ttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 32601487  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 180  Q
    | |  || || |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  32601486 ttatagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaat 32601433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19869159 - 19869044
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    |||||| |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  19869159 agacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 19869060  T
Q  103 cgttacacatgtcggc 118  Q
    | || |||||||||||    
T  19869059 ccttgcacatgtcggc 19869044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 430 - 680
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  430 cagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 529  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  530 tgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 629  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  630 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcacaaca 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13464 - 13239
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||    
T  13464 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggt 13365  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||| | || |||||| ||| | |  |||||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  13364 aaaggagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 13265  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||||    
T  13264 tttctgaagagtattaaagaagcaca 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7426 - 7291
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7426 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 7327  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7326 aaatgagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11200 - 10974
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  11200 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 11101  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||    
T  11100 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaatagtga 11001  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  11000 tttcttgaatagtatcagagaagcaca 10974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27901783 - 27901533
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27901783 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 27901684  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || |||||  |||||||    
T  27901683 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtaaagttggg 27901584  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27901583 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtataagagaagcacaaca 27901533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 15002239 - 15002489
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15002239 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 15002338  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15002339 tgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctatagcagtttagagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15002438  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15002439 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaaca 15002489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 15357995 - 15358242
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15357995 cagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgt 15358094  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||| ||||| ||    
T  15358095 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggaatttgatttaatatagcagcttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcatagtgtacagttagg 15358194  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15358195 gatgctgaagattaatagtgacttcttgaatagtatccgagaagcaca 15358242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 29452412 - 29452656
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  29452412 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 29452511  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  29452512 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 29452611  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29452612 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 29452656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 15413922 - 15414148
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15413922 ttgaaagactatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 15414021  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  15414022 ttaaagaatttgagttgctggagcattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtga 15414121  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||||||||| | |||||||||    
T  15414122 gttcttgaatagtattaaagaagcaca 15414148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 3263669 - 3263913
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  3263669 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 3263768  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  3263769 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 3263868  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3263869 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 3263913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33224320 - 33224076
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  33224320 cagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 33224221  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| || || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  33224220 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagggacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 33224121  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33224120 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtacccgagaagc 33224076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16149107 - 16148873
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||    
T  16149107 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16149008  T
Q  107 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 206  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||     
T  16149007 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16148908  T
Q  207 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 241  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16148907 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16148873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16153253 - 16153019
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||    
T  16153253 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16153154  T
Q  107 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 206  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||     
T  16153153 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16153054  T
Q  207 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 241  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16153053 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16153019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15247297 - 15247074
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15247297 aaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaa 15247198  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||  |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  15247197 aagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacttcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgattt 15247098  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15247097 cttgaatagtatccgagaagcaca 15247074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15320512 - 15320317
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  15320512 ttgaaggattatgattttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatgg 15320413  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 222  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15320412 taaaggattttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatgttgaagatcaata 15320317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 11206107 - 11206350
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  11206107 agaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacttt 11206206  T
Q  107 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 206  Q
     |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||     
T  11206207 gcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttgggg 11206306  T
Q  207 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11206307 atgttgaagattgatagtgatttcttgaacagtatctgagaagc 11206350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15078918 - 15078785
Alignment:
Q  120 atgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatca 219  Q
    |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15078918 atgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatca 15078819  T
Q  220 ataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15078818 atagtgaattcttgaatagtatcagggaagcaca 15078785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8707296 - 8707088
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  8707296 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 8707197  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| | |||    
T  8707196 ttagagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtga 8707097  T
Q  227 attcttgaa 235  Q
     ||||||||    
T  8707096 gttcttgaa 8707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 16354079 - 16354251
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  16354079 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 16354178  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    ||| |  || || ||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  16354179 ggttagagagttcgagttacttaagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 16354251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14695489 - 14695266
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || ||||||     
T  14695489 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgt 14695390  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| ||  |  | ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  14695389 taaaagagtttgagttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 14695290  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  14695289 attcttgaacagtatcaaagaagc 14695266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15071737 - 15071602
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  15071737 tattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 15071638  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15071637 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagaga 15071602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Original strand, 15146521 - 15146672
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  15146521 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 15146620  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  15146621 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 15146672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8387788 - 8387688
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8387788 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8387689  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  8387688 t 8387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12477976 - 12477876
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  12477976 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 12477877  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  12477876 t 12477876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18298581 - 18298481
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  18298581 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 18298482  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  18298481 t 18298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 19777429 - 19777529
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19777429 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19777528  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  19777529 t 19777529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Original strand, 29038040 - 29038140
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29038040 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29038139  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  29038140 t 29038140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23957120 - 23956953
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  23957120 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 23957021  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23957020 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23956953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 257
Target Start/End: Original strand, 1648153 - 1648403
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||   ||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  1648153 agaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagacatt 1648252  T
Q  107 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 206  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||| |||||  | |||||||| |||| ||| || ||| |  | || ||     
T  1648253 gcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtttagtttgtgagttgtcacctcaaagtattaaatttggg 1648352  T
Q  207 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacag 257  Q
    ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1648353 atgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcaacag 1648403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 8052259 - 8052485
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8052259 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8052358  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  8052359 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 8052458  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  8052459 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 8052485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 51605667 - 51605821
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  51605667 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 51605766  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  51605767 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 51605821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14160867 - 14160710
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  14160867 cagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagacct 14160768  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||  | |||||||||||    
T  14160767 tgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgctagaataatttagagattt 14160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20892379 - 20892171
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  20892379 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 20892280  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  20892279 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 20892180  T
Q  206 catgttgaa 214  Q
     ||| ||||    
T  20892179 gatgctgaa 20892171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27712709 - 27712578
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  27712709 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 27712610  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  27712609 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 27712578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 44660738 - 44660985
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  || |    
T  44660738 agacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaagaaaa 44660837  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    | || || ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||    
T  44660838 ctttgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagtt 44660937  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||| |||||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  44660938 gggaatgttgaaaattgatagcgacttcttgaacagtatccgagaagc 44660985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12525051 - 12524918
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||||||    
T  12525051 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggt 12524952  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12524951 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12524918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 14850011 - 14850136
Alignment:
Q  36 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 135  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || || |    
T  14850011 tatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaaaagagt 14850110  T
Q  136 ttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  14850111 ttgagttgcttgagcagtttagagat 14850136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14681943 - 14681867
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 103  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14681943 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14681867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40474415 - 40474282
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  40474415 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 40474316  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
     || || || || || || || ||||||||||||    
T  40474315 caaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 40474282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 243
Target Start/End: Original strand, 14302614 - 14302830
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || |||||||    
T  14302614 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtccgctatgatgg 14302713  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14302714 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14302813  T
Q  227 attcttgaatagtatca 243  Q
    |||| |||| |||||||    
T  14302814 attcctgaaaagtatca 14302830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 18614436 - 18614596
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    |||||| | |||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  18614436 agacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaaga 18614535  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || ||||| ||  ||||||| |  || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  18614536 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattcagagattt 18614596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 214
Target Start/End: Original strand, 18226082 - 18226269
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  18226082 ttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtcagctttgatgg 18226181  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 214  Q
    | |   | ||||||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  18226182 ttagaaagtttgagttacttgaacggttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggaatgctgaa 18226269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 324132 - 323882
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  324132 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 324033  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  324032 tgcacatgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 323933  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  323932 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaagagtatccgagaagcacaaca 323882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 202367 - 202575
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  202367 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 202466  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  202467 ttaaagagtttgagttgcttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 202566  T
Q  227 attcttgaa 235  Q
     ||||||||    
T  202567 gttcttgaa 202575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 118633 - 118477
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| |  ||||||     
T  118633 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatga 118534  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 183  Q
    | || || || ||| | ||||| ||||||||||| || ||  || ||||||||||||    
T  118533 tcaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagttttatttgtgaattgt 118477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5858 - 5610
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  5858 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgt 5759  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5758 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 5659  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaa 254  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5658 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaa 5610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 111 - 370
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  111 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 210  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  211 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtgcagttggg 310  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgt 265  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  311 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1992
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1732 cagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 1831  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||  |||||||    
T  1832 tgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagttggg 1931  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1932 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29485 - 29225
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  29485 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 29386  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  29385 tgcacatgtctgctatgatggtaaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 29286  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  29285 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaataatatcagagaagcacagcaagttgatgtc 29225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30346 - 30216
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  30346 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaagg 30247  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || |||||  | || ||||| ||||||||    
T  30246 agttcgagttggttgaacagttcagagattt 30216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 50238 - 50168
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgt 76  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  50238 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27931 - 27708
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  27931 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatgg 27832  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  27831 taaaagagtttgagctacttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 27732  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  27731 tttcttgaacagtatcagagaagc 27708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 46277 - 46524
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  46277 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaacgt 46376  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  46377 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgatccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 46476  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46477 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 46524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 41211 - 41455
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  41211 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 41310  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  41311 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 41410  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  41411 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 41455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3098
Alignment:
Q  34 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 133  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||    
T  3314 attatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaaga 3215  T
Q  134 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttg 233  Q
     |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||||||||     
T  3214 gtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattctta 3115  T
Q  234 aatagtatcagagaagc 250  Q
    |||||||||| ||||||    
T  3114 aatagtatcaaagaagc 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28645 - 28395
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  28645 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 28546  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  28545 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 28446  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28445 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaaca 28395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34898 - 34648
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  34898 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 34799  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  34798 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 34699  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34698 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaaca 34648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Original strand, 95 - 172
Alignment:
Q  65 taaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagtt 142  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagtt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Original strand, 24755 - 25001
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24755 agagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgtt 24854  T
Q  107 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 206  Q
     || ||||  ||  |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||     
T  24855 gcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagcagtttagagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgtacagttgggg 24954  T
Q  207 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24955 atgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 25001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13628 - 13379
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13628 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 13529  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||    
T  13528 tgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacaccttagagtgtacagttggg 13429  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 255  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13428 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 47912 - 48172
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  47912 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgt 48011  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  48012 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgttagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtatagttggg 48111  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  48112 tatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaacattatcagagaagcacagcaagttgatgtc 48172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 56725 - 56975
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||     
T  56725 cagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagacgc 56824  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || ||||||||  |||||  ||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  56825 tgcacatgtctgctatgatggtataggaacatgatttgctagaacagtttagagagttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 56924  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  56925 aatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaaca 56975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41102 - 40879
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  41102 aaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaa 41003  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  41002 aagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 40903  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  40902 cttgaatagtatccgagaagcaca 40879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 89323 - 89570
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  89323 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 89422  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  89423 tgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 89522  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  89523 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 89570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 90001 - 90248
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  90001 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 90100  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  90101 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 90200  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  90201 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 90248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15290
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  15540 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggt 15441  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15440 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15341  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 149997 - 149749
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  149997 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 149899  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |  | ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  149898 tgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 149799  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 255  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  149798 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 149749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 194582 - 194832
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||    
T  194582 cagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagacgt 194681  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | || || |||||||| ||||||  ||| | |||||| ||||||||    
T  194682 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagtagtttagatacttgagtcttgtttgcgaattgacacctctgagtgtacagttggg 194781  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  194782 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacaaca 194832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25568
Alignment:
Q  34 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  25439 attatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaaga 25538  T
Q  134 atttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||    
T  25539 gtttgagttgcttgaacagtttagagattt 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5204 - 4944
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  5204 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgt 5105  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||| |    
T  5104 tgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctggagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagttgag 5005  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5004 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 4944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48272
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  48508 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 48409  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  48408 aggattttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 48309  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48308 cttgagtagtatcagagaagcacatcaggttgatgtc 48272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44211 - 43967
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |    
T  44211 cagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacat 44112  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  44111 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 44012  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44011 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 43967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 182
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  429 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgt 330  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||| ||    
T  329 tgcatatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagtttgg 230  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  229 gatgttgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaagcaca 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6154 - 5918
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||  |  |||||||| |    
T  6154 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaa 6055  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  6054 aggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 5955  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5954 cttgaatagtatccgagaagcacaacaagttgatgtc 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 10935 - 11179
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10935 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 11034  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  11035 tgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 11134  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  11135 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagc 11179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 14705 - 14949
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14705 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 14804  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  14805 tgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 14904  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  14905 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagc 14949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21411 - 21164
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||||| || ||  || ||||  |||| |  | |||||    
T  21411 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacgtggtgtcaaatgcgatgagcaagaggacgt 21312  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  21311 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgctagagccatttagagaattgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 21212  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21211 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 21164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42345 - 42101
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  42345 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 42246  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  42245 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 42146  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42145 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 42101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 50753 - 51013
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || || ||||    
T  50753 cagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgt 50852  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||     
T  50853 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggc 50952  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  50953 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattagagaagcacatcaagttgatgtc 51013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 250041 - 249797
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  250041 cagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 249942  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| |    
T  249941 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgcg 249842  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  249841 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagcatccgagaagc 249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 146
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  385 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 286  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||||| |||| ||| || ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  285 taaaggagtttgtgttgcttgaatagttcagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 186  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  185 tttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2769
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| || |||| ||    
T  3016 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagatgt 2917  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  2916 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 2817  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2816 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 243
Target Start/End: Original strand, 5988 - 6206
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgta--gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  5988 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 6087  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 224  Q
    ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  6088 ggtaaaggagttggagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 6187  T
Q  225 gaattcttgaatagtatca 243  Q
    || |||||||| |||||||    
T  6188 gatttcttgaacagtatca 6206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 251
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6361
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  6116 cagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 6215  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||| ||||||||    
T  6216 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttagagcagtttagagacttaagccttgtatgtgaattgacacctctgagtgtacagttggg 6315  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 251  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6316 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagca 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 2230 - 2483
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  2230 agacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtaggaaaa 2329  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    |||| || |||||  | |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||    
T  2330 cgttgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaatttagagacttgagtcttgtgtgtgagttgacacctcagagtgttcagtt 2429  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
    ||| ||| |||| || || | ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  2430 ggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaaca 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8488 - 8244
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  8488 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgt 8389  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || |||||  |  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8388 tgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8289  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  8288 gatgctgaagattaacagtgacttcttgaatagtattcgagaagc 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1273 - 1037
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  1273 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactatgatggtaa 1174  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    |||| |||||||| || ||  |||  ||||| || || ||||||||||| ||||  ||  ||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  1173 aggagtttgagtttctagaatagtaaagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgccttagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtgattt 1074  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1073 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32839 - 32589
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||| || || ||||    
T  32839 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgt 32740  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || | || |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  32739 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 32640  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  32639 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcaaca 32589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20822 - 20578
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |    
T  20822 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacat 20723  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20722 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 20623  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20622 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 20578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23642 - 23398
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |    
T  23642 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacat 23543  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23542 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23443  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23442 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 100440 - 100684
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  100440 cagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacat 100539  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  |||  ||||| | || |||||    
T  100540 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacaccttagagtattcaattggg 100639  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  100640 gatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 100684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181436
Alignment:
Q  78 gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtg 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  178 aattgttaccccagagtgtg 197  Q
    ||| || | | |||||||||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtg 181436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 2363 - 2610
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  2363 cagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 2462  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | |||  ||||||| ||||||||    
T  2463 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttctcaccttagagtgtacagttggg 2562  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||| || |||  | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2563 tatgttgaagattaattgtaatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 851 - 1098
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| || || || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||    
T  851 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgt 950  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||| ||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  951 tgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagttggg 1050  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1051 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28052 - 27806
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||| |||||    
T  28052 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagcagaa-gacgt 27954  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |  | ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || |||||||| || |||| |||  ||||||| ||||||||    
T  27953 tggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagacttgagtcttgtttgcgagttgtcaccttagagtgtacagttggg 27854  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27853 tatgttgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 27806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 51058 - 51308
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  51058 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 51157  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  51158 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 51257  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  51258 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaaca 51308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 60092 - 60342
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  60092 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 60191  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  60192 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 60291  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  60292 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaaca 60342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 66480 - 66730
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  66480 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 66579  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  66580 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 66679  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  66680 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaaca 66730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 566 - 814
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  566 cagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatc-gggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgt 664  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  665 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagactgtacagttggg 764  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  765 gatgatgaagattaat-gtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaaca 814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3580 - 3357
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  3580 aaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctattatggtaa 3481  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||| |||  |||||||  ||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  3480 aggagtttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 3381  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  3380 cttgaacagtatcagagaagcaca 3357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 13177 - 13427
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  13177 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 13276  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||  ||  | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  13277 tgcatatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacaatttagagacttgagccttgtctgtgaattgacaccttagagtgttcagttggg 13376  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| ||||||| || | | | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13377 gatgctgaaaattaaaagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaaca 13427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11911
Alignment:
Q  48 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 147  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |  ||||||| || |||||||| || || |    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  148 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagaga 247  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgaga 11920  T
Q  248 agcacaaca 256  Q
    ||| |||||    
T  11919 agcgcaaca 11911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16448
Alignment:
Q  82 cagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  182 gttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    || | | || |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtctcagagaagcacaacaagttgatgtc 16448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 10335 - 10579
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||     
T  10335 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 10434  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || |||||    
T  10435 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 10534  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  10535 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 10579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 20549 - 20793
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||     
T  20549 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 20648  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || |||||    
T  20649 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 20748  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  20749 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 20793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 266
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6468
Alignment:
Q  62 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 6363  T
Q  162 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttg 261  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  6364 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 6463  T
Q  262 atgtc 266  Q
    |||||    
T  6464 atgtc 6468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 266
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10899
Alignment:
Q  62 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 10794  T
Q  162 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacagtttg 261  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  10795 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 10894  T
Q  262 atgtc 266  Q
    |||||    
T  10895 atgtc 10899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 253
Target Start/End: Original strand, 1 - 187
Alignment:
Q  67 aagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 166  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | |     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  167 ccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcaca 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Original strand, 9707 - 9933
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  |||| || |||||||    
T  9707 ttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatgg 9806  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  9807 ttaaagaatttgagttgcttgagcagtttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 9906  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||    
T  9907 gttcttggatagtattagagaagcaca 9933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20548 - 20298
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  20548 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacat 20449  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  20448 tgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactagaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 20349  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  20348 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaaca 20298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Original strand, 58093 - 58146
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 83  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  58093 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 243
Target Start/End: Original strand, 18114 - 18330
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  18114 ttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 18213  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  18214 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 18313  T
Q  227 attcttgaatagtatca 243  Q
    |||||||||||||||||    
T  18314 attcttgaatagtatca 18330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 16876 - 17084
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||    
T  16876 ttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgg 16975  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  |||||||    
T  16976 tcaaggaatttgagttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatga 17075  T
Q  227 attcttgaa 235  Q
    |||||||||    
T  17076 attcttgaa 17084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 4330 - 4574
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  4330 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 4429  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  4430 tacatatgtctgcattgatggtaaaagaatttgatttactagaatagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 4529  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||||    
T  4530 gatgctgagaattaatagtgatttcttgaataatattcgagaagc 4574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4177 - 3932
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||    
T  4177 cagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgt 4078  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||  | || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||    
T  4077 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcaga--gtacagttggg 3980  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  3979 aatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcaca 3932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 43012 - 43199
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| || |    
T  43012 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggttaaag 43111  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 220  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| | | ||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  43112 agttggagtttcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtatcaccacaaagtgtgaaattgggaatgttgaagatcaa 43199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 516
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 102  Q
    ||||||||||||||  | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  755 agacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaaga 656  T
Q  103 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    | ||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||    
T  655 ccttacatatgtctgcgttgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagtt 556  T
Q  203 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 242  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  555 ggggatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatc 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 7023 - 7267
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  7023 cagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 7122  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | ||||| |  ||||| || || || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  7123 tgcatatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 7222  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     |||||||| || || | | | || |||||||||||| |||||||    
T  7223 gatgttgaagattaacagtaattttttgaatagtatccgagaagc 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 12405 - 12613
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  12405 cagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgc 12504  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  12505 tgcatatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 12604  T
Q  206 catgttgaa 214  Q
     ||| ||||    
T  12605 gatgctgaa 12613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Original strand, 31652 - 31788
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  31652 ttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 31751  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  31752 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 31788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Original strand, 79391 - 79563
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  79391 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatgat 79490  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    ||| |  || || |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  79491 ggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 79563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 109058 - 108859
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||    
T  109058 cagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacgt 108959  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  108958 tgcacatgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagcgtacagttggg 108859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Original strand, 62930 - 63081
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  62930 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 63029  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
    | || |  || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  63030 ttaaagtgttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 63081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 218316 - 218539
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  218316 ttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatgg 218415  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | || |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||    
T  218416 taaaagagtttgagttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtga 218515  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||    
T  218516 attcttgaacaatatcaaagaagc 218539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Original strand, 3150 - 3387
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  3150 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 3249  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  3250 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 3349  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatca 243  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3350 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15604
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  15379 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 15478  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 224  Q
    ||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| ||  | ||||| || ||||  || ||||||||| ||||||| ||| | |  ||  ||| |    
T  15479 ggtaaaagagtttgagttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgctaaggattgatagt 15578  T
Q  225 gaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15579 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 15604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Original strand, 30163 - 30400
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| | ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  30163 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 30262  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  30263 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 30362  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatca 243  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  30363 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 30400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Original strand, 32198 - 32438
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  32198 agagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacatt 32297  T
Q  107 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 206  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | ||  ||| |||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||     
T  32298 acatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaatagtctagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggg 32397  T
Q  207 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagaga 247  Q
    ||||||   || |||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  32398 atgttgcggattaatagtgatttcttgaacagtatccgaga 32438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45945 - 45701
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||      
T  45945 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagaccc 45846  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  45845 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 45746  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     ||| |||| || || | | | ||||||||||||||| |||||||    
T  45745 aatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 45701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 19241 - 19340
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19241 tgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 19340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21315 - 21138
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21315 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 21216  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 183  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  ||||||||  | || || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  21215 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatcttctagaacagtttagagacttgagccttgtttctgagttgt 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Original strand, 177161 - 177385
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  177161 ttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgctatgatgg 177260  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || ||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  177261 ttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtga 177360  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagca 251  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||    
T  177361 attcttgaacagtattaaagaagca 177385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35540 - 35422
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  35540 agagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgtt 35441  T
Q  107 acacatgtcggccatgatg 125  Q
     |||||||| || ||||||    
T  35440 gcacatgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28527 - 28403
Alignment:
Q  132 gaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattct 231  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||||    
T  28527 gaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttct 28428  T
Q  232 tgaatagtatcagagaagcacaaca 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  28427 tgaatagtatccgagaagcacaaca 28403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17061 - 16925
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  17061 ttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 16962  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  16961 taaaagagtttgaattattggaacagtttagagattt 16925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18753 - 18517
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  18753 aaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagacatttcacatctctgctatgatggtaa 18654  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
    | || |||||||| || ||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||  || ||||| |||||||| ||| ||||  | |||| ||| ||    
T  18653 aagagtttgagttgctagaatattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagttgggtatgctgaaggttaatagtgattt 18554  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagcacaacagtttgatgtc 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  18553 cttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 18517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 15591 - 15835
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  15591 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagactt 15690  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| |  |||||||    
T  15691 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatatagttggg 15790  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15791 aaggttgaaaattgataatgacttcttgaatagtatccgagaagc 15835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10844 - 10621
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||   |||||  | ||||| || || ||||| || |||||||    
T  10844 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 10745  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  10744 ttaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtga 10645  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  10644 attcttgaacagtattaaagaagc 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 39685 - 39885
Alignment:
Q  54 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagt 153  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  39685 tatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaat 39784  T
Q  154 ttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||  || |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39785 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatcaaagaagcaca 39884  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  39885 a 39885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16284 - 16148
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16284 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16185  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||||||||||||    
T  16184 ttaaggagtttgagctgcttgaacagtttagagattt 16148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 163
Target Start/End: Original strand, 112396 - 112523
Alignment:
Q  36 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 135  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || || |    
T  112396 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagt 112495  T
Q  136 ttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | |||||  | || ||||||||||||||    
T  112496 tcgagttgttggaacagtttagagattt 112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13875 - 13652
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||    
T  13875 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatgg 13776  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || | || ||| | || ||| ||| |||    
T  13775 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtga 13676  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  13675 attcttgaacagtatcaaagaagc 13652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10376 - 10240
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10376 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 10277  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | ||||| || ||||| || || || |||||||||||    
T  10276 ttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagattt 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 163
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7688
Alignment:
Q  36 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 135  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  7561 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 7660  T
Q  136 ttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7661 tcgagttgcttgaacagttcagagattt 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Original strand, 29470 - 29621
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  29470 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 29569  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  29570 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 29621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 23084 - 23307
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||  | |||||||    
T  23084 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatgg 23183  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || || ||| | |||||  |||||||| | || ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  23184 ttaaagagttggagctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 23283  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||| || |||||||| | ||||||    
T  23284 attttttaatagtattaaagaagc 23307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8804 - 8670
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8804 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8705  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
    |||  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  8704 tgagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 8670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 102640 - 102470
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  102640 ttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatgg 102541  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | || || || ||||| || || ||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | | |||||||||    
T  102540 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtg 102470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5420 - 5215
Alignment:
Q  45 gggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttac 144  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| |    
T  5420 gggttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgc 5321  T
Q  145 tcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcag 244  Q
    | || |||||||| ||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |||||||||||| |||||||     
T  5320 ttgaacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaa 5221  T
Q  245 agaagc 250  Q
    ||||||    
T  5220 agaagc 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5280 - 5091
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  5280 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 5181  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 214  Q
    ||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  5180 ggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12410 - 12221
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  12410 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 12311  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 214  Q
    ||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  12310 ggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Original strand, 5241 - 5458
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||   ||||||    |    
T  5241 gattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagaccttacatatgtctgcgtagatggtatgag 5340  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 232  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || || | | | |||||    
T  5341 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaacagtaatttctt 5440  T
Q  233 gaatagtatcagagaagc 250  Q
    |||||||||| |||||||    
T  5441 gaatagtatccgagaagc 5458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7421 - 7270
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||    
T  7421 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacattgcatatgtcctctatgatgg 7322  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
    | |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  7321 ttagagagttcgagttacttgatcagtttagagatatgagcttagtttgtga 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3431
Alignment:
Q  34 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 133  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  3594 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaaga 3495  T
Q  134 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
     || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | | |||||||||    
T  3494 gttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtg 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7643
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7778 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7679  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7678 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7455 - 7356
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7455 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Original strand, 3534 - 3620
Alignment:
Q  53 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 139  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3534 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttga 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 14111 - 14246
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | || ||||| || ||||||||    
T  14111 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggt 14210  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  14211 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 37
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  172 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 73  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  72 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2675 - 2540
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  2675 tgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 2576  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  2575 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 2540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 25845 - 25979
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  25845 tgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 25943  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || || || |||||  | || ||||||||||||||    
T  25944 aaaagagttcgagttgttggaacagtttagagattt 25979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28361 - 28150
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| || || || |    
T  28361 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaacat 28262  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  28261 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttagaaaagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 28162  T
Q  206 catgttgaaaat 217  Q
     ||| |||||||    
T  28161 gatgctgaaaat 28150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Original strand, 277727 - 277862
Alignment:
Q  25 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  277727 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 277826  T
Q  125 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    ||| |  || || |||||||| || |||||||||||    
T  277827 ggttagagagttcgagttacttgaacagtttagaga 277862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 261735 - 261491
Alignment:
Q  7 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 106  Q
    ||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  |    
T  261735 agaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacact 261636  T
Q  107 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 206  Q
     || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | |||||||||    
T  261635 gcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttgggc 261536  T
Q  207 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 251  Q
    ||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  261535 atgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagca 261491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50838 - 50688
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  50838 tgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggt 50739  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  50738 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcaaagatttgagcttagtttgtga 50688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20008 - 19783
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  20008 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19909  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  19908 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 19809  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  19808 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 19783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35432 - 35207
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  35432 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 35333  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  35332 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 35233  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  35232 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 35207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 142
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  390 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 291  T
Q  106 ----tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagt 201  Q
        || | ||||| ||  |||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||    
T  290 tgcatatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgctataacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagt 191  T
Q  202 tgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    |||| ||| |||| ||  ||  ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  190 tggggatgctgaagatttattgtgatttcttgaacagtatccgagaagc 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 7231 - 7366
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||  |||| || ||||||||    
T  7231 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggt 7330  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7331 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26230
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  26381 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 26282  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
    | |  || || ||||||||  | |||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  26281 ttagagagttcgagttactttatcagtttagagatatgagttttgtttgtga 26230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Original strand, 80710 - 80957
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||      
T  80710 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacac 80809  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || || ||  |  |||||||    
T  80810 tacatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtagcctcaaagaataaagttggg 80909  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  80910 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcaca 80957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2315 - 2089
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||    
T  2315 ttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatgg 2216  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | ||  | || ||| | | ||| |||||||  ||  | ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  2215 ttaaaaagttggagctgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtga 2116  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  2115 atttttgaacagtattaaagaagcaca 2089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8346 - 8120
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8346 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8247  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  8246 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 8147  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  8146 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 8120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 14178 - 14331
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14178 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14276  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  14277 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 14331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 22357 - 22510
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22357 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 22455  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  22456 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 22510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 23978 - 24179
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||       ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23978 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 24070  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||  |||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  24071 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 24170  T
Q  227 attcttgaa 235  Q
     ||||||||    
T  24171 gttcttgaa 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8772 - 8639
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  8772 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8673  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
     |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  8672 cagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 8639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 7995 - 8156
Alignment:
Q  36 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 135  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| |  || |    
T  7995 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagt 8094  T
Q  136 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
    | |||||  | || |||||||||||||| ||  | || |||||||||| | | |||||||||    
T  8095 tcgagttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtg 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 38853 - 38982
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||    
T  38853 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaagg 38952  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagatt 162  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||    
T  38953 agttcgagttgcttgaacagttcagagatt 38982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 253
Target Start/End: Original strand, 4253 - 4478
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||  |||||||    
T  4253 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggt 4352  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 227  Q
     |  || || ||||| ||  | |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  4353 tagagagttcgagttgcttaaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaa 4452  T
Q  228 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    ||  | || ||||||| |||||||||    
T  4453 tttctaaagagtatcaaagaagcaca 4478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Original strand, 966 - 1102
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  966 ttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 1065  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || || || ||  |||| ||||||||||||||    
T  1066 taaaagagttcgaattgttcgaacagtttagagattt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4519 - 4383
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4519 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 4420  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | ||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  4419 ttaaggagtttgagtttcttgaacaatttagggattt 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6641 - 6394
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  6641 cagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 6542  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 205  Q
    | || ||||  || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || |||||  | ||||||||    
T  6541 ttcatatgtatgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcagagcatacagttggg 6442  T
Q  206 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 253  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6441 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcaca 6394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 2299 - 2200
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  2299 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24874 - 24723
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||  ||||||    
T  24874 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatgg 24775  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 178  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  24774 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 9915 - 10138
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  9915 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 10014  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || ||||| ||| | || || |||||| ||||||| ||  | || |||||| ||| |||| |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  10015 tcaaagaattggagctgcttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 10114  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    |||  |||||||||| | ||||||    
T  10115 atttctgaatagtattaaagaagc 10138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 96592 - 96438
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||      
T  96592 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 96493  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  96492 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagaga 96438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1824 - 1655
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  1824 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 1725  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  1724 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15564 - 15395
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  15564 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 15465  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 197  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15464 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 85421 - 85641
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  85421 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 85520  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 229  Q
      || |||||||| || || ||||||||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | || || |||||||| |||||  |||||||    
T  85521 gagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgtgaaattaggaatgttgaagatcaacgatgaatt 85620  T
Q  230 cttgaatagtatcagagaagc 250  Q
     || || | ||||| ||||||    
T  85621 ttttaacactatcaaagaagc 85641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 250
Target Start/End: Original strand, 6790 - 7013
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||     
T  6790 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatga 6889  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 226  Q
    | || || || ||| | || || ||||||||||| || ||| | || || ||| ||| |||  |||||||| |||| || ||| |||| ||   || |||    
T  6890 tcaaagagttggagctgcttgaacagtttagagacttgagcttagtctgcgaagtgtcaccttagagtgtgaagttaggaatgatgaagattgttagtga 6989  T
Q  227 attcttgaatagtatcagagaagc 250  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  6990 attcttgaacagtattaaagaagc 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 115
Target Start/End: Original strand, 32473 - 32560
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 115  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  32473 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38853
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  38720 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 38819  T
Q  128 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 161  Q
     |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  38820 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 66836 - 66745
Alignment:
Q  3 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 94  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  66836 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgag 66745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Original strand, 1712 - 1800
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 94  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1712 cagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgag 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 103
Target Start/End: Original strand, 12900 - 12967
Alignment:
Q  36 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 103  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12900 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 28268 - 28367
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  28268 tgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 28367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3491
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||  | |||||||    
T  3355 ttgaaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatgg 3454  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  3455 ttaaagagttttaattgcttgaacagtttagagattt 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131377
Alignment:
Q  63 ggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatt 162  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 131378  T
Q  163 t 163  Q
    |    
T  131377 t 131377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39958 - 39828
Alignment:
Q  33 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |  ||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  39958 gattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 39859  T
Q  133 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 163  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  39858 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 39828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6602 - 6492
Alignment:
Q  53 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcag 152  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || |||    
T  6602 ctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacag 6503  T
Q  153 tttagagattt 163  Q
    || ||||||||    
T  6502 ttcagagattt 6492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 18967 - 19033
Alignment:
Q  28 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 94  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18967 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 19033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 196377 - 196453
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 103  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  196377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagac 196453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 23972 - 24048
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 103  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  23972 ttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 11664 - 11818
Alignment:
Q  6 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 105  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  11664 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 11763  T
Q  106 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 160  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||  | || || |||||||||||    
T  11764 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatatgctggaacagtttagaga 11818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 202
Target Start/End: Original strand, 115804 - 115979
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 126  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  115804 ttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 115903  T
Q  127 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 202  Q
    | || ||  | ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  115904 tcaaagagctggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagtt 115979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 97
Target Start/End: Original strand, 13980 - 14050
Alignment:
Q  27 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 97  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  13980 ttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtag 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 343
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 88  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  401 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16591
Alignment:
Q  30 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 129  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16466 aaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16565  T
Q  130 aggaatttgagttactcgagcagttt 155  Q
    | || ||||||||  | |||||||||    
T  16566 aagagtttgagttgattgagcagttt 16591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University