View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7487_low_3 (Length: 251)

Name: NF7487_low_3
Description: NF7487
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7487_low_3
NF7487_low_3
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (19-232)||(6520277-6520493)
chr8 (19-225)||(38855254-38855461)
chr8 (19-225)||(21673618-21673822)
chr8 (19-213)||(26355713-26355906)
chr8 (19-238)||(21285509-21285728)
chr8 (19-225)||(23760847-23761052)
chr8 (19-226)||(983406-983613)
chr8 (19-225)||(20498476-20498680)
chr8 (19-225)||(17266995-17267201)
chr8 (19-210)||(5866292-5866486)
chr8 (19-210)||(21490903-21491098)
chr8 (19-222)||(17140825-17141031)
chr8 (19-210)||(21255131-21255326)
chr8 (19-217)||(6759168-6759368)
chr8 (19-160)||(4542485-4542628)
chr8 (19-160)||(5853404-5853547)
chr8 (19-160)||(19896172-19896315)
chr8 (19-210)||(21249293-21249488)
chr8 (19-225)||(24352936-24353139)
chr8 (19-160)||(1484309-1484452)
chr8 (19-160)||(20046307-20046450)
chr8 (19-160)||(20403134-20403277)
chr8 (19-225)||(16092345-16092554)
chr8 (19-230)||(21918998-21919212)
chr8 (19-217)||(23406288-23406489)
chr8 (19-225)||(28649047-28649260)
chr8 (19-225)||(22874974-22875182)
chr8 (44-225)||(37116287-37116467)
chr8 (37-206)||(17612132-17612304)
chr8 (19-230)||(7372687-7372901)
chr8 (19-160)||(15203343-15203486)
chr8 (19-160)||(41598095-41598238)
chr8 (19-225)||(17439508-17439712)
chr8 (19-179)||(19154936-19155093)
chr8 (19-225)||(21389455-21389662)
chr8 (19-225)||(21778781-21778988)
chr8 (79-230)||(22626705-22626858)
chr8 (19-225)||(31971165-31971374)
chr8 (19-205)||(16199668-16199856)
chr8 (19-184)||(18818454-18818621)
chr8 (26-160)||(22001667-22001803)
chr8 (19-160)||(26225359-26225503)
chr8 (19-160)||(45290807-45290951)
chr8 (22-225)||(21395985-21396189)
chr8 (22-225)||(21790478-21790682)
chr8 (79-184)||(18879276-18879382)
chr8 (79-222)||(14409495-14409639)
chr8 (79-230)||(21923926-21924079)
chr8 (19-225)||(26219623-26219830)
chr8 (19-178)||(45131047-45131208)
chr8 (77-230)||(20536176-20536331)
chr8 (96-225)||(13508088-13508220)
chr8 (96-225)||(13597620-13597752)
chr8 (19-222)||(14823681-14823884)
chr8 (82-222)||(16413367-16413502)
chr8 (79-153)||(4483248-4483324)
chr8 (95-160)||(19937118-19937185)
chr8 (19-170)||(22419471-22419618)
chr8 (19-114)||(23944102-23944195)
chr8 (19-212)||(22525473-22525664)
chr8 (19-153)||(20533484-20533615)
chr8 (19-160)||(25484380-25484522)
chr8 (114-160)||(18678170-18678216)
chr8 (123-160)||(15070571-15070608)
chr8 (84-160)||(20466106-20466189)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (19-238)||(1024-1246)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (19-232)||(39706284-39706501)
chr4 (19-225)||(13854-14058)
chr4 (19-225)||(52243197-52243403)
chr4 (34-211)||(8846284-8846460)
chr4 (19-221)||(43198560-43198759)
chr4 (19-226)||(12288210-12288417)
chr4 (19-209)||(12773923-12774109)
chr4 (19-208)||(15551726-15551918)
chr4 (19-117)||(14927848-14927945)
chr4 (19-222)||(44615195-44615399)
chr4 (19-225)||(16377526-16377733)
chr4 (25-205)||(53082173-53082353)
chr4 (19-160)||(12419-12562)
chr4 (19-230)||(7798683-7798897)
chr4 (19-230)||(22636344-22636558)
chr4 (19-160)||(50222451-50222594)
chr4 (19-160)||(7641294-7641437)
chr4 (19-160)||(15118464-15118607)
chr4 (19-160)||(18239531-18239674)
chr4 (19-160)||(44773199-44773342)
chr4 (19-160)||(52312417-52312560)
chr4 (19-230)||(12902666-12902880)
chr4 (19-230)||(7893611-7893826)
chr4 (19-160)||(1837621-1837764)
chr4 (19-210)||(46640472-46640662)
chr4 (19-230)||(52873365-52873579)
chr4 (19-225)||(54798757-54798966)
chr4 (79-225)||(7088846-7088995)
chr4 (19-160)||(15355437-15355581)
chr4 (19-230)||(16270234-16270448)
chr4 (19-184)||(3096202-3096369)
chr4 (19-222)||(18215325-18215530)
chr4 (19-230)||(23374357-23374565)
chr4 (145-222)||(16596686-16596763)
chr4 (79-230)||(44052799-44052952)
chr4 (95-225)||(14280298-14280430)
chr4 (79-217)||(44928935-44929075)
chr4 (19-224)||(14053306-14053513)
chr4 (19-160)||(51463980-51464122)
chr4 (19-225)||(14038565-14038766)
chr4 (81-230)||(6899862-6900013)
chr4 (19-160)||(12610858-12611000)
chr4 (79-230)||(16239968-16240121)
chr4 (95-160)||(44102196-44102264)
chr4 (79-179)||(17046456-17046559)
chr4 (114-222)||(19618223-19618330)
chr4 (95-160)||(19242682-19242749)
chr4 (98-160)||(23803377-23803442)
chr4 (26-160)||(8574935-8575072)
chr4 (19-114)||(14157763-14157857)
chr4 (19-114)||(14164468-14164562)
chr4 (19-153)||(14825384-14825514)
chr4 (95-160)||(3514989-3515057)
chr4 (95-176)||(6190452-6190531)
chr4 (19-120)||(14852980-14853079)
chr4 (19-160)||(15369927-15370071)
chr4 (19-178)||(17333192-17333347)
chr4 (95-160)||(20149814-20149879)
chr4 (77-160)||(14970819-14970910)
chr4 (22-160)||(15367602-15367743)
chr4 (19-160)||(15371111-15371255)
chr4 (19-160)||(15402612-15402756)
chr4 (22-160)||(16223444-16223585)
chr4 (91-160)||(12569989-12570063)
chr4 (196-225)||(8846461-8846490)
chr4 (95-158)||(21815699-21815760)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (19-238)||(47831715-47831938)
chr7 (19-238)||(811121-811340)
chr7 (19-225)||(67654-67863)
chr7 (19-213)||(44014092-44014284)
chr7 (19-238)||(16219707-16219925)
chr7 (19-225)||(18005560-18005764)
chr7 (19-238)||(16056242-16056458)
chr7 (19-225)||(2280122-2280329)
chr7 (19-210)||(34200694-34200889)
chr7 (19-226)||(12901234-12901444)
chr7 (19-210)||(11996045-11996240)
chr7 (77-238)||(22072880-22073045)
chr7 (19-205)||(1868016-1868201)
chr7 (77-210)||(16495369-16495505)
chr7 (19-213)||(20220201-20220394)
chr7 (19-223)||(15008503-15008706)
chr7 (79-206)||(28505320-28505450)
chr7 (19-230)||(18456411-18456624)
chr7 (19-178)||(14044661-14044817)
chr7 (19-178)||(14354691-14354847)
chr7 (19-230)||(12698740-12698955)
chr7 (22-222)||(13647236-13647440)
chr7 (19-160)||(11972403-11972546)
chr7 (19-160)||(14949234-14949377)
chr7 (19-160)||(16409966-16410109)
chr7 (19-160)||(32125398-32125541)
chr7 (19-160)||(41522824-41522967)
chr7 (19-160)||(41525286-41525429)
chr7 (95-222)||(15754893-15755023)
chr7 (19-230)||(9509098-9509312)
chr7 (19-160)||(15376825-15376968)
chr7 (19-184)||(16386292-16386460)
chr7 (19-160)||(21189707-21189850)
chr7 (91-210)||(12255809-12255924)
chr7 (79-230)||(38227450-38227603)
chr7 (19-225)||(48273298-48273507)
chr7 (19-160)||(456228-456371)
chr7 (19-160)||(11393399-11393542)
chr7 (19-160)||(16232427-16232570)
chr7 (19-160)||(20385235-20385378)
chr7 (19-160)||(24702145-24702288)
chr7 (19-160)||(24704595-24704738)
chr7 (19-225)||(3564367-3564576)
chr7 (19-176)||(9177718-9177872)
chr7 (19-160)||(20110462-20110606)
chr7 (19-160)||(27216767-27216910)
chr7 (19-222)||(44116415-44116620)
chr7 (19-230)||(26211904-26212119)
chr7 (73-160)||(15144105-15144190)
chr7 (19-160)||(18640179-18640322)
chr7 (79-160)||(13869313-13869396)
chr7 (19-179)||(48991095-48991252)
chr7 (95-222)||(17061966-17062095)
chr7 (19-178)||(18203728-18203882)
chr7 (95-225)||(18430694-18430826)
chr7 (19-225)||(40443300-40443508)
chr7 (19-160)||(3386241-3386383)
chr7 (19-140)||(14323281-14323399)
chr7 (95-160)||(16213666-16213734)
chr7 (96-177)||(27847881-27847965)
chr7 (79-160)||(38898489-38898572)
chr7 (19-119)||(16091674-16091772)
chr7 (95-169)||(13831355-13831431)
chr7 (96-206)||(19486766-19486879)
chr7 (96-225)||(10063821-10063953)
chr7 (109-222)||(24275170-24275282)
chr7 (19-96)||(12255951-12256028)
chr7 (19-184)||(10588945-10589115)
chr7 (19-169)||(26356098-26356252)
chr7 (19-169)||(26358550-26358704)
chr7 (19-52)||(15755067-15755100)
chr7 (192-225)||(16324135-16324168)
chr7 (95-135)||(15082021-15082061)
chr7 (137-205)||(14036284-14036354)
chr7 (137-205)||(14346314-14346384)
chr7 (109-160)||(14932802-14932853)
chr7 (109-160)||(15356237-15356288)
chr7 (109-160)||(15360351-15360402)
chr7 (109-160)||(19649557-19649608)
chr7 (19-64)||(16579483-16579529)
chr7 (19-64)||(16586134-16586180)
chr7 (19-53)||(27848008-27848042)
chr7 (111-160)||(2832509-2832558)
chr7 (19-120)||(11769021-11769120)
chr7 (192-225)||(15113028-15113061)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (19-238)||(6520-6742)
scaffold0333 (19-238)||(13900-14122)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (19-225)||(41-247)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (19-238)||(15767-15989)
scaffold0020 (109-160)||(178896-178947)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (19-238)||(14234392-14234618)
chr3 (19-238)||(15470837-15471055)
chr3 (19-225)||(16097241-16097446)
chr3 (19-213)||(9512835-9513026)
chr3 (19-213)||(9520810-9521001)
chr3 (19-213)||(49668091-49668282)
chr3 (19-225)||(52523730-52523936)
chr3 (19-213)||(12174274-12174457)
chr3 (19-213)||(16103695-16103886)
chr3 (19-213)||(32307592-32307783)
chr3 (19-213)||(22110365-22110559)
chr3 (19-209)||(1644693-1644879)
chr3 (19-225)||(37251169-37251375)
chr3 (19-222)||(13210333-13210540)
chr3 (79-221)||(27165217-27165361)
chr3 (37-218)||(53301561-53301744)
chr3 (19-225)||(43925873-43926078)
chr3 (19-230)||(24153207-24153420)
chr3 (19-160)||(28848723-28848866)
chr3 (19-160)||(17463085-17463228)
chr3 (19-160)||(34159233-34159376)
chr3 (19-205)||(11424783-11424971)
chr3 (19-160)||(8899001-8899144)
chr3 (19-160)||(16282923-16283066)
chr3 (19-160)||(16454393-16454536)
chr3 (18-225)||(20698438-20698649)
chr3 (19-160)||(45577950-45578093)
chr3 (19-225)||(606328-606532)
chr3 (19-230)||(12399118-12399332)
chr3 (19-225)||(14972763-14972972)
chr3 (19-230)||(14572500-14572711)
chr3 (19-225)||(36166504-36166711)
chr3 (19-160)||(13151902-13152046)
chr3 (19-160)||(13154367-13154511)
chr3 (19-222)||(43550529-43550736)
chr3 (19-224)||(55500849-55501055)
chr3 (19-230)||(23083359-23083573)
chr3 (19-230)||(26686796-26687010)
chr3 (19-222)||(29172634-29172839)
chr3 (19-225)||(42386333-42386528)
chr3 (19-230)||(43840841-43841055)
chr3 (19-160)||(45607019-45607162)
chr3 (19-160)||(15977419-15977565)
chr3 (79-225)||(18438503-18438652)
chr3 (79-230)||(13442244-13442397)
chr3 (19-230)||(14576831-14577042)
chr3 (19-225)||(21618355-21618562)
chr3 (79-225)||(40213724-40213871)
chr3 (19-160)||(7781459-7781602)
chr3 (19-160)||(9707719-9707862)
chr3 (19-160)||(17446767-17446909)
chr3 (19-230)||(17487765-17487979)
chr3 (19-230)||(17499247-17499461)
chr3 (19-172)||(28194601-28194755)
chr3 (19-160)||(6469246-6469385)
chr3 (96-225)||(24340726-24340858)
chr3 (19-232)||(12377836-12378048)
chr3 (137-225)||(23274717-23274805)
chr3 (19-160)||(10247835-10247978)
chr3 (79-160)||(8499485-8499568)
chr3 (79-160)||(15412396-15412479)
chr3 (19-225)||(25476388-25476597)
chr3 (79-160)||(55476458-55476541)
chr3 (111-222)||(17672627-17672737)
chr3 (19-160)||(38962003-38962147)
chr3 (37-160)||(41123816-41123940)
chr3 (79-160)||(10556952-10557035)
chr3 (79-160)||(12119837-12119920)
chr3 (96-206)||(37642287-37642400)
chr3 (109-222)||(12567559-12567671)
chr3 (95-160)||(17737218-17737286)
chr3 (95-160)||(50242804-50242872)
chr3 (114-222)||(13544029-13544136)
chr3 (19-178)||(13919244-13919399)
chr3 (19-143)||(316035-316155)
chr3 (111-160)||(44494810-44494859)
chr3 (96-206)||(22147547-22147660)
chr3 (91-160)||(856114-856189)
chr3 (169-225)||(2051202-2051260)
chr3 (109-160)||(15878119-15878170)
chr3 (109-176)||(23077530-23077596)
chr3 (109-159)||(26196500-26196550)
chr3 (114-160)||(46822272-46822318)
chr3 (95-160)||(53070765-53070828)
chr3 (111-160)||(14665401-14665450)
chr3 (111-160)||(14668557-14668606)
chr3 (109-161)||(12038018-12038070)
chr3 (109-161)||(12496255-12496307)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (19-225)||(19176-19382)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (19-238)||(12675-12897)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (19-225)||(25175764-25175968)
chr2 (19-238)||(7679490-7679715)
chr2 (19-225)||(7736-7940)
chr2 (19-222)||(18786907-18787110)
chr2 (19-225)||(28405891-28406095)
chr2 (19-213)||(23207191-23207385)
chr2 (19-204)||(22413160-22413344)
chr2 (19-209)||(23071968-23072161)
chr2 (19-213)||(22134222-22134418)
chr2 (21-225)||(23791189-23791393)
chr2 (75-225)||(23708622-23708773)
chr2 (19-169)||(45029958-45030109)
chr2 (19-160)||(18808850-18808993)
chr2 (19-160)||(23135497-23135640)
chr2 (19-160)||(23712125-23712268)
chr2 (19-160)||(26505286-26505429)
chr2 (19-160)||(26507764-26507907)
chr2 (19-160)||(28577006-28577149)
chr2 (19-160)||(39682220-39682363)
chr2 (19-225)||(24697608-24697813)
chr2 (19-230)||(23060421-23060636)
chr2 (19-160)||(24898307-24898451)
chr2 (19-160)||(24900790-24900934)
chr2 (19-160)||(24903267-24903411)
chr2 (96-225)||(19671816-19671948)
chr2 (19-225)||(20520195-20520399)
chr2 (19-222)||(22105320-22105524)
chr2 (111-230)||(298812-298932)
chr2 (19-178)||(23004663-23004819)
chr2 (25-230)||(23654384-23654592)
chr2 (19-160)||(24905744-24905888)
chr2 (19-160)||(24908219-24908363)
chr2 (19-160)||(571304-571447)
chr2 (19-160)||(6725902-6726045)
chr2 (19-160)||(21155172-21155315)
chr2 (19-160)||(23709644-23709787)
chr2 (18-224)||(22731238-22731447)
chr2 (19-169)||(24529633-24529785)
chr2 (19-160)||(32039610-32039753)
chr2 (19-160)||(43137206-43137349)
chr2 (19-225)||(20309017-20309224)
chr2 (19-230)||(23076350-23076565)
chr2 (77-184)||(23285832-23285941)
chr2 (19-160)||(24367680-24367824)
chr2 (19-160)||(24643062-24643206)
chr2 (79-205)||(38138-38266)
chr2 (19-160)||(38967281-38967424)
chr2 (79-160)||(23130829-23130912)
chr2 (79-160)||(23133296-23133379)
chr2 (79-160)||(34402634-34402717)
chr2 (77-160)||(22738247-22738332)
chr2 (79-230)||(23659993-23660145)
chr2 (114-222)||(32214972-32215079)
chr2 (79-184)||(8946626-8946733)
chr2 (19-160)||(23040257-23040402)
chr2 (79-225)||(23103400-23103547)
chr2 (111-225)||(22337119-22337233)
chr2 (19-177)||(26392298-26392451)
chr2 (19-53)||(23713060-23713094)
chr2 (82-178)||(25108864-25108958)
chr2 (44-178)||(23287302-23287433)
chr2 (19-53)||(298991-299025)
chr2 (109-171)||(21916156-21916217)
chr2 (95-176)||(32451981-32452060)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (19-225)||(10439-10645)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (19-225)||(100288-100492)
scaffold0023 (19-225)||(40177-40381)
scaffold0023 (19-184)||(101414-101576)
scaffold0023 (19-160)||(94318-94461)
scaffold0023 (19-180)||(119784-119948)
scaffold0023 (19-160)||(44361-44504)
scaffold0023 (96-160)||(17552-17613)
scaffold0023 (109-160)||(38547-38598)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (19-225)||(22921872-22922076)
chr1 (19-225)||(33680920-33681125)
chr1 (19-225)||(22237540-22237745)
chr1 (21-209)||(52927989-52928176)
chr1 (19-213)||(21753960-21754151)
chr1 (19-222)||(20248194-20248394)
chr1 (19-225)||(21896259-21896463)
chr1 (19-213)||(35261093-35261285)
chr1 (26-226)||(16758570-16758770)
chr1 (63-225)||(21861573-21861733)
chr1 (19-225)||(50614118-50614324)
chr1 (19-225)||(50621946-50622152)
chr1 (19-225)||(41050037-41050243)
chr1 (19-225)||(16368288-16368492)
chr1 (77-210)||(14295569-14295705)
chr1 (19-225)||(34509689-34509898)
chr1 (96-228)||(21161705-21161836)
chr1 (19-178)||(26064852-26065009)
chr1 (19-222)||(45574893-45575100)
chr1 (19-160)||(13988773-13988916)
chr1 (123-210)||(20918620-20918707)
chr1 (19-160)||(21923403-21923546)
chr1 (19-177)||(50686526-50686681)
chr1 (19-225)||(50210216-50210429)
chr1 (19-169)||(22123171-22123323)
chr1 (19-160)||(23593847-23593990)
chr1 (19-160)||(29298044-29298187)
chr1 (19-160)||(31612219-31612363)
chr1 (19-160)||(21475199-21475342)
chr1 (19-178)||(20847205-20847366)
chr1 (79-225)||(432979-433124)
chr1 (19-230)||(22532178-22532392)
chr1 (79-160)||(21346928-21347011)
chr1 (19-230)||(27250727-27250941)
chr1 (79-160)||(29776655-29776738)
chr1 (77-160)||(13212974-13213059)
chr1 (79-160)||(21342064-21342146)
chr1 (95-169)||(21707149-21707225)
chr1 (95-169)||(21711691-21711767)
chr1 (114-222)||(21840771-21840878)
chr1 (114-176)||(20454606-20454667)
chr1 (19-183)||(38801433-38801599)
chr1 (95-160)||(15860121-15860188)
chr1 (96-184)||(21026666-21026756)
chr1 (95-160)||(40389139-40389204)
chr1 (95-217)||(16275420-16275544)
chr1 (114-158)||(16361921-16361965)
chr1 (19-58)||(20916136-20916175)
chr1 (109-160)||(21714544-21714595)
chr1 (160-210)||(22130925-22130975)
chr1 (114-160)||(22468764-22468810)
chr1 (192-225)||(12271639-12271672)
chr1 (111-160)||(24783160-24783209)
chr1 (21-53)||(16275584-16275616)
chr1 (109-161)||(17678652-17678704)
chr1 (91-160)||(22831454-22831527)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (19-225)||(14700-14906)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (19-238)||(21329487-21329705)
chr5 (20-224)||(21565456-21565659)
chr5 (19-210)||(26012053-26012245)
chr5 (19-222)||(22959538-22959738)
chr5 (19-238)||(21502146-21502365)
chr5 (19-222)||(19668808-19669013)
chr5 (19-226)||(20026941-20027148)
chr5 (19-225)||(22143961-22144167)
chr5 (19-209)||(19660854-19661047)
chr5 (19-225)||(22178222-22178427)
chr5 (19-225)||(22412093-22412301)
chr5 (19-225)||(24529129-24529338)
chr5 (19-215)||(21997547-21997746)
chr5 (77-208)||(36314544-36314678)
chr5 (19-160)||(2154726-2154869)
chr5 (19-160)||(10733052-10733195)
chr5 (19-225)||(9077861-9078070)
chr5 (19-161)||(20908919-20909063)
chr5 (19-230)||(24493477-24493691)
chr5 (19-160)||(264880-265023)
chr5 (19-153)||(27989004-27989136)
chr5 (19-160)||(29329841-29329984)
chr5 (19-160)||(42245477-42245620)
chr5 (19-169)||(32027300-32027451)
chr5 (19-230)||(23390494-23390708)
chr5 (19-153)||(26740720-26740851)
chr5 (19-160)||(39245043-39245186)
chr5 (19-158)||(10775790-10775932)
chr5 (19-230)||(21808387-21808601)
chr5 (79-230)||(25421501-25421655)
chr5 (19-160)||(29345887-29346030)
chr5 (79-230)||(13025280-13025433)
chr5 (79-230)||(13095464-13095617)
chr5 (95-160)||(18319146-18319211)
chr5 (19-178)||(21293020-21293181)
chr5 (79-230)||(21729062-21729216)
chr5 (19-225)||(1096375-1096585)
chr5 (19-230)||(22074929-22075142)
chr5 (19-157)||(29348360-29348500)
chr5 (19-157)||(29350833-29350973)
chr5 (19-160)||(20918060-20918202)
chr5 (96-230)||(8286840-8286978)
chr5 (79-160)||(23064478-23064561)
chr5 (79-160)||(39363351-39363434)
chr5 (81-160)||(11581311-11581392)
chr5 (19-177)||(26732884-26733038)
chr5 (95-160)||(36154892-36154960)
chr5 (79-160)||(38619401-38619484)
chr5 (77-160)||(20902121-20902207)
chr5 (19-230)||(25431303-25431517)
chr5 (19-160)||(31060976-31061118)
chr5 (19-179)||(37723812-37723975)
chr5 (95-160)||(24067092-24067157)
chr5 (19-160)||(20806854-20806996)
chr5 (96-206)||(40725839-40725952)
chr5 (19-120)||(21731566-21731665)
chr5 (19-120)||(21809686-21809785)
chr5 (109-160)||(14079147-14079198)
chr5 (109-160)||(26704073-26704124)
chr5 (109-160)||(26973806-26973857)
chr5 (91-160)||(23572059-23572133)
chr5 (111-160)||(24767613-24767662)
chr5 (109-161)||(21873252-21873304)
chr5 (160-225)||(29448055-29448122)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (19-225)||(45795-46000)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (19-213)||(19652108-19652301)
chr6 (22-238)||(23019320-23019537)
chr6 (19-225)||(20109049-20109256)
chr6 (19-226)||(19668285-19668492)
chr6 (19-212)||(9098528-9098713)
chr6 (111-208)||(27333238-27333335)
chr6 (111-208)||(27393978-27394075)
chr6 (78-228)||(4185821-4185970)
chr6 (19-212)||(22080754-22080935)
chr6 (19-225)||(25644251-25644439)
chr6 (19-213)||(20076609-20076805)
chr6 (78-228)||(4186339-4186488)
chr6 (19-225)||(19303544-19303752)
chr6 (19-210)||(28496489-28496684)
chr6 (19-210)||(29808900-29809095)
chr6 (19-160)||(2291292-2291435)
chr6 (19-160)||(18334704-18334847)
chr6 (19-160)||(19004953-19005096)
chr6 (19-160)||(24422454-24422597)
chr6 (19-160)||(33861701-33861844)
chr6 (20-225)||(20638286-20638495)
chr6 (95-222)||(1561288-1561418)
chr6 (19-178)||(23076646-23076801)
chr6 (19-225)||(29060448-29060658)
chr6 (19-178)||(35008064-35008219)
chr6 (19-160)||(1595456-1595599)
chr6 (19-160)||(19859031-19859174)
chr6 (19-160)||(33864185-33864328)
chr6 (19-225)||(20593682-20593891)
chr6 (19-160)||(8054936-8055079)
chr6 (19-160)||(12742224-12742367)
chr6 (19-230)||(20360958-20361173)
chr6 (19-160)||(26924752-26924895)
chr6 (19-108)||(13019403-13019492)
chr6 (96-228)||(31155397-31155529)
chr6 (80-230)||(17287794-17287946)
chr6 (19-160)||(1541023-1541166)
chr6 (19-225)||(25629358-25629567)
chr6 (95-160)||(16448639-16448704)
chr6 (79-230)||(16496213-16496367)
chr6 (25-222)||(22782139-22782338)
chr6 (165-228)||(4668211-4668274)
chr6 (165-228)||(4675058-4675121)
chr6 (19-160)||(25754717-25754859)
chr6 (19-225)||(35245494-35245702)
chr6 (80-160)||(25714388-25714470)
chr6 (79-225)||(18409830-18409982)
chr6 (19-184)||(22780272-22780439)
chr6 (19-160)||(3852129-3852271)
chr6 (18-175)||(22831411-22831571)
chr6 (111-215)||(25656630-25656733)
chr6 (114-222)||(30676761-30676868)
chr6 (81-160)||(20557004-20557085)
chr6 (96-206)||(8227533-8227646)
chr6 (79-225)||(16920635-16920782)
chr6 (81-160)||(25688471-25688552)
chr6 (19-170)||(11185422-11185568)
chr6 (19-205)||(33442962-33443146)
chr6 (19-119)||(20223859-20223957)
chr6 (19-119)||(22117843-22117941)
chr6 (95-160)||(18456706-18456769)
chr6 (95-160)||(18461866-18461929)
chr6 (95-160)||(18821912-18821975)
chr6 (114-160)||(34963377-34963423)
chr6 (19-52)||(1561211-1561244)
chr6 (19-120)||(16493063-16493162)
chr6 (96-159)||(4738626-4738689)
chr6 (109-160)||(18907109-18907160)
chr6 (109-160)||(19862976-19863027)
chr6 (109-160)||(19873118-19873169)
chr6 (114-160)||(19848063-19848109)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (19-224)||(998-1199)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (19-225)||(6446-6653)
scaffold0621 (19-225)||(8380-8584)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (22-238)||(12855-13070)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (19-225)||(5557-5761)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (19-225)||(2648-2851)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (19-225)||(10544-10749)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (19-213)||(23898-24091)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (19-225)||(129818-130023)
scaffold0010 (55-225)||(60718-60886)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (19-225)||(27752-27956)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (19-225)||(22673-22877)
scaffold0037 (19-160)||(81979-82122)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (19-213)||(160597-160790)
scaffold0001 (37-160)||(85692-85817)
scaffold0001 (109-160)||(501083-501134)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (19-225)||(16103-16307)
scaffold0357 (102-225)||(13125-13246)
scaffold0357 (19-178)||(2577-2732)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (19-225)||(53552-53756)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (19-225)||(2809-3012)
scaffold0628 (19-56)||(3277-3314)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (19-222)||(6731-6927)
scaffold0556 (189-238)||(8097-8146)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (19-238)||(32447-32666)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (19-225)||(12482-12686)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (93-238)||(6113-6261)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (19-225)||(947-1150)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (19-210)||(32013-32202)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (19-210)||(132573-132762)
scaffold0028 (19-222)||(136587-136791)
scaffold0028 (19-222)||(139056-139260)
scaffold0028 (19-222)||(143994-144198)
scaffold0028 (19-222)||(134118-134322)
scaffold0028 (19-222)||(141525-141729)
scaffold0028 (125-212)||(62216-62303)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (19-226)||(8074-8280)
scaffold0218 (154-210)||(29298-29354)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (19-225)||(19886-20092)
scaffold0080 (19-230)||(39822-40035)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (19-225)||(3154-3362)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (19-232)||(8055-8267)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (19-228)||(103629-103838)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (19-191)||(28806-28976)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (81-221)||(38709-38851)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (79-210)||(11261-11395)
scaffold0046 (19-210)||(1905-2100)
scaffold0046 (19-225)||(28322-28532)
scaffold0046 (19-163)||(4460-4608)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (77-210)||(1087-1223)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (19-210)||(34032-34226)
scaffold0175 (19-160)||(182-326)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (95-210)||(15646-15764)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (19-230)||(32955-33168)
scaffold0120 (19-230)||(45837-46050)
scaffold0120 (19-184)||(16022-16189)
scaffold0120 (22-160)||(17397-17538)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (19-225)||(128972-129176)
scaffold0022 (19-225)||(78236-78441)
scaffold0022 (19-225)||(116335-116543)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (19-225)||(96920-97125)
scaffold0006 (19-225)||(106198-106403)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (19-119)||(225363-225463)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (19-225)||(1799-2005)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (79-225)||(39446-39594)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (79-225)||(75218-75366)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (22-225)||(468-669)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (19-160)||(20654-20797)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (19-230)||(51822-52036)
scaffold0011 (19-230)||(167976-168190)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (19-230)||(1046-1260)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (19-225)||(339953-340159)
scaffold0003 (19-160)||(158562-158706)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (19-160)||(40307-40450)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (19-225)||(44710-44919)
scaffold0122 (114-184)||(26110-26179)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (19-184)||(4621-4788)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (19-230)||(8531-8741)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (19-177)||(46904-47065)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (19-160)||(13299-13442)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (19-160)||(37728-37871)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (19-226)||(136369-136591)
scaffold0021 (19-226)||(145077-145299)
scaffold0021 (19-177)||(121675-121835)
scaffold0021 (19-179)||(174675-174838)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (19-230)||(1760-1974)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (19-225)||(3189-3402)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (19-224)||(11447-11656)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (19-225)||(25022-25225)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (19-225)||(4758-4967)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (79-230)||(13181-13334)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (19-179)||(10472-10636)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (19-230)||(32850-33064)
scaffold0145 (19-230)||(38669-38883)
scaffold0145 (95-160)||(9731-9799)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (19-225)||(31976-32183)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (79-225)||(7235-7382)
scaffold0106 (22-225)||(1201-1405)
scaffold0106 (19-160)||(15306-15450)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (25-213)||(2596-2783)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (77-230)||(3438-3593)
scaffold0292 (99-230)||(332-465)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (19-225)||(25804-26013)
scaffold0026 (79-225)||(39827-39975)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (19-158)||(4120-4262)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (19-225)||(1054-1261)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (19-225)||(13405-13614)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (19-225)||(17218-17433)
scaffold0056 (84-160)||(14154-14235)
scaffold0056 (95-160)||(79396-79459)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (19-232)||(8390-8604)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (79-230)||(6119-6275)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (79-225)||(51551-51698)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (165-228)||(9136-9199)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (96-206)||(11450-11563)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (19-160)||(13854-13997)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (96-206)||(38278-38391)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (82-213)||(267637-267768)
scaffold0005 (19-153)||(14195-14325)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (163-225)||(2221-2283)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (96-225)||(18030-18162)
scaffold0247 (79-160)||(2241-2324)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (19-225)||(5133-5340)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (95-230)||(22868-23005)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (95-160)||(1393-1458)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (19-161)||(128660-128805)
scaffold0031 (95-222)||(20430-20553)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (19-183)||(4427-4599)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (79-225)||(15467-15615)
scaffold0114 (19-53)||(15642-15676)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (19-230)||(1861-2075)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (19-154)||(11970-12108)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (19-225)||(4417-4625)
scaffold0228 (19-225)||(11999-12207)
scaffold0228 (19-225)||(21951-22159)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (19-217)||(16611-16812)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (95-160)||(16766-16834)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (95-222)||(4676-4805)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (114-222)||(10777-10884)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (99-224)||(16271-16397)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (19-144)||(2497-2618)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (19-174)||(4888-5045)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (131-225)||(38340-38436)
scaffold0139 (109-160)||(19978-20029)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (125-230)||(24300-24406)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (113-160)||(4300-4347)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (19-153)||(22194-22324)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (95-160)||(88-156)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (126-225)||(6285-6386)
scaffold0420 (126-173)||(13793-13840)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (114-160)||(9246-9292)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (79-156)||(161206-161285)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (77-160)||(29896-29982)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (19-120)||(55789-55888)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (79-225)||(20879-21029)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (19-119)||(4803-4901)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (19-153)||(30245-30377)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (109-160)||(23841-23892)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (19-117)||(2514-2612)
scaffold0161 (162-210)||(2460-2508)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (109-160)||(36452-36503)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (95-160)||(11953-12016)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (114-160)||(12361-12407)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (114-222)||(11292-11399)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (19-112)||(206638-206730)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (109-161)||(287-339)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (91-160)||(21871-21946)
scaffold0210 (91-160)||(29763-29838)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (84-157)||(4875-4954)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (109-160)||(157-208)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (109-160)||(69792-69843)
scaffold0004 (19-148)||(332233-332358)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (111-160)||(10110-10159)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 6520277 - 6520493
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc---a 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  6520277 atcaagcccccgacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatca 6520376  T
Q  116 tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520377 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 6520476  T
Q  216 catcaacatcataaaca 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  6520477 catcaacatcataaaca 6520493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38855461 - 38855254
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  38855461 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacataacaacttaacttcttataaacaacaacctctta--tatatccaataatttggaacatcatca 38855364  T
Q  118 --ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
      |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38855363 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaat 38855264  T
Q  216 catcaacatc 225  Q
    || |||||||    
T  38855263 caacaacatc 38855254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 21673618 - 21673822
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||     
T  21673618 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctctta--taagtccaataatttggaacatgatca 21673715  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 21673815  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  21673816 caacatc 21673822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26355906 - 26355713
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  26355906 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaaccattta-gaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatca 26355808  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26355807 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatgcaa 26355713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 21285509 - 21285728
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21285509 atcaagccctcagcaatgaatgctaatgcatggactcaactactcaacctcatagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 21285608  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  21285609 taatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 21285708  T
Q  219 caacatcataaacaccaaac 238  Q
    |||||||  ||||| |||||    
T  21285709 caacatctcaaacatcaaac 21285728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23761052 - 23760847
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| || ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  23761052 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacaaaacatcttaacaacttagaa-caataacctcttatataagtccaataatttggaacatcatca 23760954  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||     
T  23760953 tcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaattcaaatcaa 23760854  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  23760853 caacatc 23760847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 983613 - 983406
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  983613 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttataaaaatccaataatttggaacatcatct 983514  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  983513 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattc 983416  T
Q  217 atcaacatca 226  Q
    | ||||||||    
T  983415 aacaacatca 983406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 20498476 - 20498680
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20498476 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaactcagcatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 20498575  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20498576 t--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcat 20498673  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  20498674 caacatc 20498680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17267201 - 17266995
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17267201 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 17267102  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc--atcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| |   |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17267101 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 17267004  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  17267003 aacaacatc 17266995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5866486 - 5866292
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  5866486 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 5866388  T
Q  118 ttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
     |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5866387 atcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 5866292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 21490903 - 21491098
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||  | ||||| |  | ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  21490903 atcaagcccccaacaacgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatctta-attcgacaacctcttatattaattcaataatttggaacatcat 21491001  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    |   || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  21491002 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatg 21491098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 17140825 - 17141031
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  17140825 atcaagcccccaacaatgaatactaatgtatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 17140923  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 214  Q
       || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  17140924 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcgaatgtaaa 17141023  T
Q  215 tcatcaac 222  Q
    ||||||||    
T  17141024 tcatcaac 17141031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 21255131 - 21255326
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  21255131 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 21255229  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaa-caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
       || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21255230 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatg 21255326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Original strand, 6759168 - 6759368
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa--catc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||    
T  6759168 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggacatcatc 6759265  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  6759266 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 6759364  T
Q  214 gtca 217  Q
    ||||    
T  6759365 gtca 6759368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4542628 - 4542485
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  4542628 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 4542531  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4542530 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4542485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5853547 - 5853404
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  5853547 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 5853450  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5853449 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 5853404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 19896172 - 19896315
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  19896172 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 19896269  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19896270 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19896315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 21249293 - 21249488
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  21249293 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcggcctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 21249391  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaa-caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
       || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21249392 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatcgaatg 21249488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 24352936 - 24353139
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| || ||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24352936 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaa-catggacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 24353033  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24353034 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatc 24353130  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  24353131 aacaacatc 24353139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 1484309 - 1484452
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  1484309 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 1484406  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1484407 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1484452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20046450 - 20046307
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  20046450 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 20046353  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20046352 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20046307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 20403134 - 20403277
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  20403134 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 20403231  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20403232 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20403277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16092554 - 16092345
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16092554 atcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaatagtttggaacatcat 16092457  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  16092456 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16092358  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  16092357 agtcaacaacatc 16092345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21919212 - 21918998
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  21919212 atcaagcccgcaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 21919114  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||    
T  21919113 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 21919015  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  21919014 ttcaacaacatcttaaa 21918998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Original strand, 23406288 - 23406489
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23406288 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 23406385  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  23406386 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 23406484  T
Q  213 agtca 217  Q
    |||||    
T  23406485 agtca 23406489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28649260 - 28649047
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa------ 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||          
T  28649260 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 28649163  T
Q  111 -catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 208  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  28649162 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaa 28649064  T
Q  209 tgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28649063 tgcaagtcaacaacatc 28649047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 22874974 - 22875182
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaact-tcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  22874974 atcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaatatctta-aatcaacaacctcttatatag-tccaataatttggaacatcat 22875071  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  22875072 catcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagc-agcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 22875170  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  22875171 gtcaacaacatc 22875182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 225
Target Start/End: Original strand, 37116287 - 37116467
Alignment:
Q  44 atgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgca 143  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||| |||| ||||| |||||||    
T  37116287 atgcatgaactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatttt--tcatcttagaccgactcatgca 37116383  T
Q  144 gcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  37116384 gcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 37116467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17612304 - 17612132
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttata 131  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||| |    
T  17612304 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcaacaacctcttata-atagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttaga 17612207  T
Q  132 ccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 206  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17612206 ctgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 17612132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 7372687 - 7372901
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7372687 atcaagcccccaacaatgaaatgttgatgcatggactcaacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 7372784  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  7372785 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 7372883  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| || |||| ||||    
T  7372884 agtcaacatcatcttaaa 7372901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15203486 - 15203343
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  15203486 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 15203389  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15203388 atcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaa 15203343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 41598095 - 41598238
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  41598095 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aattgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 41598192  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41598193 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaa 41598238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17439712 - 17439508
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||| |||| ||||||   ||||||| ||  ||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  17439712 atcaagccccaaaca-tgaatgagtatgcatgaacttaacaactta-catcttaaaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacattt 17439615  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17439614 t--tcatcttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 17439517  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  17439516 aacaacatc 17439508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19155093 - 19154936
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa-catcatc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||    
T  19155093 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttacaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaaacaacatc 19154996  T
Q  118 ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 179  Q
    ||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  19154995 tt--tcatcttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21389662 - 21389455
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21389662 atcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttaa-tatagtccaataatttggaacatcat 21389565  T
Q  117 cttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| |||    
T  21389564 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaa 21389467  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     |||||||||||    
T  21389466 ttcatcaacatc 21389455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21778988 - 21778781
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21778988 atcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttaa-tatagtccaataatttggaacatcat 21778891  T
Q  117 cttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| |||    
T  21778890 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaa 21778793  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     |||||||||||    
T  21778792 ttcatcaacatc 21778781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 22626705 - 22626858
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22626705 acaacctcttatata-atccaataatttgaaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggc 22626802  T
Q  175 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  22626803 agtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatacaaatcaacaacatcttaaa 22626858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 31971165 - 31971374
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||  |  |||| |  | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  31971165 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 31971263  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | |||    
T  31971264 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaattccaa 31971362  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     |||||||||||    
T  31971363 ttcatcaacatc 31971374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16199856 - 16199668
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  16199856 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 16199758  T
Q  118 ttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 205  Q
     |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  16199757 atcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatc 16199668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18818621 - 18818454
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18818621 atcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 18818524  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  18818523 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 18818454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Original strand, 22001667 - 22001803
Alignment:
Q  26 ccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaa 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| | ||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22001667 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatgtta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaa 22001764  T
Q  122 tcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22001765 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 22001803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26225503 - 26225359
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||    
T  26225503 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaatactttggaacttcat 26225406  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26225405 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 26225359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45290951 - 45290807
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca- 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||     
T  45290951 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcaa 45290854  T
Q  116 --tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
      |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45290807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21396189 - 21395985
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatcatctt 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  21396189 aagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttaa-tatagtccaataatgtggaacatcatcat 21396092  T
Q  120 aatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
      |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||| ||    
T  21396091 cttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaattcaattc 21395994  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    |||||||||    
T  21395993 atcaacatc 21395985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21790682 - 21790478
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatcatctt 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  21790682 aagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttaa-tatagtccaataatgtggaacatcatcat 21790585  T
Q  120 aatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
      |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||| ||    
T  21790584 cttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--cagcatgagataattatatcaaattcaattc 21790487  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    |||||||||    
T  21790486 atcaacatc 21790478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18879382 - 18879276
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18879382 acaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggca 18879285  T
Q  176 gtatgcaaa 184  Q
    |||| ||||    
T  18879284 gtatacaaa 18879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14409639 - 14409495
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||    
T  14409639 acaacctcttatata-atccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gca 14409543  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
    |||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  14409542 gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 14409495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21924079 - 21923926
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21924079 acaacctcttacata-atccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggca 21923982  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    || | | ||| || ||||| || | |||||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  21923981 gtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaa 21923926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 26219623 - 26219830
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||    
T  26219623 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaatactttggaacttcat 26219720  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||||  |  |||| |||| |||||| |||||||    
T  26219721 catcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatgcaa 26219818  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  26219819 gtcaacaacatc 26219830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45131208 - 45131047
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  45131208 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttaaattagtccaataatttggaacatcatc 45131110  T
Q  118 ttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
     |  |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45131109 atcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 45131047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 230
Target Start/End: Original strand, 20536176 - 20536331
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  20536176 caacaatctcttatata-attcaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagaaacatagg 20536273  T
Q  174 cagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  20536274 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 20536331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13508220 - 13508088
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    |||||||||||||||| |||   |||| | | ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  13508220 tccaataatttggaacgtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatg 13508121  T
Q  193 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  13508120 atataataatatcgaacgcaagtaaacaacatc 13508088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13597752 - 13597620
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    |||||||||||||||| |||   |||| | | ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  13597752 tccaataatttggaacgtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatg 13597653  T
Q  193 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  13597652 atataataatatcgaacgcaagtaaacaacatc 13597620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 14823681 - 14823884
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---catc 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||    
T  14823681 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 14823778  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||||||| ||| ||| | |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  14823779 atcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 14823875  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
    |||| ||||    
T  14823876 gtcaacaac 14823884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16413502 - 16413367
Alignment:
Q  82 acctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc 181  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| |    
T  16413502 acctcttaaatag-tccaataatttggaacatc---ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatac 16413409  T
Q  182 -aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
     ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  16413408 aaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 16413367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 4483248 - 4483324
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaa 153  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4483248 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 4483324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19937185 - 19937118
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaa--catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19937185 atccaataatttggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19937118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22419618 - 22419471
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||     
T  22419618 atcaagcccccaaca-tgaatgtgtatgcatggactcaacaactta-catcttaaaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacttca 22419521  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 170  Q
    ||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||    
T  22419520 ta--catcatagaccgactcatgcagcttaattcaataatatacaacaacat 22419471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23944195 - 23944102
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23944195 atcaagcccccaaca-tgaatgcgtatacatggactcaacaactta-catcttacaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacatc 23944102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 22525473 - 22525664
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||| | || ||||| | |  ||||||||||| ||||| | |||    
T  22525473 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatgaactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacatcttatacaactccaataatttagaacaacttct 22525571  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    ||  || | || ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||   ||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  22525572 ta--catcatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacaacaacttaggcagtacataaaacatctcaagatataacaatatcaaatgca 22525664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20533615 - 20533484
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||||| | |  ||||||||||||||||| | |||    
T  20533615 atcaagcccccaaca-tgaatgaatattcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacatcttatacaactccaataatttggaacaacttct 20533517  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaa 153  Q
    ||  || | ||||| || |||||||||||||||||    
T  20533516 ta--catcatatactgactcatgcagcttagttaa 20533484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25484522 - 25484380
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||   |||    
T  25484522 atcaagcccacaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttagaacttcatc 25484426  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  25484425 atcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaa 25484380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18678216 - 18678170
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||    
T  18678216 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 18678170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 160
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070608
Alignment:
Q  123 caacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15070608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20466189 - 20466106
Alignment:
Q  84 ctcttaaatatatccaataatttgga-----acatcatcttaatcaacttatacc--gattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  20466189 ctcttatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 20466106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1246 - 1024
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1246 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatca 1147  T
Q  118 --ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
      |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1146 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcgaatgcaagt 1047  T
Q  216 catcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  1046 catcaacatcataaacatcaaac 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39706501 - 39706284
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaa-atatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39706501 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatttggaacatcatc 39706402  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 214  Q
       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706401 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 39706302  T
Q  215 tcatcaacatcataaaca 232  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39706301 tcatgaacatcataaaca 39706284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14058 - 13854
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14058 atcaagcccccaacaatgaatgtgaatgcatggactcaacaactcaacatcttaaaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 13959  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13958 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcat 13861  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  13860 caacatc 13854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52243403 - 52243197
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52243403 atcaagcccccataaatgaatgctaatgcctggacacaacaactcgacctattagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 52243304  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  52243303 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattc 52243206  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  52243205 aacaacatc 52243197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 211
Target Start/End: Original strand, 8846284 - 8846460
Alignment:
Q  34 atgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttatacc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  8846284 atgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatcatcatcaacttagacc 8846382  T
Q  134 gattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8846383 gacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatgc 8846460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43198759 - 43198560
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  43198759 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactcaacctcttaga---aacaacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 43198663  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43198662 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtc 43198565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12288417 - 12288210
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| |||| ||||| ||||||  | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  12288417 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgctgggactcaacaacctaacatcttagaaacaatgatctcttatgtaaatccaataatttggaacatcatct 12288318  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12288317 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattc 12288220  T
Q  217 atcaacatca 226  Q
    | ||||||||    
T  12288219 aacaacatca 12288210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 12773923 - 12774109
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||  |||| |||||||| | |||||  ||  |||||||||||| |||||||||     
T  12773923 atcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatcgacacatcatcttaacaactta-aaacaacatcatctta--taagtccaataatttg-aacatcatca 12774018  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774019 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 12774109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 15551726 - 15551918
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||| |  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  15551726 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctattaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 15551824  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 208  Q
       || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  15551825 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcgaa 15551918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14927945 - 14927848
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14927945 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaactttttat-aacaacaacctcttatatatatctaataatttggaacatcatc 14927848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 44615195 - 44615399
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  44615195 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 44615292  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  44615293 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaa 44615390  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
    |||| ||||    
T  44615391 gtcaacaac 44615399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16377733 - 16377526
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16377733 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttacata-atccaataatttggaacttcat 16377636  T
Q  117 ---cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  16377635 tatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 16377538  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  16377537 gtcaacaacatc 16377526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 53082353 - 53082173
Alignment:
Q  25 cccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatca 124  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  53082353 cccccagcaatgaatgagtatgcatggacacaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatctt--tca 53082256  T
Q  125 acttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 205  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  53082255 tcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc 53082173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12562 - 12419
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  12562 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 12465  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12464 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 7798683 - 7798897
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  7798683 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttagaacatcat 7798780  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  7798781 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 7798879  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  7798880 agtcatcaacatcttaaa 7798897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 22636344 - 22636558
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactta-acttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---cat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| || ||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||    
T  22636344 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatctta-attcaacaacctcttatata-atccaataatttggaaaatcat 22636441  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  22636442 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 22636540  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  22636541 attcatcaacatcttaaa 22636558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 50222594 - 50222451
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  50222594 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 50222497  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50222496 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 50222451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7641437 - 7641294
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  7641437 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 7641340  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7641339 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 7641294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15118607 - 15118464
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  15118607 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 15118510  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15118509 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15118464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18239674 - 18239531
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  18239674 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 18239577  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18239576 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18239531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44773342 - 44773199
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  44773342 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 44773245  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44773244 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 44773199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 52312417 - 52312560
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  52312417 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 52312514  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52312515 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 52312560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 12902666 - 12902880
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  12902666 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 12902764  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | || ||    
T  12902765 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 12902863  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||||||||||| ||||    
T  12902864 ttcatcaacatcttaaa 12902880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 7893611 - 7893826
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  7893611 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 7893708  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  7893709 tcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 7893807  T
Q  212 aagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||||| || |||| ||||    
T  7893808 aagtcaacatcatcttaaa 7893826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1837764 - 1837621
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  1837764 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 1837667  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837666 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1837621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46640662 - 46640472
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||| ||||| |  || | |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |    
T  46640662 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacatcttaacatcttagac-catcgacctcttatataaatccaataatttgaaacaacattt 46640564  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  46640563 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatg 46640472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52873579 - 52873365
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  52873579 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 52873482  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  52873481 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 52873383  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| || |||| ||||    
T  52873382 agtcaacatcatcttaaa 52873365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54798966 - 54798757
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaact-tcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||   ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||    
T  54798966 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaatactttggaacttcat 54798869  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  54798868 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 54798770  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  54798769 agtcaacaacatc 54798757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 7088846 - 7088995
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7088846 acaacctcttatattaatccaataatttagaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggca 7088944  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  7088945 gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 7088995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15355581 - 15355437
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca- 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||| || | || |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||     
T  15355581 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttctta-aatcgactacctcttatata-atccaataatttggaacttcaa 15355484  T
Q  116 --tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
      |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15355437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16270448 - 16270234
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  16270448 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 16270351  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  16270350 tcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16270252  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||| | ||||||| ||||    
T  16270251 agttaacaacatcttaaa 16270234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 3096202 - 3096369
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||    
T  3096202 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattattctaataatttggaacatcatc 3096300  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  3096301 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 3096369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18215530 - 18215325
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||   ||    
T  18215530 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctctcatata-atccaataatttgaaacttcat 18215433  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  18215432 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18215335  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  18215334 agtcaacaac 18215325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23374565 - 23374357
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||    
T  23374565 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-actcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcttc 23374467  T
Q  118 ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
       | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| ||    
T  23374466 ---aacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattc 23374371  T
Q  217 atcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||| ||||    
T  23374370 aacaacatcttaaa 23374357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 222
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596763
Alignment:
Q  145 cttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac 16596763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 44052799 - 44052952
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44052799 acaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataac-aacatcaacataggca 44052896  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  44052897 gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 44052952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 225
Target Start/End: Original strand, 14280298 - 14280430
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatca 190  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| | ||| || ||    
T  14280298 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaaca 14280395  T
Q  191 tgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  14280396 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 14280430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44929075 - 44928935
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||    
T  44929075 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 44928978  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
    |||| | ||| || ||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  44928977 gtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagtca 44928935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14053513 - 14053306
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  14053513 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttacattagtccaataatttggaacatcatc 14053415  T
Q  118 ttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 214  Q
     |  |||||   ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | | |||     
T  14053414 atcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaat 14053316  T
Q  215 tcatcaacat 224  Q
    ||||||||||    
T  14053315 tcatcaacat 14053306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51464122 - 51463980
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  51464122 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttggaacttcatc 51464026  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51464025 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 51463980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 14038565 - 14038766
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||     |||||    
T  14038565 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataattt-----atcat 14038657  T
Q  117 cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||  |||| |||||| |||||||||    
T  14038658 cttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagt 14038756  T
Q  216 catcaacatc 225  Q
    || |||||||    
T  14038757 caacaacatc 14038766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Original strand, 6899862 - 6900013
Alignment:
Q  81 aacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 176  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  6899862 aacctcttatata-attcaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aatagcaacataggcag 6899959  T
Q  177 tatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||| |||| || |||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  6899960 tatacaaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 6900013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 12610858 - 12611000
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| | ||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  12610858 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tattgtata-atccaataatttggaacttcatc 12610954  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12610955 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12611000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16240121 - 16239968
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||  | ||| ||||||    
T  16240121 acaacctcttatata-atctaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaat-agcaaaataggc 16240024  T
Q  175 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16240023 agtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 16239968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 44102196 - 44102264
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44102196 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 44102264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 179
Target Start/End: Original strand, 17046456 - 17046559
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  17046456 acaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggta 17046555  T
Q  176 gtat 179  Q
    ||||    
T  17046556 gtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19618330 - 19618223
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  19618330 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 19618233  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  19618232 agtcaacaac 19618223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 19242682 - 19242749
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaa--catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19242682 atccaataatttggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19242749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23803442 - 23803377
Alignment:
Q  98 caataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23803442 caataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23803377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8575072 - 8574935
Alignment:
Q  26 ccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatctta 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||   |||||||||    
T  8575072 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatccacaacctcttatata-atccaatgctttggaacctcatcatctta 8574975  T
Q  121 atcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8574974 attaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 8574935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 14157763 - 14157857
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  14157763 atcaagccctcaacaatgtatgctaatgcatggactagacaactcaacctcttagaaacgacaacatcttatata-gtccaataatttggaacatc 14157857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 14164468 - 14164562
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  14164468 atcaagccctcaacaatgtatgctaatgcatggactagacaactcaacctcttagaaacgacaacatcttatata-gtccaataatttggaacatc 14164562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 14825384 - 14825514
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14825384 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataactccaataatttggaacaacatct 14825481  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaa 153  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  14825482 t--tcatcttagaccgactcatgcagtttaattaa 14825514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 3514989 - 3515057
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3514989 atccaataatttagaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaa 3515057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Original strand, 6190452 - 6190531
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | | |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  6190452 atccaataaattggaacatcatctt--ttatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcag 6190531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14853079 - 14852980
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14853079 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataactccaataatttggaacaacatct 14852982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 15369927 - 15370071
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctctta-aatatatccaataatttggaacat--- 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||| ||| ||||| |  | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||       
T  15369927 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-attcgacaacctcttataata-gtccaataatttggaacatcaa 15370024  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||| | | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  15370025 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15370071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 17333192 - 17333347
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||||| | |  ||||||||||||||||| | |||    
T  17333192 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacatcttatacaactccaataatttggaacaacttct 17333290  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    ||  || | || || || ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||    
T  17333291 ta--catcatagactgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 20149814 - 20149879
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||  | |||||||||    
T  20149814 atccaataatttggaacttcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaa 20149879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14970910 - 14970819
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---------ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||         |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14970910 caacgacctcttaaatag-tccaataatttggaacatcatcatcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa 14970819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Original strand, 15367602 - 15367743
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca---tc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||   ||    
T  15367602 aagcccccaacaaagaatgctaatgaatggactcgacttcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatc 15367700  T
Q  118 ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    || | | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  15367701 ttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15367743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 15371111 - 15371255
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatca- 115  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||     
T  15371111 atcaagcccccaacaaagaatggtaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-attcgacaacctcttata-atagtccaataatttggaacatcaa 15371208  T
Q  116 --tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
      |||| | | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  15371209 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15371255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 15402612 - 15402756
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaact-tcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatca- 115  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||  ||||||  ||||| |  | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||     
T  15402612 atcaagcccccaacaaagaatgcaaatgcatggactcgacttcttaaccatctta-attcgacaacctcttata-atagtccaataatttggaacatcaa 15402709  T
Q  116 --tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
      |||| | | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  15402710 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15402756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Original strand, 16223444 - 16223585
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca---tc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||   ||    
T  16223444 aagcccccaacaaagaatgctaatgaatggactcgacttcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatc 16223542  T
Q  118 ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    || | | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  16223543 ttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 16223585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 12569989 - 12570063
Alignment:
Q  91 atatatccaataatttgga-----acatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| | ||||||||||||||    
T  12569989 atatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaa 12570063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 225
Target Start/End: Original strand, 8846461 - 8846490
Alignment:
Q  196 taacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846461 taacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 8846490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21815760 - 21815699
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataac 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  21815760 atccaataaattggaacatcatcct--tcatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataac 21815699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 47831715 - 47831938
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaa-atatatccaataatttggaacatc--- 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  47831715 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatttggaacatcatc 47831814  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 214  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831815 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 47831914  T
Q  215 tcatcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  47831915 tcatcaacatcataaacatcaaac 47831938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 811340 - 811121
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  811340 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatca 811241  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811240 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 811141  T
Q  219 caacatcataaacaccaaac 238  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  811140 taacatcataaacatcaaac 811121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 67654 - 67863
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---catca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  67654 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatca 67753  T
Q  116 tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  67754 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaat 67853  T
Q  216 catcaacatc 225  Q
    || |||||||    
T  67854 caacaacatc 67863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 44014092 - 44014284
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  44014092 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctctta--taagtccaataatttggaacatcatca 44014189  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014190 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 44014284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16219925 - 16219707
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||     
T  16219925 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacaacttagaa-caacaacctcttatataagtcgaataatttggaacatcatca 16219827  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219826 tcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 16219727  T
Q  219 caacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  16219726 caacatcttaaacatcaaac 16219707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 18005560 - 18005764
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||     
T  18005560 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatgaacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctctta--taagtccaataattcggaacatcatca 18005657  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18005658 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 18005757  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  18005758 caacatc 18005764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 16056242 - 16056458
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16056242 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 16056341  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  16056342 t--tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 16056438  T
Q  219 caacatcataaacaccaaac 238  Q
    |||||||  ||||| |||||    
T  16056439 caacatctcaaacatcaaac 16056458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2280329 - 2280122
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||     
T  2280329 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataatttggaacatcatca 2280230  T
Q  118 ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
    |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  2280229 tctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaaatca 2280130  T
Q  218 tcaacatc 225  Q
     |||||||    
T  2280129 acaacatc 2280122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 34200694 - 34200889
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  |  |||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  34200694 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 34200792  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    |   || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34200793 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 34200889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 12901234 - 12901444
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacat---ca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||   |     
T  12901234 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagcaacaacgacctcttatataaatcctataatttggaacatcggcc 12901333  T
Q  116 tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  12901334 tctt--tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaa 12901431  T
Q  214 gtcatcaacatca 226  Q
      || ||||||||    
T  12901432 aacagcaacatca 12901444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11996240 - 11996045
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  | ||||| |  | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  11996240 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacctcttaaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 11996142  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    |   || | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11996141 catcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattgaatg 11996045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 238
Target Start/End: Original strand, 22072880 - 22073045
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc---atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072880 caacaacctcttatatatatccaatagtttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 22072979  T
Q  174 cagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    || ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||||    
T  22072980 cactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaac 22073045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1868201 - 1868016
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  1868201 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaattcaataatttggaacaacatct 1868103  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 205  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1868102 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc 1868016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Original strand, 16495369 - 16495505
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495369 caacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 16495468  T
Q  174 cagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16495469 cagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 16495505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20220394 - 20220201
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20220394 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 20220296  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |  ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  20220295 t--tcatcttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa 20220201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15008706 - 15008503
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |    
T  15008706 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaacatca--t 15008609  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15008608 tcttcatcttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatc 15008510  T
Q  217 atcaaca 223  Q
    | |||||    
T  15008509 aacaaca 15008503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28505450 - 28505320
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28505450 acaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 28505351  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28505350 gtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28505320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18456624 - 18456411
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  18456624 atcaagcccctaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 18456527  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  18456526 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 18456428  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  18456427 gtcaacaacatcttaaa 18456411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 14044661 - 14044817
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14044661 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 14044759  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  14044760 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 14354691 - 14354847
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14354691 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 14354789  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  14354790 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14354847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 12698740 - 12698955
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactta-acttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| || ||||| |  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698740 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttagacatctta-attcaacaaccttttatata-atccaataatttggaacatcat 12698837  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | |||    
T  12698838 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgc 12698936  T
Q  212 aagtcatcaacatcataaa 230  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  12698937 aattcatcaacatcttaaa 12698955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 222
Target Start/End: Original strand, 13647236 - 13647440
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatctt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  | ||||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  13647236 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatctta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcat 13647334  T
Q  120 aatcaa---cttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    | ||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  13647335 attcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13647433  T
Q  216 catcaac 222  Q
    || ||||    
T  13647434 caacaac 13647440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 11972403 - 11972546
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  11972403 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 11972500  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11972501 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 11972546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14949377 - 14949234
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  14949377 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 14949280  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14949279 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 14949234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 16409966 - 16410109
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  16409966 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacgtcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 16410063  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16410064 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 16410109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 32125398 - 32125541
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  32125398 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 32125495  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32125496 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 32125541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 41522824 - 41522967
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  41522824 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 41522921  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41522922 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 41522967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 41525286 - 41525429
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  41525286 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 41525383  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41525384 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 41525429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15755023 - 15754893
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcat 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15755023 atccaattatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcat 15754924  T
Q  192 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  15754923 gatataataatatcgaatgcaaatcaacaac 15754893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 9509098 - 9509312
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9509098 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 9509195  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaa-atcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  9509196 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgca 9509294  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  9509295 attcatcaacatcttaaa 9509312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15376968 - 15376825
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  15376968 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 15376871  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15376870 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15376825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16386460 - 16386292
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  16386460 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 16386362  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
       || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16386361 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaa 16386292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21189850 - 21189707
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  21189850 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 21189753  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21189752 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21189707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12255924 - 12255809
Alignment:
Q  91 atatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--t 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  12255924 atatatccaataatttggaacatcatctt--tcaag----acagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaatt 12255831  T
Q  189 catgatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  12255830 catgatataacaatatcaaatg 12255809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 38227450 - 38227603
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38227450 acaacctcttatata-atccaataatttggaaacatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggc 38227547  T
Q  175 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  38227548 agtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 38227603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 48273298 - 48273507
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||    
T  48273298 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaatactttggaacttcat 48273395  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  48273396 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 48273494  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  48273495 agtcaacaacatc 48273507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 456228 - 456371
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  456228 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 456325  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  456326 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 456371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11393542 - 11393399
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  11393542 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaactccatc 11393445  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11393444 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 11393399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 16232427 - 16232570
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  16232427 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 16232524  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232525 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 16232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20385378 - 20385235
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  20385378 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 20385281  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20385280 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20385235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 24702145 - 24702288
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  24702145 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 24702242  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24702243 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 24702288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 24704595 - 24704738
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  24704595 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 24704692  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24704693 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 24704738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3564576 - 3564367
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||   ||    
T  3564576 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttagaacttcat 3564479  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  3564478 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgta 3564380  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  3564379 agtcaacaacatc 3564367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9177872 - 9177718
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||    
T  9177872 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacttct 9177774  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 176  Q
    ||  || | || ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  9177773 ta--catcatagaccgactcatgcagcttaattcaataataaacaacaacatatgcag 9177718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 20110462 - 20110606
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  20110462 atcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 20110559  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20110560 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20110606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 27216767 - 27216910
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  27216767 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 27216864  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27216865 atcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa 27216910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 44116415 - 44116620
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  44116415 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 44116512  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  44116513 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 44116610  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  44116611 agtcaacaac 44116620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 26211904 - 26212119
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  26211904 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaagcaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 26212002  T
Q  118 ----ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
        || | ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||    
T  26212003 attcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgca 26212101  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||| ||||||| ||||    
T  26212102 attcaacaacatcttaaa 26212119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15144190 - 15144105
Alignment:
Q  73 taaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15144190 taaacaacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatc-tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15144105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 18640179 - 18640322
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |||||  ||||| || | ||||||||||| |||  |||||||||||||| |   |||    
T  18640179 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaactcttaatatctta-aatcgacaacctcttatatag-tccaataatttggaccttcatc 18640276  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640277 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18640322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 13869313 - 13869396
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13869313 acaacctcttatata-atccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13869396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 48991095 - 48991252
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||| |||| ||||| |||||    
T  48991095 atcaagcccccaaca-tgaacgagtatgcatggactccacaacttaacatcttagaaacatcgacctctcatataaatccaatcatttagaacaacatct 48991193  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 179  Q
    |  ||| |||  | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48991194 t--tcatcttggatcgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17062095 - 17061966
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcat 191  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||| ||||  | |||    
T  17062095 atccaataatttgaaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaatagcat 17061997  T
Q  192 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  17061996 gacataataatatcaaatgcaagtcagcaac 17061966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 18203728 - 18203882
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18203728 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcgtggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 18203825  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |  ||| |||| | ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  18203826 t--tcatcttagatcgactcatgcagcttagtt-aataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 225
Target Start/End: Original strand, 18430694 - 18430826
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatc---atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat-gcaaatcatca 190  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||   ||| |||||    
T  18430694 atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatataaaaacatca 18430791  T
Q  191 tgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18430792 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 18430826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 40443300 - 40443508
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---catc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||| ||| ||   |||||||||||||||   ||||    
T  40443300 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaaccttttatattagtccaataatttggaatatcatc 40443398  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 214  Q
    ||||| | || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| || ||||| |||| |||||| | | |||     
T  40443399 atcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaat 40443497  T
Q  215 tcatcaacatc 225  Q
    |||||||||||    
T  40443498 tcatcaacatc 40443508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 3386241 - 3386383
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  3386241 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatgaactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttggaacttcatc 3386337  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3386338 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 3386383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 14323281 - 14323399
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14323281 atcaaccccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 14323379  T
Q  119 taatcaacttataccgattcat 140  Q
    |  |||||||| ||||| ||||    
T  14323380 t--tcaacttagaccgactcat 14323399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 16213666 - 16213734
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16213666 atccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 16213734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27847965 - 27847881
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27847965 tccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38898572 - 38898489
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38898572 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcaccatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38898489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 16091674 - 16091772
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| || || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16091674 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaa-catcgacctcttatatatatccaataatttggaacaacatct 16091771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 13831355 - 13831431
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13831355 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca 13831431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19486879 - 19486766
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||  ||||| ||||||||||||||||  |||  | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19486879 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatg 19486780  T
Q  193 atataacaatatcg 206  Q
    |||||| |||||||    
T  19486779 atataataatatcg 19486766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10063953 - 10063821
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    |||||||||||||||||||| |   || | | ||||| || || ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  10063953 tccaataatttggaacatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatg 10063854  T
Q  193 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||| |||||||||  ||||| | |||||||    
T  10063853 atataataatatcgaacacaagtaaacaacatc 10063821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Original strand, 24275170 - 24275282
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 207  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |    
T  24275170 aacaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 24275267  T
Q  208 atgcaagtcatcaac 222  Q
    |||||||||| ||||    
T  24275268 atgcaagtcaacaac 24275282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12256028 - 12255951
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatat 96  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  12256028 atcaagcccccatcactgaatgcgaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatatatat 12255951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 10588945 - 10589115
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgct---aatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  10588945 atcaagcccccaacaatgaatgctgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatc 10589043  T
Q  115 atcttaatc---aacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
    ||| |  ||   |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  10589044 atcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatatgcagtatacaaa 10589115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26356252 - 26356098
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaa--caacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---a 112  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |    
T  26356252 atcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaaaaatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttca 26356154  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26356153 tcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaaca 26356098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26358704 - 26358550
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaa--caacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---a 112  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |    
T  26358704 atcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaaaaatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttca 26358606  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26358605 tcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataac-aacaacaaca 26358550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15755100 - 15755067
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatgga 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755100 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatgga 15755067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 16324135 - 16324168
Alignment:
Q  192 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324135 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 16324168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15082061 - 15082021
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccga 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15082061 atccaataatttggaacttcatcttaatcaacttagaccga 15082021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 14036284 - 14036354
Alignment:
Q  137 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 205  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  14036284 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc 14036354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 14346314 - 14346384
Alignment:
Q  137 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 205  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  14346314 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatc 14346384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14932853 - 14932802
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||    
T  14932853 aacatcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 14932802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15356288 - 15356237
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||    
T  15356288 aacatcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15356237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15360402 - 15360351
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||    
T  15360402 aacatcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaa 15360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19649608 - 19649557
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19649608 aacatcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 16579483 - 16579529
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaactta 64  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16579483 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggattcaacaactta 16579529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16586180 - 16586134
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactta 64  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16586180 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggattcaacaactta 16586134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27848042 - 27848008
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggac 53  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27848042 atcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggac 27848008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2832558 - 2832509
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  2832558 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11769120 - 11769021
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || ||||| |||  |||||||||||| |||| |||||    
T  11769120 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacatcttatataactccaataatttgaaacaacatct 11769023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113061
Alignment:
Q  192 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 15113061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 6520 - 6742
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc---a 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  6520 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatca 6619  T
Q  116 tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6620 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagt 6719  T
Q  216 catcaacatcataaacaccaaac 238  Q
     |||| ||| ||||||| |||||    
T  6720 tatcatcattataaacatcaaac 6742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 13900 - 14122
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc---a 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  13900 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatca 13999  T
Q  116 tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14000 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagt 14099  T
Q  216 catcaacatcataaacaccaaac 238  Q
     |||| ||| ||||||| |||||    
T  14100 tatcatcattataaacatcaaac 14122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 41 - 247
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  41 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataatcaacaacctcttaagtatatccaataatttggaacatcatca 140  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  141 tcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 240  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  241 caacatc 247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15989 - 15767
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15989 atcaaacccccaacaatgaatgctaatgcatagacacaacaacttaacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatca 15890  T
Q  118 --ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15889 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagt 15790  T
Q  216 catcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||    
T  15789 catcatcatcatatacatcaaac 15767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 178896 - 178947
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  178896 aacatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 178947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 14234392 - 14234618
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctct----taaatatatccaataatttggaa---c 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||||||||||||||||||   |    
T  14234392 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaataacttaacttcttataaacaacaaccttttatatatatatatccaataatttggaacatc 14234491  T
Q  112 atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234492 atcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 14234591  T
Q  212 aagtcatcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14234592 aagtcatcaacatcataaacatcaaac 14234618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 15470837 - 15471055
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  15470837 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcattgacacaacaacttaacaacttagaa-caacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatca 15470935  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470936 tcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 15471035  T
Q  219 caacatcataaacaccaaac 238  Q
    |||||||  ||||| |||||    
T  15471036 caacatctcaaacatcaaac 15471055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 16097241 - 16097446
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  16097241 atcaagcccccaacaatgaatgttaattcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacaatctcttaaataagtccaataatttggaacatcatca 16097339  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16097340 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcat 16097439  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  16097440 caacatc 16097446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 9512835 - 9513026
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  9512835 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaactta-aaacaacatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 9512931  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512932 tcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 9520810 - 9521001
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  9520810 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacatcttagaa-caacatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 9520906  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9520907 tcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49668282 - 49668091
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  49668282 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 49668186  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668185 tcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 49668091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52523936 - 52523730
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  52523936 atcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggactcaacaactcaacatcttagaaataacaaactcttatataaatccaataatttggaacatcttct 52523837  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
       ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52523836 --gtcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatc 52523739  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  52523738 aacaacatc 52523730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12174457 - 12174274
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||          |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  12174457 atcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggacacaacatcttag---------aacaacaacctctta--taagtccaataatttggaacatcatca 12174369  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174368 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 12174274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 16103695 - 16103886
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |  |||| |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  16103695 atcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggacacatcatcttagcaactta-aaacaacatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 16103791  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103792 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 16103886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 32307592 - 32307783
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| || ||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||| ||||     
T  32307592 atcaagcccccaatagtgaatgctaatgcatggacataacatcttaacaacttagaa-caacatcatctta--taagtccaataatttggaacaacatca 32307688  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307689 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 32307783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22110559 - 22110365
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  22110559 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcc 22110460  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  22110459 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa 22110365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1644879 - 1644693
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||| ||||     
T  1644879 atcaagcccctaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacatcatctta--taagtccaataatttggaacaacatcg 1644783  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
    | ||||||||| ||| | | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1644782 tcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaat 1644693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37251375 - 37251169
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37251375 atcaagcccccgacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaaaatcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 37251276  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |   || |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  37251275 t--ccatcttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 37251178  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  37251177 aacaacatc 37251169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13210540 - 13210333
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  |  |||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  13210540 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttgaaacatcat 13210442  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13210441 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgcaa 13210342  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
     ||| ||||    
T  13210341 atcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Original strand, 27165217 - 27165361
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  27165217 acaacctcttatata-atccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagaca 27165315  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 221  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27165316 gtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaatgcaagtcatcaa 27165361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 53301744 - 53301561
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttatac 132  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||    
T  53301744 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagac 53301647  T
Q  133 cgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53301646 cgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcat 53301561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 43925873 - 43926078
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43925873 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 43925971  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43925972 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 43926069  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  43926070 aacaacatc 43926078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24153420 - 24153207
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  24153420 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 24153323  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  24153322 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-gatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24153224  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  24153223 gtcaacaacatcttaaa 24153207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28848866 - 28848723
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  28848866 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 28848769  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28848768 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28848723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 17463085 - 17463228
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  17463085 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 17463182  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17463183 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 17463228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 34159233 - 34159376
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  34159233 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 34159330  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34159331 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 34159376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11424971 - 11424783
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11424971 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 11424874  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 205  Q
    |   || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  11424873 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatc 11424783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 8899001 - 8899144
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  8899001 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 8899098  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899099 atcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 8899144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16283066 - 16282923
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  16283066 atcaagcccccaacaataaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaactttatc 16282969  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16282968 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 16282923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16454536 - 16454393
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  16454536 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 16454439  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16454438 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 16454393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20698649 - 20698438
Alignment:
Q  18 aatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  20698649 aatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatca 20698551  T
Q  116 tc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    ||   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || |||||  ||| |||||| | |||    
T  20698550 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgc 20698452  T
Q  212 aagtcatcaacatc 225  Q
    || |||||||||||    
T  20698451 aattcatcaacatc 20698438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45578093 - 45577950
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  45578093 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 45577996  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45577995 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45577950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 606532 - 606328
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||||| | |||| ||| | ||||| || || | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||     
T  606532 atcaagcccccaacaatgtatgagtatgcatggactctacaaattagcatcttagaa-catcgacctcttatataaatccaacaatttggaacatcatca 606434  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |   ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  606433 t--tcatcttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattc 606337  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  606336 aacaacatc 606328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 12399118 - 12399332
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  12399118 atcaagccaccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-atttgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 12399216  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  12399217 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaa 12399315  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  12399316 ttcaacaacatcttaaa 12399332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 14972763 - 14972972
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14972763 atcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 14972860  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  14972861 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 14972959  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    | ||| |||||||    
T  14972960 aatcaacaacatc 14972972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 14572500 - 14572711
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||  ||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||    
T  14572500 atcaagcccccaacaatgaaatgcaaatgcatagactcgacctcttaaacatctta-aaacaacatcctcttaagtaagtccaataatttggaacaacat 14572598  T
Q  117 cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| | ||  ||||    
T  14572599 caacatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtc 14572697  T
Q  217 atcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||| ||||    
T  14572698 aacaacatcttaaa 14572711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 36166504 - 36166711
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |  ||| ||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||    
T  36166504 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcggcctctttaacttctta-aatcgacaacctcttatata-atccaatactttggaacttcat 36166601  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  36166602 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 36166699  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  36166700 gtcaacaacatc 36166711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13152046 - 13151902
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  13152046 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 13151949  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagc-ttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13151948 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa 13151902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13154511 - 13154367
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  13154511 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 13154414  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagc-ttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13154413 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa 13154367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43550736 - 43550529
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  | ||||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  43550736 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatctta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 43550638  T
Q  117 cttaatcaa---cttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    | || ||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  43550637 catattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-tgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 43550539  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  43550538 agtcaacaac 43550529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 55500849 - 55501055
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  55500849 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 55500946  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  55500947 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 55501044  T
Q  214 gtcatcaacat 224  Q
    |||| ||||||    
T  55501045 gtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23083573 - 23083359
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23083573 atcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 23083476  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | ||||    
T  23083475 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgca 23083377  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  23083376 agtcaacaacatcttaaa 23083359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 26686796 - 26687010
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  26686796 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatatag-tccaataatttggaacatcat 26686893  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  26686894 catcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 26686992  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| || |||| ||||    
T  26686993 agtcaacatcatcttaaa 26687010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29172839 - 29172634
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||   ||    
T  29172839 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttgaaacttcat 29172742  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  29172741 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 29172644  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  29172643 agtcaacaac 29172634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 42386333 - 42386528
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||        ||||| || |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||    
T  42386333 atcaagcccccaacaatgtatgctaatgcatggactcatca--------tcttagaatcaacgacctcttaa-taaatccaatgatttggaacatcctct 42386423  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
    |  |  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42386424 t--ttgacttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtca 42386520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 43840841 - 43841055
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43840841 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 43840938  T
Q  117 ---cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
       ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  43840939 tatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 43841037  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| || |||| ||||    
T  43841038 agtcaacatcatcttaaa 43841055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45607162 - 45607019
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  45607162 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 45607065  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45607064 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 45607019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 15977419 - 15977565
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaa--caacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---a 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| |||  | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |    
T  15977419 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaaaaatcgacaacctcttgtata-atccaataatttggaacttca 15977517  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15977518 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15977565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 18438503 - 18438652
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18438503 acaacctcttatata-atccaataatttgaaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacataggc 18438600  T
Q  175 agtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18438601 agtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 18438652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 13442244 - 13442397
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  13442244 acaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacggcaacataggca 13442341  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  13442342 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 13442397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14577042 - 14576831
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||  ||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  14577042 atcaagcccccaaaaatgaaatgcaaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aaataacaacctcttaagtaagtccaataatttggaacatcat 14576944  T
Q  117 cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |   ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  | | || ||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  14576943 caacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataac-aacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtc 14576845  T
Q  217 atcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||| ||||    
T  14576844 aacaacatcttaaa 14576831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 21618355 - 21618562
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| ||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21618355 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacttctta-aatcgacaacctcttatata-atccaatactttggaacttcat 21618452  T
Q  117 ctt---aatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  21618453 cttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 21618550  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  21618551 gtcaacaacatc 21618562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40213871 - 40213724
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||    
T  40213871 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacatcaacaca-gca 40213775  T
Q  176 gtatgca-aatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| || || |||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  40213774 gtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 40213724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7781602 - 7781459
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  7781602 atcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 7781505  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781504 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 7781459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9707862 - 9707719
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | |||| |||||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  9707862 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaaactcttgtata-atccaataatttggaacttcatc 9707765  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9707764 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 9707719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17446909 - 17446767
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  17446909 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgggctcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 17446812  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  17446811 atcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaa 17446767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 17487765 - 17487979
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17487765 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 17487862  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  17487863 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 17487961  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  17487962 attcatcaacatcttaaa 17487979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 17499247 - 17499461
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17499247 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 17499344  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  17499345 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 17499443  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  17499444 attcatcaacatcttaaa 17499461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Original strand, 28194601 - 28194755
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  28194601 atcaaacccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttggaacctcatc 28194697  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatag 172  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28194698 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6469385 - 6469246
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatga-atgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||    |||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  6469385 atcaagcccccaacaatgacatgctaatgcatggactcgacctctta----ctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 6469292  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6469291 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6469246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24340858 - 24340726
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  24340858 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatg 24340759  T
Q  193 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  24340758 atataataatatcgaacgcaagtaaacaacatc 24340726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 12377836 - 12378048
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| |||||    |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |    
T  12377836 atcaagcccccaaca-tgaataagtatgcatagactcaacaacttaacatcttaaaaacatcgacctcttatataaattcaataatttggaacaacatat 12377934  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  | | |||| ||||| |||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12377935 t--ttatcttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 12378032  T
Q  217 atcaacatcataaaca 232  Q
    | ||||| | ||||||    
T  12378033 aacaacaacttaaaca 12378048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Original strand, 23274717 - 23274805
Alignment:
Q  137 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  23274717 tcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatc 23274805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10247978 - 10247835
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  10247978 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttgtata-atccaataatttggaacttcatc 10247881  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10247880 atcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaa 10247835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 8499485 - 8499568
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8499485 acaacctcttatata-atccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 8499568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 15412396 - 15412479
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15412396 acaacctcttatata-atccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15412479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25476597 - 25476388
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25476597 atcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 25476500  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  25476499 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaac-aacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 25476401  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  25476400 agtcaacaacatc 25476388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 55476458 - 55476541
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55476458 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 55476541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 222
Target Start/End: Original strand, 17672627 - 17672737
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  17672627 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  210 gcaagtcatcaac 222  Q
    |||| ||| ||||    
T  17672725 gcaaatcaacaac 17672737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38962147 - 38962003
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38962147 atcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatagactcgatctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 38962050  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38962049 cattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38962003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Original strand, 41123816 - 41123940
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttatacc 133  Q
    ||||||||||||||||  | ||  |||||| ||||| || | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||    
T  41123816 aatgctaatgcatggattcgacctcttaacatctta-aatcgacaaccttttatata-atccaataatttggaactttatcatcttaatcaacttagacc 41123913  T
Q  134 gattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  41123914 gactcatgcagcttagttaaataacaa 41123940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 10556952 - 10557035
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10556952 acaacctcttatata-attcaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 10557035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12119920 - 12119837
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12119920 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaa 12119837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37642400 - 37642287
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||  ||||| ||||||||||||||||  |||  | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37642400 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatg 37642301  T
Q  193 atataacaatatcg 206  Q
    |||||| |||||||    
T  37642300 atataataatatcg 37642287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Original strand, 12567559 - 12567671
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcga 207  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| |    
T  12567559 aacaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 12567656  T
Q  208 atgcaagtcatcaac 222  Q
    |||||||||| ||||    
T  12567657 atgcaagtcaacaac 12567671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 17737218 - 17737286
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17737218 atccaataacttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 17737286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 50242804 - 50242872
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50242804 atccaataatttggaacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 50242872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Original strand, 13544029 - 13544136
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  13544029 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 13544126  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  13544127 agtcaacaac 13544136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 13919244 - 13919399
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||||| | |  ||||||||||||||||| | |||    
T  13919244 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacatcttatacaactccaataatttggaacaacttct 13919342  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    ||  || | || ||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||    
T  13919343 ta--catcatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 316035 - 316155
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  316035 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataactccaataatttggaacaacatct 316132  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgca 143  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||    
T  316133 t--tcatcttagaccgactcatgca 316155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Original strand, 44494810 - 44494859
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44494810 catcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa 44494859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22147660 - 22147547
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||  ||||| ||||||||||||||||  |||  | || |||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  22147660 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatg 22147561  T
Q  193 atataacaatatcg 206  Q
    |||||| |||||||    
T  22147560 atataataatatcg 22147547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 856114 - 856189
Alignment:
Q  91 atatatccaataatttgga------acatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  856114 atatatccaataatttggaggataaacatcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaa 856189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051202
Alignment:
Q  169 ataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 2051202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15878170 - 15878119
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  15878170 aacatcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 15878119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23077596 - 23077530
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23077596 aacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataac-aacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26196550 - 26196500
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataaca 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  26196550 aacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Original strand, 46822272 - 46822318
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||    
T  46822272 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 46822318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 53070828 - 53070765
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53070828 atccaataaattgaaacatcatcct--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 53070765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Original strand, 14665401 - 14665450
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14665401 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14665450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Original strand, 14668557 - 14668606
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  14668557 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12038070 - 12038018
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaa 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||||||||    
T  12038070 aacatcatcttaatcatcttatataaactcatgcaacttagttaaataacaaa 12038018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 161
Target Start/End: Original strand, 12496255 - 12496307
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaa 161  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  12496255 aacatcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaaa 12496307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 19176 - 19382
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  19176 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacataacaacttaacttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatca 19275  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19276 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 19375  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  19376 caacatc 19382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 12675 - 12897
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||     
T  12675 atcaagcccccaacaatgaatgataatgcatggacacaacaacttaacttcttattaacaacaacctcttatataagtccaatcatttggaacatcatca 12774  T
Q  119 taatca---acttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    ||||||   ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12775 taatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 12874  T
Q  216 catcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12875 catcaacatcataaacatcaaac 12897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 25175764 - 25175968
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  25175764 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctctta--taagtccaataatttggaacatcatca 25175861  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25175862 tcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 25175961  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  25175962 caacatc 25175968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 7679490 - 7679715
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc---- 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||        
T  7679490 atcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacttcaacctcttatatatatccaataatttggaacatcatcc 7679589  T
Q  115 ---atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
       ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7679590 atcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatgt 7679688  T
Q  212 aagtcatcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7679689 aagtcatcaacatcataaacatcaaac 7679715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7940 - 7736
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7940 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 7841  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  ||| |||| || || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7840 t--tcatcttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcat 7743  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  7742 caacatc 7736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18787110 - 18786907
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18787110 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 18787011  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  18787010 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattc 18786913  T
Q  217 atcaac 222  Q
    | ||||    
T  18786912 aacaac 18786907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 28405891 - 28406095
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| || ||||| | |||||  ||  ||||||||||||||| ||||||     
T  28405891 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacatcatcttaacaacttagaa-caacatcatctta--taagtccaataatttggaaaatcatca 28405987  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28405988 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 28406087  T
Q  218 tcaacatc 225  Q
     |||||||    
T  28406088 acaacatc 28406095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 23207191 - 23207385
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| || || |||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23207191 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcatagaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 23207290  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  23207291 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa 23207385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22413344 - 22413160
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22413344 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatctta-aaacattgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 22413246  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatat 204  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||    
T  22413245 t--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatat 22413160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23072161 - 23071968
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  23072161 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgaaaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 23072063  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
       || | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23072062 atcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaat 23071968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22134418 - 22134222
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||  | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  22134418 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacttcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 22134322  T
Q  119 taatcaactt------ataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    | |||| | |      | ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134321 tcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaatgca 22134223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 23791189 - 23791393
Alignment:
Q  21 caagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatctta 120  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  23791189 caagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatctt- 23791287  T
Q  121 atcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
     ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||     
T  23791288 -tcatcttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaa 23791386  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  23791387 caacatc 23791393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23708773 - 23708622
Alignment:
Q  75 aacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaat-caacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  23708773 aacaacaacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcatctttcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacatagg 23708674  T
Q  174 cagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  23708673 cagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatc 23708622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45030109 - 45029958
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  45030109 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 45030012  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45030011 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca 45029958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 18808850 - 18808993
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  18808850 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 18808947  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18808948 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18808993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 23135497 - 23135640
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  23135497 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 23135594  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23135595 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23135640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23712268 - 23712125
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  23712268 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 23712171  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23712170 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23712125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 26505286 - 26505429
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  26505286 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 26505383  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26505384 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 26505429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 26507764 - 26507907
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  26507764 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 26507861  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26507862 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 26507907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 28577006 - 28577149
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  28577006 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacttcttatata-atccaataatttggaacttcatc 28577103  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28577104 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28577149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 39682220 - 39682363
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  39682220 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 39682317  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39682318 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 39682363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24697813 - 24697608
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  24697813 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactt-acatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaacaatttggaacaacatct 24697715  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||    || ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24697714 t--tcatcttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattc 24697617  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  24697616 aacaacatc 24697608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 23060421 - 23060636
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  23060421 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 23060518  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  23060519 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 23060617  T
Q  212 aagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  23060618 aagtcaacaacatcttaaa 23060636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24898451 - 24898307
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  24898451 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 24898354  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagc-ttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24898353 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa 24898307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24900934 - 24900790
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  24900934 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 24900837  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagc-ttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24900836 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa 24900790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24903411 - 24903267
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  24903411 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 24903314  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagc-ttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24903313 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa 24903267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Original strand, 19671816 - 19671948
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19671816 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatg 19671915  T
Q  193 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  19671916 atataataatatcgaacgcaagtaaacaacatc 19671948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20520399 - 20520195
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||||  ||||| || ||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20520399 atcaagcccccaacaaagaatgactatgcatggactcaacaacttaatatcttagaa-cattgacctcttatataaatccaataatttggaacattatct 20520301  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20520300 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatc 20520204  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  20520203 aacaacatc 20520195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 22105320 - 22105524
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||   |||    
T  22105320 atcaagtccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttgaaacttcatc 22105416  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  22105417 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 22105515  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
    |||| ||||    
T  22105516 gtcaacaac 22105524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 298932 - 298812
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |    
T  298932 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaatt 298833  T
Q  210 gcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| ||| ||||||| ||||    
T  298832 gcaattcaacaacatcttaaa 298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 23004663 - 23004819
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||||  || ||| ||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23004663 atcaagcccccaacaatgaaggagtatgcatggactcaacaacttacatt-ttagaaacatcgacctcttatataaatccaacaatttggaacatcatct 23004761  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  23004762 t--tcatcttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagta 23004819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23654592 - 23654384
Alignment:
Q  25 cccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---tta 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||   ||     
T  23654592 cccccaacaatgaatgctagtgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttc 23654494  T
Q  121 atcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 219  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  23654493 aacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatc 23654395  T
Q  220 aacatcataaa 230  Q
    |||||| ||||    
T  23654394 aacatcttaaa 23654384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24905888 - 24905744
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  24905888 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 24905791  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagc-ttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24905790 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa 24905744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24908363 - 24908219
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  24908363 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 24908266  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagc-ttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24908265 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaa 24908219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 571304 - 571447
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  571304 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 571401  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  571402 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 571447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 6725902 - 6726045
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| |  | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||   |||    
T  6725902 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttacat-cgacaacctcttatata-attcaataatttggaacttcatc 6725999  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6726000 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6726045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21155315 - 21155172
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc--- 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||       
T  21155315 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcttc 21155218  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21155217 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21155172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23709787 - 23709644
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  23709787 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 23709690  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23709689 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23709644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22731447 - 22731238
Alignment:
Q  18 aatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactta-acttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||   ||| || |||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22731447 aatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttagacatctt-tattcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacatca 22731350  T
Q  116 tc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    ||   || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  22731349 tcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 22731251  T
Q  212 aagtcatcaacat 224  Q
    || ||||||||||    
T  22731250 aattcatcaacat 22731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24529785 - 24529633
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  24529785 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 24529688  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24529687 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aacaacaaca 24529633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32039753 - 32039610
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  32039753 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 32039656  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32039655 atcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaa 32039610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 43137206 - 43137349
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   |||    
T  43137206 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaatactttggaacttaatc 43137303  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43137304 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 43137349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 20309017 - 20309224
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |  |||| |  | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  20309017 atcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacatcttaaacaactta-attcgacaacctcttata-atagtccaataatttggaacatcat 20309114  T
Q  117 cttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| |||    
T  20309115 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatcaaattcaa 20309212  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     |||||||||||    
T  20309213 ttcatcaacatc 20309224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 23076350 - 23076565
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  23076350 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcggcctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 23076447  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  23076448 tcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 23076546  T
Q  212 aagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||||| ||| ||| ||||    
T  23076547 aagtcaacaatatcttaaa 23076565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 184
Target Start/End: Original strand, 23285832 - 23285941
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23285832 caacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagg 23285930  T
Q  174 cagtatgcaaa 184  Q
    |||||| ||||    
T  23285931 cagtatacaaa 23285941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 24367680 - 24367824
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24367680 atcaagcccccaacaatgtaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 24367777  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24367778 cattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 24367824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24643206 - 24643062
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc-- 114  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||      
T  24643206 atcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatcatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcgt 24643109  T
Q  115 -atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24643108 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 24643062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38266 - 38138
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38266 acaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggca 38168  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 205  Q
    |||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  38167 gtatacaaaacagcatgacataataatatc 38138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 38967281 - 38967424
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | |||| ||| || ||| |||||||| ||||||||   |||    
T  38967281 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaaactcctatata-atccaatattttggaacttcatc 38967378  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38967379 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38967424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 23130829 - 23130912
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23130829 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23130912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 23133296 - 23133379
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23133296 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23133379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34402717 - 34402634
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34402717 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 34402634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22738332 - 22738247
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738332 caacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 22738247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 23659993 - 23660145
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa---catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  23659993 acaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaac-aacagcaacataggca 23660090  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| | || ||  |||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  23660091 gtatacgaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatcttaaa 23660145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32215079 - 32214972
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  32215079 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 32214982  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  32214981 agtcaacaac 32214972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 184
Target Start/End: Original strand, 8946626 - 8946733
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  8946626 acaacctcttatata-atccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggc 8946723  T
Q  175 agtatgcaaa 184  Q
    ||||| ||||    
T  8946724 agtatacaaa 8946733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23040402 - 23040257
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  23040402 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgcactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 23040304  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |   || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23040303 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23040257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23103547 - 23103400
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23103547 acaacctcttaaattagtccaatattttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggca 23103449  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||| || ||||| || |  ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  23103448 gtatacaaa-cagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacatc 23103400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Original strand, 22337119 - 22337233
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat-gcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  22337119 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaat 22337217  T
Q  210 gcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||| || |||||||    
T  22337218 gcaagacaacaacatc 22337233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 26392298 - 26392451
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || ||||| |||  ||||||||||||||||| | |||    
T  26392298 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacatcttatataactccaataatttggaacaacttct 26392395  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
    ||  || | || ||||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  26392396 ta--catcatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23713094 - 23713060
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggac 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23713094 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggac 23713060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 178
Target Start/End: Original strand, 25108864 - 25108958
Alignment:
Q  82 acctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||    | ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25108864 acctcttatataaatccaataatttggagggacctctt--tcatcttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 25108958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 23287302 - 23287433
Alignment:
Q  44 atgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgca 143  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||| ||||| | || ||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||  || | || ||||| |||||||    
T  23287302 atgcatgaactcaacaacttaacaacttagaaacatcgacatcttatacaactccaataatttggaacaacttctta--catcatagaccgactcatgca 23287399  T
Q  144 gcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  23287400 gcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 299025 - 298991
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggac 53  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  299025 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggac 298991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21916217 - 21916156
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacata 171  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21916217 aacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaaa-aacaacata 21916156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32452060 - 32451981
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  | | |||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  32452060 atccaataaattggaacatcatcat--ttatcttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcag 32451981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 10439 - 10645
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacat--cat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  10439 atcaagcccccaacaatgaatgctaatccatggacacaacaacttaacctcttataaacaacaacctcttatatatatccaataatttggaacatatcat 10538  T
Q  117 cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |||  |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10539 ctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 10636  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    |||||||||    
T  10637 atcaacatc 10645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 100288 - 100492
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  100288 atcaagctcccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaaaaacaacctctta--tatatccaataatttggaacatcatca 100385  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  100386 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaa 100485  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  100486 caacatc 100492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40381 - 40177
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  40381 atcaagtccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaccaacaacctctta--taagtccaataatttggaacatcatca 40284  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40283 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 40184  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  40183 caacatc 40177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 101414 - 101576
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| | |||||  ||  ||||||||||| ||||||||||     
T  101414 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaactta-aaacaacatcatctta--taagtccaataatttagaacatcatca 101510  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  101511 tcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 94318 - 94461
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  94318 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 94415  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  94416 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 94461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 119784 - 119948
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  119784 atcaagccctcaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 119882  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatg 180  Q
       || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  119883 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 44361 - 44504
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaat-gctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||   |||    
T  44361 atcaagtccccaacaattaaaagctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataattttgaacttcatc 44458  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44459 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 44504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17613 - 17552
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17613 tccaataatttggaacatc---ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 17552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38598 - 38547
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  38598 aacatcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaa 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22922076 - 22921872
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||     
T  22922076 atcaagcccctaacaatgaatgttaatgcatggacacaacaacataacttcttataaacaacaacctctta--tatttccaataatttggaacatcatca 22921979  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22921978 tcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 22921879  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  22921878 caacatc 22921872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 33680920 - 33681125
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  33680920 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaaccacttagaa-caaccacctcttatataagtccaataatttggaacatcatca 33681018  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33681019 tcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgt 33681118  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  33681119 caacatc 33681125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 22237540 - 22237745
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||     
T  22237540 atcaagcccccaacgatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacaacttagaa-caacaacctcttatacaagtccaataatttgaaacatcatca 22237638  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237639 tcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 22237738  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  22237739 caacatc 22237745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52928176 - 52927989
Alignment:
Q  21 caagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |     
T  52928176 caagcccccaacaatgaatgttaatgcatggacacaacaacttaacaacttagaa-caacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcaccatc 52928078  T
Q  121 atcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928077 ttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 52927989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 21753960 - 21754151
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||| ||||     
T  21753960 atcaagcccccaacaatggatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacatcatctta--taagtccaataatttggaacaacatca 21754056  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21754057 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 21754151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 20248194 - 20248394
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| || || || | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  20248194 atcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-catcatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 20248290  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20248291 tcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 20248390  T
Q  219 caac 222  Q
    ||||    
T  20248391 caac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21896463 - 21896259
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||     
T  21896463 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaactcaacatcttagaaacaatggcctcttatataaatccaataatttggaacatcttcc 21896364  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21896363 t--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcat 21896266  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  21896265 caacatc 21896259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35261285 - 35261093
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||      
T  35261285 atcaagcctccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacataattc 35261186  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  35261185 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa 35261093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 16758570 - 16758770
Alignment:
Q  26 ccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | | ||||| ||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16758570 ccccaacaatgaatgcaaatgcatggactcaacgactcagcatcttagaaacaacgacctcgtataaaaatccaataatttggaacatcatctt--tcaa 16758667  T
Q  126 cttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 223  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||  || |||||    
T  16758668 cttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaacaaca 16758767  T
Q  224 tca 226  Q
    |||    
T  16758768 tca 16758770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21861733 - 21861573
Alignment:
Q  63 taacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaac 162  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  21861733 taacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaac 21861636  T
Q  163 aacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21861635 agcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50614324 - 50614118
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||     
T  50614324 atcaagccctcaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaccaacctctcatataaatccaataatttggaacaacatcc 50614225  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50614224 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 50614127  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  50614126 aacaacatc 50614118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50622152 - 50621946
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||     
T  50622152 atcaagccctcaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaccaacctctcatataaatccaataatttggaacaacatcc 50622053  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50622052 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 50621955  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  50621954 aacaacatc 50621946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41050243 - 41050037
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  41050243 atcaagcccctaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttagcatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcc 41050144  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  41050143 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 41050046  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  41050045 aacaacatc 41050037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16368492 - 16368288
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  16368492 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttagcatcttagaa-catcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatca 16368394  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16368393 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatc 16368297  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  16368296 aacaacatc 16368288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14295705 - 14295569
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14295705 caacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 14295606  T
Q  174 cagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14295605 tagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 14295569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 34509689 - 34509898
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  34509689 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 34509786  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  34509787 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgca 34509885  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  34509886 agtcaacaacatc 34509898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Original strand, 21161705 - 21161836
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgata 195  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  21161705 tccaataatttggaacatcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaaa-cagtatgcaaatcatcgtgata 21161803  T
Q  196 taacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcata 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21161804 taacaatatcgaatgcaattcatcaacttcata 21161836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 26064852 - 26065009
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26064852 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 26064951  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |  ||| | || ||| | ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  26064952 t--tcatcatagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagta 26065009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45575100 - 45574893
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  | ||||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  45575100 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatctta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 45575002  T
Q  117 cttaatcaa---cttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    | || ||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||||    
T  45575001 catattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgca 45574903  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  45574902 agtcaacaac 45574893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 13988773 - 13988916
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  13988773 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 13988870  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13988871 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13988916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918707
Alignment:
Q  123 caacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 20918707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21923546 - 21923403
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  21923546 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 21923449  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923448 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21923403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 50686526 - 50686681
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  50686526 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatctta-gaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 50686624  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  50686625 t--tcatcttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagt 50686681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50210429 - 50210216
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa------ 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||          
T  50210429 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 50210332  T
Q  111 -catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 208  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  50210331 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 50210233  T
Q  209 tgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||||| |||||||    
T  50210232 tgcaagtcaacaacatc 50210216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22123323 - 22123171
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  22123323 atcaagcccccaacaacgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 22123226  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22123225 atcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaaca 22123171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23593990 - 23593847
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  23593990 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 23593893  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593892 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23593847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 29298044 - 29298187
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||   |||    
T  29298044 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttgaaacttcatc 29298141  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29298142 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 29298187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 31612219 - 31612363
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  31612219 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaaactcttatata-atccaataatttggaacttcat 31612316  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31612317 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 31612363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21475342 - 21475199
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  21475342 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 21475245  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21475244 atcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa 21475199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20847366 - 20847205
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  20847366 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 20847268  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20847267 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 20847205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 432979 - 433124
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||  ||||| |||||    
T  432979 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat----aacggcaacacaggca 433073  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| | ||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  433074 gtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 433124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 22532178 - 22532392
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22532178 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 22532275  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  22532276 catcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgca 22532374  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||| ||||||| ||||    
T  22532375 attcaacaacatcttaaa 22532392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 21346928 - 21347011
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21346928 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21347011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27250941 - 27250727
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | |||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  27250941 atcaagcccctatcaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaatctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 27250843  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||    
T  27250842 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 27250744  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||||||||||| ||||    
T  27250743 ttcatcaacatcttaaa 27250727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 29776655 - 29776738
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29776655 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 29776738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13213059 - 13212974
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13213059 caacgacctcttaaatag-tccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13212974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 21342064 - 21342146
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa--catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342064 acaacctcttatata-atccaataatttggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 21342146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 21707149 - 21707225
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707149 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca 21707225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 21711691 - 21711767
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21711691 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca 21711767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Original strand, 21840771 - 21840878
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21840771 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 21840868  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  21840869 agtcaacaac 21840878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20454667 - 20454606
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 176  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20454667 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 38801599 - 38801433
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  38801599 atcaagcccccaactatgaatgcttatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 38801501  T
Q  118 ttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaa 183  Q
     |  |||||   ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38801500 atcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15860188 - 15860121
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaa--catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15860188 atccaataatttggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 184
Target Start/End: Original strand, 21026666 - 21026756
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21026666 tccaataatttggaacatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaatataggcagtatacaaa 21026756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 40389139 - 40389204
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  40389139 atccaataatttggaacttcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaa 40389204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16275544 - 16275420
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatca 190  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||| || ||    
T  16275544 atccaataatttagaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacgacata-gcagtatacaaaaacagca 16275447  T
Q  191 tgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
    ||| |||| |||||| | |||||||||    
T  16275446 tgacataataatatcaattgcaagtca 16275420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 16361921 - 16361965
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataac 158  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16361921 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 16361965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Original strand, 20916136 - 20916175
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaac 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20916136 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaac 20916175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 21714544 - 21714595
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21714544 aacatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 21714595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130925
Alignment:
Q  160 aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatg 22130925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22468810 - 22468764
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||    
T  22468810 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 22468764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271672
Alignment:
Q  192 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12271672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24783209 - 24783160
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  24783209 catcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16275616 - 16275584
Alignment:
Q  21 caagcccccaacaatgaatgctaatgcatggac 53  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16275616 caagcccccaacaaagaatgctaatgcatggac 16275584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17678704 - 17678652
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaa 161  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  17678704 aacatcatcttattcatcttataacgactcatgcaacttggttaaataacaaa 17678652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22831527 - 22831454
Alignment:
Q  91 atatatccaataatttgga----acatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| ||  || ||||||| | ||||||||||||||    
T  22831527 atatatccaataatttggagttcacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaa 22831454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14906 - 14700
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14906 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttatattcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatca 14807  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  14806 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaa 14707  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  14706 caacatc 14700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21329705 - 21329487
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||     
T  21329705 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactcaacctcttagaa----caacctcttatataaattcaataatttggaacatcatca 21329610  T
Q  118 --ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
      |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21329609 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaattcaagt 21329510  T
Q  216 catcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  21329509 catcaacatcataaacatcaaac 21329487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Original strand, 21565456 - 21565659
Alignment:
Q  20 tcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatctt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  21565456 tcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggtcacaacatcttaacaacttagaa-cgacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatcat 21565554  T
Q  120 aatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 219  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565555 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 21565654  T
Q  220 aacat 224  Q
    |||||    
T  21565655 aacat 21565659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26012245 - 26012053
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  26012245 atcaaacccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacctcttataaacaacaacctcttatatatatccaataatttggaacatcatca 26012146  T
Q  118 ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  26012145 tctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatcaaatg 26012053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22959738 - 22959538
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  22959738 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 22959642  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  22959641 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaa 22959542  T
Q  219 caac 222  Q
    ||||    
T  22959541 caac 22959538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21502365 - 21502146
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||   |||||| ||| || ||||||||||||||||||||     
T  21502365 atcaagcccttaacaatgaatgctaatgcattgacacaacaactcaacctcttagaaacaac---ctcttatataaattcaataatttggaacatcatca 21502269  T
Q  118 --ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21502268 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagt 21502169  T
Q  216 catcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||| |||| |||||| |||||    
T  21502168 catcatcatcttaaacatcaaac 21502146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 19668808 - 19669013
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19668808 atcaagcccccaagaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatca 19668906  T
Q  119 taatca---acttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    | ||||   ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19668907 tcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaaat 19669006  T
Q  216 catcaac 222  Q
    || ||||    
T  19669007 caacaac 19669013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20027148 - 20026941
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  20027148 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttataaacaacgacctcttatataaatccaataatttgaaacatcttct 20027049  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  20027048 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattc 20026951  T
Q  217 atcaacatca 226  Q
    | ||||||||    
T  20026950 aacaacatca 20026941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 22143961 - 22144167
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaa-caacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatat--ccaataatttggaacatca 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||     
T  22143961 atcaagccctcaacaatgaatgctaatgcatggactcaaacaactcaacaacttagaa-caacaacctcttatatatatatccaataatttggaacatct 22144059  T
Q  116 tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    ||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |    
T  22144060 tctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaat 22144157  T
Q  216 catcaacatc 225  Q
    || |||||||    
T  22144158 caacaacatc 22144167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19661047 - 19660854
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  19661047 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 19660949  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
       || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  19660948 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcgaat 19660854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22178427 - 22178222
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  22178427 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttg-aaacatcgacctcttatatcaatccaataatttggaacaacatct 22178329  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22178328 t--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatc 22178231  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  22178230 aacaacatc 22178222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 22412093 - 22412301
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  22412093 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 22412190  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  22412191 catcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-gataacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 22412289  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  22412290 gtcaacaacatc 22412301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 24529129 - 24529338
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| || | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  24529129 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatctta-aatcgacaaactcttatata-atccaataatttggaacttcat 24529226  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  24529227 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgca 24529325  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  24529326 agtcaacaacatc 24529338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21997746 - 21997547
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21997746 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 21997649  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  21997648 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 21997550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 208
Target Start/End: Original strand, 36314544 - 36314678
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36314544 caacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 36314643  T
Q  174 cagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 208  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36314644 tagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaa 36314678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2154869 - 2154726
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  2154869 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 2154772  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2154771 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2154726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10733195 - 10733052
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  10733195 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 10733098  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10733097 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 10733052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 9077861 - 9078070
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9077861 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaa-caacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 9077958  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  9077959 catcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgca 9078057  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  9078058 agtcaacaacatc 9078070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 20908919 - 20909063
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  20908919 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 20909016  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaa 161  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20909017 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaa 20909063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 24493477 - 24493691
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  24493477 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttattt-cgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 24493574  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  24493575 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaat-agcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 24493673  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  24493674 agtcaacaacatcttaaa 24493691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 265023 - 264880
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  265023 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 264926  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  264925 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 264880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27989136 - 27989004
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  27989136 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttagcatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatc- 27989038  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaa 153  Q
     | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27989037 -attcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 27989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 29329841 - 29329984
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||   |||    
T  29329841 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttcgaacttcatc 29329938  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29329939 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 29329984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42245620 - 42245477
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  42245620 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 42245523  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42245522 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 42245477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Original strand, 32027300 - 32027451
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  32027300 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 32027397  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaaca 169  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  32027398 atcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataac-aacaacaaca 32027451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23390708 - 23390494
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23390708 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 23390611  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  23390610 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 23390512  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  23390511 attcatcaacatcttaaa 23390494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26740851 - 26740720
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26740851 atcaagcccccaaca-tgaatgattatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataactccaataatttggaacaacatct 26740753  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaa 153  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26740752 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 26740720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 39245043 - 39245186
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||   ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  39245043 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagtatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 39245140  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39245141 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 39245186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10775932 - 10775790
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  10775932 atcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 10775835  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataac 158  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10775834 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 10775790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21808601 - 21808387
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  21808601 atcaagcccccaacaatgaaggctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 21808503  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |||||    
T  21808502 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaa 21808404  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  21808403 ttcaacaacatcttaaa 21808387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 25421501 - 25421655
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421501 acaacctcttatata-atccaataaattggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggc 25421598  T
Q  175 agtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| || |||| ||||    
T  25421599 agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacagcatcttaaa 25421655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 29345887 - 29346030
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  29345887 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 29345984  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29345985 atcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaa 29346030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 13025280 - 13025433
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  13025280 acaacctcttatata-atccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggc 13025377  T
Q  175 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13025378 agtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 13025433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 13095464 - 13095617
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  13095464 acaacctcttatata-atccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataac-aatagcaacataggc 13095561  T
Q  175 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| |||| || ||||| |||   ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13095562 agtatacaaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 13095617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18319211 - 18319146
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319211 atccaataatttggaacttcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18319146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21293181 - 21293020
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21293181 atcaagcccccaacaatgaatgctaattcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttaaattagtccaataatttggaacatcatc 21293083  T
Q  118 ttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
     |  |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21293082 atcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21729216 - 21729062
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21729216 acaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggca 21729118  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||| ||||||| ||||    
T  21729117 gtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaa 21729062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 1096375 - 1096585
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  1096375 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 1096472  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
     |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||| || ||| | |||| |||||| |||||    
T  1096473 acatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgc 1096571  T
Q  212 aagtcatcaacatc 225  Q
    || ||| |||||||    
T  1096572 aaatcaacaacatc 1096585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 22074929 - 22075142
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||   | | ||  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||     
T  22074929 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaag--catctattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatca 22075026  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| |||||| | |||||    
T  22075027 ttcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataac-aacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaa 22075125  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  22075126 ttcaacaacatcttaaa 22075142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 29348360 - 29348500
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  29348360 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 29348457  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataa 157  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29348458 atcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa 29348500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 29350833 - 29350973
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  29350833 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 29350930  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataa 157  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29350931 atcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataa 29350973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20918202 - 20918060
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   |||    
T  20918202 atcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatg-actcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaatagtttggaacttcatc 20918106  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20918105 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20918060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8286978 - 8286840
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacat---catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc--aaatcatca 190  Q
    |||| |||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||| || ||    
T  8286978 tccagtaatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagca 8286880  T
Q  191 tgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  8286879 tgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 8286840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 23064478 - 23064561
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23064478 acaacctcttatata-atccaataatttggaaccccatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 23064561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 39363351 - 39363434
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39363351 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 39363434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11581392 - 11581311
Alignment:
Q  81 aacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11581392 aacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 11581311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26733038 - 26732884
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||| ||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||  || |||||||||||||| |||||    
T  26733038 atcaagcccgcaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataactctaataatttggaacaacatct 26732940  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
    |   |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  26732939 t--gcaacatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36154960 - 36154892
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154960 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 36154892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 38619401 - 38619484
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619401 acaacctcttatata-atcaaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 38619484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20902207 - 20902121
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaat-caacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20902207 caacaacctcttaaatag-tccaataatttggaacttcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20902121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 25431303 - 25431517
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    ||    
T  25431303 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataaattggaaacatca 25431400  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    ||||||| || || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||    
T  25431401 tcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 25431498  T
Q  212 aagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  25431499 aagtcaacaacatcttaaa 25431517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 31060976 - 31061118
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  31060976 atcaagctcccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttggaacttcatc 31061072  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31061073 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 31061118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 37723812 - 37723975
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca-- 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | |||||||||||| |   |||||||||||||||| |||      
T  37723812 atcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttaatttagtccaataatttggaacttcaac 37723910  T
Q  116 -tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 179  Q
     |||| | || |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37723911 atcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtat 37723975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 24067092 - 24067157
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  24067092 atccaataatttggaacttcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaa 24067157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20806996 - 20806854
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---catc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |   ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||   ||||    
T  20806996 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttggaaattcatc 20806900  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20806899 atcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaa 20806854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Original strand, 40725839 - 40725952
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||  ||||| ||||||||||||||||  |||  | || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40725839 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatg 40725938  T
Q  193 atataacaatatcg 206  Q
    |||||| |||||||    
T  40725939 atataataatatcg 40725952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21731665 - 21731566
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  21731665 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacatcttatgtaactccaataatttggaacatcatct 21731568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21809785 - 21809686
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  21809785 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacatcttatgtaactccaataatttggaacatcatct 21809688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 14079147 - 14079198
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  14079147 aacatcatcttaatcatcttatatcaattcatgcaacatagttaaataacaa 14079198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 26704073 - 26704124
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26704073 aacatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26704124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 26973806 - 26973857
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26973806 aacatcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 26973857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 23572059 - 23572133
Alignment:
Q  91 atatatccaataatttggaa-----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  23572059 atatatccaataatttggaattgaacatcatcttaatcatcttatatggactcatgcaacttagttcaataacaa 23572133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24767662 - 24767613
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24767662 catcatcttaatcatcttatatagatttatgcaacttagttaaataacaa 24767613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 161
Target Start/End: Original strand, 21873252 - 21873304
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaa 161  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  21873252 aacatcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaa 21873304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448122
Alignment:
Q  160 aacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 29448122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46000 - 45795
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  46000 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatca 45902  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45901 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcat 45802  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  45801 caacatc 45795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 19652108 - 19652301
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19652108 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacaacctcttaaataactccaataatttggaacatcatca 19652206  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652207 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 19652301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 23019320 - 23019537
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc-tta 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |      
T  23019320 aagcccccaacaatgaatgttaatgcatggacacaacaacttaacctcttataaacaacaacctcttatatatatccaataatttggaacatcatcatct 23019419  T
Q  121 atcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 220  Q
     ||| |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23019420 ttcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaaca 23019519  T
Q  221 acatcataaacaccaaac 238  Q
    |||||  ||||| |||||    
T  23019520 acatctcaaacatcaaac 23019537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 20109049 - 20109256
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||     
T  20109049 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataatttggaacatcatca 20109148  T
Q  119 taat-caacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
    |  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20109149 tctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatcaaatgcaagtca 20109248  T
Q  218 tcaacatc 225  Q
    ||||||||    
T  20109249 tcaacatc 20109256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 19668285 - 19668492
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19668285 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaatcaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 19668384  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19668385 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 19668482  T
Q  217 atcaacatca 226  Q
    | ||||||||    
T  19668483 aacaacatca 19668492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9098713 - 9098528
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||        ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9098713 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaaca--------tcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 9098622  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  9098621 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgca 9098528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27333335 - 27333238
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333335 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27394075 - 27393978
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394075 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaa 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4185970 - 4185821
Alignment:
Q  78 aacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  4185970 aacaacttcttaaatag-tccaataatttggaacatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagt 4185872  T
Q  178 atgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcata 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4185871 atgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcata 4185821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22080935 - 22080754
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---catca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   |||||    
T  22080935 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgtatggacacatcaacttaac-actta-aaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatca 22080838  T
Q  116 tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22080837 tcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagtta-------------aacataggcagtatgcaaaacatcatgatataacaatatcgaatgca 22080754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 25644251 - 25644439
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                 |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25644251 atcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggacacaacaact-----------------caacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 25644333  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25644334 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtca 25644431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 20076609 - 20076805
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20076609 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaaaatcttaaacatcttagaa-caacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 20076706  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  20076707 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 20076805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Original strand, 4186339 - 4186488
Alignment:
Q  78 aacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| || | ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||    
T  4186339 aacaacttcttaaatag-tccaataatttggaatatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagt 4186437  T
Q  178 atgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcata 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4186438 atgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcata 4186488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19303752 - 19303544
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19303752 atcaagcccccaacaatgaaatactaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 19303655  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  19303654 catcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 19303556  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  19303555 gtcaacaacatc 19303544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28496684 - 28496489
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  28496684 atcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 28496587  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28496586 tcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 28496489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29809095 - 29808900
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  29809095 atcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 29808998  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29808997 tcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 29808900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2291435 - 2291292
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  2291435 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 2291338  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2291337 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2291292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18334847 - 18334704
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  18334847 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 18334750  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18334749 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18334704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 19004953 - 19005096
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  19004953 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 19005050  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19005051 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19005096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 24422454 - 24422597
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  24422454 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 24422551  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24422552 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 24422597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 33861701 - 33861844
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  33861701 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 33861798  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33861799 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 33861844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20638495 - 20638286
Alignment:
Q  20 tcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20638495 tcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcaacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 20638397  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||    
T  20638396 atcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 20638298  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     | |||||||||    
T  20638297 tttatcaacatc 20638286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Original strand, 1561288 - 1561418
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcat 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||   || | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  1561288 atccaattatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcat 1561387  T
Q  192 gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  1561388 gatataataatatcgaatgcaaatcaacaac 1561418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 23076646 - 23076801
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  23076646 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttacaaacatcgacctcttatatatatccaataatttggaacaacctct 23076743  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |  ||  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23076744 t--tcttcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 23076801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 29060448 - 29060658
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  29060448 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 29060545  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgc 211  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  29060546 tcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 29060644  T
Q  212 aagtcatcaacatc 225  Q
    |||||| |||||||    
T  29060645 aagtcaacaacatc 29060658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 35008064 - 35008219
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  35008064 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttacaaacatcgacctcttatatatatccaataatttggaacaacctct 35008161  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |  ||  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35008162 t--tcttcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 35008219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 1595456 - 1595599
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  1595456 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 1595553  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  1595554 atcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1595599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19859174 - 19859031
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||   |||    
T  19859174 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatatag-tccaataatttggaacttcatc 19859077  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19859076 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 19859031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 33864185 - 33864328
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  33864185 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 33864282  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33864283 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 33864328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 20593682 - 20593891
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---cat 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||    
T  20593682 atcaagcccccagcaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 20593779  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  20593780 catcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20593878  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  20593879 agtcaacaacatc 20593891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 8054936 - 8055079
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  8054936 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 8055033  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8055034 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 8055079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 12742224 - 12742367
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    |||  ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  12742224 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaccttgtaatatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 12742321  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12742322 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12742367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20361173 - 20360958
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  20361173 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 20361075  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  20361074 cattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 20360976  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  20360975 attcatcaacatcttaaa 20360958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26924895 - 26924752
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  26924895 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 26924798  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26924797 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 26924752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Original strand, 13019403 - 13019492
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttgg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  13019403 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacaattcaacctcttataaacaacgacctcttatatacttccaataatttgg 13019492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31155529 - 31155397
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaa-caacaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 194  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |  || ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||| ||||| ||||    
T  31155529 tccaataatttggaacatcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaaaacagcaac-taaacagtatgcaagtcatcgtgat 31155431  T
Q  195 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcata 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31155430 ataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcata 31155397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17287946 - 17287794
Alignment:
Q  80 caacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcag 176  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  17287946 caacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggtag 17287849  T
Q  177 tatgcaaa-tcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||| ||||  || ||||| |||| |||||| | ||||||||| || |||| ||||    
T  17287848 tatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaa 17287794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1541166 - 1541023
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  1541166 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 1541069  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1541068 atcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa 1541023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25629567 - 25629358
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25629567 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgaaaacttcttatata-atccaataatttggaacatcat 25629470  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  25629469 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattac-aacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgca 25629371  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  25629370 agtcaacaacatc 25629358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16448704 - 16448639
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448704 atccaataatttggaacttcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 16448639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 16496213 - 16496367
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16496213 acaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggca 16496311  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| | |||||| ||||| |||| |||||| | ||||| ||| ||||||| ||||    
T  16496312 gtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaa 16496367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Original strand, 22782139 - 22782338
Alignment:
Q  25 cccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---catcatctt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  22782139 cccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctctcatata-atccaataatttggaaattcatcatctt 22782236  T
Q  120 aatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||     
T  22782237 aatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 22782334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4668274 - 4668211
Alignment:
Q  165 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcata 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4668274 caacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcata 4668211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4675121 - 4675058
Alignment:
Q  165 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcata 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4675121 caacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcata 4675058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 25754717 - 25754859
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  25754717 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttggaacttcatc 25754813  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25754814 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 25754859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 35245494 - 35245702
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||  |  |||  |  ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  35245494 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttg-attcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 35245592  T
Q  117 cttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| |||||| | | |||    
T  35245593 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa--caacatgacataataatatcaatttcaa 35245690  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     |||||||||||    
T  35245691 ttcatcaacatc 35245702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Original strand, 25714388 - 25714470
Alignment:
Q  80 caacctcttaaatatatccaataatttggaacatc---atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25714388 caacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 25714470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18409982 - 18409830
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa-------catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacata 171  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  18409982 acaacctcttatata-atccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataac-aacagcaacaca 18409885  T
Q  172 ggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18409884 ggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 18409830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22780439 - 22780272
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780439 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgactacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 22780342  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
    |   || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  22780341 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaa 22780272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3852271 - 3852129
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  3852271 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttggaacttcatc 3852175  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3852174 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaa 3852129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 22831411 - 22831571
Alignment:
Q  18 aatcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||  ||||| |  |||| |  ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  22831411 aatcaagcccccaactatgaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacaactta-attcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 22831509  T
Q  117 cttaatcaacttat---accgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    | |  ||||| ||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22831510 catcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Original strand, 25656630 - 25656733
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  25656630 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  210 gcaagt 215  Q
    ||||||    
T  25656728 gcaagt 25656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30676868 - 30676761
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  30676868 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgca 30676771  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  30676770 agtcaacaac 30676761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20557085 - 20557004
Alignment:
Q  81 aacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20557085 aacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaa 20557004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8227646 - 8227533
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||  | || |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8227646 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatg 8227547  T
Q  193 atataacaatatcg 206  Q
    |||||| |||||||    
T  8227546 atataataatatcg 8227533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16920782 - 16920635
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttat---accgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| |  ||||| | |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16920782 acaacctcttatattagtccaacaatttggaacatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggca 16920683  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||  |||||||| ||||  ||||| ||| | | |||||||||||    
T  16920682 gtatacaa--catcatgacataagtatatcaaattccattcatcaacatc 16920635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Original strand, 25688471 - 25688552
Alignment:
Q  81 aacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat---cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25688471 aacctcttatata-atccaataatttggaacctcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaa 25688552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 11185422 - 11185568
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||  |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||     
T  11185422 atcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcaa 11185520  T
Q  117 cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 170  Q
    | |      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185521 cat------cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 33442962 - 33443146
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| | ||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||||| | |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  33442962 atcaagcccccaaca-taaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacatcttatacaactccaataatttggaacaactcct 33443060  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatc 205  Q
    ||  || | || ||||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  33443061 ta--catcatagaccgactcatgcagcttagtt-aataaacaacagcaacataggcagtatataaaacatctcaagatataacaatatc 33443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 20223859 - 20223957
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||| |||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20223859 atcaagccccaaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttaaaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 20223956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 22117843 - 22117941
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||| |||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22117843 atcaagccccaaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttaaaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 22117940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 18456706 - 18456769
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456706 atccaataaattggaacatcatcct--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18456769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 18461866 - 18461929
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18461866 atccaataaattggaacatcatcct--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18461929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18821975 - 18821912
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18821975 atccaataaattggaacatcatcct--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18821912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Original strand, 34963377 - 34963423
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34963377 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaa 34963423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 52
Target Start/End: Original strand, 1561211 - 1561244
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatgga 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561211 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatgga 1561244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Original strand, 16493063 - 16493162
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || |||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  16493063 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacatcttatgtaactccaataatttggaacatcatct 16493160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4738689 - 4738626
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataaca 159  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  4738689 tccaataatttggaacatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 18907109 - 18907160
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  18907109 aacatcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaa 18907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 19862976 - 19863027
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862976 aacatcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 19873118 - 19873169
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19873118 aacatcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19873169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19848109 - 19848063
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||    
T  19848109 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaa 19848063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 998 - 1199
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||    ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  998 atcaagcccccaacaatgaatgctaattcatggacacaacaactcaacctcttagaa----caatctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 1093  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1094 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatacaggtcat 1193  T
Q  219 caacat 224  Q
    ||||||    
T  1194 caacat 1199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 6446 - 6653
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  6446 atcaagcccgcaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaaaaacaacctctta--taagtccaataatttggaacatcatca 6543  T
Q  119 taatca---acttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    | ||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6544 tcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaat 6643  T
Q  216 catcaacatc 225  Q
    || |||||||    
T  6644 caacaacatc 6653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 8380 - 8584
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  8380 atcaagccaccaacaatgaatgctaatgcatggactcaactactcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaaaccaataatttggaatatcttct 8479  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8480 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcat 8577  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  8578 caacatc 8584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 12855 - 13070
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |      
T  12855 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggaaacaacaacttaacaacttagaa-caacaacctcttatataagtccaataattttgaacatcatcatct 12953  T
Q  122 tcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 221  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12954 tcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 13053  T
Q  222 catcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13054 catcataaacatcaaac 13070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 5557 - 5761
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||      
T  5557 atcaagcccccaacaatggatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcatataaacaacaacctctta--taaatccaataatttggaacatgatta 5654  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 5754  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  5755 caacatc 5761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2851 - 2648
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  2851 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttctta-aaacaacaacctctta--taagtccaataatttggaacatcatca 2755  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||     
T  2754 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatgcaaatcaa 2655  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  2654 caacatc 2648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10749 - 10544
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |     
T  10749 atcaagcccccaacgatgaatgcaaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcacca 10651  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10650 tcttcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 10551  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  10550 caacatc 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24091 - 23898
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  24091 atcaatcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatca 23993  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992 tcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 129818 - 130023
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||   |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||     
T  129818 atcaagcctgcaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaactt-ggaacaacaacctcttaaataagtccattaatttggaacatcttca 129916  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 130016  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  130017 caacatc 130023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 60886 - 60718
Alignment:
Q  55 caacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaa 154  Q
    |||||||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||     
T  60886 caacaacttaacatcttagaa-catcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatctt--tcatcttaaaccgactcatgcagcttagttaat 60790  T
Q  155 taacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  60789 aaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaacatc 60718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27752
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27956 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 27857  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||     
T  27856 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaa 27759  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  27758 caacatc 27752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22877 - 22673
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||     
T  22877 atcaagcccccaa-aatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacaacctcttatacaagtccaataatttggaacatcatca 22780  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
       |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22779 ccttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 22680  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  22679 caacatc 22673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 81979 - 82122
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac----at 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    ||    
T  81979 atcaagcccccaacaaagaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcgacaac-tcttgtata-atccaataatttggaaccttcat 82075  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  82076 catcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaa 82122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 160597 - 160790
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||     
T  160597 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacgcaacctcttaacaactta-aagcaacaacctcttaaataattccaataatttgggacatcatca 160695  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  160696 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 160790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 85817 - 85692
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttatac 132  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||    
T  85817 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcatcttagac 85720  T
Q  133 cgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85719 cgactcatgcagcttagttaaataacaa 85692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 501083 - 501134
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  501083 aacaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 501134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16307 - 16103
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16307 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcaacaactcaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 16208  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||     
T  16207 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaa 16110  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  16109 caacatc 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Original strand, 13125 - 13246
Alignment:
Q  102 aatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaa 201  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13125 aatttggaacatcatcct--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaa 13222  T
Q  202 tatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||    
T  13223 tatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 2577 - 2732
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||| |||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2577 atcaagtccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttacaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 2674  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagta 178  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  2675 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53756 - 53552
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  53756 atcaagcccccaacaatgaatgtgaatgcatggactcaacaactcatcatcttataaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 53657  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53656 t--tcatcttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcat 53559  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  53558 caacatc 53552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3012 - 2809
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  3012 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacatcatcttaacaactta-aaacaacatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 2916  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  2915 tcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 2816  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  2815 caacatc 2809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3277
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacaca 3277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 6731 - 6927
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  6731 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacctcttaacaacttagaa-caacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatca 6829  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |      |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  6830 t------cttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaa 6923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8146
Alignment:
Q  189 catgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  8097 catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaac 8146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 32447 - 32666
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc- 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||     
T  32447 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataatttggaacatcatca 32546  T
Q  118 ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
    |   |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  32547 tctttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa-tca 32645  T
Q  218 tcaacatcataaacaccaaac 238  Q
     |||||||  ||||| |||||    
T  32646 acaacatctcaaacatcaaac 32666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 12482 - 12686
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12482 atcaagcccccaacgataaatgcgaatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 12581  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12582 t--tcatcttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcat 12679  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  12680 caacatc 12686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6261 - 6113
Alignment:
Q  93 atatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6261 atatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatc 6162  T
Q  190 atgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacaccaaac 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6161 atgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatcaaac 6113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 947 - 1150
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || |  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  947 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactcaacaacatagat-caacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcttct 1045  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 218  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||    
T  1046 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcat 1143  T
Q  219 caacatc 225  Q
    |||||||    
T  1144 caacatc 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 32013 - 32202
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  32013 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacatcatcttaacaactta-aaacaacatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 32109  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32110 tcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 32202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 132573 - 132762
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||||||     
T  132573 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacatcatcttaacaactta-aaacaacatcatctta--taagtccaataatttggaacatcatca 132669  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  132670 tcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatg 132762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 136587 - 136791
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  136587 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 136684  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  136685 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaa 136782  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
    |||| ||||    
T  136783 gtcaacaac 136791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 139056 - 139260
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  139056 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 139153  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  139154 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaa 139251  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
    |||| ||||    
T  139252 gtcaacaac 139260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 143994 - 144198
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  143994 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 144091  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  144092 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaa 144189  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
    |||| ||||    
T  144190 gtcaacaac 144198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 134118 - 134322
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  134118 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 134215  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  134216 atcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaa 134313  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
    |||| ||||    
T  134314 gtcaacaac 134322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 141525 - 141729
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  141525 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 141622  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  141623 atcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaa 141720  T
Q  214 gtcatcaac 222  Q
    |||| ||||    
T  141721 gtcaacaac 141729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62303
Alignment:
Q  125 acttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca 62303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8280 - 8074
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8280 atcaagccccccactatgagtgcaaatgcatggactcatcaacttagcatctta-aatcatcaacctcttaaataaatccaataatttggaacatcatct 8182  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  8181 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatc 8084  T
Q  217 atcaacatca 226  Q
    | ||||||||    
T  8083 aacaacatca 8074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29298
Alignment:
Q  154 ataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaactatcatgatataataatatcgaatg 29298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20092 - 19886
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20092 atcaagcccccaacaatgaataagtatgcatggactcaacaacttaacctcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatct 19993  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19992 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattc 19895  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  19894 aacaacatc 19886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 39822 - 40035
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39822 atcaagtccccaacaatgaaatgctaatgcatggacccgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 39919  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||     
T  39920 catcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcat 40018  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||  |||||| ||||    
T  40019 gtcaataacatcttaaa 40035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3362 - 3154
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3362 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaa-caacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 3265  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  3264 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 3166  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  3165 gtcaacaacatc 3154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8267 - 8055
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8267 atcaatcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaagtcaacaacttagat-caacaacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 8169  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| | || |||||  ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| || ||    
T  8168 t--tcatcatagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattc 8071  T
Q  217 atcaacatcataaaca 232  Q
    | ||||||| ||||||    
T  8070 aacaacatcttaaaca 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 103838 - 103629
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  103838 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagcaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcctct 103739  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| | |||||||||||||||  || ||||| ||||||||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  |    
T  103738 t--tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaac 103641  T
Q  217 atcaacatcata 228  Q
    | ||||||||||    
T  103640 aacaacatcata 103629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28976 - 28806
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||| | ||||   ||  ||||||||||||||||||||||     
T  28976 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaa-caacatcatcttt--taagtccaataatttggaacatcatca 28880  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataaca-aacaacaacataggcagtatgcaaatcatcat 191  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28879 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaatcatcat 28806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38851 - 38709
Alignment:
Q  81 aacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38851 aacctcttatata-atccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagt 38753  T
Q  178 atgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 221  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38752 atgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 38709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Original strand, 11261 - 11395
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11261 acaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 11360  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11361 gtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 11395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 1905 - 2100
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  |||||  |  |||  |  ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  1905 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttg-attcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 2003  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    |   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2004 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 2100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 28322 - 28532
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  28322 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaatagtttggaacatcat 28420  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  28421 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 28519  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    | ||| |||||||    
T  28520 attcaacaacatc 28532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 4460 - 4608
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||  | ||||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  4460 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctctaaaaacatctta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 4558  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaaca 163  Q
    |   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4559 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaca 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1223 - 1087
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1223 caacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 1124  T
Q  174 cagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1123 cagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 34032 - 34226
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  34032 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatagactcgacctcttaagcaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 34130  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
       || | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  34131 atcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcgaatg 34226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 182 - 326
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  182 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 279  T
Q  117 ---cttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
       ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  280 tatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaa 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 15646 - 15764
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcat 191  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15646 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcat 15745  T
Q  192 gatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  15746 gatataataatatcgaatg 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33168 - 32955
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33168 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaa-caacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 33071  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |||||    
T  33070 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 32972  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  32971 ttcaacaacatcttaaa 32955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 45837 - 46050
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  45837 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaa-caacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 45934  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| | |||||    
T  45935 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 46033  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  46034 ttcaacaacatcttaaa 46050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 16022 - 16189
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16022 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgaaaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 16119  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16120 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 16189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17538 - 17397
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc-- 117  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||| | | ||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      
T  17538 aagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcaacctcttaaacattttagaa-cgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcat 17441  T
Q  118 -ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
     || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17440 cttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa 17397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 129176 - 128972
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | |  ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  129176 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactt-acatcttagaaacatcgaattcttatataaatccaataatttggaacaacatct 129078  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  129077 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagtt-aataacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 128981  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  128980 aacaacatc 128972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 78236 - 78441
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| || || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||    
T  78236 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttagcatcttagaa-catcgacctcttatataaatccaatcatttggaaa--catct 78332  T
Q  119 taat-caacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagt 215  Q
    | || || |||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  78333 tcattcatcttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaat 78431  T
Q  216 catcaacatc 225  Q
    || |||||||    
T  78432 caacaacatc 78441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 116335 - 116543
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaa-taatttggaac---a 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||   |    
T  116335 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaaatactttggaacttca 116432  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||| |||| || ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  116433 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatgca 116530  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  116531 agtcaacaacatc 116543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 96920 - 97125
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  96920 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 97018  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||| | |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  97019 t--tcatcttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 97116  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  97117 aacaacatc 97125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 106198 - 106403
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  106198 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 106296  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||| | |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  106297 t--tcatcttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 106394  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  106395 aacaacatc 106403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 225363 - 225463
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  225363 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaacatcttct 225462  T
Q  119 t 119  Q
    |    
T  225463 t 225463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1799
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  2005 atcaagcccccaacaatgaatgagtgtgcatggactcaacaacttaacatcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcc 1906  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||  |||  |  |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1905 t--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatc 1808  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  1807 aacaacatc 1799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 39446 - 39594
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39446 acaacctcttatata-atccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggc 39543  T
Q  175 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  39544 agtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 39594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 75366 - 75218
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  75366 acaacctcttatata-atccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggc 75269  T
Q  175 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  75268 agtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 75218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 468 - 669
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaa 121  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| || || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |      
T  468 aagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaacttagcatcttagaa-catcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcataat-- 564  T
Q  122 tcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 219  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  565 tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaac 663  T
Q  220 aacatc 225  Q
    ||||||    
T  664 aacatc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 20654 - 20797
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  20654 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 20751  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20752 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 20797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 51822 - 52036
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51822 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aaacaaaaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 51919  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  51920 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 52018  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||||| || |||| ||||    
T  52019 agtcaacatcatcttaaa 52036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 168190 - 167976
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  168190 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 168092  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | |||||    
T  168091 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaa 167993  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||||||||||| ||||    
T  167992 ttcatcaacatcttaaa 167976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 1046
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  1260 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 1162  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  | ||||| |||| |||||| | |||||    
T  1161 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaa 1063  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||||||||||| ||||    
T  1062 ttcatcaacatcttaaa 1046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 340159 - 339953
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||   ||    
T  340159 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataattttgaacttcat 340062  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||| |||    
T  340061 catcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat-caa 339965  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||||||    
T  339964 gtcaacaacatc 339953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 158706 - 158562
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  158706 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 158609  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  158608 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 158562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 40307 - 40450
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  40307 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 40404  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40405 atcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaa 40450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44919 - 44710
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | | ||| || | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||    
T  44919 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatatta-aatcgacaacctcttatata-atccaatactttggaacttcat 44822  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  44821 catcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 44723  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  44722 agtcaacaacatc 44710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26110
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 26110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 4621 - 4788
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----cat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    |||    
T  4621 atcaagcccctaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatcat 4718  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 184  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4719 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 4788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8741 - 8531
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8741 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcaacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 8644  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||| | |||||    
T  8643 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacag----caacataggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 8548  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| || |||| ||||    
T  8547 gtcaacatcatcttaaa 8531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 46904 - 47065
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  46904 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttgaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 47002  T
Q  118 ttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
     |  |||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47003 atcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 13299 - 13442
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  13299 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 13396  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13397 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 13442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 37728 - 37871
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  37728 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 37825  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37826 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 37871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 136591 - 136369
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  136591 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcgacaactcaacatcttagaaacctcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatca 136492  T
Q  119 t-------------aatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaata 203  Q
    |             | ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  136491 tttatcttagaccgattcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaata 136392  T
Q  204 tcgaatgcaagtcatcaacatca 226  Q
    || ||||||| ||| ||||||||    
T  136391 tcaaatgcaaatcaacaacatca 136369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 145299 - 145077
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||| ||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  145299 atcaagcccccaacaatgaatgcgaatgcatggactcgacaactcaacatcttagaaacctcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatca 145200  T
Q  119 t-------------aatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaata 203  Q
    |             | ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  145199 tttatcttagaccgattcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaata 145100  T
Q  204 tcgaatgcaagtcatcaacatca 226  Q
    || ||||||| ||| ||||||||    
T  145099 tcaaatgcaaatcaacaacatca 145077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 121675 - 121835
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | | ||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  121675 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatatta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 121772  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 177  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  121773 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 174675 - 174838
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | | |||||||||| |   |||||||||||||| |||||||    
T  174675 atcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgataacctcttaatttagtccaataatttggagcatcatc 174773  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 179  Q
       || | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  174774 aacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 174838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 1760 - 1974
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1760 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 1857  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  1858 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 1956  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  1957 attcatcaacatcttaaa 1974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3402 - 3189
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaact-tcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa------ 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||          
T  3402 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaatatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 3305  T
Q  111 -catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 208  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||| ||    
T  3304 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 3206  T
Q  209 tgcaagtcatcaacatc 225  Q
    || || ||| |||||||    
T  3205 tgtaattcaacaacatc 3189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11656 - 11447
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc-- 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  |  |||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||      
T  11656 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatctt 11558  T
Q  115 -atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
     ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | | ||    
T  11557 catcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatttca 11459  T
Q  213 agtcatcaacat 224  Q
    | ||||||||||    
T  11458 attcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 25022 - 25225
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| || || | ||||||   ||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  25022 atcaagcccccaacaatgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaa-catcgacctctattataaatccaataaattggaacaacctct 25119  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtc 216  Q
    |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  25120 t--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatc 25216  T
Q  217 atcaacatc 225  Q
    | |||||||    
T  25217 aacaacatc 25225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 4758 - 4967
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |   ||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  4758 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaaatta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 4856  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  4857 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaa 4955  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     ||| |||||||    
T  4956 ttcaacaacatc 4967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Original strand, 13181 - 13334
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13181 acaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggca 13278  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  13279 gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 13334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10636 - 10472
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  |  |||| |  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  10636 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 10538  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 179  Q
    |   || | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10537 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtat 10472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 32850 - 33064
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  32850 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 32947  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  32948 tcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 33046  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||| | ||||||| ||||    
T  33047 agttaacaacatcttaaa 33064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 38669 - 38883
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggac-acaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||   | ||| ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  38669 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagaactcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 38766  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  38767 tcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38865  T
Q  213 agtcatcaacatcataaa 230  Q
    | | | ||||||| ||||    
T  38866 aataaacaacatcttaaa 38883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 9731 - 9799
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9731 atccaataatttgggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 9799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 31976 - 32183
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  31976 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 32074  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 214  Q
       || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| | | |||     
T  32075 atcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatcaatttcaat 32172  T
Q  215 tcatcaacatc 225  Q
    |||||||||||    
T  32173 tcatcaacatc 32183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 7235 - 7382
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7235 acaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 7334  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||  || ||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  7335 gtatacaa--caacatgaaataattatatcaaattcaattcatcaacatc 7382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 1201 - 1405
Alignment:
Q  22 aagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatctta 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |     
T  1201 aagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatc 1299  T
Q  121 atcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 217  Q
     |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||    
T  1300 ttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatcaaattcaattca 1397  T
Q  218 tcaacatc 225  Q
    ||||||||    
T  1398 tcaacatc 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15450 - 15306
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  15450 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaaactcttatata-atccaataatttggaacttcat 15353  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15352 catcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 2596 - 2783
Alignment:
Q  25 cccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatca 124  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||  | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  2596 cccccaacaatgaatgagtatgcatgggctcaacaacttg-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaatattttggaacaacatctt--tca 2692  T
Q  125 acttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  2693 tcttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 230
Target Start/End: Original strand, 3438 - 3593
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  3438 caacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacatagg 3535  T
Q  174 cagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  3536 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Original strand, 332 - 465
Alignment:
Q  99 aataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgata 195  Q
    |||||||||||||||||||   || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  | |||||      
T  332 aataatttggaacatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacg 430  T
Q  196 taacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||| |||||| | || |||||| ||||||| ||||    
T  431 taataatatcaattggaagtcaacaacatcttaaa 465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 25804 - 26013
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactta-acttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa----ca 112  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| || ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||    
T  25804 atcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttatacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaaacatca 25901  T
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    | ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  25902 ttatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgca 26000  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||| | |||||||    
T  26001 agtaaacaacatc 26013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 39827 - 39975
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaa----catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39827 acaacctcttatata-atccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataac-aatagcaacataggc 39924  T
Q  175 agtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||| ||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  39925 agtatacaaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatc 39975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Original strand, 4120 - 4262
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  4120 atcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 4217  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataac 158  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4218 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataac 4262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 1054
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatata-tccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1261 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttaaa-atagtccaataatttggaacatcat 1164  T
Q  117 cttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    | |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  ||||| | | |||    
T  1163 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatcaatttcaa 1066  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     |||||||||||    
T  1065 ttcatcaacatc 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 13405 - 13614
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa--cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  |  |||| |  | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  13405 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 13503  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    |   || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| || | |||||| | | | |    
T  13504 caacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatcaatttcga 13602  T
Q  214 gtcatcaacatc 225  Q
     |||||||||||    
T  13603 ttcatcaacatc 13614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17433 - 17218
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa------ 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||| | ||||| |  | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||          
T  17433 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcgtaaacatctta-attcgacaacctctcatata-atccaataatttggaaacatca 17336  T
Q  111 -catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc---aaatcatcatgatataacaatatcg 206  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |   ||| || ||||| |||| ||||||     
T  17335 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatca 17237  T
Q  207 aatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  17236 aatgcaagtcaacaacatc 17218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14235 - 14154
Alignment:
Q  84 ctcttaaatatatccaataatttgga-----acatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| | ||||||||||||||    
T  14235 ctcttatatatatccaataatttggagttcaacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaa 14154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 79459 - 79396
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79459 atccaataaattggaacattatcct--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 79396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 8390 - 8604
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaact-tcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||   |||||  | | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8390 atcaagcccccaactatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatctta--atcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcatc 8486  T
Q  118 ---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
       || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||| | ||| ||  |||| |||| |||||| | |||||    
T  8487 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataac-aatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaattgcaa 8585  T
Q  214 gtcatcaacatcataaaca 232  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  8586 gtcaacaacatcttaaaca 8604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6275 - 6119
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataaca--aacaacaacatagg 173  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6275 acaacctcttatata-atccaaaaatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacatagg 6177  T
Q  174 cagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||||| | ||| || ||||| || | |||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  6176 tagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 6119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 51551 - 51698
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51551 acaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 51650  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||  |||||||| ||||  ||| | ||| ||| |||||||||||    
T  51651 gtatacaa--catcatgacataattataacaaattcaattcatcaacatc 51698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Original strand, 9136 - 9199
Alignment:
Q  165 caacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcata 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9136 caacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcata 9199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Original strand, 11450 - 11563
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||| |  || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11450 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatg 11549  T
Q  193 atataacaatatcg 206  Q
    |||||| |||||||    
T  11550 atataataatatcg 11563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 160
Target Start/End: Original strand, 13854 - 13997
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   | |||  ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||    
T  13854 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcgtaatatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 13951  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13952 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaa 13997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38391 - 38278
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||| |  || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38391 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatg 38292  T
Q  193 atataacaatatcg 206  Q
    |||||| |||||||    
T  38291 atataataatatcg 38278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 213
Target Start/End: Original strand, 267637 - 267768
Alignment:
Q  82 acctcttaaatatatccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc 181  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||      
T  267637 acctcttatataaatcaaataatttggaacatcatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatat 267734  T
Q  182 aaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  267735 aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa 267768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14325 - 14195
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14325 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataactccaataatttggaacaacatct 14228  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaa 153  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  14227 t--tcatcttagaccgactcatgcagtttaattaa 14195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2283 - 2221
Alignment:
Q  163 aacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  2283 aacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 2221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18162 - 18030
Alignment:
Q  96 tccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  18162 tccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatg 18063  T
Q  193 atataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  18062 atataataatatcgaacgcaagtaaacaacatc 18030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2324 - 2241
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||   |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2324 acaacctcttatata-atccaataatttagaacttcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaa 2241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5340 - 5133
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atc 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||   |||    
T  5340 atcaagcccccaactatgaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacgtcatc 5242  T
Q  115 atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaag 214  Q
    ||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||  ||||| ||| |||     
T  5241 atcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaattcaat 5144  T
Q  215 tcatcaacatc 225  Q
    |||||||||||    
T  5143 tcatcaacatc 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 230
Target Start/End: Original strand, 22868 - 23005
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatca 190  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||    
T  22868 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-ccagtatacaaaaacagca 22965  T
Q  191 tgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaa 230  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  22966 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaa 23005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1458 - 1393
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1458 atccaataatttggaacttcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 128660 - 128805
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatc-- 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||      
T  128660 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 128757  T
Q  115 -atcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaa 161  Q
     ||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  128758 catcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaa 128805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20553 - 20430
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgat 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||| || |||||     
T  20553 atccaataagttggaacatcatcct--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-tcagtatacaaaacaacatgac 20458  T
Q  195 ataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  20457 ataataatatcaaatgcaagtcaacaac 20430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Original strand, 4427 - 4599
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaa---cat 113  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||   |||    
T  4427 atcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatct--taaacaacaacctcgtatata-atccaataatttggaacatcat 4523  T
Q  114 catcttaatcaa---cttat----accgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaa 183  Q
    ||||||||||||   |||||    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4524 catcttaatcaacctcttatatagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacaacagcataggcagtatgcaa 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15615 - 15467
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||   || | ||||||| || || |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  15615 acaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggca 15517  T
Q  176 gtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    |||| |||| || ||||| |||| |||||| | | ||| |||||||||||    
T  15516 gtatacaaaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatcaacatc 15467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15676 - 15642
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggac 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15676 atcaagcccccaacaatgaatgttaatgcatggac 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 1861 - 2075
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |  |||| |  | ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  1861 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 1959  T
Q  118 ttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 213  Q
     |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||| | |||||    
T  1960 atcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaac-aacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaa 2058  T
Q  214 gtcatcaacatcataaa 230  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  2059 ttcaacaacatcttaaa 2075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 11970 - 12108
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---at 113  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||    
T  11970 atcaagccaccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 12067  T
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12068 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 12108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 4417 - 4625
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4417 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttgtata-atccaataatttggaacataat 4514  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  4515 cattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 4612  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  4613 agtcaacaacatc 4625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 11999 - 12207
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11999 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttgtata-atccaataatttggaacataat 12096  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  12097 cattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 12194  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  12195 agtcaacaacatc 12207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 21951 - 22159
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21951 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttgtata-atccaataatttggaacataat 22048  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  22049 cattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 22146  T
Q  213 agtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||    
T  22147 agtcaacaacatc 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16812 - 16611
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16812 atcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttgaaacatcat 16715  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |   || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  16714 catcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgga 16616  T
Q  213 agtca 217  Q
    |||||    
T  16615 agtca 16611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 16766 - 16834
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16766 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 16834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Original strand, 4676 - 4805
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatca 190  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||    
T  4676 atccaataatttggaacctcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaaca 4773  T
Q  191 tgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  4774 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 4805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Original strand, 10777 - 10884
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  10777 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgca 10874  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  10875 agtcaacaac 10884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 224
Target Start/End: Original strand, 16271 - 16397
Alignment:
Q  99 aataatttggaacatcatcttaatcaac---ttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgata 195  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |    
T  16271 aataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgaca 16368  T
Q  196 taacaatatcgaatgcaagtcatcaacat 224  Q
    |||  ||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16369 taattatatcaaattcaattcatcaacat 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2618 - 2497
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2618 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttacaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatct 2521  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcag 144  Q
    |  ||| |||| ||||| ||||||||    
T  2520 t--tcatcttagaccgactcatgcag 2497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5045 - 4888
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||| | ||||| |  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5045 atcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatctta-attcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacatcat 4948  T
Q  117 c---ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggc 174  Q
    |   || ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4947 catcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 38340 - 38436
Alignment:
Q  131 accgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  38340 accgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatc 38436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 19978 - 20029
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  19978 aacatcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24300
Alignment:
Q  125 acttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa--tcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaac 24308  T
Q  223 atcataaa 230  Q
    ||| ||||    
T  24307 atcttaaa 24300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 160
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4347
Alignment:
Q  113 tcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 22194 - 22324
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22194 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataactccaataatttggaacaacatct 22291  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagcttagttaa 153  Q
    |  ||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  22292 t--tcatcttagaccgactcatgcagtttaattaa 22324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 88 - 156
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  88 atccaataattgggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6285
Alignment:
Q  126 cttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatca--tcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaaca 223  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  224 tc 225  Q
    ||    
T  6286 tc 6285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  126 cttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagg 173  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Original strand, 9246 - 9292
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9246 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 9292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 161285 - 161206
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaata 156  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  161285 acaacctcttatata-atccaataatttgaaacttcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaata 161206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 160
Target Start/End: Original strand, 29896 - 29982
Alignment:
Q  77 caacaacctcttaaatatatccaataatttggaac---atcatcttaatc-aacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29896 caacgacctcttaaatag-tccaataatttggaacttcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 29982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 55888 - 55789
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  55888 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataactccaataatttggaacaacatct 55791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 20879 - 21029
Alignment:
Q  79 acaacctcttaaatatatccaataatttggaacatca---tcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 175  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||   |||| | | ||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20879 acaacctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggca 20978  T
Q  176 gtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatc 225  Q
     ||||| ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||||    
T  20979 atatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatc 21029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 4901 - 4803
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4901 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaataactta-catcttagaaacatcgacctcttagataaatccaataatttggaacaacatct 4804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 30245 - 30377
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||  |||| |  |||| ||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30245 atcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggacttgacgtctta-caacttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacaacatc 30343  T
Q  118 ttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaa 153  Q
    ||  ||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  30344 tt--tcatcttagaccgactcatgcagtttaattaa 30377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 23841 - 23892
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23841 aacatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2514
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaactt-aacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||  |||| |  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  2612 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaactta-attcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2508 - 2460
Alignment:
Q  162 caacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 210  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2508 caacaacttagaccgtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 2460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 36452 - 36503
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36452 aacatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Original strand, 11953 - 12016
Alignment:
Q  95 atccaataatttggaacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11953 atccaataaattggaacatcatcct--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 12016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12407 - 12361
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12407 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaa 12361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 222
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11399
Alignment:
Q  114 catcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  11292 catcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 11389  T
Q  213 agtcatcaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  11390 agtcaacaac 11399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 206730 - 206638
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaaca 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | || ||||| | |  |||||||||||||||||    
T  206730 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacatcttatacaactccaataatttggaaca 206638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 161
Target Start/End: Original strand, 287 - 339
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaaa 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  287 aacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaa 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21871
Alignment:
Q  91 atatatccaataatttgga------acatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  21946 atatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 21871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29838 - 29763
Alignment:
Q  91 atatatccaataatttgga------acatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  29838 atatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaa 29763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4875
Alignment:
Q  84 ctcttaaatatatccaataatttgga------acatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataa 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  4954 ctcttatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataa 4875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 157 - 208
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  157 aacatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Original strand, 69792 - 69843
Alignment:
Q  109 aacatcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  69792 aacatcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 69843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 332233 - 332358
Alignment:
Q  19 atcaagcccccaacaatgaatgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || ||||| |||  ||||||||||||||||| | |||    
T  332233 atcaagcccccaaca-tgaatgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacaccgacatcttatataactccaataatttggaacaacttct 332330  T
Q  119 taatcaacttataccgattcatgcagctta 148  Q
    ||  || | || ||||| ||||||||||||    
T  332331 ta--catcatagaccgactcatgcagctta 332358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10159 - 10110
Alignment:
Q  111 catcatcttaatcaacttataccgattcatgcagcttagttaaataacaa 160  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10159 catcatcttaatcatcttatatagatttatgcaacttagttaaataacaa 10110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University