View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7677_low_1 (Length: 866)

Name: NF7677_low_1
Description: NF7677
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7677_low_1
NF7677_low_1
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (20-856)||(10126749-10127585)
chr3 (20-856)||(10663347-10664183)
chr3 (20-856)||(10031824-10032660)
chr3 (21-856)||(9838683-9839518)
chr3 (21-856)||(9849561-9850396)
chr3 (20-856)||(10260519-10261355)
chr3 (46-856)||(10363210-10364020)
chr3 (21-856)||(10433456-10434291)
chr3 (21-856)||(11769056-11769891)
chr3 (20-856)||(10184063-10184899)
chr3 (46-856)||(10195520-10196330)
chr3 (21-856)||(10375257-10376092)
chr3 (46-856)||(10088637-10089447)
chr3 (22-856)||(10580424-10581267)
chr3 (46-856)||(10077116-10077926)
chr3 (331-856)||(10527490-10528015)
chr3 (24-856)||(11159429-11160261)
chr3 (28-856)||(13332733-13333561)
chr3 (24-856)||(8861111-8861943)
chr3 (28-856)||(13170860-13171688)
chr3 (46-856)||(13343936-13344746)
chr3 (46-856)||(11130438-11131248)
chr3 (46-856)||(11148266-11149076)
chr3 (28-856)||(13289494-13290322)
chr3 (24-854)||(10889131-10889961)
chr3 (28-856)||(13160809-13161637)
chr3 (330-848)||(11781402-11781920)
chr3 (330-848)||(10517616-10518134)
chr3 (644-856)||(10672127-10672339)
chr3 (337-856)||(10500712-10501231)
chr3 (20-317)||(10500374-10500674)
chr3 (143-317)||(10527281-10527455)
chr3 (143-317)||(11781954-11782128)
chr3 (143-315)||(10517408-10517580)
chr3 (20-101)||(10527156-10527237)
chr3 (302-519)||(11153523-11153739)
chr3 (774-862)||(11246027-11246115)
chr3 (20-101)||(11782173-11782254)
chr3 (767-856)||(13396057-13396146)
chr3 (48-101)||(10517310-10517363)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (21-856)||(26906719-26907554)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (28-856)||(135300-136128)
scaffold0002 (28-856)||(145351-146179)
scaffold0002 (496-856)||(153656-154016)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (156-848)||(31679153-31679845)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (562-856)||(57823-58126)
scaffold0083 (46-95)||(49981-50030)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (331-848)||(11485170-11485687)
chr8 (494-848)||(44957109-44957462)
chr8 (143-317)||(11484961-11485135)
chr8 (143-313)||(44957664-44957834)
chr8 (20-89)||(11484835-11484904)
chr8 (21-101)||(44957876-44957956)
chr8 (331-441)||(44957515-44957625)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (331-856)||(17852335-17852860)
chr4 (143-317)||(17852895-17853069)
chr4 (20-99)||(17853116-17853195)
chr4 (199-251)||(7128992-7129044)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (388-848)||(826100-826551)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (143-425)||(29836587-29836869)
chr7 (635-848)||(29837076-29837289)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 581; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 856
Target Start/End: Original strand, 10126749 - 10127585
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10126749 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 10126848  T
Q  120 gctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10126849 gctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaat 10126948  T
Q  220 gataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10126949 gataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatgggtttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaacaaagtctctccttgaatctgtca 10127048  T
Q  320 cttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtg 419  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  10127049 cttccacaacttgggatagcaataatcttgatgtccttcgagttgcgttaaagaaaatctcgagggaaaaaagatttttgtttgtgttggacgatctatg 10127148  T
Q  420 gaatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgca 519  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||     
T  10127149 gaatgacaattgtaatgattgggatgagctagtaagtcccttcattaatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcgccaacaaaaagttgct 10127248  T
Q  520 gaggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttc 619  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10127249 gaggtggcacgcacatttcctatacatgaactaaaagtactatcagatgaagattgttggtctttactatcaaagcatgcattgggaagtgatgagattc 10127348  T
Q  620 acaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacg 719  Q
    |  ||| || ||| |||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127349 agcataatacaaatacagcccttgaagaaacaggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacg 10127448  T
Q  720 ttcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaa 819  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10127449 ttcaaaggtagacataacagagtggacttcaattttgaacaacaacatatggaacttgcgaaatgataatattcttcctgcattgcatttgagttatcaa 10127548  T
Q  820 tatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127549 tatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 10127585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 581; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 856
Target Start/End: Original strand, 10663347 - 10664183
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10663347 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctctcatggtgggtaggaagggtgacaaagagacaataatgaacatgtt 10663446  T
Q  120 gctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaat 219  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10663447 gctatcacagagagacacaacccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaat 10663546  T
Q  220 gataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10663547 gataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatgggtttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaacaaagtctctccttgaatctgtca 10663646  T
Q  320 cttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtg 419  Q
    |||| | ||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10663647 cttccacaacttgggatagcaaagatcttgatgtccttcgagttgagttaaagaaaatctcgagggagaaaagatttttgtttgtgttcgatgatctgtg 10663746  T
Q  420 gaatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgca 519  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||     
T  10663747 gaatgacaattataatgattggagtgaactagcaagtcccttcattgatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcgcgaacaaaaagttgct 10663846  T
Q  520 gaggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10663847 gaggtggcacacacatttcctatacataaattagaacttctatcaaatgaagattgttggtccttactttcaaagcatgcattgggaagcgacgagtttc 10663946  T
Q  620 acaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacg 719  Q
    || |||||  |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10663947 accatagttcaaacacaacccttgaagaaacaggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacattaggaggacttctacg 10664046  T
Q  720 ttcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaa 819  Q
    |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10664047 ttcaaaggtagacataacagagtggacttcaattttgaacagcaacatatggaacttgcgcaatgataatattcttcctgcattgcatttgagttatcaa 10664146  T
Q  820 tatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10664147 tatcttccctctcatttgaagagatgttttgcatatt 10664183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 856
Target Start/End: Original strand, 10031824 - 10032660
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10031824 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctctcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 10031923  T
Q  120 gctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaat 219  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10031924 gctatcacagagagacgcatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaat 10032023  T
Q  220 gataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10032024 gataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcctgggcttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaacaaagtctctccttgaatctgtca 10032123  T
Q  320 cttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtg 419  Q
    |||| | ||||| ||| |||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10032124 cttccacaacttcggatagcaaagatcttgatgtccttcgagttgagttaaagaaaatctcgagggagaaaagatttttgtttgttttggatgatctgtg 10032223  T
Q  420 gaatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgca 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||     
T  10032224 gaatgacaattataatgattggggtgaactagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacacgccaacgaaaagttgct 10032323  T
Q  520 gaggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttc 619  Q
    ||||| |||  |||||||||||| ||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10032324 gaggtggcatgcacatttcctatacatgaactaaaacttctatcaaatgaagattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggcagtgatgagattc 10032423  T
Q  620 acaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacg 719  Q
    |  ||| |  ||| |||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10032424 agcataatgcaaatacagcccttgaagaaacaggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgccaaaacacttggagggcttctacg 10032523  T
Q  720 ttcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaa 819  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10032524 ttcaaaggtagacataacagagtggacttcaattttgaacagcgacatatggaacttatcaaatgataatattcttcctgcattgcatttgagttatcaa 10032623  T
Q  820 tatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10032624 tatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 10032660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 856
Target Start/End: Original strand, 9838683 - 9839518
Alignment:
Q  21 aagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttg 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9838683 aagtgctagagtttctcgtagaacaccttctagttcaggggtaaatgaatctgtcgtggtgggtaggaagggtgacaaagagacaataatgaacatgttg 9838782  T
Q  121 ctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 220  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9838783 ctatctcaaagagacacaacccataacaatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 9838882  T
Q  221 ataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcac 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9838883 atgaagaagttcaacaacattttgatatgagggcgtgggcttgtgtgtctgaggattttgatattttgagagtaaccaagtctctccttgaatcggtcac 9838982  T
Q  321 ttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtgg 420  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9838983 ttccataacatgggatagcaataatcttgatgtccttcgagttgcgttaaagaaaaactcaagggagaaaagatttttgtttgtgttggatgatttgtgg 9839082  T
Q  421 aatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcag 520  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  9839083 aatgacaattataatgattggggtgaactagtaagtcccttcattgatggaaaacccggaagcatggtgattataacaacgcgccaacaaaaagttgctg 9839182  T
Q  521 aggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 620  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9839183 aggtggcacacacatttccaatacataaattagatcttctatcaaatgaagattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 9839282  T
Q  621 caatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgt 720  Q
    | |||||  |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9839283 ccatagttcaaacacagcccttgaagaaataggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacaataggaggacttctacgt 9839382  T
Q  721 tcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaat 820  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9839383 tcaaaggtagacataagtgagtggacttcaattttgaacagcgacatatggaacttatcaaatgataatattcttcctgcattgcatttgagttatcaat 9839482  T
Q  821 atcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9839483 atcttccctctcatttgaaaagatgctttgcatatt 9839518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 856
Target Start/End: Original strand, 9849561 - 9850396
Alignment:
Q  21 aagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttg 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9849561 aagtgctagagtttctcgtagaacaccttctagttcaggggtaaatgaatctgtcgtggtgggtaggaagggtgacaaagagacaataatgaacatgttg 9849660  T
Q  121 ctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 220  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9849661 ctatctcaaagagacacaacccataacaatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 9849760  T
Q  221 ataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcac 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9849761 atgaagaagttcaacaacattttgatatgagggcgtgggcttgtgtgtctgaggattttgatattttgagagtaaccaagtctctccttgaatcggtcac 9849860  T
Q  321 ttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtgg 420  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9849861 ttccataacatgggatagcaataatcttgatgtccttcgagttgcgttaaagaaaaactcaagggagaaaagatttttgtttgtgttggatgatttgtgg 9849960  T
Q  421 aatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcag 520  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9849961 aatgacaattataatgattggggtgaactagtaagtcccttcattgatggaaaacccggaagcatggtgattataacaacacgccaacaaaaagttgctg 9850060  T
Q  521 aggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 620  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9850061 aggtggcacacacatttccaatacataaattagatcttctatcaaatgaagattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 9850160  T
Q  621 caatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgt 720  Q
    | |||||  |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9850161 ccatagttcaaacacagcccttgaagaaataggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacaataggaggacttctacgt 9850260  T
Q  721 tcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaat 820  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9850261 tcaaaggtagacataagtgagtggacttcaattttgaacagtgacatatggaacttatcaaatgataatattcttcctgcattgcatttgagttatcaat 9850360  T
Q  821 atcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9850361 atcttccctctcatttgaaaagatgctttgcatatt 9850396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 541; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 856
Target Start/End: Original strand, 10260519 - 10261355
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10260519 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 10260618  T
Q  120 gctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaat 219  Q
    |||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10260619 gctatcacagagagaaacaaccaacaataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgctcaacttgtttacaat 10260718  T
Q  220 gataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10260719 gataaagaagttcaacaacattttgacatgaaggcgtgggcttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaaccaagtctctccttgaatcagtca 10260818  T
Q  320 cttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtg 419  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10260819 cttctagaaattgggatatcaataatcttgacatccttcgagttgagttaaagaaaatctcgagggagaaaagatttttgtttgtgttggacgatctgtg 10260918  T
Q  420 gaatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgca 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||     
T  10260919 gaatgacaattataatgattggggtgaactagtaagccccttcgttgatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcggcaacaaaaagttgct 10261018  T
Q  520 gaggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttc 619  Q
    ||||| |||  |||||||||||| ||| || || ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10261019 gaggtggcatgcacatttcctatacatgaactaaaacttctatcgaatgaagactgttggtctttactctcaaagcatgcattgggcagtgatgagattc 10261118  T
Q  620 acaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacg 719  Q
    |  ||| || ||| |||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10261119 agcataatacaaatacagcccttgaagaaacaggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgccaaaacacttggaggacttctacg 10261218  T
Q  720 ttcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaa 819  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10261219 ttcaaaggtagacataacagagtggacttcaattttgaacagcgacatatggaacttatcaaatgataatattcttcctgctttgcatttgagttatcaa 10261318  T
Q  820 tatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10261319 tatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 10261355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 10364020 - 10363210
Alignment:
Q  46 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctcagagagacacatcccata 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| || | |    
T  10364020 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctttcaaagagagaaacaaccgaca 10363921  T
Q  146 ataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10363920 ataatataggtgttgttgcaattttaggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttga 10363821  T
Q  246 tttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataat 345  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  10363820 tttgaaggcatgggtttgtgtctctgaggattttgatattatgagagtaacaaagtctctccttgaatctgccacttccataacttcggaaagcaataat 10363721  T
Q  346 cttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatg 445  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10363720 cttgatgtccttcgagttgagttaaagaaaatctcgagggagaaaagatatttgtttgtgttggacgatctgtggaatgacaattataatgattggggtg 10363621  T
Q  446 agctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattca 545  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10363620 aactagtaagccccttcattgatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcgccaagaaaaagtagctgaggtggcacacacatttcctataca 10363521  T
Q  546 taaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaa 645  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10363520 taaattagatcttctatcaaatgaagattgttggactttactctcaaagcatgcactgggaaatgatgagtttcacaatagtacaaacacaacccttgaa 10363421  T
Q  646 gaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtgga 745  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||    
T  10363420 gaaataggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaattgctgctaaaacactaggaggacttctccgttcaaaggtagacataacagagtgga 10363321  T
Q  746 cttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatg 845  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10363320 cttcaattttgaacagcaacatatggaacttgcgaaatgataatattcttcctgctttgcatttgagttatcaatatcttccctctcacttgaaaagatg 10363221  T
Q  846 ttttgcatatt 856  Q
     ||||||||||    
T  10363220 ctttgcatatt 10363210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 10434291 - 10433456
Alignment:
Q  21 aagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttg 120  Q
    |||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10434291 aagtgggagagtttctcatagaaatccttcaagttctgtggtcaatgaatctttcatggttggaaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttg 10434192  T
Q  121 ctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 220  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10434191 ctatcacagagaaacacaactcataataagataggtgttgttgcaattttaggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 10434092  T
Q  221 ataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcac 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10434091 ataaagaagttcaacaccattttgatttgaaggcctgggcttgtgtgtctcaggattttgatattttgaaagtaaccaagtctctccttgaatcggtcac 10433992  T
Q  321 ttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtgg 420  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10433991 ttccagaacttgggatagcaataatcttgatgtccttcgtgttgagttaaagaaaaactcgagggagaaaagatttttgtttgtgttggacgatctgtgg 10433892  T
Q  421 aatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcag 520  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  10433891 aatgacaattataatgattggggtgaactagtaagtcccttcattgatggaaaacccggaagcatggtgattataacaacgcgccaacaaaaagttgctg 10433792  T
Q  521 aggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 620  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10433791 aggtggcacacacatttcctatacataaattagaacttctatcaaatgaagattgttggtctttactctcgaagcatgcattgggcagtgatgagtttca 10433692  T
Q  621 caatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgt 720  Q
    |   | || |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10433691 cctcaatacaaacacaacccttgaagaaataggcagggagattgcaagaaagtgtggaggattgccaattgctgctaaaacaataggaggacttttacgt 10433592  T
Q  721 tcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaat 820  Q
    ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10433591 tcaaaggtagatataacagagtggacttcaattttgaacagcaacgtatggaacttatcaaatgataatattcttcctgcattgcatttgagttatcaat 10433492  T
Q  821 atcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10433491 atcttccctctcgtttgaaaagatgctttgcatatt 10433456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 856
Target Start/End: Original strand, 11769056 - 11769891
Alignment:
Q  21 aagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttg 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11769056 aagtgctagagtttctcgtagaacaccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatagtgggtaggaagaatgacaaagagacaataatgaacatgttg 11769155  T
Q  121 ctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 220  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11769156 ctatcacagagagacacaatccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgctcaacttgtctacaatg 11769255  T
Q  221 ataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcac 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  11769256 ataaagaagttcaacaatattttgatttgaaggcatgggcttgcgtgtctgaggattttgatattatgagagtaaccaggtctctccttgaatcggtcac 11769355  T
Q  321 ttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtgg 420  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  11769356 ttcaagaacttgggatagcaataatcttgatatccttcgagttgagttaaagaaaaacttgagggagaaaagatttttgtttgtgttagatgatatgtgg 11769455  T
Q  421 aatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcag 520  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  11769456 aatgacaattataatgattggggtgaactagtaagtcccttcagtaatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacacgccaacgaaaagttgctg 11769555  T
Q  521 aggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 620  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11769556 aggtggcacacacatttcctatacatgaattaaaacttctatcaaatgaagattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 11769655  T
Q  621 caatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgt 720  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  11769656 ccatagtacaaacacaacccttgaagaaataggaaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaattgccgctataacaataggagggcttctacgt 11769755  T
Q  721 tcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaat 820  Q
    ||||  ||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||   || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11769756 tcaaaggtagatataacagagtggactgcaattttaaacaatgacatatggaacttatcaaatgataatattcttcctgctttgcatttaagttatcaat 11769855  T
Q  821 atcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11769856 atcttccatctcacttgaaaagatgttttgcatatt 11769891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 856
Target Start/End: Original strand, 10184063 - 10184899
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10184063 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 10184162  T
Q  120 gctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaat 219  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10184163 gctgtcacagagagacacaacccataatgctataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgctcaacttgtttacaat 10184262  T
Q  220 gataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10184263 gataaagaagttcaacaacattttgatatgagggcgtgggcttgtgtgtccgaggattttgatattatgagagtaaccaagtctctccttgaatctgtca 10184362  T
Q  320 cttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtg 419  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||   || | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10184363 cttccacaacttgggatagcaataatcttgatgtccttcgagttgagttaaagaaacattcaagggagaaaagatttttgtttgtattggatgatctgtg 10184462  T
Q  420 gaatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgca 519  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||     
T  10184463 gaatgacagttatgatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcgccaagaaaaagtagct 10184562  T
Q  520 gaggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttc 619  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||    
T  10184563 gaggtggcacacacatttcctatacatgaactaaaacttctatcaaatgaagattgttggtcgttactctcaaagcatgcattgagagttggtgagtttc 10184662  T
Q  620 acaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacg 719  Q
    ||  || || |||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10184663 accgtactagaaactcaacctttgaagaaataggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacaataggaggacttctagg 10184762  T
Q  720 ttcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaa 819  Q
    ||| |  ||||| ||||  ||||||||  |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10184763 ttcgaaggtagatataatagagtggacaacaattttgaatagcaatgtatggaacttaccaaatgataaaattcttcctactttgcatttgagttatcaa 10184862  T
Q  820 tatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10184863 tgtcttccctctcatttgaaaatatgttttgcatatt 10184899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 856
Target Start/End: Original strand, 10195520 - 10196330
Alignment:
Q  46 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctcagagagacacatcccata 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| || | |    
T  10195520 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtagaaaggatgataaagagacaataatgaacatgttgctttcaaagagagaaacaaccgaca 10195619  T
Q  146 ataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10195620 ataatataggtgttgttgcaattttaggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaccattttga 10195719  T
Q  246 tttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataat 345  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||    
T  10195720 tttgaaggcatgggtttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaacaaagtctctccttgaatctgtcacttcgacaacttcggatagcaatgat 10195819  T
Q  346 cttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatg 445  Q
    |||| | | |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10195820 cttggtgtccttcaagttgagttaaagaaaaactcgagggagaaaagatttttgtttgtgttggatgatctgtggaatgacaattataatgattggattg 10195919  T
Q  446 agctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattca 545  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10195920 cactagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcgccaagaaaaagtagctgaggtggcacacacatttcctataca 10196019  T
Q  546 taaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaa 645  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  10196020 taaattagaacttctgtcaaatgaagattgttggactttactctcaaagcatgcattgggcaatgataagtttccccatagtacaaacacaacccttgaa 10196119  T
Q  646 gaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtgga 745  Q
    | ||| |||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  10196120 gcaattggcctgaagattgcaaggaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaaaggtagaaataacagagtgga 10196219  T
Q  746 cttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatg 845  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10196220 cttcaattttgaacagcgacatatggaacttatcaaatgataatattcttcctgctttgcatttgagttatcaatatcttccctgtcatttgaaaagatg 10196319  T
Q  846 ttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||    
T  10196320 ttttgcatatt 10196330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 10376092 - 10375257
Alignment:
Q  21 aagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttg 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  10376092 aagtggtagagtttctcgtagaacaccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgataaagacactataatgaacatgttg 10375993  T
Q  121 ctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 220  Q
    |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10375992 ctatcagagacagacacatcgcataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcacaacttgtttacaatg 10375893  T
Q  221 ataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcac 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10375892 atgaaaaagttcaacaacattttgatttgaaggcatgggcttgtgtgtctgaggattttgatattttgagagtaaccaagtctctccttgaatcggtcac 10375793  T
Q  321 ttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtgg 420  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10375792 ttcaagaacatgggatagcaataatcttgatgtccttcgagttgcgttaaagaaaaaatcaagggagaaaagatttttgtttgtgttggatgatttgtgg 10375693  T
Q  421 aatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcag 520  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||      
T  10375692 aatgacaattattatgattggggtgaactagtaagtcccttcattgatggaaaacccggaagcatggtgattataacaacgcgccaacgaaaagttgcta 10375593  T
Q  521 aggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 620  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| || || ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10375592 aggtagcatgcacatttcctatacatgaactaaaacttctatcgaatgaagactgttggtctttactctcaaagcatgcattgggtagtgatgagtttca 10375493  T
Q  621 caatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgt 720  Q
    | |||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10375492 ccatagttcaaacacaacccttgaagaaataggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacaataggaggacttctacgt 10375393  T
Q  721 tcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaat 820  Q
    ||||  |||||  |||  |||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10375392 tcaaaggtagatgtaacagagtggacatccattttgaacagcaatgtatggaacttacctaatgattacattcttcctgctttgcatttgagttatcaat 10375293  T
Q  821 atcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10375292 atcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 10375257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 856
Target Start/End: Original strand, 10088637 - 10089447
Alignment:
Q  46 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctcagagagacacatcccata 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| || | |    
T  10088637 ccttcaagttcggtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgataaagagacaataatgaacatgttgctttcaaagagagaaacaaccgaca 10088736  T
Q  146 ataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10088737 ataatataggtgttgttgcaattttaggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaccattttga 10088836  T
Q  246 tttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataat 345  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||    
T  10088837 tttgaaggcatgggtttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaacaaagtctctccttgaatctgtcacttcgacaacttcggatagcaatgat 10088936  T
Q  346 cttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatg 445  Q
    |||| | | |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10088937 cttggtgtccttcaagttgagttaaagaaaaactcgagggagaaaagatttttgtttgtgttggatgatctgtggaatgacaattataatgattggattg 10089036  T
Q  446 agctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattca 545  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10089037 cactagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcgccaagaaaaagtagctgaggtggcacacacatttcctataca 10089136  T
Q  546 taaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaa 645  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  10089137 taaattagaacttctgtcaaatgaagattgttggactttactctcaaagcatgcattgggcaatgataagtttccccatagtacaaacacaacccttgaa 10089236  T
Q  646 gaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtgga 745  Q
    | ||| |||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  10089237 gcaattggccggaagattgcaaggaagtgtggaggattgccaatagctgccaaaacactaggaggacttctacgttcaaaggtagaaataacagagtgga 10089336  T
Q  746 cttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatg 845  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10089337 cttcaattttgaacagcgacatatggaacttatcaaatgataatattcttcctgctttgcatttgagttatcaatatcttccctgtcatttgaaaagatg 10089436  T
Q  846 ttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||    
T  10089437 ttttgcatatt 10089447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 856
Target Start/End: Original strand, 10580424 - 10581267
Alignment:
Q  22 agtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgc 121  Q
    |||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10580424 agtgctagagtttctcatggaactccttcaagttctgtgtttaacgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgc 10580523  T
Q  122 tatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatga 221  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10580524 tatcacagagaaacacaatccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatga 10580623  T
Q  222 taaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcact 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10580624 taaagaagttcaacaacattttgacatgaaggcgtgggtttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaacaaagtctctccttgaatctgtcact 10580723  T
Q  322 tctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtgga 421  Q
    || | ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10580724 tccacaacttcggaaagcaataatcttgatgtccttcgtgttgagttaaagaaaatctcaagggagaaaagatttttgtttgtgttggatgatctgtgga 10580823  T
Q  422 atgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcaga 521  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |    
T  10580824 atgacaattgtaatgattgggatgagctagtaagtcccttcattaatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcgccaacaaaaagttacaaa 10580923  T
Q  522 ggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcac 621  Q
    | | |||||||  ||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10580924 gatggcacacatgtttgctgtacataatttagaacctctatcaaatgaagattgttggtctttactctcaaactatgcattgggaagtgatgagtttcac 10581023  T
Q  622 aatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgtt 721  Q
     |||||| ||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10581024 catagtacaaatacagcccttgaagaaattggcaggaagattgcaagaaggtgtgggggattgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctccctt 10581123  T
Q  722 caactgtagacataaatgagtggac---------ttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgag 812  Q
    |||  ||||||||||   |||||||         ||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10581124 caaaggtagacataacaaagtggacttcaattttttcaattttgaacagcagcatatggaacttgcgaaatgataatattcttcctgcattgcatttgag 10581223  T
Q  813 gtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10581224 ttatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgctttgcatatt 10581267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 856
Target Start/End: Original strand, 10077116 - 10077926
Alignment:
Q  46 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctcagagagacacatcccata 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  | |  | ||||||    
T  10077116 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgagatggttggtatggagcgtgacaaagagacaataatgaacatgttgctatcagggatgggcggaacccata 10077215  T
Q  146 ataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttga 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | | ||||||||    
T  10077216 ataagataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgattataaagttcgataccattttga 10077315  T
Q  246 tttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataat 345  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  10077316 tttgcaggcatgggcttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaaccaagtctctccttgaatcgatcacttctagaacttgggataacaatgat 10077415  T
Q  346 cttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatg 445  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10077416 cttgatgtccttcgagttgagttaaaaaaaaactcgagggataaaagatttttgtttgtgttagatgatatgtggaatgacaattatagtgattgggatg 10077515  T
Q  446 agctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattca 545  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  10077516 aacttgtaagtcccttcattgatggaaagcatggaagcatggtgattataacaacacgccaacaaaaagttgcagaggtggcacgcacatttcctataca 10077615  T
Q  546 taaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaa 645  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  10077616 tatattagaacctttatcaaatgaagattgttggtatttactttcaaagcatgcattgagagttggtgagtttcaccatagtacaaactcaacccttgaa 10077715  T
Q  646 gaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtgga 745  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  10077716 gaaataggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacaataggaggacttctaggttcaaaggtagatataatagagtgga 10077815  T
Q  746 cttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatg 845  Q
    |  |||||||||| || ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10077816 caacaattttgaatagtaatgtatggaacttaccaaatgataaaattcttcctgctttgcatttgagttatcaatgtcttccctctcatttgaaaatatg 10077915  T
Q  846 ttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||    
T  10077916 ttttgcatatt 10077926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 331 - 856
Target Start/End: Original strand, 10527490 - 10528015
Alignment:
Q  331 tgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaatt 430  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10527490 tgggaaagcaataatcttgatatccttcgagttcagttaaagaaaatctcaagggagaagagatttttgtttgtgttggatgatctatggaatgacaatt 10527589  T
Q  431 ataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcaca 530  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||| ||||||||| ||||| ||||     
T  10527590 acaatgattgggatgagctagtaagtccactcattgatggaaaacctggaagtatggtgattataacaacccaccaacgaaaagttgctgaggtggcacg 10527689  T
Q  531 cacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaa 630  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10527690 cacatttcctatacataaactaaaacttttatcaaatgaagattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaca 10527789  T
Q  631 aacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtag 730  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  10527790 aacacaacccttgaagaaataggcagaaagattgcaagaaagtatggaggattgccaatagctgctaaaacaataggaggacttctacgttcaaaggtag 10527889  T
Q  731 acataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctc 830  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10527890 acataacagagtggacttcaattttgaacagcaacgtatggaacttatcaaatgataatattcttcctgctttgcatttgagttatcaatatcttccctc 10527989  T
Q  831 tcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10527990 tcatttgaaaagatgttttgcatatt 10528015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 11160261 - 11159429
Alignment:
Q  24 tggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgcta 123  Q
    ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11160261 tggtaaagtttctcgtagaaccccttcaagttcagtagttaatgcatctgtcatggttggtagaaatgatgataaagagacaataatgaacatgttgcta 11160162  T
Q  124 tctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgata 223  Q
    ||  ||||   |||   | |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||     
T  11160161 tcagagagtagcactggcaataacaatataggcgttgttgcaattttaggtatgggaggtgtcggtaaaacgacacttgcacaacttgtttacaataatg 11160062  T
Q  224 aagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttc 323  Q
    || |||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||  |||||      ||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  11160061 aaaaagttcaagatcattttgatttcaaagcatgggcttgtgtatctgaggattttgatattttatctgtaactaaaactcttcttgaatctgtcacttc 11159962  T
Q  324 tagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaat 423  Q
     ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  11159961 aagagcttgggaaaccaataatcttgattttcttcgagttgaactaaagaaaactttgagcgacaaaagatttttgtttgtgttggatgacctttggaat 11159862  T
Q  424 gacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagagg 523  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||| |||||||   |||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11159861 gacaattataatgattgggatgaacttgtaactcctttgattaatggaaacagtggaagcagggtcatcgtcacaacacgccaacaaaaagttgcagagg 11159762  T
Q  524 tagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaa 623  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    |    
T  11159761 ttgcacatacatttcctattcataaattagaagttttatctaatgaagatacatggtctttactctcaaagcatgcatttggaagtgaaaacttttgtga 11159662  T
Q  624 tagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttca 723  Q
     | ||||  | ||| ||| |||| ||| || |   ||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |  | |||||     
T  11159661 caataaaggctcaaacctagaagcaattggtagacagattgcaagaaagtgtgctgggttgcccatagctgcaaaaacacttggaggagtattgcgttcg 11159562  T
Q  724 actgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatc 823  Q
    |    |||    || |||||||||  | ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| || | ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  11159561 aaaagagatgccaaagagtggactgaagttttgaacaacaaaatatggaacttaccaaatgacaatgttttacctgcattgcttctgagttatcaatatc 11159462  T
Q  824 ttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  11159461 ttccctcccaattgaaaagatgtttttcatatt 11159429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 856
Target Start/End: Original strand, 13332733 - 13333561
Alignment:
Q  28 agagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctc 127  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | | || |  |||||| |||||     
T  13332733 agagtttctcttagaacgccttcaagttcaatggtaaatgaatctgttatggttggtaggaaggatgataaagagagactcattagtatgttgatatctg 13332832  T
Q  128 agagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaaga 227  Q
    | || | |||  || ||| || | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13332833 acagtggcactaccaatagtagtgttggtgtggttgcaattttgggtatgggcggtgttggcaaaaccactcttgcccaacttctttataatgataaaga 13332932  T
Q  228 agttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctaga 327  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |  |||  |||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |  | | ||||||||||||||| |||    
T  13332933 agttcaagaccattttgatctgaaagtctgggtttgtgtatcggaggatttcgatattctgagagtaactaaaaccattcatgaatctgtcacttcaaga 13333032  T
Q  328 acttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgaca 427  Q
      | | || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13333033 ggtggtgaaaacaataatcttgattttcttcgagttgaattgaataaaaacttgagggataaaagatttttgttagtgttggatgacctgtggaatgaca 13333132  T
Q  428 attataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagc 527  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||| | || |||   ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  13333133 attataatgattgggatgagttagtaactccactgattaacggcaaaaaaggaagtagggtgatcatcacaacacgccaacaaaaagttgcggaggttgc 13333232  T
Q  528 acacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagt 627  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||   ||    |||     
T  13333233 acacacgtttcctattcacaaagtagatcctctatcagatgatgactgttggtcgttactttcaaagcatgcattcggaagtgaagaccgtcgaggtaga 13333332  T
Q  628 aaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactg 727  Q
    ||  || |||  || |||||||| || |  |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||  |    
T  13333333 aagtacccaaatctagaagaaattggtagaaagattgccaaaaagtgtggtggattgcccatagctgctaaaacactcggaggaattttgcgttcaaagg 13333432  T
Q  728 tagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttcc 827  Q
    ||||   ||| ||||||||| ||||| | || ||  || ||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  13333433 tagatgcaaaagagtggactgcaattctaaatagtgacatatggaacttaccaaatgatacaattttacctgctttgcgtctaagttatcaatatcttcc 13333532  T
Q  828 ctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13333533 ctcacatttgaaaagatgttttgcctatt 13333561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 24 - 856
Target Start/End: Original strand, 8861111 - 8861943
Alignment:
Q  24 tggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgcta 123  Q
    ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8861111 tggtaaagtttctcgtagaaccccttcaagttcagtagttaatgaatctgtcatggttggtagaaatgatgataaagagacagtaatgaacatgttgcta 8861210  T
Q  124 tctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgata 223  Q
    ||  ||||   |||     |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  8861211 tcagagagcagcactaggaataacaatatcggtgttgttgcaattttaggtatgggaggtgtcggtaaaacgacacttgcacaacttgtttacaatgatg 8861310  T
Q  224 aagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttc 323  Q
    || |||||||| | || |||||| | || |||||| ||||||| || ||||||||  ||||| | |  ||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  8861311 aaaaagttcaagagcactttgatctcaaagcatgggcttgtgtatcagaggattttgatatttcaactgtaactaaaactcttcttgaatctgtcacttc 8861410  T
Q  324 tagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaat 423  Q
     ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8861411 aagagcttgggaaaacaataatcttgattttcttcgagttgaactaaagaaaacattgagagacaaaagatttttgtttgtgttggatgacctatggaat 8861510  T
Q  424 gacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagagg 523  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||| || ||| |||||||   |||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8861511 gacaattataatgagtgggatgaacttgtaactcctttgattaatggaaacagtggaagcagggtcatcgtcacaacacgccaacaaaaagttgcagagg 8861610  T
Q  524 tagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaa 623  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    |    
T  8861611 ttgcacatacatttcctattcataaattagaagttttatctaatgaagatacatggtctttactctcaaagcatgcatttggaagtgaaaacttttgtga 8861710  T
Q  624 tagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttca 723  Q
     | ||||  | ||| ||| |||| ||| || |  |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |  | |||||     
T  8861711 caataaatgctcaaacctagaagcaattggtagaaagattgcaagaaagtgtgctgggttgcccatagctgcaaaaacacttggaggagtattgcgttcg 8861810  T
Q  724 actgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatc 823  Q
    |    |||    || |||||||||  | ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| || | ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  8861811 aaaagagatgccaaagagtggactgaagttttgaacaacaaaatatggaacttaccaaatgacaatgttttacctgcattgcttctgagttatcaatatc 8861910  T
Q  824 ttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  8861911 ttccctcccaattgaaaagatgtttttcatatt 8861943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 856
Target Start/End: Original strand, 13170860 - 13171688
Alignment:
Q  28 agagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctc 127  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | | || |  |||||| |||||     
T  13170860 agagtttctctaagaacgccttcaagttcaatggtaaatgaatctgttatggttggaaggaaggatgataaagagagactcattagtatgttgatatctg 13170959  T
Q  128 agagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaaga 227  Q
    | || | |||  || ||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13170960 acagtggcactaccaatagtagtattggtgtggttgcaattttgggtatgggcggtgttggcaaaaccactcttgcccaacttctttataatgataaaga 13171059  T
Q  228 agttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctaga 327  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |  |||  |||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |  | | ||||||||||||||| |||    
T  13171060 agttcaagaccattttgatctgaaagtctgggtttgtgtatcggaggatttcgatattctgagagtaactaaaaccattcatgaatctgtcacttcaaga 13171159  T
Q  328 acttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgaca 427  Q
      | | || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  13171160 ggtggtgaaaacaataatcttgattttcttcgagttgaattgaatcaaaacttgagggataaaagatttttgttagtgctggacgatctgtggaatgata 13171259  T
Q  428 attataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagc 527  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||| | || ||| | ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  13171260 gttataatgattgggatgagttagtaactccattgattaacggcaaaacgggaagtatggtgatcatcacaacacgccaacaaaaagttgcggaggttgc 13171359  T
Q  528 acacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagt 627  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||   ||    |||     
T  13171360 acacacgtttcctattcacaaagtagatcctctatcagatgatgactgttggtcgttactttcaaagcatgcattcggaagtgaagaccgtcgaggtaga 13171459  T
Q  628 aaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactg 727  Q
    ||  || |||  || |||||||| || |  |||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||| || | |||||||  |    
T  13171460 aagtacccaaatctagaagaaattggtagaaagattgccaaaaagtgtggtggattgcccatagctcctaaaacactcggaggaattttgcgttcaaagg 13171559  T
Q  728 tagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttcc 827  Q
    ||||   ||| ||||||||| ||||| | || ||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  13171560 tagatgcaaaagagtggactgcaattctaaatagtgacatatggaacttaccaaatgataatattttacctgctttgcgtctaagttatcaatatcttcc 13171659  T
Q  828 ctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13171660 ctcacatttgaaaagatgttttgcctatt 13171688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 46 - 856
Target Start/End: Original strand, 13343936 - 13344746
Alignment:
Q  46 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctcagagagacacatcccata 145  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | | || |  |||||| ||||| | || | |||  || |||    
T  13343936 ccttcaagttcaatggtaaatgaatctgttatggttggtaggaaggatgataaagagagactcattagtatgttgatatctgacagtggcactaccaata 13344035  T
Q  146 ataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttga 245  Q
     || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13344036 gtagtattggtgtggttgcaattttgggtatgggcggtgttggcaaaaccactcttgcccaacttctttataatgataaagaagttcaagaccattttga 13344135  T
Q  246 tttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataat 345  Q
    | |||| |  |||  |||||| || ||||||||| |||||  |||||| || ||  |  | | ||||||||||||||| |||  | | || | |||||||    
T  13344136 tctgaaagtctgggtttgtgtatcggaggatttcgatattctgagagtcactaaaaccattcatgaatctgtcacttcaagaggtggtgaaaacaataat 13344235  T
Q  346 cttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13344236 cttgattttcttcgagttgaattgaatcaaaacttgagggataaaagatttttgttagtgctggacgatctgtggaatgatagttataatgattgggatg 13344335  T
Q  446 agctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattca 545  Q
    || |||||| ||| || ||| | || ||| | ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13344336 agttagtaactccattgattaacggcaaaacgggaagtatggtgatcatcacaacacgccaacaaaaagttgcggaggttgcacacacgtttcctattca 13344435  T
Q  546 taaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaa 645  Q
     ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||   ||    ||| ||  || |||  || |||    
T  13344436 caaagtagatcctctatcagatgatgactgttggtcgttactttcaaagcatgcattcggaagtgaagaccgtcgaggtagaaagtacccaaatctagaa 13344535  T
Q  646 gaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtgga 745  Q
    ||||| || |  |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||  |||||   ||| |||||||    
T  13344536 gaaattggtagaaagattgccaaaaagtgtggtggattgcccatagctgctaaaacactcggaggaattttgcgttcaaaggtagatgcaaaagagtgga 13344635  T
Q  746 cttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatg 845  Q
    || ||||| | || ||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13344636 ctgcaattctaaatagtgacatatggaacttaccaaatgataatattttacctgctttacgtctaagttatcaatatcttccctcacatttgaaaagatg 13344735  T
Q  846 ttttgcatatt 856  Q
    |||||| ||||    
T  13344736 ttttgcctatt 13344746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 46 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 11131248 - 11130438
Alignment:
Q  46 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctcagagagacacatcccata 145  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||   | |||    
T  11131248 ccttctagttctgtggttaatgaatcattcatggttggtagaaaggatgacaaagagacaataacgaacatgttgctatcaaagagcagcactagcaata 11131149  T
Q  146 ataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttga 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  11131148 acaatatcggtgttgttgcaattttaggtatgggaggtgtcggaaaaacaacccttgcacaaattgcttacaatgatgaaaaagttcaagaacactttga 11131049  T
Q  246 tttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataat 345  Q
    | | || |||||| ||||||| || ||||||||  |||||   |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||    
T  11131048 tctcaaagcatgggcttgtgtatcggaggattttgatattttaagagtaactaaaactctccttgaatctgtcacttcaagggcttgggaaaacaataat 11130949  T
Q  346 cttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatg 445  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||  || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11130948 cttgattttcttcgagttgaactgaagaaaactttgagagacaaaagatttttgtttgtgttggatgacctatggaatgacaattataatgattgggatg 11130849  T
Q  446 agctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattca 545  Q
    | || |||| ||| || ||| |||||||   |||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11130848 aacttgtaactcctttgattaatggaaacaatggaagcagggtcatcgtcacaacacgccaacaaaaagttgcagaggttgcacatacatttcctattca 11130749  T
Q  546 taaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaa 645  Q
    ||||||||||  | |||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    | | ||||  | ||| ||| |||    
T  11130748 taaattagaagttttatctaatgaagatacatggtctttactctcaaagcatgcatttggaagtgaaaacttttgtgacaataaatgctcaaacctagaa 11130649  T
Q  646 gaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtgga 745  Q
    | ||| || |  |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |  | ||||| |    |||    || |||||||    
T  11130648 gcaattggtagaaagattgcaagaaagtgtgctgggttgcccatagctgcaaaaacacttggaggagtattgcgttcgaaaagagatgctaaagagtgga 11130549  T
Q  746 cttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatg 845  Q
    ||  | ||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| |  | ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11130548 ctgaagttttggacaacaaaatatggaacttaccaaatgacaatgtgttacctgcattgcttctgagttatcaatatcttccctcccaattgaaaagatg 11130449  T
Q  846 ttttgcatatt 856  Q
    |||| ||||||    
T  11130448 tttttcatatt 11130438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 46 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 11149076 - 11148266
Alignment:
Q  46 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctcagagagacacatcccata 145  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||   |||   | |||    
T  11149076 ccttctagttctgtggttaatgaatcattcatggttggtagaaaggatgacaaagagataataacgaacatgttgctatcaaagagcagcactagcaata 11148977  T
Q  146 ataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttga 245  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  11148976 acaatatcggtgttgttgcaattttaggtatgggaggtgtcggaaaaacaacccttgcacaaattgcttacaatgatgaaaaagttcaagaacactttga 11148877  T
Q  246 tttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataat 345  Q
    | | || |||||| ||||||| || ||||||||  |||||   |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||    
T  11148876 tctcaaagcatgggcttgtgtatcggaggattttgatattttaagagtaactaaaactctccttgaatctgtcacttcaagggcttgggaaaacaataat 11148777  T
Q  346 cttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatg 445  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||  |  |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11148776 cttgattttcttcgagttgaactgaagaaaactttgagagccaaaagatttttgtttgtgttggatgacttatggaatgacaattataatgattgggatg 11148677  T
Q  446 agctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattca 545  Q
    | || ||||  || || ||| |||||||   |||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11148676 aacttgtaacacctttgattaatggaaacagtggaagcagggtcatcgtcacaacacgccaacaaaaagttgcagaggttgcacatacatttcctattca 11148577  T
Q  546 taaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaa 645  Q
    ||||||||||  | |||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    | | ||||  | ||| ||| |||    
T  11148576 taaattagaagttttatctaatgaagatacatggtctttactctcaaagcatgcatttggaagtgaaaacttttgtgacaataaatgctcaaacctagaa 11148477  T
Q  646 gaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtgga 745  Q
    | ||| || |  |||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||    |||    || |||||||    
T  11148476 gcaattggtagaaagattgcaagaaagtgtgttgggttgcccatagctgcaaaaacacttggaggagtattgcgttcaaaaagagatgccaaagagtgga 11148377  T
Q  746 cttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatg 845  Q
    ||  | ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| |  | ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11148376 ctgaagttttgaacaacaaaatatggaacttaccaaatgacaatgtgttacctgcattgcttctgagttatcaatatcttccctcccaattgaaaagatg 11148277  T
Q  846 ttttgcatatt 856  Q
    |||| ||||||    
T  11148276 tttttcatatt 11148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 856
Target Start/End: Original strand, 13289494 - 13290322
Alignment:
Q  28 agagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctc 127  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | | || |  |||||| |||||     
T  13289494 agagtttctcttagaacgccttcaagttcaatggtaaataaatctgttatggttggtaggaaggatgataaagagagactcattagtatgttgatatctg 13289593  T
Q  128 agagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaaga 227  Q
    | || | |||  || ||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13289594 acagtggcactaccaatagtagtattggtgtggtcgcaattttgggtatgggcggtgttggcaaaaccactcttgcccaacttctttataatgataaaga 13289693  T
Q  228 agttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctaga 327  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |  |||  |||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |  | | ||||||||||||||| |||    
T  13289694 agttcaagaccattttgatctgaaagtctgggtttgtgtatcggaggatttcgatattttgagagtaactaaaaccattcatgaatctgtcacttcaaga 13289793  T
Q  328 acttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgaca 427  Q
      | | || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  13289794 ggtggtgaaagcaataatcttgattctcttcgagttgaactgaatcaaaacttgagggataaaagatttttgttggtgctggacgatctgtggaatgata 13289893  T
Q  428 attataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagc 527  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||| | || ||| | ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  13289894 gttataatgattgggatgagttagtaactccattgattaacggcaaaacaggaagtagggtgatcatcacaacacgccaacaaaaagttgcggaggttgc 13289993  T
Q  528 acacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagt 627  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |    |     ||||    
T  13289994 acacacgtttcctattcacaaagtagatcctctatcagatgatgactgttggtcgttactttcaaagcatgcatttggaagtgaagtccgtggtggtagt 13290093  T
Q  628 aaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactg 727  Q
    |||  | |||  || |||||||| || |  ||||| || | ||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || || ||| || | |||||||  |    
T  13290094 aaatgcccaaatctggaagaaattggtagaaagatcgccaaaaaatgtggtgggttgcccatagctgctaaaacgctcggtggaattttgcgttcaaagg 13290193  T
Q  728 tagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttcc 827  Q
    ||||    || ||||||| | ||||| | || ||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  13290194 tagatgctaaagagtggagtacaattctaaatagtgacatatggaacttaccaaatgataatattttacctgctttgcgtctaagttatcaatatcttcc 13290293  T
Q  828 ctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13290294 ctcacatttgaaaagatgttttgcctatt 13290322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 854
Target Start/End: Original strand, 10889131 - 10889961
Alignment:
Q  24 tggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgcta 123  Q
    ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10889131 tggtaaagtttctcgtagaaccccttcaagttcagtagttaatgaatctgtcatggttggtagaaatgatgataaagagacaataatgaacatgttgcta 10889230  T
Q  124 tctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgata 223  Q
    ||  ||||   |||     |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  10889231 tcagagagcagcactaggaataacaatatcggtgttgttgcaattttaggtatgggaggtgtcggtaaaacgacacttgcacaacttgtttacaatgatg 10889330  T
Q  224 aagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttc 323  Q
    || |||||||| | || |||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||  |||||   |  ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||    
T  10889331 aaaaagttcaagagcactttgatctcaaagcatgggcttgtgtatctgaggattttgatattttaactgtaactaaaactcttcttgaatctgtgacttc 10889430  T
Q  324 tagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaat 423  Q
     ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | ||  || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  10889431 aagagcttgggaaaacaataatctagattttcttcgagttgaactaaagaaaactttgagagacaaaagatttttgtttgtgttggatgacctatggaat 10889530  T
Q  424 gacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagagg 523  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||| |||||||   |||||| |||||  |  | ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10889531 gacaattataatgattgggatgaacttgtaactcctttgattaatggaaacagtggaagcagggtcgtcatcacaacacgccagcaaaaagttgcagagg 10889630  T
Q  524 tagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaa 623  Q
    | |||||||| | ||||||||| |||||||||  | |||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    |    
T  10889631 ttgcacacacgtatcctattcacaaattagaagttttatctaatgaagatacatggtctttactctcaaagcatgcatttggaagtgaaaacttttgtga 10889730  T
Q  624 tagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttca 723  Q
     | ||||  | ||| ||| |||| ||| || |   ||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |  | |||||     
T  10889731 caataaatgctcaaacctagaagcaattggtagacagattgcaagaaagtgtgctgggttgcccatagctgcaaaaacacttggaggagtattgcgttcg 10889830  T
Q  724 actgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatc 823  Q
    |    |||    || || ||||||  | ||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||| || | ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  10889831 aaaagagatgccaaagaatggactgaagttttgaacaacaaaatatggaacttaccaaatgacaatgttttacctgcattgcttctgagttatcaatatc 10889930  T
Q  824 ttccctctcatttgaaaagatgttttgcata 854  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  10889931 ttccctcccaattgaaaagatgtttttcata 10889961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 856
Target Start/End: Original strand, 13160809 - 13161637
Alignment:
Q  28 agagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctc 127  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| | |  | |  |||||| |||||     
T  13160809 agagtttctctaagaacgccttcaagttcaatggtaaatgaatctgttatggttggtaggaaggatgataaggagagactcgttagtatgttgatatctg 13160908  T
Q  128 agagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaaga 227  Q
    | || | |||  || ||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13160909 acagtggcactaccaatagtagtattggtgtggttgcaattttgggtatgggcggtgttggcaaaaccactcttgcccaacttctttataatgataaaga 13161008  T
Q  228 agttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctaga 327  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |  |||  |||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |  | | |||||||||||| || |||    
T  13161009 agttcaagaccattttgatctgaaagtctgggtttgtgtatcggaggatttcgatattctgagagtaactaaaaccattcatgaatctgtcacctcaaga 13161108  T
Q  328 acttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgaca 427  Q
     || | || |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  13161109 gctggcgaaagcaataatcttgattctcttcgagttgagttgaataaaaacttgagggataaaagatttttgttagtgctggacgatctgtggaatgata 13161208  T
Q  428 attataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagc 527  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||| | || ||| | ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  13161209 gttataatgattgggatgagttagtaactccattgattaacggcaaaacgggaagtagggtgatcatcacaacacgccaacaaaaagttgcggaggttgc 13161308  T
Q  528 acacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagt 627  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |    |     ||||    
T  13161309 acacacgtttcctattcacaaagtagatcctctatcagatgatgactgttggtcgttactttcaaagcatgcatttggaagtgaagtccgtggtggtagt 13161408  T
Q  628 aaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactg 727  Q
    |||  | |||  || |||||||| || |  ||||| || | ||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || || ||| || | |||||||  |    
T  13161409 aaatgcccaaatctggaagaaattggtagaaagatcgccaaaaaatgtggtgggttgcccatagctgctaaaacgctcggtggaattttgcgttcaaagg 13161508  T
Q  728 tagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttcc 827  Q
    ||||    || ||||||| | ||||| | || ||  || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  13161509 tagatgctaaagagtggagtacaattctaaatagtgacatatggaacttaccaaatgatcatattttacctgctttgcgtctaagttatcaatatcttcc 13161608  T
Q  828 ctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13161609 ctcacatttgaaaagatgttttgcctatt 13161637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 330 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 11781920 - 11781402
Alignment:
Q  330 ttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaat 429  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||    
T  11781920 ttgggaaagcgataatcttgatatccttcgagttgaattgaaaaagaactcgagggagaaaagatttttgtttgtgttagatgatttgtggaatgatgat 11781821  T
Q  430 tataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcac 529  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11781820 tacaatgattggcttgagctagtaagtccactcaatgatggaaaacctggaagttcggtgattataacaactcgccaacaaaaagttgcagaggtggcac 11781721  T
Q  530 acacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaa 629  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| | || | | |     ||||    
T  11781720 acacatttcctattcatgcattagaacctctatctcatgaagattgttggtctttactctcgaaacatgcatttggtagtaaggactgtgatcgccgtaa 11781621  T
Q  630 aaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgta 729  Q
    | || ||| ||| ||||| || |||| ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||  |||    
T  11781620 atacccaaacctagaagagattggcaggaagattgctaaaaaatgtggtggattgccaatagctgccaagacacttggaggacttatgcgttcaaaggta 11781521  T
Q  730 gacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccct 829  Q
    |    ||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11781520 gttgaaaaggagtggacttcaattctcaacagcaatatatggaacttacgaaatgataaagttttgcctgctttgcatttgagttatcaatatcttcctt 11781421  T
Q  830 ctcatttgaaaagatgttt 848  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11781420 ctcatttgaaaagatgttt 11781402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 330 - 848
Target Start/End: Original strand, 10517616 - 10518134
Alignment:
Q  330 ttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaat 429  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||    
T  10517616 ttgggaaagcgataatcttgatatccttcgagttgaattgaaaaagaactcgagggagaaaagatttttgtttgtgttagatgatttgtggaatgatgat 10517715  T
Q  430 tataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcac 529  Q
    || |||||||||  ||| |||||||||||  ||| |||||||||||| || |||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10517716 tacaatgattggcttgaactagtaagtccactcaatgatggaaaacccgggagttcggtgattataacaacgcgccaacaaaaagttgcagaggtggcac 10517815  T
Q  530 acacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaa 629  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||   | |  | |||||    
T  10517816 acacatttcctattcaggaattagaacctctatctcatgaagattgttggtctttactctcaaaacatgcatttggtagtaaggacagtgatcacagtaa 10517915  T
Q  630 aaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgta 729  Q
    | || |||  |||||||| || |||| ||||||||| | ||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||  |||    
T  10517916 atacccaaatcttgaagagattggcaggaagattgctaaaaaatgtggtgggttaccaatagctgccaaaacacttggaggacttatgcgttcaaaggta 10518015  T
Q  730 gacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccct 829  Q
    |    ||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10518016 gttgaaaaggagtggtcttcaattctaaacagcaacatatggaacttacgaaatgataaaattttgcctgctttgcatttgagttatcaatatcttcctt 10518115  T
Q  830 ctcatttgaaaagatgttt 848  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10518116 ctcatttgaaaagatgttt 10518134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 644 - 856
Target Start/End: Original strand, 10672127 - 10672339
Alignment:
Q  644 aagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtg 743  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  10672127 aagaaataggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaatagctgctaaaacaataggaggacttctacgttcaaaggtagacataactgagtg 10672226  T
Q  744 gacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaaga 843  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10672227 gacttcaattttgaacagcaacatatgaaacttgcgaaatgataatattcttcctgctttgcatttgagttatcaatatcttccctctcatttgaaaaga 10672326  T
Q  844 tgttttgcatatt 856  Q
    |||||||||||||    
T  10672327 tgttttgcatatt 10672339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 337 - 856
Target Start/End: Original strand, 10500712 - 10501231
Alignment:
Q  337 agcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatg 436  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||   | || ||| | |||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||  ||    
T  10500712 agcaataatcttgatatccttcaagttgagttaatgaaacatttgatggatagaagatttttgtttgtgttggacgacatgtggaatgacagttatgttg 10500811  T
Q  437 attgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatt 536  Q
    | ||||||||| || ||| |||||| | | |  || || | ||| | |  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  10500812 actgggatgagttaataactcccttgactaacagagaaacaggaggcaaagtgataataacaacacgcgaacaaaaagttgcagaggtcgcatgcacatt 10500911  T
Q  537 tcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacaca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||| || | |     | ||||| || ||    
T  10500912 tcctattcataaattagaacctctatctgatgatgattgttggactttactctcgaagcatgcatttggtgatgaagactatgttcgtggtaaataccca 10501011  T
Q  637 atccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataa 736  Q
    |  || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||  | |||||||  |  |    ||    
T  10501012 aagctagaagagattggcaggaagattgctagaaagtgtggtggattgccgatagctgcaaaagcacttggaggactattgcgttcaaaggcggttgaaa 10501111  T
Q  737 atgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcattt 836  Q
    | ||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||  ||||||||  ||| | ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10501112 aagagtggactgcaattctgaatagcgacatatggaacttaagaaatgatacaattttgcccactttgtatttgagttatcaatatcttccctctcattt 10501211  T
Q  837 gaaaagatgttttgcatatt 856  Q
     |||||||| ||||| ||||    
T  10501212 aaaaagatgctttgcctatt 10501231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 317
Target Start/End: Original strand, 10500374 - 10500674
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | | |  | || |||||    
T  10500374 taagtggtagagtttctcgtagaacaccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaatgatgataaagatagactcgtcaatatgtt 10500473  T
Q  120 gctatctcagagagacacatccc---ataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttac 216  Q
    | ||||  | |  |  |||  |    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  10500474 ggtatcagatattggaacaggcagaaataataatttaggtgttgttgcaattttgggtatgggaggcgtcggtaaaacaacacttgctcaacttgtttac 10500573  T
Q  217 aatgataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctg 316  Q
    || ||  |  || || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||| || ||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  10500574 aacgacgataaaattgaagaacattttgatctgaaggcatggatttgtgtaccggaggatttcgatgttgtgagaataaccaaatctctccttgaatctg 10500673  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  10500674 t 10500674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Original strand, 10527281 - 10527455
Alignment:
Q  143 ataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattt 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||| |||||    
T  10527281 ataataatttaggtgttgttgcaatcttgggtatgggaggtgtcggtaaaacaacccttgcacaacttgtttacaatgatgaaaaggttgaacaccattt 10527380  T
Q  243 tgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgt 317  Q
    |||| | ||||| |||  || ||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10527381 tgatctcaaggcctgggtttatgtatcagaggatttcgatgttgtgagagtaaccaagtctctcattgaatctgt 10527455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11782128 - 11781954
Alignment:
Q  143 ataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattt 242  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||||| || |||||||||||||||    ||||| ||||||||||    
T  11782128 ataataatttaggtgttgtcgcaattttgggtatgggaggcgtcggtaaaacgacccttgcacagcttgtttacaatgatgtgaaagttgaacaacattt 11782029  T
Q  243 tgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgt 317  Q
    |||||| || |  |||  |||||| || ||||||||| || ||   ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11782028 tgatttcaaagtctgggtttgtgtatcggaggatttcgatgttgttagaataaccaagtctctccttgaatctgt 11781954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 315
Target Start/End: Original strand, 10517408 - 10517580
Alignment:
Q  143 ataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattt 242  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  | || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  10517408 ataataatttaggtgttgctgcaattgtgggtatgggaggcgtcggtaaaacgacccttgcacagtttgtttacaatgatgcaaaagttgaacaacattt 10517507  T
Q  243 tgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatct 315  Q
    |||||| || || |||  |||||| |||||||||||  || |||  |||| |||||||||| | |||||||||    
T  10517508 tgatttcaaagcctgggtttgtgtatctgaggattttgatgttattagagcaaccaagtctatccttgaatct 10517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Original strand, 10527156 - 10527237
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaaga 101  Q
    |||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  10527156 taagtgatagattttctcgtagaaccccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcattgtgggtaggaatgatgataaaga 10527237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11153739 - 11153523
Alignment:
Q  302 ctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggaga-aaagatttttgt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| | |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||  |||| ||||||||||      
T  11153739 ctctccttgaatctgtcacttcaagagcatatgaaagtaacaatcttgattttcttcgagttgagttaaagaaaattctga--gagacaaagattttttg 11153642  T
Q  401 ttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaac 500  Q
    ||||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||||  ||||| || |||| ||| || ||| ||||||||  |||||| || |||||  | |||||    
T  11153641 ttgtgttggatgacttatggaatgataattataacgattcagatgaacttgtaactccattgatttatggaaaaagtggaagcagagtgatcatcacaac 11153542  T
Q  501 acgcaaacaaaaagttgca 519  Q
    |||| || |||||||||||    
T  11153541 acgccaagaaaaagttgca 11153523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 774 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 11246115 - 11246027
Alignment:
Q  774 cttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatattcttcga 862  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11246115 cttaccaaatgataacatattgcctgcattgcttctgagctatcaatatctttcctctcaattgaaaagatgttttgcctattgttcga 11246027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 11782254 - 11782173
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaaga 101  Q
    |||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11782254 taagtggtggagtttcttctagaaccccttcaagttcagtgctaaatcaatctgacgtggtgggtaggaatgatgataaaga 11782173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 767 - 856
Target Start/End: Original strand, 13396057 - 13396146
Alignment:
Q  767 tatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||  | |||  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13396057 tatggaacataccaaatgataatattatgccttctttgtttctgacatatcaacatcttccttcccatttgaaaagatgttttgcctatt 13396146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 101
Target Start/End: Original strand, 10517310 - 10517363
Alignment:
Q  48 ttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaaga 101  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  10517310 ttcaagttcggtgctaaatgaatctgacgtggtgggtaggaatgatgataaaga 10517363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 540; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 856
Target Start/End: Original strand, 26906719 - 26907554
Alignment:
Q  21 aagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttg 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26906719 aagtgctagagtttctcgtagaacaccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaatatgttg 26906818  T
Q  121 ctatctcagagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatg 220  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26906819 ctatcagagagagacacaacccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttaggaaaaactacccttgcccaacttctttacaatg 26906918  T
Q  221 ataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcac 320  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26906919 ataaagaagttcaacggcattttgatttgaaggcatgggtttgtgtgtctgaggattttgatattatgagagtaaccaaatctctccttgaatcggtcac 26907018  T
Q  321 ttctagaacttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtgg 420  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26907019 ttccagaacttgggataccaataatcttgatgtccttcgagttgagttaaggaaaaactcaagggagaaaagatttttgtttgtgttggatgacctgtgg 26907118  T
Q  421 aatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcag 520  Q
    || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26907119 aacgacaattatagtgattgggaagaacttgtaagtcccttcattcatggaaaacctggaagcatggtgattataacaacgcgccaacaaaaagttgcag 26907218  T
Q  521 aggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttca 620  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26907219 aggtggcacatacatttcctatacataaattagaacctctatcaactgaagattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtaaagagtttca 26907318  T
Q  621 caatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgt 720  Q
    | ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26907319 ccatagtattaacacaaccctcgaagaaattggcaggaagattgcaagaaagtgtggaggattgccaattgctgctaaaacactaggaggaattctacgt 26907418  T
Q  721 tcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaat 820  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26907419 tcaaaggtagacataacagagtggacttcaattttgaacaacgacgtatggaacttacgaaatgataatattcttccagctttgcatttgagttatcaat 26907518  T
Q  821 atcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26907519 accttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 26907554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 136128 - 135300
Alignment:
Q  28 agagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctc 127  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | | || |  |||||| |||||     
T  136128 agagtttctctaagaacgccttcaagttcaatggtaaatgaatctgttatggttggaaggaaggatgataaagagagactcattagtatgttgatatctg 136029  T
Q  128 agagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaaga 227  Q
    | || | |||  || ||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  136028 acagtggcactaccaatagtagtattggtgtggttgcaattttgggtatgggcggtgttggcaaaaccactcttgcccaacttctttataatgataaaga 135929  T
Q  228 agttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctaga 327  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |  |||  |||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |  | | ||||||||||||||| |||    
T  135928 agttcaagaccattttgatctgaaagtctgggtttgtgtatcggaggatttcgatattctgagagtaactaaaaccattcatgaatctgtcacttcaaga 135829  T
Q  328 acttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgaca 427  Q
      | | || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  135828 ggtggtgaaaacaataatcttgattttcttcgagttgaattgaatcaaaacttgagggataaaagatttttgttagtgctggacgatctgtggaatgata 135729  T
Q  428 attataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagc 527  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||| | || ||| | ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  135728 gttataatgattgggatgagttagtaactccattgattaacggcaaaacgggaagtatggtgatcatcacaacacgccaacaaaaagttgcggaggttgc 135629  T
Q  528 acacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagt 627  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||   ||    |||     
T  135628 acacacgtttcctattcacaaagtagatcctctatcagatgatgactgttggtcgttactttcaaagcatgcattcggaagtgaagaccgtcgaggtaga 135529  T
Q  628 aaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactg 727  Q
    ||  || |||  || |||||||| || |  |||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| |||||| || | |||||||  |    
T  135528 aagtacccaaatctagaagaaattggtagaaagattgccaaaaagtgtggtggattgcccatagctcctaaaacactcggaggaattttgcgttcaaagg 135429  T
Q  728 tagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttcc 827  Q
    ||||   ||| ||||||||| ||||| | || ||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  135428 tagatgcaaaagagtggactgcaattctaaatagtgacatatggaacttaccaaatgataatattttacctgctttgcgtctaagttatcaatatcttcc 135329  T
Q  828 ctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  135328 ctcacatttgaaaagatgttttgcctatt 135300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 146179 - 145351
Alignment:
Q  28 agagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaagagacaataatgaacatgttgctatctc 127  Q
    ||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | | || |  |||||| |||||     
T  146179 agagtttctctaagaacgccttcaagttcaatggtaaatgaatctgttatggttggtaggaaggatgataaagagagactcattagtatgttgatatctg 146080  T
Q  128 agagagacacatcccataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaaga 227  Q
    | || | |||  || ||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  146079 acagtggcactaccaatagtagtattggtgtggttgcaattttgggtatgggcggtgttggcaaaaccactcttgcccaacttctttataatgataaaga 145980  T
Q  228 agttcaacaacattttgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctaga 327  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| |  |||  |||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |  | | ||||||||||||||| |||    
T  145979 agttcaagaccattttgatctgaaagtctgggtttgtgtatcggaggatttcgatattctgagagtaactaaaaccattcatgaatctgtcacttcaaga 145880  T
Q  328 acttgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgaca 427  Q
      | | || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  145879 ggtggtgaaaacaataatcttgattttcttcgagttgaattgaatcaaaacttgagggataaaagatttttgttagtgctggacgatctgtggaatgata 145780  T
Q  428 attataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagc 527  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||| | || ||| | ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  145779 gttataatgattgggatgagttagtaactccattgattaacggcaaaacgggaagtatggtgatcatcacaacacgccaacaaaaagttgcggaggttgc 145680  T
Q  528 acacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagt 627  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||   ||    |||     
T  145679 acacacgtttcctattcacaaagtagatcctctatcagatgatgactgttggtcgttactttcaaagcatgcattcggaagtgaagaccgtcgaggtaga 145580  T
Q  628 aaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactg 727  Q
    ||  || |||  || |||||||| || |  |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||  |    
T  145579 aagtacccaaatctagaagaaattggtagaaagattgccaaaaagtgtggtggattgcccatagctgctaaaacactcggaggaattttgcgttcaaagg 145480  T
Q  728 tagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttcc 827  Q
    ||||   ||| ||||||||| ||||| | || ||  || ||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  145479 tagatgcaaaagagtggactgcaattctaaatagtgacatatggaacttaccaaatgatacaattttacctgctttgcgtctaagttatcaatatcttcc 145380  T
Q  828 ctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  145379 ctcacatttgaaaagatgttttgcctatt 145351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 496 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 154016 - 153656
Alignment:
Q  496 acaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagc 595  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  154016 acaacacgccaacaaaaagttgcggaggttgcacacacgtttcctattcacaaagtagatcctctatcagatgatgactgttggtcgttactttcaaagc 153917  T
Q  596 atgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgc 695  Q
    ||||||| |||||||| ||   ||    ||| ||  || |||  || |||||||| || |  |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  153916 atgcattcggaagtgaagaccgtcgaggtagaaagtacccaaatctagaagaaattggtagaaagattgccaaaaagtgtggtggattgcccatagctgc 153817  T
Q  696 taaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattctt 795  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||||  |||||   ||| ||||||||| ||||| | || ||  || ||||| |||||||||||||||  ||| |     
T  153816 taaaacactcggaggaattttgcgttcaaaggtagatgcaaaagagtggactgcaattctaaatagtgacatatggaacttaccaaatgatacaatttta 153717  T
Q  796 cctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    |||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  153716 cctgctttgcgtctaagttatcaatatcttccctcacatttgaaaagatgttttgcctatt 153656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 156 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 31679845 - 31679153
Alignment:
Q  156 tgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttgatttgaaggca 255  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||  |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | || ||     
T  31679845 tgttgtttcaattttcggcatgggaggtgtcggtaaaacagccctagctcaacttctttacaatgataaagatgttcaagaacgttttgatgtaaaagct 31679746  T
Q  256 tggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaataatcttgattttc 355  Q
    |||  |||| |||| || || ||  || ||  ||| |||||||   || | ||||||||| ||||||| |    |  ||| ||  |||||||||||||||    
T  31679745 tgggtttgtctgtccgaagagtttgatgttttgagggtaaccagaactttacttgaatctatcacttcaaatgttcaggaaagtgataatcttgattttc 31679646  T
Q  356 ttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatgagctagtaag 455  Q
    |||||||  |||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |  |||||||||||| || | ||||| |     
T  31679645 ttcgagtcaaattaaagcaaaacttgaagggaaaaagatttttgtttgtgttggatgacatgtggaatgatagctataatgattggcatcatctagtcac 31679546  T
Q  456 tcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattcataaattagaa 555  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||| ||| |  | || || ||||||||  |||||||||||    
T  31679545 tcccttcattgatggagaatctggaagtagggtgattatcacaacacgtcaataaaaagttgccgagttcacccatacctttcctatctataaattagaa 31679446  T
Q  556 cctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggca 655  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||       ||||| || ||| ||| |||| ||| || |    
T  31679445 cctctatcagatgatgattgctggtctttactctcaaagcatgcatttggaagtgaagaactttgtggccgtaaatacccaagcctagaagcaattggta 31679346  T
Q  656 agaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtggacttcaatttt 755  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||    || ||||||| | |||||||    
T  31679345 ggaagattgcaaaaaagtgttgcggattgccaatagctgccaaaacacttggaggacttctacgctcaaaagtggatgcgaaagagtggagtgcaatttt 31679246  T
Q  756 gaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgttt 848  Q
     ||||   || ||||| | || |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31679245 aaacaatgacatatggaattttccaaatgataatgttctccctgccttgcttttgagttatcaatatcttccttctcatttgaaaacatgttt 31679153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 562 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 58126 - 57823
Alignment:
Q  562 tcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaaga 661  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||| |||| |||||    
T  58126 tcaaatgaagattgttggtctttactctcaaactatgcattgggaagtgatgagtttcaccatagtacaaatacagcccttgaagaaattggcaggaaga 58027  T
Q  662 ttgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtggacttcaa---------t 752  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||   ||||||||||||         |    
T  58026 ttgcaagaaggtgtgggggattgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctcctttcaaaggtagacataacatagtggacttcaattttttcaat 57927  T
Q  753 tttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgttttgca 852  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  57926 tttgaacagcagcatatggaacttgcgaaatgataatattcttcctgctttgcatttgagttatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgctttgca 57827  T
Q  853 tatt 856  Q
    ||||    
T  57826 tatt 57823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 50030 - 49981
Alignment:
Q  46 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatga 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50030 ccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatga 49981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 331 - 848
Target Start/End: Original strand, 11485170 - 11485687
Alignment:
Q  331 tgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaatt 430  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||    | |||||| | |||| ||||||||||| |||| ||  | ||||| |||||||    
T  11485170 tgggaaagcaataatcttgatatccttcaagttgaattaatgaagcatttgaaggatagaagaattttgtttgtgttggacgacatatggaacgacaatt 11485269  T
Q  431 ataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcaca 530  Q
    ||  ||||||||||  | || ||| |||||| ||| ||||| || ||| ||| | ||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||| |||      
T  11485270 atcttgattgggatcggttaataactcccttgattaatggagaaactgtaagcaaggtgatcataacaacacgcgaagagaaagttgcagaggtcgcatg 11485369  T
Q  531 cacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaa 630  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| || ||||      |||||    
T  11485370 cgcatttcctattcataaattagaacctctatctgatgaagattgttggtctttactctcgaagcatgcatttggcggtgaagaatttcttcggggtaaa 11485469  T
Q  631 aacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtag 730  Q
     || ||| ||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||  | | |||||  ||||    
T  11485470 tacccaaacctagaagagattggcaggaagattgctagaaagtgtggtggattgccaattgctgcaaaagcacttggaggactaatgcattcaaaggtag 11485569  T
Q  731 acataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctc 830  Q
        ||| ||||||||| ||||| || | ||| || ||||| |||||  ||||||||  || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11485570 ttgaaaaggagtggactacaattctgcatagcgacatatggaacttaaaaaatgatacaatcctgccagctttgcatttgagttatcaatatcttccctc 11485669  T
Q  831 tcatttgaaaagatgttt 848  Q
    |||||| |||||||||||    
T  11485670 tcatttaaaaagatgttt 11485687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 494 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 44957462 - 44957109
Alignment:
Q  494 taacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaa 593  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44957462 taacaacacgtgaacaaaacgttgcagaggttgcacacacatttccgattcataaattagaacctctatctgatgaagattgttggtctttactctcaaa 44957363  T
Q  594 gcatgcattgggaagtgatga--gt-ttcacaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaata 690  Q
    ||||||||| |  || || ||  || ||||    ||  || || ||| ||| ||||| || |||| ||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||    
T  44957362 gcatgcatttgacagcgaagaccgtgttca----aggtaatacccaaacctagaagagattggcaggaagattgctaaaaaatgtggtggattgccaata 44957267  T
Q  691 gctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataata 790  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||   |||    ||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||| || ||||||||  |    
T  44957266 gctgccaaaacactgggaggacttatgcgttcaaagatagttgaaaaggagtggacttcaattctgaatagcgacatatggaactaacgaaatgatacaa 44957167  T
Q  791 ttcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgttt 848  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44957166 ttttgcctgctttgcatttgagttatcaatatcttccttctcatttgaaaagatgttt 44957109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Original strand, 11484961 - 11485135
Alignment:
Q  143 ataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattt 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||    
T  11484961 ataataatttaggtgttgttgcaattttggttatgggaggcgtcggtaaaacgacccttgcacaacttgtttacaacgatgaaaaagttgaacagcattt 11485060  T
Q  243 tgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgt 317  Q
    |||| | || ||||||  |||||| || ||||||||| || |   |||  |||||||||| || |||||||||||    
T  11485061 tgatctcaaagcatgggtttgtgtatcggaggatttcgatgtcgtgaggataaccaagtccctccttgaatctgt 11485135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44957834 - 44957664
Alignment:
Q  143 ataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattt 242  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||| | || ||||| || || || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  44957834 ataataatttaggtgttgttgccaccttaggtatgggaggtgtcggtaaaacgactctcgcacaacttgtttacaatgatataaaagttgaacaacattt 44957735  T
Q  243 tgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaat 313  Q
     ||| | || |||||||  ||||| || |||||||||||| ||   ||| |||| |||||||| |||||||    
T  44957734 cgatctcaaagcatggatatgtgtatcagaggatttcaatgttgttagaataacaaagtctcttcttgaat 44957664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Original strand, 11484835 - 11484904
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaa 89  Q
    |||| ||||||||||||| ||||   || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11484835 taagaggtagagtttctcgtagaacaccatcaagttcagtggtgaatgaatctgttatggtgggaaggaa 11484904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 44957956 - 44957876
Alignment:
Q  21 aagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaaga 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||  |||| |||||    
T  44957956 aagtgctagagtttctcatagaacaccttcaagttcaggggttaatgaatctattatggtgggcaggaaacatgataaaga 44957876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 331 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44957625 - 44957515
Alignment:
Q  331 tgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaatt 430  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||   | || ||| | |||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  44957625 tgggaaagcgataatcttgatatccttcaagttgaattaatgaaacatttgatggatagaagatttttgtttgtgttggacgacatatggaatgacaatt 44957526  T
Q  431 ataatgattgg 441  Q
    |||  ||||||    
T  44957525 atatcgattgg 44957515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 331 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 17852860 - 17852335
Alignment:
Q  331 tgggagagcaataatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaatt 430  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||   | || ||| | |||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  17852860 tgggaaagcgataatcttgatatcctccgagttgaattaatgaaacaattgatggatagaagatttttgtttgtgttggacgacttatggaatgacaatt 17852761  T
Q  431 ataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtagggtgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcaca 530  Q
    |   |||||||  ||||||||||| ||||||  || | |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||  | |||||||||| ||||| ||||     
T  17852760 acgttgattggagtgagctagtaactcccttgtttaagggaaaagctggaagcaaggtcatcataacaacacgcctaaaaaaagttgcggaggttgcacg 17852661  T
Q  531 cacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttactctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaa 630  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||    | ||||||    
T  17852660 cacatttccaattcataaattagaacctatatccgatgaagattgttggtctttgctctcaaagcatgcatttggaggtgaagaccttggtcacagtaaa 17852561  T
Q  631 aacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtag 730  Q
     || |||   | |||| ||| |||| ||||||  | ||||||||||  ||  ||||||||||||| ||| |||| || |||||  | || || |  ||||    
T  17852560 tactcaaatttagaagcaattggcaggaagatatctagaaagtgtgatggcttgccaatagctgccaaagcactcggtggactaatgcgctcgaaggtag 17852461  T
Q  731 acataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctc 830  Q
    |   ||||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||| | |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17852460 atgaaaatgagtggactgcaattctgaatagcgatatatggcaattacaaaatgataaaattctcccggctttgcatttgagttatcaatatcttccgtc 17852361  T
Q  831 tcatttgaaaagatgttttgcatatt 856  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17852360 tcatttgaaaatatgttttgcatatt 17852335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17853069 - 17852895
Alignment:
Q  143 ataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattt 242  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || | ||| |||| |||||    
T  17853069 ataacaatttaggtgttgttgcaatattggggatgggaggtgtcggtaaaacgacccttgcacagcttgtttacaatgatgaaaaggttgaacatcattt 17852970  T
Q  243 tgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgt 317  Q
    |||| | || || |||  |||||| || || |||||  || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17852969 tgatctcaaagcctgggtttgtgtatcagaagattttgatgttgtgagagtaaccaagtctctccttgaatctgt 17852895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17853195 - 17853116
Alignment:
Q  20 taagtggtagagtttctcatagactgccttcaagttcagtggtaaatgaatctgtcatggtgggtaggaaggatgacaaa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  17853195 taagtggtagagtttctcgtagaaccccttcaagttccgtggtaaatgaatctgtcatggtaggaaggaatgatgataaa 17853116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7129044 - 7128992
Alignment:
Q  199 cttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattttgatttgaa 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7129044 cttgctcaacttgtatacaatgacaaagaagtgcaacaacattttgagttgaa 7128992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 388 - 848
Target Start/End: Original strand, 826100 - 826551
Alignment:
Q  388 aaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatgacaattataatgattgggatgagctagtaagtcccttcattgatggaaaacctggaagtaggg 487  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | ||||||||| ||| |||| ||| |   ||| ||  || |||||||   |||||||||||    
T  826100 aaaagatttttgtttgtgttggatggcttatggaatgatagttataatgactggcatgatctaattgctccattggttaatggaaattgtggaagtaggg 826199  T
Q  488 tgattgtaacaacacgcaaacaaaaagttgcagaggtagcacacacatttcctattcataaattagaacctctatcaaatgatgattgttggtctttact 587  Q
    ||||  | ||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||  | ||  ||||||||||||||||    
T  826200 tgatcatcacaacacgctacgaaagagttgcagaggttgcacatacgtatcctattcataaattggaacctctatcggacgaacattgttggtctttact 826299  T
Q  588 ctcaaagcatgcattgggaagtgatgagtttcacaatagtaaaaacacaatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgcca 687  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| |||  ||         ||| || ||| | | |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  826300 ctccaagtatgcatttggaagtggtgacatt---------aaatacccaaccttagaagcaattgggaagaagattgcaaaaaagtgtggtggattgcca 826390  T
Q  688 atagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacataaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgata 787  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |  | ||||   || |   ||| ||||||||   ||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  826391 atagctgccaaaacgctaggagggcttttgagctcaaagttaaatgcaaaggagtggaccgaaatcttgaacagcaacatatggaacataccaaataata 826490  T
Q  788 atattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcatttgaaaagatgttt 848  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  826491 acattctgcctgctttgcttttgagttatctataccttccctctcatttgaaaagatgttt 826551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 425
Target Start/End: Original strand, 29836587 - 29836869
Alignment:
Q  143 ataataatataggtgttgttgcaattttgggcatgggaggtttgggaaaaactacccttgcccaacttgtttacaatgataaagaagttcaacaacattt 242  Q
    |||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||| | || ||||| ||||| || | |||| | |||||  |  |||||||| || | |||||    
T  29836587 ataataatataggtgtagtcgcaattacaggcatgggaggtatcggtaaaacgaccctcgctcgacttatatacaaccaggaagaagttaaaaatcattt 29836686  T
Q  243 tgatttgaaggcatggacttgtgtgtctgaggatttcaatattacgagagtaaccaagtctctgcttgaatctgtcacttctagaacttgggagagcaat 342  Q
    |||| |  | |  |||  |||||||||||| |||||  ||||   |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||   ||| | | ||||    
T  29836687 tgatgtacaagtctgggtttgtgtgtctgaagattttgatatgttgagagtaaccaaatctctccttgaagttgtcacttcaagagaatggaataccaat 29836786  T
Q  343 aatcttgattttcttcgagttgaattaaagaaaagctcgaaggagaaaagatttttgtttgtgctggatgatctgtggaatga 425  Q
    || |||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||  | |||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||    
T  29836787 aaccttgatcttcttcgagttgaattgaagaaaaatttgaacaacaaaagatttttgattgtattggatgatgtttggaatga 29836869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 635 - 848
Target Start/End: Original strand, 29837076 - 29837289
Alignment:
Q  635 caatccttgaagaaatcggcaagaagattgcaagaaagtgtggcggactgccaatagctgctaaaacactaggaggacttctacgttcaactgtagacat 734  Q
    ||| |||||||||||| ||   || ||||||||  ||||| || ||||| ||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||   || |||||       
T  29837076 caacccttgaagaaattggtcggaggattgcaatgaagtgcggtggacttccactggctgctagagcacttggaggacttctacgtgataccgtagatgc 29837175  T
Q  735 aaatgagtggacttcaattttgaacagcaacttatgggacttaccaaatgataatattcttcctgctttgcatttgaggtatcaatatcttccctctcat 834  Q
    | |  |||||| | ||||| |||| ||  || ||||| ||||| ||||||||||  |  | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | |||     
T  29837176 agagaagtggaatgcaattctgaatagtgacatatggaacttatcaaatgataaagtcatgcctgcattgcatttgagttatcaagatcttccttgtcac 29837275  T
Q  835 ttgaaaagatgttt 848  Q
    ||||||||||||||    
T  29837276 ttgaaaagatgttt 29837289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University