View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7607_high_5 (Length: 603)

Name: NF7607_high_5
Description: NF7607
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7607_high_5
NF7607_high_5
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (130-584)||(1951406-1951839)
chr5 (131-356)||(30687888-30688114)
chr5 (131-356)||(29302078-29302304)
chr5 (131-356)||(11448720-11448946)
chr5 (130-356)||(4736782-4737005)
chr5 (130-356)||(15808958-15809185)
chr5 (130-354)||(17605031-17605254)
chr5 (130-356)||(26905885-26906108)
chr5 (156-356)||(3960637-3960837)
chr5 (130-356)||(33026215-33026442)
chr5 (131-352)||(33282248-33282468)
chr5 (130-356)||(30667554-30667777)
chr5 (130-356)||(17209847-17210072)
chr5 (130-356)||(1921448-1921674)
chr5 (130-325)||(37282200-37282393)
chr5 (131-294)||(37249351-37249515)
chr5 (131-356)||(33833039-33833253)
chr5 (131-268)||(17559198-17559335)
chr5 (232-354)||(27005155-27005277)
chr5 (130-262)||(1807474-1807605)
chr5 (258-356)||(14795679-14795777)
chr5 (250-356)||(30486097-30486203)
chr5 (130-356)||(37468530-37468747)
chr5 (158-346)||(4083732-4083918)
chr5 (25-114)||(1951286-1951376)
chr5 (130-215)||(7014631-7014716)
chr5 (158-356)||(14369752-14369947)
chr5 (131-215)||(22282186-22282270)
chr5 (158-356)||(4737917-4738112)
chr5 (255-356)||(7014513-7014614)
chr5 (144-356)||(25912029-25912239)
chr5 (258-336)||(1797420-1797498)
chr5 (144-346)||(33696047-33696248)
chr5 (185-280)||(38661242-38661337)
chr5 (154-336)||(2528771-2528953)
chr5 (158-356)||(7944272-7944467)
chr5 (180-356)||(31240268-31240441)
chr5 (158-336)||(9124706-9124884)
chr5 (144-346)||(2695084-2695283)
chr5 (131-356)||(22701718-22701940)
chr5 (158-356)||(28747747-28747943)
chr5 (158-328)||(31752128-31752296)
chr5 (238-356)||(12910103-12910219)
chr5 (144-346)||(17421688-17421889)
chr5 (238-356)||(39548921-39549037)
chr5 (158-356)||(6436408-6436603)
chr5 (160-356)||(39038504-39038698)
chr5 (238-356)||(3038872-3038988)
chr5 (130-215)||(11351791-11351877)
chr5 (158-356)||(13711033-13711230)
chr5 (158-213)||(4151093-4151148)
chr5 (158-215)||(858013-858070)
chr5 (158-215)||(32736383-32736440)
chr5 (158-356)||(17232918-17233109)
chr5 (144-208)||(25912176-25912240)
chr5 (144-208)||(4737916-4737980)
chr5 (158-331)||(6260993-6261164)
chr5 (163-356)||(10951040-10951230)
chr5 (144-208)||(14369751-14369815)
chr5 (158-331)||(22800642-22800814)
chr5 (237-356)||(8410698-8410815)
chr5 (147-214)||(25593287-25593354)
chr5 (144-194)||(4083736-4083786)
chr5 (238-356)||(17233353-17233469)
chr5 (307-356)||(22213127-22213176)
chr5 (144-208)||(3038871-3038935)
chr5 (144-208)||(22701877-22701941)
chr5 (144-208)||(31240378-31240442)
chr5 (144-208)||(39038503-39038567)
chr5 (144-214)||(3038999-3039069)
chr5 (145-208)||(12910157-12910220)
chr5 (133-176)||(27005107-27005150)
chr5 (145-208)||(40234209-40234272)
chr5 (253-326)||(4150976-4151050)
chr5 (142-208)||(13711165-13711231)
chr5 (322-356)||(38661209-38661243)
chr5 (307-336)||(6260994-6261023)
chr5 (144-208)||(7944271-7944336)
chr5 (158-215)||(17210139-17210195)
chr5 (158-215)||(33832841-33832898)
chr5 (307-356)||(40234223-40234271)
chr5 (144-208)||(6436407-6436471)
chr5 (144-208)||(10951039-10951103)
chr5 (144-208)||(28747746-28747810)
chr5 (144-208)||(39548974-39549038)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (130-356)||(7848521-7848747)
chr3 (130-356)||(6748624-6748850)
chr3 (131-356)||(6114775-6115001)
chr3 (130-356)||(11460144-11460370)
chr3 (130-357)||(995002-995230)
chr3 (130-356)||(8815326-8815551)
chr3 (130-356)||(47461688-47461915)
chr3 (131-356)||(7521352-7521578)
chr3 (131-356)||(21727639-21727865)
chr3 (131-357)||(994697-994924)
chr3 (130-356)||(12896631-12896858)
chr3 (131-356)||(6109139-6109365)
chr3 (133-356)||(4043622-4043853)
chr3 (130-356)||(38797972-38798200)
chr3 (130-356)||(45059506-45059733)
chr3 (162-356)||(37504535-37504729)
chr3 (130-347)||(26152171-26152389)
chr3 (137-356)||(51147993-51148212)
chr3 (132-329)||(51952222-51952421)
chr3 (130-356)||(17065720-17065946)
chr3 (130-356)||(27728185-27728414)
chr3 (178-356)||(26158254-26158433)
chr3 (130-356)||(3544282-3544508)
chr3 (131-269)||(26152485-26152624)
chr3 (131-278)||(52654387-52654534)
chr3 (224-356)||(2868232-2868364)
chr3 (131-256)||(3269208-3269333)
chr3 (130-356)||(27800458-27800667)
chr3 (251-356)||(17226270-17226375)
chr3 (130-215)||(30347748-30347833)
chr3 (131-215)||(17226177-17226261)
chr3 (158-356)||(13349125-13349320)
chr3 (158-345)||(1376004-1376190)
chr3 (284-356)||(21408611-21408683)
chr3 (130-215)||(48649428-48649514)
chr3 (158-356)||(53581549-53581744)
chr3 (238-356)||(27317629-27317745)
chr3 (158-356)||(33837816-33838016)
chr3 (158-336)||(53467358-53467534)
chr3 (238-356)||(31039643-31039759)
chr3 (130-191)||(42856946-42857007)
chr3 (158-356)||(3800186-3800382)
chr3 (158-356)||(8814768-8814963)
chr3 (158-324)||(12127562-12127726)
chr3 (144-356)||(27359987-27360195)
chr3 (158-330)||(50801589-50801759)
chr3 (158-330)||(50874121-50874291)
chr3 (286-354)||(48649332-48649400)
chr3 (249-356)||(36823945-36824050)
chr3 (131-188)||(52945472-52945529)
chr3 (158-215)||(54244749-54244806)
chr3 (144-208)||(22894888-22894952)
chr3 (248-356)||(32203144-32203249)
chr3 (158-215)||(3269498-3269555)
chr3 (261-357)||(34277589-34277684)
chr3 (158-356)||(50913007-50913202)
chr3 (144-208)||(3800185-3800249)
chr3 (144-208)||(31039696-31039760)
chr3 (255-346)||(48765316-48765406)
chr3 (307-356)||(22894903-22894951)
chr3 (271-356)||(26103734-26103817)
chr3 (130-202)||(48765188-48765261)
chr3 (144-192)||(13349140-13349188)
chr3 (308-356)||(17604922-17604969)
chr3 (144-208)||(27317628-27317692)
chr3 (144-208)||(36823944-36824008)
chr3 (144-208)||(53581548-53581612)
chr3 (144-191)||(53467490-53467537)
chr3 (248-342)||(7521515-7521608)
chr3 (158-289)||(17605528-17605658)
chr3 (224-298)||(27360064-27360137)
chr3 (158-208)||(29239601-29239651)
chr3 (255-334)||(53455514-53455589)
chr3 (158-210)||(22894554-22894606)
chr3 (130-193)||(32203299-32203363)
chr3 (256-336)||(50912957-50913037)
chr3 (224-276)||(51148081-51148132)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (131-356)||(39906254-39906480)
chr2 (130-356)||(44542845-44543071)
chr2 (130-356)||(38986955-38987182)
chr2 (130-356)||(30406445-30406671)
chr2 (131-356)||(6332261-6332486)
chr2 (130-353)||(39904653-39904877)
chr2 (130-356)||(7681989-7682214)
chr2 (131-356)||(22301963-22302188)
chr2 (130-356)||(20939694-20939920)
chr2 (130-356)||(9689359-9689586)
chr2 (130-356)||(4293188-4293414)
chr2 (130-356)||(22711017-22711243)
chr2 (130-356)||(44257454-44257682)
chr2 (131-356)||(2586377-2586602)
chr2 (131-356)||(33173495-33173719)
chr2 (136-356)||(15554012-15554232)
chr2 (159-354)||(9690171-9690366)
chr2 (231-356)||(324973-325098)
chr2 (130-264)||(3769653-3769787)
chr2 (254-353)||(3769453-3769552)
chr2 (158-356)||(34082566-34082761)
chr2 (158-356)||(11675151-11675347)
chr2 (130-215)||(19630736-19630821)
chr2 (130-215)||(19827637-19827722)
chr2 (142-317)||(1297586-1297746)
chr2 (158-304)||(33739546-33739691)
chr2 (158-356)||(42850015-42850210)
chr2 (238-344)||(13002033-13002138)
chr2 (131-356)||(1750189-1750411)
chr2 (158-356)||(16513074-16513266)
chr2 (287-356)||(8741636-8741705)
chr2 (247-336)||(17265358-17265446)
chr2 (144-356)||(18370216-18370426)
chr2 (159-355)||(16075044-16075237)
chr2 (158-346)||(37169556-37169741)
chr2 (274-356)||(23234048-23234130)
chr2 (238-356)||(29512075-29512193)
chr2 (238-336)||(23664827-23664924)
chr2 (130-194)||(324728-324793)
chr2 (144-329)||(23387153-23387337)
chr2 (130-212)||(45629706-45629790)
chr2 (144-211)||(11675284-11675351)
chr2 (253-346)||(29403954-29404046)
chr2 (144-215)||(29511950-29512022)
chr2 (144-208)||(34082698-34082762)
chr2 (130-173)||(23175376-23175419)
chr2 (149-215)||(23387118-23387185)
chr2 (130-173)||(23586633-23586676)
chr2 (158-331)||(768568-768740)
chr2 (158-215)||(1576652-1576709)
chr2 (158-215)||(8386696-8386753)
chr2 (130-215)||(41088820-41088905)
chr2 (144-208)||(18370363-18370427)
chr2 (144-208)||(29512074-29512138)
chr2 (144-208)||(42850147-42850211)
chr2 (158-208)||(13002167-13002217)
chr2 (130-180)||(17264913-17264963)
chr2 (238-346)||(8386777-8386885)
chr2 (307-340)||(10137254-10137287)
chr2 (144-208)||(1750188-1750252)
chr2 (142-194)||(13002035-13002087)
chr2 (146-194)||(37169689-37169737)
[»] chr8 (91 HSPs)
chr8 (130-354)||(9483622-9483846)
chr8 (130-328)||(1782975-1783173)
chr8 (142-356)||(14826289-14826503)
chr8 (130-356)||(19971429-19971655)
chr8 (131-356)||(21442102-21442327)
chr8 (130-356)||(31071527-31071752)
chr8 (130-356)||(30577841-30578068)
chr8 (151-356)||(21021179-21021384)
chr8 (130-356)||(41942832-41943055)
chr8 (160-356)||(5642518-5642706)
chr8 (160-356)||(5644459-5644647)
chr8 (131-244)||(14819281-14819394)
chr8 (131-258)||(3154165-3154293)
chr8 (130-215)||(1775535-1775620)
chr8 (130-215)||(4018675-4018760)
chr8 (130-215)||(25280969-25281054)
chr8 (158-356)||(27545762-27545957)
chr8 (260-356)||(25281053-25281149)
chr8 (158-346)||(13468309-13468496)
chr8 (158-356)||(10616293-10616488)
chr8 (158-356)||(13269233-13269429)
chr8 (158-356)||(26042940-26043135)
chr8 (158-356)||(34103002-34103197)
chr8 (158-346)||(1201671-1201857)
chr8 (158-346)||(30633073-30633259)
chr8 (235-309)||(21442395-21442469)
chr8 (158-356)||(32069024-32069217)
chr8 (238-356)||(32486926-32487042)
chr8 (158-356)||(2823601-2823796)
chr8 (158-356)||(3369714-3369908)
chr8 (158-356)||(8258321-8258516)
chr8 (158-354)||(10776977-10777168)
chr8 (158-356)||(35550591-35550786)
chr8 (264-356)||(42556441-42556532)
chr8 (144-215)||(18804309-18804380)
chr8 (238-356)||(1281883-1281999)
chr8 (158-356)||(5946786-5946981)
chr8 (284-356)||(2178705-2178776)
chr8 (179-356)||(29125709-29125883)
chr8 (293-356)||(3154105-3154168)
chr8 (131-356)||(25127843-25128068)
chr8 (142-215)||(21352398-21352471)
chr8 (161-346)||(26867931-26868115)
chr8 (158-338)||(9483936-9484115)
chr8 (131-346)||(13290470-13290684)
chr8 (158-282)||(30207169-30207292)
chr8 (130-185)||(42556394-42556449)
chr8 (158-356)||(184108-184304)
chr8 (158-298)||(23544847-23544987)
chr8 (158-333)||(25123380-25123553)
chr8 (158-215)||(7089968-7090025)
chr8 (158-215)||(17691217-17691274)
chr8 (131-215)||(25123633-25123718)
chr8 (158-215)||(26630031-26630088)
chr8 (238-346)||(18804870-18804977)
chr8 (248-356)||(32512124-32512230)
chr8 (158-304)||(36899739-36899886)
chr8 (238-342)||(39934413-39934516)
chr8 (158-213)||(42556684-42556739)
chr8 (158-356)||(9413810-9414005)
chr8 (144-208)||(184241-184305)
chr8 (144-208)||(26042939-26043003)
chr8 (144-208)||(27545894-27545958)
chr8 (144-208)||(29125708-29125772)
chr8 (144-208)||(35550590-35550654)
chr8 (289-356)||(9869574-9869641)
chr8 (166-282)||(45299659-45299774)
chr8 (144-194)||(1201803-1201853)
chr8 (271-356)||(23161318-23161401)
chr8 (158-215)||(39922412-39922469)
chr8 (144-208)||(2823600-2823664)
chr8 (144-208)||(3369845-3369909)
chr8 (144-208)||(5946785-5946849)
chr8 (144-208)||(10616425-10616489)
chr8 (144-208)||(13269232-13269296)
chr8 (144-208)||(23161317-23161381)
chr8 (144-208)||(25128005-25128069)
chr8 (131-199)||(32512038-32512105)
chr8 (144-194)||(10777107-10777157)
chr8 (144-194)||(30633077-30633127)
chr8 (144-194)||(39934413-39934463)
chr8 (143-208)||(8258320-8258385)
chr8 (253-330)||(17884035-17884111)
chr8 (307-356)||(17952629-17952677)
chr8 (238-331)||(21352256-21352348)
chr8 (307-356)||(23053849-23053897)
chr8 (144-208)||(1281882-1281946)
chr8 (142-214)||(17884071-17884143)
chr8 (144-208)||(23053848-23053912)
chr8 (256-336)||(30633229-30633309)
chr8 (308-356)||(36901237-36901284)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (130-356)||(1369872-1370098)
chr6 (135-356)||(15962715-15962937)
chr6 (131-356)||(31132850-31133076)
chr6 (130-356)||(11100353-11100580)
chr6 (131-356)||(9955769-9955995)
chr6 (131-356)||(29646214-29646439)
chr6 (131-356)||(4184235-4184459)
chr6 (143-356)||(27828293-27828511)
chr6 (130-356)||(10777916-10778143)
chr6 (130-356)||(8171874-8172100)
chr6 (131-356)||(16599043-16599269)
chr6 (130-356)||(5187743-5187968)
chr6 (130-317)||(26667838-26668026)
chr6 (130-245)||(15881899-15882014)
chr6 (223-336)||(20755422-20755535)
chr6 (131-215)||(10196604-10196688)
chr6 (142-256)||(11210282-11210396)
chr6 (158-356)||(33730518-33730710)
chr6 (130-215)||(24022877-24022962)
chr6 (158-356)||(4898447-4898642)
chr6 (155-245)||(35001995-35002085)
chr6 (130-356)||(26211252-26211475)
chr6 (130-357)||(15718204-15718430)
chr6 (142-356)||(9406579-9406791)
chr6 (260-356)||(10315306-10315403)
chr6 (158-356)||(18102685-18102881)
chr6 (254-356)||(21969990-21970090)
chr6 (158-356)||(25061652-25061845)
chr6 (158-330)||(14488320-14488490)
chr6 (292-356)||(15882021-15882085)
chr6 (238-356)||(30525434-30525550)
chr6 (144-208)||(4898579-4898643)
chr6 (147-215)||(8062105-8062173)
chr6 (248-346)||(3438083-3438180)
chr6 (158-215)||(4838416-4838473)
chr6 (143-208)||(11010048-11010113)
chr6 (158-356)||(11742319-11742514)
chr6 (163-215)||(33311671-33311723)
chr6 (255-337)||(32889636-32889716)
chr6 (238-356)||(18154541-18154657)
chr6 (238-346)||(4898207-4898315)
chr6 (147-208)||(21970030-21970091)
chr6 (144-208)||(33730517-33730581)
chr6 (130-169)||(20755379-20755418)
chr6 (307-346)||(32194221-32194260)
chr6 (144-194)||(3438126-3438176)
chr6 (307-336)||(3881415-3881444)
chr6 (142-202)||(5703836-5703897)
chr6 (307-356)||(11010064-11010112)
chr6 (144-208)||(4838271-4838335)
chr6 (144-208)||(18154540-18154604)
chr6 (144-208)||(25061651-25061714)
[»] chr7 (80 HSPs)
chr7 (130-356)||(12080699-12080925)
chr7 (130-356)||(15230065-15230290)
chr7 (131-356)||(20516920-20517146)
chr7 (131-356)||(38876139-38876365)
chr7 (131-353)||(45225396-45225619)
chr7 (130-356)||(27811942-27812168)
chr7 (130-356)||(11327596-11327823)
chr7 (130-356)||(14777927-14778151)
chr7 (130-356)||(24720261-24720487)
chr7 (130-353)||(28605445-28605667)
chr7 (142-354)||(14718977-14719188)
chr7 (131-356)||(4655045-4655275)
chr7 (130-356)||(26380046-26380273)
chr7 (130-356)||(48454515-48454742)
chr7 (130-356)||(22479207-22479432)
chr7 (130-325)||(32852888-32853083)
chr7 (130-356)||(8047944-8048166)
chr7 (133-356)||(27597020-27597256)
chr7 (130-356)||(34986526-34986752)
chr7 (130-354)||(14770076-14770301)
chr7 (130-354)||(15220527-15220752)
chr7 (135-327)||(18123057-18123250)
chr7 (130-356)||(7437768-7437996)
chr7 (147-356)||(43711912-43712123)
chr7 (130-356)||(18199568-18199799)
chr7 (130-310)||(37138906-37139087)
chr7 (232-356)||(45225260-45225384)
chr7 (187-354)||(48193155-48193323)
chr7 (130-266)||(33889847-33889983)
chr7 (259-356)||(33889082-33889179)
chr7 (130-275)||(18829775-18829924)
chr7 (158-356)||(938896-939091)
chr7 (158-356)||(25818485-25818681)
chr7 (158-346)||(18352315-18352502)
chr7 (130-213)||(32577713-32577796)
chr7 (161-356)||(41407343-41407535)
chr7 (158-356)||(28912083-28912278)
chr7 (264-356)||(1325335-1325427)
chr7 (158-346)||(9401656-9401842)
chr7 (130-201)||(48193343-48193414)
chr7 (158-356)||(2509321-2509515)
chr7 (180-282)||(32577617-32577719)
chr7 (158-356)||(2936641-2936837)
chr7 (158-356)||(454105-454300)
chr7 (158-356)||(19069397-19069592)
chr7 (159-356)||(27168254-27168448)
chr7 (247-356)||(38367944-38368051)
chr7 (158-356)||(15957214-15957409)
chr7 (158-336)||(2362772-2362946)
chr7 (278-356)||(32577505-32577583)
chr7 (130-357)||(41037358-41037579)
chr7 (172-215)||(17317400-17317443)
chr7 (238-346)||(6736589-6736697)
chr7 (158-328)||(11766149-11766317)
chr7 (248-356)||(6559358-6559464)
chr7 (238-333)||(23740061-23740156)
chr7 (158-346)||(2633892-2634076)
chr7 (144-208)||(938895-938959)
chr7 (144-208)||(2936640-2936704)
chr7 (144-208)||(27168385-27168449)
chr7 (144-208)||(38367988-38368052)
chr7 (147-202)||(3407151-3407206)
chr7 (145-208)||(6559357-6559420)
chr7 (271-330)||(18829697-18829756)
chr7 (158-212)||(6559496-6559550)
chr7 (144-209)||(15957346-15957411)
chr7 (144-208)||(28912082-28912146)
chr7 (144-208)||(41407342-41407406)
chr7 (130-173)||(17327168-17327211)
chr7 (144-194)||(6736643-6736693)
chr7 (144-194)||(7835357-7835407)
chr7 (144-194)||(18352448-18352498)
chr7 (158-317)||(38796823-38796981)
chr7 (144-185)||(23740061-23740102)
chr7 (158-215)||(38367856-38367913)
chr7 (144-208)||(2362752-2362816)
chr7 (144-208)||(2509452-2509516)
chr7 (144-208)||(19069396-19069460)
chr7 (144-208)||(25818484-25818548)
chr7 (238-298)||(27168296-27168356)
[»] chr4 (85 HSPs)
chr4 (130-356)||(6214002-6214229)
chr4 (130-356)||(12584258-12584485)
chr4 (130-353)||(13211837-13212060)
chr4 (130-356)||(5046613-5046839)
chr4 (130-356)||(5157017-5157243)
chr4 (130-356)||(17745167-17745391)
chr4 (130-356)||(42807883-42808110)
chr4 (130-356)||(48560017-48560243)
chr4 (131-356)||(49970614-49970838)
chr4 (130-354)||(50182196-50182418)
chr4 (130-356)||(7630076-7630303)
chr4 (131-356)||(14202843-14203069)
chr4 (130-356)||(13621117-13621343)
chr4 (130-320)||(10216224-10216414)
chr4 (130-356)||(17377512-17377739)
chr4 (130-356)||(30820461-30820688)
chr4 (130-353)||(41172432-41172655)
chr4 (131-356)||(17180969-17181197)
chr4 (131-356)||(578730-578958)
chr4 (130-354)||(51783941-51784167)
chr4 (130-330)||(13371256-13371456)
chr4 (130-330)||(13381457-13381657)
chr4 (130-356)||(21519750-21519977)
chr4 (130-356)||(34683020-34683247)
chr4 (130-356)||(26958558-26958782)
chr4 (130-317)||(30258099-30258286)
chr4 (131-331)||(3818788-3818990)
chr4 (131-356)||(52437410-52437635)
chr4 (223-356)||(10981367-10981500)
chr4 (130-355)||(47382181-47382397)
chr4 (233-356)||(18470276-18470399)
chr4 (223-356)||(13621380-13621513)
chr4 (158-356)||(16553427-16553622)
chr4 (248-356)||(45801823-45801934)
chr4 (158-356)||(26335743-26335938)
chr4 (142-346)||(40496139-40496343)
chr4 (158-342)||(9744146-9744328)
chr4 (158-329)||(49425774-49425943)
chr4 (158-356)||(4712659-4712855)
chr4 (158-356)||(46106676-46106871)
chr4 (158-356)||(52306770-52306965)
chr4 (238-356)||(6137592-6137708)
chr4 (238-356)||(6946647-6946763)
chr4 (130-356)||(38425637-38425861)
chr4 (238-356)||(14862975-14863090)
chr4 (247-356)||(6193058-6193165)
chr4 (144-328)||(15725208-15725391)
chr4 (158-346)||(33105923-33106109)
chr4 (158-346)||(45875770-45875956)
chr4 (224-356)||(6137499-6137630)
chr4 (245-346)||(49606030-49606130)
chr4 (144-208)||(16553426-16553490)
chr4 (164-317)||(20458852-20459004)
chr4 (158-289)||(23383940-23384067)
chr4 (165-280)||(4490741-4490856)
chr4 (224-346)||(33811056-33811177)
chr4 (158-215)||(38425573-38425630)
chr4 (261-346)||(43638988-43639072)
chr4 (248-357)||(54742449-54742556)
chr4 (144-215)||(102246-102318)
chr4 (158-319)||(11777510-11777669)
chr4 (144-208)||(26335742-26335806)
chr4 (144-208)||(52306769-52306833)
chr4 (144-208)||(52437572-52437636)
chr4 (158-282)||(142693-142816)
chr4 (307-354)||(30258349-30258396)
chr4 (158-215)||(13211554-13211611)
chr4 (291-356)||(56532591-56532655)
chr4 (144-208)||(4712658-4712722)
chr4 (144-208)||(6946646-6946710)
chr4 (144-208)||(14862974-14863038)
chr4 (144-208)||(26958557-26958621)
chr4 (175-287)||(43639068-43639181)
chr4 (248-327)||(36955387-36955465)
chr4 (144-191)||(50677961-50678007)
chr4 (248-342)||(578700-578793)
chr4 (158-208)||(6192969-6193019)
chr4 (144-194)||(9744278-9744328)
chr4 (158-208)||(14948269-14948319)
chr4 (144-194)||(43638992-43639042)
chr4 (144-208)||(6193102-6193166)
chr4 (254-346)||(29101996-29102087)
chr4 (144-208)||(38425798-38425862)
chr4 (306-346)||(40496428-40496468)
chr4 (144-192)||(46106691-46106739)
[»] chr1 (90 HSPs)
chr1 (131-356)||(20411168-20411394)
chr1 (130-356)||(16960253-16960479)
chr1 (130-356)||(14494339-14494566)
chr1 (130-358)||(27389473-27389704)
chr1 (131-356)||(36817621-36817847)
chr1 (130-353)||(39424240-39424462)
chr1 (130-351)||(47130907-47131129)
chr1 (131-356)||(27255623-27255849)
chr1 (131-356)||(12864280-12864504)
chr1 (130-356)||(1804976-1805202)
chr1 (130-349)||(13385729-13385949)
chr1 (143-356)||(32716394-32716603)
chr1 (130-328)||(52772216-52772415)
chr1 (130-356)||(43236124-43236359)
chr1 (130-356)||(32374528-32374754)
chr1 (142-356)||(51465010-51465223)
chr1 (231-356)||(14387472-14387597)
chr1 (147-356)||(28094419-28094615)
chr1 (131-282)||(20201759-20201911)
chr1 (248-356)||(13943351-13943459)
chr1 (158-356)||(10764596-10764794)
chr1 (158-356)||(26842998-26843193)
chr1 (158-346)||(16005573-16005760)
chr1 (130-215)||(28646732-28646817)
chr1 (158-356)||(13157557-13157755)
chr1 (130-213)||(27348101-27348183)
chr1 (161-356)||(158417-158610)
chr1 (238-356)||(463392-463508)
chr1 (158-346)||(6192424-6192612)
chr1 (130-333)||(24190751-24190955)
chr1 (130-252)||(12010567-12010692)
chr1 (158-356)||(28454705-28454900)
chr1 (158-331)||(36389459-36389630)
chr1 (238-356)||(34515210-34515326)
chr1 (130-194)||(2965334-2965398)
chr1 (248-356)||(13264531-13264637)
chr1 (248-356)||(27787890-27787996)
chr1 (251-356)||(42199853-42199956)
chr1 (251-356)||(42208721-42208824)
chr1 (130-346)||(14387226-14387440)
chr1 (300-354)||(12010512-12010566)
chr1 (158-356)||(16073438-16073635)
chr1 (130-215)||(50797634-50797720)
chr1 (158-356)||(23413637-23413830)
chr1 (158-356)||(50559250-50559445)
chr1 (224-356)||(5491667-5491797)
chr1 (131-179)||(15660477-15660525)
chr1 (253-357)||(32155982-32156084)
chr1 (148-215)||(3099558-3099625)
chr1 (158-298)||(51431902-51432042)
chr1 (144-346)||(34306425-34306630)
chr1 (247-356)||(47130797-47130905)
chr1 (144-212)||(5491734-5491802)
chr1 (421-473)||(40631217-40631269)
chr1 (166-346)||(4158116-4158294)
chr1 (130-205)||(34825554-34825629)
chr1 (247-356)||(24770718-24770825)
chr1 (158-215)||(45818919-45818976)
chr1 (144-208)||(463445-463509)
chr1 (144-208)||(13157692-13157756)
chr1 (158-210)||(20201700-20201752)
chr1 (144-208)||(27787933-27787997)
chr1 (144-208)||(34515263-34515327)
chr1 (158-209)||(10558212-10558263)
chr1 (144-211)||(16073572-16073639)
chr1 (158-282)||(33676085-33676209)
chr1 (249-356)||(41146250-41146355)
chr1 (238-336)||(3979457-3979554)
chr1 (238-356)||(8642996-8643112)
chr1 (130-215)||(10368056-10368141)
chr1 (158-212)||(32994185-32994239)
chr1 (144-193)||(158547-158596)
chr1 (158-215)||(28704488-28704545)
chr1 (158-210)||(463018-463070)
chr1 (144-208)||(13264530-13264594)
chr1 (144-208)||(26843130-26843194)
chr1 (158-282)||(3273404-3273528)
chr1 (144-194)||(4158240-4158290)
chr1 (144-194)||(6192558-6192608)
chr1 (158-208)||(13157281-13157331)
chr1 (144-194)||(16005577-16005627)
chr1 (276-346)||(33675830-33675899)
chr1 (144-194)||(33675834-33675884)
chr1 (158-215)||(28764549-28764606)
chr1 (158-215)||(41146388-41146445)
chr1 (147-208)||(42199852-42199913)
chr1 (147-208)||(42208720-42208781)
chr1 (256-336)||(28704515-28704595)
chr1 (238-298)||(32151945-32152005)
chr1 (144-208)||(41146249-41146313)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (131-356)||(26025-26251)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (131-356)||(57893-58119)
scaffold0068 (248-342)||(58056-58149)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (130-356)||(452340-452565)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (130-317)||(2767-2955)
scaffold0119 (130-317)||(14822-15010)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (130-215)||(82715-82800)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (158-356)||(9733-9929)
scaffold0015 (144-208)||(9866-9930)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (147-356)||(22604-22813)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (158-356)||(20620-20816)
scaffold0217 (145-208)||(20754-20817)
[»] scaffold0627 (2 HSPs)
scaffold0627 (158-356)||(4060-4254)
scaffold0627 (144-208)||(4059-4123)
[»] scaffold0325 (2 HSPs)
scaffold0325 (158-356)||(6539-6734)
scaffold0325 (147-208)||(6538-6599)
[»] scaffold0778 (1 HSPs)
scaffold0778 (131-199)||(6245-6313)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (142-346)||(5692-5895)
scaffold0418 (306-346)||(5567-5607)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (131-213)||(14872-14954)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (238-346)||(573-680)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (130-209)||(65933-66012)
[»] scaffold1717 (1 HSPs)
scaffold1717 (158-215)||(1381-1437)
[»] scaffold1527 (1 HSPs)
scaffold1527 (158-215)||(1627-1683)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 130 - 584
Target Start/End: Original strand, 1951406 - 1951839
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  1951406 gtttttatgtgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaagaaacaagtgg 1951505  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951506 gtgtgttctagcaaatcctataggcatatgttagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 1951605  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaacatcacagttacatgcaccgtcacagttacatttagttattccaattgatagtggggggataccacaaaacttcc 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||                  |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1951606 accttaaggtgtagctttgctaaaacatca------------------cagttacatttagttagtccaattgataat-gggggataccacaaaacttcc 1951686  T
Q  430 ttgatgatattatctttgggagggtctatg---ctacacttgaaagagaaacatttcaaataatgtaatgtaagctgctgcagacttccaaggaattact 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951687 ttgatgatattatctttgggagggtctatgctactacacttgaaagagaaacatttcaaa-----taacgtaagctgctgcagacttccaaggaattact 1951781  T
Q  527 ttgttattaaatcttgctttgttcctagagtgccaatattaacaagagcagcttggat 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951782 ttgttattaaatcttgctttgttcctagagtgccaatattaacaagagcagcttggat 1951839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 30687888 - 30688114
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  30687888 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 30687987  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30687988 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 30688087  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30688088 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 30688114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 29302078 - 29302304
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||     
T  29302078 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtga 29302177  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29302178 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccgcttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaggtggttaaatac 29302277  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29302278 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 29302304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11448946 - 11448720
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||    
T  11448946 tttttatgtgatagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaacaaaaacaagtgg 11448847  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11448846 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacatccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaatatctaaaaagtggttaaatac 11448747  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11448746 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 11448720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4737005 - 4736782
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||    
T  4737005 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaacaagtgg 4736906  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4736905 gtgtgttatagcaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttattttt---taggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 4736809  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  4736808 accttaagatgtagctttgctaaaaca 4736782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15809185 - 15808958
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  15809185 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttacaacttaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtg 15809086  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15809085 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaaata 15808986  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15808985 caccctaaggtgtagctttgctaaaaca 15808958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 130 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17605254 - 17605031
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  17605254 gtttttatgtaggagtgttttagcaagttataactaaaaatttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 17605155  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17605154 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtaaataactaaaaagtggttaaatac 17605055  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  17605054 acctt-aagtgtagctttgctaaaa 17605031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26906108 - 26905885
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  26906108 gtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa-caagtgg 26906010  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26906009 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacagccacttattttttt--aggagtattttagcaaatgaataactaaaaagttgttaaatac 26905912  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26905911 accctaaggtgtagctttgctaaaaca 26905885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 356
Target Start/End: Original strand, 3960637 - 3960837
Alignment:
Q  156 gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||| |||| |||||||||| ||| | |||    
T  3960637 gttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgctctagcaaatcctacatgca 3960736  T
Q  256 tttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaac 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3960737 tttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaac 3960836  T
Q  356 a 356  Q
    |    
T  3960837 a 3960837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33026442 - 33026215
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtg 228  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  33026442 gttttcatgtgggagtgttttaacaagttacaactaaaaaagttaataaatacatcttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtg 33026343  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33026342 ggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccgacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaaata 33026243  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  33026242 caccctaagatgtagttttgctaaaaca 33026215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 33282468 - 33282248
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||       |||||||     
T  33282468 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaacaagtggg 33282369  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  33282368 tgtgttctagcaaatccaataggcatttgctagaatgcacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaaata-a 33282270  T
Q  331 ccttaaagtgtagctttgctaa 352  Q
     ||||| || ||||||||||||    
T  33282269 acttaaggtatagctttgctaa 33282248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 30667554 - 30667777
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||        |||||     
T  30667554 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttatgactaaaaagttaataaatacaccataagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-aagtga 30667652  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  30667653 gtgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaataca--cacatattttttagaatgagtattttagcaagtgaaaaattaaaaagtgattaaatac 30667750  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || |||| |||||||||||||||||||    
T  30667751 actttaacgtgtagctttgctaaaaca 30667777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 17209847 - 17210072
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaag--ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagt 227  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
T  17209847 gtttttatgtaggagtgttttagcaagttgtaactaaaaagagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagt 17209946  T
Q  228 ggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  17209947 gggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttag---gagtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaat 17210043  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17210044 acaccctaaggtgtagctttgctaaaaca 17210072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1921674 - 1921448
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||         |||||    
T  1921674 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatattgttataacacatcttctaacaaaaataagtg 1921575  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1921574 agtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctcggatacacccacttagtttttaaaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 1921475  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1921474 caccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 1921448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37282393 - 37282200
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  37282393 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaagttaacaaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtg 37282294  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaa 325  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37282293 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaaatacactcacttattttt---taggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 37282200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37249515 - 37249351
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  37249515 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 37249416  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtat 294  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  37249415 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccatttattttttaaaaggagtat 37249351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 33833039 - 33833253
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  33833039 tttttatgtgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaat------------gtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgg 33833126  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33833127 gtgtgttctaacaaatcctatatacatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagttagtgaataactaaaaagtggttaaatac 33833226  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33833227 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 33833253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 268
Target Start/End: Original strand, 17559198 - 17559335
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||     
T  17559198 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggg 17559297  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatac 268  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17559298 tgtgttatagcaaatcctatagacatttgctagaatac 17559335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 354
Target Start/End: Original strand, 27005155 - 27005277
Alignment:
Q  232 gtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 331  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27005155 gtgttctagcaaatcctttagacatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatagac 27005254  T
Q  332 cttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27005255 cttaaggtgtagctttgctaaaa 27005277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1807605 - 1807474
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  1807605 gtttttacatgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatatatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 1807506  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgcta 262  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1807505 -tgtgttccagcaaattctataggcatttgcta 1807474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14795777 - 14795679
Alignment:
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14795777 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataaaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 14795679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30486203 - 30486097
Alignment:
Q  250 taggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgc 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30486203 taggcatttgctaggatacatccacttagtttttagaatgagtattttagcaattgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgc 30486104  T
Q  350 taaaaca 356  Q
    |||||||    
T  30486103 taaaaca 30486097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37468747 - 37468530
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||        ||||||    
T  37468747 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttgataaatacaccttgagttgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaataagtgg 37468648  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtga-ataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     ||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||     |||||    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||     
T  37468647 gtgtatgttagcaaatcctataggaatttgctagaatacaccc-----ttttt----aggagtattttagcaagtgataacactaaaaagtggttaaatg 37468557  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  37468556 caccctaaggtgtagc-ttgctaaaaca 37468530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4083918 - 4083732
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||        |||||| |||    |||||| | |||||||||||    
T  4083918 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtcgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtacgttagcaactcctataggcatt 4083820  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4083819 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgtagctt 4083732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 114
Target Start/End: Original strand, 1951286 - 1951376
Alignment:
Q  25 ctagggagcagca-aggcttgctcacccaaaatataaaggtgttcaaagttaaaccaatattaactaacttatcaacacaaggattccctt 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1951286 ctagggagcagcagaggcttgctcacccaaaatataaaggtgttcaaagttaaatcaatattaactaacttatcaacagaagcattccctt 1951376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7014716 - 7014631
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7014716 gtttttatgtgagagtgttttagcaagctctaactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattct 7014631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14369947 - 14369752
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  14369947 tataactaaaaagttgttaactacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 14369849  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14369848 tgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 14369752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Original strand, 22282186 - 22282270
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22282186 tttttatgtgggagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttct 22282270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4738112 - 4737917
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| |  ||| ||||||    
T  4738112 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactcatatgggcatt 4738014  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4738013 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 4737917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7014614 - 7014513
Alignment:
Q  255 atttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7014614 atttgctagaacacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 7014515  T
Q  355 ca 356  Q
    ||    
T  7014514 ca 7014513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 356
Target Start/End: Original strand, 25912029 - 25912239
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||    
T  25912029 gtgttttaacaacgatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaaggttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagca 25912127  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  25912128 actcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgta 25912226  T
Q  343 gctttgctaaaaca 356  Q
     | |||||||||||    
T  25912227 ac-ttgctaaaaca 25912239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 258 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1797498 - 1797420
Alignment:
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1797498 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 1797420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33696248 - 33696047
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||    
T  33696248 gtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttatggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagca 33696150  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   | ||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33696149 actcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagttatgttttagcatgt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 33696051  T
Q  343 gctt 346  Q
    ||||    
T  33696050 gctt 33696047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38661337 - 38661242
Alignment:
Q  185 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttattt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38661337 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattt 38661242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2528953 - 2528771
Alignment:
Q  154 aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctatagg 253  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | ||||||     
T  2528953 aagttataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataga 2528854  T
Q  254 catttgctagaatacatccacttat-ttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  2528853 catttgctagaatacatccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactgaaaagtagttaaatgcaccttaa 2528771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7944467 - 7944272
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  7944467 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 7944370  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagt-ggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7944369 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaagttaaatacaccttaaagtgtaac-ttgctaaaaca 7944272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 356
Target Start/End: Original strand, 31240268 - 31240441
Alignment:
Q  180 acaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatt 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31240268 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctaggatacacccacttatt 31240366  T
Q  280 tttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  31240367 ttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 31240441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9124884 - 9124706
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  || ||| |||||||||||||    
T  9124884 tataactaaaaatttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttaacaacttctataggcatt 9124785  T
Q  258 tgctagaatacatccacttat-ttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  9124784 tgctagaatacatccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatatttaaatacaccttaa 9124706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 2695084 - 2695283
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaa 243  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  ||||||    
T  2695084 gtgttttagcaaaatataactaaaatgttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaa 2695182  T
Q  244 attctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtag 343  Q
     | ||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2695183 ctcctataggcatttgctaggata-acccacttacattttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtag 2695280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 22701718 - 22701940
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||        ||| ||    
T  22701718 tttttatgtgggagtgttttaacaaagatataactaaaaagttgtgaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagcgg 22701816  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||    |||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |    
T  22701817 gtgtacgttagcaactcttataagcatttgctagaatacacccacttattttt-ggaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgc 22701914  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  22701915 accttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 22701940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28747943 - 28747747
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  28747943 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaagcactccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 28747844  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  28747843 tgctagaatacacccacttaatttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaaca 28747747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31752296 - 31752128
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||| | ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  31752296 tataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatt 31752198  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  31752197 tgctagaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaata 31752128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Original strand, 12910103 - 12910219
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  | ||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12910103 tagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtatgttttagcatgt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 12910201  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12910202 gtgtagc-ttgctaaaaca 12910219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17421889 - 17421688
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| || || | ||||        |||||| ||| |  ||| |    
T  17421889 gtgttttaacaaatatataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaatactcattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagaa 17421791  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||    
T  17421790 actcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccataaggcgta 17421692  T
Q  343 gctt 346  Q
    ||||    
T  17421691 gctt 17421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Original strand, 39548921 - 39549037
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  39548921 tagcaacttctatagccatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaag 39549019  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
     |||||| |||||||||||    
T  39549020 atgtagc-ttgctaaaaca 39549037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6436603 - 6436408
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  6436603 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacaaacattctaaaaaat-aagtggttgtatgttagcaactcctataggcatt 6436505  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| || || | |||||||||| |||||| || ||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6436504 tgctaggattcacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tacaactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 6436408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39038698 - 39038504
Alignment:
Q  160 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttg 259  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||        |||||| | | |  |||||| | ||||| |||||||    
T  39038698 taactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaaataagtgggtctatgttagcaactcctatatgcatttg 39038599  T
Q  260 ctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| ||| | |||||||||||| |||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  39038598 ctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaataaaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 39038504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3038988 - 3038872
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||     
T  3038988 tagcaactcctataggcatttgttaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaag 3038890  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  3038889 gtgtagc-ttgctaaaaca 3038872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 11351791 - 11351877
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11351791 gtttttatgtgggagtgttttagcaaagatataattaaaaagttattgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 11351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 13711033 - 13711230
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  13711033 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 13711132  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttca-gaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||| |||||   ||| |||| ||||| ||||| | |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13711133 tgctagaatacacccactttttttttttgaatgagtgttttagcaagtta-taatcaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 13711230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4151148 - 4151093
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4151148 tataactaaaaaattaataaatacatcttgaggtgtatgttgctataacacacctt 4151093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 858070 - 858013
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  858070 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 858013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 32736440 - 32736383
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32736440 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 32736383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 17232918 - 17233109
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||        || || |||| |  |||||| | |||||||||||    
T  17232918 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaagcacaccttctaaaaaat-aaatgaatgtatgttagcaactcctataggcatt 17233016  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||| |  ||||||||||    || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17233017 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaat-tataactaaaa----gtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 17233109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 25912176 - 25912240
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  25912176 gtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 25912240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4737980 - 4737916
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  4737980 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 4737916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 6260993 - 6261164
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  6260993 tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacctt-ttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 6261091  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 331  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||| |||||| | |||||||||||    
T  6261092 tgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataattaaaaaatagttaaatacac 6261164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10951230 - 10951040
Alignment:
Q  163 ctaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgcta 262  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||         |||||| ||| |  |||||| | ||||||||||||| ||    
T  10951230 ctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttctaaaacacacattcgaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgata 10951132  T
Q  263 gaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
     |||||| | |||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  10951131 taatacacctacttattttttataaggtgtgttttagcaagt-tatatctaaaaagtagctaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 10951040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14369815 - 14369751
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  14369815 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 14369751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 22800642 - 22800814
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |        |||||| ||| |  |||||| | ||| || ||||    
T  22800642 tataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctacaacactccttttaaaaaaagaagtgggtgtatgttagcaactcctacagacatt 22800741  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||    
T  22800742 tgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagctaaatacac 22800814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 356
Target Start/End: Original strand, 8410698 - 8410815
Alignment:
Q  237 ctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    ||||||| | |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| | || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||| | || ||||    
T  8410698 ctagcaactcctataaacatttgctaggatacatcaacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaacatacattaa 8410796  T
Q  337 agtgtagctttgctaaaaca 356  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  8410797 ggtgtagc-ttgctaaaaca 8410815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 214
Target Start/End: Original strand, 25593287 - 25593354
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttc 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  25593287 ttttagcaagttataactaaaaagtggataattacaccttaaggtgtgagttgctaaaagacaccttc 25593354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4083786 - 4083736
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  4083786 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgta 4083736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Original strand, 17233353 - 17233469
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||  || ||||| ||| |  |||| |||||||| ||||||||| ||||||     
T  17233353 tagcaactcctataggcatttgctagaacacactcacttattttttagaagttgtgttttaccaaat-tataattaaaaagtagttaaatactccttaag 17233451  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  17233452 gtgtaac-ttgctaaaaca 17233469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Original strand, 22213127 - 22213176
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  22213127 ataattaaaaagtggttaaatacaccctaaattgtagctttgttaaaaca 22213176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3038935 - 3038871
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  3038935 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacac 3038871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 22701877 - 22701941
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  22701877 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 22701941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 31240378 - 31240442
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  31240378 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaacac 31240442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39038567 - 39038503
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  39038567 gtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaaataaaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 39038503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3039069 - 3038999
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttc 214  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  3039069 gtgttttaacaaagatataactaaaaa-ttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc 3038999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 12910157 - 12910220
Alignment:
Q  145 tgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  12910157 tgttttagcatgttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 12910220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27005150 - 27005107
Alignment:
Q  133 tttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaata 176  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27005150 tttatgtgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaata 27005107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 40234209 - 40234272
Alignment:
Q  145 tgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  40234209 tgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtagtttgctaaaacac 40234272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4151050 - 4150976
Alignment:
Q  253 gcatttgctagaatacatccacttatttttc-agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 326  Q
    |||| |||||||||||  | ||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4151050 gcatatgctagaatactccaacttatttttttaaaaagagtattttaacaagtgaataactaaaaagtgattaaa 4150976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 208
Target Start/End: Original strand, 13711165 - 13711231
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  13711165 gagtgttttagcaagttataatcaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 13711231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38661243 - 38661209
Alignment:
Q  322 ttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38661243 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 38661209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 336
Target Start/End: Original strand, 6260994 - 6261023
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6260994 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 6261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7944336 - 7944271
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagtta-ataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  7944336 gtgttttagcaagttataactaaaaagtaagttaaatacaccttaaagtgtaacttgctaaaacac 7944271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17210195 - 17210139
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  17210195 tataactaaaaagttg-taaatacaccttaaggtgaatgttggtaaaacacacattct 17210139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33832898 - 33832841
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  33832898 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaacgtttctaaaacacaccttct 33832841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Original strand, 40234223 - 40234271
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  40234223 ataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtag-tttgctaaaaca 40234271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6436471 - 6436407
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  6436471 gtgttttagcaagttacaactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacac 6436407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10951103 - 10951039
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  10951103 gtgttttagcaagttatatctaaaaagtagctaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacac 10951039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28747810 - 28747746
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  28747810 gtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccctaaggtgtagcttgctaaaacac 28747746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 39548974 - 39549038
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||  |||||| |||||    
T  39548974 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatataccttaagatgtagcttgctaaaacac 39549038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7848747 - 7848521
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||    
T  7848747 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 7848648  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7848647 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 7848548  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7848547 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 7848521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 6748624 - 6748850
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  6748624 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 6748723  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6748724 gtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttcttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 6748823  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6748824 accttaaggtgtaactttgctaaaaca 6748850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6115001 - 6114775
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  6115001 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 6114902  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6114901 gtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatac 6114802  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6114801 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 6114775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11460370 - 11460144
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||     
T  11460370 gtttttatgtgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtga 11460271  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11460270 gtgtgctctagcaaatcctataggcatttgctagaatgcacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 11460171  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11460170 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 11460144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Original strand, 995002 - 995230
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||    
T  995002 gtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaacaagtgg 995101  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccactta-tttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  995102 gtatgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaaccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaata 995201  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaacat 357  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  995202 caccataaggtgtagctttgctaaaacat 995230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8815551 - 8815326
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  8815551 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 8815452  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815451 gtgtgttttagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttt-agaaggagtattttcgcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 8815353  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8815352 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 8815326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47461915 - 47461688
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  47461915 gtttttatgtgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctattaaaattaagtg 47461816  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47461815 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 47461716  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47461715 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 47461688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7521578 - 7521352
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  7521578 tttttatgtgggagtattttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 7521479  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7521478 gtgtattctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaagaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 7521379  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7521378 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 7521352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21727865 - 21727639
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||    
T  21727865 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttataaaaaaagcaagtgg 21727766  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21727765 gtgtgttctagcaaatcctacaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatac 21727666  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21727665 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 21727639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 131 - 357
Target Start/End: Original strand, 994697 - 994924
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||| |||     
T  994697 tttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaaaaaaacaattggg 994796  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  994797 tgtgttctaccaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaataca 994896  T
Q  331 c-cttaaagtgtagctttgctaaaacat 357  Q
    | || |  ||||||||||||||||||||    
T  994897 ctctaagggtgtagctttgctaaaacat 994924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12896858 - 12896631
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  12896858 gtttttatgtggaagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtg 12896759  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12896758 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttaatttttggaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 12896659  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12896658 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 12896631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 6109139 - 6109365
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  6109139 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgg 6109238  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6109239 gtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccatttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 6109338  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6109339 accttaaggtgtagcgttgctaaaaca 6109365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 133 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4043853 - 4043622
Alignment:
Q  133 tttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtggat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |    
T  4043853 tttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggt 4043754  T
Q  232 gtgttctagc-------aaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggtta 324  Q
    |||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4043753 gtgttctaacttctaacaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 4043654  T
Q  325 aatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4043653 aatacaccttaaggtgtagatttgctaaaaca 4043622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38798200 - 38797972
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn--caagt 227  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||         |||||    
T  38798200 gtttttatgcgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaagtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaaaacaagt 38798101  T
Q  228 ggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38798100 gggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaaatacatccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggttaaat 38798001  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| |||| || |||||||| |||||||    
T  38798000 acacattaaggtatagctttgttaaaaca 38797972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 45059506 - 45059733
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||         |||||    
T  45059506 gtttttatgtgggagtgttttaacaggttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgttataacacacattctaacaaaaataagtg 45059605  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45059606 ggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 45059705  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  45059706 cactttaaggtgtagctttgctaaaaca 45059733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 162 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37504729 - 37504535
Alignment:
Q  162 actaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgct 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  37504729 actaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgtt 37504630  T
Q  262 agaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37504629 agaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 37504535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 347
Target Start/End: Original strand, 26152171 - 26152389
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||      
T  26152171 gtttttatgtgagagtgttttagctagttataactaaaaagttaataaatataccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagca 26152270  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26152271 ggtgtgttctatcaaatcctataggcatttggtaagatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 26152370  T
Q  329 caccttaaagtgtagcttt 347  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  26152371 caccttaaggtgtagcttt 26152389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 356
Target Start/End: Original strand, 51147993 - 51148212
Alignment:
Q  137 tgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtggatgtgt 235  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| |||||    
T  51147993 tgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaagaaacaagtgggtgtgt 51148092  T
Q  236 tctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctta 335  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51148093 tctagcaaatcctataga-atttgctagaacgcacccacttattttttagaatgagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaactta 51148191  T
Q  336 aagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  51148192 aggtgtagctttgctaaaaca 51148212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51952421 - 51952222
Alignment:
Q  132 ttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||     
T  51952421 ttttatgtgaaagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtggg 51952322  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccactta-tttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  51952321 tgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaataggttaaatac 51952222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17065946 - 17065720
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||       |||||||    
T  17065946 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaagaagttaataaatacgtcttaaggtgtatgttattataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 17065847  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17065846 gtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatgtacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatac 17065747  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||  ||  ||||||||||||||||||    
T  17065746 acccgaagatgtagctttgctaaaaca 17065720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27728414 - 27728185
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacac--cttctnnnnnnnc-aag 226  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||         |||    
T  27728414 gttttaatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacacaccttctaacaaaaataag 27728315  T
Q  227 tggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 326  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27728314 tgggtgtgttttagcaaatcctataggcatttgcttagatacacccacttagtttttagaaggaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 27728215  T
Q  327 tacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27728214 tacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 27728185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 356
Target Start/End: Original strand, 26158254 - 26158433
Alignment:
Q  178 atacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26158254 atacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 26158353  T
Q  277 atttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26158354 attttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaaca 26158433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3544508 - 3544282
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||         ||||||    
T  3544508 gtttttatgtaagagtgttttagcaaattataactaaaaagataataaatacatcttaaggtgtatgttgatataacacg--ttcaaaaataaacaagtg 3544411  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttc-agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  3544410 ggtgtattctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaagaattaaaaagtggttaaat 3544311  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  3544310 acaccctaaggtgtagctttactaaaaca 3544282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 131 - 269
Target Start/End: Original strand, 26152485 - 26152624
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  26152485 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 26152584  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaataca 269  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26152585 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaataca 26152624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52654534 - 52654387
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||      
T  52654534 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgag 52654435  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  52654434 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctaaaatacacccacttat 52654387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 356
Target Start/End: Original strand, 2868232 - 2868364
Alignment:
Q  224 aagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggtt 323  Q
    |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2868232 aagtgggtgttttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagtgaataaataaaaagtggtt 2868331  T
Q  324 aaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2868332 aaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 2868364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 256
Target Start/End: Original strand, 3269208 - 3269333
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||     
T  3269208 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggg 3269307  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcat 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3269308 tgtgttctagcaaatcctataggcat 3269333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27800667 - 27800458
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |        ||||||    
T  27800667 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaagtgtatgttgctataacacaccttgtaacaaaaacaagtg 27800568  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| |                  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27800567 ggtgtgttctagcaaatcc------------------tacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 27800486  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  27800485 caccttaagatgtaactttgctaaaaca 27800458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 356
Target Start/End: Original strand, 17226270 - 17226375
Alignment:
Q  251 aggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgct 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17226270 aggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgct 17226369  T
Q  351 aaaaca 356  Q
    ||||||    
T  17226370 aaaaca 17226375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 30347748 - 30347833
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30347748 gtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 30347833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Original strand, 17226177 - 17226261
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17226177 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 17226261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13349320 - 13349125
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | | |||||||||    
T  13349320 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactccaataggcatt 13349222  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  13349221 tgctaggatacacccacttattttttagaaggcgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtggagc-ttgctaaaaca 13349125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 345
Target Start/End: Original strand, 1376004 - 1376190
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  1376004 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 1376103  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagct 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  1376104 tgctaggatacatccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatatacctgaaggtgtagct 1376190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 284 - 356
Target Start/End: Original strand, 21408611 - 21408683
Alignment:
Q  284 agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21408611 agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 21408683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48649514 - 48649428
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaataca-ccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48649514 gtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacatctttgaggtgtatgttgctataacacacattct 48649428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 53581744 - 53581549
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  53581744 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 53581646  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  53581645 tgctaagatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 53581549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27317745 - 27317629
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  27317745 tagcaactcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaag 27317647  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  27317646 gtgtagc-ttgctaaaaca 27317629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 33837816 - 33838016
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  33837816 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 33837915  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaag---tgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| |||||| || ||||| ||||   | | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33837916 tgctaggatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 33838014  T
Q  355 ca 356  Q
    ||    
T  33838015 ca 33838016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Original strand, 53467358 - 53467534
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||| | ||| |  |||||| |  | ||||||||    
T  53467358 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacacacattctaaaatat-aagttggtgtatgttagcaactcatgtaggcatt 53467456  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53467457 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaa 53467534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Original strand, 31039643 - 31039759
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  31039643 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaag 31039741  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31039742 gtgtagc-ttgctaaaaca 31039759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 42856946 - 42857007
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 191  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42856946 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 42857007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3800382 - 3800186
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||        |||||| ||| |  || |||  |||||| |||||    
T  3800382 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttaacaacatctataagcatt 3800284  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaagga-gtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| ||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3800283 ttctaggatacacccacttattttttagaaggttgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 3800186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8814963 - 8814768
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| ||||||| |||||    
T  8814963 tataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaacttctataagcatt 8814865  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||  || | |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8814864 tgctagaatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagt-tatgattaaaaagtagttcaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 8814768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12127726 - 12127562
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  12127726 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 12127628  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggtta 324  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| || ||  ||||||||||||| ||||    
T  12127627 ttctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcatgt-tataactaaaaagtagtta 12127562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27360195 - 27359987
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||    
T  27360195 gtgttttaacaaagatataactaaaaagttattaaatacaccttagagtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagca 27360097  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||  |||||| |||||| |||||||  ||||||| || ||    
T  27360096 actcctata-gcatttgctagaatacatccacttattttttataaggtgtgttttagcaagt-tataact-aaaagtagttaaatgtaccttaaggtata 27360000  T
Q  343 gctttgctaaaaca 356  Q
    || |||||||||||    
T  27359999 gc-ttgctaaaaca 27359987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50801759 - 50801589
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||        || ||  ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  50801759 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaataaa-tgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 50801661  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  50801660 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 50801589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Original strand, 50874121 - 50874291
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||        || ||  ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  50874121 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaataaa-tgagtgtatgttagcaactcctataggcatt 50874219  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  50874220 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 50874291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48649400 - 48649332
Alignment:
Q  286 aaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  48649400 aaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtggtcaaatacaccttatgatgtagctttgctaaaa 48649332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36824050 - 36823945
Alignment:
Q  249 ataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttg 348  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36824050 ataggcatttgctagaatacaagaacttgttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttg 36823953  T
Q  349 ctaaaaca 356  Q
    ||||||||    
T  36823952 ctaaaaca 36823945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 188
Target Start/End: Original strand, 52945472 - 52945529
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaa 188  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52945472 tttttatgtgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatataccttaa 52945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54244806 - 54244749
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54244806 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 54244749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 22894888 - 22894952
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  22894888 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 22894952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32203249 - 32203144
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagcttt 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  32203249 tataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactagaaagtagttaaatgca-cttaaggtgtagc-tt 32203153  T
Q  348 gctaaaaca 356  Q
    |||||||||    
T  32203152 gctaaaaca 32203144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3269555 - 3269498
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3269555 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 3269498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Original strand, 34277589 - 34277684
Alignment:
Q  261 tagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaacat 357  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  34277589 tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaacg-ataactaaaaaaatggttaaatacactctaaggtgtag-tttgctaaaacat 34277684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 50913007 - 50913202
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||        || ||| ||| |  |||||| | ||| |||||||    
T  50913007 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacatattctaaaaaataaa-tgggtgtatgttagcaactcctacaggcatt 50913105  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||   |||  ||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  50913106 tgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagggagt-tataactaaaaagtagttaaatgtaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 50913202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3800249 - 3800185
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  3800249 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 3800185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 31039696 - 31039760
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  31039696 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 31039760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 48765316 - 48765406
Alignment:
Q  255 atttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| || |||||  |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  48765316 atttgctaaaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagtaagtta-taactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagctt 48765406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Original strand, 22894903 - 22894951
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22894903 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 22894951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 356
Target Start/End: Original strand, 26103734 - 26103817
Alignment:
Q  271 ccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  26103734 ccacttattttttagaaggtgtcttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 26103817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 202
Target Start/End: Original strand, 48765188 - 48765261
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcta 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  48765188 gtttttatgtgggagtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgcta 48765261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13349188 - 13349140
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg 192  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13349188 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 13349140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17604969 - 17604922
Alignment:
Q  308 taactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17604969 taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 17604922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27317692 - 27317628
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  27317692 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 27317628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36824008 - 36823944
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  36824008 gtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 36823944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 53581612 - 53581548
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  53581612 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacac 53581548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Original strand, 53467490 - 53467537
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  53467490 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 53467537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7521608 - 7521515
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||  |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  7521608 tatagggatttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtattttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 7521515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17605658 - 17605528
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||        ||||||  || |  |||||| | ||||| |||||    
T  17605658 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttttaaaacacatcttctaaaaaat-aagtgggggtatgttagcaactcctatatgcatt 17605560  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaagg 289  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17605559 tgctaggatacacccacttattttttagaagg 17605528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 27360064 - 27360137
Alignment:
Q  224 aagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtatttta 298  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  27360064 aagtggatgtattctagcaaatgctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 27360137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Original strand, 29239601 - 29239651
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29239601 tataactaaaaagctgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 29239651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 334
Target Start/End: Original strand, 53455514 - 53455589
Alignment:
Q  255 atttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctt 334  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  53455514 atttgctagcgtacatccacttattttttag---gagtatttgagcaagttaa-aactaaaaagtggttacatacacctt 53455589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Original strand, 22894554 - 22894606
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacac 210  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22894554 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacac 22894606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32203363 - 32203299
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 193  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  32203363 gtttttatgtcggagtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgt 32203299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Original strand, 50912957 - 50913037
Alignment:
Q  256 tttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50912957 tttgctaggatacacccactaatttttatgtgggagtattttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 50913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 51148132 - 51148081
Alignment:
Q  224 aagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccactt 276  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  51148132 aagtgggtgcgttctagcaaattctatagg-atttgctagaacacacccactt 51148081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 39906254 - 39906480
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  39906254 tttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 39906353  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906354 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 39906453  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39906454 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 39906480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44543071 - 44542845
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  44543071 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 44542972  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  44542971 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaggagtggttaaatac 44542872  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44542871 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 44542845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38987182 - 38986955
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  38987182 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtg 38987083  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38987082 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttacattttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaattggttaaata 38986983  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  38986982 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 38986955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 30406445 - 30406671
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  30406445 gtttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgg 30406544  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30406545 gtgtgttctagcaaatcctataggcacttgctacaatacacccacttattttttagatggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatac 30406644  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30406645 accctaaggtgtagctttgctaaaaca 30406671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 6332261 - 6332486
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||     
T  6332261 tttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggg 6332360  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6332361 tgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtagttaaataca 6332460  T
Q  331 ccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  6332461 ccctaaggtgtagctttgctaaaaca 6332486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 130 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 39904877 - 39904653
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  39904877 gtttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtg 39904778  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39904777 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaata 39904678  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaa 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  39904677 caccttaaggtgtagctttgctaaa 39904653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 7681989 - 7682214
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||    
T  7681989 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaagaagtgg 7682088  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7682089 gtgtattttagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccactttttttt-agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 7682187  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7682188 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 7682214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 22301963 - 22302188
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||    
T  22301963 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacct-aaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgg 22302061  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22302062 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattgtttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 22302161  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22302162 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 22302188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 20939694 - 20939920
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||       |||||||    
T  20939694 gtttttatgtggaagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgcatgttgctataacacactttctaaataaacaagtgg 20939793  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20939794 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 20939893  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  20939894 atcttaaggtgtagctttgctaaaaca 20939920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 9689359 - 9689586
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  9689359 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtg 9689458  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9689459 agtgtattctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaattactaaaaagtggttaaata 9689558  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9689559 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 9689586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 4293188 - 4293414
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||    
T  4293188 gtttttatgtaagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaacaagtgg 4293287  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  4293288 gtgtgttatagcaaattatataggtatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtgattaaatac 4293387  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  4293388 accctaagatgtagctttgctaaaaca 4293414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 22711017 - 22711243
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        || |||    
T  22711017 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaataaatgg 22711116  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22711117 gtgtgttataacaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagtaaataaataactaaaaagtggttaaatac 22711216  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22711217 accttaaggtgtagctttgttaaaaca 22711243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44257682 - 44257454
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn--caagt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||    
T  44257682 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaagcaagt 44257583  T
Q  228 ggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    || ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44257582 gggtgtgttctaacaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttcaat 44257483  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44257482 acaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 44257454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2586602 - 2586377
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |     
T  2586602 tttttatgtgggattgttttagcaagttataactaaaaaactaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagttgg 2586503  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2586502 tgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataacaaaaaagtggttaaataca 2586403  T
Q  331 ccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  2586402 ccctaaggtgtagctttgctaaaaca 2586377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33173719 - 33173495
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||     
T  33173719 tttttatgtgggagtgttgtagcaagttataactaaaaagttaataaataaaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaat-aagtggg 33173621  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33173620 tgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaataca 33173521  T
Q  331 ccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  33173520 ccctaatgtgtagctttgctaaaaca 33173495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 356
Target Start/End: Original strand, 15554012 - 15554232
Alignment:
Q  136 atgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgt 235  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||       ||| ||| |||||    
T  15554012 atgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttcctataacacacattctaaaaaaacaaatgggtgtgt 15554111  T
Q  236 tctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctta 335  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15554112 tctagcaaatcctattgacatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagttattaaatacacctta 15554211  T
Q  336 aagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  15554212 aagtgtaactttgctaaaaca 15554232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 159 - 354
Target Start/End: Original strand, 9690171 - 9690366
Alignment:
Q  159 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||    
T  9690171 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcttataggcattt 9690270  T
Q  259 gctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  9690271 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaaatcaataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgttaaaa 9690366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 324973 - 325098
Alignment:
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  324973 tgtgttctagcaaattttataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaataca 325072  T
Q  331 ccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| |||||||||||||||||||    
T  325073 ccataaggtgtagctttgctaaaaca 325098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3769787 - 3769653
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  3769787 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 3769688  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctaga 264  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3769687 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 3769653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3769552 - 3769453
Alignment:
Q  254 catttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaa 353  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3769552 catttgctagaacacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 3769453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 34082566 - 34082761
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  34082566 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 34082664  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34082665 tgctaggatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 34082761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 11675151 - 11675347
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  11675151 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 11675249  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttc-agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11675250 tgctaggatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 11675347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 19630736 - 19630821
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19630736 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttct 19630821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 19827637 - 19827722
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19827637 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttct 19827722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Original strand, 1297586 - 1297746
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagc 241  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||  |||||||||||    
T  1297586 gagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaataaaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttctagc 1297685  T
Q  242 aaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaa 317  Q
    |||            | ||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1297686 aaa------------tcgctagaatacaaccacttattttt---taggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 1297746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 304
Target Start/End: Original strand, 33739546 - 33739691
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  33739546 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 33739644  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  33739645 tgctagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt 33739691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 42850015 - 42850210
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||         | ||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  42850015 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaagaataga-tgggtgtatgttagcaattcctataggcatt 42850113  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42850114 tgctagaatacatccacttattttttaaaaagtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaagtgtagc-ttgctaaaaca 42850210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13002138 - 13002033
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13002138 tagcaactcctataggcatttgctaaaatacaccctcttattttttagaaggagtgttttagcaagtg-ataactaaaaagtggttaaatacaccctaag 13002040  T
Q  338 gtgtagc 344  Q
    |||||||    
T  13002039 gtgtagc 13002033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1750411 - 1750189
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||         ||||||    
T  1750411 tttttaagtgagagtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttc-caaaaaataagtgg 1750313  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||| |  |||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||| |    
T  1750312 -tgtatgttagcaactcctacatgcatttgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagtagttaaatgc 1750215  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1750214 accttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 1750189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16513266 - 16513074
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  16513266 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 16513168  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||    ||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16513167 tgctaggatacacccacttattttt---taggtgtatgttagcaaat-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 16513074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Original strand, 8741636 - 8741705
Alignment:
Q  287 aggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  8741636 aggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatatactttaaggtgtagctttgctaaaaca 8741705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 336
Target Start/End: Original strand, 17265358 - 17265446
Alignment:
Q  247 ctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  17265358 ctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatg-ataactaagaagtagttaagtacaccttaa 17265446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 356
Target Start/End: Original strand, 18370216 - 18370426
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||        |||||| ||| |  ||| |    
T  18370216 gtgttttaacaaagatataactaaaaaattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagaa 18370314  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    | |  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18370315 actcttatagtcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 18370413  T
Q  343 gctttgctaaaaca 356  Q
     | |||||||||||    
T  18370414 ac-ttgctaaaaca 18370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16075237 - 16075044
Alignment:
Q  159 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcattt 258  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||| | ||| |  |||||| | || |||||||||    
T  16075237 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aagttggtgtatgttagcaactcctgtaggcattt 16075139  T
Q  259 gctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaac 355  Q
     |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  16075138 actaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacacattaaggtgtagc-ttgctaaaac 16075044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Original strand, 37169556 - 37169741
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |        |||||| ||| |  ||||||    ||||||||||    
T  37169556 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacactccttttaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaacccatataggcatt 37169653  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||||||| || ||||||||| | |||| |  ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  37169654 tgctagaatacaccctcttattttttaaaaggtgcgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctt 37169741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23234130 - 23234048
Alignment:
Q  274 cttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  23234130 cttattttttagaaggggtactttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacatcctgaggtgtagctttgctaaaaca 23234048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29512193 - 29512075
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttc--agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctta 335  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||   |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29512193 tagcaacttctatagacatttactaggatacacccacttattttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtggttaaatacacttta 29512095  T
Q  336 aagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  29512094 aggtgtagc-ttgctaaaaca 29512075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 336
Target Start/End: Original strand, 23664827 - 23664924
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23664827 tagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaatacactttaa 23664924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 194
Target Start/End: Original strand, 324728 - 324793
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324728 gtttttatgtgggagtgttttaacaaaaatataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 324793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23387337 - 23387153
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||    
T  23387337 gtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatcttgttaaaacacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagca 23387239  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
    | | |||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  23387238 actcctatagacatttgttaggatacacctacttattttttagaaggtgtatcttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatac 23387153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 212
Target Start/End: Original strand, 45629706 - 45629790
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaac--aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacct 212  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  45629706 gtttttatgtgggagtgtttttaccaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacacct 45629790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 11675284 - 11675351
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacc 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  11675284 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacacacc 11675351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29404046 - 29403954
Alignment:
Q  253 gcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  29404046 gcatttgctaaaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaaatg-ataactaaaaaatggttcaatgcaccctaaggtgtagctt 29403954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 29511950 - 29512022
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29511950 gtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttct 29512022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 34082698 - 34082762
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  34082698 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 34082762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 173
Target Start/End: Original strand, 23175376 - 23175419
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagtta 173  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23175376 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagtta 23175419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23387185 - 23387118
Alignment:
Q  149 ttaacaagttataactaaaaagttaataaatac-accttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  23387185 ttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacgaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 23387118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 173
Target Start/End: Original strand, 23586633 - 23586676
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagtta 173  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23586633 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagtta 23586676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 768740 - 768568
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgct-ataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcat 256  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| | || |||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | ||||||||||    
T  768740 tataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaaatacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 768642  T
Q  257 ttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 331  Q
    ||||||  ||||| | |||||||||| |||||| |  ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  768641 ttgctacgatacaccaacttattttttagaaggtgcgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacac 768568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 1576652 - 1576709
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  1576652 tataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacaccttct 1576709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 8386696 - 8386753
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  8386696 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactccttct 8386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41088905 - 41088820
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| | || ||  ||| |||||||||||||||    
T  41088905 gtttttatatgggagtgttttaacaagatataattagaaagttgataaatataccttgacgtatacattgttataacacaccttct 41088820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 18370363 - 18370427
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  18370363 gtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 18370427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29512138 - 29512074
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  29512138 gtgttttagcaagttataactaaaaagtggttaaatacactttaaggtgtagcttgctaaaacac 29512074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 42850147 - 42850211
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||  |||||| |||||    
T  42850147 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaagtgtagcttgctaaaacac 42850211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13002217 - 13002167
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  13002217 tataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggtgaatgttgctaaaacac 13002167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 180
Target Start/End: Original strand, 17264913 - 17264963
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaata 180  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17264913 gtttttatgtaggagtgttttagcaaattataactaaaaagttgataaata 17264963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 346
Target Start/End: Original strand, 8386777 - 8386885
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccactta-tttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||   | ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8386777 tagcaactcctatatgcatttgctagaatacacccacttatttttttacaagatatgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaa 8386875  T
Q  337 agtgtagctt 346  Q
      ||||||||    
T  8386876 gatgtagctt 8386885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10137287 - 10137254
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10137287 ataactaaaaagtggttaaatacacattaaagtg 10137254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1750252 - 1750188
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  1750252 gtgttttagtaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 1750188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13002087 - 13002035
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  13002087 gagtgttttagcaagtgataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgta 13002035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Original strand, 37169689 - 37169737
Alignment:
Q  146 gttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  37169689 gttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgta 37169737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 91)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 130 - 354
Target Start/End: Original strand, 9483622 - 9483846
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  9483622 gtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatagacattaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 9483721  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483722 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 9483821  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  9483822 accttaaggtgtagctttgctaaaa 9483846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 328
Target Start/End: Original strand, 1782975 - 1783173
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  1782975 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 1783074  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1783075 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtgttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 1783173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 142 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14826503 - 14826289
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagc 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| | |||||||||||    
T  14826503 gagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtaggtgtgttctagc 14826404  T
Q  242 aaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgt 341  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14826403 aaatcctataagcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgaatatttttgcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgt 14826304  T
Q  342 agctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||||||    
T  14826303 agctttgctaaaaca 14826289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19971655 - 19971429
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||    
T  19971655 gtttttatgttggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgg 19971556  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19971555 gtgtgttctaacaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatac 19971456  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19971455 accctaaggtgtagctttgctaaaaca 19971429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 21442102 - 21442327
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  21442102 tttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgg 21442201  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21442202 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaataca-ccacttgttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 21442300  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21442301 accttaaggtgtagatttgctaaaaca 21442327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 31071527 - 31071752
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||    
T  31071527 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgtcgctataacacaccttctaaaaaa-caagtgg 31071625  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31071626 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatac 31071725  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31071726 accctaaggtgtagctttgctaaaaca 31071752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 30577841 - 30578068
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaag-tg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         || ||    
T  30577841 gtttttatgtgagagtgttttagcaagttataactgaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataggtg 30577940  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30577941 ggtgtgttctagcaaattctataggcatttgctaggatacacccgcttattttttagaatgagtattttagcaggtgaataactaaaaagtggttaaata 30578040  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30578041 caccataaggtgtagctttgctaaaaca 30578068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 151 - 356
Target Start/End: Original strand, 21021179 - 21021384
Alignment:
Q  151 aacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctat 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  21021179 aacaagttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctat 21021278  T
Q  251 aggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgct 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21021279 aggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgct 21021378  T
Q  351 aaaaca 356  Q
    ||||||    
T  21021379 aaaaca 21021384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 41942832 - 41943055
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||    
T  41942832 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccctaaggtgtatcttgctataacacaccttctaaaaaa-caagtgg 41942930  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41942931 g-gtgttctagcaaatcctataggcatt-gctagaatacacccacttattttttaggaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 41943028  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||    
T  41943029 actttaaggtgtaactttgctaaaaca 41943055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5642706 - 5642518
Alignment:
Q  160 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||| |||     ||||||| |||||||||||||    
T  5642706 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataacaagtgggtgt-----agcaaatcctataggcatttg 5642612  T
Q  260 ctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||| |||||| ||||   | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5642611 ctagaatacacccacttttttt---gtaggagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaaca 5642518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5644647 - 5644459
Alignment:
Q  160 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||| |||     ||||||| |||||||||||||    
T  5644647 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataacaagtgggtgt-----agcaaatcctataggcatttg 5644553  T
Q  260 ctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||| |||||| ||||   | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5644552 ctagaatacacccacttttttt---gtaggagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaaca 5644459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 244
Target Start/End: Original strand, 14819281 - 14819394
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  14819281 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaacacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgga 14819380  T
Q  231 tgtgttctagcaaa 244  Q
    ||||||||||||||    
T  14819381 tgtgttctagcaaa 14819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3154293 - 3154165
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  3154293 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 3154194  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcattt 258  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||    
T  3154193 gtgtgttctagcaaatcttataggcattt 3154165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1775620 - 1775535
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1775620 gtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 1775535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4018760 - 4018675
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4018760 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 4018675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 25280969 - 25281054
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25280969 gtttttatgtgagagtgttttaacaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttct 25281054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 27545762 - 27545957
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  27545762 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatt 27545860  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  27545861 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtag-attgctaaaaca 27545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 25281053 - 25281149
Alignment:
Q  260 ctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25281053 ctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtgcttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 25281149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13468496 - 13468309
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  13468496 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 13468397  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||  |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||    
T  13468396 tgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatactccttaaggtatagctt 13468309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 10616293 - 10616488
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  10616293 tataactaaaaagttgttaaatatacattaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 10616391  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10616392 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtag-tttgctaaaaca 10616488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13269429 - 13269233
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||  ||||    
T  13269429 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 13269330  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  13269329 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 13269233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26043135 - 26042940
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||        |||||| ||| |  || ||| | |||||||||||    
T  26043135 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaatacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttaacaactcctataggcatt 26043037  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26043036 tgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 26042940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 34103002 - 34103197
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| |||||||||| ||    
T  34103002 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaacttctataggcttt 34103100  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  34103101 tgctatgatacatccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatacactttaacgtgtagc-ttgctaaaaca 34103197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Original strand, 1201671 - 1201857
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  1201671 tataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 1201769  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| || ||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1201770 tgctaggatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaatta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt 1201857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30633259 - 30633073
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| ||||| | |||||    
T  30633259 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtttgttagcaacttctacatgcatt 30633161  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  30633160 tgctagaatacacccatttaatttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagctt 30633073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21442469 - 21442395
Alignment:
Q  235 ttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaata 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21442469 ttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaata 21442395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 32069024 - 32069217
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  32069024 tataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 32069122  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32069123 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataact--aaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 32069217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32487042 - 32486926
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32487042 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaagtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaa 32486944  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  32486943 gtgcagc-ttgctaaaaca 32486926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2823796 - 2823601
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        || ||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  2823796 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aattgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 2823698  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  2823697 tgctaggatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagc-ttgctaaaaca 2823601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 3369714 - 3369908
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  3369714 tatagctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 3369812  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3369813 tgctaggatacacccacttattttt-aaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 3369908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8258516 - 8258321
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  8258516 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattccttataaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 8258418  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8258417 tgctagaatacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaaat-tataaccaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 8258321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 354
Target Start/End: Original strand, 10776977 - 10777168
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  10776977 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatt 10777076  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||   | || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10777077 tgctaagatacatccacttattttttag---gtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgtag-tttgctaaaa 10777168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35550786 - 35550591
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  35550786 tataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacactttctaaaatat-aagtgggtgtatattagcaactcctataggcatt 35550688  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| |||||  ||||||||||| |||| | || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35550687 tgctaggatacactcacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 35550591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 264 - 356
Target Start/End: Original strand, 42556441 - 42556532
Alignment:
Q  264 aatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  42556441 aatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatc-ttgctaaaaca 42556532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 18804309 - 18804380
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18804309 gtgttttaacaagttataattaaaaagttgataaatacaccttgaggtgtatgttgctataagacaccttct 18804380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1281999 - 1281883
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||     
T  1281999 tagcaacttctataggcatttggtagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaatgtagttaaatacactttaag 1281901  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  1281900 gtgtaac-ttgctaaaaca 1281883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5946981 - 5946786
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||| ||||||    
T  5946981 tataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgttgaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatcggcatt 5946882  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  5946881 tgctaggataca-ccacttattttttagaagatgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 5946786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2178776 - 2178705
Alignment:
Q  284 agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2178776 agaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacacctt-aagtgtaggtttgctaaaaca 2178705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 179 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29125883 - 29125709
Alignment:
Q  179 tacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttat 278  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  29125883 tacaccttaaggtgaatgttactaaaacacaccttctaagaaat-aagtgggtgtatcttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacctat 29125785  T
Q  279 ttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||  ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29125784 tttttggaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 29125709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3154168 - 3154105
Alignment:
Q  293 attttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3154168 attttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagttttgctaaaaca 3154105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 25127843 - 25128068
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||         |||||    
T  25127843 tttttatgtgggagtgttttagcaaaaatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaaaccttctaaaaaaaataagtg 25127942  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||| |  |||||| | ||| || |||||||||||||||   |||||| |||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||     
T  25127943 ggtgtatgttagcaactcctacagacatttgctagaatactctcacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatg 25128041  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25128042 caccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 25128068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21352471 - 21352398
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21352471 gagtgttttaacaagttataactaaaaattcgataaatacacattaaggtgtatgttgttataacacacattct 21352398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26868115 - 26867931
Alignment:
Q  161 aactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgc 260  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||        |||||  ||| |  |||||| | |||||||||||| |    
T  26868115 aactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgccaaaacacaccttcttaaaaattaagtgcgtgtatgttagcaactcctataggcatttac 26868016  T
Q  261 tagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    || || ||| |||||||||||  |||||| || ||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26868015 tataacacacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagtta-tatctaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctt 26867931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9484115 - 9483936
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  9484115 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatt 9484016  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaag 338  Q
    || ||  ||| | |||||||||||| |||||  || ||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9484015 tgttaagatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaaag 9483936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 346
Target Start/End: Original strand, 13290470 - 13290684
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   || || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||        ||||||    
T  13290470 tttttatgtgggagtgttttagcaaaaataaaattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacagacattctaaaaaat-aagtgg 13290568  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
    |||| |  |||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |    
T  13290569 atgtatgttagcaactcttacatgcatttgttagaatacatccacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgc 13290667  T
Q  330 accttaaagtgtagctt 346  Q
    || |||| |||||||||    
T  13290668 actttaaggtgtagctt 13290684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Original strand, 30207169 - 30207292
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  30207169 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccatctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 30207267  T
Q  258 tgctagaatacatccacttattttt 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  30207268 tgctagaatacacccacttattttt 30207292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 185
Target Start/End: Original strand, 42556394 - 42556449
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacacct 185  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42556394 gtttttacgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacacct 42556449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 184108 - 184304
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  ||||||    ||||| ||||    
T  184108 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaacccatatagacatt 184206  T
Q  258 tgctagaatacatccactta-tttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||| |||| | || |||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  184207 tgctaggatacacccacttatttttttagaatgtgtgttttaataagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 184304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23544987 - 23544847
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  23544987 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 23544888  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtatttta 298  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  23544887 tgttagaatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 23544847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 333
Target Start/End: Original strand, 25123380 - 25123553
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||        || ||| ||| |  ||||||   |||||| ||||    
T  25123380 tataactaaaaaattgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaataaa-tggttgtatgttagcaacgcctatagacatt 25123478  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25123479 tgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcacct 25123553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7090025 - 7089968
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7090025 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 7089968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 17691217 - 17691274
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17691217 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 17691274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Original strand, 25123633 - 25123718
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaaca-agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  25123633 tttttatgtgggagtgttttagcatagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 25123718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 26630031 - 26630088
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26630031 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 26630088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 346
Target Start/End: Original strand, 18804870 - 18804977
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| || ||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  18804870 tagcaacttttatagccatttgttagaataaacccacatattttttagaaggactattttaacaaatga-taactaaaaagtagttaagtacaccttaag 18804968  T
Q  338 gtgtagctt 346  Q
    || ||||||    
T  18804969 gtatagctt 18804977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Original strand, 32512124 - 32512230
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagcttt 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||| |||| ||||| ||| ||| ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  32512124 tataggcatttgctataatacatttatttattttttagaatgagtgttttagcaaatga-taaataaaaaatagttaaatacatcttaaagtgtagc-tt 32512221  T
Q  348 gctaaaaca 356  Q
    |||||||||    
T  32512222 gctaaaaca 32512230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 304
Target Start/End: Original strand, 36899739 - 36899886
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacac--cttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggca 255  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | ||||| |||    
T  36899739 tataactaaaaagttgttaaatacacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatacgca 36899837  T
Q  256 tttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagt 304  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  36899838 tttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt 36899886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39934516 - 39934413
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||| |||     
T  39934516 tagcaactcctacaggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaggtagttaaatacaccctaag 39934418  T
Q  338 gtgta 342  Q
    |||||    
T  39934417 gtgta 39934413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Original strand, 42556684 - 42556739
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 213  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42556684 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctt 42556739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 9413810 - 9414005
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||        |||||||||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  9413810 tataactaaaaaattgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaactcaccttctaacaaat-aagtggatgtatgttagcaactcctatagacatt 9413908  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||  | ||||| |||||  |||| |||||||| | | |||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  9413909 tgctagaatacatctacttattttttaaaaggtatgttttagcaagt-tataattaaaaagtcggtgaatataacttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 9414005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 184241 - 184305
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  184241 gtgttttaataagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 184305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26043003 - 26042939
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26043003 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 26042939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 27545894 - 27545958
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  27545894 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagattgctaaaacac 27545958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29125772 - 29125708
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  29125772 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 29125708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35550654 - 35550590
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  35550654 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 35550590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9869641 - 9869574
Alignment:
Q  289 gagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||    
T  9869641 gagtattttagcatgtaaataactaaaaagtggttaaatacacctttacgtgtatctttcataaaaca 9869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45299774 - 45299659
Alignment:
Q  166 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaa 265  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| | ||||||| |  |||||||||||||||| |    
T  45299774 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgctagcaactcttataggcatttgctagga 45299676  T
Q  266 tacatccacttattttt 282  Q
    |||| ||||||||||||    
T  45299675 tacacccacttattttt 45299659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 1201803 - 1201853
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1201803 gtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 1201853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23161401 - 23161318
Alignment:
Q  271 ccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||| | || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  23161401 ccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgtagc-ttgctaaaaca 23161318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39922469 - 39922412
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  39922469 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 39922412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2823664 - 2823600
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  2823664 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagcttgctaaaacac 2823600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 3369845 - 3369909
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  3369845 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagcttgctaaaacac 3369909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5946849 - 5946785
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  5946849 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaacac 5946785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 10616425 - 10616489
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  10616425 gtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagtttgctaaaacac 10616489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13269296 - 13269232
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  13269296 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 13269232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23161381 - 23161317
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  23161381 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgtagcttgctaaaacac 23161317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 25128005 - 25128069
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  25128005 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 25128069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 32512038 - 32512105
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32512038 tttttatgtgcgagtgttttaatatattataattaaaaagttgataaataca-cttgaggtgtatgttg 32512105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 10777107 - 10777157
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10777107 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgta 10777157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30633127 - 30633077
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  30633127 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 30633077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39934463 - 39934413
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||    
T  39934463 gtgttttaacaagttataactaaaaggtagttaaatacaccctaaggtgta 39934413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8258385 - 8258320
Alignment:
Q  143 agtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  8258385 agtgttttagcaaattataaccaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 8258320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 330
Target Start/End: Original strand, 17884035 - 17884111
Alignment:
Q  253 gcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  17884035 gcatttgttaaaatacatccacttattttttagaatgagtgttttaacacgt-cataactaaaaagtagctaaataca 17884111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17952677 - 17952629
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  17952677 ataactaaaaagtagttaaatacaccctaaaatgtagc-ttgctaaaaca 17952629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21352348 - 21352256
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 331  Q
    |||||| |||| || |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |||| |||||| | ||||| |||||    
T  21352348 tagcaacttctgtaagcatatgctataatacacccacttattttttagaaggggtattttaacaaatg-ataattaaaaaatagttaagtacac 21352256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23053897 - 23053849
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23053897 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagc-ttgctaaaaca 23053849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1281946 - 1281882
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  1281946 gtgttttagcaagttataactaaaatgtagttaaatacactttaaggtgtaacttgctaaaacac 1281882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 17884071 - 17884143
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttc 214  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||| |  |||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  17884071 gagtgttttaacacgtcataactaaaaagtagctaaatacatccaaaggtgcatgttgctaaaacacatcttc 17884143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23053912 - 23053848
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  23053912 gtgttttagcaagatataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagcttgctaaaacac 23053848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30633309 - 30633229
Alignment:
Q  256 tttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30633309 tttgctaggatacacccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 30633229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 356
Target Start/End: Original strand, 36901237 - 36901284
Alignment:
Q  308 taactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  36901237 taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 36901284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 1369872 - 1370098
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||    
T  1369872 gtttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 1369971  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1369972 gtgtgttctaacaaatcctatagacatttgctagaatacatccatttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 1370071  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1370072 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 1370098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 356
Target Start/End: Original strand, 15962715 - 15962937
Alignment:
Q  135 tatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtggatgt 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||    
T  15962715 tatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgt 15962814  T
Q  234 gttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15962815 gttctagcaaattctataggcattttctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgtataactaaaaagtggttaaatacacct 15962914  T
Q  334 taaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  15962915 taaggtgtagctttgctaaaaca 15962937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 31132850 - 31133076
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||        |||||||    
T  31132850 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctatagcacaccttctagaaaaagcaagtgg 31132949  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132950 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 31133049  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31133050 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 31133076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 11100353 - 11100580
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||    
T  11100353 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtg 11100452  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11100453 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 11100552  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11100553 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 11100580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 9955769 - 9955995
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||    
T  9955769 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgg 9955868  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9955869 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatac 9955968  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9955969 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 9955995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29646439 - 29646214
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  29646439 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaa-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 29646341  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29646340 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 29646241  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29646240 accttaaggtgtagctttgttaaaaca 29646214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 4184235 - 4184459
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||        |||||||    
T  4184235 tttttatgtgagagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt--acgttgttataacgcaccttctaaaaaaaacaagtgg 4184332  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4184333 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 4184432  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4184433 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 4184459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 143 - 356
Target Start/End: Original strand, 27828293 - 27828511
Alignment:
Q  143 agtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataa----cacaccttctnnnnnnn-caagtggatgtgttc 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||        ||||||| |||||||    
T  27828293 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttc 27828392  T
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27828393 tagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 27828492  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27828493 gtgtagctttgctaaaaca 27828511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 10777916 - 10778143
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  10777916 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtg 10778015  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10778016 ggtgtgttctaacaaatcctatagacatttgctaggatacacccacttggtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgtttaaata 10778115  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10778116 caccttaagatgtagctttgctaaaaca 10778143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8172100 - 8171874
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||    
T  8172100 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaacaagtgg 8172001  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  8172000 gtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaacagtggttaaatac 8171901  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||  |||  | ||||||||||||||||    
T  8171900 actctaagttatagctttgctaaaaca 8171874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 16599043 - 16599269
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |    
T  16599043 tttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagttg 16599142  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||    
T  16599143 gtgtgttttagtgaatcctataggcatttactagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagttaataaatac 16599242  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16599243 accttaaggtgtagctttggtaaaaca 16599269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 5187743 - 5187968
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||    
T  5187743 gtttttatgtaggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataagtgg 5187842  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5187843 gtgtgttctagcaaaacctacaggcatttgctagaatacacccacttattttttagattgagtattttaacaaatgaataactaaaaagtgattaaatac 5187942  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  5187943 acc-taagatgtagatttgctaaaaca 5187968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 317
Target Start/End: Original strand, 26667838 - 26668026
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||        ||||||    
T  26667838 gtttttatatggaagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtg 26667937  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaa 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  26667938 ggtgtgttctagcaaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 26668026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 245
Target Start/End: Original strand, 15881899 - 15882014
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  15881899 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaacaagtgg 15881998  T
Q  230 atgtgttctagcaaat 245  Q
     |||||||||||||||    
T  15881999 gtgtgttctagcaaat 15882014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Original strand, 20755422 - 20755535
Alignment:
Q  223 caagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggt 322  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20755422 caagtgaatgtgttctagcaaatcctatagacgtttgctagaatacacgcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 20755521  T
Q  323 taaatacaccttaa 336  Q
    ||||||||||||||    
T  20755522 taaatacaccttaa 20755535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10196688 - 10196604
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10196688 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttct 10196604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 11210282 - 11210396
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagc 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| || ||||||||    
T  11210282 gagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgcgttctagc 11210381  T
Q  242 aaattctataggcat 256  Q
    |||| ||||||||||    
T  11210382 aaatcctataggcat 11210396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33730710 - 33730518
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        ||| | ||||    |||||| | |||||||||||    
T  33730710 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagagtatgt----tagcaactcctataggcatt 33730615  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33730614 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 33730518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24022962 - 24022877
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24022962 gtttttatgtaggagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 24022877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 4898447 - 4898642
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  4898447 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 4898545  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4898546 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 4898642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35002085 - 35001995
Alignment:
Q  155 agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||| |||||||||||||||    
T  35002085 agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaacaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat 35001995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 26211252 - 26211475
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||| || ||||        || |||    
T  26211252 gtttttatgtgggagtgttttagtaagttatagctaaaaagttgataaatacacctcggggcgtatgttgctataacatacgttctaaaaaataaa-tgg 26211350  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||| |  |||||| |  | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||||||| || || |||    
T  26211351 gtgtatgttagcaattcttgtaggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaaatg-ataattaaaaagtagtcaagtac 26211449  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26211450 accttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 26211475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15718430 - 15718204
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtg 228  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| | |||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||    
T  15718430 gtttttatgtgggagtgttgtagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacattttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaattaagtg 15718331  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | |||    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||     
T  15718330 ggtgtaagttagcaactcctataggcatttgttagaatacatccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaatg 15718232  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaacat 357  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15718231 caccttaaggtgtagc-ttgctaaaacat 15718204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9406791 - 9406579
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagc 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |  ||||||||||||        || | | ||| |  ||||    
T  9406791 gagtgttttagcaagttataactaaaaagttgataaatacactttgaggtgcatgttgttgcaacacaccttctaaaaaaataaataggtgtatattagc 9406692  T
Q  242 aaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgt 341  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||| | | |||| ||||||||    
T  9406691 aattcctatatgcatttgctagaatacacccacttattgtttacaatgagtgtttcagcaagtgaa-aactaaaaagtagttcagtgcaccataaagtgt 9406593  T
Q  342 agctttgctaaaaca 356  Q
    ||| |||||||||||    
T  9406592 agc-ttgctaaaaca 9406579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 260 - 356
Target Start/End: Original strand, 10315306 - 10315403
Alignment:
Q  260 ctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaa-taactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10315306 ctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaaataactaaaaggttgttaaatacaccctaatgtgtagctttgctaaaaca 10315403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18102881 - 18102685
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |        |||| | ||| |   ||||| |||||||||||||    
T  18102881 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaaataagttggtgtatgtcagcaacttctataggcatt 18102782  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  18102781 tgctatgatacacccacttattttttagaatgtgtattttagcaagt-tataactaaagagtagttaaatacaccttcaggtgtagc-ttgctaaaaca 18102685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 356
Target Start/End: Original strand, 21969990 - 21970090
Alignment:
Q  254 catttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaa 353  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  21969990 catttgctagaatacatctacttattttttataaggtgtattttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaa 21970087  T
Q  354 aca 356  Q
    |||    
T  21970088 aca 21970090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25061845 - 25061652
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  25061845 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaag-tgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 25061748  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| | |||||||| | |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  25061747 tgctaggatacaccaacttatttgttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaataca-tttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 25061652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14488490 - 14488320
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||        |||||  ||| |  |||||| |  ||||||||||    
T  14488490 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactcattctaaaaaat-aagtgagtgtatgttagcaactcatataggcatt 14488392  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  14488391 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 14488320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 15882021 - 15882085
Alignment:
Q  292 tattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  15882021 tattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcataaggtgtagctttgttaaaaca 15882085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Original strand, 30525434 - 30525550
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |  | ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  30525434 tagcaactcctataggcatttgctagaatacactcacttattttttagaaagtatgttttagcaaat-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 30525532  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  30525533 gtgcagc-ttgctaaaaca 30525550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 4898579 - 4898643
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  4898579 gtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 4898643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Original strand, 8062105 - 8062173
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  8062105 ttttaacaagttataattaaaaagtgaataaatacactttcacgtgtatgttgctaaaacaaaccttct 8062173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 346
Target Start/End: Original strand, 3438083 - 3438180
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||| | || ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3438083 tataggcatttgcaaggatatacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt 3438180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4838473 - 4838416
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  4838473 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttct 4838416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 11010048 - 11010113
Alignment:
Q  143 agtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  11010048 agtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacac 11010113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11742514 - 11742319
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  11742514 tataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgtattttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 11742416  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| ||| ||| ||||   |||| || ||||| || ||  ||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11742415 tgctaggatacacccatttaattttttaaaggtgtgttttagcaggt-tataactaaaaaatagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 11742319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 33311671 - 33311723
Alignment:
Q  163 ctaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  33311671 ctaaaaaattaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacatcttct 33311723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 337
Target Start/End: Original strand, 32889636 - 32889716
Alignment:
Q  255 atttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||    ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32889636 atttgctagaatacacccacttattttttaaaagaagtattttaacaaagatataact--aaagtggttaaatacaccttaaa 32889716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18154657 - 18154541
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||  ||| || || ||||| ||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||     
T  18154657 tagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttatagacggtgtgttttagcaagtta-taacaaaaaaatagttaaatacaccttaag 18154559  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  18154558 gtgtagc-ttgctaaaaca 18154541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 346
Target Start/End: Original strand, 4898207 - 4898315
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttca-gaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||| || ||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |     
T  4898207 tagcaactcctataggcatttgctagaatacactcacttattttttattaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaattgttaaatacacctcat 4898305  T
Q  337 agtgtagctt 346  Q
     |||||||||    
T  4898306 ggtgtagctt 4898315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 21970030 - 21970091
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  21970030 ttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaacac 21970091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33730581 - 33730517
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  33730581 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 33730517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 169
Target Start/End: Original strand, 20755379 - 20755418
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaa 169  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20755379 gtttttatgcgggagtgttttaacaagttataactaaaaa 20755418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32194260 - 32194221
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32194260 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt 32194221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 3438126 - 3438176
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3438126 gtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 3438176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3881444 - 3881415
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3881444 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 3881415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Original strand, 5703836 - 5703897
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcta 202  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  5703836 gagttttttaacaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtagatgttgcta 5703897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Original strand, 11010064 - 11010112
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  11010064 ataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 11010112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4838335 - 4838271
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  4838335 gtgttttagcaagttataactaaaaaatacttagatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 4838271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18154604 - 18154540
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  18154604 gtgttttagcaagttataacaaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 18154540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25061714 - 25061651
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||  |||||| |||||    
T  25061714 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaataca-tttaaggtgtagcttgctaaaacac 25061651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12080925 - 12080699
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  12080925 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgg 12080826  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12080825 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacac 12080726  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12080725 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 12080699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15230290 - 15230065
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||    
T  15230290 gtttttatgtg-gagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaacaagtgg 15230192  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15230191 gtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacac 15230092  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15230091 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 15230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20517146 - 20516920
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  20517146 tttttatgtgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtgg 20517047  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20517046 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatac 20516947  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20516946 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 20516920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 38876139 - 38876365
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  38876139 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgg 38876238  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38876239 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 38876338  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  38876339 atcttaaggtgtagctttgttaaaaca 38876365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 131 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45225619 - 45225396
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||        |||||||    
T  45225619 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaagcaagtgg 45225520  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45225519 gtgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatac 45225420  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaa 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  45225419 accttaaggtgtagctttgctaaa 45225396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27812168 - 27811942
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||    
T  27812168 gtttttatatgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaaaaaacaagtgg 27812069  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27812068 gtgtgttctagcaaatcctgtaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtagttaaatac 27811969  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27811968 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 27811942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11327823 - 11327596
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  11327823 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtg 11327724  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327723 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 11327624  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  11327623 caccttaaggtatagctttgctaaaaca 11327596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14778151 - 14777927
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||||||    
T  14778151 gtttttatgtg-gagtgttttagcaagttataactaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaacaagtgg 14778054  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14778053 gtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacac 14777954  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14777953 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 14777927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24720487 - 24720261
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||        || |||    
T  24720487 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccattaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaaataaatgg 24720388  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24720387 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatac 24720288  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24720287 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 24720261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28605667 - 28605445
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||    
T  28605667 gtttttatgagagaatgttttagcaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacataccttctaaaaaa-caagtgg 28605569  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28605568 gtgtgttttagcaaattctataggtatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacac 28605469  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaa 353  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    
T  28605468 accttaaggtgtagctttactaaa 28605445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 354
Target Start/End: Original strand, 14718977 - 14719188
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||    
T  14718977 gagtgttttagcaagttataactaaaattttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagc 14719076  T
Q  242 aaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgt 341  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14719077 aaatcctataggcatttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacctt-aagtgt 14719175  T
Q  342 agctttgctaaaa 354  Q
    |||||||||||||    
T  14719176 agctttgctaaaa 14719188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4655275 - 4655045
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataa----cacaccttctnnnnnnn-caa 225  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||        |||    
T  4655275 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctagaaaaagcaa 4655176  T
Q  226 gtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaa 325  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4655175 gtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctaaaatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 4655076  T
Q  326 atacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4655075 atacatcttaaggtgtagctttgctaaaaca 4655045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 26380046 - 26380273
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||    
T  26380046 gtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtatatgtttctataacacaccttctaacaaaaacaagtg 26380145  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26380146 aatgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccgcttagtttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 26380245  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26380246 caacttaaggtgtaactttgctaaaaca 26380273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 48454515 - 48454742
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||        ||||||    
T  48454515 gtttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagataataaatacaccttaaggtatatgttgatataacacaccttctaaaataaacaagtg 48454614  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  48454615 ggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtggttaaatg 48454714  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  48454715 caccctaaggtgtagctttgctaaaaca 48454742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22479432 - 22479207
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||        |||||||    
T  22479432 gtttttatgtgggtgtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataggacaccttcgaaaaaaacaagtgg 22479333  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22479332 gtgtgttctatcaaatcctatatacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaattc 22479233  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||    
T  22479232 accct-aagtgtagctttgctaaaaca 22479207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32853083 - 32852888
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  32853083 gtttttatgtgggaatgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 32852984  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaa 325  Q
     |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32852983 gtgtgttatagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 32852888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 8047944 - 8048166
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||     
T  8047944 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataagtg- 8048042  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
       |||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8048043 ---tgttatagcaaatcctacagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatac 8048139  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8048140 accctaaggtgtagctttgctaaaaca 8048166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27597256 - 27597020
Alignment:
Q  133 tttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatg 232  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||    
T  27597256 tttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtg 27597157  T
Q  233 tgttctagcaaattctatagg-------------catttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagt 319  Q
    ||||||||||||| |||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  27597156 tgttctagcaaatcctataggcatttcctatagacatttgctagaatacatccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagt 27597057  T
Q  320 ggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27597056 ggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 27597020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34986752 - 34986526
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |         |||||    
T  34986752 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagataataaatacaccttaaggtgtatgttgatataacacaccttataaaataaataagtg 34986653  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34986652 aatgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtggttaaata 34986553  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  34986552 cacc-taaagcgtaactttgctaaaaca 34986526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 130 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14770301 - 14770076
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||     
T  14770301 gtttttatatgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtga 14770202  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtg-aataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||||     
T  14770201 gtgtgttatagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagtgaaataattaaaaggtgattaaatg 14770102  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  14770101 caccctaaggtgtagttttgctaaaa 14770076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 130 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15220752 - 15220527
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||     
T  15220752 gtttttatatgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtga 15220653  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtg-aataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||||     
T  15220652 gtgtgttatagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagtgaaataattaaaaggtgattaaatg 15220553  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  15220552 caccctaaggtgtagttttgctaaaa 15220527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 135 - 327
Target Start/End: Original strand, 18123057 - 18123250
Alignment:
Q  135 tatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtggatgt 233  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||    
T  18123057 tatgtgggagtgttttaccaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctgacaaaagcaagtgggtgt 18123156  T
Q  234 gttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18123157 gttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaat 18123250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 7437768 - 7437996
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagtta-taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagt 227  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  7437768 gtttttatgtgggagtattttagtaagtgaataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaaaacaagt 7437867  T
Q  228 ggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  7437868 gggtgtgttatagtaaatcctataggcatttgctagaatacacccaattattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaac 7437967  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7437968 ccaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 7437996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 147 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43712123 - 43711912
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaag-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaat 245  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||    
T  43712123 ttttagcaagttataattaaaaaaattaataaatatagtttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat 43712024  T
Q  246 tctataggcatttgctagaatacatccacttatttttc-agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagc 344  Q
     |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  43712023 actatatacatttgctagaatatacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaagtgtagt 43711924  T
Q  345 tttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||    
T  43711923 tttgctaaaaca 43711912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18199799 - 18199568
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||    
T  18199799 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactacaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaacttctataaaaaacaagtg 18199700  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatac----atccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggtta 324  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |   ||   |  | |    | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18199699 ggtgtgttctagcaaatcctatagactagtgggtgtgttctataacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 18199600  T
Q  325 aatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18199599 aatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 18199568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Original strand, 37138906 - 37139087
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         |||||    
T  37138906 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtg 37139005  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataa 310  Q
    | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37139006 ggtgtgttctaacaaatcctatagacatttgctaaaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataa 37139087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 232 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45225384 - 45225260
Alignment:
Q  232 gtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45225384 gtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatacac 45225285  T
Q  332 cttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  45225284 cttaaggtgtagctttgctaaaaca 45225260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48193323 - 48193155
Alignment:
Q  187 aaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcag 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  48193323 aaggtgtatgttgctataacacatcttctaataaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttag 48193224  T
Q  286 aaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  48193223 aaggagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccccaagatgtagctttgctaaaa 48193155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33889983 - 33889847
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||    
T  33889983 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaaacaagtgg 33889884  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaat 266  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33889883 gtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaat 33889847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33889179 - 33889082
Alignment:
Q  259 gctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33889179 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaggggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 33889082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18829924 - 18829775
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct----nnnnnnncaa 225  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||    
T  18829924 gtttttatatgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaaaaataa 18829825  T
Q  226 gtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccact 275  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18829824 gtgggtgcgttctagcaaattctataagcatttgctagaacacatccact 18829775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 939091 - 938896
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  939091 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaagt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 938993  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  938992 tgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 938896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25818681 - 25818485
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  25818681 tataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 25818582  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25818581 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 25818485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Original strand, 18352315 - 18352502
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  18352315 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 18352414  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18352415 tgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagctt 18352502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32577796 - 32577713
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 213  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32577796 gtttttatgtgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 32577713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41407535 - 41407343
Alignment:
Q  161 aactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgc 260  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  41407535 aactaaaaagttgttatatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgc 41407437  T
Q  261 tagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41407436 tagaatacacccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaatgtgtagc-ttgctaaaaca 41407343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28912278 - 28912083
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||| ||||||    
T  28912278 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatgggcatt 28912180  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  28912179 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggcgtagc-ttgctaaaaca 28912083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 356
Target Start/End: Original strand, 1325335 - 1325427
Alignment:
Q  264 aatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  1325335 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaaatgcacgttaagatgtagctttgctaaaaca 1325427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Original strand, 9401656 - 9401842
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  9401656 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 9401754  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||| || ||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  9401755 tgctagaatacacccacttattttttagatggtgtgttttagcatgt-tataattaaaaagtagttaaatataccttaaggtgtagctt 9401842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48193414 - 48193343
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgct 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48193414 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgct 48193343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 2509321 - 2509515
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  || ||| | ||||| |||||    
T  2509321 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaagaat-aagtgggtgtatgttaacaactcctatatgcatt 2509419  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2509420 tgctagaatacacccacttattttt-agaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtggttaaatgtaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 2509515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32577719 - 32577617
Alignment:
Q  180 acaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32577719 acaccttaaggtgtatgttgctataacacgccttccaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttatt 32577620  T
Q  280 ttt 282  Q
    |||    
T  32577619 ttt 32577617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2936837 - 2936641
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtggatgtgttctagcaaattctataggcat 256  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||         |||||| ||| |  |||||| | |||| |||||    
T  2936837 tataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaactcctattggcat 2936739  T
Q  257 ttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  2936738 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 2936641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 454300 - 454105
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| || ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  454300 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 454202  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  454201 tgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaagt-tttaactaaaaagtagttaattacaccttaagatgtagc-ttgctaaaaca 454105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19069592 - 19069397
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| | | |  |||||| | ||||||  |||    
T  19069592 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtgggtttatgttagcaactcctatagctatt 19069494  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  |||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19069493 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataattaaaaactagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 19069397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 356
Target Start/End: Original strand, 27168254 - 27168448
Alignment:
Q  159 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattc-tataggcatt 257  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| | ||| ||||| | |||||| | |    
T  27168254 ataattaaaaagttcttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatcctaccaaatgcctatagg-agt 27168351  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27168352 tgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 27168448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 356
Target Start/End: Original strand, 38367944 - 38368051
Alignment:
Q  247 ctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |    
T  38367944 ctataggcatttgctagaatacagccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-t 38368041  T
Q  347 tgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||    
T  38368042 tgctaaaaca 38368051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 15957214 - 15957409
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  || ||| | |||||| ||||    
T  15957214 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaacgttgctaaaacacaccttctaaaaat--aagtgggtgtatgttaacaactcctatagacatt 15957311  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttc-agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||  |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15957312 tgctaggatacaccaacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 15957409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2362946 - 2362772
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||        |||||||||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  2362946 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatt 2362847  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||    ||| || ||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2362846 tgctaggatacacccacttattttt---taggtgtgttttagcaagt-tatcactaaaaagtagttaaatacaccttaa 2362772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32577583 - 32577505
Alignment:
Q  278 tttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  32577583 ttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagttgttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaaaca 32577505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 41037579 - 41037358
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||    | |||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||     
T  41037579 gtttttatgtgggagtgtttta----gatataacgaaaaatttgttatatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtga 41037484  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||    |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||| | || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |    
T  41037483 gtgtaagttagcaactcctataggcatttgctaaaatacacccagttatatttaagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatgc 41037385  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaacat 357  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41037384 accttaaggtgtagc-ttgctaaaacat 41037358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17317443 - 17317400
Alignment:
Q  172 taataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17317443 taataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 17317400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 346
Target Start/End: Original strand, 6736589 - 6736697
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccactta-tttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6736589 tagcaactcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaagtacaccttaa 6736687  T
Q  337 agtgtagctt 346  Q
     |||||||||    
T  6736688 ggtgtagctt 6736697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11766317 - 11766149
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||        ||||||| || |  |||||| |  |||| |||||    
T  11766317 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aagtggacgtatgttagcaactcttatatgcatt 11766219  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11766218 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaata 11766149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6559464 - 6559358
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagcttt 347  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||  |||| |  | ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6559464 tataggcatttgctataatacacccgcttattttatagaatgtatgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-tt 6559367  T
Q  348 gctaaaaca 356  Q
    |||||||||    
T  6559366 gctaaaaca 6559358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23740156 - 23740061
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttc-agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacct 333  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23740156 tagcaactcctataggcatttgttagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtggttaaatacacct 23740061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Original strand, 2633892 - 2634076
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| | || || |||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  2633892 tataacgaaaaagttgttaaatacaccttacgatgaatattgctaaaacacacattctagaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 2633991  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    ||| || ||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  2633992 tgctagaatacacctacttattttt---taggtgtgttttagcaagt-tataaccaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagctt 2634076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 938959 - 938895
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  938959 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 938895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2936704 - 2936640
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  2936704 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 2936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 27168385 - 27168449
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  27168385 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 27168449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 38367988 - 38368052
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  38367988 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 38368052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3407206 - 3407151
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcta 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  3407206 ttttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttgaagtgtgtgttgcta 3407151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6559420 - 6559357
Alignment:
Q  145 tgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  6559420 tgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 6559357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18829756 - 18829697
Alignment:
Q  271 ccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18829756 ccacttatttttttaaaagagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 18829697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6559550 - 6559496
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacct 212  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6559550 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct 6559496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 15957346 - 15957411
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacaca 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  15957346 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacaca 15957411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28912146 - 28912082
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  28912146 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggcgtagcttgctaaaacac 28912082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41407406 - 41407342
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  |||||| |||||    
T  41407406 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaatgtgtagcttgctaaaacac 41407342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17327211 - 17327168
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagtta 173  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17327211 gtttttatgtgggagtattttagcaagttataactaaaaagtta 17327168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 6736643 - 6736693
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  6736643 gtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaagtacaccttaaggtgta 6736693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 7835357 - 7835407
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  7835357 gtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgta 7835407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 18352448 - 18352498
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  18352448 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 18352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 317
Target Start/End: Original strand, 38796823 - 38796981
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| | ||  | ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  38796823 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaagcattcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 38796922  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaa 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||| | |||| || ||||| |||||  |||||||||||    
T  38796923 tgctagaatacacccgcttattttttaaaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 38796981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23740102 - 23740061
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacacct 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  23740102 gtgttttaacaagttataactaaaaagtggttaaatacacct 23740061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 38367856 - 38367913
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  38367856 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatcttgctaaaacacaccttct 38367913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2362816 - 2362752
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  2362816 gtgttttagcaagttatcactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtataacttgctaaaacac 2362752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 2509452 - 2509516
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||  |||||| |||||    
T  2509452 gtgttttagcaagttataactaaaaagtggttaaatgtaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 2509516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19069460 - 19069396
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  19069460 gtgttttagcaagttataattaaaaactagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 19069396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25818548 - 25818484
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  25818548 gtgttttagcaagttataactaaaaagcagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 25818484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27168356 - 27168296
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtatttta 298  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  27168356 tagcaactcctataggcatttggtaggatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 27168296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 85)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6214229 - 6214002
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||    
T  6214229 gtttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccctctaacaaaaacaagtg 6214130  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6214129 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 6214030  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6214029 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 6214002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 12584258 - 12584485
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  12584258 gtttttacgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtg 12584357  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12584358 ggtatgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 12584457  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12584458 caccttaaggtgtagctttgctagaaca 12584485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13212060 - 13211837
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  13212060 gtttttatatgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 13211961  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13211960 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtcaaatac 13211861  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaa 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  13211860 accttaaggtgtagctttgctaaa 13211837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 5046613 - 5046839
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  5046613 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 5046712  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5046713 gtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaatac 5046812  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5046813 accttaaggtgtaactttgctaaaaca 5046839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5157243 - 5157017
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |||    
T  5157243 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaaatgg 5157144  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5157143 gtgtgttctagcaaatcctataggcctttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 5157044  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5157043 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 5157017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17745391 - 17745167
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  17745391 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttcaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 17745292  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17745291 atgtgttctagcaaatcctataggcat--gctagaatacacccacctattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaatac 17745194  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17745193 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 17745167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 42807883 - 42808110
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  42807883 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtg 42807982  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42807983 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 42808082  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42808083 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 42808110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48560243 - 48560017
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||       |||||||    
T  48560243 gtttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgttttaacacaccttctaaaaaaacaagtgg 48560144  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48560143 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaatttaataactaaaaagtggttaaatac 48560044  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  48560043 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 48560017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49970838 - 49970614
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||     
T  49970838 tttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctactaaaaaaacaagtggg 49970739  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  49970738 tgtgtt-tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaaatgaataactaaaaagtggttaaataca 49970640  T
Q  331 ccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||    
T  49970639 ccctaatgtgtagatttgctaaaaca 49970614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 130 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50182418 - 50182196
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  50182418 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 50182319  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50182318 gtgtgttctagcaaatt--ataggcatttgttagaatacactcacttattttttagaagcagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 50182221  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  50182220 accttaaggtgtagctttgctaaaa 50182196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7630303 - 7630076
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||    
T  7630303 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctataacacaccttctaacaaaaacaagtg 7630204  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7630203 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagattttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 7630104  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7630103 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 7630076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 14202843 - 14203069
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||     
T  14202843 tttttatgtgggagtgttttagcgagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtga 14202942  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14202943 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtggataactaaaaagtggttaaatac 14203042  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14203043 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 14203069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13621343 - 13621117
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  13621343 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatactccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaacaagtg 13621244  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621243 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggataca-ccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 13621145  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  13621144 caccttaatttttagctttgctaaaaca 13621117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 320
Target Start/End: Original strand, 10216224 - 10216414
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  10216224 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 10216323  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtg 320  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10216324 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 10216414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17377739 - 17377512
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  17377739 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtg 17377640  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  17377639 ggtgtgttctagcaaatcctataggcttttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatagtttaata 17377540  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17377539 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 17377512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 30820461 - 30820688
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | |    
T  30820461 gtttttatgtgggagtgttttagcaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaattg 30820560  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttc-agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30820561 gtgtattctagcaaatcctataggcatttgctagaagacacccacttatttttttagaaggagtattttaccaagtgaataactaaaaagtggttaaata 30820660  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30820661 caccttaaggtgtagctttgctaaaaca 30820688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 130 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 41172655 - 41172432
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||        || |||    
T  41172655 gtttttatgtgggagtgttttagcaagatataactaaaaagttaataaatacattttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataaatgg 41172556  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172555 gtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 41172456  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaa 353  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  41172455 actttaaggtgtagctttgctaaa 41172432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17181197 - 17180969
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn---caagt 227  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||          |||||    
T  17181197 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaacttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaacaagt 17181098  T
Q  228 ggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17181097 gggtgcgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatttttgcaatttaataactaaaaagtggttaaat 17180998  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17180997 acaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 17180969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 578730 - 578958
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctata--acacaccttctnnnnnnn-caagt 227  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||        ||| |    
T  578730 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctatataacacaccttctagaaaaagcaaat 578829  T
Q  228 ggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  578830 gggtgtattctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaat 578929  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  578930 acaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 578958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 354
Target Start/End: Original strand, 51783941 - 51784167
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  51783941 gtttttatgtggaagtgttttagcaagtaataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaataaacaagtgg 51784040  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatcc-acttatttttcagaa-ggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||    
T  51784041 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccctacttattttttagaagggagtattttagtaaataaataactaaaaagtgattaaat 51784140  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  51784141 acaccttaaggtgtagctttgctaaaa 51784167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 130 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13371456 - 13371256
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  13371456 gtttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 13371357  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13371356 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaatac 13371257  T
Q  330 a 330  Q
    |    
T  13371256 a 13371256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 130 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13381657 - 13381457
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  13381657 gtttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 13381558  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13381557 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaatac 13381458  T
Q  330 a 330  Q
    |    
T  13381457 a 13381457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21519977 - 21519750
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |        ||||||    
T  21519977 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttttaaaaaaaacaagtg 21519878  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21519877 ggtgtgttctagtaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaata 21519778  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  21519777 caccctaaggagtagctttactaaaaca 21519750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 34683020 - 34683247
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  34683020 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaacaaatacagcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtg 34683119  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34683120 ggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattaaataactaaaaagtggttaaata 34683219  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  34683220 caccttaaggtgtaactctgctaaaaca 34683247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26958782 - 26958558
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  26958782 gtttttatgtgggagtgttgtagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 26958683  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  26958682 gtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaaat-tataactaaaaagtagttaaatac 26958584  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26958583 accttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 26958558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 317
Target Start/End: Original strand, 30258099 - 30258286
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||       ||||||     
T  30258099 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacgcattctaaaaaaacaagtga 30258198  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaa 317  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30258199 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaa 30258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 131 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3818990 - 3818788
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnca--agtg 228  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||        |  ||||    
T  3818990 tttttatgtgggagtgttttagcaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaaaataagtg 3818891  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3818890 ggtgtgttctagcaaatcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 3818791  T
Q  329 cac 331  Q
    |||    
T  3818790 cac 3818788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 52437410 - 52437635
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct--nnnnnnncaagtg 228  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||          |||||    
T  52437410 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaaaagtg 52437509  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52437510 ggtgtgttctagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtggttaaata 52437608  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52437609 caccttaaggtgtag-tttgctaaaaca 52437635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Original strand, 10981367 - 10981500
Alignment:
Q  223 caagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggt 322  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10981367 caagtgggtgtgttctaacaaattttataggcatttgctagaatacatccacttattttctagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 10981466  T
Q  323 taaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10981467 taaatacacattaaggtgtagctttgctaaaaca 10981500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47382397 - 47382181
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct--nnnnnnncaagt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||         |||||    
T  47382397 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgatataacacaccttctaaaaaaaaacaagt 47382298  T
Q  228 ggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||           |||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47382297 ggatgtgttctaacaaatcctataggcatatgctaaaata-----------tttttagaaagagtattttagcaagtgaataaccaaaaagtgattaaat 47382209  T
Q  328 acaccttaaagtgtagctttgctaaaac 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47382208 acaccttaaggtgtagctttgctaaaac 47382181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18470399 - 18470276
Alignment:
Q  233 tgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacc 332  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18470399 tgttctagtaaattctatagccatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacc 18470300  T
Q  333 ttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||| |||||| ||||||||||||    
T  18470299 ttaaggtgtagttttgctaaaaca 18470276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 223 - 356
Target Start/End: Original strand, 13621380 - 13621513
Alignment:
Q  223 caagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggt 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13621380 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 13621479  T
Q  323 taaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  13621480 taaatacaccacaagatgtagctttgctaaaaca 13621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16553622 - 16553427
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||| | ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  16553622 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat-aagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatt 16553524  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16553523 tgctagaatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 16553427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45801934 - 45801823
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataac---taaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagc 344  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  45801934 tataggcatttgttagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaataaaaagtggttaaatacactctaatgtgtagc 45801835  T
Q  345 tttgctaaaaca 356  Q
    |||| |||||||    
T  45801834 tttgttaaaaca 45801823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26335938 - 26335743
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  26335938 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 26335840  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26335839 tgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 26335743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Original strand, 40496139 - 40496343
Alignment:
Q  142 gagtgtttta-acaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctag 240  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| |||    |||    
T  40496139 gagtgttttagaaaagatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttag 40496238  T
Q  241 caaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtg 340  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  40496239 caactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtg 40496337  T
Q  341 tagctt 346  Q
    ||||||    
T  40496338 tagctt 40496343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 342
Target Start/End: Original strand, 9744146 - 9744328
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  9744146 tataactaaaaagttgttagatacaccttaaggtgaatgttgctacaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatattagcaactcctataggcatt 9744244  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9744245 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataaataaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 9744328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 329
Target Start/End: Original strand, 49425774 - 49425943
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| |||    |||||| |||||||||||||    
T  49425774 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtacgttagcaacttctataggcatt 49425872  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  49425873 tgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaact-tataactaaaaagtagttaaatac 49425943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4712855 - 4712659
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||        |||||| |||    |||||| | |||||||||||    
T  4712855 tataactagaaatttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctataggcatt 4712756  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
     |||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4712755 cgctaaaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 4712659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46106871 - 46106676
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||        |||||| ||| |  |||||| | | |||||||||    
T  46106871 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaatat-aagtgggtgtatgttagcaactccaataggcatt 46106773  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  46106772 tgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttgaatacaccttaaggtggagc-ttgctaaaaca 46106676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 52306965 - 52306770
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  52306965 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttataaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 52306867  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||| || || || ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  52306866 tgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttataacaact-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtag-gttgctaaaaca 52306770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Original strand, 6137592 - 6137708
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  6137592 tagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaag 6137690  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || |||| |||||||||||    
T  6137691 gtatagc-ttgctaaaaca 6137708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6946763 - 6946647
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  6946763 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacactttaag 6946665  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  6946664 gtgtagc-ttgctaaaaca 6946647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 38425637 - 38425861
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtg 228  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |        |||||    
T  38425637 gtttttatgttggagtgttttagcaaagatataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattttaaaaaat-aagtg 38425735  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||| |  |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||     
T  38425736 ggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaacacacccatttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatg 38425834  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  38425835 caacttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 38425861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14863090 - 14862975
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  14863090 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaa-gtgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacaccttaag 14862993  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  14862992 gtgtagc-ttgctaaaaca 14862975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 356
Target Start/End: Original strand, 6193058 - 6193165
Alignment:
Q  247 ctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  6193058 ctataagcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataacaaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagc-t 6193155  T
Q  347 tgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||    
T  6193156 tgctaaaaca 6193165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15725391 - 15725208
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||        |||||  ||| |  |||||    
T  15725391 gtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgagtgtatgttagca 15725293  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||  ||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  15725292 actcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaaatagttaaata 15725208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33106109 - 33105923
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||    
T  33106109 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatt 33106011  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  33106010 tgctaggatacgcccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataatcaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagctt 33105923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45875956 - 45875770
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  45875956 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 45875858  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | || ||||| ||| |  ||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  45875857 tgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgttttagcaaat-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagctt 45875770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6137630 - 6137499
Alignment:
Q  224 aagtggatgtgttctagcaaattc-tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggt 322  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||| | ||||||  ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||    
T  6137630 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaag-gtataactaaaaagtagt 6137533  T
Q  323 taaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  6137532 taaatgcaccttaaggtatatctttgctaaaaca 6137499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 49606130 - 49606030
Alignment:
Q  245 ttctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagc 344  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |  ||||| |||||  |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  49606130 ttctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttagcaagt-tatagataaaaagtagttaaatacactttaaagtgtagc 49606032  T
Q  345 tt 346  Q
    ||    
T  49606031 tt 49606030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16553490 - 16553426
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  16553490 gtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 16553426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 317
Target Start/End: Original strand, 20458852 - 20459004
Alignment:
Q  164 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctag 263  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||||||||    
T  20458852 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctag 20458951  T
Q  264 aatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaa 317  Q
    |||| | |||||||||||| |||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  20458952 aatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaa 20459004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 289
Target Start/End: Original strand, 23383940 - 23384067
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||           |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  23383940 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct----aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 23384035  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaagg 289  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  23384036 tgctaggatacacccacttattttttagaagg 23384067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4490856 - 4490741
Alignment:
Q  165 aaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctaga 264  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||| ||||||||| |    
T  4490856 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctata 4490757  T
Q  265 atacatccacttattt 280  Q
    ||||| ||||||||||    
T  4490756 atacacccacttattt 4490741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33811177 - 33811056
Alignment:
Q  224 aagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggtt 323  Q
    |||||||||| |  |||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  33811177 aagtggatgtatgttagcaactcctacaggcatttgctataatacacccacttaatttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtt 33811079  T
Q  324 aaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||| |||||||| || ||||||    
T  33811078 aaatgcaccttaaggtatagctt 33811056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 38425573 - 38425630
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  38425573 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct 38425630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43639072 - 43638988
Alignment:
Q  261 tagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  43639072 tagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagtta-taactaaaaagcagttaaatacaccttaaggtgtagctt 43638988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54742556 - 54742449
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagcttt 347  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| | || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||    
T  54742556 tataggcatttgctaaaatacacccacttatattttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactagaaagtagttaaatgcactttaaggtgtagc-tt 54742459  T
Q  348 gctaaaacat 357  Q
    ||||||||||    
T  54742458 gctaaaacat 54742449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 102246 - 102318
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  102246 gtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct 102318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 319
Target Start/End: Original strand, 11777510 - 11777669
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||        || ||| ||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  11777510 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatattctaaaaaat-aattgggtgtatgttagcaactcctataagcatt 11777608  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagt 319  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||  ||||  |||||||||||||    
T  11777609 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaagt 11777669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26335806 - 26335742
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26335806 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 26335742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52306833 - 52306769
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52306833 gtgttataacaacttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaggttgctaaaacac 52306769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 52437572 - 52437636
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  52437572 gtgttttagcaagttataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagtttgctaaaacac 52437636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 142816 - 142693
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  142816 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaagacactttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 142718  T
Q  258 tgctagaatacatccacttattttt 282  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||    
T  142717 tgctaggatacacccacttattttt 142693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30258396 - 30258349
Alignment:
Q  307 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30258396 ataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaaa 30258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 13211554 - 13211611
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  13211554 tataactaaaaagttgttaaatacacctttaggtgaatgttgctaaaacataccttct 13211611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 291 - 356
Target Start/End: Original strand, 56532591 - 56532655
Alignment:
Q  291 gtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||    
T  56532591 gtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaataca-tttaagatgtagcttttctaaaaca 56532655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4712722 - 4712658
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  4712722 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 4712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6946710 - 6946646
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  6946710 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtagcttgctaaaacac 6946646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14863038 - 14862974
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  14863038 gtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 14862974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26958621 - 26958557
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26958621 gtgttttagcaaattataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 26958557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43639181 - 43639068
Alignment:
Q  175 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatcca 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||         |||||||||| |  |||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||    
T  43639181 taaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctagaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatttgttagaatacaccca 43639082  T
Q  274 cttatttttcagaa 287  Q
    ||||||||| ||||    
T  43639081 cttattttttagaa 43639068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36955465 - 36955387
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  36955465 tataggcatttgctagaatacactcacttattttttataatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaat 36955387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50678007 - 50677961
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50678007 gtgttttagcaagttataactaaaaag-tattaaatacaccttaaggt 50677961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 342
Target Start/End: Original strand, 578700 - 578793
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||  |  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  578700 tatagggatttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta-taactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgta 578793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Original strand, 6192969 - 6193019
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  6192969 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacac 6193019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 9744278 - 9744328
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9744278 gtgttttagcaagttataaataaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 9744328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14948319 - 14948269
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  14948319 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacac 14948269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43639042 - 43638992
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  43639042 gtgttttagcaagttataactaaaaagcagttaaatacaccttaaggtgta 43638992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 6193102 - 6193166
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  6193102 gtgttttagcaagttataacaaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagcttgctaaaacac 6193166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29102087 - 29101996
Alignment:
Q  254 catttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | |||  || ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  29102087 catttgctaggatacacccacttattttttataagatgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacacattaagatgtagctt 29101996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 38425798 - 38425862
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||  |||||| |||||    
T  38425798 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaacttaaggtgtagcttgctaaaacac 38425862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40496468 - 40496428
Alignment:
Q  306 aataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40496468 aataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt 40496428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46106739 - 46106691
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg 192  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  46106739 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttgaatacaccttaaggtg 46106691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 90)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 20411168 - 20411394
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  20411168 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 20411267  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20411268 gtgtgttctagcaaatcctatagtcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatcttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 20411367  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20411368 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 20411394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 16960253 - 16960479
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  16960253 gtttttatgtgggagtgttttagcaagatataactaaaaatttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgg 16960352  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16960353 gtgtgttatagcaaatcatataggcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 16960452  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16960453 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 16960479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 14494339 - 14494566
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||    
T  14494339 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtg 14494438  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14494439 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 14494538  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14494539 aaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 14494566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 130 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27389704 - 27389473
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  27389704 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttatgactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa-caagtgg 27389606  T
Q  230 atgtgttctagcaaatt----ctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaa 325  Q
     |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27389605 gtgtgttctagcaaatcaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 27389506  T
Q  326 atacaccttaaagtgtagctttgctaaaacatc 358  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27389505 acacaccttaaggtgtagctttgctaaaacatc 27389473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 36817621 - 36817847
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  36817621 tttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgg 36817720  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36817721 gtgtgttctagcaaatcctataggaatttgctagaatacacacacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaattc 36817820  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36817821 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 36817847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 130 - 353
Target Start/End: Original strand, 39424240 - 39424462
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  39424240 gtttttatgtg-gagtgttttagcaagatataattaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgg 39424338  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39424339 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 39424438  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaa 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  39424439 accttaaggtgtagctttgctaaa 39424462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47131129 - 47130907
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  47131129 gtttttatgtgtgagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgg 47131030  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttc-agaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  47131029 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaata 47130930  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgcta 351  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    
T  47130929 caccctaaggtgtagctttgcta 47130907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 27255623 - 27255849
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        |||||||    
T  27255623 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttttagaaaaagcaagtgg 27255722  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27255723 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggagtattttaggaagtaaataactaaaaagtggttaaatac 27255822  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27255823 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 27255849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12864504 - 12864280
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgga 230  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||     
T  12864504 tttttatatgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgctataacacacctaa-aaaaaaacaagtggg 12864406  T
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12864405 tgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 12864306  T
Q  331 ccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  12864305 ccttaaggtgtagctttgctaaaaca 12864280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1805202 - 1804976
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |       |||||||    
T  1805202 gtttttatgttggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttttaaaaaaacaagtgg 1805103  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1805102 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatcttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggttaaatac 1805003  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||    
T  1805002 atcctaaggtgtagctttgctaaaaca 1804976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 130 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13385949 - 13385729
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  13385949 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtg 13385850  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13385849 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattgaataactaaaaagtggttaaata 13385750  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgc 349  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  13385749 caccttaaggtgtaactttgc 13385729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 143 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32716603 - 32716394
Alignment:
Q  143 agtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||    
T  32716603 agtgttttatcaagttataactaaaaagttaataaatacatat----gtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagca 32716508  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32716507 aatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttaagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgta 32716408  T
Q  343 gctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||||||    
T  32716407 gctttgctaaaaca 32716394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 328
Target Start/End: Original strand, 52772216 - 52772415
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn--caagt 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||         |||||    
T  52772216 gtttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg-tataacacatcttctaaaaaaaaacaagt 52772314  T
Q  228 ggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 327  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52772315 gggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttcagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 52772414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 43236124 - 43236359
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnnc-aagtg 228  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||    
T  43236124 gtttttatgtcggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtg 43236223  T
Q  229 gatgtgttct--------agcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtg 320  Q
    |||| |||||        ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43236224 gatgcgttctaggcttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaagtggataactaaaaagtg 43236323  T
Q  321 gttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43236324 gttaaatacaccttaatgtgttgctttgctaaaaca 43236359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32374754 - 32374528
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||    
T  32374754 gtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtg 32374655  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | |||||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32374654 ggtgtgttatagcaaatcctatagacatttgttacgatacacccacttagtttgtagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 32374555  T
Q  329 caccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  32374554 caccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 32374528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51465223 - 51465010
Alignment:
Q  142 gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagc 241  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||    
T  51465223 gagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggatgtgttatagc 51465124  T
Q  242 aaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgt 341  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||    
T  51465123 aaatcttacaggcaattgctagaataca-ccacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaatacagcctaaggtgt 51465025  T
Q  342 agctttgctaaaaca 356  Q
    | |||||||||||||    
T  51465024 aactttgctaaaaca 51465010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 231 - 356
Target Start/End: Original strand, 14387472 - 14387597
Alignment:
Q  231 tgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14387472 tgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttggcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 14387571  T
Q  331 ccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  14387572 ccttaaggtgtagctttgctaaaaca 14387597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28094615 - 28094419
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtggatgtgttctagcaaat 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  28094615 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaaacaagtggatgtgttctagcaaat 28094516  T
Q  246 tctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagct 345  Q
     |||||||||               |||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28094515 cctataggcac--------------ccacttatttttaagaaggagtattttagtaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagct 28094430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20201911 - 20201759
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  20201911 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatagaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 20201812  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttattttt 282  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20201811 gtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctataatacacccacttattttt 20201759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Original strand, 13943351 - 13943459
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagcttt 347  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13943351 tataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagcttt 13943450  T
Q  348 gctaaaaca 356  Q
    | |||||||    
T  13943451 gttaaaaca 13943459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10764794 - 10764596
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| |  ||||| ||||    
T  10764794 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcttatagacatt 10764695  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    | |||||||||| ||||| |||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  10764694 ttctagaatacacccactcattttttagaaggtgtgttatagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgttaaaaca 10764596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 26842998 - 26843193
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||        |||||| |||||  |||||| | |||||||||||    
T  26842998 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacacattctaataaat-aagtgggtgtgtgttagcaactcctataggcatt 26843096  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  26843097 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagttgtagc-ttgctaaaaca 26843193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16005760 - 16005573
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  16005760 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 16005661  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  16005660 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagctt 16005573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 28646732 - 28646817
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28646732 gtttttatgtaggagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacgcaccttct 28646817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 13157557 - 13157755
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaa---attctataggc 254  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  ||||||   || |||||| |    
T  13157557 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactgatcctatagac 13157655  T
Q  255 atttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13157656 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 13157753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 213
Target Start/End: Original strand, 27348101 - 27348183
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 213  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27348101 gtttttatgtgggagagttttatcaagttataactaaaaagttgataaatacaccttaaggtgtat-ttgctataacacacctt 27348183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 356
Target Start/End: Original strand, 158417 - 158610
Alignment:
Q  161 aactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgc 260  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        || ||||||| |  |||||| | ||||||| ||||||    
T  158417 aactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaaatggatgtatgttagcaactcctataggaatttgc 158516  T
Q  261 tagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| || |||||||||||  |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  158517 tataattcacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagctaaatacaccttaaggtgttgc-ttgctaaaaca 158610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Original strand, 463392 - 463508
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  463392 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaag 463490  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  463491 gtgtagc-ttgctaaaaca 463508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 346
Target Start/End: Original strand, 6192424 - 6192612
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt--atgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggca 255  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||        |||||| |||||  |||||| | ||||| |||    
T  6192424 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaat-aagtgggtgtgtgttagcaactcctatatgca 6192522  T
Q  256 tttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6192523 tttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgtttcagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt 6192612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24190955 - 24190751
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaaca-agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtg 228  Q
    |||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||     
T  24190955 gtttttatgtgataatgttttagcagagttataattaagaagttcataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaat-aagta 24190857  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccact--tatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 326  Q
      ||| |  |||||  ||||||| ||||||||||||||| | | |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  24190856 agtgtatattagcatcttctatatgcatttgctagaatagaacgacttatattttttagaaggagtattttatcaagtgaa-aactaaaaaatgattaaa 24190758  T
Q  327 tacacct 333  Q
    | |||||    
T  24190757 tgcacct 24190751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12010692 - 12010567
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg--tatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaag 226  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||        ||||    
T  12010692 gtttttatgtggcagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaag 12010593  T
Q  227 tggatgtgttctagcaaattctatag 252  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12010592 tgggtgtgttctagcaaatcctatag 12010567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28454900 - 28454705
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  28454900 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaa-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 28454802  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  28454801 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaacagtagttaaatataacttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 28454705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 36389459 - 36389630
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  36389459 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 36389557  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacac 331  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  36389558 tgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacac 36389630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Original strand, 34515210 - 34515326
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34515210 tagcaactcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaag 34515308  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  34515309 gtgtagc-ttgctaaaaca 34515326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2965398 - 2965334
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2965398 gtttttatgtcggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 2965334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13264637 - 13264531
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagcttt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  13264637 tataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-tt 13264540  T
Q  348 gctaaaaca 356  Q
    |||||||||    
T  13264539 gctaaaaca 13264531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 356
Target Start/End: Original strand, 27787890 - 27787996
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagcttt 347  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27787890 tataggaatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-tt 27787987  T
Q  348 gctaaaaca 356  Q
    |||||||||    
T  27787988 gctaaaaca 27787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42199956 - 42199853
Alignment:
Q  251 aggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgct 350  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  42199956 aggcatttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgct 42199859  T
Q  351 aaaaca 356  Q
    ||||||    
T  42199858 aaaaca 42199853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42208824 - 42208721
Alignment:
Q  251 aggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgct 350  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  42208824 aggcatttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgct 42208727  T
Q  351 aaaaca 356  Q
    ||||||    
T  42208726 aaaaca 42208721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Original strand, 14387226 - 14387440
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtg 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||        || ||    
T  14387226 gtttttatgtgggagtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaat-aaatg 14387324  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 328  Q
    | ||  |  |||||  | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||| | |||||||     
T  14387325 ggtgcatgttagcagctcctatagccatttactagaatacatccatttattttt-agaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaaatagttaaatg 14387422  T
Q  329 caccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||||||| |||||||||    
T  14387423 caccttaaggtgtagctt 14387440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12010566 - 12010512
Alignment:
Q  300 caagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaa 354  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12010566 caagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa 12010512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 16073438 - 16073635
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-nnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcat 256  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||         |||||| ||| |  |||||| | ||| ||||||    
T  16073438 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaaaaataagtgggtgtttgttagcaactcctacaggcat 16073537  T
Q  257 ttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||| ||  ||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  16073538 ttgttatgatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacgttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 16073635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 50797634 - 50797720
Alignment:
Q  130 gtttttatgtga-gagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
T  50797634 gtttttatgttatgagtgttttagcaagttataactaaaaagttaacaaatactccttgagatgtatgttgttataacccaccttct 50797720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23413830 - 23413637
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       ||||||| ||| |  |||||| | ||||   ||||    
T  23413830 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaata-caagtgggtgtatgttagcaactcctatgaacatt 23413732  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||| ||  ||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23413731 tgctagaatacatccacttattttttt--aggtgtgctttaggaattta-taactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 23413637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 50559250 - 50559445
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        || | ||||| |  |||||| | |||||||||||    
T  50559250 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat-aaatagatgtatgttagcaactcctataggcatt 50559348  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    || ||| ||||  ||||||||||||  ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  50559349 tgttaggatacgcccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtttagc-ttgctaaaaca 50559445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 356
Target Start/End: Original strand, 5491667 - 5491797
Alignment:
Q  224 aagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggtt 323  Q
    |||||||||| |  |||||| | |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  5491667 aagtggatgtatgttagcaactcctatagacatttactagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtt 5491765  T
Q  324 aaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  5491766 aaatacaccctaaggtgtatc-ttgctaaaaca 5491797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15660525 - 15660477
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaat 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15660525 tttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaat 15660477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32156084 - 32155982
Alignment:
Q  253 gcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaa 352  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  32156084 gcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagt-tataaataaaaagtagttaaatacatcctaaggtgtagc-ttgctaa 32155987  T
Q  353 aacat 357  Q
    |||||    
T  32155986 aacat 32155982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 215
Target Start/End: Original strand, 3099558 - 3099625
Alignment:
Q  148 tttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  3099558 tttatcaagttaaaactaaaaagttgataaatacaccttaaaatgtatgttgctataacacacattct 3099625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51432042 - 51431902
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  ||| || | |||||| ||||    
T  51432042 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggttaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggtgtatgttaggaactcctatagacatt 51431943  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtatttta 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  51431942 tgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 51431902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 34306425 - 34306630
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagca 242  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||        |||||  ||| |  |||||    
T  34306425 gtgttttaacaaagatataattaaaaagttgctaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcattctaaaaaat-aagtgagtgtatgttagca 34306523  T
Q  243 aattctataggcatttgctagaatacat----ccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaag 338  Q
    | | |||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||  ||  |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34306524 actcctataggcatttgctagaatacactcacccacttattttttagaagttgtgctttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagg 34306622  T
Q  339 tgtagctt 346  Q
    ||||||||    
T  34306623 tgtagctt 34306630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 356
Target Start/End: Original strand, 47130797 - 47130905
Alignment:
Q  247 ctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | || | |  ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  47130797 ctatgggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaatgtgcgttttagcaggtta-taactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctt 47130895  T
Q  347 tgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||    
T  47130896 tgctaaaaca 47130905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 5491734 - 5491802
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacct 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  5491734 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtatcttgctaaaacacacct 5491802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 40631269 - 40631217
Alignment:
Q  421 aaaacttccttgatgatattatctttgggagggtctatgctacacttgaaaga 473  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40631269 aaaacttccttgatgatattatatttgggagggtttatgttacacttgaaaga 40631217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 346
Target Start/End: Original strand, 4158116 - 4158294
Alignment:
Q  166 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaa 265  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||||||| |  |||||| | ||||| ||||||| ||| |    
T  4158116 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtggatgtatgttagcaactcctataagcatttgttagga 4158214  T
Q  266 tacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
     ||| |||||||||||| | |||| || ||||| || || | |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  4158215 aacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaggtta-taactaaaaaataattaaatacaccttaaggtgtagctt 4158294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34825629 - 34825554
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataa 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  34825629 gtttttacgtgggagtgttttagcaaattatcactaaaaagttgataaatacatattgaggtgtatgttgctataa 34825554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 356
Target Start/End: Original strand, 24770718 - 24770825
Alignment:
Q  247 ctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||| |    
T  24770718 ctataggcatttgctaggatacacccacttattcttttgaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaagatgtagc-t 24770815  T
Q  347 tgctaaaaca 356  Q
    ||||||||||    
T  24770816 tgctaaaaca 24770825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45818976 - 45818919
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45818976 tataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 45818919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 463445 - 463509
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  463445 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 463509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 13157692 - 13157756
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  13157692 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 13157756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Original strand, 20201700 - 20201752
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacac 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20201700 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 20201752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 27787933 - 27787997
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  27787933 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 27787997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 34515263 - 34515327
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  34515263 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 34515327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 10558212 - 10558263
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacaca 209  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10558212 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaca 10558263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 16073572 - 16073639
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacc 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||    
T  16073572 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacacgttaaggtgtaacttgctaaaacacacc 16073639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33676209 - 33676085
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||        |||||| ||| | ||||||| | |||||| ||||    
T  33676209 tataattaataagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgctagcaactcctatagacatt 33676110  T
Q  258 tgctagaatacatccacttattttt 282  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||    
T  33676109 tgttaggatacacccacttattttt 33676085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41146355 - 41146250
Alignment:
Q  249 ataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttg 348  Q
    |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||    
T  41146355 atagacatttgctaggatatacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttg 41146258  T
Q  349 ctaaaaca 356  Q
    ||||||||    
T  41146257 ctaaaaca 41146250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 336
Target Start/End: Original strand, 3979457 - 3979554
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||  |||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  3979457 tagcaactcctatagacatttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaaaacatcttaa 3979554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8643112 - 8642996
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  || ||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||| | ||||||     
T  8643112 tagcaactcctatacgcatttgctataatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataaccaaaaagtagttaaatgcgccttaag 8643014  T
Q  338 gtgtagctttgctaaaaca 356  Q
     |||||| |||||||||||    
T  8643013 atgtagc-ttgctaaaaca 8642996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 10368056 - 10368141
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||  ||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  10368056 gtttttatgtgggagtgttttaataaagatataactaaaat-ttgttaaatacaccttaagttgaatgttgctaaaacacaccttct 10368141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Original strand, 32994185 - 32994239
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacct 212  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32994185 tataactaaaaagttgttaagtacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct 32994239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 193
Target Start/End: Original strand, 158547 - 158596
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  158547 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagctaaatacaccttaaggtgt 158596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28704545 - 28704488
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  28704545 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattct 28704488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 210
Target Start/End: Original strand, 463018 - 463070
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacac 210  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  463018 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttcctaaaacacac 463070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13264594 - 13264530
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  13264594 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 13264530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 26843130 - 26843194
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  26843130 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagttgtagcttgctaaaacac 26843194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3273528 - 3273404
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  3273528 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaagcactcattctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 3273429  T
Q  258 tgctagaatacatccacttattttt 282  Q
    || |||||| || ||||||||||||    
T  3273428 tgttagaatgcacccacttattttt 3273404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 4158240 - 4158290
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  4158240 gtgttttagcaggttataactaaaaaataattaaatacaccttaaggtgta 4158290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 6192558 - 6192608
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6192558 gtgtttcagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 6192608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Original strand, 13157281 - 13157331
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  13157281 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacac 13157331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16005627 - 16005577
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  16005627 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgta 16005577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33675899 - 33675830
Alignment:
Q  276 tatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  33675899 tattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagctt 33675830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33675884 - 33675834
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  33675884 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgta 33675834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 28764549 - 28764606
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  28764549 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattct 28764606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41146445 - 41146388
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  41146445 tataactaaaaggttgctaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattct 41146388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42199913 - 42199852
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  42199913 ttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 42199852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42208781 - 42208720
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  42208781 ttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 42208720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28704595 - 28704515
Alignment:
Q  256 tttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 336  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| || |||||| || ||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28704595 tttgctatgatacatccatttattctttagaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 28704515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 32151945 - 32152005
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtatttta 298  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  32151945 tagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 32152005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41146313 - 41146249
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  41146313 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 41146249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Original strand, 26025 - 26251
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  26025 tttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 26124  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26125 gtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatattttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatac 26224  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26225 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 26251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 58119 - 57893
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtgg 229  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |    
T  58119 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagttg 58020  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  58019 gtgttttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatac 57920  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  57919 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 57893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 58149 - 58056
Alignment:
Q  248 tataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgta 342  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||  |  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  58149 tatagggatttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta-taactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgta 58056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 452340 - 452565
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtgg 229  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||     
T  452340 gtttttatgtgagagtgttt-agcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgc 452438  T
Q  230 atgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 329  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  452439 gtgtgttctagcaaatcgtataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtatataactaaaaagtggttaaatac 452538  T
Q  330 accttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  452539 accttaaggtgtagctttgctaaaaca 452565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2955 - 2767
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||        ||||||    
T  2955 gtttttatatggaagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtg 2856  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaa 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  2855 ggtgtgttctagcaaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15010 - 14822
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnn-caagtg 228  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||        ||||||    
T  15010 gtttttatatggaagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtg 14911  T
Q  229 gatgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaa 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  14910 ggtgtgttctagcaaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 82715 - 82800
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82715 gtttttatgtgggagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 82800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 9733 - 9929
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||        ||||||  || |  |||||| | |||||||||||    
T  9733 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggcgtatgttagcaactcctataggcatt 9832  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9833 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 9929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 9866 - 9930
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  9866 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 9930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 356
Target Start/End: Original strand, 22604 - 22813
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaa--gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaa 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |       ||||||| ||| |  ||||||     
T  22604 ttttaacaagttttaactaaaaaaagttaataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacacttt-tgaaaaaacaagtgggtgtatgttagcaag 22702  T
Q  245 ttctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagc 344  Q
    || |||| |  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22703 ttttatatgtgtttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtcatttggtaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagc 22802  T
Q  345 tttgctaaaaca 356  Q
     |||||||||||    
T  22803 -ttgctaaaaca 22813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Original strand, 20620 - 20816
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||        |||||| ||| |  |||||| | |||||||||||    
T  20620 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatt 20719  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  20720 tgctaggatacacccacttattttttagaaggtatgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtatc-ttgctaaaaca 20816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 208
Target Start/End: Original strand, 20754 - 20817
Alignment:
Q  145 tgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20754 tgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtatcttgctaaaacac 20817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4254 - 4060
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||||||| |  |||||| | ||||| |||||    
T  4254 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtggatgtatgttagcaactcctataagcatt 4156  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  4155 tgcta-aatacacccacttattttttagaaggtgtgtttgagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4123 - 4059
Alignment:
Q  144 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  4123 gtgtttgagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6734 - 6539
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctagcaaattctataggcatt 257  Q
    |||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||        || ||| |||||  |||||| | |||||||||||    
T  6734 tataactaaaaagttgttaaatatactttgaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aattgggtgtgtgttagcaactcctataggcatt 6636  T
Q  258 tgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaaca 356  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6635 tgctaggatacatctatttattttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6599 - 6538
Alignment:
Q  147 ttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  6599 ttttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 6538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0778
Description:

Target: scaffold0778; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 199
Target Start/End: Original strand, 6245 - 6313
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 199  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6245 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 6313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5895 - 5692
Alignment:
Q  142 gagtgtttta-acaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctnnnnnnncaagtggatgtgttctag 240  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        |||||| |||    |||    
T  5895 gagtgttttagaaaagatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-aagtgggtgtaagttag 5797  T
Q  241 caaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtg 340  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  5796 caactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaaggtg 5698  T
Q  341 tagctt 346  Q
    ||||||    
T  5697 tagctt 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 346
Target Start/End: Original strand, 5567 - 5607
Alignment:
Q  306 aataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctt 346  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5567 aataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt 5607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14954 - 14872
Alignment:
Q  131 tttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 213  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14954 tttttacgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttattaaacacaccttactgtgtatgttgctataacacacctt 14872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 573
Alignment:
Q  238 tagcaaattctataggcatttgctagaatacatccacttatttttcagaaggagtattttatcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaa 337  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  680 tagcaactcctataggcattttctaggatacacccacttatttttcagaaggtatgttttagcaag-ctataactaaaaagtagttaaaaacaccttaag 582  T
Q  338 gtgtagctt 346  Q
    |||||||||    
T  581 gtgtagctt 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 209
Target Start/End: Original strand, 65933 - 66012
Alignment:
Q  130 gtttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacaca 209  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||||||||| ||||||    
T  65933 gtttttatgttggattgttttagcaatttataactaaaaagttgataaatgctctttgaggtgtatgttgctacaacaca 66012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1717 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1717
Description:

Target: scaffold1717; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 1381 - 1437
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  1381 tataactaaaaagttgttaaataca-cttaaggtgaatgttgctaaaacataccttct 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1527 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1527
Description:

Target: scaffold1527; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 1627 - 1683
Alignment:
Q  158 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 215  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  1627 tataactaaaaagttgttaaataca-cttaaggtgaatgttgctaaaacataccttct 1683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University