View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7504_low_31 (Length: 389)

Name: NF7504_low_31
Description: NF7504
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7504_low_31
NF7504_low_31
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (13-374)||(17865731-17866092)
chr7 (133-374)||(18973063-18973304)
chr7 (51-287)||(45289717-45289953)
chr7 (49-287)||(4543437-4543675)
chr7 (49-287)||(26461090-26461328)
chr7 (49-287)||(37414660-37414898)
chr7 (29-349)||(1636099-1636416)
chr7 (51-279)||(22231877-22232105)
chr7 (51-279)||(22254634-22254862)
chr7 (132-348)||(20434621-20434834)
chr7 (152-252)||(13907080-13907180)
chr7 (86-131)||(22082825-22082870)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (13-374)||(649849-650210)
chr4 (13-374)||(646572-646933)
chr4 (13-374)||(22883555-22883917)
chr4 (13-374)||(22935219-22935581)
chr4 (13-252)||(7394138-7394377)
chr4 (49-287)||(49639063-49639301)
chr4 (49-287)||(5671211-5671449)
chr4 (49-287)||(15404337-15404575)
chr4 (53-280)||(52005764-52005990)
chr4 (49-287)||(56196169-56196407)
chr4 (126-287)||(26062153-26062314)
chr4 (104-287)||(19825015-19825198)
chr4 (13-98)||(15444787-15444872)
chr4 (168-252)||(22092508-22092592)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (13-374)||(14792904-14793265)
chr6 (134-374)||(15535670-15535910)
chr6 (13-252)||(12982937-12983176)
chr6 (39-286)||(13020506-13020752)
chr6 (51-280)||(23381419-23381648)
chr6 (86-280)||(14966897-14967091)
chr6 (86-251)||(32110369-32110534)
chr6 (13-287)||(28893714-28893988)
chr6 (133-330)||(23841974-23842171)
chr6 (133-287)||(22958435-22958589)
chr6 (133-287)||(23829803-23829957)
chr6 (133-287)||(18140503-18140659)
chr6 (165-321)||(12979405-12979561)
chr6 (39-119)||(12979565-12979645)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (13-374)||(34407050-34407411)
chr5 (13-280)||(30762018-30762285)
chr5 (13-280)||(19686777-19687044)
chr5 (29-349)||(22036491-22036808)
chr5 (104-280)||(2453990-2454166)
chr5 (104-280)||(28565190-28565366)
chr5 (109-349)||(36333034-36333274)
chr5 (131-287)||(22939661-22939817)
chr5 (104-280)||(26548774-26548950)
chr5 (94-287)||(21334944-21335137)
chr5 (165-360)||(18017025-18017226)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (13-374)||(13493769-13494130)
chr1 (13-252)||(22455999-22456238)
chr1 (13-287)||(49716986-49717260)
chr1 (29-349)||(28141260-28141577)
chr1 (29-349)||(21913643-21913960)
chr1 (177-252)||(39473221-39473296)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (13-252)||(224314-224553)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (13-370)||(12574727-12575084)
chr8 (13-252)||(31981955-31982194)
chr8 (28-279)||(23644446-23644697)
chr8 (62-287)||(22173190-22173415)
chr8 (49-280)||(25594143-25594374)
chr8 (13-280)||(39659189-39659456)
chr8 (94-280)||(33879845-33880031)
chr8 (88-277)||(23946392-23946581)
chr8 (49-239)||(18825187-18825377)
chr8 (141-280)||(12583745-12583884)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (51-287)||(24235720-24235956)
chr2 (51-287)||(25871398-25871634)
chr2 (49-280)||(1505898-1506129)
chr2 (49-287)||(25958953-25959189)
chr2 (49-287)||(9187900-9188136)
chr2 (29-349)||(35077546-35077863)
chr2 (13-287)||(45454449-45454723)
chr2 (51-280)||(16790002-16790231)
chr2 (132-358)||(13613975-13614201)
chr2 (189-280)||(31430013-31430104)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (49-287)||(10882203-10882441)
chr3 (21-280)||(47052166-47052425)
chr3 (13-287)||(9155416-9155690)
chr3 (49-280)||(2776215-2776446)
chr3 (53-280)||(13555842-13556069)
chr3 (49-280)||(24126221-24126452)
chr3 (13-287)||(55034223-55034495)
chr3 (49-241)||(16183959-16184151)
chr3 (53-279)||(28328086-28328312)
chr3 (104-287)||(10960598-10960781)
chr3 (104-287)||(10964105-10964288)
chr3 (51-232)||(18644052-18644233)
chr3 (133-314)||(19303899-19304081)
chr3 (132-360)||(26821443-26821670)
chr3 (166-280)||(26552326-26552439)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (50-280)||(7649-7879)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (49-256)||(11657-11864)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (62-287)||(20703-20928)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (13-287)||(26579-26853)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (51-279)||(293649-293877)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (52-349)||(36464-36758)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (49-280)||(11936-12167)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (104-256)||(3144-3296)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (49-192)||(117788-117931)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (124-316)||(847-1039)
[»] scaffold2047 (1 HSPs)
scaffold2047 (122-236)||(87-200)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (177-252)||(1061-1136)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17866092 - 17865731
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866092 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 17865993  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865992 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattgcaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 17865893  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865892 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagactgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 17865793  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865792 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 17865731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 133 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18973304 - 18973063
Alignment:
Q  133 tcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatct 232  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18973304 tcaacatagattataactctcaacttcaaaatattttagatggtttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgagaaatttgaagttcaatgtggtaatct 18973205  T
Q  233 tgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgttggt 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  18973204 tgttgagaaagcatacgagtctcagcaaaagttggttgagatggagactgagtgtcaagctactttggtggacgacaatccacaagtaatgagggttggt 18973105  T
Q  333 ctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18973104 ctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 18973063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45289953 - 45289717
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45289953 aaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggcgaatcaaccatgtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 45289854  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45289853 ctcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcacatga 45289754  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    ||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  45289753 gtctcagaagaagctggttcagatggagactgagtgt 45289717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Original strand, 4543437 - 4543675
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||| || |||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4543437 ataaaatctcaagattaaatgagaaatgtggtcgttatgagggagatcaaccaagtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 4543536  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4543537 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagttttatttgagaagtttgatgttcagtgttgtaatcttgttgagaaagcacat 4543636  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4543637 gagtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgt 4543675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Original strand, 26461090 - 26461328
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |  ||||||||   || || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26461090 ataaaatctcaagattaaatgagggatgtggttgttatgagggggatgaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 26461189  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26461190 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagttttatttgagaagtttgatgttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcacat 26461289  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26461290 gagtctcagatgaagttggttcagatggagactgagtgt 26461328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37414898 - 37414660
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| ||||   ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37414898 ataaaatctcaagattaaatgagagatgtggtcgttacgagggggatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 37414799  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  37414798 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagttttatttgagaagtttgatgttcagtgtagtaatcttgttgagaaagcacat 37414699  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37414698 gagtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgt 37414660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1636416 - 1636099
Alignment:
Q  29 gaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagag 128  Q
    |||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||    | ||  ||||||||||||  |||||||    
T  1636416 gaagataaaacaatgggacaatcaaatctcaagattaaatgcgagatgtgatcttcacgaggcgaatcatcagggtacagattgtgaagggctgaaagag 1636317  T
Q  129 gtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggta 228  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  1636316 cttatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatattaaatcaagttccatttgagaaatttgaagttcagtgtggtg 1636217  T
Q  229 atcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgt 328  Q
    ||||||||  ||||||  |||||| | || |  || |||||||||||||||| |||||| |   | |||||||||| || ||| |||||||||  |||||    
T  1636216 atcttgttcggaaagcgaatgagtgtgagaagcagctggttgagatggagactgagtgtca---tgttgtggtggaagaaaatgcacaagtgaggagtgt 1636120  T
Q  329 tggtctctacctgaagtctca 349  Q
    | |||||||  ||||||||||    
T  1636119 tcgtctctatttgaagtctca 1636099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22232105 - 22231877
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| || || || |||||   ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232105 aaaatctcgagattaaatgagagatatggtcgttgtgaggtggatcaaccatgtagtaattgtgaagagaagaaagaggttatcaacatcgattacaata 22232006  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  22232005 ctcaacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgaaaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacatga 22231906  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggaga 279  Q
    ||||||    ||||||||| |||||||||    
T  22231905 gtctcaaaggaagttggttaagatggaga 22231877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 279
Target Start/End: Original strand, 22254634 - 22254862
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    |||||||| |||||||||  ||| |||| || || |||||   ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22254634 aaaatctcgagattaaatgagaggtgtggtcgttgtgaggtggatcaaccatgtagtaattgtgaagagaagaaagaggttatcaacatcgattacaata 22254733  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  22254734 ctcaacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgaaaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacatga 22254833  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggaga 279  Q
    ||||||    ||||||||| |||||||||    
T  22254834 gtctcaaaggaagttggttaagatggaga 22254862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 348
Target Start/End: Original strand, 20434621 - 20434834
Alignment:
Q  132 atcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  20434621 atcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatattaaatcaagttacatttgagaaatttgaagttcagtgtggtgatc 20434720  T
Q  232 ttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgttgg 331  Q
    |||||   |||||| |||| | | || |  || |||||||||||||||| |||||| |   | |||||||||| || ||| | |||||||  ||||||||    
T  20434721 ttgttcgaaaagcaaatgaatgtgagaagcagctggttgagatggagactgagtgtca---tgttgtggtggaagaaaatgctcaagtgaggagtgttgg 20434817  T
Q  332 tctctacctgaagtctc 348  Q
    |||||||||||||||||    
T  20434818 tctctacctgaagtctc 20434834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13907180 - 13907080
Alignment:
Q  152 tcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgag 251  Q
    ||||||||||| |||||||||| | || || ||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  13907180 tcaacttcaaactattttagatgaatttttaatgtccaatcgagttttatatgataaatttgacgttccgtgtggtgatcttgttgagaaaacagatgag 13907081  T
Q  252 t 252  Q
    |    
T  13907080 t 13907080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22082870 - 22082825
Alignment:
Q  86 tgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtg 131  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22082870 tgaggcgaatcaactaggtagtgattgtgaagggaagaaagaggtg 22082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 650210 - 649849
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650210 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 650111  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650110 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 650011  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650010 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcaacaaaagttggttgagatggagactgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 649911  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  649910 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 649849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 646933 - 646572
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  646933 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 646834  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  646833 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 646734  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  646733 gaagtttaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagactgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 646634  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  646633 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcagatggggtctgaagaactcact 646572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22883917 - 22883555
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||    | ||   ||||    
T  22883917 aatatttgctatctcgcaagataaaacattgggatgataagatctcaagattaaatgtgagatgtgatttttatgaggcgagtcatcagggtacaaattg 22883818  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  22883817 tgaagggctgaaagagtttatcaacatcgattataatactcagcttcaaaatattttagatgatttcttgagattaaatcaaatttcatttgagaaattt 22883718  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  22883717 gaagttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcatatgagtctcatcaaaagttggttgagatggagactgagtgtcaggctactgtggttgacgacagtc 22883618  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaat-ggggtctgaagaactcact 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22883617 cacaagtgatgagtgttggtctctacctgaagcctcaacaaatgggggtttgaagaactcact 22883555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22935581 - 22935219
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||    | ||   ||||    
T  22935581 aatatttgctatctcgcaagataaaacattgggatgataagatctcaagattaaatgtgagatgtgatttttatgaggcgagtcatcagggtacaaattg 22935482  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  22935481 tgaagggctgaaagagtttatcaacatcgattataatactcagcttcaaaatattttagatgatttcttgagattaaatcaaatttcatttgagaaattt 22935382  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  22935381 gaagttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcatatgagtctcatcaaaagttggttgagatggagactgagtgtcaggctactgtggttgacgacagtc 22935282  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaat-ggggtctgaagaactcact 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22935281 cacaagtgatgagtgttggtctctacctgaagcctcaacaaatgggggtttgaagaactcact 22935219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7394377 - 7394138
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7394377 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcaacgataaattctcaagattaaatatgagatgtgatctttatgaggaaaatcaaacagataatgattg 7394278  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7394277 cgaagggaagaaagaggtggtcaacatagattataactctcaacttcaaaatattttagatgatttattgatgtcaaatcaagtttcatttgagaagttt 7394178  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7394177 gatgttctgtgtggtaatcttgttgagaaagcagatgagt 7394138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49639301 - 49639063
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||   || || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49639301 ataaaatctcaagattaaatgagggatgtggtcgttatgagggggatgaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 49639202  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49639201 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagttttatttgagaagtttgatgttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcacat 49639102  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49639101 gagtctcagatgaagttggttcagatggagactgagtgt 49639063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Original strand, 5671211 - 5671449
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5671211 ataaaatctcaagattaaatgagagatgtggtcgttatgagggggatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 5671310  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5671311 tactcaacttaaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcacat 5671410  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5671411 gagtctcagaggaagctggttcagatggagactgagtgt 5671449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15404575 - 15404337
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15404575 ataaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtggatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 15404476  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||    
T  15404475 tactcaacttcaaaatattttagatgttttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgaaaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgcaaaagcacat 15404376  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    ||||||||    | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  15404375 gagtctcaaaggatgttggttaagatggagactgagtgt 15404337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52005990 - 52005764
Alignment:
Q  53 aatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatact 152  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52005990 aatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggcgaatcaacctggtagtaattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatact 52005891  T
Q  153 caacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  52005890 caacttcaaaatattttagat-gtttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaagacacatgagt 52005792  T
Q  253 ctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    ||||    ||||||||| ||||||||||    
T  52005791 ctcaaatgaagttggttaagatggagac 52005764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Original strand, 56196169 - 56196407
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| || || |||||   |||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56196169 ataaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcattgtgaggtggatcaactaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcgacatcgattacaa 56196268  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||    
T  56196269 tactcaacttcaaaatattttagatgacttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtgatgatcttgttgagaaagcacat 56196368  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  56196369 gagtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgt 56196407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26062314 - 26062153
Alignment:
Q  126 gaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  26062314 gaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcactgtg 26062215  T
Q  226 gtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26062214 gtgattttgttgagaaagcacatgagtctcatagaaagttggttcagatggagactgagtgt 26062153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Original strand, 19825015 - 19825198
Alignment:
Q  104 tagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcattt 203  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19825015 tagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcaattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcattt 19825114  T
Q  204 gaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    || || ||||| ||||| |||||| |||||| ||  |||||| |||||||||    |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19825115 gagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgctgcaaaagcacatgagtctctaagaaagctggttcagatggagactgagtgt 19825198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15444872 - 15444787
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  15444872 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgaccataaaatctcaaaattaaatgagagatgtggtcgttatgaggcgaatcaa 15444787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22092592 - 22092508
Alignment:
Q  168 ttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    |||||| | ||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  22092592 ttagatgaattcttgaggtccaatcgagtttcacttgataaatttgaggttcagtgtggtgatcttgttgaggaaacagatgagt 22092508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 14792904 - 14793265
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14792904 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 14793003  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14793004 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcaattgaaaaattt 14793103  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14793104 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcaggaaaagttggttgagatggagactgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 14793203  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14793204 cacatgtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 14793265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 134 - 374
Target Start/End: Original strand, 15535670 - 15535910
Alignment:
Q  134 caacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatctt 233  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15535670 caacatagattacaactctcaacttcaaaatattttagacgatttctttatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcagtgtggtaatctt 15535769  T
Q  234 gttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgttggtc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15535770 gttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagactgagtgtcaggctactgtggtggacgataatccacaagtgataagtgttggtc 15535869  T
Q  334 tctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15535870 tctacctgaagtctcaacaaatggggtctgaagaactcact 15535910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12983176 - 12982937
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12983176 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgatgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacaaatagtgattg 12983077  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  12983076 tgaagggaagaaagaggtggtcaacatagattataactgtcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatttcaaatcaagtttcatttgagaagttt 12982977  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12982976 gatgttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcagatgagt 12982937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13020752 - 13020506
Alignment:
Q  39 cattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaaca 138  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13020752 cattgggacgataaaatttcaatattaaatgcgatatgtgatcattatgaggcaaatcaatcaggtagtgattgtgaagggaagaaataggtgatcaaca 13020653  T
Q  139 tcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttga 238  Q
    || |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | | ||| || ||||||||||    
T  13020652 tcaattacaata-acaacttcaaaatattttagatgatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgcttattgtagtgatcttgttga 13020554  T
Q  239 gaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtg 286  Q
    |||| |||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13020553 gaaatcatacgagtctaaaaaaaagttggttcagatggagaccgagtg 13020506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23381648 - 23381419
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23381648 aaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtagatcaatcaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatagattacaata 23381549  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  23381548 ctcaacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatctaattgagaaagcacatga 23381449  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    ||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  23381448 gtctcaaaggaagttggttaagatggagac 23381419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 280
Target Start/End: Original strand, 14966897 - 14967091
Alignment:
Q  86 tgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatg 185  Q
    |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  14966897 tgaggcgaatcaattaggtagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtg 14966996  T
Q  186 tcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||  || ||||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  14966997 tcaaatcaagtgtcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgatgagaagacacatgagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 14967091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Original strand, 32110369 - 32110534
Alignment:
Q  86 tgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatg 185  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32110369 tgaggcaaatcaaccaggtagtggttgtgaagggaagaaagaggtggtcaacatagattataactctcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatg 32110468  T
Q  186 tcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgag 251  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32110469 tcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgtttagtgtggtaatcttgttgagaaagcagatgag 32110534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28893988 - 28893714
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||  || |||  ||| ||||| |||| |||||||||  |||||||| || |||| |||    |||  ||| |||| ||||    
T  28893988 aatatatgctatctttgaagatagaatatttggacaataaattctcgagattaaatgagagatgtggtcgttataaggtggttcatccaggtagtaattg 28893889  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||    
T  28893888 tgaagagaagaaataggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatatttttgatgatttcttggtgtgaaatcaagtttcatttgagaagttt 28893789  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    ||  |||| |||||  |||||||||  |||||| |||||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28893788 gatattcagtgtggcgatcttgttgcaaaagcacatgagtctcagaggaagctggttcagatggagactgagtgt 28893714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23842171 - 23841974
Alignment:
Q  133 tcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatct 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||| ||||    
T  23842171 tcaacatagattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatcttcagtgtggtgatct 23842072  T
Q  233 tgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgttg 330  Q
    | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| | |  ||||||||||| || |||||  ||||||  |||||||    
T  23842071 tattgagaaagcacatgagtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgtcacgagattgtggtggaagaaaatcccaaagtgaagagtgttg 23841974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 287
Target Start/End: Original strand, 22958435 - 22958589
Alignment:
Q  133 tcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatct 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||  |||| |||||| ||||    
T  22958435 tcaacatagattacaatactcaacttcaaaaaaatttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttaatttgagaagtttgatattcagtgtggtgatct 22958534  T
Q  233 tgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22958535 tgttgagaaagcacatgagtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgt 22958589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23829957 - 23829803
Alignment:
Q  133 tcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatct 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||  |||| |||||| ||||    
T  23829957 tcaacatagattacaatactcaacttcaaaaaaatttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttaatttgagaagtttgatattcagtgtggtgatct 23829858  T
Q  233 tgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23829857 tgttgagaaagcacatgagtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgt 23829803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18140659 - 18140503
Alignment:
Q  133 tcaacatcgattacaata--ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaat 230  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||| ||    
T  18140659 tcaacatagattacaatatactcaacttcaaaatattttagatgattttttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatcttcagtgtggtgat 18140560  T
Q  231 cttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  18140559 tttgatgagaaagcacatgagtctcagaggaagttggttcagacggagactgagtgt 18140503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12979561 - 12979405
Alignment:
Q  165 attttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagt 264  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | | ||| || |||||||||| ||| |||| |||||| |  ||||||    
T  12979561 atttttgatgatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgcttagtgtagtgatcttgttgaaaaatcatacgagtctaaaaaaaagt 12979462  T
Q  265 tggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtga 321  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | |   |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12979461 tggtttagatggagaccaagtgtcacgaggttgtagtggaagacaatccacaagtga 12979405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12979645 - 12979565
Alignment:
Q  39 cattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaaggg 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  12979645 cattgggacgataatatctcaatattaaatgcgatatgtgatcattatgaggcaaatcaatcaggttgtgactgtgaaggg 12979565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 34407050 - 34407411
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34407050 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataagatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacaaatagtgattg 34407149  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34407150 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 34407249  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34407250 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcaacaaaagttggttgagatggagactgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 34407349  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34407350 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 34407411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 30762018 - 30762285
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  30762018 aatatatgctatctttgaagataaaatattgggacaataaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggctaatcaacaaggtagtgattg 30762117  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||    
T  30762118 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattataatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtgtcatttgagaagttt 30762217  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  30762218 gatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacatgagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 30762285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 19686777 - 19687044
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||| || |||||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  19686777 aatatatgctatctttgaagataaaatattgggacaataaaatttcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggctaatcaactaggtagtgattg 19686876  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||    
T  19686877 tgaaggaaagaaagaggtgatcaacatcgattataatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtgtcatttgagaagttt 19686976  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  19686977 gatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacatgagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 19687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 22036491 - 22036808
Alignment:
Q  29 gaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagag 128  Q
    |||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||    | ||  ||||||||||||  |||||||    
T  22036491 gaagataaaacaatgggacaatcaaatctcaagattaaatgcgagatgtgatcttcacgaggcgaatcatcagggtacagattgtgaagggctgaaagag 22036590  T
Q  129 gtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggta 228  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  22036591 cttatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatattaaatcaagttccatttgagaaatttgaagttcagtgtggtg 22036690  T
Q  229 atcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgt 328  Q
    ||||||||  ||||||  |||||| | || |  || |||||||||||||||| |||||| |   | |||||||||| || ||| |||||||||  |||||    
T  22036691 atcttgttcggaaagcgaatgagtgtgagaagcagctggttgagatggagactgagtgtca---tgttgtggtggaagaaaatgcacaagtgaggagtgt 22036787  T
Q  329 tggtctctacctgaagtctca 349  Q
    | |||||||  ||||||||||    
T  22036788 tcgtctctatttgaagtctca 22036808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 280
Target Start/End: Original strand, 2453990 - 2454166
Alignment:
Q  104 tagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcattt 203  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2453990 tagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcattt 2454089  T
Q  204 gaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  2454090 gataagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacatgagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 2454166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28565366 - 28565190
Alignment:
Q  104 tagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcattt 203  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28565366 tagtaattgtaaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaaccaagtttcattt 28565267  T
Q  204 gaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  28565266 gataagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacaggagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 28565190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 349
Target Start/End: Original strand, 36333034 - 36333274
Alignment:
Q  109 attgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  36333034 attgtgaagggaagaaagaggtgatctacatcgattacaactctcaactttaaaatattttagatgaattcttgaggttaaatcgagtttcatttgataa 36333133  T
Q  209 atttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgac 308  Q
    |  ||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||   | || | ||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| ||     
T  36333134 aactgaagttcagtgtggtggttttgttgagaaagtaaatgaacatgagaagaagtttgttgagataaagaccgagtgtcatgctattgtggtggaagaa 36333233  T
Q  309 aatccacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctca 349  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36333234 aatccgcaagtaaggagtgttggtctctacctgaagtctca 36333274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22939817 - 22939661
Alignment:
Q  131 gatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||  |||| |||||||||    
T  22939817 gatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcatatcaagttttatttgagaagtttgatattcagtgtggtaat 22939718  T
Q  231 cttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22939717 cttgttgagaaagcacatgagtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgt 22939661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 280
Target Start/End: Original strand, 26548774 - 26548950
Alignment:
Q  104 tagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcattt 203  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  26548774 tagtaattgtaaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaaccaattttcattt 26548873  T
Q  204 gaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  26548874 gataagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacaggagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 26548950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21335137 - 21334944
Alignment:
Q  94 atcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatca 193  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  21335137 atcaaccaggtagtaattgtgtagagaagaaagaggtgatcaacattgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatga 21335038  T
Q  194 agtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||| |    ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21335037 agtttcatttgataagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaagacacatgagtctaaaaggaagctggttcagatggagactgagtgt 21334944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 360
Target Start/End: Original strand, 18017025 - 18017226
Alignment:
Q  165 attttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagt 264  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||||| ||| ||||||| |||| | | || |  |||    
T  18017025 attttagatgaattcttgagatcaaataaagtttcatttgataaatttgaggtttagtgtggtgatcttattgggaaagcaaatgaatgtgagaagcagt 18017124  T
Q  265 tggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtg------gtggacgacaatccacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggg 358  Q
    ||||||||||||| || |||||| | | | |||||      || || || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  18017125 tggttgagatggaaactgagtgtcatgttgttgtgatggaagtcgaagaaaaaccacaagtgatgagtgttggtctcgacctgaagtctcaaccaatggg 18017224  T
Q  359 gt 360  Q
    ||    
T  18017225 gt 18017226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 13493769 - 13494130
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493769 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 13493868  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  13493869 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgagaagttt 13493968  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  13493969 gatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagtttgttgagatggagactgagtgtccggctactatggtggacgacaatc 13494068  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaactcact 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13494069 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcaacaaatggggtctgaagaactcact 13494130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22456238 - 22455999
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22456238 aatatatgctatctgtgaagatgaaatattgcgatgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatgtttatgaggcaaatcaaacatataatgattg 22456139  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22456138 tgaagggaagaaagtggtggtcaacatagattataactctcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgagaagttt 22456039  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22456038 gatgttcagtgtggtaatcttgttgagaaagcagatgagt 22455999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 49716986 - 49717260
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||  ||  |||  |||||||||   |||||||  ||| |||| || || |||||| |||||| | |||| ||||||    
T  49716986 aatatatgctatctctgaagatcaaatgtttggacagtaaaatctcgttattaaatgagagttgtggtcgttgtgaggcgaatcaaccggatattgattg 49717085  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  49717086 tgaaggaaagaaagaggtaatcaacatcgattacaatactcaacttcaaactattttagatgatttattggtgtcaaatcaagttgcatttgagaagttt 49717185  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    || ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||| || ||||||    
T  49717186 gatgttctgtgtggtgatcttgttgagaaagcacatgagtctcagagaaagttagttcagatggatactgagtgt 49717260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28141577 - 28141260
Alignment:
Q  29 gaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagag 128  Q
    |||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||    | ||  ||||||||||||  |||||||    
T  28141577 gaagataaaacaatgggacaatcaaatctcaagattaaatgcgagatgtgatcttcacgaggcgaatcatcagggtacagattgtgaagggctgaaagag 28141478  T
Q  129 gtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggta 228  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  28141477 cttatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatattaaatcaagttccatttgagaaatttgaagttcagtgtggtg 28141378  T
Q  229 atcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgt 328  Q
    ||||||||  | ||||  |||||| | || |  || |||||||||||||||| |||||| |   | |||||||||| || ||| |||||||||  |||||    
T  28141377 atcttgttcgggaagcgaatgagtgtgagaagcagctggttgagatggagactgagtgtca---tgttgtggtggaagaaaatgcacaagtgaggagtgt 28141281  T
Q  329 tggtctctacctgaagtctca 349  Q
    |  ||||||  ||||||||||    
T  28141280 tcatctctatttgaagtctca 28141260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21913960 - 21913643
Alignment:
Q  29 gaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagag 128  Q
    |||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||   || ||  ||||||||||||  |||||||    
T  21913960 gaagataaaacaatgggacaatcaaatctcaagattaaatgtgagatgtgatcttcatgaggtgaatcatcaaggtacagattgtgaagggctgaaagag 21913861  T
Q  129 gtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggta 228  Q
     | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  21913860 cttatcaacatcaattacaatactcagcttcaaaatattttggatgatatcttgatattaaatcaagtttcatttgagaaatttgaagttcagtgtggtg 21913761  T
Q  229 atcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgt 328  Q
    ||||||||| ||||||  |||| | | || |  || |||||||||||||||| | |||| |   | |||||||||| || ||| |||||||||  | |||    
T  21913760 atcttgttgggaaagcgaatgaatgtgagaagcagctggttgagatggagactgggtgtca---tgttgtggtggaagaaaatgcacaagtgaggaatgt 21913664  T
Q  329 tggtctctacctgaagtctca 349  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  21913663 tggtctctatctgaagtctca 21913643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39473296 - 39473221
Alignment:
Q  177 ttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  39473296 ttcttgaggtccaatcaagtttcatttgatgaatttgaagtttagtgcggtgatcttatttagaaagcaaatgagt 39473221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 224314 - 224553
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224314 aatatttgctatctgtgaagttgaaacattacgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 224413  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  224414 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttattgatgtcaaatcaagtttcatttgagaagttt 224513  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  224514 gatgtttagtggggtaatcttgttgagaaagcagatgagt 224553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12575084 - 12574727
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| ||||||||  |||||| | |||||| ||| ||||| || |||||||||||  || || |||||||||||||| |||  |    | |||||||||    
T  12575084 aatatctgctatcttggaagataagacattgggactataaactcgcaagattaaatgtgaaatttgatctttatgaggaaaagtatcagggtagtgattg 12574985  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    | ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12574984 taaagggaataaagaggcactcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgattttttgatgtcaaatcaagtttcatttaagaaattt 12574885  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatc 312  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  12574884 gaagttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcatatgagtctcagaagaatttggttgagatggagaccgagtgtcaggctactgtggtggaagacaatc 12574785  T
Q  313 cacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctcagcaaatggggtctgaagaact 370  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  12574784 cacaagtgatgaatgttggtctctacctgaagtctcaacaaatagggtttgaagaact 12574727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 31981955 - 31982194
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31981955 aatatttgctatctgtgaagttgaaacattacgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatatttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 31982054  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31982055 tgaagggaagaaaaaggtggtcaacatagattataactctcaacttcaaaatattttagatgattttttgatgtcaaatcaagtttcatttgagaagttt 31982154  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    || ||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31982155 gatgtttagtggggtaatcttgttgagaaagcagatgagt 31982194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 23644446 - 23644697
Alignment:
Q  28 tgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaaga 127  Q
    ||||||| ||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  23644446 tgaagatcaaatatttggacaatacaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggcgaatcaaccagatagtaattgtgaaagcaagaaaga 23644545  T
Q  128 ggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggt 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  23644546 ggtgatcaccatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggt 23644645  T
Q  228 aatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggaga 279  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  23644646 gatcttgttgagaaagcacatgagtctcagaggaagttggttcagatggaga 23644697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22173415 - 22173190
Alignment:
Q  62 attaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaa 161  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173415 attaaatgagagatgtgatagttatgaggtgaatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaa 22173316  T
Q  162 attattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaa 261  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  22173315 aatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcagttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcacatgagtctcagagga 22173216  T
Q  262 agttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  22173215 agttggttcagatggagactgagtgt 22173190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25594374 - 25594143
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||||||||   |||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25594374 ataaaatctcgagattaaatgagagatgtggccgttatgaggtggatcaactaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacattgattacaa 25594275  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25594274 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcacat 25594175  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    |||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  25594174 gagtctcagaggaagttggttcagatggagac 25594143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39659456 - 39659189
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||  ||| ||||||| |  |||||||||  ||| |||| || || |||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  39659456 aatattttctatctttgaagataaaatatttggacaataaaatattgagattaaatgagagttgtggtcgttgtgaggcgaatcaaccaggtagtaattg 39659357  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  39659356 tgaatggaagaaagagttgatcaacattgattacaatagtcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatgttaaatcaagtttcatttgagaagttt 39659257  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    || ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  39659256 gatgttcagtgcggtgatcttgttgagaaagcacatgagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 39659189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33880031 - 33879845
Alignment:
Q  94 atcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatca 193  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33880031 atcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatca 33879932  T
Q  194 agtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  33879931 agtttcatttgagaagttcgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcgcatgagtctcagaggaagttggttcagatggagac 33879845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23946581 - 23946392
Alignment:
Q  88 aggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtc 187  Q
    ||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||    
T  23946581 aggcaaatcaatctggtagtaattatgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgattttttagtgtc 23946482  T
Q  188 aaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatgga 277  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| |||||||    
T  23946481 aaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacatgagtctcaaaggaagttggttaagatgga 23946392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18825377 - 18825187
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||  | ||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18825377 ataaaatctcgagattaaatgagagatatggccgttatgaggtggatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 18825278  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgag 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  18825277 tactcaacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgag 18825187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 280
Target Start/End: Original strand, 12583745 - 12583884
Alignment:
Q  141 gattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgaga 240  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||||||    
T  12583745 gattacaatactcaatttaaaaatattctagatgatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaagtttgaggttcagtgtagtgatcttgttgaga 12583844  T
Q  241 aagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12583845 aagcatatgagtctcagaagaagttggttcagatggagac 12583884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 287
Target Start/End: Original strand, 24235720 - 24235956
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24235720 aaaatctcaagattaaatgagagatgtggtcgttatgagggggatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 24235819  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24235820 ctcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagttttatttgagaagtttgatgttcagtgtagtaatcttgttgagaaagcacatga 24235919  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24235920 gtctcagaagaagttggttcagatggagactgagtgt 24235956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 287
Target Start/End: Original strand, 25871398 - 25871634
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25871398 aaaatctcaagattaaatgtgagatgtggtcgttatgagggtgatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagagatgatcaacatcgattacaata 25871497  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25871498 ctcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagttttatttgagaagtttgatgttcagtgtggtaatcttgttgagaaagcacatga 25871597  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25871598 gtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgt 25871634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1506129 - 1505898
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1506129 ataaaatctcaagattaaatgagagatgtggtcgttatgagggggatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagagatgatcaacatcggttacaa 1506030  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1506029 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagttttatttgagaagtttgatgttcagtgtggtaatcttgttgagaaagcacat 1505930  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    |||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  1505929 gagtctcagaggaagttggttcagatggagac 1505898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25959189 - 25958953
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25959189 ataaaatctcaagattaaat--gagatgtggtcgttatgagggggatcaaccaggtactaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcaattacaa 25959092  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25959091 tactcaacttcaaaatattttagatgattttttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcacat 25958992  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25958991 gagtctcagaggaagttggttcagatggagactgagtgt 25958953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9188136 - 9187900
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9188136 ataaaatctcaagattaatgat-agatgtggtcgttatgagggggatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 9188038  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||    
T  9188037 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcaat-tggtgatcttgttgagaaagaacat 9187939  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9187938 gagtctcagaggaagctggttcagatggagactgagtgt 9187900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 35077546 - 35077863
Alignment:
Q  29 gaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagag 128  Q
    |||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    | ||  ||||||||||||  |||||||    
T  35077546 gaagataaaacaatgggacaatcaaatctcaagattaaatgcgagatgtgatcttcatgaggcgaatcatcagggtacagattgtgaagggctgaaagag 35077645  T
Q  129 gtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggta 228  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||     
T  35077646 cttatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatattaaatcaagttccatttgagaaatttgaaattcagtgtggtg 35077745  T
Q  229 atcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgt 328  Q
    |||||||| |||||||  |||||| | || |  || |||||||||||||||| |||||| |   | |||||||||| || ||| |||||||||  |||||    
T  35077746 atcttgttcagaaagcgaatgagtgtgagaagcagctggttgagatggagactgagtgtca---tgttgtggtggaagaaaatgcacaagtgaggagtgt 35077842  T
Q  329 tggtctctacctgaagtctca 349  Q
    | |||||||  ||||||||||    
T  35077843 tcgtctctatttgaagtctca 35077863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 45454449 - 45454723
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||  || |||  ||| |||||||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||    
T  45454449 aatatatgctatctttgaagatagaatatttggacaataaaatctcgagattaaatgagagttgtggtcgttatgaggtggatcaaccagttagtaattg 45454548  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45454549 tgaaaagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagttttatttgaaaagttt 45454648  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    || ||||| ||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||    | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  45454649 gatgttcagtgtggtgttcttgttgcaaaagcacatgagtctcaaaggatgttggttaagatggagactgagtgt 45454723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 51 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16790231 - 16790002
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||  || || |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16790231 aaaatctcaagattaaatgagagatgttgtcgttgtgaggcgaatcaaccagatagtaattgtgaagagaagaaggaggtgatcaacatcgattacaata 16790132  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| || || |||||||||| ||| ||||    
T  16790131 ctcaacttaaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgtttagtgttgtgattttgttgagaaggcacatga 16790032  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    ||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  16790031 gtctcaaaggaagttggttaagatggagac 16790002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 358
Target Start/End: Original strand, 13613975 - 13614201
Alignment:
Q  132 atcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatc 231  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| | ||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||     
T  13613975 atcaatatcgattacaactctcaacttcaaaatatttaagatgaattcttaagatcaaatcgagtttcatttgataaattaaaagttcaatgtggtaata 13614074  T
Q  232 ttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgttgg 331  Q
    | |||||||| ||| |||| ||| ||   ||||| |||||||||||||   |||||   | || ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  13614075 tggttgagaaggcaaatgactctgagaggaagttagttgagatggagataaagtgtcttgttactgtggtggaagaaaatccacaagtgagaagagttgg 13614174  T
Q  332 tctctacctgaagtctcagcaaatggg 358  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||    
T  13614175 gctcttcctgaagtctcagccaatggg 13614201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31430104 - 31430013
Alignment:
Q  189 aatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||| || || |||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  31430104 aatcaagtttcatttgagcagtttgatgttcagtgttgtgattttgttgagaaggcacatgagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 31430013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 287
Target Start/End: Original strand, 10882203 - 10882441
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  || ||||| || ||||||||| |||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10882203 ataaaatctcgagattaaatgagatatgtggtcgttatgaggcgaatcaaccaggtggtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 10882302  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10882303 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatggtcaatgtggtgatcttgttgagaaagcacat 10882402  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10882403 gagtctcagaggaagctggttcagatggagactgagtgt 10882441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Original strand, 47052166 - 47052425
Alignment:
Q  21 ctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaaggga 120  Q
    |||||| ||||||| ||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||    
T  47052166 ctatctttgaagatcaaatatttggacaatacaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggcgaatcaaccaggtagtaattgtgcaggga 47052265  T
Q  121 agaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttca 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  47052266 agaaagagatgatcaacatcgattagaatactcaacttcaaaatattttaaatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttca 47052365  T
Q  221 atgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  47052366 gtgtggtgatcttgttgagaaagcacatgagtctcagaggaagttggttcagatggagac 47052425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 9155416 - 9155690
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||  || |||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||    
T  9155416 aatatatgctatctttgaagatagaatatttggacaataaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtggatcaaccaggtagtaattg 9155515  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  9155516 tgaagagaagaaagaggtaatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagttt 9155615  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |  ||||| |||||| ||||||||   |||||| |||||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9155616 gttgttcagtgtggtgatcttgtttcaaaagcacatgagtctcagaggaagctggttcagatggagactgagtgt 9155690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 280
Target Start/End: Original strand, 2776215 - 2776446
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2776215 ataaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtagatcaaccaggtattaattgtgaagagaagaaagaggtgatccacatagattacaa 2776314  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  2776315 tactcaacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacat 2776414  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    ||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  2776415 gagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 2776446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 280
Target Start/End: Original strand, 13555842 - 13556069
Alignment:
Q  53 aatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatact 152  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||  | |||||||| | ||||| ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13555842 aatctcgagattaaatgagagatgtggacgttatgaggtagatcaaccaggtagtaatggtgaagagaagaaagaggtgatcaacatagattacaatact 13555941  T
Q  153 caacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13555942 caacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcacatgagt 13556041  T
Q  253 ctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    ||||    ||||||||| ||||||||||    
T  13556042 ctcaaaggaagttggttaagatggagac 13556069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 280
Target Start/End: Original strand, 24126221 - 24126452
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||| ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24126221 ataaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtagatcaaccaggtagtaattataaagagaagaaagaggtgatcaacatagattacaa 24126320  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  24126321 tactcaacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacat 24126420  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    ||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  24126421 gagtctcaaaggaagttggttaagatggagac 24126452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55034495 - 55034223
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||    
T  55034495 aatatatgctatctttgaagataaaatatttggacaataaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtggatcaaccaggtagtaattg 55034396  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||     
T  55034395 tgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttagtgtcaaatcaaatttcatttgagaagttc 55034296  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    || ||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  55034295 gatgttcagtgtggtgatcttgtt--gaaagcacatgagtctcaaaggaagttagttcagatggagactgagtgt 55034223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16184151 - 16183959
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16184151 ataaactctcaagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggaggatcaaccaggtagtaattgtaaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 16184052  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaa 241  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16184051 tactcaacttcaaaatattttaaatgatttcttgatgtcaaatcaagttttatttgagaagtttgatgttcagtgtggtaatcttgttgagaa 16183959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 279
Target Start/End: Original strand, 28328086 - 28328312
Alignment:
Q  53 aatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatact 152  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||| || || |||||   ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28328086 aatctcgagattaaatgagaggtgtggtcgttgtgaggtggatcaaccaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattaccatact 28328185  T
Q  153 caacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  28328186 caacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacatgagt 28328285  T
Q  253 ctcagcaaaagttggttgagatggaga 279  Q
    ||||    ||||||||| |||||||||    
T  28328286 ctcaaaggaagttggttaagatggaga 28328312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Original strand, 10960598 - 10960781
Alignment:
Q  104 tagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcattt 203  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10960598 tagtaattctgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcagtt 10960697  T
Q  204 gaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10960698 gagaagtttgaagttcagtgtggtgatcttgttgcaaaagcacatgagtcttagaggaagctggttcagatggagactgagtgt 10960781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 287
Target Start/End: Original strand, 10964105 - 10964288
Alignment:
Q  104 tagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcattt 203  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10964105 tagtaattctgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcagtt 10964204  T
Q  204 gaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||   ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10964205 gagaagtttgaagttcagtgtggtgatcttgttgcaaaagcacatgagtcttagaggaagctggttcagatggagactgagtgt 10964288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18644233 - 18644052
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||| | ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18644233 aaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtagatcaaccaggtagtaattgtaaagagaagaaagaggtgatcaacatagattacaata 18644134  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatct 232  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  18644133 ctcaacttcaaaatattttagatgaattcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatct 18644052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 133 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19304081 - 19303899
Alignment:
Q  133 tcaacatcgattacaatactcaacttcaaat-tattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatc 231  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  19304081 tcaacatagattataatactcaacttaaaaaatattctagatgatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaagtttgatgttcaatgtagtgatc 19303982  T
Q  232 ttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatcca 314  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | | ||||||||| ||||||||||  | ||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  19303981 ttgttgagaaagcgtacgagtctccgaagaagttggttcagatggagactaattgtcatgctattgtggtggaagaaaatcca 19303899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26821670 - 26821443
Alignment:
Q  132 atcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatc 231  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  26821670 atcaacatagattacaactctcaacttcaaactattttagattaatttttgaggtcaaatctaggttcatttgataaatttaaagttcaatgtggtgatc 26821571  T
Q  232 ttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgttgg 331  Q
    ||||| |||||||| |||| | | |  | ||||||||||||||| |||  |||||| | | |||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||     
T  26821570 ttgttaagaaagcaaatgaatgtgaaaagaagttggttgagatgaagattgagtgtcatgttattgtggtgggagaaaattcataagtgatgagtgttga 26821471  T
Q  332 tctctacctgaagtctcagcaaatggggt 360  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||||    
T  26821470 tctcta-ctaaagtctcaaccaatggggt 26821443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 280
Target Start/End: Original strand, 26552326 - 26552439
Alignment:
Q  166 ttttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagtt 265  Q
    |||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| || | |||||    
T  26552326 ttttagatgaattcctgaggtccaatcaagtttcatttgatcgatttgaa-tccaatgtgttaatcttgttgagaaagtacatcagtctgagaagaagtt 26552424  T
Q  266 ggttgagatggagac 280  Q
    ||||||||| |||||    
T  26552425 ggttgagatagagac 26552439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 280
Target Start/End: Original strand, 7649 - 7879
Alignment:
Q  50 taaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaat 149  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7649 taaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggctaatcaattaggtagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaat 7748  T
Q  150 actcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  7749 actcaacttcaaaatattttagatgattgcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttaagaaggcacatg 7848  T
Q  250 agtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    |||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  7849 agtctcaaaggaagttggttaagatggagac 7879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11864 - 11657
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  || ||||| |  ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11864 ataaaatctcgagattaaatgagatatgtggttgttatgaggcgaatcaaccaggtagtaattgtgaagggaagaaagaggtgatcaatatggattacaa 11765  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11764 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcatat 11665  T
Q  249 gagtctca 256  Q
    ||||||||    
T  11664 gagtctca 11657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 287
Target Start/End: Original strand, 20703 - 20928
Alignment:
Q  62 attaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaa 161  Q
    |||||||  |||||||||   ||||||||  ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20703 attaaatgagagatgtgacagttatgaggtgaatcaacgaggtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaa 20802  T
Q  162 attattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaa 261  Q
    | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  20803 aatattttaaatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaaatttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaagcacatgagtctcagagga 20902  T
Q  262 agttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  20903 agttggttcagatggagactgagtgt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 26579 - 26853
Alignment:
Q  13 aatatttgctatctgtgaagatgaaacattgcgacgataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattg 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||  || |||  ||| ||||||||||  ||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| ||| |||| ||||    
T  26579 aatatatgctatctttgaagatagaatatttggacaataaaatctcgggattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtggatcaaccaggtagtaattg 26678  T
Q  113 tgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaattt 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  26679 tgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagattatttcttggtgtcaaatcaagtttcatttgagaagttt 26778  T
Q  213 gaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgt 287  Q
    || ||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||   ||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  26779 gatgttcagtgtggtgatcttgttgcaaaagcacatgagtctcagaggaagctagttcagatggagactgagtgt 26853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 279
Target Start/End: Original strand, 293649 - 293877
Alignment:
Q  51 aaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    |||||||| ||||||||   |||||||| || |||||||    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  293649 aaaatctcgagattaaaagagagatgtggtcgttatgagatggatcaaccagatagtaattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 293748  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  293749 ctcaacttcaaaatattttagatgatttcttgatggcaaatcaagtttcatttgagaagtttgacgttcagtgtggtgatcttgttgcaaaagcacatga 293848  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggaga 279  Q
    |||||||   ||| ||||| |||||||||    
T  293849 gtctcagaggaagctggttcagatggaga 293877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 349
Target Start/End: Original strand, 36464 - 36758
Alignment:
Q  52 aaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacaga-tagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaata 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||  |||| ||  ||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36464 aaatctcaagattaaatgtgagatgtgatcttcatgaggtgaatcat-cagagtacagattgtgaaaggctgaaagagcttatcaacatcgattacaata 36562  T
Q  151 ctcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatga 250  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  36563 ctcagcttcaaaatattttagatgatttcttgatattaaatcaagtttcatttgagaaatttgaagttcagtgtggtgatcttgttgggaaagcgaatga 36662  T
Q  251 gtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccacaagtgataagtgttggtctctacctgaagtctca 349  Q
     | | || |  ||||||||||||||||||| |||||| |   | || ||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36663 atgtgagaagcagttggttgagatggagactgagtgtca---tgttctggtggaagaaaatgcacaagtgaggagtgttggtctctacctgaagtctca 36758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 280
Target Start/End: Original strand, 11936 - 12167
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||   ||||| |||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11936 ataaaatctcgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaggtggatcaaccaggcagtaattgtgatgagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 12035  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||| |||||||||  |||||| ||    
T  12036 tactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggagtcaaatcaagtttcatttgagaagtttgatgtttagtgtggtgatcttgttgcaaaagcacat 12135  T
Q  249 gagtctcagcaaaagttggttgagatggagac 280  Q
    |||||||||   ||| ||||| ||||||||||    
T  12136 gagtctcagaggaagctggtttagatggagac 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Original strand, 3144 - 3296
Alignment:
Q  104 tagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcattt 203  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3144 tagtaattgtgaagagaaaaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaaatattttagatgatttcttggtgtcaaatcaagtttcattt 3243  T
Q  204 gaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctca 256  Q
    || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3244 gataagtttgatgttcagtgtggtgatcttgttgagaaggcacatgagtctca 3296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 117931 - 117788
Alignment:
Q  49 ataaaatctcaagattaaatacgagatgtgatctttatgaggcaaatcaaacagatagtgattgtgaagggaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 148  Q
    |||||||||  |||||||||  |||||||| || |||||| || |||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117931 ataaaatcttgagattaaatgagagatgtggtcgttatgaagcgaatcaaccatgtagtaattgtgaagagaagaaagaggtgatcaacatcgattacaa 117832  T
Q  149 tactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatc 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  117831 tactcaacttcaaaatattttagatgattttttgatgtcaaatc 117788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 316
Target Start/End: Original strand, 847 - 1039
Alignment:
Q  124 aagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatg 223  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||| ||    
T  847 aagaagtggtcaacatagattacaatactcaacttaaaaatattcaagatgatttcttgatgtcaaataaattttcatttgaaaaggttgatgttcagtg 946  T
Q  224 tggtaatcttgttgagaaagcatatgagtctcagcaaaagttggttgagatggagaccgagtgtaaggctattgtggtggacgacaatccaca 316  Q
    | || |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||  | ||| | | |||||||||||| || ||||||||    
T  947 tagtgatcttgttcagaaagcatattagtctcggaagaagttggttcagatggagactaattgtcatgatattgtggtggaagaaaatccaca 1039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2047 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold2047
Description:

Target: scaffold2047; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 200 - 87
Alignment:
Q  122 gaaagaggtgatcaacatcgattacaatactcaacttcaaattattttagataatttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaa 221  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  200 gaaagagataatcaacatcgattacaa-actcagcttcaaaatattttagatgattttttgagattaaatcaagtgccatttgagaaatttgaagttcag 102  T
Q  222 tgtggtaatcttgtt 236  Q
    |||||| ||||||||    
T  101 tgtggtgatcttgtt 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 252
Target Start/End: Original strand, 1061 - 1136
Alignment:
Q  177 ttcttgatgtcaaatcaagtttcatttgaaaaatttgaagttcaatgtggtaatcttgttgagaaagcatatgagt 252  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  1061 ttcttgaggtccaatcaagtttcatttgatgaatttgaagtttagtgcggtgatcttatttagaaagcaaatgagt 1136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University