View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7489_low_3 (Length: 775)

Name: NF7489_low_3
Description: NF7489
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7489_low_3
NF7489_low_3
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (112-758)||(52780971-52781613)
chr3 (16-107)||(38934743-38934834)
chr3 (16-105)||(34701028-34701117)
chr3 (16-107)||(8043479-8043570)
chr3 (16-114)||(35227149-35227247)
chr3 (16-105)||(13697514-13697603)
chr3 (16-105)||(16355323-16355412)
chr3 (16-105)||(25493730-25493819)
chr3 (16-105)||(44689627-44689716)
chr3 (16-105)||(15521445-15521534)
chr3 (16-105)||(32360129-32360218)
chr3 (16-107)||(20699933-20700024)
chr3 (16-106)||(46451649-46451739)
chr3 (16-105)||(22175403-22175492)
chr3 (16-105)||(26000146-26000235)
chr3 (16-105)||(32244987-32245076)
chr3 (16-105)||(38856702-38856791)
chr3 (16-105)||(50529731-50529820)
chr3 (16-105)||(53028919-53029008)
chr3 (16-107)||(29785761-29785852)
chr3 (20-105)||(15517928-15518013)
chr3 (16-105)||(26123468-26123557)
chr3 (16-105)||(29784209-29784298)
chr3 (16-105)||(37697435-37697524)
chr3 (20-105)||(42307236-42307321)
chr3 (20-105)||(54869376-54869461)
chr3 (16-105)||(44608814-44608903)
chr3 (16-105)||(42103552-42103638)
chr3 (16-105)||(48924524-48924613)
chr3 (16-105)||(49129878-49129967)
chr3 (35-107)||(12116974-12117046)
chr3 (20-105)||(21581850-21581935)
chr3 (16-80)||(50528135-50528199)
chr3 (16-65)||(20841705-20841754)
chr3 (60-105)||(29446358-29446403)
chr3 (16-55)||(54533375-54533414)
chr3 (16-65)||(24835383-24835432)
chr3 (61-105)||(20841680-20841724)
chr3 (45-105)||(36787449-36787509)
chr3 (59-105)||(24835358-24835404)
chr3 (61-107)||(52922298-52922344)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (16-107)||(17592485-17592576)
chr1 (16-105)||(42369647-42369736)
chr1 (16-104)||(17586694-17586782)
chr1 (16-105)||(1168716-1168805)
chr1 (16-105)||(40150156-40150245)
chr1 (16-107)||(33511074-33511165)
chr1 (16-105)||(23323432-23323521)
chr1 (16-105)||(51358678-51358767)
chr1 (16-104)||(43906351-43906439)
chr1 (16-105)||(1940252-1940341)
chr1 (16-105)||(7146461-7146550)
chr1 (16-105)||(8078955-8079044)
chr1 (16-105)||(8121664-8121753)
chr1 (16-105)||(26579513-26579602)
chr1 (16-105)||(26663961-26664050)
chr1 (16-105)||(29079300-29079389)
chr1 (20-105)||(38172568-38172653)
chr1 (16-105)||(38829923-38830012)
chr1 (16-105)||(40093299-40093388)
chr1 (16-106)||(2348531-2348621)
chr1 (20-105)||(969855-969940)
chr1 (16-105)||(1171316-1171405)
chr1 (20-105)||(6766239-6766324)
chr1 (16-105)||(15718482-15718571)
chr1 (20-105)||(23318855-23318940)
chr1 (16-105)||(25898038-25898127)
chr1 (16-105)||(46761769-46761858)
chr1 (20-105)||(52697460-52697545)
chr1 (20-105)||(52752520-52752605)
chr1 (16-104)||(15553658-15553746)
chr1 (20-105)||(39259704-39259789)
chr1 (37-107)||(2478438-2478508)
chr1 (20-105)||(20097490-20097575)
chr1 (20-105)||(41927795-41927880)
chr1 (20-82)||(5216181-5216243)
chr1 (16-65)||(13995978-13996027)
chr1 (16-65)||(14004092-14004141)
chr1 (16-105)||(22887393-22887486)
chr1 (16-65)||(16052963-16053012)
chr1 (16-63)||(15203753-15203800)
chr1 (16-78)||(29699636-29699698)
chr1 (59-105)||(32672496-32672542)
chr1 (59-105)||(46410102-46410148)
chr1 (16-65)||(46410074-46410123)
chr1 (16-65)||(32672468-32672517)
chr1 (29-105)||(5678565-5678640)
chr1 (74-105)||(52088471-52088502)
chr1 (59-105)||(29288947-29288993)
chr1 (37-79)||(29699748-29699790)
chr1 (21-65)||(52088432-52088477)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (16-105)||(127-216)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (16-105)||(2041804-2041893)
chr8 (16-105)||(22259933-22260022)
chr8 (16-105)||(24112483-24112572)
chr8 (16-105)||(34678962-34679051)
chr8 (16-105)||(35117508-35117597)
chr8 (16-105)||(39207271-39207360)
chr8 (16-107)||(29939174-29939265)
chr8 (16-105)||(4716583-4716672)
chr8 (16-104)||(28639981-28640069)
chr8 (16-105)||(26782021-26782110)
chr8 (16-105)||(34998181-34998270)
chr8 (16-105)||(44804189-44804278)
chr8 (16-107)||(6143777-6143868)
chr8 (16-107)||(8022325-8022416)
chr8 (16-106)||(13111016-13111106)
chr8 (16-114)||(34841831-34841929)
chr8 (16-105)||(10830662-10830751)
chr8 (16-105)||(18595349-18595438)
chr8 (16-105)||(36494864-36494953)
chr8 (16-105)||(38166238-38166327)
chr8 (16-105)||(39219410-39219499)
chr8 (18-107)||(39222106-39222195)
chr8 (16-105)||(40116683-40116772)
chr8 (21-105)||(6082909-6082993)
chr8 (16-105)||(5321148-5321237)
chr8 (16-105)||(14423538-14423627)
chr8 (20-105)||(15730409-15730494)
chr8 (16-105)||(33286445-33286534)
chr8 (16-105)||(41576207-41576296)
chr8 (20-108)||(9807915-9808003)
chr8 (29-114)||(4036475-4036560)
chr8 (16-85)||(33279340-33279409)
chr8 (29-107)||(2320501-2320579)
chr8 (37-105)||(5015223-5015291)
chr8 (16-90)||(145092-145166)
chr8 (16-65)||(10836025-10836074)
chr8 (20-64)||(42572240-42572284)
chr8 (20-65)||(883414-883459)
chr8 (29-105)||(18684855-18684930)
chr8 (29-105)||(18730420-18730495)
chr8 (59-105)||(883438-883484)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (16-105)||(38867422-38867511)
chr7 (16-105)||(42205161-42205250)
chr7 (16-105)||(934118-934207)
chr7 (16-105)||(3512189-3512278)
chr7 (16-105)||(9453390-9453479)
chr7 (16-105)||(12097091-12097180)
chr7 (16-105)||(17754400-17754489)
chr7 (16-107)||(24791821-24791912)
chr7 (16-103)||(25749095-25749182)
chr7 (16-105)||(5281505-5281594)
chr7 (16-105)||(33358413-33358502)
chr7 (20-105)||(36890269-36890354)
chr7 (20-105)||(42674233-42674318)
chr7 (16-101)||(43067470-43067555)
chr7 (33-105)||(22648924-22648996)
chr7 (20-107)||(7164801-7164888)
chr7 (16-105)||(6395890-6395979)
chr7 (16-105)||(32042155-32042244)
chr7 (18-105)||(4476322-4476409)
chr7 (19-105)||(33845870-33845956)
chr7 (16-105)||(1803721-1803810)
chr7 (16-105)||(12100486-12100575)
chr7 (35-105)||(18120699-18120769)
chr7 (20-105)||(48866240-48866325)
chr7 (16-105)||(43407751-43407840)
chr7 (16-97)||(46133774-46133855)
chr7 (20-105)||(30180071-30180156)
chr7 (16-65)||(42964134-42964183)
chr7 (18-104)||(36847607-36847693)
chr7 (29-104)||(15648625-15648700)
chr7 (29-104)||(37004121-37004196)
chr7 (16-65)||(16893857-16893906)
chr7 (61-107)||(43021063-43021109)
chr7 (16-65)||(43157357-43157406)
chr7 (14-65)||(43021090-43021141)
chr7 (67-105)||(43157393-43157431)
chr7 (20-65)||(15656694-15656739)
chr7 (55-103)||(8631577-8631625)
chr7 (61-105)||(16893832-16893876)
chr7 (16-63)||(8631553-8631600)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (16-105)||(18614340-18614429)
chr6 (16-105)||(10550997-10551086)
chr6 (16-105)||(20727404-20727493)
chr6 (16-105)||(3346843-3346932)
chr6 (16-105)||(16306476-16306565)
chr6 (16-105)||(53703-53792)
chr6 (16-105)||(3955123-3955212)
chr6 (16-105)||(33465157-33465246)
chr6 (16-105)||(9460408-9460497)
chr6 (16-105)||(26703662-26703751)
chr6 (16-105)||(30692640-30692729)
chr6 (32-105)||(34887100-34887173)
chr6 (16-114)||(2838357-2838455)
chr6 (20-104)||(17260377-17260461)
chr6 (16-101)||(23073673-23073758)
chr6 (16-80)||(21894150-21894214)
chr6 (16-105)||(26946377-26946465)
chr6 (20-69)||(30692736-30692785)
chr6 (64-107)||(30691809-30691852)
chr6 (20-65)||(6085970-6086015)
chr6 (16-65)||(35198928-35198977)
chr6 (59-105)||(6085945-6085991)
chr6 (87-120)||(484005-484038)
chr6 (68-105)||(35198965-35199002)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (16-105)||(9007298-9007387)
chr5 (16-105)||(19360773-19360862)
chr5 (21-105)||(1165058-1165142)
chr5 (29-105)||(26602292-26602368)
chr5 (16-105)||(8373605-8373694)
chr5 (16-101)||(23765305-23765390)
chr5 (16-101)||(23815153-23815238)
chr5 (16-105)||(27678499-27678588)
chr5 (16-105)||(33992012-33992101)
chr5 (16-105)||(27421475-27421564)
chr5 (16-105)||(33490506-33490595)
chr5 (20-105)||(35782006-35782090)
chr5 (16-105)||(4121733-4121824)
chr5 (16-107)||(1579650-1579741)
chr5 (16-107)||(1605074-1605165)
chr5 (16-105)||(24104964-24105053)
chr5 (16-105)||(34708284-34708373)
chr5 (20-105)||(35419638-35419723)
chr5 (20-105)||(31883999-31884084)
chr5 (35-105)||(16736641-16736711)
chr5 (16-105)||(27025802-27025891)
chr5 (16-82)||(31413403-31413469)
chr5 (16-65)||(16070242-16070291)
chr5 (16-105)||(35419924-35420004)
chr5 (29-105)||(19515501-19515577)
chr5 (52-105)||(38597164-38597217)
chr5 (18-65)||(41818028-41818075)
chr5 (55-105)||(41818003-41818053)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (16-105)||(851709-851798)
chr2 (16-105)||(3872482-3872571)
chr2 (16-105)||(5734198-5734287)
chr2 (16-107)||(18806117-18806208)
chr2 (16-105)||(33905290-33905379)
chr2 (16-105)||(26322522-26322611)
chr2 (16-107)||(19383350-19383441)
chr2 (20-105)||(1481275-1481360)
chr2 (16-105)||(31516569-31516658)
chr2 (20-114)||(44946953-44947047)
chr2 (16-105)||(16065741-16065830)
chr2 (16-105)||(42938595-42938684)
chr2 (14-105)||(1679354-1679445)
chr2 (16-90)||(16588296-16588370)
chr2 (16-105)||(1110096-1110185)
chr2 (16-105)||(6174328-6174417)
chr2 (16-105)||(28323013-28323102)
chr2 (16-105)||(30265984-30266073)
chr2 (18-106)||(42445087-42445175)
chr2 (16-65)||(30419450-30419499)
chr2 (16-63)||(2178161-2178208)
chr2 (38-104)||(12516404-12516470)
chr2 (16-65)||(4231685-4231734)
chr2 (61-105)||(19900664-19900708)
chr2 (21-65)||(19900689-19900733)
chr2 (20-71)||(4016846-4016897)
chr2 (16-65)||(39636168-39636217)
chr2 (61-105)||(2178134-2178178)
chr2 (61-105)||(4231660-4231704)
chr2 (17-64)||(11707762-11707809)
chr2 (59-106)||(39636196-39636243)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (16-107)||(53408893-53408984)
chr4 (16-105)||(6687857-6687946)
chr4 (16-105)||(15669983-15670072)
chr4 (16-105)||(19912933-19913022)
chr4 (16-105)||(35490266-35490355)
chr4 (20-105)||(50354421-50354506)
chr4 (16-105)||(52140073-52140162)
chr4 (20-104)||(30172319-30172403)
chr4 (16-105)||(2480819-2480908)
chr4 (20-105)||(16701588-16701673)
chr4 (16-105)||(23775768-23775856)
chr4 (16-105)||(33704638-33704727)
chr4 (16-105)||(44784218-44784307)
chr4 (16-105)||(45423899-45423988)
chr4 (16-105)||(47632907-47632996)
chr4 (16-105)||(50053599-50053688)
chr4 (16-107)||(1756253-1756344)
chr4 (16-105)||(10687641-10687730)
chr4 (16-105)||(10901281-10901370)
chr4 (16-105)||(28361192-28361281)
chr4 (16-105)||(38056032-38056121)
chr4 (16-105)||(38070575-38070664)
chr4 (21-114)||(40428109-40428202)
chr4 (16-105)||(41852218-41852307)
chr4 (16-105)||(43289453-43289542)
chr4 (20-105)||(53716712-53716797)
chr4 (16-101)||(15240331-15240416)
chr4 (20-105)||(16704829-16704914)
chr4 (20-105)||(23261221-23261306)
chr4 (16-105)||(23702072-23702161)
chr4 (16-105)||(27583131-27583220)
chr4 (20-105)||(48910560-48910645)
chr4 (16-105)||(54190330-54190419)
chr4 (16-104)||(6610744-6610832)
chr4 (16-104)||(44377352-44377440)
chr4 (29-112)||(53353682-53353765)
chr4 (16-105)||(26088187-26088276)
chr4 (16-105)||(28031940-28032029)
chr4 (16-105)||(30423033-30423122)
chr4 (16-105)||(50055758-50055847)
chr4 (16-97)||(53876367-53876448)
chr4 (37-105)||(20877763-20877831)
chr4 (16-105)||(48748703-48748797)
chr4 (20-105)||(9595303-9595388)
chr4 (21-105)||(34617969-34618052)
chr4 (16-105)||(8590098-8590187)
chr4 (45-114)||(27531956-27532025)
chr4 (46-105)||(14988593-14988652)
chr4 (16-82)||(33704991-33705057)
chr4 (20-105)||(31970486-31970571)
chr4 (20-105)||(40679527-40679612)
chr4 (20-97)||(44378585-44378662)
chr4 (30-107)||(44547163-44547239)
chr4 (16-57)||(27488186-27488227)
chr4 (20-64)||(19164045-19164089)
chr4 (21-69)||(37968255-37968303)
chr4 (16-71)||(1617767-1617822)
chr4 (18-63)||(51780305-51780350)
chr4 (16-65)||(54413370-54413419)
chr4 (59-102)||(51780281-51780324)
chr4 (16-49)||(27535461-27535494)
chr4 (29-106)||(46035798-46035875)
[»] scaffold1827 (1 HSPs)
scaffold1827 (16-109)||(92-185)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (16-107)||(18259-18350)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (16-104)||(1718-1806)
scaffold0444 (20-97)||(495-572)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (16-105)||(10970-11061)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (16-104)||(144652-144740)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 541; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 758
Target Start/End: Original strand, 52780971 - 52781613
Alignment:
Q  112 ttattatataagtgcatgcacttatttactttgttgcactacttgattttgtgctgtaatttggacgtacaagatggaaaggtccttattaattgacag- 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  52780971 ttattatatgagtgcatgcacttatttactttgttgcactacttgattttgtgctgtaatttggacgtacaagatggaaagatccttattaattgacaga 52781070  T
Q  211 -ttacttgactaatattattttcgcatcatattcttaaaaccttttcatacaatcaatctgtccaactccaatgtcatgtcatgttatctacaagtgaaa 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52781071 attacttgactaatattattttcgcatcatattcttaaaaccttttcatacaatc----tgtccaactccaatgtcatgtcatgttatctacaagtgaaa 52781166  T
Q  310 atggagagtcattttaacacatcagtattttgaatgatatggtttgaatctcttacggcttaaggcttaaccacaattgaaaagtttgaatttactcgat 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  52781167 atggagagtcattttaacacattagtattttgaatgatatggtttgagtctcttagggcttaaggcttaaccacaattaataagtttgaatttacccgat 52781266  T
Q  410 tctaaagattaatctctacaaagagagaataggcttagaattcnnnnnnnntctcatattcaattaagttacataaaattcaaggtcttgcctgaaatgt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52781267 tctaaagattaatctctacaaagagagaataggcttaaaatt--aaaaaaatctcatattcaattaagttacataaaattcaaggtcttgcctgaaatat 52781364  T
Q  510 ttattaatatttaatttatgttgaattaaacaggtttgcaggccagccctattcaagagatctatgagaaggtttaatgttgcatggtgggcttattcct 609  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52781365 tgattaatatttaatttatgttgaattaaacaggtttgcaggccagccctattcaagagatctatgagaaggtttaatgttgcatggtgggcttattcct 52781464  T
Q  610 ttcctgttaccgtacttgctatggcttccacaaattatgcacaacaagtcaaaggaactgtttcccatattctaatgctcattctcttggcactttctgt 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52781465 ttcctgttaccgtacttgctatggcttccacaaattatgcacaacaagtcaaaggaactgtttcccatattctaatgctcattctcttggcactttctgt 52781564  T
Q  710 tcttgtctctgtttctctcacattgttcactttgctcaactctaagatg 758  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52781565 tcttgtctctttttctctcacattgttcactttgctcaactctaagatg 52781613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 38934743 - 38934834
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934743 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacag 38934834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 34701028 - 34701117
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34701028 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 34701117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 8043479 - 8043570
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8043479 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacag 8043570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 35227149 - 35227247
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagagtctta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  35227149 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacggagcctta 35227247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 13697514 - 13697603
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13697514 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 13697603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 16355323 - 16355412
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355323 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctataatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 16355412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25493819 - 25493730
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25493819 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagtcataatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 25493730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 44689627 - 44689716
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44689627 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaaggctataagcatctatataagttgtttatccaaac 44689716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 15521445 - 15521534
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15521445 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 15521534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 32360129 - 32360218
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  32360129 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 32360218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 20699933 - 20700024
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20699933 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtcagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacag 20700024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46451739 - 46451649
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaaca 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46451739 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctgatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaaca 46451649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 22175403 - 22175492
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22175403 atagcttatcaagtataagagtttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 22175492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 26000146 - 26000235
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26000146 atagcttatcaaatataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataaaatgtttatccaaac 26000235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 32244987 - 32245076
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32244987 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgctataagtatctatataagctgtttatccaaac 32245076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 38856702 - 38856791
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38856702 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctattgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 38856791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 50529731 - 50529820
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50529731 atagcttatcaagtataagagcttgtgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 50529820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 53028919 - 53029008
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53028919 atagcttatcaagtataagagcttatgacgtaaactctaatgttataagccctaatgctataaacatctatataagttgtttatccaaac 53029008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 29785761 - 29785852
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29785761 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagatctaatgttataagccttaatgctataagcatctagataagttgtttatccaaacag 29785852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15518013 - 15517928
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15518013 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatggtataagcacctatataagctgtttatccaaac 15517928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 26123468 - 26123557
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26123468 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgttataagcatctacataagttgtttatctaaac 26123557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 29784298 - 29784209
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29784298 atagcttatcaagtataagaacttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 29784209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 37697524 - 37697435
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37697524 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 37697435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42307321 - 42307236
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42307321 cttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagatgtttatccaaac 42307236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 54869461 - 54869376
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  54869461 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatggtataagcacctatataaactgtttatccaaac 54869376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44608903 - 44608814
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44608903 atagcttatcaagtataagagtttatgatgtaagctctaatattataagttctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 44608814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42103638 - 42103552
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42103638 atagcttatcaaatataagagcttatgatataagctct---gttataagccataatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 42103552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 48924613 - 48924524
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48924613 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtgagctctaatgttataagccctaatgtcataagcatctatataatctgtttatccaaac 48924524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 49129878 - 49129967
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49129878 atagcttattgaatataagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataagcatcaatataagctgtttatccaaac 49129967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12117046 - 12116974
Alignment:
Q  35 agcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12117046 agcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacag 12116974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 21581850 - 21581935
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21581850 cttatcaagtataagagtttatgatataagctctaatattataagcactaatgctataagtatctatataagctgtttatccaaac 21581935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 50528199 - 50528135
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagc 80  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50528199 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccataatgctataagc 50528135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 20841754 - 20841705
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841754 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 20841705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 105
Target Start/End: Original strand, 29446358 - 29446403
Alignment:
Q  60 ataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29446358 ataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 29446403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 54533414 - 54533375
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaa 55  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54533414 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaa 54533375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24835432 - 24835383
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24835432 atagcttatcaagtataagagcttataatataagccctaatgttataagc 24835383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20841724 - 20841680
Alignment:
Q  61 taagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841724 taagctctaatgttataagcatctatataagttgtttatccaaac 20841680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36787509 - 36787449
Alignment:
Q  45 gtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  36787509 gtaagctctagtgctataagctctaatgctataagcatcaatataagctgtttattcaaac 36787449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24835404 - 24835358
Alignment:
Q  59 tataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24835404 tataagccctaatgttataagcatttatataagctgtttatccaaac 24835358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 107
Target Start/End: Original strand, 52922298 - 52922344
Alignment:
Q  61 taagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  52922298 taagctctaatgctataagcatcaatataagttgtttattcaaacag 52922344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 17592485 - 17592576
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592485 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacag 17592576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42369736 - 42369647
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42369736 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 42369647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17586782 - 17586694
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17586782 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaa 17586694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1168805 - 1168716
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168805 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgttataagcatctatataagttgtttatccaaac 1168716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 40150156 - 40150245
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40150156 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatattataagcatttatataagttgtttatccaaac 40150245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 33511074 - 33511165
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33511074 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 33511165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 23323432 - 23323521
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23323432 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctttaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 23323521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 51358767 - 51358678
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51358767 atagcttatcaaatataagaacttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 51358678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Original strand, 43906351 - 43906439
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43906351 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaatctttaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaa 43906439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1940341 - 1940252
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940341 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatgttataagccctaatgtcataagcatctatataagttgtttatccaaac 1940252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 7146461 - 7146550
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7146461 atagcttattaagtataagagcttatgatgaaagctccaatgttataagccctaatactataagcatctatataagctgtttatccaaac 7146550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8079044 - 8078955
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8079044 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 8078955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 8121664 - 8121753
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8121664 atagtttatcaaatataagaacttatgatgtaagctctaatgttataagccttaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 8121753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26579602 - 26579513
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26579602 atagcttatcaagtataaaagcttatgatgtaagctctaatattataaaccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 26579513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 26663961 - 26664050
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663961 atagcttatcaagtataagaatttatgatgtaagctctaatgttataagtcctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 26664050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 29079300 - 29079389
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29079300 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 29079389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 38172568 - 38172653
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38172568 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgctataagcatctatataagatgtttatccaaac 38172653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 38829923 - 38830012
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829923 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatggtataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 38830012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 40093299 - 40093388
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40093299 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctccaatgctataagtatctatataagttgtttatccaaac 40093388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Original strand, 2348531 - 2348621
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaaca 106  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  2348531 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctacataagctgcttatccaaaca 2348621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 969940 - 969855
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  969940 cttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataaacactaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 969855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 1171316 - 1171405
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171316 atagcttatcaagtataagagctcatgatgtaagctttaatgttataagctataatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 1171405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 6766239 - 6766324
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6766239 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctataatgttataagccctaatgctataagcatctatataaattgtttattcaaac 6766324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 15718482 - 15718571
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15718482 atagcttatcaagtataagaacttatgatgtaagctctaatgttataagccataatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 15718571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23318940 - 23318855
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23318940 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataaattgtttatcaaaac 23318855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 25898038 - 25898127
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25898038 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 25898127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 46761769 - 46761858
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  46761769 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataaacatctatataaactgtttatccaaac 46761858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 52697460 - 52697545
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52697460 cttatcaagtataagaacttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 52697545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 52752605 - 52752520
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52752605 cttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatattataagcatctatataagctgtttatccaaac 52752520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15553746 - 15553658
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  15553746 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatatcataagcatctatataagctacttatccaaa 15553658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 39259789 - 39259704
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39259789 cttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 39259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Original strand, 2478438 - 2478508
Alignment:
Q  37 cttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2478438 cttatgatgtaagctctaatgctataagccttaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacag 2478508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 20097490 - 20097575
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20097490 cttataaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 20097575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41927880 - 41927795
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41927880 cttatcaagtataaaaacttatgatgtaaactctaatgttataagctataatactataagcatctatataagctgtttatccaaac 41927795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 82
Target Start/End: Original strand, 5216181 - 5216243
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcat 82  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5216181 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcat 5216243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13996027 - 13995978
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13996027 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 13995978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 14004141 - 14004092
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14004141 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 14004092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22887486 - 22887393
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgta----agctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  22887486 atagcttatcaaatacaagagcttatgatgtactctagctttaatattataagtcataatactataaacatctatataaattatttatccaaac 22887393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 16052963 - 16053012
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16052963 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctataatgttataagc 16053012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Original strand, 15203753 - 15203800
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataa 63  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15203753 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataa 15203800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Original strand, 29699636 - 29699698
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataa 78  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||    
T  29699636 atagcttatcaagtataaaagcttatgatgtaagctctaatgatatatgctctaatgctataa 29699698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 105
Target Start/End: Original strand, 32672496 - 32672542
Alignment:
Q  59 tataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32672496 tataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 32672542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 105
Target Start/End: Original strand, 46410102 - 46410148
Alignment:
Q  59 tataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46410102 tataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 46410148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 46410074 - 46410123
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  46410074 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgctataagc 46410123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 32672468 - 32672517
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  32672468 atagcttatcaagtataagagcttatggtataagctctaatgctataagc 32672517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Original strand, 5678565 - 5678640
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||| | ||| || | |||||||||||    
T  5678565 tataagagcttatgatgtaagttctagt-ttataagctctaatgctataagcatttctatgagctatttatccaaac 5678640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 105
Target Start/End: Original strand, 52088471 - 52088502
Alignment:
Q  74 tataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52088471 tataagcatctatataagttgtttatccaaac 52088502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 105
Target Start/End: Original strand, 29288947 - 29288993
Alignment:
Q  59 tataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29288947 tataagcactaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 29288993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 79
Target Start/End: Original strand, 29699748 - 29699790
Alignment:
Q  37 cttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataag 79  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  29699748 cttatgatgtaagctctaatgatataagctctaatgctataag 29699790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Original strand, 52088432 - 52088477
Alignment:
Q  21 ttatcaaa-tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52088432 ttatcaaagtataagaacttatgatgtaaactctaatgttataagc 52088477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 127 - 216
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  127 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagctgtttatccaaac 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2041893 - 2041804
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041893 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 2041804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22260022 - 22259933
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22260022 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 22259933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24112572 - 24112483
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24112572 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34679051 - 34678962
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34679051 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 34678962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35117597 - 35117508
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35117597 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 35117508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 39207271 - 39207360
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39207271 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagcccttatgctataagcatctatataaattgtttatccaaac 39207360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 29939174 - 29939265
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29939174 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgttataagcatctatataagttgtttatcaaaacag 29939265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 4716583 - 4716672
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4716583 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctcatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 4716672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Original strand, 28639981 - 28640069
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28639981 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatattataagcatctatataagcagtttatccaaa 28640069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26782110 - 26782021
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26782110 atagcttatcaagtataagagcttacgaagtaaactctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 26782021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34998270 - 34998181
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34998270 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataaggtctaatgatataagcatctatataagttgtttatccaaac 34998181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44804278 - 44804189
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44804278 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctgatgctataagcatctatataagctgtttatctaaac 44804189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 6143868 - 6143777
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6143868 atagcttattaagtataagagcttatgacgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 6143777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 8022325 - 8022416
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8022325 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgtcataagcatctatataagctgtttatccaaacag 8022416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Original strand, 13111016 - 13111106
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaaca 106  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111016 atagcttattaagtataagagcttatgacgtaagctctaatgttataagccctaatgtcataagcatctatataagttgtttatccaaaca 13111106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 34841929 - 34841831
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagagtctta 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  34841929 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataaaccctagtgctataagcatctatataagctgtttatccaaacggagcctta 34841831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10830751 - 10830662
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10830751 atagcttattaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataaactgtttatccaaac 10830662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 18595349 - 18595438
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18595349 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 18595438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 36494864 - 36494953
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36494864 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagagctaatgctatacgcatctatataagctgtttatccaaac 36494953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38166327 - 38166238
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  38166327 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagtcctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 38166238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 39219410 - 39219499
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39219410 atagcttataaagtataagagcttatgatataagctctaatgctataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 39219499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Original strand, 39222106 - 39222195
Alignment:
Q  18 agcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39222106 agcttatcgagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccataatgctataagcatctatacaagctgtttatccaaacag 39222195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 40116772 - 40116683
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40116772 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatattataagctctaatgctataagcatctatataagttgttaatccaaac 40116683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6082993 - 6082909
Alignment:
Q  21 ttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  6082993 ttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatttatataagctatttatccaaac 6082909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 5321148 - 5321237
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5321148 atagtttatcaagtataagaacttatgatgtaagctctaattctataagccctaatattataagcatttatataagttgtttatccaaac 5321237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 14423538 - 14423627
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14423538 atagtttatcaagtatacgagcttataatgtaagctctaatgttataagccttaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 14423627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 15730409 - 15730494
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15730409 cttatcaagtagaagagtttatgatgtaagctctactgttataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 15730494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33286534 - 33286445
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33286534 atagcttatcaagtataaaagtttatgatgtaagctctaatattataagccctaatgctataaacatctatataagttgtttatcaaaac 33286445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 41576207 - 41576296
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  41576207 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataagtcctaatgctataagcatctatataaactgtttatgcaaac 41576296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 9807915 - 9808003
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacaga 108  Q
    ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9807915 cttattaagtataagagcttataacgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacaga 9808003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 4036475 - 4036560
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagagtctta 114  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4036475 tataaaagcttatgttgtaagctctaatgttataagcactaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacggagtctta 4036560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Original strand, 33279340 - 33279409
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatcta 85  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  33279340 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgtcataagcatcta 33279409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 2320579 - 2320501
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  2320579 tataagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgttataagcatcaatataagttatttatctaaacag 2320501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 105
Target Start/End: Original strand, 5015223 - 5015291
Alignment:
Q  37 cttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5015223 cttatgatataagctttaatattataagccataatgctataagcatctatataaattgtttatccaaac 5015291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Original strand, 145092 - 145166
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataa 90  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  145092 atagcttattaagtataagaacttatgatgtaaactctaatgttataagtcataatgctataaccatctatataa 145166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 10836074 - 10836025
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836074 atagcttattaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 10836025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Original strand, 42572240 - 42572284
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataag 64  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42572240 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataag 42572284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Original strand, 883414 - 883459
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  883414 cttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgctataagc 883459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Original strand, 18684855 - 18684930
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||   |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  18684855 tataagagcttatgatgtaagctctagt-ctataagttttaatgctataagcatctctataagctatttatccaaac 18684930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Original strand, 18730420 - 18730495
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||   |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  18730420 tataagagcttatgatgtaagctctagt-ctataagttttaatgctataagcatctctataagctatttatccaaac 18730495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 105
Target Start/End: Original strand, 883438 - 883484
Alignment:
Q  59 tataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  883438 tataagctctaatgctataagcatctatataagctatttatccaaac 883484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 38867422 - 38867511
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38867422 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 38867511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 42205161 - 42205250
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42205161 atagcttatcaaaaataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccccaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 42205250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 934118 - 934207
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  934118 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataaactgtttatccaaac 934207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 3512189 - 3512278
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3512189 atagtttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatattataagccctaatgctataagcgtctatataagttgtttatccaaac 3512278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 9453390 - 9453479
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9453390 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagtatctatataagttgtttattcaaac 9453479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12097180 - 12097091
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12097180 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 12097091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 17754400 - 17754489
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17754400 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 17754489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24791912 - 24791821
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24791912 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaataccataaacatctatataagctgtttatccaaacag 24791821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 25749095 - 25749182
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25749095 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagccctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagttgtttatccaa 25749182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 5281505 - 5281594
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5281505 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagttctaatgctataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 5281594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33358502 - 33358413
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33358502 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagatgtttatccaaac 33358413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36890354 - 36890269
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890354 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgctgtaagccctaatggtataagcatctatataagttgtttatccaaac 36890269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 42674233 - 42674318
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  42674233 cttatcaaatataagagtttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatttatataaactgtttatccaaac 42674318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 43067555 - 43067470
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatcc 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  43067555 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaataccataagcatctatataaactgtttatcc 43067470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22648996 - 22648924
Alignment:
Q  33 agagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22648996 agagcttatgatgtaagctctaatattataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 22648924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 7164801 - 7164888
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7164801 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctattgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 7164888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 6395890 - 6395979
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6395890 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaatctctaatgatataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 6395979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 32042155 - 32042244
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32042155 atagcttatcaagtataagggcttaagatgtaagctctaatgttataagctctaatgatataagcatctatataagttgtttatccaaac 32042244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4476409 - 4476322
Alignment:
Q  18 agcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4476409 agcttattaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgatataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 4476322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33845956 - 33845870
Alignment:
Q  19 gcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33845956 gcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 33845870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 1803721 - 1803810
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  1803721 atagcttatcaagtataagagcttataatgtaagctctaatgttataagcccttatgctataagcatttgtataagctgtttatccaaac 1803810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12100575 - 12100486
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12100575 atagcttatcaagtataagaacttatgatataagctctaatgttataagtactaattctataagcatctatataagctgtttatccaaac 12100486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18120769 - 18120699
Alignment:
Q  35 agcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18120769 agcttatgatgtaagctctaatgtgataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 18120699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 48866240 - 48866325
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  48866240 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatattataaaccctaatgccataaacacctatataagctgtttatccaaac 48866325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 43407751 - 43407840
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43407751 atagcttattgagtataagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataagcatcaatataagctgtttatccaaac 43407840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 46133855 - 46133774
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgttt 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  46133855 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataggccctaatgatataagcatttatataagctgttt 46133774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30180156 - 30180071
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30180156 cttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatggtataaactctaatgcaacaagcatgtatataagttgtttatccaaac 30180071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 42964183 - 42964134
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964183 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 42964134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 36847693 - 36847607
Alignment:
Q  18 agcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36847693 agcttattgaatacaagagcttatgatgtaagctctagtgctataaactctaatgttataagcatcaatataagttgtttatccaaa 36847607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15648700 - 15648625
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15648700 tataagagcttatgatgtaagctgtagtgctataagctctactgctataagcatcaatataagctgtttatccaaa 15648625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 37004196 - 37004121
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  37004196 tataagagcttatgatgtgagctctagtgctataagctctaatgctataagcatcaatataaactgtttatccaaa 37004121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16893906 - 16893857
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16893906 atagcttatcaagtataagagtttatgatgtaagctctaatgttataagc 16893857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 43021109 - 43021063
Alignment:
Q  61 taagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43021109 taagccctaatgctataagcatttatataagttgtttatccaaacag 43021063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 43157357 - 43157406
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43157357 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatgctataagc 43157406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 43021141 - 43021090
Alignment:
Q  14 atatagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43021141 atataacttatcaagtataagagcttatgatgtaagccctaatgctataagc 43021090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 105
Target Start/End: Original strand, 43157393 - 43157431
Alignment:
Q  67 ctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43157393 ctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 43157431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Original strand, 15656694 - 15656739
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15656694 cttatcaagtataagaacttatgatgtaaactctaatgttataagc 15656739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 103
Target Start/End: Original strand, 8631577 - 8631625
Alignment:
Q  55 atgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaa 103  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8631577 atgttgtaagctctaatgctataaacatctatataagttgtttatccaa 8631625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16893876 - 16893832
Alignment:
Q  61 taagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16893876 taagctctaatgttataagcatctatataagttgtttatccaaac 16893832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Original strand, 8631553 - 8631600
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataa 63  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  8631553 atagcttatcaagtataagaacttatgttgtaagctctaatgctataa 8631600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 18614340 - 18614429
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18614340 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 18614429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 10550997 - 10551086
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10550997 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 10551086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 20727404 - 20727493
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20727404 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagttgtttatccaaac 20727493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3346932 - 3346843
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3346932 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataaaccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 3346843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16306565 - 16306476
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16306565 atagcttatctagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 16306476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 53703 - 53792
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53703 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 53792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3955212 - 3955123
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3955212 atagcttatcaagtatgagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 3955123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 33465157 - 33465246
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33465157 atagcttatcaagtataagagtttatgatgtaagctctaatgttataagttctaatgctataagcatctatataagttgtttattcaaac 33465246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 9460408 - 9460497
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9460408 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatattataagctctgatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 9460497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26703751 - 26703662
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26703751 atagcttatcaagtataagagcttatcatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcacctatataagctgtttatccaaac 26703662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 30692640 - 30692729
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692640 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctgatgttataagcactaatgttttaagcatctatataagttgtttatccaaac 30692729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Original strand, 34887100 - 34887173
Alignment:
Q  32 aagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887100 aagagcttatggtgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 34887173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Original strand, 2838357 - 2838455
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagagtctta 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  2838357 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagttctaatgttataaacactaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaacggggtctta 2838455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17260461 - 17260377
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  17260461 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatggtataagctctaattctataagcatctttataagctgtttatacaaa 17260377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23073758 - 23073673
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatcc 101  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23073758 atagtttatcaagtataagagcttatgatataaactctaatgttataaactctaatgttataagcatctatataagttgtttatcc 23073673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Original strand, 21894150 - 21894214
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagc 80  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  21894150 atagcttataaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataaatcctaatgctataagc 21894214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26946465 - 26946377
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26946465 atagcttattgagtataagagcttatgatataagctc-agtgctataagctctaatgctataagtatcaatataagctgtttatccaaac 26946377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 30692785 - 30692736
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagcccta 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30692785 cttatcaagtataaaagcttatgatgtaagctctaatgttataagtccta 30692736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 30691852 - 30691809
Alignment:
Q  64 gccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30691852 gccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacag 30691809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 6086015 - 6085970
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6086015 cttattaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagc 6085970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 35198928 - 35198977
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35198928 atagcttatcaagtatgagagcttatgatgtaagctataatattataagc 35198977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6085991 - 6085945
Alignment:
Q  59 tataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6085991 tataagctctaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 6085945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 484038 - 484005
Alignment:
Q  87 ataagttgtttatccaaacagagtcttattatat 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  484038 ataagttgtttatccaaatagagtcttattatat 484005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 105
Target Start/End: Original strand, 35198965 - 35199002
Alignment:
Q  68 taatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35198965 taatattataagcatctatataagctgtttatccaaac 35199002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9007387 - 9007298
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9007387 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 9007298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 19360773 - 19360862
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19360773 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataaattgtttatccaaac 19360862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1165142 - 1165058
Alignment:
Q  21 ttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165142 ttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccataatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 1165058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26602368 - 26602292
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602368 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 26602292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8373694 - 8373605
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373694 atagcttataaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgatataagcatctatataagttgtttatccaaac 8373605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23765390 - 23765305
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatcc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23765390 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagttctaatgttataagtcctaatgctataaacatctatataagttgtttatcc 23765305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23815238 - 23815153
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatcc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23815238 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagttctaatgttataagtcctaatgctataaacatctatataagttgtttatcc 23815153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27678588 - 27678499
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27678588 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataaacatctatataagttgtttatccaaac 27678499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 33992012 - 33992101
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33992012 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 33992101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 27421475 - 27421564
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27421475 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatattataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatctaaac 27421564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33490595 - 33490506
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33490595 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataaacactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 33490506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35782090 - 35782006
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35782090 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataaattg-ttatccaaac 35782006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 4121733 - 4121824
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagag--cttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4121733 atagcttatcaagtataagagagcttatgatataagctctaatattataagccctaatactataatcatctatataagttgtttatccaaac 4121824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 1579650 - 1579741
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1579650 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaattttattagtcctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 1579741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1605165 - 1605074
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1605165 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaattttattagtcctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 1605074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24105053 - 24104964
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24105053 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataaactgtttatccaaac 24104964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 34708373 - 34708284
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34708373 atagtttattaagtataagagcttgtgatataagctctaatgttataagcactaatactataagcatctatataagctgtttatccaaac 34708284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35419723 - 35419638
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35419723 cttatgaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgttataagcatctatataaactgtttatccaaac 35419638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 31883999 - 31884084
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31883999 cttatcaagtataagagcttatgatttaagctctaatgttataagttctaatgctataagcatttatataagctgtttatccaaac 31884084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16736711 - 16736641
Alignment:
Q  35 agcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16736711 agcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcacctatataagctgtttatccaaac 16736641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 27025802 - 27025891
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  27025802 atagcttatcaaatataaaaacttataatgcaaactctaatattataagccctaatgctataaacatctatataagctgtttattcaaac 27025891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Original strand, 31413403 - 31413469
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcat 82  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  31413403 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatgctataagccctaatgttataagcat 31413469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 16070242 - 16070291
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16070242 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 16070291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35420004 - 35419924
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35420004 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagct---------taagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 35419924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19515577 - 19515501
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  19515577 tataagaacttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataagcacctgtataagctatttatccaaac 19515501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38597217 - 38597164
Alignment:
Q  52 ctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  38597217 ctaatgttataagccctaatgctataaacatctaaataagctgtttatccaaac 38597164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41818075 - 41818028
Alignment:
Q  18 agcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41818075 agcttatcaagtataagaacttatgttgtaagctctaatgttataagc 41818028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41818053 - 41818003
Alignment:
Q  55 atgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41818053 atgttgtaagctctaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 41818003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 851709 - 851798
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851709 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 851798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3872571 - 3872482
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3872571 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 3872482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 5734198 - 5734287
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5734198 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 5734287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18806208 - 18806117
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806208 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctttaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacag 18806117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33905379 - 33905290
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33905379 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 33905290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26322611 - 26322522
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26322611 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctataatgttataagccctaatcctataagcatctatataagctgtttatccaaac 26322522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19383441 - 19383350
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19383441 atagcttatcaagtataggagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatccatataagttgtttatccaaacag 19383350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1481360 - 1481275
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1481360 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagaatctatataagttgtttatccaaac 1481275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 31516658 - 31516569
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31516658 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgtaataagtcctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 31516569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 44947047 - 44946953
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagagtctta 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  44947047 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatattataagccttaatgctataaacatctatataaactgtttatccaaacggagtctta 44946953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16065830 - 16065741
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16065830 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagttgtaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 16065741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 42938595 - 42938684
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42938595 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagttctaatgctataagcatctatataagctatttatccaaac 42938684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Original strand, 1679354 - 1679445
Alignment:
Q  14 atatagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1679354 atatagcttataaagtatgagagcttatgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgctataaacatctatataagatgtttatccaaac 1679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16588370 - 16588296
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataa 90  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16588370 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataa 16588296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 1110096 - 1110185
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1110096 atagcttatcaagtacaagagcttataatgtaagctctaatgttataagccctgatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 1110185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6174417 - 6174328
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  6174417 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaattctataaaccctaatactataagcatctatataaactatttatccaaac 6174328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28323102 - 28323013
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28323102 atagcttattaagtataagagcttatgatataagccctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 28323013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30266073 - 30265984
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  30266073 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatgttataagctctaatgctataagtaaatatataagttgtttgtccaaac 30265984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 42445175 - 42445087
Alignment:
Q  18 agcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaaca 106  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42445175 agcttattgaatttaagagcttataatgtaaactctagtgttataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaaca 42445087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 30419499 - 30419450
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30419499 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataagc 30419450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2178208 - 2178161
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataa 63  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2178208 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataa 2178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12516470 - 12516404
Alignment:
Q  38 ttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  12516470 ttatgatataagctctcatgttataagctctaatgctataagcatttgtataagctgtttatccaaa 12516404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 4231734 - 4231685
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4231734 atagcttatcaagtataagggcttatgatgtaagctctaatgatataagc 4231685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19900708 - 19900664
Alignment:
Q  61 taagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19900708 taagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 19900664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19900733 - 19900689
Alignment:
Q  21 ttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19900733 ttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataagc 19900689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 71
Target Start/End: Original strand, 4016846 - 4016897
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaat 71  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4016846 cttatcaagtacaagaacttatgatgtaagctctaatgttataagctctaat 4016897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 39636168 - 39636217
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39636168 atagcttatcaagtataagaacttatgatataagctctaatgctataagc 39636217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2178178 - 2178134
Alignment:
Q  61 taagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2178178 taagctctaatgctataaacatctatataagttgtttatccaaac 2178134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4231704 - 4231660
Alignment:
Q  61 taagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4231704 taagctctaatgatataagcatctatataagttgtttatccaaac 4231660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11707809 - 11707762
Alignment:
Q  17 tagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataag 64  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11707809 tagcttattaagtattagagcttatgatgtaagctctaatgctataag 11707762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 106
Target Start/End: Original strand, 39636196 - 39636243
Alignment:
Q  59 tataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaaca 106  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39636196 tataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatctaaaca 39636243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 53408893 - 53408984
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53408893 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacag 53408984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6687946 - 6687857
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6687946 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 6687857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 15669983 - 15670072
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669983 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 15670072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19913022 - 19912933
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913022 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 19912933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 35490355 - 35490266
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490355 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagttgtttatccaaac 35490266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 50354421 - 50354506
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50354421 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 50354506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 52140073 - 52140162
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52140073 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagacctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 52140162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Original strand, 30172319 - 30172403
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30172319 cttatcaagtataagagcttatgatttaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 30172403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2480908 - 2480819
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2480908 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 2480819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 16701588 - 16701673
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16701588 cttatcaagtataaaagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 16701673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23775856 - 23775768
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23775856 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagttg-ttatccaaac 23775768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 33704638 - 33704727
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33704638 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgatataagcatctatataagctgtttatccaaac 33704727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44784307 - 44784218
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44784307 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagtcttaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 44784218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 45423988 - 45423899
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45423988 atagcttatcaagtataagagtttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 45423899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 47632907 - 47632996
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47632907 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatttatataagctgtttatccaaac 47632996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 50053688 - 50053599
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50053688 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 50053599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1756344 - 1756253
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1756344 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctattgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 1756253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10687730 - 10687641
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10687730 atagcttatcaagtataagagcttatgatttaagctctaatggtataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 10687641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10901370 - 10901281
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10901370 atagcttatcaagtataagagcttatgatttaagctctaatggtataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 10901281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 28361192 - 28361281
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28361192 atagcttatcaaatataagaacttatgatgtaagctctaatattataagctctaatcctataagcatctatataagctgtttatccaaac 28361281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 38056032 - 38056121
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38056032 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagttctaatgttataagccctaatgctttaagcatctatataagctgtttatccaaac 38056121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38070664 - 38070575
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38070664 atagtttatcaagtataagagtttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 38070575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 40428202 - 40428109
Alignment:
Q  21 ttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagagtctta 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40428202 ttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctactgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacagggtctta 40428109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41852307 - 41852218
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41852307 atagcttatcaagtataagagcttatgacgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctttttatccaaac 41852218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 43289542 - 43289453
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43289542 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctgatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 43289453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 53716797 - 53716712
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53716797 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgtgataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 53716712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15240416 - 15240331
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatcc 101  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15240416 atagcttatcaagtttaagaacttatgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgctataagcatctatataagttgtttatcc 15240331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 16704829 - 16704914
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16704829 cttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatggtataagctctaatactataagcatctatataaactgtttatccaaac 16704914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23261306 - 23261221
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23261306 cttatcaaatataaaaacttatgatgtaagctctaatgttataaaccctaatattataagcatctatataagctgtttatccaaac 23261221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23702161 - 23702072
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23702161 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatattataagccataatgctataagcatctatataaactgtttatccaaac 23702072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27583220 - 27583131
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  27583220 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatgttataagccctaatgctataagcatttatataagctttttatccaaac 27583131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 48910560 - 48910645
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48910560 cttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataaaccataatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 48910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 54190330 - 54190419
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  54190330 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataaacatctatataagatgtttatccaaac 54190419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6610832 - 6610744
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6610832 atagcttatcaagtataaaagcttatgatataagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaa 6610744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Original strand, 44377352 - 44377440
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  44377352 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctacaagcatctattaatgttgtttatccaaa 44377440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 112
Target Start/End: Original strand, 53353682 - 53353765
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagagtct 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53353682 tataagagcttatgacgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacagggtct 53353765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26088276 - 26088187
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26088276 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactttaatgttataagttctaatgctataagcatcaatataagttgtttatccaaac 26088187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28032029 - 28031940
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28032029 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctcttatgttataagctcggatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 28031940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30423122 - 30423033
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  30423122 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataagccctaatgctataagcatttatataagttggttattcaaac 30423033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 50055758 - 50055847
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  50055758 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatattataagccctaatgtcataagcatctatataaactatttatccaaac 50055847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 53876367 - 53876448
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgttt 97  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53876367 atagtttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatattataagctctaatgctataagcatctatataagttgttt 53876448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 105
Target Start/End: Original strand, 20877763 - 20877831
Alignment:
Q  37 cttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877763 cttatgatgtaagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 20877831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 48748703 - 48748797
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagc-----atctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     || ||||||||||||||||||||||    
T  48748703 atagtttatcaaatataagagtttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagctctatatatatataagttgtttatccaaac 48748797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9595388 - 9595303
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9595388 cttatcaagtataagaacttataatgtaagctctattgttataagccctaatgctataagcatctatataagctatttatccaaac 9595303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Original strand, 34617969 - 34618052
Alignment:
Q  21 ttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34617969 ttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatattataagccataatgctat-agcatttatataagttgtttatccaaac 34618052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8590187 - 8590098
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8590187 atagcttatcaagtataagagcttataatgtaagctctaacattataagctctaatgatataagcatctatataaactgtttatccaaac 8590098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27532025 - 27531956
Alignment:
Q  45 gtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagagtctta 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27532025 gtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacggagcctta 27531956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 105
Target Start/End: Original strand, 14988593 - 14988652
Alignment:
Q  46 taagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14988593 taagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 14988652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Original strand, 33704991 - 33705057
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcat 82  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  33704991 atagcttatcaaatataagaatttatgatgtaagctctaatgttataaaccctaaagctataagcat 33705057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 31970486 - 31970571
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  31970486 cttatcaagtataagagattatgatataagctctaatgttataagcactagtgttataagcatcaatataaactgtttatccaaac 31970571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 40679612 - 40679527
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  40679612 cttattaagtataaaagcttatgatataagctctaatgttataagctctaatattataagcatttatataaactggttatccaaac 40679527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 44378662 - 44378585
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgttt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  44378662 cttatcaagtataagagcttatgatgtaatctctaatattataagtcttaatgtcataagcatctatataagttgttt 44378585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 44547239 - 44547163
Alignment:
Q  30 ataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44547239 ataagagcttatgatgtaagctctactgctataagttctaatgc-ataagcatcaatataagttgtttatccaaacag 44547163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 27488227 - 27488186
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatg 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488227 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatg 27488186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19164089 - 19164045
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataag 64  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19164089 cttatcaaatataagagtttatgatgtaagctctaatgttataag 19164045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 37968303 - 37968255
Alignment:
Q  21 ttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagcccta 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37968303 ttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgctataagcccta 37968255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 1617767 - 1617822
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaat 71  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1617767 atagcttatcaagtataagagtttattatgtaagctctaatgttataagccttaat 1617822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 51780350 - 51780305
Alignment:
Q  18 agcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51780350 agcttatcaaatataagagcttatgatataagctctaatgctataa 51780305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Original strand, 54413370 - 54413419
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 65  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  54413370 atagcttatcaagtataagagcttatgatataagctctaatgtcataagc 54413419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 51780324 - 51780281
Alignment:
Q  59 tataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatcca 102  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51780324 tataagctctaatgctataaacatctatataagttgtttatcca 51780281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 27535494 - 27535461
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaag 49  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27535494 atagcttatcaaatataagaacttatgatgtaag 27535461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Original strand, 46035798 - 46035875
Alignment:
Q  29 tataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaaca 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |   |||| | ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  46035798 tataagagcttatgatgtaagttcttgttcaataaactctaatgctataagcatgtgtgtaagttgtttatccaaaca 46035875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1827 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1827
Description:

Target: scaffold1827; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 109
Target Start/End: Original strand, 92 - 185
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacagag 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  92 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaacagag 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18350 - 18259
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaacag 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18350 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 18259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 1806 - 1718
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  1806 atagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctacaagcatctattaatgttgtttatccaaa 1718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Original strand, 495 - 572
Alignment:
Q  20 cttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgttt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  495 cttatcaagtataagagcttatgatgtaatctctaatattataagtcttaatgtcataagcatctatataagttgttt 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 10970 - 11061
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatc--tatataagttgtttatccaaac 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10970 atagcttatcaaatataagagtttacgatgtaatctctaatattataagctctaatgctataagcatctatatataagttgtttatccaaac 11061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 144740 - 144652
Alignment:
Q  16 atagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  144740 atagcttatcaaatataagggcttatgatataaactctaatgttataagccttaatgttataaacatctatataagctgtttatccaaa 144652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University