View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7589_low_5 (Length: 397)

Name: NF7589_low_5
Description: NF7589
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7589_low_5
NF7589_low_5
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (30-380)||(17450091-17450441)
chr2 (48-272)||(45726538-45726762)
chr2 (48-261)||(1632067-1632281)
chr2 (48-272)||(35447219-35447444)
chr2 (48-267)||(42288445-42288663)
chr2 (48-261)||(7450919-7451133)
chr2 (51-248)||(42261947-42262146)
chr2 (48-231)||(33647817-33648003)
chr2 (48-242)||(24397702-24397891)
chr2 (52-248)||(30218372-30218570)
chr2 (75-222)||(40935542-40935690)
chr2 (256-299)||(34682026-34682069)
chr2 (256-298)||(42269730-42269772)
chr2 (48-136)||(24197643-24197731)
chr2 (256-299)||(8040426-8040469)
chr2 (256-295)||(31056404-31056443)
chr2 (256-301)||(36773345-36773390)
chr2 (81-133)||(34811599-34811651)
chr2 (256-293)||(33162776-33162813)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (48-301)||(28074196-28074449)
chr3 (48-242)||(43402125-43402320)
chr3 (48-272)||(54593312-54593538)
chr3 (48-248)||(49199806-49200007)
chr3 (48-272)||(40912945-40913172)
chr3 (48-241)||(6095934-6096128)
chr3 (48-248)||(43404068-43404269)
chr3 (52-261)||(30235743-30235954)
chr3 (48-261)||(47303870-47304085)
chr3 (48-272)||(34490820-34491046)
chr3 (48-272)||(55302300-55302525)
chr3 (48-248)||(4569583-4569784)
chr3 (48-231)||(41819857-41820040)
chr3 (48-230)||(46860120-46860304)
chr3 (49-248)||(36018482-36018683)
chr3 (51-241)||(26323850-26324042)
chr3 (51-270)||(34795479-34795700)
chr3 (48-242)||(5434212-5434409)
chr3 (51-242)||(39127197-39127389)
chr3 (54-268)||(35139046-35139270)
chr3 (48-184)||(1683184-1683321)
chr3 (172-248)||(31340501-31340577)
chr3 (256-299)||(47649930-47649973)
chr3 (133-222)||(36796064-36796154)
chr3 (256-299)||(3715684-3715727)
chr3 (85-139)||(31340448-31340503)
chr3 (76-134)||(1737253-1737311)
chr3 (256-301)||(44700818-44700863)
chr3 (80-139)||(22859306-22859367)
chr3 (81-177)||(41509960-41510056)
chr3 (100-170)||(50432938-50433006)
chr3 (256-290)||(29196727-29196761)
chr3 (256-296)||(9666794-9666834)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (49-301)||(47255675-47255923)
chr1 (48-267)||(34602674-34602894)
chr1 (48-267)||(34603189-34603409)
chr1 (48-261)||(19754110-19754324)
chr1 (48-229)||(37167948-37168130)
chr1 (48-268)||(11348310-11348531)
chr1 (64-248)||(29135880-29136065)
chr1 (48-227)||(7482565-7482746)
chr1 (48-242)||(42298310-42298505)
chr1 (48-272)||(13547424-13547649)
chr1 (48-272)||(13549335-13549560)
chr1 (48-241)||(37033408-37033598)
chr1 (48-248)||(37879246-37879447)
chr1 (50-248)||(193244-193442)
chr1 (48-261)||(19752305-19752518)
chr1 (48-227)||(28242041-28242221)
chr1 (49-227)||(47114825-47115003)
chr1 (51-268)||(41135432-41135651)
chr1 (99-242)||(6808084-6808229)
chr1 (112-260)||(31928208-31928349)
chr1 (51-268)||(9109739-9109958)
chr1 (80-185)||(16216861-16216966)
chr1 (106-176)||(22079039-22079109)
chr1 (91-169)||(3331255-3331333)
chr1 (48-177)||(28318094-28318225)
chr1 (256-301)||(45644682-45644727)
chr1 (256-301)||(50167515-50167560)
chr1 (256-301)||(50169537-50169582)
chr1 (48-100)||(31926041-31926093)
chr1 (52-177)||(6068321-6068447)
chr1 (256-297)||(19073289-19073330)
chr1 (256-297)||(19121179-19121220)
chr1 (260-301)||(28265898-28265939)
chr1 (256-292)||(47703636-47703672)
chr1 (256-295)||(40816514-40816553)
chr1 (80-122)||(12318848-12318890)
chr1 (80-141)||(38747084-38747144)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (48-299)||(22269555-22269806)
chr7 (48-261)||(4512725-4512938)
chr7 (66-272)||(32358189-32358396)
chr7 (48-261)||(6431590-6431804)
chr7 (48-261)||(34311051-34311266)
chr7 (48-231)||(29608390-29608569)
chr7 (48-248)||(2361306-2361507)
chr7 (48-228)||(2389934-2390115)
chr7 (48-267)||(3258608-3258829)
chr7 (48-261)||(4509041-4509246)
chr7 (48-261)||(4510883-4511088)
chr7 (48-248)||(6360247-6360448)
chr7 (48-242)||(48599669-48599854)
chr7 (48-231)||(22328733-22328919)
chr7 (80-222)||(5116292-5116435)
chr7 (140-248)||(30814397-30814505)
chr7 (80-172)||(22552806-22552897)
chr7 (48-103)||(8359653-8359708)
chr7 (256-301)||(8153126-8153171)
chr7 (256-297)||(12098199-12098240)
chr7 (256-301)||(41317774-41317819)
chr7 (256-300)||(36146749-36146793)
chr7 (114-184)||(37545308-37545379)
chr7 (258-299)||(24526225-24526266)
chr7 (256-299)||(29160167-29160207)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (48-301)||(28277892-28278149)
chr5 (48-259)||(40146882-40147094)
chr5 (48-297)||(16642213-16642462)
chr5 (48-261)||(213087-213302)
chr5 (48-242)||(38746643-38746838)
chr5 (48-229)||(27015183-27015365)
chr5 (48-272)||(5057657-5057880)
chr5 (48-267)||(27637951-27638169)
chr5 (51-268)||(316371-316596)
chr5 (51-265)||(35615786-35616002)
chr5 (48-268)||(30802553-30802774)
chr5 (48-260)||(30792860-30793072)
chr5 (48-242)||(10055041-10055237)
chr5 (51-268)||(14689747-14689963)
chr5 (51-175)||(33906366-33906491)
chr5 (57-263)||(4160251-4160458)
chr5 (159-268)||(33906578-33906687)
chr5 (256-295)||(10282111-10282150)
chr5 (48-136)||(21205987-21206076)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (48-272)||(26363873-26364098)
chr4 (48-268)||(27417286-27417507)
chr4 (52-261)||(8665025-8665236)
chr4 (48-272)||(46569881-46570106)
chr4 (48-248)||(40630616-40630817)
chr4 (48-242)||(54882658-54882853)
chr4 (48-248)||(2209340-2209541)
chr4 (48-248)||(6655588-6655789)
chr4 (48-248)||(50263033-50263234)
chr4 (56-267)||(46703114-46703326)
chr4 (48-248)||(55085700-55085902)
chr4 (48-248)||(50674181-50674382)
chr4 (48-267)||(12073005-12073225)
chr4 (48-267)||(41964029-41964248)
chr4 (49-228)||(35662094-35662274)
chr4 (100-261)||(8653218-8653380)
chr4 (48-230)||(379028-379212)
chr4 (48-241)||(33989501-33989695)
chr4 (90-261)||(10071503-10071676)
chr4 (51-222)||(38811417-38811589)
chr4 (80-268)||(3785702-3785891)
chr4 (100-268)||(22883140-22883309)
chr4 (100-268)||(22934804-22934973)
chr4 (81-231)||(35370705-35370857)
chr4 (52-157)||(8647861-8647967)
chr4 (87-188)||(10071963-10072065)
chr4 (81-248)||(35369807-35369971)
chr4 (64-196)||(33089583-33089716)
chr4 (81-242)||(26699814-26699978)
chr4 (75-231)||(47514864-47515021)
chr4 (51-248)||(25723554-25723752)
chr4 (125-227)||(32091222-32091326)
chr4 (82-177)||(6719289-6719384)
chr4 (48-222)||(22629223-22629399)
chr4 (256-299)||(3793774-3793817)
chr4 (48-178)||(34112314-34112445)
chr4 (256-301)||(45687523-45687568)
chr4 (256-301)||(46147682-46147727)
chr4 (256-301)||(52467681-52467726)
chr4 (51-139)||(12119281-12119369)
chr4 (51-177)||(41961110-41961237)
chr4 (256-299)||(36463728-36463771)
chr4 (233-272)||(41639173-41639212)
chr4 (80-167)||(43135813-43135899)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (51-272)||(11383594-11383816)
chr8 (49-248)||(42435327-42435527)
chr8 (30-272)||(22976142-22976383)
chr8 (48-261)||(44353414-44353625)
chr8 (30-268)||(2999838-3000078)
chr8 (95-248)||(4283178-4283331)
chr8 (48-248)||(40221376-40221578)
chr8 (48-183)||(40328476-40328612)
chr8 (107-241)||(20686452-20686586)
chr8 (48-215)||(3846153-3846321)
chr8 (102-268)||(40585336-40585503)
chr8 (51-218)||(3817670-3817840)
chr8 (48-222)||(11136798-11136974)
chr8 (80-194)||(40535538-40535651)
chr8 (91-170)||(10020150-10020229)
chr8 (256-298)||(6127583-6127625)
chr8 (256-298)||(26402923-26402965)
chr8 (256-301)||(18141617-18141662)
chr8 (256-299)||(9765547-9765590)
chr8 (80-165)||(10101527-10101612)
chr8 (256-301)||(5689067-5689112)
chr8 (51-184)||(9633875-9634007)
chr8 (186-268)||(10239700-10239782)
chr8 (67-136)||(28461305-28461375)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (48-248)||(6960-7161)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (48-248)||(3809043-3809245)
chr6 (49-267)||(2973275-2973495)
chr6 (48-267)||(5043241-5043460)
chr6 (48-272)||(17762595-17762822)
chr6 (48-270)||(21593276-21593499)
chr6 (30-268)||(26830442-26830680)
chr6 (37-242)||(22425150-22425356)
chr6 (48-212)||(26800438-26800603)
chr6 (48-182)||(603415-603550)
chr6 (51-242)||(25072823-25073015)
chr6 (48-173)||(17757789-17757917)
chr6 (256-298)||(3039241-3039283)
chr6 (208-249)||(26661580-26661621)
chr6 (208-249)||(26767551-26767592)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (48-248)||(11190-11391)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (48-242)||(80618-80813)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (67-261)||(18354-18549)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (51-248)||(490782-490981)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (67-268)||(1759-1962)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (256-299)||(11091-11134)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (256-295)||(5655-5694)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17450441 - 17450091
Alignment:
Q  30 tcacaattgactc-ttcgcctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaag 128  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17450441 tcacaattgactccttcgc-tcatgtgtttcccatccccatgaatctttcacaaagggcaccaaccctttcccaagagccccctcttttggttctccaag 17450343  T
Q  129 attcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17450342 attcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattctctaag 17450243  T
Q  229 cttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagcaccacatccttcatcatcttctcaaca 328  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17450242 tttgcccaacaaatgggtcatgaagtgcttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagcaccacatccttcatcatcttctcaaca 17450143  T
Q  329 aaaccaatggaaataaagactgtaccgaattgagcggtaaaggtagtgcggg 380  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17450142 aaacccatggaaagaaagactgtaccgaattgagcattaaaggtagtgcggg 17450091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45726762 - 45726538
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726762 ctcatgtgtttccaaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 45726663  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtc 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  45726662 gaacctcacccaaagactctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtc 45726563  T
Q  248 atgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||    
T  45726562 atggagtgcttacatagtgttcaga 45726538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 1632067 - 1632281
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1632067 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagacaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttccccaagattcacatcttgaagctt 1632166  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1632167 tgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacacaacaaataggt 1632266  T
Q  247 catgaagtgcttaaa 261  Q
    |||| ||||||||||    
T  1632267 catggagtgcttaaa 1632281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Original strand, 35447219 - 35447444
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctc-caagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35447219 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccc-ctcttttggttctctcaagactcacatcttgaagct 35447317  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  35447318 ttgaacctcacacaaatactctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatggg 35447417  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35447418 tcatggagtgcttacatagtgttcaga 35447444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Original strand, 42288445 - 42288663
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  42288445 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttcc-caaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagttt 42288543  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||||    ||||||| |||    
T  42288544 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcatttggtttccatgagattcacctagctt-tttaacaaatgggt 42288642  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  42288643 catagagtgcttaaatagtgt 42288663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7451133 - 7450919
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaa-gagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7451133 ctcatgtgttttccaaccccataaatcttctccaaaagtcatcaaccctttaccaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcctgaagctt 7451034  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaac-aaatagg 245  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||    
T  7451033 tgaacctcacccaaagacgc-caacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctccttttgtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaaatggg 7450935  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaa 261  Q
    ||||| ||||||||||    
T  7450934 tcatggagtgcttaaa 7450919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 42261947 - 42262146
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatcttccaca-aaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||  ||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42261947 atgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctccaaagagcccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 42262046  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  42262047 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctcatgagattcaccaagcttgctcaacaaatgggtca 42262146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33648003 - 33647817
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||| ||||| ||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33648003 ctcatatgttttccaacctcgtgaatctctcctcaaaaggcaccaacccttttcccaagagcctcctcttttgattctccaagattcacatcttgaaact 33647904  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagctt 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  33647903 ttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaatactctaaaagttctctcctttggtttccatgaaattcaccaagctt 33647817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24397891 - 24397702
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24397891 ctcatgtgtttaccagcccgatgagtctctccctaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagct 24397792  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  24397791 ttgaacctcacacaaagaccgtcaacctttagtatctaaataccctaaaag--------tttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaat 24397702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 248
Target Start/End: Original strand, 30218372 - 30218570
Alignment:
Q  52 tgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| || | |||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  30218372 tgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaaggcactaactctctcccataagccctcatttttggttgtccaagattcacattttgatgttttgaa 30218471  T
Q  151 cctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  30218472 cctcacccaaagaccctcaacatatagtatctaaataccctaaaagttccctcctttgagttccataatattcaccaagattacccaacgaataggtca 30218570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 40935542 - 40935690
Alignment:
Q  75 ttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctt 174  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  40935542 ttccccaataggcaccaaccctttcccaagagcctcatcttttggttctcctagattcacatttggacactttgaatctctcccaaaggccctcaacctt 40935641  T
Q  175 tagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattc 222  Q
    |||| |||||   ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  40935642 tagtttctaagttccctaaacggtctctcctttggtttccatgagattc 40935690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34682069 - 34682026
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34682069 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 34682026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 42269730 - 42269772
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcg 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42269730 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacgtttcg 42269772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24197731 - 24197643
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacat 136  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  24197731 ctcatgtgtttcccatccc-atcattccctccccaaaaggcaccaaccctctcccaagagtcccctcttttggttccccaagattcacat 24197643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Original strand, 8040426 - 8040469
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8040426 cttaaatagtgttcaggaatacacagcatcgtgccacgtttcga 8040469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 295
Target Start/End: Original strand, 31056404 - 31056443
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31056404 cttaaatagtgttcagaaatacgcaacatcgtgccacgtt 31056443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36773390 - 36773345
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36773390 cttaaatagtgttcaggaatacgcgacatcgtgccacgtttcgagc 36773345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Original strand, 34811599 - 34811651
Alignment:
Q  81 aaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattca 133  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34811599 aaaaggcaccaacctttttccaaaaaccccctcttttggttctctaagattca 34811651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 293
Target Start/End: Original strand, 33162776 - 33162813
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacg 293  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33162776 cttaaatagtgttcaggaatatgcagcatcgtgccacg 33162813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 48 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28074449 - 28074196
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28074449 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccccaaaacgcaccaactatttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaacttt 28074350  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  28074349 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtc 28074250  T
Q  248 atgaagtgcttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28074249 atgaagtgcttaaatagagttcaggaaaacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 28074196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 43402125 - 43402320
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402125 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 43402224  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  43402225 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccataagattcaccaagctcacccaacaaat 43402320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54593538 - 54593312
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54593538 ctcatgtgttttccatccccatgaatcttccccaaaaggtaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 54593439  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||    
T  54593438 tgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttcgaacaaatggg 54593339  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54593338 tcatggagtgcttacatagtgttcaga 54593312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 49199806 - 49200007
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49199806 ctcatatgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactt 49199905  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  49199906 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 49200005  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  49200006 ca 49200007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40913172 - 40912945
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaa-ggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40913172 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagct 40913073  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagc-ttgcccaacaaatag 244  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |    
T  40913072 ttgaacctcacccaaagaccctaaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttacccaacaaatgg 40912973  T
Q  245 gtcatgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    ||||   | |||||| ||||||||||||    
T  40912972 gtcaaagaatgcttacatagtgttcaga 40912945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 6095934 - 6096128
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaa-gagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095934 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcaaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 6096033  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6096034 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctctgatttccatgagattcaccaagctttcccaacaaa 6096128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 43404068 - 43404269
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43404068 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactt 43404167  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||    
T  43404168 tgaacctcacccaaagaccctcaacttttagtatctaaaaccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagctcacccaacaaatgggt 43404267  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  43404268 ca 43404269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30235954 - 30235743
Alignment:
Q  52 tgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30235954 tgtgttttccaaccccatgaatattccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 30235855  T
Q  151 cctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaac-aaataggtcat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||    
T  30235854 cctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttcattgagattcaccaagcttacccaacaaaatgggtcat 30235755  T
Q  250 gaagtgcttaaa 261  Q
    | ||||||||||    
T  30235754 ggagtgcttaaa 30235743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47304085 - 47303870
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47304085 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 47303986  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaac-aaatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||    
T  47303985 tgaacctcacccaaagaccttcaacatttagtatctaaaaccataaaagttctctcctttgatttccatgagattcaccaagcttacccaacaaaatggg 47303886  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaa 261  Q
    || || ||||||||||    
T  47303885 tcgtggagtgcttaaa 47303870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34491046 - 34490820
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491046 ctcatgtgtttttcaactccatgaatcttctccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 34490947  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaa-caaatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||| ||    
T  34490946 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctttcacaataaaatggg 34490847  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  34490846 tgatggagtgcttatatagtgttcaga 34490820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Original strand, 55302300 - 55302525
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55302300 ctcatgtgttttccaacctcatgaatttttcccaaaaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 55302399  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  55302400 tgaacctcatccaaagaccctcaacttttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttcaatgaaattcaccaagcttacccaacaaatgggt 55302499  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  55302500 catggagtgcttacatagtgttcaga 55302525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4569784 - 4569583
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4569784 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaataggcacacccccttttcccaagagccccctcttttgattctccaagatttacatcttgaagctt 4569685  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||    
T  4569684 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggt 4569585  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  4569584 ca 4569583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 41819857 - 41820040
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41819857 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttcc-caaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctt 41819955  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagctt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41819956 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaacctaaaagttatctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 41820040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46860304 - 46860120
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46860304 ctcatgtgtttcccatccctatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctt 46860205  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagct 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46860204 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttctctcatttggtttccatgagattcaccaagct 46860120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36018683 - 36018482
Alignment:
Q  49 tcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018683 tcatgtgtttcccatccccatggatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 36018584  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  36018583 gaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctgaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttatccaacaaatgggt 36018484  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  36018483 ca 36018482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 241
Target Start/End: Original strand, 26323850 - 26324042
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | |  |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26323850 atgtgtttctcaaccccatgaatctctgctgaaaatgcaccaaccctttcccaatagccctctcttttgattcttcaagatttacatcttgaagctttga 26323949  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaa 241  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  26323950 acttcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaatatcttaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaaacttactcaacaaa 26324042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34795700 - 34795479
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  || ||| | || ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34795700 atgtgtatcccaaccccatgaatctctcctcaaaaggcatgaaacctctccctagaaccccctcttctggttctccaagattcagatcttgaagctttga 34795601  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||| |||  ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  34795600 acatcacccaacgaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagatctctcctttggttttcataggattcaccaaacttacccaacaaataagtca 34795501  T
Q  249 tgaagtgcttaaatagtgttca 270  Q
    |  |||||||| ||| ||||||    
T  34795500 tagagtgcttatatactgttca 34795479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 5434212 - 5434409
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  5434212 ctcatgtgtttcctaaccccatgaatctctccctaaaaaacactaacccttttcccaagagccccctcttttggttctataagatttacatcttgaagct 5434311  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    || |||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  5434312 ttaaacctccctcaaagacccttaacttttggtatctaaatatcctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagcttactcaacaaat 5434409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39127389 - 39127197
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||| || || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39127389 atgtgtttcccaacctcatgaatctctcccaaaaaggcaccaactctcttccaagagtcccctattttagttctctaagattcatatcttgaagctttga 39127290  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  39127289 acctca-ccaaaggccccaaacctttagtatgtaaataccctaaaagttctctccgttgatttccatgagattcactaagcttactcaacaaat 39127197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Original strand, 35139046 - 35139270
Alignment:
Q  54 tgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccc-tctcttttggttctccaagattcacatcttg-------aagc 144  Q
    ||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||        |||     
T  35139046 tgttttccaacctcatgaatctctcctcaaaaggcatcaaccctttccgaagaacccatttcttttggttctccaagattcacatcttacatcttaaagt 35139145  T
Q  145 tttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaata 243  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||     
T  35139146 tttgaacctcatctaaagaccctcaacgtttagtatctaaatacccaaaaagtaccctcctttggtttccatgaaattcaccaagcttacttaacaaatg 35139245  T
Q  244 ggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    |||||   |||| ||||||||||||    
T  35139246 ggtcaaagagtgtttaaatagtgtt 35139270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1683321 - 1683184
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagc-t 145  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  1683321 ctcatgtgttttccaaccccatgaatctcttcccaaaatgcaccaaccctttccgaaaaaccttctcttttggttctccaagattcacat-ttgaaacat 1683223  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1683222 ttgaatctcacccaaagaccctcaacctttagtttctaa 1683184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 248
Target Start/End: Original strand, 31340501 - 31340577
Alignment:
Q  172 ctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  31340501 ctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccataagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 31340577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Original strand, 47649930 - 47649973
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47649930 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 47649973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36796154 - 36796064
Alignment:
Q  133 acatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  36796154 acatcttgaagctttgaacctcatctaaagaccttcaacctttagtttctaagttccctaaaagttatctcctttgatttccatgagattc 36796064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3715727 - 3715684
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3715727 cttaaatagtgttcagaaatacgcagtatcgtgccacgtttcga 3715684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 139
Target Start/End: Original strand, 31340448 - 31340503
Alignment:
Q  85 ggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatctt 139  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340448 ggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatctt 31340503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 134
Target Start/End: Original strand, 1737253 - 1737311
Alignment:
Q  76 tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcac 134  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  1737253 tccacaaaagacacgaacccttttccaagagtccgctcttttggttccccaagattcac 1737311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 44700818 - 44700863
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44700818 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcatgccacgtttcgagc 44700863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22859367 - 22859306
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagag--ccctctcttttggttctccaagattcacatctt 139  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22859367 caaaaggcaccaaccatttttcaagagtcccctctcttttacttctccaagattcacatctt 22859306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41510056 - 41509960
Alignment:
Q  81 aaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 177  Q
    ||||||||  |||||||| | || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  41510056 aaaaggcattaaccctttcctaaaagctctcttttttggttttccaatattcacatcttgaccatttgaatctcatctaaagacccttaacctttag 41509960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Original strand, 50432938 - 50433006
Alignment:
Q  100 ccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaa 170  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50432938 ccaatagccccctcttttggttc--caagattcacctcttgaccctttgaatctcactcaaagaccctcaa 50433006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 290
Target Start/End: Original strand, 29196727 - 29196761
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgcc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29196727 cttaaatagtgttcagaaatacgtagcatcgtgcc 29196761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Original strand, 9666794 - 9666834
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgttt 296  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  9666794 cttaaatagtgttcacgaatacgcaacatcgtgccacgttt 9666834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 49 - 301
Target Start/End: Original strand, 47255675 - 47255923
Alignment:
Q  49 tcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttg 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255675 tcatgtgtttcccaaccc-atgaatcttccccaaaaggcaccat---tttcccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttg 47255770  T
Q  149 aacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  47255771 aacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 47255870  T
Q  249 tgaagtgcttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47255871 tgaagtgcttaaatagtgttcagaaaaacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 47255923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Original strand, 34602674 - 34602894
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaaccctttt-ccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34602674 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttaccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 34602773  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  34602774 tgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaatgggt 34602873  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  34602874 catagagtgcttaaatagtgt 34602894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34603409 - 34603189
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603409 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 34603310  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  34603309 tgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaatgggt 34603210  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  34603209 catagagtgcttaaatagtgt 34603189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19754324 - 19754110
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||    
T  19754324 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctcttggttttccaagattcaaatcatggtgctt 19754225  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  19754224 tgaacctcacccaaagacccttaacctttagtatctagaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 19754125  T
Q  247 catgaagtgcttaaa 261  Q
    |||| ||||||||||    
T  19754124 catggagtgcttaaa 19754110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37168130 - 37167948
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168130 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 37168031  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37168030 tgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaactgtaaaagttccctcctttgatttccatgagattccccaagc 37167948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11348531 - 11348310
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11348531 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccagaccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactt 11348432  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||    
T  11348431 tgaacctcacccaaagaccctcaacccttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattcactaagcttacccaacaaatgggt 11348332  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    |||| ||| |||| ||||||||    
T  11348331 catggagtacttatatagtgtt 11348310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 64 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29136065 - 29135880
Alignment:
Q  64 ccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaag 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29136065 ccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaag 29135966  T
Q  163 accctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  29135965 accctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggtca 29135880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Original strand, 7482565 - 7482746
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctc-tcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7482565 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 7482664  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7482665 ttgaacctcacccaaagaccctcaaccgttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaa 7482746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 42298310 - 42298505
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298310 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 42298409  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  42298410 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcatcctttggttgttatgggattcaccaagcttacccaacaaat 42298505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Original strand, 13547424 - 13547649
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13547424 ctcatgtgttttccaaccccatgaattttcctcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctt 13547523  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  13547524 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccaaacaaatgggt 13547623  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    ||  || ||| ||  |||||||||||    
T  13547624 caaaaaatgcatatgtagtgttcaga 13547649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Original strand, 13549335 - 13549560
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13549335 ctcatgtgttttccaaccccatgaattttcctcaaaaggcaccgacccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctt 13549434  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    
T  13549435 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccaaacaaatgggt 13549534  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    ||  || ||| ||  |||||||||||    
T  13549535 caaaaaatgcatatgtagtgttcaga 13549560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 37033408 - 37033598
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033408 ctcatgtgtttcccaacctcatgaatcttcctcaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 37033507  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  37033508 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttag----taaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcacccagcttactcaacaaa 37033598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 37879246 - 37879447
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879246 ctcatgtgtttcccaaccccatgaattttccccaaaaggcaccaacctttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctt 37879345  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  37879346 tgaacctcacccaaagatcctcaacatttagtatctaaaaccctaacagttccttcctttgatttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 37879445  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  37879446 ca 37879447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 193442 - 193244
Alignment:
Q  50 catgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttg 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  193442 catgtgtttcccaaccccatgaatcttcc-caaaaggcaccaaccttttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttg 193344  T
Q  149 aacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  193343 aacctcaccgaaagaccctcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttatctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 193244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19752518 - 19752305
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||     
T  19752518 ctcatgtgtttcccaactcaatgaatcttccccaaaaggcaccaaccttttcataagagccccatcttttggttctccaagattcacattatgacgctta 19752419  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtc 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19752418 gaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaaaccctaaaaattccctcatttggttttcatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtc 19752319  T
Q  248 atgaagtgcttaaa 261  Q
    ||| ||||||||||    
T  19752318 atggagtgcttaaa 19752305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28242221 - 28242041
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28242221 ctcatgtgtttcccaaccttatgaatcttcc-caaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctt 28242123  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28242122 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaa 28242041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47115003 - 47114825
Alignment:
Q  49 tcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47115003 tcatgtgtttcccaaccccatgaatcttcc-caaaaggtaccaaccctgttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacagcttgaagcttt 47114905  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47114904 gaacctcacccaaagaccctcaatctttaatatctaaagccttaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaa 47114825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41135651 - 41135432
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||| | |   |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41135651 atgtgtttcccaaccccatgaatctctccctaaaaggcaccaaccctctcccaaaatcttcctcttttggttctccaagatccacatcttgaaggtttga 41135552  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||| |||||    
T  41135551 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaatacattaaaatttccctcctttggtttccatgagattaaccaagcttattcaacaaatgggtca 41135452  T
Q  249 tgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
     | || ||||||||||||||    
T  41135451 agcagcgcttaaatagtgtt 41135432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6808229 - 6808084
Alignment:
Q  99 tccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaga-ccctcaacctttagtatct-aaaaccctaaaagt 196  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  6808229 tccaagagcccaatcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacctaaagacccctcaacctttagtatctaaaaaatctaaaagt 6808130  T
Q  197 cccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  6808129 ttcctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaat 6808084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 260
Target Start/End: Original strand, 31928208 - 31928349
Alignment:
Q  112 tcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggttt 211  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||    
T  31928208 tcttttggttttctaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagactctcaacctttagtat--------ctaaaagttccctcctttggttt 31928299  T
Q  212 ccatgagattccccaagcttgcccaa-caaataggtcatgaagtgcttaa 260  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  31928300 ccatgaaattcaccaagcttacccaatcaaatgggtcatggagtgcttaa 31928349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 9109739 - 9109958
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||| || ||||||| | ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9109739 atgtgtctcccaacctcatgaatctctccccaaaagacatcaaccctctcccatgagtccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagttttga 9109838  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||| ||||||  | || |||| ||||||||| |||| ||||| |  | ||| |||| |||||    
T  9109839 acctcacccaaataccctcaacctttagtatttatataccccaaaagtttcatcatttgatttccatgacattcaccaagttgtctcaataaatgggtca 9109938  T
Q  249 tgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
     | | |||||||||||||||    
T  9109939 aggattgcttaaatagtgtt 9109958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 185
Target Start/End: Original strand, 16216861 - 16216966
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 179  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||     
T  16216861 caaaatgcaccaacccttttcgaagagccccctcttttggttcttcaagatatacatcttgaacctttgaatatcacccaaagacccttaacctttagtt 16216960  T
Q  180 tctaaa 185  Q
    ||||||    
T  16216961 tctaaa 16216966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22079109 - 22079039
Alignment:
Q  106 gccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttta 176  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22079109 gccccctcttttggttctttaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaacttta 22079039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3331333 - 3331255
Alignment:
Q  91 aacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctca 169  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| || |||||| |||||||||||    
T  3331333 aaccctttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgatcatttaaatctcacctaaagaccctca 3331255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 177
Target Start/End: Original strand, 28318094 - 28318225
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccc-tctcttttggttctccaagattcacatcttga-agc 144  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  28318094 ctcatatgtttctcatccc-atgaatctctccccaaaatgcactaaccctttcccaagaacccctctcttttggttatccaaaattcacatcttgacccc 28318192  T
Q  145 tttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 177  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  28318193 tttgaaactcatccaaagatcctcaacttttag 28318225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 45644682 - 45644727
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45644682 cttaaatagtgttcaggaatacgcaacatcgtgccacgtttcgagc 45644727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 50167515 - 50167560
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50167515 cttaaatagtgttcaggaatacgaagcatcgtgccacgtttcgagc 50167560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 50169537 - 50169582
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50169537 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacgttttgagc 50169582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 100
Target Start/End: Original strand, 31926041 - 31926093
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31926041 ctcacgtgtttcccaaacccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttc 31926093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6068447 - 6068321
Alignment:
Q  52 tgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 150  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| | | |||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||| |   ||||||    
T  6068447 tgtgtttcccaaccttatgaatctcttcccaaaagacaccaaccttttcctaagagccccctcttttggttcccttagattcacgtcttcatcatttgaa 6068348  T
Q  151 cctcacccaaagaccctcaacctttag 177  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||    
T  6068347 tctcatccaaagaccctcaacttttag 6068321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 297
Target Start/End: Original strand, 19073289 - 19073330
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttc 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19073289 cttaaatagtgttcaggaatacgcaacatcgtgccacgtttc 19073330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 297
Target Start/End: Original strand, 19121179 - 19121220
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttc 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19121179 cttaaatagtgttcaggaatacgcaacatcgtgccacgtttc 19121220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Original strand, 28265898 - 28265939
Alignment:
Q  260 aatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28265898 aatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacgttttgagc 28265939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47703672 - 47703636
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccac 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47703672 cttaaatagtgttcagaaatacgcaacatcgtgccac 47703636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40816553 - 40816514
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtt 295  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40816553 cttaaatagtgatcaggaatacgcagcatcgtgccacgtt 40816514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 122
Target Start/End: Original strand, 12318848 - 12318890
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttc 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  12318848 caaaaggcaccaaccctctcccaagagccctctcatttggttc 12318890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Original strand, 38747084 - 38747144
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttga 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| || |||||||| |||||||    
T  38747084 caaaaggcaccaaccctttttcaagagccc-ccgttttggttgtctaagattcatatcttga 38747144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 48 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22269806 - 22269555
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22269806 ctcatgtgtttcccctccccatgaatcttccccaaaaggcaccaactctttcccaagagccc-ctcttttggttctccaagattcacatcttgtagcttt 22269708  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22269707 gaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatctacataccctaaatgttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggt 22269608  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  22269607 catgaagtgcttaaatagtgttcaggaaaacgcaacatcgtgccacgtttcga 22269555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 4512725 - 4512938
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4512725 ctcatgtgtttccaaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagcttt 4512824  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||    
T  4512825 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagaatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccattaaatgggtc 4512924  T
Q  248 atgaagtgcttaaa 261  Q
    ||| ||||||||||    
T  4512925 atggagtgcttaaa 4512938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 272
Target Start/End: Original strand, 32358189 - 32358396
Alignment:
Q  66 ccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 164  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358189 ccatgaattttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 32358288  T
Q  165 cctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  32358289 cctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttttcaacaaatgggtcatggagtgcttacatag 32358388  T
Q  265 tgttcaga 272  Q
    ||||||||    
T  32358389 tgttcaga 32358396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6431804 - 6431590
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6431804 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttt 6431705  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  6431704 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttctatgagattcaccaagcttacccaataaatgggt 6431605  T
Q  247 catgaagtgcttaaa 261  Q
    |||| || |||||||    
T  6431604 catggagcgcttaaa 6431590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 34311051 - 34311266
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34311051 ctcatgtgttttccatccccatgaaccttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 34311150  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  34311151 tgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccttcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaaaaaattgg 34311250  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaa 261  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  34311251 tcatggagtacttaaa 34311266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29608569 - 29608390
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29608569 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatc-----caaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttt 29608475  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagctt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29608474 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 29608390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 2361306 - 2361507
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |    
T  2361306 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcatccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttgattcttcaagattcacatcttgaaggat 2361405  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  2361406 tgaatctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaatcctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcactaagcttgcccaacaaatgggt 2361505  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  2361506 ca 2361507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2390115 - 2389934
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2390115 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaagccaccaacccttttcgcaatagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagctt 2390016  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2390015 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaag 2389934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3258829 - 3258608
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3258829 ctcatatgtttcccatccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccatctttttgttctccaagattcacatcatgaagctt 3258730  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   || ||||| ||    
T  3258729 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctctggtttccatgagattcaccaagttttttcaccaaatggg 3258630  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  3258629 tcatagagtgcttaaatagtgt 3258608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 4509041 - 4509246
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  4509041 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttcccaagagctccctcttttggttctc--------acatcttgaagcttt 4509132  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  4509133 gaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattaaccaagcttacccaacaaatgggtc 4509232  T
Q  248 atgaagtgcttaaa 261  Q
    ||  ||||||||||    
T  4509233 atagagtgcttaaa 4509246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 4510883 - 4511088
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  4510883 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttcccaagagctccctcttttggttctc--------acatcttgaagcttt 4510974  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtc 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  4510975 gaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattaaccaagcttacccaacaaatgggtc 4511074  T
Q  248 atgaagtgcttaaa 261  Q
    ||  ||||||||||    
T  4511075 atagagtgcttaaa 4511088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 6360247 - 6360448
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6360247 ctcatgtgtttttcaactccatgaatcttcttcaaaaggcaccattccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactt 6360346  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  6360347 ttaacctcacccaaagaccctcaacctttaatatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 6360446  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  6360447 ca 6360448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 48599669 - 48599854
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||          ||||||||||||||    
T  48599669 ctcatgttttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttc----------acatcttgaagctt 48599758  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  48599759 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaat 48599854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 22328733 - 22328919
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22328733 ctcatgtttttcccaaccctatgaatctctccccaaaaggcaccaactcttttcctaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagct 22328832  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagctt 231  Q
    || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22328833 tttaacctccaccaaagatcctcaacctttagtatctaaataccctaaaagttttctcctttggtttccatgagattcactaagctt 22328919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5116435 - 5116292
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 179  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5116435 caaaaggcaccgaccctctcccaagagccccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagttttgaacatcacctaaagaccctcaacctttagta 5116336  T
Q  180 tctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattc 222  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5116335 tttaaataccctaaaagtcccctcctttggtatccatgagattc 5116292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30814505 - 30814397
Alignment:
Q  140 gaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaaca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30814505 gaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttaagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaaca 30814406  T
Q  240 aataggtca 248  Q
    ||| |||||    
T  30814405 aatgggtca 30814397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 22552806 - 22552897
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacc 172  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  22552806 caaaaggcaccaaccgttt-ccaagagccccctcttttggttctctaagattcacattttgaccctttaaatctcacccaaagaccctcaacc 22552897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 103
Target Start/End: Original strand, 8359653 - 8359708
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaa 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  8359653 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttcccaa 8359708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8153171 - 8153126
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8153171 cttaaatagtgttcaggaatacgcaacatcgtgccacgtttcgagc 8153126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 297
Target Start/End: Original strand, 12098199 - 12098240
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12098199 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgcgccacgtttc 12098240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 41317774 - 41317819
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  41317774 cttaaatagtgttcaggtatccgcagcatcgtgccacgtttcgagc 41317819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Original strand, 36146749 - 36146793
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgag 300  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36146749 cttaaataatgttcaggaatatgcagcatcgtgccacgtttcgag 36146793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 37545308 - 37545379
Alignment:
Q  114 ttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaga-ccctcaacctttagtatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||||| | |||||| |||||| |||||    
T  37545308 ttttggttctccaagattcacatcttaaacctttgaatcttatccaaagatctctcaacttttagtctctaa 37545379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 299
Target Start/End: Original strand, 24526225 - 24526266
Alignment:
Q  258 taaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  24526225 taaatagtgttcaggaatacgcaacatcatgccacgtttcga 24526266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Original strand, 29160167 - 29160207
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29160167 cttaaatagtgttcag---tacgcagcatcgtgccacgtttcga 29160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 48 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28278149 - 28277892
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctc-tcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278149 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 28278050  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagct--tgcccaacaaata 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||  |   ||||||||     
T  28278049 ttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttagtttccttgagattcaccaagcttattttcaacaaatg 28277950  T
Q  244 ggtcatgaagtgcttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  28277949 ggtcatgaagtgcttaaatagtgttcaggaaaacgcagcatcgttccacgtttcgagc 28277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 48 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40147094 - 40146882
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147094 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccattttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 40146995  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  40146994 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcatcctttggtttccatgagattcaccaagcttaaccaacaaatgggt 40146895  T
Q  247 catgaagtgctta 259  Q
    |||| ||||||||    
T  40146894 catggagtgctta 40146882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 297
Target Start/End: Original strand, 16642213 - 16642462
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16642213 ctcatgtgtttcctaaccccatgaatctgtccccaaaaggcaccaaccctttcccaagagccctct--tttggttcttcaagattcacttcttgaagctt 16642310  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  16642311 tgaacctcacccaaagaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagtgctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatggg 16642410  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttc 297  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  16642411 tcatggagtgcttaaataatgtccaggaacacgcagcaacgtgccacgtttc 16642462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 213302 - 213087
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctcc-aagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  213302 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctcccaagattcacatcttgaagct 213203  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||    
T  213202 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttacccaaaaaatggg 213103  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaa 261  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  213102 tcatggagtacttaaa 213087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38746838 - 38746643
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38746838 ctcacgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcttaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactt 38746739  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38746738 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaat 38746643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27015365 - 27015183
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27015365 ctcatgtgtttcccaaccccatgattcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctt 27015266  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagc 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  27015265 tgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttgatttccattagattcgccaagc 27015183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5057880 - 5057657
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5057880 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacctttttcccaaaagccc-ctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagctt 5057782  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| |    ||||||| |||    
T  5057781 tgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcacccagc-tctttaacaaatgggt 5057683  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  5057682 catggagtgcttacatagtgttcaga 5057657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Original strand, 27637951 - 27638169
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27637951 ctcatgtgtttcctaaccccatgaatcttcc-caaaatgcaccaacccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaa-ctt 27638048  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||| |||    
T  27638049 tgaacctcacccaaagattctcaacctttagtatctaaaaccttaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcctttttaacaaatgggt 27638148  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  27638149 catagagtgcttaaatagtgt 27638169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 316596 - 316371
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  316596 atgtgtttcccaaccttatgaatctctccccaaaaggcaccaaccctctcccaagagcccccccttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 316497  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattc------cccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||       |||||||| | ||||||||    
T  316496 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaagtacaataaaagttctctcctttagtttccatgagattcaccattaccaagcttactcaacaaat 316397  T
Q  243 aggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||    
T  316396 gggtcaaggagtgcttaaataatgtt 316371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35616002 - 35615786
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35616002 atgtgtttctcaactccatgaatctctccccaaaaggcatcacccctttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 35615903  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    || ||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||   |||    
T  35615902 acctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaatactctaaaagttttttcatttggtttcaaggagattcaccaagcttacgcaacaaattaatca 35615803  T
Q  249 tgaagtgcttaaatagt 265  Q
     | ||||||||||||||    
T  35615802 aggagtgcttaaatagt 35615786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30802774 - 30802553
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  30802774 ctcatgtgttttctaaccccatgaatctctccccaaaaggcacaaaccctttcccaagagcctcctcttttggttctctaagata-acatcatgaagctt 30802676  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| |     
T  30802675 tgaacctcacctaaagaccctcaacctagaatatctaaataccctaaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagcgtactcaacaaatcga 30802576  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    ||| | ||| |||||||||||||    
T  30802575 tcaaggagtacttaaatagtgtt 30802553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30793072 - 30792860
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||   | |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30793072 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatatctccccaaaaggcaccaaccttttcccaa-agccacatattttggttctccaagata-acatcttgaagctt 30792975  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||    
T  30792974 tgaacatcacctaaagaccctcaacctttagtatctaattaccctaaaagtttactcatttggtttccatgagattcaccaagcttacttaacaaatggg 30792875  T
Q  246 tcatgaagtgcttaa 260  Q
    ||| |||||||||||    
T  30792874 tcaagaagtgcttaa 30792860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 10055041 - 10055237
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10055041 ctcatgtgtttcccaaccccgtgaatctctccccataaggcaccaaacctttcccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 10055140  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||  || ||||| || || || |||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||    
T  10055141 tgaatctcacccaaaaaccttcaatctttagtatccaagtactctaaatgttccatcatttgatttctatgagattcaccaaacttactcaacaaat 10055237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 14689747 - 14689963
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 150  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  | |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14689747 atgtgtttcccattctcacgaatctctc-caaaaggcaccaaccctttcacaagaaccccttcttttggttctccaaaattcacatcttgaaactttgaa 14689845  T
Q  151 cctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcat 249  Q
    | |||| |||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||| |     
T  14689846 catcactcaaagacccttaaccttcactatctaaatgccctaaaagttttctcctttagtttccatgagattcaccaagcctactcaacaaatgggtaag 14689945  T
Q  250 gaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  14689946 gaa-tgcttaaatagtgtt 14689963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 175
Target Start/End: Original strand, 33906366 - 33906491
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||    
T  33906366 atgtgtttctcaaccccatgaatctctccccaaaaggcaccaaccctctcccaagagcccccttttttggttctacaagattcacattttgaggcttcga 33906465  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaaccttt 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33906466 acctcactcaaagaccctcaaccttt 33906491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4160458 - 4160251
Alignment:
Q  57 ttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctca 155  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||  ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||    
T  4160458 ttcccaaccctatgaatctctccccaaaagacacttaccctctcccaagagccccctcttttagttctccaggattcacttctttaaactttgaacatca 4160359  T
Q  156 cccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagt 254  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| || ||||  | ||| |||||||| |   |||    
T  4160358 cccaaa-accctcaaactttagtatctaaataccctaaatgttctctcatttggtttccatgagattcaccgagctcactcaaaaaataggttaaagagt 4160260  T
Q  255 gcttaaata 263  Q
    |||||||||    
T  4160259 gcttaaata 4160251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 268
Target Start/End: Original strand, 33906578 - 33906687
Alignment:
Q  159 aaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgct 257  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||| | | ||||||    
T  33906578 aaagaacctcaacctttaatatctaaataccctaaaagttctcttctttggtttc-atgagattcaccaagcttgttcaacaaatgggttaaggagtgct 33906676  T
Q  258 taaatagtgtt 268  Q
    |||||||||||    
T  33906677 taaatagtgtt 33906687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 295
Target Start/End: Original strand, 10282111 - 10282150
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10282111 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtt 10282150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 136
Target Start/End: Original strand, 21205987 - 21206076
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacat 136  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || |||  ||||| |||||||||||| | |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  21205987 ctcatgtgtttcccaaccctatgaacctctccgaaaaagacaccaaccctttccaaagaaccccatcttttggttctctaagattcacat 21206076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26364098 - 26363873
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364098 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggccccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 26363999  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  26363998 tgaacctcacccaaaggccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcccttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 26363899  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  26363898 catggagtgcttacatagtgttcaga 26363873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Original strand, 27417286 - 27417507
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27417286 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagacaccaacccctttcccaagagccccttcttttggttctccaagattcacatcttaaagctt 27417385  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  27417386 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 27417485  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  27417486 catggagtgcttatatagtgtt 27417507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8665236 - 8665025
Alignment:
Q  52 tgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 150  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665236 tgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 8665137  T
Q  151 cctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaac-aaataggtcat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||    
T  8665136 cctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacctaacaaaatgggtcat 8665037  T
Q  250 gaagtgcttaaa 261  Q
    | ||||||||||    
T  8665036 ggagtgcttaaa 8665025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Original strand, 46569881 - 46570106
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46569881 ctcatttgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaaggcaccaatccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 46569980  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  46569981 tgaacctcacctaaagaccttcaacatttagtatctaaaaccctaaaatttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggt 46570080  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  46570081 catggtgtgcttacatagtgttcaga 46570106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40630817 - 40630616
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40630817 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 40630718  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  40630717 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcatcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 40630618  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  40630617 ca 40630616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 54882853 - 54882658
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54882853 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctt 54882754  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  54882753 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcactaagcttacccaacaaat 54882658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2209541 - 2209340
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209541 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagtcccctcgtttggttctccaagattcacatcttgaagctt 2209442  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  2209441 tgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcatttgctttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 2209342  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  2209341 ca 2209340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6655789 - 6655588
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6655789 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagttt 6655690  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  6655689 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagatttaccaagcttacccaacaaatgggt 6655590  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  6655589 ca 6655588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 50263033 - 50263234
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaaccctttt-ccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50263033 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 50263132  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||   |||||||| |||    
T  50263133 tgaacctcacccaaagactctcaacctttagtgtctaaaaccctaaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaaactttttcaacaaatgggt 50263232  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  50263233 ca 50263234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 56 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 46703326 - 46703114
Alignment:
Q  56 tttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703326 tttcccatccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttgattctcgaagattcacatcttgaagctttgaacctc 46703227  T
Q  155 acccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | | || ||||| ||| ||  |||    
T  46703226 acccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcctcctcagcaaatgggttatagagt 46703127  T
Q  255 gcttaaatagtgt 267  Q
    | |||||||||||    
T  46703126 gattaaatagtgt 46703114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 55085700 - 55085902
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaa-gct 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  55085700 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaaagct 55085799  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  55085800 tttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttcattgagattcaccaagcttacccaacaaatggg 55085899  T
Q  246 tca 248  Q
    |||    
T  55085900 tca 55085902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 50674181 - 50674382
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcca-agagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674181 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccataaggcaccaacccttttcattagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 50674280  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  50674281 tgaacctcacccaaagacccttaacatttagtatttaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 50674380  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  50674381 ca 50674382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12073225 - 12073005
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaaccctttt--ccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12073225 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttcc-caaaaggcaccaaccctttttcccaagagccc-ctcttttggttctccaagatttacatcttgaagct 12073128  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagc-ttgcccaacaaatag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||    ||||||| |    
T  12073127 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattcaccaagctttttttaacaaatgg 12073028  T
Q  245 gtcatgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    
T  12073027 gtcataaagtgcttaaacagtgt 12073005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41964248 - 41964029
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41964248 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatctttcccaaaag--actaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctt 41964151  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | || ||||| ||    
T  41964150 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaaactttctcaccaaatggg 41964051  T
Q  246 tcatgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  41964050 tcatagagtgcttaaatagtgt 41964029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35662274 - 35662094
Alignment:
Q  49 tcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35662274 tcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcctaagagccccctcttttggttctccaagattcacatattgaagcttt 35662175  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaag 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  35662174 gaacctcacccaaagactctcaacctttagtatctaaaatcctaaaagttctctcatttggtgtccatgagattcaccaag 35662094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8653380 - 8653218
Alignment:
Q  100 ccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtccc 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  8653380 ccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttct 8653281  T
Q  200 ctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaac-aaataggtcatgaagtgcttaaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  8653280 ctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacctaacaaaatgggtcatggagtgcttaaa 8653218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 379212 - 379028
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  379212 ctcatgtgtttcccattctcatgaatcttccccaaaaggcaccgacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctt 379113  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagct 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  379112 tgaacctcacccaaagtccctcaacctttagtatctacaaatcctaaaagttctctcctttggtttccacgagattcaccaagct 379028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33989695 - 33989501
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33989695 ctcatgtgtttcccaatcccatgaatctctcccaaaaggcaccaaccttctcccaagagccccctattttggttcttcaagattcacatcttgaagcttt 33989596  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33989595 gaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatctaaataccctaaaagttatctgctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaa 33989501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10071676 - 10071503
Alignment:
Q  90 caacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaacc 188  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10071676 caacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaacc 10071577  T
Q  189 ctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaac-aaataggtcatgaagtgcttaaa 261  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  10071576 ttaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagattacccaacaaaatgggtcatggagtgcttaaa 10071503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Original strand, 38811417 - 38811589
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||||||| | || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38811417 atgtgtttcctaacctcatgaatctctccgcaaaagacaccaaccctttcccaagagccc-ctctttgggttctccaagattcacatcttaaagctttga 38811515  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattc 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38811516 acctcacccaaataccctcaacctttagtatctaagtaccctaaaagttccctcctttagtttccatgagattc 38811589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3785891 - 3785702
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  3785891 caaaaggcaccaacccttttccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaatctcgcctaaagactctcaacctttagta 3785792  T
Q  180 tcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    || |   | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||| ||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  3785791 tccatgtatcctaaaagttccatcctttgatttccatgagatccaccaaacttactcaacaaatgggtcaagtagtgcttaaatagtgtt 3785702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Original strand, 22883140 - 22883309
Alignment:
Q  100 ccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcc 198  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  22883140 ccaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaataccctaaaatttc 22883239  T
Q  199 cctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  22883240 cctcatttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggttaaggagtgcttaaatagtgtt 22883309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Original strand, 22934804 - 22934973
Alignment:
Q  100 ccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcc 198  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  22934804 ccaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaataccctaaaatttc 22934903  T
Q  199 cctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  22934904 cctcatttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggttaaggagtgcttaaatagtgtt 22934973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 35370705 - 35370857
Alignment:
Q  81 aaaaggcaccaacccttttccaagagccctctctttt-ggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 179  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35370705 aaaagggaccaaccctctcccaagaaccccctcttttaggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctctcccaaagaccctcaacctttagta 35370804  T
Q  180 tctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagctt 231  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  35370805 tctaaataccttaaaagttccctcctttgatttccatgagattcatcaagctt 35370857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8647967 - 8647861
Alignment:
Q  52 tgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 150  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8647967 tgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 8647868  T
Q  151 cctcacc 157  Q
    |||||||    
T  8647867 cctcacc 8647861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10072065 - 10071963
Alignment:
Q  87 caccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10072065 caccaacccttttcacaagagccccctcttttagttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa 10071966  T
Q  186 acc 188  Q
    |||    
T  10071965 acc 10071963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 248
Target Start/End: Original strand, 35369807 - 35369971
Alignment:
Q  81 aaaaggcaccaacccttttccaagagccctctctttt-ggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 179  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35369807 aaaagggaccaaccctctcccaagaaccccctcttttaggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 35369906  T
Q  180 tctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    ||||||    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| || |||||    
T  35369907 tctaaa----taaaagttccctcctttaatttccatgagattcatcaagcttactcaacagatgggtca 35369971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33089716 - 33089583
Alignment:
Q  64 ccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaag 162  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33089716 ccccatgaatctctctccaaaagacaccaaccctctcccaagagccccctcttttgattctccaagattcacatcttcaaactttgaacctcacccaaag 33089617  T
Q  163 accctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagt 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  33089616 accctcaatctttagtatctaaatacctaaaagt 33089583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 242
Target Start/End: Original strand, 26699814 - 26699978
Alignment:
Q  81 aaaaggcaccaaccctttt-ccaagagccctct-cttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagt 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  26699814 aaaaggcaccaaccctttttccaagatcccccttcatttggctctctaagattcacatcttgaagttttgaacctcaaccaaagatcttcaacctttagt 26699913  T
Q  179 atctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  26699914 atctaaatgccctacaagttccctcatttggtttccatgagattcacaaagcttgctcaacaaat 26699978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 231
Target Start/End: Original strand, 47514864 - 47515021
Alignment:
Q  75 ttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctt 174  Q
    |||| |||||| || ||| | ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  47514864 ttcctcaaaagacatcaatcatttcccaagagtccactcttttggttcaccaagattcatatcttgaagctttgaacttcacccgaagaccttcaacctt 47514963  T
Q  175 tagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagctt 231  Q
    |||| | |||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47514964 tagtgtttaagtaccctaaaagttcactcatttggtttccatgagattccacaagctt 47515021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 25723554 - 25723752
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||  |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25723554 atgtgtttcccaaccccacgaagctctctccaaaaggcattaaccattatccaagagctccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttga 25723653  T
Q  150 acctcac-ccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtc 247  Q
    ||||| | |||||||  |||||| ||||||||  ||  ||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  25723654 acctccctccaaaga--ctcaacatttagtattgaagtaccctaagagttcactcatttggtttccatgaaattcaccaagcttacttaacaaataggtc 25723751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32091326 - 32091222
Alignment:
Q  125 caagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa--accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattc 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  32091326 caagattcacatcttgaagttttgaacctcactcaaagaccctcaacatttagtatccaaaataccttaaaaattccctcttttagtttccatgaaattc 32091227  T
Q  223 cccaa 227  Q
     ||||    
T  32091226 accaa 32091222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6719384 - 6719289
Alignment:
Q  82 aaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttag 177  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  6719384 aaaggcatcaaccctttcccaagaatccactcttttagttttccaagattcacatcttgaacctttgaatctcaccctaaaaccttcaacctttag 6719289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 222
Target Start/End: Original strand, 22629223 - 22629399
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaat--cttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    |||||||||||| || |||||| |||  ||||| |||||||||| |||| |||| ||| |  |  || |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22629223 ctcatgtgtttctcaaccccataaatatcttcc-caaaaggcactaaccatttttcaatattctcctattttggttctccaagattcacatcttgaactt 22629321  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattc 222  Q
    || || |||||||| |||| || |||||||||| ||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  22629322 ttaaatctcacccagagacactgaacctttagtttctaaatttcctaaaagttcactcatttggtttctatgagattc 22629399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3793817 - 3793774
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793817 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 3793774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34112445 - 34112314
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||| |||||||||||||  | ||   ||    
T  34112445 ctcatgtgttttccaaccccgtgaacctctccccaaaaggcaccaacccttttctaagagcctcgtctttaggttatccaagattcacaattggacattt 34112346  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagt 178  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34112345 tgaatctcacacaaagaccctcaatctttagt 34112314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 45687523 - 45687568
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45687523 cttaaatagtgttcagaaatacgcaacattgtgccacgtttcgagc 45687568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 46147682 - 46147727
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46147682 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacgttttgagc 46147727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 52467681 - 52467726
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52467681 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacatttcgagc 52467726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12119369 - 12119281
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatctt 139  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||  | || ||||  |||||||||||||| |||||    
T  12119369 atgtgtttcgcaaccccatgaatcttcccaaaagggaaccaaccctttcccaagagttcccttttttaattctccaagattcatatctt 12119281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41961237 - 41961110
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | || ||||||| || ||| |||||| |||||||||||| | ||  ||||||    
T  41961237 atgtgtttcccaaccc-atgaatctctccccaaaaagcaccgaccttctccctagagccccctttttcggttctacaagattcacatttggacactttga 41961139  T
Q  150 acctca-cccaaagaccctcaacctttag 177  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  41961138 atctcaccccaaagaccctcaccctttag 41961110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Original strand, 36463728 - 36463771
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36463728 cttaaataatgttcaggaatacgcaacatcgtgccacgtttcga 36463771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41639212 - 41639173
Alignment:
Q  233 cccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41639212 cccaacaaatgggtcatgaagtgcttacatagtgttcaga 41639173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Original strand, 43135813 - 43135899
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccct 167  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  43135813 caaaagacaccaaccctctctcaagagccc-ctcttttggttcaccatgattcacatttggacactttaaacatcacccaaagaccct 43135899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11383816 - 11383594
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383816 atgtatttcccaaccccatgaatcttcctcaaaaggcaccaacccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 11383717  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||    
T  11383716 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcctaacaaatgggacat 11383617  T
Q  250 gaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    | |||||||| ||||| ||||||    
T  11383616 ggagtgcttacatagtattcaga 11383594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 248
Target Start/End: Original strand, 42435327 - 42435527
Alignment:
Q  49 tcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42435327 tcatatgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaagtcaccaacctttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 42435426  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  42435427 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccgaacaaatgggtc 42435526  T
Q  248 a 248  Q
    |    
T  42435527 a 42435527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22976383 - 22976142
Alignment:
Q  30 tcacaattgactcttcgcctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaaccctttt-ccaagagccctctcttttggttctccaag 128  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22976383 tcacaatagactcttcac-tcatgtgttttcaa-ccccatgaatcttccccaaaaggcaccaaccctttttccaagagcctcctcttttggttctccaag 22976286  T
Q  129 attcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaag 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  22976285 attcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactctaaaagttcactcctttggtttcgaagagattcactaag 22976186  T
Q  229 cttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    ||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  22976185 cttacccaacaaatgggttatggagtgcttacatagtgttcaga 22976142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44353625 - 44353414
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||    
T  44353625 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctcttcacaagagccccctcttttagttctccaagattc---tcttgaagttt 44353529  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  44353528 taaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgagt 44353429  T
Q  247 catgaagtgcttaaa 261  Q
    |||| | ||||||||    
T  44353428 catggattgcttaaa 44353414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 2999838 - 3000078
Alignment:
Q  30 tcacaattgactcttcgcctcatgtgtttcccatccccatgaatctt-ccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaag 128  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2999838 tcacaattgactct-ctactcatgtgtttctcatccccatgaatctttccccaaaagacaccaaccatatcccaagaaccccctcttttggttctccaag 2999936  T
Q  129 attcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2999937 attcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaattccctaaaagttctctcctttggtttctatgagattcaccaa 3000036  T
Q  228 -gcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
     | ||   |||||| | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  3000037 ggttttttcaacaattgggtcataaagtgcttaaacagtgtt 3000078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4283331 - 4283178
Alignment:
Q  95 cttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 194  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283331 ctttcccaaaagccccctcttttggttctccaagatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 4283232  T
Q  195 gtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  4283231 gttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacacaacaaatgggtca 4283178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40221578 - 40221376
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  40221578 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcactaacccctttcccaagagccccctattttggttctcgaagattcacatcttgaagttc 40221479  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaag-tcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    | ||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  40221478 taaacctcatccaaagaccttccacctttagtatcaaaaaccctaaaagttcccctcctatggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatggg 40221379  T
Q  246 tca 248  Q
    |||    
T  40221378 tca 40221376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40328612 - 40328476
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40328612 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccctaaaaggcaccaacccttttcccaagaaccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctt 40328513  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40328512 tgaacctcacccaaagaccctaaatctttagtatcta 40328476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 241
Target Start/End: Original strand, 20686452 - 20686586
Alignment:
Q  107 ccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  20686452 ccctctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacttca-ccaaagatcctcaacatttagtatctaagtaccctgaaagttccctcctt 20686550  T
Q  206 tggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaa 241  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  20686551 tggtttcaatgagattcaccgagcttacccaacaaa 20686586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 215
Target Start/End: Original strand, 3846153 - 3846321
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||    
T  3846153 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatctctccccaaaagacaccaactcttttccaagagctct-tcttttggttcttcaagattcacattatgaacctt 3846251  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccat 215  Q
    |||| ||||| |||  |||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  3846252 tgaatctcactcaagaaccctcaacctttagtttcaaagtaccctgaaagttttctcctttggtttccat 3846321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40585503 - 40585336
Alignment:
Q  102 aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccc 200  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||        
T  40585503 aagagcccactcttttgattctcaaatattcacatcttgaagctttgaacctcaaccaaagactcttaacctttagtatctaaatactctaaaagttatt 40585404  T
Q  201 tcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||||||  | |||||||| |||||   |||||||||||| ||||    
T  40585403 tcctttggttttcatgagattaatcaagctcacgcaacaaatgggtcaatgagtgcttaaataatgtt 40585336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 3817670 - 3817840
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatcttccac-aaaaggcaccaacccttttccaagagccct--ctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || |||||| || ||||    
T  3817670 atgtattttccaaccccatgaatctttctccaaaaggcaccaacccttttccaagagccctaattcttttggttcttcaagaatcccatcttcaaccttt 3817769  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgag 218  Q
    |||  | || || | |||||||||||||||| |||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3817770 gaa-tttactcagaaaccctcaacctttagtttctaagtaccctaaaagttttctcctttggtttccatgag 3817840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11136974 - 11136798
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||| || ||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||   ||    
T  11136974 ctcatgtgttttcctacccaatgaacctctccccaaaaggcatcgaccaatttccaagagccctctcttttagttctccaaaattcatatttggacaatt 11136875  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa-aaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattc 222  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||   |||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  11136874 tgaatctcacccaaagacccccaacctttagtttttaagttccctaaaaatctcatcctttagtttccatgagattc 11136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40535651 - 40535538
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagta 179  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  40535651 caaaaggcatcaaccctttctcaagaaccccctcttttggttctaaaagatccacaacttgaaactttgaac--cacccaaagaccatcaatctttagta 40535554  T
Q  180 tctaaa-accctaaaa 194  Q
    |||||| |||||||||    
T  40535553 tctaaataccctaaaa 40535538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10020229 - 10020150
Alignment:
Q  91 aacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaa 170  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||||||||||    
T  10020229 aaccctttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatattgatcatttgaatctcacctaaagaccctcaa 10020150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 6127583 - 6127625
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6127583 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcg 6127625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26402965 - 26402923
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26402965 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcg 26402923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18141662 - 18141617
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18141662 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 18141617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9765590 - 9765547
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9765590 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 9765547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Original strand, 10101527 - 10101612
Alignment:
Q  80 caaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacc 165  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  10101527 caaaatgcagcaaccctttcccaagagcctcctcttttggttctccaaggttcacattttgacccattgaatctcactcaaagacc 10101612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5689112 - 5689067
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcgagc 301  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5689112 cttaaatagtgttcaggaatacccaacatcgtgccacgtttcgagc 5689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 9633875 - 9634007
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaa 150  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||  | ||||||| ||||||| ||||| |||||| |  ||||||| || | |||||||||||| | ||  |||||||    
T  9633875 atgtgtttaccaaccccattaatctctcccaaaaggtaccaacctttttc-aagagcgccatcttttgattattcaagattcacatttggacactttgaa 9633973  T
Q  151 cctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaa 184  Q
     |||||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  9633974 tctcacccaaagacgttcgacctttagtttctaa 9634007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10239782 - 10239700
Alignment:
Q  186 accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||    
T  10239782 accctaaaagttccctctattgatttccatgagattcgtcaagcttactcaacaaaagggtcaaggagttcttaaatagtgtt 10239700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28461375 - 28461305
Alignment:
Q  67 catgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacat 136  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  28461375 catgaatctatccccaaaaggaaccaaccatttcctaagagcttcctcttttggttctccaagattcacat 28461305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7161 - 6960
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7161 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 7062  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  7061 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 6962  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  6961 ca 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 3809043 - 3809245
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctc-tcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3809043 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggaaccaacccttttcacaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagct 3809142  T
Q  146 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  3809143 ttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgctcaacaaatggg 3809242  T
Q  246 tca 248  Q
    |||    
T  3809243 tca 3809245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 267
Target Start/End: Original strand, 2973275 - 2973495
Alignment:
Q  49 tcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973275 tcatgtgtttcccaaccccatgaatcttcccaaaaaagcaccaacccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagcttt 2973374  T
Q  148 gaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |  ||||||| |||    
T  2973375 gaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctacaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaaggtctcttaacaaatgggt 2973474  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  2973475 cataaagtgcttaaatagtgt 2973495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5043460 - 5043241
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5043460 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttcc-caaaaggcaccaacccttttcccaagagccctctcttttggttctccaagattctcatcttgaagctt 5043362  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||     || |||| |||    
T  5043361 tgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagctcctttaataaatgggt 5043262  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgt 267  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  5043261 catagagtgcttaaatagtgt 5043241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17762822 - 17762595
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatctt--ccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagc 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762822 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatctaacccccaaaaggcaccaaaccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagc 17762723  T
Q  145 tttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaatag 244  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  17762722 cttgaacttcacccaaagatcctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttctctccttttgtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgg 17762623  T
Q  245 gtcatgaagtgcttaaatagtgttcaga 272  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||    
T  17762622 gccatggagtgcttacatagtgttcaga 17762595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21593499 - 21593276
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21593499 ctcatgtgttttccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaatctt 21593400  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  21593399 tgaacctcacccaaagaccctcaacatttagtatctaaaaccctaaaagttctaacctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 21593300  T
Q  247 catgaagtgcttaaatagtgttca 270  Q
     ||| |||||||| ||||||||||    
T  21593299 tatggagtgcttacatagtgttca 21593276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 26830442 - 26830680
Alignment:
Q  30 tcacaattgactcttcgcctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaag 128  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  26830442 tcacaaatgactctgcgc-tcatctgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaacctttttcccaagagactcctcttttggttctccaag 26830540  T
Q  129 attcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaag 228  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26830541 attcacatcttgaagttttaaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaag 26830640  T
Q  229 cttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 268  Q
    ||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||    
T  26830641 cttacccaacaaatggatcatggagtgcttatatattgtt 26830680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Original strand, 22425150 - 22425356
Alignment:
Q  37 tgactcttcgcctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagag--ccctctcttttggttctccaagattca 133  Q
    ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22425150 tgactcttcacc-catgtgtttcacaaccccatgaatcttccccaaaatgcaccaacccttatcccaagaggcccccctcttttggttctccaagattca 22425248  T
Q  134 catcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgc 233  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  22425249 catcttgaagctctgaaccacacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct-aaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttat 22425347  T
Q  234 ccaacaaat 242  Q
    |||||||||    
T  22425348 ccaacaaat 22425356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26800603 - 26800438
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  26800603 ctcatgtgtttcccatccc-atgaatcttccccaaaaggcaccaacctttttcccaagagccccctcttttggttatccatgatccacatcttgaagctt 26800505  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||    
T  26800504 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagttttctcctttggtttc 26800438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 182
Target Start/End: Original strand, 603415 - 603550
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603415 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctttcctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 603514  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatct 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  603515 tgaacctcatccaaagaccctcaacctttactatct 603550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25073015 - 25072823
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| | | ||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25073015 atgtgtttccaaaccctatgaatctcttcccaagaggcacaatcccttttccaagagccccc-ctttgggttctcaaagattcacatcttgaagctttga 25072917  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  25072916 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaataccctaaaagttcacttctttgatttccatgagattcatcaagcttactcaacaaat 25072823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17757917 - 17757789
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatctt--ccacaaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagc 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17757917 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatctaacccccaaaatgcaccaacccttttcacaagagccccctattttggttctccaacattcacatcttcaagc 17757818  T
Q  145 tttgaacctcacccaaagaccctcaacct 173  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17757817 tttgaatctcacccaaagaccatcaacct 17757789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 3039241 - 3039283
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcg 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3039241 cttaaatagtgttcaggaatacgcagcatcgtgccacgtttcg 3039283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26661621 - 26661580
Alignment:
Q  208 gtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcat 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  26661621 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaattggtcat 26661580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26767592 - 26767551
Alignment:
Q  208 gtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcat 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  26767592 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaattggtcat 26767551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11391 - 11190
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11391 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttctccaaaaggcaccaaccctttccccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 11292  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  11291 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagatttaccaagcttacccaacaaatgggt 11192  T
Q  247 ca 248  Q
    ||    
T  11191 ca 11190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 242
Target Start/End: Original strand, 80618 - 80813
Alignment:
Q  48 ctcatgtgtttcccatccccatgaatcttccacaaaaggcaccaacccttttcc-aagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctt 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  80618 ctcatgtgtttcccaaccccatgaatcttccccaaaaggcaccaacccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcaaatcttgaagctt 80717  T
Q  147 tgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  80718 tgaacctcacccaaagaccctcaacctctagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagattttccaacaaat 80813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 18354 - 18549
Alignment:
Q  67 catgaatcttccac-aaaaggcaccaacccttttc-caagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 164  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18354 catgaatcttcccccaaaaggcaccaacccttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagac 18453  T
Q  165 cctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaa 261  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  18454 ccgcaacctttagtatctaaaa-cctataagttttctcctttggtttccatgagattcacccagcttacccaacaaatgtgtcatggactgcttaaa 18549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 490782 - 490981
Alignment:
Q  51 atgtgtttcccatccccatgaatcttccaca-aaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 149  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||  ||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  490782 atgtgtttcccaatcccatgaatctctcacctaaaggcaccaaccctctccaaagagcccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagctttga 490881  T
Q  150 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatcta-aaaccctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  490882 acctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccctcctttggttctcatgagattcaccaagcttgctcaacaaatgggtca 490981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 268
Target Start/End: Original strand, 1759 - 1962
Alignment:
Q  67 catgaatct-tccacaaaaggcaccaacccttttccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacc 165  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||   ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1759 catgaatctctccacaaaagacaccaagcctcgcccaagagtcccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttggagctcacccaaagacc 1858  T
Q  166 ctcaacctttagtatctaaa-accctaaaagtcccctcctttggtttccatgagattccccaagcttgcccaacaaataggtcatgaagtgcttaaatag 264  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| ||||| || |  ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1859 ttcaacctttagtatctaaataccctaaaagttctctcatttggtttccataaaattcaccaagtttacttaacaaataggtcaaggagtgcttaaatag 1958  T
Q  265 tgtt 268  Q
    ||||    
T  1959 tgtt 1962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Original strand, 11091 - 11134
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11091 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtttcga 11134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5694 - 5655
Alignment:
Q  256 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5694 cttaaatagtgttcagaaatacgcagcatcgtgccacgtt 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University