View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7584_high_4 (Length: 436)

Name: NF7584_high_4
Description: NF7584
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7584_high_4
NF7584_high_4
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (4-421)||(13910932-13911348)
chr6 (1-423)||(13931432-13931851)
chr6 (92-423)||(14046561-14046892)
chr6 (53-423)||(13875877-13876247)
chr6 (37-423)||(14083772-14084158)
chr6 (6-407)||(14024352-14024753)
chr6 (1-421)||(14109542-14109962)
chr6 (37-423)||(13473565-13473951)
chr6 (53-425)||(13893579-13893951)
chr6 (37-423)||(14014252-14014638)
chr6 (61-423)||(13863407-13863769)
chr6 (37-412)||(14021821-14022196)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 421
Target Start/End: Original strand, 13910932 - 13911348
Alignment:
Q  4 tgaaatataattatatatgagaggttaaaagcaaaagtattagtaccggttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13910932 tgaaatataattatatatgagaggttaaaagtaaa-gtattatcaccggttaatccttgagccaccatctgcatttcatgtaaatactatcccctaaatt 13911030  T
Q  104 gttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaagaacgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911031 gttcatgaatctgaaataagcatgtctccatgaacgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatg 13911130  T
Q  204 taaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911131 taaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcctgaatttcaactttcagtttatgttgtggctcctcttgagcacacaattttacaagtggtggac 13911230  T
Q  304 cacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13911231 cacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacaaatctaa 13911330  T
Q  404 cacactaagccggtctat 421  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  13911331 cacactaagacggtctat 13911348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 13931432 - 13931851
Alignment:
Q  1 atgtgaaatataattatatatgagaggttaaaagcaaaagtattagtaccggttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaa 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||| |  |||| ||||    
T  13931432 atgttaaatgtaagtatatatgagaggttaacagttaaagtattattaccagttaatcattgagccatcatctgcatttgacgtaaatattatccactaa 13931531  T
Q  101 attgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaagaacgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactg 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13931532 attgttcatgaacttgaaataagcatgtctccaagaacgcttgattaggattgaaccaaaaacgccccagaagcctataataaatccaaatgtcagactg 13931631  T
Q  201 atgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   |||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13931632 atgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcatcttgaacttc---ttttggatcatgtggtggctccccctgagtacacaattttacaagtggtg 13931728  T
Q  301 gaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13931729 gaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtagttgtgtactcgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatc 13931828  T
Q  401 taacacactaagccggtctattt 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  13931829 taacacactaagccagtctattt 13931851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 92 - 423
Target Start/End: Original strand, 14046561 - 14046892
Alignment:
Q  92 atcccctaaattgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaagaacgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaat 191  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14046561 atccactaaattgttcatgaacctgaaataagcatgtctccaagaacgcttgattaggattgagccaaagacaccccagaagcctataataaatccgaat 14046660  T
Q  192 gtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaatttta 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||| | ||| | | |||| |||||||    
T  14046661 gtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaacttctacttttggttcatgtggtggtttccctttaacacaaaatttta 14046760  T
Q  292 caagtggtggaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatg 391  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14046761 caaatggtggtccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgagggattgaaactttgtagttgtgtactcgttggaatcttgccagataattgattatg 14046860  T
Q  392 tgacagatctaacacactaagccggtctattt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14046861 tgacagatctaacacactaagccggtctattt 14046892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13876247 - 13875877
Alignment:
Q  53 ttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaattgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaagaacgcttgattaggatt 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13876247 ttaatctttgagccaccatctgcatttcacgtaaatatcatccactaaattgttcaagaacttgaaataagcatgtcgccaagaacgcttgattaggatt 13876148  T
Q  153 gagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttcaactt 252  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  13876147 gaaccaaatactccccaaaagcctataataaatccaaatgtcaggcttatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttttccat 13876048  T
Q  253 tcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtag 352  Q
    |  ||| ||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  13876047 ttggttcatgtggtggctcccctttgacgcacaagtttacaagtggtggtccacaaagatcaagattatcttcgtaatttgaggcattgaaactttgtag 13875948  T
Q  353 ttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaacacactaagccggtctattt 423  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13875947 ttgtgtactctttggaatctctccagataattggttatgtgacaaatctaacacaccaagccggtctattt 13875877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 14083772 - 14084158
Alignment:
Q  37 aaagtattagtaccggttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaattgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaaga 136  Q
    ||||||||| |||| ||||  || | ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||     
T  14083772 aaagtattattaccagttagcctctaagccaccttctgcatttcacgtaaatattatctgctaaattgttcatgaacttgaaataagcatgtctccaagt 14083871  T
Q  137 acgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcg 236  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14083872 gcgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccaaatatcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcagatcttcatcg 14083971  T
Q  237 tcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtgg 336  Q
     ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  14083972 ccttgaatttcaacttttggttcatgtggtggcttcccctgagcacacgattttacaagtggtggtccacaaagatcaagattatctttgtaacgtgagg 14084071  T
Q  337 cgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaacacactaagccggtctattt 423  Q
    | |  |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14084072 catcaaaactttgaagttgtgtactctttggaatttctcccgataattgattatgcgacaaatctaacacactaagccggtctattt 14084158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 407
Target Start/End: Original strand, 14024352 - 14024753
Alignment:
Q  6 aaatataattatatatgagaggttaaaagcaaaagtattagtaccggttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaattgt 105  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||    
T  14024352 aaatgtaagtatatatgagaggtctaaagttaaagtattattaccggttaatctttgagccaccatctgcatttcacgtaaatagcatccactaagttgt 14024451  T
Q  106 tcatgaatctgaaataagcatgtcttcaagaacgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgta 205  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14024452 tcatgaacttgaaataagcatgtctccaggaacgcttgattaggattgagccaaacactccccaaaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgta 14024551  T
Q  206 aaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggacca 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | || |||| | |||| ||| | | |||||| ||||||||||||  | |||    
T  14024552 aaatccacgattaagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttttaattttacttcatgtcgaggcttcccttcaacacacagttttacaagtggcagccca 14024651  T
Q  306 caaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaaca 405  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||  |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14024652 caaaggtcaagattatcttcataacatgaggaatcaaaactttgtagttgtgtactcgttggaatttctccagataattgattatgtgacaaatctagca 14024751  T
Q  406 ca 407  Q
    ||    
T  14024752 ca 14024753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 14109542 - 14109962
Alignment:
Q  1 atgtgaaatataattatatatgagaggttaaaagcaaaagtattagtaccggttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaa 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||  ||||||| | |||||||||| || |||| | |||||||||||||| |||||    |||| ||||    
T  14109542 atgttaaatgtaagtatatatgagatgtctaaagttaaagtataattaccggttaacctttgagtccccatctgcatttcacgtaaattgtatccactaa 14109641  T
Q  101 attgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaagaacgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactg 200  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14109642 gttgttcatgaacttgaaataagcatgtctccaagagcgcttgattaggattgagccaaacactccccaaaagcctataataaatccgaatgtcagactt 14109741  T
Q  201 atgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtg 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||  ||| ||| | ||| | ||| | | ||||||| ||||||||||||     
T  14109742 atgtaaaatcctcgattgagaagcaaatctttatcgtcttgaacttctgcttttggttcatgcgctggtttcccttcaacacacaactttacaagtggtt 14109841  T
Q  301 gaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatc 400  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14109842 gtccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgagggattgaaactttgtagttgtgtactcgttggaatttctccagataattgattatgtgacaaatc 14109941  T
Q  401 taacacactaagccggtctat 421  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  14109942 taacacacttagccggtctat 14109962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13473951 - 13473565
Alignment:
Q  37 aaagtattagtaccggttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaattgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaaga 136  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||| | |||||    ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||    
T  13473951 aaagtattattaccagttaatctttaagcccccatctgcatttgacgtaaattttatccattaaattgttcatgaacttgaaataagcatgtctccagga 13473852  T
Q  137 acgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcg 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13473851 acgcttgattaggattgatccaaatacaccccaaaagcctataataaatccaaatgtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcg 13473752  T
Q  237 tcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtgg 336  Q
    | ||||| ||| |||||  | | || |||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  13473751 ttttgaacttctacttttggatcatatggtggtttcccttcaacacacaattttacaagtggtggtccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgacg 13473652  T
Q  337 cgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaacacactaagccggtctattt 423  Q
      |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  13473651 gattgaaactttgtagttgtgtgctcaatggaatctctccagataattgattatgtgacaaatctaacacaccaagccgatctattt 13473565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 53 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13893951 - 13893579
Alignment:
Q  53 ttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaattgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaagaacgcttgattaggatt 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |  |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13893951 ttaatctttgagccaccatctgcatttgacgtaaatattatccactaaattgttcaagaacttgaaataagcatgtcgccaagaacgcttgattaggatt 13893852  T
Q  153 gagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttcaactt 252  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |    
T  13893851 gaaccaaatactccccaaaagcctataataaatccaaatgtcaggcttatgtaaaatcctcgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttttccat 13893752  T
Q  253 tcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtag 352  Q
    |  ||| ||| |||||| |  | | ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13893751 ttggttcatgcggtggcccatcttcagcgcacagttttacaagtggtgctccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgaggcattgaaactttgtag 13893652  T
Q  353 ttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaacacactaagccggtctattttg 425  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  13893651 ttgtgtactcgttggaatttctccagacaattgattatgtgacagatctaacacaccaatccgatctattttg 13893579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 423
Target Start/End: Original strand, 14014252 - 14014638
Alignment:
Q  37 aaagtattagtaccggttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaattgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaaga 136  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||    
T  14014252 aaagtattattaccagttagtctttgagctaccttctgcatttcacgtaaatattatcccataaattgttcatgaacttgaaataagcatgtcgccaaga 14014351  T
Q  137 acgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcg 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  14014352 acgcttgattaggattgaaccaaatactccccaaaagcctaaaataaatccaaatgtcaggcttatataaaatcctcgattccgaagcaaatcttcatcg 14014451  T
Q  237 tcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtgg 336  Q
    ||||||||||   ||||  |||  |||| |||||| || | | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14014452 tcttgaattttcccttttggttcttgtgatggctctccatcaacgcacaattttacaagtggtgctccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgagg 14014551  T
Q  337 cgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaacacactaagccggtctattt 423  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14014552 cattgaaactttgtagttgtgtactccttggaatttctcccgataattgattatgtgacaaatctaacacaccaagccggtgtattt 14014638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 61 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13863769 - 13863407
Alignment:
Q  61 tgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaattgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaagaacgcttgattaggattgagccaaa 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  13863769 tgagccaccatctgcacttcacgtaaacatcatccactaaattgttcaagaacttgaaataagcatgtctccaggagcgcttgattaggattgagccaaa 13863670  T
Q  161 tactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcgtcttgaatttcaactttcagttta 260  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||||| ||| |||||  | | |    
T  13863669 tacaccccagaagcctataataaatccaaatgtcagactgatgtaaaacccacgattgagaagccgttcgtcatcgtcttgaacttctacttttggatca 13863570  T
Q  261 tgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtggcgttgaaactttgtagttgtgtac 360  Q
    ||  |||| | | | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13863569 tgcagtggtttcactttaacacacaattttacaagtggtgggccacaaagatcaagattatcttcgtaaaatgaggcattgaaaccttgtagttgtgtac 13863470  T
Q  361 ttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaacacactaagccggtctattt 423  Q
    |  ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  13863469 tctttggaatttcaccagataattgattatgtgacacatctaacccaccaagccgatctattt 13863407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 412
Target Start/End: Original strand, 14021821 - 14022196
Alignment:
Q  37 aaagtattagtaccggttaatctatgagccaccatctgcatttcatgtaaagaccatcccctaaattgttcatgaatctgaaataagcatgtcttcaaga 136  Q
    ||||||| | |||| ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||    |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||| || ||    
T  14021821 aaagtataattaccagttaacctttgagcccccatctgcatttcacgtaaattgtatccactaagttgttcatgaacttgaaataagcatgtctccatga 14021920  T
Q  137 acgcttgattaggattgagccaaatactccccagaagcctataataaatccgaatgtcagactgatgtaaaatccacgattgagaagcaaatcttcatcg 236  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14021921 acgctatattaggattgagccaaacactccccaaaagcctataataaatccgaatgtcagacttatgtaaaatccacgattcagaagcaaatcttcatca 14022020  T
Q  237 tcttgaatttcaactttcagtttatgtggtggctccccctgagcacacaattttacaagtggtggaccacaaagatcaagattatcttcgtaacttgtgg 336  Q
    | ||||| |||  ||||  ||| ||| | ||  | ||| | | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14022021 tattgaacttctgcttttggttcatgcgctgatttcccttcaacacacaactttacaagcggtggtccacaaagatcaagattatcttcgtaacatgagg 14022120  T
Q  337 cgttgaaactttgtagttgtgtacttgttggaatctctccagataattgattatgtgacagatctaacacactaag 412  Q
      | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14022121 gatcgaaactttgtagctgtgtacacgttggaatctctccatataattgattatgtgacacatctaacacactaag 14022196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University