View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7623_low_11 (Length: 312)

Name: NF7623_low_11
Description: NF7623
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7623_low_11
NF7623_low_11
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (2-301)||(27608609-27608908)
chr8 (2-301)||(16277766-16278065)
chr8 (1-301)||(19688309-19688609)
chr8 (2-301)||(14557836-14558135)
chr8 (1-301)||(2136963-2137263)
chr8 (2-301)||(16283661-16283960)
chr8 (2-300)||(29829534-29829832)
chr8 (2-300)||(19674653-19674951)
chr8 (2-300)||(31489455-31489753)
chr8 (5-300)||(19286677-19286972)
chr8 (2-300)||(3329212-3329510)
chr8 (2-300)||(19208065-19208363)
chr8 (2-300)||(28361660-28361958)
chr8 (2-300)||(31354736-31355034)
chr8 (5-300)||(9354838-9355133)
chr8 (1-219)||(189305-189523)
chr8 (2-300)||(12092429-12092727)
chr8 (2-300)||(33258935-33259233)
chr8 (2-294)||(18710798-18711090)
chr8 (182-301)||(18791099-18791218)
chr8 (5-293)||(19658752-19659040)
chr8 (5-294)||(44563315-44563603)
chr8 (5-293)||(33244880-33245168)
chr8 (2-204)||(22080679-22080881)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (2-301)||(27434178-27434477)
chr2 (2-301)||(28882422-28882721)
chr2 (2-301)||(20838126-20838425)
chr2 (2-301)||(12655750-12656049)
chr2 (2-301)||(23128300-23128599)
chr2 (2-300)||(27777430-27777728)
chr2 (2-300)||(27817188-27817486)
chr2 (2-300)||(12587018-12587316)
chr2 (2-300)||(27803915-27804213)
chr2 (2-300)||(37375369-37375667)
chr2 (2-300)||(13936279-13936577)
chr2 (2-300)||(12716337-12716635)
chr2 (2-300)||(39051557-39051855)
chr2 (5-300)||(39890285-39890580)
chr2 (2-300)||(260488-260786)
chr2 (9-300)||(11634921-11635212)
chr2 (9-300)||(11641110-11641401)
chr2 (2-300)||(40233719-40234017)
chr2 (2-300)||(16829073-16829371)
chr2 (2-300)||(16892110-16892408)
chr2 (2-300)||(32050006-32050304)
chr2 (2-300)||(21676917-21677215)
chr2 (2-300)||(34861888-34862186)
chr2 (2-300)||(37685644-37685942)
chr2 (2-300)||(37700909-37701207)
chr2 (2-300)||(37925701-37925999)
chr2 (2-300)||(34286562-34286860)
chr2 (2-300)||(34291622-34291920)
chr2 (5-300)||(19416234-19416529)
chr2 (2-301)||(31876489-31876788)
chr2 (2-300)||(9349717-9350015)
chr2 (2-301)||(21702898-21703197)
chr2 (2-294)||(22925769-22926061)
chr2 (1-301)||(19456155-19456455)
chr2 (5-209)||(34303129-34303333)
chr2 (5-293)||(27118899-27119187)
chr2 (5-294)||(16163810-16164102)
chr2 (5-203)||(3784865-3785063)
chr2 (5-203)||(34157221-34157419)
chr2 (2-96)||(27393177-27393271)
chr2 (2-43)||(34279657-34279698)
chr2 (5-153)||(31891210-31891358)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (2-301)||(22998756-22999055)
chr5 (2-301)||(23717630-23717929)
chr5 (1-301)||(24687799-24688099)
chr5 (1-298)||(33777707-33778004)
chr5 (2-290)||(11549575-11549863)
chr5 (2-298)||(23752095-23752391)
chr5 (2-301)||(15658402-15658701)
chr5 (2-300)||(18500373-18500671)
chr5 (2-301)||(24970239-24970538)
chr5 (2-301)||(30934854-30935153)
chr5 (2-300)||(28649456-28649754)
chr5 (2-300)||(13324472-13324770)
chr5 (2-300)||(43078473-43078771)
chr5 (5-300)||(3789765-3790060)
chr5 (2-300)||(24681661-24681959)
chr5 (2-300)||(24724188-24724486)
chr5 (2-300)||(31826050-31826348)
chr5 (2-301)||(18375054-18375353)
chr5 (2-300)||(6874526-6874824)
chr5 (2-300)||(31431661-31431959)
chr5 (5-300)||(34616742-34617037)
chr5 (5-300)||(37358286-37358581)
chr5 (2-300)||(2511272-2511570)
chr5 (2-300)||(8665118-8665416)
chr5 (2-300)||(12132376-12132674)
chr5 (2-300)||(15758500-15758798)
chr5 (2-300)||(37755201-37755499)
chr5 (2-300)||(40473192-40473490)
chr5 (2-300)||(9317672-9317970)
chr5 (2-300)||(33516577-33516875)
chr5 (2-300)||(5638131-5638429)
chr5 (2-300)||(30152239-30152537)
chr5 (2-300)||(32599115-32599413)
chr5 (2-300)||(37671126-37671424)
chr5 (5-300)||(28959429-28959724)
chr5 (2-300)||(26480613-26480910)
chr5 (2-300)||(30029636-30029934)
chr5 (2-300)||(37770630-37770928)
chr5 (2-300)||(30168690-30168988)
chr5 (2-300)||(23892427-23892725)
chr5 (2-300)||(41674930-41675228)
chr5 (2-216)||(29966793-29967007)
chr5 (2-162)||(9548324-9548484)
chr5 (2-293)||(29888732-29889023)
chr5 (2-301)||(22888691-22888990)
chr5 (2-301)||(25199250-25199549)
chr5 (2-294)||(33877468-33877760)
chr5 (5-239)||(13184352-13184586)
chr5 (2-203)||(11326015-11326216)
chr5 (5-162)||(13440275-13440432)
chr5 (2-179)||(33292746-33292923)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (2-301)||(6192489-6192788)
chr3 (1-301)||(4796439-4796739)
chr3 (2-301)||(8296145-8296444)
chr3 (2-301)||(15892492-15892791)
chr3 (5-301)||(4721807-4722103)
chr3 (2-301)||(8301053-8301352)
chr3 (2-297)||(18330842-18331137)
chr3 (2-301)||(29148541-29148840)
chr3 (2-298)||(15740883-15741179)
chr3 (1-297)||(35880938-35881234)
chr3 (2-297)||(22387368-22387663)
chr3 (2-300)||(7073385-7073683)
chr3 (2-300)||(28021448-28021746)
chr3 (2-300)||(48466100-48466398)
chr3 (2-300)||(18276839-18277137)
chr3 (2-300)||(18307441-18307739)
chr3 (2-300)||(20576634-20576932)
chr3 (2-300)||(28115741-28116039)
chr3 (2-301)||(18051435-18051734)
chr3 (2-300)||(4417092-4417390)
chr3 (2-300)||(8211911-8212209)
chr3 (2-300)||(11110136-11110434)
chr3 (2-300)||(18292140-18292438)
chr3 (2-300)||(4346474-4346772)
chr3 (2-300)||(21674866-21675164)
chr3 (2-300)||(51782196-51782494)
chr3 (2-300)||(29664757-29665055)
chr3 (2-300)||(36996864-36997162)
chr3 (5-300)||(18242915-18243210)
chr3 (2-300)||(5467158-5467456)
chr3 (2-300)||(10396306-10396604)
chr3 (2-300)||(5609109-5609407)
chr3 (2-300)||(22870643-22870941)
chr3 (2-300)||(22885702-22886000)
chr3 (2-300)||(31964260-31964558)
chr3 (5-300)||(5596144-5596439)
chr3 (2-300)||(18225364-18225662)
chr3 (2-300)||(28339475-28339773)
chr3 (2-300)||(17984743-17985041)
chr3 (2-300)||(6542249-6542547)
chr3 (2-300)||(7996735-7997033)
chr3 (2-300)||(10643243-10643541)
chr3 (2-300)||(5013885-5014183)
chr3 (2-300)||(24328332-24328630)
chr3 (2-300)||(47023626-47023924)
chr3 (2-178)||(51797286-51797462)
chr3 (2-168)||(50133990-50134156)
chr3 (5-239)||(17993632-17993866)
chr3 (1-301)||(18530560-18530860)
chr3 (2-294)||(31033910-31034202)
chr3 (2-294)||(32292925-32293217)
chr3 (1-301)||(16626292-16626592)
chr3 (5-293)||(5652563-5652851)
chr3 (2-203)||(5713400-5713601)
chr3 (2-203)||(5724310-5724511)
chr3 (2-203)||(5767857-5768058)
chr3 (2-162)||(5757007-5757167)
chr3 (2-153)||(32439327-32439478)
chr3 (5-162)||(4626120-4626277)
chr3 (2-93)||(20066216-20066307)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (2-301)||(2154786-2155085)
chr7 (2-301)||(10916499-10916798)
chr7 (2-297)||(11424412-11424706)
chr7 (2-301)||(16503011-16503310)
chr7 (2-301)||(16518047-16518346)
chr7 (2-297)||(5128205-5128500)
chr7 (2-300)||(26435470-26435768)
chr7 (2-300)||(26537502-26537800)
chr7 (2-300)||(5146972-5147270)
chr7 (2-300)||(24592173-24592471)
chr7 (2-300)||(3445519-3445817)
chr7 (2-300)||(4144755-4145053)
chr7 (2-300)||(31564022-31564320)
chr7 (2-300)||(16736092-16736390)
chr7 (2-300)||(16751146-16751444)
chr7 (2-300)||(17523745-17524043)
chr7 (2-300)||(17529172-17529470)
chr7 (2-300)||(9618864-9619162)
chr7 (2-300)||(45387556-45387854)
chr7 (2-300)||(26319501-26319799)
chr7 (2-300)||(26669546-26669844)
chr7 (2-300)||(26274726-26275024)
chr7 (2-258)||(11441785-11442041)
chr7 (5-300)||(31125136-31125431)
chr7 (2-301)||(16449629-16449928)
chr7 (138-300)||(26513130-26513292)
chr7 (1-301)||(16041535-16041835)
chr7 (2-294)||(39210661-39210953)
chr7 (2-294)||(26484907-26485199)
chr7 (2-273)||(2775572-2775843)
chr7 (5-294)||(26682638-26682927)
chr7 (2-293)||(4200760-4201051)
chr7 (2-273)||(2108664-2108935)
chr7 (5-203)||(31088193-31088391)
chr7 (5-203)||(45733676-45733874)
chr7 (2-179)||(18541012-18541189)
chr7 (2-179)||(5159732-5159909)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (2-301)||(24863926-24864225)
chr6 (1-297)||(26918588-26918884)
chr6 (2-301)||(22934568-22934867)
chr6 (2-301)||(23857013-23857312)
chr6 (1-301)||(15424005-15424305)
chr6 (2-301)||(26989210-26989510)
chr6 (2-301)||(24304306-24304605)
chr6 (2-300)||(16750063-16750361)
chr6 (2-301)||(13298639-13298938)
chr6 (2-300)||(29549684-29549982)
chr6 (2-300)||(3696290-3696588)
chr6 (2-301)||(27290058-27290357)
chr6 (2-300)||(34463035-34463333)
chr6 (5-300)||(29501627-29501922)
chr6 (2-300)||(16674348-16674646)
chr6 (1-301)||(27272268-27272568)
chr6 (2-300)||(4545464-4545762)
chr6 (2-300)||(4773215-4773513)
chr6 (2-300)||(27007936-27008234)
chr6 (5-300)||(4723823-4724118)
chr6 (5-300)||(27044600-27044895)
chr6 (5-300)||(27485341-27485636)
chr6 (2-300)||(4757973-4758271)
chr6 (2-301)||(27359680-27359979)
chr6 (2-301)||(27450023-27450322)
chr6 (2-300)||(29573222-29573520)
chr6 (2-300)||(30557705-30558003)
chr6 (5-300)||(28207666-28207961)
chr6 (2-300)||(4525495-4525793)
chr6 (2-300)||(16943716-16944014)
chr6 (2-300)||(26116099-26116397)
chr6 (5-300)||(26777299-26777599)
chr6 (2-174)||(17025486-17025658)
chr6 (118-300)||(27019461-27019643)
chr6 (1-122)||(27000281-27000402)
chr6 (2-294)||(14142980-14143272)
chr6 (2-294)||(26788153-26788445)
chr6 (2-294)||(27196526-27196818)
chr6 (2-294)||(27252422-27252714)
chr6 (2-294)||(22456638-22456921)
chr6 (2-294)||(13521768-13522060)
chr6 (2-156)||(17092273-17092427)
chr6 (1-123)||(20160909-20161031)
chr6 (1-123)||(22171800-22171922)
chr6 (5-162)||(33374083-33374240)
chr6 (5-203)||(8892097-8892295)
chr6 (5-203)||(8903332-8903530)
chr6 (5-162)||(28162869-28163026)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (2-301)||(14665245-14665544)
chr4 (2-301)||(17014227-17014526)
chr4 (2-301)||(24592059-24592358)
chr4 (2-300)||(36344261-36344559)
chr4 (2-300)||(14763050-14763348)
chr4 (2-300)||(18800359-18800657)
chr4 (2-300)||(6570080-6570378)
chr4 (2-300)||(33673544-33673842)
chr4 (5-300)||(30753984-30754279)
chr4 (2-300)||(39850865-39851163)
chr4 (5-300)||(54833617-54833912)
chr4 (2-300)||(5006100-5006398)
chr4 (2-300)||(31126264-31126562)
chr4 (2-300)||(14098768-14099066)
chr4 (2-300)||(21969928-21970226)
chr4 (2-300)||(40105384-40105682)
chr4 (5-300)||(27163063-27163358)
chr4 (1-301)||(15284673-15284973)
chr4 (2-300)||(1900484-1900782)
chr4 (2-301)||(15228097-15228396)
chr4 (5-203)||(24460448-24460646)
chr4 (2-186)||(14235385-14235569)
chr4 (2-179)||(24112889-24113066)
chr4 (2-179)||(34188827-34189004)
chr4 (2-294)||(15391090-15391382)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (3-301)||(39814-40112)
scaffold0089 (2-301)||(46730-47029)
scaffold0089 (2-301)||(29975-30274)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (2-300)||(6226-6524)
scaffold0415 (2-133)||(1831-1961)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (2-301)||(30664-30964)
scaffold0124 (2-133)||(20600-20730)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (2-301)||(27504-27804)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (2-301)||(51638429-51638728)
chr1 (2-300)||(41793054-41793352)
chr1 (2-300)||(10962881-10963179)
chr1 (2-300)||(28585192-28585490)
chr1 (2-301)||(16207776-16208075)
chr1 (2-294)||(28152073-28152365)
chr1 (2-301)||(20340080-20340379)
chr1 (1-301)||(20461291-20461591)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (2-300)||(8812-9110)
scaffold0159 (2-300)||(20227-20526)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (2-301)||(14675-14974)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (2-300)||(9778-10076)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (2-300)||(25947-26245)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (2-300)||(6985-7283)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (5-300)||(8164-8459)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (2-285)||(46556-46848)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (2-174)||(1-173)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (2-301)||(2403-2702)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (2-300)||(364-662)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (2-273)||(21773-22044)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (2-65)||(9-72)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27608908 - 27608609
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608908 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 27608809  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27608808 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttccctattcagccatgatcatgc 27608709  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27608708 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27608609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 16277766 - 16278065
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16277766 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtat 16277865  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16277866 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 16277965  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16277966 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 19688309 - 19688609
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19688309 aaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagta 19688408  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19688409 tgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 19688508  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19688509 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgtccaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgaatgtcaatgatgt 19688608  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  19688609 c 19688609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 14557836 - 14558135
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14557836 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtat 14557935  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14557936 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgc 14558035  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14558036 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 14558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2137263 - 2136963
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2137263 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagca 2137164  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2137163 tgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 2137064  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2137063 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgt 2136964  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  2136963 c 2136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 16283661 - 16283960
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16283661 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtat 16283760  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  16283761 gtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcatac 16283860  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283861 catttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 16283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 29829534 - 29829832
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29829534 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 29829633  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29829634 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 29829733  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  29829734 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29829832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 19674653 - 19674951
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19674653 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 19674752  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19674753 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 19674852  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  19674853 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19674951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31489753 - 31489455
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31489753 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31489654  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  31489653 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 31489554  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  31489553 caagtgtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 19286677 - 19286972
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19286677 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 19286776  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19286777 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 19286876  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  19286877 atgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 19286972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3329510 - 3329212
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3329510 aagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 3329411  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3329410 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 3329311  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  3329310 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataacttcctgactgtcagtgatgt 3329212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19208363 - 19208065
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19208363 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 19208264  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19208263 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 19208164  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19208163 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19208065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28361958 - 28361660
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28361958 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28361859  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28361858 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 28361759  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28361758 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 31354736 - 31355034
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31354736 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31354835  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31354836 gtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgc 31354935  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31354936 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcctgatggatgataatctcctgactgtcagtgatgt 31355034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 9354838 - 9355133
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9354838 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 9354937  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9354938 aggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 9355037  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9355038 gtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9355133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 189305 - 189523
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  189305 aaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagta 189404  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  189405 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 189504  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgcct 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  189505 ccaagtgcctaggatgcct 189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12092727 - 12092429
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12092727 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 12092628  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||    |  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  12092627 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatga 12092528  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12092527 caagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgaccgtcagtgatgt 12092429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 33258935 - 33259233
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33258935 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgt 33259034  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  33259035 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 33259134  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33259135 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 18710798 - 18711090
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  18710798 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 18710897  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  18710898 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 18710997  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  18710998 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 18711090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Original strand, 18791099 - 18791218
Alignment:
Q  182 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18791099 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcattcgtaatcctttgggttgctacactgctcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatt 18791198  T
Q  282 ttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  18791199 ttttgactgttagtgatgtc 18791218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19659040 - 19658752
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  19659040 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 19658941  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||| ||||  || || |||||||  ||||||||||||||||| || | ||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||     
T  19658940 aggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccag 19658841  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtca 293  Q
     |||| || |||| | | |||||||| ||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||||    
T  19658840 ttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 19658752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 44563315 - 44563603
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  44563315 ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatg 44563413  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  44563414 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 44563513  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
     |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  44563514 ttgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 44563603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 33244880 - 33245168
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || || || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  33244880 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 33244979  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||  ||||  || ||  ||||||  ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||     
T  33244980 aggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaactcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccag 33245079  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtca 293  Q
     |||| || |||| | | |||||||| ||| ||||    ||||||  |||||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||||    
T  33245080 ttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 33245168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22080881 - 22080679
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||         
T  22080881 aagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagactc 22080782  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||| |||| ||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  22080781 atgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgc 22080682  T
Q  202 caa 204  Q
    |||    
T  22080681 caa 22080679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27434477 - 27434178
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27434477 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 27434378  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27434377 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 27434278  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434277 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 27434178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 28882422 - 28882721
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28882422 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 28882521  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882522 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 28882621  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882622 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 28882721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 20838126 - 20838425
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20838126 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtat 20838225  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20838226 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 20838325  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838326 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 20838425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 12655750 - 12656049
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12655750 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtat 12655849  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12655850 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 12655949  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12655950 caagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtgagtgatgtc 12656049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23128599 - 23128300
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23128599 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 23128500  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23128499 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 23128400  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128399 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactattcaagatgatatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 27777430 - 27777728
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27777430 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 27777529  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27777530 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 27777629  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27777630 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 27817188 - 27817486
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27817188 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 27817287  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27817288 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 27817387  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27817388 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27817486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 12587018 - 12587316
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12587018 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 12587117  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12587118 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 12587217  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12587218 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 27803915 - 27804213
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27803915 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 27804014  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27804015 gtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 27804114  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27804115 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 37375369 - 37375667
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37375369 aagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37375468  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37375469 gtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgaacatgc 37375568  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37375569 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 37375667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13936577 - 13936279
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13936577 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 13936478  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13936477 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 13936378  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| || ||||||||||| ||  |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13936377 caaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13936279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12716635 - 12716337
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12716635 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 12716536  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12716535 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgc 12716436  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12716435 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12716337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39051855 - 39051557
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39051855 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 39051756  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39051755 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgatcagccatgatcatgc 39051656  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39051655 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacaacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39051557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 39890285 - 39890580
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39890285 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 39890384  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39890385 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 39890484  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  39890485 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgttgttcaagacgacatccaaggcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39890580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 260786 - 260488
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  260786 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 260687  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  260686 gcgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgc 260587  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  260586 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11635212 - 11634921
Alignment:
Q  9 ttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgagga 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11635212 ttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgagga 11635113  T
Q  109 agctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11635112 agctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgt 11635013  T
Q  209 ctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    || |||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  11635012 ctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11634921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11641401 - 11641110
Alignment:
Q  9 ttgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgagga 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11641401 ttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgagga 11641302  T
Q  109 agctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11641301 agctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgt 11641202  T
Q  209 ctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    || |||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  11641201 ctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcggtgatgt 11641110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 40233719 - 40234017
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40233719 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgt 40233818  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40233819 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 40233918  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  40233919 caagtgtctgggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctaactgtcagtgatgt 40234017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16829371 - 16829073
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16829371 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 16829272  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16829271 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 16829172  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16829171 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16829073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 16892110 - 16892408
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16892110 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 16892209  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16892210 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 16892309  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16892310 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16892408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 32050006 - 32050304
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32050006 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgt 32050105  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  32050106 gtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgc 32050205  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32050206 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32050304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21677215 - 21676917
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21677215 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 21677116  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21677115 gtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 21677016  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  21677015 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 21676917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 34861888 - 34862186
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34861888 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 34861987  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  34861988 gtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 34862087  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34862088 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37685942 - 37685644
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37685942 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37685843  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  37685842 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 37685743  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37685742 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37701207 - 37700909
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37701207 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37701108  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  37701107 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 37701008  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37701007 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37700909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 37925701 - 37925999
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37925701 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37925800  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  37925801 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 37925900  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37925901 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 34286562 - 34286860
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  34286562 aagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatat 34286661  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34286662 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 34286761  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34286762 caagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34286860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 34291622 - 34291920
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  34291622 aagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcgagatat 34291721  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34291722 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 34291821  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34291822 caagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19416529 - 19416234
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19416529 ctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 19416430  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  19416429 aagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaa 19416330  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| || ||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19416329 gtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19416234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 31876489 - 31876788
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31876489 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31876588  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  31876589 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttctctgttcaatcatgatcatgc 31876688  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||| || ||||| || ||| | |||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31876689 caagtgtctgggatgtctccgtgaccctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 31876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9350015 - 9349717
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  9350015 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 9349916  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  | ||||| |||||||| |   |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9349915 atgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 9349816  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9349815 caagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9349717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21703197 - 21702898
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  21703197 aagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 21703098  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||| | ||| |||||| |    
T  21703097 atgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttaaccacgatcatac 21702998  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||| |||| || |||| | |||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||    
T  21702997 caattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacggcaattatttgactgtcagcgatgtc 21702898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22926061 - 22925769
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  22926061 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 22925962  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  22925961 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 22925862  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||| ||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  22925861 caattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 22925769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19456455 - 19456155
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||| ||||| || |||    
T  19456455 aaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggta 19456356  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   |||||||||||    
T  19456355 tgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatg 19456256  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||  ||||  | |||| |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||| ||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  19456255 ccagttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgatatccagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 19456156  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  19456155 c 19456155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34303333 - 34303129
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||| | || ||||| || |||| ||    
T  34303333 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatg 34303234  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   | |||||||||||||    
T  34303233 aggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgacaatgatcatgccaa 34303134  T
Q  205 gtgcc 209  Q
     ||||    
T  34303133 ttgcc 34303129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 27118899 - 27119187
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||| || ||||| || |||| ||    
T  27118899 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatg 27118998  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||| ||||  || ||  |||||   ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||     
T  27118999 aggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccag 27119098  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtca 293  Q
     |||| || |||| | | |||||||| ||| ||||    ||||||  |||||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||||    
T  27119099 ttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 27119187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 16163810 - 16164102
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  16163810 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 16163909  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttcc---ctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| |||   |||||   ||||||||||||    
T  16163910 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctcctctctgtttgaccatgatcatgc 16164009  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  16164010 caattgccaagaatgattatgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 16164102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 3784865 - 3785063
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  3784865 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 3784964  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcca 203  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||    
T  3784965 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcca 3785063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 34157221 - 34157419
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  34157221 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 34157320  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcca 203  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||    
T  34157321 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcca 34157419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Original strand, 27393177 - 27393271
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 96  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||| || | |||||| ||||||||    
T  27393177 aagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcga 27393271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 34279657 - 34279698
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279657 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31891358 - 31891210
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  31891358 ctcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 31891259  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcc 153  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  31891258 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcc 31891210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22999055 - 22998756
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22999055 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 22998956  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22998955 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 22998856  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22998855 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22998756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23717929 - 23717630
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23717929 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 23717830  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23717829 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 23717730  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717729 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23717630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24688099 - 24687799
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24688099 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagta 24688000  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24687999 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 24687900  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24687899 ccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 24687800  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  24687799 c 24687799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 33777707 - 33778004
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33777707 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagta 33777806  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33777807 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatg 33777906  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgat 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33777907 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 33778004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 290
Target Start/End: Original strand, 11549575 - 11549863
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11549575 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 11549674  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11549675 gcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 11549774  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactg 290  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549775 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactg 11549863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23752391 - 23752095
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752391 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 23752292  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23752291 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 23752192  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgat 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23752191 caagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgat 23752095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15658701 - 15658402
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15658701 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgt 15658602  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15658601 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctgttcagccatgatcatgc 15658502  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658501 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 15658402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18500671 - 18500373
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18500671 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18500572  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18500571 gtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 18500472  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18500471 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18500373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 24970239 - 24970538
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  24970239 aagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtac 24970338  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24970339 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 24970438  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24970439 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24970538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 30934854 - 30935153
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30934854 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtat 30934953  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934954 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 30935053  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30935054 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30935153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 28649456 - 28649754
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28649456 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28649555  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28649556 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 28649655  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28649656 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgctataccgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28649754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13324770 - 13324472
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13324770 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 13324671  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13324670 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 13324571  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13324570 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 13324472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 43078473 - 43078771
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43078473 aagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 43078572  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43078573 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 43078672  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43078673 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 43078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 3789765 - 3790060
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3789765 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 3789864  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3789865 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 3789964  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3789965 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3790060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 24681661 - 24681959
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681661 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 24681760  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24681761 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgc 24681860  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  24681861 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24681959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 24724188 - 24724486
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24724188 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 24724287  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24724288 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgc 24724387  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  24724388 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31826348 - 31826050
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31826348 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 31826249  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31826248 gtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 31826149  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31826148 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaagctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 31826050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18375353 - 18375054
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18375353 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgt 18375254  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  18375253 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 18375154  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18375153 caagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 18375054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 6874526 - 6874824
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6874526 aagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 6874625  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6874626 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgc 6874725  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6874726 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6874824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 31431661 - 31431959
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31431661 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31431760  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31431761 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 31431860  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  31431861 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31431959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 34616742 - 34617037
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34616742 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 34616841  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34616842 aggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 34616941  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34616942 gtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34617037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37358581 - 37358286
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37358581 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 37358482  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37358481 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 37358382  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37358381 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagattgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37358286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 2511272 - 2511570
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2511272 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 2511371  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2511372 gtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 2511471  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  2511472 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 2511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8665416 - 8665118
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8665416 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 8665317  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8665316 gtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgc 8665217  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  8665216 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 8665118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 12132376 - 12132674
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12132376 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 12132475  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  12132476 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 12132575  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12132576 caagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12132674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15758798 - 15758500
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15758798 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 15758699  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15758698 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgc 15758599  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15758598 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 15758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 37755201 - 37755499
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37755201 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37755300  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37755301 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 37755400  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  37755401 caagtgtctagggtgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37755499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40473490 - 40473192
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40473490 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 40473391  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40473390 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgc 40473291  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40473290 caagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgacgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 9317672 - 9317970
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9317672 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9317771  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  9317772 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 9317871  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9317872 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9317970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 33516577 - 33516875
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  33516577 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 33516676  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  33516677 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 33516776  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33516777 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33516875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 5638131 - 5638429
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  5638131 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgt 5638230  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  5638231 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 5638330  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5638331 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5638429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 30152239 - 30152537
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30152239 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 30152338  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30152339 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 30152438  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  30152439 caagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32599413 - 32599115
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32599413 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 32599314  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || |  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32599313 gtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgc 32599214  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  32599213 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37671424 - 37671126
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37671424 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37671325  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37671324 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgcccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 37671225  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37671224 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28959724 - 28959429
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28959724 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtg 28959625  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||  || |  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28959624 aggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaa 28959525  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28959524 gtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28959429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 26480613 - 26480910
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26480613 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 26480712  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  26480713 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaact-ctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 26480811  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||  || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26480812 caagtgtctgggatatctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26480910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 30029636 - 30029934
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30029636 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 30029735  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30029736 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 30029835  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30029836 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccacgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30029934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37770928 - 37770630
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37770928 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37770829  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37770828 gtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgc 37770729  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  37770728 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgctaatcttctgactgtcagtgatgt 37770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 30168690 - 30168988
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30168690 aagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 30168789  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30168790 gtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 30168889  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
     ||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30168890 taagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatgctgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30168988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 23892427 - 23892725
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||    
T  23892427 aagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtat 23892526  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  23892527 atgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccatgatcatgc 23892626  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  23892627 caactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctacttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgacaattatttaactgttagtgatgt 23892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 41674930 - 41675228
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||    
T  41674930 aagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatat 41675029  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41675030 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 41675129  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41675130 caagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtaatgt 41675228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29967007 - 29966793
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29967007 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 29966908  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  29966907 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 29966808  T
Q  202 caagtgcctaggatg 216  Q
    |||||| || |||||    
T  29966807 caagtgtctgggatg 29966793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9548484 - 9548324
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9548484 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9548385  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacat 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9548384 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacat 9548324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29889023 - 29888732
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || || |    
T  29889023 aagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgt 29888924  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  29888923 atgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccgtgatcatgc 29888824  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtca 293  Q
    ||| |||| ||  ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  29888823 caattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctatgctgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtca 29888732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 22888691 - 22888990
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  22888691 aagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 22888790  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || | ||  ||||   ||||||||||||    
T  22888791 atgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctctttgtttgaccatgatcatgc 22888890  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
     |  |||| || |||| | |||||||||||||| || |    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  22888891 tagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 22888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 25199250 - 25199549
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  25199250 aagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 25199349  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||| |||| || ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   ||||||||||||    
T  25199350 atgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgc 25199449  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||  |||| || |||| |  ||||||||| ||| ||||     ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  25199450 cagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgctacgtcgttcaagatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 25199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 33877468 - 33877760
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  33877468 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 33877567  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  |||||||  ||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||| |||||    
T  33877568 atgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgc 33877667  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| || |    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  33877668 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 33877760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13184586 - 13184352
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  13184586 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 13184487  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  13184486 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 13184387  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgct 239  Q
     |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    
T  13184386 ttgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 13184352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 11326015 - 11326216
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |  ||||| || ||||| || ||||    
T  11326015 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtat 11326114  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  11326115 atgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 11326214  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  11326215 ca 11326216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13440432 - 13440275
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  13440432 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 13440333  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacat 162  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13440332 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacat 13440275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 33292746 - 33292923
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||  || ||||||||||| ||  |||    
T  33292746 aagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgagatat 33292845  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 179  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  33292846 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 33292923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 6192489 - 6192788
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6192489 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 6192588  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6192589 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 6192688  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192689 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 6192788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4796739 - 4796439
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796739 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 4796640  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4796639 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 4796540  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4796539 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 4796440  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  4796439 c 4796439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 8296145 - 8296444
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8296145 aagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 8296244  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8296245 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 8296344  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8296345 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgatgattttttgactgtcagtgatgtc 8296444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15892791 - 15892492
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15892791 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 15892692  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15892691 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 15892592  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15892591 caagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 15892492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 4721807 - 4722103
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4721807 ctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtg 4721906  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4721907 aggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 4722006  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4722007 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 4722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8301352 - 8301053
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8301352 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgt 8301253  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8301252 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 8301153  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8301152 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgattgtcggtgatgtc 8301053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Original strand, 18330842 - 18331137
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330842 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 18330941  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18330942 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 18331041  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18331042 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgaaaattttttgactgttagtga 18331137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29148840 - 29148541
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29148840 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 29148741  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29148740 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 29148641  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29148640 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgacaattctttgactgtcagtgatgtc 29148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15741179 - 15740883
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15741179 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 15741080  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15741079 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 15740980  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgat 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15740979 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatggatgataattttttgactgttagtgat 15740883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 35880938 - 35881234
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880938 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 35881037  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35881038 tgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 35881137  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  35881138 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgaaatttttttgactgttagtga 35881234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22387663 - 22387368
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387663 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 22387564  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22387563 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 22387464  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22387463 caagtgtctaggatgccttcgtaattctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 22387368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 7073385 - 7073683
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7073385 aagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgt 7073484  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7073485 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 7073584  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7073585 caagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 7073683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 28021448 - 28021746
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021448 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 28021547  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28021548 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 28021647  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28021648 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 48466100 - 48466398
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48466100 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 48466199  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48466200 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 48466299  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48466300 caagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 48466398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18277137 - 18276839
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18277137 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18277038  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18277037 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 18276938  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18276937 caagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18276839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18307739 - 18307441
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18307739 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18307640  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18307639 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 18307540  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18307539 caagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18307441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20576932 - 20576634
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20576932 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 20576833  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20576832 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 20576733  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20576732 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 20576634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28116039 - 28115741
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28116039 aagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28115940  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28115939 gcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 28115840  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28115839 caagtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 28115741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 18051435 - 18051734
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18051435 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtat 18051534  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  18051535 gtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgt 18051634  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18051635 caattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 18051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 4417092 - 4417390
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4417092 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4417191  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4417192 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgc 4417291  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4417292 caagtgtctcggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaaacttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4417390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 8211911 - 8212209
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8211911 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 8212010  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8212011 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 8212110  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8212111 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgatgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 8212209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11110434 - 11110136
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11110434 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgt 11110335  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11110334 gtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 11110235  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11110234 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaaacttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 11110136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18292438 - 18292140
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18292438 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18292339  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18292338 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 18292239  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18292238 caagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 18292140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4346772 - 4346474
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4346772 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4346673  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4346672 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 4346573  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  4346572 caagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 4346474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 21674866 - 21675164
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21674866 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 21674965  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21674966 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 21675065  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21675066 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21675164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 51782196 - 51782494
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51782196 aagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 51782295  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  51782296 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgc 51782395  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51782396 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 51782494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29665055 - 29664757
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  29665055 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 29664956  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29664955 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 29664856  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29664855 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29664757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36997162 - 36996864
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36997162 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 36997063  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36997062 gtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 36996963  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  36996962 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 36996864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 18242915 - 18243210
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18242915 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 18243014  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18243015 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 18243114  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  18243115 gtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 18243210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 5467158 - 5467456
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5467158 aagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 5467257  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5467258 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 5467357  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  5467358 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 5467456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 10396306 - 10396604
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10396306 aagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 10396405  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10396406 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgc 10396505  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10396506 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10396604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5609407 - 5609109
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5609407 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 5609308  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5609307 gtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgc 5609208  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  5609207 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22870941 - 22870643
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22870941 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 22870842  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22870841 gtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 22870742  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  22870741 caagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22870643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22886000 - 22885702
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22886000 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 22885901  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22885900 gtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 22885801  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  22885800 caagtgtctaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 22885702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31964558 - 31964260
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31964558 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31964459  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31964458 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgagcatgc 31964359  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
T  31964358 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagagatgt 31964260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5596439 - 5596144
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5596439 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 5596340  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5596339 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 5596240  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||||||||||  || |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5596239 gtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5596144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 18225364 - 18225662
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18225364 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 18225463  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18225464 gtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 18225563  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18225564 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttataccgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18225662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 28339475 - 28339773
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28339475 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28339574  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28339575 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 28339674  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  28339675 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17985041 - 17984743
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17985041 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 17984942  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17984941 gtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaagcttctctgttcagtcatgatcatgc 17984842  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||    
T  17984841 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgccatattgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgatgatcttctgaccgtcagtgatgt 17984743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6542547 - 6542249
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6542547 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 6542448  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6542447 gtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 6542348  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  6542347 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatttcctgaccgtcagtgatgt 6542249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 7996735 - 7997033
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7996735 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 7996834  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7996835 gtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgc 7996934  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7996935 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 7997033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 10643243 - 10643541
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10643243 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 10643342  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10643343 gtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgc 10643442  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10643443 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10643541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 5013885 - 5014183
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5013885 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 5013984  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  5013985 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 5014084  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5014085 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 24328332 - 24328630
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24328332 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 24328431  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  24328432 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgc 24328531  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  24328532 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24328630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 47023626 - 47023924
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  47023626 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 47023725  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  47023726 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgc 47023825  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  47023826 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 47023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 51797286 - 51797462
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51797286 aagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 51797385  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagct 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51797386 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagct 51797462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50134156 - 50133990
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50134156 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 50134057  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50134056 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagct 50133990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17993866 - 17993632
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  17993866 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 17993767  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17993766 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 17993667  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgct 239  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17993666 gtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgct 17993632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18530560 - 18530860
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || |||    
T  18530560 aaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggta 18530659  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    | ||||| |||||| |||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |   ||||   |||||||||||    
T  18530660 tatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatg 18530759  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||| || | || |||| | |||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  18530760 ccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctatgttgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 18530859  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  18530860 c 18530860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31034202 - 31033910
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  31034202 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 31034103  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  31034102 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 31034003  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  31034002 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 31033910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 32292925 - 32293217
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  32292925 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 32293024  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  32293025 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 32293124  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  32293125 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 32293217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16626592 - 16626292
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||  | |||||||| ||||| || |||    
T  16626592 aaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggta 16626493  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    | |||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   |||||||||||    
T  16626492 tatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatg 16626393  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||  ||||  | |||| | | |||||||||||| ||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||    
T  16626392 ccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcagcgatgt 16626293  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  16626292 c 16626292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 5652563 - 5652851
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  5652563 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtg 5652662  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    |||||||||| ||||  || || |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||     
T  5652663 aggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccag 5652762  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtca 293  Q
     |||| || |||| | | |||||||| ||| ||||    ||||||  |||||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||||    
T  5652763 ttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtca 5652851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 5713400 - 5713601
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  5713400 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 5713499  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  5713500 atgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 5713599  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  5713600 ca 5713601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 5724310 - 5724511
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  5724310 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 5724409  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  5724410 atgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 5724509  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  5724510 ca 5724511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5768058 - 5767857
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  5768058 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 5767959  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  5767958 atgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 5767859  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  5767858 ca 5767857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5757167 - 5757007
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  5757167 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 5757068  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacat 162  Q
     |||||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  5757067 atgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacat 5757007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 32439327 - 32439478
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||    
T  32439327 aagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatat 32439426  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcc 153  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  32439427 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcc 32439478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 4626120 - 4626277
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  4626120 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 4626219  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacat 162  Q
    || ||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  4626220 agaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacat 4626277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 20066216 - 20066307
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgat 93  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||||||||    
T  20066216 aagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 20066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 2154786 - 2155085
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2154786 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 2154885  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154886 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 2154985  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2154986 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 2155085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10916798 - 10916499
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10916798 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 10916699  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10916698 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 10916599  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10916598 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 10916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11424706 - 11424412
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424706 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 11424607  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11424606 gtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 11424507  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11424506 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataat-ttttgactgttagtga 11424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16503310 - 16503011
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16503310 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 16503211  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16503210 gtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgc 16503111  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16503110 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16503011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16518346 - 16518047
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16518346 aagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 16518247  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16518246 gtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgc 16518147  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16518146 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 16518047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Original strand, 5128205 - 5128500
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128205 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 5128304  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5128305 gtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 5128404  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5128405 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtga 5128500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 26435470 - 26435768
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26435470 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 26435569  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26435570 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 26435669  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26435670 cgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26537800 - 26537502
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26537800 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 26537701  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26537700 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 26537601  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26537600 caagtgtctaggatgccttcgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 26537502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5147270 - 5146972
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5147270 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 5147171  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5147170 gcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 5147071  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5147070 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24592471 - 24592173
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24592471 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 24592372  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592371 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 24592272  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24592271 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24592173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 3445519 - 3445817
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3445519 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtat 3445618  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3445619 gtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgc 3445718  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  3445719 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 3445817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4145053 - 4144755
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4145053 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4144954  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4144953 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 4144854  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4144853 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4144755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31564320 - 31564022
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31564320 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31564221  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31564220 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 31564121  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31564120 caagtgtctaggatgcctccgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31564022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16736390 - 16736092
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16736390 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgt 16736291  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16736290 gtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 16736191  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16736190 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16736092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16751444 - 16751146
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16751444 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgt 16751345  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16751344 gtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 16751245  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16751244 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16751146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 17523745 - 17524043
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17523745 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgt 17523844  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17523845 gtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 17523944  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17523945 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17524043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17529470 - 17529172
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17529470 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgt 17529371  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17529370 gtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 17529271  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17529270 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 9618864 - 9619162
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9618864 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9618963  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9618964 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgc 9619063  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9619064 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 45387556 - 45387854
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45387556 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 45387655  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45387656 gtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgc 45387755  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45387756 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 45387854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26319799 - 26319501
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26319799 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 26319700  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  26319699 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 26319600  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26319599 caagtgactgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26319501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26669844 - 26669546
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26669844 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 26669745  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  26669744 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 26669645  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  26669644 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatctcctgactgtcagtgatgt 26669546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26275024 - 26274726
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26275024 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 26274925  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  26274924 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 26274825  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26274824 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26274726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 11441785 - 11442041
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11441785 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 11441884  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11441885 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 11441984  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacat 258  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||    
T  11441985 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacat 11442041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 31125136 - 31125431
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31125136 ctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 31125235  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31125236 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 31125335  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  31125336 gtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataatcttctgaccgtcagtgatgt 31125431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16449928 - 16449629
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  16449928 aagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 16449829  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  16449828 atgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 16449729  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||| |||| || |||| | |||||||||||||| ||||    ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  16449728 caattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16449629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 300
Target Start/End: Original strand, 26513130 - 26513292
Alignment:
Q  138 caactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  26513130 caactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctctgggttg 26513229  T
Q  238 ctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26513230 ccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26513292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16041535 - 16041835
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || |||    
T  16041535 aaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggta 16041634  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |  || ||||||     
T  16041635 tacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctgtttaatcacgatcata 16041734  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||| |||| || |||| | ||||||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  16041735 ccaattgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 16041834  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  16041835 c 16041835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39210953 - 39210661
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  39210953 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 39210854  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  39210853 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 39210754  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  39210753 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgtgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 39210661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 26484907 - 26485199
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  26484907 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 26485006  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  26485007 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 26485106  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  26485107 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 26485199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 2775572 - 2775843
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  2775572 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 2775671  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  2775672 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 2775771  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 273  Q
    ||| |||| || |||  |   |||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2775772 caattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaa 2775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26682927 - 26682638
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||| ||    
T  26682927 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 26682828  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  26682827 aggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 26682728  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
     |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  26682727 ttgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 26682638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Original strand, 4200760 - 4201051
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  4200760 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 4200859  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  4200860 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 4200959  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtca 293  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||  |||||||||| ||  ||||||| || |||| | |||||||||    
T  4200960 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaattatctgactgtca 4201051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2108935 - 2108664
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  2108935 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 2108836  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  |||| || |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||  | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  2108835 atgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 2108736  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 273  Q
    ||  |||| || |||| | | |||||||| ||| ||||    ||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  2108735 cagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 2108664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31088391 - 31088193
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  31088391 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 31088292  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcca 203  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||    
T  31088291 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcca 31088193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 45733676 - 45733874
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  45733676 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 45733775  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcca 203  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||    
T  45733776 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcca 45733874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 18541012 - 18541189
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||    
T  18541012 aagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatat 18541111  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 179  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  18541112 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 18541189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 5159732 - 5159909
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||| |||| || |||||||| || ||  |||    
T  5159732 aagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgagatat 5159831  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 179  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  5159832 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccgctccatatcaagttgtgccaagctt 5159909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 24863926 - 24864225
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24863926 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 24864025  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  24864026 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctgttcagccatgatcatgc 24864125  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24864126 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacgtccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 24864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 26918588 - 26918884
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918588 aaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 26918687  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26918688 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 26918787  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918788 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagataacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtga 26918884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22934867 - 22934568
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22934867 aagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 22934768  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22934767 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 22934668  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934667 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 22934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23857312 - 23857013
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23857312 aagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 23857213  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23857212 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 23857113  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857112 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 23857013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15424305 - 15424005
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15424305 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagta 15424206  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15424205 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 15424106  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15424105 ccgagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 15424006  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  15424005 c 15424005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 26989210 - 26989510
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26989210 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 26989309  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26989310 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 26989409  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatga-taattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26989410 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgattaattttttgactgttagtgatgt 26989509  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  26989510 c 26989510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24304605 - 24304306
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24304605 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 24304506  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24304505 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgc 24304406  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24304405 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 24304306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 16750063 - 16750361
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750063 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 16750162  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16750163 gtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 16750262  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16750263 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 16750361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13298938 - 13298639
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13298938 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 13298839  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13298838 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 13298739  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13298738 caagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtatactgttcaaaatgacatccagagcttgatgaatgacaattatttgactgtcagtgatgtc 13298639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 29549684 - 29549982
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29549684 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgt 29549783  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29549784 gtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 29549883  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29549884 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataattttctgactgtcagtgatgt 29549982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 3696290 - 3696588
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  3696290 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgt 3696389  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3696390 gtgatgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgc 3696489  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3696490 caagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagcgatgt 3696588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27290357 - 27290058
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||||||||  |||| |||||||| || ||||    
T  27290357 aagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtat 27290258  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27290257 atgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 27290158  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27290157 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 27290058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34463333 - 34463035
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34463333 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 34463234  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34463233 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 34463134  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34463133 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 29501627 - 29501922
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29501627 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 29501726  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29501727 aggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 29501826  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  29501827 gtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 16674348 - 16674646
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16674348 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 16674447  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16674448 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctattcagccatgatcatgc 16674547  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16674548 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27272568 - 27272268
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27272568 aaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagta 27272469  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27272468 tgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatg 27272369  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27272368 ccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctttattgttcaagatgacatccagagcttgatgaatgataagtttttgactgttagtgatgt 27272269  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  27272268 c 27272268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4545762 - 4545464
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4545762 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4545663  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4545662 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 4545563  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4545562 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4545464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 4773215 - 4773513
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4773215 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4773314  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4773315 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgc 4773414  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4773415 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4773513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 27007936 - 27008234
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27007936 aagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 27008035  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27008036 gtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 27008135  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27008136 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27008234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4724118 - 4723823
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4724118 ctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 4724019  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4724018 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 4723919  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4723918 gtgtctaggatgcctccgagatcctttgggctgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4723823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 27044600 - 27044895
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27044600 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27044699  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27044700 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 27044799  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27044800 gtgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27044895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 27485341 - 27485636
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27485341 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27485440  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27485441 aggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 27485540  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27485541 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgttagtgatgt 27485636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 4757973 - 4758271
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4757973 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4758072  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4758073 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 4758172  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  4758173 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttcggactgtcagtgatgt 4758271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27359979 - 27359680
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27359979 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 27359880  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |  || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27359879 gtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgc 27359780  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  27359779 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27359680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27450322 - 27450023
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27450322 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 27450223  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |  || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27450222 gtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgc 27450123  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  27450122 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 27450023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 29573222 - 29573520
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29573222 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 29573321  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  29573322 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 29573421  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29573422 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29573520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30558003 - 30557705
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30558003 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 30557904  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30557903 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 30557804  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30557803 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30557705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 28207666 - 28207961
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28207666 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 28207765  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28207766 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaa 28207865  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28207866 gtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28207961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 4525495 - 4525793
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4525495 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4525594  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4525595 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 4525694  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  4525695 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 4525793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16944014 - 16943716
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16944014 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 16943915  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16943914 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 16943815  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16943814 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26116397 - 26116099
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26116397 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 26116298  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26116297 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 26116198  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  26116197 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttcgatgaacgataatcttctgactgtcagtgatgt 26116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26777599 - 26777299
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26777599 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 26777500  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgc-----acattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcat 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||  || |  || |||||||||||||||||||     || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26777499 aggaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcat 26777400  T
Q  200 gccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatg 299  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  26777399 gccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatg 26777300  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  26777299 t 26777299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 17025486 - 17025658
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17025486 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 17025585  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17025586 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaa 17025658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 118 - 300
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019643
Alignment:
Q  118 acttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgc 27019560  T
Q  218 cttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||||||||| ||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27019561 cttcgtaatgctttgagttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgt 27019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 27000281 - 27000402
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000281 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 27000380  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttg 122  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  27000381 tgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14143272 - 14142980
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  14143272 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 14143173  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  14143172 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 14143073  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    |||| || |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  14143072 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 14142980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 26788153 - 26788445
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  26788153 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 26788252  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  26788253 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 26788352  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    |||| || |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  26788353 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 26788445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 27196526 - 27196818
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  27196526 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 27196625  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  27196626 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 27196725  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    |||| || |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  27196726 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 27196818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27252714 - 27252422
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  27252714 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 27252615  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  27252614 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 27252515  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    |||| || |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  27252514 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaattatttgactgtcag 27252422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22456921 - 22456638
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||  |||| || ||||    
T  22456921 aagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtat 22456822  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||         ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||   ||||||||||||    
T  22456821 atgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcc---------tctgcacatcaagctatgcaaagcttctttgtttgaccatgatcatgc 22456731  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| || | || |||| |  ||||||||||||| ||||    ||||||| | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  22456730 caattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagattgatgaacgacaattatttgactgtcag 22456638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13522060 - 13521768
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  13522060 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 13521961  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  |||||||  ||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   |||||| |||||    
T  13521960 atgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgc 13521861  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| || |    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  13521860 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 13521768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092273
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || || |||||||| ||||  || ||||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctct 156  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctct 17092273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 20160909 - 20161031
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||  |||||||| | |||||| |||||||||||     
T  20160909 aaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtg 20161008  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20161009 tgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22171922 - 22171800
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||  |||||||| | |||||| |||||||||||     
T  22171922 aaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtg 22171823  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22171822 tgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33374240 - 33374083
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||| ||    
T  33374240 ctcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 33374141  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacat 162  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  33374140 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacat 33374083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8892295 - 8892097
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||    
T  8892295 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatg 8892196  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcca 203  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||    
T  8892195 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcca 8892097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8903530 - 8903332
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||    
T  8903530 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatg 8903431  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcca 203  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||    
T  8903430 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcca 8903332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 28162869 - 28163026
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||    
T  28162869 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 28162968  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacat 162  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  28162969 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacat 28163026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 14665245 - 14665544
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14665245 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 14665344  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14665345 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 14665444  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665445 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 14665544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 17014227 - 17014526
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17014227 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 17014326  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17014327 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 17014426  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17014427 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 17014526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24592358 - 24592059
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24592358 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 24592259  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24592258 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 24592159  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592158 caagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 24592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36344559 - 36344261
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36344559 aagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 36344460  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36344459 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 36344360  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36344359 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 36344261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14763348 - 14763050
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14763348 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 14763249  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14763248 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 14763149  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14763148 caagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 14763050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18800657 - 18800359
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18800657 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18800558  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18800557 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 18800458  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18800457 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 18800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 6570080 - 6570378
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6570080 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 6570179  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6570180 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgattatgc 6570279  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6570280 caagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33673842 - 33673544
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33673842 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 33673743  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33673742 gtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 33673643  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33673642 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33673544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 30753984 - 30754279
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30753984 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 30754083  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30754084 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 30754183  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  30754184 gtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 39850865 - 39851163
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39850865 aagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 39850964  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39850965 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 39851064  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39851065 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 39851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 54833617 - 54833912
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54833617 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 54833716  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54833717 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 54833816  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  54833817 atgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcaatgatgt 54833912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 5006100 - 5006398
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5006100 aagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 5006199  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5006200 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgc 5006299  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5006300 caagtgtctgggatgcctccgtgatcctttggattgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31126562 - 31126264
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31126562 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 31126463  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  31126462 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 31126363  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31126362 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31126264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 14098768 - 14099066
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14098768 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 14098867  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  14098868 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 14098967  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  14098968 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataaccttctgactgtcagtgatgt 14099066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 21969928 - 21970226
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  21969928 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgt 21970027  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  21970028 gtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgc 21970127  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21970128 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21970226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40105682 - 40105384
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40105682 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 40105583  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  40105582 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgc 40105483  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40105482 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27163358 - 27163063
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27163358 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 27163259  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  27163258 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 27163159  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| || |||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  27163158 gtgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27163063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15284973 - 15284673
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||| ||||| || |||    
T  15284973 aaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggta 15284874  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   |||||||||||    
T  15284873 tgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatg 15284774  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||  ||||    |||| | |||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||| | || |||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  15284773 ccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatctagagtttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 15284674  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  15284673 c 15284673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 1900484 - 1900782
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  1900484 aagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 1900583  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| | ||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   |||||| |||||    
T  1900584 atgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgaccatgc 1900683  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||  |||| || |||  | | |||| ||||||| ||||    ||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  1900684 cagttgcccagaatgattccataatactttgggttgctacgttgttcaaaatgaaatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 1900782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 15228097 - 15228396
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |  ||||    
T  15228097 aagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtat 15228196  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||  |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||    
T  15228197 atgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgc 15228296  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||| || | || |||| | ||||||||||| || |||     ||||| | |||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||| ||||||    
T  15228297 caattgtccagaatgcttccgtaatcctttaggttgccacgttgttcgaaatgacatccagagcttgatgaacgacagttatttgactgtcagcgatgtc 15228396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24460646 - 24460448
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||    
T  24460646 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatg 24460547  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcca 203  Q
    |||||||||| |||   || ||  ||||||  ||||||||||||||||| || |||||  || | ||| |||| || |||||   ||||||||||||||    
T  24460546 aggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgcca 24460448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14235569 - 14235385
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| ||    |    
T  14235569 aagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacct 14235470  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgtt 186  Q
     ||| |||||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  14235469 atgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgactcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttccttgtt 14235385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 24112889 - 24113066
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||    
T  24112889 aagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatat 24112988  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 179  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  24112989 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 24113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34189004 - 34188827
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||    
T  34189004 aagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatat 34188905  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagctt 179  Q
    |||| || | ||| |  || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||    
T  34188904 gtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctt 34188827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15391382 - 15391090
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga-agta 100  Q
    |||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||  ||||| || |||||||| |||||||| |||     
T  15391382 aagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagagt- 15391284  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
      ||| |||| ||| || |||||  ||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   |||| ||||||    
T  15391283 catgaagaagttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatg 15391184  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    |||| |||| || |||||  | |||||||| ||| ||||    ||||||  |||| ||||| ||| ||||||| || |||| | ||||||||||    
T  15391183 ccaattgcccagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgatatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtcag 15391090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40112 - 39814
Alignment:
Q  3 agctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40112 agctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatg 40013  T
Q  103 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgcc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40012 tgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgcc 39913  T
Q  203 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39912 aagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgacgaatgataattttttgactgtcaatgatgtc 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 47029 - 46730
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47029 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 46930  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46929 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 46830  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46829 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaggcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 46730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 29975 - 30274
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29975 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtat 30074  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  30075 gtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcacgc 30174  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30175 caagtgcctaggatgccttcggaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgttagtgatgtc 30274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 6226 - 6524
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6226 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 6325  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6326 gtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 6425  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6426 caagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 6524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1961 - 1831
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  1961 aagctcattgatcaaggaaat-taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 1863  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaac 133  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1862 atgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 30664 - 30964
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30664 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 30763  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30764 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttagccatgatcatgc 30863  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataa-ttttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30864 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatttttttgactgtcagtgatgt 30963  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  30964 c 30964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 20600 - 20730
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  20600 aagctcattgatcaaggaaat-taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 20698  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaac 133  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20699 atgaagaagctcccagactcgatgttcgtaac 20730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 27504 - 27804
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27504 aagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 27603  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  27604 gtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctatttagccatgatcatgc 27703  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatga-taattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27704 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgattaattttttgactgttagtgatgt 27803  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  27804 c 27804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 51638429 - 51638728
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51638429 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 51638528  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51638529 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 51638628  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51638629 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgtc 51638728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41793352 - 41793054
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41793352 aagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 41793253  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41793252 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaaccatgatcatgc 41793153  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  41793152 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtaatgt 41793054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 10962881 - 10963179
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10962881 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgt 10962980  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  10962981 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 10963080  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10963081 caagtgtttaggatgcctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 10963179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 28585192 - 28585490
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28585192 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28585291  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28585292 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 28585391  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28585392 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28585490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16208075 - 16207776
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  16208075 aagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 16207976  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||  ||||   ||||||||||||    
T  16207975 atgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgc 16207876  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||  |||| || |||| | |||||||||||||| |||| |   |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  16207875 cagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctatgtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 16207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 28152073 - 28152365
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||  |||    
T  28152073 aagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatat 28152172  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||||||||||||  ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  28152173 atgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 28152272  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcag 294  Q
    ||| |||| || |||  |  ||||||||||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||||||    
T  28152273 caattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactgtcag 28152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20340379 - 20340080
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  20340379 aagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 20340280  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  20340279 atgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 20340180  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||  || | || |||  |  ||||||||||||| | ||    ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  20340179 cagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 20340080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 20461291 - 20461591
Alignment:
Q  1 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagta 100  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || | |||||| ||||| || |||    
T  20461291 aaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggta 20461390  T
Q  101 tgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatg 200  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||  ||||   |||||||||||    
T  20461391 tatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatg 20461490  T
Q  201 ccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||  || | || |||| |||||||||||||||| ||||    ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  20461491 ccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgt 20461590  T
Q  301 c 301  Q
    |    
T  20461591 c 20461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9110 - 8812
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9110 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9011  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9010 gtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 8911  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  8910 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 20227 - 20526
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20227 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 20326  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20327 gtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 20426  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataat-tttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  | |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20427 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatctttctgactgtcagtgatgt 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14974 - 14675
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14974 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgt 14875  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  14874 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 14775  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14774 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataactttctgactgtcagtgatgtc 14675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 9778 - 10076
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9778 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9877  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  9878 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctttctgttcagccatgatcatgc 9977  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9978 caagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26245 - 25947
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26245 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgt 26146  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26145 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgc 26046  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26045 caagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaatgataattttctgactgtcagtgatgt 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7283 - 6985
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7283 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 7184  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7183 gtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgc 7084  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    |||||| || ||||| || ||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7083 caagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 300
Target Start/End: Original strand, 8164 - 8459
Alignment:
Q  5 ctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtg 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8164 ctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtg 8263  T
Q  105 aggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgccaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8264 aggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgacaa 8363  T
Q  205 gtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8364 gtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46848 - 46556
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaa-gctgactttt-gagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatga-tcgaag 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  46848 aagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgaatcaaag 46749  T
Q  99 tatgtgagg-aagctccta-gacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatg-a 195  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  46748 tacgtgagggaagctcctaagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgaa 46649  T
Q  196 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcc-tttgggctgctttactgttcaaga-tgacatcc-aaagcttgatgaatgataatttttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46648 tcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatccttttgggttgctttactgttcaagattgacatccaaaagcttgatgaatgataatttttt 46556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  173 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 74  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  73 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2702 - 2403
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||    
T  2702 aagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 2603  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| || |||||   ||||||||||||    
T  2602 atgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgc 2503  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 301  Q
    ||  || | || |||  |  ||||||||||||| | ||    ||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  2502 cagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaattatttgactgtcagcgatgtc 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 662 - 364
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||    |    
T  662 aagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagactt 563  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     ||| |||| ||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||  ||| ||||   ||||||||||||    
T  562 atgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctccttgtttgaccatgatcatgc 463  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgt 300  Q
    ||| |||| |  |||||  | |||||||| ||| || |    ||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||| |||||    
T  462 caattgcccataatgccgccataatccttggggttgttacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaatgacaattatcttactgtcagcgatgt 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 21773 - 22044
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcctccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 101  Q
    ||||||||||| || |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||    |    
T  21773 aagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagactt 21872  T
Q  102 gtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacggcgcaactcctctggtgcctctgcacattaagctgtgcaaagcttccctgttcagccatgatcatgc 201  Q
     |||  ||| |||  | |||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  21873 atgaaaaagttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgc 21972  T
Q  202 caagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggctgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 273  Q
    ||| |||| || |||||  | |||||||| ||| ||||    ||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  21973 caattgcccagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 22044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 9
Alignment:
Q  2 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctc 65  Q
    |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  72 aagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctc 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University