View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7620_high_1 (Length: 886)

Name: NF7620_high_1
Description: NF7620
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7620_high_1
NF7620_high_1
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (323-585)||(36630118-36630382)
chr1 (622-886)||(36630382-36630633)
chr1 (598-721)||(47921562-47921686)
chr1 (594-757)||(30414098-30414261)
chr1 (593-757)||(1406706-1406870)
chr1 (610-757)||(24992861-24993008)
chr1 (593-739)||(17168152-17168298)
chr1 (597-757)||(1627671-1627830)
chr1 (595-757)||(44720064-44720225)
chr1 (596-757)||(25825294-25825455)
chr1 (591-692)||(30819574-30819675)
chr1 (596-755)||(2964860-2965019)
chr1 (597-757)||(1838656-1838817)
chr1 (615-757)||(43939448-43939590)
chr1 (593-717)||(7336093-7336218)
chr1 (598-714)||(14463321-14463438)
chr1 (606-731)||(40460991-40461116)
chr1 (637-757)||(8549558-8549678)
chr1 (597-717)||(25671012-25671133)
chr1 (597-757)||(26213695-26213855)
chr1 (607-717)||(42470767-42470878)
chr1 (595-700)||(17452949-17453054)
chr1 (598-750)||(9005430-9005580)
chr1 (684-782)||(38509615-38509713)
chr1 (672-757)||(49660363-49660448)
chr1 (598-690)||(5226801-5226893)
chr1 (632-739)||(10769783-10769890)
chr1 (621-712)||(15661119-15661211)
chr1 (630-712)||(10835582-10835664)
chr1 (669-757)||(42470573-42470661)
chr1 (593-664)||(49659888-49659959)
chr1 (699-781)||(22675169-22675250)
chr1 (654-739)||(26897311-26897396)
chr1 (607-687)||(30289030-30289110)
chr1 (677-755)||(1469693-1469771)
chr1 (595-634)||(1469752-1469791)
chr1 (597-755)||(4105513-4105662)
chr1 (677-755)||(2752654-2752732)
chr1 (273-322)||(36630017-36630066)
chr1 (595-648)||(38509725-38509778)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (594-782)||(36418711-36418899)
chr3 (594-757)||(6125768-6125932)
chr3 (599-757)||(39328415-39328573)
chr3 (596-787)||(37702540-37702730)
chr3 (594-757)||(50090829-50090992)
chr3 (595-757)||(54253794-54253956)
chr3 (595-757)||(3283271-3283433)
chr3 (615-757)||(34673343-34673485)
chr3 (594-757)||(13700249-13700412)
chr3 (593-705)||(34673519-34673631)
chr3 (594-717)||(54160386-54160510)
chr3 (596-755)||(54411793-54411952)
chr3 (593-735)||(21395882-21396024)
chr3 (597-757)||(8674537-8674697)
chr3 (597-756)||(45408247-45408406)
chr3 (594-755)||(9665307-9665468)
chr3 (594-757)||(42092805-42092969)
chr3 (597-757)||(52945571-52945730)
chr3 (622-757)||(41355439-41355574)
chr3 (619-757)||(4125996-4126134)
chr3 (614-755)||(38101190-38101331)
chr3 (620-757)||(52089066-52089204)
chr3 (616-725)||(36227811-36227920)
chr3 (615-705)||(34673457-34673547)
chr3 (595-719)||(19855463-19855588)
chr3 (620-755)||(11238690-11238825)
chr3 (607-750)||(20513037-20513180)
chr3 (671-757)||(27418763-27418847)
chr3 (606-719)||(8351062-8351176)
chr3 (596-757)||(35180573-35180734)
chr3 (621-757)||(35280433-35280569)
chr3 (593-728)||(35711856-35711991)
chr3 (678-750)||(46770514-46770586)
chr3 (595-755)||(5232615-5232778)
chr3 (652-755)||(19228619-19228722)
chr3 (651-737)||(27026656-27026742)
chr3 (593-692)||(39867134-39867233)
chr3 (653-737)||(27038002-27038086)
chr3 (640-716)||(53518908-53518985)
chr3 (654-719)||(21481947-21482013)
chr3 (597-643)||(27027333-27027379)
chr3 (606-700)||(27432054-27432149)
chr3 (669-700)||(53518869-53518900)
chr3 (643-750)||(53581551-53581658)
chr3 (597-643)||(46770495-46770541)
chr3 (677-757)||(46969897-46969977)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (594-757)||(43837689-43837852)
chr4 (606-755)||(47960296-47960445)
chr4 (593-757)||(6137256-6137420)
chr4 (594-757)||(34728219-34728382)
chr4 (596-782)||(51682534-51682719)
chr4 (596-782)||(13387863-13388048)
chr4 (597-739)||(38427086-38427228)
chr4 (597-750)||(19329360-19329513)
chr4 (593-782)||(20503429-20503617)
chr4 (607-757)||(32626061-32626211)
chr4 (594-739)||(42434246-42434391)
chr4 (593-757)||(51702453-51702617)
chr4 (607-757)||(11020347-11020497)
chr4 (595-757)||(20835705-20835867)
chr4 (593-756)||(13386980-13387143)
chr4 (596-750)||(32089969-32090123)
chr4 (597-757)||(34041191-34041351)
chr4 (598-717)||(5975657-5975777)
chr4 (596-757)||(48860725-48860883)
chr4 (597-756)||(52344494-52344654)
chr4 (607-757)||(40479857-40480007)
chr4 (652-757)||(27907045-27907150)
chr4 (599-750)||(52719062-52719215)
chr4 (618-748)||(6944568-6944698)
chr4 (597-717)||(33117514-33117635)
chr4 (625-739)||(32868013-32868127)
chr4 (618-739)||(16467174-16467295)
chr4 (650-757)||(53773684-53773792)
chr4 (620-738)||(13372395-13372513)
chr4 (620-738)||(13382596-13382714)
chr4 (595-674)||(22254221-22254300)
chr4 (653-757)||(40875268-40875372)
chr4 (597-757)||(38962407-38962565)
chr4 (673-757)||(7603622-7603706)
chr4 (593-643)||(54158113-54158163)
chr4 (678-726)||(26889493-26889541)
chr4 (671-738)||(849255-849322)
chr4 (598-667)||(38963331-38963400)
chr4 (596-626)||(7645950-7645980)
chr4 (677-727)||(42560155-42560205)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (595-782)||(27130995-27131181)
chr7 (593-782)||(38368156-38368345)
chr7 (594-739)||(42373471-42373616)
chr7 (593-757)||(48227226-48227390)
chr7 (595-757)||(45099969-45100131)
chr7 (596-757)||(41378366-41378527)
chr7 (598-750)||(21993471-21993623)
chr7 (606-748)||(12362836-12362978)
chr7 (597-757)||(24251831-24251994)
chr7 (595-714)||(43077530-43077650)
chr7 (594-750)||(31953156-31953312)
chr7 (594-757)||(3203282-3203449)
chr7 (610-749)||(20568271-20568411)
chr7 (597-755)||(27946820-27946978)
chr7 (631-739)||(48709048-48709156)
chr7 (596-757)||(35983106-35983267)
chr7 (596-757)||(36004518-36004679)
chr7 (597-757)||(35221660-35221825)
chr7 (598-757)||(3961178-3961337)
chr7 (595-757)||(5995047-5995210)
chr7 (630-757)||(41585874-41586001)
chr7 (595-755)||(46003729-46003890)
chr7 (606-757)||(41037134-41037285)
chr7 (663-757)||(26927960-26928054)
chr7 (595-679)||(3875107-3875189)
chr7 (677-757)||(32392232-32392313)
chr7 (618-757)||(24611437-24611576)
chr7 (678-757)||(7596874-7596953)
chr7 (596-757)||(9522461-9522619)
chr7 (669-736)||(3875211-3875277)
chr7 (662-755)||(3350011-3350104)
chr7 (675-752)||(8953288-8953365)
chr7 (709-781)||(31853772-31853844)
chr7 (593-641)||(32392287-32392335)
chr7 (671-750)||(3407148-3407227)
chr7 (615-682)||(36343021-36343088)
chr7 (662-722)||(44868031-44868091)
chr7 (710-757)||(36343104-36343150)
chr7 (677-750)||(20009183-20009256)
chr7 (656-722)||(37187248-37187313)
chr7 (593-634)||(48625002-48625043)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (595-757)||(23204375-23204537)
chr5 (596-782)||(19323673-19323859)
chr5 (597-757)||(27365716-27365876)
chr5 (594-757)||(13960375-13960538)
chr5 (595-757)||(16273562-16273725)
chr5 (595-724)||(31056403-31056532)
chr5 (594-757)||(9741723-9741886)
chr5 (606-724)||(31042554-31042672)
chr5 (595-750)||(18015642-18015796)
chr5 (594-717)||(16994176-16994300)
chr5 (595-757)||(37172390-37172552)
chr5 (595-732)||(28038226-28038364)
chr5 (596-757)||(28813056-28813218)
chr5 (596-782)||(38758595-38758779)
chr5 (598-692)||(20269235-20269329)
chr5 (593-757)||(17689337-17689500)
chr5 (659-739)||(5497759-5497839)
chr5 (618-739)||(38293494-38293616)
chr5 (677-755)||(23129597-23129675)
chr5 (593-665)||(21913836-21913908)
chr5 (630-737)||(19325055-19325163)
chr5 (652-713)||(26730345-26730407)
chr5 (652-750)||(19995334-19995429)
chr5 (688-757)||(25593283-25593352)
chr5 (676-757)||(19863106-19863187)
chr5 (608-754)||(15978814-15978958)
chr5 (677-750)||(16490924-16490997)
chr5 (592-648)||(33429249-33429305)
chr5 (595-642)||(19863159-19863206)
chr5 (593-643)||(23129647-23129697)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (597-782)||(4206430-4206618)
chr2 (596-757)||(39089096-39089257)
chr2 (597-757)||(18924532-18924692)
chr2 (595-757)||(9548203-9548365)
chr2 (596-757)||(29471627-29471788)
chr2 (595-755)||(33740233-33740393)
chr2 (596-757)||(1749909-1750072)
chr2 (595-757)||(24314213-24314375)
chr2 (597-739)||(42090415-42090557)
chr2 (597-757)||(12725710-12725870)
chr2 (598-757)||(10664684-10664843)
chr2 (597-757)||(39961531-39961691)
chr2 (677-780)||(27175442-27175545)
chr2 (597-707)||(39434974-39435084)
chr2 (606-752)||(44539841-44539988)
chr2 (596-739)||(25880575-25880722)
chr2 (593-757)||(34125541-34125702)
chr2 (606-722)||(2969675-2969792)
chr2 (607-755)||(21950650-21950798)
chr2 (652-757)||(12895384-12895489)
chr2 (595-697)||(16719780-16719882)
chr2 (677-750)||(29511837-29511911)
chr2 (596-676)||(25810479-25810559)
chr2 (652-757)||(5534282-5534387)
chr2 (677-757)||(34450334-34450414)
chr2 (677-734)||(5601710-5601767)
chr2 (677-757)||(10862595-10862675)
chr2 (653-734)||(22594149-22594230)
chr2 (595-634)||(10862575-10862614)
chr2 (683-750)||(18370357-18370424)
chr2 (678-755)||(6231240-6231317)
chr2 (595-628)||(27097032-27097065)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (597-782)||(1270993-1271182)
chr8 (593-757)||(12176202-12176366)
chr8 (593-757)||(12420630-12420794)
chr8 (596-738)||(38498265-38498407)
chr8 (594-781)||(14041328-14041514)
chr8 (597-747)||(5224300-5224449)
chr8 (595-757)||(10078303-10078462)
chr8 (606-719)||(39077316-39077430)
chr8 (595-751)||(26912324-26912480)
chr8 (596-750)||(9478711-9478865)
chr8 (597-755)||(40067550-40067708)
chr8 (597-757)||(16930800-16930960)
chr8 (594-757)||(33568064-33568227)
chr8 (593-739)||(12295180-12295326)
chr8 (597-751)||(16784331-16784478)
chr8 (593-757)||(23472511-23472674)
chr8 (597-755)||(42806210-42806370)
chr8 (606-757)||(31272770-31272921)
chr8 (595-757)||(30774124-30774286)
chr8 (622-757)||(253946-254081)
chr8 (622-757)||(661777-661912)
chr8 (598-725)||(13326958-13327084)
chr8 (597-711)||(44873913-44874028)
chr8 (598-750)||(22812325-22812476)
chr8 (652-757)||(19922566-19922671)
chr8 (595-719)||(9479413-9479538)
chr8 (622-757)||(847575-847710)
chr8 (594-717)||(28539161-28539285)
chr8 (608-757)||(28969096-28969244)
chr8 (597-700)||(1983531-1983634)
chr8 (677-731)||(40301372-40301426)
chr8 (593-757)||(14916658-14916822)
chr8 (677-757)||(3210863-3210943)
chr8 (607-667)||(10775933-10775993)
chr8 (652-754)||(38092157-38092259)
chr8 (617-692)||(41829580-41829655)
chr8 (677-757)||(16645476-16645556)
chr8 (593-634)||(39589995-39590036)
chr8 (597-682)||(44473748-44473833)
chr8 (599-643)||(14371614-14371658)
chr8 (595-634)||(16645537-16645576)
chr8 (669-755)||(41624649-41624735)
chr8 (597-634)||(3210924-3210961)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (598-757)||(10074994-10075153)
chr6 (606-757)||(12159444-12159595)
chr6 (593-721)||(9891369-9891498)
chr6 (595-757)||(6322488-6322650)
chr6 (599-757)||(17347042-17347200)
chr6 (614-757)||(15081138-15081281)
chr6 (596-757)||(18096330-18096485)
chr6 (596-757)||(18102450-18102605)
chr6 (608-748)||(9533376-9533519)
chr6 (676-757)||(22423894-22423975)
chr6 (652-719)||(19104313-19104381)
chr6 (683-755)||(29427232-29427304)
chr6 (673-722)||(8062086-8062135)
chr6 (652-757)||(14975402-14975505)
chr6 (651-719)||(25090554-25090623)
chr6 (699-782)||(28295595-28295677)
chr6 (699-782)||(28516396-28516478)
chr6 (664-750)||(32645707-32645793)
chr6 (597-675)||(30416461-30416539)
chr6 (653-690)||(7190660-7190697)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (600-752)||(103247-103399)
scaffold0003 (678-738)||(88185-88245)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (593-757)||(392402-392566)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (594-749)||(35051-35206)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (596-719)||(231162-231286)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (600-757)||(9155-9311)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (606-717)||(478319-478431)
scaffold0002 (653-757)||(94805-94909)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (607-757)||(17796-17946)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (676-750)||(24586-24660)
scaffold0112 (677-757)||(35895-35975)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (597-757)||(121629-121789)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (652-747)||(3773-3867)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (599-675)||(77027-77103)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (677-757)||(8524-8604)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-102; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 323 - 585
Target Start/End: Original strand, 36630118 - 36630382
Alignment:
Q  323 tacaattaagtggagtggacatgttgtttttctaacttagtattatactactacactcattttgtcacttccatagtcatttcatttcaagtttttaatt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36630118 tacaattaagtagagtggacacgttgattttttaattgagtgttacactactacactcattttgtcacttccatagtcatttcatttcaagtttttaatt 36630217  T
Q  423 tcactagtttattggccacta--atgacaagtcccttcagaaaacaaattttcattttcataacataagtctcttccttattgagtgctacactactgct 520  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  36630218 tcactagtttattgaccactataatgacaagtcccttcaaaaaacaaattttcattttcataacacaagtctcttccttattctgtactacactactgct 36630317  T
Q  521 tacaaccatattcaaaattatattgttgctgtcctgtaataaaattttagcgatttgttgactaa 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36630318 tacaaccatattcaaaattatattgttgctgtcctgtaataaaattttggcgacttgttgactaa 36630382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 622 - 886
Target Start/End: Original strand, 36630382 - 36630633
Alignment:
Q  622 aaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggata 721  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |            |||||||||||||||||||||||||||    
T  36630382 aaggtgtcttttaaaaagttatcctattgacatttactaaaagacaccaactaattttttt------------tagcaagttataattaaaaagtggata 36630469  T
Q  722 atcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaaccgttttctttaatagtattataactccaaacaannnnnnn 821  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  36630470 atcacatcttgagatatgacttgctaaaaaacacctataaag-gtgtcttgtagcaaaacccttttctttaatagtattataactccaaacaattttttt 36630568  T
Q  822 atatattactattagttgcttgtcttgagaacgcccgactttgtgtggtttgtccttattgaacc 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36630569 atatattactattagttgcttgtcttgagaacgcccgactttgtgtgatttgtccttattgaacc 36630633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 598 - 721
Target Start/End: Original strand, 47921562 - 47921686
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  47921562 ttttgctagaagacgccttttatgaaggtgttttttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagataccaattaatttttatgaaggtgtcttttag 47921661  T
Q  698 c-aagttataattaaaaagtggata 721  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  47921662 caaagttataactaaaaagtggata 47921686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 30414261 - 30414098
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  30414261 agggttttgctagaatacaccttttatgaaggtgttttttagcaagttattatattagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctt 30414162  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  30414161 ttagcaaagttataactaaaaaatgga-aataacaccttgagatgtgggttgctaaaagacacct 30414098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Original strand, 1406706 - 1406870
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  1406706 tagggttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaaattattctatgaacatttggtaaaagacaccgactaatttttgtgaaggtgtct 1406805  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  1406806 tttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacactttgagatgtgagttgttaaaaaacacct 1406870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 610 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 24993008 - 24992861
Alignment:
Q  610 acaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataat 708  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||     
T  24993008 acaccttttatgaaggtgtcttttagcaaattattatattagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttaacaaagttataac 24992909  T
Q  709 taaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  24992908 taaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 24992861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 593 - 739
Target Start/End: Original strand, 17168152 - 17168298
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  17168152 taggattttgctagaagacaccaattatgaaggtgtcttttaacaagttattctatatgcatttgctaaaagacactagttaatttttatgaaggtgtct 17168251  T
Q  693 cttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
     |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  17168252 tttagcaagttataactaaaaaattgataatcacattttgaggtgtg 17168298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 1627830 - 1627671
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1627830 gttttgctagaagacaccttttataaagatgtcttttagcaagttattctatgaacatttgctaaaagaca-caactaacttttatgaaggtgtctttta 1627732  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||| ||||||    
T  1627731 gcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttactaaaagacacct 1627671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Original strand, 44720064 - 44720225
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  44720064 gggttttgttagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctattagcaattggtaaaagacatcaactaatttttatg-aggtgtcttt 44720162  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || | ||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  44720163 taacaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttaaggtgtgagttgctaaaagacacct 44720225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 25825455 - 25825294
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||   ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |     
T  25825455 ggttttgttagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattttatgagcatttgttaaaagacacaaactaatttttatggaggtgcctttc 25825356  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  25825355 agcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 25825294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 591 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 30819675 - 30819574
Alignment:
Q  591 tttagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgt 690  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30819675 tttaggattttgctagaagacaccttttatgaaggtgttttttagcaaattatcctataggcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgt 30819576  T
Q  691 ct 692  Q
    ||    
T  30819575 ct 30819574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 596 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 2965019 - 2964860
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  2965019 ggttttgctagaagacaccgtttatgaaggtgtcttctagcaagttattctatgaacatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttta 2964920  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    ||| || |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  2964919 agcaaaattataactaaaaagtgga-aatgacaccttgagatgtggattgctaaaagacac 2964860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 1838817 - 1838656
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  1838817 gttttgttagaagacacattttatgaaagtgtcttttagtaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttta 1838718  T
Q  697 gc--aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  1838717 gcaaaagttataactaaaaagtgga-aatcacacattgaggtgtgggttgctaaaagacacct 1838656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 615 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 43939590 - 43939448
Alignment:
Q  615 ttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaa 713  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||    
T  43939590 ttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgtcttttaacaaaattataactaaaa 43939491  T
Q  714 agtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  43939490 agt-gaaaatcacaccttgaggtgtggattgctaaaagacacct 43939448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 593 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 7336218 - 7336093
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||  ||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7336218 tagggttttgctagaagacacattttattaaggtgtcttttagcaaattactctataagcatttgttaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgtct 7336119  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtg 717  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||    
T  7336118 tttagcaaagttataactaaaaagtg 7336093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 714
Target Start/End: Original strand, 14463321 - 14463438
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||     
T  14463321 ttttgctagaagacaccttttatgaaggtgttttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacactaactaatttttatgaaggtgtcttttaa 14463420  T
Q  698 c-aagttataattaaaaa 714  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  14463421 caaagttataagtaaaaa 14463438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 606 - 731
Target Start/End: Original strand, 40460991 - 40461116
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag-caagtta 704  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||  ||||||    
T  40460991 gaagacactttttatgaaggtgtcttttagcaagttattatatgaacatttgttaaaagacaccaagtaatttttatgaaagtatcttttagtaaagtta 40461090  T
Q  705 taattaaaaagtggataatcacatctt 731  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40461091 taactaaaaagtgga-aatcacatctt 40461116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 637 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 8549678 - 8549558
Alignment:
Q  637 aagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgagg 735  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  8549678 aagttattctattagcatttgttaaaagacactaactaatttttatgaaggtgttttttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgagg 8549580  T
Q  736 tgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||  ||||||||| ||||||    
T  8549579 tgtggattgctaaaatacacct 8549558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 597 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 25671133 - 25671012
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    ||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25671133 gttttgctaaaagacatattttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttta 25671034  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtg 717  Q
     | ||||||||| |||||||||    
T  25671033 acaaagttataactaaaaagtg 25671012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 26213855 - 26213695
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||| |||    
T  26213855 gttttgctagaagacacattttacgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaaaacatcaactaatatttataaatgtgtctttta 26213756  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     | |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  26213755 acaaagttataattaaaaagt-gagagtcacagcttgaggtgtcggttgctaaaagacacct 26213695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 607 - 717
Target Start/End: Original strand, 42470767 - 42470878
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttat 705  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  42470767 aagacacattttatgaagatgtgctttaacaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttaacaaaattat 42470866  T
Q  706 aattaaaaagtg 717  Q
    ||||||||||||    
T  42470867 aattaaaaagtg 42470878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 595 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 17453054 - 17452949
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  17453054 gggttttactcgaagacactttttatgaaggtgtcttttagcaagctattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttgtgaaggtgtcttt 17452955  T
Q  695 tagcaa 700  Q
    ||||||    
T  17452954 tagcaa 17452949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 598 - 750
Target Start/End: Original strand, 9005430 - 9005580
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaag--gtgtctctt 695  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||    |||||||| |||||||  |||||| ||    
T  9005430 ttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatcagcatttgttaaaagac----actaatttctatgaaggtgtgtctttt 9005525  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    ||| || |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  9005526 agcaaaattataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgcggattgctaaaa 9005580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 684 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 38509713 - 38509615
Alignment:
Q  684 aaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  38509713 aaggtgtcttttatcatgttataactaaaaagtggataatcacacattgaggtgtagattgctaaaagacaccttcaaagagtgtcttttagcaaaacc 38509615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 672 - 757
Target Start/End: Original strand, 49660363 - 49660448
Alignment:
Q  672 ctaatttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  49660363 ctaatttttatgaaggtgtcttttaacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaacttgaggtgtgagttgctaaaagacacct 49660448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 598 - 690
Target Start/End: Original strand, 5226801 - 5226893
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgt 690  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5226801 ttttgctaaaagacacattttatgaaggtgtcttttaacaagttattatatgagtatttgttaaaaaacaccaactaatttttatgaaggtgt 5226893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 632 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 10769890 - 10769783
Alignment:
Q  632 ttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta-gcaagttataattaaaaagtggataatcacatct 730  Q
    |||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  10769890 ttaacaagttattctataagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgccttttatccaagttataactaaaaagtgga-aatcacacct 10769792  T
Q  731 tgaggtgtg 739  Q
    | |||||||    
T  10769791 tcaggtgtg 10769783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 621 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 15661211 - 15661119
Alignment:
Q  621 gaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaa 712  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  15661211 gaaggtgttttttagcaagttattttataagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaa 15661119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 630 - 712
Target Start/End: Original strand, 10835582 - 10835664
Alignment:
Q  630 ttttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaa 712  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||| ||||    
T  10835582 ttttagcaaattatcctattgacatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaagtgtgttctagcaaattataactaaa 10835664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 669 - 757
Target Start/End: Original strand, 42470573 - 42470661
Alignment:
Q  669 caactaatttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  42470573 caactaatttttatgaatgtatcttttaacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgaattgctaaaagacacct 42470661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 664
Target Start/End: Original strand, 49659888 - 49659959
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaag 664  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  49659888 tagggttttgttagaagacacctttcatgaaggtgttttttagcaagttattctatgaacatttgttaaaag 49659959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 699 - 781
Target Start/End: Original strand, 22675169 - 22675250
Alignment:
Q  699 aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaac 781  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22675169 aagttataactaaaaaa-ggataatcacaccttgaggcgtggcttactaaaagacacctctaaagagtgtcttctagcaaaac 22675250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 654 - 739
Target Start/End: Original strand, 26897311 - 26897396
Alignment:
Q  654 tttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  26897311 tttgctaaaagacaccaactaatttttatgaagatgttttttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttaaggtgtg 26897396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 30289110 - 30289030
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaagg 687  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||  | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  30289110 aagacacgttttatgaaggcgtcttttaacaagttattttatgaatatttgttaaaaggcaccaactattttttatgaagg 30289030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 1469771 - 1469693
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    |||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  1469771 ttttatgaaggtgtcttttagaaaagctataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacac 1469693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1469791 - 1469752
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtatttta 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1469791 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtctttta 1469752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 755
Target Start/End: Original strand, 4105513 - 4105662
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||| ||         ||||||||||||| |||    
T  4105513 gttttgttagaagacatcttttatgaaggtgatttttaacaagttattttatcaacatttgttaaaaaacacca---------tatgaaggtgtctttta 4105603  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    || ||||||||| |||||||| || |||||||  || |||| ||| ||||||||| ||||    
T  4105604 gcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacacattaaggtatgaattgctaaaagacac 4105662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 677 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 2752732 - 2752654
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  2752732 ttttatgaggctgtcttttagcaagttataactaaaaaactgataattacaccttgaggtgtggattgctaaaagacac 2752654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Original strand, 36630017 - 36630066
Alignment:
Q  273 tgtgattctaacctgaaaaaattgaggacaagaatttcaccaagttcttg 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  36630017 tgtgactctaacctgaaaaaattgaggataagaaattgatcaagttcttg 36630066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 38509778 - 38509725
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctat 648  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  38509778 gggttttgttagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaaattatcctat 38509725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 594 - 782
Target Start/End: Original strand, 36418711 - 36418899
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||     
T  36418711 agggttttgctagaagacaccttttatgaaagtgtcttttagcaagttatcctattgacatttgttaaaagacaccaattattttttatcaaggtgtctt 36418810  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  36418811 ttagcaaagttataattaaaaagtggat-atcacaccttaaggtgtgacttgctaaaaaacacctctaaagagtgtcttcttgcaaaacc 36418899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Original strand, 6125768 - 6125932
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  6125768 agggttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttatcttatagacatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctt 6125867  T
Q  694 ttagcaagttataa-ttaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6125868 ttagcaagttataactaaaaaagtggataatcacaccttgaggtgtaagttgctaaaaaacacct 6125932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 599 - 757
Target Start/End: Original strand, 39328415 - 39328573
Alignment:
Q  599 tttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc 698  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39328415 tttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttatcctattgacatttcttaaaagacaccaactaatttttatgaaagtgtcttttagc 39328514  T
Q  699 -aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  39328515 aaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtggattgttaaaagacacct 39328573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 596 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 37702730 - 37702540
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  37702730 ggttttgctagaagacaccttttttgaaagtgtcttttagcaagttatcctattggcatttgctaatagacaccaactaatttttatgaaggtgtttttt 37702631  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaaccgtttt 787  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||| ||| |||||| ||||  |||| || |||||||||| ||||    
T  37702630 agcaaagttataactaaaaagtggat-atcacaccttgatttgtggcttgct-aaagacacctctaaaaggtgttttctagcaaaaccctttt 37702540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 50090992 - 50090829
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |     
T  50090992 agggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctattaacatttggtgaaagacaccaactaatttttatgaaagtgtttt 50090893  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  50090892 ttagcaaaattataactaaaaagtgga-aatcacaccttaaggtgtggattgctaaaagacacct 50090829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 54253956 - 54253794
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  54253956 gggttttgctagaagacgcattttatgaaggtgtattttagcaagttattctatgagcatttcctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 54253857  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  54253856 taacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 54253794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 3283433 - 3283271
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  3283433 gggttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 3283334  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  3283333 tagcaaagctataactaaaaagt-aaaaatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 3283271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 615 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34673485 - 34673343
Alignment:
Q  615 ttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaa 713  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  34673485 ttttatgaaggtgtcttttagcaagttattatattagtatttgttaaaagacatcaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaa 34673386  T
Q  714 agtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  34673385 agtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 34673343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 13700412 - 13700249
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattga-catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13700412 agggttttgctagaagacacattttatgaaggtgttttttaataagttattct-ttgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtatct 13700314  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13700313 tttaacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacacattgaggtgtgggttgctaaaagacacct 13700249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 593 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 34673631 - 34673519
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34673631 tagggctttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattatattagtatttgttaaaagacatcaactaatttttatgaaggtgtct 34673532  T
Q  693 cttagcaagttat 705  Q
     ||||||||||||    
T  34673531 tttagcaagttat 34673519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 594 - 717
Target Start/End: Original strand, 54160386 - 54160510
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  54160386 agggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctataagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctt 54160485  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtg 717  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||    
T  54160486 ttaacaaagttataacaaaaaagtg 54160510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 596 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 54411952 - 54411793
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||    
T  54411952 ggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgttttttagcaagatattctatgatcatttgctaaaagacaccaactaatttttataaaggtgtttttt 54411853  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||    
T  54411852 agcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtaggttgctaaaagacac 54411793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 593 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 21396024 - 21395882
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  21396024 tagggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgttttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaactaaattttataaatgtgtct 21395925  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgagg 735  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||    
T  21395924 tttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgagg 21395882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Original strand, 8674537 - 8674697
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||   |||||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8674537 gttttgctagaagacaccttttatgaaagtgtcttttagcaagttattttatgagcatttgctaaaacagaccaactgatttttatgaaggtgtctttta 8674636  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  8674637 gcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtatgaattgctaaaagacacct 8674697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 597 - 756
Target Start/End: Original strand, 45408247 - 45408406
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||   |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45408247 gttttgctagaaaacaccttttatgaaagtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacacaaactaatttttatgaaggtgtctttta 45408346  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacc 756  Q
     | || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  45408347 ccaaaattataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgcgttgctaaaagacacc 45408406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 594 - 755
Target Start/End: Original strand, 9665307 - 9665468
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtg-tct 692  Q
    ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  9665307 agggttttgttaaaagacaccttctatgaaggtgtcttttaacaagttattctattaacatttgttaaaagacattaactaatttttatgaaggtgttct 9665406  T
Q  693 cttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
     ||   ||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  9665407 tttgcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacacattgaggtatgggttgctaaaagacac 9665468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Original strand, 42092805 - 42092969
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtg-tct 692  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||     |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |    
T  42092805 agggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagtctttgttaaaagacaccaattaatttttataaaggtgtttt 42092904  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  42092905 tttagcaaagttataactaaaaaatgga-aatcataccttgaggtgtggattgctaaaaaacacct 42092969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Original strand, 52945571 - 52945730
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||   |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52945571 gttttgctagaaga-acattttatgaaagtgtcttttagcaagttattcaatgagcatttggtaaaaggcaccaactaatttttatgaaggtgtctttta 52945669  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52945670 gcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacactttgaggtgtgagttgctaaaagacacct 52945730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 622 - 757
Target Start/End: Original strand, 41355439 - 41355574
Alignment:
Q  622 aaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggat 720  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||     
T  41355439 aaggtgtcttttaacaagttattcaatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttatagcaaagttataactaaaaagtgga- 41355537  T
Q  721 aatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  41355538 aatcacaccttgagttgtgggttgctaaaagacacct 41355574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 619 - 757
Target Start/End: Original strand, 4125996 - 4126134
Alignment:
Q  619 atgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtg 717  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4125996 atgaaggtgtcttttaacaagttattctatgagcatttgctaaaagacatcaattaatttttatgaatgtatcttttagcaaagttataattaaaaagtg 4126095  T
Q  718 gataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||| |||||||||||  || |||||| ||||||    
T  4126096 ga-aatcacaccttgaggtgtggattactaaaagacacct 4126134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 614 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 38101331 - 38101190
Alignment:
Q  614 cttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaa 712  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  38101331 cttttatgaaggtgttttttagtaagatattctatgatcatttgctaaaagacaccaactaatttttataaaggtgtcttttagcaaagttataactaaa 38101232  T
Q  713 aagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  38101231 aagtgga-aatcacaccttgaggtgtaggttgctaaaaaacac 38101190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 620 - 757
Target Start/End: Original strand, 52089066 - 52089204
Alignment:
Q  620 tgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaag-ttataattaaaaagtgg 718  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  52089066 tgaaggtgtcttttagcaagttattgtatagacatttattaaaaaacaccaactaatatttatgaaggtgtcttttagcaagtttataactaaaaagtgg 52089165  T
Q  719 ataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||  || |||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  52089166 ataatatcaccttgagatgtgggttgctaaaagacacct 52089204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 616 - 725
Target Start/End: Original strand, 36227811 - 36227920
Alignment:
Q  616 tttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaag 715  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | | |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36227811 tttatgaatgtgttttttagcaagttatcttataggcgtttgctaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaag 36227910  T
Q  716 tggataatca 725  Q
    | ||||||||    
T  36227911 ttgataatca 36227920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 615 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 34673547 - 34673457
Alignment:
Q  615 ttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttat 705  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34673547 ttttatgaaggtgtcttttagcaagttattatattagtatttgttaaaagacatcaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttat 34673457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 595 - 719
Target Start/End: Original strand, 19855463 - 19855588
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19855463 gggttttgcgagaagaaaccttttatgaaggtgtctattagcaagttattctacgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 19855562  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtgga 719  Q
    |||| || |||||| |||||||||||    
T  19855563 tagcaaaattataactaaaaagtgga 19855588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 620 - 755
Target Start/End: Original strand, 11238690 - 11238825
Alignment:
Q  620 tgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtgg 718  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||| |||||||| |    
T  11238690 tgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacatcaactaatttttatgaagatgtattttaacaaagttataactaaaaagtag 11238789  T
Q  719 ataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    | ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  11238790 a-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacac 11238825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 20513180 - 20513037
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttat 705  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||||    
T  20513180 aagacactttttatgaaggtgtcttttagcaatttattctatgagcatttgttaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgttttttaacaaagttat 20513081  T
Q  706 aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||||||    
T  20513080 aactaaaaagtgga-aatcacaccttggagtgtgggttgctaaaa 20513037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 671 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 27418847 - 27418763
Alignment:
Q  671 actaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27418847 actaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagtagataattac--cttgaggtgtgagttgctaaaagacacct 27418763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 606 - 719
Target Start/End: Original strand, 8351062 - 8351176
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagtta 704  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  8351062 gaagacactttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaatgtgtcttttaacaaagtta 8351161  T
Q  705 taattaaaaagtgga 719  Q
    ||| |||||| ||||    
T  8351162 taactaaaaaatgga 8351176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Original strand, 35180573 - 35180734
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  35180573 ggttttgctagaagatatattttatgaaggtgtcttttaaaaagttattttattagcatttgttaaaatacatcaattaatttttatgaaattgtctttt 35180672  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    | | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||||    
T  35180673 aacaaagttataattaaaaagtaga-aatcacaccttgaggtatgagtttttaaaagacacct 35180734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 621 - 757
Target Start/End: Original strand, 35280433 - 35280569
Alignment:
Q  621 gaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtgga 719  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35280433 gaaggtgtcttttagcaagttattatatgagcatttgttaaaagatacaaactaatttttatgaaggtgttttttagcaaagttataactaaaaagtgga 35280532  T
Q  720 taatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  35280533 -aatcacaccttgagttgtgggttgctaaaacacacct 35280569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 593 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 35711991 - 35711856
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  35711991 tagggttttgctagaagacacattttacgagggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccagctaacttttatgaaggtgtct 35711892  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacat 728  Q
     ||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  35711891 tttagcaaagctatagctaaaaagtgga-aatcacat 35711856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 678 - 750
Target Start/End: Original strand, 46770514 - 46770586
Alignment:
Q  678 tttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  46770514 tttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagttgataatcacaacttgaggtgtggattgctaaaa 46770586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 595 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5232778 - 5232615
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtg---tc 691  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||    
T  5232778 gggttttgctacaagacacattttatgaaggtgtcatttagcaagttattctagaagcatttgttaaaagacaccaactaatttttataaaggtgtactc 5232679  T
Q  692 tcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    | ||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  5232678 tgttagcaaagttacaactaaaaagtgg-gaatcacaccttaaggtgtgggttgctaaaagacac 5232615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 652 - 755
Target Start/End: Original strand, 19228619 - 19228722
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  19228619 catttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttaacaaaattataattaaaaagt-gaaaatcacaccttgaagtgtgagtttctaaaa 19228717  T
Q  751 aacac 755  Q
     ||||    
T  19228718 gacac 19228722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 27026742 - 27026656
Alignment:
Q  651 acatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtg 737  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  27026742 acatttgttaaaagacaccaactaatttttaggaaggtgtcttttagcaaaattataactaaaaagtgga-aattacaccttgaggtg 27026656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 39867233 - 39867134
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||  |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  39867233 tagggttttgctagaagaaacattttatgaaggtgtcatttatcaaattattctataaacatttcttaaatgataccaactaatttttatgaaggtgtct 39867134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 653 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 27038086 - 27038002
Alignment:
Q  653 atttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtg 737  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  27038086 atttgttaaaagacaccaactcatttttatgaaggtgtcttttagcaaaattataactaaaaagtgga-aatcacgccttgaggtg 27038002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 53518985 - 53518908
Alignment:
Q  640 ttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagt 716  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  53518985 ttatcctattggcatttgttaaaagacaccaattaatttttatgaaagtgtcttttaacaaagttataactaaaaagt 53518908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 654 - 719
Target Start/End: Original strand, 21481947 - 21482013
Alignment:
Q  654 tttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtgga 719  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21481947 tttgctaaaagacaccagctaatttttatgaaggtgtcttttaacaaagttataactaaaaagtgga 21482013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 27027379 - 27027333
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttat 643  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27027379 gttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttat 27027333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 700
Target Start/End: Original strand, 27432054 - 27432149
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaac-aagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaa 700  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| |  ||||||| |||| | |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  27432054 gaagacatcttttatgaagatgtctttttagtaagttattctatgggcatttactaaaagacaccaaataatttttatgaaggtgttttttagcaa 27432149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 669 - 700
Target Start/End: Original strand, 53518869 - 53518900
Alignment:
Q  669 caactaatttttatgaaggtgtctcttagcaa 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53518869 caactaatttttatgaaggtgtctcttagcaa 53518900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 643 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 53581658 - 53581551
Alignment:
Q  643 tcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgact 742  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||| | ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||| | |||  ||||||| ||||||  ||    
T  53581658 tcctatagacatttgctaagatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagct 53581559  T
Q  743 tgctaaaa 750  Q
    ||||||||    
T  53581558 tgctaaaa 53581551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 597 - 643
Target Start/End: Original strand, 46770495 - 46770541
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttat 643  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46770495 gttttgctagaagacaccctttatgaaggtgtcttttagcaagttat 46770541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 46969977 - 46969897
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  46969977 ttttatgaaggtgtcttttagcaaaattataactaaaaagtgga-aatcataccttgatgtgtgggttgctaaaagacacct 46969897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 43837852 - 43837689
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  43837852 agggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcgtttagcaagttatcctataggcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcct 43837753  T
Q  694 ttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  43837752 ttagcaagttataactaaaaagtggataatcacaccttgaggtgtggattgctaaaagacacct 43837689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 606 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 47960445 - 47960296
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttat 705  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47960445 gaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttatcctataggcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttat 47960346  T
Q  706 aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    || |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47960345 aactaaaaaatggataatctcaccttgaggtgtgaattgctaaaagacac 47960296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Original strand, 6137256 - 6137420
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6137256 tagggttttgctagaagacaccttttatgaatgtgtcttttagcaagttattctattagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtct 6137355  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6137356 tttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacacattgaggtgtgagttgctaaaagacacct 6137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34728382 - 34728219
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34728382 agggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctataagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctt 34728283  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  34728282 ttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 34728219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 596 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 51682719 - 51682534
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  51682719 ggttttgctagaaaacaccttttatgaaggtgttttttagcaagttattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttt 51682620  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| | | ||||| ||| ||||||||||    
T  51682619 aacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct-tcatgagtggcttctagcaaaacc 51682534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 596 - 782
Target Start/End: Original strand, 13387863 - 13388048
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||    
T  13387863 ggttttgctagatgacacattttatga-ggtgtcttttagcaagttatcctattgacatttgttaaaagacaccaacaaatttttataaaggtgcctttt 13387961  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    ||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||   |||||| ||||||||||    
T  13387962 agcaaaattataactaaaaagtggat-atcacaccttgaggtatgacttgctaaaagacacctttaaatgatgtcttctagcaaaacc 13388048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 597 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 38427228 - 38427086
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38427228 gttttgctagaagacaccttttatgaaagtgtcttttagcaagttattctattaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttta 38427129  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
    || ||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  38427128 gcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttaaggtgtg 38427086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 597 - 750
Target Start/End: Original strand, 19329360 - 19329513
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  19329360 gttttgctagaaaacatcttttatgaaggtgtattttaacaaattattctatgatcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttta 19329459  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  19329460 gcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgagatgtgggttgctaaaa 19329513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 593 - 782
Target Start/End: Original strand, 20503429 - 20503617
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20503429 tagggttttgctagaaggcaccttttatgaaggtgttttttagcaagatattctatgatcatttgctaaaagacaccaactaatttttataaaggtgtct 20503528  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||    
T  20503529 tttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggcgtgggttgctaaaaaacacct-tcatgagtggcttctagcaaaacc 20503617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 607 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 32626211 - 32626061
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttat 705  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  32626211 aagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaagttgtcttttagcaaagttat 32626112  T
Q  706 aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  32626111 aactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 32626061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 594 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 42434391 - 42434246
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  42434391 agggttttgttagaagacaccttttaggaaggtgttttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctt 42434292  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  42434291 ttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgtg 42434246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Original strand, 51702453 - 51702617
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  51702453 tagggttttgctagaagacacctcttatgaaagtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagaaaccaactaatttttatgaaggtgtct 51702552  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  51702553 tttaacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 51702617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 607 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 11020497 - 11020347
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttat 705  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11020497 aagacaccttttatgaaggtgtgttttagcaagttattctatgaacatttgttaaaagataccaattattttttatgaaggtgtcttttagcaaagttat 11020398  T
Q  706 aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  11020397 aactaaaaagtgga-aatcacaccttgagatgtgggttgctaaaagacacct 11020347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Original strand, 20835705 - 20835867
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  20835705 gggttttgctataagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctattagcatttgttaaaagataccaactaaattttacgaaggtgtcttt 20835804  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  20835805 tagcaaagttataactaaaaaatgga-aatcaccccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 20835867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 593 - 756
Target Start/End: Original strand, 13386980 - 13387143
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13386980 tagggttttgctagaagacacattttataaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtct 13387079  T
Q  693 cttagca-agttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacc 756  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  13387080 tttagcatagttataactaaaatgt-gaaaatcacaccttgaggtgtgtgttgttaaaagacacc 13387143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 596 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 32090123 - 32089969
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32090123 ggttttgctagaagacatcttttatgaaggtgtcttttagcaagttattttattagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaatgtgtctttt 32090024  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    | | ||||||||| |||||||| || ||||||| || ||||||||  |||||||||    
T  32090023 aacaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacacctcgaggtgtgggttgctaaaa 32089969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34041351 - 34041191
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||  ||||   |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  34041351 gttttgctagaagacacattttatgaatgtgtcttttagcaagttactctataagcatttgttaaaagacaccaagtaattttaatgaaggtgtctttta 34041252  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  34041251 gcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaacttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 34041191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 598 - 717
Target Start/End: Original strand, 5975657 - 5975777
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5975657 ttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttattatattagcatttgttgaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttag 5975756  T
Q  698 c-aagttataattaaaaagtg 717  Q
    | ||||||||| |||||||||    
T  5975757 caaagttataactaaaaagtg 5975777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 48860883 - 48860725
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||    
T  48860883 ggttttgctagaagacaccttttataaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaactaa---ttatgaaggtgtctttt 48860787  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     || ||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48860786 cgcaaagttataactaaaaaatgga-aatcaaaccttgagatgtgaattgctaaaaaacacct 48860725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 597 - 756
Target Start/End: Original strand, 52344494 - 52344654
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| || |  ||||| | ||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||    
T  52344494 gttttgctagaagacacattttatgaatgtatcatttaatatgttattctataagcatttgttaaaagacaccaactaatatttatgaatgtgtctttta 52344593  T
Q  697 gcaag-ttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacc 756  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  52344594 gcaagtttataattaaaaagtggatgatctcaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacc 52344654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 757
Target Start/End: Original strand, 40479857 - 40480007
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttat 705  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||  || |||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  40479857 aagacaccttttatgaatatgttttttagtaatttactcaattaacatttgttaaaagacatcaactaatttttatgaaggtgttttttagcaaagttat 40479956  T
Q  706 aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  40479957 aactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggcgtgagttgctaaaagacacct 40480007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 652 - 757
Target Start/End: Original strand, 27907045 - 27907150
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||    
T  27907045 catttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggctgctaaaa 27907143  T
Q  751 aacacct 757  Q
     ||||||    
T  27907144 gacacct 27907150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 599 - 750
Target Start/End: Original strand, 52719062 - 52719215
Alignment:
Q  599 tttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt--- 695  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||       
T  52719062 tttgctagaagacacattttatgaaggtgttctttaacaaattattctattagcatttgttaaaagacatcaactaatttttacgaaggtgtgtctttta 52719161  T
Q  696 agcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |  || |||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  52719162 acaaaattataactaaaaagtgaa-aatcacatcttgaagtgtaagttgctaaaa 52719215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 618 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 6944698 - 6944568
Alignment:
Q  618 tatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagt 716  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  6944698 tatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaacgacaccaactaagttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 6944599  T
Q  717 ggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaa 748  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  6944598 gga-aatcacaccttaaggtgtgaattgctaa 6944568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 597 - 717
Target Start/End: Original strand, 33117514 - 33117635
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||   |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33117514 gttttgctagaagataccttttatgaaggtgtattttagcaagatattctatgatcatttgctaaaagtcaccaactaatttttataaaggtgtctttta 33117613  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtg 717  Q
     | ||||||||| |||||||||    
T  33117614 acaaagttataactaaaaagtg 33117635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 625 - 739
Target Start/End: Original strand, 32868013 - 32868127
Alignment:
Q  625 gtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataat 723  Q
    |||| |||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| || |||    
T  32868013 gtgtcttttaacaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtgttttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaat 32868111  T
Q  724 cacatcttgaggtgtg 739  Q
    |||| |||||||||||    
T  32868112 cacaccttgaggtgtg 32868127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 618 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 16467295 - 16467174
Alignment:
Q  618 tatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagt 716  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  16467295 tatgaaggtgtcttttaacaagttattatatgaacatttgttaaaaagcaccaactaatttttatgaaggtatcttttaacaaagttataactaaaaagt 16467196  T
Q  717 ggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
     || ||||||| |||||||||||    
T  16467195 -gaaaatcacaccttgaggtgtg 16467174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 650 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 53773792 - 53773684
Alignment:
Q  650 gacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt-agcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaa 748  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||   |||||||    
T  53773792 gacatttgctagaagacaccaactaatttttatgatggtgtctttttagcaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaagtgttgattgctaa 53773693  T
Q  749 aaaacacct 757  Q
    || ||||||    
T  53773692 aagacacct 53773684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 620 - 738
Target Start/End: Original strand, 13372395 - 13372513
Alignment:
Q  620 tgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtgg 718  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | ||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  13372395 tgaaggtgtcttttagcaagttattccatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataacaaaaaagtgg 13372494  T
Q  719 ataatcacatcttgaggtgt 738  Q
    | ||||| | ||||||||||    
T  13372495 a-aatcataccttgaggtgt 13372513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 620 - 738
Target Start/End: Original strand, 13382596 - 13382714
Alignment:
Q  620 tgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtgg 718  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | ||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  13382596 tgaaggtgtcttttagcaagttattccatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataacaaaaaagtgg 13382695  T
Q  719 ataatcacatcttgaggtgt 738  Q
    | ||||| | ||||||||||    
T  13382696 a-aatcataccttgaggtgt 13382714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 595 - 674
Target Start/End: Original strand, 22254221 - 22254300
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaacta 674  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22254221 gggttttgctagaagacattttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctattggcatttgttaaaagacaccaacta 22254300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 653 - 757
Target Start/End: Original strand, 40875268 - 40875372
Alignment:
Q  653 atttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaa 751  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||||  |||||||||     
T  40875268 atttgttcaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcaaaccttaaggtgtgggttgctaaaag 40875366  T
Q  752 acacct 757  Q
    ||||||    
T  40875367 acacct 40875372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Original strand, 38962407 - 38962565
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||| |   |||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  | |||    
T  38962407 gttttgctagaatacaactattatgaaggtgtcttttagcaagtcactttataagcatttgttaaaagacaccaactaatttttataaagatg--tttta 38962504  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  38962505 gcaaagttataaataaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgtgggttgttaaaaaacacct 38962565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 673 - 757
Target Start/End: Original strand, 7603622 - 7603706
Alignment:
Q  673 taatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  7603622 taatttgtatgaagatgtcttttagcaatttataactaaaaagtttataatcacaccttgatgtgtaaattgctaaaaaacacct 7603706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 643
Target Start/End: Original strand, 54158113 - 54158163
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttat 643  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  54158113 tagggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttat 54158163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 678 - 726
Target Start/End: Original strand, 26889493 - 26889541
Alignment:
Q  678 tttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcac 726  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26889493 tttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagttgataatcac 26889541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 671 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 849322 - 849255
Alignment:
Q  671 actaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgt 738  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  849322 actagtttttaggaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagtgagtaattacatcttgaagtgt 849255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 38963400 - 38963331
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagaca 667  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||   |||||| |||||||||    
T  38963400 ttttgctagaagacaccttttatgaatgtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagaca 38963331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 596 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 7645980 - 7645950
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggt 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7645980 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggt 7645950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 677 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 42560205 - 42560155
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcaca 727  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42560205 ttttatgaagatgtattttaacaagttataactaaaaagtggataatcaca 42560155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 595 - 782
Target Start/End: Original strand, 27130995 - 27131181
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27130995 gggttttgctagaagacaccctttatgaaggtgttttttagcaagttatcttataggcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 27131094  T
Q  695 tagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| | | | ||||||| ||||||||||    
T  27131095 tagcaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgtggattgctaaaagacacct-tcatgtgtgtcttctagcaaaacc 27131181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 593 - 782
Target Start/End: Original strand, 38368156 - 38368345
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  38368156 tagggttatgctagaagacaccttttatgaatgtgtcttttagcaagatatcatattaacatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtat 38368255  T
Q  693 cttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||||||    
T  38368256 tttagcaagttataactaaaaattggataaacataccttgaggtgtgacttgctaaaagacatctttaaagggtatcttctagcaaaacc 38368345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 594 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 42373616 - 42373471
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||     
T  42373616 agggttttgctagaagacaccttttatgaatgtgtcttttagcaaattatcctattgacatttgttaaaagacaccaattaatttttatgaagatgtctt 42373517  T
Q  694 ttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42373516 ttagcaagttctaactaaaaagtggataatcacatattgaggtgtg 42373471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 48227390 - 48227226
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48227390 tagggttttgctggaagacaccttttatgaaggtgtattttagcaagatattctatgatcatttgctaaaagacaccaactaatttttataaaggtgtct 48227291  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  48227290 tttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaagtgtgggttgctaaaagacacct 48227226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Original strand, 45099969 - 45100131
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  45099969 gggttttgctagaagacacattttatgaaggtgttttttaacaagttattcaatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 45100068  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  45100069 tagcaaagttacaactaaaaagtgta-aatcacatcttgaggcgtgggttgctaaaagacacct 45100131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 41378527 - 41378366
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  41378527 ggttttgctagaagacactttttattaaggtgttttttagcaagttattctatgaacatttgctaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgtctttt 41378428  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  41378427 agcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 41378366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 598 - 750
Target Start/End: Original strand, 21993471 - 21993623
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21993471 ttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttattctattagcattttttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttag 21993570  T
Q  698 c-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    | ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  21993571 caaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaa 21993623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 606 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 12362978 - 12362836
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttat 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  12362978 gaagacaccctttatgaatgtgtcttttaacaagttattctatagacatttgttaaaagacatcaacaaatttttatgaagatgtcttttaacaaattat 12362879  T
Q  706 aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaa 748  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||    
T  12362878 aattaaaaagttgataaacataccttaaggtgtgaattgctaa 12362836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Original strand, 24251831 - 24251994
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||   |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24251831 gttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtatt--agcaagttatcctataagcatttgctaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgtctttta 24251928  T
Q  697 gcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggt-----gtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||     |||| ||||||||||||||||    
T  24251929 acaagttataactaaaaagttgattatcacatcttaaggtaaggcgtgaattgctaaaaaacacct 24251994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 595 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 43077650 - 43077530
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |    
T  43077650 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgttttttagcaagtttttctattgacatttgttaaaagacaccaactaatttttatcaaggtttcttt 43077551  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaa 714  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  43077550 tagcaaagttataactaaaaa 43077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 594 - 750
Target Start/End: Original strand, 31953156 - 31953312
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |     
T  31953156 agggttttgctagaacacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttagtctatgagcatttgttaaaagacatcaattaatttttatgaaggtgtttt 31953255  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  31953256 ttaacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgtgttgctaaaa 31953312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 3203449 - 3203282
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3203449 agggttttgctagaagataccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgtttaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctt 3203350  T
Q  694 ttagc-----aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||     || |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  3203349 ttagctagcaaatttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 3203282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 610 - 749
Target Start/End: Original strand, 20568271 - 20568411
Alignment:
Q  610 acaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaattttt-atgaaggtgtctcttagcaagttataat 708  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||     
T  20568271 acaccctttatgaatgtgtcttttagcaagttatcctattaacatttgctaaaagacaccaagtaattttttatcaaggtgtcttgtagcaaattataac 20568370  T
Q  709 taaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaa 749  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  20568371 taaaaagtggataatcacaccttgaggtgtggattgctaaa 20568411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 597 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27946978 - 27946820
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27946978 gttttgctagaagacactctttatggaggtgtcttttagcaagttattctatagctatttgttaaaacacaccaactaatttttatgaaggtgtctttta 27946879  T
Q  697 gcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
     ||| |||||| |||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  27946878 acaaattataactaaaaaattgataatcatatcttaagatgtgaattgctaaaagacac 27946820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 631 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 48709156 - 48709048
Alignment:
Q  631 tttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatct 730  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  48709156 tttagcaagttatcctataggcatttgctaaaagacactaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttattactaaaaagtggatagtcacacct 48709057  T
Q  731 tgaggtgtg 739  Q
    |||||||||    
T  48709056 tgaggtgtg 48709048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Original strand, 35983106 - 35983267
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  35983106 ggttttgctagaagacacattttatgaagatgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaattaatttttatgaaggtatctttt 35983205  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| ||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  35983206 agcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttaaggtgtgggttgctaaaagacacct 35983267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Original strand, 36004518 - 36004679
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  36004518 ggttttgctagaagacacattttatgaagatgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaattaatttttatgaaggtatctttt 36004617  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| ||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  36004618 agcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttaaggtgtgggttgctaaaagacacct 36004679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 35221825 - 35221660
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctatt----ga-catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtc 691  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35221825 gttttgctagaagatactttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctattctatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtc 35221726  T
Q  692 tcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||| || |||  || |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  35221725 ttttagctaagttataactaaaaagtaga-aatttcaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 35221660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 598 - 757
Target Start/End: Original strand, 3961178 - 3961337
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  3961178 ttttgctagaagacacattttatgaaagtgtcttttagcaagttattctatgatcatttgttaaaagacaccaactaatttttattaaggtgttttttag 3961277  T
Q  698 c-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    | || |||||| |||||| | || ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  3961278 caaaattataactaaaaa-ttgaaaatgacatcttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 3961337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 5995210 - 5995047
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5995210 gggttttgctagaagacaccttttatgaaagtgtcttttagcaagttattatatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 5995111  T
Q  695 tagc-aagttataa-ttaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| || |||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  5995110 tagcaaaattataactaaaaaagtgta-aatcacaccttgaggtgtagattgctaaaagacacct 5995047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 630 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 41586001 - 41585874
Alignment:
Q  630 ttttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacat 728  Q
    ||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||     
T  41586001 ttttagcaggttattctattagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaaattataactaaaaagtgga-aatcacac 41585903  T
Q  729 cttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  41585902 cttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 41585874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 595 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 46003890 - 46003729
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattga-catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  46003890 gggttttgctagaagacacatttcatgaaggtgtcttttagcaagttactctatgaagcatttgctaaaagacatcaactaatttttataaaggtgtctt 46003791  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  46003790 ttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaattacaccttaagatgtgacttgctaaaagacac 46003729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 606 - 757
Target Start/End: Original strand, 41037134 - 41037285
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagtta 704  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||   |||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41037134 gaagacaccttttatgaaggtgtcttttagtaaattattctatgagcatttggtaaaagacacaaactaagttttatgaaggtgtcttttagcaaagtta 41037233  T
Q  705 taattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||| ||||| ||||||    
T  41037234 taactaaaaagtgga-aatcacaccttgagatgtgggttgttaaaagacacct 41037285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 663 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 26928054 - 26927960
Alignment:
Q  663 agacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26928054 agacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgagttgctaaaagacacct 26927960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 595 - 679
Target Start/End: Original strand, 3875107 - 3875189
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttt 679  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3875107 gggttttgctagaagacacattttatgaaagtgtattttagcaagttatcctataaacatttgttaaaagac--caactaatttt 3875189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 677 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 32392313 - 32392232
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaagtt-ataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  32392313 ttttatgaaggtgtcttttagcaagtttataactaaaaagtggataatctcaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 32392232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 618 - 757
Target Start/End: Original strand, 24611437 - 24611576
Alignment:
Q  618 tatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagt 716  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |   ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||    
T  24611437 tatgaaggtgtcttttagcaagttattctctgagcatttattaaaagataccaactaatttttatgaaagtgtcttttaacaaagttataactaaaaagt 24611536  T
Q  717 ggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     || |||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  24611537 -gaaaatcacacattgaggtgtgggttgctaaaagacacct 24611576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 7596953 - 7596874
Alignment:
Q  678 tttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  7596953 tttatgaaggtgtcttttaacaaattataactaaaaagtggataatcacacattgaggtgtgaattgttaaaagacacct 7596874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 9522619 - 9522461
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  |||     ||||  ||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||    
T  9522619 ggttttgctagaagacacattttatgaagatgtcttttagcaagttaatctacgaggatttcctaaaagacaccaactaattttt---aaggtgtctttt 9522523  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  9522522 atcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtggattgctaagagacacct 9522461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 669 - 736
Target Start/End: Original strand, 3875211 - 3875277
Alignment:
Q  669 caactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggt 736  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3875211 caactaatttttatgaaggtttcttttaacaagttataa-taaaaagttgataatcacaccttgaggt 3875277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3350104 - 3350011
Alignment:
Q  662 aagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  3350104 aagacaccaactacttttaatgaaggtgtcttttagcaaaattataactaaaaagtgga-aatcacaccttgagatgtgggttgctaaaaaacac 3350011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 675 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 8953365 - 8953288
Alignment:
Q  675 atttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaa 752  Q
    |||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  8953365 atttgtatgaagatgtcttttaataagttataactaaaaagttgataatcacaccttgatgtgtgaattgctaaaaaa 8953288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 781
Target Start/End: Original strand, 31853772 - 31853844
Alignment:
Q  709 taaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaac 781  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  31853772 taaaaagtggataatcacaccttgaagtgtggattgctaaaagacaccttcaaaaagtgtcttctagcaaaac 31853844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 593 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 32392335 - 32392287
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagtt 641  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32392335 tagggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagtt 32392287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 671 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 3407227 - 3407148
Alignment:
Q  671 actaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||| |||||  |||||||||    
T  3407227 actagtttttatgaagctgtcttttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttgaagtgtgtgttgctaaaa 3407148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 615 - 682
Target Start/End: Original strand, 36343021 - 36343088
Alignment:
Q  615 ttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttat 682  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36343021 ttttatgaagatgttttttaacaagttattttatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttat 36343088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 44868091 - 44868031
Alignment:
Q  662 aagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataa 722  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44868091 aagacacccactaatttttatgaaagtgttttttaacaagttataactaaaaagtggataa 44868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 710 - 757
Target Start/End: Original strand, 36343104 - 36343150
Alignment:
Q  710 aaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36343104 aaaaagtgga-aatcacatcttgaggtgtgggttgctaaaaaacacct 36343150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 677 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 20009256 - 20009183
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20009256 ttttatgaaggtgtcttttaacaaagttataactaaaaagtaaa-aatcacatcttgaggtatgagttgctaaaa 20009183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 656 - 722
Target Start/End: Original strand, 37187248 - 37187313
Alignment:
Q  656 tgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataa 722  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  37187248 tgttaaaagacatctattaatttttataaaggtgttt-ttaacaagttataattaaaaagtagataa 37187313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 48625043 - 48625002
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtatttta 634  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  48625043 tagggttttgctataagacaccttttatgaaggtgtctttta 48625002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Original strand, 23204375 - 23204537
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23204375 gggttttgctagaagacatcttttatgaaggtgtcttttaacaagttattctatgagcatttgttaaaagacatcaactaatttttatgaaggtgtcttt 23204474  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23204475 tagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgacttgctaaaagacacct 23204537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 596 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 19323859 - 19323673
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  19323859 ggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttatccttttagcatttgttaaaagacaccaattaatttttatgaaagtgtctttt 19323760  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||||||    
T  19323759 agcaaagttataactaaaaagtggat-atcacaccttaaggtgtgccttgctaaaagacatctctatagagtgtctaatagcaaaacc 19323673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Original strand, 27365716 - 27365876
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||| |||    
T  27365716 gttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccacctaggttttataaaggtgtctttta 27365815  T
Q  697 gcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27365816 gcaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgtggattgctaaaaaacacct 27365876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 13960538 - 13960375
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  13960538 agggtttcgctagaagacactttttatgaaggtgtcttttagcaagttatcctataggcctttgctaaaagaca-cagctaatttttatgaaggtgtctt 13960440  T
Q  694 ttagcaag-ttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  13960439 ttagcaagtttatgactaaaaagtggataatcacatcttgaggtgttgattgctaaaaaacacct 13960375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 16273725 - 16273562
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  16273725 gggttttgctagaagacaccctttatgaaggtgtcttttagcaagttatcttatagacatttgctaaaagacacaaactaatttttatgaaggtgtcttt 16273626  T
Q  695 tagcaagttat-aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||   |||  || | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16273625 tagcaagttatcttttagcaaattgataatcacactttgaggtgtgaattgctaaaaaacacct 16273562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 595 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 31056532 - 31056403
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||   |||||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  31056532 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtattttagcaagttaacttataggcatttccgaaaagacaccaactaatttttattaaagtgtcttt 31056433  T
Q  695 tagcaagttataattaaaaagtggataatc 724  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31056432 tagcaagttataattaaaaagttgataatc 31056403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Original strand, 9741723 - 9741886
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9741723 agggttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttaacaaattattctatgagcatttgctaaaaaacaccaactaatttttatgaaggtgtttt 9741822  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  9741823 ttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgagatgtgggttgctaaaagacacct 9741886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 31042672 - 31042554
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttat 705  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  31042672 gaagacaccctttatgaaggtgtattttagcaagttatcttataggcatttgttaaaagacaccaactaatttttattaaagtgtcttttagcaagttat 31042573  T
Q  706 aattaaaaagtggataatc 724  Q
    ||  ||||||| |||||||    
T  31042572 aacaaaaaagttgataatc 31042554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 595 - 750
Target Start/End: Original strand, 18015642 - 18015796
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  18015642 gggttttgctaga-gacaccttatatgaaggtgtcttttagcaagttattgcatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgttttt 18015740  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  18015741 tagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaa 18015796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 594 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 16994300 - 16994176
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  16994300 agggttttgctagaagacacattttatgaaggtgttgtttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaagatgtctt 16994201  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtg 717  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  16994200 ttagcaaagttataactaaaaagtg 16994176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 37172552 - 37172390
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  37172552 gggtttggctagaagtcaccttttatgaaggtgtcttttaacaagttattctacgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 37172453  T
Q  695 tag-caagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||  || |||||| |||||||| || ||||||| ||| |||| ||  ||||||||| ||||||    
T  37172452 tagaaaaattataactaaaaagt-gaaaatcacaccttaaggtatggattgctaaaagacacct 37172390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 595 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 28038364 - 28038226
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28038364 gggttttgctagaagacacattttatgaaagtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaacacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 28038265  T
Q  695 tag-caagttataattaaaaagtggataatcacatcttg 732  Q
    |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||    
T  28038264 tagtaaagttataactaaaaagtgaaaaatcacaccttg 28038226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 28813218 - 28813056
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttt-tatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  28813218 ggttttgctaaaagacacatttgtatgaagatgttttttagcaagatattctatgatcatttgctaaaagacaccaactaatttttataaaggcgtcttt 28813119  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  28813118 tagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 28813056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 596 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 38758779 - 38758595
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||   ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  38758779 ggttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttattcta-tgagcattgctaaaagacaccaactgatttttataaaggtgtctttt 38758681  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    | | ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||| | | ||||| ||| ||||||||||    
T  38758680 aacaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgagatgtgggttgctaaaagacacct-tcatgagtggcttctagcaaaacc 38758595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 692
Target Start/End: Original strand, 20269235 - 20269329
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20269235 ttttgctagaagacagcttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgaacatttgctaaaagacaacaattaatttttatgaaggtgtct 20269329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 17689500 - 17689337
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||| |||||  | ||||| ||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17689500 tagggttttgttagaagacacattttataaagatgtcttttagtaggttattctatgagcatttgctaaaagacacca-ctaatttttatgaaggtgtct 17689402  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  17689401 tttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttaaggtgtggattgctaaaagacacct 17689337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 659 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 5497839 - 5497759
Alignment:
Q  659 taaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  5497839 taaaagacaccaactaatttttatgaaagtgtctttcagcaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaagtgtg 5497759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 618 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 38293616 - 38293494
Alignment:
Q  618 tatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttg-ttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaag 715  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  38293616 tatgaaggtgtcttttaacaagttattctatgagcattttattaaaagacaccaactaatttttatgaacgtgtcttttaacaaagttataactaaaaag 38293517  T
Q  716 tggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
    |||| ||||||| | |||||||||    
T  38293516 tgga-aatcacaccatgaggtgtg 38293494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 677 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 23129675 - 23129597
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  23129675 ttttatgaaggtgtcttttaacaagttataactaaaaggttgataatcacatcttgaggtgtggattgctaaaagacac 23129597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 593 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 21913908 - 21913836
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaaga 665  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  21913908 tagggttttgctagaagacaccctttatgaaggtgtcttttagcaagttatcctataggcatttgctaaaaga 21913836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 630 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 19325163 - 19325055
Alignment:
Q  630 ttttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaa--gttataattaaaaagtggataatcaca 727  Q
    ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  19325163 ttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagaaaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagtttataactaaaaagtgga-aatcaca 19325065  T
Q  728 tcttgaggtg 737  Q
     |||||||||    
T  19325064 ccttgaggtg 19325055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 652 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 26730407 - 26730345
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaa 713  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  26730407 catttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaa 26730345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 652 - 750
Target Start/End: Original strand, 19995334 - 19995429
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  19995334 catttgttaaaaaacaccaactaa---ttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtggattgctaaaa 19995429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 757
Target Start/End: Original strand, 25593283 - 25593352
Alignment:
Q  688 tgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  25593283 tgtcttttagcaagttataactaaaaagtggataattacaccttaaggtgtgagttgctaaaagacacct 25593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 676 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 19863187 - 19863106
Alignment:
Q  676 tttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  19863187 tttttgtgaaggtgtcttttaacaagttaaaactaaaaagtggataatcacactttgagatgtggattgctaaaagacacct 19863106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 754
Target Start/End: Original strand, 15978814 - 15978958
Alignment:
Q  608 agacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttata 706  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| | || |||||    
T  15978814 agacacattttatgaaggtgtcttttagcaaattaatctatgagtatttgctaaaagacaccaactaatttttataaaagtgtcttttaacaaaattata 15978913  T
Q  707 attaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaaca 754  Q
    | ||||||||  | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  15978914 actaaaaagt-aaaaatcacaccttgaggtgtg--ttgctaaaaaaca 15978958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 16490997 - 16490924
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  16490997 ttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgtggattgctaaaa 16490924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 592 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 33429305 - 33429249
Alignment:
Q  592 ttagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctat 648  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  33429305 ttagggttttgctagaagacacattttatgaaggtgccttttagcaagttattctat 33429249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 19863206 - 19863159
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagtta 642  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19863206 gggttttgctggaagacactttttgtgaaggtgtcttttaacaagtta 19863159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 593 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 23129697 - 23129647
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttat 643  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23129697 tagggttttgttagaatacacattttatgaaggtgtcttttaacaagttat 23129647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 597 - 782
Target Start/End: Original strand, 4206430 - 4206618
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcct---attgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||     
T  4206430 gttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttatcctcctattgacatttgctaacagaaaccaactaatttttatgaatgtgtctt 4206529  T
Q  694 ttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  4206530 ttagcaagttataactaaaaagtggataatcacaccttaaggtgtggcttgctaaaagacacttctaaagggtgtcatctagcaaaacc 4206618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 39089257 - 39089096
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39089257 ggttttgttagaagacaccttttatgaatgtgtcttttaacaagttattctattaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaagatgtctttt 39089158  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39089157 agcaaagttataactaaaaaatgga-aatcataccttgaggtgtggattgctaaaaaacacct 39089096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 18924692 - 18924532
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  18924692 gttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtccttta 18924593  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  18924592 gcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtatgggttgctaaaagacacct 18924532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 9548365 - 9548203
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9548365 gggttttgctataagacatcttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 9548266  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  9548265 tagcgaagttataactaaaaagtgga-aatcacatcttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 9548203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 29471788 - 29471627
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29471788 ggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgaacatttgctaaaagacacaaactaatttttatgaaggtgtctttt 29471689  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  29471688 agcaaagttataactaaaaagtgga-aatcactccttgaggtgtggattgctaaaagacacct 29471627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 595 - 755
Target Start/End: Original strand, 33740233 - 33740393
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  33740233 gggttttactagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttatcctattgacatttcttaaaagacaccaactaatttttataaatgtgtcttt 33740332  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    |||| ||||||||| || |||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33740333 tagcaaagttataactagaaagtgaat-atcacactttgagatgtgacttgctaaaatacac 33740393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 1750072 - 1749909
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1750072 ggttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaggttattctattagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttt 1749973  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg--acttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| || |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    ||||||||||||||||    
T  1749972 agcaaaattataactaaaaagtgga-aattacaccttgaggtgtgtaggttgctaaaaaacacct 1749909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Original strand, 24314213 - 24314375
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||  |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24314213 gggttttgctaaaatacaccttttataaaggtgtcttttagcaaattattttatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 24314312  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24314313 tagcaaagttataactaaaatgtgga-aatcacaccttgaggtgtgaattgctaaaagacacct 24314375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 597 - 739
Target Start/End: Original strand, 42090415 - 42090557
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42090415 gttttgctggaagacaccttttatgaaagtgtcttttagcaaattattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttta 42090514  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
    || ||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  42090515 gcaaagttataactaaaaaat-gaaaatcacatcttaaggtgtg 42090557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 12725870 - 12725710
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||   |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12725870 gttttgctagaagacaccttttataaagatgtcttttagcaagttattctatgagcatttactaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttta 12725771  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  12725770 gcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacactttgaggtgtggcctgctaaaagacacct 12725710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 598 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 10664843 - 10664684
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10664843 ttttgctataagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggcgtcttttag 10664744  T
Q  698 c-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |||||| ||||||    
T  10664743 caaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttactaaaagacacct 10664684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 39961691 - 39961531
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||| |||    
T  39961691 gttttgctagaagatacattttatgaaggtgtcttttaacaagttatctcatagacatttgttaaaagatacaaactaattttcacgaaggtgtctttta 39961592  T
Q  697 gcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||| |||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  39961591 tcaaattataactaaaaagttgataatcatactttgaggtgtggattgctaaaagacacct 39961531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 677 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 27175545 - 27175442
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagc 776  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  27175545 ttttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagtggataatcacaccttgaggtgttgcttgctaaaagacacctctaaagggtgtcttctagc 27175446  T
Q  777 aaaa 780  Q
    ||||    
T  27175445 aaaa 27175442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 597 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 39435084 - 39434974
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  39435084 gttttgctagaagacaccttttatgaaagtgtcttttaacaagttttcctatagacatttgttaaaatacactaactaatttttatgaagatgtctttta 39434985  T
Q  697 gcaagttataa 707  Q
    | |||||||||    
T  39434984 gtaagttataa 39434974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 44539988 - 44539841
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcct-attgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagtt 703  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| || |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  44539988 gaagacatcttttatgaaggtgtcatttagcaagttattcttattggcatttgttaaaagataccaactaatttttatgaaggtgtattttagcaaagtt 44539889  T
Q  704 ataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaa 752  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  44539888 ataactaaaaaatggat-atcacaccttaaggtgtggcttgctaaaaaa 44539841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 596 - 739
Target Start/End: Original strand, 25880575 - 25880722
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgtt----aaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtc 691  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| ||    |||||  | ||||||||||||||||||||||     
T  25880575 ggttttgctagaagacactttttatgaaggtgttttttagcaagttatcatataaacatttatttgctaaaagctatcaactaatttttatgaaggtgtt 25880674  T
Q  692 tcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  25880675 ttttaacaagttataactaaaaagttgataatcacactttgaggtgtg 25880722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 34125702 - 34125541
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||||||   |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  34125702 tagggttttgttagaagtcaccctttatg---gtgtcttttagcaagttatcatataggcatttgttaaattacaccaagtaatttttatgaatgtgtct 34125606  T
Q  693 cttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     |||||||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  34125605 tttagcaacctataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgtggattgctaaaagacacct 34125541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 606 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 2969792 - 2969675
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagtta 704  Q
    ||||||||||| |||  | |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2969792 gaagacaccttctatacatgtgtcttttaaaaaattattctattgacatttgttaaaagataccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagtta 2969693  T
Q  705 taattaaaaagtggataa 722  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  2969692 taactaaaaggtggataa 2969675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 607 - 755
Target Start/End: Original strand, 21950650 - 21950798
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttat 705  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  21950650 aagacatcttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaaaacaccaactaatatttatgaatgtgtcttttagcaaagttat 21950749  T
Q  706 aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    || |||||||| || ||||| | |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  21950750 aactaaaaagt-gaaaatcataccttgaggtgtgggttgctaaaagacac 21950798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 652 - 757
Target Start/End: Original strand, 12895384 - 12895489
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12895384 catttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttaacaatgctataactaaaaagt-gaaaatcacatcttgaggtgtggattgctaaaa 12895482  T
Q  751 aacacct 757  Q
     ||||||    
T  12895483 gacacct 12895489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 595 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16719882 - 16719780
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | ||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  16719882 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagctagttattccatgaatatttgttaaaagacacaaactaatttttatgaaggtgtcttt 16719783  T
Q  695 tag 697  Q
    |||    
T  16719782 tag 16719780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 677 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 29511911 - 29511837
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaag-ttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29511911 ttttatgaaggtgtcttttagcaaaattataactaaaaagtggataagcacaccttgaggtgtgacttgctaaaa 29511837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 25810559 - 25810479
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaat 676  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  25810559 ggttttgctagaagataccttttatgaaggtgttttttagcaagttattatattatcatttgttaaaagacaccaactaat 25810479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 652 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 5534387 - 5534282
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||    
T  5534387 catttgttaaaaaataccaattaatttttatgaaggtattttttagcaaagttataattaaaaagttga-aatcacatcttgaggtgtggattactaaaa 5534289  T
Q  751 aacacct 757  Q
    || ||||    
T  5534288 aatacct 5534282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 757
Target Start/End: Original strand, 34450334 - 34450414
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  34450334 ttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataaataaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 34450414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 677 - 734
Target Start/End: Original strand, 5601710 - 5601767
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgag 734  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  5601710 ttttatgaaggtgtcttttagcaaattataactaaaaagttgataatcacaccttgag 5601767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 677 - 757
Target Start/End: Original strand, 10862595 - 10862675
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaag-ttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  10862595 ttttatgaaggtgtcttttagcaaaattataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 10862675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 653 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22594230 - 22594149
Alignment:
Q  653 atttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgag 734  Q
    |||||||| |||||| | |||| | | ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22594230 atttgttagaagacatccactagtctgtatgacggtgttttttagcaagttaaaattaaaaagtggataattacatcttgag 22594149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 634
Target Start/End: Original strand, 10862575 - 10862614
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtatttta 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10862575 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtctttta 10862614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 683 - 750
Target Start/End: Original strand, 18370357 - 18370424
Alignment:
Q  683 gaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  18370357 gaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaa 18370424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 678 - 755
Target Start/End: Original strand, 6231240 - 6231317
Alignment:
Q  678 tttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  6231240 tttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttaaaatgtgagttgctaaaaaacac 6231317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 628
Target Start/End: Original strand, 27097032 - 27097065
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgt 628  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27097032 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgt 27097065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 597 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 1271182 - 1270993
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttg----ttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    |||||    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1271182 gttttgctagaagacaccctttataaaggtgttttttaacaagttatcctatatgtatttgctaattaaaatacaccaactaatttttatgaaggtgtct 1271083  T
Q  693 cttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  1271082 tttaacaagttataattaaaaagtggataatcacaccttgaagtgtgaattgctaaaatacacattcaaagagtgtcttctagcaaaacc 1270993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 12176366 - 12176202
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  12176366 tagggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtgttttagcaagttatcctataggcaattgctaaaagacaccaaataatttttatcaaggtgtct 12176267  T
Q  693 cttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  12176266 tttagcaggttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgtggattgctaaaagacacct 12176202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 12420794 - 12420630
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  12420794 tagggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtgttttagcaagttatcctataggcaattgctaaaagacaccaaataatttttatcaaggtgtct 12420695  T
Q  693 cttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  12420694 tttagcaggttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgtggattgctaaaagacacct 12420630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 596 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 38498407 - 38498265
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38498407 ggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctattaacatttgttaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgtctttt 38498308  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgt 738  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38498307 agcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgt 38498265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 594 - 781
Target Start/End: Original strand, 14041328 - 14041514
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  14041328 agggttttgccagaaaacatcttttatgaaggtgttttttagcaagttatcctattgacatttgttaaaaaacaccaattaatttttatgaaggtgtctt 14041427  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaac 781  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||    
T  14041428 ttaacaaagttataactaaaaagtggat-atcacaccttga-gtgtgacttactaaaagacacatctaaatggtgtcttctagcaaaac 14041514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 597 - 747
Target Start/End: Original strand, 5224300 - 5224449
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  5224300 gttttgctataagacactttttatgaaggtgtcttttaacaagttattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgt-tttta 5224398  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgcta 747  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5224399 gcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgagttgcta 5224449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Original strand, 10078303 - 10078462
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10078303 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 10078402  T
Q  695 tagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  10078403 tagcaa--agtaactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 10078462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 606 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 39077430 - 39077316
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagtta 704  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39077430 gaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagtta 39077331  T
Q  705 taattaaaaagtgga 719  Q
    ||| |||||||||||    
T  39077330 taactaaaaagtgga 39077316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 595 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 26912480 - 26912324
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26912480 gggttttgctagaagacacattttatgaatgtgtcttttaacaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttt 26912381  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaa 751  Q
    |||| ||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  26912380 tagcaaagttataactgaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaaa 26912324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 596 - 750
Target Start/End: Original strand, 9478711 - 9478865
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9478711 ggttttgttagaagacacctttaatgaaaatgttttttagcaagttattctattaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtctttt 9478810  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  9478811 aacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacactttgaggtgtgggttgctaaaa 9478865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 597 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40067708 - 40067550
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  40067708 gtttttctagaagacatcatttatgaatgtgtcttttagcaagttattctataaatatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtatttta 40067609  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
     | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40067608 acaaaattataactaaaaagtgga-aatcacatcttgaggtgtgagttgctaaaaaacac 40067550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 16930960 - 16930800
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||    
T  16930960 gttttgatagaagataccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcattttttaaaagacaccaactaatttttatgaaagtgtttttta 16930861  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  16930860 gcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtggattgctaaaagacacct 16930800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 594 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 33568227 - 33568064
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  33568227 agggttttgttagaagacacattttataaaggtgtcttttatcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaactagtttttatgaaggtgtctt 33568128  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |  | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33568127 ttagcaaagttataactaaaaaat-aaaaatcacaccttgaggtgtggattgctaaaaaacacct 33568064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 593 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 12295326 - 12295180
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  12295326 taggattttgctataagacaccttttatgaatgtgtcttttagcaagttattctattagcatttgttaaaagataccaattaaattttatgaaggtgtct 12295227  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtg 739  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12295226 tttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtg 12295180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 597 - 751
Target Start/End: Original strand, 16784331 - 16784478
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||    
T  16784331 gttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattatattaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaagg-------ta 16784423  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaa 751  Q
    || ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  16784424 gcaaagttataactaaaaaatgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaaa 16784478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Original strand, 23472511 - 23472674
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23472511 tagggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagc-agttattctatgaggatttgctaaaagataccaactaatttttatgaaggtgtct 23472609  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||||||||| ||||||    
T  23472610 tttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgagttgtagattgctaaaagacacct 23472674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 597 - 755
Target Start/End: Original strand, 42806210 - 42806370
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctat-tga-catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||  ||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  42806210 gttttgctagaagacaccttttatgaagatgtcttttagcaaattattttatatgagcatttgttagaagacacaaactaatttttatgaaggtgtcttt 42806309  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  42806310 tagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtggattgctaaaagacac 42806370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 31272921 - 31272770
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagtta 704  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||    
T  31272921 gaagacacattttatgaaggtgttttttaacaaattattctatgagtatttgttaaaagacaacaactaatttttataaagatgtcttttagcaaaatta 31272822  T
Q  705 taattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  31272821 taactaaaaagtgga-aatcacatcttgagatatgagttgctaaaagacacct 31272770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Original strand, 30774124 - 30774286
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |    
T  30774124 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgttttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagataccaactaatttttatgaaggtatcctt 30774223  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  30774224 taacaaaggtataactaaaaagtgga-aatcacaccttaaggtgtgggttgctaaaagacacct 30774286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 622 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 254081 - 253946
Alignment:
Q  622 aaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggat 720  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||     
T  254081 aaggtgtcttttaacaagttattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttaggaaagtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt-gaa 253983  T
Q  721 aatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  253982 aatcacaccttgaggtgtaggttgctaaaagacacct 253946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 622 - 757
Target Start/End: Original strand, 661777 - 661912
Alignment:
Q  622 aaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggat 720  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||     
T  661777 aaggtgtcttttaacaagttattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttaggaaagtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt-gaa 661875  T
Q  721 aatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  661876 aatcacaccttgaggtgtaggttgctaaaagacacct 661912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 598 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 13327084 - 13326958
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||     
T  13327084 ttttgctagaagacacattttatgaaggtatcttttagcaagttattttat-gacatttgctaaaagacgccaactaatttttatgaagttgtcttttat 13326986  T
Q  698 caagttataattaaaaagtggataatca 725  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13326985 caagttataactaaaaagtgaataatca 13326958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 597 - 711
Target Start/End: Original strand, 44873913 - 44874028
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  44873913 gttttgttagaagacaccttttatgaaggtgttttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccagctaatttttatgaaggtgtctttta 44874012  T
Q  697 gc-aagttataattaa 711  Q
    || |||||||||||||    
T  44874013 gcaaagttataattaa 44874028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22812476 - 22812325
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    ||||||| |||||||| |||||| | ||| | ||||| || ||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  22812476 ttttgctagaagacacattttatta-ggtatcttttagcacgttattctatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttaa 22812378  T
Q  698 c-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22812377 caaagttataactaaaaagt-gaaaatcacatcttgaggtgtgggttgctaaaa 22812325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 652 - 757
Target Start/End: Original strand, 19922566 - 19922671
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  19922566 catttgttaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaggtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaa 19922664  T
Q  751 aacacct 757  Q
     ||||||    
T  19922665 gacacct 19922671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 595 - 719
Target Start/End: Original strand, 9479413 - 9479538
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |    
T  9479413 gggttttgttagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacacaaactaatttttatgaaagtgtcttt 9479512  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtgga 719  Q
    || | ||||||||| |||||||||||    
T  9479513 taacaaagttataactaaaaagtgga 9479538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 622 - 757
Target Start/End: Original strand, 847575 - 847710
Alignment:
Q  622 aaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggat 720  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||| |||||| || |||||||| ||     
T  847575 aaggtgtcttttaacaagttattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttagggaagtgtcttttagcaaagttaaaactaaaaagt-gaa 847673  T
Q  721 aatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  847674 aatcacaccttgaggtgtaggttgctaaaagacacct 847710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 594 - 717
Target Start/End: Original strand, 28539161 - 28539285
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  28539161 agggttttgttagaagacacattttatgaatatgtcttttagcaagttattttatgagcatttgttaaaagataccaactaatttttatgaaggtgtctt 28539260  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtg 717  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28539261 ttagcaaagttataactaaaaagtg 28539285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 608 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 28969244 - 28969096
Alignment:
Q  608 agacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttata 706  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||    
T  28969244 agacacctttt-tgaaggtgttttttagcaatttattctatgagcatttgttaaaagacaccaattaatttttatgaaagtatcttttaacaaagttata 28969146  T
Q  707 attaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  28969145 actaaaaagtgga-aatcacaccttgaagtgtgggttgctaaaatacacct 28969096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 597 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 1983634 - 1983531
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1983634 gttttactggaagacacattttatgaaggtgtcttttaacaaattattctataaaaatttgttaaaaaatatcaactaatttttatgaaagtgtctttta 1983535  T
Q  697 gcaa 700  Q
    ||||    
T  1983534 gcaa 1983531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 40301372 - 40301426
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatctt 731  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40301372 ttttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagtggataatcacatctt 40301426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 14916822 - 14916658
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||| |||||||  |||| | ||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  14916822 taggattttgctataagatatcttatatgaatgtgttttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagataccaactaatttttatgaaggtatct 14916723  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||| | |||||||||  ||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  14916722 tttaacaaagttataacaaaaaagt-gaaaatcacaccttaaggtgtgagttgctaaaagacacct 14916658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 3210943 - 3210863
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  3210943 ttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataattaaaaagtgga-aataacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 3210863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 607 - 667
Target Start/End: Original strand, 10775933 - 10775993
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagaca 667  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10775933 aagacaccttttatgaaagtgccttttagcaagttatcctattgacattttttaaaagaca 10775993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 652 - 754
Target Start/End: Original strand, 38092157 - 38092259
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||  || ||||||    
T  38092157 catttgttaaaagacaccaattaatttttatgaacgtgtcatttaacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgatgtgtggattactaaaa 38092255  T
Q  751 aaca 754  Q
    ||||    
T  38092256 aaca 38092259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 41829655 - 41829580
Alignment:
Q  617 ttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41829655 ttatgaagatgtcttttagcaagttattctatgaacatttgttaaaagacacaaactaatttttatgaagatgtct 41829580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 16645556 - 16645476
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  16645556 ttttatgaaggtgtcttttagtaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtatgggttgctaaaagacacct 16645476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 39590036 - 39589995
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtatttta 634  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39590036 tagggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtctttta 39589995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 597 - 682
Target Start/End: Original strand, 44473748 - 44473833
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttat 682  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||  |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44473748 gttttgttagaagacatctttcatgaaggtgtcttttagcaagttattgtatgagtatttgttaaaagacaccaactaatttttat 44473833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 599 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 14371658 - 14371614
Alignment:
Q  599 tttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttat 643  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14371658 tttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttat 14371614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 16645576 - 16645537
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtatttta 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16645576 gggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtctttta 16645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 669 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 41624735 - 41624649
Alignment:
Q  669 caactaatttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41624735 caactaaattttacgaaggtgtcttttaacaaagttataactaaaaagtaaa-aatcacaccttgaggtgtgagttgctaaaagacac 41624649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 597 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 3210961 - 3210924
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtatttta 634  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3210961 gttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtctttta 3210924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 598 - 757
Target Start/End: Original strand, 10074994 - 10075153
Alignment:
Q  598 ttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttag 697  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  10074994 ttttgctagaagacaccttttatgaaagtgtcttttaacaagttattttatgaatatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttaa 10075093  T
Q  698 c-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10075094 caaagttataattaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgagttgctaaaagacacct 10075153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 606 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 12159595 - 12159444
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagtta 704  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12159595 gaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattatattagcatttgttagaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagtta 12159496  T
Q  705 taattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  12159495 taactaaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 12159444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 593 - 721
Target Start/End: Original strand, 9891369 - 9891498
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9891369 tagggttttgctagaagataccttttataaaggtgtcttttagcaaattatcctattgtcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaatgtgtct 9891468  T
Q  693 cttagc-aagttataattaaaaagtggata 721  Q
     ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  9891469 tttagcaaatttataactaaaaagtggata 9891498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 595 - 757
Target Start/End: Original strand, 6322488 - 6322650
Alignment:
Q  595 gggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctct 694  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| |    
T  6322488 gggttttgctagaagacatcttttatgagggtgttttttaacaagttattctattagcatttgttaaaaaacacaaattaatttttatgaaggtgtcttt 6322587  T
Q  695 tagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  6322588 tagcaaagttataactaaaaagtgga-aaccacaccttaaggtgtggattgctaaaagacacct 6322650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 599 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 17347200 - 17347042
Alignment:
Q  599 tttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc 698  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17347200 tttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttagcaagttattatattagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaagatgtcttttagc 17347101  T
Q  699 -aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||||||||||||||||    
T  17347100 aaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttaaagtatggattgctaaaaaacacct 17347042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 614 - 757
Target Start/End: Original strand, 15081138 - 15081281
Alignment:
Q  614 cttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaa 712  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  15081138 cttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaattaattgttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaa 15081237  T
Q  713 aagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  15081238 aagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 15081281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Original strand, 18096330 - 18096485
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||    
T  18096330 ggttttgctagaagacatcttttgtgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaagg------tt 18096423  T
Q  696 agca-agttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18096424 agcagagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 18096485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 596 - 757
Target Start/End: Original strand, 18102450 - 18102605
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||    
T  18102450 ggttttgctagaagatatcttttgcgaaggtgttttttagcaagttattctatgagcatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaagg------tt 18102543  T
Q  696 agca-agttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  18102544 agcagagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaagacacct 18102605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 748
Target Start/End: Original strand, 9533376 - 9533519
Alignment:
Q  608 agacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctat---tga-catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagt 702  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  9533376 agacacctttaatgaagatgtcttttagtaagttattctatatatgagcatttgttaaaagacactaacaaatttttatgaaggtgtcttttaacaaagt 9533475  T
Q  703 tataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaa 748  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9533476 tataatt-aaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtggattgctaa 9533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 22423975 - 22423894
Alignment:
Q  676 tttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  22423975 tttttatgaatgtgttctttagcaagttataattaaaaagttgataatcacacgttgaagtgtggattgctaaaaaacacct 22423894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 652 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 19104381 - 19104313
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtgga 719  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19104381 catttgttaaaagacaccaactaatttttacgaaggtgtgttttagcaaagttataactaaaaagtgga 19104313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 683 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29427304 - 29427232
Alignment:
Q  683 gaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacac 755  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  29427304 gaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtggattgctaaaaaacac 29427232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 722
Target Start/End: Original strand, 8062086 - 8062135
Alignment:
Q  673 taatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataa 722  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8062086 taatttttataaaggtgtcttttaacaagttataattaaaaagtgaataa 8062135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 14975505 - 14975402
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaa 751  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || || ||||| | ||| |||||||  |||||||||     
T  14975505 cattttttaaaagacaccaactaatttt-atgaaggtgttttttagcaaattataactaaaaggt-gaaaatcataccttaaggtgtgggttgctaaaag 14975408  T
Q  752 acacct 757  Q
    ||||||    
T  14975407 acacct 14975402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 25090623 - 25090554
Alignment:
Q  651 acatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtgga 719  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||    
T  25090623 acatttgtcaaaaaacaccaattaatttttatgaaggtgtctttcagcaaagttataactaaaaagtgga 25090554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 782
Target Start/End: Original strand, 28295595 - 28295677
Alignment:
Q  699 aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||  ||| ||| ||||||||||    
T  28295595 aagttataaccaaaaagtggata-tcacaccttgaggtgtggcttgctaaaagacacttgtaaaatgtgacttctagcaaaacc 28295677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 699 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28516478 - 28516396
Alignment:
Q  699 aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacctataaagagtgtcttgtagcaaaacc 782  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||  ||| ||| ||||||||||    
T  28516478 aagttataaccaaaaagtggata-tcacaccttgaggtgtggcttgctaaaagacacttgtaaaatgtgacttctagcaaaacc 28516396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 664 - 750
Target Start/End: Original strand, 32645707 - 32645793
Alignment:
Q  664 gacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| | | |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  32645707 gacaccaactaatttttatgaaagtgtcttttaacaaagttcttactaaaaagtggat-atcataccttgaggtgtggcttgctaaaa 32645793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 597 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 30416539 - 30416461
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaa 675  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||| |||||||    
T  30416539 gttttgctagaagatactctttatgaaggtgctttttaacaagttgtcctataggtatttgctaaaagacaccaactaa 30416461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 653 - 690
Target Start/End: Original strand, 7190660 - 7190697
Alignment:
Q  653 atttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgt 690  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7190660 atttattaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgt 7190697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 600 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 103399 - 103247
Alignment:
Q  600 ttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagca 699  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |    
T  103399 ttgctagaagacaccctttatgaaggtgttttttagtaagttatcttatagacatttgctaaaagacaccaactaacttttatgaaggtgttttttagga 103300  T
Q  700 agttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaa 752  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  103299 agttataactaaaaagttgataatcacaacttgaggtgtggtttactaaaaaa 103247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 678 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 88245 - 88185
Alignment:
Q  678 tttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgt 738  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  88245 tttatgaaggtgtcttttaggaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgt 88185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Original strand, 392402 - 392566
Alignment:
Q  593 tagggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtct 692  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  392402 tagggttttgctagaagacaccttttatgaagatgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaactaattattatgaaggtgtct 392501  T
Q  693 cttagcaagt-tataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
     ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  392502 tttagcaaatgtataactaaaaagtgga-aatcacaccttaaggtgtgggttgctaaaagacacct 392566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 73; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 594 - 749
Target Start/End: Original strand, 35051 - 35206
Alignment:
Q  594 agggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctc 693  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  35051 agggttttgctagaagacaccttttatgaaggtgtcttttagcaagttattctatgagcatttgctaagagacaccgactaatttttatgaaggtgtctt 35150  T
Q  694 ttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaa 749  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  35151 ttagcaaagttataactaaaaagt-gaaaatcacaccttgaggtgtggattgctaaa 35206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 596 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 231286 - 231162
Alignment:
Q  596 ggttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctt 695  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  231286 ggttttgctagaagacacattttatgaaggtgtcttttaacaaattattctatgaacatttgttaaaagataccaactaatttttatgaaggtgtcttat 231187  T
Q  696 agc-aagttataattaaaaagtgga 719  Q
    | | |||||||||||||||||||||    
T  231186 aacaaagttataattaaaaagtgga 231162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 600 - 757
Target Start/End: Original strand, 9155 - 9311
Alignment:
Q  600 ttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc- 698  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  9155 ttgctagaagacaccttttatgaaggtgtattttagcaagttattctatgagcatttgctaaaagataccaactaa-ttttatgaaggtgtcttttagca 9253  T
Q  699 aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  9254 aaattataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtggattgcgaaaagacacct 9311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 717
Target Start/End: Original strand, 478319 - 478431
Alignment:
Q  606 gaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagtta 704  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  478319 gaagacactttttatgaaggtgttttttagcaagttattctatgaacatttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttaacaaagtta 478418  T
Q  705 taattaaaaagtg 717  Q
    ||| |||||||||    
T  478419 taactaaaaagtg 478431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 653 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 94909 - 94805
Alignment:
Q  653 atttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaa 751  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||     
T  94909 atttgttaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggtgtgggttgctaaaag 94811  T
Q  752 acacct 757  Q
    ||||||    
T  94810 acacct 94805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 607 - 757
Target Start/End: Original strand, 17796 - 17946
Alignment:
Q  607 aagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttat 705  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||  || |||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  17796 aagacaccttttatgaatatgttttttagtaatttactcaattaacatttgttaaaagacatcaactaatttttatgaaggtgttttttagcaaagttat 17895  T
Q  706 aattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  17896 aactaaaaagtgga-aatcacaccttgaggcgtgagttgctaaaagacacct 17946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 676 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 24660 - 24586
Alignment:
Q  676 tttttatgaaggtgtctcttagcaagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaa 750  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24660 tttttatgaaggtgtcttgtagcaagttataaataaaaagttgataatcaaatcttgaggtgtgacttgctaaaa 24586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 35975 - 35895
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| || || |||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  35975 ttttatgaaggtgtcttttagcaaaattataactaaaaagtaga-aaacacacctggaggtgttaattgctaaaaaacacct 35895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 597 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 121789 - 121629
Alignment:
Q  597 gttttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctctta 696  Q
    ||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  121789 gttttgctataaaacacattttatgaaggtgtcttttaacaagttattctatgagcatttgctaaaagacaccaattaatttttatgaatgagtctttta 121690  T
Q  697 gc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    || || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | ||  ||||||||||||||||    
T  121689 gcaaaattataactaaaaagtgga-aatcacaccttgaaatatggattgctaaaaaacacct 121629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 652 - 747
Target Start/End: Original strand, 3773 - 3867
Alignment:
Q  652 catttgttaaaagacagcaactaatttttatgaaggtgtctcttagc-aagttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgcta 747  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3773 catttgttaatagacaccaactaatttttatgaaggtgt-ttttagcaaagttataactaaaaaaagga-aatcacaccttgaggtgtgagttgcta 3867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 599 - 675
Target Start/End: Original strand, 77027 - 77103
Alignment:
Q  599 tttgcttgaagacaccttttatgaaggtgtattttaacaagttatcctattgacatttgttaaaagacagcaactaa 675  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  77027 tttgctagaagacactatttatgaaggtgttttttagcaagttattctgtaaacatttgctaaaagacaccaactaa 77103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 8604 - 8524
Alignment:
Q  677 ttttatgaaggtgtctcttagcaa-gttataattaaaaagtggataatcacatcttgaggtgtgacttgctaaaaaacacct 757  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  8604 ttttatgaagttgtcttttaacaaagttataactaaaaagtgga-aatcacaccttcaggtgtggattgctaaaagacacct 8524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University