View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7531_low_2 (Length: 526)

Name: NF7531_low_2
Description: NF7531
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7531_low_2
NF7531_low_2
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (20-516)||(5750538-5751034)
chr4 (57-416)||(56094114-56094476)
chr4 (72-410)||(867471-867812)
chr4 (159-410)||(42679191-42679442)
chr4 (57-351)||(24194911-24195200)
chr4 (57-353)||(22097142-22097431)
chr4 (175-353)||(47312131-47312308)
chr4 (217-385)||(48827624-48827790)
chr4 (220-395)||(51906005-51906177)
chr4 (57-351)||(18521263-18521560)
chr4 (224-335)||(26635908-26636018)
chr4 (142-254)||(35292995-35293108)
chr4 (110-355)||(51983377-51983621)
chr4 (123-350)||(13204829-13205041)
chr4 (225-313)||(40549350-40549437)
chr4 (290-385)||(25856972-25857067)
chr4 (62-153)||(48546759-48546850)
chr4 (175-308)||(24273985-24274119)
chr4 (143-267)||(2818943-2819068)
chr4 (123-308)||(26003779-26003959)
chr4 (98-352)||(26644827-26645081)
chr4 (232-290)||(600532-600590)
chr4 (213-282)||(10402112-10402181)
chr4 (62-187)||(23480643-23480767)
chr4 (251-352)||(52646778-52646878)
chr4 (224-355)||(4154330-4154459)
chr4 (220-283)||(14352264-14352327)
chr4 (212-395)||(23441516-23441691)
chr4 (310-392)||(40283853-40283936)
chr4 (241-344)||(48831655-48831757)
chr4 (220-290)||(7555718-7555788)
chr4 (72-118)||(24273919-24273965)
chr4 (310-352)||(47809056-47809098)
chr4 (224-337)||(48685772-48685884)
chr4 (192-272)||(18743010-18743091)
chr4 (220-253)||(25857083-25857116)
chr4 (68-112)||(3161385-3161429)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (20-516)||(18680576-18681072)
chr3 (57-410)||(16194073-16194427)
chr3 (57-404)||(8795534-8795881)
chr3 (57-393)||(29306180-29306507)
chr3 (58-395)||(43369768-43370101)
chr3 (57-208)||(42339903-42340054)
chr3 (57-343)||(33282710-33282997)
chr3 (62-410)||(36260781-36261108)
chr3 (220-352)||(29490997-29491128)
chr3 (143-317)||(2757339-2757513)
chr3 (220-337)||(30537507-30537621)
chr3 (275-355)||(22224029-22224108)
chr3 (192-282)||(17549728-17549819)
chr3 (289-352)||(20524556-20524619)
chr3 (224-267)||(22223785-22223828)
chr3 (62-155)||(47731195-47731288)
chr3 (296-345)||(39028708-39028757)
chr3 (220-264)||(48393893-48393937)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (72-410)||(31165617-31165956)
chr1 (57-410)||(31064937-31065296)
chr1 (72-407)||(15183625-15183961)
chr1 (57-410)||(27458241-27458588)
chr1 (60-410)||(35306991-35307341)
chr1 (60-260)||(39984737-39984938)
chr1 (57-260)||(14579172-14579374)
chr1 (57-213)||(11581528-11581687)
chr1 (251-395)||(14578442-14578586)
chr1 (57-352)||(26801264-26801557)
chr1 (80-410)||(15939102-15939432)
chr1 (301-410)||(11580590-11580699)
chr1 (137-375)||(2765463-2765696)
chr1 (224-308)||(4080395-4080478)
chr1 (60-183)||(20710743-20710866)
chr1 (231-375)||(48496985-48497128)
chr1 (253-352)||(23532831-23532929)
chr1 (62-196)||(6568043-6568177)
chr1 (224-308)||(30440642-30440725)
chr1 (220-395)||(15947498-15947672)
chr1 (220-395)||(28292285-28292459)
chr1 (166-328)||(32893687-32893849)
chr1 (224-273)||(21686334-21686383)
chr1 (192-265)||(42241960-42242033)
chr1 (72-116)||(15947760-15947804)
chr1 (72-116)||(28292547-28292591)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (57-410)||(11175319-11175672)
chr8 (57-394)||(15175047-15175382)
chr8 (57-410)||(35170766-35171119)
chr8 (149-375)||(43120648-43120875)
chr8 (64-382)||(31447013-31447331)
chr8 (224-410)||(26600835-26601020)
chr8 (57-238)||(1824241-1824422)
chr8 (57-238)||(1858686-1858867)
chr8 (96-404)||(26916095-26916403)
chr8 (276-395)||(32350815-32350933)
chr8 (276-395)||(32367476-32367594)
chr8 (72-157)||(9555212-9555297)
chr8 (224-349)||(4187325-4187449)
chr8 (72-375)||(4606082-4606382)
chr8 (72-273)||(45537752-45537952)
chr8 (244-395)||(1823403-1823551)
chr8 (244-395)||(1857848-1857996)
chr8 (235-354)||(14636679-14636794)
chr8 (248-355)||(10839657-10839763)
chr8 (80-249)||(10839910-10840079)
chr8 (57-159)||(16816200-16816302)
chr8 (90-290)||(40112689-40112892)
chr8 (84-135)||(26601064-26601115)
chr8 (137-263)||(12076565-12076692)
chr8 (163-249)||(37294978-37295065)
chr8 (234-344)||(9550609-9550716)
chr8 (220-292)||(14628946-14629018)
chr8 (57-115)||(43915680-43915738)
chr8 (224-305)||(8149813-8149893)
chr8 (237-290)||(28452044-28452097)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (57-410)||(5187740-5188094)
chr2 (57-410)||(9298600-9298953)
chr2 (72-410)||(10221498-10221838)
chr2 (57-395)||(18704550-18704888)
chr2 (57-395)||(21436885-21437221)
chr2 (174-393)||(43080828-43081044)
chr2 (144-355)||(37817597-37817809)
chr2 (224-395)||(83555-83723)
chr2 (146-353)||(33428814-33429019)
chr2 (57-410)||(1130598-1130937)
chr2 (90-284)||(17200687-17200882)
chr2 (224-290)||(11862316-11862382)
chr2 (175-284)||(14201473-14201583)
chr2 (224-352)||(35347227-35347358)
chr2 (220-355)||(45707221-45707355)
chr2 (238-357)||(36472374-36472491)
chr2 (72-159)||(931122-931209)
chr2 (224-375)||(41959698-41959848)
chr2 (82-170)||(41959855-41959947)
chr2 (144-252)||(7816961-7817069)
chr2 (226-287)||(9158759-9158820)
chr2 (224-281)||(35494086-35494143)
chr2 (224-308)||(43229275-43229361)
chr2 (292-352)||(35341851-35341911)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (60-410)||(11751788-11752136)
chr6 (57-352)||(2391390-2391685)
chr6 (57-330)||(11785667-11785938)
chr6 (62-410)||(10479507-10479854)
chr6 (58-187)||(10629020-10629148)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (62-394)||(34595909-34596241)
chr7 (72-231)||(29407998-29408158)
chr7 (224-410)||(47084935-47085121)
chr7 (57-227)||(47084740-47084909)
chr7 (224-355)||(38582236-38582366)
chr7 (85-161)||(39983558-39983634)
chr7 (140-343)||(32438064-32438267)
chr7 (243-353)||(33407187-33407291)
chr7 (224-355)||(3839277-3839405)
chr7 (232-344)||(30053847-30053958)
chr7 (60-159)||(37204698-37204797)
chr7 (220-352)||(43230828-43230956)
chr7 (224-333)||(46435576-46435688)
chr7 (57-170)||(32450396-32450509)
chr7 (140-256)||(32711248-32711365)
chr7 (220-260)||(9003588-9003628)
chr7 (57-252)||(32297269-32297464)
chr7 (175-290)||(33589262-33589378)
chr7 (224-267)||(38362622-38362665)
chr7 (224-290)||(44594342-44594408)
chr7 (72-157)||(30053685-30053770)
chr7 (220-261)||(45123141-45123182)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (57-410)||(16600313-16600670)
chr5 (67-355)||(33401534-33401813)
chr5 (57-187)||(27499433-27499562)
chr5 (234-335)||(34367194-34367294)
chr5 (66-350)||(5473948-5474231)
chr5 (224-352)||(5552512-5552639)
chr5 (224-394)||(36267944-36268110)
chr5 (58-166)||(932479-932587)
chr5 (194-257)||(8822379-8822443)
chr5 (162-265)||(10099625-10099729)
chr5 (238-308)||(932643-932711)
chr5 (224-283)||(32424222-32424281)
chr5 (310-352)||(4248965-4249007)
chr5 (256-353)||(5177433-5177529)
chr5 (295-352)||(17053558-17053615)
chr5 (224-339)||(21076304-21076415)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (60-410)||(508077-508412)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 516
Target Start/End: Original strand, 5750538 - 5751034
Alignment:
Q  20 acatgaatataaaaagttagtcctttaannnnnnnnggttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5750538 acatgaatataaaaagttagtcctttaattttttttggttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactca 5750637  T
Q  120 atcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5750638 atcaaaaagtgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc 5750737  T
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5750738 aaacaaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatatgaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtgta 5750837  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaaccgatgcga 419  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5750838 taaataatcatgttggttgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtttataagcactttttagcgatgttggctgaaccgatgcga 5750937  T
Q  420 gcctcgttggtgaactttgtcgtttttcttcctcgacattttgttgggacagaatttctccaaattatattgccctctaagccttttgaaacctttg 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5750938 gcctcgttggtgaactttgtcgtttttcttcctcgacatttcgttgggacagaatttctccaaattatattgccctctaagccttttgaaacctttg 5751034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 57 - 416
Target Start/End: Original strand, 56094114 - 56094476
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagc--gtttgtatggatgtttaatgttaag 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  56094114 gttataaattggtcatttaagttataaaataattgcaccattatcctaatttcatcaaactaagtcaaaaaaaatgtttgtgtggatgtttaatgttaag 56094213  T
Q  155 ttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaa-taaaattgatcgattacttgatttataatat 253  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  56094214 ttgatttgtccaaattcactgctctcaaaactagtgctcatagatgtgttattcggtctttattcaaaataaaattgacctattacttgatttataatgt 56094313  T
Q  254 tgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaa-tgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56094314 tgttgatcaaatatttatctgtaaaattaggctt-aaattcaaaaataagaagaagaaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataaacactttt 56094412  T
Q  353 ggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaaccgatg 416  Q
    | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||||| |||||    
T  56094413 gaacctaccatcttaatgttaaatggtctataagcacattttaatgaagttggctgaaacgatg 56094476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 867812 - 867471
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccatta----tcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaa 167  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  867812 tttaagtcataaaatatttgcatcattaattgtcctaatttcatcaaacttaatcaaaaagtgtttacgtggatgtttactgttaagttagtttgtccaa 867713  T
Q  168 attaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaata 266  Q
    ||| |||  | |||||| || ||||||||   ||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  867712 attcatttatatcaaaagtagagctcataatagtgttattcggtcttgattcaaaacaaaaatgaccgattatttgatttataatattgttgatcaaata 867613  T
Q  267 tctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatctt 366  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||    
T  867612 t---tatgtaaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaggaaaatgtttataagtaatcatgtttgatgtcataagtatttttgaacctaccatctt 867516  T
Q  367 -aatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
     |||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||    
T  867515 aaatgttaaatagtctataaacactttttaacgaagttgactgaa 867471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 159 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42679442 - 42679191
Alignment:
Q  159 tttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattgtt 257  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| | || ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||     
T  42679442 tttgtccaaattcactgctcttaaaactagtgctcaaaggtgtgttatacggttttgattcaaaacaaaattgaccgattacttgatttataacgttgtc 42679343  T
Q  258 gataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatc 357  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  42679342 gatcaaatatttatctgtaaaattaggcttgaa-ttcaaaaataataagaaaaaaatatgtatacgtaatcatgtttgatgttataaacacttttggacc 42679244  T
Q  358 caccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  42679243 tactatcttaatgttaaatggtctataaacactttttaacgaagttggctgaa 42679191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24195200 - 24194911
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  || |||| ||||||||| | |||||| |||| | || | |||| ||||||||||    
T  24195200 gttataaattggtcatttaagtcataaaatatcggcaccattattatattttcttcaaactcagttaaaaagtgtttatgtgaacgtttgatgttaagtt 24195101  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttga-ttcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    ||| ||||||| || ||  ||||||||| ||  | ||| | ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| |    
T  24195100 ggtatgtccaatttcatcactctcaaaattagggttcaaaagtgtgttattcagtcttgacttgaaacaaaattgattaattacttaatttataatatcg 24195001  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttt 351  Q
    ||||| | |||| ||| | |||||||| ||||| |||||||    |  ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24195000 ttgattatatatttat-tgtaaaattaagcttg-aattcaa----attaagaagaaaatgtgtgtaagtaatcatgtttgatgtcataaacacttt 24194911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22097431 - 22097142
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||      | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||     
T  22097431 gttataaattggtcatttaagttagaaaatattt------tgatcttacttttatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtgtggaaacttaattttaagtc 22097338  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaa--taaaattgatcgattacttgatttataatatt 254  Q
     || |||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||| | |||| ||||||||| |||    |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22097337 agtatgtccaaatttattcctctcaaaactaaggttgataggtgtatcattcagtcttgatttaaaagcgaaattgttcgattacttga--tataatatt 22097240  T
Q  255 gttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttg 353  Q
    |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |   ||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  22097239 gttgatgaaatatttatctttaaaattagtcttg-aattcaaaaccaagaagaaaaaaatttgcgtaagtaatcaaggttgatgtcacaagcccttttg 22097142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47312308 - 47312131
Alignment:
Q  175 gctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatata 274  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||  || | | |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| ||| |     
T  47312308 gctctcaaaactaaggttcatatgtgtattattcagtcttatttgacacaaaactgatcgattacttgctctataatatcgttgatgaaatatttatctg 47312209  T
Q  275 taaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttg 353  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  47312208 taaaatcaagcttg-aattcaaaaacaagaagaagaaaatgtacacaagcaatcacgtttgatgttataaacatttttg 47312131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 385
Target Start/End: Original strand, 48827624 - 48827790
Alignment:
Q  217 ttcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgt 316  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || | ||||||||  |||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  48827624 ttcaaataaaattaatatattacttgatttataatattgtagatgaaatattaatttgtaaaattatacttg-aatttaaaaacaagaagaataaaatgt 48827722  T
Q  317 atataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataa 385  Q
      |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | | ||||||| || |||||| ||| |||||    
T  48827723 gcataagtaatcatg-ttgatgtcataaacacttttgaagctaccatctcaacgttaaatggtttataa 48827790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 51906177 - 51906005
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| |||   || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  51906177 aaatgaaattgatcgatcactttgtttataatgttgttgatgaaatatttatcggtacaattagactt-aaattcaaaaactagaagaagaaaatgtgtg 51906079  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
    ||| ||||||||||  |||| ||||| |||| |||| | ||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  51906078 taagtaatcatgttatatgtaataagtacttctggacctaccgtctcaatgttaaaa--tctataaacacttttta 51906005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18521560 - 18521263
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaat--gttaag 154  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||| | |||||  |||   |||  |||||||  ||||||    
T  18521560 gttataaattgaacatataagtcataaaatatatgcaccactatcttattttcattaaactcaaccgaaaagtctttaggtgggcgtttaatatgttaag 18521461  T
Q  155 ttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatat 253  Q
    |||   ||||| | || |  |||||||||||||  | ||| | |||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    |||||||||||||||||    
T  18521460 ttgacatgtcctagttcagggctctcaaaactatggttcacatgtgtgttattcgatcttgatttgaaacaaaattgataatatacttgatttataatat 18521361  T
Q  254 tgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaa-gaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttt 351  Q
    |||||||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| | |||  |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  18521360 tgttgatggaatatttatttgtaaaattaggcttg-aattcaaaaataagaagaataaaaatgtgtgtaagcatacatgtttgatgtcgtaagcacttt 18521263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 335
Target Start/End: Original strand, 26635908 - 26636018
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26635908 aaaattgatcaattacttgatctataatgttgttgataaaatatttatctgtaaaattatgattg-aattgtgaaacaataagaagaaaatgtatataaa 26636006  T
Q  324 taatcatgtttg 335  Q
    ||||||| ||||    
T  26636007 taatcatctttg 26636018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35293108 - 35292995
Alignment:
Q  142 gtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattact 240  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||  | |||||  ||| |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  35293108 gtttaatgttaagttggtatgtctaaattcatcgctctcaaaattagggttcataaatgtattattcagtcttgatttgaaacaaaattgatcgattact 35293009  T
Q  241 tgatttataatatt 254  Q
    ||||||||||||||    
T  35293008 tgatttataatatt 35292995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 51983621 - 51983377
Alignment:
Q  110 atcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaat-gttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagct-cataggtgtgttatt 207  Q
    |||||||||||| |||||  |||| | | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||  | | |||| |||| |||||    
T  51983621 atcaaactcaattaaaaaatgtttatgtagatatttaattgttaagttggtatgttcaaattaactgttctcaaaattaggggttcataagtgtattatt 51983522  T
Q  208 ctgtcttgattcaa-ataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaag 306  Q
    |  ||||||||  | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||| | |||||||| | ||||| |||||||||  ||||    
T  51983521 cgatcttgatttgacacaaagttgatcgattacttaatttataatattg---ataaaatatttatctgtaaaattaagtttgaa-ttcaaaaacttgaag 51983426  T
Q  307 aagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    || |||||||  |||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  51983425 aacaaaatgtgcataagtaaccatatttgatgtcataaatacttttgga 51983377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13205041 - 13204829
Alignment:
Q  123 aaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aa 221  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||||| || || |||| ||||| |   |||| ||||||| || |||||||||| ||||||  | || |||  ||    
T  13205041 aaaaagtgtttatatggacgttcaatgttaaattagtatgtctaaattcac--ctcttaaaactagagttcataggtgtattattcaattttaatttgaa 13204944  T
Q  222 ataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatata 321  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||             |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13204943 agaaaattgatccattacttgatttataatgttgttgatgaaatat-------------taggcttgaa-ttcaaaaacaagaagaagaaaatgcatgta 13204858  T
Q  322 aataatcatgtttgatgtcataagcactt 350  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  13204857 agtaattatgtttgatgtcataaacactt 13204829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 313
Target Start/End: Original strand, 40549350 - 40549437
Alignment:
Q  225 aaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaa 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  40549350 aaattgatcgattacttgacttataatattgttgataaaatatttatttgtaaaattatgattg-aattcggaaacaagaaaaagaaaa 40549437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25857067 - 25856972
Alignment:
Q  290 aattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataa 385  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||    
T  25857067 aattcaaaatcaataagtagagaatgtgcgtaaataatcatgtttgatgtcataaacatttttggatctaccacctcaatgttaaatggtccataa 25856972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 153
Target Start/End: Original strand, 48546759 - 48546850
Alignment:
Q  62 aaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaa 153  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||| | |||| |||| |||||||    
T  48546759 aaattgatcctttaaatcataaaatatttgcaccattatcctattttcatcaaacttagttaaaaagtgtttatgtggacgtttgatgttaa 48546850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 308
Target Start/End: Original strand, 24273985 - 24274119
Alignment:
Q  175 gctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatat 273  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||  ||||  |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||   |||| |||||| ||| |    
T  24273985 gctctcaaaactagaactcatatgtgtaatatttagtcttgatttgaaataaaattgatcgtttattggatttataatatcaatgatgaaatatttatct 24274084  T
Q  274 ataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaa 308  Q
     ||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  24274085 gtaaaattatactttgaattcaaaaacaagaagaa 24274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2819068 - 2818943
Alignment:
Q  143 tttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtctt-gattcaaataaaattgatcgattactt 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| | || | ||||| | || |||| ||||   | ||||||||    
T  2819068 tttaatgctaagttggttggtcgaaattcattgctctcaaaactaatgttcatatgtgtatcatacggtcttagtttgaaatgaaatcatttgattactt 2818969  T
Q  242 gatttataatattgttgataaaatat 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||    
T  2818968 gatttataatgttgttcataaaatat 2818943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26003959 - 26003779
Alignment:
Q  123 aaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc--a 220  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| | | ||| || |   |||||| |||||| | ||||| |||| |||| | |||||||||   |    
T  26003959 aaaaagtgtttatgtggaagtttaatgttaagttggtattttcaatttcacatctctcacaactaaggttcatatgtgtattat-cagtcttgattttga 26003861  T
Q  221 aataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaa 308  Q
    ||| |||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  26003860 aattaaattgatcgattactt-----ataatattgttgatgaaatatttatctgtaaaattaagcttg-aattcaaaaataagaagaa 26003779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 352
Target Start/End: Original strand, 26644827 - 26645081
Alignment:
Q  98 tatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcatag 197  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||| |||| | ||||  || |||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||| ||||  | |||||     
T  26644827 tatcctattttcatcaaacttagttaaaaagtgtttatttggacattcaatgttaaattggtatgtccaaattcactaatctcaagactagtgttcatat 26644926  T
Q  198 gtgtgttattctgtcttga-ttcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaa 296  Q
    |||| |||| | || |||| || | |  ||||||| | |||||||  ||||||| ||  ||||| |||||| |||   ||||||||| |||||| |||||    
T  26644927 gtgtattatccagttttgacttgacactaaattgacctattactttctttataacatcattgatgaaatatttatcggtaaaattagacttgaa-ttcaa 26645025  T
Q  297 aaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    |||||| | ||||||||| | |  || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26645026 aaacaaaaggaagaaaatatgtgcaagtaatcatgtttgatgtcgtaagaactttt 26645081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 290
Target Start/End: Original strand, 600532 - 600590
Alignment:
Q  232 tcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaa 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  600532 tcgattacttgatttgtaatattgttgatgaaatgtttatatgtaaaattaagcttgaa 600590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10402181 - 10402112
Alignment:
Q  213 ttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaatta 282  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  10402181 ttgatttaaatcaaatcaatcgattacttgatttatcatgttgttgatataatatttatctataaaatta 10402112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23480767 - 23480643
Alignment:
Q  62 aaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggttt 161  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||||| |||  |||| |||||||   | |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||      
T  23480767 aaattggtcctttaatttataaaatattttcgccattaccctc-tttcttcaaacttggttaaaaagtgtttatgttgatgtttaatgttaagttggtgg 23480669  T
Q  162 gtccaaattaattgctctcaaaacta 187  Q
    || |||||| | ||||||||||||||    
T  23480668 gttcaaattcactgctctcaaaacta 23480643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 52646778 - 52646878
Alignment:
Q  251 tattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactt 350  Q
    |||||||||| || ||| ||| | |||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  52646778 tattgttgatgaattatttatctctaaaattaagcttgaa-ttaaaaaataataagaagaaaatgtgtttaactaatcatgcttgatatcataaacactt 52646876  T
Q  351 tt 352  Q
    ||    
T  52646877 tt 52646878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 355
Target Start/End: Original strand, 4154330 - 4154459
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| | |  |      
T  4154330 aaaattgatagattacttgatttataatgtcattgataaaaaaattatctgtaaaatta-gcttg-aattcaaaagtaagaagaagaaaatatgtgcatg 4154427  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    | || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4154428 tgattatgtttgatatcataaacacttttgga 4154459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14352327 - 14352264
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattag 283  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  14352327 aaataaaatcgatagattacttgattaataatattgctgatgaaatatttatctgtaaaattag 14352264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23441691 - 23441516
Alignment:
Q  212 cttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaa 311  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||     | |  || |||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  23441691 cttgattgaaataaaattaatagattatttgatttataatgttgttgata----gtatgaatgtaaaattaagattg-aattcaaaaacaa-aggaagaa 23441598  T
Q  312 aatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
    ||| |   ||| |||||||||||||||||  || || ||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||    
T  23441597 aatatgcgtaagtaatcatgtttgatgtc--aaacatttttggatttaccatctcaatgttaaatgatctataaatacttttta 23441516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40283936 - 40283853
Alignment:
Q  310 aaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcac-ttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttt 392  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |  ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40283936 aaaatgtatgtaagtaatcatgtttggtgtcataaacactttttggaccttccacctcaatgttaaaaggtcattaagcacttt 40283853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48831757 - 48831655
Alignment:
Q  241 tgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtc 340  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| |||||||||  || || || |||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | ||    
T  48831757 tgatttataatgttgtagattaaatatttatatgtaaaattagtatttaa-ttgaaaaacaataagaataaaatttatgtaagtaatcatgtttggtatc 48831659  T
Q  341 ataa 344  Q
    ||||    
T  48831658 ataa 48831655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7555788 - 7555718
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaa 290  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||| || || | ||||||||||||||    
T  7555788 aaataaaattaatcaattacttgatttataatattattgatgatttatttacatgtgaaattaggcttgaa 7555718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 118
Target Start/End: Original strand, 24273919 - 24273965
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactc 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24273919 tttaagtcataaaatatctgcatcattatcctattttcatcaaactc 24273965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 352
Target Start/End: Original strand, 47809056 - 47809098
Alignment:
Q  310 aaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47809056 aaaatatatataaataatcatgtttgacgtcataaacactttt 47809098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 337
Target Start/End: Original strand, 48685772 - 48685884
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataata-ttgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataa 322  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||   ||| |||||||||| | ||||||||||||| |  |||    
T  48685772 aaaattgattgattattttatttataatatttgttgattaaatatttatttgtaaaattatttttg-aattcaaaaatatgaagaagaaaatggaggtaa 48685870  T
Q  323 ataatcatgtttgat 337  Q
    || ||||||||||||    
T  48685871 at-atcatgtttgat 48685884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Original strand, 18743010 - 18743091
Alignment:
Q  192 tcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctata 272  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||    
T  18743010 tcataagtgtgttattcaatcttgatttgaaactaaattgatcggttacttgatttgtaatattgttaatgaaatatttata 18743091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25857116 - 25857083
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25857116 aaataaaactgatcgattacttgatttataatat 25857083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 3161385 - 3161429
Alignment:
Q  68 gtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  3161385 gtcatttaagtcataaaatacttgcacaattatcctattttcatc 3161429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 516
Target Start/End: Original strand, 18680576 - 18681072
Alignment:
Q  20 acatgaatataaaaagttagtcctttaannnnnnnnggttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18680576 acatgaatataaaaagttagtcctttaattttttttggttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactca 18680675  T
Q  120 atcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18680676 atcaaaaagtgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc 18680775  T
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18680776 aaacaaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatatgaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtgta 18680875  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaaccgatgcga 419  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18680876 taaataatcatgttggttgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtttataagcactttttagcgatgttggctgaaccgatgcga 18680975  T
Q  420 gcctcgttggtgaactttgtcgtttttcttcctcgacattttgttgggacagaatttctccaaattatattgccctctaagccttttgaaacctttg 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18680976 gcctcgttggtgaactttgtcgtttttcttcctcgacatttcgttgggacagaatttctccaaattatattgccctctaagccttttgaaacctttg 18681072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Original strand, 16194073 - 16194427
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||    
T  16194073 gttagaaattggtcctttaaatcataaaatatttgcatcattatcctaatttcatcaaattcaatcaaaaaatgtttttgtggatgtttaatattaagtt 16194172  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16194173 ggtttgtccaaattcatagctcttaaaactagagctcataggtgtgttatttagtcttgattcaaaacaaaattgatcgattacttgatttataatattg 16194272  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16194273 ttgatcaaatatttatatgtaaaattaggcttgaaattcaaaaacaaaaagaagaaaatgtgtatgagtaatcacgtttgatgtcataagcacttttgga 16194372  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  16194373 cctaccatcttaatgttaaatggtctataaacactttttaacgaagttggctgaa 16194427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 57 - 404
Target Start/End: Original strand, 8795534 - 8795881
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||    
T  8795534 gttataaatttgtcctttaagtcataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagtgtta-tgtggatgtttaatgttaagtt 8795632  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8795633 ggtttgtccaaattcattgctctcaaaactagagctcataagtgtgttattcggtcttgattcaaaacaaaattgatcaattacttgatttataatattg 8795732  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8795733 ttgatcaaatatttatatgtaaaattatgtttgaaattcaaaaacaataagaagaaaatgtgtataaataatcatgcatgatgtcataagtacttttgga 8795832  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttg 404  Q
     | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8795833 cctaccatcttaatattaaatggtttataagcactttttaacgaagttg 8795881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 57 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29306507 - 29306180
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29306507 gttacaaattggtc-tttaagtcataaaatatttacaccattatcctaatttcatcaaacttaatcaaaaagcgtttatatggatgtttaatgttaagtt 29306409  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||||||||||||| ||| ||         | || || ||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29306408 ggtttgtccaaattcatttct---------agaggtcgtaggtgtgttattcgatcttaattcaaaacaaaattgatcgattacttgatttataatatgg 29306318  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  29306317 ttgatcaaatatttatatgtaaaatttggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtgtataagtaataatgtttgatgtcataagcacttttgaa 29306218  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttt 393  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  29306217 cctaccatcttaatattaaatggtctataaacactttt 29306180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43370101 - 43369768
Alignment:
Q  58 ttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcg-tttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||    ||||| | |||||||||||   ||||    
T  43370101 ttataaattggtcatttaagtcgtaaaatatttgcaccatttttctaatttcatcaaactaagtcaaaaaaatatttgtgtagatgtttaatg---agtt 43370005  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    | |||||||||||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  ||||||  |||||||||| |||    
T  43370004 gatttgtccaaattcactactctcaaaactaatgttcataggtgtgttattcggtcttgatacaaaacaaaattgactgattac--gatttataattttg 43369907  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43369906 ttgattaaatatttatttgtaaaattatgcttgaa-ttcaaaaataataagaagaatatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataaatacttttgga 43369808  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43369807 tttaccatattaatgttaaatggtctataagcacttttta 43369768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42340054 - 42339903
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  42340054 gttacaaattggtcatttatgtcataaaatatttgcaccattatcctaatttcgtcaaactcaaacaaaaaatgtttatgtggatgtttaatgttaagtt 42339955  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattc 208  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  42339954 cgtctgtccaaattcattgctctcaaaactagagttcataggtgtgttattc 42339903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33282997 - 33282710
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||  || ||||||| || ||| |||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  33282997 gttacaaattggtcctttaagtcataaaacattcacatcattatcatattttaatcaaactcagttaaaaagtgtttatgtggacgtttaatgttaagtt 33282898  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||  ||| ||||| |    ||| |||| ||  | |||||||||| |||||   | ||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||    
T  33282897 ggtaggtctaaattcaccattcttaaaattagggttcataggtgtattattaaattttgatttgaaaaaaaattgatctatcacttgatttatgaaattg 33282798  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcata 343  Q
    ||| |||||||| ||| | |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33282797 ttggtaaaatatttatttgtaaaattatgtttgaaattacaaaacaagaagaagaaaatgtatgtaagtaatcatgtttgatgtcata 33282710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36261108 - 36260781
Alignment:
Q  62 aaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggttt 161  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||| |||| | ||||  ||||||||||||| ||| |    
T  36261108 aaattgatcatttaagttagaaaatatatgcaccatgatcctattttcatcaaactctgttaaaaagtgtttatttggacatttaatgttaagtaggtat 36261009  T
Q  162 gtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgata 261  Q
    ||||||||| |   ||||||     | || |||||| ||| |||||| |||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36261008 gtccaaattcaacactctca-----agagttcatagatgtattattcagtctt-----------aattgatcgattacttgatttataatattgttgaag 36260925  T
Q  262 aaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccacc 361  Q
    |||||| |||   |||||||| | ||| |||||||||||   |||| ||||||||  |  |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| | |||    
T  36260924 aaatatttatccgtaaaattaagtttg-aattcaaaaac---aagatgaaaatgt-gagtaataatcatgtttgatgaaataagtactattggacctacc 36260830  T
Q  362 atcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    | || ||||||||| |||||||||| | ||||||  || ||||||||||    
T  36260829 aactcaatgttaaatggtctataagtaatttttaaagaagttggctgaa 36260781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 352
Target Start/End: Original strand, 29490997 - 29491128
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| | ||| |||| |||||||| |||||  ||||||||     
T  29490997 aaataaaattgaccgattatttgatttataatattgtcgatgaaatatttatctgtaaaattaagattg-aattgaaaaacaataagaaacaaatgtatg 29491095  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  29491096 taagtaatcacgtttggtgtcgtaaccactttt 29491128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2757513 - 2757339
Alignment:
Q  143 tttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaa-taaaattgatcgattactt 241  Q
    |||||| ||| |||| | |||| ||||| | |||| |||||||||| | || || || | |||||| ||||||||| ||| ||||||| || | |||| |    
T  2757513 tttaatattatgttgatatgtcgaaatttactgctatcaaaactaaggttcttaagtatattattcagtcttgatttaaaataaaatttattgtttacct 2757414  T
Q  242 gatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgta 317  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| || ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2757413 gatttataatactattgatgaaacatttatctattaaatttggcttg-aattcaaaaacaaaaagaagagaatgta 2757339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 337
Target Start/End: Original strand, 30537507 - 30537621
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||| ||| | | |||||||| ||| ||||  ||||||| || || ||||||||||    
T  30537507 aaataaaattgatcgattaattgatttacaatgttgttgatgaactatttatttgt-aaattaggattg-aattggaaaacaataa-aaaaaaatgtata 30537603  T
Q  320 taaataatcatgtttgat 337  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  30537604 taagtaatcatgcttgat 30537621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 355
Target Start/End: Original strand, 22224029 - 22224108
Alignment:
Q  275 taaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |  | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22224029 taaaattaggcttgaa-tgcaaatacaagaagaagaaaatgtgcataagtcgttatatttgatgtcataaacacttttgga 22224108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 282
Target Start/End: Original strand, 17549728 - 17549819
Alignment:
Q  192 tcataggtgtgttattctgtcttgattcaaa-taaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaatta 282  Q
    |||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||| ||| | ||||||||    
T  17549728 tcataggtgtattattcagtcttagtttaaactaaaattgatcgattagttgatttacaatgttgatgatgaaatatttatctgtaaaatta 17549819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 352
Target Start/End: Original strand, 20524556 - 20524619
Alignment:
Q  289 aaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||| |||||||    
T  20524556 aaattgaaaaacaataagaagaaaatgtatgtaagtaatcatgttatgtgtcataaacactttt 20524619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 267
Target Start/End: Original strand, 22223785 - 22223828
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatat 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22223785 aaaattgatcgattatttgatttataatgatgttgataaaatat 22223828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47731288 - 47731195
Alignment:
Q  62 aaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatt-tcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagt 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||  || || |||||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  47731288 aaattgatcatttaagtcataaaa-atctgcatcattattatatttctcatcaaacttaattaaaaagtgtttatatggacgtttaatgttaagt 47731195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39028757 - 39028708
Alignment:
Q  296 aaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataag 345  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  39028757 aaaacaagaagaagaaaatgtgcataagtaatcatgtttaatgccataag 39028708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 264
Target Start/End: Original strand, 48393893 - 48393937
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaa 264  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  48393893 aaattaaattgatcgatcacttaatttattatattgttgataaaa 48393937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31165956 - 31165617
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaatta 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31165956 tttaagtcataaaatatttgcaccattatcttaatttcatcaaacaaaatcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattc 31165857  T
Q  172 attgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaa-taaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatcta 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  31165856 attgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattcgatcttgattcaaaataaaattaaccgattacttgatttataatattgttgaacaaatattta 31165757  T
Q  271 tatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatg 370  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31165756 tatgtaaaattaagcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataagcacttttggacctaccatcttaatg 31165657  T
Q  371 ttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  31165656 ttaaatggtctataagcacgttttaacgaagttggatgaa 31165617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Original strand, 31064937 - 31065296
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| |||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||    
T  31064937 gttacaaattgatcctttaagtcgtaaaatatttgcacaattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgttatgtt 31065036  T
Q  157 ggtttgtccaaatt-----aattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataa 250  Q
     | |||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31065037 tggttgtccaaattcattatattgctctcaaaactagagctcataggtgtgttattcgatcttgattcaaaacaaaattgatctattacttgatttataa 31065136  T
Q  251 tattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactt 350  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31065137 tatcgttgataaaatatttatatgtaaaattaggcttgaaattcagaaacaagaagaaaaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatatcataagcattt 31065236  T
Q  351 ttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31065237 ttggacctaccatcttaatttcaaatggtctataagcactttttaacgaagttggctgaa 31065296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 72 - 407
Target Start/End: Original strand, 15183625 - 15183961
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaatta 171  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||| || |||||     
T  15183625 tttaagtcataaaatatttacatcattatcttaatttcatcaaacttaatcaaaaagtgtttatgtagatttttaatgttaagttggtttatctaaattc 15183724  T
Q  172 attgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatcta 270  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  15183725 attgctctcaaaactagaacttataggtgtgttattcggtcttgattcaaaacaaaattgaccgattacatgatttataatatcgttgatcaaatattta 15183824  T
Q  271 tatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatg 370  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15183825 tatgtaaaattaggtttgaaattcaaaaacaacaagaagaaaatgtgcgcaagtaatcatgtttgatgtcataagcacttttggacctaccatcttaatg 15183924  T
Q  371 ttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggct 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15183925 ttaaatggtctataagcactttttaacgaagttggct 15183961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27458588 - 27458241
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  27458588 gttataaattgattctttaaatcataaaatattagcaccattatcctaatttcat-------aatcaaaaagtgtttatgtggatgcttaatgttaagtt 27458496  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27458495 ggtttgtccaaattcattgctcttaaaactagagctcataggtgtgttatccagtcttgattcaaaacaaaattgactgattacttgatttataatattg 27458396  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27458395 ttgatcaaatatttatatgtaaaattatgtttgaaattaaaaaacaagaagaagaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataaacacttttgaa 27458296  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
     | ||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  27458295 cctaccatcttaagtttaaatggtttataagcattttttaacgaagttggctgaa 27458241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 410
Target Start/End: Original strand, 35306991 - 35307341
Alignment:
Q  60 ataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggt 159  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  35306991 ataaattggtcatttatgtcataaaatatttgcatcattatcctaatttcatcaaactcaatcacaatgtgtttatgtggatgtttaatgataagttggt 35307090  T
Q  160 ttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttg 258  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||  | ||||||||||||||||    
T  35307091 ttgttcaaattcattgctctcaaaactaaggctcgtaggtgtattattcggtcttgattcaaaacaaaattgaccaattaacttatttataatattgttg 35307190  T
Q  259 ataaaatatctatatataaa-attaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatc 357  Q
    || |||| | ||||| |||| | ||| ||||||||| ||||||||||  || |||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  35307191 atcaaatgtttatatgtaaatactagacttgaaattaaaaaacaaga--aaaaaaaagtgtataagtaatcatgtttgatgtcaaaaacacttttggacc 35307288  T
Q  358 caccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  35307289 taccatcttaatgttaaatgatctataaacactttttaacgaagttggctgaa 35307341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 260
Target Start/End: Original strand, 39984737 - 39984938
Alignment:
Q  60 ataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggt 159  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39984737 ataaattggtcttttaagtcataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaaatgtttatgtggatgtttaatgttaagttggt 39984836  T
Q  160 ttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgat-tcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttg 258  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39984837 ttatccaaattcattgccctcaaaactaaagctcaaagatgtgctattcggtctttatgaaaaacaaaattgaccgattacttgatttataatattgttg 39984936  T
Q  259 at 260  Q
    ||    
T  39984937 at 39984938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14579374 - 14579172
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||| ||    
T  14579374 gttacaaattggtcttttaagtcataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaagagtgtttatgtagatgtttaatgttaaatt 14579275  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgt 256  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  14579274 ggtttctccaaattcattgctctcaaacctagagctcataggaatgttattccgtcttgatt-aaaaaaaattgaccgattacttgatttataatattga 14579176  T
Q  257 tgat 260  Q
    ||||    
T  14579175 tgat 14579172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11581687 - 11581528
Alignment:
Q  57 gttataaattggt-catttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgt--taa 153  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||| |||||||  |||    
T  11581687 gttataaattggttcctttaagtcataaaatatttgcatcattatcctaatttcatcaaacttaatcaaaaagtatttatgtggatgcttaatgtgttaa 11581588  T
Q  154 gttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtct 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11581587 gttggtttgtccaaattcattgctctcaaaactatagctcatatgtgtgttattcggtct 11581528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14578586 - 14578442
Alignment:
Q  251 tattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactt 350  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14578586 tattgatgatcaaatatttatatgtaaaattaggctttaaattaaaaaacaagaagaaaaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataagccctt 14578487  T
Q  351 ttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
    || || | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  14578486 ttagacctaccatcttaatgttaaatgatctataagtacttttta 14578442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26801557 - 26801264
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | | |||||  |||| |||| ||  |||||||||||||    
T  26801557 gttataaattggttatctaagtcataaaatatttgcatcattatcctattttcatcaagtttagttaaaaaatgtttatatgaataattaatgttaagtt 26801458  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    ||| | |||||||  |   ||||||||| ||| | | |||||||| ||||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  26801457 ggtatatccaaatccacaactctcaaaattaaggtttataggtgttttattcgatctttattttaaacaaaattgatcgattatttgatttataatattc 26801358  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||   |||| |||| | ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  26801357 ttgatgaaatgtttatttataaaattatgcttgaattaaaaaaacaaga---agaatatgtgtgtaagtaatcatatttgatgttataaacactttt 26801264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15939432 - 15939102
Alignment:
Q  80 ataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctct 179  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || | |||||| ||   | |||| ||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||    
T  15939432 ataaaatatctgcaccattatcatattttcatcaaacccagttaaaaagtgtgcatgtggacgtttaatcttaagttggtatgtccaaactcatcgctct 15939333  T
Q  180 caaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaa 278  Q
    ||| ||||  | ||||||||||  ||| | |||||||||  ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||    
T  15939332 caacactagggttcataggtgtaatatacagtcttgatttgaaacaaaattgatcaaacacttgatttataatactattgatgaaatatttatatgtaaa 15939233  T
Q  279 attaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaagg 378  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||   ||  ||||||||||| ||     |||||| ||| || | |||| |||||||||||| |     
T  15939232 attagggttg-aattcaaaaactagaagaataaaatgtgcgtaggtaatcatgtttaataaggaaagcacatttagaactaccaccttaatgttaaatga 15939134  T
Q  379 tctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    || ||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  15939133 tccataagcactatttaacgaagttggttgaa 15939102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11580699 - 11580590
Alignment:
Q  301 aagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgat 400  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||     
T  11580699 aagaagaagaagatgtgtataattaatcatgttggatgtcataagcacttttgaacctaccatcttaatgttaaatggttcatgagcactttttaacgaa 11580600  T
Q  401 gttggctgaa 410  Q
     |||||||||    
T  11580599 tttggctgaa 11580590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 375
Target Start/End: Original strand, 2765463 - 2765696
Alignment:
Q  137 tggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcga 235  Q
    ||||||||| ||||||| || ||  ||||||||| |  |||||||||||||| | | |||| ||| |||||| ||||||||| |||  |||| |||| ||    
T  2765463 tggatgtttgatgttaactttgtacgtccaaattcaccgctctcaaaactaaggtttatagatgt-ttattcggtcttgatttaaaacaaaagtgattga 2765561  T
Q  236 ttacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  || |  | |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||    ||||   |||| |||||||    
T  2765562 ttacttgatttataatattgttgatgaaattttaatgtgaacaattaggc-tcaaattcaagaacaagtagaagaaa----atatgtgtaataatgtttg 2765656  T
Q  336 atgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaa 375  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||    
T  2765657 atgtcataagcatttttggatctatcacctcaatgttaaa 2765696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Original strand, 4080395 - 4080478
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4080395 aaaattgatcgattacttgatttgtaatattgttaatgaaatatttatctgtaaaattatgctt-aaattcaaaaacaagaagaa 4080478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20710866 - 20710743
Alignment:
Q  60 ataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggt 159  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||   ||| | | | ||| ||||| |||||||||    
T  20710866 ataaattggtcttttaagtcataaaatattttcaccattatcctcttttcatcaaactcaattaaaaaatatttatgtagctgtctaatgctaagttggt 20710767  T
Q  160 ttgtccaaattaattgctctcaaa 183  Q
    | ||||||||| | || |||||||    
T  20710766 tggtccaaattcactgttctcaaa 20710743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48497128 - 48496985
Alignment:
Q  231 atcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcat 330  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  || | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | | ||| ||||| |    
T  48497128 atcgattatttgatttataaagttgttgataaaatattcatctctaaaattaagcttg-aattcaaaaacaataagaataaaatttgtgtaagtaatcct 48497030  T
Q  331 gtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaa 375  Q
     |||||| |||||||| |||||| | | |||| || |||||||||    
T  48497029 atttgatatcataagcccttttgaacctaccacctcaatgttaaa 48496985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 352
Target Start/End: Original strand, 23532831 - 23532929
Alignment:
Q  253 ttgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  23532831 ttgttgatgaaatatttatctataaaattaagatt-aaattgaaaaacaataagaagaaaatgtatgtaagtaattatgtttggtgtcataagcattttt 23532929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6568177 - 6568043
Alignment:
Q  62 aaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggttt 161  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||| || || ||  ||| |||||||||||||||| |||||  |||| | | ||||||||||||||||||| |      
T  6568177 aaattggtactttaagtcataaaatattttcaacaatactctattttcatcaaactcaattaaaaattgtttatgtagatgtttaatgttaagttgatgg 6568078  T
Q  162 gtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcata 196  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| || |||||    
T  6568077 gtccaaattcattgcttgcaaaactagagttcata 6568043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30440725 - 30440642
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaa 308  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  30440725 aaaattgatagtttatttgatttataatatcgttgatgaaatacttatatataaaattaggtttg-aattcaaaaacaaaaagaa 30440642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15947672 - 15947498
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| | || || |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||       
T  15947672 aaatgaaattgatcgaacacttgatttataatactattaatgaaatatttatatgtaaaattaggctt-caattcaaaaattagaagaataaaatgtgcg 15947574  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
    ||| ||||||||||| ||     |||||| ||| || | |||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||    
T  15947573 taagtaatcatgtttaataaggaaagcacgtttagacctaccaccttaatgttaaatgatccataagcactgttta 15947498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28292459 - 28292285
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| | || || |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||       
T  28292459 aaatgaaattgatcgaacacttgatttataatactattaatgaaatatttatatgtaaaattaggctt-caattcaaaaattagaagaataaaatgtgcg 28292361  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
    ||| ||||||||||| ||     |||||| ||| || | |||| |||||||||||| | || ||||||||| ||||    
T  28292360 taagtaatcatgtttaataaggaaagcacgtttagacctaccaccttaatgttaaatgatccataagcactgttta 28292285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 328
Target Start/End: Original strand, 32893687 - 32893849
Alignment:
Q  166 aaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtctt-gattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaa 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||   | || | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||    
T  32893687 aaattcattgctctcaaaactaaggttcataggtgtattatttgattttagtttgaaataaaattgatctattacttgaattataatgttgttgttgaaa 32893786  T
Q  265 tatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatc 328  Q
    ||| ||| | |||||||| | ||| ||||   |||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  32893787 tatttatctgtaaaattaagattg-aattgggaaacaataagaagaaaatgcatgtaagtaatc 32893849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Original strand, 21686334 - 21686383
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatat 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21686334 aaaattgatcgattacttaatttataacattgttgataaaatatatatat 21686383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 265
Target Start/End: Original strand, 42241960 - 42242033
Alignment:
Q  192 tcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaat 265  Q
    ||||| || |||||||| || |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42241960 tcatatgtttgttattcagttttgatttaaaatagattgatcgattacttgatttataatattgttgatgaaat 42242033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15947804 - 15947760
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaac 116  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  15947804 tttaagtcataaaatatctgcaccattatcatattttcatcaaac 15947760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 28292591 - 28292547
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaac 116  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  28292591 tttaagtcataaaatatctgcaccattatcatattttcatcaaac 28292547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11175672 - 11175319
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  11175672 gttacaaattggtcatttaagtcgtaaaatatttgcaccattatcctaattttatcaaacttaatcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgttaagtt 11175573  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11175572 ggtttgtccaaattctttgctctcaaaactagagctcataggtgtgttattcggtcttgattcaaaataaaattgaccgattacttgatttataatattg 11175473  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11175472 ttgatcaaatatttataagtaaaattaggcttgaaattcaaaaataagaagaa-aatgtgtgtataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgaa 11175374  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
     | | ||||||||||||| |  |||||||| || |||||| ||| |||| |||||    
T  11175373 cctatcatcttaatgttagatagtctataaacattttttaacgaagttgactgaa 11175319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 57 - 394
Target Start/End: Original strand, 15175047 - 15175382
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  15175047 gttataaatttgtcctttaagtcataaaatatttgcaccattattctaatttcatcaaactcaatcaaacaatgtttatgtggatgtttaatgttaagtt 15175146  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||||||| |||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15175147 ggtttgtctaaatt---tgctctcgaaactagagctcataggtgtgttattcggtcttgattcaaaacaaaattgatcgattacttgatttataatattg 15175243  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15175244 ttgatcaaatatttatatgtaatattaggtttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtgtgtaagtaatcatgtttgatgtcataagcatttttgga 15175343  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttt 394  Q
     | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  15175344 cctaccatcttaatattaaatgatctataagcacttttt 15175382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35171119 - 35170766
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35171119 gttacaaattggtcatttaagtcataaaatatatgcaccattatcctaatttcatcaaactcagtcaaaaagtgtttgtatagatgtttaatgctaagtt 35171020  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    | |||||||||||| | | |||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35171019 gatttgtccaaattcacttctcttaaaattagggctcataggtgtgttattcggtcttggttcaaaacaaaattggccgattacttaatttataatattg 35170920  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    || || |||||| ||| | ||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  35170919 tttatcaaatatttatctctaatattaggcttg-atttcaaaaatacgaagaagaaaatgtgtataagtaatcatctttgatgtcataaactcttttgga 35170821  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
       ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  35170820 cttaccatcttaatgttaaacggtccataaacacattttaacgaagttagctgaa 35170766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 149 - 375
Target Start/End: Original strand, 43120648 - 43120875
Alignment:
Q  149 gttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaa-taaaattgatcgattacttgattta 247  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43120648 gttaaattggtttgttcaaatttattgttctcaaaactagagcttatatgtgtgttattcagtctttattcaaaataaaattgatcgattacttgattta 43120747  T
Q  248 taatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagca 347  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43120748 taatattgttgattaaatatttatatgtaaaattaggtttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatatcataagca 43120847  T
Q  348 cttttggatccaccatcttaatgttaaa 375  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||    
T  43120848 cttttggacctaccatcttaatgttaaa 43120875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 382
Target Start/End: Original strand, 31447013 - 31447331
Alignment:
Q  64 attggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgt 163  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31447013 attggtcctttaagtcataaaatatttgcactattatcttaatttaaccaaactccgtcaaaaagtgtttgtgtgggtgtttaatgttaagttgatttgt 31447112  T
Q  164 ccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataa 262  Q
    ||||||| |  |||||||||||||  || ||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  31447113 ccaaattcaccgctctcaaaactagggcacatagttgtgttattcggtcttcattcaaaacaaaattgattgattacttgatctataatattgtttttaa 31447212  T
Q  263 aatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccacca 362  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  31447213 aataattatctgtaaaattaggcttg-aattcaaaaataagaagagtaaaatgtgtacaagtaatcatgtttgatgtcataagcactttagaatctacca 31447311  T
Q  363 tcttaatgttaaaaggtcta 382  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  31447312 tcttaatgttaaatggtcta 31447331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26601020 - 26600835
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26601020 aaaattgaccgattacttgatttataatattgttgatcaaatatttgtatgtaaa-ttaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtgtataag 26600922  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  26600921 taatcatgtttgatgtcataagcacttttggacctaccatcttaatgttaaattgtttataaacactttttaacgaagttggctgaa 26600835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1824422 - 1824241
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | | || | ||||||||||||||||||||    
T  1824422 gttataaattggtcatttaagtcataaaatatttgcactattatcctaatttcatcaaactcggtcaaaaggtg-ttatgtggatgtttaatgttaagtt 1824324  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgatta 238  Q
     |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  1824323 tgtttgttcaaattcattgctctaaaaactagagctcatatgtgtgctattcggtcctgattcaaaacaaaattgaccgatta 1824241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1858867 - 1858686
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | | || | ||||||||||||||||||||    
T  1858867 gttataaattggtcatttaagtcataaaatatttgcactattatcctaatttcatcaaactcggtcaaaaggtg-ttatgtggatgtttaatgttaagtt 1858769  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgatta 238  Q
     |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  1858768 tgtttgttcaaattcattgctctaaaaactagagctcatatgtgtgctattcggtcctgattcaaaacaaaattgaccgatta 1858686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 404
Target Start/End: Original strand, 26916095 - 26916403
Alignment:
Q  96 attatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcat 195  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||| | || | |||||||  ||| ||  | ||| |||||| || ||||||||||||| || ||||    
T  26916095 attattctattttcatcaaactcgattaaaaagtgtttatttgaacgtttaatactaaattcatatgttcaaattcatcgctctcaaaactatagttcat 26916194  T
Q  196 aggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattc 294  Q
    | ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||    
T  26916195 atgtgtgatattcagtcttgatttaaatcaaaattgatcatttacttgatttataatactattgatgaaatatttatttataaaattaaactt-aaattc 26916293  T
Q  295 aaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttt 394  Q
    ||||| |||||||||||||| |   | | |||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  26916294 aaaaataagaagaagaaaatatgcgttagtaatcatggttgatgtcataaacacttttgaacctaccaccttaattttaaatggtccataagcacatttt 26916393  T
Q  395 agcgatgttg 404  Q
    | ||| ||||    
T  26916394 aacgaagttg 26916403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 276 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32350933 - 32350815
Alignment:
Q  276 aaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaa 375  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||||||||||||||    
T  32350933 aaaaataggcttgaa-ttcaaaaataagaagaagaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataaacacttttagacctatcatcttaatgttaaa 32350835  T
Q  376 aggtctataagcacttttta 395  Q
     |||||||||||||||||||    
T  32350834 tggtctataagcacttttta 32350815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 276 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32367594 - 32367476
Alignment:
Q  276 aaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaa 375  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||||||||||||||    
T  32367594 aaaaataggcttgaa-ttcaaaaataagaagaagaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataaacacttttagacctatcatcttaatgttaaa 32367496  T
Q  376 aggtctataagcacttttta 395  Q
     |||||||||||||||||||    
T  32367495 tggtctataagcacttttta 32367476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9555297 - 9555212
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttg 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  9555297 tttaagtcataaaatatttgcaccagtatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgttaagttg 9555212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4187449 - 4187325
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||     
T  4187449 aaaattgattgattacttgatttataacgttgttgatgaaatatttatctataaatttaggatt-aaattagaaaacaataagaagataatgtatgtaag 4187351  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcact 349  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4187350 taatcatgtttgatgtcataaacact 4187325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 375
Target Start/End: Original strand, 4606082 - 4606382
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaatta 171  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||  | || | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4606082 tttaagtcataaaatacttgcacaattatcttattttcaccaaactcaattaaaaaatggttatgt---tgtttaatgttaagttggtatgtccaaattc 4606178  T
Q  172 attgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatcta 270  Q
    ||   ||| |||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||  ||| |||| | |  |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||  ||    
T  4606179 atccatcttaaaactagggttcataagtgtattattcggtcttgatttgaaagaaaaattaatgattacttaatttttaatattattgatgaaatactta 4606278  T
Q  271 tatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatg 370  Q
      | |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |  ||||  ||| || |||||||||||||  ||||||||||| | || || ||||    
T  4606279 cctgtaaaattatgcttgaa-ttaaaaaacaagaagaaaaaaatatgcataaggaattatatttgatgtcataaatacttttggatctaacacctcaatg 4606377  T
Q  371 ttaaa 375  Q
    |||||    
T  4606378 ttaaa 4606382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 45537952 - 45537752
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaatta 171  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||||  | |||||   ||| | ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||     
T  45537952 tttaagtcataaaatctctgcactattatcatattttcatcaaactcggttaaaaaatatttatgtggat-tttaatgttaaattggtaggtccaaattc 45537854  T
Q  172 attgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctat 271  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||||||| || || || |||||||||||  || |||||| |||    
T  45537853 atcgctctcaaaactaaggttcataggtgtattattcattcttgatttgaaaaaaattgatcgaatatttaatctataatattgtcaatcaaatatttat 45537754  T
Q  272 at 273  Q
    ||    
T  45537753 at 45537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1823551 - 1823403
Alignment:
Q  244 tttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcata 343  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| |||| |  | ||||||||| |||||   ||||| ||||  ||||| |||||||||||| |    
T  1823551 tttataatattgttaatcaaatatttataggtaaaattaagcttcatgtacaaaaacaaaaagaa---aatgtgtataggtaatcttgtttgatgtcaca 1823455  T
Q  344 agcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
    ||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1823454 agcacatttggacctaccatcgtaatgttaaatggtttataagcacttttta 1823403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1857996 - 1857848
Alignment:
Q  244 tttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcata 343  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| |||| |  | ||||||||| |||||   ||||| ||||  ||||| |||||||||||| |    
T  1857996 tttataatattgttaatcaaatatttataggtaaaattaagcttcatgtacaaaaacaaaaagaa---aatgtgtataggtaatcttgtttgatgtcaca 1857900  T
Q  344 agcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
    ||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1857899 agcacatttggacctaccatcgtaatgttaaatggtttataagcacttttta 1857848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14636794 - 14636679
Alignment:
Q  235 attacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgttt 334  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||| || ||| |||||||||||    
T  14636794 attaattgatttataatattgctgatgaaatatttatttgtaaaattaagcttgaa-ttcaaaaacaagaagaa---aatgcatgtaactaatcatgttt 14636699  T
Q  335 gatgtcataagcacttttgg 354  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  14636698 gatgtcataagtatttttgg 14636679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10839763 - 10839657
Alignment:
Q  248 taatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagca 347  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||  ||    
T  10839763 taatattgttgatgaaatatttatatgtaaaatcaaacttgaa-ttcaaaaacaagaagaagaaaatgtgcgtaggtaatcatgtttgatgtaatagaca 10839665  T
Q  348 cttttgga 355  Q
    ||||||||    
T  10839664 cttttgga 10839657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10840079 - 10839910
Alignment:
Q  80 ataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctct 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||  | |||| | |||| | |||| |||| ||||||||||| | |||||||||| | ||| ||    
T  10840079 ataaagtatatgcaccattatcttattttcatcaaactcggttaaaa-gtgtttatgtggacgttttatgttaagttgatatgtccaaattcactgcact 10839981  T
Q  180 caaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttga-ttcaaataaaattgatcgattacttgatttata 249  Q
    |||||||| |  | |||||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  10839980 caaaactagaatttataggtgtattattcactcttgatttgaaacaaaattgaatgattacttgatttata 10839910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16816302 - 16816200
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| || |||||   ||| | ||||  ||||||||||||||    
T  16816302 gttataaattggtcctttaagtcataaaatatctacatcattattctaatttcatcaaactcgattaaaaaatatttatgtggacatttaatgttaagtt 16816203  T
Q  157 ggt 159  Q
    |||    
T  16816202 ggt 16816200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40112892 - 40112689
Alignment:
Q  90 tgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgtt---aagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaact 186  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||| |  ||| ||||| |    ||||||||||    
T  40112892 tgcaccattatcttattttcatcaaactcaattaaaaagtgtttatatgaatgtttaatgttgttaagttgttaagtctaaattcaccattctcaaaact 40112793  T
Q  187 aaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggct 286  Q
    |  | | ||  ||||||||||  || ||| || |    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||    
T  40112792 aggggttatgtgtgtgttatttggttttgttttacgacaaattgattgattacttgatttataatattgtcgatgaaatatttatcaaaaaaattaggct 40112693  T
Q  287 tgaa 290  Q
    ||||    
T  40112692 tgaa 40112689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26601115 - 26601064
Alignment:
Q  84 aatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgt 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26601115 aatatttgcaccattatcttaattttatcaaactcaatcaaaaagtgtttgt 26601064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12076692 - 12076565
Alignment:
Q  137 tggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcga 235  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||   |||| | | ||||||||||||  | ||||| |||||||||| |   ||||||  |||||||| |||| ||    
T  12076692 tggacgtttaattttaagttggtatgttggaattcacttctctcaaaactagggttcatatgtgtgttattttactttgatttgaaataaaagtgattga 12076593  T
Q  236 ttacttgatttataatattgttgataaa 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12076592 ttacttgaattataatattgttgataaa 12076565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Original strand, 37294978 - 37295065
Alignment:
Q  163 tccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaa-taaaattgatcgattacttgatttata 249  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  | ||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37294978 tccaaattaaccgctctcaaaaatagggttcataagtgtcttattcagtcttgatttaaaataaaattgattgattacttgatttata 37295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 344
Target Start/End: Original strand, 9550609 - 9550716
Alignment:
Q  234 gattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtt 333  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||| | |||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  9550609 gattacttgatt-ataatgttgttaacaaaatatttatctctaaaattaggattgaa-ttaacaaacaa-aagaagaaaatgtataaaagtaattatgtt 9550705  T
Q  334 tgatgtcataa 344  Q
    || ||||||||    
T  9550706 tggtgtcataa 9550716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14629018 - 14628946
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaat 292  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||| ||||    
T  14629018 aaatagaattgattaattaattgatttataatattgttgatgaaatatttatttgtaaaattaagcttaaaat 14628946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43915738 - 43915680
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaa 115  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  43915738 gttataaattggttctttaagtcataaaatatctacaccattattctattttcatcaaa 43915680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8149893 - 8149813
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaa 305  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |  | ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8149893 aaaattgatcgtttacataatttatagtgcttttgatgaaatatttatatataaagttaggtttg-aattcaaaaacaagaa 8149813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28452097 - 28452044
Alignment:
Q  237 tacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||| |||||    
T  28452097 tacttgatttataatattgttaatgaaatatttatctttaaaattaggattgaa 28452044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Original strand, 5187740 - 5188094
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  5187740 gttacaaattggtcctttaaatcataaaatatttgcaccattattctaatttcatcaaactcaatcaaaaagtgtttatgtgaatgtttaatgttaagtt 5187839  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||| ||||||||| |||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  5187840 ggttggtccaaattcattattttcaaaactagagctcatgggtgtgttattcggtcttgattcaaaacaaaatttaccaattacttaatttataatattg 5187939  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    || || |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5187940 ttcatcaaatatttatatgtaaaattaggtttgaaatttaaaaacaagaacaagaaaatgtgtataaataatcatgtttgatgtcataaacacttttgga 5188039  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
     | | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  5188040 cctaacatcttaatgttacatggtctataaacactttttaacgaagttggctgaa 5188094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Original strand, 9298600 - 9298953
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  9298600 gttacaaattggtc-tttaagtcataaaatatttgcactattatcctaatttcatcaaattcagtcaaaaagtatttatgtggatgtttaatgttaagtt 9298698  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
     || |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9298699 tgtctgtccaaattcattgctctataaactagagctcataggagtgttattcagtcttgattcaaaacaaaattgaccgattatttgatttataatattg 9298798  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9298799 ttgatcaaatatttatatgtaaaattaagcttgaaatacaaaaacaagaagaagaaaatgtgtataagtaatcatgattgatgtcataagcacttttgga 9298898  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    || |||||  |||||||||| | | | ||||||||||| |  || ||||||||||    
T  9298899 tctaccattgtaatgttaaatgatttgtaagcacttttcaatgaagttggctgaa 9298953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10221838 - 10221498
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactca----atcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaa 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    || |||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10221838 tttaagtcataaaatatttgcacgattatcctaatttcatcaaacatacataattaaaaggtgtttatgtggatgtttaatgttaagttggtttgtccaa 10221739  T
Q  168 attaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaata 266  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||   ||||||||  ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10221738 attcattgctctcaaaactatagctcatatgtgtgttattcggt---gattcaaaacaaaattgactaattatttgatttataatattgttgatcaaata 10221642  T
Q  267 tctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatctt 366  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  | | ||||||||    
T  10221641 tttatatgttcaattaggcttgaaattcaaaaataagaagaagaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatatcataagcattttttaacctaccatctt 10221542  T
Q  367 aatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  10221541 aatgttaaatggtctataagcatgttttaacgaagttggctgaa 10221498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 395
Target Start/End: Original strand, 18704550 - 18704888
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||    
T  18704550 gttacaaattggtcatttaagtcataaaatattttcaccattatcccaatttcatcaaactcggtcaaaaagtgtatgtgtggatgcttaatgttaagtt 18704649  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    | ||||||| |||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  18704650 gatttgtcctaattcatcgctctcaaaactatggttcataggtgtgttatttgatcttgattcaaaacaaaattgaccgattatttaatttataatattg 18704749  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |  |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18704750 ttgataaaatatttatctgtaaaattaggcttg-aattcaaaagcaagaagaaaaatatatgcataagtaattatgtttgttgtcataagcacttttgga 18704848  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
     | ||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||    
T  18704849 cctaccatcttaatattaaatgatccataaacacttttta 18704888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 395
Target Start/End: Original strand, 21436885 - 21437221
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21436885 gttacaaattggtcctttaagtcataaaataattgcaccgttatcctaatttcatcaaactaagtcaaaaagtgtttgtgtggatgtttaatgttaagtt 21436984  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    | |||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||  ||||||||||  | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21436985 gatttgtccaaattcactgctgtcaaaactagtgatcataaatgtgttattcgattttgattcaaaacaaaattgaccgattacttgatttataatgttg 21437084  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||||| |||||| ||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |    
T  21437085 ttgatcaaatatttatctgtaaaattagg-ttggaattcaaaaataagaaga--aaaatatgtataagtaatcatgtttgatgtcatcaatacttttgaa 21437181  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
     | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21437182 cctaccatcttaatgttaaatgctctataagcacttttta 21437221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 393
Target Start/End: Original strand, 43080828 - 43081044
Alignment:
Q  174 tgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctata 272  Q
    ||||||||||||||    ||| ||||||||||||  ||||||||| |||  |||||| |  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||     
T  43080828 tgctctcaaaactatgattcaaaggtgtgttatttggtcttgatttaaaacaaaattcacagtttacatgatttataatcttgttgatcaaatatttatc 43080927  T
Q  273 tataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgtt 372  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||     || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||    
T  43080928 tataaaattaggcttgaatttataaat----aataagaaaatgtgtataagtactcatgtttgatgtcataaacacttttgaacttaccatcttaatgtt 43081023  T
Q  373 aaaaggtctataagcactttt 393  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  43081024 aaatggtctataagcactttt 43081044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37817809 - 37817597
Alignment:
Q  144 ttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaa-ataaaattgatcgattacttg 242  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||  | ||||| |||| ||||||  ||||||||  | | ||  |||||| ||||||||    
T  37817809 ttaatgttaagttaatatgtccaaattcaccgctctcaaaactatggttcataagtgtattattcaatcttgatttgacacaatgttgatctattacttg 37817710  T
Q  243 atttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaag-aaaatgtatataaataatcatgtttgatgtca 341  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| | ||| ||||  ||||||||||||    
T  37817709 ctttatagtattgttgataaaatatttatatgtaaaattaggcttg-aattaaaaaacttgaagaagaaaaatgtgtttaagtaattttgtttgatgtca 37817611  T
Q  342 taagcacttttgga 355  Q
    ||||||||||||||    
T  37817610 taagcacttttgga 37817597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 83723 - 83555
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| || ||| | ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||     
T  83723 aaaattgatcgattact--atttataatgttgttgatgaaaaatttatctgtaaaattagacttgaa-ttcaataacatgaagaagaaaatgtgcataag 83627  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttta 395  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  83626 caatcatgtttgatgacataaacacttttggacctaccacctcaatgttaaatggtcgataaacatttttta 83555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33429019 - 33428814
Alignment:
Q  146 aatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattgatcgattacttgat 244  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||| |  ||||| |||  |||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||    
T  33429019 aatgttaagttgatatgtctaaatttatcgctctcaaaactagat-tcatatgtgcattattcagtcttgatttaaaacaaaatcgatcgattatttgat 33428921  T
Q  245 ttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| | |  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33428920 ttataatattgttgataaaatatttaaccgtaaaattaagcttg-aattcaaaaagaagaagaa-aaaaggcaagtaagtaatcatatttgatgtcataa 33428823  T
Q  345 gcacttttg 353  Q
     ||||||||    
T  33428822 acacttttg 33428814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Original strand, 1130598 - 1130937
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||| | |||| ||||||||||| |||    
T  1130598 gttacaaattggtcttttaagtcataaaatatctgcatcattatcctattttaatcaaactcagttaaaaagtgtttatgtgga-gtttaatgttaggtt 1130696  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgt 256  Q
    |||  ||| ||||| |    |||||||||  | | |||||||||| ||    ||  ||||    || ||||||||| ||||||||||||||||||  | |    
T  1130697 ggtaggtctaaattcaccattctcaaaac--aggttcataggtgtatt----tgatttga----aacaaaattgattgattacttgatttataatgcttt 1130786  T
Q  257 tgataaaa-tatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||   |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1130787 tgataaaaatatttatctgtaaaattaggcttgaa-ttcaaaaacaagaacaa---aatgtgcgtaagaaatcatgttttatgtcataagcacttttgga 1130882  T
Q  356 tccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
       ||||  | ||||||||| |||| || | ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1130883 cttaccacttcaatgttaaatggtccatgaacaccttttaacgaagttggctgaa 1130937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17200882 - 17200687
Alignment:
Q  90 tgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaa 189  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||  ||||   | || ||| |||||||||||||| |   |||||| || ||||||||||||| |    
T  17200882 tgcaccataatcctattttcctcaaacttaattaaaaaatgtttacgtagacgttgaatgttaagttggtatacacaaattcatcgctctcaaaactaga 17200783  T
Q  190 gctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattagg 284  Q
      |||||||||  || |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||||||    
T  17200782 cttcataggtgcattgttcactcttgattcgaaataaaattgatcgatcacttgatttataatattgttgatgaaatatttatccttaaaattagg 17200687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11862382 - 11862316
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||| ||||| |||||    
T  11862382 aaaattgatcgattacttgatttataattttgttgatgaaatatttatctgtaaagttaggattgaa 11862316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 284
Target Start/End: Original strand, 14201473 - 14201583
Alignment:
Q  175 gctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatat 273  Q
    |||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||      
T  14201473 gctctcaaaactatgattcataagtgtattattcggtcttggtttgaaacaaaattgattgattacttgatttataatgttgttgataaaatatttatta 14201572  T
Q  274 ataaaattagg 284  Q
     ||||||||||    
T  14201573 ttaaaattagg 14201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 352
Target Start/End: Original strand, 35347227 - 35347358
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaat----gtata 319  Q
    |||| |||| |||| || ||||||||| |||| | || |||||| ||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    |||      
T  35347227 aaaaatgatagattgctcgatttataacattgctaatgaaatatttatctttaaatttaggcttg-aattcaaaaacaagaaaatgaaaatgttggtaat 35347325  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35347326 taagtaatcatgtttgatgtcataagcattttt 35347358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 355
Target Start/End: Original strand, 45707221 - 45707355
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | |||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||| | |     
T  45707221 aaataaaattgattgattaactgatttataaaattgtggatgaaatatttatttctaaaattaagcttg-aatttgaaaacacgaagaagaaaatatgtg 45707319  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    ||| | |||||||||  |||||| |  |||||||||    
T  45707320 taagttatcatgtttagtgtcatgattacttttgga 45707355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 357
Target Start/End: Original strand, 36472374 - 36472491
Alignment:
Q  238 acttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaac-aagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttga 336  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||  | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  | ||| |||| | ||||||    
T  36472374 acttgatttattatattcttgatgaaatatttacctgtaaatttaggcttg-aattcaaaaacaaaaaagaagaaaatg--tgtaagtaattaggtttga 36472470  T
Q  337 tgtcataagcacttttggatc 357  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  36472471 tgtcataaacacttttagatc 36472491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 159
Target Start/End: Original strand, 931122 - 931209
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggt 159  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| | | |||| | |||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  931122 tttaagtcataaaatatatgcatcattatcatactttcatcaaacttagttaaaaggtgtttatgtggccgtttaatgttaagttggt 931209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41959848 - 41959698
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    |||| |||||||||| || |||||| ||||| ||| |  ||||| ||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||   | |     
T  41959848 aaaactgatcgattattttatttatgatattattgctggaatatttatctgtaaacttaggtttgaa-ttcaaaaacaagaagaggaaaatgtgagtgag 41959750  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaa 375  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | | ||||||| |||||||||    
T  41959749 taatcatatttgatatcatatgcatttttcaacctaccatctcaatgttaaa 41959698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41959947 - 41959855
Alignment:
Q  82 aaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaa----aaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaatt 170  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||    |||| ||| || | |||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  41959947 aaaatatttgcaccatgatcctatttttatcaaactcaattaattaaaaagtgttcgtgtagatgtttaatgttaagttagtatgtcgaaatt 41959855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 252
Target Start/End: Original strand, 7816961 - 7817069
Alignment:
Q  144 ttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaa-taaaattgatcgattacttg 242  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| |||| | | |||| || || |||||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||     
T  7816961 ttaatgttaagttagtatgtctaaattcattgttgttaaaa-tagagttcatatatgtattattcagtcttgatttaaaataaaattgatcgactactta 7817059  T
Q  243 atttataata 252  Q
    ||||||||||    
T  7817060 atttataata 7817069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Original strand, 9158759 - 9158820
Alignment:
Q  226 aattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggctt 287  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  9158759 aattgatcaatttattgatttgtaatattgttgatgaaatatttatttataaaattatgctt 9158820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 281
Target Start/End: Original strand, 35494086 - 35494143
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaatt 281  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  35494086 aaaattgatcaatgacttgatttataaaattgctgatgaaatatttatctataaaatt 35494143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43229361 - 43229275
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttata---atattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaa 308  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  43229361 aaaactgatcaaatacttgatttatacaaatattgttaataaaatatttatttgtaaaattaagttt-aaattcaaaaacaagaagaa 43229275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 352
Target Start/End: Original strand, 35341851 - 35341911
Alignment:
Q  292 ttcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||||||||||| || | |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35341851 ttcaaaaacaataacatgaaaatatggataagtaatcatgtttgatgtcataagcattttt 35341911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 60 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11752136 - 11751788
Alignment:
Q  60 ataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggt 159  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||||||||||||||||||    
T  11752136 ataaattggtcatttatgtcataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaatgtg-ttatgtggatgtttaatgttaagttggt 11752038  T
Q  160 ttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttg 258  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  11752037 ttgtccaaatttattgctatcaaaactaaggctcgtaggtgtgttattc-gtcttgattcaaaacaaaattgaccaattacttgatttgtaatattgttg 11751939  T
Q  259 ataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatcc 358  Q
    || |||| | ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |     
T  11751938 atcaaatgtttatatgtaaaattaaacttgaaattaaaaaacaagaa-aaaaaaatttgtataagtaatcgtgtttgatgtcataaacacttttggacct 11751840  T
Q  359 accatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  11751839 accatcttaatgttaaatggtctataaacactttttaacgaagttggctgaa 11751788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 57 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2391685 - 2391390
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  2391685 gttacaaattgatcctttaagtcataaaatatttgcaccattaccctaatttcatcaaactcaatcaaaaagtatttatgtggatatttaatgttaagtt 2391586  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2391585 ggtttgtccaaattcattgctctcaaaactagagcttataagtgtgttattcggtcttgattcaaaacaaaattgatcgattacttgatttataatattg 2391486  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    |||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2391485 ttgat-taatatttatatgtaaaattaggtttgaaattcaaaaacaaaaacaagaaaatgtgtataagtaatcatatttgatgtcataagcactttt 2391390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11785938 - 11785667
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  11785938 gttataaattgatcctttaagtcataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcacactcaatcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgttaagtt 11785839  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  11785838 ggtttgtccaaattcattgctctcaaaactaaaactcatagacatgttattcagtcttgattcaaaacaaaattgacagattactt--tttataatattg 11785741  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcat 330  Q
    |||||  ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||    
T  11785740 ttgat-caatatttctatgtaaaattaggtttgaaattcaaaaacaagaacaataaaatgtgtataagtaatcat 11785667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 410
Target Start/End: Original strand, 10479507 - 10479854
Alignment:
Q  62 aaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaa-gcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtt 160  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  10479507 aaattggtcttttaaataataaaatatttgtacctttatcctaatttcatcaaactcagtcaaaaacatgtttgtgtggatgtttaatgttaagtt-gat 10479605  T
Q  161 tgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttga 259  Q
    |||||||||| | | |||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  10479606 tgtccaaattcactactcttaaaactatggctcaaaggtgtgttattcggtcttgattcaaaacaaaattgatcgattacttgatttataatgtttttaa 10479705  T
Q  260 taaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatcca 359  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||| || | |    
T  10479706 tcaaatatttatttgtaaaattaggcttg-aattcataaataagaagaagaaaatggatacaagcaatcatgtttgatgtcatagacacttttagaccta 10479804  T
Q  360 ccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10479805 ctatcttaatgtt-aaatgtttataagcactttttaacgaagttggctgaa 10479854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10629148 - 10629020
Alignment:
Q  58 ttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| || |||||  |||| | | |||||| ||| ||||||||    
T  10629148 ttataaattggccatttaagtcataaa-tatttgcatcattattctattttcaccaaactcgattaaaaaaagtttatgttgatgttcaatattaagttg 10629050  T
Q  158 gtttgtccaaattaattgctctcaaaacta 187  Q
     | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  10629049 atatgtccaaattcattgttctcaaaacta 10629020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 62 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34596241 - 34595909
Alignment:
Q  62 aaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggttt 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  34596241 aaattggtcatttaagtcataaaatatttgcactattatcctagtttcatcgaactaagtcaaaaagtgtttgtgtggatgtttaatgttaagttgattt 34596142  T
Q  162 gtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgat 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  |  | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34596141 gtccaaattcactgctctcaaaactagtgtccgtaggtgtgttattcgatcttgattcaaaataaaattgacggattacttgatttataatgttgttgat 34596042  T
Q  261 aaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccac 360  Q
     |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  34596041 caaatatttatctttaaaattaagcttg-aattcaaaaataagaagaagaaaatgtgtataagtaatcatatttgatgtcataaacacttttggacctac 34595943  T
Q  361 catcttaatgttaaaaggtctataagcacttttt 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  34595942 catcttaatgttaaatggtctataaacatttttt 34595909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29408158 - 29407998
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaatta 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29408158 tttaagtcataaaatatttgcactattattctaatttcatcaaactcaatcaaaaagtgtttatatggatgtttaatgttaagttggtttgtccaaattc 29408059  T
Q  172 attgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaat-aaaattga 231  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29408058 attgttctcaaaactagagttcatagatgtattattcggtcttgattcaaatcaaaattga 29407998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 410
Target Start/End: Original strand, 47084935 - 47085121
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  47084935 aaaattgaccgattacttgatttataatattgttgatcaaatatttatatgtaaaactaggcctgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtgcataag 47085034  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    ||  |||||||||||| |||| || ||||| | | ||||||||||||||||| | | || || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  47085035 tatccatgtttgatgtaataaacatttttgaacctaccatcttaatgttaaatgatttacaaacactttttaacgaagttggctgaa 47085121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 47084740 - 47084909
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatg-ttaagt 155  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  47084740 gttacaaattggtcctttaagtca--aaatatttgcaccattatcctaatttcaacaaacttaatcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgtttaagt 47084837  T
Q  156 tggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaa 227  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  47084838 tggtttgtcaaaattcattgatgtcaaatctagagttcataggtgtgttattcggtattgattaaaaaaaaa 47084909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 355
Target Start/End: Original strand, 38582236 - 38582366
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  38582236 aaaatcgatcgattacttaatttataatattgtttataaaatatttatctttaaaattaggcttg-aattcaaaaacaagaaaaagaaaatgtgtctaag 38582334  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  38582335 taatcatgttagatgtcataaacatttttgga 38582366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Original strand, 39983558 - 39983634
Alignment:
Q  85 atatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggttt 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39983558 atatatgcaccattatcctaatttcatcagattcaatcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgttaagttggttt 39983634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 343
Target Start/End: Original strand, 32438064 - 32438267
Alignment:
Q  140 atgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtctt-gattcaaataaaattgatcgatta 238  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||| | | |||||||||||| || | |||||||| ||||||  |||| | || ||| ||||||||| |||||    
T  32438064 atgtttaatgttaagttggtcaactcaaatttactactctcaaaactagagtttataggtgtattattcactcttcgtttgaaacaaaattgattgatta 32438163  T
Q  239 cttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatg 338  Q
    |||||||||||   | ||| || |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| | | | |||| ||||||||||    
T  32438164 cttgatttataccgtagttaatgaaatatttatctgtaaaattagacttgaa-ttcaaaaacaacaagatgaaaatgtgtgtgagtaataatgtttgatg 32438262  T
Q  339 tcata 343  Q
    |||||    
T  32438263 tcata 32438267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33407291 - 33407187
Alignment:
Q  243 atttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcat 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  33407291 atttataatattgttgatgaaatatatag---taaaattagacttgaa-ttcaaaaacaagaagaagaaaatg--tctaagtaatcatgtttgatgtcat 33407198  T
Q  343 aagcacttttg 353  Q
    || | ||||||    
T  33407197 aaacccttttg 33407187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 355
Target Start/End: Original strand, 3839277 - 3839405
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| | | | |||||||||||| | | |||  |||||| |||||||||| || | |||     
T  3839277 aaaattgatcgattgcttgatttataatgttgttgatgaaatatttttctgtaaaattaggctcg-acttc--aaacaacaagaagaaaacgtgtgtaag 3839373  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3839374 taattatgtttggtgttataagcacttttgga 3839405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 344
Target Start/End: Original strand, 30053847 - 30053958
Alignment:
Q  232 tcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatg 331  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| ||  | |||||||||| ||||| |  | |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||    
T  30053847 tcgattatttaatttataatgttgttgatgaaatatttacctctaaaattaggattgaacta-acaaacaataagaagaaaatgtaaataagtaattatg 30053945  T
Q  332 tttgatgtcataa 344  Q
    |||| ||||||||    
T  30053946 tttggtgtcataa 30053958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 37204698 - 37204797
Alignment:
Q  60 ataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggt 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   |||| ||||||||   |||||  |||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  37204698 ataaattggtcatttaagtcataaaatattttcaccattaccctcccttcaacaaactcagataaaaaatgtttatgtggaagtttaatgttaaattggt 37204797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 43230956 - 43230828
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtata 319  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||| | |||||| | |  || ||||  ||||||| |||| ||||||||||     
T  43230956 aaataaatttgatcgattaattgatttatattgttgttgatgaaatatttatctgtaaaataaagagtg-aattggaaaacaataagatgaaaatgtatg 43230858  T
Q  320 taaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||| ||   |||||||||||||||| |||||||    
T  43230857 taagta---atgtttgatgtcataaacactttt 43230828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46435688 - 46435576
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaa---attcaaaaacaagaagaagaaaatgtatat 320  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||   |||||   | | ||||||||||| |||||||| |  ||    
T  46435688 aaaattgatcatttatttgatttataatattgttgatgaaatatttatttctaaaattatagttgaattcaataaaaaacaagaataagaaaatatgcat 46435589  T
Q  321 aaataatcatgtt 333  Q
    |||||||||||||    
T  46435588 aaataatcatgtt 46435576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32450509 - 32450396
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||  |||| ||||||| || |||||||||||||  | |||| |  ||| | | || |||||||||||||||    
T  32450509 gttataaattgatcatttaagtcagaaaatacatgcatcattatcttattttcatcaaactcggttaaaaggtatttatgtagacgtttaatgttaagtt 32450410  T
Q  157 ggtttgtccaaatt 170  Q
    | ||||| ||||||    
T  32450409 gatttgttcaaatt 32450396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Original strand, 32711248 - 32711365
Alignment:
Q  140 atgtttaatgttaagttggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgatta 238  Q
    ||||||||||||||| | |  | |||||||| |  ||||| ||||||||   |||||| ||| |||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32711248 atgtttaatgttaagatagcatatccaaattcaccgctcttaaaactaagattcatagatgtattattcagtgttgatttgaaataaaattcatcgatta 32711347  T
Q  239 cttgatttataatattgt 256  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  32711348 cttaatttataatattgt 32711365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 260
Target Start/End: Original strand, 9003588 - 9003628
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgat 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9003588 aaataaaattgatcaattacttgatttataatattattgat 9003628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 32297464 - 32297269
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||| ||| || ||| |||||| || || |||||| |||| | ||||  |||||| |||||||    
T  32297464 gttagaaattggtcatttaagtcataaaacatgtgcatcatcatcatatttttatcaaattcgattaaaaagtgtttatgtggagatttaat-ttaagtt 32297366  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttga-ttcaaataaaattgatcgattacttgatttataata 252  Q
    ||| ||||| |||| |  | ||||||||||| || ||||| | ||  |||||  |||||| || ||| ||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  32297365 ggtatgtccgaattcaccgttctcaaaactagagttcatatgcgtactattcaatcttgatttgaaaaaaaattgcttgtttactggatttataata 32297269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 290
Target Start/End: Original strand, 33589262 - 33589378
Alignment:
Q  175 gctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttga-ttcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatat 273  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||||| || | | |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  33589262 gctctcaaaactagagttcatatgtgtattattcaatcttgatttgacacaaaattgatcaattacctaatttataacattgttgatgaaatatttatct 33589361  T
Q  274 ataaaattaggcttgaa 290  Q
     |||| ||| |||||||    
T  33589362 gtaaagttatgcttgaa 33589378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 267
Target Start/End: Original strand, 38362622 - 38362665
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatat 267  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38362622 aaaattgattgattaattgatttataatattgttgatgaaatat 38362665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44594408 - 44594342
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaa 290  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||| ||||||    
T  44594408 aaaattgatcgatttattaatttataatattgttgatgaaatgtttatttgtaaaattagacttgaa 44594342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Original strand, 30053685 - 30053770
Alignment:
Q  72 tttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttg 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||| |||||| | || | ||||||| || || |||||||    
T  30053685 tttaagtcataaaatatatgcaccattattatatttccatcaaactcaattaaaaagtgcttatgtggatgtgtattgctaagttg 30053770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 261
Target Start/End: Original strand, 45123141 - 45123182
Alignment:
Q  220 aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgata 261  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45123141 aaataaaattaaccgtttacttgatttataatattgttgata 45123182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 410
Target Start/End: Original strand, 16600313 - 16600670
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  16600313 gttataaattggtcatttaagtcataaaatatttgcaccattatcctaatttaatcaaactaagtcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgttaagtt 16600412  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattg 255  Q
      ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| | |    
T  16600413 tatttgtccaagttcattgctctcaaaactagtgctcataggtctgttattcgctcttgattcaaaataaaatttaccgattacttgaattataatgtgg 16600512  T
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaa---gaagaag-aaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttt 351  Q
    ||||| |||||| | | | |||||||||||||| |||||||||| ||    || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16600513 ttgatcaaatatttgtctgtaaaattaggcttg-aattcaaaaataaaataaaaaagaaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataaacacttt 16600611  T
Q  352 tggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    || | | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  16600612 tgaacctatcatcttaatgtcaaagggtctataagcattttttaatgaagttggctgaa 16600670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33401813 - 33401534
Alignment:
Q  67 ggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtcca 166  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33401813 ggtcctttaagccataaaatatttgcactattatcctagtttcattaaattcgatcaaaaagtgtttatgtggatgtttaatgttaacttggtttgtcca 33401714  T
Q  167 aattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||       ||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33401713 aattaattgctctcaaaactagaggtcatatgtgtgt-------tcttgattcaaaacaaaattgacggattacgtgatttataatattgttgatcaaat 33401621  T
Q  266 atctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttgga 355  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33401620 atttatatgtaaaattaggcttgaaattcaaaaac---aaaaagaaaatgttttcaagtaatcatgtttgatgtcataagcatttttgga 33401534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27499562 - 27499433
Alignment:
Q  57 gttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagtt 156  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| |||||   ||| | | ||  ||||||||||||||    
T  27499562 gttataaattggtcatttatgtcataaaatatttacaccactatcttattttcatcaaactcaattaaaaaatatttat-ttgaactttaatgttaagtt 27499464  T
Q  157 ggtttgtccaaattaattgctctcaaaacta 187  Q
    | | |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27499463 gctatgtctaaattaatcactctcaaaacta 27499433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 335
Target Start/End: Original strand, 34367194 - 34367294
Alignment:
Q  234 gattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtt 333  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34367194 gattacttgatttaaaatgttgttgatgaaatatttatctctaaaattaggattg-aattggcaaacaataagaagaaaatgtatataagtaattatgtt 34367292  T
Q  334 tg 335  Q
    ||    
T  34367293 tg 34367294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5474231 - 5473948
Alignment:
Q  66 tggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggtttgtcc 165  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| | | |||||| |||| | || |  ||||||||||  ||||| ||| |    
T  5474231 tggtcttttaattcataaaatatatgcatcatcatcctattttcatcaaacttagttaaaaagtgtttatgtgcacatttaatgttagattggtatgttc 5474132  T
Q  166 aaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttga-ttcaaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaa 264  Q
    ||||  |  ||||||||||| | || ||||| |||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||| || || |||    
T  5474131 aaatccaccgctctcaaaaccagagttcatatgtgtattattcaatcttgatttgaaacaaaattgattgtttactagttttataatattattaatgaaa 5474032  T
Q  265 tatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactt 350  Q
    ||| ||| | ||||||||   |||| ||  ||||| || ||||||||||||| | |   ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  5474031 tatttatctttaaaattatatttgatat--aaaaaaaacaagaagaaaatgtgtgttggtaatcatatttgatgttataaacactt 5473948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 352
Target Start/End: Original strand, 5552512 - 5552639
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || |||   |||||||| | ||| ||||  |||| |||||| ||||||| | | |||     
T  5552512 aaaattaatcgattacttaatttataatattgttcattaaacatttatcgttaaaattaagtttg-aattagaaaataagaaggagaaaatatttgtaat 5552610  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5552611 taatcatgtttgttgtcataaacactttt 5552639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 394
Target Start/End: Original strand, 36267944 - 36268110
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||  || |||     
T  36267944 aaaattgattgataacttgattaataatagtgttgattaaatacttatttgtaaaattatgtttgaa-ttcaaaaacaaga---agaaaataaatgtaag 36268039  T
Q  324 taatcatgtttgatgtcataagcacttttggatccaccatcttaatgttaaaaggtctataagcacttttt 394  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||||| | | ||||  | ||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  36268040 taatcatatttaatatcacaagcacttttgaacctaccacatcaatattaaatggtcaataagcacttttt 36268110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 166
Target Start/End: Original strand, 932479 - 932587
Alignment:
Q  58 ttataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttg 157  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||| || |||||  |||| | |||  |||||||||||| ||     
T  932479 ttataaattggtcctttaaatcataaaatatttgaatcattatcttgttttcatcaaactcgattaaaaattgtttatgtgggcgtttaatgttaaattt 932578  T
Q  158 gtttgtcca 166  Q
    || ||||||    
T  932579 gtatgtcca 932587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 8822379 - 8822443
Alignment:
Q  194 ataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgtt 257  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8822379 ataggtgtattattcagtcttggtttgaaatgaaattgatcgattacttgatttataatgttgtt 8822443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10099729 - 10099625
Alignment:
Q  162 gtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattcaaataaaattga-tcgattacttgatttataatattgttgat 260  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| | |||||| ||| || ||| ||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10099729 gtccaaattcatcgctctcaaaattaaggttcatagttgtatttttcggtctttattcaaaacatattcaatcgattacttgatttataatgttgttgat 10099630  T
Q  261 aaaat 265  Q
     ||||    
T  10099629 gaaat 10099625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 308
Target Start/End: Original strand, 932643 - 932711
Alignment:
Q  238 acttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||  |||||  | ||||||||||||||    
T  932643 acttgatttataatattgttgatgaaatatttatctgtaaaattagctttgaa--ttaaaaacaagaagaa 932711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32424281 - 32424222
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattag 283  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  32424281 aaaattgatccattatttaatttataatattgttgaggaaatatttatatgtaaaattag 32424222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4249007 - 4248965
Alignment:
Q  310 aaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4249007 aaaatgtatataaataattatgtttggtgtcataaacactttt 4248965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5177529 - 5177433
Alignment:
Q  256 ttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttg 353  Q
    ||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||  |||| | || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  5177529 ttgatgaagtatttatttataaaattaggtttgaaata-aaaaacaacaacaagaaaatgtgcataagtgattatgtttgatgttataaacacttttg 5177433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17053615 - 17053558
Alignment:
Q  295 aaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcactttt 352  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17053615 aaaaaaaataagaagaaaatgtatgtaagtaatcatgttttgtgtcataaacactttt 17053558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 224 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21076415 - 21076304
Alignment:
Q  224 aaaattgatcgattacttgatttataatattgttgataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaa 323  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||  || |||||||| ||| ||| | |||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||| |||     
T  21076415 aaaattaatcaattacttaatttataacgttcttgataaa-tatttatttgtaaaattagatttgaa-ttcagaaacaagaaaaa--aaatgtatgtaag 21076320  T
Q  324 taatcatgtttgatgt 339  Q
    ||||||||||||||||    
T  21076319 taatcatgtttgatgt 21076304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 60 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 508412 - 508077
Alignment:
Q  60 ataaattggtcatttaagtaataaaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaaagcgtttgtatggatgtttaatgttaagttggt 159  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  508412 ataaattggtcatttatgtcatagaatatttgcaccattatcctaatttcatcaaactcaatcaaaatgtgtttatgtggatgtttaatgttaagttgat 508313  T
Q  160 ttgtccaaattaattgctctcaaaactaaagctcataggtgtgttattctgtcttgattc-aaataaaattgatcgattacttgatttataatattgttg 258  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||                  
T  508312 ttatccaaattcattgctctcaaaattaaggcttgtgggtgtgttattcggtcttgattcaaaacaaaattaattaattacttgat-------------- 508227  T
Q  259 ataaaatatctatatataaaattaggcttgaaattcaaaaacaagaagaagaaaatgtatataaataatcatgtttgatgtcataagcacttttggatcc 358  Q
    || |||| | ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||  || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |     
T  508226 atcaaatgtttatatgtaaaattagacttgaaattaaaaaacagga--aaaaaaatgtgtataagtaatcatgtttgatgtcataaacatttttggacct 508129  T
Q  359 accatcttaatgttaaaaggtctataagcactttttagcgatgttggctgaa 410  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  508128 accatcttaacgttaaatggtctataaacactttttaacgaagttggctgaa 508077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University