View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7523_low_12 (Length: 415)

Name: NF7523_low_12
Description: NF7523
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7523_low_12
NF7523_low_12
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (121-305)||(13988246-13988430)
chr5 (126-305)||(36890381-36890559)
chr5 (126-306)||(11247196-11247376)
chr5 (221-306)||(20151473-20151558)
chr5 (119-203)||(15285326-15285410)
chr5 (126-306)||(12248277-12248457)
chr5 (128-203)||(35906000-35906075)
chr5 (134-304)||(1447748-1447917)
chr5 (126-304)||(43100208-43100386)
chr5 (232-305)||(8076364-8076438)
chr5 (238-306)||(15285434-15285503)
chr5 (240-301)||(35906101-35906163)
chr5 (126-199)||(33687651-33687724)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (126-306)||(1994957-1995136)
chr1 (126-305)||(27325626-27325806)
chr1 (126-306)||(44797465-44797644)
chr1 (120-306)||(2402923-2403109)
chr1 (126-303)||(29637211-29637388)
chr1 (126-306)||(32267463-32267643)
chr1 (126-296)||(1673373-1673543)
chr1 (223-305)||(40030887-40030969)
chr1 (120-306)||(526907-527083)
chr1 (121-213)||(39858346-39858438)
chr1 (120-203)||(46845757-46845840)
chr1 (229-305)||(15066019-15066096)
chr1 (126-202)||(7178213-7178289)
chr1 (126-305)||(15224986-15225169)
chr1 (128-303)||(29731194-29731369)
chr1 (126-212)||(26040974-26041060)
chr1 (126-201)||(13276567-13276642)
chr1 (126-305)||(47571562-47571741)
chr1 (232-306)||(19989346-19989420)
chr1 (116-175)||(40030832-40030891)
chr1 (127-194)||(49430574-49430641)
chr1 (126-203)||(6487732-6487809)
chr1 (238-305)||(13276473-13276541)
chr1 (126-213)||(40314096-40314183)
chr1 (120-213)||(40294822-40294915)
chr1 (126-187)||(33502641-33502702)
chr1 (238-306)||(39858452-39858521)
chr1 (232-303)||(48489558-48489630)
chr1 (238-304)||(46845666-46845733)
chr1 (128-203)||(48489455-48489530)
chr1 (238-305)||(40314197-40314265)
chr1 (254-306)||(49430482-49430534)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (126-304)||(36272661-36272839)
chr2 (116-304)||(13696965-13697153)
chr2 (121-305)||(32599247-32599431)
chr2 (117-304)||(17823574-17823761)
chr2 (121-306)||(33555360-33555546)
chr2 (128-306)||(36709190-36709367)
chr2 (126-306)||(40095267-40095446)
chr2 (120-305)||(14242523-14242699)
chr2 (126-304)||(42061237-42061409)
chr2 (224-304)||(4434592-4434672)
chr2 (121-213)||(23860255-23860347)
chr2 (121-213)||(33299978-33300070)
chr2 (120-203)||(3121608-3121691)
chr2 (117-213)||(24475792-24475888)
chr2 (126-179)||(14945861-14945914)
chr2 (113-305)||(40216400-40216592)
chr2 (266-304)||(23860198-23860236)
chr2 (118-199)||(4434695-4434776)
chr2 (126-306)||(5562940-5563117)
chr2 (238-304)||(3121715-3121782)
chr2 (240-301)||(24475714-24475776)
chr2 (238-306)||(14945734-14945803)
chr2 (229-282)||(40042472-40042525)
chr2 (229-306)||(31220668-31220746)
chr2 (238-305)||(33300086-33300154)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (119-304)||(37605691-37605876)
chr4 (119-305)||(55281205-55281391)
chr4 (116-304)||(25164471-25164659)
chr4 (117-304)||(45995895-45996081)
chr4 (126-305)||(17044007-17044185)
chr4 (126-305)||(43749096-43749277)
chr4 (126-304)||(5817380-5817558)
chr4 (126-304)||(3287088-3287262)
chr4 (126-306)||(51579585-51579764)
chr4 (126-306)||(24059133-24059311)
chr4 (221-306)||(39631008-39631093)
chr4 (120-292)||(32525034-32525206)
chr4 (126-201)||(51579324-51579399)
chr4 (128-272)||(26719936-26720077)
chr4 (116-213)||(42179228-42179325)
chr4 (112-213)||(50498200-50498301)
chr4 (245-306)||(5208425-5208486)
chr4 (112-187)||(32290205-32290279)
chr4 (127-275)||(41277220-41277371)
chr4 (256-305)||(51293081-51293130)
chr4 (126-201)||(20107114-20107190)
chr4 (232-306)||(14149958-14150033)
chr4 (126-213)||(22364552-22364639)
chr4 (120-305)||(25783908-25784092)
chr4 (121-212)||(36851226-36851317)
chr4 (126-171)||(39631271-39631316)
chr4 (232-304)||(48525435-48525508)
chr4 (229-306)||(9118513-9118591)
chr4 (126-192)||(48525330-48525396)
chr4 (232-305)||(40947103-40947176)
chr4 (245-300)||(53456316-53456371)
chr4 (244-305)||(42179148-42179210)
chr4 (242-306)||(22364469-22364534)
chr4 (235-306)||(14786734-14786806)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (126-306)||(46576240-46576420)
chr7 (129-305)||(33496506-33496682)
chr7 (126-306)||(30922708-30922888)
chr7 (126-300)||(48460663-48460830)
chr7 (121-303)||(51937-52118)
chr7 (128-304)||(38754897-38755071)
chr7 (128-306)||(47480012-47480188)
chr7 (126-213)||(42974469-42974556)
chr7 (126-306)||(38349457-38349637)
chr7 (126-305)||(28713681-28713860)
chr7 (128-193)||(31741049-31741114)
chr7 (129-304)||(11752604-11752781)
chr7 (238-306)||(31741148-31741217)
chr7 (234-302)||(37536317-37536386)
chr7 (234-306)||(43359083-43359156)
chr7 (237-304)||(42974395-42974462)
chr7 (124-192)||(43068765-43068833)
chr7 (264-302)||(43659258-43659296)
chr7 (238-282)||(6220185-6220230)
chr7 (126-203)||(37536416-37536493)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (121-304)||(34792651-34792834)
chr6 (121-305)||(9045832-9046015)
chr6 (126-306)||(14313985-14314164)
chr6 (126-306)||(1244554-1244734)
chr6 (117-203)||(23915967-23916053)
chr6 (128-212)||(29429590-29429674)
chr6 (128-306)||(12748217-12748396)
chr6 (229-306)||(9521810-9521887)
chr6 (232-304)||(16718106-16718179)
chr6 (238-306)||(23916077-23916146)
chr6 (130-174)||(9521947-9521991)
chr6 (126-174)||(16717994-16718042)
chr6 (232-304)||(32720468-32720541)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (118-305)||(14342186-14342375)
chr8 (126-306)||(43065903-43066082)
chr8 (126-305)||(1993638-1993818)
chr8 (221-306)||(4076767-4076852)
chr8 (126-304)||(11904857-11905035)
chr8 (118-203)||(2599527-2599612)
chr8 (126-213)||(28897999-28898086)
chr8 (127-203)||(41075698-41075774)
chr8 (120-203)||(4077062-4077145)
chr8 (126-213)||(45413629-45413716)
chr8 (130-203)||(8368472-8368545)
chr8 (127-306)||(31774729-31774910)
chr8 (126-306)||(35200560-35200740)
chr8 (224-304)||(5749029-5749109)
chr8 (128-212)||(10391397-10391481)
chr8 (127-193)||(16465723-16465789)
chr8 (126-187)||(12142085-12142146)
chr8 (231-302)||(16465610-16465681)
chr8 (130-302)||(45502670-45502841)
chr8 (231-306)||(8368370-8368445)
chr8 (126-181)||(27497177-27497231)
chr8 (238-304)||(28898100-28898167)
chr8 (234-305)||(31523512-31523582)
chr8 (232-306)||(41075594-41075668)
chr8 (238-293)||(2599636-2599692)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (126-304)||(38247802-38247979)
chr3 (126-302)||(12224006-12224181)
chr3 (127-304)||(48034808-48034986)
chr3 (120-304)||(50989201-50989385)
chr3 (120-304)||(51092333-51092517)
chr3 (119-306)||(9271107-9271296)
chr3 (128-302)||(8496712-8496887)
chr3 (126-254)||(33288136-33288264)
chr3 (130-306)||(54713532-54713708)
chr3 (126-305)||(23004760-23004938)
chr3 (128-199)||(39947262-39947333)
chr3 (234-305)||(46135636-46135708)
chr3 (119-173)||(29915090-29915144)
chr3 (119-173)||(29964243-29964297)
chr3 (126-203)||(8330693-8330770)
chr3 (126-199)||(36674624-36674697)
chr3 (117-194)||(46135522-46135599)
chr3 (235-304)||(40725959-40726029)
chr3 (232-304)||(36674519-36674592)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (120-304)||(10232-10415)
[»] scaffold0933 (1 HSPs)
scaffold0933 (127-306)||(3054-3231)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (235-306)||(52924-52996)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 121 - 305
Target Start/End: Original strand, 13988246 - 13988430
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnn 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||           
T  13988246 agagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccccacacacaaaaaaa 13988345  T
Q  221 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988346 gtcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 13988430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Original strand, 36890381 - 36890559
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||    
T  36890381 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtcccc-cacacacaaaaaaactcac 36890479  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890480 atgtattgtctctcatacactctcacatcgagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 36890559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 11247196 - 11247376
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |  ||||||       |||||    
T  11247196 agtgatacatagactaccttagatggcatatactacttgtacatccacacacaattttgacaaatgtctttgtgatccccctacacacaaaaaaactcac 11247295  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11247296 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 11247376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Original strand, 20151473 - 20151558
Alignment:
Q  221 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  20151473 ctcacatttattgtctctcacacactctcacatggggtggtataatgtatgtatggaaaaaaaggtgtacatgaaatattatcctt 20151558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 203
Target Start/End: Original strand, 15285326 - 15285410
Alignment:
Q  119 aaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  15285326 aaagagtagtgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttatacactcatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtcc 15285410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 12248277 - 12248457
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||   ||| |||       ||||     
T  12248277 agtgatacataaatcaccttaggtggcatataccacttgtacatccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtccctacacgcacaagaaa-ctcat 12248375  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
     | |  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12248376 cttttgtgtctctcaaacactatcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcctt 12248457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 203
Target Start/End: Original strand, 35906000 - 35906075
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  35906000 tgatacatagaccaccttaggtggtatgtatcacttatacacccatatacaattgtgacatgtgtccatgtagtcc 35906075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1447917 - 1447748
Alignment:
Q  134 atagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacatgtattg 233  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||| ||| || | | |||| |        |||| || |||||    
T  1447917 atagacaactttaggtggcatgtaccacttatacatccacgcacaattgtgacatatgtccatgtagttcccacacaaaaaaaaaaactcatatttattg 1447818  T
Q  234 tctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1447817 tctctcatacactctcacattggatggtacaacgtgtgtatagaaaaaag-gtgttcatgaaacattatcc 1447748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43100386 - 43100208
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctct-cacacacnnnnnnnctca 224  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||        |||    
T  43100386 agtgatacataaaccatcttaggtggtatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggt-ctctacacacacaagaaat-tca 43100289  T
Q  225 catgtattgtctctcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
      | |  ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  43100288 tcttttgtgtctctcaaacactatcacatgaaagtggtacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcc 43100208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 305
Target Start/End: Original strand, 8076364 - 8076438
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8076364 tgtctctcaaacactctcacatggaagtggtacaatgtatgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcct 8076438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Original strand, 15285434 - 15285503
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15285434 tcacacactctcacatgggagtggtacatagtgtgtatgcagaaaagggtgttcatgaaacattatcctt 15285503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 301
Target Start/End: Original strand, 35906101 - 35906163
Alignment:
Q  240 acacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacatta 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  35906101 acacactctcacatgagagtggtacatagtatgtatggagaaaagggtgttcatgaaacatta 35906163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 33687651 - 33687724
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtg 199  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  33687651 agtgatacataaatcatcttaggtggcatataccacttgtacatccatatataattgtgacatgtgtccatgtg 33687724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 1994957 - 1995136
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||       |||||    
T  1994957 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtctttgtggtcctc-cacacacaaaaaaactcac 1995055  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1995056 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 1995136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27325806 - 27325626
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||        ||||    
T  27325806 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgataagtgtccttgtggttcccccacacacaaaaaaagtcac 27325707  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactct-cacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27325706 atgtattgtctctcacacactcttcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 27325626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44797644 - 44797465
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||       |||||    
T  44797644 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgataagtgtccttgtggtcccc-caaacacaaaaaaactcac 44797546  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44797545 atgtattgtctctcacacactctcacatgaagtggtacaatgtgtgtatagaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 44797465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2403109 - 2402923
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnn 219  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||           
T  2403109 aagagtagtgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgaaaagtgttcttgtggtccccccacacaaaaaaaa 2403010  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2403009 actcacatgtattgtctctcgcacactctcacatggaatggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 2402923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 126 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29637388 - 29637211
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||     
T  29637388 agtgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtcctcccacacacaaaaaaactcat 29637289  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatc 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29637288 atgtattgtctctctcacactctcatatgtggtggtacaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatc 29637211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32267643 - 32267463
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       |||||    
T  32267643 agtgatacatagaccatcttaagtggcatgtacaatttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccttccacatacaaaaaaactcac 32267544  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32267543 atgtattggctctcacacactctcacatggagtagtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaatattatcctt 32267463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Original strand, 1673373 - 1673543
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |  ||| ||       ||||     
T  1673373 agtgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgataagtgtccttgtggttcccctacatacaaaaaaactcat 1673472  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaa 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1673473 atgtattgtctctcatacactcttacatgaaatggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaa 1673543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 305
Target Start/End: Original strand, 40030887 - 40030969
Alignment:
Q  223 cacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40030887 cacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 40030969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 527083 - 526907
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnn 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| | || ||||          
T  527083 aagagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacatacac-aagaa 526985  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
     |||||||          |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  526984 actcacat----------tcacacactctcacatggaagtggtacatagtgtgtatggagaaaagggtgttcatgaaacattatcctt 526907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 213
Target Start/End: Original strand, 39858346 - 39858438
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  39858346 agagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatataccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 39858438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 46845840 - 46845757
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  46845840 aagagtagtgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtcc 46845757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15066096 - 15066019
Alignment:
Q  229 tattgtctctcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15066096 tattgtctctcacacactctcacatgagagtggtacattgtatgtatggaaaaaagagtgttcatgaaacattatcct 15066019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7178289 - 7178213
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  7178289 agtgatacatagaccaccttaggtgacatgtaccatttgtacacccacatacaattgtgacaagtgtctatgtggtc 7178213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15225169 - 15224986
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac-nnnnnnnctca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||   |||||| | |||||||        ||||    
T  15225169 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtacaacttatacacccacatgcaattgtgacatatgtccacatggtccccacacacacacaaaaaactca 15225070  T
Q  225 catgtattgtctctcacacactctcacatgga-gtgg--tacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||| |  | |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15225069 cattttatatctctcacacactctcacatagaggtggtatacgatgtgcgtacggagaaaagggtgttcatgaaacattatcct 15224986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 303
Target Start/End: Original strand, 29731194 - 29731369
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacat 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||        |||  |    
T  29731194 tgatacataaaccaccttaggtggcatataccactagtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtccctacacacacaagaaat-tcatct 29731292  T
Q  228 gtattgtctctcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatc 303  Q
     |  ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  29731293 tttgtgtctctcaaacactctcacatggaagtgatacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatc 29731369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Original strand, 26040974 - 26041060
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacaca 212  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| | ||||||    
T  26040974 agtgatacacaaaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacatacaattgtgacatgtgtccacgtggtccccacacaca 26041060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13276642 - 13276567
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  13276642 agtgatacatagaccaccttaggtggtatgtaccacttatacactcatacacaattatgacatgtgtccatgtggt 13276567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 47571741 - 47571562
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||   ||||||        ||||     
T  47571741 agtgatatataaaccaccttaggtgacatatgccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtccctacacaca-taagaaactcat 47571643  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
     | |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  47571642 cttttgtgtctctcaaacactctcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagaggaaagggtgttcatgaaacattatcct 47571562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 306
Target Start/End: Original strand, 19989346 - 19989420
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  19989346 tgtctctcacacactctcacatgagagtggtacaatgtgtgtat-gagaaaagagtgtctatgaaacattatcctt 19989420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 175
Target Start/End: Original strand, 40030832 - 40030891
Alignment:
Q  116 aaaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacat 175  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40030832 aaaaacgagtagtgatacatagaccaccttaggtagcatgtaccacttgtacacccacat 40030891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 49430641 - 49430574
Alignment:
Q  127 gtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtcc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||||| ||||||    
T  49430641 gtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacatcaatacacaattgtgacatgtgtcc 49430574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 203
Target Start/End: Original strand, 6487732 - 6487809
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  6487732 agtgatacatagaccaatttaggtggcatgtaccacttgtacatccacacacaattgtgacatgtgtccacgtggtcc 6487809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13276541 - 13276473
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13276541 tcacacactctcacatgggagtggtacatagtgtgtatggagaaaagggtgttcatgaaacattatcct 13276473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Original strand, 40314096 - 40314183
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  40314096 agtgatacataaaccaccttaggtagtatgtaccatttatacatccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 40314183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40294915 - 40294822
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| | | |||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||    
T  40294915 aagagtagtgatacatagaccactttaggtggcacgtaccacttgtccacctatacacaattgtgacatgtatctatgtggtcctcacacacac 40294822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33502702 - 33502641
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgaca 187  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  33502702 agtgatacatagaccacattagatgacatgtaccacttgtacacctacatgcaattgtgaca 33502641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Original strand, 39858452 - 39858521
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39858452 tcacactctctcatatgggagtggtacatagtgtgtatggagaaaagggtgttcatgaaacattatcctt 39858521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 303
Target Start/End: Original strand, 48489558 - 48489630
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatc 303  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||  |||| ||||||||||||||    
T  48489558 tgtctctcaaacactatcacatggaagtggtacaatgtatgtatagagaaaatggtgttcatgaaacattatc 48489630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46845733 - 46845666
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  46845733 tcacacactctcacatgggagtggtacataatgtgtatgcagaaaagggtgttcatgaaacattatcc 46845666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 203
Target Start/End: Original strand, 48489455 - 48489530
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||| |||||  ||||| ||||||||    
T  48489455 tgatacataaatcaccttaggtggcatataccacttgtacatccatatataattgtgacatctgtccatgtggtcc 48489530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Original strand, 40314197 - 40314265
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |  || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  40314197 tcacacactctcatatgggagtggtatatagtatgtatggaaaaaatggtgttcatgaaacattatcct 40314265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49430534 - 49430482
Alignment:
Q  254 ggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  49430534 ggagtggtacatagtgtgtatggagaaaagagtgttcatgaaatattatcctt 49430482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 126 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36272839 - 36272661
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||    
T  36272839 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccacacacacaaaaaaactcac 36272740  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36272739 atgtattgtctttcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtatatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 36272661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 116 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13697153 - 13696965
Alignment:
Q  116 aaaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnn 215  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||      
T  13697153 aaaaaaaagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggttcccccacacacaa 13697054  T
Q  216 nnnnnctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13697053 aaaaagtcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 13696965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 121 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32599431 - 32599247
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnn 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||           
T  32599431 agagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacatccacacataattttgacaagtgtccttgtggtccctccacacacaaaaaaa 32599332  T
Q  221 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599331 ctcacatgtattgtctgtcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 32599247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 117 - 304
Target Start/End: Original strand, 17823574 - 17823761
Alignment:
Q  117 aaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnn 216  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||       
T  17823574 aaaaggagtagtgatacataaaccaccttagatggtatgtatcacttgtacacccacatacaattttgataagtgtccttgtggtccccccacacacaaa 17823673  T
Q  217 nnnnctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17823674 aaaactcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 17823761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33555546 - 33555360
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnn 220  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||            
T  33555546 agagtagtgatacatagatcaccttaagtggcatgtaccacttgtacacttacacacaattttgacaagtgtcattgtggtccccccacacaaaaaaaaa 33555447  T
Q  221 -ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33555446 actcacatgtattgtctgtcacacattctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 33555360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 128 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36709367 - 36709190
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacat 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||       |||||||    
T  36709367 tgatacatagaccatcttaggtggtatgtaccacttatacacccacacacaattttgacaaatgtcattgtggtccccccacacacaaaaaa-ctcacat 36709269  T
Q  228 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36709268 gtattgtctgtcacacattctcatatggagtggtacaatgtttgtatggaaaaaaatgtgtacatgaaacattatcctt 36709190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 40095267 - 40095446
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||       || ||    
T  40095267 agtgatacatagaccaccttagatgacatgtaccacttgtacatccacatacaattttgacaagtgtcattgtggtccccccacacacaaaaaaacttac 40095366  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40095367 atgtattgtctctcacacactctcgcatagagtggtacagtgtatgtatggaaaaaa-tgtgtacatgaaacattatcctt 40095446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14242699 - 14242523
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnn 219  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||        | | | |||||||          
T  14242699 aagagtagtgatacatagaccatcttaggtggtatgtaccacctgtacacccacacacaattttgacaagtgt--------taccc-cacacacaaaaaa 14242609  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14242608 gctcacatgtattgcctctcagacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 14242523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42061409 - 42061237
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac-nnnnnnnctca 224  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||        ||||    
T  42061409 agtgatacatagagcactttgggtggcatgtaccacttgtacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtccccccacacacacaaaaaactca 42061310  T
Q  225 catgtattg--tctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42061309 catgtattgtctctctcacacactctcatatggagtg---------gtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 42061237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4434672 - 4434592
Alignment:
Q  224 acatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  4434672 acatttattgtctctcacacattctcacatgaggtggtacaatgtgtgtatggaaaaaatagtgttcatgaaacattatcc 4434592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23860347 - 23860255
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  23860347 agagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtatactcacacactattttgacaagtgttcttgtgatccccccacacac 23860255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 213
Target Start/End: Original strand, 33299978 - 33300070
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||||    
T  33299978 agagtagtgatacatagaccaccttaagtggcatgtaccatttatacacccatatacaattgtgacatgtgttcatgtggtccccacacacac 33300070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 203
Target Start/End: Original strand, 3121608 - 3121691
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  3121608 aagagtagtgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttatacactcatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtcc 3121691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24475888 - 24475792
Alignment:
Q  117 aaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||| | |||||||    
T  24475888 aaaaagagtaatgatacatagaccaccttaggtggtatgtatcacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtagtccccacacacac 24475792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14945914 - 14945861
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14945914 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaa 14945861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 305
Target Start/End: Original strand, 40216400 - 40216592
Alignment:
Q  113 tttaaaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacaca 212  Q
    ||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||   ||||||    
T  40216400 tttaagaaagggtagtgatatataaaccaccttagatgatatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtccctacacaca 40216499  T
Q  213 cnnnnnnnctcacatgtattgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
            ||||  | |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  40216500 -taagaaactcatcttttatgtctctcaaacactctcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagaggaaagggtgttcatgaaacattatcct 40216592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23860236 - 23860198
Alignment:
Q  266 tgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23860236 tgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 23860198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4434776 - 4434695
Alignment:
Q  118 aaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtg 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| || ||| ||||| |||||| ||||    
T  4434776 aaaagagtagtgatatatagaccaccttatgtggcatgtaccacttgtacttccacacactattgtgacatgtgtccatgtg 4434695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 5562940 - 5563117
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||| |||||  |||||||  | |||||||       ||||     
T  5562940 agtgatacatagactattttaggtggcatgtaccatttatacattcatatataattttgacatgtgtcgatgtggtctccacacacacaaaaaaactcat 5563039  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    || ||| |||||  |   |||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  5563040 atttatcgtctcata---actctcacataggatagtacaatgtgtgtatagaaaaaaatgtatacataaaacattatcctt 5563117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 304
Target Start/End: Original strand, 3121715 - 3121782
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  3121715 tcacacactctcacatgggagtggtacatagtgtgtatgcagaaaagggtgttcatgaaacattatcc 3121782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24475776 - 24475714
Alignment:
Q  240 acacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacatta 301  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  24475776 acacactctcacgtggaagtggtacatagtgtgtatggagaaaagggtgttcatgaaacatta 24475714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14945803 - 14945734
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacat-ggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14945803 tcacgcactctcacataggagtggtacataatgtgtatgaagaaaagggtgttcatgaaacattatcctt 14945734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 282
Target Start/End: Original strand, 40042472 - 40042525
Alignment:
Q  229 tattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaa 282  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40042472 tattgtctttcgcacactctcacatgaggtgatacaatgtttgtatggaaaaaa 40042525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 306
Target Start/End: Original strand, 31220668 - 31220746
Alignment:
Q  229 tattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgg--aaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31220668 tattgtcacccacacactctcatatgggg-ggtacaatttgtgtatggcgagaaaagggtgtccatgaaacattatcctt 31220746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Original strand, 33300086 - 33300154
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |  |||| ||||||||||||||||    
T  33300086 tcacacactctcacatgggagtggtacatagtgtgtatgaagaatacggtgttcatgaaacattatcct 33300154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37605876 - 37605691
Alignment:
Q  119 aaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnn 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||         
T  37605876 aaagagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccccacacacaaaaa 37605777  T
Q  219 nnctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37605776 aagtcacatgtattgtccctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 37605691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 305
Target Start/End: Original strand, 55281205 - 55281391
Alignment:
Q  119 aaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnn 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||         
T  55281205 aaagagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccccacacacaaaaa 55281304  T
Q  219 nnctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55281305 aagtcacatgtattgtctctcacacattctcacatggagtggtacaatgtatgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 55281391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 116 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25164659 - 25164471
Alignment:
Q  116 aaaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggt-cctctcacacacn 214  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  25164659 aaaaaaaagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggttcctc-cacacaca 25164561  T
Q  215 nnnnnnctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25164560 aaaaaactcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgcaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 25164471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 117 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45996081 - 45995895
Alignment:
Q  117 aaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnn 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||       
T  45996081 aaaaagagtagtgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgttcttgtggtc-tcccacacacaaa 45995983  T
Q  217 nnnnctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45995982 aaaactcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaaatgtgtacatgaaacattatcc 45995895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Original strand, 17044007 - 17044185
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||        || |    
T  17044007 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggttccc-cacacacaaaaaaagtccc 17044105  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17044106 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 17044185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Original strand, 43749096 - 43749277
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc--tctcacacacnnnnnnnctc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||       |||    
T  43749096 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacataattttgacaagtgtccttgtggtccctccacacacacaaaaaagctc 43749195  T
Q  224 acatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43749196 acatatattgtccctcacacactcttacatggagtggtacaatatatgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 43749277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5817558 - 5817380
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||       ||||     
T  5817558 agtgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacaccaaaaaactcat 5817459  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    || |||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  5817458 atttattgtctcctacacacttttacatggggtggtacaatgtgtgtatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 5817380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 304
Target Start/End: Original strand, 3287088 - 3287262
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||          ||    
T  3287088 agtgatacataaaccaccttagatggtatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagagtccttgtggtc-tctc-cacacaaaaaaa---ac 3287182  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgg-aaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3287183 tcgtattatctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 3287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 51579585 - 51579764
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| | | | |||| ||       |||||    
T  51579585 agtgataca-agaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccaaatacaattgtgacatgtgtccatgtgattcccacacatacaaaaaaactcac 51579683  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51579684 atttattgtctcttacacactctcacatggggtggtacaatgtgtgtatgaaagaaagtgtttacataaaacattatcctt 51579764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24059311 - 24059133
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  || |||||||        |  |    
T  24059311 agtgatacatagaccaccttagatggcatgtatcatttgtacacccacatacaattgtgacatgtgtccatgtggt--tcccacacacaaaaaaaatatc 24059214  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24059213 atttattgtctcttacacactcttacatggggtggtacaatgtgtgtatggaagaaagtgtgtacataaaacattatcctt 24059133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39631093 - 39631008
Alignment:
Q  221 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39631093 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatagagtggtacaatgtgtatatggaaaaaagtatgtacatgaaacattatcctt 39631008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32525206 - 32525034
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnn 219  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||  |||| ||| | |||||||          
T  32525206 aagagtagtgatacatagaccatcttaggtggcatataccacttatacatccacacacaattgtgatatgtgtctatgtgttccacacacacacacaaaa 32525107  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacat 292  Q
     ||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32525106 actgtcatttattatctctcacacactctcatatggggtgatacaatgtgtgtatggaaaaaaaggtgtacat 32525034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 201
Target Start/End: Original strand, 51579324 - 51579399
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  51579324 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacatacaattgtgacatgtgtccatgtggt 51579399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26720077 - 26719936
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacat 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||| | ||| |||       |||||||    
T  26720077 tgatacataaaccaccttaggtggcgtgtaccacttctacacccacattcaattgtaacatgtgtctttgtggtccccacacgcac---aaaactcacat 26719981  T
Q  228 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgt 272  Q
     |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26719980 tttgtgtctctcacacactgtcacatggggtggtacaatgtgtgt 26719936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42179325 - 42179228
Alignment:
Q  116 aaaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  42179325 aaaaaagagtaatgatacatagaccaccttaggtggtatgtaccacttatacacccatgcacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 42179228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 213
Target Start/End: Original strand, 50498200 - 50498301
Alignment:
Q  112 ttttaaaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacac 211  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  50498200 ttttataaaagagtagtgatacatagatcaccttaggtagtatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacac 50498299  T
Q  212 ac 213  Q
    ||    
T  50498300 ac 50498301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Original strand, 5208425 - 5208486
Alignment:
Q  245 ctctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5208425 ctctcacatggagtggtacaatatgtgtatgaaaaaaagtgtgtacataaaacattatcctt 5208486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 187
Target Start/End: Original strand, 32290205 - 32290279
Alignment:
Q  112 ttttaaaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgaca 187  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  32290205 ttttaaaaaa-agtagtgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgaca 32290279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 275
Target Start/End: Original strand, 41277220 - 41277371
Alignment:
Q  127 gtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac--nnnnnnnctca 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||||         ||||    
T  41277220 gtgatacatagatcaccttaggtgacatgtaccacctgtacacccacatacaattgtgacatgtgttcatgtggtccccacacacacaaaaaaaaactca 41277319  T
Q  225 catgtattgtctctcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatg 275  Q
    | | |  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41277320 ccttttgtgtctctcacacagtctcacatgatagtggtacaatgtgtgtatg 41277371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 51293130 - 51293081
Alignment:
Q  256 agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51293130 agtggtacaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 51293081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 201
Target Start/End: Original strand, 20107114 - 20107190
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttataca-cccacatacaattttgacaagtgtccttgtggt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  20107114 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacaccccgcacacaattgtgacatgtgtccatgtggt 20107190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14150033 - 14149958
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14150033 tgtctctcaaacactttcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcctt 14149958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22364639 - 22364552
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||| || ||||||    
T  22364639 agtgatacataaatcaacttaggtggcatataccacttatacacccatatacaattgtgatatgtgtccatgtggtcccctaacacac 22364552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25784092 - 25783908
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnn 219  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||| || | | ||| |||| | || ||||          
T  25784092 aagagtagtgatacatagatcatcttaggtggcatgtaccacttgtacatccacacataattgtgacatgtattcatgtagtccccacatacac-aaaaa 25783994  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
     ||||| | |||||| || ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  25783993 actcacttttattgtttcacacacactctcacataggatggtacaacgtgtgtatagaaaaaaagatgttcatgaaacattatcct 25783908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Original strand, 36851226 - 36851317
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacaca 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||    
T  36851226 agagcagtgatgcatagaccaccttaagtggcatgtaccacttgtacacccacgcatgattgtgacatgtgtccatgtagtcctcacacaca 36851317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39631316 - 39631271
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacaccc 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39631316 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacaccc 39631271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Original strand, 48525435 - 48525508
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  48525435 tgtctctcaaacactctcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagaggaaagggtgttcatgaaacattatcc 48525508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9118591 - 9118513
Alignment:
Q  229 tattgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  9118591 tattgtctctcacgcactctcacatgaatgtggtacattgtatgtatggaggaaagggtgttcatgaaatattatcctt 9118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 192
Target Start/End: Original strand, 48525330 - 48525396
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgt 192  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  48525330 agtgatacataaaccactttaggtggcatataccacttgtacatccacatataattgtgacatgtgt 48525396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40947176 - 40947103
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | | |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  40947176 tgtctctcacacactctcatatgaaatggtacaatatttatatgaaaaaaagagtgtccataaaacattatcct 40947103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 53456371 - 53456316
Alignment:
Q  245 ctctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||||    
T  53456371 ctctcacatggtgtggtacaatgtgtgcacggaaaaaagggttttcatgaaacatt 53456316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42179210 - 42179148
Alignment:
Q  244 actctcacat-ggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  42179210 actctcacataggagtggtacatagtgtgtatgaaaaaaaggatgttcatgaaacattatcct 42179148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22364534 - 22364469
Alignment:
Q  242 acactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||   | |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22364534 acactctcacatgggagtggtacataatatgtatggagaaaagggtgttcatgaaacattatcctt 22364469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14786806 - 14786734
Alignment:
Q  235 ctctcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  14786806 ctcttacacaatctcacatgagagtggtacataatgtgtatgaaaaaaatggtgtccatgaaacattatcctt 14786734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46576420 - 46576240
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||        ||||    
T  46576420 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttaacaagtgtccttgtggttcccccacacacaaaaaaagtcac 46576321  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46576320 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 46576240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 129 - 305
Target Start/End: Original strand, 33496506 - 33496682
Alignment:
Q  129 gatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||       |||| |||    
T  33496506 gatacatagaccaccttaggtgacatgtaccacttgtacacccacatataattttgacaagtgtctttgtgatccccccacacacaaaaaaactcatatg 33496605  T
Q  229 tattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33496606 tattgtctctcacacactctcacatggagtggtataatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 33496682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30922888 - 30922708
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||  |||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||       |||||    
T  30922888 agtgatacatagatcaccttaggtggtatgtaccacatgtacattcacacataattttgacaagtgtccttgtagtccccccacacacaaaaaaactcac 30922789  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30922788 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtatgtacatgaaacattatcctt 30922708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Original strand, 48460663 - 48460830
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |   |||||       |||      
T  48460663 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccatttgtacatccacatacaattttgacaagtgtccttatgatcccc---cacacaataaaactc-- 48460757  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacatt 300  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  48460758 --gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtgtggaaaaaagtgtgtacataaaacatt 48460830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 303
Target Start/End: Original strand, 51937 - 52118
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnn 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||            
T  51937 agagtagtgatacatagaccaccttaggtggtatgtactatttgtacatctatatacaattttaacaagtatccttgtggtccttccacaca-aaaaaaa 52035  T
Q  221 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatc 303  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52036 ctcatatgtattatctctctcacactctcatatgtagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatc 52118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38755071 - 38754897
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||| ||||| |||||| |||| ||| |  ||||||       |||||||    
T  38755071 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgaacacccatacataattatgacatgtgtccatgtgatcccc--acacacaaaaaaactcacat 38754974  T
Q  228 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  38754973 ttattgtctctcacacactctcacatggggtggtataatgtatgtatggaaaaaaaggtgtacatgaaatattatcc 38754897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47480188 - 47480012
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  || |||||||       || ||||    
T  47480188 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccatttgtacaccca-atacaattgtgacatgtgtccatatggt--tcccacacacaaaaaaacttacat 47480092  T
Q  228 gtattgtctctcacacactctcacatggag-tggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  47480091 ttattgtctcttacacactctcacatgggggtggtacaatgtgtgtatggaagaaagtgtatacattaaagattgtcctt 47480012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42974556 - 42974469
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||| | |||||||    
T  42974556 agtgatacataaaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattgtgacatgtgttcatatggtccccacacacac 42974469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38349637 - 38349457
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||   ||||||        ||||     
T  38349637 agtgatacataaaccatcttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtgttccctacacaca-taagaaactcat 38349539  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
     | |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  38349538 cttttgtgtctctcaaacactctcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagaggaaagggtgttcatgaaacattatcctt 38349457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Original strand, 28713681 - 28713860
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||   ||||||        ||||     
T  28713681 agtgatacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtgttccctacacaca-taagaaactcat 28713779  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
     | |  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28713780 cttttgtgtctctcaaacactctcacatgaaagtggtacaatatgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcct 28713860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 31741049 - 31741114
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  31741049 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtc 31741114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 304
Target Start/End: Original strand, 11752604 - 11752781
Alignment:
Q  129 gatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||| |  ||||||| | ||||||        ||||| |     
T  11752604 gatacatagaccaccttaggtggcatgtatcacttgtacacctacatataattgtgacatgtgttcacgtggtccccacacaca-taaaaaactcacctt 11752702  T
Q  229 tattgtctctcacacactctcaca---tggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |  |||||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||    
T  11752703 ttgtgtctctcacacactctcacatagtagcgtggtacaatgtgtgtatggaaaaaaagatgtccatgaaatattatcc 11752781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Original strand, 31741148 - 31741217
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  31741148 tcacacactctcacatgggagtggtacatagtgtgtatagaaaaaaggatgttcatgaaacattatcctt 31741217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37536386 - 37536317
Alignment:
Q  234 tctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattat 302  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||    
T  37536386 tctctcaaacactctcacatgaaagtggtacaatgtgtgtatagagaaaatggtgttcatgaaacattat 37536317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 306
Target Start/End: Original strand, 43359083 - 43359156
Alignment:
Q  234 tctctcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  43359083 tctctcacacactctcacatgagggtgatacattgtgtgtatggagaaaatggtgtcaatgaaacattatcctt 43359156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42974462 - 42974395
Alignment:
Q  237 ctcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  42974462 ctcacacactcttacatgggagtg-tacaatgtgtgtatggaaacaaaggtgttcatgaaacattatcc 42974395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43068833 - 43068765
Alignment:
Q  124 gcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgt 192  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||| ||||    
T  43068833 gcagtgatacacataccaccttaggtcgcatgtaccacttaaacctccacacataattttgacatgtgt 43068765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 302
Target Start/End: Original strand, 43659258 - 43659296
Alignment:
Q  264 aatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattat 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43659258 aatgtgtgtatggaaaaaagggtgttcatgaaacattat 43659296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6220230 - 6220185
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaa 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6220230 tcacacactctcacatgagagtggtacatagtgtgtatggaaaaaa 6220185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37536493 - 37536416
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||| || |||||    
T  37536493 agtgatacataaatcatcttaggtggcatatatcacatgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgcggtcc 37536416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34792834 - 34792651
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctc-acacacnnnnnn 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||          
T  34792834 agagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacatataattttgacaagtgtccttgtggtc-tctctacacacacaaaa 34792736  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792735 actcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgcaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 34792651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 121 - 305
Target Start/End: Original strand, 9045832 - 9046015
Alignment:
Q  121 agagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnn 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           
T  9045832 agagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtatcacttgtacacccacacacaattttgacaagtgttcttgtggtcctc-cacacacacaaaaa 9045930  T
Q  221 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9045931 cttacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 9046015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14314164 - 14313985
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||        ||||    
T  14314164 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggttcccccacacacaaaaaaagtcac 14314065  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14314064 atgtattgtctctcacacactctcacataaagtggtacaatgtgtgtatgga-aaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 14313985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1244734 - 1244554
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||       |||||    
T  1244734 agtgatacatagaccaccttaagtggcatgtaccacttgtacatccacacacaattttggcaagtgtccttgtggtccccccacacacaaaaaaactcac 1244635  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1244634 atgtattgtctctcgaacactctcatatgaagtagtacaatgtgtgtatgaaaaaaaatgtgtacatgaaacattatcctt 1244554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 203
Target Start/End: Original strand, 23915967 - 23916053
Alignment:
Q  117 aaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  23915967 aaaaagagtagtgatacatagatcaccttagatggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtcc 23916053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 29429590 - 29429674
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacaca 212  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| ||||||||    
T  29429590 tgatacacagactaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacatacaattgtgacatgtgtccacatggtcccctcacaca 29429674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 306
Target Start/End: Original strand, 12748217 - 12748396
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacat 227  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||| |   |||||||        |||  |    
T  12748217 tgatacataaaccactttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgacatctgtccatgtggttcctacacacacacaaaaaatcatct 12748316  T
Q  228 gtattgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  12748317 tttgtgtctctcaaacactctcacatggaagtggtacaatgtgtgtataaagaaaagggtgtttatgaaacattatcctt 12748396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9521887 - 9521810
Alignment:
Q  229 tattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  9521887 tattgtctcctacacacttttacatgggatggtacaatgtgtgtatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcctt 9521810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Original strand, 16718106 - 16718179
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  16718106 tgtctctcaaacactatcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcc 16718179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Original strand, 23916077 - 23916146
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23916077 tcacacactctcacatgggagtggtacatagtgtgtatgcagaaaagggtgttcatgaaacattatcctt 23916146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9521991 - 9521947
Alignment:
Q  130 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccaca 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9521991 atacatagatcaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccaca 9521947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Original strand, 16717994 - 16718042
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccaca 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16717994 agtgatacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccaca 16718042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Original strand, 32720468 - 32720541
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacat-ggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||    
T  32720468 tgtctctcacatactttcaaataggagtggtataatgtgtgtatggaaaaaaaggtgtccataaagcattatcc 32720541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 118 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14342375 - 14342186
Alignment:
Q  118 aaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaatttt-gacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnn 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||       
T  14342375 aaaagagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacacacaatttttgacaagtgtccttgtggtccccccatacacaaa 14342276  T
Q  217 nnnnct-cacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14342275 aaaaattcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 14342186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43066082 - 43065903
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||       |||||    
T  43066082 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacatccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtcccc-cacacacaaaaaaactcac 43065984  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43065983 atgtattgtctctcacacactctcacatggaatggtacaatgtatgtatggaaaaaaatgtgtacataaaacattatcctt 43065903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1993818 - 1993638
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnn-ctca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||         ||||    
T  1993818 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtatcacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtctccccacacataaaaaaaactca 1993719  T
Q  225 catgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1993718 catgtattgtctctcatacactctcacatgaaatggtacaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtacacgaaacattatcct 1993638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4076852 - 4076767
Alignment:
Q  221 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4076852 ctcacatgtattgtctctcacacactctcacatagagtggtacaatatgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 4076767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 304
Target Start/End: Original strand, 11904857 - 11905035
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||   | |||||       ||||     
T  11904857 agtgatacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtccctactcacac-aagaaactcat 11904955  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
     | |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  11904956 cttttgtgtctctcaaacactctcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcc 11905035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 203
Target Start/End: Original strand, 2599527 - 2599612
Alignment:
Q  118 aaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  2599527 aaaagagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgttcatgtggtcc 2599612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Original strand, 28897999 - 28898086
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  28897999 agtgatacatagaccaccttaggtggcatataccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 28898086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41075774 - 41075698
Alignment:
Q  127 gtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  41075774 gtgatacatagaccaccttaggtgacatgtaccacttgtacacccacatacaattgtgacatgtgttcatgtggtcc 41075698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4077145 - 4077062
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  4077145 aagagtagtgatatatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtatacccacacacaactttgataagtgttcttgtggtcc 4077062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45413716 - 45413629
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||| | |||||| | |||||||    
T  45413716 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacatccatacacaattgtgacatgtgtccatatggtccccacacacac 45413629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8368545 - 8368472
Alignment:
Q  130 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  8368545 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgtccacgtggtcc 8368472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 306
Target Start/End: Original strand, 31774729 - 31774910
Alignment:
Q  127 gtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnn--ctca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | || | |          ||||    
T  31774729 gtgatacatagaccaccttaggtgacatgtaccacttgtacactcacatacaattgtgacatgtgttcatgtggtccccacaaaaaaaaaaaaaaactca 31774828  T
Q  225 catgtattgtctctcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatg-gaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  31774829 cattttgtgtctttcacacactctcacatgatagtggtacaatgtgtgtatgagaaaatagtgtctac--gaaacattatcctt 31774910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 35200560 - 35200740
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| || |||||   |||| ||       ||||     
T  35200560 agtgatacataaaccaccttaggtggcatatattacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgcggtccctacacatacaagaaa-ctcat 35200658  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
     | |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  35200659 cttttgtgtctctcaaacactctcacatggaagtggtacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatcaaacattatcctt 35200740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5749109 - 5749029
Alignment:
Q  224 acatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||   ||||||||||| |||||||    
T  5749109 acatttattgtctctcacacactctcacatggggtggtataatgtatgtatgaaaaaaaagatgtacatgaaatattatcc 5749029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10391481 - 10391397
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacaca 212  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||    
T  10391481 tgatacatagatcatcttaggtggcatgtgccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacaca 10391397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16465789 - 16465723
Alignment:
Q  127 gtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtc 193  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  16465789 gtgatacatagaccaccttagacggcatgtaccacttgtatacccacatacaattgtgacatgtgtc 16465723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 187
Target Start/End: Original strand, 12142085 - 12142146
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgaca 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||    
T  12142085 agtgatacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacatccacatataattgtgaca 12142146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16465681 - 16465610
Alignment:
Q  231 ttgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattat 302  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  16465681 ttgtctctcacacattctgaaatggggtggtacattgtgtgtattgaaaaaaaggtgtccatgaaacattat 16465610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 302
Target Start/End: Original strand, 45502670 - 45502841
Alignment:
Q  130 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacatgt 229  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| |||||| |||||||  |  |||||        |||| || |    
T  45502670 atacataaaccaccttaagtggtatgtaccacttgtacattcatatacaattgtgacatgtgtccatgtggtctccatacacaaaaaaaaactcatattt 45502769  T
Q  230 attgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattat 302  Q
    |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  45502770 attgcctcttagacactctcacatagagtggtacaatatatatat-gaaaaaagggtgtccataaaacattat 45502841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8368445 - 8368370
Alignment:
Q  231 ttgtctctcacacactctcac-atggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8368445 ttgtctctcacacactcttactatgg-gtggcacattgtgtgtatggagaaaaatgtgtcaatgaaacattatcctt 8368370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 181
Target Start/End: Original strand, 27497177 - 27497231
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaatt 181  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  27497177 agtgataca-agaccactttaggtggcatgtaccacttgtacatccacagacaatt 27497231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 304
Target Start/End: Original strand, 28898100 - 28898167
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  28898100 tcacacactctcatatgagagtggtacatagtgtgtatggagaaaatggtgttcatgaaacattatcc 28898167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31523582 - 31523512
Alignment:
Q  234 tctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31523582 tctctcacacactctcgcatgaaatggtacaatgtatatatgaaaaaaag-gtgtccatcaaacattatcct 31523512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41075668 - 41075594
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatg-gaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||    
T  41075668 tgtctttcacacactctcacatgatagtggtacaatgtgtgtatgagaaaatggtgtctac--gaaacattatcctt 41075594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 2599636 - 2599692
Alignment:
Q  238 tcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatg 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  2599636 tcacacactctcacatgggagtggtacatagtgtgtatgaaaaaaagggtgttcatg 2599692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 304
Target Start/End: Original strand, 38247802 - 38247979
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||        ||||    
T  38247802 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggttcccccacacacaaaaaaagtcac 38247901  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38247902 atgtattgtctctcacacactctcacatagagtggtacaatgtgtgtatgg-aaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 38247979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 126 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12224181 - 12224006
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||    
T  12224181 agtgatacataaaccaccttaggtggcatgtaccatttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtcccctcacacacaagaaaactcac 12224082  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12224081 atgtattgtctctcacacactctcacctgaagtggtacaa-gtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattat 12224006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 127 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48034986 - 48034808
Alignment:
Q  127 gtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctc-acacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||       ||||     
T  48034986 gtgatacataaaccaccttaggtgacatgtaccacttgtacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcccccccacacacaaaaaaactcaa 48034887  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48034886 atgtattgtctctcacacactctcacatgaagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacataaaacattatcc 48034808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Original strand, 50989201 - 50989385
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnn 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | || |          
T  50989201 aagagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccctaaacgcaaaaaa 50989300  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50989301 actcacatgtattgtctctcacacactctcacatgaagtggtataatgtgtgtataaaaaaaaatgtgtacatgaaacattatcc 50989385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Original strand, 51092333 - 51092517
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnn 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | || |          
T  51092333 aagagtagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccctaaacgcaaaaaa 51092432  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51092433 actcacatgtattgtctctcacacactctcacatgaagtggtataatgtgtgtataaaaaaaaatgtgtacatgaaacattatcc 51092517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 9271107 - 9271296
Alignment:
Q  119 aaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc--tctcacacacnnn 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||       
T  9271107 aaagagtagtgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttgtacacccacacataattttgacaagtgtccttgtggtccctccacacacacaaa 9271206  T
Q  217 nnnnctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
        ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9271207 aaaactcacatgtattgtccctcacacactcttacatgaagtggtacaatatatgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 9271296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 128 - 302
Target Start/End: Original strand, 8496712 - 8496887
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggt-cctctcacacacnnnnnnnctcaca 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||        |||| |    
T  8496712 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtccacccacatacaattttgacaagtgtctttgtggtcccccacacgcaaaaaaatactcata 8496811  T
Q  227 tgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattat 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8496812 tgtattgtctctcacatactctcacatggagtggtagaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtgcatgaaacattat 8496887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 254
Target Start/End: Original strand, 33288136 - 33288264
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||  |||||||||| |||||||       |||||    
T  33288136 agtgatacatagaccaccttaggtggtatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgatatgtgtctatgtggtcctcacacacacaaaaaaactcac 33288235  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatg 254  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||    
T  33288236 atttattgtctctcacatattctcacatg 33288264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 306
Target Start/End: Original strand, 54713532 - 54713708
Alignment:
Q  130 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcacatgt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||| ||||| |||||| |||  ||| | |||| ||       |||| || |    
T  54713532 atacatagaccacgttaggtggcatgtaccacttgaacatccacacataattatgacatgtgtccatgtaatccccacacatacaaaagaactcatattt 54713631  T
Q  230 attgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  54713632 attgtctctcacacactctcacatggggttatataatgtatgtgtggaaaaaagggtgtacatgaaatattatcctt 54713708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 305
Target Start/End: Original strand, 23004760 - 23004938
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || | | |||||||  | |||||||       |||||    
T  23004760 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtattcatgtggtc--cccacacacataaaaactcac 23004857  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatgg-agtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    ||  |    || |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23004858 attcacacactttcacacactctcacatggaagtggtgcatagtgtgtatggagaaaagggtgttcatgaaacattatcct 23004938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39947333 - 39947262
Alignment:
Q  128 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtg 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  39947333 tgatatatagaccaccttaagtgacatgtaccacttatacacccacatacaattgtgatatgtgtccatgtg 39947262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 46135636 - 46135708
Alignment:
Q  234 tctctcacacactctcacat-ggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcct 305  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||    
T  46135636 tctctcacacactctcacataggggtggtacaatgtgtgtatggagaaaatgatgttcatgaaacattatcct 46135708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29915144 - 29915090
Alignment:
Q  119 aaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccac 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  29915144 aaagagtagtgatacatagaccaccttatgtggcatataccacttgtacacccac 29915090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29964297 - 29964243
Alignment:
Q  119 aaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccac 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  29964297 aaagagtagtgatacatagaccaccttatgtggcatataccacttgtacacccac 29964243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8330770 - 8330693
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcc 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||| |  ||||| ||||||||    
T  8330770 agtgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttgtacattcacacacaattgtgatatatgtccatgtggtcc 8330693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36674697 - 36674624
Alignment:
Q  126 agtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtg 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||    
T  36674697 agtgatacataaaccaccttaggtgacatataccacttgtacactcacatataattgtgacatgtgtccatgtg 36674624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Original strand, 46135522 - 46135599
Alignment:
Q  117 aaaaagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtcc 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  46135522 aaaaagggcagtgatacatagaccatcttaaatggcatgtatcatttgtacacctacatacaattgtgacatgtgtcc 46135599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 304
Target Start/End: Original strand, 40725959 - 40726029
Alignment:
Q  235 ctctcacacactctcacat-ggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40725959 ctctcacacattctcacataggagtgatacatagtgtgtatgaaaaaaaatgtgtccatgaaacattatcc 40726029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36674592 - 36674519
Alignment:
Q  232 tgtctctcacacactctcacatgga-gtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||| ||||    
T  36674592 tgtctctcaaacactctcatatggaagtggtacaatgtgtgtatagagaaaaggatgttcatgaaacataatcc 36674519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10415 - 10232
Alignment:
Q  120 aagagcagtgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnn 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  10415 aagagtagtaatacatagaccaccttaggtgacatgtactacttgtatattcacatataattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacaaaaaa 10316  T
Q  220 nctcacatgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 304  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10315 actcacatgtattgtctctcacatactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgg-aaaaagtgcgtacatgaaacattatcc 10232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0933 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0933
Description:

Target: scaffold0933; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 127 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3231 - 3054
Alignment:
Q  127 gtgatacata-gaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcctctcacacacnnnnnnnctcac 225  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||         |||     
T  3231 gtgatacataagaccatcttagatgacatgtaccatttgtacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtagtcc-ctcacacaaaaaaat--tcat 3135  T
Q  226 atgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3134 atgtattgtctctcatacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtatatgaaacattatcctt 3054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 306
Target Start/End: Original strand, 52924 - 52996
Alignment:
Q  235 ctctcacacactctcacatg-gagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcctt 306  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  52924 ctcttacacaatctcacatgagagtggtacataatgtgtatgaaaaaaatggtgtccatgaaacattatcctt 52996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University