View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7453_low_2 (Length: 501)

Name: NF7453_low_2
Description: NF7453
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7453_low_2
NF7453_low_2
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (34-301)||(45450696-45450963)
chr7 (368-482)||(1803029-1803143)
chr7 (365-482)||(30181103-30181220)
chr7 (365-482)||(33846603-33846720)
chr7 (360-482)||(42965075-42965197)
chr7 (365-482)||(12101257-12101374)
chr7 (365-482)||(20346488-20346605)
chr7 (365-482)||(33359169-33359286)
chr7 (362-482)||(7164181-7164301)
chr7 (360-482)||(43068052-43068174)
chr7 (365-482)||(22649773-22649890)
chr7 (365-482)||(24792411-24792528)
chr7 (366-482)||(3511324-3511440)
chr7 (370-482)||(43156718-43156830)
chr7 (367-482)||(4477400-4477515)
chr7 (357-482)||(6394743-6394868)
chr7 (365-482)||(32041542-32041659)
chr7 (354-482)||(15655901-15656029)
chr7 (360-482)||(42204149-42204272)
chr7 (360-482)||(4347268-4347390)
chr7 (366-482)||(5280861-5280977)
chr7 (358-482)||(36890909-36891032)
chr7 (360-482)||(933280-933402)
chr7 (360-482)||(19828265-19828387)
chr7 (365-482)||(8630666-8630783)
chr7 (365-482)||(25748487-25748604)
chr7 (356-460)||(37704971-37705075)
chr7 (365-482)||(12097669-12097786)
chr7 (366-477)||(9452591-9452702)
chr7 (363-482)||(17753598-17753717)
chr7 (368-482)||(38866547-38866661)
chr7 (367-482)||(42673467-42673578)
chr7 (357-482)||(46891418-46891544)
chr7 (358-482)||(43021655-43021779)
chr7 (364-477)||(46134388-46134501)
chr7 (360-482)||(16894586-16894698)
chr7 (360-474)||(43405015-43405129)
chr7 (367-482)||(37005890-37006005)
chr7 (400-482)||(48865665-48865750)
chr7 (370-454)||(27691433-27691517)
chr7 (368-482)||(15655491-15655605)
chr7 (370-482)||(20163824-20163936)
chr7 (365-482)||(36849616-36849733)
chr7 (365-460)||(30075330-30075424)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (360-482)||(9008146-9008268)
chr5 (358-482)||(24105760-24105884)
chr5 (365-482)||(27679258-27679375)
chr5 (358-480)||(33491287-33491409)
chr5 (360-482)||(35782733-35782855)
chr5 (365-482)||(1579038-1579155)
chr5 (365-482)||(1605660-1605777)
chr5 (360-482)||(27420855-27420977)
chr5 (369-482)||(3386575-3386688)
chr5 (357-482)||(16069347-16069472)
chr5 (368-482)||(16737536-16737650)
chr5 (360-482)||(19358523-19358645)
chr5 (365-482)||(8374427-8374544)
chr5 (360-482)||(20992370-20992496)
chr5 (370-482)||(1165690-1165802)
chr5 (367-482)||(31883148-31883263)
chr5 (360-482)||(20992235-20992357)
chr5 (365-482)||(4120939-4121056)
chr5 (365-482)||(5202974-5203091)
chr5 (365-482)||(33991142-33991259)
chr5 (366-482)||(3921584-3921700)
chr5 (369-482)||(38598539-38598652)
chr5 (371-482)||(33284664-33284775)
chr5 (365-482)||(26603031-26603138)
chr5 (368-482)||(31410481-31410595)
chr5 (408-482)||(27025001-27025075)
chr5 (437-482)||(41818552-41818597)
chr5 (375-482)||(31638157-31638264)
chr5 (365-482)||(25634584-25634699)
chr5 (213-257)||(4742132-4742176)
chr5 (213-257)||(4751396-4751440)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (365-482)||(18594538-18594655)
chr8 (365-482)||(39206587-39206704)
chr8 (365-482)||(14422704-14422821)
chr8 (365-482)||(34842454-34842571)
chr8 (365-482)||(35118120-35118237)
chr8 (360-482)||(40117941-40118063)
chr8 (365-482)||(29938062-29938179)
chr8 (366-482)||(13110406-13110522)
chr8 (358-482)||(26783822-26783946)
chr8 (368-482)||(2042613-2042727)
chr8 (366-482)||(8021721-8021837)
chr8 (368-482)||(10836844-10836958)
chr8 (365-482)||(24113255-24113372)
chr8 (365-482)||(39218778-39218895)
chr8 (362-482)||(7791409-7791529)
chr8 (367-482)||(41575516-41575631)
chr8 (360-482)||(6144362-6144484)
chr8 (365-482)||(22260719-22260836)
chr8 (369-482)||(34679546-34679659)
chr8 (358-482)||(144388-144512)
chr8 (368-482)||(7774768-7774882)
chr8 (368-482)||(42571598-42571711)
chr8 (365-482)||(33287114-33287231)
chr8 (366-482)||(34998985-34999101)
chr8 (360-482)||(4035843-4035965)
chr8 (365-482)||(5320565-5320682)
chr8 (369-482)||(38167244-38167357)
chr8 (370-482)||(44805033-44805145)
chr8 (365-482)||(7811996-7812113)
chr8 (365-482)||(33278401-33278518)
chr8 (365-473)||(36491158-36491266)
chr8 (367-482)||(66269-66384)
chr8 (366-482)||(28639280-28639400)
chr8 (360-482)||(2322101-2322223)
chr8 (369-482)||(5005171-5005284)
chr8 (360-451)||(9806869-9806960)
chr8 (366-479)||(39220258-39220371)
chr8 (443-482)||(9807339-9807378)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (365-482)||(23776536-23776653)
chr4 (362-482)||(54412624-54412744)
chr4 (358-482)||(14987784-14987908)
chr4 (366-482)||(20877047-20877163)
chr4 (356-482)||(30423641-30423767)
chr4 (365-482)||(19913707-19913824)
chr4 (365-482)||(54189544-54189661)
chr4 (362-482)||(1756841-1756961)
chr4 (367-482)||(16700782-16700897)
chr4 (360-482)||(50353795-50353917)
chr4 (365-482)||(6611437-6611554)
chr4 (365-482)||(27488725-27488842)
chr4 (365-482)||(38055156-38055273)
chr4 (365-482)||(40428797-40428914)
chr4 (365-482)||(50055178-50055295)
chr4 (365-482)||(53717541-53717658)
chr4 (365-482)||(2481485-2481602)
chr4 (365-482)||(11639655-11639772)
chr4 (369-482)||(28032789-28032902)
chr4 (365-482)||(44784994-44785111)
chr4 (357-482)||(45424611-45424736)
chr4 (369-482)||(48909849-48909962)
chr4 (365-482)||(50053442-50053559)
chr4 (367-482)||(19165048-19165164)
chr4 (367-482)||(53875658-53875773)
chr4 (360-482)||(8932255-8932377)
chr4 (368-482)||(15241105-15241219)
chr4 (356-482)||(37464711-37464837)
chr4 (365-482)||(15669182-15669299)
chr4 (369-482)||(28360433-28360546)
chr4 (365-482)||(37968834-37968951)
chr4 (365-469)||(6688711-6688815)
chr4 (367-482)||(43290037-43290152)
chr4 (366-480)||(1617084-1617198)
chr4 (360-482)||(23704286-23704408)
chr4 (359-482)||(53353048-53353175)
chr4 (366-482)||(31969681-31969797)
chr4 (366-482)||(35490850-35490966)
chr4 (366-482)||(52139203-52139319)
chr4 (375-482)||(38071397-38071504)
chr4 (365-482)||(47632033-47632151)
chr4 (366-482)||(8591169-8591285)
chr4 (370-482)||(40680115-40680227)
chr4 (367-482)||(30171581-30171696)
chr4 (370-482)||(27583709-27583821)
chr4 (369-482)||(44379264-44379377)
chr4 (365-482)||(27536181-27536294)
chr4 (375-482)||(33703850-33703957)
chr4 (365-464)||(55344920-55345019)
chr4 (364-482)||(44375843-44375961)
chr4 (366-451)||(23265865-23265950)
chr4 (388-482)||(16703843-16703937)
chr4 (358-462)||(44548238-44548343)
chr4 (443-482)||(23269123-23269162)
chr4 (365-419)||(9595975-9596028)
chr4 (433-482)||(51780795-51780844)
chr4 (373-482)||(17493340-17493449)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (365-482)||(37698218-37698335)
chr3 (359-482)||(42307980-42308103)
chr3 (365-482)||(25999384-25999501)
chr3 (363-482)||(38856087-38856206)
chr3 (360-482)||(15520217-15520339)
chr3 (369-482)||(21581042-21581155)
chr3 (365-482)||(22175065-22175182)
chr3 (365-482)||(50528925-50529042)
chr3 (358-482)||(20842423-20842547)
chr3 (356-482)||(25494360-25494486)
chr3 (365-482)||(20699145-20699262)
chr3 (365-482)||(29445484-29445601)
chr3 (365-482)||(38933942-38934058)
chr3 (369-482)||(50529848-50529961)
chr3 (365-482)||(54534402-54534518)
chr3 (365-482)||(54870249-54870366)
chr3 (366-482)||(32244117-32244233)
chr3 (360-482)||(8042598-8042720)
chr3 (360-482)||(12117733-12117855)
chr3 (365-482)||(15520632-15520749)
chr3 (369-482)||(26122814-26122927)
chr3 (365-482)||(35643213-35643330)
chr3 (365-482)||(46452237-46452354)
chr3 (362-482)||(44609408-44609528)
chr3 (365-482)||(34700337-34700454)
chr3 (369-482)||(35226447-35226560)
chr3 (362-482)||(42105046-42105166)
chr3 (365-482)||(2895181-2895298)
chr3 (365-482)||(24835774-24835891)
chr3 (366-482)||(32359256-32359372)
chr3 (360-482)||(49128040-49128162)
chr3 (365-482)||(44688762-44688874)
chr3 (369-482)||(48925078-48925189)
chr3 (369-482)||(53028225-53028330)
chr3 (402-479)||(16354379-16354456)
chr3 (392-482)||(12915930-12916019)
chr3 (358-419)||(24366081-24366142)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (368-482)||(30691855-30691969)
chr6 (365-482)||(6086688-6086805)
chr6 (365-482)||(26946965-26947082)
chr6 (358-482)||(3955855-3955979)
chr6 (365-479)||(2837546-2837660)
chr6 (360-482)||(3347612-3347734)
chr6 (356-482)||(26704428-26704554)
chr6 (365-482)||(52837-52954)
chr6 (365-482)||(9459564-9459681)
chr6 (366-482)||(17261162-17261278)
chr6 (367-482)||(34887381-34887496)
chr6 (360-482)||(18613534-18613656)
chr6 (365-482)||(21893456-21893573)
chr6 (365-482)||(35198285-35198401)
chr6 (365-482)||(16307097-16307214)
chr6 (365-482)||(20726792-20726905)
chr6 (365-482)||(11167241-11167358)
chr6 (374-482)||(1153603-1153711)
chr6 (366-482)||(28199596-28199714)
chr6 (366-442)||(33463703-33463779)
chr6 (368-482)||(30699018-30699132)
chr6 (434-482)||(33464399-33464447)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (360-482)||(26663252-26663374)
chr1 (365-482)||(1168502-1168619)
chr1 (369-482)||(29078519-29078632)
chr1 (360-482)||(20089465-20089587)
chr1 (365-482)||(25897373-25897490)
chr1 (365-482)||(26580359-26580476)
chr1 (365-482)||(29288148-29288265)
chr1 (365-482)||(39260435-39260552)
chr1 (365-482)||(52753236-52753353)
chr1 (366-482)||(8079798-8079914)
chr1 (358-482)||(16052088-16052212)
chr1 (367-482)||(43905655-43905770)
chr1 (365-482)||(1170533-1170650)
chr1 (365-474)||(1940844-1940953)
chr1 (369-480)||(38829072-38829183)
chr1 (360-482)||(8120863-8120985)
chr1 (360-482)||(32671573-32671695)
chr1 (369-482)||(12682823-12682936)
chr1 (365-482)||(41928584-41928701)
chr1 (365-482)||(52696790-52696907)
chr1 (365-482)||(970613-970732)
chr1 (358-482)||(5215377-5215501)
chr1 (365-480)||(42370886-42371001)
chr1 (367-482)||(46409436-46409551)
chr1 (365-482)||(2347655-2347772)
chr1 (365-482)||(33510483-33510600)
chr1 (366-482)||(2473722-2473838)
chr1 (366-482)||(19715250-19715366)
chr1 (369-482)||(40092494-40092607)
chr1 (365-482)||(17591690-17591804)
chr1 (365-482)||(15203111-15203228)
chr1 (365-482)||(51359306-51359422)
chr1 (366-482)||(46760966-46761082)
chr1 (358-482)||(49146164-49146288)
chr1 (360-482)||(13996812-13996934)
chr1 (369-482)||(23498463-23498576)
chr1 (365-456)||(15554259-15554350)
chr1 (360-482)||(6765453-6765575)
chr1 (369-482)||(29695678-29695792)
chr1 (369-482)||(52086270-52086383)
chr1 (382-482)||(17587594-17587694)
chr1 (368-482)||(15717787-15717900)
chr1 (356-482)||(38171822-38171948)
chr1 (366-482)||(7145207-7145323)
chr1 (400-482)||(40149497-40149579)
chr1 (379-482)||(23322929-23323032)
chr1 (368-482)||(5217873-5217986)
chr1 (360-429)||(5675099-5675168)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (365-482)||(36704-36821)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (365-482)||(30420256-30420373)
chr2 (365-482)||(31517304-31517421)
chr2 (357-482)||(33906136-33906261)
chr2 (368-482)||(3873333-3873447)
chr2 (365-482)||(18806973-18807090)
chr2 (365-482)||(39635451-39635568)
chr2 (366-482)||(28329926-28330042)
chr2 (360-482)||(1108274-1108395)
chr2 (365-482)||(4232231-4232348)
chr2 (365-482)||(6174917-6175034)
chr2 (359-482)||(26323275-26323398)
chr2 (366-482)||(4016039-4016155)
chr2 (367-482)||(42937720-42937835)
chr2 (360-482)||(19901227-19901348)
chr2 (365-482)||(5733398-5733515)
chr2 (354-482)||(30270768-30270896)
chr2 (367-482)||(1482992-1483106)
chr2 (370-482)||(16066383-16066495)
chr2 (367-482)||(16588865-16588980)
chr2 (365-482)||(2178858-2178975)
chr2 (366-482)||(850997-851113)
chr2 (365-482)||(44947631-44947748)
chr2 (367-482)||(429817-429932)
chr2 (380-474)||(19384032-19384126)
chr2 (365-482)||(42446658-42446775)
chr2 (365-482)||(22101236-22101352)
chr2 (367-482)||(3585291-3585406)
chr2 (369-481)||(12517274-12517385)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (365-482)||(23040-23157)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (365-482)||(3709-3826)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (362-482)||(384-504)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (366-482)||(145334-145450)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (365-482)||(95-212)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (358-482)||(10230-10354)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (366-482)||(94-212)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 301
Target Start/End: Original strand, 45450696 - 45450963
Alignment:
Q  34 gttgtgtagcaagatattaataattcggttctaaatgagaagagataagctaccacgagttcaagtgattaggatataatgcaacaaaaggtcatgagat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45450696 gttgtgtagcaagatattaataattcggttctaaatgagaagaggtaagctaccatgagttcaagtgattaggatataatgcaacaaaaggtcatgagat 45450795  T
Q  134 cgaatgcaattagttggatgcatgagacatcacagccctatttaaagctgtaaaaaagtggtgtatttatctgagcatacaaagtggttagtgaaatata 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45450796 cgaatgcaattagttggatgcatgagacatcacagccctatttaaagctgtaaaaaagtggtgtatttatccgagcatacaaagtggttagtgaaatata 45450895  T
Q  234 tattaaaaaagtggttaacaacatttaattttttggttaacaaagaaataaaattggttaacaactct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45450896 tattaaaaaagtggttaacaacatttaattttgtggttaacaaagaaataaaattggttaacaactct 45450963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803143
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttat 1803143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30181220 - 30181103
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181220 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30181121  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30181120 gtttcataagctgcttat 30181103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 33846720 - 33846603
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846720 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 33846621  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  33846620 gtttcataaactgcttat 33846603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 42965197 - 42965075
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42965197 taaggccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 42965098  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42965097 tcatagtttcataagctgcttat 42965075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12101374 - 12101257
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101374 ccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 12101275  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12101274 gtttcataagctgcttat 12101257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 20346488 - 20346605
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20346488 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 20346587  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20346588 gtttcataagctgcttat 20346605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 33359286 - 33359169
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359286 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 33359187  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33359186 gtttcataagctgcttat 33359169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 362 - 482
Target Start/End: Original strand, 7164181 - 7164301
Alignment:
Q  362 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164181 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 7164280  T
Q  462 atagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7164281 atagtttcataagctgcttat 7164301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43068174 - 43068052
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43068174 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 43068075  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  43068074 tcatagtttcataagcttcttat 43068052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22649890 - 22649773
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22649890 ccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 22649791  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
     |||||||||||||||||    
T  22649790 atttcataagctgcttat 22649773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24792528 - 24792411
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792528 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 24792429  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24792428 gtttcataagctgcttat 24792411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 3511324 - 3511440
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3511324 cccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatag 3511423  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  3511424 tttcataagctgcttat 3511440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156830
Alignment:
Q  370 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  470 ataagctgcttat 482  Q
    |||||||| ||||    
T  43156818 ataagctgtttat 43156830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477400
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttat 4477400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 482
Target Start/End: Original strand, 6394743 - 6394868
Alignment:
Q  357 tactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagc 456  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  6394743 tactaaggccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagt 6394842  T
Q  457 ttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6394843 ttatcatggtttcataagctgcttat 6394868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 32041542 - 32041659
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041542 ccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 32041641  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32041642 gtttcataagctgcttat 32041659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 354 - 482
Target Start/End: Original strand, 15655901 - 15656029
Alignment:
Q  354 tgatactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaat 453  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  15655901 tgatattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaac 15656000  T
Q  454 agcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656001 agcttatcatagtttcataagctgcttat 15656029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 42204149 - 42204272
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctt 458  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42204149 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagctt 42204248  T
Q  459 atcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42204249 atcatagtttcataagctgcttat 42204272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 4347268 - 4347390
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4347268 taaggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 4347367  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  4347368 ccatagtttcataagctgcttat 4347390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 5280861 - 5280977
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5280861 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 5280960  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  5280961 tttcataagctgcttat 5280977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 36891032 - 36890909
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36891032 actaaggccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 36890934  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  36890933 tatcatagtttcataagttgcttat 36890909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 933280 - 933402
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  933280 taaggccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 933379  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  933380 tcatagtttcataagctgcttat 933402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 19828265 - 19828387
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19828265 taaggccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagctta 19828364  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||  |||||||    
T  19828365 tcatagtttcataaattgcttat 19828387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 8630666 - 8630783
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8630666 ccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 8630765  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8630766 gtttcataagctgcttat 8630783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 25748487 - 25748604
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748487 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 25748586  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25748587 gtttcataagctgcttat 25748604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 356 - 460
Target Start/End: Original strand, 37704971 - 37705075
Alignment:
Q  356 atactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatag 455  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37704971 atactaaggccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 37705070  T
Q  456 cttat 460  Q
    |||||    
T  37705071 cttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12097786 - 12097669
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12097786 ccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 12097687  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||| |||||    
T  12097686 gtttcataagctacttat 12097669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 366 - 477
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452702
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  466 tttcataagctg 477  Q
    ||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctg 9452702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 363 - 482
Target Start/End: Original strand, 17753598 - 17753717
Alignment:
Q  363 gaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 462  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17753598 gaccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaaca 17753697  T
Q  463 tagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17753698 tagtttcataagctgcttat 17753717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866661
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| ||||    
T  38866647 tcataagctgtttat 38866661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673578
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||||||||||||    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttggg----taaataaaaacagcttatcatagt 42673562  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  42673563 ttcataagctgcttat 42673578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 357 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 46891544 - 46891418
Alignment:
Q  357 tactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttt-aaaggtatttgggtaaataaataaaaatag 455  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46891544 tactatgatcccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 46891445  T
Q  456 cttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
     || ||||||||| |||||||||||||    
T  46891444 tttgtcatagttttataagctgcttat 46891418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43021779 - 43021655
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  43021779 actaaggccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataact 43021680  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  43021679 tattatagtttcataagctgcttat 43021655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 364 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 46134501 - 46134388
Alignment:
Q  364 accccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 463  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46134501 accccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattat 46134402  T
Q  464 agtttcataagctg 477  Q
    ||||||||||||||    
T  46134401 agtttcataagctg 46134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16894698 - 16894586
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16894698 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttat----------ctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagttta 16894609  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16894608 tcatagtttcataagctgcttat 16894586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 474
Target Start/End: Original strand, 43405015 - 43405129
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43405015 taaggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagctta 43405114  T
Q  460 tcatagtttcataag 474  Q
    || || |||||||||    
T  43405115 tcgtaatttcataag 43405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 37006005 - 37005890
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||  ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  37006005 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaat 37005906  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  37005905 ttcataagctgcttat 37005890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 400 - 482
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865750
Alignment:
Q  400 gcttatctactcccataagcctttt---taaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttat 48865750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691433
Alignment:
Q  370 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaata 454  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15655605 - 15655491
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||    
T  15655605 cgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttaccacaatt 15655506  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    | |||| ||||||||    
T  15655505 ttataaactgcttat 15655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Original strand, 20163824 - 20163936
Alignment:
Q  370 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 469  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||| |||   ||||| ||||| | || |  ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  20163824 tttggattgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttc 20163923  T
Q  470 ataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||    
T  20163924 ataagctgcttat 20163936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 36849733 - 36849616
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||||||| || ||||||  |||| |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |    
T  36849733 ccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcaca 36849634  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
     |||||||| ||| ||||    
T  36849633 atttcataaactgtttat 36849616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30075424 - 30075330
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttat 460  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||| ||| | |    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30075424 ccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagcttat 30075330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 9008268 - 9008146
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9008268 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 9008169  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9008168 tcatagtttcataagctgcttat 9008146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24105884 - 24105760
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24105884 actaaggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 24105785  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24105784 tatcatagtttcataagctgcttat 24105760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27679375 - 27679258
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679375 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 27679276  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27679275 gtttcataagctgcttat 27679258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 358 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33491409 - 33491287
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33491409 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 33491310  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgctt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33491309 tatcatagtttcataagctgctt 33491287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 35782855 - 35782733
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35782855 taaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 35782756  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35782755 tcatagtttcataagctgcttat 35782733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 1579038 - 1579155
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1579038 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 1579137  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1579138 gtttcataagctgcttat 1579155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1605777 - 1605660
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1605777 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 1605678  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1605677 gtttcataagctgcttat 1605660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 27420855 - 27420977
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  27420855 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagttta 27420954  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27420955 tcatagtttcataagctgcttat 27420977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386575
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  3386588 cataagctgcttat 3386575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 357 - 482
Target Start/End: Original strand, 16069347 - 16069472
Alignment:
Q  357 tactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagc 456  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16069347 tactaaggtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagc 16069446  T
Q  457 ttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16069447 ttatcatagtttcataagctgcttat 16069472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737536
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttat 16737536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 19358523 - 19358645
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19358523 taaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 19358622  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19358623 tcatagtttcataagctgcttat 19358645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8374544 - 8374427
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8374544 ccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 8374445  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8374444 gtttcataagctgcttat 8374427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20992496 - 20992370
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgt----gggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatag 455  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20992496 taaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 20992397  T
Q  456 cttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  20992396 catatcatagtttcataagctgcttat 20992370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165690
Alignment:
Q  370 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 469  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  470 ataagctgcttat 482  Q
    ||||| |||||||    
T  1165702 ataagttgcttat 1165690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 31883148 - 31883263
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31883148 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31883247  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  31883248 ttcataagctgcttat 31883263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20992357 - 20992235
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20992357 taaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcata 20992258  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  20992257 tcatagtttcataagctgattat 20992235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 4120939 - 4121056
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4120939 ccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcata 4121038  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4121039 gtttcataagctgcttat 4121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 5202974 - 5203091
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5202974 ccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 5203073  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5203074 gtttcataagctgcttat 5203091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 33991142 - 33991259
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991142 ccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 33991241  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| |||||||    
T  33991242 gtttcataagttgcttat 33991259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 3921584 - 3921700
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3921584 cccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 3921683  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  3921684 tttcataagctgcttat 3921700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38598652 - 38598539
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38598652 gtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagttt 38598553  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  38598552 cataagctgcttat 38598539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 371 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284664
Alignment:
Q  371 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 470  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  471 taagctgcttat 482  Q
    ||| ||||||||    
T  33284675 taaactgcttat 33284664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26603138 - 26603031
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603138 ccccgtttggattggcttattttgagc----------ttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 26603049  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  26603048 gtttcataaactgcttat 26603031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Original strand, 31410481 - 31410595
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31410481 cgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagtt 31410580  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    | |||||||||||||    
T  31410581 ttataagctgcttat 31410595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 482
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025075
Alignment:
Q  408 actcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 27025075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 41818597 - 41818552
Alignment:
Q  437 ggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41818597 ggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 482
Target Start/End: Original strand, 31638157 - 31638264
Alignment:
Q  375 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 474  Q
    |||| ||||||||  | ||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||| || ||||| |||||  ||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  31638157 attgacttattttatgtttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataag 31638256  T
Q  475 ctgcttat 482  Q
    || |||||    
T  31638257 cttcttat 31638264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 25634584 - 25634699
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||||  |||||||  ||| |||    |||||||||||||   |||||||||||| | |    
T  25634584 ccccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataa--taaaatagcttataaca 25634681  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
     |||||||||| ||||||    
T  25634682 atttcataagccgcttat 25634699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 4742132 - 4742176
Alignment:
Q  213 caaagtggttagtgaaatatatattaaaaaagtggttaacaacat 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  4742132 caaagtggttaatgaaatatatggtaaaaaagtggttaataacat 4742176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 4751396 - 4751440
Alignment:
Q  213 caaagtggttagtgaaatatatattaaaaaagtggttaacaacat 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  4751396 caaagtggttaatgaaatatatggtaaaaaagtggttaataacat 4751440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 18594538 - 18594655
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594538 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 18594637  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18594638 gtttcataagctgcttat 18594655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 39206587 - 39206704
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206587 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 39206686  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39206687 gtttcataagctgcttat 39206704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 14422704 - 14422821
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422704 ccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 14422803  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14422804 gtttcataagctgcttat 14422821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34842571 - 34842454
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34842571 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 34842472  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34842471 gtttcataagctgcttat 34842454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 35118237 - 35118120
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118237 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 35118138  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35118137 gtttcataagctgcttat 35118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 40118063 - 40117941
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40118063 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 40117964  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40117963 tcatagtttcataagctgcttat 40117941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 29938062 - 29938179
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29938062 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 29938161  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29938162 gtttcataagctgcttat 29938179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110522
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    ||| |||||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttat 13110522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26783946 - 26783822
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26783946 actaaggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagct 26783847  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26783846 tatcatagtttcataagctgcttat 26783822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042613
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttat 2042613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021837
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  8021821 tttcataagctgcttat 8021837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 10836958 - 10836844
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10836958 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 10836859  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||| ||||||||    
T  10836858 tcataaactgcttat 10836844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24113372 - 24113255
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24113372 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcata 24113273  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24113272 gtttcataagctgcttat 24113255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 39218778 - 39218895
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39218778 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcata 39218877  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    | ||||||||||||||||    
T  39218878 gcttcataagctgcttat 39218895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 362 - 482
Target Start/End: Original strand, 7791409 - 7791529
Alignment:
Q  362 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7791409 agaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 7791508  T
Q  462 atagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7791509 atagtttcataagctgcttat 7791529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575631
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  41575616 ttcataagctgcttat 41575631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6144484 - 6144362
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6144484 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 6144385  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6144384 tcatagtttcataagctgcttat 6144362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22260836 - 22260719
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22260836 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatccta 22260737  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22260736 gtttcataagctgcttat 22260719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679546
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  34679559 cataagctgcttat 34679546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Original strand, 144388 - 144512
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  144388 actatgactccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtt 144487  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  144488 tatcatagtttcataagctgcttat 144512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Original strand, 7774768 - 7774882
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7774768 cgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 7774867  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  7774868 tcataagctgcttat 7774882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571711
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  42571697 tcataagctgcttat 42571711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 33287231 - 33287114
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33287231 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 33287132  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33287131 gtttcataagctgcttat 33287114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34999101 - 34998985
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34999101 cccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttag 34999002  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  34999001 tttcataagctgcttat 34998985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 4035843 - 4035965
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4035843 taaggccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagctta 4035942  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4035943 tcatagtttcataagctgcttat 4035965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 5320565 - 5320682
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5320565 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcata 5320664  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| |||||||    
T  5320665 gtttcataagttgcttat 5320682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38167357 - 38167244
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38167357 gtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcatagttt 38167258  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  38167257 cataagctgcttat 38167244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44805033
Alignment:
Q  370 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  470 ataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttat 44805033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 7811996 - 7812113
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7811996 ccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 7812095  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7812096 gtttcataagctgcttat 7812113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 33278401 - 33278518
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33278401 ccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 33278500  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33278501 gtttcataagctgcttat 33278518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 365 - 473
Target Start/End: Original strand, 36491158 - 36491266
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36491158 ccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 36491257  T
Q  465 gtttcataa 473  Q
    |||||||||    
T  36491258 gtttcataa 36491266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66269
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagt 66285  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  66284 ttcataagctgcttat 66269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 28639280 - 28639400
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccata----agcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc 461  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28639280 cccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatc 28639379  T
Q  462 atagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28639380 atagtttcataagctgcttat 28639400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2322223 - 2322101
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2322223 taaggccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagctta 2322124  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  2322123 tcacaatttcataagctgcttat 2322101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005284
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  || | |    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactct 5005270  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||| ||||||||    
T  5005271 cataaactgcttat 5005284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 360 - 451
Target Start/End: Original strand, 9806869 - 9806960
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaa 451  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9806869 taagatcccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 366 - 479
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220371
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||   |     
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  466 tttcataagctgct 479  Q
    ||||||||||||||    
T  39220358 tttcataagctgct 39220371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 482
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807378
Alignment:
Q  443 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttat 9807378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23776653 - 23776536
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776653 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 23776554  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23776553 gtttcataagctgcttat 23776536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 362 - 482
Target Start/End: Original strand, 54412624 - 54412744
Alignment:
Q  362 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54412624 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 54412723  T
Q  462 atagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  54412724 atagtttcataagctgcttat 54412744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Original strand, 14987784 - 14987908
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14987784 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 14987883  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14987884 tatcatagtttcataagctgcttat 14987908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 20877047 - 20877163
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20877047 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 20877146  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  20877147 tttcataagctgcttat 20877163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 356 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30423767 - 30423641
Alignment:
Q  356 atactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatag 455  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30423767 atactaaggtcccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 30423668  T
Q  456 cttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30423667 cttatcatagtttcataagctgcttat 30423641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19913824 - 19913707
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19913824 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcata 19913725  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19913724 gtttcataagctgcttat 19913707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 54189544 - 54189661
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189544 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 54189643  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54189644 gtttcataagctgcttat 54189661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 362 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1756961 - 1756841
Alignment:
Q  362 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1756961 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 1756862  T
Q  462 atagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1756861 atagtttcataagctgcttat 1756841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700897
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttat 16700897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 50353795 - 50353917
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50353795 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 50353894  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  50353895 tgatagtttcataagctgcttat 50353917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6611554 - 6611437
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611554 ccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 6611455  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  6611454 gtttcataagctgtttat 6611437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27488842 - 27488725
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488842 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 27488743  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27488742 gtttcataagctgcttat 27488725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 38055156 - 38055273
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38055156 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 38055255  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38055256 gtttcataagctgcttat 38055273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 40428914 - 40428797
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428914 ccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 40428815  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40428814 gtttcataagctgcttat 40428797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 50055295 - 50055178
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  50055295 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatg 50055196  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50055195 gtttcataagctgcttat 50055178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 53717658 - 53717541
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717658 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 53717559  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53717558 gtttcataagctgcttat 53717541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2481602 - 2481485
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2481602 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 2481503  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2481502 gtttcataagctgcttat 2481485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11639772 - 11639655
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639772 ccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 11639673  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11639672 gtttcataagctgcttat 11639655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 28032902 - 28032789
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032902 gtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtat 28032803  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  28032802 cataagctgcttat 28032789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44785111 - 44784994
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44785111 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcata 44785012  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| |||||||    
T  44785011 gtttcataagttgcttat 44784994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 357 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 45424736 - 45424611
Alignment:
Q  357 tactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagc 456  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  45424736 tactaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagt 45424637  T
Q  457 ttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45424636 ttatcatagtttcataagctgcttat 45424611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 48909849 - 48909962
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48909849 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 48909948  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  48909949 cataagctgcttat 48909962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 50053442 - 50053559
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50053442 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatcata 50053541  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50053542 gtttcataagctgcttat 50053559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19165048
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataag-cctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  19165064 tttcataagctgcttat 19165048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875773
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    || |||||||||||||    
T  53875758 tttataagctgcttat 53875773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8932377 - 8932255
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8932377 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctta 8932278  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  8932277 acgtagtttcataagctgcttat 8932255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15241219 - 15241105
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15241219 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtt 15241120  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  15241119 tcataagctgcttat 15241105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 356 - 482
Target Start/End: Original strand, 37464711 - 37464837
Alignment:
Q  356 atactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatag 455  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  37464711 atactgaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacag 37464810  T
Q  456 cttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  37464811 tttatcatagtttcataagctgcttat 37464837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 15669182 - 15669299
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15669182 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 15669281  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15669282 gtttcataagctgcttat 15669299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360546
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
     |||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttat 28360546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 37968951 - 37968834
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968951 ccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 37968852  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37968851 gtttcataagctgcttat 37968834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6688815 - 6688711
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688815 ccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 6688716  T
Q  465 gtttc 469  Q
    |||||    
T  6688715 gtttc 6688711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43290152 - 43290037
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290152 ccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43290053  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  43290052 ttcataagctgcttat 43290037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 366 - 480
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617198
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  466 tttcataagctgctt 480  Q
    |||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgctt 1617198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23704408 - 23704286
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23704408 taaggccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 23704309  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23704308 tcatagtttcataagctgcttat 23704286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 359 - 482
Target Start/End: Original strand, 53353048 - 53353175
Alignment:
Q  359 ctaagaccccgtttggattggcttattttgagctta----tgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaata 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53353048 ctaaggccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 53353147  T
Q  455 gcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353148 gcttatcatagtttcataagctgcttat 53353175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969797
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31969780  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  31969781 tttcataagctgcttat 31969797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490850
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 35490867  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||| |||||||    
T  35490866 tttcataagttgcttat 35490850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139319
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgcttat 52139319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 375 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071397
Alignment:
Q  375 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 474  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  475 ctgcttat 482  Q
    ||||||||    
T  38071404 ctgcttat 38071397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 47632033 - 47632151
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaa-ggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47632033 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctcat 47632132  T
Q  464 agtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47632133 agtttcataagctgcttat 47632151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591169
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8591186  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  8591185 tttcataagctgcttat 8591169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680115
Alignment:
Q  370 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 469  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  470 ataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttat 40680115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171696
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgcttat 30171696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583709
Alignment:
Q  370 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 469  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  470 ataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||    
T  27583721 ataagctgcttat 27583709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44379377 - 44379264
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44379377 gtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 44379278  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    |||||| |||||||    
T  44379277 cataagttgcttat 44379264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27536294 - 27536181
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27536294 ccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 27536199  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27536198 gtttcataaactgcttat 27536181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 375 - 482
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33703957
Alignment:
Q  375 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 474  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  475 ctgcttat 482  Q
    ||||||||    
T  33703950 ctgcttat 33703957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 365 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 55345019 - 55344920
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55345019 ccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 55344920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 364 - 482
Target Start/End: Original strand, 44375843 - 44375961
Alignment:
Q  364 accccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 463  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44375843 accccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 44375942  T
Q  464 agtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  44375943 agtttcataaactgcttat 44375961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 366 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23265950 - 23265865
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaa 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23265950 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 388 - 482
Target Start/End: Original strand, 16703843 - 16703937
Alignment:
Q  388 gagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16703843 gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttat 16703937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 44548343 - 44548238
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggc-ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagc 456  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |    
T  44548343 actaaggccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatc 44548244  T
Q  457 ttatca 462  Q
    ||||||    
T  44548243 ttatca 44548238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269123
Alignment:
Q  443 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 23269123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 365 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9596028 - 9595975
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagc 419  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9596028 ccccgtttggattggcttattt-gagtttatgtgggcttatctactctcataagc 9595975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 51780844 - 51780795
Alignment:
Q  433 tttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51780844 tttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttat 51780795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 373 - 482
Target Start/End: Original strand, 17493340 - 17493449
Alignment:
Q  373 ggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 472  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||  | |||||||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| |||    
T  17493340 ggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttata 17493439  T
Q  473 agctgcttat 482  Q
    ||||||||||    
T  17493440 agctgcttat 17493449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 37698335 - 37698218
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698335 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 37698236  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37698235 gtttcataagctgcttat 37698218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 359 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 42308103 - 42307980
Alignment:
Q  359 ctaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctt 458  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42308103 ctaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagctt 42308004  T
Q  459 atcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42308003 atcatagtttcataagctgcttat 42307980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 25999384 - 25999501
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 25999483  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25999484 gtttcataagctgcttat 25999501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 363 - 482
Target Start/End: Original strand, 38856087 - 38856206
Alignment:
Q  363 gaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856087 gaccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 38856186  T
Q  463 tagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38856187 tagtttcataagctgcttat 38856206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15520339 - 15520217
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15520339 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataactta 15520240  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  15520239 tcatcgtttcataaactgcttat 15520217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581155
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  21581142 cataagctgcttat 21581155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22175182 - 22175065
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22175182 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 22175083  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22175082 gtttcataagctgcttat 22175065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 50528925 - 50529042
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50528925 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 50529024  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50529025 gtttcataagctgcttat 50529042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20842547 - 20842423
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  20842547 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaact 20842448  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20842447 tatcatagtttcataagctgcttat 20842423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 356 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25494486 - 25494360
Alignment:
Q  356 atactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatag 455  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25494486 atactatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 25494387  T
Q  456 cttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25494386 cttatcatagtttcataagctgcttat 25494360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 20699145 - 20699262
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20699145 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 20699244  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20699245 gtttcataagctgcttat 20699262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 29445484 - 29445601
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445484 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 29445583  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  29445584 gtttcataagctgtttat 29445601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 38933942 - 38934058
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38933942 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 38934040  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38934041 gtttcataagctgcttat 38934058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529848
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  50529861 cataagctgcttat 50529848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 54534518 - 54534402
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54534518 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatg 54534419  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||| |||||||||||||    
T  54534418 gttt-ataagctgcttat 54534402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 54870366 - 54870249
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54870366 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatc 54870267  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54870266 gtttcataagctgcttat 54870249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 32244117 - 32244233
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32244117 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 32244216  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  32244217 tttcataagctgcttat 32244233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 8042598 - 8042720
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8042598 taaggccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagttta 8042697  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8042698 tcatagtttcataagctgcttat 8042720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12117855 - 12117733
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12117855 taaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagttta 12117756  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  12117755 tcatagtttcataagttgcttat 12117733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 15520632 - 15520749
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15520632 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 15520731  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15520732 gtttcataagctgcttat 15520749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 26122814 - 26122927
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122814 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 26122913  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  26122914 cataagctgcttat 26122927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 35643213 - 35643330
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643213 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 35643312  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35643313 gtttcataagctgcttat 35643330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 46452354 - 46452237
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46452354 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 46452255  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| |||||||    
T  46452254 gtttcataagttgcttat 46452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 362 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44609528 - 44609408
Alignment:
Q  362 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc 461  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44609528 agaccctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 44609429  T
Q  462 atagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44609428 atagtttcataagctgcttat 44609408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 34700337 - 34700454
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34700337 ccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcata 34700436  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34700437 gtttcataagctgcttat 34700454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 35226447 - 35226560
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35226447 gtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagttt 35226546  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  35226547 cataagctgcttat 35226560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 362 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 42105166 - 42105046
Alignment:
Q  362 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc 461  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  42105166 agaccccattaggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatc 42105067  T
Q  462 atagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42105066 atagtttcataagctgcttat 42105046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 2895181 - 2895298
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  2895181 ccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcata 2895280  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2895281 gtttcataagctgcttat 2895298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24835891 - 24835774
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24835891 ccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattata 24835792  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24835791 gtttcataagctgcttat 24835774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 32359256 - 32359372
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32359256 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatag 32359355  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  32359356 tttcataagctgcttat 32359372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 49128040 - 49128162
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49128040 taaggccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataactta 49128139  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  49128140 tcgtaatttcataagctgcttat 49128162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 44688762 - 44688874
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| ||||||||||     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44688762 ccccgtttgaattggcttat-----gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 44688856  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44688857 gtttcataagctgcttat 44688874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48925078
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||| ||||    
T  48925091 cataagctgtttat 48925078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 53028225 - 53028330
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53028225 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaga--------ggtaaataaataaaaatagcttatcatatttt 53028316  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||| ||||||||    
T  53028317 cataaactgcttat 53028330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 402 - 479
Target Start/End: Original strand, 16354379 - 16354456
Alignment:
Q  402 ttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 479  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16354379 ttatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgct 16354456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 482
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916019
Alignment:
Q  392 ttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactcc-ataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttat 12916019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 419
Target Start/End: Original strand, 24366081 - 24366142
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagc 419  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24366081 actaaggccccttttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagc 24366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Original strand, 30691855 - 30691969
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691855 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30691954  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  30691955 tcataagctgcttat 30691969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6086805 - 6086688
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086805 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 6086706  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6086705 gtttcataagctgcttat 6086688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26947082 - 26946965
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26947082 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 26946983  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26946982 gtttcataagctgcttat 26946965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3955979 - 3955855
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3955979 actatgaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 3955880  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  3955879 tatcatagtttcataaactgcttat 3955855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 479
Target Start/End: Original strand, 2837546 - 2837660
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837546 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 2837645  T
Q  465 gtttcataagctgct 479  Q
    ||||||| |||||||    
T  2837646 gtttcatgagctgct 2837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3347734 - 3347612
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3347734 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagctta 3347635  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3347634 tcatagtttcataagctgcttat 3347612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 356 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26704554 - 26704428
Alignment:
Q  356 atactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatag 455  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26704554 atactagggccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 26704455  T
Q  456 cttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26704454 cttatcatagtttcataagctgcttat 26704428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 52837 - 52954
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52837 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 52936  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52937 gtttcataagctgcttat 52954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 9459564 - 9459681
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459564 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 9459663  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9459664 gtttcataagctgcttat 9459681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17261278 - 17261162
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17261278 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatat 17261179  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  17261178 tttcataagctgcttat 17261162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887381
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||| ||||    
T  34887396 ttcataagctgtttat 34887381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 18613534 - 18613656
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18613534 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctta 18613633  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  18613634 tcatagttccataagctgcttat 18613656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 21893456 - 21893573
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21893456 ccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcata 21893555  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21893556 gtttcataagctgcttat 21893573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 35198285 - 35198401
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198285 ccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 35198383  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35198384 gtttcataagctgcttat 35198401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16307214 - 16307097
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16307214 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcata 16307115  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16307114 gtttcataagctgcttat 16307097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 20726792 - 20726905
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||    
T  20726792 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg----taaataaaaataacttatcata 20726887  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20726888 gtttcataagctgcttat 20726905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 11167241 - 11167358
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167241 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 11167340  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11167341 gtttcataagctgcttat 11167358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 374 - 482
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153711
Alignment:
Q  374 gattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  474 gctgcttat 482  Q
    |||||||||    
T  1153703 gctgcttat 1153711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 28199714 - 28199596
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 462  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199714 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 28199616  T
Q  463 tagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  28199615 tagtttcatatgctgcttat 28199596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 366 - 442
Target Start/End: Original strand, 33463703 - 33463779
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33463703 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30699018
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| || | | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    | || ||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttat 30699018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 482
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464447
Alignment:
Q  434 ttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttat 33464447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 26663252 - 26663374
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26663252 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 26663351  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  26663352 tcatagtttcataagctgtttat 26663374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 1168502 - 1168619
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168502 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 1168601  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1168602 gtttcataagctgcttat 1168619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078632
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttat 29078632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 20089465 - 20089587
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20089465 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 20089564  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20089565 tcatagtttcataagctgcttat 20089587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 25897373 - 25897490
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897373 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 25897472  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25897473 gtttcataagctgcttat 25897490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26580476 - 26580359
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26580476 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcata 26580377  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26580376 gtttcataagctgcttat 26580359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 29288148 - 29288265
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29288148 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 29288247  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29288248 gtttcataagctgcttat 29288265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 39260552 - 39260435
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260552 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 39260453  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| |||||||    
T  39260452 gtttcataagttgcttat 39260435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 52753353 - 52753236
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753353 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 52753254  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||| |||||    
T  52753253 gtttcataagctacttat 52753236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079798
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8079815  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8079814 tttcataagctacttat 8079798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Original strand, 16052088 - 16052212
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16052088 actaaggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 16052187  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16052188 tatcatagtttcataagctgcttat 16052212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 43905655 - 43905770
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905655 ccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43905754  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  43905755 ttcataagctgcttat 43905770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1170650 - 1170533
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1170650 ccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 1170551  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1170550 gtttcataagctgcttat 1170533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1940953 - 1940844
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940953 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 1940854  T
Q  465 gtttcataag 474  Q
    ||||||||||    
T  1940853 gtttcataag 1940844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 369 - 480
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829183
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  469 cataagctgctt 480  Q
    ||||||||||||    
T  38829172 cataagctgctt 38829183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 8120863 - 8120985
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  8120863 taagactccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagttta 8120962  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8120963 tcatagtttcataagctgcttat 8120985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 32671573 - 32671695
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  32671573 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagctta 32671672  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  32671673 tcatagtttcataagctacttat 32671695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 12682823 - 12682936
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682823 gtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 12682922  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  12682923 cataagctgcttat 12682936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 41928701 - 41928584
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41928701 ccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 41928602  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41928601 gtttcataagctgcttat 41928584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 52696790 - 52696907
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  52696790 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcata 52696889  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52696890 gtttcataagctgcttat 52696907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 970732 - 970613
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc--a 462  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  970732 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 970633  T
Q  463 tagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  970632 tagtttcataagctgcttat 970613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Original strand, 5215377 - 5215501
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  5215377 actaggaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagct 5215476  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  5215477 tatcatagtttcataagttgcttat 5215501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 365 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 42371001 - 42370886
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42371001 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcata 42370902  T
Q  465 gtttcataagctgctt 480  Q
    ||||||||||||||||    
T  42370901 gtttcataagctgctt 42370886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 46409436 - 46409551
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409436 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46409535  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  46409536 ttcataagctgcttat 46409551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 2347655 - 2347772
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2347655 ccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 2347754  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2347755 gtttcataagctgcttat 2347772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 33510483 - 33510600
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33510483 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 33510582  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33510583 gtttcataagctgcttat 33510600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 2473722 - 2473838
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2473722 cccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 2473821  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  2473822 tttcataagctgcttat 2473838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715250
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttat 19715250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 40092494 - 40092607
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40092494 gtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagttt 40092593  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  40092594 cataagctgcttat 40092607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 17591690 - 17591804
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17591690 ccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 17591786  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17591787 gtttcataagctgcttat 17591804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 15203111 - 15203228
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203111 ccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatcata 15203210  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15203211 gtttcataagctgtttat 15203228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 51359422 - 51359306
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51359422 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcata 51359324  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| |||||||    
T  51359323 gtttcataaggtgcttat 51359306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761082
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||| ||||||||    
T  46761066 tttcataaactgcttat 46761082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Original strand, 49146164 - 49146288
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49146164 actaaggctccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 49146263  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  49146264 tatcatagtttcataagctgcttat 49146288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 13996934 - 13996812
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13996934 taaggccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagctta 13996835  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  13996834 taatggtttcataagctgcttat 13996812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 23498463 - 23498576
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23498463 gtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcatagttt 23498562  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    |||||| |||||||    
T  23498563 cataagttgcttat 23498576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 365 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15554350 - 15554259
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagc 456  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15554350 ccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 15554259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 6765453 - 6765575
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6765453 taagaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 6765552  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||| |||||| ||||||||||    
T  6765553 tcatattttcatgagctgcttat 6765575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 29695678 - 29695792
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataa-gcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29695678 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatcatagtt 29695777  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  29695778 tcataagctgcttat 29695792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 369 - 482
Target Start/End: Original strand, 52086270 - 52086383
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  52086270 gtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataattt 52086369  T
Q  469 cataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||    
T  52086370 cataagctgcttat 52086383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 382 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587594
Alignment:
Q  382 tattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctta 481  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  482 t 482  Q
    |    
T  17587594 t 17587594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717900
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  15717886 tcataagctgcttat 15717900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 356 - 482
Target Start/End: Original strand, 38171822 - 38171948
Alignment:
Q  356 atactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatag 455  Q
    |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  38171822 atactaaggctccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacag 38171921  T
Q  456 cttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  38171922 tttatcatagtttcataagctgcttat 38171948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 7145207 - 7145323
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttatttt-gagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7145207 cccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcata 7145305  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7145306 gtttcataagctgcttat 7145323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 400 - 482
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149579
Alignment:
Q  400 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttat 40149579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 379 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322929
Alignment:
Q  379 gcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgc 478  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgc 23322933  T
Q  479 ttat 482  Q
    ||||    
T  23322932 ttat 23322929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5217986 - 5217873
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||  ||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||   | ||    
T  5217986 cgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaat-aataaaaatagcttataccaatt 5217888  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||| ||||||    
T  5217887 tcataagccgcttat 5217873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 429
Target Start/End: Original strand, 5675099 - 5675168
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaag 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  5675099 taaggccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaag 5675168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 36704 - 36821
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36704 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 36803  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36804 gtttcataagctgcttat 36821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420256
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30420274  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    | ||||||||||||||||    
T  30420273 ggttcataagctgcttat 30420256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 31517421 - 31517304
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517421 ccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 31517322  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31517321 gtttcataaactgcttat 31517304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 357 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 33906261 - 33906136
Alignment:
Q  357 tactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagc 456  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33906261 tactaaggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 33906162  T
Q  457 ttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33906161 ttatcatagtttcataagctgcttat 33906136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 368 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3873447 - 3873333
Alignment:
Q  368 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3873447 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 3873348  T
Q  468 tcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||    
T  3873347 tcataagctgcttat 3873333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18807090 - 18806973
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807090 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 18806991  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18806990 gtttcataagctgcttat 18806973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 39635451 - 39635568
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39635451 ccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcata 39635550  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39635551 gtttcataagctgcttat 39635568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329926
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||| ||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttat 28329926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Original strand, 1108274 - 1108395
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1108274 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 1108372  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  1108373 tcatagtttcataagttgcttat 1108395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4232348 - 4232231
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232348 ccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 4232249  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4232248 gtttcataagctgcttat 4232231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6175034 - 6174917
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6175034 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 6174935  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6174934 gtttcataagctgcttat 6174917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 359 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26323398 - 26323275
Alignment:
Q  359 ctaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctt 458  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26323398 ctaaggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagctt 26323299  T
Q  459 atcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26323298 atcatagtttcataagctgcttat 26323275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016155
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttat 4016155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 42937720 - 42937835
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42937720 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 42937819  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  42937820 ttcataagctgcttat 42937835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 19901348 - 19901227
Alignment:
Q  360 taagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagctta 459  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19901348 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagctta 19901250  T
Q  460 tcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  19901249 tcatagtttcataaactgcttat 19901227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 5733398 - 5733515
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  5733398 ccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcata 5733497  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5733498 gtttcataagctgcttat 5733515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 354 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 30270896 - 30270768
Alignment:
Q  354 tgatactaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaat 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||    
T  30270896 tgatactaaggccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaat 30270797  T
Q  454 agcttatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30270796 agtttatcatagtttcataagctgcttat 30270768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482992
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgt 1483008  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  1483007 ttcataagctgcttat 1482992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066383
Alignment:
Q  370 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  470 ataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttat 16066383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16588980 - 16588865
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16588980 ccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 16588881  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  16588880 ttcataagctgcttat 16588865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2178975 - 2178858
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2178975 ccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcata 2178876  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2178875 gtttcataagctgcttat 2178858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851113
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    ||| |||||||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttat 851113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44947748 - 44947631
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44947748 ccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcata 44947649  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44947648 gtttcataagctgcttat 44947631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 429817 - 429932
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  429817 ccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataat 429916  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||| |||||||    
T  429917 ttcataagttgcttat 429932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19384032
Alignment:
Q  380 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 474  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 19384032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 42446775 - 42446658
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||| |    
T  42446775 ccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcaca 42446676  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
     |||||||||||||||||    
T  42446675 atttcataagctgcttat 42446658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22101352 - 22101236
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| ||||| |||||  ||  ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| |    
T  22101352 ccccgtttgaattgggttattcagaatttatgtggt-ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcaca 22101254  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
     |||||||||||||||||    
T  22101253 atttcataagctgcttat 22101236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 482
Target Start/End: Original strand, 3585291 - 3585406
Alignment:
Q  367 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 466  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||  ||||| |||  ||||| |||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| |  |||||| | |    
T  3585291 ccgtttggatcggcttattcaaagcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaat 3585390  T
Q  467 ttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||    
T  3585391 ttcataagctgcttat 3585406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517274
Alignment:
Q  369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 468  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||   |||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||| |||| |||||||| || |||    
T  12517385 gtttggattggcttattta-agcttatgtgagcttatctactaaaataagctttcctaaaagtgtttggataccttaattaaaagagcttatcctaattt 12517287  T
Q  469 cataagctgctta 481  Q
    ||||||| |||||    
T  12517286 cataagcagctta 12517274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23157 - 23040
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23157 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 23058  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23057 gtttcataagctgcttat 23040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Original strand, 3709 - 3826
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3709 ccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3808  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3809 gtttcataagctgcttat 3826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 362 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 504 - 384
Alignment:
Q  362 agaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatc 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  504 agaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 405  T
Q  462 atagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  404 atagtttcataagctgcttat 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145334
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 465  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  466 tttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttat 145334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 365 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 95
Alignment:
Q  365 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 464  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 ccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 113  T
Q  465 gtttcataagctgcttat 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  112 gtttcataagctgcttat 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Original strand, 10230 - 10354
Alignment:
Q  358 actaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 457  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10230 actaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 10329  T
Q  458 tatcatagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10330 tatcatagtttcataagctgcttat 10354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 94
Alignment:
Q  366 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 462  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 114  T
Q  463 tagtttcataagctgcttat 482  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  113 tagtttcatatgctgcttat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University