View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7609_high_1 (Length: 813)

Name: NF7609_high_1
Description: NF7609
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7609_high_1
NF7609_high_1
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (19-805)||(24412236-24413022)
chr5 (19-805)||(30454195-30454981)
chr5 (19-805)||(30459253-30460039)
chr5 (22-801)||(18568449-18569229)
chr5 (19-799)||(30444829-30445609)
chr5 (19-805)||(24421696-24422471)
chr5 (42-805)||(22488618-22489379)
chr5 (35-805)||(4635387-4636139)
chr5 (552-792)||(24244050-24244287)
chr5 (552-792)||(24290674-24290911)
chr5 (552-801)||(13815371-13815617)
chr5 (552-804)||(42732572-42732818)
chr5 (552-801)||(33955498-33955745)
chr5 (552-805)||(11223318-11223568)
chr5 (552-801)||(20035941-20036188)
chr5 (552-795)||(20834373-20834614)
chr5 (614-784)||(5600580-5600749)
chr5 (614-784)||(5610226-5610395)
chr5 (611-761)||(22118140-22118291)
chr5 (614-784)||(31150651-31150820)
chr5 (634-804)||(26652642-26652811)
chr5 (634-804)||(26924227-26924396)
chr5 (119-293)||(24278813-24278987)
chr5 (119-293)||(24383227-24383401)
chr5 (718-799)||(22448330-22448411)
chr5 (349-453)||(22118443-22118545)
chr5 (718-802)||(37514856-37514940)
chr5 (743-799)||(22457666-22457722)
chr5 (611-784)||(16110881-16111058)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (19-805)||(3242281-3243067)
chr4 (19-805)||(26811916-26812702)
chr4 (19-805)||(26821383-26822169)
chr4 (19-801)||(54689911-54690693)
chr4 (19-801)||(54699342-54700124)
chr4 (19-801)||(3917475-3918256)
chr4 (35-805)||(37058511-37059280)
chr4 (41-805)||(15842892-15843654)
chr4 (552-801)||(20884447-20884694)
chr4 (552-804)||(50516493-50516742)
chr4 (552-804)||(11482257-11482507)
chr4 (614-784)||(23622919-23623088)
chr4 (696-802)||(18125409-18125514)
chr4 (221-451)||(18125754-18125981)
chr4 (614-691)||(16489947-16490025)
chr4 (743-801)||(28256097-28256155)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (19-805)||(28367647-28368433)
chr3 (19-805)||(28375465-28376251)
chr3 (19-805)||(28383287-28384073)
chr3 (19-805)||(28351714-28352501)
chr3 (413-805)||(24794540-24794932)
chr3 (179-802)||(4951164-4951784)
chr3 (23-408)||(38529528-38529912)
chr3 (474-805)||(38529171-38529502)
chr3 (552-796)||(5385632-5385874)
chr3 (552-801)||(46305572-46305818)
chr3 (552-804)||(23486983-23487235)
chr3 (611-804)||(13328273-13328465)
chr3 (614-784)||(17529877-17530046)
chr3 (614-784)||(32877870-32878039)
chr3 (614-784)||(54624655-54624824)
chr3 (614-784)||(48978670-48978835)
chr3 (614-784)||(48988210-48988375)
chr3 (221-455)||(27168983-27169216)
chr3 (699-804)||(7783984-7784089)
chr3 (190-394)||(7784561-7784764)
chr3 (613-715)||(7784091-7784194)
chr3 (658-784)||(19388809-19388936)
chr3 (696-802)||(4361513-4361618)
chr3 (221-451)||(4361858-4362085)
chr3 (35-99)||(4951021-4951085)
chr3 (718-762)||(24285493-24285537)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (19-801)||(94429-95211)
scaffold0028 (19-801)||(103870-104652)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (23-804)||(2945-3726)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (23-804)||(7789073-7789854)
chr8 (359-805)||(20713818-20714263)
chr8 (552-796)||(18883163-18883404)
chr8 (552-799)||(25051063-25051307)
chr8 (552-801)||(18143427-18143673)
chr8 (552-792)||(18232870-18233107)
chr8 (552-792)||(18242321-18242558)
chr8 (552-799)||(25037026-25037270)
chr8 (552-792)||(18251772-18252009)
chr8 (552-804)||(42712173-42712423)
chr8 (552-801)||(4843720-4843968)
chr8 (552-799)||(31575411-31575652)
chr8 (552-804)||(20044760-20045010)
chr8 (552-801)||(12925296-12925543)
chr8 (552-804)||(20030121-20030371)
chr8 (552-804)||(12767573-12767825)
chr8 (657-805)||(33601767-33601914)
chr8 (657-799)||(33592134-33592275)
chr8 (611-798)||(15833950-15834137)
chr8 (651-801)||(12915499-12915648)
chr8 (612-797)||(24096077-24096262)
chr8 (652-789)||(24634009-24634145)
chr8 (734-801)||(20714417-20714484)
chr8 (657-774)||(42896174-42896290)
chr8 (376-455)||(15833720-15833798)
chr8 (376-445)||(15827408-15827476)
chr8 (738-796)||(26194048-26194106)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (35-805)||(7592430-7593200)
chr7 (35-449)||(15172743-15173157)
chr7 (37-440)||(15202171-15202571)
chr7 (455-805)||(15174385-15174734)
chr7 (35-330)||(4118893-4119188)
chr7 (552-792)||(11634337-11634574)
chr7 (552-801)||(14634776-14635023)
chr7 (552-801)||(14644476-14644723)
chr7 (552-801)||(33292175-33292422)
chr7 (556-801)||(15947371-15947614)
chr7 (552-804)||(9736888-9737138)
chr7 (552-804)||(32817939-32818188)
chr7 (613-799)||(19352589-19352775)
chr7 (657-799)||(13874432-13874572)
chr7 (685-802)||(48710004-48710121)
chr7 (24-73)||(7590414-7590463)
chr7 (617-784)||(4306573-4306739)
chr7 (552-679)||(48711401-48711526)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (35-805)||(23895610-23896380)
chr6 (19-805)||(18419960-18420745)
chr6 (552-801)||(22066235-22066482)
chr6 (552-797)||(23884434-23884677)
chr6 (613-804)||(14102308-14102500)
chr6 (633-799)||(10259779-10259945)
chr6 (190-443)||(14101770-14102022)
chr6 (552-804)||(17512218-17512467)
chr6 (658-804)||(11421446-11421591)
chr6 (659-804)||(12173469-12173613)
chr6 (658-776)||(23110242-23110359)
chr6 (618-712)||(13218359-13218453)
chr6 (614-740)||(12415064-12415190)
chr6 (377-444)||(12173195-12173260)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (35-805)||(30817-31571)
scaffold0040 (46-800)||(9481-10230)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (39-805)||(31710460-31711213)
chr2 (35-805)||(24022736-24023504)
chr2 (526-804)||(14273121-14273397)
chr2 (35-445)||(14272482-14272889)
chr2 (552-802)||(35877458-35877706)
chr2 (552-802)||(35884947-35885195)
chr2 (552-802)||(36724660-36724908)
chr2 (552-797)||(3396865-3397108)
chr2 (614-784)||(1800493-1800662)
chr2 (614-784)||(22632402-22632571)
chr2 (614-784)||(1790999-1791164)
chr2 (630-803)||(18578704-18578877)
chr2 (729-804)||(29911278-29911353)
chr2 (718-787)||(16446670-16446739)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (35-611)||(26309-26867)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (19-399)||(412706-413086)
scaffold0001 (509-805)||(408226-408522)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (35-805)||(15809970-15810743)
chr1 (611-804)||(5378419-5378613)
chr1 (611-801)||(14272016-14272205)
chr1 (611-795)||(14281888-14282071)
chr1 (614-804)||(26906241-26906431)
chr1 (611-805)||(40999029-40999224)
chr1 (657-799)||(21919431-21919572)
chr1 (552-804)||(21633524-21633772)
chr1 (176-341)||(41000835-41001003)
chr1 (611-787)||(3470949-3471124)
chr1 (376-549)||(40999283-40999455)
chr1 (611-798)||(30676788-30676976)
chr1 (655-796)||(28310018-28310155)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (552-796)||(256901-257142)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (611-804)||(124047-124239)
scaffold0021 (552-679)||(143111-143237)
scaffold0021 (633-784)||(100002-100152)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (552-804)||(2051-2301)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (614-784)||(14830-14999)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (614-784)||(24593-24762)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (657-805)||(2255-2402)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (657-799)||(12548-12689)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (611-774)||(27078-27246)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 751; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 751; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Original strand, 24412236 - 24413022
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412236 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 24412335  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412336 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 24412435  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412436 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 24412535  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24412536 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacatacaaag 24412635  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412636 caaattccaagctctctcactgtatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 24412735  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412736 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 24412835  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412836 ttgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 24412935  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24412936 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 24413022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 739; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 30454981 - 30454195
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454981 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 30454882  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454881 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 30454782  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454781 ttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 30454682  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30454681 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacatacaaag 30454582  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30454581 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattctatccaaaca 30454482  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454481 aatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 30454382  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454381 ttgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 30454282  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30454281 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatttttctc 30454195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 735; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 30460039 - 30459253
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30460039 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 30459940  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459939 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 30459840  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459839 ttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 30459740  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30459739 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacatacaaag 30459640  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30459639 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattctatccaaaca 30459540  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459539 aatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 30459440  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30459439 ttgtataagcctgccgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 30459340  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30459339 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttatttttctc 30459253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 733; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 801
Target Start/End: Original strand, 18568449 - 18569229
Alignment:
Q  22 taaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttataca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18568449 taaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtggactgcaagttacaca 18568548  T
Q  122 gctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18568549 gctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttta 18568648  T
Q  222 agaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataa 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568649 agaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataa 18568748  T
Q  322 atacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaa 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18568749 atacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaa 18568848  T
Q  422 attccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaat 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568849 attccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaat 18568948  T
Q  522 ctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatag-ttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaatt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18568949 ctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaatt 18569048  T
Q  621 gtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaact 720  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569049 gtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaact 18569148  T
Q  721 atagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569149 atagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 18569229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 729; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 30445609 - 30444829
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445609 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 30445510  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445509 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 30445410  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445409 ttaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 30445310  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30445309 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacatacaaag 30445210  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30445209 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattctatccaaaca 30445110  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445109 aatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 30445010  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445009 ttgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttatggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 30444910  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30444909 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaatcaggataactctcctgtgttatt 30444829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 713; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Original strand, 24421696 - 24422471
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24421696 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 24421795  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||    
T  24421796 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattct-----------ggctattt 24421884  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24421885 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccagcagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 24421984  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24421985 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacatacaaag 24422084  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422085 caaattccaagctctctcactgtatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 24422184  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422185 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 24422284  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422285 ttgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 24422384  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422385 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 24422471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 805
Target Start/End: Original strand, 22488618 - 22489379
Alignment:
Q  42 agatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22488618 agatcacatggcttatttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagcattaggcagcaagttatacagctcattacagctggttatc 22488717  T
Q  142 tcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaa 241  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22488718 tcatgtgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaat 22488816  T
Q  242 tgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22488817 tgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtctttgaaggt 22488916  T
Q  342 cataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22488917 cataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcactat 22489016  T
Q  442 atctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgtt 541  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22489017 atctcttggatcttctctcttgaatttg-ctattgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgtt 22489115  T
Q  542 gtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttga 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22489116 gtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggttga 22489215  T
Q  642 taatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacga 741  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22489216 taatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcataagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacga 22489315  T
Q  742 ggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22489316 ggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 22489379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 805
Target Start/End: Original strand, 4635387 - 4636139
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||    
T  4635387 atggataagatcacatgacttatttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagcagtgcgcaacaagttatacaactcattacaact 4635486  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4635487 ggttctctcacgcgcaagcaa-gcaatagtgctttcaaagccaggcaaatcagaaagaacattttgagaacattctagctattttaaagaagaaaagaaa 4635585  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4635586 aatcaattgagactttggacaactatcaaaaacgcatccaacagctctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtctt 4635685  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||                ||||||||||||| |    
T  4635686 tgaaggtcataagctagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactgcaaacaaagc----------------aaattccaagctccc 4635769  T
Q  435 tcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaa 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4635770 tcactatatctcttggatcttctctttcgaatttgc-tattgtaaaactcaaacaaagaattaagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaa 4635868  T
Q  535 gagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatg 634  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4635869 gtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctg 4635968  T
Q  635 aggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 734  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4635969 aggttgataaaacaggtgtaacggactgatatggtgtgatcaagatcttatagtgctggtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatct 4636068  T
Q  735 cacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4636069 cacgtgaggtgtggggactgaaaatagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattcctctc 4636139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 552 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 24244287 - 24244050
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  24244287 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24244191  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24244190 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24244092  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24244091 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 24244050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 552 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 24290911 - 24290674
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  24290911 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 24290815  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24290814 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 24290716  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24290715 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 24290674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 13815617 - 13815371
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||      
T  13815617 aagtttattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgttgaggttgataatacaag 13815521  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13815520 ggttacagaatgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaatactatagtggataatctcacatgaagtgtgg 13815424  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815423 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 13815371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 42732818 - 42732572
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  42732818 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaagagtttcaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtagaagcctgttgaggttgataatacagg 42732725  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42732724 ggttctggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 42732626  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42732625 actggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattcttct 42732572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 33955745 - 33955498
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33955745 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 33955649  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33955648 tggttacgtactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33955552  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33955551 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 33955498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 552 - 805
Target Start/End: Original strand, 11223318 - 11223568
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11223318 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 11223414  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa-gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | ||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11223415 gggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accactgtatactataatggataatctcacacgaagtgtgg 11223511  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11223512 ggactggaagtagccgagtttggtgaaccaggataactcttttgtgttattcttctc 11223568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Original strand, 20035941 - 20036188
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||| || ||| |  |  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||    
T  20035941 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaaccttttttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatatag 20036037  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20036038 tggttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacatgatgtgtg 20036134  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20036135 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattct 20036188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 552 - 795
Target Start/End: Original strand, 20834373 - 20834614
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  20834373 aagtctattgggcttaatagttt-gacataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattggagaagcctgctgaggttgattatacag 20834469  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20834470 tggttacgaactgatctggtatgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacggagtgtg 20834566  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 795  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20834567 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 20834614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 5600580 - 5600749
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5600580 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagca 5600679  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  5600680 ggata-ctatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 5600749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 5610226 - 5610395
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5610226 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagca 5610325  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  5610326 ggata-ctatagtggataatctcacacgtggtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 5610395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 611 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 22118291 - 22118140
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag-aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 709  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||    
T  22118291 gcaaataattgtagaagcatgctgatgttgataatacaggatgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttattcagaagtttctgtta 22118192  T
Q  710 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtag 761  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118191 gcaagacaactataatggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtag 22118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 31150820 - 31150651
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  31150820 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 31150722  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  31150721 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 31150651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 634 - 804
Target Start/End: Original strand, 26652642 - 26652811
Alignment:
Q  634 gaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatc 733  Q
    |||||||||||||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||    
T  26652642 gaggttgataatacaagggttctgaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatc 26652740  T
Q  734 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26652741 tcacacgaagtgtggggactggaagtagtcaggtttggtgaaccagcataactctcctgtgttattcttct 26652811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 634 - 804
Target Start/End: Original strand, 26924227 - 26924396
Alignment:
Q  634 gaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatc 733  Q
    |||||||||||||||  ||||  | |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||    
T  26924227 gaggttgataatacaagggttctgaactgatatggtgtgatcaagacctaatagtgctagttagaagtttctattagct-gaatactatagtggattatc 26924325  T
Q  734 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26924326 tcacacgaagtgtggggactggaagtagtcaggtttggtgaaccagcataactctcctgtgttattcttct 26924396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24278987 - 24278813
Alignment:
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24278987 acagttcattacaactggtactctcatgcacaagcaa-gcaacaatgcaagcaaagttaggcaaatcagacacaacatt-tgagaacgttctggctattt 24278890  T
Q  219 t-aaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatca-aaaacgtgtccaacagctctattttctccct 293  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24278889 ttaaagaagaagagagaaatcaactgagattttggacagctatcaaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 24278813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 293
Target Start/End: Original strand, 24383227 - 24383401
Alignment:
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24383227 acagttcattacaactggtactctcatgcacaagcaa-gcaacaatgcaagcaaagttaggcaaatcagacacaacatt-tgagaacgttctggctattt 24383324  T
Q  219 t-aaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatc-aaaaacgtgtccaacagctctattttctccct 293  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24383325 ttaaagaagaagagagaaatcaactgagattttggacagctatcaaaaaacgtgtccaacaactctattttctccct 24383401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 718 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 22448411 - 22448330
Alignment:
Q  718 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22448411 actatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcttgtgttatt 22448330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 349 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22118545 - 22118443
Alignment:
Q  349 aagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctct 447  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  22118545 aagagttttgaaagcaaatattctctcaa-gtgaaaatcatcactacatacaaagctcttcacaaacaaatcaaattccaagc--tctcattatatctct 22118449  T
Q  448 tggatc 453  Q
    ||||||    
T  22118448 tggatc 22118443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 718 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 37514940 - 37514856
Alignment:
Q  718 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattctt 802  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  37514940 actatagtggataatctcacacaaggtgtggggactagaagtagccggctttgatgaaccagtataaatctcatgtgttattctt 37514856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 743 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 22457722 - 22457666
Alignment:
Q  743 gtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22457722 gtgtggggactggaagtagccggattgggtgaacaaggataactcttctgtgttatt 22457666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 611 - 784
Target Start/End: Original strand, 16110881 - 16111058
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 709  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  || || || || |||||||||||||||||  | ||||| || ||  |||||| || ||    
T  16110881 gcaaataattgtataaacctgttgatgttgataatacagaatgtaacagattggtctggtgtgatcaagaacatatagtgttattccaaagtttttgata 16110980  T
Q  710 gcaagaaaactatagtggat---aatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgg-atttggtgaaccaggataa 784  Q
    | | || | ||||| |||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  16110981 gtaggata-ctataatggatggtaatctcacacgaagtgtcgggactggaagtagccggcttttggtgaaccatgataa 16111058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 751; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 751; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 3243067 - 3242281
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3243067 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 3242968  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242967 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 3242868  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242867 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 3242768  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3242767 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaag 3242668  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242667 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 3242568  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242567 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 3242468  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242467 ttgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 3242368  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3242367 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 3242281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 735; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Original strand, 26811916 - 26812702
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26811916 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 26812015  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812016 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 26812115  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812116 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 26812215  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26812216 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaag 26812315  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812316 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 26812415  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812416 aatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 26812515  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812516 ttgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 26812615  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26812616 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 26812702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 735; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Original strand, 26821383 - 26822169
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821383 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 26821482  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821483 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 26821582  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821583 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 26821682  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26821683 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaag 26821782  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821783 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 26821882  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821883 aatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 26821982  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821983 ttgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 26822082  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822083 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 26822169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 735; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 54690693 - 54689911
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690693 aagtaaagcccattaaaaggttaagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 54690594  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690593 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 54690494  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690493 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 54690394  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  54690393 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaag 54690294  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690293 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 54690194  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690193 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 54690094  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54690093 ttgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 54689994  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54689993 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 54689911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 735; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 54700124 - 54699342
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54700124 aagtaaagcccattaaaaggttaagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 54700025  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54700024 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 54699925  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699924 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 54699825  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  54699824 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgaaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaag 54699725  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699724 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 54699625  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699624 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 54699525  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699524 ttgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 54699425  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54699424 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 54699342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 727; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 801
Target Start/End: Original strand, 3917475 - 3918256
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917475 aagtaaagcccattaaatg-ataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 3917573  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917574 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 3917673  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917674 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 3917773  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3917774 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaag 3917873  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917874 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 3917973  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3917974 aatctcttcaaacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagaaagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 3918073  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3918074 ttgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtaatgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 3918173  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3918174 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 3918256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 805
Target Start/End: Original strand, 37058511 - 37059280
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  37058511 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggcacaaagttatacagctcattacagct 37058610  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37058611 ggttatctcatgcgcaagcaaaacaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaaagaacattttgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 37058710  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37058711 aatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 37058810  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37058811 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacagagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctc 37058910  T
Q  435 tcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaa 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37058911 tcactatatctcttggatcttctctcttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaa 37059009  T
Q  535 gagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatg 634  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37059010 gtgtgttgtatttctcaaagtctattgagcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctg 37059109  T
Q  635 aggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 734  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37059110 aggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 37059209  T
Q  735 cacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37059210 cacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 37059280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 15843654 - 15842892
Alignment:
Q  41 aagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttat 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15843654 aagatcacatggcttatttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagcattgggcagcaaattatacagctcattacagctggttat 15843555  T
Q  141 ctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaa 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15843554 ctcatgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaaagaacattatgagaacgttatggctattttaaagaagaaaagagaaatcaa 15843456  T
Q  241 atgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaagg 340  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15843455 ttgagactttgaacagctataaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaagg 15843356  T
Q  341 tcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcacta 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15843355 tcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcacta 15843256  T
Q  441 tatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgt 540  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15843255 tatctcttggatcttctctcttgaatttg-ctattgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgt 15843157  T
Q  541 tgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttg 640  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  15843156 tgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaatttcaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgcttaggttg 15843057  T
Q  641 ataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacg 740  Q
    |||||||||  || || |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15843056 ataatacaggtgtaacagactgatctgatgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacg 15842957  T
Q  741 aggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15842956 aggtgtggggactggaagtagccgagtttggtgaaccaagataactctcctgtgttattcctctc 15842892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 20884694 - 20884447
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20884694 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20884598  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20884597 tggttacggactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 20884501  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20884500 gggactggaagtagccgggtttggggaaccaggataactctcctgtgttattct 20884447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 50516742 - 50516493
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  || |  |  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||      
T  50516742 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaagttccaacctttcttgagcgaaag--caaagaattgtaacagcctgctgaggttgataatacaag 50516646  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||| |||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50516645 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaaatttct---accaacggaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 50516549  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50516548 ggactggaagtagtcgggtttggggaaccaggataactctcctgtgttattcttct 50516493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 11482257 - 11482507
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  11482257 aagtctattcggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagccggctgaggttgataatacag 11482353  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11482354 gggttacggactgatatggtgtgataaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 11482450  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11482451 gggactagaagtagccgggtttggacaaccaggataactctcctacgttattcttct 11482507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 23622919 - 23623088
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23622919 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagca 23623018  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  23623019 ggata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 23623088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 696 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 18125514 - 18125409
Alignment:
Q  696 agaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 795  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||    
T  18125514 agaagtttttgttagcaggata-ctataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataaatctcttgtgt 18125416  T
Q  796 tattctt 802  Q
     ||||||    
T  18125415 cattctt 18125409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 18125981 - 18125754
Alignment:
Q  221 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 320  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||| |||||| ||  ||||    
T  18125981 aagaagaaaagtgaaaccaattgaagctttggacagctg-caaaaatgtgtccaacaactcttttttcacacttgatcactaagtcactccacatatata 18125883  T
Q  321 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagc 419  Q
    |||||||| |  ||| ||| |   ||  |||| ||||| |||| || || ||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  18125882 aatacaagtggttttaaagcttcaaataaagaattttgaaagcaaacattctctcta-gtaaaaatcatcactacatacaa-gctcttcacaaacaaa-c 18125786  T
Q  420 aaattccaagctctctcactatatctcttgga 451  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  18125785 aaataccaagctctctcattataccttttgga 18125754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 614 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 16490025 - 16489947
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgct 691  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  16490025 aagaatcgtagaagtctgctgaggttgataatactgagtgtaacagactgatatggtgtgatcaacaaattatagtgct 16489947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 743 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 28256155 - 28256097
Alignment:
Q  743 gtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28256155 gtgtggggactgaaagtagccaactttgatgaaccacgataaatctcctgtgttattct 28256097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 740; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 740; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 28368433 - 28367647
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368433 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 28368334  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368333 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 28368234  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28368233 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggt-accaagacactcctcaccta 28368135  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368134 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 28368035  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaa-c 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28368034 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaac 28367935  T
Q  518 aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaaga 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367934 aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaaga 28367835  T
Q  618 attgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaa 717  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367834 attgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaa 28367735  T
Q  718 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28367734 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 28367647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 740; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 28376251 - 28375465
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28376251 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 28376152  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28376151 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 28376052  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28376051 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggt-accaagacactcctcaccta 28375953  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375952 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 28375853  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaa-c 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28375852 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaac 28375753  T
Q  518 aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaaga 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375752 aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaaga 28375653  T
Q  618 attgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaa 717  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375652 attgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaa 28375553  T
Q  718 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28375552 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 28375465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 740; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 28384073 - 28383287
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384073 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 28383974  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383973 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 28383874  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28383873 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggt-accaagacactcctcaccta 28383775  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383774 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 28383675  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaa-c 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28383674 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaac 28383575  T
Q  518 aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaaga 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383574 aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaaga 28383475  T
Q  618 attgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaa 717  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383474 attgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaa 28383375  T
Q  718 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28383374 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 28383287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 736; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 28352501 - 28351714
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352501 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 28352402  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352401 acaactcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 28352302  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352301 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 28352202  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352201 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 28352102  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatcc-aaac 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28352101 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaac 28352002  T
Q  518 aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaaga 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352001 aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaaga 28351902  T
Q  618 attgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaa 717  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28351901 attgtataagcctgctaaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaa 28351802  T
Q  718 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28351801 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagcataactctcctgtgttattcttctc 28351714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 413 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 24794932 - 24794540
Alignment:
Q  413 acaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794932 acaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatc 24794833  T
Q  513 caaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794832 caaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgc 24794733  T
Q  613 aaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794732 aaagaattgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 24794633  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794632 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 24794540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 179 - 802
Target Start/End: Original strand, 4951164 - 4951784
Alignment:
Q  179 gcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacag 278  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4951164 gcaaatcagacataacattatgagaacgttcttcctatttttaagaagaaaagagaaatcaattgagactttagacagttatcaaaaacgtgtccaacaa 4951263  T
Q  279 ctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaaga-gttttgcaagctaatat-ctctcaa 376  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||  ||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  4951264 ctctagtttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagtggttttgaaggtta-aagatagaagttttgcaagtaaatattctctcaa 4951362  T
Q  377 agtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttg 476  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| | |||    
T  4951363 -gtgaaaatcaccactacaaacaaaactctttgcaaacaaagcaaattccaagttctctcactatgtctcttggatcttctctttcgaatttgc-tattg 4951460  T
Q  477 ttaaa-ctcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaac-aaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttt 574  Q
    | ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  4951461 taaaatctcaaacaaagtgttgagtatttatttgatccaaaccaaatctcattgtacaatg--tgttgtatttctcat-gtctatttggcttaatagttt 4951557  T
Q  575 tgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgat 674  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||     
T  4951558 -gagatagaaaatttcaacctttcttttgctagtgtgtaaagaattgtagaaggctgttgaggttgataatacaggtgtaacagactgatctggtgtgac 4951656  T
Q  675 caagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtga 774  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  4951657 caataccttgtagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaaatatagtggataatctcacacgaggtgtgaggacttgaagtagtcgagtttggtga 4951756  T
Q  775 accaggataactctcctgtgttattctt 802  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4951757 accaagataactctcatgtgttattctt 4951784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 38529912 - 38529528
Alignment:
Q  23 aaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacag 122  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||  ||||||| |||     
T  38529912 aaagcccatcaaatgaataagatcacatggcatt-ttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcaacattgggcaacaagttaaacaa 38529814  T
Q  123 ctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaa 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38529813 ctcattacagctggttctctcacgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagtcagacaattcagaaagaacattctgagaacggtctggctattttaaa 38529715  T
Q  223 gaagaaaaga-gaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataa 321  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38529714 gaagaaaaaaagaaatcaattgagactttggacaactataaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttgatcaccaagacactcctcgcctataa 38529615  T
Q  322 atacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttc 408  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38529614 atacaagggcctttgaagattataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttc 38529528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 474 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 38529502 - 38529171
Alignment:
Q  474 ttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtt 573  Q
    |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38529502 ttgtaaaactaaaacaaagtattgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgtgttgtaattctcaaagtctattgggcttaatcgtt 38529403  T
Q  574 ttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtga 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||   || || |||| |||||||||||    
T  38529402 ttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctactgaggttgataatacaagtgtaacagactcatctggtgtga 38529303  T
Q  674 tcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtg 773  Q
    ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38529302 tcaagatcttatagtgctagtcagaaatttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggcactggaagtagccgggtttggtg 38529203  T
Q  774 aaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  38529202 aactatgataactctcctgtattattcctctc 38529171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 552 - 796
Target Start/End: Original strand, 5385632 - 5385874
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  5385632 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgatgatacag 5385728  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 749  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||| | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5385729 tggttacatactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcagct-gtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 5385827  T
Q  750 gactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 796  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5385828 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 5385874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 46305818 - 46305572
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  46305818 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 46305722  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  46305721 tggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactaaagtggataatctca-acgaagtgtg 46305626  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46305625 gggactggaagtagccgggtttgatgaaccaagataactctcctgtgttattct 46305572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 23486983 - 23487235
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  23486983 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaagctttcttgtgcaaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaa 23487079  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23487080 gggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtg 23487176  T
Q  748 gggactg--gaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487177 gggactgtggaagtaaccgggattggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 23487235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 611 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 13328465 - 13328273
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 710  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| | || ||||||||||   |     
T  13328465 gcaaagaattgtagaagcttgctgaggttgataatacaagggttacggactgatctggtgtgatcaagacctaatagtgttggttagaagtttct---ac 13328369  T
Q  711 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13328368 caactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagtcgggtttggtgaaccaagataactctcctgtgttattattct 13328273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 17530046 - 17529877
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  17530046 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 17529948  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  17529947 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 17529877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 32877870 - 32878039
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| || |||||    
T  32877870 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacaaattatagtgttattcagaagtttatgatagca 32877969  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  32877970 tgata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 32878039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 54624655 - 54624824
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54624655 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtatgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagca 54624754  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  54624755 ggata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 54624824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 48978670 - 48978835
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  48978670 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 48978764  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  48978765 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 48978835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 48988210 - 48988375
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  48988210 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 48988304  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  48988305 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 48988375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 455
Target Start/End: Original strand, 27168983 - 27169216
Alignment:
Q  221 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 320  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||||     |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27168983 aagaagaaaagtgaaatcaattgaatcgttggacagctgcactaaacgtgtccaacacctctattttcactcttgatcaccaagtcactcctcacctata 27169082  T
Q  321 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagc 419  Q
    || ||||| |   | ||||||  ||   |||||||||| |||  |  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  27169083 aacacaagtggtctagaaggttctatataagagttttgaaagtaagcattctctcaa-gtgaaaatcatcactacatacaaagttcttcacaaacaaa-a 27169180  T
Q  420 aaattccaagctctctcactatatctcttggatcat 455  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27169181 aaatttcaagctctctcattatatcttttggatcat 27169216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 699 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 7784089 - 7783984
Alignment:
Q  699 agtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttat 798  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  7784089 agtttctgttagcaagacaactgtagtggataatctcacatgtggtgtgggaactggaagtagtcaggtttggtgaaccagaacagttctcctgtgttat 7783990  T
Q  799 tcttct 804  Q
    ||||||    
T  7783989 tcttct 7783984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7784764 - 7784561
Alignment:
Q  190 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 289  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||     
T  7784764 agaacattctaagaacattctgtctgttt-aaagaagaaaagtgaaatcaattgaagctttggaaagctgccaaaaacatgtccaacaacactattttca 7784666  T
Q  290 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcat 388  Q
    | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |  | |||||||   ||| |||||||||  |||| | || |||||| |||||||||||||    
T  7784665 ctcttgatcaccaaggcactgctcacctataaatacaagtggttatgaaggttgaaagtaagagttttaaaagcaagtattctctc-aagtgaaaatcat 7784567  T
Q  389 cactac 394  Q
    ||||||    
T  7784566 cactac 7784561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 613 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 7784194 - 7784091
Alignment:
Q  613 aaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 711  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7784194 aaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttagtcataagtttctgttagc 7784095  T
Q  712 aaga 715  Q
    ||||    
T  7784094 aaga 7784091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 658 - 784
Target Start/End: Original strand, 19388809 - 19388936
Alignment:
Q  658 gactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta--gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgg 755  Q
    ||||||| |||||| ||||| || || |||||||| |||||||||| || ||  ||  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19388809 gactgatatggtgtcatcaacaacttatagtgctattcagaagtttatgatatagct-gaatactatagtcgataatctcacacgaagtgtggggacttg 19388907  T
Q  756 aagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19388908 aagtagccgattttggtgaaccaggataa 19388936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 696 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 4361618 - 4361513
Alignment:
Q  696 agaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 795  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||    
T  4361618 agaagtttttgttagcaggata-ctataatggataatctcacacgaggtgtggagaccgaaaataaccggatttaatgaaccaggataaatctcttgtgt 4361520  T
Q  796 tattctt 802  Q
     ||||||    
T  4361519 cattctt 4361513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4362085 - 4361858
Alignment:
Q  221 aagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctata 320  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||| |||||| ||  ||||    
T  4362085 aagaagaaaagtgaaaccaattgaagctttggacagctg-caaaaatgtgtccaacaactcttttttcacacttgatcactaagtcactccacatatata 4361987  T
Q  321 aatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagc 419  Q
    |||||||| |  ||| ||| |   ||  |||| ||||| |||| || || ||||| | || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  4361986 aatacaagtggttttaaagcttcaaataaagaattttgaaagcaaacattctctcta-gtaaaaatcatcactacatacaa-gctcttcacaaacaaa-c 4361890  T
Q  420 aaattccaagctctctcactatatctcttgga 451  Q
    |||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  4361889 aaataccaagctctctcattataccttttgga 4361858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 4951021 - 4951085
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  4951021 atggataagagcacatggcttattaaggtatgacatcactaaagcaaaaggacatgacataatca 4951085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 718 - 762
Target Start/End: Original strand, 24285493 - 24285537
Alignment:
Q  718 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagc 762  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24285493 actatagtggataatctcacacgaagtgtagggagtggaagtagc 24285537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 739; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 739; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 95211 - 94429
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95211 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 95112  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95111 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 95012  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95011 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 94912  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  94911 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaag 94812  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  94811 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatctattcgatccaaaca 94712  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94711 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 94612  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94611 ttgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 94512  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94511 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactctcctgtgttattct 94429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 739; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 104652 - 103870
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104652 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 104553  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104552 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 104453  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104452 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 104353  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  104352 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaag 104253  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  104252 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatctattcgatccaaaca 104153  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104152 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 104053  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104052 ttgtataagcctgctgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 103953  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103952 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaattagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 103870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 726; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 726; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 804
Target Start/End: Original strand, 2945 - 3726
Alignment:
Q  23 aaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2945 aaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcacaagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacag 3044  T
Q  123 ctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3045 ctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaa 3144  T
Q  223 gaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaa 322  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3145 gaagaaaagagaaatcaaaagatactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaa 3244  T
Q  323 tacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3245 tacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctgtcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaa 3344  T
Q  423 ttccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatc 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3345 ttccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatc 3444  T
Q  523 tcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3445 tcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt 3544  T
Q  623 ataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactat 722  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3545 ataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactat 3644  T
Q  723 agtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3645 agtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataattctcctgtgttattcttct 3726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 726; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 726; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 7789854 - 7789073
Alignment:
Q  23 aaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789854 aaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcacaagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacag 7789755  T
Q  123 ctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789754 ctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaa 7789655  T
Q  223 gaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaa 322  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789654 gaagaaaagagaaatcaaaagatactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaa 7789555  T
Q  323 tacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaa 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7789554 tacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctgtcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacatacaaagcaaa 7789455  T
Q  423 ttccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatc 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789454 ttccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatc 7789355  T
Q  523 tcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7789354 tcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt 7789255  T
Q  623 ataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactat 722  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7789254 ataagcctgctgaggttgataatacagaggttacagactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactat 7789155  T
Q  723 agtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7789154 agtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccagaataattctcctgtgttattcttct 7789073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 805
Target Start/End: Original strand, 20713818 - 20714263
Alignment:
Q  359 caagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctc 458  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20713818 caagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagaaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctc 20713917  T
Q  459 tcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtcta 558  Q
    | | |||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20713918 tttcgaatttgc-tattgtaaatctcaaacaaagaattgagtatttatttgatccaaacaaatctcctcataaaaagtgtgttgtatttctcaaagtata 20714016  T
Q  559 ttgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacgg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || |    
T  20714017 ttgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacag 20714116  T
Q  659 actgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaag 758  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20714117 actgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactataatggataatgtcacacgaggtgtggggactggaag 20714216  T
Q  759 tagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20714217 tagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattcttctc 20714263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 552 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 18883404 - 18883163
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18883404 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 18883308  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||| ||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18883307 gggtacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaattttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18883211  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18883210 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 18883163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 552 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 25051307 - 25051063
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25051307 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25051211  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25051210 ggttacagactgatctggtgtgatcaagacattatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 25051114  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25051113 ggactggaagtagccagattgggtgaaccaagataactctcttgtgttatt 25051063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 18143673 - 18143427
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||      
T  18143673 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaagcctactgaggttgataatacaag 18143577  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||   ||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18143576 ggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagttt---ttaccaactgaatgctatagtggataatctcacacgaagtgtgg 18143480  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18143479 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaagataactctcctgtgttattct 18143427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 552 - 792
Target Start/End: Original strand, 18232870 - 18233107
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  18232870 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18232966  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232967 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18233065  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18233066 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 18233107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 552 - 792
Target Start/End: Original strand, 18242321 - 18242558
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  18242321 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18242417  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18242418 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttgtagtgttgattagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18242516  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242517 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 18242558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 552 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 25037270 - 25037026
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25037270 aagtatattgggcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 25037174  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25037173 ggttacagactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 25037077  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25037076 ggactggaagtagccagattgggtgaaccaagataactctcttgtgttatt 25037026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 552 - 792
Target Start/End: Original strand, 18251772 - 18252009
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  18251772 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaatcctgctgaggttgataatacaga 18251868  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18251869 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 18251967  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18251968 actggaagtagccggatttggtgaatcaggataactctcctg 18252009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 42712423 - 42712173
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  42712423 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 42712327  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42712326 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 42712230  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42712229 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 42712173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 4843968 - 4843720
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgt-ataagcctgatgaggttgata--ataca 648  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  4843968 aagtctattggccttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgcta--gtgcaaagaattgtaagaagcctgatgaggttgataatataca 4843872  T
Q  649 gaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt 746  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||  | || |||| ||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4843871 agggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtcttggttagaaatttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgt 4843775  T
Q  747 ggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4843774 ggggactggaagtagccggatttagtgaaccaggataactctcctttgttattct 4843720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 552 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 31575652 - 31575411
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    ||  ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||     
T  31575652 aagtctattgggcttaatagttt-gagatagaagagttccaacctttcttgtg----tgatcaa-gaattgtagaagcttgctgaggttgataatacagg 31575559  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31575558 ggttctggactgatttggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 31575460  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31575459 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcttgtgttatt 31575411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 20044760 - 20045010
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20044760 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20044856  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20044857 gggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatcgtggataatctcacacgaagtgtg 20044953  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20044954 gggactggatgtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattcttct 20045010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Original strand, 12925296 - 12925543
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12925296 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaaa--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 12925392  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12925393 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 12925489  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12925490 gggactggaagtagtcgggtttcgtgaaccaggataactctcctgtgttattct 12925543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 20030121 - 20030371
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20030121 aagtctatttggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 20030217  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||| |   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20030218 ggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttat---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 20030314  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20030315 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattcttct 20030371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 12767573 - 12767825
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12767573 aagtctattgagcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 12767669  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12767670 gggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatctcacacgaaatgtg 12767766  T
Q  748 gggac--tggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12767767 gggactgtggaagtaaccgggattggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 12767825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 657 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 33601914 - 33601767
Alignment:
Q  657 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgga 756  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33601914 ggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactgga 33601816  T
Q  757 agtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33601815 agtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatttttctc 33601767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 657 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 33592275 - 33592134
Alignment:
Q  657 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgga 756  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33592275 ggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggtcagaagtttctgtcaact-gaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactgga 33592177  T
Q  757 agtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33592176 agtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 33592134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 611 - 798
Target Start/End: Original strand, 15833950 - 15834137
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 709  Q
    ||||||||||||| || |||  ||| ||||||||||||| | || ||| ||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15833950 gcaaagaattgtagaaacctactgatgttgataatacagggagtaacgaacttatctggtatggtcaagaacttatagtgctagtcagaagtttcagtta 15834049  T
Q  710 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttat 798  Q
    ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15834050 gcatgata-ctataatggataatctcacacgaggtgtgtggactgaaagtagccggatttggtgaaccaagataaatctcttgtgttat 15834137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 651 - 801
Target Start/End: Original strand, 12915499 - 12915648
Alignment:
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12915499 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 12915595  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12915596 ggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 12915648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 612 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 24096262 - 24096077
Alignment:
Q  612 caaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 711  Q
    |||||||||| | |||  || ||||||||||||||||  |   | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24096262 caaagaattgaagaagtttgttgaggttgataatacaaggaaaatggactgatatggtgtaatcaagaacttgtagtgctagtcaaaagtttatgttagc 24096163  T
Q  712 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgt-ggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 797  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24096162 aag-atactatagtggataatctcacacgaggtgtgggggactggaagtagtcgagtttggtgaaccagaataaatctcctgtgtta 24096077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 652 - 789
Target Start/End: Original strand, 24634009 - 24634145
Alignment:
Q  652 gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 751  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24634009 gttatggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatatcacacgaagtgtgggga 24634107  T
Q  752 ctggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctc 789  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  24634108 ctggaagtagtcgggtttgaggaaccaggataactctc 24634145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 734 - 801
Target Start/End: Original strand, 20714417 - 20714484
Alignment:
Q  734 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20714417 tcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcatgtgttattct 20714484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 657 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 42896290 - 42896174
Alignment:
Q  657 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgga 756  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42896290 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctatcaact-gaaatctatagtggataatctcacacgaagtgtggagactgga 42896192  T
Q  757 agtagccggatttggtga 774  Q
    |||||||||||| |||||    
T  42896191 agtagccggattgggtga 42896174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 376 - 455
Target Start/End: Original strand, 15833720 - 15833798
Alignment:
Q  376 aagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcat 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  15833720 aagtgaaaatcatcactacatacaaagctcctcacaaacaaa-caaattgcaagccctctcattatatcttttggatcat 15833798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 445
Target Start/End: Original strand, 15827408 - 15827476
Alignment:
Q  376 aagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatct 445  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15827408 aagtgaaaatcatcactacatacaaagtttttcacaaacaaa-caaattccaagctatctcattatatct 15827476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 738 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 26194106 - 26194048
Alignment:
Q  738 acgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 796  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26194106 acgaagtgtggggactagaagtagttgggtttgatgaaccaggataactctcatgtgtt 26194048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 711; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 711; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 805
Target Start/End: Original strand, 7592430 - 7593200
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7592430 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcatcacagct 7592529  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592530 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 7592629  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592630 aatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 7592729  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7592730 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcatacaaagcaaattccaagctctc 7592829  T
Q  435 tcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592830 tcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaa 7592929  T
Q  535 gagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatg 634  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592930 gtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatg 7593029  T
Q  635 aggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 734  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7593030 aggttgataatacaggtgttacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactataatggataatct 7593129  T
Q  735 cacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7593130 cacacgaggtgtggggactggaagtagccaggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattcttctc 7593200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 449
Target Start/End: Original strand, 15172743 - 15173157
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15172743 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgagcagcaagttatacagctcattatagct 15172842  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15172843 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 15172942  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15172943 aatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 15173042  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15173043 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagaaaattccatgctctc 15173142  T
Q  435 tcactatatctcttg 449  Q
    |||||||||||||||    
T  15173143 tcactatatctcttg 15173157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 440
Target Start/End: Original strand, 15202171 - 15202571
Alignment:
Q  37 ggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15202171 ggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggcagcaagttatacaactcattacagctgg 15202270  T
Q  137 ttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202271 ttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgcttttaaagccagacaaatcagaaagaacattcatagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaa 15202370  T
Q  237 tcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttg 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202371 tcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttg 15202470  T
Q  337 aaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15202471 aaggtcataagcaagagttttgcaag---atatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaaggaaattccaagctctctc 15202567  T
Q  437 acta 440  Q
    ||||    
T  15202568 acta 15202571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 455 - 805
Target Start/End: Original strand, 15174385 - 15174734
Alignment:
Q  455 tctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaag 554  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15174385 tctctcttgaatttgc-tcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaag 15174483  T
Q  555 tctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggtt 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||     
T  15174484 tctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattatataagcctgctgaggttgataatacaggtgta 15174583  T
Q  655 acggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15174584 acggactgatctggtgtgatcaagatcttgtagtgctagtcagaagtttttgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 15174683  T
Q  755 gaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15174684 gaagtagccgggtttggtgaaccaggataaatctcctgtgttattcttctc 15174734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 35 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4119188 - 4118893
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  4119188 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgagcaacaagttatacagctcattaaagct 4119089  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4119088 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttttggctattttaaagaagaaaagaga 4118989  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaaggg 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4118988 aatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaaggg 4118893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 552 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 11634574 - 11634337
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11634574 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcctgctgaggttgataatacaga 11634478  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||  || ||||| | || |||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11634477 ggttacaaactgatcgggtgtgatcaagacgttatagtgttggttagaagtttctgccaac-tgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggg 11634379  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11634378 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctg 11634337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 14635023 - 14634776
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14635023 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14634927  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 749  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14634926 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccagct-gcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggg 14634828  T
Q  750 gactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634827 gactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14634776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 14644723 - 14644476
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14644723 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 14644627  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14644626 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 14644530  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14644529 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14644476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 33292422 - 33292175
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33292422 aagtctattgggctcaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 33292326  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33292325 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 33292229  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33292228 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 33292175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 556 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 15947614 - 15947371
Alignment:
Q  556 ctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggt 653  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15947614 ctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggt 15947518  T
Q  654 tacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggga 751  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15947517 tacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggtga 15947421  T
Q  752 ctggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15947420 ctggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 15947371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 9736888 - 9737138
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9736888 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 9736984  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggg 749  Q
     || ||| |||||||||||||||||||||   || ||||| | || ||||||||||   | |  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9736985 gggctacagactgatctggtgtgatcaaggccttatagtgttggttagaagtttctacaaact-gaatactataatggataatctcacacgaagtgtggg 9737083  T
Q  750 gactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9737084 gactggaagtagccgggtttagtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 9737138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 32817939 - 32818188
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||| ||| |     |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  32817939 aagtctattgggcttaatagttta-agataggaaagttcgaacctttcttgtgcgaaaa--caaaaaattgtagaagcctgcggaggttgataatacagg 32818035  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32818036 ggttacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgg 32818132  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32818133 ggaccggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 32818188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 613 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 19352775 - 19352589
Alignment:
Q  613 aaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 711  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19352775 aaagaagtgtagaagcctgatgaggttcataatacagggtgtaacggaaagatctggtgtgatcaggaatttatagtacaagtcagaagtttctgttagc 19352676  T
Q  712 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19352675 aggaga-ctatagtggataatctcacacgaagtgtgaggactggaagtagccgaatttggtgaaccagtataactctcctgtattatt 19352589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 657 - 799
Target Start/End: Original strand, 13874432 - 13874572
Alignment:
Q  657 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 754  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13874432 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactg 13874528  T
Q  755 gaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13874529 gaagtag-cggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 13874572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 685 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 48710121 - 48710004
Alignment:
Q  685 tagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg-actggaagtagccggatttggtgaaccaggata 783  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  48710121 tagtgctagttagaagtttctactagct-gaatactatagtggataatctcacacgaagtgtgggggactggaagtatccgagtttggtgaaccagaata 48710023  T
Q  784 actctcctgtgttattctt 802  Q
     ||||||||||||||||||    
T  48710022 tctctcctgtgttattctt 48710004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Original strand, 7590414 - 7590463
Alignment:
Q  24 aagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcac 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7590414 aagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcac 7590463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 617 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 4306739 - 4306573
Alignment:
Q  617 aattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggtta--cggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaag 714  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||| ||| ||||||||| |||   |    
T  4306739 aattgtagaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaatcggactgatctggtgtgatcaacaacat--agtgctattcataagtttctgatagttgg 4306642  T
Q  715 aaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
    | | ||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  4306641 ata-ctatagtagaaaatctcactcgaagtgtgggaactggaagtagctggctttggtgaactaggataa 4306573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 48711526 - 48711401
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||  |  |  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||      
T  48711526 aagtctattgtgcttaatagttt-gagatagaaaagttttaacctttcttgtgtgaaag--caaagaattatagaagcctgttgaggttgataatacatg 48711430  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaaga 679  Q
     ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  48711429 tgttccgaactgatatggtgtgatcaaga 48711401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 691; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 691; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 23896380 - 23895610
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23896380 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggcagcaagttatacagctcattacagct 23896281  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896280 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 23896181  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896180 aatcaattgagactttggacaactatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 23896081  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23896080 tgaaggtcataagcaagagttttgtaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctc 23895981  T
Q  435 tcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaa 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23895980 tcactatatctcttggatcttctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaa 23895881  T
Q  535 gagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatg 634  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23895880 gtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctg 23895781  T
Q  635 aggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 734  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895780 aggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 23895681  T
Q  735 cacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895680 cacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 23895610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 675; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 805
Target Start/End: Original strand, 18419960 - 18420745
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18419960 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 18420059  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18420060 acagctcatcacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttctaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 18420159  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18420160 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 18420259  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18420260 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaag 18420359  T
Q  419 caaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaaca 518  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18420360 caaattcaaagctctctcactatatctcttggatcttctcacttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaaca 18420458  T
Q  519 aatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaa 618  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18420459 aatctcttcatacaaagtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagtttggagatagaaaattccaacctttcttttgctattgtgcaaagaa 18420558  T
Q  619 ttgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 718  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18420559 ttgtataagcctgctgaggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatttgttagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaa 18420658  T
Q  719 ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18420659 ctatagtgtataatctcacacgaggtgtcgggactggaagtagccgggttttgtgaaccaggataactatcctgtgttattcttctc 18420745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 552 - 801
Target Start/End: Original strand, 22066235 - 22066482
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22066235 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaaaagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 22066331  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22066332 tggttacggactgatctagtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 22066428  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22066429 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 22066482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 552 - 797
Target Start/End: Original strand, 23884434 - 23884677
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23884434 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 23884530  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23884531 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggacaatctcacacgaagtgtg 23884627  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 797  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23884628 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 23884677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 613 - 804
Target Start/End: Original strand, 14102308 - 14102500
Alignment:
Q  613 aaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagc 711  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| | || || | |||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14102308 aaagaattgtagaagtctgctgaggttaataatacagggtgtaacaggctgatctgttgtgatcaagaccttacagtgctagtcaaaagtttctgttagc 14102407  T
Q  712 aagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  14102408 aagacaactatagtggataatctcacaagaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataattcttcagtgttattcttct 14102500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 633 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 10259945 - 10259779
Alignment:
Q  633 tgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 731  Q
    ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||    
T  10259945 tgaggtttataatacagggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaatttatagtgctagtcagaagtttctcttagcaggata-ctatagtggagaa 10259847  T
Q  732 tctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10259846 tcccacacgaagtgtgaggactggaagtagctggatttggtgaaccagaataattctcctgtgttatt 10259779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 443
Target Start/End: Original strand, 14101770 - 14102022
Alignment:
Q  190 agaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttct 289  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  14101770 agaacattctgagaacgttcttcccgttttaatgaagaaaagtgaaatcaattgaagctttggacagctgccaaaaacgtatccaacaactctattttca 14101869  T
Q  290 cccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcat 388  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||| || | | |||||||||||  |||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  14101870 ctcttgatcaccaaggcactcctcacctataaatacaattggttttgaatgttaaatgcaagagtttttaaagcaaatattatctc-aagtgaaaatcat 14101968  T
Q  389 cactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatat 443  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  14101969 cactacatacaaaactcttcacaattaaaacaaactccaa-ctctctcactatat 14102022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 17512467 - 17512218
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||  |||  ||   |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  17512467 aagtctattgggcttaatagtttt-agataggaaaagttccaacctttctcgtgc--gtaaacaaagaattgtagaagcctgctaaggttgataatacag 17512371  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17512370 -ggttacagactgatctagtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacaagaagtgtg 17512275  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17512274 gggactgaaagtagccgagtttggtgaaccaggataactcttctgtgttattcttct 17512218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 658 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 11421591 - 11421446
Alignment:
Q  658 gactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaa 757  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421591 gactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgttagtcagaattttttgttaacatgata-ctatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaa 11421493  T
Q  758 gtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||| ||||    
T  11421492 gtagccggatttgatgaactaggataattatcttgtgttattgttct 11421446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 659 - 804
Target Start/End: Original strand, 12173469 - 12173613
Alignment:
Q  659 actgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaag 758  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  12173469 actgatctggtgtgatcaagaatttatggtgctagtcataagtttctgttagcatgata-ctatagtggataatcttacacaaggtgtggggactgaaag 12173567  T
Q  759 tagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||  |||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||    
T  12173568 tagccgagtttggtgaactatgataaatctcaggtgttattcttct 12173613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 658 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 23110359 - 23110242
Alignment:
Q  658 gactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaa 757  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23110359 gacttatctggtgtgatcaagaacatatagtgctagtcagaagtttctgttagcc-gaatactatagtggataatctaacacggggtgtggggactggaa 23110261  T
Q  758 gtagccggatttggtgaac 776  Q
    ||||| || ||| ||||||    
T  23110260 gtagctggttttcgtgaac 23110242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 712
Target Start/End: Original strand, 13218359 - 13218453
Alignment:
Q  618 attgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || | || || |||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13218359 attgtataagcttgttgaggttgataatatagtgattccgaactggtctggtgtgatcaataccttatagttctagtcaaaagtttctgttagca 13218453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 614 - 740
Target Start/End: Original strand, 12415064 - 12415190
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| |  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| | ||||||||||| ||       
T  12415064 aagaatcgtagaagcctgctatggttaataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacttattatagtgctattaagaagtttctgata-ag 12415162  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacg 740  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||    
T  12415163 aggatactataatggataatctcacacg 12415190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 444
Target Start/End: Original strand, 12173195 - 12173260
Alignment:
Q  377 agtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatc 444  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  12173195 agtgaaaatcatcactatatacaaa-ctcttcacaaacaaa-caaattctaagttctctcaatatatc 12173260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 630; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 630; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 31571 - 30817
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31571 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggcagcaagttatacagctcattacagct 31472  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31471 ggttatctcatgtgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagccaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 31372  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31371 aatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttgttcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 31272  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  31271 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagc----------------aaattccaagctctc 31188  T
Q  435 tcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaa 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31187 tcactatatctcttggatcttctctcttgaatttgcctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaa 31088  T
Q  535 gagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatg 634  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31087 gtgtgttgtatgtctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgctg 30988  T
Q  635 aggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 734  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30987 aggttgataatacaggtgttactgactgatctggtgtgatcaaaatattgtagtgttagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 30888  T
Q  735 cacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30887 cacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 30817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 46 - 800
Target Start/End: Original strand, 9481 - 10230
Alignment:
Q  46 cacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcaga-agtgggctgcaagttatacagctcattacagctggttatctca 144  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||| | | || ||  ||| ||| ||| ||||||| |||||||| | |||    
T  9481 cacatgggttatttaagcatgacatcactaaagtaaaaggacatgacataatcaaacattgagcaacaatttaaacaactcattatagctggttctttca 9580  T
Q  145 tgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatga 244  Q
      ||||||||| ||||||| ||   |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  9581 ctcgcaagcaa-gcaacagagcaagcaaagctaggcaaatcagacagaacattctgagaacgttctagctatttttaagaagaaaagtgaaaacaaatga 9679  T
Q  245 gactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggtcat 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||| |     
T  9680 gactttggacagctatcaaaaatgtgtccatcaactctattttcacccttgatcaccaagacactcctcacctatatatacaaatagttttgaaggttaa 9779  T
Q  345 aagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatat 443  Q
    | |||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9780 aggcaagagttttgaaagaaaatattctctc-aagtgaaaaacatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaatttcaagctctctcactatat 9878  T
Q  444 ctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaa-ctcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgtt 541  Q
    | |||||||  ||||| |  ||||||  | |||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  9879 cacttggatattctctttcaaatttg-ttattgtaaaatctcaaac-aggtgttgagtatttatttgatccaaaccaaatctcattatacaaagtgtgtt 9976  T
Q  542 gtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttga 641  Q
    ||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  9977 gtaattctc-aagtctattatgcttaatag-tttgagatagaaaattctaacatttatttttcta--gtgcaaagaattgtagaagcctattgaggttga 10072  T
Q  642 taatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacga 741  Q
    ||||||||  || || |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  10073 taatacaggtgtaacagactgatctggtgtgatctagaccttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcacacgg 10172  T
Q  742 ggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattc 800  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10173 ggtgtggggactggaa-tagccgtgtttggtgaaccaagataactctcatgtgttattc 10230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 525; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 31711213 - 31710460
Alignment:
Q  39 ataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagctggtt 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31711213 ataagatcacatggcttatttaagcatgacatcactaaagcaaagggacatgacatcatcagcattgggcaacaagttatacagctcattacaactggtt 31711114  T
Q  139 atctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatc 238  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||           |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31711113 ctctcacgcgcaagcaa-gcaacagtgctttcaaagccaggaaaatcagaaagaacattctg-----------gctatttttaagaagaaaagagaaatc 31711026  T
Q  239 aaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaa 338  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31711025 aattgagactttggacaactatcaaaaacgcgtccaacaactctattttctcacttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaa 31710926  T
Q  339 ggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcac 438  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31710925 ggtcataagtaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaacaaagcaaattccaagctctctcac 31710826  T
Q  439 tatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaagagt 538  Q
    ||||||||||||||| ||||| | || ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  31710825 tatatctcttggatcttctctttcgagtttgc-tattgtaaaactcaaacaaagaattgagtatttatttgatccaaacaaatctcatcatacaaagtgt 31710727  T
Q  539 gttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggt 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  31710726 gttgtatttctcaaagtctattgggcttactagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagtctgctgaggt 31710627  T
Q  639 tgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcaca 738  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31710626 tgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatctcaca 31710527  T
Q  739 cgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31710526 cgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaacaaggataactctcatgtgttattcttctc 31710460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 24023504 - 24022736
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  24023504 atggataagatcacatggcttactaaggcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacctcatcagaattgagcgacaagttaaacagctcattacagtt 24023405  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24023404 ggttctctcacgcgcaag-aaagcaacagtgctttcaaagtaaggcaattcagacagaacattctaagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 24023306  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24023305 aatcaattgagactttggatagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttgatcactaagacactcctcacctataaatacaagggcttt 24023206  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctc 434  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24023205 tgaaggttataaccaagacttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcgcaaataaagcaaattccaagctctc 24023106  T
Q  435 tcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaa 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||    
T  24023105 tcactatatctcttggatcttctctttcgaatttg-ctattgtaaaactcaaacaaagtattgagtatttatttgatccaaagaaatttcatcatacaaa 24023007  T
Q  535 gagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatg 634  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24023006 gtgtgttgtatttctcaaagtctattggggttaatagttttgagatagaaaatttcaaccttccttttgctagtgtgcaaagaattgtagaagcctgttg 24022907  T
Q  635 aggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatct 734  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24022906 aggttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagtggataatct 24022807  T
Q  735 cacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  24022806 cacacgaggtgtgggaattggaagtagccgggtttggtgaacgaggataactctccaatgttattcttctc 24022736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 526 - 804
Target Start/End: Original strand, 14273121 - 14273397
Alignment:
Q  526 tcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtata 625  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14273121 tcatacaaagtgtattgtatttctcaa-gtctattgggcttaatagttta-agatagaaaattccaacatttcttttgctagtgtgcaaagaattgtaga 14273218  T
Q  626 agcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagt 725  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  || || ||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14273219 agcctgctgaggttgataatataggtgtaacagactgatatggtgtgattaagatcttatagtgctagtcagaagtttctgttagcaagacaactatagt 14273318  T
Q  726 ggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14273319 ggataatctcacacgaggtgtggagactgaaagtagccgggtttggtgaaccaggataattctcgtgtgttattcttct 14273397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 445
Target Start/End: Original strand, 14272482 - 14272889
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgaca-tgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagc 133  Q
    |||||||||| || |||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||  | |||||  ||||| | ||| ||||||||||     
T  14272482 atggataagagcatatggtttattaaagcatgacatcactaaagcaaag-gacaatgacataatcaacattgggcaacaagtaa-acaactcattacagt 14272579  T
Q  134 tggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagag 233  Q
    ||||| || |   ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  14272580 tggttctccccctcgcaagcaa-gcaacaatgctttcaaagttaggcaattcagacagaacattctgaaaacgttctggctatttataagtagaaaagag 14272678  T
Q  234 aaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcct 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14272679 aaatcaattgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacaactctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggtct 14272778  T
Q  334 ttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaata-tctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctc 432  Q
    |||||||| | | | |||||||||| |||| || | |||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  14272779 ttgaaggttaaaggtaagagttttgaaagcaaacattctcttgaa-tgaaaatcatcactacatacaaaactcttcacaaacaaaacaaactccaa-ctc 14272876  T
Q  433 tctcactatatct 445  Q
    |||||||||||||    
T  14272877 tctcactatatct 14272889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 552 - 802
Target Start/End: Original strand, 35877458 - 35877706
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35877458 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 35877554  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35877555 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 35877651  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattctt 802  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35877652 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattctt 35877706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 552 - 802
Target Start/End: Original strand, 35884947 - 35885195
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35884947 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 35885043  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35885044 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 35885140  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattctt 802  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35885141 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattctt 35885195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 552 - 802
Target Start/End: Original strand, 36724660 - 36724908
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  36724660 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 36724756  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36724757 tggttacgaactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 36724853  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattctt 802  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36724854 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctatgttattctt 36724908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 552 - 797
Target Start/End: Original strand, 3396865 - 3397108
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||     
T  3396865 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattttagaagtctgctgaggttgataatacaa 3396961  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3396962 tggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 3397058  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtta 797  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3397059 gggactagaagtagctgggtttggtgaaccatgataactctcctgtgtta 3397108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 1800493 - 1800662
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  1800493 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 1800591  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  1800592 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 1800662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 22632402 - 22632571
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||     
T  22632402 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgttagtcagaagtttctgatagc- 22632500  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  22632501 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 22632571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 1790999 - 1791164
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||     |    
T  1790999 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctg-----a 1791093  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  1791094 tggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 1791164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 630 - 803
Target Start/End: Original strand, 18578704 - 18578877
Alignment:
Q  630 tgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtgga 728  Q
    |||||||||||||||||||| | || || || || |||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | || |  ||  ||| |    
T  18578704 tgatgaggttgataatacagggtgtaacagattggtctggtgttatcaagaacttatagtcctagtcaaaagtttctgttaggaggatat-tactgtgaa 18578802  T
Q  729 taatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttc 803  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  18578803 taatctcacacaaggtgtggggactgaaagtagtcgggtttgatgaacatggataaatctcatgtgttattcttc 18578877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 729 - 804
Target Start/End: Original strand, 29911278 - 29911353
Alignment:
Q  729 taatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  29911278 taatctcacacgaggtgaggggactggaagcagctggatttggttaaccatgataaatctcatgtgttattcttct 29911353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 718 - 787
Target Start/End: Original strand, 16446670 - 16446739
Alignment:
Q  718 actatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactc 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16446670 actatagtggataatctcacacgaaatgtggggactgaaagtagtcggatttagtgatccaggataactc 16446739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 26867 - 26309
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26867 atggataagatcacatggcttatttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagcattgggcagcaagttatacagctcattacagct 26768  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26767 gattaactcatgcgcatacaa-gcaacagtgctttcaaagccagacaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 26669  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26668 aatcaattgagactttggatagctatcaaaaatgtgtccaacatctctattttctcccttgatcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 26569  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctc 434  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||    
T  26568 tgaaggtcataagtaagagttttgcaagctaatatctctctaagtgaaaatcatcactacaaaca----------------aagcaaattccaagctctc 26485  T
Q  435 tcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaacaaatctcttcatacaaa 534  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  26484 tcactatatcccttggatcttctctcttgaatttg-ctcttgtaaaactcaaacaaagatttgagtatttattttatccaaacaaatctcatcatacaaa 26386  T
Q  535 gagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtg 611  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26385 gtgtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtg 26309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 399
Target Start/End: Original strand, 412706 - 413086
Alignment:
Q  19 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  412706 aagtaaagcccattaaatggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactaaagcaaaaggacatgacatcatcagaagtgggcagcaagttat 412805  T
Q  119 acagctcattacagctggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  412806 acagctcattacagctggttatctcatgtgcaagcaaagcaatagtgctttcaaagtcagacaaatcagaaagaacattatgagaacgttctggctattt 412905  T
Q  219 taaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcaccta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  412906 taaagaagaaaagagaaatcaattgagactttggacagctatcaaaaaagagtccaacaactctattttctcccttgatcaccaagacactcctcaccta 413005  T
Q  319 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaaca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  413006 taaatacaagggcctttgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatatctctcaaagtgaaaatcatcactacaaaca 413086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 509 - 805
Target Start/End: Original strand, 408226 - 408522
Alignment:
Q  509 gatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagt 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408226 gatccaaacaaatctcttcatacaaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagt 408325  T
Q  609 gtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 708  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  408326 gtgcaaagaattgtataagcctgaagaggttgataatacaggtgttacggactaatctggtgtgatcaagatattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 408425  T
Q  709 agcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408426 agcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagacgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 408522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 35 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 15810743 - 15809970
Alignment:
Q  35 atggataagatcacatggcttacttaagcatgacatcactagagcaaaatgacatgacatcatcagaagtgggctgcaagttatacagctcattacagct 134  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  15810743 atggataagagcacatggcttattaaaacctgacatcactaaagcaaaaggacatgacataatcagaattgagcaacaagtaaaacagctcattacagct 15810644  T
Q  135 ggttatctcatgcgcaagcaaagcaacagtgctttcaaagtcaggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagaga 234  Q
    |||| |||||  ||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||  ||    
T  15810643 ggttctctcactcgcaagcaa-gcaacagtgcaagcaaagttatgcaaatcagacataacattctgagatcattctgtctatttttaagaagaaaaatga 15810545  T
Q  235 aatcaaatgagactttggacagctatcaaaaacgtgtccaacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctt 334  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||    
T  15810544 aatcaattaggactttggacagctatcaaaaatgtgtccaacaactctatttgcaccattgatcaccaagacactcatcacctataaatacaagtggttt 15810445  T
Q  335 tgaaggtcataagcaagagttttgcaagctaatat-ctctcaaagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctct 433  Q
    ||||  | | | |||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  15810444 tgaattttaaaggcaagagttttgaaagaaaatattctctcaa-gtgaaaaacatcactacaaacaaagctcctcgcaaacaaagcaaatttcaagctct 15810346  T
Q  434 ctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctcttgttaaa-ctcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaac-aaatctcttcatac 531  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| | |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||  |||||||| |||| || | ||||    
T  15810345 ctcactatatctcttgcatcttctctttcgaatttgc-tattgtaaaatctcaaacaa-gtgttgagtatttattttatccaaaccaaatatcattatac 15810248  T
Q  532 aaagagtgttgtatttctcaaagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctg 631  Q
    |||| |||||||| ||||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| ||    
T  15810247 aaagtgtgttgtaattctcaa-gtatgttgagcttaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctggtt--caaagaattgtagaagcatg 15810152  T
Q  632 atgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 731  Q
      || |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  15810151 ccgaagttgataatacaggtgtaacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctactcagaagtttctgttaccaagataattatagtggataa 15810052  T
Q  732 tctcacacgaggtgtgggga--------ctggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    ||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  15810051 tctcacacgaggtgtggggactcgaactctggaagtagtcggatttggtgaaccaggataattctcttgtgttattattctc 15809970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 611 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 5378613 - 5378419
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 709  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| || | || || ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||    
T  5378613 gcaaagaattgtagaagtctgctgaggtttataatatagggtgtaacagactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgctagttagaagtttctgtta 5378514  T
Q  710 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5378513 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataattctcctgtgttattcttct 5378419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 611 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 14272205 - 14272016
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 710  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  14272205 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttct---ac 14272109  T
Q  711 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 801  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14272108 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgttattct 14272016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 611 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 14282071 - 14281888
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 710  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  14282071 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgtttgttagaagtttct---ac 14281975  T
Q  711 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgt 795  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14281974 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcctgtgt 14281888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 614 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 26906431 - 26906241
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26906431 aagaattgtaaaagtctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgaccaagaacttatagtgctagtcagaagtttctgttaaca 26906332  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26906331 agatat-tataatggataatctcacacgaggtatggggactagaagtagcctggtttggtgaaccaggataaatctcgtgtgttattcttct 26906241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 611 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 40999224 - 40999029
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 709  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  | || ||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  40999224 gcaaagaattgtagaagtctgttgaggttgataatacatggtgtaacaaactgatctggtgtgatcaaaaccttatagtgctagtcataagtttccgtta 40999125  T
Q  710 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  40999124 gcaagacaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagttgtcgggtttggtgaaccaggataactcttatgtgttattcctctc 40999029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 657 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 21919572 - 21919431
Alignment:
Q  657 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 754  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21919572 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgaaaactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactg 21919476  T
Q  755 gaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21919475 gaagtagccggattgggtgaatcaggataactctcctgtgttatt 21919431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 21633524 - 21633772
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa-ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  |  |  ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  21633524 aagtctattgggcataatagttt-gagatagaaaagttccaacatttcttgtgtgaaag--caaggaatt-tagaagcctgctgaggttgataatacagt 21633619  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgggg 750  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  21633620 tgttccggactgatctggtgtgaccaagaccttataatgctagtcagaagtttctactag-tagaatactatagtggataatctcacaaaaagtgtgggg 21633718  T
Q  751 actggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||    
T  21633719 actagacgtagccgggtttggtgaaccagaatatttatcttgtgttattcttct 21633772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 176 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41001003 - 41000835
Alignment:
Q  176 caggcaaatcagaaagaacattctgagaacgttctggctattttaaagaagaaaagagaaatcaaatgagactttggacagctatcaaaaa---cgtgtc 272  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||    
T  41001003 caggcaaatcagacataacattctgagatctttctgcccaattttaagaagaaaagtgaaatcaaatgagactttggacatctataaaaaaaaacgtgtc 41000904  T
Q  273 caacagctctattttctcccttggtcaccaagacactcctcacctataaatacaagggcctttgaaggt 341  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  41000903 caacatctctattttcactcttgatcaccaaggcactcctcacctataaatacaagtggttttgaaggt 41000835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 611 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 3471124 - 3470949
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 710  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || || | || |||||||||   ||     
T  3471124 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttataatgttggttagaagtttc---tac 3471028  T
Q  711 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactc 787  Q
    |||  | | |||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3471027 caattgtatactacagtggataatctcacatgaagtgtgggggctggaagtaaccgggtttggtgaaccaggataactc 3470949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 376 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 40999455 - 40999283
Alignment:
Q  376 aagtgaaaatcatcactacaaacaaagctcttcacaaacaaagcaaattccaagctctctcactatatctcttggatcatctctcttgaatttgcctctt 475  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  |    
T  40999455 aagtgaaaaacatcactacatacaaagctcttcgcaaacaaagtaaattccaagctctctcactatatctcttggatcttctctttcgaatttg-cttat 40999357  T
Q  476 gttaaactcaaacaaagatttgagtatttattcgatccaaa-caaatctcttcatacaaagagtgttgtatttct 549  Q
    || || ||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| || ||||| ||||    
T  40999356 gtaaatctcaaac-aagtgttgagaatttatttgatccaaaccaaatctcatcttacaaagtgtattgtaattct 40999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 611 - 798
Target Start/End: Original strand, 30676788 - 30676976
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtta 709  Q
    |||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||  ||    
T  30676788 gcaaagaattatataagtatgttgagattgataatacagagtgtaacagactgatcttgtgtgatcaagaacatatagtgctattcataagtttcttata 30676887  T
Q  710 gcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttg-gtgaaccaggataactctcctgtgttat 798  Q
    ||  ||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  30676888 gc-tgaatattgtaatggataatctcacacgaagtgtggggactgaaagtagtctgctttgtgtgaaccatgataaatcttgtgtgttat 30676976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 655 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 28310155 - 28310018
Alignment:
Q  655 acggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 754  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||| || |||| || | ||||||||||||||   ||||||  ||||||  || |    
T  28310155 acggactgatctggtgtgatcaacaacttatagtgttattcggaagtttttgatagc-aggatactatagtggataa--ccacacgtagtgtggaaaccg 28310059  T
Q  755 gaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 796  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28310058 gaagtagccgg-ttaggtgaatcaggataaatctcttgtgtt 28310018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 552 - 796
Target Start/End: Original strand, 256901 - 257142
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaattccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtat-aagcctgatgaggttgataatacaga 650  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  256901 aagtctattgggctgaatagttt-gagatagaaaattccaacctttcttttgctagtg--caaagaattgtaagaagcttgctgaggttgataatacaga 256997  T
Q  651 ggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtgg 748  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||||   || |||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  256998 ggttacgaactgatctggtgtgatcaagactttatagtgttggttagaagtttc---taccaactgaatactatagtggataatttcacacgaagtgtgg 257094  T
Q  749 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257095 ggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgtt 257142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 611 - 804
Target Start/End: Original strand, 124047 - 124239
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagaggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttag 710  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   |     
T  124047 gcaaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacagtggttacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---ac 124143  T
Q  711 caa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124144 caactgcatactatagtggataatctcacacgaagtgtggggactggaagtaacaggatttgatgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 124239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 552 - 679
Target Start/End: Original strand, 143111 - 143237
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  143111 aagtctattgggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 143207  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaaga 679  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  143208 tggttacggactgatctggtgtgatcaaga 143237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 633 - 784
Target Start/End: Original strand, 100002 - 100152
Alignment:
Q  633 tgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataa 731  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||| || | |||||| |||||||    
T  100002 tgaggttgataatacagagtgtaacagactgatttggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc-aggatactataatggataa 100100  T
Q  732 tctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||    
T  100101 tctcacacgtagtgtggggactggacatagccgg-ttaggcgaaccaggataa 100152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 552 - 804
Target Start/End: Original strand, 2051 - 2301
Alignment:
Q  552 aagtctattgggcttaatagttttgagatagaaaa--ttccaacctttcttttgctagtgtgcaaagaattgtataagcctgatgaggttgataatacag 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||| ||| |  |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2051 aagtctatttggcttaatagttt-gagataggaagagttccaacctttcttgtgcgaaag--caaagaattgtagaagcctgctgaggttgataatacag 2147  T
Q  650 aggttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtg 747  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | || |||||||| |   | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2148 ggattacggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttat---accaactgtatactatagtggataatctcacacgaagtgtg 2244  T
Q  748 gggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttct 804  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2245 gggactggaagtagccgggtttggtgaaccaggataactctcttgtgttattcttct 2301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 14999 - 14830
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14999 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacagactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagca 14900  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
     || | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  14899 ggata-ctatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagccgg-ttaggcgaaccaggataa 14830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 614 - 784
Target Start/End: Original strand, 24593 - 24762
Alignment:
Q  614 aagaattgtataagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagca 712  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  24593 aagaatcgtagaagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacggactgatctggtgtgatcaacatattatagtgctattcagaagtttctgatagc- 24691  T
Q  713 agaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtgaaccaggataa 784  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  24692 aggatactatagtggataatctcacacgtagtgtggggactggacgtagctgg-ttaggcgaaccaggataa 24762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 657 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 2402 - 2255
Alignment:
Q  657 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaa--gaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactg 754  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | |||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  2402 ggactgatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttct---accaactgtatactatagtggataatctcacaagaagtgtggggacta 2306  T
Q  755 gaagtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 805  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2305 gaagtagccggattgggtgaaccaggataactctcctgtgttattcttctc 2255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 657 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 12689 - 12548
Alignment:
Q  657 ggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgttagcaagaaaactatagtggataatctcacacgaggtgtggggactgga 756  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||   | | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12689 ggactaatctggtgtgatcaagaccttatagtgttggttagaagtttctaccaacta-aaaactatagtggataatctcacacgaagtgtagggactgga 12591  T
Q  757 agtagccggatttggtgaaccaggataactctcctgtgttatt 799  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12590 agtagccggattgggtgaaccaggataactctcctatgttatt 12548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 27246 - 27078
Alignment:
Q  611 gcaaagaattgta-taagcctgatgaggttgataatacagag-gttacggactgatctggtgtgatcaagaaattgtagtgctagtcagaagtttctgtt 708  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||  | ||||| || | ||||||||||| |    
T  27246 gcaaagaattgtaataagcctgctgaggttgataatacagagtgtaacgaattgatctagtgtgatcaagaacatatagtgttattaagaagtttctgat 27147  T
Q  709 agcaagaaaactatag----tggataatctcacacgaggtgtggggactggaagtagccggatttggtga 774  Q
    ||   | | |||||||    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27146 ag-ttggatactatagtggatggataatctcacacgaagtatggggactggaagtagccgactttggtga 27078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University