View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7493_low_3 (Length: 270)

Name: NF7493_low_3
Description: NF7493
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7493_low_3
NF7493_low_3
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (2-209)||(16150642-16150849)
chr7 (1-209)||(824494-824702)
chr7 (13-209)||(15064640-15064836)
chr7 (44-209)||(15917908-15918073)
chr7 (2-209)||(16530912-16531121)
chr7 (2-209)||(16634541-16634750)
chr7 (7-199)||(16760940-16761132)
chr7 (1-200)||(20107143-20107342)
chr7 (8-209)||(8716738-8716938)
chr7 (2-209)||(13672725-13672931)
chr7 (3-209)||(16466755-16466960)
chr7 (8-209)||(13656807-13657007)
chr7 (8-209)||(14549970-14550170)
chr7 (8-209)||(18286499-18286699)
chr7 (5-209)||(48802998-48803202)
chr7 (2-209)||(18594406-18594615)
chr7 (2-209)||(18617069-18617278)
chr7 (51-180)||(4311654-4311783)
chr7 (51-197)||(8783239-8783385)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (2-209)||(22132-22339)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (2-209)||(4369542-4369749)
chr3 (2-209)||(22165443-22165650)
chr3 (2-209)||(16654585-16654792)
chr3 (2-198)||(12161214-12161410)
chr3 (2-209)||(10603672-10603879)
chr3 (2-209)||(15945483-15945692)
chr3 (1-208)||(20157593-20157800)
chr3 (2-209)||(3340356-3340565)
chr3 (2-209)||(13505652-13505861)
chr3 (8-209)||(13196569-13196769)
chr3 (8-209)||(7599230-7599430)
chr3 (15-209)||(10145892-10146085)
chr3 (8-209)||(13689541-13689741)
chr3 (8-209)||(12188215-12188415)
chr3 (8-197)||(13188568-13188757)
chr3 (15-209)||(13137309-13137502)
chr3 (8-209)||(15630096-15630296)
chr3 (9-209)||(15643954-15644156)
chr3 (8-187)||(16374640-16374819)
chr3 (8-209)||(12194629-12194829)
chr3 (9-209)||(10161325-10161527)
chr3 (7-199)||(17386629-17386821)
chr3 (1-168)||(3278337-3278504)
chr3 (1-158)||(14446755-14446912)
chr3 (13-209)||(13693758-13693954)
chr3 (51-180)||(3246671-3246800)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (2-209)||(3988956-3989163)
chr1 (2-199)||(20392360-20392557)
chr1 (13-209)||(20236360-20236555)
chr1 (9-209)||(21799811-21800013)
chr1 (1-200)||(8651892-8652090)
chr1 (7-209)||(19876814-19877015)
chr1 (36-200)||(8948700-8948864)
chr1 (8-209)||(20072071-20072272)
chr1 (2-51)||(19783886-19783935)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (2-203)||(21561595-21561796)
chr6 (2-203)||(11218477-11218678)
chr6 (8-209)||(18010720-18010921)
chr6 (8-209)||(24856384-24856584)
chr6 (2-209)||(22166692-22166901)
chr6 (2-209)||(20017377-20017586)
chr6 (2-199)||(22768279-22768476)
chr6 (1-209)||(18447075-18447282)
chr6 (3-199)||(25966513-25966709)
chr6 (2-183)||(20169101-20169282)
chr6 (36-183)||(30672912-30673058)
chr6 (47-197)||(23518889-23519039)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-209)||(29333477-29333685)
chr8 (1-209)||(11348086-11348295)
chr8 (1-209)||(19766364-19766572)
chr8 (8-209)||(22098097-22098297)
chr8 (8-209)||(22100765-22100965)
chr8 (2-209)||(21826253-21826462)
chr8 (8-209)||(16419740-16419940)
chr8 (8-209)||(8313342-8313542)
chr8 (8-209)||(21380967-21381167)
chr8 (8-209)||(21954953-21955153)
chr8 (8-209)||(22034670-22034870)
chr8 (8-209)||(8323991-8324191)
chr8 (1-209)||(21942593-21942801)
chr8 (1-199)||(22289892-22290089)
chr8 (8-209)||(21099952-21100153)
chr8 (1-209)||(22368824-22369032)
chr8 (50-199)||(22831958-22832107)
chr8 (51-180)||(20040224-20040353)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-209)||(21749-21958)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (2-202)||(12349-12549)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (1-209)||(3353484-3353692)
chr4 (2-183)||(15261251-15261432)
chr4 (1-209)||(15864372-15864580)
chr4 (2-209)||(13821777-13821986)
chr4 (44-209)||(15253256-15253420)
chr4 (8-209)||(22109834-22110034)
chr4 (51-114)||(14686993-14687056)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (2-209)||(18071779-18071986)
chr5 (2-209)||(20596979-20597186)
chr5 (2-209)||(20603276-20603483)
chr5 (2-209)||(20791922-20792129)
chr5 (2-209)||(20609595-20609802)
chr5 (2-209)||(25117283-25117492)
chr5 (2-209)||(25176374-25176583)
chr5 (2-209)||(30760779-30760988)
chr5 (1-209)||(26846534-26846735)
chr5 (2-199)||(20439313-20439510)
chr5 (8-209)||(15734408-15734608)
chr5 (8-209)||(20621037-20621237)
chr5 (8-209)||(22318624-22318824)
chr5 (8-197)||(23746925-23747114)
chr5 (8-209)||(25007923-25008123)
chr5 (2-197)||(24954328-24954523)
chr5 (4-202)||(22947301-22947499)
chr5 (119-209)||(21387268-21387358)
chr5 (4-81)||(21387177-21387254)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-209)||(1006-1215)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (2-202)||(19121-19321)
scaffold0004 (44-209)||(253024-253189)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (2-203)||(3201-3402)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (5-209)||(122243-122447)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (2-203)||(25532-25733)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (2-202)||(90152-90352)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (2-209)||(17867188-17867396)
chr2 (37-209)||(24821241-24821414)
chr2 (2-209)||(116372-116581)
chr2 (8-209)||(22045800-22046000)
chr2 (8-209)||(25356386-25356586)
chr2 (2-209)||(24796432-24796641)
chr2 (8-209)||(27626468-27626668)
chr2 (36-183)||(27769966-27770113)
chr2 (2-209)||(23160512-23160721)
chr2 (2-209)||(23571769-23571978)
chr2 (8-209)||(12754-12954)
chr2 (3-209)||(27630376-27630584)
chr2 (1-209)||(26192761-26192969)
chr2 (2-209)||(16774525-16774734)
chr2 (8-209)||(25145930-25146131)
chr2 (4-209)||(25368760-25368965)
chr2 (44-209)||(24170244-24170409)
chr2 (52-199)||(25372134-25372281)
chr2 (47-197)||(25339253-25339403)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (2-209)||(29362-29571)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (37-209)||(19407-19580)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (2-183)||(24438-24619)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (44-208)||(34-197)
[»] scaffold1879 (1 HSPs)
scaffold1879 (8-209)||(61-262)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (44-209)||(115557-115720)
scaffold0020 (44-209)||(119861-120024)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (5-209)||(11400-11604)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (5-203)||(10288-10486)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (8-209)||(12912-13112)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (4-209)||(32717-32921)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-142)||(132494-132635)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (8-209)||(38879-39080)
[»] scaffold1571 (1 HSPs)
scaffold1571 (8-145)||(1496-1633)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (13-209)||(2155-2351)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (13-209)||(4730-4926)
[»] scaffold1620 (1 HSPs)
scaffold1620 (8-209)||(134-335)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (44-209)||(44344-44507)
scaffold0037 (44-209)||(51733-51896)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (13-209)||(7633-7829)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (46-209)||(6798-6961)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (98-209)||(7759-7869)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (8-209)||(8123-8325)
[»] scaffold0577 (2 HSPs)
scaffold0577 (106-209)||(5587-5689)
scaffold0577 (8-111)||(4980-5083)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (135-209)||(28-104)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (8-105)||(21792-21889)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (51-114)||(1537-1600)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16150849 - 16150642
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16150849 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatg 16150750  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150749 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 16150650  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  16150649 aatgtgag 16150642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 824494 - 824702
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| |   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  824494 caatgataatgaaagatggacatggatgcaaactgaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgat 824593  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  824594 gtcctaaggggaaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 824693  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  824694 aaatgtgag 824702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 15064640 - 15064836
Alignment:
Q  13 aagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggc 112  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15064640 aagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaactacggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggc 15064739  T
Q  113 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15064740 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctttggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 15064836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15918073 - 15917908
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15918073 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatattcgaagaaaataaccaaatgc 15917974  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15917973 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccacggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 15917908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 16530912 - 16531121
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  16530912 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaagaaaggcaaggtattgaattgatgggactaaggaatgatg 16531011  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |    
T  16531012 tcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttccgaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaca 16531111  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  16531112 aaaatgtgag 16531121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16634750 - 16634541
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  16634750 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaagaaaggcaaggtattgaattgatgggactaaggaatgatg 16634651  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |    
T  16634650 tcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttccgaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaca 16634551  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  16634550 aaaatgtgag 16634541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16761132 - 16760940
Alignment:
Q  7 aaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtccta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  16761132 aaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcacctagcaactaaggcaaggtgttgaattgttgtgactaaggaattatgtccta 16761033  T
Q  107 aggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16761032 tggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatacttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatga 16760940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 20107143 - 20107342
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || |||||| | ||||||    
T  20107143 caatgataatgaaagatgggcatggatgcacatagaggttgagaggataagcaccgtgcaacaaaggcaaggtgttgagttatccggactacgaaatgat 20107242  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  20107243 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggtcctccttatggacctcaatgaa 20107342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 8716738 - 8716938
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  8716738 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 8716837  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8716838 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 8716936  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  8716937 ag 8716938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 13672725 - 13672931
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  13672725 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatg 13672824  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||| ||||| || |||||| |||    
T  13672825 tcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttgcaccttcagggccctacctatggacctcaat-aaa 13672923  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  13672924 aatgtgag 13672931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16466960 - 16466755
Alignment:
Q  3 atgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgt 102  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  16466960 atgacaatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgt 16466861  T
Q  103 cctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaa 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||| || |||||| ||||    
T  16466860 cctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaacacttcaacctccatggccctccctatggacctcaat-aaaa 16466762  T
Q  203 atgtgag 209  Q
    |||||||    
T  16466761 atgtgag 16466755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 13656807 - 13657007
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13656807 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaa 13656906  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13656907 gaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatggaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 13657005  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  13657006 ag 13657007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 14549970 - 14550170
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||     
T  14549970 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaataatgtcctac 14550069  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14550070 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 14550168  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  14550169 ag 14550170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 18286499 - 18286699
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  18286499 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 18286598  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  18286599 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctttggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 18286697  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  18286698 ag 18286699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 48803202 - 48802998
Alignment:
Q  5 gaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcc 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  48803202 gaaaatggaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgttc 48803103  T
Q  105 taaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaat 204  Q
    || |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  48803102 tacggggcaaccgcatcaccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaacaat 48803003  T
Q  205 gtgag 209  Q
    |||||    
T  48803002 gtgag 48802998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18594615 - 18594406
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||  | |||    
T  18594615 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taagacacgat 18594517  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg-- 198  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||      
T  18594516 gtccaaaggagcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgat 18594417  T
Q  199 aaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||    
T  18594416 aaaaatgtgag 18594406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 18617069 - 18617278
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||  | |||    
T  18617069 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taagacacgat 18617167  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg-- 198  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||      
T  18617168 gtccaaaggagcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgat 18617267  T
Q  199 aaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||    
T  18617268 aaaaatgtgag 18617278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 180
Target Start/End: Original strand, 4311654 - 4311783
Alignment:
Q  51 gcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcgga 149  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| || || ||| |||| || ||||||||||||||||| || |||   ||| |||| || |||||||| || |    
T  4311654 gcaccgagcaacaaaaacaaggtgttgaaatggtcggga-taagaaacgatgtcctaaggggcaatcgaataaatgaataaaacaatcaaatgctccgaa 4311752  T
Q  150 acatgatgcaccattttcacctccaaggtcc 180  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4311753 acatgatgcaacaccttcacctccaaggtcc 4311783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8783385 - 8783239
Alignment:
Q  51 gcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaa 150  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||   || ||||| || |||||||||||||||||  | |||   ||||||||||| ||||||||    ||    
T  8783385 gcaccgagcaacaaagacaaagtgttgaaatggtcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaattgaataaatgaagaaaataatcaaatgctctaaaa 8783286  T
Q  151 catgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 197  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||||||| || ||| || ||||||    
T  8783285 catgatgctacaccttcacctccaaggtccaccttatggacctcaat 8783239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22339 - 22132
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22339 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatg 22240  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22239 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagacctcattgaaa 22140  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  22139 aatgtgag 22132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 4369542 - 4369749
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4369542 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattttcgggactaaggaatgatg 4369641  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369642 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcagaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 4369741  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  4369742 aatgtgag 4369749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22165650 - 22165443
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22165650 aatgaaaatgcaagatgagcatggatgcataccgaggactagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatg 22165551  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22165550 tcctaaagggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaa 22165451  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  22165450 aatgtgag 22165443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 16654585 - 16654792
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||    
T  16654585 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgatgaattgtcgagactaaggaattatg 16654684  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16654685 tcctaaggggcaatcgcatatccgaagaaaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaccatcttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaa 16654784  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  16654785 aatgtgag 16654792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12161410 - 12161214
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12161410 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatg 12161311  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12161310 tcctaagtggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatg 12161214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10603879 - 10603672
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  10603879 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatactgaggctgagaggataaacaccaagcaactaagggaaggtgtggaattgtcgggactaaggaattatg 10603780  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10603779 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccatcttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaa 10603680  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  10603679 aatgtgag 10603672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 15945483 - 15945692
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  15945483 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatg 15945582  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |    
T  15945583 tccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgata 15945682  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  15945683 aaaatgtgag 15945692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20157800 - 20157593
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  20157800 caatgaaaatgaaagatgagcatggatacataccgaggtggagaggataagcaccgagaaacaaaggcagggtgttgaattttcaggattaagaaatgat 20157701  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20157700 gtcctaaggggcaaccgcatatcccaagaaaataaccaaatgcttcagaacatgatgcaacactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaa 20157601  T
Q  201 aaatgtga 208  Q
    ||||||||    
T  20157600 aaatgtga 20157593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3340565 - 3340356
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  3340565 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatg 3340466  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  |    
T  3340465 tccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgata 3340366  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  3340365 aaaatgtgag 3340356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13505861 - 13505652
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  13505861 aatgaaaatacaagatgggcatggatgaaaaccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatg 13505762  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  |    
T  13505761 tccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccacaatgata 13505662  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  13505661 aaaatgtgag 13505652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13196769 - 13196569
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  13196769 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccaggctaaggaatgatgtcctaa 13196670  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13196669 gaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcagaacatgatgcaacatttccacctccaaggtcctccctatggaactcaat-aaaaatgtg 13196571  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  13196570 ag 13196569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 7599230 - 7599430
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  7599230 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 7599329  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  7599330 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 7599428  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  7599429 ag 7599430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 209
Target Start/End: Original strand, 10145892 - 10146085
Alignment:
Q  15 gatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 114  Q
    |||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  10145892 gatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctacggggcaa 10145991  T
Q  115 ccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  10145992 ccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtgag 10146085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 13689541 - 13689741
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13689541 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaa 13689640  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13689641 gaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatggaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 13689739  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  13689740 ag 13689741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12188415 - 12188215
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||     
T  12188415 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagaaccgagcaacaaaggcaaggtgttgacttatctgggctaagaaatgatgtcctac 12188316  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  12188315 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 12188217  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  12188216 ag 12188215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13188757 - 13188568
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  13188757 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataggcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 13188658  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || ||||||    
T  13188657 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaat 13188568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13137502 - 13137309
Alignment:
Q  15 gatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 114  Q
    |||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  13137502 gatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacagggcaa 13137403  T
Q  115 ccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  13137402 ccgcatatccaaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtgag 13137309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15630296 - 15630096
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||     
T  15630296 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccaggcaaagaaatgatgtcctac 15630197  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  15630196 ggggcaaccgcatatccgaagaaaaaaaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 15630098  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  15630097 ag 15630096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Original strand, 15643954 - 15644156
Alignment:
Q  9 atgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaag 108  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||| || || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |   |  ||||| ||||||||| |||    
T  15643954 atgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaactcttgagcataaggcatgatgtccaaag 15644053  T
Q  109 gggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||    
T  15644054 gggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgt 15644153  T
Q  207 gag 209  Q
    |||    
T  15644154 gag 15644156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16374819 - 16374640
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  16374819 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 16374720  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctat 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||    
T  16374719 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctttggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctat 16374640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12194829 - 12194629
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | | ||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||     
T  12194829 aatgaaaggtgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagaaccgagcaacaaaggcaaggtgttgacttatctgggctaagaaatgatgtcctac 12194730  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||| || |||||| |||||||||    
T  12194729 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggctctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 12194631  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  12194630 ag 12194629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10161527 - 10161325
Alignment:
Q  9 atgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||| ||||||||| ||    
T  10161527 atgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taaggcatgatgtccaaa 10161429  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatg 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||    
T  10161428 agggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatg 10161329  T
Q  206 tgag 209  Q
    ||||    
T  10161328 tgag 10161325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 199
Target Start/End: Original strand, 17386629 - 17386821
Alignment:
Q  7 aaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtccta 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||     
T  17386629 aaatgaaagatgggcatggatacacacctaggttgagaggataagcaacgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctacgaaatgatgtcctt 17386728  T
Q  107 aggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  17386729 aggggcaaccgcatctccgaagataataaccaaatgcttcgaattatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaatga 17386821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 3278337 - 3278504
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||  |||| ||||||    
T  3278337 caatgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggttgagaggataaacaccaagcaacaaagacaaggtgttgaattatccgggataagaaatgat 3278436  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttca 168  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3278437 gtcataagaggcaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacactttca 3278504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14446912 - 14446755
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| || |   |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||| | || ||     
T  14446912 caatgacaatgaaagatggacatggatacacaatgaggttgagaggataagcaccgagcaaaaaagggaaggtgttgaattatccggactacgaaacgac 14446813  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14446812 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataatcaaatgcttcggaacatgatgc 14446755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 13693758 - 13693954
Alignment:
Q  13 aagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggc 112  Q
    ||||||| |||||||| | | | |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||| ||||    
T  13693758 aagatggacatggatgtaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactatccggactccgaaatgatgtcctaaagggc 13693857  T
Q  113 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||| |||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13693858 aaccacatcatcgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgaaacacctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgag 13693954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3246800 - 3246671
Alignment:
Q  51 gcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaa 150  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |    || ||||| || ||||||||||||||||| || |||   ||| |||| || ||||||||  | ||    
T  3246800 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaataatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcgaataaatgaataaaacaatcaaatgctctgaaa 3246701  T
Q  151 catgatgcaccattttcacctccaaggtcc 180  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3246700 catgatgcaacaccttcacctccaaggtcc 3246671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 3988956 - 3989163
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3988956 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatg 3989055  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3989056 tcctaaggggcaaccgcatatctgaagaaaataaccaaatgcttcagaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 3989155  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  3989156 aatgtgag 3989163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 20392360 - 20392557
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||| ||||    
T  20392360 aatgaaaatgcacgatgggcatggatgaatatcgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaacgatg 20392459  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  20392460 tccaaaggggcaaccgcatatccgaagagaacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatga 20392557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 20236360 - 20236555
Alignment:
Q  13 aagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggc 112  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  20236360 aagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggc 20236459  T
Q  113 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  20236460 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtgag 20236555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21800013 - 21799811
Alignment:
Q  9 atgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||| ||||||||| ||    
T  21800013 atgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taaggcatgatgtccaaa 21799915  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||    
T  21799914 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatg 21799815  T
Q  206 tgag 209  Q
    ||||    
T  21799814 tgag 21799811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 8651892 - 8652090
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || || ||||| ||||||    
T  8651892 caatgagaatgaaagatgggcatggatgcacaccgaggttgaaatgataagcaccgagcaacaaaggcaatgtgttgaactatcggg-ctaagaaatgat 8651990  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  8651991 gtcctaagggacaaccgtatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacatctcaacctccaaggttctccttatggacctcaatgaa 8652090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19877015 - 19876814
Alignment:
Q  7 aaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtccta 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |   ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||||    
T  19877015 aaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtccaaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaactctccaggctaagaaatgatgtccta 19876916  T
Q  107 aggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgt 206  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  19876915 aggggcaaccacatgaccgaagaaaacaatcaaatgcttcgaaacatgatggagcacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaat-aaaaatgt 19876817  T
Q  207 gag 209  Q
    |||    
T  19876816 gag 19876814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8948864 - 8948700
Alignment:
Q  36 aggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataa 135  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  8948864 aggttgagagaataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgagttatccggactacgaaatgatgtcctaagaggcaaccgcatatcaatagaaaataa 8948765  T
Q  136 ccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
     ||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  8948764 tcaaatgcttcataacatgatgcaacacttccacctccaagatcctccttatggacctcaatgaa 8948700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20072272 - 20072071
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||| || |   |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||| || |||||| | ||||| ||||||     
T  20072272 aatgaaagatgggcatggatacacaatgaggtagagaggataaacaccgagaaacaaaggcaaggtgtcggattatccggactatgaaatgaggtcctac 20072173  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||||   || |||||||| |||||||    
T  20072172 ggggcaaccgcatcaccaaagaaaataatcaaaggctttggaatatgatgcaacacctacacctccaaggccctccctgcggacctcaatgacaaatgtg 20072073  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  20072072 ag 20072071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 19783886 - 19783935
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataag 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  19783886 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 19783935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21561796 - 21561595
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21561796 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatcgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 21561697  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  21561696 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatggaa 21561597  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  21561596 aa 21561595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 11218477 - 11218678
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11218477 aatgaaaatgtaatatgggcatggatgcatactgaggtcgagaggataagcacctagtaactaatgtaaggtgttgaattgtctggactaaggaatgatg 11218576  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11218577 tcctaagtggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaa 11218676  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  11218677 aa 11218678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 18010720 - 18010921
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||  |||| || |||||||||     
T  18010720 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggataagcaccgagcaacagaggcaaggtgtcgaattatccggtttaagaaacgatgtcctac 18010819  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18010820 ggggcaaccgcatatccgaacaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtg 18010919  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  18010920 ag 18010921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24856584 - 24856384
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||      
T  24856584 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtccttc 24856485  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  24856484 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 24856386  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  24856385 ag 24856384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22166901 - 22166692
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||  | |||    
T  22166901 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taagacacgat 22166803  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg-- 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||      
T  22166802 gtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgat 22166703  T
Q  199 aaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||    
T  22166702 aaaaatgtgag 22166692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20017586 - 20017377
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||  | |||    
T  20017586 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taagacacgat 20017488  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg-- 198  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||      
T  20017487 gtccaaaggggcaactgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgat 20017388  T
Q  199 aaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||    
T  20017387 aaaaatgtgag 20017377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22768476 - 22768279
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||  || | |||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||| |||||    
T  22768476 aatgaagatgcgagatgggaatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taaggcatgat 22768378  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  22768377 gtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatga 22768279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18447075 - 18447282
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| || | | |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||    
T  18447075 caatgataatgaaagatggacatggatacaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatcagggctccgaaatgat 18447174  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
      |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||| || || ||||||    
T  18447175 tccctaaggggcaacc-catatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcccctttatggaccttaatgaa 18447273  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  18447274 aaatgtgag 18447282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Original strand, 25966513 - 25966709
Alignment:
Q  3 atgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgt 102  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| |   | || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  25966513 atgataatgaaagatgagcatggatgcaaactgaagttgagaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgt 25966612  T
Q  103 cctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    | |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  25966613 cataagaggcaaccgcatgaccgaagaaaataaccaaatgcttcagaacatgatggagcaaattcacctccaaggtcctccttatggacctcaatga 25966709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 20169101 - 20169282
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  || | |||| || || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||| ||||     
T  20169101 aatgaagatgcgagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taaggcatgac 20169199  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20169200 gtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcc 20169282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30673058 - 30672912
Alignment:
Q  36 aggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataa 135  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||    
T  30673058 aggttgagaggataagaatcgagcaacaaaggaaaggtgttgaattatccgggctaggaaatgatgtcctaagaggcaaccacatatccgaagtgaataa 30672959  T
Q  136 ccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 183  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30672958 tcaaatgtttcggaacatgatgca-catttccacctccaaggtcctcc 30672912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23519039 - 23518889
Alignment:
Q  47 ataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttc 146  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||  | ||||| |||||||||| |||| |||| | |||  |||||||||||||  |||| || |    
T  23519039 ataagcaccgagtaacaaagacaaggtgttgaaatctccaggctaagaaatgatgtccaaaggagcaatcacatgaccgaagaaaataataaaattctcc 23518940  T
Q  147 ggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 197  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| || ||||||    
T  23518939 ggaacatgatgcaacaacttcacctacaaggtccaccttatggacctcaat 23518889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 29333477 - 29333685
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29333477 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaactaacgcaaagtgttgaattgtcgggactaaggaatgat 29333576  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29333577 gtcctaaggggaaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatggtgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcgatgaa 29333676  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  29333677 aaatgtgag 29333685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11348295 - 11348086
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  11348295 caatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgtcaaattatcgggactaaggaatgat 11348196  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctat-agaactcaatga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  11348195 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctataagaactcaatgc 11348096  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  11348095 aaaatgtgag 11348086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19766364 - 19766572
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19766364 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcaaacagaggtcgagaagataagcaccgagcaaaaaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgat 19766463  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  19766464 gtcctaaagggaaatcgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaagtcctccctatgaacctcaatgaa 19766563  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  19766564 aaatgtgag 19766572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 22098097 - 22098297
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  22098097 aatgaaagatgggcatggatgcaaatcgaggtacaaaggataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 22098196  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22098197 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22098295  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  22098296 ag 22098297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22100965 - 22100765
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  22100965 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 22100866  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22100865 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22100767  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  22100766 ag 22100765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 21826253 - 21826462
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||| ||||    
T  21826253 aatgaaaatgcacgatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataaccaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaacgatg 21826352  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  |    
T  21826353 tccaaaggggcaaccacatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgata 21826452  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  21826453 aaaatgtgag 21826462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16419940 - 16419740
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16419940 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaa 16419841  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  16419840 gaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 16419742  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  16419741 ag 16419740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 8313342 - 8313542
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||      
T  8313342 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtccttc 8313441  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8313442 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccacatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 8313540  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  8313541 ag 8313542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 21380967 - 21381167
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  21380967 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgtcgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 21381066  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  21381067 gaggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 21381165  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  21381166 ag 21381167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 21954953 - 21955153
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||| || | | ||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  21954953 aatgaaagatgggcatggatccaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 21955052  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  21955053 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttaggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 21955151  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  21955152 ag 21955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22034870 - 22034670
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | | ||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  22034870 aatgaaagattggcatggatgcaaaccgaggtacaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 22034771  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22034770 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaagttcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22034672  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  22034671 ag 22034670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8324191 - 8323991
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  8324191 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 8324092  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8324091 gaggcaaccgcatatccgaagaaaataaccgaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 8323993  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  8323992 ag 8323991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21942801 - 21942593
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||    
T  21942801 caatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattatgagggctccgaaatgat 21942702  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||| || |||||||||    
T  21942701 gtcctaaggggcaaccgcatatctaaatagaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcccctctatggacctcaatgaa 21942602  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  21942601 aaatgtgag 21942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 22289892 - 22290089
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||    
T  22289892 caatgaaaatgaaagatgggcatgaatgcaaactgaggttgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaattatccgggctaagaaatgat 22289991  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||| || ||| || ||||||||    
T  22289992 gtcct-aggggcaaccgcatatccgaagagcataatcaaatgcttcggaacatggtgcaacacttccacctccaaggtcccccttatggacctcaatga 22290089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21100153 - 21099952
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||| || |   |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||     
T  21100153 aatgaaagatgggcatggatacacaatgaggtagagaggataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgtcggattatccggactaagaaatgatgtcctac 21100054  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  21100053 ggggcaaccgcatcaccgaagaaaataatcaaatgcttcggaatatgatgcaacacctacacctccaaggccctccctgcagacctcaatgacaaatgtg 21099954  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  21099953 ag 21099952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22368824 - 22369032
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||    
T  22368824 caatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggatatgcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattatgagggctccgaaatgat 22368923  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||| || || | ||||    
T  22368924 gtcctaaggggcaaccgcatatccaaagagaataaccaaatgcatcggaacatgatgcaacacttccacctccagggtcccctctatggaccttagtgaa 22369023  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  22369024 aaatgtgag 22369032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 199
Target Start/End: Original strand, 22831958 - 22832107
Alignment:
Q  50 agcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcgga 149  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  22831958 agcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaattacccaggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccacatcttcgaagagaataatcaaatacttcgaa 22832057  T
Q  150 acatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  22832058 acatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaatga 22832107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20040353 - 20040224
Alignment:
Q  51 gcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcgga 149  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| ||||      
T  20040353 gcaccgagcaataaagacaaggtgttgaaatgatcagg-ctaagaaacgatttcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgtttcgat 20040255  T
Q  150 acatgatgcaccattttcacctccaaggtcc 180  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20040254 acatgatgcaacatcttcacctccaaggtcc 20040224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21749 - 21958
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21749 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggaaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgat 21848  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactc-aatga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21849 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcagaacatgatgcaccattttgacctccaaggtcctccctatagaactcaaatga 21948  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  21949 aaaatgtgag 21958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12549
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12349 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaatgtgttgaattgtcgggactaaggaattatg 12448  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12449 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 12548  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  12549 a 12549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3353484 - 3353692
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3353484 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcacaccgaggtcgagaggataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgat 3353583  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3353584 gtcctaaagggaaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagacctcaatgaa 3353683  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  3353684 aaatgtgag 3353692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15261432 - 15261251
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||  ||||||||||||    
T  15261432 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggcataaggaatgatg 15261333  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 183  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15261332 tccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcc 15261251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15864372 - 15864580
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| || |   |||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| || |||||| | || |||    
T  15864372 caatgaaaataaaagatggacatggatacacaatgaggttgagaggataagcactgagcaacaatgacaaggtgttgaattatccggactacgaaacgat 15864471  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  15864472 gtcctaaggggcaaccacatatccaaagaaaataactaaatgcttcggaacatgatgcaccacttccacctccaaggtcctccctatggacctccatgaa 15864571  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  15864572 aaatgtgag 15864580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 13821777 - 13821986
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||  | |||    
T  13821777 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taagacacgat 13821875  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg-- 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||      
T  13821876 gtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgat 13821975  T
Q  199 aaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||    
T  13821976 aaaaatgtgag 13821986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 15253256 - 15253420
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15253256 aggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgc 15253355  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    | |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  15253356 tccggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtgag 15253420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 22109834 - 22110034
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||      
T  22109834 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtccttc 22109933  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22109934 agggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22110032  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  22110033 ag 22110034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14687056 - 14686993
Alignment:
Q  51 gcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 114  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  14687056 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcagg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaa 14686993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 18071779 - 18071986
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18071779 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggactagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatg 18071878  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18071879 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatacttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaa 18071978  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  18071979 aatgtgag 18071986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20597186 - 20596979
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20597186 aatgaaaatgcaagacgggcatggatgcctaacgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatg 20597087  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20597086 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatacttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaac 20596987  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  20596986 aatgtgag 20596979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20603483 - 20603276
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20603483 aatgaaaatgcaagacgggcatggatgcctaacgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatg 20603384  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20603383 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatacttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaac 20603284  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  20603283 aatgtgag 20603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20792129 - 20791922
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20792129 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatacagaggccgagaggataagcaccaagaaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatg 20792030  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20792029 tcctaaggggcaaccgcatatccgaaggaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccatcttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaa 20791930  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  20791929 aatgtgag 20791922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20609802 - 20609595
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20609802 aatgaaaatgcaagacgggcatggatgcctaacgaggccgagaggataagcaccaagcaactaagacaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatg 20609703  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  20609702 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatacttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaac 20609603  T
Q  202 aatgtgag 209  Q
    ||||||||    
T  20609602 aatgtgag 20609595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25117492 - 25117283
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  25117492 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatattgaggtcgggaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatg 25117393  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |    
T  25117392 tccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgata 25117293  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  25117292 aaaatgtgag 25117283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25176583 - 25176374
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  25176583 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatattgaggtcgggaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatg 25176484  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |    
T  25176483 tccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgata 25176384  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  25176383 aaaatgtgag 25176374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30760988 - 30760779
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||| |||||||    
T  30760988 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaagaaatgatg 30760889  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |    
T  30760888 tccgaaggggtaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgata 30760789  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  30760788 aaaatgtgag 30760779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26846534 - 26846735
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26846534 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcacaccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgggaccaaggaatgat 26846633  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26846634 gtcctaaagggaaaccgcatatctgaagaaaataactaaatgcttcggaacatg-------attttcacctccaaggtcctccctatagacctcaatgaa 26846726  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  26846727 aaatgtgag 26846735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20439510 - 20439313
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  20439510 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaattggaataaggaatgatg 20439411  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  20439410 tccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctcgaaggtcctccatatggacctcaatga 20439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 15734408 - 15734608
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  15734408 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 15734507  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  15734508 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 15734606  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  15734607 ag 15734608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 20621037 - 20621237
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  20621037 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 20621136  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  20621137 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 20621235  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  20621236 ag 20621237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22318824 - 22318624
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  22318824 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgacgtcctaa 22318725  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22318724 ggggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22318626  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  22318625 ag 22318624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 23746925 - 23747114
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  23746925 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 23747024  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  23747025 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat 23747114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25008123 - 25007923
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  25008123 aatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 25008024  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  25008023 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgtttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 25007925  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  25007924 ag 25007923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24954523 - 24954328
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |   | |  ||||  | ||||    
T  24954523 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcataagcataagacaggatg 24954424  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 197  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  24954423 tccaaaggggcaaccgcatatctgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaat 24954328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 22947301 - 22947499
Alignment:
Q  4 tgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtc 103  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |   ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||  |||| |||||||||    
T  22947301 tgaaaatgaaagatggccatggatgcaaacggaggtttagaggataagcaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaaatatccggggtaagaaatgatgtc 22947400  T
Q  104 ctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||| ||| |  | |||||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  22947401 ctaaggggcaaccgcatatccgaagagaataataaaatgctttagaacatgatgcaacatctcaatctccaaggtccttcttatggacctcaatgaaaa 22947499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 209
Target Start/End: Original strand, 21387268 - 21387358
Alignment:
Q  119 atatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  21387268 atatccgaagagaataatcaaatgctttggaacatgatggagcacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaatgaaaaatgtgag 21387358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 21387177 - 21387254
Alignment:
Q  4 tgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaatt 81  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |   |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21387177 tgaaaatgaaaggtgggcatggatgcaaactgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtattgaatt 21387254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1006 - 1215
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaa-gatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatga 99  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1006 caataaaaatgcaaagatgggcatggatgcataccgaggtcgggaggataagcatcgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatga 1105  T
Q  100 tgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1106 tgtcctaaggggcaaccgcatatccgaataaaataaccaaatacttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccttatagaactcaatga 1205  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  1206 aaaatgtgag 1215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19321 - 19121
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19321 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatgccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaagaaatgatg 19222  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19221 tcctaagcggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaa 19122  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  19121 a 19121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 253189 - 253024
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||     
T  253189 aggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactatccggactcataaatgatgtcctaaagggcaaccacatcaccgaagagaataatcaaatgt 253090  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||||||| ||  |  ||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  253089 ttcggaacatgatgcaacacctcaacctccacggtcctcactatggacctcaacgaaaaatgtgag 253024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3402 - 3201
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3402 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatg 3303  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3302 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcaccttcaaggtcctccctatggacctcaatgaaa 3203  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  3202 aa 3201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 122243 - 122447
Alignment:
Q  5 gaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  122243 gaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaggggataagcaccaagcaactaaggtaaggtgttgaattgtcgggactaaggaataatgtcc 122342  T
Q  105 taaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaat 204  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122343 taacgggcgaccgcatatccgaagaaaataacaaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaat 122442  T
Q  205 gtgag 209  Q
    |||||    
T  122443 gtgag 122447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25733 - 25532
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  25733 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatactgaggtcgagaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaatcgacaggactaaggaataatg 25634  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25633 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggaccttaatgaaa 25534  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  25533 aa 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 90152 - 90352
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  90152 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggacgagaggataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatg 90251  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  90252 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcgaaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaa 90351  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  90352 a 90352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17867396 - 17867188
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||  | | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17867396 aatgataatgaaagatggacatggatgcgaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggctaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatg 17867297  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctat-agaactcaatgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17867296 tcctaaggggcaaccgcatacccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctataagaactcaatgaa 17867197  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  17867196 aaatgtgag 17867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24821414 - 24821241
Alignment:
Q  37 ggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaag-aaaataa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24821414 ggtcgagaggataagcaccgagcatcaaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaaataa 24821315  T
Q  136 ccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24821314 ccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgag 24821241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 116372 - 116581
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  116372 aatgaaaatgcgagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcatcgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatg 116471  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |    
T  116472 tccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgtttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgata 116571  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  116572 aaaatgtgag 116581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22046000 - 22045800
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  22046000 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 22045901  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22045900 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22045802  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  22045801 ag 22045800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 25356386 - 25356586
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  25356386 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 25356485  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  25356486 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 25356584  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  25356585 ag 25356586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24796641 - 24796432
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||| |||||    
T  24796641 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taaggcatgat 24796543  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg-- 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||      
T  24796542 gtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgat 24796443  T
Q  199 aaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||    
T  24796442 aaaaatgtgag 24796432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 27626468 - 27626668
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||      
T  27626468 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtccttc 27626567  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  27626568 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 27626666  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  27626667 ag 27626668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27770113 - 27769966
Alignment:
Q  36 aggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataa 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27770113 aggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaa 27770014  T
Q  136 ccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27770013 ccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcc 27769966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23160721 - 23160512
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    ||  ||||||| ||||    
T  23160721 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataaggaacgatg 23160622  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  |    
T  23160621 tccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcagaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgata 23160522  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  23160521 aaaatgtgag 23160512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23571978 - 23571769
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    ||  ||||||| ||||    
T  23571978 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataaggaacgatg 23571879  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  |    
T  23571878 tccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcagaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgata 23571779  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  23571778 aaaatgtgag 23571769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12754
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||    
T  12954 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaagaataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccgggctaataaatgatgtcctaa 12855  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  12854 ggggcaaccgcatatccaaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 12756  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  12755 ag 12754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 27630376 - 27630584
Alignment:
Q  3 atgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||  |||||||  ||||    
T  27630376 atgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataaggaacaatgt 27630475  T
Q  103 cctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aa 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||    
T  27630476 ccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaaaatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataa 27630575  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  27630576 aaatgtgag 27630584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26192969 - 26192761
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||    
T  26192969 caatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattatgagggctccgaaatgat 26192870  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||| || |||||||||    
T  26192869 gtcctaaggggcaaccacatatccaaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccagggtcccctctatggacctcaatgaa 26192770  T
Q  201 aaatgtgag 209  Q
    |||||||||    
T  26192769 aaatgtgag 26192761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 16774525 - 16774734
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | || | ||||  | |||    
T  16774525 aatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagca-taagacacgat 16774623  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg-- 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||      
T  16774624 gtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgattcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgat 16774723  T
Q  199 aaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||    
T  16774724 aaaaatgtgag 16774734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25146131 - 25145930
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||  |  |||| || || ||||||     
T  25146131 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggattagcaccgagcaacagaggcaagttgtcgaattatccagtttaagaaacgaagtcctac 25146032  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25146031 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccacttccacctccaaggtcctccctatcgacctcaatgaaaaatgtg 25145932  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  25145931 ag 25145930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25368965 - 25368760
Alignment:
Q  4 tgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtc 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  || | ||| |||||||||    
T  25368965 tgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggttcagaggataagcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaaatattcgggcaaagaaatgatgtc 25368866  T
Q  104 ctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaa 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||    
T  25368865 ctaagggccaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcagaacatgatgcaacatctcaacctccaaggtcctccttatggacctcaatgaataa 25368766  T
Q  204 tgtgag 209  Q
    ||||||    
T  25368765 tgtgag 25368760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 24170244 - 24170409
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  24170244 aggattagcactgagcaacaaaggcaaggtgtcgaactatccgggctaagaaacgatgtcctacggggcaaccacatatccgaagtgaataatcaaatgc 24170343  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24170344 ttcggaacatgatacaccatctcaacctccacggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgag 24170409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25372281 - 25372134
Alignment:
Q  52 caccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaac 151  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  25372281 caccgagcaacaaaggcaaggtattgaattatccgggctacgaaatgatgtccttaggggaaaccgcatctccgaagagaataatcaaatgcttcggagc 25372182  T
Q  152 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 199  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  25372181 atgatgcaacacttccacctccaaggtcatccttatggacctcaatga 25372134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25339403 - 25339253
Alignment:
Q  47 ataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttc 146  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||   || ||  |||||||||||| ||||||||| |||||  | || ||||| |||||||||||      
T  25339403 ataagcaccgagcaacaaatacaaggtgttgaaatggacgggctgcggaatgatgtccaaaggggcaatcgcatgactgaggaaaacaaccaaatgctct 25339304  T
Q  147 ggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 197  Q
    ||||||||||||| ||  |||| || |||||||| || ||| || ||||||    
T  25339303 ggaacatgatgcaacaccttcatctgcaaggtcccccttatggacctcaat 25339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 29362 - 29571
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  29362 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatg 29461  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--a 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |    
T  29462 tccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgata 29561  T
Q  200 aaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||    
T  29562 aaaatgtgag 29571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19580 - 19407
Alignment:
Q  37 ggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaag-aaaataa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19580 ggtcgagaggataagcaccgagcatcaaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaaataa 19481  T
Q  136 ccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19480 ccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgag 19407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 24438 - 24619
Alignment:
Q  2 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatg 101  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  24438 aatgaaaatacaagatgggaatggatgcatactgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatg 24537  T
Q  102 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 183  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24538 tccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcc 24619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 34 - 197
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34 aggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 133  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtga 208  Q
    ||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  134 ttcagaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtga 197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 61
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||  |||| || |||||||||     
T  262 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggattagcaccgagcaacagaggcaaggtgtcgaattatccggtttaagaaacgatgtcctac 163  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  162 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccacttccacctccaaggtccaccctatggacctcaatgaaaaatgtg 63  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  62 ag 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 115557 - 115720
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  115557 aggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggaaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgc 115655  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  115656 ttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtgag 115720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 119861 - 120024
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  119861 aggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggaaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgc 119959  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  119960 ttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtgag 120024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 11400 - 11604
Alignment:
Q  5 gaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||    
T  11400 gaaaatgcaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattattcgggctaagaaatgatgtcc 11499  T
Q  105 taaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaat 204  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11500 taaggggcaatcacatatccgaagaaaataatcgaatgcttcggaacatgatgtaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaat 11599  T
Q  205 gtgag 209  Q
     ||||    
T  11600 ctgag 11604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 10288 - 10486
Alignment:
Q  5 gaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcc 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  | || ||| ||||||    
T  10288 gaaaatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggtttagaaataatgtcc 10387  T
Q  105 taaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaa 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10388 taaggggcaatcgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccgactccaaggtcctccctatggaccccaatgaaaaa 10486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 12912 - 13112
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||    
T  12912 aatgtaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccaagctaagaaatgatgtcctaa 13011  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||    
T  13012 ggggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaccatgatgcaacacttccacctccaaggtcctcccgatggacctcaat-aaaaatgtg 13110  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  13111 ag 13112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32921 - 32717
Alignment:
Q  4 tgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtc 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||    
T  32921 tgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaactatccgggctaagaaatgatgtc 32823  T
Q  104 ctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaa 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32822 ctacggggcaaccgcatatccgaagagaataattaaattcttcggaacatgatgcaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaa 32723  T
Q  204 tgtgag 209  Q
    ||||||    
T  32722 tgtgag 32717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 132494 - 132635
Alignment:
Q  1 caatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgat 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  132494 caatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgat 132593  T
Q  101 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132594 gtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatg 132635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39080 - 38879
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | || ||  |||| || |||||||||     
T  39080 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggattagcaccgagcaacaaaggcaaggtgtcgaactatccggtttaagaaacgatgtcctac 38981  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38980 ggggtaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtg 38881  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  38880 ag 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1633
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  1496 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 1595  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1596 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctt 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 2155 - 2351
Alignment:
Q  13 aagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggc 112  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||||    
T  2155 aagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaattatccgggctccgaaatgatgtcctaaggggc 2254  T
Q  113 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||| |||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  2255 aaccacatcgccgaagagaataatcaaatgattcggaacatgatgcaacacctcaacctccaaggtcctcgctatggacctcaatgaaaaatgtgag 2351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4926 - 4730
Alignment:
Q  13 aagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggc 112  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||    ||||||||||||||||||    
T  4926 aagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccagactccaaaatgatgtcctaaggggc 4827  T
Q  113 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  4826 aaccacatcaccgaagagaataatcaaatgcttcggcacatgatgcaacacctaaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaattgtgag 4730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 335 - 134
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| | || || ||||| || ||||||||||    
T  335 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggcgaggaactatccgggctaagaaacgatgtcctaa 236  T
Q  108 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 207  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  235 agcgcaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacacctcaacctccaaggtcctccctacggacctcaatgaaaaatgtg 136  T
Q  208 ag 209  Q
    ||    
T  135 ag 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 44344 - 44507
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44344 aggataagcaccgagcaacaaaggcaaagtgttgaattatcagggctccgaaatgatgtcctaaggggcaacc-catatccgaagagaataaccaaatgc 44442  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||||  | || || |||||||||||||| || ||| || |||||| |||||||||||    
T  44443 ttcggaacatgatataacacttccacctccaaggtcc-ccttatggacctcaataaaaaatgtgag 44507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 51733 - 51896
Alignment:
Q  44 aggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51733 aggataagcaccgagcaacaaaggcaaagtgttgaattatcagggctccgaaatgatgtcctaaggggcaacc-catatccgaagagaataaccaaatgc 51831  T
Q  144 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||||  | || || |||||||||||||| || ||| || |||||| |||||||||||    
T  51832 ttcggaacatgatataacacttccacctccaaggtcc-ccttatggacctcaataaaaaatgtgag 51896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7829 - 7633
Alignment:
Q  13 aagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggc 112  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || |||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  7829 aagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaactatccggactccgaaataatgtcctaaagggc 7730  T
Q  113 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7729 aaccgcatcaccgaagagaataatcaaatgcttcagaacatgatgcaacacctcaacttccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgag 7633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 6798 - 6961
Alignment:
Q  46 gataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctt 145  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6798 gataagcaccgagcaataaaagcaagatgttgaattattcgggctaagaaatgatgtcctaaggggaaaccacatatccgaagagaataatcaaatgctt 6897  T
Q  146 cggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 209  Q
    || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||    
T  6898 cgaaacatgatgcaacatctcaacctccaaggtccaccctatggacctcaataaaaaatgtgag 6961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Original strand, 7759 - 7869
Alignment:
Q  98 gatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  7759 gatgtcctacggggcaagcgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaatatgatgcacca-ttccacctccaaggtcctccctatggacctccat 7857  T
Q  198 gaaaaatgtgag 209  Q
    ||||||||||||    
T  7858 gaaaaatgtgag 7869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8325 - 8123
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataag-caccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtccta 106  Q
    |||| ||||||||||||||| || |   |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||    
T  8325 aatgaaagatgggcatggatacacaatgaggtagagaggataaaacaccgagcaacaaaggcaaggtgtcggattatccggactaagaaatgatgtccta 8226  T
Q  107 aggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgt 206  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |   || |||||||| ||||||    
T  8225 cggggcaaccgcatcaccgaagaaaataatcaaatgcttcggaatatgatgcaacacctacacctccaaggccctccatgcggacctcaatgacaaatgt 8126  T
Q  207 gag 209  Q
    |||    
T  8125 gag 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Original strand, 5587 - 5689
Alignment:
Q  106 aaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||    
T  5587 aaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacaaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaaccgccaaggtcctccctatggacctccat-aaaaatg 5685  T
Q  206 tgag 209  Q
    ||||    
T  5686 tgag 5689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 111
Target Start/End: Original strand, 4980 - 5083
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  4980 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 5079  T
Q  108 gggg 111  Q
    ||||    
T  5080 gggg 5083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 28 - 104
Alignment:
Q  135 accaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||    
T  28 accaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgag 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 21792 - 21889
Alignment:
Q  8 aatgcaagatgggcatggatgcatatctaggtcgagaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcct 105  Q
    |||| |||||||||||||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  | || |||||||| ||||||||    
T  21792 aatgaaagatgggcatggatgcaaacggaggttcagaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaaataaccgggctaaggaacgatgtcct 21889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 114
Target Start/End: Original strand, 1537 - 1600
Alignment:
Q  51 gcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 114  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||   || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1537 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaa 1600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University