View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7468_low_1 (Length: 558)

Name: NF7468_low_1
Description: NF7468
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7468_low_1
NF7468_low_1
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (71-547)||(45429129-45429602)
chr2 (71-547)||(28469179-28469652)
chr2 (71-512)||(39948139-39948577)
chr2 (71-512)||(45136402-45136837)
chr2 (71-356)||(22686917-22687201)
chr2 (76-317)||(32955648-32955888)
chr2 (342-547)||(10828064-10828268)
chr2 (294-547)||(17421286-17421540)
chr2 (340-543)||(29400663-29400864)
chr2 (370-547)||(15831969-15832146)
chr2 (370-547)||(3939784-3939961)
chr2 (370-547)||(30495991-30496168)
chr2 (370-547)||(5352806-5352983)
chr2 (370-547)||(43979371-43979548)
chr2 (370-547)||(43538782-43538959)
chr2 (342-512)||(36655487-36655648)
chr2 (395-512)||(25514980-25515097)
chr2 (263-327)||(17421155-17421219)
chr2 (479-547)||(20931519-20931587)
chr2 (309-350)||(25515143-25515184)
chr2 (71-121)||(17421105-17421157)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (71-547)||(31782788-31783262)
chr1 (71-512)||(52802670-52803109)
chr1 (71-543)||(51321253-51321712)
chr1 (75-547)||(19525102-19525564)
chr1 (75-547)||(19526237-19526699)
chr1 (75-547)||(19524254-19524716)
chr1 (71-512)||(45825416-45825853)
chr1 (174-547)||(2424270-2424641)
chr1 (71-512)||(47502842-47503261)
chr1 (75-543)||(35257955-35258403)
chr1 (142-547)||(19525763-19526159)
chr1 (71-512)||(23275219-23275638)
chr1 (174-547)||(22524871-22525230)
chr1 (342-547)||(96983-97186)
chr1 (294-533)||(30890775-30891012)
chr1 (156-323)||(49857281-49857448)
chr1 (75-261)||(19526702-19526886)
chr1 (296-547)||(49857030-49857278)
chr1 (71-261)||(19526889-19527077)
chr1 (370-547)||(19156851-19157028)
chr1 (370-547)||(13639065-13639243)
chr1 (75-261)||(19524719-19524903)
chr1 (370-547)||(3731425-3731602)
chr1 (370-547)||(26876494-26876671)
chr1 (119-277)||(11196268-11196424)
chr1 (342-512)||(50343088-50343256)
chr1 (142-261)||(19524906-19525024)
chr1 (142-261)||(19525567-19525685)
chr1 (396-512)||(38126602-38126717)
chr1 (368-512)||(47656678-47656822)
chr1 (370-465)||(2366064-2366159)
chr1 (429-512)||(21141748-21141831)
chr1 (71-121)||(19925280-19925332)
chr1 (71-121)||(30890599-30890651)
chr1 (297-327)||(30890676-30890706)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (71-547)||(3976245-3976718)
chr3 (71-547)||(50963492-50963969)
chr3 (71-505)||(42165701-42166133)
chr3 (71-543)||(47073272-47073741)
chr3 (75-462)||(4007469-4007853)
chr3 (91-512)||(49268365-49268782)
chr3 (75-547)||(30255064-30255532)
chr3 (174-547)||(597541-597912)
chr3 (75-512)||(42756694-42757128)
chr3 (79-512)||(20917113-20917541)
chr3 (79-512)||(20926075-20926503)
chr3 (71-435)||(48889273-48889633)
chr3 (71-508)||(48563466-48563903)
chr3 (142-547)||(50215998-50216403)
chr3 (71-512)||(44230252-44230678)
chr3 (71-512)||(49195562-49195981)
chr3 (342-547)||(36128406-36128609)
chr3 (342-547)||(2273985-2274188)
chr3 (79-282)||(42805586-42805788)
chr3 (368-546)||(52390451-52390629)
chr3 (342-543)||(16611891-16612090)
chr3 (342-543)||(22047163-22047362)
chr3 (1-149)||(54681906-54682054)
chr3 (371-547)||(29009712-29009888)
chr3 (370-547)||(42903234-42903411)
chr3 (370-547)||(49143507-49143684)
chr3 (370-547)||(34046227-34046404)
chr3 (370-547)||(50479851-50480028)
chr3 (370-547)||(46389802-46389979)
chr3 (370-547)||(46701070-46701247)
chr3 (370-547)||(54386975-54387152)
chr3 (342-512)||(20351413-20351581)
chr3 (342-512)||(17567192-17567361)
chr3 (342-512)||(41613142-41613310)
chr3 (225-341)||(54682060-54682171)
chr3 (485-547)||(4007411-4007472)
chr3 (475-543)||(48889636-48889704)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (71-547)||(43212044-43212517)
chr8 (71-547)||(39252541-39253011)
chr8 (71-547)||(15035789-15036262)
chr8 (75-543)||(39938284-39938746)
chr8 (75-547)||(41249169-41249619)
chr8 (71-512)||(34822112-34822551)
chr8 (71-473)||(45064769-45065170)
chr8 (71-512)||(39846094-39846520)
chr8 (75-513)||(43188592-43189025)
chr8 (71-512)||(40076353-40076793)
chr8 (217-547)||(39602271-39602599)
chr8 (71-512)||(5303336-5303755)
chr8 (294-547)||(42484644-42484894)
chr8 (287-547)||(488763-489024)
chr8 (342-529)||(34369617-34369802)
chr8 (342-529)||(34370945-34371130)
chr8 (370-547)||(1053376-1053553)
chr8 (370-547)||(23021365-23021542)
chr8 (370-547)||(26660298-26660475)
chr8 (370-547)||(24582-24759)
chr8 (342-512)||(20858071-20858239)
chr8 (322-512)||(37327612-37327799)
chr8 (296-534)||(2984874-2985118)
chr8 (368-512)||(35552475-35552619)
chr8 (176-308)||(2984721-2984850)
chr8 (395-523)||(5677896-5678024)
chr8 (395-510)||(45128576-45128692)
chr8 (172-253)||(37327300-37327381)
chr8 (71-121)||(489112-489164)
chr8 (71-121)||(42485012-42485064)
chr8 (309-350)||(45128489-45128530)
chr8 (297-327)||(489057-489087)
chr8 (84-120)||(37327264-37327300)
chr8 (299-327)||(42484957-42484985)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (82-547)||(37021139-37021601)
chr4 (71-544)||(21021953-21022423)
chr4 (71-547)||(40357342-40357815)
chr4 (71-543)||(50902018-50902475)
chr4 (71-547)||(50275273-50275727)
chr4 (74-512)||(55406884-55407318)
chr4 (71-512)||(51683741-51684178)
chr4 (71-423)||(48255758-48256105)
chr4 (263-547)||(1088785-1089069)
chr4 (294-547)||(30725853-30726105)
chr4 (304-547)||(1308215-1308456)
chr4 (82-323)||(68070-68306)
chr4 (342-547)||(44679119-44679322)
chr4 (342-533)||(3184802-3184991)
chr4 (370-547)||(41798039-41798216)
chr4 (370-547)||(6180834-6181011)
chr4 (370-547)||(31422540-31422717)
chr4 (370-547)||(49165885-49166062)
chr4 (370-547)||(49091272-49091449)
chr4 (342-512)||(50194264-50194432)
chr4 (322-540)||(46436990-46437203)
chr4 (395-546)||(11083074-11083225)
chr4 (370-482)||(9892387-9892499)
chr4 (342-448)||(3185018-3185122)
chr4 (368-512)||(30704833-30704977)
chr4 (296-456)||(11049726-11049892)
chr4 (395-510)||(41932754-41932869)
chr4 (296-508)||(10752540-10752759)
chr4 (296-508)||(10966309-10966528)
chr4 (296-427)||(14316131-14316252)
chr4 (342-444)||(50022741-50022841)
chr4 (183-273)||(21537868-21537958)
chr4 (263-327)||(30726162-30726226)
chr4 (209-308)||(11049916-11050012)
chr4 (395-543)||(21537535-21537683)
chr4 (172-253)||(46436761-46436842)
chr4 (275-324)||(10752761-10752810)
chr4 (275-324)||(10966530-10966579)
chr4 (71-121)||(1089067-1089119)
chr4 (71-121)||(1308597-1308649)
chr4 (71-121)||(30726224-30726276)
chr4 (297-327)||(1308542-1308572)
chr4 (294-332)||(21537762-21537799)
chr4 (476-529)||(14316307-14316360)
chr4 (298-350)||(41932915-41932967)
chr4 (84-120)||(46436725-46436761)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (71-547)||(17835615-17836088)
chr7 (75-547)||(34738909-34739375)
chr7 (71-512)||(27452715-27453153)
chr7 (75-546)||(9493867-9494326)
chr7 (71-512)||(37340843-37341281)
chr7 (185-547)||(10517546-10517906)
chr7 (71-543)||(36978137-36978586)
chr7 (75-433)||(47672271-47672615)
chr7 (294-547)||(15073329-15073582)
chr7 (294-543)||(42507142-42507391)
chr7 (72-282)||(47776874-47777082)
chr7 (342-543)||(46739578-46739777)
chr7 (370-547)||(17462349-17462526)
chr7 (370-547)||(17590688-17590865)
chr7 (252-512)||(39461169-39461434)
chr7 (370-547)||(41881342-41881519)
chr7 (370-547)||(48404209-48404386)
chr7 (370-547)||(9370434-9370611)
chr7 (342-512)||(16677837-16678005)
chr7 (342-512)||(17652073-17652241)
chr7 (342-512)||(19798081-19798249)
chr7 (370-547)||(35609470-35609647)
chr7 (71-267)||(14689405-14689592)
chr7 (342-512)||(5540671-5540838)
chr7 (330-512)||(47777047-47777227)
chr7 (368-528)||(14689238-14689397)
chr7 (263-327)||(42507448-42507512)
chr7 (71-137)||(39461067-39461133)
chr7 (172-253)||(556121-556202)
chr7 (470-547)||(47672183-47672260)
chr7 (263-327)||(15073649-15073713)
chr7 (156-206)||(39461132-39461182)
chr7 (71-121)||(15073711-15073763)
chr7 (71-121)||(42507510-42507562)
chr7 (71-101)||(10517519-10517549)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (71-547)||(8579567-8580040)
chr5 (71-547)||(7757863-7758317)
chr5 (72-541)||(42941554-42942020)
chr5 (75-547)||(8701282-8701754)
chr5 (142-547)||(13858-14259)
chr5 (71-547)||(28877181-28877652)
chr5 (71-547)||(38968637-38969110)
chr5 (71-512)||(42537688-42538125)
chr5 (71-547)||(17658861-17659327)
chr5 (294-547)||(28240884-28241138)
chr5 (298-547)||(27672713-27672958)
chr5 (342-547)||(30705911-30706114)
chr5 (370-547)||(19040161-19040338)
chr5 (342-512)||(5197748-5197916)
chr5 (322-523)||(40624012-40624211)
chr5 (410-547)||(19228008-19228145)
chr5 (74-165)||(512214-512303)
chr5 (75-137)||(19228140-19228202)
chr5 (172-253)||(40624389-40624470)
chr5 (71-121)||(28241282-28241334)
chr5 (297-327)||(28241227-28241257)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (71-547)||(14683-15157)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (71-492)||(6319680-6320097)
chr6 (71-354)||(31769244-31769526)
chr6 (79-323)||(24088066-24088308)
chr6 (296-528)||(24087833-24088063)
chr6 (370-547)||(27617567-27617744)
chr6 (370-547)||(6202000-6202177)
chr6 (370-547)||(11688967-11689144)
chr6 (370-547)||(22302032-22302209)
chr6 (370-547)||(30828696-30828873)
chr6 (371-512)||(24722705-24722846)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (156-534)||(10887-11260)
scaffold0155 (82-133)||(10833-10884)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (84-245)||(7899-8059)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (294-405)||(1-107)
scaffold0293 (263-327)||(164-228)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (396-512)||(18052-18168)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 45429129 - 45429602
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45429129 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 45429227  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45429228 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 45429327  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  45429328 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgt 45429425  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429426 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 45429525  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429526 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 45429602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 28469179 - 28469652
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28469179 ttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 28469277  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28469278 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 28469377  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  | | |    
T  28469378 tgttgtagttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtttattttat--tttatttttt 28469475  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469476 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagataattggtggtaggcgtgcgatgacccagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 28469575  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469576 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 28469652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Original strand, 39948139 - 39948577
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39948139 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 39948237  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39948238 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatggtcat 39948337  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||    
T  39948338 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttttttattt--tttgt 39948435  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39948436 gtagatatggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggagggaaaggcagagcggccaca 39948535  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39948536 tcccaaagaggggtaaaggtcggaggggagatggttcaggga 39948577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 45136837 - 45136402
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45136837 ttggttaaatgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatataaatgatt-aagtgtatgttaa 45136740  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45136739 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggt-atggaaatgatgttcat 45136641  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45136640 tgttgtacttttaatgagtt-gattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattttttgtgt 45136542  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
      |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  45136541 --agatatggccgatcaggaccccattgttcaatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagagacaaagcgaccaca 45136444  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  45136443 tcccaaagaggggtagaggtcggaggatggatggttcaggga 45136402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 71 - 356
Target Start/End: Original strand, 22686917 - 22687201
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22686917 ttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaattatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttga 22687015  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22687016 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 22687115  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687116 tgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt 22687201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 76 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32955888 - 32955648
Alignment:
Q  76 taagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattatt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32955888 taagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattatt 32955790  T
Q  176 gaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttg 275  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32955789 gaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttg 32955690  T
Q  276 tacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955689 tacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtt 32955648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 342 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 10828268 - 10828064
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  10828268 aatgatgttaattttattatttttt-tgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgattcaaag 10828170  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10828169 ccaccggagggagaggcagagcggtcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtca 10828070  T
Q  542 caggtt 547  Q
     |||||    
T  10828069 taggtt 10828064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 294 - 547
Target Start/End: Original strand, 17421286 - 17421540
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccgatcaggac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||   | | | ||||||||||||||||||||    
T  17421286 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatataaatttt-ttatttttattttttatagatatggccgatcaggac 17421384  T
Q  392 ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtc 491  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17421385 cccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccacatcccaaagaggggtagaggtc 17421484  T
Q  492 ggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421485 gaagaggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 17421540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 340 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 29400864 - 29400663
Alignment:
Q  340 gaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcag 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29400864 gaaatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatagccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcag 29400767  T
Q  440 agccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagt 539  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29400766 agccaccggagggagaggcaaagcagccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagt 29400667  T
Q  540 caca 543  Q
    ||||    
T  29400666 caca 29400663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 15831969 - 15832146
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  15831969 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 15832068  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15832069 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 15832146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 3939961 - 3939784
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  3939961 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcaaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 3939862  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3939861 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 3939784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 30496168 - 30495991
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  30496168 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 30496069  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30496068 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 30495991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 5352806 - 5352983
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  5352806 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 5352905  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5352906 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 5352983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 43979371 - 43979548
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  43979371 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgctatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 43979470  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43979471 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacaacctgaggagtcacaggtt 43979548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 43538959 - 43538782
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||    
T  43538959 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcatggagagacagagtgcccac 43538860  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43538859 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatgcctcaggaagctctcaagctacacagcctgaggagtcacaggtt 43538782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36655648 - 36655487
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||     
T  36655648 aatgatgttaattttataattttttttgt--agatatggccgatcaggatctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgaattaga- 36655552  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
          |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  36655551 ------gagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatgtttcaggga 36655487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 395 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25515097 - 25514980
Alignment:
Q  395 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 494  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||   ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  25515097 attgatccatctaagataattggtggtaggcgtgcgatgacacaaagccaccggaatgagaggcaagacgggcacatcccaaagaggggaagaggttgga 25514998  T
Q  495 ggggagatggttcaggga 512  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25514997 ggggggatggttcaggga 25514980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Original strand, 17421155 - 17421219
Alignment:
Q  263 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421155 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 17421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 479 - 547
Target Start/End: Original strand, 20931519 - 20931587
Alignment:
Q  479 aggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931519 aggggtagaggtcggaggggagatgactcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 20931587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25515184 - 25515143
Alignment:
Q  309 gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25515184 gtttaggtttaatgtttttgattaggttatggaaatgatgtt 25515143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Original strand, 17421105 - 17421157
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17421105 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 17421157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 31783262 - 31782788
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31783262 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgattgacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 31783164  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31783163 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 31783064  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31783063 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttagttttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattatttt-tttgt 31782965  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31782964 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccaca 31782865  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31782864 tcccaaagaggggtagaggtcggaagggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 31782788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Original strand, 52802670 - 52803109
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  52802670 ttggttaagtgtatattgatttttttgttagtttaggttaagagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtgtgttaa 52802768  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  52802769 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgattgacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttatgttatggaaatgatgttcat 52802868  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52802869 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagcgtaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttttgtgt 52802968  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52802969 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 52803068  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52803069 tcccaaaga-gggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 52803109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 543
Target Start/End: Original strand, 51321253 - 51321712
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  51321253 ttggttaagtgtatattgattttt-agttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtataaaaatgatt-aagcgtatgttaa 51321349  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51321350 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 51321449  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          | |||    
T  51321450 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattt----------tttgt 51321539  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  51321540 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcaca 51321639  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51321640 tcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcagggacttctcaggctacacagcctgaagagtcaca 51321712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 75 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19525564 - 19525102
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||     
T  19525564 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatattggacacaaatgattaagt-gtatataaatgatt-aagtgtatgttaaataa 19525467  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19525466 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 19525367  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  19525366 gtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaaatgatgttaattttattattttttgtgt--ag 19525275  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19525274 atatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggagagagaggcagagcggccacatccc 19525175  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19525174 aaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttctcatgctacatagcctgaagagtcacaggtt 19525102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 75 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19526699 - 19526237
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||     
T  19526699 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatattggacacaaatgattaagt-gtatataaatgatt-aagtgtatgttaaataa 19526602  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19526601 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 19526502  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  19526501 gtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaaatgatgttaattttattattttttgtgt--ag 19526410  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19526409 atatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggagagagaggcagagcggccacatccc 19526310  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19526309 aaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttctcatgctacatagcctgaagagtcacaggtt 19526237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 75 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19524716 - 19524254
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||     
T  19524716 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatattggacacaaatgattaagt-gtatataaatgatt-aagtgtatgttaaataa 19524619  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19524618 tgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 19524519  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  19524518 gtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaaatgatgttaattttattattttttgtgt--ag 19524427  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19524426 atatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggagagagaggcagagcggccacatccc 19524327  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19524326 aaagaaggggagaggtcggaggggagatggttcagggagttctaatgctacatagcctgaagagtcacaggtt 19524254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Original strand, 45825416 - 45825853
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45825416 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaagttacgagaattatgatggacacaaatgattaaat-gtataaaaatgatt-aagtgtatgttaa 45825513  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45825514 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 45825613  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || | |||    
T  45825614 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattt--ttaaattttttgt 45825711  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||    
T  45825712 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggaaggagagacaaagtgggcaca 45825811  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  45825812 tcccaaagaggggaagaggtcggaggttggatggttcaggga 45825853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 174 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 2424641 - 2424270
Alignment:
Q  174 ttgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2424641 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgt 2424542  T
Q  274 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  2424541 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattt--tttgtgta 2424444  T
Q  374 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 473  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2424443 gatatggccgaccatgaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgagcgatgacccagagccaccggagggagaggtagagcgcccacatcc 2424344  T
Q  474 taaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2424343 caaagaggggtagaggtcggaggggagatgattcagggagttctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 2424270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Original strand, 47502842 - 47503261
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||                    |||||||||||||    
T  47502842 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacaagaattatgatggagacaaatgatt--------------------aagtgtatgttaa 47502921  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  47502922 ttattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttatgttatggaaatgatattcat 47503021  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  47503022 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaatatgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgt 47503119  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47503120 gtagatatggccgatcaggattccattgatcgatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagagacaaagcggccaca 47503219  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47503220 tctcaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcaggga 47503261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 75 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35258403 - 35257955
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35258403 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattat 35258306  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    |||||||||||||||||     | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35258305 tgaatgatgtttaggtt-----ggaaatgatggacataaaatttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 35258211  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          | |||||||    
T  35258210 gtacttttaatgagtttgattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaataatgttaattt----------tttgtgtag 35258121  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  35258120 atatg---gatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatccc 35258024  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaact-ctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  35258023 aaagaaaggaagaggtcggaggggagatggttta-ggaactgctcagactacacagtctgaagagtcaca 35257955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 142 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19526159 - 19525763
Alignment:
Q  142 tgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaa 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19526159 tgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaa 19526061  T
Q  242 tgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgga 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19526060 tgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatgga 19525967  T
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  19525966 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaag 19525869  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  19525868 ccaccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttctcatgctacatagcctgaagagtca 19525769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23275638 - 23275219
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                    |||||||||||||    
T  23275638 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatt--------------------aagtgtatgttaa 23275559  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23275558 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaagttatggaaatgatgttcat 23275459  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  | |||    
T  23275458 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaaatttttaattt--tttgt 23275361  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||    
T  23275360 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccatcgaaaggagaggcaaagcgggcaca 23275261  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  23275260 tcccaaagaggggaagaggtcggatggtggatggttcaggga 23275219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 174 - 547
Target Start/End: Original strand, 22524871 - 22525230
Alignment:
Q  174 ttgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22524871 ttgaataatgtttaggttattatggaaatggtggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatg-aaatgatgttcattgt 22524969  T
Q  274 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |    
T  22524970 tgtacttttaaggagtttgattatgtttatgttta-----------atgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattttttctgt--a 22525056  T
Q  374 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 473  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22525057 gatatggccgaccaggatcccattaatccatctagaatgattggtggtaggcgagcgatgaccaagagccaccgaagggagaggcagagcgtccacatcc 22525156  T
Q  474 taaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525157 caaagaggggtagaggtcggaagggagatggttcagggagttctcaggctacacagcctgaggagtcataggtt 22525230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 342 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 97186 - 96983
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  97186 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggctgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgactcagag 97089  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  97088 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggtgagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtca 96989  T
Q  542 caggtt 547  Q
    ||||||    
T  96988 caggtt 96983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 294 - 533
Target Start/End: Original strand, 30890775 - 30891012
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||  |||||||||||||||||||      
T  30890775 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttgt--agatatggccgatcaggactc 30890872  T
Q  394 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 493  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30890873 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaaggagagacagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgg 30890972  T
Q  494 aggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctg 533  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30890973 aggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctg 30891012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 49857448 - 49857281
Alignment:
Q  156 ttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857448 ttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatggtggacataaattttattgcaatgatgattatattgaatgattttaggttat 49857349  T
Q  256 ggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857348 ggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 49857281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19526886 - 19526702
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  19526886 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaaataa 19526789  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526788 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaatgattttaggttatggaaat 19526702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 296 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 49857278 - 49857030
Alignment:
Q  296 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 395  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  49857278 atgtttatgtttagtctaggtttaatgtgttttattaggttatggaaatgatgtttattttttttattttt-tgtgtagatatggccgatcaagacccca 49857180  T
Q  396 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggag 495  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || ||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49857179 ttgatccatctaagatgattggtgataggcgtgtgatgacccaaagccatcggaaggag--gcaaagcgggcacatcctaaagaggggaagaggtcggag 49857082  T
Q  496 gggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  49857081 gggagatggttcagggacttctcaggctacacagcctgaagagtcactggtt 49857030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19527077 - 19526889
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19527077 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgtaaa 19526980  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaat 261  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19526979 ataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaatgattttaagttatggaaat 19526889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 19156851 - 19157028
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19156851 tgtagatatggccgatcatgaccccattgatccatcaaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 19156950  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19156951 atcccaaagaggggtagaggtcggatgggagatggctcaggaagctctcagactacacagcctgaggagtcacaggtt 19157028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 13639243 - 13639065
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggaggg-agaggcagagcggcca 468  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  13639243 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaggggagagacagagcggcca 13639144  T
Q  469 catcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13639143 catcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatgactcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 13639065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19524903 - 19524719
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||     
T  19524903 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatattggacacaaatgattaagt-gtatataaatgatt-aagtgtatgttaaataa 19524806  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaat 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19524805 tgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaatgattttaggttatggaaat 19524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 3731602 - 3731425
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  3731602 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 3731503  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3731502 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 3731425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 26876494 - 26876671
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||    
T  26876494 tgtagatatggccgatcaggaccccatttatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaacgcagggagagacagagtgcccac 26876593  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26876594 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 26876671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 277
Target Start/End: Original strand, 11196268 - 11196424
Alignment:
Q  119 atgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaatttt 218  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  11196268 atgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatg-tttaagtgtatattaattattgaatgatgtttaggttattatggaactaatggacataaatttt 11196365  T
Q  219 attgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgta 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11196366 attgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgta 11196424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 50343256 - 50343088
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  50343256 aatgatgttaattttataattttttctgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtctgcgatgactcagag 50343159  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  50343158 ccaccggagggagcggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcaggga 50343088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19525024 - 19524906
Alignment:
Q  142 tgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaa 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19525024 tgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaa 19524926  T
Q  242 tgattttaggttatggaaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19524925 tgattttaggttatggaaat 19524906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19525685 - 19525567
Alignment:
Q  142 tgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaa 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19525685 tgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaa 19525587  T
Q  242 tgattttaggttatggaaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19525586 tgattttaggttatggaaat 19525567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 396 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38126717 - 38126602
Alignment:
Q  396 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggag 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38126717 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagtgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggag 38126618  T
Q  496 gggagatggttcaggga 512  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38126617 ggg-gatggttcaggga 38126602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 368 - 512
Target Start/End: Original strand, 47656678 - 47656822
Alignment:
Q  368 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 467  Q
    |||||||||||| | |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |    
T  47656678 tgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccagctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagtgggc 47656777  T
Q  468 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  47656778 acatcccaaagaggggaagaggtcggaggtgggatgattcaggga 47656822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 370 - 465
Target Start/End: Original strand, 2366064 - 2366159
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcgg 465  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2366064 tgtagatattgccgatcaggaccccattgatccatctcagatgattggtggtaggcgtgccatgactcatagccaccgtagggagaggcagagcgg 2366159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 429 - 512
Target Start/End: Original strand, 21141748 - 21141831
Alignment:
Q  429 cgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21141748 cgatgacttagagccaccggagggagaggcaaagtggccacatcccaaagaggggtagaggtctgagggtggatggttcaggga 21141831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Original strand, 19925280 - 19925332
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19925280 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 19925332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Original strand, 30890599 - 30890651
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30890599 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 30890651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 327
Target Start/End: Original strand, 30890676 - 30890706
Alignment:
Q  297 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890676 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 30890706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 3976245 - 3976718
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3976245 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 3976343  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3976344 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatggtggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 3976443  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  3976444 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgt 3976541  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3976542 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagtggccaca 3976641  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3976642 tcccaaagaggggtagaggtcggagaggagatggttcagggagctctcaggctacacagactgaggagtcacaggtt 3976718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 50963492 - 50963969
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  50963492 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattga-gtgtacgttaa 50963590  T
Q  171 ttat----tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgt 266  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50963591 ttatatattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatagacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgt 50963690  T
Q  267 tcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50963691 tcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--t 50963788  T
Q  367 gtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggc 466  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50963789 ttgtgtagatatggtcgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagctaccggagggagaggcagagcggc 50963888  T
Q  467 cacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50963889 cacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacaacctgaggagtcacaggtt 50963969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 505
Target Start/End: Original strand, 42165701 - 42166133
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42165701 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 42165799  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42165800 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 42165899  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  42165900 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattatttt-tttgt 42165998  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42165999 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtacgatgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccaca 42166098  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggt 505  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42166099 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggt 42166133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 47073741 - 47073272
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47073741 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 47073643  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47073642 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattctattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 47073543  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||    
T  47073542 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttggtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttagttttattattt--tttgt 47073445  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47073444 gtagatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattggtagtaggtgtgcgatgactcagagtcaccggagggagaggcagagcagccaca 47073345  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47073344 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctaaggagtcaca 47073272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4007853 - 4007469
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4007853 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacaagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattat 4007755  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4007754 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 4007655  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
T  4007654 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtatag 4007557  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagag 462  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4007556 atatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtacgatgactcagagccaccggatggagaggcagag 4007469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 91 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 49268782 - 49268365
Alignment:
Q  91 tttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49268782 tttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacgcaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-atgtgtatgttaattattggatgatgtttaggt 49268685  T
Q  191 tattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtt 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49268684 tattatggaaatgatggacataaattaaattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtt 49268585  T
Q  291 tgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcagga 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49268584 tgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattttgt--gtgtagatatggccgatcagga 49268487  T
Q  391 cctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggt 490  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  49268486 ctccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaacaggggtagaggt 49268387  T
Q  491 cggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  49268386 cggagggtggatggttcaggga 49268365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 75 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 30255532 - 30255064
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30255532 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattat 30255435  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30255434 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatatcgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 30255335  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||    
T  30255334 gtacttttaatgtgttaaatgatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaattt--tttgtgcag 30255237  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||  ||| ||||||||| || || |||||||     
T  30255236 atatgaccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgacccaaagccattggaaggagaggcaaagtgggcacatccc 30255137  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30255136 aaagaagggaagaggtcggaggggagatggttcagggacttctcaggctacacagcctgaagagtcacaggtt 30255064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 174 - 547
Target Start/End: Original strand, 597541 - 597912
Alignment:
Q  174 ttgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  597541 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgt 597640  T
Q  274 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 373  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  597641 tatacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattt--tttgtgta 597738  T
Q  374 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 473  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  597739 gatatggccgaccaggaccccattgatccatctaaaatgatttgtggtaggcgagcgatgacctagagccaccggagggagaggcagagcgcccacatcc 597838  T
Q  474 taaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  597839 caaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttctcaggctacacagcttgaggagtcacaggtt 597912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 75 - 512
Target Start/End: Original strand, 42756694 - 42757128
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42756694 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacgcaaatgattaagtc-tatagaaatgatt-aagcgtatgttaattat 42756791  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42756792 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 42756891  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | |||||||    
T  42756892 gtacttttaatgagttaaaaaatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-ttttattttttgtgtag 42756990  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    ||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||     
T  42756991 atatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagagacaaagcgggcacatccc 42757090  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  42757091 aaagaagggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 42757128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 79 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20917541 - 20917113
Alignment:
Q  79 gtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaa 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20917541 gtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtacagaaatgatt-aagtgtatgttaattattgaa 20917444  T
Q  179 tgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtac 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20917443 tgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgcaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtac 20917344  T
Q  279 ttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatat 378  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||    
T  20917343 ttttaatgtgtttgatcatgcttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatta-gttatggaaatgatgttaattt--tttttttttttgtgtagatat 20917247  T
Q  379 ggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaag 478  Q
    | | ||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  20917246 gtctgataagaacccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaag 20917147  T
Q  479 aggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  20917146 aggggaagaggtcgaagggtggatggttcaggga 20917113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 79 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20926503 - 20926075
Alignment:
Q  79 gtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaa 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20926503 gtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtacagaaatgatt-aagtgtatgttaattattgaa 20926406  T
Q  179 tgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtac 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20926405 tgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgcaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtac 20926306  T
Q  279 ttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatat 378  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||    
T  20926305 ttttaatgtgtttgatcatgcttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatta-gttatggaaatgatgttaattt--tttttttttttgtgtagatat 20926209  T
Q  379 ggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaag 478  Q
    | | ||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  20926208 gtctgataagaacccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaag 20926109  T
Q  479 aggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  20926108 aggggaagaggtcgaagggtggatggttcaggga 20926075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 71 - 435
Target Start/End: Original strand, 48889273 - 48889633
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48889273 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 48889370  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48889371 ttattgaatgcagtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaattattttaggttatggaaatgatgttcat 48889470  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||    
T  48889471 tgctttacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaattt--tttgt 48889568  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgac 435  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48889569 gtagatatggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgac 48889633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 71 - 508
Target Start/End: Original strand, 48563466 - 48563903
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  48563466 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagattacaagaattatgatggacacaaatgattaagt-gcatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 48563563  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48563564 ttattgaatgatgtttatgttattatgaaaatgatgggcataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaagttatggaaatgatgttcat 48563663  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaa--ttttattattttgtgt 368  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  48563664 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaatttttttttt 48563763  T
Q  369 gtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcca 468  Q
    ||||||||||    |||||| ||     | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  48563764 gtgtagatatttatgatcagaactcgggtaatccatctaagatgattggtggtaggcatgcgataactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggca 48563863  T
Q  469 catcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttca 508  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  48563864 catcccaaataggggaagaggtcggagggtggatggttca 48563903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 142 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 50216403 - 50215998
Alignment:
Q  142 tgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaa 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50216403 tgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaaatgatgaataatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgta-tgttgattatattgaa 50216306  T
Q  242 tgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgga 341  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50216305 tgatttaaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttagtgagtttgattatgtttatgtttagtttagatttaatgtgtttgattatgttatgga 50216206  T
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgt--gtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcag 439  Q
    ||||||||||||||| || |||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  50216205 aatgatgttaattttttttttttttttttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaa 50216106  T
Q  440 agccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagt 539  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  || | ||||    
T  50216105 agtcatcggagggacaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagagagttctcaggctacacaatctaaagagt 50216006  T
Q  540 cacaggtt 547  Q
    ||||||||    
T  50216005 cacaggtt 50215998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Original strand, 44230252 - 44230678
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44230252 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 44230349  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  44230350 ttattgaatgatgtttaggttattacggaaattatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcaa 44230449  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |       |||    
T  44230450 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttat-----------gtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttagtttta--aaaaaaattgt 44230536  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44230537 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaaaatgattgctggtcggcgagcaatgactcagagcaaccggagggagaggcaaagcgggcaca 44230636  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  44230637 tcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 44230678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 49195981 - 49195562
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||                    |||||||||| ||    
T  49195981 ttggttaattgtatattgattttttagttagtttagcttacaagaattatgatggacacaaatgatt--------------------aagtgtatgtaaa 49195902  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49195901 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 49195802  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaa-ttttattattttgtgtg 369  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||   ||    
T  49195801 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttttaaaaattt---tg 49195705  T
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    |||||||||| | |||||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||    
T  49195704 tgtagatatgtctgatcagaatccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggaaggagagcgaaagcgggcac 49195605  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  49195604 atcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 49195562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 342 - 547
Target Start/End: Original strand, 36128406 - 36128609
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36128406 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggctgattaggacctcattgattcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcggag 36128503  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36128504 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtca 36128603  T
Q  542 caggtt 547  Q
    ||||||    
T  36128604 caggtt 36128609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 342 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 2274188 - 2273985
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  2274188 aatgatattaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaccccattgattcatctaagatgattgggggtaggcgtgcgataactcagag 2274091  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2274090 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtca 2273991  T
Q  542 caggtt 547  Q
    ||||||    
T  2273990 caggtt 2273985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 79 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42805788 - 42805586
Alignment:
Q  79 gtgtatattgatttttt-agttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattga 177  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42805788 gtgtatattgatttttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattattga 42805691  T
Q  178 atgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgta 277  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42805690 atgatgtttaggttatgatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgta 42805591  T
Q  278 ctttt 282  Q
    |||||    
T  42805590 ctttt 42805586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 368 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 52390629 - 52390451
Alignment:
Q  368 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52390629 tgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgactcagagccaccggagggagaagcagagcggcc 52390530  T
Q  468 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggt 546  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52390529 acatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaaggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggt 52390451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Original strand, 16611891 - 16612090
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16611891 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattagtggtaggcgtgcgatgactcagag 16611988  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16611989 ccaccagaggcagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtacaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctaaggagtca 16612088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22047362 - 22047163
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22047362 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattagtggtaggcgtgcgatgactcagag 22047265  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22047264 ccaccagaggcagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtacaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctaaggagtca 22047165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 54681906 - 54682054
Alignment:
Q  1 ttttatggttccttcccaaccagtgttataatcaccgcaattgattgtgaggtgagaaccaattatcatgttggttaagtgtatattgattttttagtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54681906 ttttatggttccttcccaaccagtgttataatcaccgcaattgattgtgaggtgagaaccaattatcatgttggttaagtgtatattgattttttagtta 54682005  T
Q  101 gtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtataga 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54682006 gtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtataga 54682054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 371 - 547
Target Start/End: Original strand, 29009712 - 29009888
Alignment:
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29009712 gtagatatggccgatcaggaccccattgatcaatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagcggccaca 29009811  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29009812 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 29009888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 42903411 - 42903234
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  42903411 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 42903312  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42903311 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 42903234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 49143684 - 49143507
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  49143684 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 49143585  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49143584 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 49143507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 34046227 - 34046404
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  34046227 tgtagatatggccgatcaggaccccattaatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 34046326  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34046327 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 34046404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 50480028 - 50479851
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  50480028 tgtagatatgaccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 50479929  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50479928 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 50479851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 46389802 - 46389979
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  46389802 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcatgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 46389901  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46389902 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 46389979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 46701247 - 46701070
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  46701247 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 46701148  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46701147 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagtctgaggagtcacaggtt 46701070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 54386975 - 54387152
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||    
T  54386975 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcggggagagacagagtgcccac 54387074  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54387075 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatgactcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 54387152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 20351413 - 20351581
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20351413 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgataaggaccccgttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 20351510  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  20351511 ccacctgagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 20351581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17567361 - 17567192
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtgg-taggcgttcgatgactcaga 440  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  17567361 aatgatgttaattttataattttttgtgt--agatatggccgatcagaaccccattgatccatctaagatgattggggggtaggcgtgcgatgactcaga 17567264  T
Q  441 gccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17567263 gccaccggagggagagtcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcaggga 17567192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 41613142 - 41613310
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41613142 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccaatcaggaccccattgatccacccaagatgattggtggtaggcctgcgatgactcagag 41613239  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  41613240 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggatggtggatagttcaggga 41613310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 225 - 341
Target Start/End: Original strand, 54682060 - 54682171
Alignment:
Q  225 atgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54682060 atgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtac-----atgagtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaatgtg 54682154  T
Q  325 tttgattaggttatgga 341  Q
    |||||||||||||||||    
T  54682155 tttgattaggttatgga 54682171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 485 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 4007472 - 4007411
Alignment:
Q  485 agaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007472 agaggtcgg-ggggagatggttcagggagctctctggctacacagcctgaggagtcacaggtt 4007411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 475 - 543
Target Start/End: Original strand, 48889636 - 48889704
Alignment:
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  48889636 aaagaggggaagaggtcggaggagagatggttcagggacttctcaggctacacagtctgacgagtcaca 48889704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 43212044 - 43212517
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43212044 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 43212142  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43212143 ttattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 43212242  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | |||    
T  43212243 tgttgtgcttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaagatgatgttaattttattattt--tttgt 43212340  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212341 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 43212440  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212441 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 43212517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 39252541 - 39253011
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39252541 ttggtcaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatc-aagtgtatgttaa 39252639  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39252640 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatatt-aatgattttaggttatggaaatgatgttcat 39252738  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  39252739 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtg--- 39252835  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39252836 -tagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtagacgtgcaatgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccaca 39252934  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252935 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 39253011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15036262 - 15035789
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15036262 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 15036164  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15036163 ttattgaatgatgtttaggttattatcgaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 15036064  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | |    
T  15036063 tgttgtacttttaatcagtttgattttgtttatgtttagtttaggttgaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatattaattttatt-ttttgt-ttt 15035966  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15035965 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 15035866  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15035865 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacaacatgaggagtcacaggtt 15035789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39938746 - 39938284
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  39938746 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaag--gtatagaaatgatt-aagtgtgtgttaattaa 39938650  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39938649 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggaaataaattttattgtaatgttgattatattgaatgaatttaggttatggaaatgatgttcattgtt 39938550  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  39938549 gtacttttaatgagtttgcttatgtttatgtttagtttatgtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtag 39938452  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  39938451 ata-ggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgtgatgactcagagtcaccggagggagaggtagagcggccacgtccc 39938353  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39938352 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcaca 39938284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 75 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 41249619 - 41249169
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                    ||||||||||||||||     
T  41249619 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatgatggacacaaatgatt--------------------aagtgtatgttaattaa 41249540  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  41249539 tgagtgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgct 41249440  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  41249439 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttaattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtag 41249342  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41249341 atatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggagggagaggcagagcggccacatccc 41249242  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41249241 aaagagaggtagaggtcggaggggagatagttcagggagttctcaggctacacagcttgaggagtcacaggtt 41249169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34822551 - 34822112
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgatttttt-agttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgtta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34822551 ttggttaagtgtatattgatttttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgtta 34822454  T
Q  170 attattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34822453 attattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttca 34822354  T
Q  270 ttgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtg 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |     
T  34822353 ttgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatttgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-taattttgtttt 34822255  T
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    |||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  34822254 tgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgatatgtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcac 34822155  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  34822154 atcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 34822112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 71 - 473
Target Start/End: Original strand, 45064769 - 45065170
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45064769 ttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttaggagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 45064867  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45064868 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttattgtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 45064967  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttat-----gtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg 365  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  45064968 tgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatagaaatgatgttaatttttttttttt- 45065066  T
Q  366 tgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcgg 465  Q
        |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45065067 ----tgtagatatggctgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagtcaccggagggagaggcagagcgg 45065162  T
Q  466 ccacatcc 473  Q
    ||||||||    
T  45065163 ccacatcc 45065170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39846520 - 39846094
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39846520 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag-------------tgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 39846436  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39846435 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacatacattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 39846336  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  39846335 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatttgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgt 39846238  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagg--gagaggcagagcggcca 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  39846237 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcaatgactcagagccatcggaggaagagaggcaaagcggcca 39846138  T
Q  469 catcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||    
T  39846137 catcccaaagaggggtaaaggtcgtagtgtggatggttcaggga 39846094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 75 - 513
Target Start/End: Original strand, 43188592 - 43189025
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43188592 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggaaacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattat 43188689  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43188690 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatgaacataaattttattgtaatgatgattattttgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcattgtt 43188789  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||  | |||| ||    
T  43188790 gtactttcaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaataatgttaattttttaattt--tttgtgaag 43188887  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||     
T  43188888 atatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcaatgactcagagcca-gggatggagaggcaaagcggccacatccc 43188986  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaa 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  43188987 aaagaagggtagaggtcggagggtggatggttcatggaa 43189025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 40076793 - 40076353
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40076793 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaataattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 40076696  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40076695 ttattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 40076596  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaa-ttttattattttgtgtg 369  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||    
T  40076595 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttttttttttttttttg 40076496  T
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    |||||||||| | |||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| | |||    
T  40076495 tgtagatatgtctgatcagaatctggttgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgtgatgactcaaagccaccgaaaggagaggcaaagcaggcac 40076396  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    || | ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  40076395 attccaaataggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 40076353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 217 - 547
Target Start/End: Original strand, 39602271 - 39602599
Alignment:
Q  217 ttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602271 ttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggt 39602370  T
Q  317 ttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattg 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39602371 ttaatgtgtttgattaggttatcgaaatgatgttaattttattattttttgtgt--aggtatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattg 39602468  T
Q  417 gtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactc 516  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  39602469 gtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttaagggagctc 39602568  T
Q  517 tcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39602569 tcaggctacacagcctgaggagtcaaaggtt 39602599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5303755 - 5303336
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                    |||||||||||||    
T  5303755 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatt--------------------aagtgtatgttaa 5303676  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  5303675 ttattgaaagatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattaaattgaatgattttaagttacggaaatgatgttcat 5303576  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||  | |||    
T  5303575 tgttgtacttttaatatgtttgattatgtttatgtttagttttggtttaatgtgtttgattagcttatggaaatgatgttaaatttttaattt--tttgt 5303478  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| | |||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5303477 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatctatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcaca 5303378  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||| | | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  5303377 tcccaaagatgagaagaggtcggagggtggatggttcaggga 5303336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 294 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 42484894 - 42484644
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |   |||||||||||||||||||||||     
T  42484894 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattatgttattgaaatgatgttaatttttttttttttt---tgtagatatggccgatcaggaccc 42484798  T
Q  394 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 493  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42484797 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagaacggccacatcccaaagaggggtagaggtcgg 42484698  T
Q  494 aggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42484697 aggggagatggctcaggaagctctcaagctacacagcctgaggagtcacaggtt 42484644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 287 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 489024 - 488763
Alignment:
Q  287 agtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccga 384  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | | |||||||||||||||    
T  489024 agtttaattaggtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatattaatttt-ttatttttattttttgtagatatggccga 488926  T
Q  385 tcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggt 484  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  488925 tcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccacatcccaaagaggggt 488826  T
Q  485 agaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  488825 agaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 488763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 342 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 34369802 - 34369617
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34369802 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgattaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 34369705  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacag 529  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34369704 tcaccggagggagaggcagagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacag 34369617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 342 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 34371130 - 34370945
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34371130 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgattaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 34371033  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacag 529  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34371032 tcaccggagggagaggcagagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacag 34370945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 1053376 - 1053553
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  1053376 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 1053475  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1053476 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 1053553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 23021542 - 23021365
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  23021542 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 23021443  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23021442 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 23021365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 26660298 - 26660475
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  26660298 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 26660397  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26660398 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 26660475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 24759 - 24582
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  24759 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 24660  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatgactcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 24582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 20858071 - 20858239
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20858071 aatgatgttaattttataaatttttgtg--tagatatggccgatcagaaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 20858168  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  20858169 ccaccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaagaggggaagaggtcggagagtggatggttcaggga 20858239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 322 - 512
Target Start/End: Original strand, 37327612 - 37327799
Alignment:
Q  322 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  || | |||||||||||| | || || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  37327612 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtaaattttttaa--ttatttgtgtagatatgtctgagcatgacccgattgatccatctaagatgattggtgat 37327709  T
Q  422 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37327710 aggcgtgcgatgactcagagtcatcggaaagagaggcaaag-gggcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatggttcaggga 37327799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 534
Target Start/End: Original strand, 2984874 - 2985118
Alignment:
Q  296 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggac---- 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||| | |||||||||        
T  2984874 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-taattt--tttgtgtagatatgtctgatcaggaccagg 2984970  T
Q  392 -----ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtag 486  Q
         || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||| | || | ||||| | | ||  || || |  |||||||| ||    
T  2984971 ggcagctgattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtggtatgacacaaagccatcagaagaagaggaaaaacgcacaaataccgaagaggggaag 2985070  T
Q  487 aggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctga 534  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  2985071 aggtcggaggggggatggttcagggacttcttaggctacacagcctga 2985118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 368 - 512
Target Start/End: Original strand, 35552475 - 35552619
Alignment:
Q  368 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 467  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |    
T  35552475 tgtgtagatatgtctgatcagaacctggttgatccatctaagatgattggtggtagacgtgcgatgactcaaagccaccggaagaagaggcaaagcgggc 35552574  T
Q  468 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  35552575 acatcccaaagaggggaagaggtcggaggggggatggttcaggga 35552619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 308
Target Start/End: Original strand, 2984721 - 2984850
Alignment:
Q  176 gaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttg 275  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||       
T  2984721 gaatgatgtttaggttatgatggaaatgatgcacacaaattatattgaaatgatgattatatggaatggttttaggttatggaaatgatgttcattgg-- 2984818  T
Q  276 tacttttaatgagtttgattatgtttatgttta 308  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2984819 -aattttaatgtgtttgattatgtttatgttta 2984850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 523
Target Start/End: Original strand, 5677896 - 5678024
Alignment:
Q  395 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||| | |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5677896 attgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggtaaagcgggaacatcccaaagaggggaagaggtcgga 5677995  T
Q  495 ggggagatggttcagggaactctcaggct 523  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  5677996 ggggggatggttcaaggatttctcaggct 5678024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 395 - 510
Target Start/End: Original strand, 45128576 - 45128692
Alignment:
Q  395 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  45128576 attgatccatctaagatgattggtgataggcgtgagatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaggcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcaga 45128675  T
Q  495 ggggag-atggttcagg 510  Q
    |||| | ||||||||||    
T  45128676 ggggggaatggttcagg 45128692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Original strand, 37327300 - 37327381
Alignment:
Q  172 tattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 253  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37327300 tattcaataatgtttatgttatgatggaaatgatgcacataaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 37327381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 489164 - 489112
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  489164 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 489112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42485064 - 42485012
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42485064 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 42485012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 350
Target Start/End: Original strand, 45128489 - 45128530
Alignment:
Q  309 gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 350  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45128489 gtttatgtttaatgtttttgattaggttatggaaatgatgtt 45128530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 489087 - 489057
Alignment:
Q  297 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  489087 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 489057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Original strand, 37327264 - 37327300
Alignment:
Q  84 tattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37327264 tattgattatttagttagtttaggttatgagaattat 37327300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42484985 - 42484957
Alignment:
Q  299 tttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42484985 tttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 42484957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 82 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 37021601 - 37021139
Alignment:
Q  82 tatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatga 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37021601 tatattaattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattattgaatga 37021503  T
Q  182 tgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37021502 tgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattataatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttt 37021403  T
Q  282 taatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggc 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37021402 taatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtttattttattattt--tttgtgtagatatggc 37021305  T
Q  382 cgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagagg 481  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37021304 cgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccatcggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagg 37021205  T
Q  482 ggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021204 ggtagaggtcagaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 37021139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21022423 - 21021953
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21022423 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 21022325  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21022324 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 21022225  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |    
T  21022224 tgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattattt--ttttt 21022127  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022126 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 21022027  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacag 544  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21022026 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggaagctctcagactacacagcctgaggagacacag 21021953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 40357815 - 40357342
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40357815 ttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaagttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 40357717  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  40357716 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattaaatgattttaggttatcgaaatgatgttcgt 40357617  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |    
T  40357616 tgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattattt--ttttt 40357519  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40357518 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatggctcagggccactgcagggagaggcagagcggccaca 40357419  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357418 tcccaaagaggggtagaggtcggagggcagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 40357342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 543
Target Start/End: Original strand, 50902018 - 50902475
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  50902018 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 50902115  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50902116 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 50902215  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | | |    
T  50902216 tgttgtacttttaatgagtttgattat-----------gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatagaaatgatgttaatcttattattt--ttttt 50902302  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  50902303 gtagatatgaccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaagcgtgcgatgactcagagccaccagagggagaggcaaagcagccaca 50902402  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50902403 tcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggacttctcaggatacacagcctgaagagtcaca 50902475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 50275273 - 50275727
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||                    |||||||||||||    
T  50275273 ttggttaaatgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattatgatggacacaaatgatt--------------------aagtgtatgttaa 50275352  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50275353 ataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 50275452  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  50275453 tgttgtacttttaatgagtttgattatgttcatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgt 50275550  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50275551 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggttggcgtgcgatgacccaaagccattggagggagaggcagagcggccaca 50275650  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  50275651 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttctcatgctacacagcctgaagcgtcacaggtt 50275727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 74 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 55407318 - 55406884
Alignment:
Q  74 gttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaatta 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55407318 gttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaatta 55407221  T
Q  174 ttgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 273  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55407220 ttgaatgatgtttaggttattgtggaaattattgacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgt 55407121  T
Q  274 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||    
T  55407120 tgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-taaatttttg-gtgta 55407023  T
Q  374 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 473  Q
    |||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  55407022 gatatgtctgatcagaacccatttgatccatctaagatgattgctggtaggtgtgcgatgactcagagccaccggaaggagaggcaaatcgggcacatcc 55406923  T
Q  474 taaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
     ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  55406922 caaagatgggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 55406884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Original strand, 51683741 - 51684178
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51683741 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 51683838  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51683839 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaagttatggaaatgatgttcat 51683938  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  | | |    
T  51683939 tgttgtacttttagtgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtatttgattaggttatggaaatgatgttaaatttttaattt--tttat 51684036  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||| || || | ||    
T  51684037 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagctaccgaaaggagaggcaaagtgggcgca 51684136  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  51684137 tcccaaagaggggaagaggtcagagggtggatggttcaggga 51684178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 48256105 - 48255758
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48256105 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacagatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 48256008  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  48256007 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcgt 48255908  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||    
T  48255907 tgttgtacttttaacgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaattt--tttgt 48255810  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtag 423  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48255809 gtatatatggccgatcaggacc-cattgatccatctaagatgattggtggtag 48255758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 263 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1089069 - 1088785
Alignment:
Q  263 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattatt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  1089069 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaatttttttttt 1088970  T
Q  363 ttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagag 462  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1088969 ttttttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagag 1088870  T
Q  463 cggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1088869 cagccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 1088785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 294 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 30726105 - 30725853
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  30726105 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaatttttttttttttttt-tgtagatatggccgatcaggaccc 30726007  T
Q  394 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 493  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30726006 cattgatccatcgaagataattggtggtaggcgcgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgg 30725907  T
Q  494 aggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30725906 aggggagttggctcaggaagctctcaggctacacagcctgacgagtcacaggtt 30725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 304 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1308456 - 1308215
Alignment:
Q  304 gtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatcca 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1308456 gtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattattttttttgt--agatatggtcgatcaggaccccattgatcca 1308359  T
Q  404 tctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 503  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1308358 tcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagcggccacatcccaaagaggggtagaagtcggaggggagatg 1308259  T
Q  504 gttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1308258 gctcaggaagctctcaggctacacagcctgaagagtcacaggtt 1308215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 82 - 323
Target Start/End: Original strand, 68070 - 68306
Alignment:
Q  82 tatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatga 181  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  68070 tatattgattatttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattattgaatga 68167  T
Q  182 tgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttt 281  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  68168 tgtttaggttatgatggaaatgatggacacaaattttattgtaataatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttca---ttgtacttt 68264  T
Q  282 taatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  68265 taatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaatgt 68306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 342 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 44679322 - 44679119
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  44679322 aatgatgttaattttattattttttatgt--agatattgccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtagtaggcatgcgatgactcagag 44679225  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44679224 ccaccggagggagaggcagagtggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtca 44679125  T
Q  542 caggtt 547  Q
    ||||||    
T  44679124 caggtt 44679119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 342 - 533
Target Start/End: Original strand, 3184802 - 3184991
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3184802 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggccaatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtatgcgtgcgatgactcagag 3184899  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctg 533  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3184900 ccaccggagggagagacagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcagaggggagatggttcagggagctctcatgctacacagcctg 3184991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 41798216 - 41798039
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41798216 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccac 41798117  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41798116 atcccaaagaggggtagaggtcgaagaggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 41798039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 6181011 - 6180834
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  6181011 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 6180912  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180911 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 6180834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 31422540 - 31422717
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  31422540 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagtcaccgcagggagagacagagtgcccac 31422639  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422640 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatgactcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 31422717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 49165885 - 49166062
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  49165885 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccttcgaagatgattggtggtaggcgtgccataactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 49165984  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49165985 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggccacacagcctgaggagtcacaggtt 49166062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 49091272 - 49091449
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||||    
T  49091272 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaaggagagacagattgcccac 49091371  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49091372 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcagaaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 49091449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 50194264 - 50194432
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50194264 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatgaccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtacgatgactcagag 50194361  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  50194362 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 50194432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 322 - 540
Target Start/End: Original strand, 46436990 - 46437203
Alignment:
Q  322 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 421  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||  || ||||||||||||   || ||||     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46436990 gtgtttgattcggttatggaaatgatgtaaattttttaatt--gtttgtgtagatatgtttgagcaggcg---attgatctatctaagatgattggtggt 46437084  T
Q  422 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcagg 521  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||    
T  46437085 aggcgtgcgatgactcagagctaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatgattcagggacttcttagg 46437184  T
Q  522 ctacacagcctgaggagtc 540  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  46437185 ctacatagcctgaagagtc 46437203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 395 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 11083225 - 11083074
Alignment:
Q  395 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11083225 attgatccatctaagatgattggtggtaggagtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggcagaggtcaga 11083126  T
Q  495 ggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggt 546  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11083125 ggggggatggttcagggacttctcaggctacacaacctgatgagtcacaggt 11083074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 370 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 9892499 - 9892387
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9892499 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgtcatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccac 9892400  T
Q  470 atcctaaagaggg 482  Q
    |||| ||||||||    
T  9892399 atcccaaagaggg 9892387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 342 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3185122 - 3185018
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3185122 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccaatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtatgcgtgcgatgactcagag 3185025  T
Q  442 ccaccgg 448  Q
    |||||||    
T  3185024 ccaccgg 3185018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 368 - 512
Target Start/End: Original strand, 30704833 - 30704977
Alignment:
Q  368 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 467  Q
    |||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| | ||||||||| ||||| |    
T  30704833 tgtgtagatatgtctgatcagaacccaattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgttgactcaaaaccaccgaaaggagaggcaaagcgggc 30704932  T
Q  468 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  30704933 acatcccaaagaggggaagacgtgggaggggggatggttcaggga 30704977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11049892 - 11049726
Alignment:
Q  296 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggac---- 391  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||   |||||||||||| | |||||||||        
T  11049892 atgtttatgttcagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtgaattttttaatttt---tgtgtagatatgtctgatcaggaccagg 11049796  T
Q  392 -----ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagag 456  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||||||    
T  11049795 ggcaacccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgctatgacacaaagccaccgaaaggagag 11049726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 395 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 41932869 - 41932754
Alignment:
Q  395 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41932869 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaggcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 41932770  T
Q  495 ggggagatggttcagg 510  Q
    |||| |||| ||||||    
T  41932769 ggggggatgtttcagg 41932754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10752759 - 10752540
Alignment:
Q  296 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctc- 394  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||  ||||||| | ||||| ||||       
T  10752759 atgtttatgtttaatctaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttttaaatttttgtgt--agatatgtctgatcaagaccaag 10752662  T
Q  395 --------attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtag 486  Q
            | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  10752661 ggccaccgactgatccatctaagatgatcggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccatcagaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaag 10752562  T
Q  487 aggtcggaggggagatggttca 508  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  10752561 atgtcggaggggggatggttca 10752540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10966528 - 10966309
Alignment:
Q  296 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctc- 394  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||  ||||||| | ||||| ||||       
T  10966528 atgtttatgtttaatctaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttttaaatttttgtgt--agatatgtctgatcaagaccaag 10966431  T
Q  395 --------attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtag 486  Q
            | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  10966430 ggccaccgactgatccatctaagatgatcggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccatcagaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaag 10966331  T
Q  487 aggtcggaggggagatggttca 508  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  10966330 atgtcggaggggggatggttca 10966309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 296 - 427
Target Start/End: Original strand, 14316131 - 14316252
Alignment:
Q  296 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||| | ||||||||||  |    
T  14316131 atgtttatgtttagtctaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattt----------tttgtgtagatatgtctgatcaggaccgga 14316220  T
Q  396 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgt 427  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14316221 ttgatctatctgagatgattggtggtaggcgt 14316252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 50022841 - 50022741
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  50022841 aatgatgttaattttataattttttgtgt--agatatgaccgatcaggaccccattgatccatttaagatgattggtggtaggcgtgcaatgactcaaag 50022744  T
Q  442 cca 444  Q
    |||    
T  50022743 cca 50022741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21537958 - 21537868
Alignment:
Q  183 gtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 273  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21537958 gtttaggttatgatggaaatgatgcacacaaattatattgaaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgtttattgt 21537868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30726226 - 30726162
Alignment:
Q  263 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726226 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 30726162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11050012 - 11049916
Alignment:
Q  209 cataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgttta 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11050012 cataaattatattgtaatgatgatgatatggactagttttaggttatggaaatgatgttca---ttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgttta 11049916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 395 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21537683 - 21537535
Alignment:
Q  395 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 494  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||| || ||||||| | | ||  || ||    || ||||  ||||||||||    
T  21537683 attgatccatctaagataattggtggtaggcgtgctatgacacaaagtcaccagaaggagaggaaaaacgcacatatatcgaatagggaaagaggtcgga 21537584  T
Q  495 ggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21537583 ggggggatggttcagggatttctcaggctacacaacctgaagagtcaca 21537535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Original strand, 46436761 - 46436842
Alignment:
Q  172 tattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 253  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46436761 tattgaatgatgtttatgttatgatggaaattatacacagaaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 46436842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10752810 - 10752761
Alignment:
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 324  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752810 gtacttataatttgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 10752761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10966579 - 10966530
Alignment:
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 324  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966579 gtacttataatttgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 10966530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1089119 - 1089067
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1089119 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 1089067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1308649 - 1308597
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1308649 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 1308597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30726276 - 30726224
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30726276 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 30726224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1308572 - 1308542
Alignment:
Q  297 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308572 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 1308542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21537799 - 21537762
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatta 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537799 ttatgttta-gtttagtttaggtttaatgtgtttgatta 21537762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 529
Target Start/End: Original strand, 14316307 - 14316360
Alignment:
Q  476 aagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacag 529  Q
    |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14316307 aagaggggaaaaggtcagaggggggatggttcagggacttctcaggctacacag 14316360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41932967 - 41932915
Alignment:
Q  298 gtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 350  Q
    |||||||||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41932967 gtttatgttatgtttaggtataacgttttttattaggttatggaaatgatgtt 41932915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 120
Target Start/End: Original strand, 46436725 - 46436761
Alignment:
Q  84 tattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  46436725 tattgattatttagttagtttaggttatgagaattat 46436761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 17835615 - 17836088
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17835615 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttat 17835713  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17835714 ttattgaataatatttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 17835813  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  17835814 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgt 17835911  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17835912 gtagatatggtcgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggaggaagaggcagagcgaccaca 17836011  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17836012 tcgcaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttgggggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 17836088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 547
Target Start/End: Original strand, 34738909 - 34739375
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  34738909 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaagttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaaataa 34739006  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||    
T  34739007 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatattgattatattgaatgatt--aggttatggaaatgatgttcatcgtt 34739104  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |     
T  34739105 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttttgtgt--aa 34739202  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  34739203 atatggccgatcaggaccccgttgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccagagggagaggcagagcggccacattcc 34739302  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34739303 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagttctcaggctacacagcctgaagagtcacaggtt 34739375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27453153 - 27452715
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27453153 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 27453056  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27453055 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatgaacataaattttattttaatgatgattatattgaatgatttttggttatggaaatgatgttcat 27452956  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27452955 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaatgtgtttgattaggttttggaaatgatgttaattttattatttt-tttgt 27452857  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27452856 atagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtgttaggcgtgtaatgactcagagccaccagagggagaggcaaagcggccaca 27452757  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  27452756 tcccaaaaaggggtagagatcggagggtggatggttcaggga 27452715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9494326 - 9493867
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9494326 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattat 9494229  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9494228 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 9494129  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||    
T  9494128 gtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttagatttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattt----------tttgtgtag 9494039  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  9494038 atatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatccc 9493939  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggt 546  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  9493938 aaagaggggaagaggtcgatggggagatggttcagggagttctcagactaaacagcctgaagagtcacaggt 9493867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Original strand, 37340843 - 37341281
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  37340843 ttggttaagagtatattaatttgttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtgtagaaatgatt-aagtgtatgttaa 37340940  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37340941 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 37341040  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||    
T  37341041 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-ttaatttttttgt 37341139  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  37341140 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaagcgtgcgatgactcaaagccaccggaagcagaggcaaagcgggcaca 37341239  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37341240 tcccaaagaggggaagaggtcgaaggggggatggttcaggga 37341281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 185 - 547
Target Start/End: Original strand, 10517546 - 10517906
Alignment:
Q  185 ttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaa 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10517546 ttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgaaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgaggttcattgttgtacttttaa 10517645  T
Q  285 tgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  10517646 tgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccga 10517743  T
Q  385 tcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggt 484  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10517744 tcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactgagagccaccatagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 10517843  T
Q  485 agaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517844 agaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 10517906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 71 - 543
Target Start/End: Original strand, 36978137 - 36978586
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36978137 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacagatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatattaa 36978234  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36978235 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataatttttattgtaatgatgattatgttgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcat 36978334  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | |||    
T  36978335 tgttgtac-tttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgcaaatgatgttaattttttaattt--tttgt 36978431  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||   ||||||||  |||||| || ||||||||||  |||||||| |||           
T  36978432 gtagatatggccgatcaggaccccattgatctatccaagatgattgacagtaggcgtgtgatgacccaaagccaccggaatgagaggcaaagc------- 36978524  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36978525 -----------ggaagaggtcggaggggagatggttcagggatttctcaggctacacagcctgaagagtcaca 36978586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 47672615 - 47672271
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47672615 ttaagtgtatattgattttctagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagta-tatagaaatgatt-aagtgtatgttaattat 47672518  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    |||||||||||| |          |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47672517 tgaatgatgtttgg----------aaatgatgaacataaattttattgtaatgatgattatatttaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgtt 47672428  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||    
T  47672427 gtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttataattt--tttgtgtag 47672330  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatg 433  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47672329 atatggccgatcaataccccattgatccatctaagatgattggttgtaggcgtgcgatg 47672271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 294 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15073582 - 15073329
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  15073582 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttttgtagatatggccgatcaggaccc 15073483  T
Q  394 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 493  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15073482 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgg 15073383  T
Q  494 aggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15073382 aggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcataggtt 15073329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 294 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 42507391 - 42507142
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| |||||||||||     
T  42507391 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttttgtagatatggtcgatcaggaccc 42507292  T
Q  394 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 493  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  42507291 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgcgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcag 42507192  T
Q  494 aggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcaca 543  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507191 aggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcaca 42507142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Original strand, 47776874 - 47777082
Alignment:
Q  72 tggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaat 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47776874 tggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatgaacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaat 47776971  T
Q  172 tattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcatt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  47776972 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgtttatt 47777071  T
Q  272 gttgtactttt 282  Q
    |||||||||||    
T  47777072 gttgtactttt 47777082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 46739777 - 46739578
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46739777 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgaatcagag 46739680  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46739679 ccaccggagggagagacagagcggccacatcccaaagcggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtca 46739580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 17462526 - 17462349
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17462526 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 17462427  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462426 attccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 17462349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 17590688 - 17590865
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17590688 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 17590787  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590788 attccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 17590865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 252 - 512
Target Start/End: Original strand, 39461169 - 39461434
Alignment:
Q  252 ttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtta 351  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461169 ttatggaaatgatgttcattgtcgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgtta 39461268  T
Q  352 attt-----tattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccacc 446  Q
    ||||     ||  ||      |||||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39461269 atttaaaaataaaataaaaattgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgagcgatgactcagagccacc 39461368  T
Q  447 ggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||  ||| |||||||||    
T  39461369 ggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaaaaggggaaaaggtcggagggtggattgttcaggga 39461434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 41881342 - 41881519
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  41881342 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 41881441  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41881442 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 41881519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 48404209 - 48404386
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  48404209 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 48404308  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48404309 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 48404386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 9370611 - 9370434
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  9370611 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 9370512  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9370511 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatgactcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 9370434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 16677837 - 16678005
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16677837 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccattgatgcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 16677934  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  16677935 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 16678005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 17652073 - 17652241
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17652073 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccattgatgcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 17652170  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17652171 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 17652241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 19798081 - 19798249
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19798081 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccatcgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 19798178  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19798179 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggatggtggatggttcaggga 19798249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 35609647 - 35609470
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | | ||    
T  35609647 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcctac 35609548  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35609547 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcataggtt 35609470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14689592 - 14689405
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |       | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14689592 ttggttaagtgtatattgattatttagttagtttatgttatg-------taatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 14689502  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgtt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  14689501 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattatattgattgatttgaggttatggaaatgatgtt 14689405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5540838 - 5540671
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5540838 aatgatgttaattttataattttttctgt--agatatggccgatcaggccc-cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 5540742  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5540741 ccaccggagggagaggaaaagtggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcaggga 5540671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 330 - 512
Target Start/End: Original strand, 47777047 - 47777227
Alignment:
Q  330 ttaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  || ||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47777047 ttaggttatggaaatgatgtttattgttgtactt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccctattgatccatctaagatgattggtggtaggcatgc 47777144  T
Q  430 gatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47777145 aatgactcaaagctaccggagcgagaggcaaagcggccacatcccaaagagaggtagaggtcggagggtggatggttcaggga 47777227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 368 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 14689397 - 14689238
Alignment:
Q  368 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 467  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| || ||||||||| ||||| |    
T  14689397 tgtgaagatatggccgatcatgaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgtgatgacccaaaaccaccagaaggagaggcaaagcgggc 14689298  T
Q  468 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacaca 528  Q
    |||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14689297 acatcc-aaaaaagggaagagatcggaggggagatggttcagggacttctcaggctacaca 14689238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42507512 - 42507448
Alignment:
Q  263 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507512 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 42507448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Original strand, 39461067 - 39461133
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatt 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39461067 ttggttaagtgtatattgatgttttagttagtttaggttacaagaattatgatggacacaaatgatt 39461133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 556202 - 556121
Alignment:
Q  172 tattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  556202 tattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgttgcacacaaattatattgaaatgatgattatattgaatgattttaggtt 556121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 470 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 47672260 - 47672183
Alignment:
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47672260 atcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggtttagggagttctcaggctacacagcctgaagagtcacaggtt 47672183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15073713 - 15073649
Alignment:
Q  263 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15073713 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggttgaatgtgttt 15073649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Original strand, 39461132 - 39461182
Alignment:
Q  156 ttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39461132 ttaagtgtatgttaattattgaatgatatttaggttattatggaaatgatg 39461182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15073763 - 15073711
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15073763 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 15073711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42507562 - 42507510
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42507562 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 42507510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 101
Target Start/End: Original strand, 10517519 - 10517549
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517519 ttggttaagtgtatattgattttttagttag 10517549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 8580040 - 8579567
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8580040 ttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattacgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 8579942  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8579941 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttattgtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 8579842  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | |    
T  8579841 tgttgtacttttaatgagtttgattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtttatttttttattt--ttttt 8579744  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8579743 gtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccgaagggagaggcagagcggccaca 8579644  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8579643 tcccagagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 8579567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 7757863 - 7758317
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7757863 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 7757961  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7757962 ttattgaatgatgtttagattattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcgt 7758061  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  7758062 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagt-------------------ttaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgt 7758140  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7758141 gtagatatggccgatcaggactccattgatcgatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcgaca 7758240  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7758241 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcataggtt 7758317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 42942020 - 42941554
Alignment:
Q  72 tggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaat 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  42942020 tggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aattgtatgttaat 42941923  T
Q  172 tattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcatt 271  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  42941922 tattgaaggatgtttagattattgtggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcatc 42941823  T
Q  272 gttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||     
T  42941822 gttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaaatgatgttaatttttttaattt-tttgta 42941724  T
Q  372 tagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacat 471  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  42941723 tacatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgtgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacat 42941624  T
Q  472 cctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    || ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42941623 cccaaagaggggaagaggttggagaggagatggttcagggacttctcaggctacacagcatgaagagtca 42941554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 75 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 8701754 - 8701282
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattat 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8701754 ttaagtgtatattgattgtttagttagtttaggttatgaaaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattat 8701657  T
Q  175 tgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgtt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8701656 tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaataatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatattcattgtt 8701557  T
Q  275 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtag 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  8701556 gtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaatttt-ttaatttttttgtgtag 8701458  T
Q  375 atatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcct 474  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  8701457 atatgaccgatcaggaccccattgatcaatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacctaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcca 8701358  T
Q  475 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggc---tacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  8701357 aaagaggggaagaggtcggaggggatatggttcagggacttctcaggctgttacacagcctgaagagtcacaggtt 8701282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 142 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 14259 - 13858
Alignment:
Q  142 tgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaa 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14259 tgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatcgaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattaaa 14161  T
Q  242 tgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgga 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14160 tgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttcgattttgtttatgtttagtttaggtttaatgcgtttgattaggttatgga 14061  T
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14060 aatgatgttaatttttttttttt---tttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacacagag 13964  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13963 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaatggtagaggtcggaggggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtca 13864  T
Q  542 caggtt 547  Q
    ||||||    
T  13863 caggtt 13858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 28877181 - 28877652
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28877181 ttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 28877279  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28877280 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttcaggttatggaaatgatgttcat 28877379  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||  | | |    
T  28877380 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaatgtgtttgattagattatggaaatgatgttaaatttttaattt--tttat 28877477  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| | ||||||  ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28877478 gtagatatgtctgatcagatcccggttgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgattcagagccaccgcagggagaggcagagtggccaca 28877577  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||   |||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  28877578 tcccaaaaaggggtagaggtcggagggtggatggctcaggatgctctcaggc--cacagcctgaagagtcacaggtt 28877652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 38968637 - 38969110
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38968637 ttggttaagtgtatattgtttttttggttagtttaggttacgggaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 38968734  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38968735 ttattgaatgaggtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgaagattatattcaatgattttaggttatggaaatgatgttcat 38968834  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | |||    
T  38968835 tgttgtacttttaatgtgattgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaagttatggaaatgatgttaaattttttaattt-tttgt 38968933  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||  |||||||  || || ||||    
T  38968934 ttagatatggccgatcaggaccccattgatccatttaagatgattggtggtaggcgtgcgaagacccaaagccaccagaaagagaggctaagtgggcaca 38969033  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38969034 tcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcagggacttcttaggctacacagcctgaagagtcacaggtt 38969110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 71 - 512
Target Start/End: Original strand, 42537688 - 42538125
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42537688 ttggttaagtgtatattgattttttagttagttaaggttacgagaattatgatgaacacaaatgattaagt-gtatataaatgatt-aagtgtatgttaa 42537785  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  42537786 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatcttattgtaatgatgaatatattgaatgattttaagttatgaaaatgatgttcat 42537885  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  | |||    
T  42537886 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatcttttaattt--tttgt 42537983  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  42537984 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcatgcgatgactcaaagccaccggaaggagagacaaagcgggcaca 42538083  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  42538084 tcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 42538125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Original strand, 17658861 - 17659327
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17658861 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaaat-gtataaaaatgatt-aagtgtatgttaa 17658958  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17658959 ttattgaatgatatttagattattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattatattgaatgattttagattatgaaaatgatgttcat 17659058  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||    
T  17659059 tgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttagttttaatgtgtttgactaggttatggaaatgatgttaattttttaattt--tttgt 17659156  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    || ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||||| |||||  |||    
T  17659157 gttgatatggccgatcaggacactattgattcatctaagatgattggtggtaggcgtgggatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggtaca 17659256  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||| ||||||||| ||||||     |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  17659257 tcccaaagaggggaagaggt----tgggagatggttcaggg-act-tcagactacacagcctgaaaagtcacaggtt 17659327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 294 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 28241138 - 28240884
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccgatcaggac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  28241138 ttatgtttatgtttagtttaggtttaaagtgtttgattaggttattgaaatgatattaatttt-ttatttttattttttgtagatatggccgatcaggac 28241040  T
Q  392 ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtc 491  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28241039 cccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccacatcccaaagaggggtagaggtc 28240940  T
Q  492 ggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28240939 ggaggggagatggctcatgaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 28240884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 298 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 27672958 - 27672713
Alignment:
Q  298 gtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcatt 397  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| | ||  | | |||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27672958 gtttaggttttgtttaggtttagtgtttttgataaagtggttg-aatgatattaattttattatttt---tttgtagatatggccgatcaggaccccatt 27672863  T
Q  398 gatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27672862 gatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggg 27672763  T
Q  498 gagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27672762 cagatggctcaggaagctctcaggctacacaacctgaggagtcgcaggtt 27672713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 342 - 547
Target Start/End: Original strand, 30705911 - 30706114
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30705911 aatgatattaattttattattttttttgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 30706008  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtca 541  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30706009 ccaccgcaggaagaggcagagcagccacttcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtca 30706108  T
Q  542 caggtt 547  Q
    ||||||    
T  30706109 caggtt 30706114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19040338 - 19040161
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19040338 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccac 19040239  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19040238 atcccaaagaggggtagaggtcgaagaggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 19040161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 342 - 512
Target Start/End: Original strand, 5197748 - 5197916
Alignment:
Q  342 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5197748 aatgatgttaattttataattttttttgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 5197845  T
Q  442 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5197846 ccatcggagggagaggcaaagcggccacatcccaaataggggtagaggtcggagggtggatggttcaggga 5197916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 322 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 40624211 - 40624012
Alignment:
Q  322 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  || |||||||||||| | || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40624211 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtaaattttttaatt--gtttgtgtagatatgtctgagcaggacccgattgatccatttaagatgattggtggt 40624114  T
Q  422 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcagg 521  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || | ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  40624113 aggcgtgcgatgacttagagccatcgaaaggagaggcaaagggggcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatggttcagggacttctcagg 40624014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 410 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 19228145 - 19228008
Alignment:
Q  410 atgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcag 509  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19228145 atgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcag 19228046  T
Q  510 ggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||   |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19228045 ggactgctcaggcttcacagcctgaagagtcacaggtt 19228008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 512303 - 512214
Alignment:
Q  74 gttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  512303 gttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggatacaaatgattaag-tgtatagaaatga-ttaagtgtat 512214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19228202 - 19228140
Alignment:
Q  75 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19228202 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatagacacaaatgatt 19228140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40624470 - 40624389
Alignment:
Q  172 tattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40624470 tattgaatgatgtttaggttatgatagaaatgatgcacataaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 40624389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28241334 - 28241282
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtt--acgagaattatg 121  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28241334 ttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttacacgagaattatg 28241282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28241257 - 28241227
Alignment:
Q  297 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241257 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 28241227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15157 - 14683
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttag-ttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgtta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15157 ttggttaagtgtatattgatttttttggttagtttaggttacaagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgtta 15059  T
Q  170 attattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttca 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15058 attattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatggtgttca 14959  T
Q  270 ttgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14958 ttgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattt--tttg 14861  T
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14860 tgtagatatggtcgatcaagaccccattgatccatctaagatgattggtgatagacgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcgcccac 14761  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760 atcccaaagaaggttagaggtcggaagggagatggttcagggagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 14683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 71 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6320097 - 6319680
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6320097 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgattaagta-tatagaaataatt-aagtgtatgttaa 6320000  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6319999 ttattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatattcat 6319900  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgt 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||    
T  6319899 tgttgtacttttaatgtgtttgattatattaatgtttagtttaggtttaacttgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttttaaattttttgtgt 6319800  T
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
      |||| || | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  6319799 --agatgtgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccatcggaaggagaggcaaagcgggcaca 6319702  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcg 492  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  6319701 tcccaaagaggggaagaggtcg 6319680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 71 - 354
Target Start/End: Original strand, 31769244 - 31769526
Alignment:
Q  71 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31769244 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaa 31769342  T
Q  171 ttattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcat 270  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31769343 ttattgaatgatatttatgttattatggaaatgatggaaataaattttattataatgatgattatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcat 31769442  T
Q  271 tgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatt 354  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769443 tgttgtaattttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatt 31769526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 79 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24088308 - 24088066
Alignment:
Q  79 gtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24088308 gtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattca-gtgtatgttaattattgaa 24088211  T
Q  179 tgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtac 278  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24088210 tgatgtttaggttatgatggaaatgattgacacaaattttatagtaatgatgattatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtac 24088111  T
Q  279 ttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24088110 ttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 24088066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 296 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 24088063 - 24087833
Alignment:
Q  296 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  24088063 atgtttatgtttagtctaggtttaaagtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaattttttgtgt--agatacggccgatcaggacccca 24087966  T
Q  396 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggag 495  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| | | | ||||||| |||| |||| | ||||| |||    
T  24087965 ttgatctatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaaacaggcacatcccaaagcggggaaaaggtcagag 24087866  T
Q  496 gggagatggttcagggaactctcaggctacaca 528  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24087865 gggagatggttcagggacttctcaggctacaca 24087833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 27617567 - 27617744
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27617567 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgtagggagaggcagggcggccac 27617666  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617667 atcccaaagaggggtagaggtcgaagaggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 27617744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 6202000 - 6202177
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  6202000 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 6202099  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6202100 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 6202177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 11688967 - 11689144
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  11688967 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 11689066  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11689067 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 11689144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Original strand, 22302032 - 22302209
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  22302032 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 22302131  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22302132 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 22302209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 370 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 30828873 - 30828696
Alignment:
Q  370 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  30828873 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 30828774  T
Q  470 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 547  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30828773 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagctctcaggctacacagcctgaggagtcacaggtt 30828696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 512
Target Start/End: Original strand, 24722705 - 24722846
Alignment:
Q  371 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 470  Q
    ||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  24722705 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaacccaccagaaggagaggcaaagcgggcaca 24722804  T
Q  471 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 512  Q
    | | ||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||    
T  24722805 ttccaaagaggggaagaggttagagaggggatggttcaggga 24722846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 156 - 534
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11260
Alignment:
Q  156 ttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10887 ttaagtgtatgttaattattgaatgatgtttagattat---------gatggacacaaactatattgtaatgatgattatactgaatggttttaggttat 10977  T
Q  256 ggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgttt------agtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 349  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  10978 ggaaatgatgttcattgt---acttttaatgtgtttgattatgtttatgtttctgtttagtttaggtttaatgtttttgattaggttatgaaaatgaggt 11074  T
Q  350 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatca-ggacctca--ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccacc 446  Q
    ||| ||| | | ||| |||||  ||||||| | ||| | || || |   |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| || |||||||    
T  11075 taagtttttaaatttttgtgt--agatatgtctgatgaagggccaccggttgatccatctaagatgattggtggtcggtgtgtgatgacacaaagccacc 11172  T
Q  447 ggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggaactctcaggctacacagcctga 534  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11173 ggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggtgatggttcagggacttctcaggctacacagcctga 11260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 133
Target Start/End: Original strand, 10833 - 10884
Alignment:
Q  82 tatattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaat 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10833 tatattgattatttagttagtttaggttatgagaattatgatggacacaaat 10884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 7899 - 8059
Alignment:
Q  84 tattgattttttagttagtttaggttacgagaattatgatagacacaaatgatttagttgtatagaaatgatttaagtgtatgttaattattgaatgatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7899 tattgattttttagttagtttaggttacgagaattattatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatt-aagtgtatgttaattattgaatgatg 7997  T
Q  184 tttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgat 245  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7998 tttaggttattatcgaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattaaatgat 8059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 1
Alignment:
Q  294 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||     
T  107 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattttttt-----tgtagatatggccgatcaggaccc 13  T
Q  394 cattgatccatc 405  Q
    ||||||||||||    
T  12 cattgatccatc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 228 - 164
Alignment:
Q  263 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  228 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttatgtttaatgtgttt 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18168 - 18052
Alignment:
Q  396 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggag 495  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18168 ttgatacatctaagatgattgttggtaggcgtgcaatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgagcacatcctaaagaggggaagaggtcggag 18069  T
Q  496 gggagatggttcaggga 512  Q
    ||  | |||||||||||    
T  18068 ggtgggtggttcaggga 18052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University