View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7469_high_6 (Length: 412)

Name: NF7469_high_6
Description: NF7469
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7469_high_6
NF7469_high_6
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (6-412)||(12640-13046)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (6-412)||(50018-50424)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (6-412)||(16825489-16825897)
chr3 (6-412)||(14290742-14291148)
chr3 (6-412)||(12180857-12181263)
chr3 (6-412)||(12357737-12358143)
chr3 (6-412)||(17494159-17494565)
chr3 (6-412)||(31692395-31692801)
chr3 (6-412)||(31941416-31941822)
chr3 (6-411)||(11958391-11958796)
chr3 (6-408)||(18131557-18131958)
chr3 (6-412)||(12857706-12858111)
chr3 (18-374)||(16326931-16327287)
chr3 (6-371)||(11949135-11949500)
chr3 (11-411)||(10408482-10408882)
chr3 (11-411)||(28756833-28757233)
chr3 (11-411)||(47126458-47126858)
chr3 (6-412)||(16831738-16832144)
chr3 (216-412)||(12272851-12273047)
chr3 (191-406)||(10417440-10417655)
chr3 (6-267)||(35982839-35983100)
chr3 (121-412)||(15230116-15230407)
chr3 (121-412)||(15235984-15236275)
chr3 (6-412)||(17188887-17189293)
chr3 (192-412)||(16378330-16378550)
chr3 (195-412)||(8744789-8745006)
chr3 (6-412)||(24189817-24190223)
chr3 (180-411)||(12509867-12510098)
chr3 (195-412)||(13944537-13944754)
chr3 (126-348)||(13317864-13318086)
chr3 (274-412)||(14575499-14575637)
chr3 (195-412)||(15262133-15262350)
chr3 (195-399)||(12843513-12843717)
chr3 (195-401)||(15345655-15345861)
chr3 (195-401)||(16638287-16638493)
chr3 (195-401)||(24185704-24185910)
chr3 (195-401)||(43165189-43165395)
chr3 (195-401)||(48427961-48428167)
chr3 (214-401)||(15065585-15065772)
chr3 (195-401)||(10008114-10008320)
chr3 (195-401)||(10908724-10908930)
chr3 (195-401)||(12889223-12889429)
chr3 (195-401)||(13255204-13255410)
chr3 (195-401)||(15358597-15358803)
chr3 (195-401)||(15713466-15713672)
chr3 (195-401)||(3688457-3688663)
chr3 (195-401)||(15586802-15587008)
chr3 (142-367)||(15013115-15013340)
chr3 (195-399)||(14578818-14579022)
chr3 (195-401)||(15399927-15400133)
chr3 (195-401)||(20059464-20059670)
chr3 (214-367)||(14873997-14874150)
chr3 (195-367)||(16754111-16754283)
chr3 (214-401)||(5422359-5422546)
chr3 (195-401)||(6603249-6603455)
chr3 (195-401)||(16694678-16694884)
chr3 (195-401)||(26790823-26791029)
chr3 (195-401)||(53382428-53382634)
chr3 (195-367)||(16804357-16804529)
chr3 (287-399)||(17492367-17492479)
chr3 (195-256)||(11861033-11861094)
chr3 (195-283)||(23079427-23079515)
chr3 (6-152)||(16384582-16384728)
chr3 (216-261)||(8271830-8271875)
chr3 (80-161)||(13028640-13028721)
chr3 (216-261)||(13964786-13964831)
chr3 (216-261)||(30150021-30150066)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (6-412)||(63504-63910)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (6-412)||(12798470-12798876)
chr7 (6-412)||(15099572-15099978)
chr7 (7-412)||(19149885-19150290)
chr7 (7-412)||(20749284-20749689)
chr7 (6-406)||(14261215-14261615)
chr7 (6-412)||(13676325-13676731)
chr7 (21-411)||(16947456-16947846)
chr7 (18-403)||(13024228-13024612)
chr7 (11-411)||(26091772-26092172)
chr7 (11-411)||(49155176-49155576)
chr7 (21-411)||(12459503-12459893)
chr7 (6-406)||(21755292-21755692)
chr7 (6-412)||(14283343-14283749)
chr7 (11-376)||(40924791-40925156)
chr7 (15-411)||(13965646-13966042)
chr7 (11-411)||(26115564-26115964)
chr7 (6-412)||(11385398-11385804)
chr7 (120-412)||(14140553-14140845)
chr7 (121-412)||(12203884-12204175)
chr7 (192-412)||(15343305-15343525)
chr7 (195-412)||(18051111-18051328)
chr7 (195-401)||(11550282-11550488)
chr7 (195-401)||(14957438-14957644)
chr7 (195-401)||(44788531-44788737)
chr7 (195-401)||(8710489-8710695)
chr7 (195-401)||(13688925-13689131)
chr7 (195-401)||(14335280-14335486)
chr7 (225-367)||(15146133-15146275)
chr7 (195-401)||(11234393-11234599)
chr7 (150-412)||(15627397-15627659)
chr7 (195-401)||(18180627-18180833)
chr7 (195-401)||(18587351-18587557)
chr7 (195-401)||(15158237-15158443)
chr7 (195-401)||(17703635-17703841)
chr7 (195-399)||(14042581-14042785)
chr7 (195-399)||(14352611-14352815)
chr7 (195-401)||(9591248-9591454)
chr7 (195-401)||(12690386-12690591)
chr7 (291-401)||(8200932-8201042)
chr7 (195-282)||(16726621-16726708)
chr7 (199-284)||(38330-38415)
chr7 (313-401)||(10873574-10873662)
chr7 (216-261)||(4442951-4442996)
chr7 (216-261)||(7826924-7826969)
chr7 (6-219)||(12712632-12712845)
chr7 (216-261)||(13459057-13459102)
chr7 (216-261)||(27104975-27105020)
chr7 (216-261)||(27173305-27173350)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (6-412)||(22015799-22016205)
chr1 (6-412)||(21739090-21739496)
chr1 (6-412)||(21742606-21743012)
chr1 (6-411)||(24096669-24097074)
chr1 (6-412)||(19857204-19857610)
chr1 (6-412)||(20832954-20833360)
chr1 (11-411)||(48425804-48426204)
chr1 (6-411)||(52988672-52989077)
chr1 (11-411)||(38909885-38910285)
chr1 (6-369)||(20074763-20075126)
chr1 (191-412)||(18710315-18710536)
chr1 (15-411)||(31537060-31537456)
chr1 (11-411)||(37679980-37680380)
chr1 (6-376)||(20297347-20297719)
chr1 (191-412)||(20853999-20854220)
chr1 (150-401)||(16379004-16379255)
chr1 (6-234)||(21961135-21961363)
chr1 (195-401)||(22496499-22496705)
chr1 (195-401)||(16347838-16348044)
chr1 (195-401)||(20081619-20081825)
chr1 (195-401)||(24785100-24785306)
chr1 (195-401)||(51330735-51330941)
chr1 (195-370)||(21751988-21752163)
chr1 (214-401)||(33388291-33388478)
chr1 (195-401)||(17042258-17042464)
chr1 (195-367)||(21833246-21833418)
chr1 (304-411)||(12200449-12200556)
chr1 (195-401)||(21842122-21842328)
chr1 (195-401)||(19109278-19109484)
chr1 (195-352)||(41350911-41351068)
chr1 (195-343)||(21228799-21228947)
chr1 (150-256)||(21045322-21045428)
chr1 (195-272)||(22401631-22401708)
chr1 (195-250)||(22435976-22436031)
chr1 (216-261)||(20828656-20828701)
chr1 (216-261)||(20928104-20928149)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (7-412)||(14993350-14993755)
chr4 (6-336)||(15266736-15267066)
chr4 (6-374)||(20892953-20893321)
chr4 (6-412)||(15073243-15073649)
chr4 (11-411)||(3261781-3262181)
chr4 (11-411)||(29450524-29450924)
chr4 (6-405)||(16150527-16150926)
chr4 (6-405)||(16154673-16155072)
chr4 (11-411)||(44658853-44659253)
chr4 (15-376)||(11204223-11204584)
chr4 (191-412)||(27903269-27903490)
chr4 (195-412)||(51603963-51604180)
chr4 (195-369)||(53750641-53750815)
chr4 (274-410)||(15354290-15354426)
chr4 (6-283)||(7357280-7357557)
chr4 (150-412)||(14696985-14697247)
chr4 (195-396)||(14162370-14162571)
chr4 (195-399)||(15946-16150)
chr4 (195-401)||(14683462-14683668)
chr4 (195-401)||(17092060-17092266)
chr4 (6-108)||(18259629-18259731)
chr4 (195-401)||(12479495-12479701)
chr4 (195-401)||(16233903-16234109)
chr4 (195-401)||(23958642-23958848)
chr4 (195-401)||(27714231-27714437)
chr4 (195-367)||(8050534-8050706)
chr4 (195-367)||(14300890-14301062)
chr4 (195-367)||(19635065-19635237)
chr4 (195-401)||(8389307-8389513)
chr4 (195-401)||(16350465-16350671)
chr4 (217-401)||(15144825-15145009)
chr4 (195-367)||(19775704-19775876)
chr4 (214-401)||(18224376-18224563)
chr4 (195-401)||(40475935-40476141)
chr4 (332-411)||(15258812-15258891)
chr4 (214-401)||(16250780-16250967)
chr4 (195-361)||(13513285-13513451)
chr4 (195-298)||(16219186-16219289)
chr4 (195-298)||(16222506-16222609)
chr4 (182-239)||(15354234-15354291)
chr4 (198-262)||(18604733-18604797)
chr4 (342-401)||(16219125-16219184)
chr4 (342-401)||(16222445-16222504)
chr4 (199-282)||(18546794-18546877)
chr4 (287-367)||(14188435-14188515)
chr4 (216-261)||(14999681-14999726)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (6-412)||(5094-5500)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (6-412)||(29537-29943)
scaffold0067 (6-412)||(64587-64993)
scaffold0067 (6-412)||(49165-49571)
scaffold0067 (6-412)||(58199-58605)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (6-412)||(42611-43017)
scaffold0102 (195-367)||(50519-50691)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (6-412)||(868-1274)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (6-412)||(800-1206)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (6-412)||(36852-37258)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (6-412)||(34250-34656)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (6-412)||(1296-1702)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (6-412)||(7657-8063)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (6-412)||(11873-12279)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (6-412)||(19455771-19456177)
chr6 (6-357)||(19465971-19466322)
chr6 (6-409)||(14377043-14377446)
chr6 (6-412)||(19437750-19438156)
chr6 (6-412)||(24515541-24515947)
chr6 (6-412)||(21474348-21474754)
chr6 (21-411)||(10465990-10466380)
chr6 (32-412)||(25770592-25770972)
chr6 (18-374)||(18797476-18797832)
chr6 (88-412)||(19486503-19486827)
chr6 (191-412)||(15462084-15462305)
chr6 (6-412)||(34642713-34643119)
chr6 (11-376)||(24367184-24367549)
chr6 (6-411)||(21567118-21567523)
chr6 (195-399)||(18405260-18405464)
chr6 (246-402)||(20010821-20010977)
chr6 (195-399)||(23081184-23081388)
chr6 (195-361)||(5836544-5836710)
chr6 (198-412)||(18182686-18182900)
chr6 (150-412)||(23085096-23085358)
chr6 (195-401)||(29589755-29589961)
chr6 (195-367)||(22436662-22436834)
chr6 (152-412)||(30678297-30678557)
chr6 (195-401)||(2872118-2872324)
chr6 (195-401)||(16574649-16574855)
chr6 (195-401)||(16620525-16620731)
chr6 (195-401)||(16924956-16925162)
chr6 (195-401)||(27559285-27559491)
chr6 (195-401)||(24293098-24293304)
chr6 (217-401)||(19867446-19867630)
chr6 (195-401)||(28260513-28260719)
chr6 (195-401)||(28285197-28285403)
chr6 (195-401)||(28339262-28339468)
chr6 (195-367)||(28312423-28312595)
chr6 (198-367)||(27190229-27190398)
chr6 (198-367)||(27258842-27259011)
chr6 (195-401)||(25115311-25115517)
chr6 (195-262)||(22829702-22829769)
chr6 (216-261)||(16379710-16379755)
chr6 (216-261)||(16647306-16647351)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (6-367)||(4289-4650)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (6-412)||(43404-43810)
scaffold0104 (325-412)||(25129-25216)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (6-412)||(8527-8933)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (6-412)||(23563332-23563738)
chr5 (18-411)||(23078081-23078474)
chr5 (11-376)||(20345116-20345481)
chr5 (57-412)||(21983392-21983747)
chr5 (6-376)||(22505513-22505883)
chr5 (11-411)||(14884160-14884560)
chr5 (88-412)||(21561271-21561595)
chr5 (93-406)||(20824257-20824570)
chr5 (11-411)||(25850871-25851271)
chr5 (191-412)||(28892291-28892512)
chr5 (191-412)||(20778711-20778932)
chr5 (191-412)||(22464748-22464969)
chr5 (195-412)||(17266687-17266904)
chr5 (80-367)||(21631637-21631924)
chr5 (195-399)||(25429250-25429454)
chr5 (195-401)||(21882601-21882807)
chr5 (195-401)||(16359329-16359535)
chr5 (195-401)||(29473426-29473632)
chr5 (195-401)||(34569321-34569527)
chr5 (195-401)||(40711607-40711813)
chr5 (195-399)||(26736080-26736284)
chr5 (195-401)||(14997092-14997298)
chr5 (195-401)||(18781941-18782147)
chr5 (195-401)||(22330240-22330446)
chr5 (195-401)||(27521233-27521439)
chr5 (195-367)||(37288849-37289021)
chr5 (195-367)||(41773703-41773875)
chr5 (225-412)||(23474011-23474198)
chr5 (195-401)||(19772787-19772993)
chr5 (195-401)||(27613183-27613389)
chr5 (195-401)||(27682753-27682959)
chr5 (195-401)||(22350746-22350952)
chr5 (195-401)||(27665843-27666049)
chr5 (195-367)||(23460832-23461004)
chr5 (214-401)||(20803424-20803611)
chr5 (195-367)||(22137529-22137701)
chr5 (195-327)||(23525952-23526084)
chr5 (57-161)||(43122516-43122620)
chr5 (145-367)||(21409995-21410217)
chr5 (195-296)||(21332339-21332440)
chr5 (310-401)||(21336762-21336853)
chr5 (306-367)||(21342878-21342939)
chr5 (216-261)||(23508633-23508678)
chr5 (216-261)||(24584159-24584204)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (6-354)||(70079-70427)
scaffold0046 (207-412)||(60652-60857)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (6-412)||(1937-2343)
scaffold0034 (191-412)||(70285-70506)
scaffold0034 (6-110)||(11891-11995)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (6-412)||(5718-6124)
scaffold0035 (149-365)||(41236-41452)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (6-412)||(839-1245)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (6-412)||(20727-21133)
scaffold0222 (6-412)||(472-878)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (6-410)||(5194-5598)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (6-412)||(9757-10163)
scaffold0243 (195-399)||(24119-24323)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (6-412)||(325620-326026)
scaffold0004 (180-412)||(200627-200859)
scaffold0004 (6-61)||(319507-319562)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (6-412)||(23274108-23274514)
chr2 (6-412)||(19716539-19716945)
chr2 (11-411)||(20848105-20848505)
chr2 (7-411)||(23097541-23097945)
chr2 (121-412)||(23113238-23113528)
chr2 (195-412)||(12576868-12577085)
chr2 (6-269)||(19721102-19721365)
chr2 (195-399)||(22733485-22733689)
chr2 (195-399)||(23074391-23074595)
chr2 (221-412)||(24817577-24817768)
chr2 (217-399)||(23105461-23105643)
chr2 (195-401)||(9338108-9338314)
chr2 (195-401)||(9486742-9486948)
chr2 (195-401)||(11351422-11351628)
chr2 (195-401)||(16983766-16983972)
chr2 (195-401)||(17001526-17001732)
chr2 (195-401)||(21322977-21323183)
chr2 (195-401)||(45673723-45673929)
chr2 (195-367)||(22742677-22742849)
chr2 (195-367)||(23064973-23065145)
chr2 (195-401)||(22323053-22323259)
chr2 (195-401)||(24705193-24705399)
chr2 (195-401)||(24712560-24712766)
chr2 (195-401)||(44383281-44383487)
chr2 (214-401)||(23029191-23029378)
chr2 (198-401)||(27220542-27220745)
chr2 (214-401)||(27373795-27373982)
chr2 (195-401)||(10871376-10871582)
chr2 (195-401)||(24678013-24678219)
chr2 (195-401)||(24657369-24657575)
chr2 (195-401)||(24874461-24874667)
chr2 (142-352)||(30208578-30208788)
chr2 (195-367)||(24264930-24265102)
chr2 (214-401)||(21142771-21142958)
chr2 (195-367)||(23204874-23205046)
chr2 (360-412)||(23279291-23279343)
chr2 (195-282)||(19817492-19817579)
chr2 (195-262)||(23676583-23676650)
chr2 (193-261)||(22739363-22739431)
chr2 (192-261)||(22280771-22280840)
chr2 (306-367)||(41606209-41606269)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (9-412)||(22373819-22374222)
chr8 (6-411)||(31413957-31414362)
chr8 (6-412)||(19985130-19985536)
chr8 (6-412)||(22027705-22028111)
chr8 (11-411)||(29300856-29301256)
chr8 (6-412)||(21928378-21928784)
chr8 (6-411)||(22053814-22054219)
chr8 (11-411)||(28983862-28984262)
chr8 (6-406)||(16268649-16269049)
chr8 (57-412)||(20391036-20391391)
chr8 (180-411)||(28989081-28989312)
chr8 (233-411)||(27357487-27357665)
chr8 (195-399)||(21253908-21254112)
chr8 (195-399)||(21391475-21391679)
chr8 (195-399)||(21780801-21781005)
chr8 (195-399)||(22421506-22421710)
chr8 (195-401)||(19980928-19981134)
chr8 (225-399)||(21785999-21786173)
chr8 (198-412)||(22375071-22375284)
chr8 (195-401)||(17671636-17671842)
chr8 (225-401)||(22523507-22523683)
chr8 (195-401)||(19115361-19115567)
chr8 (195-401)||(20015877-20016083)
chr8 (195-401)||(21164152-21164358)
chr8 (195-401)||(32603106-32603312)
chr8 (195-401)||(18859538-18859744)
chr8 (195-401)||(22031064-22031270)
chr8 (195-401)||(22117789-22117995)
chr8 (195-401)||(22126573-22126779)
chr8 (195-401)||(22990006-22990212)
chr8 (195-401)||(22042788-22042994)
chr8 (150-412)||(22245584-22245846)
chr8 (150-412)||(22246002-22246264)
chr8 (195-401)||(30310758-30310964)
chr8 (195-401)||(15536344-15536550)
chr8 (195-401)||(22129231-22129437)
chr8 (195-352)||(19481686-19481843)
chr8 (57-161)||(6606945-6607049)
chr8 (199-282)||(19870773-19870856)
chr8 (216-261)||(20649990-20650035)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (6-412)||(29440-29846)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (6-412)||(98568-98974)
scaffold0020 (6-412)||(175901-176306)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (18-411)||(5142-5535)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (21-411)||(30326-30716)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (6-412)||(1634-2039)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (6-411)||(39318-39723)
scaffold0010 (250-412)||(44656-44818)
scaffold0010 (225-401)||(4839-5015)
scaffold0010 (195-367)||(14382-14554)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (7-412)||(5515-5920)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (6-412)||(22035-22441)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (6-410)||(164386-164790)
scaffold0023 (217-367)||(30770-30920)
scaffold0023 (193-399)||(47155-47360)
scaffold0023 (287-399)||(152007-152119)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (21-411)||(251536-251923)
scaffold0009 (195-262)||(230026-230093)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (6-412)||(1257-1663)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (6-412)||(28270-28676)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (6-410)||(6953-7357)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (6-412)||(8447-8853)
scaffold0235 (6-412)||(18661-19067)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (6-411)||(10891-11296)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (6-411)||(514338-514743)
scaffold0001 (221-406)||(441572-441757)
scaffold0001 (195-406)||(495939-496150)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (180-412)||(14-246)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (6-410)||(53962-54366)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (198-412)||(2784-2998)
scaffold0523 (6-203)||(5562-5759)
scaffold0523 (11-246)||(11733-11968)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (191-412)||(496-717)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (175-412)||(20682-20919)
scaffold0261 (175-412)||(12502-12739)
scaffold0261 (6-115)||(12397-12506)
scaffold0261 (6-115)||(20577-20686)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (6-411)||(375-780)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (192-412)||(1033-1253)
scaffold0167 (6-173)||(5205-5372)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (6-411)||(29848-30253)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (11-376)||(41684-42049)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (6-412)||(65283-65689)
scaffold0053 (6-199)||(62757-62950)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (126-412)||(151480-151766)
scaffold0011 (195-412)||(23707-23924)
scaffold0011 (6-118)||(153699-153811)
scaffold0011 (216-265)||(73792-73841)
scaffold0011 (216-265)||(78173-78222)
scaffold0011 (216-268)||(175708-175760)
scaffold0011 (216-261)||(182054-182099)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (6-411)||(4834-5239)
scaffold0348 (6-411)||(17469-17874)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (96-412)||(93969-94285)
scaffold0029 (6-374)||(115513-115881)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (191-412)||(15036-15257)
scaffold0074 (198-406)||(6032-6240)
scaffold0074 (6-109)||(15288-15391)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (208-412)||(110523-110727)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (6-333)||(9006-9333)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (6-412)||(53408-53814)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (191-407)||(9397-9613)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (6-412)||(263139-263545)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (180-412)||(4248-4480)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (57-412)||(11743-12096)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (180-411)||(11723-11954)
scaffold0443 (11-88)||(12034-12111)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (9-411)||(39972-40374)
scaffold0114 (195-399)||(17523-17726)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (6-412)||(203294-203700)
scaffold0003 (195-367)||(424266-424438)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (18-411)||(67105-67498)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (6-412)||(9772-10177)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (230-412)||(49086-49268)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (121-406)||(3992-4274)
scaffold0130 (214-367)||(7972-8125)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (102-412)||(626-936)
scaffold0476 (195-401)||(10710-10916)
scaffold0476 (6-43)||(530-567)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (6-370)||(6242-6606)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (191-374)||(4-187)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (6-269)||(857-1125)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (75-314)||(19023-19262)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (6-260)||(51716-51970)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (198-412)||(17791-18005)
scaffold0040 (195-379)||(111081-111265)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (230-374)||(21802-21946)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (6-305)||(1833-2132)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (279-412)||(26025-26158)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (21-241)||(1487-1707)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (6-178)||(269-441)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (93-412)||(5001-5320)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (6-201)||(16761-16956)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (195-399)||(8336-8540)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (195-401)||(36422-36628)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (195-412)||(23472-23689)
scaffold0018 (221-412)||(9551-9742)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (6-238)||(788-1020)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (279-412)||(1132-1257)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (6-246)||(1592-1832)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (195-399)||(552-756)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (195-399)||(4360-4564)
scaffold0621 (195-341)||(1-147)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (195-399)||(2437-2641)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (150-406)||(13608-13864)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (221-412)||(6786-6977)
scaffold0270 (221-412)||(13916-14107)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (195-412)||(14440-14657)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (195-399)||(11054-11258)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (150-412)||(26265-26527)
scaffold0042 (195-401)||(36994-37200)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (195-412)||(57788-58005)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (153-406)||(216552-216805)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (195-399)||(1915-2119)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (195-399)||(55644-55848)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (195-401)||(10332-10538)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (195-401)||(29102-29308)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (195-365)||(1959-2129)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (195-401)||(22171-22377)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (195-401)||(17240-17446)
scaffold0017 (217-400)||(195034-195217)
scaffold0017 (198-411)||(24220-24433)
scaffold0017 (6-64)||(4438-4496)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (195-363)||(14873-15041)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (216-412)||(13997-14193)
scaffold0120 (195-298)||(11291-11394)
scaffold0120 (216-261)||(25242-25287)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (195-399)||(8149-8353)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (195-399)||(54563-54767)
scaffold0080 (196-401)||(31807-32012)
scaffold0080 (196-367)||(37307-37478)
scaffold0080 (195-367)||(10412-10584)
scaffold0080 (195-367)||(13067-13239)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (195-367)||(7194-7366)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (153-404)||(15111-15362)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (195-370)||(40681-40856)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (195-399)||(8876-9077)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (153-412)||(15335-15582)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (198-399)||(104153-104354)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (219-399)||(24910-25090)
scaffold0218 (216-261)||(1147-1192)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (195-399)||(7913-8117)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (197-401)||(17861-18065)
scaffold0028 (195-401)||(11393-11599)
scaffold0028 (195-271)||(55058-55134)
scaffold0028 (333-401)||(53651-53719)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (217-364)||(1-148)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (195-401)||(10292-10498)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (195-401)||(8182-8388)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (195-401)||(3348-3554)
scaffold0044 (195-367)||(17118-17290)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (217-401)||(34911-35095)
scaffold0022 (195-399)||(41558-41762)
scaffold0022 (195-399)||(75278-75482)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (214-365)||(942-1093)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (301-412)||(3450-3561)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (195-352)||(3524-3681)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (195-399)||(18576-18780)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (195-367)||(13298-13470)
scaffold0109 (195-401)||(41079-41285)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (195-401)||(1206-1412)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (225-399)||(4509-4683)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (195-367)||(943-1115)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (195-363)||(21566-21734)
scaffold0081 (195-363)||(36990-37158)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (198-401)||(65-268)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (6-173)||(2783-2950)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (198-363)||(11533-11698)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (215-367)||(674-826)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (150-252)||(16738-16840)
scaffold0100 (249-412)||(21413-21576)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (195-336)||(15753-15894)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (150-281)||(11072-11203)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (306-399)||(3527-3620)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (195-271)||(48719-48795)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (195-282)||(2907-2994)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (11-105)||(23913-24007)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (310-401)||(12587-12678)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (191-241)||(1364-1414)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (6-48)||(527-569)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (216-261)||(2635-2680)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (192-261)||(13502-13571)
scaffold0467 (216-261)||(816-861)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (216-261)||(5000-5045)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (214-255)||(171188-171229)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (195-262)||(1-68)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (216-261)||(5499-5544)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (216-261)||(26460-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (216-261)||(35149-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (216-261)||(24027-24072)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (216-261)||(8221-8266)
scaffold0021 (216-261)||(90566-90611)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (216-268)||(3556-3608)


Alignment Details
Target: scaffold0309 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13046 - 12640
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  13046 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatca 12947  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12946 gttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacgcaaacggtgaatgaggaccaacttatcaggggtac 12847  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12846 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 12747  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12746 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggtagag 12647  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  12646 actttga 12640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 50424 - 50018
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50424 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccttagctgattgtaagcgtggggatattgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatca 50325  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  50324 gttcgtagtgtacccagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtac 50225  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  50224 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgta 50125  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50124 tctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagag 50025  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  50024 actttga 50018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 16825489 - 16825897
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16825489 gagaagaagtgcttcaggtgtggtaaaaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaatgaggaaggtcatatca 16825588  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16825589 gtttgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggactgacttatcagaggtac 16825688  T
Q  206 ttgtttctttaataa--tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttg 303  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825689 ttgtttctttaatatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttg 16825788  T
Q  304 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtag 403  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  16825789 tatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtag 16825888  T
Q  404 agactttga 412  Q
    |||||||||    
T  16825889 agactttga 16825897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 14290742 - 14291148
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| || |   | || || || ||||| |    
T  14290742 gagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttatttgctataattgtgatgaagagggacatatta 14290841  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14290842 gctcgcagtgcaagaagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 14290941  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14290942 ttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttata 14291041  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  14291042 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagag 14291141  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  14291142 actttga 14291148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12181263 - 12180857
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||    
T  12181263 gagaagaagtgcttcagttgtggtcggaaaggacacacactagctgattgtaagcttggggacattgtttgttataattgcaacaaggaaggtcatatca 12181164  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| || |    | |||||||  |||||||||||||||    
T  12181163 gttcgtagtgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgtaaaccactagtgaggaccgacttatcagaggtac 12181064  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12181063 ttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtttgta 12180964  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  12180963 tctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 12180864  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  12180863 actttga 12180857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 12357737 - 12358143
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  12357737 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatca 12357836  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  12357837 gttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 12357936  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12357937 ttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 12358036  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  12358037 tctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 12358136  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  12358137 actttga 12358143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17494565 - 17494159
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  17494565 gagaagaagtgct-caggtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagtgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatatta 17494467  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |  | | |||||||   ||||||||||||||    
T  17494466 gttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccattagtgaggacatgcttatcagaggtac 17494367  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17494366 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggttgta 17494267  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttg-aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtaga 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  17494266 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtaga 17494167  T
Q  405 gactttga 412  Q
    ||||||||    
T  17494166 gactttga 17494159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 31692395 - 31692801
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| || ||| |||| ||  ||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||    
T  31692395 gagaagaagtgtttcaggtgtggttagaagggacacactctagctgactgcaagagtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaggagggccatatca 31692494  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  31692495 gttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 31692594  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31692595 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgta 31692694  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  31692695 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 31692794  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  31692795 actttga 31692801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31941822 - 31941416
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||  ||||||| || || | ||| ||||| || |||||||    
T  31941822 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgactgcaagcgtggtgatgttgtttgttataattgcaatgaggagggccatatca 31941723  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  31941722 gttcatagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 31941623  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31941622 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 31941523  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||||    
T  31941522 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctatgtttggcagag 31941423  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  31941422 actttga 31941416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Original strand, 11958391 - 11958796
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  11958391 gagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacatacactagctgaatgtaagcgtgaggacattgtctgctacaactgcaacgaagaaagtcatatca 11958490  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  11958491 gttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 11958590  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  11958591 ttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgta 11958690  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  11958691 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 11958790  T
Q  406 actttg 411  Q
    ||||||    
T  11958791 actttg 11958796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 408
Target Start/End: Original strand, 18131557 - 18131958
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||  | || ||||| |||| ||| |||||| ||||||| |    
T  18131557 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacgcattagctaattgtaagcgtggggatgtagtgtgctataactgcaatgaggaaagtcatatta 18131656  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| || | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  18131657 gttcgcagtgtactcaactgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttactctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 18131756  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18131757 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 18131855  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18131856 tctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagag 18131955  T
Q  406 act 408  Q
    |||    
T  18131956 act 18131958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 12857706 - 12858111
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||| | |||||   |||||||||||   ||| ||| || |||||| | || |||||||||||||| |   | || ||||||||||| |    
T  12857706 gagaagaagtgtttccgatgtggaaagaaaggacacataatagctgagtgcaagcgtcgtgatattgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatatta 12857805  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | |||||||| | | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12857806 gctcgtagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggacga-cttatcagaggtac 12857904  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12857905 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggttata 12858004  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12858005 tctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtg 12858104  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  12858105 actttga 12858111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 374
Target Start/End: Original strand, 16326931 - 16327287
Alignment:
Q  18 ttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgta 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||||||| ||||||    
T  16326931 ttcaggtgtggtcagaagggacacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagttcgcagtgta 16327030  T
Q  118 cgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaa 217  Q
    |  |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16327031 ctaagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaa 16327130  T
Q  218 taatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaa 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16327131 tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaa 16327230  T
Q  318 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327231 ggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 16327287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 371
Target Start/End: Original strand, 11949135 - 11949500
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11949135 gagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacatattagctgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcacatca 11949234  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||| | |||||||| || | |||||||||||||  ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||  ||||||||||||||||    
T  11949235 gtttgcagtgtacgtagacgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcaacttatcagaggtac 11949334  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  11949335 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgggtctggttgta 11949434  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11949435 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10408882 - 10408482
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  10408882 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 10408783  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10408782 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccaacttatcagaggtacttgtt 10408683  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10408682 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 10408583  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  10408582 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 10408483  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  10408482 g 10408482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28757233 - 28756833
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| |||||     
T  28757233 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttca 28757134  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  || || |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28757133 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 28757034  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28757033 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 28756934  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  28756933 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 28756834  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  28756833 g 28756833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47126858 - 47126458
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  47126858 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 47126759  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    || ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47126758 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 47126659  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  47126658 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctga 47126559  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  47126558 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 47126459  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  47126458 g 47126458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 16831738 - 16832144
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||   ||||  || || |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || |||||||    
T  16831738 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgttagcggactgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatca 16831837  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    || |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  16831838 gtacacagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtac 16831937  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  16831938 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgta 16832037  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  16832038 tctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 16832137  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  16832138 attttga 16832144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 216 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272851
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatga 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  316 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttga 12272851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 191 - 406
Target Start/End: Original strand, 10417440 - 10417655
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  10417440 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataag 10417539  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||  ||||    
T  10417540 ttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgt 10417639  T
Q  391 ctatgtttggtagaga 406  Q
    ||||||||||||||||    
T  10417640 ctatgtttggtagaga 10417655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35983100 - 35982839
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |    
T  35983100 gagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatatta 35983001  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  35983000 gttcgcattgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactgttacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagagatac 35982901  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 267  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35982900 ttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15230407 - 15230116
Alignment:
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| || ||  |||| |   | || ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15230407 agcctaagaaggatcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatag 15230308  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||    
T  15230307 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtgga 15230208  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15230207 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttga 15230116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15236275 - 15235984
Alignment:
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| || ||  |||| |   | || ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15236275 agcctaagaaggatcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtacttgtttctttaatag 15236176  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||    
T  15236175 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtgga 15236076  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15236075 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttga 15235984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 17189293 - 17188887
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||    
T  17189293 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatca 17189194  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||| |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  17189193 gttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaactactaatgaggacaggcttatcagaggtac 17189094  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||    
T  17189093 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgta 17188994  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  17188993 tctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 17188894  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  17188893 attttga 17188887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 412
Target Start/End: Original strand, 16378330 - 16378550
Alignment:
Q  192 cttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagt 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  16378330 cttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagt 16378429  T
Q  292 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtc 391  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| | | ||    
T  16378430 tgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatc 16378529  T
Q  392 tatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16378530 tatgtttggtagagattttga 16378550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Original strand, 8744789 - 8745006
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||    
T  8744789 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgg 8744888  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||| | | |||||    
T  8744889 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctat 8744988  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||| |||||    
T  8744989 gtttggtagagattttga 8745006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 24190223 - 24189817
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||    
T  24190223 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatca 24190124  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| || | |||||| || ||| |||||||  |    || ||||||   ||||||||||||||    
T  24190123 gttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagagtttgcgttgactggtacgcagactactaacgaggacaggcttatcagaggtac 24190024  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||    
T  24190023 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgta 24189924  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  24189923 tctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 24189824  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  24189823 attttga 24189817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 180 - 411
Target Start/End: Original strand, 12509867 - 12510098
Alignment:
Q  180 aatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  12509867 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 12509966  T
Q  280 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 379  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||| |  |    
T  12509967 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggg 12510066  T
Q  380 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
     |||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  12510067 gtgtcttatatctatgtttggtagagattttg 12510098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13944754 - 13944537
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  |||    
T  13944754 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgg 13944655  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    || || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | || |||| | | |||||    
T  13944654 gtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctat 13944555  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||| |||||    
T  13944554 gtttggtagagattttga 13944537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 126 - 348
Target Start/End: Original strand, 13317864 - 13318086
Alignment:
Q  126 aagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactc 225  Q
    |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13317864 aagaaggtcagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactc 13317963  T
Q  226 ctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaat 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  13317964 ctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaat 13318063  T
Q  326 ggttgttgaaactccagctaagg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13318064 ggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 274 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14575637 - 14575499
Alignment:
Q  274 ttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14575637 ttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 14575538  T
Q  374 tctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14575537 tctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 14575499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262133
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 15262251  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  15262250 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 15262151  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  15262150 gtttggtcgagattttga 15262133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 12843513 - 12843717
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  12843513 atcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 12843612  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
     ||| | | | ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||| |||    
T  12843613 atcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttat 12843712  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  12843713 gtttg 12843717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 15345655 - 15345861
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15345655 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15345754  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15345755 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15345854  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  15345855 gtttggt 15345861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16638493 - 16638287
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  | |   ||||    
T  16638493 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgg 16638394  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16638393 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16638294  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16638293 gtttggt 16638287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24185910 - 24185704
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  24185910 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24185811  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  24185810 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 24185711  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  24185710 gtttggt 24185704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43165395 - 43165189
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  43165395 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 43165296  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  43165295 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 43165196  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  43165195 gtttggt 43165189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 48428167 - 48427961
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  48428167 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 48428068  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  48428067 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 48427968  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  48427967 gtttggt 48427961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15065772 - 15065585
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |   |||||||| ||| | ||||||||    
T  15065772 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatat 15065673  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  15065672 gaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 15065585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10008320 - 10008114
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  10008320 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10008221  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10008220 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10008121  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  10008120 gtttggt 10008114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10908930 - 10908724
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  10908930 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10908831  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10908830 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10908731  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  10908730 gtttggt 10908724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12889429 - 12889223
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  12889429 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12889330  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  12889329 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 12889230  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  12889229 gtttggt 12889223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13255410 - 13255204
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  13255410 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 13255311  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  13255310 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 13255211  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  13255210 gtttggt 13255204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15358803 - 15358597
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15358803 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15358704  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15358703 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15358604  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  15358603 gtttggt 15358597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 15713466 - 15713672
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15713466 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15713565  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15713566 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15713665  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  15713666 gtttggt 15713672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3688663 - 3688457
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||  | |   ||||    
T  3688663 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgg 3688564  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  3688563 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 3688464  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  3688463 gtttggt 3688457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 15586802 - 15587008
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15586802 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15586901  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15586902 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15587001  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  15587002 gtttggt 15587008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 367
Target Start/End: Original strand, 15013115 - 15013340
Alignment:
Q  142 gtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattat 241  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| ||  ||| |||||||||    || ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15013115 gtgggaaggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattat 15013214  T
Q  242 agatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 341  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| |||| || |||||||||   |||||||||||| ||| | ||   |||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  15013215 agatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaacccca 15013314  T
Q  342 gctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  15013315 gctaagggttcggtgactacttctct 15013340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 14578818 - 14579022
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||| ||| |||||  || ||||||| |||||| || ||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14578818 atcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 14578917  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    ||||     | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||  ||||||||    
T  14578918 gtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctat 14579017  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  14579018 gtttg 14579022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 15399927 - 15400133
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15399927 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15400026  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15400027 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15400126  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  15400127 gtttggt 15400133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 20059464 - 20059670
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  20059464 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 20059563  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  20059564 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20059663  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  20059664 gtttggt 20059670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874150
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||| | |||||||| | ||  |||||||| | | | ||| ||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatat 14874096  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14874097 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14874150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 16754111 - 16754283
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16754111 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16754210  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16754211 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16754283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422546
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||||||    
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggt 5422546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6603455 - 6603249
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  6603455 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 6603356  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  6603355 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 6603256  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  6603255 gtttggt 6603249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16694884 - 16694678
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |  |||||    
T  16694884 atcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgg 16694785  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  16694784 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 16694685  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16694684 gtttggt 16694678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 26790823 - 26791029
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||  |     ||||    
T  26790823 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgg 26790922  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  26790923 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 26791022  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  26791023 gtttggt 26791029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 53382428 - 53382634
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  53382428 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 53382527  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  53382528 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 53382627  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  53382628 gtttggt 53382634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 16804357 - 16804529
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16804357 atcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16804456  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  16804457 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 16804529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 287 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17492479 - 17492367
Alignment:
Q  287 taagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtcta 386  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||      
T  17492479 taagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtccc 17492380  T
Q  387 ttgtctatgtttg 399  Q
    |||| ||||||||    
T  17492379 ttgtttatgtttg 17492367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 256  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 283
Target Start/End: Original strand, 23079427 - 23079515
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgc 283  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  23079427 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgc 23079515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 152
Target Start/End: Original strand, 16384582 - 16384728
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  || | |||||| |||||||| ||  |||| ||||| || |  || || || || |||||||    
T  16384582 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacatgttggctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagagggccatatca 16384681  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtg 152  Q
    || |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16384682 gtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtg 16384728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271875
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8271875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Original strand, 13028640 - 13028721
Alignment:
Q  80 caacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcttta 161  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| | | |||||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||    
T  13028640 caactgcaaagaggaaggacatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaggcaggtggaaaggtgtttgcttta 13028721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964831
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150021
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 30150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 63504 - 63910
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  63504 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcatggggatattgtttgctacaactataatgaggaaggtcatatca 63603  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  63604 gttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaagtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 63703  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63704 ttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 63803  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  63804 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagag 63903  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  63904 actttga 63910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 12798470 - 12798876
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  12798470 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtgagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatca 12798569  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12798570 gttcgcagtgtacacagcctaagaaggctaggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 12798669  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12798670 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 12798769  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12798770 tctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctatgtttggtagag 12798869  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  12798870 actttga 12798876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 15099572 - 15099978
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  15099572 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactctagatgattgtaagcgtggggacatcgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatca 15099671  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||  |||||||||| ||||    
T  15099672 gttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaactggtatgcagacagttaatgaggaccgacttatcagatgtac 15099771  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15099772 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgta 15099871  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15099872 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagag 15099971  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  15099972 actttga 15099978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19150290 - 19149885
Alignment:
Q  7 agaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcag 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| ||    
T  19150290 agaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattag 19150191  T
Q  107 ttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtact 206  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| || || ||||| || ||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19150190 ttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtact 19150091  T
Q  207 tgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtat 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19150090 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtat 19149991  T
Q  307 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19149990 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 19149891  T
Q  407 ctttga 412  Q
    ||||||    
T  19149890 ctttga 19149885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20749689 - 20749284
Alignment:
Q  7 agaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcag 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| ||    
T  20749689 agaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatattag 20749590  T
Q  107 ttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtact 206  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| || || ||||| || ||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20749589 ttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtact 20749490  T
Q  207 tgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtat 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20749489 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtat 20749390  T
Q  307 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20749389 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga 20749290  T
Q  407 ctttga 412  Q
    ||||||    
T  20749289 ctttga 20749284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 406
Target Start/End: Original strand, 14261215 - 14261615
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |    
T  14261215 gagaagaagtactttaggtgtagtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatatta 14261314  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  14261315 gttcgcagtttatgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactatgaatgaggaccgacttatcagaggtac 14261414  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14261415 ttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggttgta 14261514  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14261515 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 14261614  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  14261615 a 14261615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13676731 - 13676325
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||    
T  13676731 gagaagaagtacttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatca 13676632  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||| | || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  13676631 gttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 13676532  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13676531 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 13676432  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13676431 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 13676332  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  13676331 actttga 13676325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Original strand, 16947456 - 16947846
Alignment:
Q  21 aggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgc 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||  |    
T  16947456 aggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagagggtcatatcagttcacagtgtattc 16947555  T
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||  ||||||| ||| || ||||| || |||||||| || | | |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16947556 agctgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaatggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 16947655  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16947656 tactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagga 16947755  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16947756 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 16947846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13024612 - 13024228
Alignment:
Q  18 ttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgta 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  13024612 ttcaggtgtggttagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttctcagtgta 13024513  T
Q  118 cgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaa 217  Q
    | ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13024512 ctcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaa 13024413  T
Q  218 taatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaa 317  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13024412 tag-actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaa 13024314  T
Q  318 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||  |||||||||||||||||    
T  13024313 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtag 13024228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 26091772 - 26092172
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  26091772 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 26091871  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26091872 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 26091971  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26091972 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 26092071  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  26092072 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 26092171  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  26092172 g 26092172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 49155576 - 49155176
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  49155576 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 49155477  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49155476 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 49155377  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  49155376 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctga 49155277  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  49155276 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagagatttt 49155177  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  49155176 g 49155176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12459893 - 12459503
Alignment:
Q  21 aggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgc 120  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||  ||||||| |    
T  12459893 aggtgtggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactc 12459794  T
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || |||||||  || |   |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12459793 agccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgaattgaaaggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 12459694  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  12459693 tactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 12459594  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  12459593 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagagactttg 12459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21755692 - 21755292
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |    
T  21755692 gagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatta 21755593  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||  ||||| |  |||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  21755592 gctcacagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 21755493  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  21755492 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgta 21755393  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||    
T  21755392 tctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 21755293  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  21755292 a 21755292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 14283343 - 14283749
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || ||||||||||    
T  14283343 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggtcatatca 14283442  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    |  |  ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  14283443 gcacacagtgcccacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggactgtcttatcagaggtac 14283542  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  14283543 ttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgta 14283642  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  14283643 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 14283742  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  14283743 attttga 14283749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 40924791 - 40925156
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  40924791 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 40924890  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  || || |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40924891 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 40924990  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  40924991 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctga 40925090  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40925091 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 40925156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 411
Target Start/End: Original strand, 13965646 - 13966042
Alignment:
Q  15 tgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagt 114  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| | ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||  |||    
T  13965646 tgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagt 13965745  T
Q  115 gtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctt 214  Q
    || |  |||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13965746 gtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctt 13965845  T
Q  215 taataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13965846 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 13965945  T
Q  315 aaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  13965946 aaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 13966042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 26115564 - 26115964
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| ||| |     
T  26115564 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtaca 26115663  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  | || ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  26115664 cagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtt 26115763  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26115764 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 26115863  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  26115864 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 26115963  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  26115964 g 26115964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 11385398 - 11385804
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||    
T  11385398 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatca 11385497  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || || || |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  11385498 gttcacagtgcactcaaccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacagacttatcagaggtac 11385597  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11385598 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgta 11385697  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  11385698 tttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 11385797  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  11385798 attttga 11385804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 120 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14140845 - 14140553
Alignment:
Q  120 cagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaata 219  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140845 cagccgaagaaggttagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaata 14140746  T
Q  220 atactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagg 319  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||    
T  14140745 gtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaaggg 14140646  T
Q  320 agaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  14140645 agaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 14140553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 412
Target Start/End: Original strand, 12203884 - 12204175
Alignment:
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| || ||  ||||  |  | || ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12203884 agcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacatagacggttaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 12203983  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||    
T  12203984 taatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtgga 12204083  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12204084 gaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 12204175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 192 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15343525 - 15343305
Alignment:
Q  192 cttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  15343525 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagt 15343426  T
Q  292 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtc 391  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||    
T  15343425 tgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatc 15343326  T
Q  392 tatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  15343325 tatgtttggtagagattttga 15343305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Original strand, 18051111 - 18051328
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||    
T  18051111 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgg 18051210  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | || |||| | | |||||    
T  18051211 gtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctat 18051310  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||| |||||    
T  18051311 gtttggtagagattttga 18051328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 11550282 - 11550488
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || |   ||||    
T  11550282 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgg 11550381  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  11550382 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 11550481  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  11550482 gtttggt 11550488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14957644 - 14957438
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14957644 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14957545  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  14957544 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 14957445  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  14957444 gtttggt 14957438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 44788531 - 44788737
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  44788531 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 44788630  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  44788631 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 44788730  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  44788731 gtttggt 44788737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8710695 - 8710489
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  8710695 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8710596  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  8710595 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 8710496  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  8710495 gtttggt 8710489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13689131 - 13688925
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  13689131 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgg 13689032  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  13689031 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 13688932  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  13688931 gtttggt 13688925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14335486 - 14335280
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14335486 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14335387  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  14335386 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 14335287  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  14335286 gtttggt 14335280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 367
Target Start/End: Original strand, 15146133 - 15146275
Alignment:
Q  225 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 324  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | || |||||||| ||||| |    
T  15146133 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatggagaga 15146232  T
Q  325 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15146233 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15146275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 11234393 - 11234599
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  11234393 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 11234492  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  11234493 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11234592  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  11234593 gtttggt 11234599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15627659 - 15627397
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    | || | |||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15627659 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactg 15627560  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||   || ||||||||| | | | ||   |||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15627559 gtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaaggg 15627460  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||| || ||||||||| | || |||||||| |||   ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15627459 ttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttga 15627397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18180833 - 18180627
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18180833 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18180734  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |  ||||  ||||||||    
T  18180733 gtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18180634  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  18180633 gtttggt 18180627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 18587351 - 18587557
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18587351 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18587450  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  18587451 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18587550  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  18587551 gtttggt 18587557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 15158237 - 15158443
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  15158237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 15158336  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  15158337 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 15158436  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  15158437 gtttggt 15158443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 17703635 - 17703841
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17703635 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17703734  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  17703735 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17703834  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  17703835 gtttggt 17703841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042581
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||  ||| ||||  ||||||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctat 14042586  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  14042585 gtttg 14042581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352611
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||  ||| ||||  ||||||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctat 14352616  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  14352615 gtttg 14352611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9591454 - 9591248
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||  | |   | ||    
T  9591454 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 9591355  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  || |||||    
T  9591354 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 9591255  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  9591254 gtttggt 9591248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12690591 - 12690386
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  12690591 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12690493  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  12690492 gtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 12690393  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  12690392 gtttggt 12690386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8201042 - 8200932
Alignment:
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||    
T  8201042 ttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgt 8200943  T
Q  391 ctatgtttggt 401  Q
    |||||||||||    
T  8200942 ctatgtttggt 8200932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 282
Target Start/End: Original strand, 16726621 - 16726708
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 282  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||    
T  16726621 atcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtg 16726708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Original strand, 38330 - 38415
Alignment:
Q  199 gaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgca 284  Q
    |||||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| || |||||||||||    
T  38330 gaggtacttgtttcatcaacaatttccctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatttctcttgattgtgca 38415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873574
Alignment:
Q  313 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 10873574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826924
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 7826924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 12712632 - 12712845
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||   |||| |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| ||| | ||| ||||||||||    
T  12712632 gagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaaacgtggtgatattgtatgctataactgcaatggggagggtcatatca 12712731  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
     |||  |||| || || |  ||||||||||||||  | || || |||||||| ||  |  |||||||| |    ||| | ||   |||||||||||||||    
T  12712732 attctcagtgcactcaacggaagaaggttaggaccagcgggaaagtgtttgccttggcgggtacgcaaaccacaaatcaagatagacttatcagaggtac 12712831  T
Q  206 ttgtttctttaata 219  Q
    ||||||||||||||    
T  12712832 ttgtttctttaata 12712845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459057
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13459057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105020
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27105020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173305
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27173305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 22015799 - 22016205
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |    
T  22015799 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataactgcaacgaggaagatcatatta 22015898  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22015899 gtttgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 22015998  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22015999 ttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 22016098  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  22016099 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 22016198  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  22016199 actttga 22016205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 21739090 - 21739496
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  21739090 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacaccttagttgattgtaagcgtggggatgttttttgctacaactataatgaagaaggtcatatca 21739189  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  21739190 gttcgcagtgtacggagcctaagaaggttaggacaggtggcaagctgttttctttgactggtacgcaaacggttaatgaggaccgacttatcagaggtac 21739289  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21739290 ttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcttgtttta 21739389  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21739390 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 21739489  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  21739490 actttga 21739496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 21742606 - 21743012
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||  || |||||||| ||||| |    
T  21742606 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatatta 21742705  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21742706 gttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 21742805  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21742806 ttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctgattgta 21742905  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21742906 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagag 21743005  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  21743006 actttga 21743012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Original strand, 24096669 - 24097074
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24096669 gagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatca 24096768  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  24096769 gttcacagtgtactcagccgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggactgacttatcagaggtac 24096868  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24096869 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgta 24096968  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||    
T  24096969 tctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 24097068  T
Q  406 actttg 411  Q
    ||||||    
T  24097069 actttg 24097074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19857610 - 19857204
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |    
T  19857610 gagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcggggagacattgtttgttataactacaatgaggaaggtcatatta 19857511  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||| |||  |||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||| ||||||||    
T  19857510 gttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttatgaccagtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttattagaggtac 19857411  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19857410 ttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtatggttgta 19857311  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  19857310 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 19857211  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  19857210 actttga 19857204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 20832954 - 20833360
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||| | || ||  ||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  20832954 gagaagaattgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatca 20833053  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||||| || | |||||||||||| ||| | || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  20833054 gttcgcagtgtacgcaaccgaggaaggttaggaccggtagtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 20833153  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  20833154 ttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttgggtctggttgta 20833253  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  20833254 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 20833353  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  20833354 actttga 20833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 48426204 - 48425804
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  48426204 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 48426105  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48426104 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 48426005  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  48426004 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 48425905  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  48425904 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 48425805  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  48425804 g 48425804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 52989077 - 52988672
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||    
T  52989077 gagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatca 52988978  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  | ||| |  | || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  52988977 gttcacaatgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 52988878  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  52988877 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgta 52988778  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||    
T  52988777 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 52988678  T
Q  406 actttg 411  Q
    | ||||    
T  52988677 attttg 52988672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 38909885 - 38910285
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  38909885 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 38909984  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| ||||| ||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38909985 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtttttgccttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 38910084  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38910085 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 38910184  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  38910185 tatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 38910284  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  38910285 g 38910285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 369
Target Start/End: Original strand, 20074763 - 20075126
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||    
T  20074763 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagcttggctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatca 20074862  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
     |||| ||||| |  |||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  20074863 attcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 20074962  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  20074963 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgta 20075062  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20075063 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18710536 - 18710315
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  18710536 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataag 18710437  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  18710436 ttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgt 18710337  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18710336 ctatgtttggtagagactttga 18710315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 411
Target Start/End: Original strand, 31537060 - 31537456
Alignment:
Q  15 tgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagt 114  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| ||||| |||||  |||    
T  31537060 tgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggccatattagttcacagt 31537159  T
Q  115 gtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctt 214  Q
    || |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||| | ||| |||||||  |    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31537160 gtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacgcagactcctaatgaagaccgacttatcagaggtacttgtttctt 31537259  T
Q  215 taataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  31537260 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatatg 31537359  T
Q  315 aaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  31537360 aaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 31537456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37680380 - 37679980
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| |||||     
T  37680380 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttca 37680281  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| | ||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37680280 cagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagacttatcagaggtacttgtt 37680181  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  37680180 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctga 37680081  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  37680080 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 37679981  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  37679980 g 37679980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20297719 - 20297347
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||   ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |    
T  20297719 gagaggaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacagcctagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatatta 20297620  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaa-ctcgtacgcaatcagtg--aatgaggacgaacttatcagagg 202  Q
    |||| |||||| |  || | ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| | || ||    |  || |   |||||||||  ||||||||||||    
T  20297619 gttcatagtgtcctgagtcgaagaaggttagaactggtgggaaggtgtttggtttgagctggttattac-cactaccaatgaggaccgacttatcagagg 20297521  T
Q  203 tacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtt 302  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |    
T  20297520 tactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggat 20297421  T
Q  303 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297420 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 20297347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Original strand, 20853999 - 20854220
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  20853999 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataag 20854098  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  20854099 ttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgt 20854198  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20854199 ctatgtttggtagagattttga 20854220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16379255 - 16379004
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||     | ||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16379255 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattg 16379156  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||  | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16379155 gtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 16379056  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  16379055 ttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggt 16379004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21961363 - 21961135
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||    
T  21961363 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatca 21961264  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||  |  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  21961263 gttcgcagtgccctgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 21961164  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattg 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21961163 ttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 22496499 - 22496705
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  22496499 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgg 22496598  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22496599 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22496698  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22496699 gtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 16347838 - 16348044
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16347838 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16347937  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16347938 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16348037  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16348038 gtttggt 16348044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 20081619 - 20081825
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  20081619 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 20081718  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  20081719 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20081818  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  20081819 gtttggt 20081825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 24785100 - 24785306
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |   ||||    
T  24785100 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgg 24785199  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  24785200 gtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 24785299  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  24785300 gtttggt 24785306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 51330735 - 51330941
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  51330735 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 51330834  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  51330835 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 51330934  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  51330935 gtttggt 51330941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 370  Q
    |||| | | | ||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388478
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||| ||| | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 33388478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042464
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    | || | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17042457  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  17042458 gtttggt 17042464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21833418 - 21833246
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||  | |   ||||    
T  21833418 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgg 21833319  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21833318 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21833246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 304 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200449
Alignment:
Q  304 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtag 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtag 12200457  T
Q  404 agactttg 411  Q
    ||| ||||    
T  12200456 agattttg 12200449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21842328 - 21842122
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  | |   || |    
T  21842328 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttag 21842229  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  21842228 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctat 21842129  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  21842128 gtttggt 21842122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19109484 - 19109278
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||   ||||||||| | |   |||     
T  19109484 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttga 19109385  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  19109384 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19109285  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  19109284 gtttggt 19109278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Original strand, 41350911 - 41351068
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  41350911 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 41351010  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 352  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41351011 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41351068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 343
Target Start/End: Original strand, 21228799 - 21228947
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  21228799 atcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 21228898  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 343  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21228899 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 256
Target Start/End: Original strand, 21045322 - 21045428
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||     | || | |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21045322 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 21045421  T
Q  250 gtgctac 256  Q
    |||||||    
T  21045422 gtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22401708 - 22401631
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 272  Q
    ||||||| ||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22401708 atcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgct 22401631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 250
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactgg 250  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828701
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928104
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 7 - 412
Target Start/End: Original strand, 14993350 - 14993755
Alignment:
Q  7 agaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14993350 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcatggggatgttgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatcag 14993449  T
Q  107 ttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtact 206  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14993450 ttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgaatggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtact 14993549  T
Q  207 tgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtat 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14993550 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtat 14993649  T
Q  307 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||     
T  14993650 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtggagg 14993749  T
Q  407 ctttga 412  Q
    ||||||    
T  14993750 ctttga 14993755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15267066 - 15266736
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  15267066 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcatggagacattgtttgctataactgcaacgaagaaggtcatatca 15266967  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||   | ||| |||  ||||||||||||||     
T  15266966 gttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtacgcaaacaactagtgaagacagacttatcagaggtag 15266867  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15266866 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgta 15266767  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15266766 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20893321 - 20892953
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || || || |||||||    
T  20893321 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacaatttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctactacaactgcaatgaagaggggcatatca 20893222  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  20893221 gttcgcagtgtactgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 20893122  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  20893121 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgta 20893022  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893021 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 20892953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15073649 - 15073243
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| || ||||||||   |||||||||||| |||| |||||| |||| | | ||  |||||||||| || |   | || ||||||||||| |    
T  15073649 gagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagctttgtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatataa 15073550  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||  |||| | | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15073549 gctcacagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgttttctttgactggtacacaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtac 15073450  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  15073449 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctctggttata 15073350  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  15073349 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagag 15073250  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  15073249 actttga 15073243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 3261781 - 3262181
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  3261781 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 3261880  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3261881 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 3261980  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3261981 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 3262080  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  3262081 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 3262180  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  3262181 g 3262181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 29450524 - 29450924
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||     
T  29450524 gaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcacatcagttca 29450623  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  || || |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29450624 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 29450723  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29450724 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 29450823  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  29450824 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 29450923  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  29450924 g 29450924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16150926 - 16150527
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||   | || || || ||||| |    
T  16150926 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatatta 16150827  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca-atcagtgaatgaggacgaacttatcagaggta 204  Q
    | ||| | || | | | || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| ||||| | | || | | ||||||   |||||||||| |||    
T  16150826 gctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccact-agtgaggatcgacttatcagatgta 16150728  T
Q  205 cttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgt 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16150727 cttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgt 16150628  T
Q  305 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtaga 404  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  16150627 ttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaga 16150528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16155072 - 16154673
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||   | || || || ||||| |    
T  16155072 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatatta 16154973  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgca-atcagtgaatgaggacgaacttatcagaggta 204  Q
    | ||| | || | | | || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| ||||| | | || | | ||||||   |||||||||| |||    
T  16154972 gctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccact-agtgaggatcgacttatcagatgta 16154874  T
Q  205 cttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgt 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16154873 cttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgt 16154774  T
Q  305 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtaga 404  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  16154773 gtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaga 16154674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 44658853 - 44659253
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |  ||| ||||||| |||||     
T  44658853 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgttacaattgcaatggagaatgtcatattagttca 44658952  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  | || ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| | | |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44658953 cagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgaatggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 44659052  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44659053 tctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 44659152  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  44659153 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 44659252  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  44659253 g 44659253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 11204223 - 11204584
Alignment:
Q  15 tgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagt 114  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| | ||| | | || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||||||  |||    
T  11204223 tgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagttcacagt 11204322  T
Q  115 gtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctt 214  Q
    || |  |||| || |||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11204323 gtcctgagccgaaaaaggctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctt 11204422  T
Q  215 taataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatg 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  11204423 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatg 11204522  T
Q  315 aaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11204523 aaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 11204584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27903490 - 27903269
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  27903490 acttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataag 27903391  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||    
T  27903390 ttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgt 27903291  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27903290 ctatgtttggtagagattttga 27903269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Original strand, 51603963 - 51604180
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  |||    
T  51603963 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgg 51604062  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||| | | |||||    
T  51604063 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctat 51604162  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||| |||||    
T  51604163 gtttggtagagattttga 51604180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 369
Target Start/End: Original strand, 53750641 - 53750815
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  |||    
T  53750641 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgg 53750740  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 369  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53750741 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 274 - 410
Target Start/End: Original strand, 15354290 - 15354426
Alignment:
Q  274 ttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15354290 ttgattgtgtatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttg 15354389  T
Q  374 tctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15354390 tctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagacttt 15354426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7357557 - 7357280
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |    
T  7357557 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatta 7357458  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||| |  |||| ||||||| ||| ||  |||| ||||||||||| || ||| |||| ||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  7357457 gttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 7357358  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgc 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  7357357 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14697247 - 14696985
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||     | || | |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14697247 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 14697148  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14697147 gtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 14697048  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||| || |||||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14697047 ttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttga 14696985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14162571 - 14162370
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14162571 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttgg 14162472  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
     ||| | | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  14162471 atcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctat 14162372  T
Q  395 gt 396  Q
    ||    
T  14162371 gt 14162370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 15946 - 16150
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  15946 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 16045  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  16046 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 16145  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  16146 gtttg 16150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14683668 - 14683462
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14683668 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14683569  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||||||    
T  14683568 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctat 14683469  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  14683468 gtttggt 14683462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 17092060 - 17092266
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17092060 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgg 17092159  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  17092160 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17092259  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  17092260 gtttggt 17092266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18259731 - 18259629
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18259731 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatca 18259632  T
Q  106 gtt 108  Q
    |||    
T  18259631 gtt 18259629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12479701 - 12479495
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  12479701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 12479602  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  12479601 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 12479502  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  12479501 gtttggt 12479495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 16233903 - 16234109
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16233903 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16234002  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16234003 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16234102  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16234103 gtttggt 16234109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23958848 - 23958642
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  23958848 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 23958749  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  23958748 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 23958649  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  23958648 gtttggt 23958642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27714437 - 27714231
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27714437 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27714338  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||    
T  27714337 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctat 27714238  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  27714237 gtttggt 27714231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 8050534 - 8050706
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  8050534 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8050633  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8050634 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 14300890 - 14301062
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  14300890 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14300989  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14300990 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14301062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19635237 - 19635065
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19635237 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19635138  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19635137 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19635065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8389513 - 8389307
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  8389513 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 8389414  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  8389413 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 8389314  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  8389313 gtttggt 8389307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 16350465 - 16350671
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  16350465 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16350564  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  16350565 gtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 16350664  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    || ||||    
T  16350665 gtctggt 16350671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Original strand, 15144825 - 15145009
Alignment:
Q  217 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | | |||||||| | ||  |||||||| ||| | |||||||||||    
T  15144825 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaa 15144924  T
Q  317 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  15144925 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 15145009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 19775704 - 19775876
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19775704 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19775803  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19775804 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19775876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224563
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  |||||||||||||||    
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggt 18224563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40476141 - 40475935
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  40476141 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 40476042  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  40476041 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 40475942  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  40475941 gtttggt 40475935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 332 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258812
Alignment:
Q  332 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 15258812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Original strand, 16250780 - 16250967
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  16250780 ttaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatat 16250879  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  |||||||||||||||    
T  16250880 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggt 16250967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13513451 - 13513285
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||  | |   | ||    
T  13513451 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 13513352  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactac 361  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  13513351 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16219289 - 16219186
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  16219289 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16219190  T
Q  295 gtct 298  Q
    ||||    
T  16219189 gtct 16219186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16222609 - 16222506
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  16222609 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16222510  T
Q  295 gtct 298  Q
    ||||    
T  16222509 gtct 16222506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 239
Target Start/End: Original strand, 15354234 - 15354291
Alignment:
Q  182 tgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctatt 239  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15354234 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 262
Target Start/End: Original strand, 18604733 - 18604797
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 262  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18604733 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16219125
Alignment:
Q  342 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggt 16219125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222445
Alignment:
Q  342 gctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggt 16222445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 282
Target Start/End: Original strand, 18546794 - 18546877
Alignment:
Q  199 gaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 282  Q
    |||||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| || |||||||||    
T  18546794 gaggtacttgtttcgtcaacaatttccctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatttctcttgattgtg 18546877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14188515 - 14188435
Alignment:
Q  287 taagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||||||||||| | | | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14188515 taagttgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctct 14188435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999681
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 14999681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5500 - 5094
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || || |||||||||||||    
T  5500 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatca 5401  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5400 gttcgcagtgtacgcagcctaagaagtctaggtcaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 5301  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  5300 ttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatg 5201  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5200 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagag 5101  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  5100 actttga 5094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29943 - 29537
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| || |  | ||| ||||||||||||||||    
T  29943 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggacacactctagctgattgtaagtgtggggacatcgtttgttatatttgcaatgaggaaggtcatatca 29844  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  29843 gttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtac 29744  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29743 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgta 29644  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29643 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 29544  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  29543 actttga 29537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 64587 - 64993
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| |    
T  64587 gagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatatta 64686  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || || || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||  || |||||||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  64687 gttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtac 64786  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||  | || |||||    
T  64787 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgta 64886  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  64887 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 64986  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  64987 attttga 64993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 49165 - 49571
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| |    
T  49165 gagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatatta 49264  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || || || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||  || |||||||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  49265 gttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtac 49364  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||  | || |||||    
T  49365 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgta 49464  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  49465 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 49564  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  49565 attttga 49571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 58199 - 58605
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| |    
T  58199 gagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagagggccatatta 58298  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || || || ||||||||||| || ||| | || |||||||||||  || |||||||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  58299 gttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtac 58398  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||  | || |||||    
T  58399 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgta 58498  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  58499 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 58598  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  58599 attttga 58605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43017 - 42611
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |  || |  ||||||||||| |    
T  43017 gagaagaagtgctttaggtgtagtcagaaaggacacactttagcggattttaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgcagaaggtcatatta 42918  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  42917 gttcgcagtgtacgcaacctaagaagattaggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtgcgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggtac 42818  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42817 ttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 42718  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  42717 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 42618  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  42617 actttga 42611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 50519 - 50691
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  50519 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgg 50618  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50619 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 50691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 868 - 1274
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  868 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggatacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttattataactgcaatgaggaaggtcatatca 967  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||   |||||||||  |||||||||||||||    
T  968 gttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcagaggtac 1067  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  1068 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtctgattgta 1167  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  1168 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 1267  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  1268 actttga 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 800 - 1206
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  800 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatatca 899  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||   |||||||||  |||||||| ||||||    
T  900 gttcgcagtgtacgcagccaaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcaaaggtac 999  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1000 ttgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgta 1099  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  1100 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 1199  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  1200 actttga 1206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37258 - 36852
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  37258 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagtgtggggatattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatca 37159  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||  |||||||| ||   ||||| |||  |||||||| ||||||    
T  37158 gttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgttttctttgaccggtacgcaaacaactaatgaagacagacttatcataggtac 37059  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37058 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctggttgta 36959  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  36958 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 36859  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  36858 actttga 36852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34656 - 34250
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |    
T  34656 gagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaaggacacacattagttgattgtaagcgtggggacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatta 34557  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  34556 gttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggaaaggtgtttgccttgactggtacgcaaacagttaatgaggaccgacttattagaggtac 34457  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  34456 ttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgta 34357  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||    
T  34356 tctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaaag 34257  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  34256 actttga 34250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1702
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  1296 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatca 1395  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||| | | |||  |    | |||||||  |||||||||||||||    
T  1396 gttcgcagtgtactcagcctaagaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtac 1495  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgta 1595  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  1596 tctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 1695  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  1696 actttga 1702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8063 - 7657
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  8063 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaaggtcatatca 7964  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||| | | |||  |    | |||||||  |||||||||||||||    
T  7963 gttcgcagtgtactcagcctaagaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtac 7864  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7863 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgta 7764  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  7763 tctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 7664  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  7663 actttga 7657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12279 - 11873
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| |    
T  12279 gagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagtgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaagaaggacatatta 12180  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12179 gttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 12080  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  12079 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatg 11980  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||     
T  11979 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagat 11880  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  11879 actttga 11873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19456177 - 19455771
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  19456177 gagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatatta 19456078  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||    ||||||||||||||    
T  19456077 gttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtac 19455978  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19455977 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 19455878  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19455877 tctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagag 19455778  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  19455777 actttga 19455771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19466322 - 19465971
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  19466322 gagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatatta 19466223  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||    ||||||||||||||    
T  19466222 gttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggtac 19466123  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19466122 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 19466023  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466022 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 14377043 - 14377446
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || || || ||||    
T  14377043 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctaattgtaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccacatca 14377142  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    | |||||||  |||||||||||||||    
T  14377143 gttcgcaatgtacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggtac 14377242  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14377243 ttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgta 14377342  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14377343 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagag 14377442  T
Q  406 actt 409  Q
    ||||    
T  14377443 actt 14377446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19438156 - 19437750
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| ||  | |||||||    
T  19438156 gagaataagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagcgccatatca 19438057  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||| |||||||| |    | | ||||   |||||||||||||||    
T  19438056 gttcgcagtgcacacagccgaagaaggttaggactagtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtac 19437957  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  19437956 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgta 19437857  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  19437856 tctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagag 19437757  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  19437756 actttga 19437750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 24515541 - 24515947
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||| | || ||  ||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  24515541 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaagacacacactagctgattggaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcacatca 24515640  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||||||||| || | || ||||||||| ||||| || |||||| || | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  24515641 gttcgcagtgtacgcaaccgaggacggttaggaccggtggtaacgtgttttctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 24515740  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24515741 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 24515840  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  24515841 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 24515940  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  24515941 actttga 24515947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21474754 - 21474348
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||| | |||||   |||||||||||| || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| |    
T  21474754 gagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatatta 21474655  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| | | | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    |||||||||  ||||||||||||||     
T  21474654 gttctcagtgcaggaaacctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacttctaatgaggaccgacttatcagaggtat 21474555  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21474554 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatg 21474455  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21474454 tctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 21474355  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  21474354 actttga 21474348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Original strand, 10465990 - 10466380
Alignment:
Q  21 aggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgc 120  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||  ||||||| |    
T  10465990 aggtgtggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaaggtcatattagttcacagtgtactc 10466089  T
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || |||||||  || |   |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10466090 agccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgtattgatcggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 10466189  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  10466190 tactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 10466289  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  10466290 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtagggactttg 10466380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25770972 - 25770592
Alignment:
Q  32 gaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaag 131  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||| |||||||| |   | || ||||||||||| || ||  |||| | | | |||||||||    
T  25770972 gaaaggacacacattatctgattgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctctcagtgcaggaaacctaagaag 25770873  T
Q  132 gttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaa 231  Q
    | |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| | || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25770872 gctctgacaggtggcaaggtgtttcctttgactagtaagcaaactgttaataaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaa 25770773  T
Q  232 ttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgt 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25770772 ttgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgt 25770673  T
Q  332 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25770672 tgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttga 25770592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18797832 - 18797476
Alignment:
Q  18 ttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgta 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||  |||| |    
T  18797832 ttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgctataactgcaatgatgaaggccatatcagttcacagtgca 18797733  T
Q  118 cgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaa 217  Q
    | || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18797732 ctcaaccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaa 18797633  T
Q  218 taatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaa 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  18797632 tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgacatgaaa 18797533  T
Q  318 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18797532 ggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 18797476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 88 - 412
Target Start/End: Original strand, 19486503 - 19486827
Alignment:
Q  88 acgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgagga 187  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| |  | ||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||| || | ||||||||    
T  19486503 acgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaggcaggtggaaagttgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgagga 19486602  T
Q  188 cgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatat 287  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19486603 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatat 19486702  T
Q  288 aagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctat 387  Q
    ||||||||||||||  | ||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  19486703 aagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgt 19486802  T
Q  388 tgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  19486803 tgtctatgtttggtagagattttga 19486827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15462305 - 15462084
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  15462305 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataag 15462206  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  || |    
T  15462205 ttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttat 15462106  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  15462105 ctatgtttggtagagattttga 15462084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 34642713 - 34643119
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||   |||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  34642713 gagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgtaaacgtggtgatattgtatgctacaactgcaatggggagggtcatatca 34642812  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  || |||||||| | | |||||| ||   |||||||||||||||    
T  34642813 gttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtacgcaaaccgcgaatgaagatagacttatcagaggtac 34642912  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||| || ||||     
T  34642913 ttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggtttgattgtg 34643012  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||   | |||||||||||||| |    
T  34643013 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggg 34643112  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  34643113 attttga 34643119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24367549 - 24367184
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||| |  ||||||||||| |||||     
T  24367549 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcggggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagttca 24367450  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||  |  | || |||||   ||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24367449 cagtgccctgaaccgaagaaaactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 24367350  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  24367349 tctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatctga 24367250  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24367249 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtct 24367184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Original strand, 21567118 - 21567523
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   |  |||| || || ||||    
T  21567118 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgataaggagggccacatca 21567217  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    ||| |||||   ||||||||||||||    
T  21567218 gttcccagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaataaggacatgcttatcagaggtac 21567317  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| || |||||    
T  21567318 ttgtttctttaatagtacttattcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgggtttgattgta 21567417  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  21567418 actgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 21567517  T
Q  406 actttg 411  Q
    | ||||    
T  21567518 attttg 21567523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405464
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || ||||  ||||||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctat 18405459  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  18405460 gtttg 18405464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010977
Alignment:
Q  246 actggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcta 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  346 agggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggta 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatttttggta 20010977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23081388 - 23081184
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23081388 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23081289  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    || | | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  23081288 gttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 23081189  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  23081188 gtttg 23081184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Original strand, 5836544 - 5836710
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||    
T  5836544 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgg 5836643  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactac 361  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5836644 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactac 5836710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 412
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182900
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   | |||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgct 18182885  T
Q  398 tggtagagactttga 412  Q
    |||| |||| |||||    
T  18182886 tggtcgagattttga 18182900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 412
Target Start/End: Original strand, 23085096 - 23085358
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||  ||| ||||||||||  | | || |||||||| ||||  ||| ||| |||||||||| || ||||||| || ||||    
T  23085096 gtgtttgctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactg 23085195  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||   | | ||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23085196 gtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 23085295  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  23085296 ttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttga 23085358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 29589755 - 29589961
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  29589755 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 29589854  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  29589855 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 29589954  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  29589955 gtttggt 29589961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22436834 - 22436662
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  22436834 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 22436735  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22436734 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22436662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 412
Target Start/End: Original strand, 30678297 - 30678557
Alignment:
Q  152 gtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggt 251  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||     | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  30678297 gtttgctttgactggtacacaaacagtgaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgt 30678396  T
Q  252 gctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 351  Q
    ||||| | |||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||| | ||   |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30678397 gctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtt 30678496  T
Q  352 cagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
      || ||||||||||| || ||||| |  |||   ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30678497 tggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttga 30678557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 2872118 - 2872324
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  2872118 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 2872217  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  2872218 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 2872317  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  2872318 gtttggt 2872324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16574855 - 16574649
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16574855 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16574756  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16574755 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16574656  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16574655 gtttggt 16574649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 16620525 - 16620731
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16620525 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16620624  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16620625 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16620724  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16620725 gtttggt 16620731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925162
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||| | || ||||  || |||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctat 16925155  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16925156 gtttggt 16925162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559491
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  27559385 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 27559484  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  27559485 gtttggt 27559491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 24293098 - 24293304
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  24293098 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24293197  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  24293198 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 24293297  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  24293298 gtttggt 24293304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19867630 - 19867446
Alignment:
Q  217 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 316  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||| || ||| | ||| |||||||    
T  19867630 ataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaa 19867531  T
Q  317 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  19867530 tgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 19867446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 28260513 - 28260719
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  28260513 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28260612  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  28260613 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28260712  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  28260713 gtttggt 28260719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28285403 - 28285197
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  28285403 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28285304  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  28285303 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28285204  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  28285203 gtttggt 28285197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 28339262 - 28339468
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  28339262 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28339361  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  28339362 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 28339461  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  28339462 gtttggt 28339468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28312595 - 28312423
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||  | |   ||||    
T  28312595 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgg 28312496  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28312495 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28312423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190229
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27190229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 367
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259011
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27259011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25115517 - 25115311
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   | ||    
T  25115517 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgg 25115418  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  25115417 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 25115318  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  25115317 gtttggt 25115311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 262
Target Start/End: Original strand, 22829702 - 22829769
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 262  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22829702 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379755
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16379755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647351
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16647351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 367
Target Start/End: Original strand, 4289 - 4650
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |    
T  4289 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatatta 4388  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4389 gttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 4488  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4489 ttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttata 4588  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 43404 - 43810
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || |   | || || |||||||| |    
T  43404 gagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagagggtcatatta 43503  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||| |||| | | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43504 gctcgcagtgcaagaagcccaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 43603  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43604 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatg 43703  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||     
T  43704 tctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagat 43803  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  43804 actttga 43810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25129
Alignment:
Q  325 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttga 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8933 - 8527
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  8933 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggccatatca 8834  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||| || || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  8833 gttcgcagtgcactcaaccgaagaaggttagtaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcatactactagtgaggatcgacttatcagaggtac 8734  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  8733 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgta 8634  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8633 tctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 8534  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  8533 attttga 8527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 23563332 - 23563738
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||| |    
T  23563332 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagggtggagacaatgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatta 23563431  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||   |||||||||  |||||||||||||||    
T  23563432 gttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtac 23563531  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | ||    
T  23563532 ttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatggatata 23563631  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  23563632 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagag 23563731  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  23563732 actttga 23563738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 411
Target Start/End: Original strand, 23078081 - 23078474
Alignment:
Q  18 ttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgta 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23078081 ttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgta 23078180  T
Q  118 cgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaa 217  Q
    | ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23078181 ctcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaa 23078280  T
Q  218 taatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaa 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  23078281 tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaag 23078380  T
Q  318 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23078381 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 23078474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20345481 - 20345116
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||     
T  20345481 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggggaaggtcatattagttca 20345382  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20345381 cagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 20345282  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  20345281 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctga 20345182  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 376  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20345181 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtct 20345116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 57 - 412
Target Start/End: Original strand, 21983392 - 21983747
Alignment:
Q  57 aagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttg 156  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| |  | ||||||| ||||||||||    
T  21983392 aagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaggcaggtggaaaggtgtttg 21983491  T
Q  157 ctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 256  Q
    | || |||  ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21983492 cattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctac 21983591  T
Q  257 tcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 356  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21983592 acattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 21983691  T
Q  357 actacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21983692 actacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttga 21983747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22505883 - 22505513
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||| ||||    
T  22505883 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagatgggacatagcttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatca 22505784  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||| |  | || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||| ||||||    
T  22505783 gttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaaaggtac 22505684  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  22505683 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgta 22505584  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 376  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22505583 tctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtct 22505513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 14884160 - 14884560
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| | ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||| |||||     
T  14884160 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttggctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatattagttca 14884259  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| | ||||  ||| |  ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14884260 cagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 14884359  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||| |||||    
T  14884360 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtctga 14884459  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  14884460 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 14884559  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  14884560 g 14884560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 88 - 412
Target Start/End: Original strand, 21561271 - 21561595
Alignment:
Q  88 acgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaagg-ttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgagg 186  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||| |||| |||||||    
T  21561271 acgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcataagaaggcttagg-caggtggaaaggtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgagg 21561369  T
Q  187 acgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcata 286  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21561370 accgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcata 21561469  T
Q  287 taagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtcta 386  Q
    |||||| ||| ||||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |    
T  21561470 taagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtcca 21561569  T
Q  387 ttgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  21561570 ttgtctatgtttggtagagattttga 21561595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 93 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20824570 - 20824257
Alignment:
Q  93 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaac 192  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||| |||||||  |    ||||||||   ||    
T  20824570 gaaggtcacattagttcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcaggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgac 20824471  T
Q  193 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagtt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  20824470 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagtt 20824371  T
Q  293 gggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtct 392  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||    
T  20824370 gggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtct 20824271  T
Q  393 atgtttggtagaga 406  Q
    ||||||||||||||    
T  20824270 atgtttggtagaga 20824257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25851271 - 25850871
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||| ||| |  |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |||||     
T  25851271 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatacaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagttca 25851172  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25851171 cagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtt 25851072  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  25851071 tctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctga 25850972  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  25850971 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 25850872  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  25850871 g 25850871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Original strand, 28892291 - 28892512
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  28892291 acttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataag 28892390  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||    
T  28892391 ttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgt 28892490  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  28892491 ctatgtttggtagagattttga 28892512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20778932 - 20778711
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  20778932 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataag 20778833  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  20778832 ttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgt 20778733  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20778732 ctatgtttggtagagattttga 20778711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22464969 - 22464748
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22464969 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataag 22464870  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  22464869 ttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgt 22464770  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22464769 ctatgtttggtagagattttga 22464748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Original strand, 17266687 - 17266904
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||    
T  17266687 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgg 17266786  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    || || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||| | | |||||    
T  17266787 gtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctat 17266886  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||| |||||    
T  17266887 gtttggtagagattttga 17266904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Original strand, 21631637 - 21631924
Alignment:
Q  80 caacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtg 179  Q
    ||||| ||| || |||||||||||  ||||| |||| | | |||||||||||| |  |||  |||| || ||||||||||| ||| |||| ||  |||||    
T  21631637 caactgcaatgaagaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcagactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacacagacagtg 21631736  T
Q  180 aatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 279  Q
    |||||||||    | || |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21631737 aatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgatt 21631836  T
Q  280 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | |||||||||||| ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21631837 gtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429250
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||   ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctat 25429255  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  25429254 gtttg 25429250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21882807 - 21882601
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  21882807 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21882708  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  21882707 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 21882608  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  21882607 gtttggt 21882601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16359535 - 16359329
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16359535 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16359436  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16359435 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16359336  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16359335 gtttggt 16359329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 29473426 - 29473632
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  29473426 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 29473525  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  29473526 gtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 29473625  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  29473626 gtttggt 29473632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34569527 - 34569321
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  34569527 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 34569428  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  34569427 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 34569328  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  34569327 gtttggt 34569321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40711813 - 40711607
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  40711813 atcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 40711714  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  40711713 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 40711614  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  40711613 gtttggt 40711607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736284
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgg 26736179  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  26736180 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctat 26736279  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  26736280 gtttg 26736284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 14997092 - 14997298
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  | |   ||||    
T  14997092 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgg 14997191  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  14997192 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 14997291  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  14997292 gtttggt 14997298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18782147 - 18781941
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18782147 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18782048  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  18782047 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 18781948  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  18781947 gtttggt 18781941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 22330240 - 22330446
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22330240 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22330339  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22330340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22330439  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22330440 gtttggt 22330446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27521439 - 27521233
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27521439 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27521340  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  27521339 gtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27521240  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  27521239 gtttggt 27521233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 37288849 - 37289021
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  37288849 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 37288948  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37288949 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 37289021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41773875 - 41773703
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  41773875 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 41773776  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41773775 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 41773703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23474198 - 23474011
Alignment:
Q  225 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 324  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||| | |  |  ||||||| ||||| |    
T  23474198 cctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagaga 23474099  T
Q  325 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |  ||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  23474098 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 23474011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19772993 - 19772787
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19772993 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19772894  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  19772893 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19772794  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  19772793 gtttggt 19772787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27613389 - 27613183
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27613389 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27613290  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  27613289 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27613190  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  27613189 gtttggt 27613183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 27682753 - 27682959
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27682753 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27682852  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  27682853 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27682952  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  27682953 gtttggt 27682959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22350952 - 22350746
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  22350952 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 22350853  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22350852 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22350753  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22350752 gtttggt 22350746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 27665843 - 27666049
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  27665843 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27665942  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  27665943 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 27666042  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  27666043 gtttggt 27666049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23461004 - 23460832
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  23461004 atcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 23460905  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23460904 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803424
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 20803424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22137701 - 22137529
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22137701 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22137602  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22137601 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22137529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23526084 - 23525952
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||| | || |||||    
T  23526084 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgg 23525985  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 327  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||    
T  23525984 gtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 43122620 - 43122516
Alignment:
Q  57 aagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttg 156  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43122620 aagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttg 43122521  T
Q  157 cttta 161  Q
    |||||    
T  43122520 cttta 43122516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21410217 - 21409995
Alignment:
Q  145 gcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattataga 244  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |  ||| |||||||||    || ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  21410217 gcaaggtgtttgctttagctggtacttagacagagaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcataga 21410118  T
Q  245 tactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagct 344  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||  |  || |||||||| ||| | ||   ||| || || ||||||||||| ||||| || |||    
T  21410117 tactggtgctacatattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctattaatggggaaatggttgtcgaaaccccggct 21410018  T
Q  345 aagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| ||| || |||| ||||||    
T  21410017 aaggcttcggtgactagttctct 21409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 296
Target Start/End: Original strand, 21332339 - 21332440
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  21332339 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 21332438  T
Q  295 gt 296  Q
    ||    
T  21332439 gt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 401
Target Start/End: Original strand, 21336762 - 21336853
Alignment:
Q  310 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  21336762 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggt 21336853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21342939
Alignment:
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21342939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508633
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 23508633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584159
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24584159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 70427 - 70079
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |    
T  70427 gagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatatta 70328  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  70327 gttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggtac 70228  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  70227 ttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttata 70128  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70127 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 207 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60652
Alignment:
Q  207 tgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtat 306  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  307 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagaga 60658  T
Q  407 ctttga 412  Q
    ||||||    
T  60657 ctttga 60652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 1937 - 2343
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  1937 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcatatca 2036  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | |||| |    ||||||||||||||    
T  2037 gttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaacccactagtgagaagatgcttatcagaggtac 2136  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  2137 ttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtctggttgta 2236  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  2237 tctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctatgtttggtagag 2336  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  2337 actttga 2343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 70506 - 70285
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  70506 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataag 70407  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||    
T  70406 ttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgt 70307  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  70306 ctatgtttggtagagattttga 70285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Original strand, 11891 - 11995
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||| |||||||||||||    
T  11891 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgttacatttggaacgaagaaggtcatatca 11990  T
Q  106 gttcg 110  Q
    |||||    
T  11991 gttcg 11995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6124 - 5718
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |    
T  6124 gagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatatta 6025  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||||| |    |  ||||||   ||||||||||||||    
T  6024 gttcacagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgcaaaccactagcgaggacaggcttatcagaggtac 5925  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5924 ttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtctggttgta 5825  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  5824 tctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 5725  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  5724 actttga 5718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 41236 - 41452
Alignment:
Q  149 ggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatact 248  Q
    ||||||||||||| || |||| ||  ||| |||||||||  | || ||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41236 ggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcatctgatcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatact 41335  T
Q  249 ggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 348  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |  || |||||||| ||| | ||   |||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  41336 ggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagg 41435  T
Q  349 gttcagtaactacttct 365  Q
    |||| || |||||||||    
T  41436 gttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 839 - 1245
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| || || ||||||||||    
T  839 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatca 938  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgagga-cgaacttatcagaggta 204  Q
    ||||  |||||||||| || | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| ||| |||| |    | |||||| |||| ||||||||||||    
T  939 gttcacagtgtacgcaaccgaggaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgaa-ttatcagaggta 1037  T
Q  205 cttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgt 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1038 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgt 1137  T
Q  305 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtaga 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  1138 atatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaga 1237  T
Q  405 gactttga 412  Q
    ||||||||    
T  1238 gactttga 1245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21133 - 20727
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||| ||||| || | |||||    
T  21133 gagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggacacacattagttgattgtaagcggggagacataatttgctataactgcaatgaggagggccgtatca 21034  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  21033 gttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggatctacttatcagaggtac 20934  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20933 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggtcgta 20834  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20833 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagag 20734  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  20733 actttga 20727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 472 - 878
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||| || || || |||||||    
T  472 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacagcctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatca 571  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || ||||| ||||||||||| || | ||| || |||||||| || ||| |||| ||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  572 gttcacagtgcacacagccgaagaaggttagaaccgatgggaaagtgtttgcattgactggtacacagactactaatgaggaccgacttatcagaggtac 671  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | || |||||||||||| ||||| |     ||    
T  672 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgggtataaaaata 771  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||||||| ||||||    
T  772 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagag 871  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  872 actttga 878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 410
Target Start/End: Original strand, 5194 - 5598
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||  |||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||    
T  5194 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactttagctgattgtaagcggagagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatatca 5293  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    |||| ||||||||  | || ||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  5294 gttcatagtgtacataaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactactgaggatcgacttatcagaggtac 5393  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5394 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 5493  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5494 tctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagag 5593  T
Q  406 acttt 410  Q
    |||||    
T  5594 acttt 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 9757 - 10163
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |    
T  9757 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatataa 9856  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  | |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||| ||||||    
T  9857 gttcacaatgtacgcaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaaggtac 9956  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  9957 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgta 10056  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  10057 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagag 10156  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  10157 actttga 10163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24323
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || | || ||||  ||||||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctat 24318  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  24319 gtttg 24323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 326026 - 325620
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  ||||||| || |||| ||| || || || |||||||    
T  326026 gagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatca 325927  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  325926 gttcacagtgcacacaaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 325827  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  325826 ttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 325727  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  325726 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagag 325627  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  325626 actttga 325620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 180 - 412
Target Start/End: Original strand, 200627 - 200859
Alignment:
Q  180 aatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  200627 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgatt 200726  T
Q  280 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |     
T  200727 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgat 200826  T
Q  380 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  200827 ttgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 200859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 319562 - 319507
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcg 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  319562 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcg 319507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23274514 - 23274108
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||    
T  23274514 gagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatca 23274415  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||| |||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  23274414 gttcacagtgcacacaaccgaagaaggttaggactggtggtaaagtgtttgctctgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 23274315  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23274314 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 23274215  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  23274214 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 23274115  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  23274114 actttga 23274108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 19716539 - 19716945
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||  ||||||| || |||| |||| | || || |||||||    
T  19716539 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatca 19716638  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    | |||||||  |||||||| ||||||    
T  19716639 gttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtac 19716738  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  19716739 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgta 19716838  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||    
T  19716839 tctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 19716938  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  19716939 actttga 19716945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20848505 - 20848105
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  20848505 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 20848406  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20848405 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 20848306  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20848305 tctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctga 20848206  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  20848205 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 20848106  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  20848105 g 20848105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 23097541 - 23097945
Alignment:
Q  7 agaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcag 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || |||||    
T  23097541 agaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatcag 23097640  T
Q  107 ttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtact 206  Q
    |||  |||| || ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   ||||| |||||||||    
T  23097641 ttcacagtgcactcagccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttataagaggtact 23097740  T
Q  207 tgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtat 306  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||     
T  23097741 tgattctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaa 23097840  T
Q  307 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | |||||||||||||||||    
T  23097841 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 23097940  T
Q  407 ctttg 411  Q
     ||||    
T  23097941 ttttg 23097945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23113528 - 23113238
Alignment:
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||  |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23113528 agcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgactggaacacaggcagttattgaggacga-cttatcaaaggtacttgtttctttaatag 23113430  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||   |||||  |||    
T  23113429 tactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctggttatgtcaagtatgagtgga 23113330  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23113329 gaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttga 23113238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12577085 - 12576868
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  |||    
T  12577085 atcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgg 12576986  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  | || |||| | | |||||    
T  12576985 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctat 12576886  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||| |||||    
T  12576885 gtttggtagagattttga 12576868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Original strand, 19721102 - 19721365
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||  ||||||| || |||| |||| | || || |||||||    
T  19721102 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagagggccatatca 19721201  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    | |||||||  |||||||| ||||||    
T  19721202 gttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcaaaggtac 19721301  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19721302 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733689
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctat 22733684  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  22733685 gtttg 22733689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23074595 - 23074391
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  23074595 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23074496  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  23074495 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 23074396  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  23074395 gtttg 23074391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 412
Target Start/End: Original strand, 24817577 - 24817768
Alignment:
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||     | ||  ||||||| |||    
T  24817577 tactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatgga 24817676  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  24817677 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttga 24817768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 399
Target Start/End: Original strand, 23105461 - 23105643
Alignment:
Q  217 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 316  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  23105461 ataatacacctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaa 23105560  T
Q  317 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 399  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  23105561 tggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 23105643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9338314 - 9338108
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  9338314 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 9338215  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  9338214 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 9338115  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  9338114 gtttggt 9338108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9486948 - 9486742
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  9486948 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 9486849  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  9486848 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 9486749  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  9486748 gtttggt 9486742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 11351422 - 11351628
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  11351422 atcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 11351521  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  11351522 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11351621  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  11351622 gtttggt 11351628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16983972 - 16983766
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  16983972 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16983873  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  16983872 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 16983773  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  16983772 gtttggt 16983766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17001732 - 17001526
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17001732 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17001633  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  17001632 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17001533  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  17001532 gtttggt 17001526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 21322977 - 21323183
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  21322977 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21323076  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  21323077 gtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 21323176  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  21323177 gtttggt 21323183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 45673723 - 45673929
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  45673723 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgattgtgattctgctttgg 45673822  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||    
T  45673823 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctat 45673922  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  45673923 gtttggt 45673929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 22742677 - 22742849
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  22742677 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 22742776  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22742777 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23065145 - 23064973
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  23065145 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23065046  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23065045 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 22323053 - 22323259
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22323053 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22323152  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22323153 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22323252  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22323253 gtttggt 22323259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 24705193 - 24705399
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  24705193 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24705292  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| | || || |  ||||||||    
T  24705293 gtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctat 24705392  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  24705393 gtttggt 24705399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24712766 - 24712560
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  24712766 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24712667  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  24712666 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 24712567  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  24712566 gtttggt 24712560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 44383281 - 44383487
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  44383281 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgg 44383380  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  44383381 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 44383480  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  44383481 gtttggt 44383487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029378
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |   |||||||| ||| | ||||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  |||||||||||||||    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggt 23029378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220542
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 27220646  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||    
T  27220645 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtt 27220546  T
Q  398 tggt 401  Q
    ||||    
T  27220545 tggt 27220542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373795
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27373883  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  27373882 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 27373795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10871582 - 10871376
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  10871582 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10871483  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10871482 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctat 10871383  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  10871382 gtttggt 10871376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24678219 - 24678013
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  24678219 atcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 24678120  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  24678119 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 24678020  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  24678019 gtttggt 24678013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 24657369 - 24657575
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  24657369 atcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24657468  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
     ||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  24657469 atcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 24657568  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  24657569 gtttggt 24657575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 24874461 - 24874667
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  24874461 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24874560  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  24874561 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctat 24874660  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  24874661 gtttggt 24874667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 352
Target Start/End: Original strand, 30208578 - 30208788
Alignment:
Q  142 gtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattat 241  Q
    |||| |||||| | |||||| || |||| ||  |||||||||||||  | || |||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||    
T  30208578 gtgggaaggtgatcgctttagctggtactcagacagtgaatgaggatcatctgatcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattat 30208677  T
Q  242 agatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |  || |||||||| ||| | ||   ||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  30208678 agatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcgtctatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccg 30208777  T
Q  342 gctaagggttc 352  Q
    || ||||||||    
T  30208778 gcaaagggttc 30208788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24265102 - 24264930
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  24265102 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 24265003  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||  ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24265002 gtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 24264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21142958
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 21142870  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  21142871 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 21142958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23205046 - 23204874
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  |  ||||| |  ||||||  | |   ||||    
T  23205046 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgg 23204947  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23204946 gtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctct 23204874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23279343 - 23279291
Alignment:
Q  360 acttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23279343 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 23279291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19817579 - 19817492
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 282  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||    
T  19817579 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattgctgcggattgtg 19817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23676650 - 23676583
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 262  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23676650 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739431
Alignment:
Q  193 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 22739431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22280840 - 22280771
Alignment:
Q  192 cttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22280840 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 367
Target Start/End: Original strand, 41606209 - 41606269
Alignment:
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  41606209 tctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 41606269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22374222 - 22373819
Alignment:
Q  9 aagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagtt 108  Q
    |||||||| || ||||||||   |||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || |   | || ||||||||||| || |    
T  22374222 aagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagct 22374123  T
Q  109 cgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttg 208  Q
    || |||| | | |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22374122 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 22374023  T
Q  209 tttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatct 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22374022 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatct 22373923  T
Q  309 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagact 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22373922 gatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagagact 22373823  T
Q  409 ttga 412  Q
    ||||    
T  22373822 ttga 22373819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Original strand, 31413957 - 31414362
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31413957 gagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatca 31414056  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||| ||| | ||||||| ||| || ||||| || |||||||| || ||| ||| |||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  31414057 gttcacagtgtactcagtcgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtatgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtac 31414156  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  31414157 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgggtttggatgta 31414256  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||||||||||||||||    
T  31414257 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 31414356  T
Q  406 actttg 411  Q
    ||||||    
T  31414357 actttg 31414362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19985536 - 19985130
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| | |||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  |||||||||| || |   | || || || ||||| |    
T  19985536 gagaagaagtatttcagatgtggacagaaatgacacacattagctgattgcaagagtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggggcatatta 19985437  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||  |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||  | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19985436 gctcacagtgcaagaagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagaggtac 19985337  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19985336 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggttata 19985237  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19985236 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 19985137  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  19985136 actttga 19985130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 22027705 - 22028111
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||| || || || |||||||    
T  22027705 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgtaagaggggagacgttgtttgctataactacaatgaagagggccatatca 22027804  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||  |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  22027805 gttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgaccggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtac 22027904  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22027905 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggtttta 22028004  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22028005 tcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 22028104  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  22028105 attttga 22028111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 29300856 - 29301256
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||| || |||||||||| || |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||     
T  29300856 gaagtgttttaggtgtggtcagagaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctactataactgcaatgaagaaggtcatatcagttct 29300955  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||| || |||||| | || ||  |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29300956 cagtgtactcagccgaagaaggctaggatcggtgggaaagtgttttcattgacgggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 29301055  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29301056 tctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctga 29301155  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29301156 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggtagagacttt 29301255  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  29301256 g 29301256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21928784 - 21928378
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||| || |   | || || || ||||| |    
T  21928784 gagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacactttgggtgattgcaagcgtggtgatgtcgtttgctataattgtgatgaagaggggcatatta 21928685  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||  | || | | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||| |||  |||||||||||||||    
T  21928684 gctcacaatgcaagaagcccaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaaactgtgaatgaagaccgacttatcagaggtac 21928585  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21928584 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttata 21928485  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||||    
T  21928484 tctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctatgtttggtagag 21928385  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  21928384 actttga 21928378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22054219 - 22053814
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || |||||||    
T  22054219 gagaagaagtgcttcagatgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatca 22054120  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    || |  |||| || ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  22054119 gtacacagtgcacacagccgaagaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtac 22054020  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  22054019 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtctgattgta 22053920  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     ||||||||||||||||    
T  22053919 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagag 22053820  T
Q  406 actttg 411  Q
    ||||||    
T  22053819 actttg 22053814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28984262 - 28983862
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  28984262 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 28984163  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  ||||| |||||||||||| | ||| |||| ||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28984162 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 28984063  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  28984062 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctga 28983963  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagacttt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| |||    
T  28983962 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagatttt 28983863  T
Q  411 g 411  Q
    |    
T  28983862 g 28983862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 406
Target Start/End: Original strand, 16268649 - 16269049
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || || |   ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |  || ||||||||||    
T  16268649 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagcctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatca 16268748  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||| |  |||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  16268749 gttcacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 16268848  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16268849 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgta 16268948  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||   | ||||||||||||||||    
T  16268949 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 16269048  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  16269049 a 16269049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 57 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20391391 - 20391036
Alignment:
Q  57 aagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttg 156  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  20391391 aagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttg 20391292  T
Q  157 ctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 256  Q
    | || ||| |||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20391291 cattgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctac 20391192  T
Q  257 tcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 356  Q
     ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391191 acattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 20391092  T
Q  357 actacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20391091 actacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttga 20391036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 180 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28989312 - 28989081
Alignment:
Q  180 aatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |    
T  28989312 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaat 28989213  T
Q  280 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 379  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  28989212 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 28989113  T
Q  380 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
     ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  28989112 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 28989081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357487
Alignment:
Q  233 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgtt 332  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  333 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 27357487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21254112 - 21253908
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||   ||||||||    
T  21254112 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgg 21254013  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  21254012 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 21253913  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  21253912 gtttg 21253908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 21391475 - 21391679
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||   ||||||||    
T  21391475 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgg 21391574  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  21391575 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 21391674  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  21391675 gtttg 21391679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 21780801 - 21781005
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||   ||||||||    
T  21780801 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgg 21780900  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  21780901 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 21781000  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  21781001 gtttg 21781005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421710
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  || |||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctat 22421705  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  22421706 gtttg 22421710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19981134 - 19980928
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  19981134 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 19981035  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  19981034 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19980935  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  19980934 gtttggt 19980928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 225 - 399
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786173
Alignment:
Q  225 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 324  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||   |||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  325 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 21786173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 412
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375284
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||    
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||  || ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 22375269  T
Q  398 tggtagagactttga 412  Q
    ||||||||| |||||    
T  22375270 tggtagagattttga 22375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 17671636 - 17671842
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17671636 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17671735  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  17671736 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 17671835  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  17671836 gtttggt 17671842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22523683 - 22523507
Alignment:
Q  225 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 324  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||||| |    
T  22523683 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 22523584  T
Q  325 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||   || ||||||||||||    
T  22523583 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggt 22523507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19115567 - 19115361
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19115567 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19115468  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  19115467 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 19115368  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  19115367 gtttggt 19115361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 20015877 - 20016083
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  20015877 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 20015976  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  20015977 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 20016076  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  20016077 gtttggt 20016083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 21164152 - 21164358
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || || ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |  ||||||| | |   ||||    
T  21164152 atcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgg 21164251  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  21164252 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 21164351  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  21164352 gtttggt 21164358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32603312 - 32603106
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  32603312 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 32603213  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  32603212 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 32603113  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  32603112 gtttggt 32603106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18859744 - 18859538
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18859744 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18859645  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  18859644 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 18859545  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  18859544 gtttggt 18859538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031064
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22031071  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22031070 gtttggt 22031064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 22117789 - 22117995
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||  | |   ||||    
T  22117789 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgg 22117888  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22117889 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22117988  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22117989 gtttggt 22117995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 22126573 - 22126779
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22126573 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22126672  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22126673 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22126772  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22126773 gtttggt 22126779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22990212 - 22990006
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||    
T  22990212 atcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtgctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgg 22990113  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  22990112 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctat 22990013  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22990012 gtttggt 22990006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22042994 - 22042788
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || |||||||||  | |   ||||    
T  22042994 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgg 22042895  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  22042894 gtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22042795  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22042794 gtttggt 22042788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 412
Target Start/End: Original strand, 22245584 - 22245846
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||     | || |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||  ||||||  ||| |     
T  22245584 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatta 22245683  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  22245684 gtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaaggg 22245783  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||| || |||||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  22245784 ttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 22245846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 412
Target Start/End: Original strand, 22246002 - 22246264
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||     | || |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||  ||||||  ||| |     
T  22246002 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatatta 22246101  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  22246102 gtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaaggg 22246201  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||| || |||||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  22246202 ttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 22246264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 30310758 - 30310964
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  30310758 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 30310857  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  30310858 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 30310957  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  30310958 gtttggt 30310964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15536550 - 15536344
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||| ||  | |   ||||    
T  15536550 atcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgg 15536451  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| || ||||||  ||||||||    
T  15536450 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctat 15536351  T
Q  395 gtttggt 401  Q
     ||||||    
T  15536350 atttggt 15536344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 22129231 - 22129437
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22129231 atcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22129330  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |  | ||||  ||||||||    
T  22129331 gtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22129430  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22129431 gtttggt 22129437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Original strand, 19481686 - 19481843
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  19481686 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19481785  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 352  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19481786 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19481843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Original strand, 6606945 - 6607049
Alignment:
Q  57 aagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttg 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |   | || ||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6606945 aagcgtggggatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttg 6607044  T
Q  157 cttta 161  Q
    |||||    
T  6607045 cttta 6607049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19870856 - 19870773
Alignment:
Q  199 gaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 282  Q
    |||||||||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||| || |||||||||    
T  19870856 gaggtacttgtttcatcaacaatttccctttaattgctattatagatattggagctacgcattcttttatttctcttgattgtg 19870773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650035
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20650035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29846 - 29440
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||  ||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||| |   | || ||||||||||| |    
T  29846 gagaagaagtgtttccggtgtgggacgaaaggacacacaatagctgagtgcaagcgtggtgatgttgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatatta 29747  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||| |||| | | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  29746 gctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctctgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtac 29647  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  29646 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgggtctggttatg 29547  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29546 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 29447  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  29446 actttga 29440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 98568 - 98974
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| || || |||||||    
T  98568 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatca 98667  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| |    | |||||||  |||||||| ||||||    
T  98668 gttcgcagtgcacacagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacacaaaccactagtgaggaccgacttatcaaaggtac 98767  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  98768 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgta 98867  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  98868 tctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagag 98967  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  98968 actttga 98974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 176306 - 175901
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| || ||||||||   |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| || |   | || ||||||||||| |    
T  176306 gagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatatta 176207  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||| |||| | | ||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||| | |||  |||||||||||||||    
T  176206 gctcgcagtgcaggaagctttagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaataaagaccgacttatcagaggtac 176107  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  176106 ttatttcttta-tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttata 176008  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  176007 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 175908  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  175907 attttga 175901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 411
Target Start/End: Original strand, 5142 - 5535
Alignment:
Q  18 ttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgta 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5142 ttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcatagtgta 5241  T
Q  118 cgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaa 217  Q
    | ||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5242 ctcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaa 5341  T
Q  218 taatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaa 317  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5342 tagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtatggatgtatctgatatgaaa 5441  T
Q  318 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5442 agagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagagattttg 5535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Original strand, 30326 - 30716
Alignment:
Q  21 aggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgc 120  Q
    |||||||||  |||||||||||   ||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  30326 aggtgtggtaagaaaggacacaaactagctgaatgtaagaatggggacattgtatgctacaactgcaaagaagaaggtcatatcagttcgaagtgtactc 30425  T
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  30426 agccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagacaacaaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaag 30525  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  30526 tactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggg 30625  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30626 gtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 30716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 2039 - 1634
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||| || |   | || || || ||||| |    
T  2039 gagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacatactttagctgattgtaagcgtggg-atgttgtatgctataattgtgatgaagagggacatatta 1941  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||| |||| | | |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  1940 gctcgcagtgcaagaagcccaagaagtttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcaaaggtac 1841  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1840 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatg 1741  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| || | ||||||||||||||||||    
T  1740 tctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctatgtttggtagag 1641  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  1640 actttga 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Original strand, 39318 - 39723
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  39318 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcgtatca 39417  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  39418 gttcgcagtgtacacaatcgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 39517  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39518 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgta 39617  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||    
T  39618 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 39717  T
Q  406 actttg 411  Q
    | ||||    
T  39718 attttg 39723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 250 - 412
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44818
Alignment:
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 44818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4839
Alignment:
Q  225 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 324  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||| | ||| | ||  ||||||| ||||| |    
T  5015 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagaga 4916  T
Q  325 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||  |||||| ||||||||    
T  4915 tggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggt 4839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14382
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | ||||| |  | |   ||||    
T  14554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgg 14455  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14454 gtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5920 - 5515
Alignment:
Q  7 agaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcag 106  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||| || || |   | || || || || || ||    
T  5920 agaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataattgtgatgaagagggacacattag 5821  T
Q  107 ttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtact 206  Q
     |||||||| | | | |||||||||||| | || ||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5820 ctcgtagtgcaagaaacctaagaaggttcgaaccggtggcatggtgtttgctctaattggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtact 5721  T
Q  207 tgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtat 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| | |    
T  5720 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgggtctggttatgt 5621  T
Q  307 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5620 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctatgtttggtagaga 5521  T
Q  407 ctttga 412  Q
    ||||||    
T  5520 ctttga 5515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22441 - 22035
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||| ||| || || || |||||||    
T  22441 gagaagaaatgcttcaagtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggccatatca 22342  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || ||||| ||||||||||| || | ||| |  |||||||| || ||| |||| ||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  22341 gttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccgttggtatagtgtttgcattgactggtactcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtac 22242  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22241 ttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgggtttggttgta 22142  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22141 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 22042  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  22041 attttga 22035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 410
Target Start/End: Original strand, 164386 - 164790
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||    
T  164386 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagttgattgcaagcgtggtaatgttgtttgttataactgcaatgaagaaggccatatca 164485  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| | | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||  ||||| |  |    | |||||||  |||||||||||||||    
T  164486 gttcgcattatactcagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaccggtacgtagactactagtgaggaccgacttatcagaggtac 164585  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  164586 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttata 164685  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  164686 tctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgtttatctaaggtgtctattgtctatgtttggtaggg 164785  T
Q  406 acttt 410  Q
    |||||    
T  164786 acttt 164790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 367
Target Start/End: Original strand, 30770 - 30920
Alignment:
Q  217 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |   |||||||| ||| | |||||||||||    
T  30770 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaa 30869  T
Q  317 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30870 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 399
Target Start/End: Original strand, 47155 - 47360
Alignment:
Q  193 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagtt 292  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||    
T  47155 ttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagtt 47254  T
Q  293 gggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtct 392  Q
    ||||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  47255 gggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtct 47353  T
Q  393 atgtttg 399  Q
    |||||||    
T  47354 atgtttg 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 152119 - 152007
Alignment:
Q  287 taagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtcta 386  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||      
T  152119 taagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcct 152020  T
Q  387 ttgtctatgtttg 399  Q
    |||||||||||||    
T  152019 ttgtctatgtttg 152007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 251923 - 251536
Alignment:
Q  21 aggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgc 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  251923 aggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctaaaactgcaacgaagaaggtcatatcagttcacagtgtactc 251824  T
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    ||||   ||||| |||||| |||||  | |||||||| |  ||| |||||||  |    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  251823 agcc---gaaggctaggaccggtggggaagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagaggtacttgtttctttaatag 251727  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  251726 tacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagga 251627  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  251626 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttg 251536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 262
Target Start/End: Original strand, 230026 - 230093
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 262  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  230026 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 1257 - 1663
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||| | |||||   |||||||||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| |    
T  1257 gagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatatta 1356  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||  |||| | | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  1357 gctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtac 1456  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  1457 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatg 1556  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1557 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 1656  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  1657 actttga 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 28270 - 28676
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||| | |||||   |||||||||||| || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | || || |||||||| |    
T  28270 gagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatatta 28369  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||  |||| | | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  28370 gctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgacttatcagaggtac 28469  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  28470 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatg 28569  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28570 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 28669  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  28670 actttga 28676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7357 - 6953
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||   | || || || ||||| |    
T  7357 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactatgatgaagaggggcatatta 7258  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||| | || | | |||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  7257 gctcgcaatgcaagaagcccaagaagattaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactggcacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 7158  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||     
T  7157 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtt 7058  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  7057 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 6958  T
Q  406 acttt 410  Q
    |||||    
T  6957 acttt 6953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 8447 - 8853
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||  | || |||||||    
T  8447 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatca 8546  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||| |  || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  8547 gttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtac 8646  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8647 ttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgta 8746  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  8747 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 8846  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  8847 actttga 8853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 18661 - 19067
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| || |||| ||| ||  | || |||||||    
T  18661 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatagggccatatca 18760  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| |||| |  || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  18761 gttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgacttatcagaggtac 18860  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18861 ttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgta 18960  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  18961 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 19060  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  19061 actttga 19067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11296 - 10891
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  11296 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacgcactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatgaagagggtcatatca 11197  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||  ||||||| ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||| || ||| |||||||  |  | |||||||||  |||||||||||||||    
T  11196 gctcacagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagaggtac 11097  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  11096 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgggtttgattgta 10997  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||   | |||||||||||||| |    
T  10996 tctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtaggg 10897  T
Q  406 actttg 411  Q
    ||||||    
T  10896 actttg 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Original strand, 514338 - 514743
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |  || ||||||||||    
T  514338 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagcttaactgaatgtaagtgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatca 514437  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||| |  | || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  514438 gttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 514537  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  514538 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgta 514637  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||    
T  514638 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 514737  T
Q  406 actttg 411  Q
    | ||||    
T  514738 attttg 514743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 441757 - 441572
Alignment:
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||   | | ||  ||||||| |||    
T  441757 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatgga 441658  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  441657 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagaga 441572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 496150 - 495939
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||    
T  496150 atcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgg 496051  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | |||| |||   ||||||||    
T  496050 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctat 495951  T
Q  395 gtttggtagaga 406  Q
    ||||||| ||||    
T  495950 gtttggtcgaga 495939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 180 - 412
Target Start/End: Original strand, 14 - 246
Alignment:
Q  180 aatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 113  T
Q  280 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  114 gtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataag 213  T
Q  380 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
     |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  214 atgtacgttgtctatgtttggtagagactttga 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 54366 - 53962
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||| |||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || ||||||||||    
T  54366 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagcttattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatca 54267  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    | ||   ||| || || || || |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  54266 gctcacggtgcacacaaccgaaaaaggttaggaccagtggtaaagtgtttgctttcactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 54167  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54166 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgtgtctggttgta 54067  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  54066 tctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 53967  T
Q  406 acttt 410  Q
    |||||    
T  53966 acttt 53962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 198 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2784
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtt 2799  T
Q  398 tggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||    
T  2798 tggtagagactttga 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5759 - 5562
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  || || |||||||||||||    
T  5759 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgaagaaggtcatatca 5660  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggt 203  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  5659 gttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtggcaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatcagaggt 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 11733 - 11968
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |     
T  11733 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaaagcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagaaggtcatattagtaca 11832  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  | || ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |    | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11833 cagtgtcctgaaccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactaccagtgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 11932  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagata 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11933 tctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 717 - 496
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  717 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataag 618  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  617 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgt 518  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  517 ctatgtttggtagagactttga 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 175 - 412
Target Start/End: Original strand, 20682 - 20919
Alignment:
Q  175 cagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20682 cagtgaatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 20781  T
Q  275 tgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20782 tgattgtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 20881  T
Q  375 ctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20882 ctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 20919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 175 - 412
Target Start/End: Original strand, 12502 - 12739
Alignment:
Q  175 cagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12502 cagtgaatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 12601  T
Q  275 tgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 374  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12602 tgattgtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 12701  T
Q  375 ctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12702 ctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 12739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 12397 - 12506
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  12397 gagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatca 12496  T
Q  106 gttcgtagtg 115  Q
    ||||| ||||    
T  12497 gttcgcagtg 12506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 20577 - 20686
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  20577 gagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaaggacacacattagatgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatca 20676  T
Q  106 gttcgtagtg 115  Q
    ||||| ||||    
T  20677 gttcgcagtg 20686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 780 - 375
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| |    
T  780 gagaggaagtgcttcaggtgcggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatataa 681  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||| |  | || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  680 gttcacagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 581  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  580 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgta 481  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||    
T  480 tctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 381  T
Q  406 actttg 411  Q
    | ||||    
T  380 attttg 375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 192 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1033
Alignment:
Q  192 cttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  292 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtc 1054  T
Q  392 tatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1053 tatgtttggtagagactttga 1033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5372 - 5205
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  5372 gagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatca 5273  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 173  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  5272 gttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 5205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30253 - 29848
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  || ||||||||||    
T  30253 gagaggaagtgattcaggtgtggtcagaaaagacacaacctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagagggtcatatca 30154  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||| |  |||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || | | |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  30153 gttcgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaaatggtggaaaggtgtttgcattgattggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 30054  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30053 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgta 29954  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  | ||||   | ||||||||||||||||    
T  29953 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 29854  T
Q  406 actttg 411  Q
    | ||||    
T  29853 attttg 29848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42049 - 41684
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||     
T  42049 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttca 41950  T
Q  111 tagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtt 210  Q
     ||||| |  |||| ||||||  ||| |  || || |||||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41949 cagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 41850  T
Q  211 tctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctga 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  41849 tctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctga 41750  T
Q  311 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41749 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 41684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 65283 - 65689
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||||||| | || ||  ||||||| || || |   | |||||||| || ||||    
T  65283 gagaaaaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaattgtaagagaggagatgttgtttgttataattgtgatgaggaaggccacatca 65382  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| || ||| |||||||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  65383 gttcacagtgcacccagccaaagaaggttaggaccggtggaaaagtgtatgcattgactggtacgcagactaccaatgaggacaggcttatcagaggtac 65482  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| || |||||    
T  65483 ttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgta 65582  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | || |||||||||||||    
T  65583 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagag 65682  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  65683 attttga 65689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 199
Target Start/End: Original strand, 62757 - 62950
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  || ||  ||||||||||||    
T  62757 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaagtacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgttttctacaactgtaatgaataaggtcatatca 62856  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcag 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  62857 gttcgcagtgtacgcagcctaagaaagttaggacaggtggcaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcag 62950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 126 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 151766 - 151480
Alignment:
Q  126 aagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactc 225  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | |||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  151766 aagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttctttaatagtactc 151667  T
Q  226 ctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  151666 ctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaaggagaaat 151567  T
Q  326 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  151566 ggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattga 151480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23924
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23806  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||    
T  23807 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctat 23906  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  23907 gtttggtcgagattttga 23924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 153811 - 153699
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |    
T  153811 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaatgaggaaggtcacatta 153712  T
Q  106 gttcgtagtgtac 118  Q
    ||||| |||||||    
T  153711 gttcgcagtgtac 153699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 265
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73841
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 265  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 73841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 265
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78222
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 265  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 78222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 268
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175760
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 268  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcat 175760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182054
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 182054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Original strand, 4834 - 5239
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| |||||||| ||  |||| || || |||| ||||||||| || |||||||    
T  4834 gagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggagggccatatca 4933  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    || |  ||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||   |||||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  4934 gtactcagtgtacacagccgaggaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactatgacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtac 5033  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  5034 ttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgta 5133  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  5134 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 5233  T
Q  406 actttg 411  Q
    | ||||    
T  5234 attttg 5239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 411
Target Start/End: Original strand, 17469 - 17874
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  || || ||||| ||||  ||||  | |||||| ||  |||| || ||||| | |||||| || || |||||||    
T  17469 gagaagaagtgctttaggtgtgatcaaaagggtcacacattagcggattacatgcgtggtgatgttgtatgttacaattgcaacgaagagggccatatca 17568  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    || |  ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| ||| |||||||  |    ||||||||    ||||||||||||||    
T  17569 gtactcagtgtacacagccgaagaaggttagaactggtgggaaaatgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtcttatcagaggtac 17668  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  17669 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgta 17768  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||    
T  17769 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactatgtttggtagag 17868  T
Q  406 actttg 411  Q
    | ||||    
T  17869 attttg 17874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 96 - 412
Target Start/End: Original strand, 93969 - 94285
Alignment:
Q  96 ggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaactta 195  Q
    ||||| || |||||| |||| || || ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||| |||||||  |    ||||||||   |||||    
T  93969 ggtcacattagttcgcagtgcactcaacctaagaaggtcaggactggaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgactta 94068  T
Q  196 tcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  94069 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttggg 94168  T
Q  296 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatg 395  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||    
T  94169 tctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatg 94268  T
Q  396 tttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||| |||||    
T  94269 tttggtagagattttga 94285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 115881 - 115513
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||   |||| |||||| |||||||| || || || ||||| || | ||| | ||| ||||||||||    
T  115881 gagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgatatagtatgctataattgcaatggggagggtcatatca 115782  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  || ||| |||| |    ||||| ||   |||||||||||||||    
T  115781 gttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtatgcaaaccacaaatgaagatagacttatcagaggtac 115682  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||  | ||| || |||||    
T  115681 ttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactaggtttgattgta 115582  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  115581 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 115513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 191 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15257 - 15036
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15257 acttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataag 15158  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  15157 ttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgt 15058  T
Q  391 ctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  15057 ctatgtttcgtagagattttga 15036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6032
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||| || ||||||| | |||||||||||    
T  6240 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtc 6141  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
    |   | | ||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||| |||||    
T  6140 ttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtt 6041  T
Q  398 tggtagaga 406  Q
    |||| ||||    
T  6040 tggtcgaga 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15391 - 15288
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||  ||||||| || |||| ||| || || || |||||||    
T  15391 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaatgacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccatatca 15292  T
Q  106 gttc 109  Q
    ||||    
T  15291 gttc 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 208 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110523
Alignment:
Q  208 gtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatc 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  308 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagac 110528  T
Q  408 tttga 412  Q
    |||||    
T  110527 tttga 110523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 333
Target Start/End: Original strand, 9006 - 9333
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| || ||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  9006 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcaaatca 9105  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
     |||| ||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |    | ||||||   |||||||||||||||    
T  9106 attcgcagtgtacacaaacgaagaaggttaggaccggtggtaatgtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtac 9205  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9206 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtcaggttgta 9305  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttg 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9306 tctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 53408 - 53814
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||| ||| | || || || ||||  || || || || |||||||    
T  53408 gagaagaaatgattcaggtgtggtcaaaaaggacacatcctagttgattgcaagcgtggtgacgtggtatgttataactgtaatgaagagggccatatca 53507  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  | || ||  |||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||| |||||||  |    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  53508 gttcacaatgcacatagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtatttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccaacttatcagaggtac 53607  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| ||| |  |||||    
T  53608 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttaggtttaattgta 53707  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||    
T  53708 tctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 53807  T
Q  406 actttga 412  Q
    |||||||    
T  53808 actttga 53814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 191 - 407
Target Start/End: Original strand, 9397 - 9613
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||    
T  9397 acttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataag 9496  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  9497 ttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgt 9596  T
Q  391 ctatgtttggtagagac 407  Q
    |||||||||||||||||    
T  9597 ctatgtttggtagagac 9613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 263545 - 263139
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||  ||| ||  |||| || || ||||  ||||| || || |||||||    
T  263545 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatca 263446  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    || |  |||| || ||| | ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   ||||| ||||||||    
T  263445 gtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtac 263346  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  263345 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgta 263246  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  263245 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 263146  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  263145 attttga 263139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 180 - 412
Target Start/End: Original strand, 4248 - 4480
Alignment:
Q  180 aatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4248 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 4347  T
Q  280 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 379  Q
    |||||||||||||||||||  || | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  4348 gtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgag 4447  T
Q  380 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4448 ttgtcctttgtctatgtttggtagagactttga 4480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 57 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12096 - 11743
Alignment:
Q  57 aagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttg 156  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |   |||| ||||||||| | |||||| |||| | | |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  12096 aagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttg 11997  T
Q  157 ctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 256  Q
    | || ||| |||||||  || | |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  11996 cattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaccatggtgctac 11897  T
Q  257 tcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 356  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11896 acattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaata 11799  T
Q  357 actacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  11798 actacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttga 11743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 180 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11954 - 11723
Alignment:
Q  180 aatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  11954 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 11855  T
Q  280 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 379  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  11854 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcg 11755  T
Q  380 ttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
     ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  11754 gtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 11723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12111 - 12034
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaa 88  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | || ||||||| |||    
T  12111 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgttacaactgcaa 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40374 - 39972
Alignment:
Q  9 aagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagtt 108  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||||  ||||| |||||| | ||  |||| || || |||| |||||| || || |||||||||     
T  40374 aagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagcggattgcaagcgttgtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcagta 40275  T
Q  109 cgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttg 208  Q
    |  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   ||||| |||||||||||    
T  40274 ctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttattagaggtacttg 40175  T
Q  209 tttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatct 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  40174 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttggggttgattgtatct 40075  T
Q  309 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |    
T  40074 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatt 39975  T
Q  409 ttg 411  Q
    |||    
T  39974 ttg 39972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17726
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||   ||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgg 17622  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    ||||  |  |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  17623 gtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtc-cttgtctat 17721  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  17722 gtttg 17726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 203700 - 203294
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||  ||||| |||  ||| ||  |||| || || ||||  ||||| || || |||||||    
T  203700 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgatgttgtatgttataactgtaacgaagagggccatatca 203601  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    || |  |||| || ||| | ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||||||   ||||| ||||||||    
T  203600 gtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttattagaggtac 203501  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||| || |||||    
T  203500 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgta 203401  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  203400 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 203301  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  203300 attttga 203294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 424438 - 424266
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    |||||||  | |   |||     
T  424438 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttga 424339  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  424338 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 411
Target Start/End: Original strand, 67105 - 67498
Alignment:
Q  18 ttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgta 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||| | ||||    
T  67105 ttcaggtgtggtcaaaagggacacaacctagctgaatgtaagcttggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatattagttcgcaatgta 67204  T
Q  118 cgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaa 217  Q
       |||| |||| |||||| || ||||| || |||||||| || ||| ||| |||  |    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  67205 gtgagccgaagagggttagaactggtggaaaagtgtttgcattgactggtatgcagactaccaatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaa 67304  T
Q  218 taatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaa 317  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  67305 tagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaa 67404  T
Q  318 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  67405 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 67498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 412
Target Start/End: Original strand, 9772 - 10177
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||  |||||  ||||| |||||||| ||  |||| || || |||| |||||| ||  | |||||||    
T  9772 gagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagtgccatatca 9871  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    || |  |||| || | ||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |    |||||    |  ||||||||||||||    
T  9872 gtacacagtgcacactgccgaagaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgatatagg-cttatcagaggtac 9970  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  9971 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgta 10070  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||   | ||||||||||||||||    
T  10071 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 10170  T
Q  406 actttga 412  Q
    | |||||    
T  10171 attttga 10177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 230 - 412
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49268
Alignment:
Q  230 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  330 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 49268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 406
Target Start/End: Original strand, 3992 - 4274
Alignment:
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| || ||  |||| ||  | || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3992 agcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggtacttgtttctttaatag 4091  T
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    |||||   ||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||    
T  4092 tactc---taattgctattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtgga 4188  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4189 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagaga 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 367
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8125
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |  | |   |||||||| | | | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctct 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 412
Target Start/End: Original strand, 626 - 936
Alignment:
Q  102 atcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagag 201  Q
    ||||||||  |||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||  |    ||||||||| | ||||||||||    
T  626 atcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcagactactaatgaggacaagcttatcagag 725  T
Q  202 gtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggt 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |    
T  726 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgat 825  T
Q  302 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||   | ||||||||||||    
T  826 tgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggt 925  T
Q  402 agagactttga 412  Q
    || || |||||    
T  926 agggattttga 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10710
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||   ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || |||| |||||||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctat 10717  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  10716 gtttggt 10710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Original strand, 530 - 567
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacac 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  530 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacac 567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 370
Target Start/End: Original strand, 6242 - 6606
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |  |||||  | || || ||||    
T  6242 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgctagctgattgtaagcgtggcgatattgtatgctataattgtaacgaatagggccacatca 6341  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    || |  |||| || || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||  |    |||||||||   ||||||||||||||    
T  6342 gtactcagtgcacacaacagaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacacagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtac 6441  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||| || |||||    
T  6442 ttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgta 6541  T
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6542 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 191 - 374
Target Start/End: Original strand, 4 - 187
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  4 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatataag 103  T
Q  291 ttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 374  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  104 ttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 269
Target Start/End: Original strand, 857 - 1125
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  857 gagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcgtggtgacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcacatca 956  T
Q  106 gttc-----gtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcaga 200  Q
    ||||     | ||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||   | | |||||  ||||||||||    
T  957 gttcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacaactagtaaggacagacttatcaga 1056  T
Q  201 ggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1057 ggtacttgtttctttaataatacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgtttcatt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 314
Target Start/End: Original strand, 19023 - 19262
Alignment:
Q  75 tgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaat 174  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||     
T  19023 tgctataactgcaatgaggaaggtcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaa 19122  T
Q  175 cagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgt 274  Q
    |    | |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19123 ccactagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgctat 19222  T
Q  275 tgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatg 314  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19223 tgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51970 - 51716
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||  |||||| ||| ||||   | || |||||| |||| |    
T  51970 gagaagaagtgctttaggtgtggtaagaaaggacacactttagcttattgcaagcatggtgatgttgttttctataactgtgatgaagaaggtaatatta 51871  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51870 gttcacagtgtacgcagccaaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttactttgactggtacgcagattgtgaatgaggactgacttatcagaggtac 51771  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcat 260  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51770 ttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 198 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17791
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
    |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 17806  T
Q  398 tggtagagactttga 412  Q
    |||| ||||||||||    
T  17805 tggtcgagactttga 17791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 379
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111265
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 111180  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaag 379  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| ||||    
T  111181 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaag 111265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21802
Alignment:
Q  230 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 329  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  330 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 21802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 305
Target Start/End: Original strand, 1833 - 2132
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | | || ||| | || ||  ||||||| || || |   | ||||| || || ||||    
T  1833 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacatca 1932  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  | |  | |||||||   ||||||||||||||    
T  1933 gttcccagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactagtacgcagactgctattgaggacaggcttatcagaggtac 2032  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgta 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||    
T  2033 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtttgattgta 2132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 279 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26158 - 26025
Alignment:
Q  279 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26158 tgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaa 26059  T
Q  379 gttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26058 ggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 26025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 1487 - 1707
Alignment:
Q  21 aggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatcagttcgtagtgtacgc 120  Q
    |||||||||  ||| ||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1487 aggtgtggttagaagggacacaccctagctgaatgtaagtgtggggacattgtttgctacaactgcaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtactc 1586  T
Q  121 agcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataa 220  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || |||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1587 agccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag 1686  T
Q  221 tactcctttaattgctattat 241  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1687 tactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 269 - 441
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |    
T  269 gagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaagacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatta 368  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagt 178  Q
    ||||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  369 gttcgcaatgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagt 441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 5320 - 5001
Alignment:
Q  93 gaaggtcatatcagttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaac 192  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | | |||||||||||| |   ||  |||| || ||||||||||| ||| |||||||  || ||||| |||||        
T  5320 gaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaaactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagacattgaataaggaccggt 5221  T
Q  193 ttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagtt 292  Q
    | || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||    
T  5220 tgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagtt 5121  T
Q  293 gggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtct 392  Q
    |||||| ||| | |   ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  |||||     
T  5120 gggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcg 5021  T
Q  393 atgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  5020 atgtttggtcgagactttga 5001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16956 - 16761
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |    
T  16956 gagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatatta 16857  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagag 201  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  || ||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||    
T  16856 gttcgcagtgtacgcagactaagaaggttaggacaggtggcaaggtattttcgttgtctggtatgcaaactgtgaatgaggaccgacttatcagag 16761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8540 - 8336
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||    
T  8540 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 8441  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| | || ||||  ||||||||    
T  8440 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctat 8341  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  8340 gtttg 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36422
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  ||||||||    
T  36528 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 36429  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  36428 gtttggt 36422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Original strand, 23472 - 23689
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  23472 atcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgg 23571  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |||| ||||  || |||||    
T  23572 gtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctat 23671  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    |||||||||||| |||||    
T  23672 gtttggtagagattttga 23689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 221 - 412
Target Start/End: Original strand, 9551 - 9742
Alignment:
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||     | ||  ||||||| |||    
T  9551 tactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatgga 9650  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  9651 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttga 9742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 788 - 1020
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |  || |||||||| |    
T  788 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgaaatggagagggtcatatta 887  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||| ||||| |  | || ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||| ||||||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  888 gttcgcagtgtcctgaaccgaagaaggttagaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagtctaccaatgaggaccaacttatcagaggtac 987  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctat 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  988 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 279 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1132
Alignment:
Q  279 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  1257 tgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggt--------tacttctcttgtttgtctaa 1166  T
Q  379 gttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1165 gatgtctgttgtctatgtttggtagagactttga 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 246
Target Start/End: Original strand, 1592 - 1832
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||| ||| |  || ||||||||||    
T  1592 gagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgctacaactgcaatggagagggtcatatca 1691  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtac 205  Q
    ||||  ||||| |  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||| |||||||  |    |||||||||  |||||||||||||||    
T  1692 gttcacagtgtcccgaaccgaagaaggttagaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtac 1791  T
Q  206 ttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagata 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1792 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 552 - 756
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 751  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  752 gtttg 756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4360
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 4365  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  4364 gtttg 4360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 341  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 2437 - 2641
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||||   ||||||||    
T  2437 atcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgg 2536  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  2537 gtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 2636  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  2637 gtttg 2641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 406
Target Start/End: Original strand, 13608 - 13864
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||     | ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13608 gtgtttgctttgactggtacacaaacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattg 13707  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
     |||||| |||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  13708 atgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagag 13807  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
    ||| || |||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13808 ttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgaga 13864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6977 - 6786
Alignment:
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| |||    
T  6977 tactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgga 6878  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6877 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 6786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14107 - 13916
Alignment:
Q  221 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 320  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| |||    
T  14107 tactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgga 14008  T
Q  321 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  14007 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttga 13916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Original strand, 14440 - 14657
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||   ||||||||    
T  14440 atcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgg 14539  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | |||| ||||  ||||||||    
T  14540 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctat 14639  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  14640 gtttggtcgagattttga 14657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11258
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||    
T  11054 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 11153  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  11154 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 11253  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  11254 gtttg 11258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26527 - 26265
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||   | | || |||||||  ||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||    
T  26527 gtgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattg 26428  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 349  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26427 gtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 26328  T
Q  350 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  26327 ttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttga 26265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 36994 - 37200
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   || || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  36994 atcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 37093  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  37094 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctat 37193  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  37194 gtttggt 37200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 412
Target Start/End: Original strand, 57788 - 58005
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| | |||||| |    
T  57788 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttag 57887  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  57888 gtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 57987  T
Q  395 gtttggtagagactttga 412  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  57988 gtttggtcgagattttga 58005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 153 - 406
Target Start/End: Original strand, 216552 - 216805
Alignment:
Q  153 tttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 252  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||  || | ||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  216552 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtg 216651  T
Q  253 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 352  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||| | |  ||||| ||||| | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  216652 ctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttc 216751  T
Q  353 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagaga 406  Q
     || |||||||||||||| ||| | || ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  216752 ggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgaga 216805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1915
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 1920  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  1919 gtttg 1915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 55644 - 55848
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  55644 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 55743  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    ||||   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||    
T  55744 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctat 55843  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  55844 gtttg 55848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10538
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    ||||   | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10531  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  10532 gtttggt 10538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29308
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  || |||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 29301  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  29302 gtttggt 29308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2129 - 1959
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||   ||||||||    
T  2129 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtgctactaagttgg 2030  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 365  Q
    ||||  || | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2029 gtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttct 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22377 - 22171
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  22377 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22278  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  22277 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 22178  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  22177 gtttggt 22171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17446
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||  || |||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 17439  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  17440 gtttggt 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 400
Target Start/End: Original strand, 195034 - 195217
Alignment:
Q  217 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||  |||||||| ||| | ||||||||||     
T  195034 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgat 195133  T
Q  317 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttgg 400  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||||||||    
T  195134 tggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttgg 195217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24220
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||||||  |  || |||| ||    
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatc 24334  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
    | ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || |  ||||  ||||| |||||    
T  24333 ttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtt 24234  T
Q  398 tggtagagactttg 411  Q
    ||||||||| ||||    
T  24233 tggtagagattttg 24220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 64
Target Start/End: Original strand, 4438 - 4496
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtgg 64  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4438 gagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtgg 4496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15041 - 14873
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||    
T  15041 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 14942  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 363  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14941 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 216 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 13997
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatga 315  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||| | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  316 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||   |||||||| |||| | | ||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactttga 13997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11291
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  295 gtct 298  Q
    ||||    
T  11294 gtct 11291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8149
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  | | ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   | ||| ||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgg 8254  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    | || | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  8253 gacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8154  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  8153 gtttg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 54767 - 54563
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||||||||    
T  54767 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 54668  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    ||||  |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  || |||||    
T  54667 gtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctat 54568  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  54567 gtttg 54563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31807
Alignment:
Q  196 tcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 295  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| | |||||||| | |   |||||    
T  32012 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 31913  T
Q  296 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatg 395  Q
    ||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||    
T  31912 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatg 31813  T
Q  396 tttggt 401  Q
    ||||||    
T  31812 tttggt 31807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37478 - 37307
Alignment:
Q  196 tcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 295  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| | |||||||| | |   |||||    
T  37478 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 37379  T
Q  296 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    ||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37378 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctct 37307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 10412 - 10584
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || | |||||||  | |   ||||    
T  10412 atcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgg 10511  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10512 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 13067 - 13239
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||   | | |||||||  | |   ||||    
T  13067 atcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgg 13166  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13167 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7366 - 7194
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  7366 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 7267  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7266 gtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 153 - 404
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15362
Alignment:
Q  153 tttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 252  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||   | | || |||||||| ||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  253 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 352  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15310  T
Q  353 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtaga 404  Q
     || ||||||||| | || ||| |||| | ||  || |||||||||||||||    
T  15311 ggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtaga 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 370
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40856
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 370  Q
    |||| ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 9077 - 8876
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||||  | |||||||   ||||||||    
T  9077 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatttt---attgcttattattgtgctactaagttgg 8981  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  8980 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8881  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  8880 gtttg 8876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15582 - 15335
Alignment:
Q  153 tttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtg 252  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||   | | ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15582 tttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtg 15483  T
Q  253 ctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 352  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||            ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15482 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg------------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttc 15395  T
Q  353 agtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
     || |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| | ||||| |||| |||||    
T  15394 ggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttga 15335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 104354 - 104153
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  104354 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtc 104255  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
      ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  104254 ctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 104155  T
Q  398 tg 399  Q
    ||    
T  104154 tg 104153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 219 - 399
Target Start/End: Original strand, 24910 - 25090
Alignment:
Q  219 aatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaag 318  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   |||||  ||||| ||  | ||||||||||| |    
T  24910 aatacgcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatg 25009  T
Q  319 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 399  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||  || ||||||||||    
T  25010 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttg 25090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1192
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcatt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8117
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||   |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8112  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  8113 gtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17861
Alignment:
Q  197 cagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggt 296  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||  | |   ||| ||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagt 17966  T
Q  297 ctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgt 396  Q
    || | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |  ||||  ||||||||||    
T  17965 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgt 17866  T
Q  397 ttggt 401  Q
    |||||    
T  17865 ttggt 17861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11599 - 11393
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||  | |   |||     
T  11599 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttga 11500  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |  ||||  ||||||||    
T  11499 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 11400  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  11399 gtttggt 11393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 55134 - 55058
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 271  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  55134 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 55058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53651
Alignment:
Q  333 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 148 - 1
Alignment:
Q  217 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||| | ||  |||||||| ||| | |||||||||||    
T  148 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaa 49  T
Q  317 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttc 364  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10498 - 10292
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  10498 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 10399  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  10398 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10299  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  10298 gtttggt 10292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8388 - 8182
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| || |   || |    
T  8388 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttag 8289  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |   |||||  ||||||||    
T  8288 gtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctat 8189  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  8188 gtttggt 8182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3554 - 3348
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  3554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgg 3455  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  3454 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 3355  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  3354 gtttggt 3348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17118
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 17118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Original strand, 34911 - 35095
Alignment:
Q  217 ataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | | |||||||| | ||  |||||||| ||| | |||||||||||    
T  34911 ataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaa 35010  T
Q  317 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  35011 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 35095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41558
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 41663  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | |   |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||||    
T  41662 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 41563  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  41562 gtttg 41558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75278
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 75383  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | |   |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||||    
T  75382 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 75283  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  75282 gtttg 75278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 942
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 313  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  | |   |||||||| ||| | ||||||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  314 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 365  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 412
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3561
Alignment:
Q  301 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttgg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||   | |||||||||||    
T  3450 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttgg 3549  T
Q  401 tagagactttga 412  Q
    ||| || |||||    
T  3550 tagggattttga 3561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3524
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  3681 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 3582  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 352  Q
    |||| | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3581 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18780 - 18576
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  18780 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18681  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||||||    
T  18680 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 18581  T
Q  395 gtttg 399  Q
    |||||    
T  18580 gtttg 18576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13470
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  13298 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 13397  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13398 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41285 - 41079
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| | |||| ||  | |   ||||    
T  41285 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgg 41186  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  41185 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 41086  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  41085 gtttggt 41079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 401
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1412
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| | || | ||  | ||  ||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgg 1305  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctat 394  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  ||||||||    
T  1306 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 1405  T
Q  395 gtttggt 401  Q
    |||||||    
T  1406 gtttggt 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4683 - 4509
Alignment:
Q  225 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaa 324  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||   |||||||||||| | | | ||| ||||||| ||||| |    
T  4683 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaga 4584  T
Q  325 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 399  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||  |||  |||||||||||||    
T  4583 tggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttg 4509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 367
Target Start/End: Original strand, 943 - 1115
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   ||||    
T  943 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 1042  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    |||| | | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  1043 gtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21734 - 21566
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  21734 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21635  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 363  Q
    |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21634 gtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37158 - 36990
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| | ||  ||||    
T  37158 atcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgg 37059  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 363  Q
    |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37058 gtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 36990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 65
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  268 agaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 169  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtt 397  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| || ||| | || ||||  || ||||||||    
T  168 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtt 69  T
Q  398 tggt 401  Q
    ||||    
T  68 tggt 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2950 - 2783
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||    
T  2950 gagaagaagttcttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatca 2851  T
Q  106 gttcgtagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttaactcgtacgcaa 173  Q
    ||||  ||||| | || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  2850 gttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 363
Target Start/End: Original strand, 11533 - 11698
Alignment:
Q  198 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 297  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  11533 agaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 11632  T
Q  298 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 363  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11633 ttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactactt 11698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 367
Target Start/End: Original strand, 674 - 826
Alignment:
Q  215 taataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatg 314  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | |||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  315 aaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 367  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctct 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Original strand, 16738 - 16840
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16738 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactg 16837  T
Q  250 gtg 252  Q
    |||    
T  16838 gtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 412
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21576
Alignment:
Q  249 ggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 348  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||| || ||| | ||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  349 gttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggtagagactttga 412  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  || || ||||||||| ||||||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttga 21576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Original strand, 15753 - 15894
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 294  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  | ||  ||||    
T  15753 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattgctttcgattgtgtttctactttgg 15852  T
Q  295 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 336  Q
    |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15853 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11203 - 11072
Alignment:
Q  150 gtgtttgctttaactcgtacgcaatcagtgaatgaggacgaacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactg 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||     | || |||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11203 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactg 11104  T
Q  250 gtgctactcattgtttcattgctgttgattgt 281  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11103 gtactactcattgttttattgctattgattgt 11072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3527
Alignment:
Q  306 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttg 399  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 3527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48795 - 48719
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 271  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  48795 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 48719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2907
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtg 282  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtg 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 23913 - 24007
Alignment:
Q  11 gaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttagttgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaacgaggaaggtcatatca 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  23913 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggggaaggtcatatca 24007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12587
Alignment:
Q  310 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtctattgtctatgtttggt 401  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||  |||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1364
Alignment:
Q  191 acttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  1414 acttatcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 48
Target Start/End: Original strand, 527 - 569
Alignment:
Q  6 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcggaaaggacacactttag 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  527 gagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2635
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 261
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13571
Alignment:
Q  192 cttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13502 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 816 - 861
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5045
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 5045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  214 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgcta 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 68 - 1
Alignment:
Q  195 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 262  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  68 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgctacgcattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5544
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26460
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 26460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35149
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 35149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24027
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8221
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90566
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 261  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3556
Alignment:
Q  216 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 268  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcat 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University