View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7545_low_1 (Length: 784)

Name: NF7545_low_1
Description: NF7545
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7545_low_1
NF7545_low_1
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (17-784)||(16661972-16662739)
chr2 (128-778)||(16657503-16658153)
chr2 (209-720)||(14703021-14703532)
chr2 (177-784)||(43624993-43625600)
chr2 (182-723)||(7541812-7542353)
chr2 (180-447)||(11998992-11999258)
chr2 (260-774)||(12234354-12234867)
chr2 (211-723)||(12245447-12245959)
chr2 (180-784)||(12258561-12259165)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (179-735)||(30774835-30775391)
chr4 (178-777)||(9335878-9336477)
chr4 (211-514)||(35132071-35132375)
chr4 (602-784)||(35132454-35132636)
chr4 (250-327)||(23597022-23597099)
chr4 (240-327)||(23588170-23588257)
chr4 (254-327)||(54396081-54396154)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (176-784)||(8585686-8586294)
chr7 (116-679)||(8616201-8616764)
chr7 (179-783)||(10494355-10494959)
chr7 (107-784)||(8658874-8659551)
chr7 (178-784)||(8654032-8654638)
chr7 (211-720)||(27830919-27831428)
chr7 (180-784)||(6789096-6789700)
chr7 (108-774)||(8666931-8667597)
chr7 (178-778)||(1301043-1301642)
chr7 (109-738)||(8545149-8545775)
chr7 (211-494)||(17267554-17267837)
chr7 (178-783)||(3146846-3147451)
chr7 (211-494)||(17259856-17260139)
chr7 (407-783)||(13333437-13333813)
chr7 (179-389)||(8609500-8609710)
chr7 (188-324)||(8575918-8576054)
chr7 (179-393)||(29578043-29578257)
chr7 (181-318)||(8581285-8581422)
chr7 (672-784)||(8628608-8628720)
chr7 (220-324)||(29582281-29582385)
chr7 (128-297)||(13333835-13334001)
chr7 (215-304)||(27846566-27846655)
chr7 (188-784)||(8646469-8647065)
chr7 (198-300)||(8537638-8537740)
chr7 (240-390)||(8102311-8102461)
chr7 (176-318)||(8569891-8570033)
chr7 (563-733)||(8570278-8570448)
chr7 (180-394)||(8590222-8590436)
chr7 (563-736)||(7877761-7877934)
chr7 (673-784)||(8636323-8636434)
chr7 (563-784)||(8590605-8590826)
chr7 (182-394)||(7878103-7878315)
chr7 (634-737)||(8559371-8559474)
chr7 (635-784)||(29581821-29581970)
chr7 (563-739)||(8576293-8576469)
chr7 (179-278)||(8558966-8559065)
chr7 (263-389)||(8636718-8636844)
chr7 (629-735)||(29577701-29577807)
chr7 (659-737)||(8602037-8602115)
chr7 (254-327)||(8017850-8017923)
chr7 (557-774)||(17260202-17260419)
chr7 (250-470)||(8383170-8383390)
chr7 (179-239)||(8671623-8671683)
chr7 (556-620)||(17267899-17267963)
chr7 (240-315)||(39985290-39985365)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (178-784)||(4678538-4679143)
chr1 (185-784)||(34466773-34467367)
chr1 (211-784)||(15594649-15595222)
chr1 (207-315)||(52549395-52549503)
chr1 (424-484)||(52549292-52549352)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (207-716)||(43744427-43744936)
chr8 (233-739)||(12528141-12528647)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (178-723)||(28219500-28220045)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 712; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 712; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 16662739 - 16661972
Alignment:
Q  17 agcatgttgttgtcactcacttttgccctctcaccctcataaacttcaatcaaggcactatattggttatctttagaagtaagatattggtttgtcatct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662739 agcatgttgttgtcactcacttttgccctctcaccctcataaacttcaatcaaggcactatattggttatctttagaagtaagatattggtttgtcatct 16662640  T
Q  117 tgaaaggtacagaagtgttcctaggaaccaccacattcataatacgatcatcatgtaccgagataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662639 tgaaaggtacagaagtgttcctaggaaccaccacattcataatacgatcatcatgtaccgagataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaa 16662540  T
Q  217 gtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662539 gtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttc 16662440  T
Q  317 ccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662439 ccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaat 16662340  T
Q  417 ccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtc 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662339 ccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtc 16662240  T
Q  517 ctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttgga 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16662239 ctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttgga 16662140  T
Q  617 ttcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccag 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16662139 ttcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccag 16662040  T
Q  717 cagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaacacca 784  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  16662039 aagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtcccaccacca 16661972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 16658153 - 16657503
Alignment:
Q  128 gaagtgttcctaggaaccaccacattcataatacgatcatcatgtaccgagataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacat 227  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||| | | ||||| |||   |  |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||| | ||| ||||    
T  16658153 gaagtgttcctaggaatcacaacactcatgacatgatcaacatcggctaagataccaagcgacaatggggtaacatctctcaacaccaaatctgggacat 16658054  T
Q  228 ccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 327  Q
     ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||    
T  16658053 tcttaaagccttcactcaaaatagcagcttgaacagctgcaccgtaagcaacagcttcatccgggttgatacttttgcataaatccttgcccttgaaaaa 16657954  T
Q  328 gttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaa 427  Q
    ||   ||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||  | | | ||  ||| ||||||||||||   || ||||    
T  16657953 gtcttgcaatagatcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaagaacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcacgaagacaa 16657854  T
Q  428 ctctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaat 527  Q
     |||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||  |||   |||||     
T  16657853 ttctcaacagttttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaag 16657754  T
Q  528 aatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgat 627  Q
    |||| | ||||| || |||||| ||    |||||||||||||| || ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||    
T  16657753 aatctacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttgagttcccacttat 16657654  T
Q  628 atccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggctttt 727  Q
     ||||| || |||||| | | ||| || |  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16657653 gtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttctgttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttccggcagtggctttt 16657554  T
Q  728 acttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtacca 778  Q
    || ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16657553 acctcaaaaacatcacccttaattgtaaggatagacacatcaaaagtacca 16657503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 209 - 720
Target Start/End: Original strand, 14703021 - 14703532
Alignment:
Q  209 agcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcaca 308  Q
    |||||||| || ||||||| ||| | | |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  14703021 agcaccaacttcggaacattcttgacgtcttcactcaacaaagcagcctgaacagctgccccataagctacagcttcatcagggttaatgctgttgcaca 14703120  T
Q  309 actccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccat 408  Q
    |||||||||| | ||| ||||   | ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |  | |||||||||    
T  14703121 actccttcccctggaaaaagtcctgtaataattgctgtactttgggaatccgagaagacccaccgacaagaacaacatcatctactctactcttgtccat 14703220  T
Q  409 ctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaag 508  Q
    ||| | ||| | || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | | |||  |||| ||| |||    
T  14703221 cttagcatcaataagacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaag 14703320  T
Q  509 tcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaagg 608  Q
    ||||||   |   |||||  ||| | |||||||| || ||| | || |||||| ||||| ||||| ||| | || ||||  |||||||| ||||| ||||    
T  14703321 tcaatgcattgaaataaagcatctacctcaatagtggcgacaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaagg 14703420  T
Q  609 ctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggt 708  Q
    || ||||||| | | | || |||| | |||| || || || || ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  14703421 cttttggatttccactaatgtccaatctgttttttctcttgaactcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagt 14703520  T
Q  709 gtttccagcagt 720  Q
    ||||||||||||    
T  14703521 gtttccagcagt 14703532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 177 - 784
Target Start/End: Original strand, 43624993 - 43625600
Alignment:
Q  177 agataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagc 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| || |||||||| ||||||||    
T  43624993 agataccaagtgacaaaggggtaacatctcgcagcaccaattttggaacattcttaatgcctttactcaaaatagcagcctggacagctgcaccataagc 43625092  T
Q  277 aacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgaca 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||  | |||||||| ||||| || |   |||| |  |  |  ||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  43625093 aacagcctcatcagggtttatgctttcgcatgattccttccccttgaaaaactcctgcaacagctgttttacttttggaattctagaggagccgccaaca 43625192  T
Q  377 agaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttctt 476  Q
    || |||| ||| || | | | | |||||||| ||| | ||| | || |||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  43625193 aggacaacatcgtggatagcactcttgtccaacttggcatcaataagacaactcttaacagttttcaaacactcgttgaaaagatccatatttatttcat 43625292  T
Q  477 caaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgc 576  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||  |   | ||||| |||| | |||||||| | ||| | |    ||||| |||||||||||  |    
T  43625293 caaatttggcacgagtgattgatgaaaagaagtcaataccacggaataaagaatctacctcaatagtgctgaacgaagcaaaagacagtgtcctttttcc 43625392  T
Q  577 cttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacatt 676  Q
      | || || |  ||||||||||| || | ||||||||  || | | | |||||||| ||||||||| | | ||||||||   |||||||||||| ||||    
T  43625393 tctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggctcttgagtttccaataatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccatt 43625492  T
Q  677 ctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtac 776  Q
    || | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||     |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43625493 ctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagcagtggctttaacacggaagaccttgtccttaattgtaagtatagacacatcaaaagtac 43625592  T
Q  777 caacacca 784  Q
    || |||||    
T  43625593 caccacca 43625600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 723
Target Start/End: Original strand, 7541812 - 7542353
Alignment:
Q  182 ccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacag 281  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||| |||||| | | ||||| |||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7541812 ccaagagacaaaggtgtaacatcctgcagcaccaactttggagcgttcttaacgcctccactcaacaatgcagcctgaacagctgccccataagcaacag 7541911  T
Q  282 cctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaac 381  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||     ||||  |  || ||| | |||||||| || || || |||||||| ||    
T  7541912 cctcatcaggattaatgctcttgcacaagtcctttccattgaaaaagtcctttaatagctgatgtactatgggaatcctcgaagacccgccgacaaggac 7542011  T
Q  382 aatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaac 481  Q
    || ||||| ||     | ||||||||| || | ||| | || ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  7542012 aacatcatctatcatgctcttgtccatattagcatcaataagacagcttccaacaatcgtcatacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaac 7542111  T
Q  482 ttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcctttt 581  Q
    ||| | | | |||  |||| ||| ||||||||| | |   ||||| |||| | |||||||| ||  || |    |||||| ||||  ||||| ||| | |    
T  7542112 ttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagtggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctct 7542211  T
Q  582 cacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgtt 681  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||| || || || ||||  ||||||||||||  |||||| ||    
T  7542212 cacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctatt 7542311  T
Q  682 atcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggc 723  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7542312 atcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccagcagtggc 7542353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 447
Target Start/End: Original strand, 11998992 - 11999258
Alignment:
Q  180 taccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaac 279  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||  ||| |||||| |||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11998992 taccaagagacaaaggagtaacatcctgcaacaccaaatttggaacattcttaacatcttcactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagctac 11999091  T
Q  280 agcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaaga 379  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||||  |  || || ||||| |||||||| || || || |||||     
T  11999092 agcctcatcagggttaatgctcttgcacaactccttcccgttgaaaaagtcatgtaatagctgttggac-tttgggatcctagaagatccaccaacaagt 11999190  T
Q  380 acaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcataca 447  Q
    |||| ||||| || |   | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||    
T  11999191 acaacatcatctatagtactcttgtccatctttgcatccataatacaactctcaacagtctttataca 11999258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 260 - 774
Target Start/End: Original strand, 12234354 - 12234867
Alignment:
Q  260 acagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcc 359  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| || |   |||||| || ||||||||| |||||||    
T  12234354 acagctgcctcataagcaaccgcctc-tcagggttaatactcttgcacagctccttccccttgaaaaaatcctgcaatagttgctgcactttgggaatcc 12234452  T
Q  360 tagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaag 459  Q
    |||| || || || | ||| ||||  ||||  || |  |  ||||||||||| | |||   || |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  12234453 tagaggacccgccaataaggacaacttcatccaccctacttttgtccatcttagcatcactaagacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaag 12234552  T
Q  460 gtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaa 559  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| | | | |||  |||| ||| || |||||| | ||  ||||| |||| | |||||| |  |  || |    ||||    
T  12234553 atccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaatggttgcaacaacaaggaaa 12234652  T
Q  560 gagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttca 659  Q
    || | ||  ||||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||       
T  12234653 gacaatgatctttttgccctctcacaagcagttcttaacctcctcaaggcttttggatttccactcatgtccacttttttctttctattgaactcttgag 12234752  T
Q  660 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggat 759  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||  ||||||  ||| |||||| | ||||     
T  12234753 caaggtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccggctgtggctttaacttggaagacattacctttgattgttaggag 12234852  T
Q  760 agacacatcaaaagt 774  Q
    |||||||||||||||    
T  12234853 agacacatcaaaagt 12234867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 12245959 - 12245447
Alignment:
Q  211 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 310  Q
    |||||| |||||||||| |||||   ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  12245959 caccaaatttggaacattcttaacatctttactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagcaacagcctcgtcagggttaatgctcttgcacaat 12245860  T
Q  311 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 410  Q
    |||||||| ||||| ||||   | ||||  |  || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| ||||| || |   | |||||||||||    
T  12245859 tccttcccgttgaaaaagtcctgtaatagctgttggactttgggaatcctagaagatccaccaacaagtacaaaatcatctatagtactcttgtccatct 12245760  T
Q  411 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 510  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||| || | ||| | ||| ||||||||  | ||| |||  |||| ||| || ||    
T  12245759 ttgcatccataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcccgattgatggatgaagaaaaatc 12245660  T
Q  511 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaa-gagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggc 609  Q
    |||| | |   ||||| |||| | ||||||||  |  | |||   |||| || ||| | ||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12245659 aatgccttgaaataaagaatctacctcaatagttg-caacaacaagaaacgaaagtattctttttgccctctcacaagcagttctcaatctcctcaaggc 12245561  T
Q  610 tcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtg 709  Q
    | ||| | |   | | ||||||| ||||||||| || || || || |   |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  12245560 ttttgaacttgcactaatatccaatttgttctttctcttgaactcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtg 12245461  T
Q  710 tttccagcagtggc 723  Q
    ||||||||||||||    
T  12245460 tttccagcagtggc 12245447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 12259165 - 12258561
Alignment:
Q  180 taccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaac 279  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||  ||||| |||| |||||||||| ||  ||  ||||||| |||| |||||| || | ||| |||||| |||| ||    
T  12259165 taccaagagacaaaggtgtaacatcctgcagctccaactttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctac 12259066  T
Q  280 agcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaaga 379  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |   | ||||  | |||||||||  |||||||||| || || || |||||     
T  12259065 agcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaagg 12258966  T
Q  380 acaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaa 479  Q
    |||| ||||| ||||   | ||||||| | || | ||||  || ||||||||||||| ||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  12258965 acaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatccgtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaa 12258866  T
Q  480 acttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttga-aagagagtgtccttttcgcct 578  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| ||| || |||||| | ||  ||||| |||| ||||||||||  |  || ||   || |||| ||||  ||||| ||      
T  12258865 acttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaatagttgcaac-aacaagataagaaagtgatctttttgcac 12258767  T
Q  579 tttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattct 678  Q
    | |||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||||||||  ||| ||||||    
T  12258766 tctcacaagctgttttcaatctcctcaaagctcttggatttccacttatatctactttgttctttctcttgaactcttctacaaagtaactcaccattct 12258667  T
Q  679 gttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtacca 778  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||| |||||||  | |||| ||  | || | ||||||||||||||| |||    
T  12258666 attatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccagctgtagccttaacttgaaagacattatccttaatggttagtagagacacatcaaaagtgcca 12258567  T
Q  779 acacca 784  Q
     |||||    
T  12258566 ccacca 12258561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 179 - 735
Target Start/End: Original strand, 30774835 - 30775391
Alignment:
Q  179 ataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaa 278  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | |||||    
T  30774835 ataccaagtgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagcaa 30774934  T
Q  279 cagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaag 378  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  30774935 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 30775034  T
Q  379 aacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttca 478  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||| | |||||||||   || ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30775035 aacaatatcatctacactactcttgtctacctttgaatcagtaagacaactctcaacagtctgtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctca 30775134  T
Q  479 aacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcct 578  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |   |||||| ||| ||||||| |   ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  30775135 aacttgacacgagtgattgatgaagaaaagtcaatgtcttgaaataaattatctatctcaacaaatgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcct 30775234  T
Q  579 tttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattct 678  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||| |||||||||||||  || || ||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  30775235 tttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattct 30775334  T
Q  679 gttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaa 735  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30775335 gttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagcagttgctttaacttcaaa 30775391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 178 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 9336477 - 9335878
Alignment:
Q  178 gataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9336477 gataccaagtgacaatggggtaacatctcgtagcaccaagttgggcgcattcttaaagccttcactcaaaatagcagcttgaacagctgcaccataagca 9336378  T
Q  278 acagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaa 377  Q
    ||||||||||| |||||||| | | || | || |||||||| ||||| || |   |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  9336377 acagcctcatctgggttgatacccatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagttcttgcactttcggaatcctagacgagccacccacaa 9336278  T
Q  378 gaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttc 477  Q
    ||||||||||||  | |   | |||||  ||||||||||||   | |||  | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || | ||| ||    
T  9336277 gaacaatatcatcaatattactcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaacaatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctc 9336178  T
Q  478 aaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcc 577  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||  ||    |||||  ||| | ||||| || ||| || ||    ||||| ||| ||||||| |||    
T  9336177 aaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtaacaaaagcaaaagacagtatcctttttgcc 9336078  T
Q  578 ttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattc 677  Q
     | ||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| |||    |||| |||||||| |||||| | || || |||| |||||| ||||| | |||||    
T  9336077 ctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttctgcttgatgtccactttattcttcttttttaactcttccacaaaatagttaaccattc 9335978  T
Q  678 tgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtacc 777  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9335977 tgttatcaaagtcctcgcctccaaggtgcgtgtttcctgcggtggcttttacttcaaatagatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtacc 9335878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 211 - 514
Target Start/End: Original strand, 35132071 - 35132375
Alignment:
Q  211 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 310  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35132071 caccaactttggaacattttttatgcctttactcaacaaagcagcctgaactgctgccccataagctacagcctcatcggggttaatgctcttgcacaac 35132170  T
Q  311 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacac-cccccttgtccatc 409  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||  | ||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||| ||||| ||| |   | ||||||||||    
T  35132171 tccttccctttgaaaaagttttgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagaccctccaacaagaacaacatcatctacccttgctcttgtccatc 35132270  T
Q  410 tttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagt 509  Q
    || | ||| |  | ||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| ||| || |    
T  35132271 ttagcatcaatgagacaactctctacggtattcatacactcattaaaaaggtctgcattcatttcctcaaacttggcgcgattgattgatgaagaaaaat 35132370  T
Q  510 caatg 514  Q
    |||||    
T  35132371 caatg 35132375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 784
Target Start/End: Original strand, 35132454 - 35132636
Alignment:
Q  602 ctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccaccta 701  Q
    ||||||||| ||| ||||| | | || || ||||||||||| || || || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35132454 ctcaaggcttttgaattcccactaatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccga 35132553  T
Q  702 ggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaacacca 784  Q
    | || |||||||| |||||||| || ||||  ||||||  | |||| ||  |||| || || ||||||||||| ||| |||||    
T  35132554 gatgagtgtttccggcagtggccttaacttggaagacattatccttaatagtaagtattgaaacatcaaaagtgccaccacca 35132636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23597099 - 23597022
Alignment:
Q  250 agcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 327  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  23597099 agcagcttggactgcagcgccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttacaaagttccttcccattgaagaa 23597022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23588257 - 23588170
Alignment:
Q  240 cactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 327  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  23588257 cactcaaaatagcagcttggacggctgccccatatgcaacagcttcatcggggttgatgctcttacaaagctcctttccattgaagaa 23588170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 327
Target Start/End: Original strand, 54396081 - 54396154
Alignment:
Q  254 gcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 327  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  54396081 gcttgaacagcagcaccataagcaacagcttcatcagggttaatactcttgcaaagctctttcccattgaagaa 54396154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 176 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 8586294 - 8585686
Alignment:
Q  176 gagataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataag 275  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| || || || || ||| || || || ||||||  ||    
T  8586294 gagataccaagtgacagaggggtaacatctcgcagcaccaagtttggaactttcttaaagtctttacacagcaaagaagcctgaactgcagccccactag 8586195  T
Q  276 caacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgac 375  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  8586194 caacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccattgaagaagtcactcaatagttcctgtactttgggaattctggacgagccaccgac 8586095  T
Q  376 aagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttct 475  Q
    ||| |||||||| | ||||||   ||| || ||||| |||||   || ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  8586094 aaggacaatatcgtctacaccattcttctctatcttagaatcggtaagacaactctcaacagtatttatacactcattaaaaaggtccatattgatttcc 8585995  T
Q  476 tcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcg 575  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||| || | | ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8585994 tcaaacttgacacgcgtgattgatgaagagaaatcgacgccctcacataaataatcaatttcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttg 8585895  T
Q  576 ccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacat 675  Q
    |||||||||| |  ||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8585894 ccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggttcttagtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacat 8585795  T
Q  676 tctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagta 775  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||||     
T  8585794 tctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccagcggttgctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaaagtc 8585695  T
Q  776 ccaacacca 784  Q
    ||| |||||    
T  8585694 ccaccacca 8585686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 116 - 679
Target Start/End: Original strand, 8616201 - 8616764
Alignment:
Q  116 ttgaaaggtacagaagtgttcctaggaaccaccacattcataatacgatcatcatgtaccgagataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcacca 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   ||  | |  ||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||    
T  8616201 ttgacaggtacagaagtattcctaggaatcaccacactcataata---tctcctttgactaagataccaagtgacagaggggtaacatctcgcagcgcca 8616297  T
Q  216 agtttggaacatccttaatgccttcact---caacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactc 312  Q
    |||||||||||| ||||| | ||  | |   ||||| |||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  8616298 agtttggaacattcttaaagtctgtagtacccaacaaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcacaaatc 8616397  T
Q  313 cttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatcttt 412  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||| || |||||     
T  8616398 cttcccatcgaaaaagtcactcaatagttcctgcactttaggaatcctagacgagccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttctctatctta 8616497  T
Q  413 gaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaa 512  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| || |    
T  8616498 gaatcattaaaacaactctcaacagtctttatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaagagaaatcga 8616597  T
Q  513 tgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctct 612  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||| || | |||| |||||| |||||| | |||    
T  8616598 tgccctcacataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaatgaaagcatccgtttcgccttttcgcatgcagttttcaaccgcctcaacgatct 8616697  T
Q  613 tggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctg 679  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  8616698 tgggttcctagtaatatccacattgttcttcctcttaaaatcctcaacaaagtagttcaacattctg 8616764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 179 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 10494959 - 10494355
Alignment:
Q  179 ataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||    
T  10494959 ataccaagtgacaatggggtaacatctcgtagcaccaagttcgggacattcttaaagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaa 10494860  T
Q  279 cagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaag 378  Q
    |||||||||| |||||||| | | || | || |||||||| ||||| || |   ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  10494859 cagcctcatctgggttgatacgcatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacaag 10494760  T
Q  379 aacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttca 478  Q
    |||||||||||  | | |   |||||  ||||||||||||   | |||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||    
T  10494759 aacaatatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctca 10494660  T
Q  479 aacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcct 578  Q
    || ||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||  ||    |||||  ||| | |||||  | |||||| ||    ||||||||| ||||||| |||     
T  10494659 aatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacctcaacggtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgccc 10494560  T
Q  579 tttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattct 678  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||| | |||| ||||| || |||||| | || || || |  ||||| || |||| ||||||    
T  10494559 tctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattct 10494460  T
Q  679 gttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtacca 778  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10494459 gttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgttacctgcagtggcttttacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagtacca 10494360  T
Q  779 acacc 783  Q
     ||||    
T  10494359 ccacc 10494355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 107 - 784
Target Start/End: Original strand, 8658874 - 8659551
Alignment:
Q  107 tttgtcatcttgaaaggtacagaagtgttcctaggaaccaccacattcataatacgatcatcatgtaccgagataccaagtgacaatggggtaacgtctc 206  Q
    |||||| || ||| ||| |||| ||||||||| |||| ||| |||  ||| | | ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||     
T  8658874 tttgtcttcctgagaggcacagtagtgttccttggaatcactacacccatgacatgatcaacatctactgcgataccaagtgacaatggggtaacatctt 8658973  T
Q  207 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 306  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||  || || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  8658974 gcagcaccaagtttgggacattcttaaagcctttgcttaaaacagcagcttgaagagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgatactcttgta 8659073  T
Q  307 caactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtcc 406  Q
     ||  |||||     ||| | ||   ||||||  || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |  | | | | | | |      
T  8659074 taaaaccttctttgggaaaaggtcttgcaatagatcttgcactttgggaatcctagacgaaccacccacaagaacaatatcgtcaatatcactcatctgt 8659173  T
Q  407 atctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagaga 506  Q
    || ||||||||   || ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||| | |||    
T  8659174 atttttgaatcgctaagacaactctcaacagttttcatacactcattaaaaagatccatattcatttcctcaaacctggcacgagtgattaatgaacaga 8659273  T
Q  507 agtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaa 606  Q
    |||| ||  |||   ||||| |||| | ||||| || |||||| ||    |||||||||||||| || ||| | ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  8659274 agtctattccctgaaataaagaatcgacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 8659373  T
Q  607 ggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgg 706  Q
    || | |||| || | | | || |||||||| |||||| | || || || |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||     
T  8659374 ggattttgggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattctgctatcaaagtcctctcctccaaggtga 8659473  T
Q  707 gtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaacacca 784  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8659474 gtgtttccagaagtggcttttacttcaaagacatcacccttcattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacca 8659551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 178 - 784
Target Start/End: Original strand, 8654032 - 8654638
Alignment:
Q  178 gataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||| | |||||| || ||||| || ||||| |||    
T  8654032 gataccaagtgacaatggggtaacatcacgtagcaccaagttggggacattcttaaagtcttcactcaaaatagcagcctgaacagcagcgccatatgca 8654131  T
Q  278 acagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaa 377  Q
    | ||||||||| ||||||||  || |  ||||  ||||||| ||||| || |   ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  8654132 atagcctcatctgggttgatattcataaacaaagccttccccttgaaaaactctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacga 8654231  T
Q  378 gaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttc 477  Q
    | |||| |||||  | | |   |||||  |||||||||||    | |||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||    
T  8654232 gtacaacatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctc 8654331  T
Q  478 aaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcc 577  Q
    ||| ||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||  ||    |||||  ||| | ||||| || |||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||    
T  8654332 aaatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgcc 8654431  T
Q  578 ttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattc 677  Q
     | ||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| || |   | || |||||||| |||||| | || || || |  |||||||||| || |||||    
T  8654432 ctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattc 8654531  T
Q  678 tgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtacc 777  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  8654532 tgttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccagcagtggcttttacgtcaaagacatcacccttaattgtgagtatagacacatcaaaagtacc 8654631  T
Q  778 aacacca 784  Q
    | |||||    
T  8654632 accacca 8654638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 211 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 27831428 - 27830919
Alignment:
Q  211 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27831428 caccaagtttggaacattcataatgtcatcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccaaaagcaacagcctcatcaggattgatgctcttgcacaaa 27831329  T
Q  311 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 410  Q
    ||||| || ||||| ||||    |||||  | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||| ||||| || ||  | |||||||||||    
T  27831328 tcctttcccttgaaaaagtccgccaatagctgctgcactttgggaatccttgaagagccaccaacaaggacaacatcatctatactactcttgtccatct 27831229  T
Q  411 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 510  Q
    | || ||    | ||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    || | |||||||    
T  27831228 tagagtcagtgagacaactctcaacagtctccatacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagtc 27831129  T
Q  511 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggct 610  Q
    |||| ||||  ||||   ||| ||||||||||  ||| | |     ||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  27831128 aatgccctcaaataaggcatctatctcaatagtagtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggct 27831029  T
Q  611 cttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgt 710  Q
    ||||| |||| | | || |||||| | |||||| | || ||  | | |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27831028 cttgggttcccactaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtgt 27830929  T
Q  711 ttccagcagt 720  Q
    ||||||||||    
T  27830928 ttccagcagt 27830919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 180 - 784
Target Start/End: Original strand, 6789096 - 6789700
Alignment:
Q  180 taccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaac 279  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| |||||| || |||||||| || ||||||||    
T  6789096 taccaagagacaacggtgtaacatcttgcagcaccaagtttggaacactcttagagccttcgctcaacaaagcagcctggacagctgcaccgtaagcaac 6789195  T
Q  280 agcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaaga 379  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||| |  |   |||||| ||  |||||||| ||||| ||||| || || || |||||     
T  6789196 agcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatcctttcccatgaaaacttcttgcaatagttgttgcactttgggaattctagaagacccaccaacaagg 6789295  T
Q  380 acaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaa 479  Q
    |||| ||||| ||||   | |||||||||||| |  || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  6789296 acaacatcatttacaatactcttgtccatcttagcgtcaacaagacaactctcaacggtcttcatacactcattaaaaatatccatattgatttcctcaa 6789395  T
Q  480 acttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcctt 579  Q
    ||||| | ||||| ||||||| |  |||||| ||| |||   ||||| | || | ||||||||  ||||| |     |||||||||  |||||| ||| |    
T  6789396 acttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctgaaataaagagtctacctcaatagtagtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccct 6789495  T
Q  580 ttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctg 679  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||| ||||  || | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |   |||||||||| | || || |    
T  6789496 ttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttccagtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcgg 6789595  T
Q  680 ttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaa 779  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| || ||||  |||||   | | |||||| | | |||||||||||| ||||| |||     
T  6789596 ttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttccaccggtggccttaacttggaagaccttatctttgattgttaagatagacacatcgaaagtgccac 6789695  T
Q  780 cacca 784  Q
    |||||    
T  6789696 cacca 6789700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 774
Target Start/End: Original strand, 8666931 - 8667597
Alignment:
Q  108 ttgtcatcttgaaaggtacagaagtgttcctaggaaccaccacattcataatacgatcatcatgtaccgagataccaagtgacaatggggtaacgtctcg 207  Q
    ||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| | |||  |  ||| || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  8666931 ttgtcttcttgacaggtatggaagtgtttctaggaatcaccacactcatgatatgttcaatacttacagaaataccaagtgacaaaggggtcacatctcg 8667030  T
Q  208 cagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcac 307  Q
     ||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | | || |     
T  8667031 tagcaccaagttggggacattcttacagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcgtctgggttgatacccatgaat 8667130  T
Q  308 aactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtcca 407  Q
    || |||||||| |||||  | |   |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  | | |   |||||  |    
T  8667131 aattccttccccttgaaatattctagcaattgttcctgcactttgggaatcctagacgagccaccgacaagtacaacatcatcaatatcattcttgtata 8667230  T
Q  408 tctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaa 507  Q
    |||||||||||   | |||  | ||||| || ||||||||||| || |||| |||||| || | ||| ||||| ||  ||||||| | ||||| | | ||    
T  8667231 tctttgaatccctgagacaggtgtcaactatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctcaaatttagcacgagtaattgatgaacaaaa 8667330  T
Q  508 gtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaag 607  Q
    ||| ||  ||    |||||  ||| | ||||| || ||| || ||    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| |||    
T  8667331 gtcgattcccgtaaataaagcatctacctcaacagtggtaacaaaagcaaaagagagtatcctttttgccctctcacaggcagttctcaacctccttaag 8667430  T
Q  608 gctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtggg 707  Q
    | | |||| |||  | |||| |||||||| |||||| | || || || |  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  8667431 gattttgggttctgactgatgtccactttattcttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgag 8667530  T
Q  708 tgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagt 774  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  8667531 tgtttcctgcagtggctttcacttcaaagacatcacccttaattgtgaggatagacacatcaaaagt 8667597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 778
Target Start/End: Original strand, 1301043 - 1301642
Alignment:
Q  178 gataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |  ||||  || || | ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  1301043 gataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttgaatcctttgcttaaaatagcagcttgaatagctgcaccataagca 1301142  T
Q  278 acagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaa 377  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | ||  | ||| |   ||| | ||   ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  1301143 acagcctcgtc-gggttgatactcttgtataaaactttctccgggaaaatgtcttgcaatatatcttgcactttgggaatcctagacgagccacccacaa 1301241  T
Q  378 gaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttc 477  Q
    ||||||||||||  | | | | | ||   || ||||||||   || ||||||||||||  | ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  1301242 gaacaatatcatcgatatcactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttgtacactcattaaaaagatccatattaatttcctc 1301341  T
Q  478 aaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcc 577  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| ||  |||   ||||| |||| | |||||  | |||||| ||    ||||||||||||||||| |||    
T  1301342 aaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgaaataaagaatcgacctcaacggtggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgcc 1301441  T
Q  578 ttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattc 677  Q
     | ||||| | | ||||||||||||| |||| | |  | || | | | || |||||||| |||||| |  | || || |  ||||||||| ||| |||||    
T  1301442 ctctcacacgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttctttctgaactcctctacaaagtagctcaccattc 1301541  T
Q  678 tgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtacc 777  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1301542 tattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttccaccagtggcttttacttcaaagacatcgcccttgatggtaaggatagacacatcaaaagtacc 1301641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 738
Target Start/End: Original strand, 8545149 - 8545775
Alignment:
Q  109 tgtcatcttgaaaggtacagaagtgttcctaggaaccaccacattcataatacgatcatcatgtaccgagataccaagtgacaatggggtaacgtctcgc 208  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||   |   | ||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  8545149 tgtcttcttgaatggtacagaagtattccaaggaatcaccacactcataata---tttccgtgtataaagataccaagtgacaaaggggtaacatctcgt 8545245  T
Q  209 agcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcaca 308  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||| || |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8545246 agcaccatgtttgggacattcttattgtcttcactcagcaaagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttaatgctcttgcata 8545345  T
Q  309 actccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccat 408  Q
    | |||||||| || || || |   | ||||  |    |||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  8545346 attccttccccttaaaaaactcctgtaatagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccgccaacaaggacaacatcatctacactacccttgtccat 8545445  T
Q  409 ctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaag 508  Q
    ||| | ||| |||| |||||  | |||| | | ||||||||  | ||| ||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||   ||| | | |||    
T  8545446 cttagcatcaacaagacaacaattaacagtgtccatacacttttcaaagaggtccatattcaattgctcaaacttggcccgagtgatgcatgaacaaaag 8545545  T
Q  509 tcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaagg 608  Q
    |||||  | |  ||||||  ||| |  ||||| | ||   |    | | | || ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8545546 tcaataccttgatataaagcatctaggtcaattgtggcctcagtgtcgtatgaaagtgtcctttttgccttctcacaggcagttctcaacctcctcaagg 8545645  T
Q  609 ctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggt 708  Q
    ||  ||| |||| | | |||||| | ||||||||||| || || || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||  ||    
T  8545646 cttctgggttccgactaatatcctcattgttcttcctcttgaactccttcacaaagtaattcaccattctgttatcaaagtcttcaccgcctaggtaagt 8545745  T
Q  709 gtttccagcagtggcttttacttcaaagac 738  Q
    || |||||||||||| || || ||||||||    
T  8545746 gtctccagcagtggccttgacatcaaagac 8545775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 494
Target Start/End: Original strand, 17267554 - 17267837
Alignment:
Q  211 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 310  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || | |||| |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  17267554 caccaagtttggaacattcttgacgcttccacttaacaaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatacttttgcataat 17267653  T
Q  311 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 410  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| |||||  || |  | |||||| ||||    
T  17267654 tccttccccttgaagaagttctgcaatagttgctgcactttcggaatcctagaagacccaccaacaaggacaacatcatcaactctgctcttgtcaatct 17267753  T
Q  411 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtga 494  Q
    | | |||   || |||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17267754 tagcatcactaagacacttctcaacaatctccatgcactcatcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtga 17267837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 783
Target Start/End: Original strand, 3146846 - 3147451
Alignment:
Q  178 gataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagca 277  Q
    ||||||||| ||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3146846 gataccaagagacaaaggagcaacatcttgcaccaccaagtttggaacatttttaaagtcttcactcaacaaagcagcttgcacagctgcaccataagca 3146945  T
Q  278 acagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttac-gcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgaca 376  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||  | |||||| |  || || || | |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3146946 acggcctcatcagggttgatgctgttacacagatgcttccc-tgcaaaaaattcctgcaatagttgttgcacttttggaattctagacgagccaccgaca 3147044  T
Q  377 agaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttga-atccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttct 475  Q
    || || | |||||||| | | |  |||||||| || || |||  | |||||||||| |||| | | || ||||||  | ||||| ||||||||||||||     
T  3147045 aggacgacatcatgtatagcacttttgtccat-ttcgacatcagcgaaacaactcttaacagtttccaaacactcagtgaaaagatccatattgatttcc 3147143  T
Q  476 tcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcg 575  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||   |||   ||||| |||| |||||||| | |||||  |     ||||| ||| | | ||| |    
T  3147144 tcaaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaatccctgaaataaagaatctatctcaatggtggtgatgacagcaaaagatagtattcgttttg 3147243  T
Q  576 ccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacat 675  Q
    |  ||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||  |||  | | || || || ||||||||| | ||||| ||     |||||||||||| |||    
T  3147244 ctctttcacacgccgttttcaacctccttaaggctcttgagttctcactaatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccat 3147343  T
Q  676 tctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagta 775  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||| || |||| ||||||   | |||| ||| |||| | |||||||||||||||     
T  3147344 cctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcctgcgatggccttaacttgaaagaccttatccttaattgtaagaagagacacatcaaaagtc 3147443  T
Q  776 ccaacacc 783  Q
    ||| ||||    
T  3147444 ccaccacc 3147451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 211 - 494
Target Start/End: Original strand, 17259856 - 17260139
Alignment:
Q  211 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 310  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || | |||| |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17259856 caccaagtttggaacattcttgacgcttccacttaacaaagcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataat 17259955  T
Q  311 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 410  Q
    ||||| || |||||||| |   |||||| || ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||| |||||  |  |  | |||||| ||||    
T  17259956 tccttacccttgaagaaatcctgcaatagttgctgcactttcggaatcctagaagatccaccaacaaggacaacatcatcaattctgctcttgtcaatct 17260055  T
Q  411 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtga 494  Q
    |   |||   || |||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17260056 taccatcactaagacacttctcaacaatctccatgcactcataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtga 17260139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 407 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 13333813 - 13333437
Alignment:
Q  407 atctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagaga 506  Q
    ||||||||||||   | |||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |    
T  13333813 atctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaa 13333714  T
Q  507 agtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaa 606  Q
    |||| ||  ||    |||||  ||| |  |||| || |||||| ||    || |||||| |||||||  || | ||||| | ||||||||||||||| ||    
T  13333713 agtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaagaaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctcaacctccttaa 13333614  T
Q  607 ggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgg 706  Q
    || | |||| |||| | ||||||| || || |||||| | || || || |  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  13333613 ggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtga 13333514  T
Q  707 gtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaacacc 783  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13333513 gtgtttcctgcggtggcttttacttcaaagacatcacccataattgtaaggatagacacatcaaaagtaccaccacc 13333437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 389
Target Start/End: Original strand, 8609500 - 8609710
Alignment:
Q  179 ataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaa 278  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    || |||||||||| ||||| |||||| || ||||| || ||||||||||    
T  8609500 ataccaagtgacaaaggtgtaacatctcgcagcaccaagtttggaactgatttgatgccttcacccaacaaagcagcctggacagcagcaccataagcaa 8609599  T
Q  279 cagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaag 378  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||   ||| ||  | || |||||| ||||||||||| || || || |||||    
T  8609600 ccgcctcatcagggttgatgctcatacacaaatcctttccattgaaaaagtcttgcagtagctgcttcactttcggaatcctagaagaacctccaacaag 8609699  T
Q  379 aacaatatcat 389  Q
    ||||| |||||    
T  8609700 aacaacatcat 8609710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 324
Target Start/End: Original strand, 8575918 - 8576054
Alignment:
Q  188 gacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcat 287  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  8575918 gacaacggtgtaacatctcgtaacaccaagtttggaacattcttactgccttcactcaacaaagcagcttggacaacagcaccataagcaacagcctcat 8576017  T
Q  288 cagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaa 324  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  8576018 cagggttgatgctcttacataattccttccccttgaa 8576054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29578257 - 29578043
Alignment:
Q  179 ataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaa 278  Q
    |||||||| ||||| || ||||  |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29578257 ataccaagcgacaagggtgtaatatctcgcaagaccaaatttggaacattcttaatgccatcaatcaacaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaa 29578158  T
Q  279 cagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaag 378  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| | || ||||| ||||   |||||| || | ||||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  29578157 cagcctcgtcagggtttatgctcatgcacaaatccctacccttgaaaaagtcttgcaatagtttccgcactttgggaattctagatgaacctccaacaag 29578058  T
Q  379 aacaatatcatgtac 393  Q
     ||||| ||||||||    
T  29578057 gacaatttcatgtac 29578043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 318
Target Start/End: Original strand, 8581285 - 8581422
Alignment:
Q  181 accaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaaca 280  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||| | || |||||| || | ||| || ||||||||||||    
T  8581285 accaagtgacaatggtgtaacatctcgcaaaatcaagtttggaacactcttaatgccttcactaaccaaagcagcctgaatagcagcaccataagcaaca 8581384  T
Q  281 gcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttccc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8581385 gcctcatcagggttgatgctcttgcataattccttccc 8581422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 672 - 784
Target Start/End: Original strand, 8628608 - 8628720
Alignment:
Q  672 acattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaa 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||||||||    
T  8628608 acattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccagcagtggctttaacttcaaagacatcacctttaattgtgaggagagacacatcaaa 8628707  T
Q  772 agtaccaacacca 784  Q
    ||| ||| |||||    
T  8628708 agtcccaccacca 8628720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29582385 - 29582281
Alignment:
Q  220 tggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttccca 319  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  29582385 tggaacattctcaatgccttcaatcagcaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatccttcccc 29582286  T
Q  320 ttgaa 324  Q
    |||||    
T  29582285 ttgaa 29582281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13334001 - 13333835
Alignment:
Q  128 gaagtgttcctaggaaccaccacattcataatacgatcatcatgtaccgagataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacat 227  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||    ||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||     
T  13334001 gaagtgttcctaggaatcacaacattcatgatatgttcata---tactgaaataccaagtgataatgggataacatctcgtagcaccaagttcgggacag 13333905  T
Q  228 ccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgat 297  Q
     ||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13333904 tcttaaagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagcaacagcctcatctgggttgat 13333835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27846655 - 27846566
Alignment:
Q  215 aagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttg 304  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27846655 aagtttggaacattcttaatgtcatcactcaacaaagcagcctgcacagctgctccaaaagcaacagcctcatcagggttgatgctcttg 27846566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 784
Target Start/End: Original strand, 8646469 - 8647065
Alignment:
Q  188 gacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcat 287  Q
    ||||||||||| || ||| | | ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||  || | |||||| || || ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  8646469 gacaatggggtgacatcttgaaacaccaagtttggagcattcttaaagccatcacataataaagcagcctgaacggctgcgccataagcaacggccacat 8646568  T
Q  288 cagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatc 387  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| || |    ||  |  |  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||    
T  8646569 cagggttgatgctctcgcataattccttctcattgaaaaactccttcagcatctgttgtacttttggaattctagaggagccaccaacaagaacaacatc 8646668  T
Q  388 atgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgaca 487  Q
    ||| | |   | |||||||||||| | |||   |  ||||||||||||| | | || ||| ||| | || || |||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  8646669 atggatagaactcttgtccatcttggcatcattatgacaactctcaacagtttccaaacattcgatgaacagatccatattgattgcgtcaaatttggca 8646768  T
Q  488 cgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaag 587  Q
    ||||||| ||||| |   ||||||||| | |   ||||| |||| |  ||||| | ||||    |    ||||| ||||||||||| ||  | || || |    
T  8646769 cgagtgattgatgaaataaagtcaatgccattaaataaagaatctaattcaatggtggtgcaagaagcaaaagatagtgtcctttttgctctctcgcatg 8646868  T
Q  588 aagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaa 687  Q
      |||||||||||||| ||||||||||  || | ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||   |||||| || || ||||||  |||||||    
T  8646869 ccgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaa 8646968  T
Q  688 gtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaacacca 784  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||   | |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  8646969 gtcctctcctccgaggtgagtgtttccagcggtggctttaacatgaaagaccttatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagttccaccacca 8647065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 300
Target Start/End: Original strand, 8537638 - 8537740
Alignment:
Q  198 taacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgat 297  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8537638 taacatctcgcagcaccaagttcggaacagtcttaatgcctccgctcaacaaagcagcctggacagcagcaccataagcaacagcttcatcagggttgat 8537737  T
Q  298 gct 300  Q
    |||    
T  8537738 gct 8537740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 390
Target Start/End: Original strand, 8102311 - 8102461
Alignment:
Q  240 cactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataa 339  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||   |||| |     
T  8102311 cactcaagatagcagcttgaacagcggcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatgcttttgcatagctccttaccattgaagaagtcttgcaacag 8102410  T
Q  340 ttcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatg 390  Q
    || ||| ||||| ||||||||||  || || || |||||||||| ||||||    
T  8102411 ttgctgaactttgggaatcctagttgaaccaccaacaagaacaacatcatg 8102461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 318
Target Start/End: Original strand, 8569891 - 8570033
Alignment:
Q  176 gagataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataag 275  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||| || ||||||   || | |||| || | |||||| || ||||    
T  8569891 gagacaccaagtgacaatggtgtaacatctcgcaaaaccaagtttggaacactcttaacgctttcactatgcaaaacagcctgaatagctgcaccgtaag 8569990  T
Q  276 caacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttccc 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  8569991 caacagcctcatcagggttaatgctgttgcataattccttccc 8570033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 563 - 733
Target Start/End: Original strand, 8570278 - 8570448
Alignment:
Q  563 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 662  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| | ||||||||| | || || |  |||||||    
T  8570278 agtgtcctttttgccctctcacaagctgttcttaacctcctcaaggcttttgggttcctactaatatcctcgttgttcttcttcttgaacttcttcacaa 8570377  T
Q  663 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttca 733  Q
    |||   ||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  8570378 agtgagtcaacattctgttatcaaaatcttcacctcccaggtgagtgtctccagcagtggccttgacttca 8570448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 394
Target Start/End: Original strand, 8590222 - 8590436
Alignment:
Q  180 taccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaac 279  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||| || ||||  | || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8590222 taccaagagacaatggagtaacatcttgtagcaccaaattaggaacattcttaatcccatcacaaagcaaagcagcttgaacagctgcaccataagcaac 8590321  T
Q  280 agcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaaga 379  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | |  ||||||||  | || ||||   ||||||  | ||||||||| ||||||||||| || || || |||||     
T  8590322 agcctcatctggattgatgctattgtaaagatccttccccataaaaaagtcttgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagaaccaccaacaagt 8590421  T
Q  380 acaatatcatgtaca 394  Q
    |||| ||||| ||||    
T  8590422 acaacatcatctaca 8590436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 563 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 7877934 - 7877761
Alignment:
Q  563 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 662  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || || | |   || |||||||| |||||||| ||||| ||  |||| |    
T  7877934 agtgtccttttagccctctcacatgcagttctcaacctcctaagggccctcgggtttccaccaatgtccactttattcttcctcttaaactccatcacta 7877835  T
Q  663 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaag 736  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  7877834 aatggttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtatctccggcagtagctattacatcaaag 7877761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 8636434 - 8636323
Alignment:
Q  673 cattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaa 772  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || |||||||| || ||     
T  8636434 cattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggcagtggctttaacttcaaagacttcacctttaattttgagtatagacacgtcgaat 8636335  T
Q  773 gtaccaacacca 784  Q
    |||||| |||||    
T  8636334 gtaccaccacca 8636323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 563 - 784
Target Start/End: Original strand, 8590605 - 8590826
Alignment:
Q  563 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 662  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||  ||| |||||||||| |  || ||||  |||| | | | ||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |    
T  8590605 agtgtccttttagccctctcacaagctgttttcaacctcctaagagcccttgcgttcccacttaaatccactttattcttcctcctaaactccttcacca 8590704  T
Q  663 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggataga 762  Q
    | | ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||  | |||| |||| | | || | |||    
T  8590705 aatggtgaaccattctgttatcaaagtcctctcctcctaggtgggtatctccggaagtggcttttacatcaaagctatcacctttgagtgtgagaagaga 8590804  T
Q  763 cacatcaaaagtaccaacacca 784  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  8590805 cacatcaaaagtgccaccacca 8590826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7878315 - 7878103
Alignment:
Q  182 ccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacag 281  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||| || ||||||| |||||| || ||||  | || |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  7878315 ccaagagacaatggagtaacatcttgcaacaccaaattaggaacattcttaataccatcacaaagcagagcagcctgaacagctgcaccataagcaacag 7878216  T
Q  282 cctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaac 381  Q
    | ||||| |||||||||||  |||| |  |||||||| || || ||||   ||||||  | |||||||||  |||||||||| || || || ||||| ||    
T  7878215 cttcatccgggttgatgctactgcaaatatccttccccttaaaaaagtcctgcaatagctgctgcactttgagaatcctagatgatccaccaacaagtac 7878116  T
Q  382 aatatcatgtaca 394  Q
    || ||||| ||||    
T  7878115 aacatcatctaca 7878103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 737
Target Start/End: Original strand, 8559371 - 8559474
Alignment:
Q  634 tttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttca 733  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||||| || ||||||    
T  8559371 tttgttcttcctctcaaactcttttacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttca 8559470  T
Q  734 aaga 737  Q
    ||||    
T  8559471 aaga 8559474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 635 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 29581970 - 29581821
Alignment:
Q  635 ttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaa 734  Q
    ||||||||||| || || || ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |||||||    
T  29581970 ttgttcttcctcttcaactcattcgcaaagtaattcaccattcggttatcaaagtcctctcctcctaggtgagtatcgccagcagtggccttcacttcaa 29581871  T
Q  735 agacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaacacca 784  Q
    |   | || |||||| | | || | ||||||||||||||| ||| |||||    
T  29581870 acttatcatccttgagtgtgagaagagacacatcaaaagtgccaccacca 29581821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 563 - 739
Target Start/End: Original strand, 8576293 - 8576469
Alignment:
Q  563 agtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaa 662  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||  | | |||||| |||||| |||  |  | || || || ||||    
T  8576293 agtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaacctccttaaggcttttgaattctcactaatatcctctttgtacttgttcctgaactccttaacaa 8576392  T
Q  663 agtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagaca 739  Q
    |||  | || |||| ||||||||||||| |  || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  8576393 agtgatccaccattatgttatcaaagtcttggcctcctaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttcgaagaca 8576469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 278
Target Start/End: Original strand, 8558966 - 8559065
Alignment:
Q  179 ataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaa 278  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| | || | |||| || |||||||| ||||||||||    
T  8558966 ataccaagggacaaaggggtaacatctctcagcaccatgtttggaacattcttagtgtcttcactaagcaaaacagcctggacagctgcaccataagcaa 8559065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8636844 - 8636718
Alignment:
Q  263 gctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctag 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| | || || | ||   | |||| || |||||| |||||||||||||    
T  8636844 gctgctccataagcaacagcctcatcagcgttgatgctcttacacagttccttcgccttaaaaatgtcctgtaatagttgctgcacctttggaatcctag 8636745  T
Q  363 acgagcccccgacaagaacaatatcat 389  Q
    | ||||| || ||||| |||| |||||    
T  8636744 aggagccaccaacaaggacaacatcat 8636718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 629 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 29577807 - 29577701
Alignment:
Q  629 tccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggctttta 728  Q
    ||||| ||||||||||| || || || |||||||||| | ||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| ||||    
T  29577807 tccacattgttcttcctcttcaactcattcacaaagtggctcaccattttattatcgaagtcctctcctcctaggtgagtatcaccagcagtggccttta 29577708  T
Q  729 cttcaaa 735  Q
    |||||||    
T  29577707 cttcaaa 29577701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 659 - 737
Target Start/End: Original strand, 8602037 - 8602115
Alignment:
Q  659 acaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaaga 737  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| | |||||| || ||||||||||    
T  8602037 acaaagtggttcaccattcggttatcaaagtcctctcctccaaggtgtgtgtctccggaagtggccttgacttcaaaga 8602115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8017923 - 8017850
Alignment:
Q  254 gcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaa 327  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||    
T  8017923 gcttgtacagcggcaccataagcaacagcctcgtctgggttgatactcttgcaaagctctttaccattgaagaa 8017850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 557 - 774
Target Start/End: Original strand, 17260202 - 17260419
Alignment:
Q  557 aaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctt 656  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||| | | || |||| ||| ||| | || || |  || |    
T  17260202 aaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctccttaaggcttttgggttcccaataatgtccaattttttcgttcttttgatctcct 17260301  T
Q  657 tcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaag 756  Q
      ||||| |||| || |||||| |||||||||||||| || || || || |||| |||| | ||||| || ||||| |||||   | |||| ||| |||     
T  17260302 ctacaaaatagtacaccattctattatcaaagtcctcacccccaagatgagtgtctccaccggtggccttaacttcgaagaccttatccttaattgtaac 17260401  T
Q  757 gatagacacatcaaaagt 774  Q
    || |||||||||||||||    
T  17260402 gagagacacatcaaaagt 17260419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8383390 - 8383170
Alignment:
Q  250 agcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcact 349  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || |  ||||||| |||||| ||||   ||||||  || ||||||    
T  8383390 agcagctttaactgctgcaccataagcaacagcctcgtcaggatttatgctcacacaaaggtccttccaattgaaaaagtgttgcaatagctcttgcact 8383291  T
Q  350 tttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacact 449  Q
    || |||||||| || || || ||||  ||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||| | |||   || ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  8383290 ttgggaatcctcgaagaaccaccgatgagaacaacatcatctacactactcttgttcatcttagcatcagtaagacagctctcaacagtctccatacact 8383191  T
Q  450 cgttaaaaaggtccatattga 470  Q
      | ||| |||||||||||||    
T  8383190 tttcaaataggtccatattga 8383170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8671683 - 8671623
Alignment:
Q  179 ataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgcctt 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||    
T  8671683 ataccaagtgacaatggcgtaacatctcgtagcaccaagttggggacattcttaaagcctt 8671623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 620
Target Start/End: Original strand, 17267899 - 17267963
Alignment:
Q  556 gaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcc 620  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  17267899 gaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaacctcctcatggcttttgggttcc 17267963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 315
Target Start/End: Original strand, 39985290 - 39985365
Alignment:
Q  240 cactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactcctt 315  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  39985290 cactcaagatagcagcctgaacagcagcaccatatgcaacagcctcatcaggatttatgctcttgcatagctcctt 39985365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 178 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 4679143 - 4678538
Alignment:
Q  178 gataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||  ||||| ||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  4679143 gataccaagtgacaatggggtaacatctcgcagcacaaaattcgggacattcttaaaaccttcgctcaaaatagcagcttggatagctgcaccataagca 4679044  T
Q  278 acagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaa 377  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || || ||||   ||||||  ||||||||||| |||||||| || || || || ||||    
T  4679043 acagcctcatctgggttgatactcttgcacaaatccttccgcttaaaaaagtcttgcaatagatcctgcactttgggaatcctcgatgaaccacccacaa 4678944  T
Q  378 gaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttc 477  Q
    |||||| |||||  | |   | |  |  ||||||||||||   || |||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  4678943 gaacaacatcatcaatattactcccgcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctc 4678844  T
Q  478 aaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcc 577  Q
    ||||||| ||||||| |  |||| ||| ||||| ||  |||   ||||| |||| | ||||| || |||||| ||   ||||||||||||||| || |||    
T  4678843 aaacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatcta-ctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgcc 4678745  T
Q  578 ttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattc 677  Q
     | || || | ||||||||||||||| |||| | |||  ||| || | || ||||| || |||||| | || || || |  ||||||||||||| |||||    
T  4678744 ctctcgcaggcagttctcaacctccttaagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattc 4678645  T
Q  678 tgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtacc 777  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678644 tgttatcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtacc 4678545  T
Q  778 aacacca 784  Q
    | |||||    
T  4678544 accacca 4678538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 185 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 34467367 - 34466773
Alignment:
Q  185 agtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcct 284  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  34467367 agtgacaatggtgtaacatctcgcagcaccaagtttggaacattgttaaagcctttactcaacaaagcagcttgcacagctgcgacataagcgacagcct 34467268  T
Q  285 catcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaat 384  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||  |||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||      
T  34467267 catcagggttgatgctattgcatagatccttaccattgaaaaagtcccgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagagcccccgacaaggacagc 34467168  T
Q  385 atcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatac---actcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaac 481  Q
    |||||| ||||  | | |||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |   | || ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  34467167 atcatgcacactactcgtgtccatcttagcatcaacaagacaactcacaacaatcctcatgcattaatctttaaagaagtccatattgatttcctcaaac 34467068  T
Q  482 ttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcctttt 581  Q
    ||| ||||||||| ||| | |  |||||||||  |||| |||||| |||| || |||| ||  | |||        || |||||||||| || || || |    
T  34467067 ttggcacgagtgattgacgaatggaagtcaattacctcatataaagaatctatttcaacagtagcgac--------aaaagagtgtcctctttgcattct 34466976  T
Q  582 cacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgtt 681  Q
    | || | |||||||||||||||||| ||||| || || | | | ||||||   || | |||||| || || || ||  |||||| ||||  |||||| ||    
T  34466975 cgcacgcagttctcaacctcctcaaagctctagggtttccactaatatccttattatgcttcctcttgaactcctttgcaaagtggttcgccattctatt 34466876  T
Q  682 atcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaaca 781  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||||  | |||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  34466875 atcaaagtcctctcgtccgaggtgagtgttaccagaagtggccttaacttcaaagacattatccttaattgtaaggagagacacatcaaaagtcccacca 34466776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 211 - 784
Target Start/End: Original strand, 15594649 - 15595222
Alignment:
Q  211 caccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaac 310  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15594649 caccaagtttggaacatttttaaaaccttcactcaacaaagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaat 15594748  T
Q  311 tccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatct 410  Q
    ||||| || | ||| || |    ||||| ||  |||||||| ||||||||||| || || || ||||  |||||||||| |||||  | ||| | |||||    
T  15594749 tcctttccctcgaaaaaatccttcaatagttgttgcactttgggaatcctagaagacccaccaacaatgacaatatcatttacactactcttattcatct 15594848  T
Q  411 ttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtc 510  Q
    | | |||  ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |  |||| | |||||||    
T  15594849 tagcatcatcaagacaactctcaactatcttcatacaatccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaacttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtc 15594948  T
Q  511 aatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggct 610  Q
    |||  | |   ||||| |||| | |||||| |  |||||     | |||||||||  |||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||     
T  15594949 aataccgttaaataaacaatctacctcaatggtagtgacagtagtaaaagagagtaccctttttgccctttcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcc 15595048  T
Q  611 cttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgt 710  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  15595049 cttgggttcccagtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgttatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgt 15595148  T
Q  711 ttccagcagtggcttttacttcaaagacaccacccttgattttaaggatagacacatcaaaagtaccaacacca 784  Q
    ||||  | ||||| || ||||  |||||     |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15595149 ttccgcctgtggccttaacttggaagaccttgtccttaattgttaggatagacacatcaaaagtgccaccacca 15595222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 52549503 - 52549395
Alignment:
Q  207 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 306  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||    
T  52549503 gcagcaccaactttggaacattctgaatgccttcactcaacaatgcagcctgaacagctgcgccataagctacaacctcatcaggattaatgcccttgca 52549404  T
Q  307 caactcctt 315  Q
    |||||||||    
T  52549403 caactcctt 52549395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 424 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 52549352 - 52549292
Alignment:
Q  424 acaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttg 484  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  52549352 acaactttcaacaatcttcatacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttg 52549292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 207 - 716
Target Start/End: Original strand, 43744427 - 43744936
Alignment:
Q  207 gcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgca 306  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  43744427 gcagcaccacgtttggaacttttttaaagccttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccaatagcaactgcctcatcagggttaatgttcttaca 43744526  T
Q  307 caactccttcccattgaagaagttac-gcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtc 405  Q
    ||| |||||||| |  || || || | |||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| | | | ||||||    
T  43744527 caaatccttccc-tgcaaaaaattcctgcaatagttgttgtacttttggaatcctagaggagccaccaacaagaacaacatcatgtatagcgctcttgtc 43744625  T
Q  406 catctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagag 505  Q
    |||||| | |||   || ||||||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||   |||||||| || |||| ||    
T  43744626 catcttggcatcagtaagacaactctcaacaattttcaaacactcgttgaagagatccatattgatttcctcaaacttagtacgagtgattgttgtaaag 43744725  T
Q  506 aagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctca 605  Q
    || |||||| ||||  ||||| |||| | |||||||| |||||| |     ||||| | ||||||||| ||  |||| || |  |||||||||||||| |    
T  43744726 aaatcaatgccctcaaataaagaatctacctcaatagtggtgacaacagcaaaagataatgtcctttttgctctttcgcatgctgttctcaacctcctta 43744825  T
Q  606 aggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtg 705  Q
    | |||||||| || | ||| || ||||| ||||||||| | ||||| || |   | |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  43744826 atgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcctattatcaaaatcctctcctccgaggtg 43744925  T
Q  706 ggtgtttccag 716  Q
     ||||||||||    
T  43744926 agtgtttccag 43744936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 739
Target Start/End: Original strand, 12528141 - 12528647
Alignment:
Q  233 atgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttac 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| || |       
T  12528141 atgccttcactcaacaaagcagcctgaacagcggcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgtataactccttgcccttgaaaaactcct 12528240  T
Q  333 gcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaagaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctc 432  Q
    ||||||  | || |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||| | |||    |||||||| ||    
T  12528241 gcaatagctgcttcactttgggaatcctagacgagccaccaacaagtacaatatcatctacactactcttgtccatcttagcatcggtcaaacaactttc 12528340  T
Q  433 aacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatca 532  Q
    |||  ||| ||||||||  | ||| ||||||||||| | ||  || |||||| | ||||||| |||||   ||||||||||| ||||  ||| |  |||     
T  12528341 aacggtctccatacacttttcaaagaggtccatattcagttgctcgaacttggctcgagtgattgatgagcagaagtcaatgccctcacatatagcatct 12528440  T
Q  533 atctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgccttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatcca 632  Q
    || ||||| |  |   |    | | | || ||||||||||||||||| || ||   ||||||||| ||||| | |||| |||  |||| | | || || |    
T  12528441 atgtcaattgtagcctctgtatcgtatgaaagtgtccttttcgccttctcgcagttagttctcaatctccttagggcttttgagttcccaataatgtcaa 12528540  T
Q  633 ctttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggcttttacttc 732  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || |||||    
T  12528541 ctttgttcttcctcttaaactctttcacaaagtgattcaccattcgattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtctccggcagtggccttgacttc 12528640  T
Q  733 aaagaca 739  Q
     ||||||    
T  12528641 gaagaca 12528647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 178 - 723
Target Start/End: Original strand, 28219500 - 28220045
Alignment:
Q  178 gataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagca 277  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||||| |  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28219500 gataccaagagacaaaggtgtaacatcttgcagcaccaacttcggaacttttttaaagccttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccataagca 28219599  T
Q  278 acagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttac-gcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgaca 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  || || || | ||| || ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  28219600 acagcctcatcagggttaatgctcttacacaattccttccc-tccaaaaaattcctgcagtagttgttgtacttttggaattctagaggagcctccaaca 28219698  T
Q  377 agaacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggtccatattgatttctt 476  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| || | |||    | ||| ||||||||| | |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  28219699 agaacaacatcgtgtacagccctcttgtccatattggcatcagtgagacacctctcaacagttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcct 28219798  T
Q  477 caaacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgc 576  Q
    |||||||  ||||||| | ||||| | |||| |||||| | ||  ||||| |||| | |||||| | || ||| |     ||||| ||||||||||| ||    
T  28219799 caaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgc 28219898  T
Q  577 cttttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacatt 676  Q
      | |  || |  |||||||||||||| ||||||||||  || | ||| || ||||| ||||||||| | ||||| || |   | |||||||||| |||     
T  28219899 tctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatc 28219998  T
Q  677 ctgttatcaaagtcctctccacctaggtgggtgtttccagcagtggc 723  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  28219999 ctactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagcggtggc 28220045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University