View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7633_low_2 (Length: 546)

Name: NF7633_low_2
Description: NF7633
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7633_low_2
NF7633_low_2
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (10-520)||(3183830-3184346)
chr4 (10-415)||(3185775-3186177)
chr4 (10-376)||(50193500-50193868)
chr4 (10-258)||(50023226-50023476)
chr4 (10-258)||(50030344-50030594)
chr4 (10-252)||(6181473-6181715)
chr4 (10-252)||(49090569-49090810)
chr4 (10-249)||(44679758-44679997)
chr4 (10-252)||(31421846-31422087)
chr4 (10-230)||(9892951-9893168)
chr4 (10-261)||(30704165-30704413)
chr4 (10-244)||(49165191-49165423)
chr4 (75-252)||(41800694-41800871)
chr4 (25-200)||(55279941-55280119)
chr4 (25-122)||(41933321-41933418)
chr4 (10-73)||(41798678-41798741)
chr4 (10-96)||(11050206-11050292)
chr4 (161-231)||(11051244-11051313)
chr4 (334-415)||(34528124-34528205)
chr4 (144-221)||(47383689-47383766)
chr4 (283-415)||(51494832-51494962)
chr4 (334-400)||(44680106-44680172)
chr4 (334-415)||(16473712-16473793)
chr4 (328-404)||(28235587-28235663)
chr4 (335-410)||(28234381-28234456)
chr4 (10-44)||(3185567-3185601)
chr4 (328-410)||(44795024-44795106)
chr4 (328-374)||(56565758-56565804)
chr4 (328-404)||(34530795-34530871)
chr4 (334-404)||(50020088-50020158)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (10-415)||(97631-98036)
chr1 (10-342)||(21141084-21141417)
chr1 (10-344)||(50343652-50343984)
chr1 (18-261)||(2365375-2365618)
chr1 (10-342)||(19156074-19156405)
chr1 (10-252)||(26875806-26876047)
chr1 (10-252)||(3732064-3732303)
chr1 (10-252)||(8473934-8474175)
chr1 (10-342)||(38127166-38127504)
chr1 (52-244)||(470321-470513)
chr1 (10-186)||(13639706-13639882)
chr1 (10-74)||(47656196-47656260)
chr1 (334-415)||(22524086-22524167)
chr1 (328-404)||(31783741-31783817)
chr1 (334-404)||(18609927-18609997)
chr1 (328-404)||(21140996-21141072)
chr1 (334-376)||(14985337-14985379)
chr1 (344-415)||(45977740-45977811)
chr1 (334-415)||(21699844-21699925)
chr1 (67-124)||(25147569-25147625)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (14-374)||(34371553-34371918)
chr8 (10-322)||(20857355-20857675)
chr8 (10-252)||(1052672-1052914)
chr8 (10-252)||(23022004-23022246)
chr8 (10-244)||(26659602-26659836)
chr8 (10-244)||(25210-25444)
chr8 (10-244)||(22510696-22510930)
chr8 (30-249)||(2416294-2416514)
chr8 (10-230)||(5677241-5677460)
chr8 (10-122)||(35551943-35552055)
chr8 (10-122)||(45128027-45128139)
chr8 (144-231)||(24249652-24249739)
chr8 (328-415)||(45409831-45409918)
chr8 (328-415)||(22550891-22550978)
chr8 (335-415)||(45410952-45411032)
chr8 (328-415)||(10749700-10749787)
chr8 (67-122)||(24249761-24249816)
chr8 (328-404)||(44885686-44885762)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (11-342)||(5541224-5541557)
chr7 (10-342)||(45257046-45257378)
chr7 (10-244)||(9371069-9371303)
chr7 (36-342)||(17649196-17649505)
chr7 (10-252)||(35610099-35610340)
chr7 (36-258)||(16674913-16675137)
chr7 (10-252)||(41880636-41880880)
chr7 (10-252)||(17465404-17465647)
chr7 (10-252)||(17587567-17587810)
chr7 (10-261)||(41734302-41734553)
chr7 (10-230)||(48403525-48403747)
chr7 (10-129)||(46740230-46740350)
chr7 (10-122)||(556329-556441)
chr7 (144-244)||(10175599-10175699)
chr7 (334-410)||(10516984-10517060)
chr7 (334-404)||(5541575-5541645)
chr7 (334-410)||(45256952-45257028)
chr7 (192-243)||(46740386-46740437)
chr7 (51-83)||(16675141-16675173)
chr7 (51-83)||(17649509-17649541)
chr7 (353-404)||(556696-556747)
chr7 (328-415)||(17834447-17834534)
chr7 (360-404)||(37345161-37345205)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (10-342)||(20350703-20351034)
chr3 (10-342)||(41612427-41612757)
chr3 (10-262)||(17567747-17567999)
chr3 (10-400)||(16611075-16611467)
chr3 (10-400)||(22047786-22048178)
chr3 (10-244)||(42903873-42904107)
chr3 (10-252)||(54386272-54386513)
chr3 (10-342)||(2274597-2274930)
chr3 (10-252)||(29009008-29009249)
chr3 (10-252)||(46701708-46701949)
chr3 (10-252)||(34045524-34045766)
chr3 (10-252)||(49144145-49144387)
chr3 (10-244)||(46389115-46389351)
chr3 (25-250)||(2967623-2967848)
chr3 (10-244)||(52391079-52391312)
chr3 (10-214)||(50480467-50480670)
chr3 (56-241)||(36127566-36127752)
chr3 (10-70)||(36127766-36127826)
chr3 (48-122)||(4172084-4172158)
chr3 (48-107)||(4178097-4178156)
chr3 (328-415)||(8475786-8475873)
chr3 (328-415)||(42166436-42166523)
chr3 (334-404)||(41612339-41612409)
chr3 (144-209)||(4171993-4172058)
chr3 (334-404)||(2274948-2275018)
chr3 (334-404)||(17561730-17561800)
chr3 (334-415)||(52387744-52387825)
chr3 (328-404)||(14043924-14044000)
chr3 (334-404)||(16861100-16861170)
chr3 (334-415)||(4331852-4331933)
chr3 (144-206)||(4178002-4178064)
chr3 (334-404)||(44523394-44523464)
chr3 (67-124)||(31045333-31045390)
chr3 (328-404)||(4015155-4015231)
chr3 (335-415)||(42165123-42165203)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (10-342)||(29401287-29401619)
chr2 (10-270)||(36656033-36656293)
chr2 (10-249)||(45284323-45284562)
chr2 (10-249)||(45291686-45291925)
chr2 (10-252)||(20938046-20938286)
chr2 (10-252)||(3940412-3940653)
chr2 (10-252)||(5352112-5352355)
chr2 (10-252)||(15831275-15831518)
chr2 (10-252)||(30496630-30496873)
chr2 (10-252)||(43539421-43539661)
chr2 (10-244)||(43978677-43978910)
chr2 (10-249)||(10828708-10828952)
chr2 (77-249)||(45290784-45290956)
chr2 (10-122)||(25515492-25515604)
chr2 (334-415)||(28419367-28419448)
chr2 (69-121)||(31367308-31367360)
chr2 (328-374)||(41273274-41273320)
chr2 (334-404)||(29401637-29401707)
chr2 (334-404)||(36652877-36652947)
chr2 (349-415)||(40157473-40157539)
chr2 (328-369)||(39947605-39947646)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (144-342)||(3501210-3501407)
chr6 (10-252)||(11688263-11688505)
chr6 (10-252)||(30829335-30829576)
chr6 (10-240)||(6201308-6201538)
chr6 (10-250)||(27616865-27617105)
chr6 (19-342)||(26423039-26423374)
chr6 (10-129)||(3501440-3501559)
chr6 (10-186)||(22301395-22301570)
chr6 (10-122)||(24722206-24722318)
chr6 (328-410)||(26351122-26351204)
chr6 (334-415)||(26422940-26423021)
chr6 (334-404)||(3501122-3501192)
chr6 (335-404)||(24719912-24719981)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (10-342)||(30705196-30705526)
chr5 (10-252)||(27673336-27673579)
chr5 (10-250)||(19040800-19041040)
chr5 (10-342)||(5197044-5197363)
chr5 (334-415)||(42912910-42912991)
chr5 (334-373)||(5200388-5200427)
chr5 (67-122)||(20422217-20422272)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (10-195)||(4337-4523)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (10-122)||(18616-18728)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (328-413)||(15648-15733)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (203-252)||(11329-11378)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (328-412)||(12345-12429)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (328-413)||(10614-10699)
[»] scaffold0283 (1 HSPs)
scaffold0283 (328-404)||(1639-1715)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 3184346 - 3183830
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3184346 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 3184247  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnn--ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||                |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3184246 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaaaaaaactacccaaactaacattatgattaaaaatgagtaaaaatacttacttgtgattaaatggagatg 3184147  T
Q  208 atgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaactaagtttttgcttc 307  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  3184146 atgcacttgaatttgctaaaaaa-ggaaattggagaacttggttgattttggaaaacttttgagaaattgaataaacttagaaaactgagtttctgcttc 3184048  T
Q  308 tgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagc 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3184047 tgtgtatggtcagttcg-catcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgtcgaaggacatttagataaaatactcgtgtggc 3183949  T
Q  408 acaacct-------tgattaaacaaaaattctatgtaaaccacaaagcataaccaaaacgacaaagaagggaccaaaacgacacttcaagtctgaaactt 500  Q
    ||| |||       ||  ||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3183948 acagccttatcaaatgtgtaagcaacaatt-tatgtaaaccacgaagcataagcaaaacgacaaagaagggaccaaaacgacacttcaagtctgaaactt 3183850  T
Q  501 cacgcatagtgcaatttcct 520  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3183849 cacgcatagtgcaatttcct 3183830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 415
Target Start/End: Original strand, 3185775 - 3186177
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3185775 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagtcactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccataaac 3185874  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3185875 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaaa--ctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtaaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 3185972  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaactaagtttttgcttctg 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3185973 gcacttgattttgctcaaaaaaggaaattggagaacttggttgattttggaaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaactgagtttctgcttctg 3186072  T
Q  310 tgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcac 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3186073 tgtatggtcagttcg-catcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttctgcagttaactgtcgaaggacatttaggtaaaatactcgtgtggcac 3186171  T
Q  410 aacctt 415  Q
    | ||||    
T  3186172 agcctt 3186177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50193868 - 50193500
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50193868 attatactctaacattattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaattacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 50193769  T
Q  110 acatgaaaactaccat-ttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
     ||||||||||||||| ||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50193768 ccatgaaaactaccatttttttttataaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatta 50193669  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa--taaactcagaaaactaagtttttgctt 306  Q
    || |||||||||||||||||||| || || |||||| |||  || |||||||||  ||||||  | |||||   | |||||||||||| |||||||||||    
T  50193668 tgtacttgattttgctcaaaaattgagatgggagaagttgtttggttttggaaagtttttgaacacttgaagcaatactcagaaaactgagtttttgctt 50193569  T
Q  307 ctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtc 376  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |  ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  50193568 ctgtttatgttcagttcg-catcggcagttaactgccgtcagttttctaaaacttcgacaattaattgtc 50193500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 50023226 - 50023476
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50023226 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 50023325  T
Q  110 acatgaaaactacca--tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 207  Q
    |||| ||||||||||  |||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50023326 acataaaaactaccattttttttaaaaaaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatt 50023425  T
Q  208 atgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  50023426 atgcacttgatttcgctcaaaaatcgaaattggagaagttggttggttttg 50023476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 50030344 - 50030594
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50030344 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcagccctaacc 50030443  T
Q  110 acatgaaaactacca--tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 207  Q
    |||| ||||||||||  |||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50030444 acataaaaactaccattttttttaaaaaaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatt 50030543  T
Q  208 atgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  50030544 atgcacttgatttcgctcaaaaatcgaaattggagaagttggttggttttg 50030594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 6181473 - 6181715
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  6181473 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 6181572  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181573 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 6181672  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  6181673 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 6181715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 49090810 - 49090569
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  49090810 attataccataacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 49090711  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49090710 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaac-ctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 49090612  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  49090611 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 49090569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 44679758 - 44679997
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44679758 attatactctaacatcattcaatcatcaatcaaagcaactacattcaattatgaactacatgcaatcataaaaaaatcaattcctacatcaaccctaacc 44679857  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||    ||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44679858 acatgaaaactatatatttttttttaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 44679957  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttgg 249  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  44679958 gcacttgattttgctgaaaattcgaaattggagaagttgg 44679997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31422087 - 31421846
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  31422087 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactgcattcaattataaactacatgcactcataaaaaagtcaattcctacatcaaccctaacc 31421988  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31421987 acatgaaaactaccattttt-taaaaaaaaaaaactacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatatttaattgtgattaaatggagatgat 31421889  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  31421888 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaaattggatg 31421846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 9892951 - 9893168
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9892951 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 9893050  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9893051 acatgaaaactaccattttt---ttaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 9893147  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaa 230  Q
      ||||||||||||| |||||    
T  9893148 aaacttgattttgctgaaaaa 9893168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30704413 - 30704165
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  30704413 attatactctaacatcattcaaacatcaattaaagcaacaacgttcaactataaaatacatgcaatcatcgaattttcaattccaacatcaaccctaacc 30704314  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    || || |||||||| |||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30704313 acgtgcaaactaccttttttttttaaaaaac---ctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 30704217  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaa 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30704216 gcacttgattttgctcaaaaatcgaaattggaggagttggatggttttggaa 30704165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 49165423 - 49165191
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  49165423 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 49165324  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||              |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49165323 acatgaaaactaccaatttt-ttttaaaaaaaacctacccaaactaacattatga-taaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 49165226  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  49165225 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaa 49165191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 252
Target Start/End: Original strand, 41800694 - 41800871
Alignment:
Q  75 tcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatga 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41800694 tcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaaccacatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatga 41800793  T
Q  175 gtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||    
T  41800794 gtcaacatacttagttgtgtttaaatgaagatgatgcacttgattttgctgaaaaaacgaatttggagaagttggatg 41800871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 200
Target Start/End: Original strand, 55279941 - 55280119
Alignment:
Q  25 cattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactacca 124  Q
    ||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  55279941 cattcaaacatcaattacaacaactacattcatttataaactacatacaatcatcaaaatgtcaattcctacatcaaccttaaccacatgcgaactacca 55280040  T
Q  125 ---tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaat 200  Q
       |||||              |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  55280041 aattttttataaaaaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatcagtcaaactacttacttgtgattaaat 55280119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Original strand, 41933321 - 41933418
Alignment:
Q  25 cattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactac 122  Q
    ||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  41933321 cattcaaacatcaattacaacaactacattcatttataaactacatgcaatcatcaaaatatcaattcctacatcaaccctatccacatgcaaactac 41933418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 73
Target Start/End: Original strand, 41798678 - 41798741
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgca 73  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41798678 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgca 41798741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 96
Target Start/End: Original strand, 11050206 - 11050292
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctac 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||    
T  11050206 attatactctaacatcattcaaacataaattaaaacaactacattaaattataaattacatgcaatcatcaaaattttaaatcctac 11050292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 231
Target Start/End: Original strand, 11051244 - 11051313
Alignment:
Q  161 atgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaat 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  11051244 atgattaaaaatgagtcaaggtacttacttgtgattaaatggagatgattaactt-attttgctccaaaat 11051313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34528205 - 34528124
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34528205 gttaactgccgccggtttactaaaacttcgacagttaactgtcgaagggcattttcgtaaagtactcgtgtagcacagcctt 34528124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 221
Target Start/End: Original strand, 47383689 - 47383766
Alignment:
Q  144 ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgatttt 221  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  47383689 ctacacaaactaacattataattaaaaataagtaaaactacttacttgtgataaaatggagatgattcacttgatttt 47383766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 415
Target Start/End: Original strand, 51494832 - 51494962
Alignment:
Q  283 actcagaaaactaagtttttgcttctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatga 382  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| | || |     
T  51494832 actcagaaaactgagtttctgcttctgt-tatgttcagttcg-catcggcagttagctgccgccagtttactaaaacttctgcagttaactgccgaaggg 51494929  T
Q  383 catttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  51494930 catttaggtaaattattcgtgtgacacaacctt 51494962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 400
Target Start/End: Original strand, 44680106 - 44680172
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactc 400  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  44680106 gttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgtcgaaggacatttaggtaaattactc 44680172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Original strand, 16473712 - 16473793
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16473712 gttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaagggcattttcgtaaagtactcgtgtggcacaacctt 16473793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 28235587 - 28235663
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||  |||||||||||||||    
T  28235587 tcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaagggcattttcgtaaaatactcgtgt 28235663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28234456 - 28234381
Alignment:
Q  335 ttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcaca 410  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  28234456 ttaactgccgccggtttactaaaacttcgacaattaactgtcgaagggcatttttgtaaagtactcgtgtggcaca 28234381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 44
Target Start/End: Original strand, 3185567 - 3185601
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaag 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3185567 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaag 3185601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44795106 - 44795024
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcaca 410  Q
    ||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  44795106 tcggcagtttactgccgccagtttactaaaacttcggcagttaactgccgaatggcattttcgtaaagtactcgtgtagcaca 44795024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 56565804 - 56565758
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactg 374  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56565804 tcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcgacagttaactg 56565758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 34530795 - 34530871
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgcc-gatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||    
T  34530795 tcggcagttaactgcagccagattt-ctaaaacttcgacagttaactgccgaaggacatttaggtaaattattcgtgt 34530871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 50020158 - 50020088
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||| |||||||||    
T  50020158 gttaactgcaaccgattttctaaaacttcggcagttaactaccaaagggcatttagataaattactcgtgt 50020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 415
Target Start/End: Original strand, 97631 - 98036
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97631 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 97730  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnn-ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||               |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97731 acatgaaaactaccatttttaaaataaaaaaaaaactacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 97830  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaactaagtttttgcttct 308  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  97831 tgcacttggttttgctcaaaaaaggaaattggagaacttggttgattttgaaaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaaccgagtttctgcttct 97930  T
Q  309 gtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagca 408  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||| |||    
T  97931 gtgtatgtttagttcg-catcggcagttaactgccgccgatttactaaaacttcggcagttaactgttgaagagcatttaggtaaaatactcgtgtggca 98029  T
Q  409 caacctt 415  Q
    || ||||    
T  98030 cagcctt 98036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21141417 - 21141084
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21141417 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 21141318  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnc-tactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||              | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21141317 acatgaaaactaccattttttaaaaaacaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 21141218  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataa-actcagaaaactaagtttttgcttc 307  Q
    ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  21141217 tgatcttgattttgctcaaaaaacgaaattggagaagttggttggttttggaaagcttttgagaaattgaacaatactcagaaaactgagtttctgcttc 21141118  T
Q  308 tgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21141117 tgtttatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 21141084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Original strand, 50343652 - 50343984
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50343652 attatactctaacatcattcaatcatcaatcaaagtcagtacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 50343751  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50343752 acatgaaaactaccatttttttttttaaaaac--ctacacaaactaacattatgattaaaattgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 50343849  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataa-actcagaaaactaagtttttgcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  || |||||||||  ||||||  | ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||    
T  50343850 gcacttgattttgctcaaaaatcgaaatgggagaagttgtttggttttggaaagtttttgaacacttgaacaatactcagaaaactgagtttctgcttct 50343949  T
Q  309 gtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgctg 344  Q
    || |||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  50343950 gtttatgttaagttcg-catcggcagttaactgctg 50343984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2365618 - 2365375
Alignment:
Q  18 ctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2365618 ctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaaccacatgaaa 2365519  T
Q  118 actaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttga 217  Q
    |||||| |||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2365518 actacctttttttttttaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaacatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttga 2365419  T
Q  218 ttttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaa 261  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2365418 ttttgctgaaaaatcgaaattggagaagttgaatgattttggaa 2365375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19156405 - 19156074
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19156405 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 19156306  T
Q  110 acatgaaaactaccat-ttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    |||||||||||||||| ||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19156305 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaacatacttacttgtgattaaatggagatga 19156206  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataa-actcagaaaactaagtttttgcttc 307  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||  |  || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  19156205 ttcacttgattttgctgaaaaatcgaaattggagaagttggatg-gtttggaaattttttgaacaatgaagcaatactcagaaaactgagtttctgcttc 19156107  T
Q  308 tgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  19156106 tgt-tatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 19156074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26876047 - 26875806
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  26876047 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaagtcaattcctacatcaaccctaacc 26875948  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26875947 acatgaaaactaccattttt-ttttttaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 26875849  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  26875848 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaatttggatg 26875806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 3732064 - 3732303
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  3732064 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 3732163  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3732164 acatgaaaactaccatttttttaaaaaaaaa---ctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 3732260  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3732261 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 3732303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8474175 - 8473934
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  8474175 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 8474076  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8474075 acatgaaaactaccatttttttaaaaaaaaaac-ctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 8473977  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  8473976 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 8473934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Original strand, 38127166 - 38127504
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  38127166 attatactctaacatcattcaaacatcaattaaagcaacaacattcaactataaaatacatgcaatcatcaaattttcaattccaacatcaaccctaacc 38127265  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnn-------ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatgg 202  Q
    || || ||||||||||||||                     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38127266 acgtgcaaactaccattttttttttttttaaaaaaaaaaacctaaacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatgg 38127365  T
Q  203 agatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa-taaactcagaaaactaagtttt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||   ||||||  |||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  38127366 agatgatgcacttgattttgctcaaaaatcgaaattggaggagttggatggttttggaagttttttgaacaattgaaggaaact-agaaaactgagtttt 38127464  T
Q  302 tgcttctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    || |||||| |||| ||||  || ||||||| |||||||||    
T  38127465 tgtttctgtttatgttcagcacg-catcggcagttaactgc 38127504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 470513 - 470321
Alignment:
Q  52 attcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||              |||| |||    
T  470513 attcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaaccacatcaaaactaccatttttattttaaaaaaaacctacccaa 470414  T
Q  152 actaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  470413 actaacattatgattacaaatgaatcaagatacttacttgtaattaaatgaagatgatgcacttgattttgctgaaaattcgaaattggagaa 470321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 13639706 - 13639882
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13639706 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 13639805  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatactt 186  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13639806 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgataaaaaatgagtcaagatactt 13639882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 47656260 - 47656196
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaa 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47656260 attatactctaacatcattcaaacatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaa 47656196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22524167 - 22524086
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22524167 gttaactgccgccggtttactaaaacttcggcacttaactgtcgaggggcatttaggtaaattactcgtgtggcacaacctt 22524086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 31783741 - 31783817
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||    
T  31783741 tcggcagttaactaccgccaatttactaaaacttcgacagttaactgtcgaaggacattttcgttaaatactcgtgt 31783817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Original strand, 18609927 - 18609997
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||| ||||||    
T  18609927 gttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccaaagggcaattaggtaaaatattcgtgt 18609997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21141072 - 21140996
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    |||| |||||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  21141072 tcggtcgttaactgccgtcggttttctaaaacttcggcagttaattgtcgaaggacatttaggtaaattactcgtgt 21140996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14985379 - 14985337
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtc 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14985379 gttaactgccgccgatttactaaaacttcggcagttaactgtc 14985337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 415
Target Start/End: Original strand, 45977740 - 45977811
Alignment:
Q  344 gccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  45977740 gccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaatgacattttcgtaaagtactcgtatggcacagcctt 45977811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21699925 - 21699844
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |  || |  |||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  21699925 gttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactattgaagggaatttaggtaaaatatttgtgtggcacagcctt 21699844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25147625 - 25147569
Alignment:
Q  67 acatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactacca 124  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  25147625 acatgcaatcatcaaag-ttcaattcctacatcaacactaaccagatgcaaactacca 25147569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 374
Target Start/End: Original strand, 34371553 - 34371918
Alignment:
Q  14 tactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  34371553 tactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctaaatcaactctaaccacat 34371652  T
Q  114 gaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnn---ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatg 210  Q
    ||||||||||||||||                 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34371653 gaaaactaccatttttttttttataaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatg 34371752  T
Q  211 cacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaactaagtttttgcttctgt 310  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  34371753 cacttgattttgcttaaaaaacgaaattggagaacttgcttgattttggaaaacttgtgaaaaattgaacaaattcagaaaactgagtttctgcttctgt 34371852  T
Q  311 gtatgg---tcagttcgtcatcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactg 374  Q
     |||||   |||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34371853 ttatggagttcagttcg-catcggcagtttactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactg 34371918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20857675 - 20857355
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20857675 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccttaacc 20857576  T
Q  110 acatgaaaactaccattttt------nnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||                    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20857575 acatgaaaactaccatttttttataaaaaaaaaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaataga 20857476  T
Q  204 gatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa--taaactcagaaaactaagtttt 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||  |||||||   | |||||||||||| |||||     
T  20857475 gatgatgcacttgtttttgctcaaaaatcgaaattggagaatttggttggttttggaaagcttttgaacaattgaagcaatactcagaaaactgagtttc 20857376  T
Q  302 tgcttctgtgtatggtcagtt 322  Q
    ||||||| | |||| ||||||    
T  20857375 tgcttctatttatgttcagtt 20857355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1052914 - 1052672
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  1052914 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcttacattaaccctaacc 1052815  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052814 acatgaaaactaccatttttttttttaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 1052715  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  1052714 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 1052672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 23022004 - 23022246
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23022004 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaagtcaattcctacatcaaccctaacc 23022103  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23022104 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgaatcaaaatacttacttgtgattaaatggagatgat 23022203  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23022204 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 23022246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26659836 - 26659602
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  26659836 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 26659737  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26659736 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 26659637  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  26659636 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaa 26659602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 25210 - 25444
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  25210 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 25309  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25310 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 25409  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  25410 gcacttgattttgttgaaaaatcgaatttggagaa 25444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22510930 - 22510696
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  22510930 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 22510831  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22510830 acatgaaaactaccatttttttttaaaaaaaaacctacccaaactaacgttatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 22510731  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  22510730 gcatttgattttgttgaaaaatcgaatttggagaa 22510696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2416514 - 2416294
Alignment:
Q  30 aatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactaccat-ttt 128  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  2416514 aatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaaccacatgaaaactaccattttt 2416415  T
Q  129 tnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaa 228  Q
    |              |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2416414 tttttttaaaaaaacctacccaaactaacattatgataaacaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgttgaaa 2416315  T
Q  229 aatggaaattggagaacttgg 249  Q
    ||| ||| |||||||| ||||    
T  2416314 aatcgaatttggagaagttgg 2416294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5677460 - 5677241
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5677460 attatactctaacaccattcaaacatcaattatagcaactattgtcatttacaaactacatgcaatcatcaaaatttcaattcctacatcaaccctaacc 5677361  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||| | ||||||| ||||              |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5677360 acatgcagactaccaatttt-atttaaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgaatcaaggtacttacttgtaattaaatggagatgat 5677262  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaa 230  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  5677261 tcacttgattttgctaaaaaa 5677241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35552055 - 35551943
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35552055 attatactctaacatcattcaaacatcaattaaaacaactacattcaattataaactacatgcaataataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 35551956  T
Q  110 acatgaaaactac 122  Q
    |||||||||||||    
T  35551955 acatgaaaactac 35551943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 45128139 - 45128027
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  45128139 attatactctaacatcattcaaacatcaattaaagcaacgacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaatttcaattcctacatcaaccataacc 45128040  T
Q  110 acatgaaaactac 122  Q
    ||||| |||||||    
T  45128039 acatgcaaactac 45128027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24249739 - 24249652
Alignment:
Q  144 ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaat 231  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||    
T  24249739 ctacacaaactaacatcatgattaaaaatgagtcaaggtacttacttgtgattaaatggatatgattaacttgattttgctccaaaat 24249652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 45409918 - 45409831
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  45409918 tcggcagttaactgccgccgatttactaaaacttcggcagttaactgccgaagggcattttcgtaaagtactcgtgtggcacagcctt 45409831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Original strand, 22550891 - 22550978
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  22550891 tcggcagttaactgcagccggatttctaaaacttcggcagttaactgccgaagggcatttaggtaaattactcgtgtggcacagcctt 22550978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 415
Target Start/End: Original strand, 45410952 - 45411032
Alignment:
Q  335 ttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||   || |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  45410952 ttaactgccgccggtttactaaaacttccacagttaactgctgaaggacattttcgtaaagtactcatgtggcacaacctt 45411032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Original strand, 10749700 - 10749787
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||  ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  10749700 tcggcagttaactgccgctggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaagggcattttcgtaaagttctcgtgtggcacaacctt 10749787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24249816 - 24249761
Alignment:
Q  67 acatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactac 122  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  24249816 acatgcaatcatcaaattgtcaattcctatatcaaccctaaccacatgcaaactac 24249761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44885762 - 44885686
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| | || || |||||  |||| |||||||||    
T  44885762 tcggcagttaactgcaaccgattttctaaaacttcaacagttaactgccgaaagatatttaaataaattactcgtgt 44885686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 5541224 - 5541557
Alignment:
Q  11 ttatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5541224 ttatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgaaatcatcaaaa-ttcaattcctacatcaaccctaacca 5541322  T
Q  111 catgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnn---ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 207  Q
    |||||||||||||||||||                 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5541323 catgaaaactaccatttttaaaattaaaaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 5541422  T
Q  208 atgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa-taaactcagaaaactaagtttttgctt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||    
T  5541423 atgcacttgattttgctcaaaaaacgaaattggagaacttggttggttttggaaagcttttgagaaattgaacgatactcagaaaactgagtttctgctt 5541522  T
Q  307 ctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  5541523 ctgtttatgttcagtttg-catcggcagttaactgc 5541557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45257378 - 45257046
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45257378 attatactctaacatcattcaattatcaattaaagcaactacattcagttataaactacaagcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 45257279  T
Q  110 acatgaaaactaccat--ttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 207  Q
    ||||||||||||||||  ||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45257278 acatgaaaactaccatttttttttttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 45257179  T
Q  208 atgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataa-actcagaaaactaagtttttgctt 306  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||  |||  |  || |||||||||||| ||||| |||||    
T  45257178 atgcacttgattttgctgaaaattcgaaattggagaagttggatg-gtttggaaaaattttgaacaatgaagcaatactcagaaaactgagtttctgctt 45257080  T
Q  307 ctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  45257079 ctgt-tatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 45257046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 9371069 - 9371303
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  9371069 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 9371168  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9371169 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 9371268  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  9371269 gcacttgattttgttgaaaaatcgaatttggagaa 9371303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17649505 - 17649196
Alignment:
Q  36 caattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactaccatttttnnnnnn 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          
T  17649505 caattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaagtccaattcctacatcaaccctaaccacatgaaaactaccattttttttata 17649406  T
Q  136 nnnnnnnn--ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatgg 233  Q
              |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17649405 aaaaaaaaatctacacaaactaacattatgattaaaaataagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatcg 17649306  T
Q  234 aaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa--taaactcagaaaactaagtttttgcttctgtgtatggtcagttcgtcatcgg 331  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||   ||||||  ||||| |   | |||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||| ||    
T  17649305 aaattggagaagttggttggttttggaatttttttgaacaattgcagcaatactcagaaaactgagtttctgcttttgtttatgttcagttcg-cattgg 17649207  T
Q  332 ccgttaactgc 342  Q
    | |||||||||    
T  17649206 cagttaactgc 17649196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 35610099 - 35610340
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  35610099 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 35610198  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35610199 acatgaaaactaccattttt-tttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgactaaaaatgattcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 35610297  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  35610298 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 35610340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16675137 - 16674913
Alignment:
Q  36 caattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactaccatttttnnnnnn 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          
T  16675137 caattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaagtccaattcctacatcaaccctaaccacatgaaaactaccattttttttata 16675038  T
Q  136 nnnnnnnn--ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatgg 233  Q
              |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16675037 aaaaaaaaatctacacaaactaacattatgattaaaaataagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatcg 16674938  T
Q  234 aaattggagaacttggatgattttg 258  Q
    ||||||||||| |||| || |||||    
T  16674937 aaattggagaagttggttggttttg 16674913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41880880 - 41880636
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattc--ctacatcaaccctaa 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  41880880 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcagctacatcaactctaa 41880781  T
Q  108 acacatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 207  Q
     |||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41880780 ccacatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgataaacaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 41880681  T
Q  208 atgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  41880680 atgcacttgattttgctgaaaaatcgaatttgaagaagttggatg 41880636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 17465404 - 17465647
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17465404 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 17465503  T
Q  110 acatgaaaactacca-tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    ||||||||||||||| |||||              |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17465504 acatgaaaactaccatttttttaaaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgataaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 17465603  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    |  ||||||||||||| |||||  ||  |||||||| |||||||    
T  17465604 taaacttgattttgctgaaaaaacgattttggagaagttggatg 17465647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17587810 - 17587567
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17587810 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 17587711  T
Q  110 acatgaaaactaccat-ttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    |||||||||||||||| ||||              |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587710 acatgaaaactaccatttttttaaaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgataaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 17587611  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    |  ||||||||||||| |||||  ||  |||||||| |||||||    
T  17587610 taaacttgattttgctgaaaaaacgattttggagaagttggatg 17587567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41734553 - 41734302
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  41734553 attatactataacgtcattgaaacatcaattaaagcaacaacattcaactataaaatacatgcaatcatcaaattttcaattccaacatcaaccctaacc 41734454  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    || || ||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41734453 acgtgcaaactaccatttttttctcttaaaaaaactacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 41734354  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaa 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | | || |||| ||||||||    
T  41734353 gcacttgattttgctcaaaaatcgaaattgggggagtttgatggttttggaa 41734302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48403747 - 48403525
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48403747 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 48403648  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgat--taaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48403647 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaatctacccaaactaacattatgataaaaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 48403548  T
Q  208 atgcacttgattttgctcaaaaa 230  Q
    ||  ||||||||||||| |||||    
T  48403547 ataaacttgattttgctgaaaaa 48403525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 46740230 - 46740350
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcat-caaaaattcaattcctacatcaaccctaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  46740230 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcaatcataaaaaaattcaattcctacatcaaccctaac 46740329  T
Q  109 cacatgaaaactaccattttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46740330 cacatgaaaactaccattttt 46740350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 556329 - 556441
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  556329 attatactctaacatcatccaatcatcaattaaagcaactatattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacataaaccttaacc 556428  T
Q  110 acatgaaaactac 122  Q
    |||||||||||||    
T  556429 acatgaaaactac 556441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Original strand, 10175599 - 10175699
Alignment:
Q  144 ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggaga 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  10175599 ctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgttgaaaaatcgaatttggaga 10175698  T
Q  244 a 244  Q
    |    
T  10175699 a 10175699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10517060 - 10516984
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcaca 410  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  10517060 gttaactgctgccggtttactaaaacttcgacagttaactgccaaagaacattttcgtaaagtactcgtgtggcaca 10516984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Original strand, 5541575 - 5541645
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  5541575 gttaactgccgccggttttctaaaactttgacagttaactgccaaagggcatttaggtaaattactcgtgt 5541645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 45257028 - 45256952
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcaca 410  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  45257028 gttagctgccgccggtttactaaaacttcgacaattaactgccgaaggacatttaggtaaattactcatgtggcaca 45256952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 243
Target Start/End: Original strand, 46740386 - 46740437
Alignment:
Q  192 tgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggaga 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  46740386 tgattaaatggagataatgcacttgattttgctgaaaaattaaaattggaga 46740437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16675173 - 16675141
Alignment:
Q  51 cattcaattataaactacatgcaatcatcaaaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16675173 cattcaattataaactacatgcaatcatcaaaa 16675141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17649541 - 17649509
Alignment:
Q  51 cattcaattataaactacatgcaatcatcaaaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17649541 cattcaattataaactacatgcaatcatcaaaa 17649509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 404
Target Start/End: Original strand, 556696 - 556747
Alignment:
Q  353 ctaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  556696 ctaaaactttgacagttaactgtcaagagacatttagataaattactcgtgt 556747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17834534 - 17834447
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||   |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  17834534 tcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaagggcattttcataaattactcgtgtggcacagcctt 17834447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 360 - 404
Target Start/End: Original strand, 37345161 - 37345205
Alignment:
Q  360 ttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||    
T  37345161 ttcgacagttaactgccgaaggacatttaggtaaattactcgtgt 37345205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20351034 - 20350703
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20351034 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 20350935  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350934 acatgaaaactaccattttt--tttaaaaaaaacctacataaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 20350837  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa--taaactcagaaaactaagtttttgcttc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||  ||||||  ||||| |   | |||||||||| | ||||| ||||||    
T  20350836 gcacttgattttgctcaaaaatcgaaattggataagttggttggttttggaaattttttgaacaattgtagcaatactcagaaaattgagtttatgcttc 20350737  T
Q  308 tgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  20350736 tgtttatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 20350703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41612757 - 41612427
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41612757 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagtaactacattcaattataaactacatgcaattatcaaaaattcaattcctacattaaccctaacc 41612658  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41612657 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaac--ctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 41612560  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataa-actcagaaaactaagtttttgcttct 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |  || |||||||||  ||||||  | ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||    
T  41612559 gcacttgattttgctcaaaaatcgaaatgggagaagtagtttggttttggaaagtttttgaacacttgaacaatactcagaaaactgagtttctgcttct 41612460  T
Q  309 gtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    || |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  41612459 gtttatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 41612427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 17567747 - 17567999
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17567747 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagtaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 17567846  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17567847 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaaaaactacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 17567946  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaa 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  || |||||||||    
T  17567947 gcacttgattttgctcaaaaattgaaatgggagaagttgtttggttttggaaa 17567999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16611467 - 16611075
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16611467 attatattctaacattattcaatcatcgattaaaacaactacattcaattataaactacttgcaatcataaaaaattcaattccgacatcaaccctaacc 16611368  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnn---ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagat 206  Q
    ||||||||||||||||||||                 |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16611367 acatgaaaactaccatttttttttttaaaaaaaaaacctatccaaactaacattatgattgaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagat 16611268  T
Q  207 gatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa--taaactcagaaaactaagtttttgc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||| |||| |||   | |||||||||||| ||||| |||    
T  16611267 gatgcacttgattttgctgaaaaatcgaaattggagaagttggttg-gtttggaaagattttgaaaaatggaagcaatactcagaaaactgagtttctgc 16611169  T
Q  305 ttctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactc 400  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||| | || | |||||||||||| |||||    
T  16611168 ttctgt-tatgttcagttcg-catcggcagttaactgccgccggttttctaaaacttcggtagttaactgccgaagggcatttaggtaaattactc 16611075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 400
Target Start/End: Original strand, 22047786 - 22048178
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22047786 attatattctaacattattcaatcatcgattaaaacaactacattcaattataaactacttgcaatcataaaaaattcaattccgacatcaaccctaacc 22047885  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnn---ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagat 206  Q
    ||||||||||||||||||||                 |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047886 acatgaaaactaccatttttttttttaaaaaaaaaacctatccaaactaacattatgattgaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagat 22047985  T
Q  207 gatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa--taaactcagaaaactaagtttttgc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||  |||||| |||| |||   | |||||||||||| ||||| |||    
T  22047986 gatgcacttgattttgctgaaaaatcgaaattggagaagttggttg-gtttggaaagattttgaaaaatggaagcaatactcagaaaactgagtttctgc 22048084  T
Q  305 ttctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactc 400  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||| | || | |||||||||||| |||||    
T  22048085 ttctgt-tatgttcagttcg-catcggcagttaactgccgccggttttctaaaacttcggtagttaactgccgaagggcatttaggtaaattactc 22048178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 42903873 - 42904107
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  42903873 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaaatcaattcctacatcaaccctaacc 42903972  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42903973 acatgaaaactaccatttttttttttaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 42904072  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  42904073 gcacttgattttgttgaaaaatcgaatttggagaa 42904107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 54386513 - 54386272
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  54386513 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 54386414  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54386413 acatgaaaactaccatttttttttaaaaaaaac-ctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 54386315  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  54386314 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 54386272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Original strand, 2274597 - 2274930
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2274597 attatattctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactgcattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 2274696  T
Q  110 acatgaaaactacca---tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagat 206  Q
    |||||||||||||||   |||||              |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2274697 acatgaaaactaccatttttttttaaaaaaaaaaaacctacccaaactaacgttatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagat 2274796  T
Q  207 gatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataa-actcagaaaactaagtttttgct 305  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || ||||  ||||||||  |||| |  |||  |  || |||||||||||| ||||| ||||    
T  2274797 gatgcacttgattttgctgaaaattcgaaattggagaagtttgatg-gtttggaaatattttaaacaatgaagcaatactcagaaaactgagtttctgct 2274895  T
Q  306 tctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  2274896 tctgt-tatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 2274930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29009249 - 29009008
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29009249 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 29009150  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29009149 acatgaaaactaccattttt-ttttaaaaaaaacctacccaaactaacattatgataaacaatgattcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 29009051  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  29009050 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 29009008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 46701708 - 46701949
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  46701708 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 46701807  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46701808 acatgaaaactaccattttt-ttaaaaaaaaaacctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatagagatgat 46701906  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||    
T  46701907 gcacttgattttgctgaaaaatcaaatttggagaagttggatg 46701949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34045766 - 34045524
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  34045766 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcatcaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 34045667  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34045666 acatgaaaactaccatttttttaaaaaaaaatacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaatatacttacttgtgtttaaatgaagatgat 34045567  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||    
T  34045566 gcacttgattttgctgaaaaaacgaatttggagaagttggatg 34045524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 49144145 - 49144387
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  49144145 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcatcaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 49144244  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  49144245 acatgaaaactaccatttttttaaaaaaaaatacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaatatacttacttgtgtttaaatgaagatgat 49144344  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||    
T  49144345 gcacttgattttgctgaaaaaacgaatttggagaagttggatg 49144387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 46389351 - 46389115
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  46389351 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 46389252  T
Q  110 acatgaaaactaccat--ttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 207  Q
    ||||||||||||||||  ||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46389251 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatg 46389152  T
Q  208 atgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  46389151 atgcacttgattttgttgaaaaatcgaatttggagaa 46389115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 2967623 - 2967848
Alignment:
Q  25 cattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactacca 124  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2967623 cattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaaccacatgaaaactacca 2967722  T
Q  125 tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgct 224  Q
    |||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2967723 tttttttttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaacatacttacttgtgtttaaatgaagatgatgcacttgattttgct 2967822  T
Q  225 caaaaatggaaattggagaacttgga 250  Q
     |||||  ||| |||||||| |||||    
T  2967823 gaaaaaacgaatttggagaagttgga 2967848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 52391079 - 52391312
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52391079 attatacactaacatcattcaatcatcaattaaaacaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 52391178  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||              |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52391179 acatcaaaactaccattttt-tttaaaaaaaaacctacccaagctaacattatgattacaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggaaatgat 52391277  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  52391278 gcacttgattttgctgaaaatttgaaattgaagaa 52391312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 50480467 - 50480670
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  50480467 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaagtcaattcctacatcaaccctaacc 50480566  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50480567 acatgaaaactaccattttt-ttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaaaatacttacttgtgattaaatggagatgat 50480665  T
Q  210 gcact 214  Q
    |||||    
T  50480666 gcact 50480670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36127752 - 36127566
Alignment:
Q  56 aattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnc-tactcaaact 154  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||              | ||| ||||||    
T  36127752 aattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctatatcaaccctaaccacatcaaaactaccatttttttaaaaaaaaaaaccctacccaaact 36127653  T
Q  155 aacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattgga 241  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  36127652 aacattatgattacaaattaatcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctgaaaattcgaaattgga 36127566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 36127826 - 36127766
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacat 70  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36127826 attatactctaacatcatttaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacat 36127766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4172158 - 4172084
Alignment:
Q  48 ctacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactac 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  4172158 ctacattcatttataaactacatgcaatcatcaaaatatcaattcctacatcaaccctaacaacatgcaaactac 4172084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 4178156 - 4178097
Alignment:
Q  48 ctacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaa 107  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4178156 ctacattcatttataaactacatgcaatcatcaaaatatcaattcctacatcaaccctaa 4178097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 8475873 - 8475786
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8475873 tcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaaggacattttcgtaaagtactcgtgtggcacaacctt 8475786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 415
Target Start/End: Original strand, 42166436 - 42166523
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42166436 tcggcagtttactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaatgacatttttgtaaagtactcgtgtggcacaacctt 42166523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41612409 - 41612339
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  41612409 gttaactgccgccgattttctaaaacttcgacagttaactgccaatagacatttatgtaaattactcgtgt 41612339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4172058 - 4171993
Alignment:
Q  144 ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4172058 ctacacaaactaacattatgattaaaaattagtaaacctacttacttgtgataaaatggagatgat 4171993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Original strand, 2274948 - 2275018
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2274948 gttaacggccgccggtttactaaaactttggcagttaactgcccaatgacatttaggtaaattactcgtgt 2275018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17561800 - 17561730
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  17561800 gttaactgcagccggttttctaaaatttcggcagttaactgtcaagggacatttaggtaaattactcgtgt 17561730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 52387825 - 52387744
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52387825 gttaactgccaccggtttactaaaacttcgacagttaactgccgaagggcattttcgtaaaatactcatgtggcacaacctt 52387744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 14043924 - 14044000
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |  |||| |||||| |||||||||    
T  14043924 tcggcagttaactgcagccgattttctaaaacttcgacagttaactgccgaagggtatttgggtaaattactcgtgt 14044000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16861170 - 16861100
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||    
T  16861170 gttaactgcatccggttttctaaaacttcgacagttaactgtcgaggggcatttaggtaaattactcgtgt 16861100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Original strand, 4331852 - 4331933
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || || ||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  4331852 gttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaaggatattttcgtaaagtactcgtgtggcacagcctt 4331933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4178064 - 4178002
Alignment:
Q  144 ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagat 206  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  4178064 ctacacaaactgacattatgattaaaaattattaaacctacttacttgtgataaaatggagat 4178002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44523464 - 44523394
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  44523464 gttaactgcagccgatttccacaaaattcgacaattaactgtcgaaggatatttaggtaaattactcgtgt 44523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Original strand, 31045333 - 31045390
Alignment:
Q  67 acatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactacca 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  31045333 acatgcaatcatcaaaatgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaactacca 31045390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 4015155 - 4015231
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||  ||||| |||||||||    
T  4015155 tcggcagttaactcccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaagggcattttcgtaaagtactcgtgt 4015231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42165203 - 42165123
Alignment:
Q  335 ttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||||| | || | |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42165203 ttaactgccgccggtttactaaaacttcagcagctaactgccgaagggcattttcgtaaaatactcgtgtggcacagcctt 42165123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Original strand, 29401287 - 29401619
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29401287 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 29401386  T
Q  110 acatgaaaactacca-tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    | ||||||||||||| |||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29401387 atatgaaaactaccattttttttttaaaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 29401486  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaa--taaactcagaaaactaagtttttgctt 306  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||  ||| |||   | |||||||||||| ||||| |||||    
T  29401487 tgcacttgattttgctgaaaaatcgaaattggagaagttggttg-gtttggaaagattttgaagaatggaagcaatactcagaaaactgagtttctgctt 29401585  T
Q  307 ctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  29401586 ctgt-tatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 29401619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 270
Target Start/End: Original strand, 36656033 - 36656293
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  36656033 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagtcactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaatattcaattcctacatcaaccctaacc 36656132  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    |||||||||||||| |||||              |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36656133 acatgaaaactacctttttttttataaaaaaaacctacacaaactaacattataattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 36656232  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttga 270  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  36656233 gcacttgattttgttcaaaaatcgaaatttgagaagttggttggttttggaaagcttttga 36656293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45284562 - 45284323
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45284562 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 45284463  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45284462 acatgaaaactaccatttttaaaaaaaaaatcacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttgcttgtgattaaattgagatgat 45284363  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttgg 249  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45284362 gcatttgattttgctcaaaaatcgaaattggagaagttgg 45284323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45291925 - 45291686
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45291925 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 45291826  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45291825 acatgaaaactaccatttttaaaaaaaaaatcacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttgcttgtgattaaattgagatgat 45291726  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttgg 249  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45291725 gcatttgattttgctcaaaaatcgaaattggagaagttgg 45291686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20938286 - 20938046
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20938286 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 20938187  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20938186 acatgaaaactaccattttt--ttttaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 20938089  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  20938088 gcacttgattttgttgaaaaatagaatttggagaagttggatg 20938046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 3940412 - 3940653
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  3940412 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcatcaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 3940511  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3940512 acatgaaaactaccattttt-ttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 3940610  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3940611 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 3940653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5352355 - 5352112
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5352355 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 5352256  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnc-tactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||              | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5352255 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 5352156  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  5352155 tgcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 5352112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15831518 - 15831275
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15831518 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 15831419  T
Q  110 acatgaaaactaccat-ttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    |||||||||||||||| ||||              |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15831418 acatgaaaactaccatttttttttttaaaaaaaacctacccaaactaacattatgataaacaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 15831319  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15831318 tgcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 15831275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 30496630 - 30496873
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  30496630 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 30496729  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnc-tactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    ||||||||||||||||||||              | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30496730 acatgaaaactaccattttttttttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 30496829  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  30496830 tgcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 30496873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 43539421 - 43539661
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  43539421 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 43539520  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43539521 acatgaaaactaccattttt--ttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 43539618  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  43539619 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttgaagaagttggatg 43539661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43978910 - 43978677
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  43978910 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcatcaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 43978811  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43978810 acatgaaaactaccattttt-tttaaaaaaaaaactacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 43978712  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaa 244  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  43978711 gcacttgattttgttgaaaaatcgaatttggagaa 43978677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 249
Target Start/End: Original strand, 10828708 - 10828952
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaa-- 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  10828708 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattca-ttataaactacatgcaatcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 10828806  T
Q  108 acacatgaaaactacca----tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatgga 203  Q
    ||| |||||||||||||    |||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10828807 acatatgaaaactaccattttttttttataaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaacgaa 10828906  T
Q  204 gatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttgg 249  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  10828907 gatgatgcacttaattttgctgaaaaatcgaaattggagaagttgg 10828952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45290956 - 45290784
Alignment:
Q  77 atcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290956 atcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaccacatgaaaactaccatttttaaaaaaaaaatcacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagt 45290857  T
Q  177 caagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttgg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45290856 caagatacttgcttgtgattaaattgagatgatgcatttgattttgctcaaaaatcgaaattggagaagttgg 45290784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 25515492 - 25515604
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25515492 attatactctaacatcattcaaacatcaactaaagcaactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaatttcaattcctacatcaaccctaacc 25515591  T
Q  110 acatgaaaactac 122  Q
    ||||| |||||||    
T  25515592 acatgcaaactac 25515604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28419448 - 28419367
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28419448 gttaactaccgccggtttactaaaacttcggcagttaactgccgaagggcatttaggtaaaatactcgtgtggcacagcctt 28419367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31367360 - 31367308
Alignment:
Q  69 atgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaacta 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31367360 atgcaatcatcaaaatatcaattcctacatcaaccctaaccacatgcaaacta 31367308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Original strand, 41273274 - 41273320
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactg 374  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41273274 tcggcagttaactgccgccgatttactaaaacttcggcagttaactg 41273320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Original strand, 29401637 - 29401707
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||| ||||| |||||||||    
T  29401637 gttaactgccgccggttttctaaaacttcgacagttaactgccgaggggcatttaagtaaattactcgtgt 29401707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36652947 - 36652877
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |||||||||    
T  36652947 gttaactgcatccggttttctaaaacttcgacagttaactgccgatggacatttaagtaaattactcgtgt 36652877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 415
Target Start/End: Original strand, 40157473 - 40157539
Alignment:
Q  349 tttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  40157473 tttactaaaacttcgacagttaactgttgaagggcattttcgtaaagtacacgtgtcgcacaacctt 40157539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39947646 - 39947605
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagtt 369  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39947646 tcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcgacagtt 39947605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3501407 - 3501210
Alignment:
Q  144 ctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggaga 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3501407 ctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttgcttgtgattaaatggagatgatgcacttgattttgctcaaaaaatgaaattggaga 3501308  T
Q  244 acttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaactaagtttttgcttctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  3501307 acttggttgattttggaaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaactgagtttctgcttctgtgtatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 3501210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11688505 - 11688263
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  11688505 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 11688406  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11688405 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 11688306  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  11688305 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 11688263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 30829335 - 30829576
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  30829335 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 30829434  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30829435 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaac-ctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 30829533  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  30829534 gcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 30829576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6201538 - 6201308
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  6201538 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcatacattaaccctaacc 6201439  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6201438 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 6201339  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattgg 240  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  6201338 gcacttgattttgttgaaaaatcgaatttgg 6201308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27617105 - 27616865
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27617105 attataccctaacaccattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 27617006  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27617005 acatgaaaactaccattttttttaaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaacatacttacttgtgtttaaatgaagatgat 27616906  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttgga 250  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||    
T  27616905 gcacttgattttgctgaaaaaacgaatttggagaagttgga 27616865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26423374 - 26423039
Alignment:
Q  19 taacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26423374 taacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaaccacatgaaaa 26423275  T
Q  119 ctaccattttt---nnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttac-------ttgtgattaaatggagatga 208  Q
    ||||  |||||                 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||    
T  26423274 ctacttttttttaaaaaaaaaaaaaaaactacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatactaacttgtgaattgtgattaaatggagatga 26423175  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttgg-aaaacttttgagaaattgaataaactcagaaaactaagtttttgcttc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |  |  |||| ||||| ||||||    
T  26423174 tgcacttgattttgctcaaaaaatgaaattggagaacttgcttgattttggaaaaacttgtgaaaaattg-ataaagtgggttaactgagtttatgcttc 26423076  T
Q  308 tgtgtatgg---tcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    ||| |||||   |||||||| ||||||| |||||||||    
T  26423075 tgtttatggagttcagttcg-catcggcagttaactgc 26423039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3501559 - 3501440
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501559 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 3501460  T
Q  110 acatgaaaactaccattttt 129  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3501459 acatgaaaactaccattttt 3501440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22301570 - 22301395
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22301570 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 22301471  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatactt 186  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22301470 acatgaaaactaccattttt-tttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgataaaaaatgagtcaagatactt 22301395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24722318 - 24722206
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24722318 attatactctaacatcattcaaacatcaattaaagacactacattcaattataaactacatgcaataatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 24722219  T
Q  110 acatgaaaactac 122  Q
    |||||||||||||    
T  24722218 acatgaaaactac 24722206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 410
Target Start/End: Original strand, 26351122 - 26351204
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcaca 410  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  26351122 tcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcgacagttaactgtcgaatgacattttcgtaaagtactcgtgtggcaca 26351204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26423021 - 26422940
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  26423021 gttaactgccgccggtttactaaaacttcgacagtaaactaccgaatgacattttaataaagtactcgtgtagcacaacctt 26422940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3501192 - 3501122
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||    
T  3501192 gttaactgccgctggtttactaaaacttcgacagttaactgccgaagggcatttacgtaaaatactcgtgt 3501122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24719981 - 24719912
Alignment:
Q  335 ttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||    
T  24719981 ttaactgcagccgatttccacaaacttcggcagttaactgccgaaggacatttaggtaaattagtcgtgt 24719912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30705526 - 30705196
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30705526 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 30705427  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    |||| |||||||||||||||              |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30705426 acataaaaactaccattttttttataaaaaaaacctacccaaattaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 30705327  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaat--aaactcagaaaactaagtttttgcttc 307  Q
    ||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||  |||||| || |||||| | | |||||  | |||||||||| | ||||| ||||||    
T  30705326 gcatttgattttgctgacaaatcgaaattggagaagttggatg-gtttggagaatttttga-acaatgaatcaatactcagaaaattgagtttctgcttc 30705229  T
Q  308 tgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  30705228 tgt-tatgttcagttcg-catcggtagttaactgc 30705196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 27673336 - 27673579
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  27673336 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctatatcaactctaacc 27673435  T
Q  110 acatgaaaactacca-tttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 208  Q
    ||||||||||||||| |||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27673436 acatgaaaactaccatttttttttttaaaaaaaccctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatga 27673535  T
Q  209 tgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  27673536 tgcacttgattttgctgaaaaatcaaaattggagaagttggatg 27673579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 19040800 - 19041040
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19040800 attataccctaacatcattcaatcatcaattaaaccaactacattcaattataaactacatgcactcataaaaaattcaattcctacatcaaccctaacc 19040899  T
Q  110 acatgaaaactaccatttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagatgat 209  Q
    ||||||||||||||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19040900 acatgaaaactaccatttttttttaaaaaaaaacctacccaaactaacattatgattaaaaatgagtcaacatacttacttgtgtttaaatgaagatgat 19040999  T
Q  210 gcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttgga 250  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||    
T  19041000 gcacttgattttgctgaaaaaacgaatttggagaagttgga 19041040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5197363 - 5197044
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5197363 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagtaactacattcaattataaactacatgcaatcataaaaaattcaattcatacatcaaccctaacc 5197264  T
Q  110 acatgaaaactaccattttt---nnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgattaaatggagat 206  Q
    ||||||||||||||||||||                 || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||       
T  5197263 acatgaaaactaccatttttaaaattaaaaaaaaaacctgcacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaaga----tacttgtgattaaatgga--- 5197171  T
Q  207 gatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatgattttggaaaacttttgagaaattgaataa-actcagaaaactaagtttttgct 305  Q
             |||||||||||||||| ||||| |||||| |||  || |||||||||  ||||||  | ||||| || || ||||||||| ||||| ||||    
T  5197170 ---------gattttgctcaaaaattgaaatgggagaagttgtttggttttggaaagtttttgaatacttgaacaatacccagaaaactgagtttctgct 5197080  T
Q  306 tctgtgtatggtcagttcgtcatcggccgttaactgc 342  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  5197079 tctgtttatgttcagttcg-catcggcagttaactgc 5197044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 415
Target Start/End: Original strand, 42912910 - 42912991
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacctt 415  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  | || | ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42912910 gttaactgccgccggtttactaaaacttcgacaattaactaccgaagggcatttaaataaaatactcgtgtggcacagcctt 42912991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 373
Target Start/End: Original strand, 5200388 - 5200427
Alignment:
Q  334 gttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaact 373  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5200388 gttaactgcagccgattttctaaaacttcgacagttaact 5200427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20422272 - 20422217
Alignment:
Q  67 acatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaacacatgaaaactac 122  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20422272 acatccaatcatcaaattgtcaattcctacatcaaccctaaccacatgcaaactac 20422217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 4337 - 4523
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  4337 attatattctaacatcattcaaacatcaattacaacaactacattcgtttataatctacatgcaatcatcaaaatttcaattcctacatcaacccttacc 4436  T
Q  110 acatgaaaactacc-atttttnnnnnnnnnnnnnnctactcaaactaacattatgattaaaaatgagtcaagatacttacttgtgat 195  Q
    ||||| |||||||| ||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4437 acatgcaaactaccaattttttaaacaaaaaaaacctacacaaactaacattatgattaaaaatgagtcaaggtacttacttgtgat 4523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 18616 - 18728
Alignment:
Q  10 attatactctaacatcattcaatcatcaattaaagccactacattcaattataaactacatgcaatcatcaaaaattcaattcctacatcaaccctaaac 109  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18616 attacactctaacatgattcaaaaatcaattaaagcaactacattcaattataaactacatgcaataatcaaaatttcaattcctacatcaaccctaacc 18715  T
Q  110 acatgaaaactac 122  Q
    |||||||||||||    
T  18716 acatgaaaactac 18728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 413
Target Start/End: Original strand, 15648 - 15733
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacc 413  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  15648 tcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcgacagttaactgccgaaggacattttcgtaaagtactcgtgtggcacaacc 15733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 252
Target Start/End: Original strand, 11329 - 11378
Alignment:
Q  203 agatgatgcacttgattttgctcaaaaatggaaattggagaacttggatg 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  11329 agatgatgcacttgattttgctgaaaaatcgaatttggagaagttggatg 11378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12429 - 12345
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaac 412  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || | |||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  12429 tcggcagttaattgccgccggtttactaaaatttcgacagttaactgccgaagggcatttttgtaaagtactcgtgtggcacaac 12345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10699 - 10614
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgtagcacaacc 413  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || | || | |||||| ||||  |||||||||  |||||||    
T  10699 tcggcagttaactgccgccggtttactaaaacttcggcagttaattgccgaagggcatttaagtaatttactcgtgtgacacaacc 10614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0283 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0283
Description:

Target: scaffold0283; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 1639 - 1715
Alignment:
Q  328 tcggccgttaactgctgccgatttactaaaacttcgacagttaactgtcaaatgacatttaggtaaaatactcgtgt 404  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| | || || |||||  |||| |||||||||    
T  1639 tcggcagttaactgcaaccgattttctaaaacttcaacagttaactgccgaaagatatttaaataaattactcgtgt 1715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University