View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7685_low_4 (Length: 341)

Name: NF7685_low_4
Description: NF7685
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7685_low_4
NF7685_low_4
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-334)||(5845-6179)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-334)||(138339-138673)
scaffold0021 (68-334)||(76589-76853)
scaffold0021 (88-230)||(10003-10148)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (1-334)||(26071796-26072131)
chr7 (1-334)||(26095583-26095918)
chr7 (69-334)||(15824105-15824371)
chr7 (68-334)||(44863443-44863711)
chr7 (68-334)||(141869-142136)
chr7 (68-334)||(47287976-47288244)
chr7 (1-334)||(3893381-3893729)
chr7 (1-334)||(12753172-12753515)
chr7 (1-334)||(112827-113168)
chr7 (142-334)||(7286328-7286522)
chr7 (142-334)||(12545607-12545802)
chr7 (143-334)||(18305642-18305831)
chr7 (143-334)||(13867887-13868080)
chr7 (1-232)||(45453788-45454016)
chr7 (141-334)||(7290908-7291102)
chr7 (142-334)||(2192606-2192799)
chr7 (1-234)||(1938300-1938532)
chr7 (142-334)||(369143-369336)
chr7 (142-334)||(14253071-14253263)
chr7 (142-334)||(16480836-16481029)
chr7 (142-334)||(15952859-15953050)
chr7 (68-334)||(49049452-49049723)
chr7 (1-111)||(15913965-15914075)
chr7 (1-142)||(9058165-9058311)
chr7 (88-334)||(15629004-15629255)
chr7 (1-107)||(13388493-13388599)
chr7 (1-164)||(32496076-32496242)
chr7 (1-162)||(15761890-15762051)
chr7 (68-164)||(13867688-13867784)
chr7 (1-112)||(20587143-20587254)
chr7 (69-334)||(13272976-13273246)
chr7 (1-107)||(13376200-13376305)
chr7 (146-319)||(15762262-15762429)
chr7 (1-102)||(8565111-8565212)
chr7 (68-164)||(11285619-11285715)
chr7 (1-161)||(18255343-18255505)
chr7 (1-107)||(9322597-9322703)
chr7 (3-112)||(28718977-28719086)
chr7 (68-164)||(11582535-11582631)
chr7 (59-198)||(15952673-15952813)
chr7 (68-235)||(16571751-16571921)
chr7 (68-235)||(16593741-16593911)
chr7 (265-334)||(16571983-16572053)
chr7 (265-334)||(16593609-16593679)
chr7 (67-164)||(13038808-13038905)
chr7 (142-239)||(2024757-2024858)
chr7 (68-234)||(10862515-10862683)
chr7 (68-203)||(12249771-12249908)
chr7 (68-164)||(12545404-12545501)
chr7 (142-216)||(12545553-12545627)
chr7 (84-156)||(36051075-36051147)
chr7 (59-164)||(369364-369471)
chr7 (1-107)||(3058585-3058690)
chr7 (85-156)||(122987-123059)
chr7 (84-164)||(16210183-16210263)
chr7 (117-171)||(18305492-18305546)
chr7 (270-334)||(2024692-2024757)
chr7 (85-161)||(2192376-2192453)
chr7 (59-162)||(10988092-10988197)
chr7 (59-161)||(15518435-15518539)
chr7 (150-334)||(16416509-16416684)
chr7 (144-216)||(16480710-16480782)
chr7 (259-334)||(45455505-45455581)
chr7 (1-91)||(125378-125469)
chr7 (104-198)||(2024904-2024998)
chr7 (1-102)||(2027097-2027199)
chr7 (84-142)||(7291277-7291335)
chr7 (68-161)||(7821406-7821500)
chr7 (68-161)||(7828717-7828811)
chr7 (68-161)||(16416949-16417043)
chr7 (84-161)||(16480605-16480683)
chr7 (68-161)||(27103134-27103228)
chr7 (68-161)||(27110482-27110576)
chr7 (68-161)||(27175098-27175192)
chr7 (68-161)||(38785226-38785320)
chr7 (144-216)||(2192480-2192552)
chr7 (1-161)||(2436110-2436266)
chr7 (60-112)||(4483268-4483320)
chr7 (1-44)||(4483318-4483361)
chr7 (142-334)||(11582659-11582840)
chr7 (117-164)||(3055193-3055241)
chr7 (59-161)||(13757060-13757164)
chr7 (59-161)||(25293856-25293960)
chr7 (142-246)||(122854-122951)
chr7 (68-161)||(11514604-11514698)
chr7 (205-334)||(13038989-13039114)
chr7 (68-161)||(15443146-15443240)
chr7 (84-161)||(30263727-30263805)
chr7 (59-136)||(42057741-42057819)
chr7 (18-63)||(3193586-3193630)
chr7 (263-334)||(16209975-16210045)
chr7 (19-63)||(13460914-13460958)
chr7 (59-157)||(13912691-13912791)
chr7 (59-161)||(26010770-26010874)
[»] chr6 (90 HSPs)
chr6 (1-334)||(31626739-31627074)
chr6 (68-334)||(25646518-25646786)
chr6 (1-334)||(18775506-18775847)
chr6 (1-334)||(22428473-22428811)
chr6 (1-334)||(16104850-16105194)
chr6 (1-334)||(25745831-25746160)
chr6 (142-334)||(35017451-35017645)
chr6 (143-334)||(35011124-35011316)
chr6 (142-334)||(18128340-18128532)
chr6 (142-334)||(18578834-18579027)
chr6 (148-334)||(13622937-13623121)
chr6 (143-334)||(19627498-19627690)
chr6 (142-319)||(14628368-14628545)
chr6 (142-334)||(18004857-18005050)
chr6 (142-334)||(23975708-23975902)
chr6 (142-334)||(18843708-18843900)
chr6 (68-334)||(13016436-13016702)
chr6 (151-311)||(33316422-33316582)
chr6 (68-189)||(18422182-18422303)
chr6 (1-164)||(19984722-19984887)
chr6 (202-334)||(23151706-23151839)
chr6 (117-334)||(32896282-32896492)
chr6 (142-268)||(18825647-18825774)
chr6 (68-235)||(25369014-25369184)
chr6 (1-112)||(34965470-34965581)
chr6 (1-107)||(18383217-18383323)
chr6 (2-107)||(33323342-33323447)
chr6 (1-162)||(1554324-1554485)
chr6 (1-83)||(16083970-16084052)
chr6 (68-334)||(18397163-18397434)
chr6 (1-142)||(22846615-22846765)
chr6 (1-162)||(16238848-16239009)
chr6 (146-319)||(1553946-1554113)
chr6 (2-101)||(16889281-16889379)
chr6 (1-102)||(16134814-16134915)
chr6 (1-102)||(17790676-17790776)
chr6 (1-141)||(18128776-18128921)
chr6 (68-152)||(35017303-35017387)
chr6 (1-161)||(11214623-11214784)
chr6 (1-83)||(35137483-35137565)
chr6 (1-112)||(19852795-19852906)
chr6 (205-334)||(16827873-16828003)
chr6 (84-156)||(18740863-18740935)
chr6 (59-163)||(4989379-4989485)
chr6 (84-162)||(13622800-13622878)
chr6 (1-161)||(1659231-1659387)
chr6 (1-112)||(23220222-23220333)
chr6 (60-161)||(33316158-33316260)
chr6 (254-334)||(17787746-17787827)
chr6 (59-161)||(14628185-14628289)
chr6 (59-161)||(23976053-23976157)
chr6 (59-161)||(26088319-26088423)
chr6 (149-216)||(23975956-23976023)
chr6 (68-164)||(16827462-16827559)
chr6 (68-164)||(18004635-18004732)
chr6 (144-216)||(14628316-14628388)
chr6 (263-334)||(25173518-25173590)
chr6 (68-163)||(18825420-18825515)
chr6 (1-52)||(23151845-23151896)
chr6 (1-141)||(1651468-1651605)
chr6 (142-319)||(4989004-4989171)
chr6 (68-233)||(15738590-15738757)
chr6 (148-202)||(16238711-16238765)
chr6 (142-334)||(18740645-18740828)
chr6 (68-161)||(25174040-25174134)
chr6 (68-161)||(27655670-27655764)
chr6 (68-172)||(28196439-28196546)
chr6 (68-163)||(18843481-18843576)
chr6 (142-216)||(4989201-4989275)
chr6 (68-161)||(10487364-10487458)
chr6 (1-136)||(15861243-15861373)
chr6 (68-161)||(16377869-16377963)
chr6 (68-161)||(16385193-16385287)
chr6 (265-334)||(18422115-18422185)
chr6 (151-212)||(33316292-33316353)
chr6 (142-212)||(16827663-16827733)
chr6 (84-161)||(17343864-17343942)
chr6 (18-63)||(16374954-16374999)
chr6 (59-161)||(16230065-16230169)
chr6 (59-161)||(23993645-23993749)
chr6 (59-161)||(29871049-29871153)
chr6 (59-137)||(16650820-16650899)
chr6 (158-216)||(18004770-18004827)
chr6 (142-334)||(19984915-19985096)
chr6 (84-161)||(22227278-22227356)
chr6 (142-216)||(25173731-25173805)
chr6 (263-334)||(18835474-18835544)
chr6 (68-112)||(21930417-21930462)
chr6 (18-63)||(31162441-31162486)
chr6 (96-140)||(32896494-32896538)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (2-334)||(37760-38094)
[»] chr8 (95 HSPs)
chr8 (1-334)||(41243948-41244268)
chr8 (1-334)||(37605283-37605625)
chr8 (68-334)||(25120745-25121012)
chr8 (68-334)||(19994802-19995078)
chr8 (68-334)||(20479893-20480166)
chr8 (68-334)||(16416537-16416810)
chr8 (143-334)||(18610428-18610620)
chr8 (142-334)||(41508927-41509122)
chr8 (147-334)||(24719328-24719513)
chr8 (142-334)||(13664550-13664743)
chr8 (142-334)||(13723825-13724018)
chr8 (153-334)||(22008366-22008548)
chr8 (142-334)||(22909342-22909535)
chr8 (80-334)||(20655677-20655943)
chr8 (142-334)||(24108465-24108657)
chr8 (1-250)||(16203855-16204098)
chr8 (142-334)||(23509068-23509261)
chr8 (142-319)||(22323225-22323398)
chr8 (143-334)||(269950-270138)
chr8 (143-334)||(645782-645970)
chr8 (143-334)||(831517-831705)
chr8 (1-142)||(37655178-37655324)
chr8 (143-334)||(16043054-16043245)
chr8 (181-334)||(17343480-17343632)
chr8 (143-334)||(16041378-16041569)
chr8 (1-107)||(21192278-21192384)
chr8 (1-107)||(39448354-39448460)
chr8 (1-102)||(31195816-31195917)
chr8 (68-233)||(17731117-17731286)
chr8 (1-107)||(21199705-21199811)
chr8 (1-107)||(21696086-21696192)
chr8 (1-164)||(29758768-29758933)
chr8 (68-156)||(24719077-24719165)
chr8 (1-107)||(23835746-23835851)
chr8 (1-86)||(41245210-41245295)
chr8 (1-113)||(22498835-22498947)
chr8 (68-334)||(38531882-38532152)
chr8 (1-155)||(270226-270378)
chr8 (1-155)||(645542-645694)
chr8 (1-155)||(831277-831429)
chr8 (1-107)||(23116352-23116458)
chr8 (52-142)||(25294490-25294582)
chr8 (52-142)||(25756479-25756571)
chr8 (7-112)||(33170785-33170890)
chr8 (68-235)||(28543270-28543440)
chr8 (216-334)||(6776303-6776422)
chr8 (1-112)||(22312190-22312301)
chr8 (1-112)||(45560750-45560861)
chr8 (142-334)||(43375310-43375493)
chr8 (1-154)||(24930633-24930789)
chr8 (1-102)||(33612593-33612694)
chr8 (68-334)||(18768422-18768691)
chr8 (68-164)||(22008139-22008236)
chr8 (1-112)||(23153341-23153452)
chr8 (68-191)||(24108245-24108368)
chr8 (142-334)||(3433535-3433718)
chr8 (68-164)||(22323102-22323197)
chr8 (84-156)||(43375202-43375274)
chr8 (1-156)||(24387226-24387383)
chr8 (272-334)||(28543151-28543213)
chr8 (68-161)||(23509397-23509491)
chr8 (68-164)||(13664296-13664393)
chr8 (68-164)||(13723571-13723668)
chr8 (144-216)||(13664424-13664496)
chr8 (144-216)||(13723699-13723771)
chr8 (68-164)||(22909146-22909242)
chr8 (1-112)||(24238065-24238174)
chr8 (153-216)||(23509315-23509378)
chr8 (205-334)||(23631046-23631173)
chr8 (1-141)||(24547724-24547861)
chr8 (59-161)||(3433150-3433254)
chr8 (59-161)||(21846065-21846169)
chr8 (59-161)||(21853470-21853574)
chr8 (150-334)||(28835980-28836155)
chr8 (149-216)||(3433285-3433352)
chr8 (1-44)||(37609956-37609999)
chr8 (68-161)||(272786-272880)
chr8 (68-161)||(642969-643063)
chr8 (68-161)||(828775-828869)
chr8 (68-161)||(5236674-5236768)
chr8 (1-59)||(11543088-11543146)
chr8 (262-334)||(39448573-39448646)
chr8 (279-334)||(17731331-17731387)
chr8 (59-137)||(22090018-22090097)
chr8 (142-246)||(29758643-29758740)
chr8 (59-161)||(16874513-16874617)
chr8 (59-137)||(224737-224816)
chr8 (59-137)||(738360-738439)
chr8 (59-137)||(862255-862334)
chr8 (59-137)||(15320634-15320713)
chr8 (59-137)||(15501003-15501082)
chr8 (59-137)||(16675900-16675979)
chr8 (293-334)||(21695899-21695941)
chr8 (68-161)||(24662830-24662924)
chr8 (151-216)||(3433390-3433455)
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (68-334)||(256560-256827)
scaffold0011 (84-164)||(125009-125089)
scaffold0011 (84-162)||(72028-72106)
scaffold0011 (84-162)||(76409-76487)
scaffold0011 (84-156)||(192985-193057)
scaffold0011 (204-334)||(72191-72317)
scaffold0011 (204-334)||(76572-76698)
scaffold0011 (205-334)||(125173-125298)
scaffold0011 (201-334)||(192768-192897)
[»] chr4 (95 HSPs)
chr4 (46-334)||(12837900-12838192)
chr4 (1-334)||(21961096-21961440)
chr4 (68-334)||(44345057-44345333)
chr4 (1-334)||(12901300-12901631)
chr4 (67-334)||(33738477-33738732)
chr4 (142-334)||(18166874-18167067)
chr4 (142-334)||(34393385-34393580)
chr4 (142-334)||(53909555-53909750)
chr4 (68-334)||(16366361-16366624)
chr4 (143-334)||(19699414-19699606)
chr4 (143-334)||(19709999-19710191)
chr4 (142-334)||(7134310-7134503)
chr4 (142-334)||(8372607-8372800)
chr4 (142-334)||(15274470-15274663)
chr4 (142-334)||(26678179-26678370)
chr4 (68-334)||(44054168-44054427)
chr4 (1-142)||(8874021-8874162)
chr4 (1-162)||(14899948-14900112)
chr4 (68-334)||(45460611-45460894)
chr4 (1-111)||(34197702-34197812)
chr4 (1-111)||(37958594-37958704)
chr4 (68-334)||(13244606-13244861)
chr4 (1-102)||(27959563-27959664)
chr4 (140-334)||(53706635-53706828)
chr4 (1-107)||(12245789-12245895)
chr4 (1-164)||(109957-110120)
chr4 (68-334)||(13811287-13811558)
chr4 (68-334)||(30236147-30236411)
chr4 (142-334)||(22356424-22356616)
chr4 (1-99)||(41167471-41167569)
chr4 (1-107)||(15852853-15852959)
chr4 (1-216)||(15211762-15211981)
chr4 (161-334)||(20813715-20813890)
chr4 (153-334)||(47355509-47355688)
chr4 (68-156)||(53909431-53909519)
chr4 (189-334)||(18294600-18294746)
chr4 (1-112)||(5372231-5372342)
chr4 (1-112)||(10238970-10239081)
chr4 (1-107)||(47469870-47469976)
chr4 (5-142)||(41257889-41258031)
chr4 (2-112)||(50223696-50223806)
chr4 (68-160)||(43283043-43283138)
chr4 (59-164)||(5684479-5684586)
chr4 (142-334)||(15211515-15211698)
chr4 (254-334)||(8874265-8874346)
chr4 (68-164)||(10642586-10642683)
chr4 (1-134)||(16521294-16521428)
chr4 (160-216)||(34393610-34393666)
chr4 (68-137)||(52267125-52267196)
chr4 (98-174)||(53706515-53706591)
chr4 (150-252)||(55378542-55378646)
chr4 (149-216)||(8372854-8372921)
chr4 (149-216)||(18167097-18167164)
chr4 (68-334)||(18496065-18496334)
chr4 (68-161)||(19999005-19999099)
chr4 (84-154)||(54119906-54119976)
chr4 (95-216)||(7134088-7134208)
chr4 (201-334)||(9293712-9293843)
chr4 (68-164)||(9293924-9294021)
chr4 (201-334)||(10642374-10642505)
chr4 (59-161)||(15138134-15138238)
chr4 (142-334)||(19998517-19998700)
chr4 (59-161)||(26678522-26678626)
chr4 (59-161)||(47355803-47355907)
chr4 (149-212)||(26678428-26678491)
chr4 (84-161)||(8372951-8373029)
chr4 (68-161)||(14994678-14994772)
chr4 (84-161)||(18167195-18167273)
chr4 (68-161)||(18246668-18246762)
chr4 (150-216)||(19998907-19998973)
chr4 (84-164)||(15274361-15274442)
chr4 (151-216)||(19998780-19998845)
chr4 (59-163)||(22356139-22356244)
chr4 (149-217)||(13751910-13751978)
chr4 (263-334)||(18246178-18246250)
chr4 (152-216)||(47355705-47355769)
chr4 (88-214)||(7848776-7848902)
chr4 (142-334)||(16520801-16520985)
chr4 (201-334)||(54120066-54120195)
chr4 (261-327)||(55378691-55378757)
chr4 (59-161)||(14950498-14950602)
chr4 (149-250)||(109828-109922)
chr4 (68-128)||(15043381-15043443)
chr4 (68-128)||(15110981-15111043)
chr4 (151-216)||(16521015-16521080)
chr4 (68-124)||(53706465-53706521)
chr4 (104-198)||(16521168-16521263)
chr4 (68-161)||(10487149-10487243)
chr4 (68-161)||(16329508-16329602)
chr4 (142-216)||(18246391-18246465)
chr4 (190-234)||(43283140-43283185)
chr4 (270-329)||(5684742-5684802)
chr4 (59-161)||(13049739-13049843)
chr4 (1-41)||(17213380-17213420)
chr4 (68-112)||(17377040-17377084)
[»] chr1 (72 HSPs)
chr1 (68-334)||(22407894-22408162)
chr1 (68-334)||(2422733-2422997)
chr1 (1-334)||(35053141-35053472)
chr1 (142-334)||(41217544-41217739)
chr1 (150-334)||(5676350-5676535)
chr1 (143-334)||(20252342-20252534)
chr1 (4-216)||(5676137-5676355)
chr1 (68-206)||(49966013-49966151)
chr1 (142-334)||(9786123-9786315)
chr1 (68-334)||(35524082-35524350)
chr1 (2-139)||(41217945-41218082)
chr1 (1-164)||(20444214-20444377)
chr1 (1-164)||(37845999-37846162)
chr1 (1-107)||(38035154-38035260)
chr1 (1-102)||(13378294-13378395)
chr1 (1-107)||(21193694-21193800)
chr1 (68-234)||(22836911-22837078)
chr1 (1-107)||(37235494-37235600)
chr1 (142-271)||(22250776-22250905)
chr1 (1-156)||(20929955-20930112)
chr1 (1-102)||(19601713-19601814)
chr1 (1-93)||(8539492-8539584)
chr1 (1-93)||(8604731-8604823)
chr1 (1-164)||(20529978-20530142)
chr1 (68-334)||(51657986-51658255)
chr1 (1-107)||(36357870-36357976)
chr1 (1-107)||(5769747-5769853)
chr1 (1-161)||(22226459-22226619)
chr1 (68-164)||(20895390-20895486)
chr1 (68-216)||(20956627-20956776)
chr1 (162-334)||(18505646-18505817)
chr1 (68-164)||(9785899-9785995)
chr1 (1-198)||(15862957-15863149)
chr1 (68-334)||(21716430-21716707)
chr1 (4-164)||(22352601-22352763)
chr1 (1-112)||(20821476-20821587)
chr1 (1-112)||(5471916-5472028)
chr1 (1-156)||(44036424-44036582)
chr1 (142-308)||(20895514-20895660)
chr1 (1-112)||(22144925-22145036)
chr1 (1-112)||(41213200-41213311)
chr1 (142-216)||(41217793-41217867)
chr1 (142-334)||(15863325-15863508)
chr1 (142-334)||(21857753-21857934)
chr1 (68-198)||(22250622-22250752)
chr1 (142-334)||(17146820-17147003)
chr1 (68-164)||(27673257-27673355)
chr1 (68-164)||(22365155-22365252)
chr1 (59-161)||(17147258-17147362)
chr1 (144-216)||(22352498-22352570)
chr1 (142-216)||(15863221-15863295)
chr1 (142-334)||(22352285-22352468)
chr1 (84-153)||(21857966-21858035)
chr1 (68-141)||(35935166-35935239)
chr1 (68-161)||(17003302-17003396)
chr1 (201-334)||(22364943-22365074)
chr1 (59-161)||(7642166-7642270)
chr1 (189-302)||(20589963-20590078)
chr1 (285-334)||(22080190-22080240)
chr1 (68-161)||(41392929-41393023)
chr1 (1-141)||(45050185-45050322)
chr1 (68-161)||(51451090-51451184)
chr1 (59-161)||(20826805-20826909)
chr1 (59-161)||(22034325-22034429)
chr1 (59-137)||(5073884-5073963)
chr1 (68-107)||(18505816-18505855)
chr1 (59-137)||(18602627-18602706)
chr1 (212-250)||(20444085-20444123)
chr1 (212-250)||(20529825-20529863)
chr1 (68-112)||(77632-77677)
chr1 (205-250)||(37846241-37846286)
chr1 (189-232)||(27673216-27673260)
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (68-334)||(36892360-36892628)
chr2 (68-334)||(25877618-25877882)
chr2 (1-252)||(6877821-6878074)
chr2 (1-334)||(8886450-8886772)
chr2 (143-334)||(42180210-42180402)
chr2 (1-162)||(25600431-25600592)
chr2 (1-197)||(22861923-22862119)
chr2 (1-216)||(24088904-24089120)
chr2 (142-334)||(21276342-21276535)
chr2 (148-334)||(24966425-24966609)
chr2 (3-142)||(19435003-19435144)
chr2 (151-319)||(12638003-12638171)
chr2 (149-334)||(21140139-21140325)
chr2 (68-334)||(7319718-7319989)
chr2 (1-195)||(43644494-43644688)
chr2 (1-112)||(19658470-19658581)
chr2 (68-334)||(28972272-28972543)
chr2 (2-107)||(25304094-25304199)
chr2 (1-164)||(15631864-15632028)
chr2 (1-107)||(4819-4925)
chr2 (68-334)||(31832-32102)
chr2 (1-113)||(43641346-43641458)
chr2 (59-216)||(12643600-12643758)
chr2 (142-334)||(12643812-12644000)
chr2 (1-107)||(23823051-23823157)
chr2 (1-107)||(23824995-23825101)
chr2 (1-107)||(23832130-23832236)
chr2 (66-334)||(269422-269693)
chr2 (142-234)||(25600309-25600401)
chr2 (1-156)||(22282601-22282759)
chr2 (69-334)||(24573051-24573320)
chr2 (1-107)||(24296115-24296221)
chr2 (142-252)||(15631702-15631812)
chr2 (1-85)||(27260130-27260214)
chr2 (1-156)||(22273368-22273526)
chr2 (1-107)||(19670673-19670778)
chr2 (68-334)||(22581588-22581858)
chr2 (248-334)||(4450084-4450171)
chr2 (2-112)||(24272579-24272689)
chr2 (1-112)||(18534350-18534461)
chr2 (84-164)||(461139-461219)
chr2 (142-334)||(3801123-3801306)
chr2 (1-112)||(22137358-22137469)
chr2 (142-334)||(38706810-38706993)
chr2 (84-156)||(9654507-9654579)
chr2 (84-164)||(20629034-20629114)
chr2 (1-161)||(22692768-22692930)
chr2 (1-161)||(22697415-22697577)
chr2 (142-334)||(34822315-34822498)
chr2 (84-162)||(24966692-24966770)
chr2 (68-217)||(22691607-22691758)
chr2 (68-217)||(22696254-22696405)
chr2 (59-161)||(12637739-12637843)
chr2 (149-216)||(12637873-12637940)
chr2 (248-334)||(22691823-22691910)
chr2 (248-334)||(22696470-22696557)
chr2 (248-334)||(25600173-25600260)
chr2 (68-161)||(21140355-21140449)
chr2 (263-334)||(8941712-8941784)
chr2 (263-334)||(19888848-19888920)
chr2 (142-319)||(25210909-25211076)
chr2 (149-216)||(34822578-34822645)
chr2 (265-334)||(6877721-6877791)
chr2 (68-161)||(19888362-19888456)
chr2 (142-250)||(20629142-20629243)
chr2 (68-161)||(21276111-21276205)
chr2 (142-250)||(43644713-43644814)
chr2 (59-161)||(3800687-3800791)
chr2 (142-214)||(25211108-25211180)
chr2 (59-161)||(34822676-34822780)
chr2 (149-216)||(3800822-3800889)
chr2 (68-161)||(5889880-5889974)
chr2 (142-334)||(9654615-9654792)
chr2 (68-161)||(11232835-11232929)
chr2 (68-161)||(14908022-14908116)
chr2 (68-161)||(22514682-22514776)
chr2 (68-161)||(28777283-28777377)
chr2 (262-334)||(22654339-22654412)
chr2 (84-141)||(24828161-24828218)
chr2 (84-141)||(24832613-24832670)
chr2 (84-164)||(720835-720918)
chr2 (59-161)||(8942124-8942228)
chr2 (59-161)||(12726531-12726635)
chr2 (59-161)||(23773015-23773119)
chr2 (59-137)||(17398170-17398249)
chr2 (59-137)||(24687243-24687322)
chr2 (142-216)||(3800969-3801043)
chr2 (68-161)||(20013601-20013695)
chr2 (265-334)||(22273164-22273233)
chr2 (68-161)||(23818658-23818752)
chr2 (142-216)||(24089074-24089146)
chr2 (91-141)||(25211379-25211429)
chr2 (143-196)||(461007-461060)
chr2 (205-250)||(23806359-23806404)
[»] chr3 (133 HSPs)
chr3 (1-334)||(319141-319486)
chr3 (1-334)||(50113655-50113991)
chr3 (68-334)||(17098913-17099181)
chr3 (68-334)||(6148457-6148723)
chr3 (68-334)||(30204696-30204961)
chr3 (1-334)||(51159996-51160335)
chr3 (1-334)||(47786398-47786735)
chr3 (1-334)||(12351373-12351709)
chr3 (142-334)||(11812801-11812994)
chr3 (68-334)||(16183665-16183945)
chr3 (68-334)||(19572430-19572693)
chr3 (68-334)||(22145882-22146145)
chr3 (142-334)||(38166213-38166407)
chr3 (142-334)||(18737974-18738167)
chr3 (1-216)||(7852223-7852439)
chr3 (142-334)||(19944805-19944998)
chr3 (142-334)||(7851683-7851877)
chr3 (142-334)||(30140984-30141177)
chr3 (151-329)||(12796728-12796908)
chr3 (142-334)||(17936455-17936649)
chr3 (142-334)||(16819043-16819234)
chr3 (1-164)||(8630315-8630478)
chr3 (68-334)||(14287323-14287596)
chr3 (1-210)||(14060770-14060980)
chr3 (68-334)||(11199144-11199415)
chr3 (1-112)||(5229610-5229721)
chr3 (1-107)||(12490266-12490372)
chr3 (1-111)||(18008666-18008776)
chr3 (1-143)||(38812525-38812671)
chr3 (1-107)||(15874690-15874796)
chr3 (68-334)||(35121921-35122189)
chr3 (1-107)||(48420197-48420303)
chr3 (146-277)||(8630101-8630232)
chr3 (1-164)||(2048535-2048700)
chr3 (68-334)||(14296730-14297000)
chr3 (68-334)||(14302357-14302627)
chr3 (68-235)||(11062691-11062861)
chr3 (1-164)||(23490980-23491146)
chr3 (226-334)||(54045594-54045703)
chr3 (1-156)||(19230535-19230691)
chr3 (1-112)||(47983418-47983530)
chr3 (1-112)||(47992705-47992817)
chr3 (1-112)||(48001992-48002104)
chr3 (1-112)||(48011278-48011390)
chr3 (1-164)||(33340317-33340483)
chr3 (1-107)||(55442295-55442404)
chr3 (1-107)||(11330537-11330643)
chr3 (68-164)||(11813307-11813403)
chr3 (142-239)||(13815973-13816070)
chr3 (68-334)||(14523006-14523278)
chr3 (201-334)||(17958169-17958303)
chr3 (146-307)||(54686551-54686707)
chr3 (1-161)||(14846179-14846339)
chr3 (1-170)||(19945098-19945266)
chr3 (5-164)||(10737033-10737192)
chr3 (259-334)||(11062944-11063020)
chr3 (59-198)||(49230655-49230795)
chr3 (1-112)||(9592283-9592394)
chr3 (59-164)||(17913826-17913933)
chr3 (1-112)||(41660135-41660246)
chr3 (68-164)||(17957996-17958093)
chr3 (146-307)||(9304664-9304819)
chr3 (201-334)||(25057035-25057166)
chr3 (1-155)||(5227201-5227356)
chr3 (68-232)||(15516035-15516197)
chr3 (69-164)||(19262602-19262698)
chr3 (248-334)||(13815856-13815943)
chr3 (2-161)||(15939979-15940140)
chr3 (1-198)||(16259487-16259681)
chr3 (142-334)||(19230318-19230499)
chr3 (142-216)||(11813179-11813253)
chr3 (68-210)||(12563136-12563281)
chr3 (68-164)||(25057247-25057344)
chr3 (18-107)||(33370914-33371002)
chr3 (259-334)||(17536847-17536923)
chr3 (150-334)||(18908679-18908854)
chr3 (150-334)||(22273034-22273209)
chr3 (92-164)||(45581310-45581382)
chr3 (142-209)||(7851968-7852035)
chr3 (84-162)||(15860824-15860902)
chr3 (68-161)||(16819386-16819480)
chr3 (84-161)||(18905356-18905434)
chr3 (142-216)||(18908892-18908966)
chr3 (142-319)||(49230262-49230429)
chr3 (144-216)||(11813048-11813120)
chr3 (68-210)||(17137827-17137969)
chr3 (202-334)||(23490768-23490898)
chr3 (59-161)||(27839184-27839288)
chr3 (149-212)||(16819292-16819355)
chr3 (68-163)||(30141361-30141456)
chr3 (68-161)||(2450910-2451004)
chr3 (18-64)||(11517010-11517056)
chr3 (1-141)||(15613564-15613701)
chr3 (68-161)||(18909169-18909263)
chr3 (68-161)||(22273524-22273618)
chr3 (1-141)||(23081684-23081821)
chr3 (66-216)||(40938085-40938236)
chr3 (68-141)||(15574545-15574618)
chr3 (59-162)||(44227903-44228008)
chr3 (259-334)||(53900388-53900463)
chr3 (1-161)||(12266009-12266167)
chr3 (68-161)||(1469236-1469330)
chr3 (142-216)||(7851857-7851931)
chr3 (68-161)||(16745754-16745848)
chr3 (68-233)||(17536606-17536774)
chr3 (212-334)||(33340038-33340155)
chr3 (69-161)||(15470048-15470141)
chr3 (149-334)||(19262733-19262907)
chr3 (272-334)||(12563334-12563397)
chr3 (68-142)||(12951476-12951555)
chr3 (262-334)||(39654163-39654237)
chr3 (59-161)||(8269976-8270080)
chr3 (59-161)||(8277087-8277191)
chr3 (59-161)||(8305896-8306000)
chr3 (264-334)||(14061039-14061110)
chr3 (59-161)||(30151813-30151917)
chr3 (59-161)||(53769137-53769241)
chr3 (59-137)||(13956378-13956457)
chr3 (59-137)||(13977211-13977290)
chr3 (59-137)||(41268743-41268822)
chr3 (59-137)||(45859521-45859600)
chr3 (68-215)||(53900177-53900326)
chr3 (59-137)||(55314883-55314962)
chr3 (142-216)||(2451155-2451229)
chr3 (142-216)||(22273247-22273321)
chr3 (142-216)||(49230509-49230583)
chr3 (149-198)||(2451035-2451084)
chr3 (201-250)||(10736904-10736953)
chr3 (68-113)||(11883923-11883968)
chr3 (68-113)||(14291910-14291955)
chr3 (68-112)||(38377415-38377460)
chr3 (201-250)||(45581181-45581230)
chr3 (68-107)||(15989508-15989548)
[»] chr5 (95 HSPs)
chr5 (1-334)||(4863551-4863900)
chr5 (18-334)||(21661268-21661593)
chr5 (68-334)||(21392432-21392698)
chr5 (1-334)||(27185361-27185699)
chr5 (142-334)||(34937571-34937764)
chr5 (142-334)||(10307-10500)
chr5 (142-334)||(10780112-10780305)
chr5 (142-334)||(43445708-43445901)
chr5 (142-334)||(28257781-28257970)
chr5 (142-334)||(22885041-22885234)
chr5 (148-334)||(25211796-25211982)
chr5 (148-334)||(25275948-25276134)
chr5 (145-334)||(17473704-17473892)
chr5 (151-319)||(19497952-19498120)
chr5 (68-216)||(11582266-11582414)
chr5 (142-334)||(11579922-11580113)
chr5 (68-214)||(1170321-1170467)
chr5 (1-111)||(32967705-32967815)
chr5 (68-334)||(23453184-23453454)
chr5 (68-334)||(23460428-23460698)
chr5 (68-334)||(23464689-23464959)
chr5 (1-107)||(23492532-23492638)
chr5 (143-334)||(23986165-23986359)
chr5 (1-142)||(24227000-24227146)
chr5 (1-113)||(21615535-21615647)
chr5 (192-334)||(1171320-1171464)
chr5 (2-102)||(7727112-7727212)
chr5 (142-334)||(9732592-9732782)
chr5 (1-113)||(19860756-19860868)
chr5 (142-334)||(1221638-1221826)
chr5 (68-334)||(24184869-24185137)
chr5 (68-334)||(24470555-24470804)
chr5 (1-107)||(37189661-37189767)
chr5 (1-112)||(11964472-11964583)
chr5 (1-111)||(28888441-28888554)
chr5 (59-216)||(1221426-1221584)
chr5 (1-107)||(13793659-13793765)
chr5 (68-164)||(21653052-21653148)
chr5 (68-198)||(22884887-22885017)
chr5 (84-164)||(17473568-17473648)
chr5 (84-250)||(23510313-23510473)
chr5 (1-112)||(20455630-20455741)
chr5 (142-334)||(29192671-29192857)
chr5 (146-327)||(17907853-17908030)
chr5 (59-164)||(110678-110785)
chr5 (68-198)||(16534750-16534881)
chr5 (1-198)||(35792770-35792964)
chr5 (142-334)||(35793162-35793345)
chr5 (59-164)||(11213297-11213404)
chr5 (142-216)||(10554-10628)
chr5 (84-198)||(18779790-18779904)
chr5 (68-164)||(22368188-22368285)
chr5 (68-164)||(28257998-28258093)
chr5 (149-216)||(9732495-9732562)
chr5 (130-334)||(11338584-11338802)
chr5 (142-334)||(25944566-25944750)
chr5 (68-161)||(19498280-19498374)
chr5 (68-164)||(10779883-10779980)
chr5 (142-334)||(11340599-11340782)
chr5 (142-334)||(18780052-18780235)
chr5 (59-161)||(25425102-25425206)
chr5 (149-216)||(11341018-11341085)
chr5 (68-161)||(10831-10925)
chr5 (142-319)||(110990-111157)
chr5 (68-142)||(5452432-5452511)
chr5 (150-216)||(19498182-19498248)
chr5 (59-161)||(9732360-9732464)
chr5 (59-161)||(11341116-11341220)
chr5 (142-334)||(16534391-16534574)
chr5 (95-191)||(25211623-25211719)
chr5 (95-191)||(25275775-25275871)
chr5 (263-319)||(25424680-25424736)
chr5 (152-216)||(25944472-25944536)
chr5 (59-161)||(43445451-43445555)
chr5 (144-216)||(43445582-43445654)
chr5 (60-161)||(4201661-4201764)
chr5 (68-161)||(21075192-21075286)
chr5 (68-161)||(21933863-21933957)
chr5 (68-161)||(21940033-21940127)
chr5 (142-216)||(22368337-22368411)
chr5 (68-161)||(29192321-29192415)
chr5 (68-161)||(35580735-35580829)
chr5 (68-161)||(37010867-37010961)
chr5 (68-142)||(3672421-3672497)
chr5 (144-216)||(10780011-10780082)
chr5 (263-334)||(22368602-22368674)
chr5 (59-161)||(24594981-24595085)
chr5 (59-161)||(27008492-27008596)
chr5 (59-137)||(23327458-23327537)
chr5 (142-212)||(110888-110957)
chr5 (262-334)||(7726919-7726993)
chr5 (60-161)||(25902021-25902123)
chr5 (158-216)||(29192583-29192641)
chr5 (68-161)||(37051465-37051559)
chr5 (202-239)||(21653228-21653265)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (68-334)||(31038-31304)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-334)||(12488-12831)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-334)||(59865-60207)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (68-334)||(20860-21128)
scaffold0008 (67-334)||(28450-28719)
scaffold0008 (1-156)||(129719-129877)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (67-334)||(7012-7287)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (68-334)||(535-802)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-334)||(13964-14311)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (68-334)||(1046-1307)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (1-334)||(4425-4762)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (150-334)||(236412-236597)
scaffold0009 (1-216)||(270545-270762)
scaffold0009 (142-334)||(270329-270515)
scaffold0009 (1-163)||(236652-236814)
scaffold0009 (18-62)||(255963-256007)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (142-334)||(27950-28145)
scaffold0116 (68-216)||(28179-28327)
scaffold0116 (142-216)||(28125-28199)
[»] scaffold0269 (4 HSPs)
scaffold0269 (143-334)||(3055-3248)
scaffold0269 (142-334)||(281-477)
scaffold0269 (68-156)||(3430-3518)
scaffold0269 (1-142)||(577-720)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (143-334)||(30650-30843)
scaffold0049 (68-156)||(31002-31090)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (142-334)||(13548-13740)
scaffold0359 (68-192)||(13434-13557)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (68-334)||(15006-15271)
scaffold0138 (143-334)||(26451-26642)
scaffold0138 (1-51)||(23959-24009)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-216)||(3828-4044)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (68-252)||(3707-3893)
scaffold0673 (248-334)||(3927-4014)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (142-334)||(4638-4831)
scaffold0483 (1-164)||(4269-4435)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (142-334)||(49478-49671)
scaffold0109 (1-164)||(49109-49275)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (1-164)||(3129-3292)
scaffold0434 (142-334)||(2907-3101)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (68-227)||(26416-26575)
scaffold0037 (74-334)||(66322-66592)
scaffold0037 (1-78)||(70926-71003)
scaffold0037 (265-334)||(26590-26660)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (142-334)||(21633-21827)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (142-334)||(156183-156376)
scaffold0023 (142-334)||(85966-86149)
scaffold0023 (149-216)||(156062-156129)
scaffold0023 (68-161)||(155937-156031)
scaffold0023 (59-162)||(34811-34916)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-250)||(249068-249313)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (142-318)||(7453-7631)
scaffold0622 (1-216)||(7842-8065)
scaffold0622 (142-219)||(7682-7759)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (1-164)||(3095-3258)
scaffold0447 (142-216)||(2737-2811)
scaffold0447 (142-216)||(2865-2939)
scaffold0447 (142-209)||(2616-2683)
scaffold0447 (142-216)||(2993-3067)
scaffold0447 (248-334)||(2475-2561)
[»] scaffold0383 (7 HSPs)
scaffold0383 (1-164)||(5703-5866)
scaffold0383 (68-198)||(813-943)
scaffold0383 (142-209)||(5480-5547)
scaffold0383 (142-216)||(5601-5675)
scaffold0383 (142-334)||(328-511)
scaffold0383 (248-334)||(5339-5425)
scaffold0383 (142-216)||(641-715)
[»] scaffold0396 (4 HSPs)
scaffold0396 (1-162)||(13723-13884)
scaffold0396 (142-235)||(13914-14007)
scaffold0396 (1-161)||(15922-16084)
scaffold0396 (259-334)||(14078-14154)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (151-334)||(2474-2658)
scaffold0342 (68-334)||(4078-4346)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (142-332)||(77600-77793)
scaffold0034 (84-142)||(77919-77977)
scaffold0034 (189-236)||(35999-36047)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (151-334)||(14849-15032)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (143-334)||(17735-17928)
scaffold0292 (68-164)||(18055-18151)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (148-334)||(499-683)
[»] scaffold0195 (8 HSPs)
scaffold0195 (1-217)||(19799-20024)
scaffold0195 (142-334)||(17526-17716)
scaffold0195 (142-334)||(19556-19746)
scaffold0195 (1-163)||(17776-17940)
scaffold0195 (1-111)||(8183-8293)
scaffold0195 (1-111)||(13572-13682)
scaffold0195 (262-334)||(8466-8539)
scaffold0195 (262-334)||(13855-13928)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (142-319)||(29653-29830)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-141)||(27067-27207)
scaffold0120 (254-319)||(26889-26954)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (1-197)||(56369-56572)
scaffold0051 (162-334)||(56206-56370)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (142-334)||(33395-33580)
scaffold0184 (1-156)||(32711-32869)
scaffold0184 (68-191)||(33725-33848)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (142-334)||(39264-39449)
scaffold0078 (1-156)||(39975-40133)
scaffold0078 (68-191)||(38996-39119)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (1-174)||(68785-68960)
scaffold0031 (158-331)||(68597-68773)
scaffold0031 (117-334)||(30314-30531)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (142-331)||(6984-7175)
scaffold0338 (68-152)||(7214-7298)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (1-217)||(8493-8711)
scaffold0190 (279-334)||(8387-8443)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (185-334)||(23040-23190)
scaffold0158 (266-334)||(16376-16445)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (84-334)||(19248-19489)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (144-303)||(94335-94495)
scaffold0044 (117-164)||(94695-94742)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (68-216)||(90600-90748)
scaffold0028 (1-86)||(78228-78313)
scaffold0028 (142-334)||(90802-91018)
scaffold0028 (1-161)||(128867-129025)
scaffold0028 (142-216)||(128730-128804)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (1-111)||(71812-71922)
scaffold0058 (262-334)||(72093-72166)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (65-334)||(1652-1925)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (142-277)||(16826-16961)
scaffold0315 (84-142)||(17070-17128)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (1-107)||(106453-106559)
scaffold0022 (88-334)||(113902-114150)
scaffold0022 (1-161)||(6668-6830)
scaffold0022 (1-112)||(130409-130520)
scaffold0022 (1-161)||(58955-59117)
scaffold0022 (68-164)||(108058-108156)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (1-107)||(7197-7303)
scaffold0095 (262-334)||(7416-7489)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (142-334)||(9930-10122)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (5-142)||(3244-3386)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (1-108)||(2155-2262)
scaffold0610 (262-334)||(2438-2511)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (1-216)||(2650-2869)
scaffold0597 (142-334)||(2899-3083)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (68-327)||(6123-6386)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-107)||(4886-4991)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-128)||(25145-25274)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-107)||(78366-78472)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (1-162)||(54118-54279)
scaffold0032 (1-198)||(109601-109799)
scaffold0032 (142-216)||(109897-109971)
scaffold0032 (142-250)||(54011-54112)
scaffold0032 (143-196)||(110002-110055)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (1-164)||(11553-11716)
scaffold0467 (201-250)||(11796-11845)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (1-156)||(145016-145172)
scaffold0025 (1-156)||(147275-147431)
scaffold0025 (142-196)||(144926-144980)
scaffold0025 (142-196)||(147185-147239)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (142-277)||(21158-21288)
scaffold0039 (68-164)||(20906-21002)
scaffold0039 (142-216)||(21030-21104)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (1-156)||(197623-197778)
scaffold0004 (1-112)||(84942-85053)
scaffold0004 (1-112)||(26080-26191)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (68-334)||(3125-3395)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-156)||(217269-217426)
scaffold0003 (150-334)||(5221-5396)
scaffold0003 (68-161)||(5661-5755)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-107)||(118138-118244)
scaffold0016 (68-152)||(163817-163901)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-99)||(34006-34104)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (142-334)||(6410-6583)
scaffold0407 (68-164)||(6310-6406)
scaffold0407 (238-334)||(22-119)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (150-334)||(75550-75727)
scaffold0001 (68-139)||(72106-72177)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (1-156)||(5118-5274)
scaffold0266 (68-156)||(12788-12876)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (1-106)||(14145-14250)
scaffold0346 (142-218)||(15935-16011)
scaffold0346 (90-164)||(15833-15907)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-161)||(4320-4482)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (153-276)||(25594-25718)
scaffold0134 (152-216)||(25735-25799)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (1-112)||(211-322)
scaffold0786 (1-112)||(5266-5377)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (68-233)||(31925-32093)
scaffold0103 (259-334)||(31776-31850)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (68-156)||(40010-40098)
scaffold0106 (263-334)||(37627-37697)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (146-307)||(44288-44443)
scaffold0066 (161-307)||(52457-52597)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (1-112)||(3799-3910)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-161)||(51511-51671)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (1-102)||(55922-56023)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (88-216)||(145283-145413)
scaffold0014 (262-334)||(144987-145060)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (1-161)||(14779-14939)
scaffold0225 (1-161)||(28300-28460)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (212-307)||(12989-13085)
scaffold0130 (263-334)||(31120-31192)
scaffold0130 (158-216)||(31333-31391)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (1-96)||(4568-4662)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (1-163)||(1311-1469)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (84-162)||(1509-1587)
scaffold1140 (201-334)||(1298-1427)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (2-102)||(1-102)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (142-334)||(804-987)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-161)||(106479-106641)
scaffold0026 (142-334)||(27169-27352)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (1-161)||(35-196)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (69-161)||(1-94)
scaffold0384 (142-334)||(264-448)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (263-334)||(15167-15239)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (84-156)||(6826-6898)
scaffold0218 (142-334)||(6934-7115)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (248-334)||(4639-4725)
scaffold0450 (149-217)||(4528-4596)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (84-161)||(9529-9607)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-156)||(41190-41348)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (68-161)||(37768-37862)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (84-156)||(7465-7538)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (59-161)||(17667-17771)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (68-217)||(2839-2989)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (68-217)||(26542-26692)
scaffold0124 (68-161)||(3160-3254)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (18-62)||(12285-12329)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (59-137)||(29855-29934)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (1-44)||(4532-4575)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-44)||(52794-52837)
scaffold0018 (1-44)||(56746-56789)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (68-161)||(25382-25476)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (293-334)||(7299-7341)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (87-160)||(7049-7125)


Alignment Details
Target: scaffold0240 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6179 - 5845
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 6080  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6079 atgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 5980  T
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |    
T  5979 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttaatgtaactatatgtatgagaatgttattattgatcaaatacatgatgtttgaattgaaat 5880  T
Q  301 attcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5879 attcatgttaactgttatttggattataatgatgt 5845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 138339 - 138673
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138339 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 138438  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  138439 atatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtataaataattttgaattgatatttgttcatgaaa 138538  T
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  138539 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtataagtatgaaaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaat 138638  T
Q  301 attcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  138639 attaatgttaactgttatttggattatgatgatgt 138673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 76853 - 76589
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  76853 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgca 76754  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||    
T  76753 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatatgaatattat 76654  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76653 ta---atcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 76589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10148 - 10003
Alignment:
Q  88 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattg 184  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  10148 tggtaccacatgcatgtatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattgctgaaatgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttg 10050  T
Q  185 atatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagata 230  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10049 atgattgttcatggcacatgtgattgatgattaattgatgtgagata 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 26071796 - 26072131
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  26071796 cttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgc 26071895  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26071896 atatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagaca 26071995  T
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  26071996 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaa 26072095  T
Q  300 tattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26072096 tatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 26095583 - 26095918
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  26095583 cttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgc 26095682  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26095683 atatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagaca 26095782  T
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  26095783 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaa 26095882  T
Q  300 tattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26095883 tatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26095918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 69 - 334
Target Start/End: Original strand, 15824105 - 15824371
Alignment:
Q  69 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  15824105 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgtttggtgattatgtat 15824204  T
Q  169 gaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 268  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824205 gaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 15824304  T
Q  269 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15824305 attgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15824371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44863711 - 44863443
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44863711 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 44863612  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44863611 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgcgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtataagtatgagaatatta 44863512  T
Q  267 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  44863511 ttattgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 44863443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 142136 - 141869
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  142136 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggttattgtgta 142037  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142036 tgaataattgtgaattgatattcgttcatgacacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 141937  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  141936 tattgatcaagtgcatgatgattaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 141869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47288244 - 47287976
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  47288244 gtgacaaccttgggatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtaattggtgattgtgta 47288145  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47288144 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggtttttgatgtaagtatatgtacgagaatatta 47288045  T
Q  267 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47288044 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 47287976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3893729 - 3893381
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3893729 cttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 3893630  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3893629 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgtt 3893530  T
Q  194 catgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag------tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatga 285  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||      ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||    
T  3893529 catgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatatttatgaggatatcattattgatcaaatgcatga 3893430  T
Q  286 tgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3893429 tgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3893381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12753515 - 12753172
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12753515 cttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 12753416  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc---ttattgatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgt 192  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||| || |     ||||||| ||| ||||||||||||| ||   ||||||  || |    
T  12753415 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttttgaaatgtgattggtgattggtgactgtgtatgaataactgcaaattgatgatttt 12753316  T
Q  193 tcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg-gggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12753315 tcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagaatgtgatataagtat-tatttgtgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 12753217  T
Q  291 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12753216 atattgaattattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 12753172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 112827 - 113168
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccaca 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  112827 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgattcggtaccaca 112926  T
Q  98 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-------tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatattt 190  Q
    ||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||       ||  ||  ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| | |||    
T  112927 tgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattggtgattgataattgcgtatgaataaatgtgaattgttgttt 113026  T
Q  191 gttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 290  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||   |||| |   | || |||||||||||| ||| ||||||    
T  113027 gttcatgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattgagttttgatgtaagtattgatatgtg---actactattgatcaagtgcataatgttt 113123  T
Q  291 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  113124 attttgaaatattcatgctaaatgttatttggattatgatgatgt 113168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 7286328 - 7286522
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 240  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  7286328 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttg 7286427  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  7286428 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgttgattatgatgatgt 7286522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 12545607 - 12545802
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  12545607 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattgttgatgtgagatattggggttttt 12545706  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  12545707 gatgtaagtatatgtataagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtaatgtggactatgatgatgt 12545802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 18305642 - 18305831
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18305642 gatatatgtgattgacgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttggt 18305741  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18305742 gtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18305831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 13867887 - 13868080
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tga 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||    
T  13867887 gatatatgtgattggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattgagattatga 13867986  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13867987 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 13868080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 45453788 - 45454016
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45453788 cttttacttcggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgat---tttgttgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 45453884  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||    
T  45453885 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaat-tgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatgattgttcatgaca 45453983  T
Q  201 catgtgattggtga-ttattgatgtaagatatt 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45453984 catgtgattggtgatttattgatgtgagatatt 45454016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 141 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7291102 - 7290908
Alignment:
Q  141 ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttg 240  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7291102 ttgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttg 7291003  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7291002 atgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7290908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 2192606 - 2192799
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2192606 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 2192705  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  2192706 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatttggattatgataatgt 2192799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 1938300 - 1938532
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||  | |||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  1938300 cttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcaaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 1938398  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1938399 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaacgtgattggtgattacgtatgcataattgtgtattgatatttgtccatgaca 1938498  T
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1938499 catgtgattggtggttattgatgtgagatattgg 1938532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 369336 - 369143
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  369336 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattggtgatgattgatgtgagatattggggtttga 369237  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  369236 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 369143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 14253071 - 14253263
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14253071 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgt-catgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattggggtttga 14253169  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14253170 tgtaagtattgatttgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 14253263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 16480836 - 16481029
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16480836 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 16480935  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16480936 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcatgtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 16481029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 15952859 - 15953050
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15952859 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 15952958  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  15952959 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 15953050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 49049452 - 49049723
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||    
T  49049452 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattgatgaaatgtgaatgattagtgt 49049551  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  49049552 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatgtggat 49049649  T
Q  263 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49049650 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 49049723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 15913965 - 15914075
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15913965 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 15914064  T
Q  101 atgtatgcgtc 111  Q
    || ||||||||    
T  15914065 atttatgcgtc 15914075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 9058165 - 9058311
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9058165 cttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 9058264  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 142  Q
    || |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9058265 atatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 9058311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15629255 - 15629004
Alignment:
Q  88 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattg 184  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  15629255 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtgcatgaataaatgtgagttg 15629156  T
Q  185 atatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatta-ttgatcaagtac 281  Q
    ||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||  | ||||||| | ||||| ||||||    
T  15629155 atgattgttcataacacatctgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatatggatattatgatttgattaagtac 15629058  T
Q  282 atgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15629057 atgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 15629004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13388599 - 13388493
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13388599 cttttacttcggtgattatgtaatacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttctgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 13388500  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  13388499 atttatg 13388493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 32496076 - 32496242
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  32496076 cttttacttcggagattatgtaacgcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 32496175  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32496176 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 32496242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 15761890 - 15762051
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  15761890 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 15761988  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  15761989 atttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 15762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 13867688 - 13867784
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13867688 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgt 13867784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 20587143 - 20587254
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587143 cttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 20587242  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  20587243 atatatgtgtcg 20587254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13273246 - 13272976
Alignment:
Q  69 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 165  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  13273246 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtg 13273147  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
     ||| |||| ||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  ||| | || | |||| | |||    
T  13273146 catggataaatgtgatttgatgattgttccagacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatatcgggattatg--gtatgaatgtatatgtggata 13273049  T
Q  264 ttatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||    
T  13273048 ttattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcttgtcaactgttatgtgaattatgatgatgt 13272976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13376305 - 13376200
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13376305 cttttacttcggtgattatgtaagacgg-tgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccatatgc 13376207  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  13376206 atttatg 13376200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Original strand, 15762262 - 15762429
Alignment:
Q  146 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 244  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15762262 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 15762354  T
Q  245 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15762355 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 15762429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 8565111 - 8565212
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8565111 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttattgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 8565210  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  8565211 at 8565212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11285715 - 11285619
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11285715 gtgacgaccttgagttaatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattaatgattgt 11285619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 18255343 - 18255505
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  18255343 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 18255441  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18255442 gcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18255505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 9322597 - 9322703
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9322597 cttttacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgc 9322696  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  9322697 atatatg 9322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28719086 - 28718977
Alignment:
Q  3 tttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 102  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28719086 tttacttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatgtgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgacttggtaccacatgcat 28718987  T
Q  103 gtatgcgtcg 112  Q
     |||| ||||    
T  28718986 atatgtgtcg 28718977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 11582535 - 11582631
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11582535 gtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 11582631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 198
Target Start/End: Original strand, 15952673 - 15952813
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 157  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  15952673 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagacttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattgg 15952772  T
Q  158 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15952773 agattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 15952813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 235
Target Start/End: Original strand, 16571751 - 16571921
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16571751 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16571850  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 235  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16571851 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16571921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16593911 - 16593741
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16593911 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16593812  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 235  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16593811 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 16571983 - 16572053
Alignment:
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16571983 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16572053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16593679 - 16593609
Alignment:
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16593679 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16593609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Original strand, 13038808 - 13038905
Alignment:
Q  67 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13038808 agtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttattgatatatgtgattggtgattgt 13038905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2024858 - 2024757
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatg----tgattggtgattattgatgtaagatattggggt 237  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2024858 tgatgtatatgattgatgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattgattggtgattattgatgtgagatattgcggt 2024759  T
Q  238 tt 239  Q
    ||    
T  2024758 tt 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 10862515 - 10862683
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10862515 gtgacgaccttgaagtgatttgctactgcatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacataagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 10862614  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgg 234  Q
      ||| |||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10862615 tcatg-ataaatgtg-gttgatgattgttcatgacacatgtgattggtggttacttaatgtaagatattgg 10862683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Original strand, 12249771 - 12249908
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||  ||| ||||    
T  12249771 gtgacgactttgaagtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatttcgaaatgtgattagtgaatgtg 12249870  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacat 203  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||    
T  12249871 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacat 12249908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 12545404 - 12545501
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgattt-ggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  12545404 gtgacgaccttgaggtgattttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 12545501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 12545553 - 12545627
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12545553 tgatatatgggattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtgattggtgatt 12545627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36051147 - 36051075
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051147 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtcttattgatatatgtgattg 36051075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 369471 - 369364
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  369471 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattg 369372  T
Q  157 atgattgt 164  Q
     |||||||    
T  369371 gtgattgt 369364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3058690 - 3058585
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3058690 cttttacttcggagattatataaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 3058592  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  3058591 atttatg 3058585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122987
Alignment:
Q  85 atttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 122987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16210263 - 16210183
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  16210263 gatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgatttgtgattgt 16210183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 171
Target Start/End: Original strand, 18305492 - 18305546
Alignment:
Q  117 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18305492 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgtttatgaa 18305546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2024757 - 2024692
Alignment:
Q  270 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2024757 ttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2024692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Original strand, 2192376 - 2192453
Alignment:
Q  85 atttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  2192376 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 2192453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10988197 - 10988092
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  10988197 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 10988098  T
Q  157 atgatt 162  Q
     |||||    
T  10988097 gtgatt 10988092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 15518435 - 15518539
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15518435 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 15518534  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  15518535 gtgat 15518539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16416684 - 16416509
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  16416684 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 16416592  T
Q  250 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16416591 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 16416509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 16480710 - 16480782
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16480710 atatttgtgattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 16480782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Original strand, 45455505 - 45455581
Alignment:
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45455505 gaatatcattattgatcaagtatatgatttttgaattaaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 45455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 125469 - 125378
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  125469 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtaaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgaccttttggagatttggt 125378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2024998 - 2024904
Alignment:
Q  104 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2024998 tatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2024904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 2027199 - 2027097
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  2027199 cttttacttcggagattatgtaagtcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcggaggtgacgaccttttcgagatttggtaccacatg 2027100  T
Q  100 cat 102  Q
    |||    
T  2027099 cat 2027097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7291335 - 7291277
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7291335 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 7291277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7821500 - 7821406
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7821500 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7821406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7828811 - 7828717
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7828811 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16417043 - 16416949
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  16417043 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 16416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 16480605 - 16480683
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  16480605 gatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 16480683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 27103134 - 27103228
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27103134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27103228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 27110482 - 27110576
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27110482 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27110576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27175192 - 27175098
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27175192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27175098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 38785226 - 38785320
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  38785226 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 38785320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 2192480 - 2192552
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2192480 atatttgttattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 2192552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2436266 - 2436110
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  2436266 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgtgatgtgttttat-catcaaaggtgacgacctttttgagatttggtaccacatgc 2436172  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  2436171 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 2436110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4483320 - 4483268
Alignment:
Q  60 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4483320 catcgaaggtgacgaccttgacgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 4483268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 4483361 - 4483318
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 44  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483361 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 4483318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 11582659 - 11582840
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  11582659 tgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtccatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 11582751  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||| ||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11582752 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattaatcaaatgcatgatgtt--aattgaactattcatgataactgttatttggattatgataatgt 11582840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3055241 - 3055193
Alignment:
Q  117 gtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  3055241 gtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 3055193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13757164 - 13757060
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13757164 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13757065  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  13757064 gtgat 13757060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 25293856 - 25293960
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  25293856 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 25293955  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  25293956 gtgat 25293960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 122951 - 122854
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  122951 tgataaatgtaattggtgattgtgaattaatagttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 122859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11514698 - 11514604
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  11514698 gtgacgaccttgtagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 11514604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 334
Target Start/End: Original strand, 13038989 - 13039114
Alignment:
Q  205 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 302  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||||||| |||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  13038989 tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattatggatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 13039081  T
Q  303 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13039082 tcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13039114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 15443146 - 15443240
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  15443146 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 15443240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 30263727 - 30263805
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  30263727 gatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 30263805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 136
Target Start/End: Original strand, 42057741 - 42057819
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 136  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  42057741 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagt 42057819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Original strand, 3193586 - 3193630
Alignment:
Q  18 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 63  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3193586 atgtaagacgggtgtgaaatgttacat-tgatgtttttgttgcatc 3193630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16210045 - 16209975
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16210045 attattattgatcaaatgcatgatgttaata--gaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 16209975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13460958 - 13460914
Alignment:
Q  19 tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 63  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13460958 tgtaatacgggagtgaaatcttacatttgatgtttttgttgcatc 13460914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 157
Target Start/End: Original strand, 13912691 - 13912791
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| |||  || |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13912691 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccgtaagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13912790  T
Q  157 a 157  Q
    |    
T  13912791 a 13912791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 26010770 - 26010874
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  26010770 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 26010869  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  26010870 gtgat 26010874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 90)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31627074 - 31626739
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31627074 cttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 31626975  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31626974 atgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattaatatttgttcatgaca 31626875  T
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||     
T  31626874 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaa 31626775  T
Q  300 tattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31626774 tatccatgttaactgttatttggattaagatgatgt 31626739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 25646518 - 25646786
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  25646518 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatttgattggtgattgtgtg 25646617  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 266  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25646618 tgaatagttgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaaatattggggttttgatgtaagtatatgtatgtgaatatta 25646717  T
Q  267 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25646718 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 25646786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18775847 - 18775506
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  18775847 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtctttgttgtatcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccacatgc 18775748  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga-------ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||       ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18775747 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaaatgtgaatggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttgtt 18775648  T
Q  194 catgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttata 293  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18775647 tatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatttttttttgaattttattattgatcaagtgcatgatgtttaaa 18775548  T
Q  294 ttgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18775547 ttgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 18775506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22428811 - 22428473
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22428811 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcgtacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 22428712  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| ||    
T  22428711 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatgattgttcatgtca 22428612  T
Q  201 catgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattg 296  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||  || |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22428611 tatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgatgtaagtattgatatatttgagtattattgttgatcaagtacatgatgtttaaattg 22428512  T
Q  297 aattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22428511 aaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22428473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16105194 - 16104850
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  16105194 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggttatccggtaccacatgc 16105095  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgt 192  Q
    || |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||   || || |     ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  ||||    
T  16105094 atttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgattagtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgt 16104995  T
Q  193 tcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt-ggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 290  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16104994 tcatgacaaatgtgataggtgattaattgatgtgagatattgggggtatgatgtaagtattgttatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgttt 16104895  T
Q  291 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16104894 ataacgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16104850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 25745831 - 25746160
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25745831 cttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgagggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatga 25745930  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||  || || |     ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25745931 atttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgtt 25746030  T
Q  194 catgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttat 292  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||  ||           ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  25746031 catgacacacgtgattggggatttattaatgtgagatattggggttt--tg-----------atgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttat 25746117  T
Q  293 attgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25746118 gttgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 25746160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 35017451 - 35017645
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35017451 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 35017550  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35017551 atgtaagtatatctatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgatatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35017645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 35011124 - 35011316
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35011124 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 35011223  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35011224 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35011316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18128532 - 18128340
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18128532 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatatgattggagattattgatgtgagatattggggtttga 18128433  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18128432 tgtaagtatatgtatgggaatgtaattattgatcaagtgcatgatgtttaga-tgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18128340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18579027 - 18578834
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18579027 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttga 18578928  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18578927 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcatatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatcatgt 18578834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 13622937 - 13623121
Alignment:
Q  148 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 247  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13622937 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 13623036  T
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13623037 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13623121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19627690 - 19627498
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19627690 gatatatatgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19627591  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19627590 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataataatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19627498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 319
Target Start/End: Original strand, 14628368 - 14628545
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14628368 tgatacatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 14628467  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    |||||||||   | || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  14628468 tgtaagtattgatgtgggaatattattaatgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatt 14628545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 18004857 - 18005050
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18004857 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18004956  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  18004957 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatgttcatgttaactattatttggattatgataatgt 18005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23975902 - 23975708
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23975902 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 23975803  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23975802 tgtaagtattgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 18843708 - 18843900
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 240  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18843708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 18843807  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18843808 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattaaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18843900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 13016436 - 13016702
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgat--atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||| |  || | || |||||| |||||||||||| |||  | |||||  | |||||||    
T  13016436 gtgacgaccttgagatgatatggtaccacatgcatatttgtgtcggtctatatacacatcatg-catgagtcttatcgattgaatgtgacaggtgattgt 13016534  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatat 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||    
T  13016535 gtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatattttttagaatat 13016633  T
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  13016634 tattattgatcaaatgcttgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgtatttggattatgatgatgt 13016702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 311
Target Start/End: Original strand, 33316422 - 33316582
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33316422 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 33316521  T
Q  251 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaa 311  Q
       | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  33316522 tgatgtgggaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaa 33316582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18422303 - 18422182
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18422303 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 18422204  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatt 189  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18422203 tgaataattgtgaattgatatt 18422182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 19984722 - 19984887
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt-tttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  19984722 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgaccttttggatatttggtaccacatg 19984821  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19984822 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19984887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23151839 - 23151706
Alignment:
Q  202 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  23151839 atgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaaata 23151740  T
Q  302 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23151739 tccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 23151706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32896492 - 32896282
Alignment:
Q  117 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-t 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32896492 gtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatt 32896393  T
Q  216 tattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg 314  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||          |||||  ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||    
T  32896392 tattgatatgagttattggggttatgatgtaagtat----------atatttatatcgatcaagtacataatgtttgaattaaattattcatggtaactg 32896303  T
Q  315 tta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  32896302 ttatttggattatgatgatgt 32896282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 268
Target Start/End: Original strand, 18825647 - 18825774
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 240  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18825647 tgatgtatatgattggtgattgttcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 18825746  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattatt 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18825747 atgtaagtatatatatgagaatattatt 18825774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 235
Target Start/End: Original strand, 25369014 - 25369184
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25369014 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 25369113  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggg 235  Q
    | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25369114 gcatgaataaatgtg-attgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattacttaatgtaagatattggg 25369184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 34965581 - 34965470
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965581 cttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 34965482  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  34965481 atatatgtgtcg 34965470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 18383217 - 18383323
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18383217 cttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 18383316  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  18383317 atttatg 18383323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 33323447 - 33323342
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33323447 ttttactacggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccaaatgca 33323348  T
Q  102 tgtatg 107  Q
    | ||||    
T  33323347 tttatg 33323342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1554485 - 1554324
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  1554485 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 1554387  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  1554386 atttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 1554324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16084052 - 16083970
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16084052 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 16083970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18397434 - 18397163
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg--tgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | || | |   | || |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  18397434 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatataagtgccggtctagatacacatcatg-catgagtcttattggtgatttgtgattgatgatttt 18397336  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | |||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| | |  |||| || |||||| |||| ||||    
T  18397335 gcatgaataaatgtgattggatacttgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagttgttgagatcgtgatatatgtatatatatgtgaat 18397236  T
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18397235 attattattgaccaagtacacgaagtttaaattgaaatattcatgttaaacgttatgtggattatgatgatgt 18397163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22846765 - 22846615
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat----gcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22846765 cttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatcgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgcggtgatttggtactac 22846666  T
Q  97 atgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 142  Q
    |||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22846665 atgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 22846615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16239009 - 16238848
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||   || ||||| ||||||||||    
T  16239009 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgacctttttggagattttgtaccacatg 16238911  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16238910 catatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 16238848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1554113 - 1553946
Alignment:
Q  146 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 244  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1554113 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 1554021  T
Q  245 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  1554020 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 1553946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Original strand, 16889281 - 16889379
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16889281 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgca 16889379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16134915 - 16134814
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16134915 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgaagaccttgaggtgatttggtaccacatgc 16134816  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  16134815 at 16134814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 17790676 - 17790776
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17790676 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttatatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacctagaggtgattcggtaccacatgc 17790774  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  17790775 at 17790776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18128921 - 18128776
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaa-----gtgacgaccttgaggtgatttggtacca 95  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||      ||||||| || |||||||||||||||||    
T  18128921 cttttacttcgaagattatgtaagacaggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagtggcatcgaatcgaaggtgacgaactggaggtgatttggtacca 18128822  T
Q  96 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    ||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18128821 catgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 18128776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Original strand, 35017303 - 35017387
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35017303 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 35017387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11214784 - 11214623
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  11214784 cttttacttcggagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgacctttttggagatttggtaccacatg 11214686  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11214685 catttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatgat 11214623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 35137483 - 35137565
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 83  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35137483 cttttactacgaagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 35137565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19852906 - 19852795
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19852906 cttttatttcgatgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 19852807  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  19852806 atatatgtgtcg 19852795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 334
Target Start/End: Original strand, 16827873 - 16828003
Alignment:
Q  205 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 304  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  16827873 tgattgatgattattgatgtgagataatggggtttgatgtaagtattgacgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 16827972  T
Q  305 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16827973 atattaactgttatttggattatgataatgt 16828003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18740935 - 18740863
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18740935 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 18740863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4989485 - 4989379
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  4989485 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattg 4989386  T
Q  157 atgattg 163  Q
    |||||||    
T  4989385 atgattg 4989379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Original strand, 13622800 - 13622878
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13622800 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 13622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 1659231 - 1659387
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  1659231 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 1659325  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1659326 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtgat 1659387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23220333 - 23220222
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23220333 cttttacttcagtgataatataagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatggataacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 23220234  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  23220233 atatatgtgtcg 23220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 33316158 - 33316260
Alignment:
Q  60 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 158  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  33316158 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 33316257  T
Q  159 gat 161  Q
    |||    
T  33316258 gat 33316260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17787827 - 17787746
Alignment:
Q  254 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  17787827 tatgataatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattattattttgattatgatgatgt 17787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 14628185 - 14628289
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  14628185 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattg 14628284  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  14628285 gtgat 14628289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23976157 - 23976053
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23976157 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 23976058  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  23976057 gtgat 23976053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26088423 - 26088319
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26088423 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 26088324  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  26088323 gtgat 26088319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23976023 - 23975956
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23976023 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23975956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 16827462 - 16827559
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  16827462 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtcttaaatgatgtatgtgatttatgattgt 16827559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 18004635 - 18004732
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  18004635 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgattgt 18004732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 14628316 - 14628388
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14628316 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 14628388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25173590 - 25173518
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25173590 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25173518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Original strand, 18825420 - 18825515
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 163  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18825420 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18825515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 23151896 - 23151845
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23151896 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtt 23151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 1651468 - 1651605
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  1651468 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 1651562  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1651563 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 1651605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4989171 - 4989004
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  4989171 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 4989079  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    |||||||||  |||| |     |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  4989078 tgtaagtattaatgtgt-----tattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttatttgttatt 4989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15738757 - 15738590
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| |  ||| | | |||||||| ||||||||    
T  15738757 gtgacgacgttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatgatgacatgagtttatttggtgaaatgtgattaatgattgt 15738658  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 233  Q
      ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||  || |||||||||||||    
T  15738657 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacgtgtgaacggtgattgtttaatgtaagatattg 15738590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16238765 - 16238711
Alignment:
Q  148 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacaca 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16238765 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacaca 16238711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18740828 - 18740645
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||    
T  18740828 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttttgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatatctggatgtga 18740736  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18740735 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattcaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18740645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25174134 - 25174040
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  25174134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25174040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 27655670 - 27655764
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27655670 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 27655764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 172
Target Start/End: Original strand, 28196439 - 28196546
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  28196439 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatataagtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 28196538  T
Q  165 gtatgaat 172  Q
    | ||||||    
T  28196539 gcatgaat 28196546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Original strand, 18843481 - 18843576
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 163  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18843481 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18843576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4989275 - 4989201
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  4989275 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 4989201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10487458 - 10487364
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10487458 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 10487364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15861373 - 15861243
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  15861373 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 15861279  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 136  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15861278 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 16377869 - 16377963
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16377869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16377963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 16385193 - 16385287
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16385193 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16385287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18422185 - 18422115
Alignment:
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  18422185 tattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 18422115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Original strand, 33316292 - 33316353
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  33316292 tgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgtttctgatacatgtgattggt 33316353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 212
Target Start/End: Original strand, 16827663 - 16827733
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 212  Q
    |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16827663 tgatttatatgattggtgattatgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggt 16827733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 17343864 - 17343942
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17343864 gattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatataagtgattggtgat 17343942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16374999 - 16374954
Alignment:
Q  18 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16374999 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttacatc 16374954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16230169 - 16230065
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  16230169 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 16230070  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  16230069 gtgat 16230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23993749 - 23993645
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  23993749 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 23993650  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  23993649 gtgat 23993645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 29871049 - 29871153
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  29871049 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 29871148  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  29871149 gtgat 29871153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 16650820 - 16650899
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16650820 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16650899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 18004770 - 18004827
Alignment:
Q  158 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18004770 tgattgtgaatgaatagttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 18004827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 19984915 - 19985096
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||     ||||  |||| |||  |||||||| |||||||| ||| |||    
T  19984915 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaatcgataattgttca-----catg--attgatgacgattgatgtgagatattgaggtgtga 19985007  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    | |||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19985008 tataagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19985096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 22227278 - 22227356
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22227278 gattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25173805 - 25173731
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  25173805 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 25173731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 18835474 - 18835544
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18835474 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18835544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21930462 - 21930417
Alignment:
Q  68 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21930462 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 21930417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Original strand, 31162441 - 31162486
Alignment:
Q  18 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 63  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31162441 atgtaagacggatgtcaaatcttacatatgatgtttttgttgcatc 31162486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896494
Alignment:
Q  96 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta 140  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 32896494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38094 - 37760
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38094 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgca 37995  T
Q  102 tgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacac 201  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37994 tgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttagtgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacac 37895  T
Q  202 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatt 300  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  37894 ttgttattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaat 37795  T
Q  301 attcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37794 atccatggtaactgttatttggattatgatgatgt 37760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 95)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41244268 - 41243948
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41244268 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 41244169  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||||||||||||||||    
T  41244168 atatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatcttattgatatatgtgattgagg--------------attgtgtattgatatttgttcatgaca 41244083  T
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  41244082 catgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaat 41243983  T
Q  301 attcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41243982 atacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41243948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37605625 - 37605283
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgac-gaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  37605625 cttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcgaaggtgacagaccttgaggtgatccggtaccacatg 37605526  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg-------tgtatgaataattgtgtattgatatttgt 192  Q
    ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37605525 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgatgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgt 37605426  T
Q  193 tcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  37605425 tcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgaaatattggggtttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttga 37605326  T
Q  293 attgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  37605325 attgaaatattcatgttaactgttatttagattatgatgatgt 37605283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25121012 - 25120745
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25121012 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttgataattgtgta 25120913  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120912 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatttatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 25120813  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25120812 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25120745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 19994802 - 19995078
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  19994802 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgtg 19994901  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatg--------taagtatatgtatga 258  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||        ||  ||||| |||||    
T  19994902 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagttattggggttttgatgtatatatatatatatatatatga 19995001  T
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  19995002 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactattattttgattatgatgatgt 19995078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20480166 - 20479893
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||     
T  20480166 gtgacgacattgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgctcggtgattatgtg 20480067  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagta------tatgtatgaga 260  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||      ||| |||||||    
T  20480066 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatatttgggttttgatgtaagtatatatgtatatatgaga 20479967  T
Q  261 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20479966 atatcatt-ttgatcaaatgcatgatgtttatattgaactatccatgttaagtgttattttgattatgatgatgt 20479893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16416810 - 16416537
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||     
T  16416810 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattcatatatgtgttcggtgattgtgtg 16416711  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgaga 260  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||      ||| |||  ||    
T  16416710 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattattgattattgatgtgagatattggggttttgatgtgagtatatatgtatatatttga 16416611  T
Q  261 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  16416610 atatcattattgatcaa-tgtatgatgtttatattgaactatccatgttaattattattttgattatgatgatgt 16416537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18610620 - 18610428
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18610620 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 18610521  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18610520 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 18610428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 41508927 - 41509122
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41508927 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgagtggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41509026  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41509027 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcctgatgtttgaattgaaatatccatattaactgttatttggattatgatgatgt 41509122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 147 - 334
Target Start/End: Original strand, 24719328 - 24719513
Alignment:
Q  147 tatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  24719328 tatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgcaa 24719427  T
Q  247 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24719428 gtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24719513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 13664550 - 13664743
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13664550 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13664649  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13664650 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13664743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 13723825 - 13724018
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13723825 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13723924  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13723925 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13724018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Original strand, 22008366 - 22008548
Alignment:
Q  153 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  22008366 attgatgattgtgtatgaataactatgaaatgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattg 22008465  T
Q  253 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22008466 atgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttaactgttatttggattatgataatgt 22008548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 22909342 - 22909535
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||    
T  22909342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatttgagatattgggatttga 22909441  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22909442 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 22909535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 334
Target Start/End: Original strand, 20655677 - 20655943
Alignment:
Q  80 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatga 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||     |||||| |||||||||||||    
T  20655677 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatga 20655776  T
Q  171 ataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 268  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||  |||| | ||||||||    
T  20655777 ataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggatcatgatataagtatacatatgtggatattatt 20655876  T
Q  269 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20655877 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 20655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 24108465 - 24108657
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 240  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  24108465 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgacatattggagttttg 24108564  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  24108565 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 24108657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16203855 - 16204098
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||| | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16203855 cttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgaattgatccatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatg 16203954  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgac 199  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||          
T  16203955 catatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt------ 16204048  T
Q  200 acatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
     |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  16204049 -catgtgattaatgattattgatgtgagatattggagtgtgatgcaagtat 16204098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23509261 - 23509068
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  23509261 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgatgattgatgtgcgatattggggtttga 23509162  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |  | ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23509161 tgtaagtattgatgcgggaatattattattgaccaaatgtaggatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 23509068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 319
Target Start/End: Original strand, 22323225 - 22323398
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  22323225 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 22323324  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    |||||| ||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22323325 tgtaagcattgttatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcatgttaactgttatt 22323398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 270138 - 269950
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  270138 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 270039  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270038 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 269950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 645782 - 645970
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  645782 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 645881  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  645882 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 645970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 831517 - 831705
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  831517 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 831616  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  831617 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 831705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 37655178 - 37655324
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37655178 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggcaccacatgc 37655277  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 142  Q
    || |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37655278 atatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 37655324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 16043054 - 16043245
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 241  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16043054 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16043153  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16043154 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16043245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17343632 - 17343480
Alignment:
Q  181 attgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||   | || |||||||||||||||||||||     
T  17343632 attgatatttgttcatgacacatgtgattggcgattattgatgtgggatattggggtttgatg--agtattgatgtgggaatattattattgatcaagtg 17343535  T
Q  281 catgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17343534 catgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17343480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 16041378 - 16041569
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 241  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16041378 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16041477  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16041478 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16041569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 21192278 - 21192384
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21192278 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgattcggtaccacatgc 21192377  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  21192378 atttatg 21192384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 39448354 - 39448460
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39448354 cttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 39448453  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  39448454 atttatg 39448460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 31195816 - 31195917
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31195816 cttttacttcggagattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgc 31195915  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  31195916 at 31195917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 17731117 - 17731286
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  17731117 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 17731216  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 233  Q
    |||| ||||| ||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17731217 gtataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattaattgatgtgagatattg 17731286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 21199705 - 21199811
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21199705 cttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgattcggtaccacatgc 21199804  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  21199805 atttatg 21199811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21696192 - 21696086
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21696192 cttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 21696093  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  21696092 atttatg 21696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29758933 - 29758768
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt-tttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  29758933 cttttacttcggagattttgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgatttgttccatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatg 29758834  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29758833 catttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 29758768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 24719077 - 24719165
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24719077 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatatgattg 24719165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23835851 - 23835746
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23835851 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtg-ttcggtaccacatgc 23835753  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  23835752 atttatg 23835746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41245295 - 41245210
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41245295 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgat 41245210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 22498835 - 22498947
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498835 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 22498934  T
Q  101 atgtatgcgtcga 113  Q
    || |||| |||||    
T  22498935 atatatgtgtcga 22498947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38532152 - 38531882
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||  || ||| | | ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  38532152 gtgacgaccttgaagtgatatggtaccccatgcatatatgtgtcgaactaggtgtacagcatgacatgagtcttatgggtgaaatgtgattgatgattgt 38532053  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || | | ||||||| |||  | ||    
T  38532052 gcat-aataattgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattacttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatatat--ggat 38531957  T
Q  263 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  38531956 attcttatttgattaagtgcatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttatatgaattatgatgatgt 38531882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 270378 - 270226
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  270378 cttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 270281  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 155  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  270280 atatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 270226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 645542 - 645694
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  645542 cttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 645639  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 155  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  645640 atatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 645694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 831277 - 831429
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  831277 cttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 831374  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 155  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  831375 atatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 831429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 23116352 - 23116458
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23116352 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgc 23116451  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  23116452 atatatg 23116458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25294582 - 25294490
Alignment:
Q  52 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25294582 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25294490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25756571 - 25756479
Alignment:
Q  52 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25756571 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25756479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33170890 - 33170785
Alignment:
Q  7 cttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 106  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33170890 cttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 33170791  T
Q  107 gcgtcg 112  Q
    | ||||    
T  33170790 gtgtcg 33170785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28543440 - 28543270
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  28543440 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatttgattggtgattgt 28543342  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 235  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28543341 gcatgaataaatgtgatttgataattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattggg 28543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 334
Target Start/End: Original strand, 6776303 - 6776422
Alignment:
Q  216 tattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  6776303 tattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgt 6776402  T
Q  316 ta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  6776403 tatttggattatgataatgt 6776422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22312301 - 22312190
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22312301 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgactttgaggtgatttggtaccacatgc 22312202  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  22312201 atatatgtgtcg 22312190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 45560750 - 45560861
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45560750 cttttaattcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgc 45560849  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    ||||||| ||||    
T  45560850 atgtatgtgtcg 45560861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 43375310 - 43375493
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  43375310 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 43375402  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  43375403 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 43375493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 24930633 - 24930789
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  24930633 cttttacttcagagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 24930732  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgat 154  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24930733 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgat 24930789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 33612593 - 33612694
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33612593 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 33612692  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  33612693 at 33612694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 18768422 - 18768691
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  18768422 gtgacgactttgaagtgaaatggtaccatatgcatgtatgtgtcgaacttggtgcataacatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 18768521  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | |||| ||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || | | ||||||  |||  | ||    
T  18768522 gcatga-taaatatg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattggaattatggtatgagtata--tatttggat 18768617  T
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18768618 attattattgagtaagtacatgatatttgaattgatttattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 18768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 22008139 - 22008236
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22008139 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22008236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 23153341 - 23153452
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23153341 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacaccatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgc 23153440  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  23153441 atatatgtgtcg 23153452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Original strand, 24108245 - 24108368
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| |||     
T  24108245 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtg 24108344  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttg 191  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  24108345 tgaataattgtgaattgatgtttg 24108368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 3433535 - 3433718
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3433535 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3433627  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3433628 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3433718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 22323102 - 22323197
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  22323102 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgataaatgtgtttggtgattgt 22323197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 43375202 - 43375274
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43375202 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 43375274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 24387226 - 24387383
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||   ||||||| |||||||   ||||| ||||  | |||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  24387226 cttttacttcggagattatgtaaggcaggggtgagcccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgaccttttga-gatttggtaccacat 24387324  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24387325 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatgattg 24387383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28543213 - 28543151
Alignment:
Q  272 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28543213 gatcaagtacatgatgttta-attgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 28543151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23509491 - 23509397
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23509491 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23509397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 13664296 - 13664393
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13664296 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13664393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 13723571 - 13723668
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13723571 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13723668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 13664424 - 13664496
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13664424 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13664496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 13723699 - 13723771
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13723699 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13723771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 22909146 - 22909242
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||||||||||    
T  22909146 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttgaaaatgtgattgatgattgt 22909242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24238174 - 24238065
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24238174 cttttacttcggcgataatgtaagatgg--acgaaatcgtacatacgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgagctgatttggtaccacatgc 24238077  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  24238076 atatatgtgtcg 24238065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23509378 - 23509315
Alignment:
Q  153 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23509378 attgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 334
Target Start/End: Original strand, 23631046 - 23631173
Alignment:
Q  205 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 304  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  23631046 tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 23631142  T
Q  305 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  23631143 atgttaactgttatttggattatgataatgt 23631173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24547861 - 24547724
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  24547861 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 24547767  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24547766 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24547724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 3433150 - 3433254
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  3433150 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 3433249  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  3433250 gtgat 3433254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 21846065 - 21846169
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21846065 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 21846164  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  21846165 gtgat 21846169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 21853470 - 21853574
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21853470 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 21853569  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  21853570 gtgat 21853574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28836155 - 28835980
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  28836155 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 28836063  T
Q  250 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  28836062 tta--atgtgta-attattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcaggttaactgttatttggattatgataatgt 28835980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 3433285 - 3433352
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3433285 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3433352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 37609999 - 37609956
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 44  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37609999 cttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 37609956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 272786 - 272880
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  272786 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 272880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 643063 - 642969
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  643063 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 642969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 828869 - 828775
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  828869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 828775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5236768 - 5236674
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5236768 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11543146 - 11543088
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 59  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11543146 cttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttg 11543088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 39448573 - 39448646
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39448573 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 39448646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Original strand, 17731331 - 17731387
Alignment:
Q  279 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17731331 tacatgatatttaaattgaatcattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 17731387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 22090018 - 22090097
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  22090018 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 22090097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29758740 - 29758643
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||       |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29758740 tgataaatgtaattggtgattgtgaatgaatagttgtgaattgataattgttaatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 29758648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 16874513 - 16874617
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  16874513 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 16874612  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  16874613 gtgat 16874617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 224737 - 224816
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  224737 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 224816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 738360 - 738439
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  738360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 738439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 862255 - 862334
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  862255 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 862334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 15320634 - 15320713
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15320634 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15320713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 15501003 - 15501082
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15501003 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15501082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 16675900 - 16675979
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16675900 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16675979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21695941 - 21695899
Alignment:
Q  293 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21695941 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 21695899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 24662830 - 24662924
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24662830 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 24662924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 216
Target Start/End: Original strand, 3433390 - 3433455
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3433390 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3433455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 256560 - 256827
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  256560 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 256659  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256660 tgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 256759  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  256760 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaaatattcatattaactgttatttggattatgatgatgt 256827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Original strand, 125009 - 125089
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  125009 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 125089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Original strand, 72028 - 72106
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  72028 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Original strand, 76409 - 76487
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  76409 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 76487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 193057 - 192985
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193057 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 192985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 334
Target Start/End: Original strand, 72191 - 72317
Alignment:
Q  204 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  72191 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 72283  T
Q  302 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  72284 ttcatgataactgttatttggattatgatgatgt 72317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 334
Target Start/End: Original strand, 76572 - 76698
Alignment:
Q  204 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  76572 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 76664  T
Q  302 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76665 ttcttgataactgttatttggattatgatgatgt 76698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 334
Target Start/End: Original strand, 125173 - 125298
Alignment:
Q  205 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 302  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  125173 tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 125265  T
Q  303 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  125266 tcatgataactgttatttagattatgatgatgt 125298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 192897 - 192768
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  192897 catgtaattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 192805  T
Q  299 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  192804 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 192768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 95)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 46 - 334
Target Start/End: Original strand, 12837900 - 12838192
Alignment:
Q  46 cgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattg 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12837900 cgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtctttttg 12837999  T
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgat 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12838000 atatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggttttgat 12838099  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12838100 ataagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12838192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 21961096 - 21961440
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21961096 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 21961195  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgt 192  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   || || |     ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  ||||    
T  21961196 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgtttagtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgt 21961295  T
Q  193 tcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 290  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||| |||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961296 tcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagctattgggagtatgatttaagtattgatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgttt 21961395  T
Q  291 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21961396 atattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21961440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44345333 - 44345057
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||     
T  44345333 gtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatatgtttggtgattgtgtg 44345234  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaa--------gtatatgtatga 258  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||    
T  44345233 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatatga 44345134  T
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  44345133 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttgttttgattatgatgatgt 44345057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 12901300 - 12901631
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12901300 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 12901399  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 194  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || |     ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||    
T  12901400 atttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttgaaatgtgattggtgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgattattgttc 12901499  T
Q  195 atgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttat 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||          |||||  |||||||||||||||||||||||      
T  12901500 atgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat----------atatttatattgatcaagtacatgatgtttga 12901589  T
Q  293 attgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12901590 att-aattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12901631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 67 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33738732 - 33738477
Alignment:
Q  67 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33738732 agtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgt 33738633  T
Q  167 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||                
T  33738632 atgaataattgtgaattgatatttgctcatggcacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatg------------ 33738545  T
Q  266 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
      |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33738544 --tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 33738477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18167067 - 18166874
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18167067 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18166968  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18166967 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 18166874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34393580 - 34393385
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 239  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  34393580 tgatatatgtgattggcgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacagatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 34393481  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34393480 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34393385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 53909555 - 53909750
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 239  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  53909555 tgataaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 53909654  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  53909655 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgatgatgt 53909750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 16366361 - 16366624
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  16366361 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattagtgattgtgaa 16366460  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 265  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  16366461 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatttgattgatgattattgatgtgagatattagggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 16366555  T
Q  266 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16366556 attattgatcaaacgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactattatttggattatgatgatgt 16366624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 19699414 - 19699606
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19699414 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19699513  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19699514 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 19709999 - 19710191
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19709999 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19710098  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19710099 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19710191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 7134310 - 7134503
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7134310 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgggatattggggtttga 7134409  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7134410 tgtaattattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7134503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8372800 - 8372607
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8372800 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 8372701  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8372700 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcttgttaactgttatttggattatgataatgt 8372607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 15274470 - 15274663
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15274470 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 15274569  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15274570 tgtaagtattgatgtgggaattttattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15274663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26678370 - 26678179
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  26678370 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgataggtgaatattgatgtgacatattggggtttga 26678271  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  26678270 tgtaagtattgatatgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 26678179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44054427 - 44054168
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  44054427 gtgacggccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 44054328  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatt 265  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||          |||||    
T  44054327 tgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgactggtgatttattgatatgagatattgggattatgatgtaagtat----------atatt 44054238  T
Q  266 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
      ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44054237 tatatcgatcaagtacatgatgtttgaattaaattaattatgttaactgttatttggattatgatgatgt 44054168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 8874021 - 8874162
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8874021 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 8874120  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
    || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8874121 atttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 8874162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14900112 - 14899948
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14900112 cttttacttcggtgattttgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcggaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgc 14900013  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 162  Q
    || |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  14900012 atatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 14899948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 45460611 - 45460894
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgatt- 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| |||||     
T  45460611 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccgcatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaactgtgattggtgattt 45460710  T
Q  163 -------gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatg 253  Q
           |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||     
T  45460711 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatgaattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatata 45460810  T
Q  254 --tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  45460811 catatgtgaatattatcattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattattatgatgt 45460894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 34197702 - 34197812
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34197702 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 34197801  T
Q  101 atgtatgcgtc 111  Q
    || ||||||||    
T  34197802 atttatgcgtc 34197812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 37958594 - 37958704
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37958594 cttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 37958693  T
Q  101 atgtatgcgtc 111  Q
    || ||||||||    
T  37958694 atttatgcgtc 37958704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13244861 - 13244606
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13244861 gtgacgaccctgaaatgatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 13244762  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 265  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  13244761 tgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 13244674  T
Q  266 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13244673 attattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13244606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 27959664 - 27959563
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27959664 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 27959565  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  27959564 at 27959563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 334
Target Start/End: Original strand, 53706635 - 53706828
Alignment:
Q  140 attgatatatgtgatt-gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt 238  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  53706635 attgatatatgtgatttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtg 53706734  T
Q  239 tgatgtaagta--tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||   || ||||      ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53706735 tgatgtaagtactaatttatg-----tttactattgatcaaatgcatgatgtttatactgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 53706828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 12245789 - 12245895
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12245789 cttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 12245888  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  12245889 atttatg 12245895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 110120 - 109957
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  110120 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 110022  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  110021 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 109957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 13811287 - 13811558
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || || |||||||    
T  13811287 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgcgaatgttgattgt 13811386  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||  ||| | || | |||  | ||    
T  13811387 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcattacacgtgtgattggtgattaatggatgtaagatattgggattatg--gtatgaatttatatttggat 13811484  T
Q  263 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13811485 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 13811558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 30236147 - 30236411
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgattg 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| ||| ||    
T  30236147 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatccatatatgtgtcaaattaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaattgtgattggtgactg 30236246  T
Q  164 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 261  Q
    ||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||          
T  30236247 tgtatgaataactgtgaattattgattgttcatgacacatgtaattggtgatttattgatgtgagatattgcagttatgatataagtatatata------ 30236340  T
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
       |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30236341 ---tattattgatcaggtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 30236411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 22356424 - 22356616
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttg 240  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22356424 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 22356523  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| ||||||   |||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22356524 atgcaagtattgttatgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattattgttaactgttatttggattatgataatgt 22356616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 41167471 - 41167569
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41167471 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatctcacatacgatgtttttgttacatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatg 41167569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 15852853 - 15852959
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15852853 cttttacttcggagattatgtaagactttggtgaaatcttacatacgatgttttttttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 15852952  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  15852953 atttatg 15852959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15211981 - 15211762
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttga-ggtgatttggtaccaca 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | |||||| ||||   ||  |||||||||||||    
T  15211981 cttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgtcctttttggatatttggtaccaca 15211882  T
Q  98 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 196  Q
    ||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| || || || ||||||||||||||||    
T  15211881 tgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgagtatttttgaattgatatttgttcat 15211782  T
Q  197 gacacatgtgattggtgatt 216  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  15211781 gatacatgtaattggtgatt 15211762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 334
Target Start/End: Original strand, 20813715 - 20813890
Alignment:
Q  161 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatga 258  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||  |||     
T  20813715 ttgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattaatgaattattgatgtgaaatattgggattatgatataagtatatacatgt 20813814  T
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20813815 gtgaat-attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 20813890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 47355688 - 47355509
Alignment:
Q  153 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 251  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  47355688 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 47355589  T
Q  252 tgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 334  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||    |||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47355588 gttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatcatgt---aattgaaatgttcgtgataactgttattggattatgataatgt 47355509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 53909431 - 53909519
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909431 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 53909519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 334
Target Start/End: Original strand, 18294600 - 18294746
Alignment:
Q  189 ttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgt 288  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18294600 ttgttcatgatttatgtgatcggtgattattgatgtgagatattgggatttaatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtagatgatat 18294699  T
Q  289 ttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18294700 ttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18294746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 5372231 - 5372342
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5372231 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaagtcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgc 5372330  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  5372331 atatatgtgtcg 5372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 10238970 - 10239081
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238970 cttttactttggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttgttgcatcatgtgtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 10239069  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  10239070 atatatgtgtcg 10239081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 47469870 - 47469976
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47469870 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttggggttatttggtaccacatgc 47469969  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  47469970 atatatg 47469976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Original strand, 41257889 - 41258031
Alignment:
Q  5 tacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgt 104  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41257889 tacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatat 41257988  T
Q  105 atgcgtcg--atatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 142  Q
    ||| ||||   || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41257989 atgtgtcggactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 41258031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Original strand, 50223696 - 50223806
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50223696 ttttacttcggtgataatgtaagacgggtatgaaatctaacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgaccttgaggtgatttggtatcacatgca 50223795  T
Q  102 tgtatgcgtcg 112  Q
    | |||| ||||    
T  50223796 tatatgtgtcg 50223806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 160
Target Start/End: Original strand, 43283043 - 43283138
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatga 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  43283043 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatga 43283138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 164
Target Start/End: Original strand, 5684479 - 5684586
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  5684479 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattg 5684578  T
Q  157 atgattgt 164  Q
    ||||||||    
T  5684579 atgattgt 5684586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15211698 - 15211515
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||    
T  15211698 tgataaatgtgattggtgattgttaatgaatatttgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattgaggtgtga 15211606  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  ||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15211605 tgtaagtatgaatgtatga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15211515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 334
Target Start/End: Original strand, 8874265 - 8874346
Alignment:
Q  254 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8874265 tatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 8874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10642683 - 10642586
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  10642683 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 10642586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16521428 - 16521294
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  16521428 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttggcttgtc-catcggaggtgacgaccttttgaagatttggtaccacat 16521330  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga 134  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16521329 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34393666 - 34393610
Alignment:
Q  160 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393666 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 34393610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Original strand, 52267125 - 52267196
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  52267125 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 174
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706591
Alignment:
Q  98 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 174  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttggtgattgtgtgtgaataa 53706591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Original strand, 55378542 - 55378646
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  55378542 gtgattgatgattgtgtatgaatatttgtgatttgatgattgttcatgacacataagattggtgattaattgatgtgagatattggaattatgatgtaag 55378641  T
Q  248 tatat 252  Q
    |||||    
T  55378642 tatat 55378646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8372921 - 8372854
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8372921 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 8372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18167164 - 18167097
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18167164 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 18167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 18496065 - 18496334
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga-tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||| || | | || ||| |||||| ||||    
T  18496065 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaactaggtgcacatcatgacatgagttttaatggtgaaatatgagtgatgactgtg 18496164  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
     || ||||| ||||  |||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || || | | | ||||| | ||   |||    
T  18496165 cataaataaatgtgatttgatgattattcatgaaacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatggtatgaatatatttgtg---ata 18496261  T
Q  264 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||  ||| || | |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18496262 ttattatcggattaaatgcatgatatttaaattgaactattcatgttatttgttatatggattatgatgatgt 18496334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19999099 - 19999005
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19999099 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19999005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 154
Target Start/End: Original strand, 54119906 - 54119976
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 154  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54119906 gatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgat 54119976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 216
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134208
Alignment:
Q  95 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 194  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtg-ttgcgaatgaatatttgtgaattgatatttattc 7134186  T
Q  195 atgacacatgtgattggtgatt 216  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  7134187 ctgatacatgtgattggtgatt 7134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9293843 - 9293712
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  9293843 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa 9293749  T
Q  299 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     ||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9293748 atatccatgttatctgttatttggattatgataatgt 9293712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9294021 - 9293924
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||    
T  9294021 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgattgt 9293924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10642505 - 10642374
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  10642505 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 10642411  T
Q  299 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  10642410 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 10642374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 15138134 - 15138238
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15138134 gcatcgaaaggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 15138233  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  15138234 gtgat 15138238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19998700 - 19998517
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  19998700 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 19998608  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| |||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  19998607 tgtgagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttgactgttatttggattatgataatgt 19998517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26678626 - 26678522
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  26678626 gcatcgaaagatgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattg 26678527  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  26678526 gtgat 26678522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 47355907 - 47355803
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47355907 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 47355808  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  47355807 gtgat 47355803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26678491 - 26678428
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26678491 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 26678428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8373029 - 8372951
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8373029 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 8372951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14994772 - 14994678
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  14994772 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 14994678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18167273 - 18167195
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18167273 gatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 18167195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18246762 - 18246668
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18246762 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18246668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19998973 - 19998907
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19998973 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19998907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Original strand, 15274361 - 15274442
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  15274361 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 15274442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19998845 - 19998780
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  19998845 tgattggtgattgtgtatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtaattggtgatt 19998780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 163
Target Start/End: Original strand, 22356139 - 22356244
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 157  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  22356139 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattgg 22356238  T
Q  158 tgattg 163  Q
    ||||||    
T  22356239 tgattg 22356244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 217
Target Start/End: Original strand, 13751910 - 13751978
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 217  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13751910 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacatatgtgattggtgatta 13751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18246250 - 18246178
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  18246250 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 18246178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47355769 - 47355705
Alignment:
Q  152 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  47355769 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 47355705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7848902 - 7848776
Alignment:
Q  88 tggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgat 186  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||| |||||  ||| |    
T  7848902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctcatttgaaat-tgtgagtggtgattgtgtgcgaatagttgtggtttggt 7848804  T
Q  187 atttgttcatgacacatgtgattggtga 214  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  7848803 atttgtttaggacccatgtgattggtga 7848776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16520985 - 16520801
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16520985 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatatagatgtaagatatcggggtgtga 16520893  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatg-tttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  16520892 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgttttaaattgaaatatccatgttaactattatttagattatgatgatgt 16520801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Original strand, 54120066 - 54120195
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||| | | |||||||||   ||||||    
T  54120066 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcgaatgcatgatgtt--aattgaa 54120158  T
Q  299 ttattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  54120159 atatccatgttaattgttaattggattatgttgatgt 54120195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 327
Target Start/End: Original strand, 55378691 - 55378757
Alignment:
Q  261 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatg 327  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  55378691 atattattattgattaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaacagttattggattatg 55378757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14950602 - 14950498
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  14950602 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattg 14950503  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  14950502 gtgat 14950498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 109922 - 109828
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 248  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  109922 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 109830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15043443 - 15043381
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15043443 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15043381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 128
Target Start/End: Original strand, 15110981 - 15111043
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15110981 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16521080 - 16521015
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  16521080 tgattggtgattgtgtatgaataattgttaattgatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 16521015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 124
Target Start/End: Original strand, 53706465 - 53706521
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatat 124  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  53706465 gtgacgaccctgaggtgatctagtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatat 53706521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16521263 - 16521168
Alignment:
Q  104 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga-gtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16521263 tatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgatggcttattttgaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 16521168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10487243 - 10487149
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  10487243 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 10487149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 16329508 - 16329602
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16329508 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 16329602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18246465 - 18246391
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  18246465 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtggattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 18246391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 234
Target Start/End: Original strand, 43283140 - 43283185
Alignment:
Q  190 tgttcatgacacatgtgattggtgattattg-atgtaagatattgg 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43283140 tgttcatgacatatgtgattggtgattgttgaatgtaagatattgg 43283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 329
Target Start/End: Original strand, 5684742 - 5684802
Alignment:
Q  270 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 329  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5684742 ttgatcaagtgcatgatgtttaatttgtaatattcatgttaactgttatttggattatgat 5684802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 13049739 - 13049843
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13049739 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatatgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13049838  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  13049839 gtgat 13049843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 17213380 - 17213420
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctta 41  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17213380 cttttacttcggcgaaaatgtaagacgggtgtgaaatctta 17213420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 17377040 - 17377084
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17377040 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacattcatatatgtgtcg 17377084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 72)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 22407894 - 22408162
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22407894 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 22407993  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22407994 tgaataattgtgaattgatatttgctcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatatta 22408093  T
Q  267 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22408094 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 22408162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 2422733 - 2422997
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  2422733 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 2422832  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  2422833 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa---tat 2422929  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2422930 tattgatcaagtgtatgatgtttatattgaaatatccatgttaattgttatttggattatgttgatgt 2422997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35053472 - 35053141
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35053472 cttttacttatgagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 35053373  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga-------ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||       ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35053372 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtgtttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgtt 35053273  T
Q  194 catgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttata 293  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  35053272 catgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattgtggtttg----------atgtatgagaatgttattattgatcaagtacatggtgtttaaa 35053183  T
Q  294 ttgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  35053182 ttgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 35053141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41217739 - 41217544
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41217739 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41217640  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41217639 gatgtaagtatatttatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41217544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Original strand, 5676350 - 5676535
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676350 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagta 5676449  T
Q  250 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5676450 tatgcatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttataatgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 5676535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20252534 - 20252342
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20252534 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatattcgttcatgatacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 20252435  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20252434 gtaagtattgatatgataatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20252342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 5676137 - 5676355
Alignment:
Q  4 ttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  5676137 ttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtgatacggtaccacatgcatt 5676236  T
Q  104 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg-------attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 196  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||       |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5676237 tatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtaattggtgattgtgtatgaataattatgtattgatatttg-tcat 5676335  T
Q  197 gacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5676336 gacacatgtgattggtgatt 5676355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49966151 - 49966013
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49966151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 49966052  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtg 206  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49966051 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtg 49966013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 9786123 - 9786315
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  9786123 tgatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacaaatgtgattggagattattgatgtgagacattgggg-ttga 9786221  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9786222 tgtaagtacatgtatgaggatattattattgatcaagtgtatgatgtttatgatgaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 9786315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 35524082 - 35524350
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  35524082 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcacgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 35524181  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| | |||| |||||    
T  35524182 tatgaataactgtgatttggtgattgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatgtaagtatttatatgtgaata 35524281  T
Q  264 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  35524282 tt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 35524350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41218082 - 41217945
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  41218082 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgta 41217983  T
Q  102 tgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 139  Q
    | |||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41217982 tatatctatcgataggtgcatatcatgacatgagtctt 41217945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20444377 - 20444214
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  20444377 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttgattcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 20444278  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20444277 atatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20444214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 37845999 - 37846162
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  37845999 cttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttgattcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 37846098  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37846099 atatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 37846162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 38035154 - 38035260
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38035154 cttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 38035253  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  38035254 atttatg 38035260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 13378294 - 13378395
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13378294 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 13378393  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  13378394 at 13378395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21193800 - 21193694
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21193800 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacaaccttgaggtgatttggtaccacatgc 21193701  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  21193700 atatatg 21193694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 22836911 - 22837078
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22836911 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgatgattgtt 22837010  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattgg 234  Q
     ||| |||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22837011 catg-ataaatgtg-attgaagattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattgg 22837078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 37235494 - 37235600
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37235494 cttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 37235593  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  37235594 atatatg 37235600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 271
Target Start/End: Original strand, 22250776 - 22250905
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22250776 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 22250875  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattatt 271  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22250876 tgtaagtattgatatgagaatattattatt 22250905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20930112 - 20929955
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  20930112 cttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttacatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 20930013  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20930012 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 20929955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19601814 - 19601713
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19601814 cttttacttcgttgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 19601715  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  19601714 at 19601713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 8539492 - 8539584
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtac 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8539492 cttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8539584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 8604731 - 8604823
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtac 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8604731 cttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8604823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20530142 - 20529978
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtg-acgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| |||| | ||||||| | | ||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  20530142 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttgattcatcgaagggggacgacgttttggagatttggtaccacatg 20530043  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20530042 catatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20529978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 51657986 - 51658255
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||    
T  51657986 gtgacgaccttggagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtggaatgtgaatgatgattgt 51658085  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tg--atgtaagtatatgtatgaga 260  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||| | |||||||||         
T  51658086 gtatgaataaatgtgatttgataattgttcatgccacatgcgattggtgattaattgatgtaagatattggaattatggtatgaatgtatatgta----g 51658181  T
Q  261 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51658182 atattatt-gtgattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 51658255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 36357870 - 36357976
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36357870 cttttacttcagagattatgtaagactggagtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 36357969  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  36357970 atttatg 36357976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 5769747 - 5769853
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5769747 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 5769846  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  5769847 atatatg 5769853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22226619 - 22226459
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  22226619 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 22226521  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22226520 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 22226459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 20895390 - 20895486
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20895390 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20895486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 20956627 - 20956776
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20956627 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 20956726  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
      ||| || |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20956727 tcatg-attattgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgatt 20956776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18505817 - 18505646
Alignment:
Q  162 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa 261  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   |||| |      
T  18505817 tgtgaatgaatatttgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatatttgggtgtgatgtaagtattaatatgtg-t 18505719  T
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18505718 gattattattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18505646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 9785899 - 9785995
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  9785899 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 9785995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15862957 - 15863149
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  15862957 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 15863051  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15863052 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 15863149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21716707 - 21716430
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||  ||| |  || ||||||| | |||||    
T  21716707 gtgacgaccttgagataatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtctatttggtgaattgtgattggtaattgt 21716609  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt------tga-tgtaagtatatgtat 256  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||      ||  |||  |||||| |||    
T  21716608 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagattatggtatgtgtgtgtgtatatatat 21716509  T
Q  257 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21716508 atgaatattattattgatcaagtacatgatgtttataatgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 21716430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22352763 - 22352601
Alignment:
Q  4 ttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  22352763 ttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgca 22352665  T
Q  102 tgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    | |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22352664 tttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22352601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20821587 - 20821476
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20821587 cttttacttcggcgataatgtaagacgggcgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgc 20821488  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  20821487 atatatgtgtcg 20821476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 5471916 - 5472028
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc-gaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5471916 cttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatggggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 5472015  T
Q  100 catgtatgcgtcg 112  Q
    ||| |||| ||||    
T  5472016 catatatgtgtcg 5472028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 44036424 - 44036582
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  44036424 cttttacttcggagattatgtaaggcaggggtggacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 44036523  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44036524 gcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 44036582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 308
Target Start/End: Original strand, 20895514 - 20895660
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                        
T  20895514 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgtttatgacacatgtgattggtgattattga-------------------- 20895593  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20895594 tgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgt 20895660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 22144925 - 22145036
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144925 cttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaattttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 22145024  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  22145025 atatatgtgtcg 22145036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 41213200 - 41213311
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41213200 cttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttattgtatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 41213299  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  41213300 atatatgtgtcg 41213311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41217867 - 41217793
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217867 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 41217793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 15863325 - 15863508
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  15863325 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 15863417  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15863418 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatggttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15863508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21857934 - 21857753
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||     ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21857934 tgataaatgtgattggtgattatgaatgaatatttgtgcattgataattgttca-----catg--attgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 21857842  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21857841 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatacatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 21857753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Original strand, 22250622 - 22250752
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | |||||||||  || |||| |    
T  22250622 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatttggaaatgtgattggagactgtgaa 22250721  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22250722 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22250752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17147003 - 17146820
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| | |||| ||||| |||    
T  17147003 tgatatacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgaaatatcggggtgtga 17146911  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17146910 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17146820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27673355 - 27673257
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27673355 gtgacgcccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcatatcatgacatgagtctatttgataaatgtgattgatgattgt 27673257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22365252 - 22365155
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  22365252 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 22365155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17147362 - 17147258
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17147362 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 17147263  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  17147262 gtgat 17147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22352570 - 22352498
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22352570 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 22352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 15863221 - 15863295
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15863221 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15863295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22352468 - 22352285
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22352468 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgaaaattgttcata-------tgattgatgaatattgatatgagatattggggtgtga 22352376  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||  |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22352375 tgtaagtattaatgcgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgataatgt 22352285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21858035 - 21857966
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga 153  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21858035 gatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgacatatgtga 21857966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 141
Target Start/End: Original strand, 35935166 - 35935239
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35935166 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 35935239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17003396 - 17003302
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17003396 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17003302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22365074 - 22364943
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  22365074 catgtgatggatgattattgacgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 22364980  T
Q  299 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  22364979 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 22364943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 7642166 - 7642270
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  7642166 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattg 7642265  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  7642266 gtgat 7642270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Original strand, 20589963 - 20590078
Alignment:
Q  189 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgat 286  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| || || ||||     
T  20589963 ttgttcatgatacatgcgattggtgatttattgatgtgagatattgtgattatgatataagtatatacatgtggatattattattgattaaatatatgag 20590062  T
Q  287 gtttatattgaattat 302  Q
     |||| ||||||||||    
T  20590063 atttaaattgaattat 20590078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22080240 - 22080190
Alignment:
Q  285 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22080240 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22080190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41393023 - 41392929
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||   ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41393023 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 41392929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45050322 - 45050185
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  45050322 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgatgaccttttggagatttggtaccacat 45050228  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    |||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  45050227 gcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttat 45050185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51451184 - 51451090
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  51451184 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 51451090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 20826805 - 20826909
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  20826805 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 20826904  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  20826905 gtgat 20826909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22034429 - 22034325
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  22034429 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 22034330  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  22034329 gtgat 22034325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 5073884 - 5073963
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  5073884 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 5073963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18505855 - 18505816
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18505855 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatg 18505816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 18602627 - 18602706
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  18602627 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 18602706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20444123 - 20444085
Alignment:
Q  212 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20444123 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20444085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20529863 - 20529825
Alignment:
Q  212 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20529863 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20529825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 77632 - 77677
Alignment:
Q  68 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  77632 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 77677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 250
Target Start/End: Original strand, 37846241 - 37846286
Alignment:
Q  205 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37846241 tgattgatgatcattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 37846286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27673260 - 27673216
Alignment:
Q  189 ttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  27673260 ttgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 27673216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 36892360 - 36892628
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36892360 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 36892459  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892460 tgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtaagctattggggttttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 36892559  T
Q  267 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36892560 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 36892628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 25877618 - 25877882
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25877618 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 25877717  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   |||| |||   |||    
T  25877718 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgcgagatattggggattgatgtaagtattgttatgtgaa---tat 25877814  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25877815 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25877882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6878074 - 6877821
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  6878074 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccaaatgc 6877975  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6877974 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgaca 6877875  T
Q  201 catgtgattggtga-ttattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagtatat 252  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6877874 catgtgaatggtgatttattaatgtcagatatttgggttttgatgtaagtatat 6877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8886772 - 8886450
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  8886772 cttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 8886673  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||           
T  8886672 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatgtgtgattggtgattgtgagtgaatatttgtgaattgataattgtt------- 8886580  T
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  8886579 catgtgattaatgattattgatgcgagatattggagtgtgatgtaggtattgatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 8886487  T
Q  299 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8886486 atattcatgataactgttatttggattatgataatgt 8886450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 42180210 - 42180402
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  42180210 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 42180309  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  42180310 gtaagtattgatatgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 42180402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25600592 - 25600431
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25600592 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtaatatggtaccacatgc 25600493  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  25600492 atatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttggtgatt 25600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22862119 - 22861923
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22862119 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatctcgtaccacatgc 22862020  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 197  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||   |  |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  22862019 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttggaagtgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataatcgttcatg 22861923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 24088904 - 24089120
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24088904 cttttacgtcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 24089003  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 197  Q
    || |||| |||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  |||||||||    
T  24089004 atatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatg 24089101  T
Q  198 acacatgtgattggtgatt 216  Q
    | | ||||||||| |||||    
T  24089102 ataaatgtgattgatgatt 24089120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 21276342 - 21276535
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21276342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatcgatgtgagatattggggtttga 21276441  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || |||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21276442 tgtaagtattgatgtgggaatatgattattgatcaaatgcatgatgcttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 21276535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24966609 - 24966425
Alignment:
Q  148 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 247  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24966609 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 24966510  T
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  24966509 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaacttttatttggattatgatgatgt 24966425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 19435003 - 19435144
Alignment:
Q  3 tttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19435003 tttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacgtacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgcat 19435102  T
Q  103 gtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
     |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19435103 atatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatt 19435144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Original strand, 12638003 - 12638171
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12638003 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattagtgattattgatgtgagacattggggtttgatgtaagtat 12638102  T
Q  251 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
       | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  12638103 tgatgtgggaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 12638171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21140325 - 21140139
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 248  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21140325 tgtgattgatgattgtaaatgaatacttgtgaattgatatttgttccttatacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 21140226  T
Q  249 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||   | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  21140225 attgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 21140139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7319989 - 7319718
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  7319989 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 7319890  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    |||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  ||| | |||| || | | ||    
T  7319889 gtatgaatgaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggattatg--gtatgaatatatacgtggat 7319792  T
Q  263 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7319791 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 7319718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 43644494 - 43644688
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||  ||| | || |||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  43644494 cttttacttcgaagattatgtgaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgcttgattcaacgaaggtgacgatcttttggagatttggtaccacatgc 43644593  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttca 195  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  43644594 atatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca 43644688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19658581 - 19658470
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19658581 cttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 19658482  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  19658481 atatatgtgtcg 19658470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28972543 - 28972272
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  28972543 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 28972445  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggttt--gatgtaagtatatgtatgagaa 261  Q
    | |||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||  ||  | | || |||||| | || |||    
T  28972444 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcaggacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaattttgggaattatggtatatgtatatatgtgtgaa 28972345  T
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28972344 tattattattgatcaagtacatgatgttta-attgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 28972272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25304199 - 25304094
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25304199 ttttacttcggagattatgtaagaagggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgca 25304100  T
Q  102 tgtatg 107  Q
    | ||||    
T  25304099 tttatg 25304094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15632028 - 15631864
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |  ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15632028 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgttcaagaggcatcaaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgc 15631929  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    || | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  15631928 atttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattggtgattgt 15631864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 4819 - 4925
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4819 cttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 4918  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  4919 atttatg 4925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 31832 - 32102
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31832 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 31931  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||   ||  | ||| | |||| |||| | |||    
T  31932 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacatatgtgactggtgattatttgatgtgagatattgaaattata-gtatgaatatatatgtg-ata 32029  T
Q  264 ttattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32030 ttattatcgaattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43641458 - 43641346
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43641458 cttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttattgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 43641359  T
Q  101 atgtatgcgtcga 113  Q
    || |||| |||||    
T  43641358 atatatgtgtcga 43641346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Original strand, 12643600 - 12643758
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 157  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12643600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattgg 12643699  T
Q  158 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12643700 tgattgtgtatgaatatttctgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12643758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 12643812 - 12644000
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12643812 tgatgtatatgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagacattggggtttga 12643911  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  12643912 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 12644000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 23823051 - 23823157
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23823051 cttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 23823150  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  23823151 atttatg 23823157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 23824995 - 23825101
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23824995 cttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 23825094  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  23825095 atttatg 23825101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 23832130 - 23832236
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23832130 cttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 23832229  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  23832230 atttatg 23832236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 269693 - 269422
Alignment:
Q  66 aagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgatt 162  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| | |||    
T  269693 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaatt 269595  T
Q  163 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgaga 260  Q
    ||| || ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |  || | || ||||||  ||| ||    
T  269594 gtgcataaatatatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagatcatggtatatgtatat--atgtga 269497  T
Q  261 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  269496 atattgttattgatcaaattcatgatgtttatatttaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 269422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25600401 - 25600309
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600401 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 25600309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22282759 - 22282601
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22282759 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 22282660  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22282659 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22282601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 334
Target Start/End: Original strand, 24573051 - 24573320
Alignment:
Q  69 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 165  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  24573051 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgggtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgaagattgtg 24573150  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
     || ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||     
T  24573151 cataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---att 24573247  T
Q  264 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||  ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24573248 ttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 24573320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24296115 - 24296221
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24296115 cttttacttcggagattatgtaagacttgggtgaaatcttacatacgatgttttagttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 24296214  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  24296215 atttatg 24296221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15631812 - 15631702
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15631812 tgatatatatgattgataatggtgtatgaataattgtaagttgatattcgttcatgacacatgtgattggagattattgatgtgagatattggagtttga 15631713  T
Q  242 tgtaagtatat 252  Q
    |||||||||||    
T  15631712 tgtaagtatat 15631702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27260214 - 27260130
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27260214 cttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtga 27260130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22273526 - 22273368
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22273526 cttttacttaagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 22273427  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22273426 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22273368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 19670673 - 19670778
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  19670673 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tcttgatgcatcgaaggtgacgaccttgaggagattcggcaccacatgc 19670771  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  19670772 atttatg 19670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 22581588 - 22581858
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22581588 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatttatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 22581687  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | || ||| | | ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||    
T  22581688 gcataaatgaatatgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgacgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---at 22581784  T
Q  263 attattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||  ||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22581785 attattatcggattaaataaatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 22581858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Original strand, 4450084 - 4450171
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4450084 tatatatatgagaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4450171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24272689 - 24272579
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24272689 ttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgca 24272590  T
Q  102 tgtatgcgtcg 112  Q
    | |||| ||||    
T  24272589 tatatgtgtcg 24272579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18534461 - 18534350
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18534461 cttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgcaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacgttgaggtgatttggtaccacatgc 18534362  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  18534361 atatatgtgtcg 18534350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 461219 - 461139
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  461219 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 461139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 3801123 - 3801306
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3801123 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3801215  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3801216 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3801306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 22137358 - 22137469
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137358 cttttatttcggtgataatgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 22137457  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  22137458 atatatgtgtcg 22137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 38706810 - 38706993
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||    
T  38706810 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggtgtgtga 38706902  T
Q  242 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  38706903 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 38706993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 9654507 - 9654579
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9654507 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttattgatatatgtgattg 9654579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Original strand, 20629034 - 20629114
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629034 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20629114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22692930 - 22692768
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22692930 cttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttatggagatttggtaccacat 22692832  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22692831 gcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22692768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22697577 - 22697415
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22697577 cttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttatggagatttggtaccacat 22697479  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22697478 gcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22697415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34822498 - 34822315
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  34822498 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 34822406  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  34822405 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 34822315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24966770 - 24966692
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24966770 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttattgatatatgtgattggtgatt 24966692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 22691607 - 22691758
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 164  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22691607 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22691705  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 217  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22691706 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22691758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 22696254 - 22696405
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 164  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22696254 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22696352  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 217  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22696353 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22696405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 12637739 - 12637843
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12637739 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 12637838  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  12637839 gtgat 12637843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 12637873 - 12637940
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12637873 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Original strand, 22691823 - 22691910
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22691823 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22691910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Original strand, 22696470 - 22696557
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22696470 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22696557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25600260 - 25600173
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25600260 tatatgtgtgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 25600173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21140449 - 21140355
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21140449 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 21140355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8941784 - 8941712
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8941784 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 8941712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 19888848 - 19888920
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19888848 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 19888920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25211076 - 25210909
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| || |||||| |||||| ||||| |||    
T  25211076 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatactgatgtgagatatcggggtgtga 25210984  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  25210983 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 25210909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34822645 - 34822578
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  34822645 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 34822578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6877791 - 6877721
Alignment:
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6877791 tattattgttcaagtgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 6877721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 19888362 - 19888456
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19888362 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19888456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Original strand, 20629142 - 20629243
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  20629142 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catgtgattgataattattgatgtgagataatggggtgtga 20629234  T
Q  242 tgtaagtat 250  Q
    |||||||||    
T  20629235 tgtaagtat 20629243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 21276111 - 21276205
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  21276111 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 21276205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Original strand, 43644713 - 43644814
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43644713 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 43644805  T
Q  242 tgtaagtat 250  Q
    |||||||||    
T  43644806 tgtaagtat 43644814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 3800687 - 3800791
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  3800687 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 3800786  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  3800787 gtgat 3800791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25211180 - 25211108
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 214  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  25211180 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacaagtaattggtga 25211108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34822780 - 34822676
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34822780 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 34822681  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  34822680 gtgat 34822676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 3800822 - 3800889
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3800822 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3800889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 5889880 - 5889974
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5889880 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5889974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 9654615 - 9654792
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  9654615 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtga 9654707  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||| |   ||||||||||||||| | ||||      |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  9654708 tgtaagtattaatatgtg---attattattgatcaaatgcatg------atattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 9654792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 11232835 - 11232929
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11232835 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11232929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 14908022 - 14908116
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  14908022 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 14908116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 22514682 - 22514776
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22514682 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22514776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 28777283 - 28777377
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28777283 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 28777377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22654412 - 22654339
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22654412 tattattattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 22654339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 141
Target Start/End: Original strand, 24828161 - 24828218
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24828161 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24828218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 141
Target Start/End: Original strand, 24832613 - 24832670
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24832613 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24832670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 720918 - 720835
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  720918 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 720835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8942228 - 8942124
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8942228 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaagtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 8942129  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  8942128 gtgat 8942124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12726635 - 12726531
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  12726635 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 12726536  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  12726535 gtgat 12726531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23773119 - 23773015
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  23773119 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 23773020  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  23773019 gtgat 23773015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 17398170 - 17398249
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  17398170 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 17398249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 24687243 - 24687322
Alignment:
Q  59 gcatcgaaagt-gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  24687243 gcatcgaaagttgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 24687322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 3800969 - 3801043
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3800969 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20013695 - 20013601
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  20013695 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 20013601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22273233 - 22273164
Alignment:
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  22273233 tattattgatcaaatacatgatgatta-attgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgt 22273164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23818752 - 23818658
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23818752 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23818658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 24089074 - 24089146
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24089074 tgataaatgtgattgatgattgttcatga-taaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattgatgatt 24089146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211379
Alignment:
Q  91 taccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 25211379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 461060 - 461007
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 196  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  461060 gataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgacttgataattgttcat 461007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 250
Target Start/End: Original strand, 23806359 - 23806404
Alignment:
Q  205 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  23806359 tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtgatgtaagtat 23806404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 133)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 319141 - 319486
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  319141 cttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgc 319240  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatat---at--gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  319241 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgcgattggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgtt 319340  T
Q  194 catgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtat--gagaatattattattgatcaagtacatgatgtt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  319341 catgacacatgtgattggtgatttattaatatgagatattggggttttgatgtaagtatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtt 319440  T
Q  290 tatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  319441 tatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 319486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 50113655 - 50113991
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50113655 cttttacttcggagattatgcaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttattgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 50113754  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgac 199  Q
    || |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||     
T  50113755 atttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtggattgatgattattcatgat 50113854  T
Q  200 acatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattga 297  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113855 atatgtgattgatgattaattgatgtgagatattggggttctaatgtaagtat-tgaatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattga 50113953  T
Q  298 attattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  50113954 attattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 50113991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17099181 - 17098913
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17099181 gtgacaaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 17099082  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17099081 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatttatgagaatatta 17098982  T
Q  267 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17098981 ttattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 17098913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 6148457 - 6148723
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  6148457 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatat--gtgattggtgattgtgtg 6148554  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 266  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6148555 tgaatacttgtgaattgatattcgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatgtgtatgagaatatta 6148654  T
Q  267 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6148655 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 6148723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30204961 - 30204696
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  30204961 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttgtg--tcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 30204864  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30204863 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaacattat 30204764  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30204763 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatccatattaacttttatttggattatgatgatgt 30204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 51159996 - 51160335
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctt----acatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacca 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    |||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  51159996 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtacca 51160095  T
Q  96 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttca 195  Q
    ||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51160096 catgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttca 51160195  T
Q  196 tgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatatt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  51160196 tgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggtttgatgtaagtattgatttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaatt 51160295  T
Q  296 gaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  51160296 gagatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 51160335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 47786398 - 47786735
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  47786398 cttttactttggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatagtaacacatgc 47786497  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 197  Q
    || |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  47786498 atatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatg 47786597  T
Q  198 acacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatatt 295  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||   |||    
T  47786598 acacatgagattagtgattaattgatgtgagatattgggattgtgatataagtatatatatgtgaaaactattattgatcaagtacatgatgtt--aatt 47786695  T
Q  296 gaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||  |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  47786696 gatatattcatgataacagttatttggattatgatgatgt 47786735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 12351373 - 12351709
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  12351373 cttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccagtaccacatgc 12351472  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||   | |||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||    
T  12351473 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtcttgttttgaaatgtgactggtgattgtgtatgaataattatgaattgatgattgttcatgtca 12351572  T
Q  201 catgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
     ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||  |||||||   |||| || ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  12351573 tatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgacataagtattgatatgtgagtattattgttgatcaactgcatgatgtttaaattgaa 12351672  T
Q  299 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12351673 atattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12351709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11812994 - 11812801
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11812994 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 11812895  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11812894 tgtaagtataaatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 11812801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 16183665 - 16183945
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     
T  16183665 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtctg 16183764  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-------------gatgtaagtatatgt 254  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||  ||||| |    
T  16183765 tgaatgattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttttgatatatatatatatatatatatatat 16183864  T
Q  255 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16183865 atgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 16183945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 19572430 - 19572693
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19572430 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgagtggtgattgtgaa 19572529  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 265  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  19572530 tgaatatttgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 19572624  T
Q  266 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19572625 attattgatcaaacacatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19572693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 22145882 - 22146145
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  22145882 gtgacgaccttgaggtaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatgtgatgacacgagtcttattgatatatgtgattggtgattgcata 22145981  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||   |||| |||   |||    
T  22145982 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgttagatattgggg-tggatgtatgtattgatatgtgaa---tat 22146077  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22146078 tattgatcaagtgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 22146145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38166407 - 38166213
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 240  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  38166407 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggagttttg 38166308  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38166307 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 38166213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18738167 - 18737974
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18738167 tgatatatgtaattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattgaagattattgatgtgagatattggggtttga 18738068  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18738067 tgtaagtatatgtatgagaatagtactattgatcaagtgcatgatgtttatattggaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18737974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7852439 - 7852223
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7852439 cttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttggatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgc 7852340  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgac 199  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||   | ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  ||||||||||     
T  7852339 atgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgat 7852240  T
Q  200 acatgtgattggtgatt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  7852239 aaatgtgattggtgatt 7852223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19944998 - 19944805
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19944998 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttga 19944899  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19944898 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19944805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7851877 - 7851683
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 240  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  7851877 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttgtc 7851778  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7851777 atataagtatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatactaactgttatttggattatgatgatgt 7851683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30141177 - 30140984
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  30141177 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 30141078  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30141077 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 30140984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12796908 - 12796728
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12796908 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 12796809  T
Q  251 --atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 329  Q
      ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12796808 tgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgat 12796728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17936649 - 17936455
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17936649 tgatatatatgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatttgagattattgatgtgagatattggggtttga 17936550  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttat-attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17936549 tataagtatatgtatgggaatattataattgatcaagtgcatgatgtttatgatgaaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 17936455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16819234 - 16819043
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16819234 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 16819135  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16819134 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16819043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8630478 - 8630315
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8630478 cttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagtggcatcgaaggtgacgacctggaggtgatttggtaccacatgc 8630379  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  8630378 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattaatgattgt 8630315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14287596 - 14287323
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||    
T  14287596 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattttg 14287497  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggt-ttgatgtaag--tatatgtatgagaa 261  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  |  || | ||||  ||||| |||| |||    
T  14287496 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgttgattaattgatgtgaggtattggaatcatggtataagtatatatatatgtgaa 14287397  T
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14287396 cgttattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14287323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 14060770 - 14060980
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14060770 cttttacttcggagattatgtaagatgggggtgaactcttacattcgatatttttgttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgc 14060869  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 197  Q
    || || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  |||||||||    
T  14060870 atatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtaaaatgtaattgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatg 14060967  T
Q  198 acacatgtgattg 210  Q
    |||||||||||||    
T  14060968 acacatgtgattg 14060980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 11199144 - 11199415
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| | ||   || ||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||    
T  11199144 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtggcgggctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattggtgattgt 11199242  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | |||||| | ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |  || | || |||||| |||| ||||    
T  11199243 gcatgaatgaatgtgatttgatgactgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaatattggaatgatggtatatgtatatatatgtgaat 11199342  T
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11199343 attattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattgttcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11199415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 5229610 - 5229721
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229610 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 5229709  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  5229710 atatatgtgtcg 5229721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 12490266 - 12490372
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12490266 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgagatgattcggtaccacatgc 12490365  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  12490366 atttatg 12490372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 18008666 - 18008776
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18008666 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtgattcagtaccacatgc 18008765  T
Q  101 atgtatgcgtc 111  Q
    || ||||||||    
T  18008766 atttatgcgtc 18008776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 38812525 - 38812671
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38812525 cttttacttcggagattatgtaagacggg-gtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtacgacatgc 38812623  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttattg 143  Q
    || |||| |||||  || ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38812624 atatatgtgtcgaactaggtgcatatcatggtgacatgagtcttattg 38812671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15874796 - 15874690
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15874796 cttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 15874697  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  15874696 atttatg 15874690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35122189 - 35121921
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| || |||||||||||||| ||   |   ||||||| ||||||||    
T  35122189 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacattatgacatgagtcttgttttgaatcgtgattggtgattgtg 35122090  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||  |||||| ||||||| | ||||  ||      
T  35122089 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaatttgggattttgatataagtatttatatgtaaa-- 35121992  T
Q  264 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35121991 -tattattgatcaagtacacgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35121921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 48420303 - 48420197
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48420303 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 48420204  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  48420203 atttatg 48420197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8630232 - 8630101
Alignment:
Q  146 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgta 245  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  8630232 atatgtgattggtaattgtgcatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggagattatgaatgtgagatattggggtttgatgta 8630133  T
Q  246 agtatatgtatgagaatattattattgatcaa 277  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  8630132 agtatatgtatgtggatattgttattgatcaa 8630101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2048700 - 2048535
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  2048700 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgaccttttgaagatttggtaccacatg 2048601  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2048600 catttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 2048535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14297000 - 14296730
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14297000 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14296902  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14296901 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14296802  T
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14296801 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14296730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14302627 - 14302357
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14302627 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14302529  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14302528 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14302429  T
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14302428 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14302357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 235
Target Start/End: Original strand, 11062691 - 11062861
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  11062691 gtgacgaccttgaagtgaaacggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcaggacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 11062790  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 235  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11062791 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattggg 11062861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23491146 - 23490980
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  23491146 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 23491047  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  23491046 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 23490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 226 - 334
Target Start/End: Original strand, 54045594 - 54045703
Alignment:
Q  226 agatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  54045594 agatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactattatttggatt 54045693  T
Q  325 atgatgatgt 334  Q
    ||||||||||    
T  54045694 atgatgatgt 54045703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19230691 - 19230535
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||| |||    
T  19230691 cttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttgattcatcgaaaggtgacgacgttttggagatttggtaccatatg 19230592  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19230591 catatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgataaatgtgattg 19230535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 47983530 - 47983418
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47983530 cttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatg 47983431  T
Q  100 catgtatgcgtcg 112  Q
    ||| |||| ||||    
T  47983430 catatatgtgtcg 47983418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 47992817 - 47992705
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47992817 cttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatg 47992718  T
Q  100 catgtatgcgtcg 112  Q
    ||| |||| ||||    
T  47992717 catatatgtgtcg 47992705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 48002104 - 48001992
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48002104 cttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatg 48002005  T
Q  100 catgtatgcgtcg 112  Q
    ||| |||| ||||    
T  48002004 catatatgtgtcg 48001992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 48011390 - 48011278
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48011390 cttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatg 48011291  T
Q  100 catgtatgcgtcg 112  Q
    ||| |||| ||||    
T  48011290 catatatgtgtcg 48011278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33340483 - 33340317
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  33340483 cttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 33340384  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33340383 gcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 33340317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 55442295 - 55442404
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccaca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55442295 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccaca 55442394  T
Q  98 tgcatgtatg 107  Q
    ||||| ||||    
T  55442395 tgcatttatg 55442404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 11330537 - 11330643
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  11330537 cttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcaaaggtgacaaccttgaggtgactcggtaccacatgc 11330636  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  11330637 atttatg 11330643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11813403 - 11813307
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11813403 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgctgattgt 11813307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13816070 - 13815973
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 239  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13816070 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgacgtgagatattggagttt 13815973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 14523006 - 14523278
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  || |||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  14523006 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggaacacatcatg-cataagtcttattggtgaaatgtaattgatgattgt 14523104  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatg---taagtatatgtatgaga 260  Q
    | ||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | || || | |  |||||   || |||| | || | ||    
T  14523105 gcatgcataagtgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgaataattgagctga-atctttgagaatgatggtatatgtatttatacgtga 14523203  T
Q  261 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14523204 atattattattgatcaagtacatgatggttaaattggaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14523278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Original strand, 17958169 - 17958303
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17958169 catgtgattggtgattattgatgtgagatattgggggatatgatgtaagtattaatatgggagtattattattgatcaagtacatgatgtttactttgaa 17958268  T
Q  299 ttattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 334  Q
     ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17958269 atatccatgttaactgttatt-gattatgttgatgt 17958303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54686707 - 54686551
Alignment:
Q  146 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt--gatg 243  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  54686707 atatgtgatcggtaattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggtttttgatg 54686615  T
Q  244 taagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 307  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  54686614 taagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 54686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 14846179 - 14846339
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  14846179 cttttacttcggagattatgtaaggggggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 14846277  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  14846278 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtgat 14846339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19945266 - 19945098
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | ||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  19945266 cttttacttcggagattatgtaaggtggttttgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 19945168  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatga 170  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||    
T  19945167 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtttatga 19945098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10737192 - 10737033
Alignment:
Q  5 tacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgt 104  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| || |    
T  10737192 tacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtggcgaccttttggagatttggtaccacatgaattt 10737094  T
Q  105 atgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  10737093 atgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgattgt 10737033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Original strand, 11062944 - 11063020
Alignment:
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11062944 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11063020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 49230795 - 49230655
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 157  Q
    |||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  49230795 gcatcgaaaggtgacgacgttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 49230696  T
Q  158 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  49230695 agattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 49230655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 9592283 - 9592394
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592283 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacacatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 9592382  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  9592383 atatatgtgtcg 9592394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 164
Target Start/End: Original strand, 17913826 - 17913933
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17913826 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattg 17913925  T
Q  157 atgattgt 164  Q
    ||||||||    
T  17913926 atgattgt 17913933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 41660246 - 41660135
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41660246 cttttatttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgc 41660147  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  41660146 atatatgtgtcg 41660135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 17957996 - 17958093
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgattgt 17958093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 307
Target Start/End: Original strand, 9304664 - 9304819
Alignment:
Q  146 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 244  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  9304664 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 9304756  T
Q  245 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 307  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  9304757 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 9304819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25057166 - 25057035
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25057166 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaa 25057072  T
Q  299 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  25057071 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 25057035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5227356 - 5227201
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc-ttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||| ||| |  ||||||| ||||||||| ||  || |||| |||||||||||    
T  5227356 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgttt-tatcatcgaatgtgacgacctttttggagattcggtaccacatg 5227258  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgatt 155  Q
    ||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5227257 catttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgatt 5227201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15516197 - 15516035
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    |||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15516197 gtgacgaccttgaagtgatttcgtaccacatgcatatat----cgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 15516102  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 232  Q
      ||| |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  15516101 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 15516035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 164
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262698
Alignment:
Q  69 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19262698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13815943 - 13815856
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13815943 tatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 13815856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Original strand, 15939979 - 15940140
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||   |||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15939979 ttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtct-atcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatg 15940077  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15940078 catttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtgat 15940140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16259681 - 16259487
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16259681 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 16259587  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  16259586 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgggtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaatatttgtcaattgataattgttcatga 16259487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19230499 - 19230318
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19230499 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 19230407  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19230406 tgtaagtattaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19230318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11813253 - 11813179
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11813253 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacccatgtgattggtgatt 11813179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 12563136 - 12563281
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12563136 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatggcatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 12563235  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 210  Q
    | |||| ||| ||||  |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  12563236 gcatgattaaatgtgatttgatgatttctcatgacacatgtgattg 12563281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25057344 - 25057247
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  25057344 gtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 25057247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Original strand, 33370914 - 33371002
Alignment:
Q  18 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33370914 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgat-tttttgttgcaccatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 33371002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Original strand, 17536847 - 17536923
Alignment:
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17536847 gaatattattattgatcaagtgcatgaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 17536923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18908854 - 18908679
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18908854 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 18908762  T
Q  250 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18908761 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18908679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22273209 - 22273034
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22273209 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 22273117  T
Q  250 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22273116 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 22273034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581310
Alignment:
Q  92 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 45581310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7852035 - 7851968
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 209  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852035 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 7851968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Original strand, 15860824 - 15860902
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15860824 gatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 15860902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16819480 - 16819386
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16819480 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 16819386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 18905356 - 18905434
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18905356 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18905434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18908966 - 18908892
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18908966 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 18908892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 49230429 - 49230262
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  49230429 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatattggggtgtga 49230337  T
Q  242 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  49230336 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtccatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatt 49230262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11813120 - 11813048
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11813120 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgaaacatgtaattggtgatt 11813048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17137969 - 17137827
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgat-atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||  || | ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||||    
T  17137969 gtgacaaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtgaattaggtgcacatcatgacatgagtgttattggtgtaatgtggttgatgattgtg 17137870  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 210  Q
     || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17137869 cat-aataaatgtg-attgatgtttgttcatgacacatgtgattg 17137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23490898 - 23490768
Alignment:
Q  202 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  23490898 atgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttactattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaa 23490804  T
Q  300 tattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23490803 tactcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23490768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27839288 - 27839184
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  27839288 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 27839189  T
Q  157 atgat 161  Q
    |||||    
T  27839188 atgat 27839184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16819355 - 16819292
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16819355 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 16819292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30141456 - 30141361
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 163  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  30141456 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 30141361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 2450910 - 2451004
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2450910 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 2451004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 11517010 - 11517056
Alignment:
Q  18 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 64  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517010 atgtaaaacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 11517056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15613701 - 15613564
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  15613701 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 15613607  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15613606 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15613564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18909263 - 18909169
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18909263 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18909169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22273618 - 22273524
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22273618 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 23081684 - 23081821
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  23081684 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 23081778  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23081779 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 23081821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40938236 - 40938085
Alignment:
Q  66 aagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 162  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | || ||| |||| |||    
T  40938236 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgagctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgaatgataatt 40938138  T
Q  163 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40938137 gtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgatt 40938085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15574618 - 15574545
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15574618 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15574545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44228008 - 44227903
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44228008 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 44227909  T
Q  157 atgatt 162  Q
     |||||    
T  44227908 gtgatt 44227903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Original strand, 53900388 - 53900463
Alignment:
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  53900388 gaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattatttatg-taactgttgtttggattatgatgatgt 53900463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 12266009 - 12266167
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  12266009 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 12266103  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  12266104 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 12266167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 1469236 - 1469330
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1469236 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 1469330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7851931 - 7851857
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  7851931 tgatatatgtggttgatggttgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtggttgatgatt 7851857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 16745754 - 16745848
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16745754 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 16745848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 17536606 - 17536774
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| |  | ||    
T  17536606 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtattggt 17536704  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 233  Q
    |  ||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  17536705 gcgtgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacagatgtgatcggtgattaattgatgtgagttattg 17536774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33340155 - 33340038
Alignment:
Q  212 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||| ||||||| | |||| ||||   ||||||||||||||| |    
T  33340155 tgattattgatgttagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattagtgatcaaatgcatgttgtt--aattgaattattcatgat 33340063  T
Q  310 aattgttattggattatgatgatgt 334  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  33340062 aactgttattggattatgataatgt 33340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 161
Target Start/End: Original strand, 15470048 - 15470141
Alignment:
Q  69 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  15470048 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 15470141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 334
Target Start/End: Original strand, 19262733 - 19262907
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 248  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19262733 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 19262825  T
Q  249 at--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg-ttattggattatgatgatgt 334  Q
    ||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||    
T  19262826 attaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgctaattggattatgataatgt 19262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 334
Target Start/End: Original strand, 12563334 - 12563397
Alignment:
Q  272 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  12563334 gattaagtacatgatatttaaattgaattattcatgttaagtgttatgtgaattatgatgatgt 12563397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12951555 - 12951476
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 142  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12951555 gtgacgaccttgaagtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 12951476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 39654237 - 39654163
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39654237 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 39654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 8269976 - 8270080
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8269976 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8270075  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  8270076 gtgat 8270080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 8277087 - 8277191
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8277087 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8277186  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  8277187 gtgat 8277191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 8305896 - 8306000
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8305896 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8305995  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  8305996 gtgat 8306000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 334
Target Start/End: Original strand, 14061039 - 14061110
Alignment:
Q  264 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14061039 ttatcattgattaagtacatgatgttga-attgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 14061110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 30151917 - 30151813
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  30151917 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 30151818  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  30151817 gtgat 30151813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 53769241 - 53769137
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  53769241 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 53769142  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  53769141 gtgat 53769137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 13956378 - 13956457
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  13956378 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 13956457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Original strand, 13977211 - 13977290
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  13977211 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 13977290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41268822 - 41268743
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  41268822 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 41268743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 45859600 - 45859521
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  45859600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 45859521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 53900177 - 53900326
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| | |||||    
T  53900177 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcggtctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaattgt 53900275  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 215  Q
    | |||||||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53900276 gcatgaatatacgtgatttgatacttgtttatgacacatgtgattgatgat 53900326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 55314962 - 55314883
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  55314962 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 55314883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 2451155 - 2451229
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  2451155 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 2451229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22273321 - 22273247
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  22273321 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 22273247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 49230583 - 49230509
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  49230583 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 49230509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 198
Target Start/End: Original strand, 2451035 - 2451084
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2451035 tgtgattgatgtttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2451084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10736953 - 10736904
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  10736953 catgtgattggtgattattaatgtgagatattggagtgtgacgtaagtat 10736904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 113
Target Start/End: Original strand, 11883923 - 11883968
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 113  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11883923 gtgacgactttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 11883968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14291955 - 14291910
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 113  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14291955 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcga 14291910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 38377415 - 38377460
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 112  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38377415 gtgacgacctttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcg 38377460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45581230 - 45581181
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45581230 catgagattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 45581181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15989548 - 15989508
Alignment:
Q  68 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15989548 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 15989508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 95)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4863900 - 4863551
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4863900 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacattc 4863801  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  4863800 atttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgctttgatgtttgtt 4863701  T
Q  194 catgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  4863700 catgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgat 4863601  T
Q  287 gtttatattgaattattcatg-ttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||    
T  4863600 gtttatattaaattattcatgattaactgttgttttgattatgatgatgt 4863551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 334
Target Start/End: Original strand, 21661268 - 21661593
Alignment:
Q  18 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21661268 atgtaagactggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataag 21661367  T
Q  118 tgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || || ||     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21661368 tgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 21661467  T
Q  211 gtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 309  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  21661468 gtgattattgttgtgagatattggggtcttgatgtaagcatatgtatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgtt 21661567  T
Q  310 aattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || ||||| |||||||||||||||||    
T  21661568 aactgttatttggattatgatgatgt 21661593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21392698 - 21392432
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21392698 gtgacgaccttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgta 21392599  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392598 tgaataattggaaactgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatttt 21392500  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21392499 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21392432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 27185361 - 27185699
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27185361 cttttacttcggagattatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 27185460  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| | |||||     
T  27185461 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgataattgtgtctgaataaatgtgaattgttgtttgta 27185560  T
Q  194 catgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttata 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27185561 catgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcataatgtttata 27185657  T
Q  294 ttgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27185658 ttgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 27185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34937764 - 34937571
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34937764 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgttagatattggggtttga 34937665  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34937664 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34937571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10500 - 10307
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10500 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10401  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10400 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 10780112 - 10780305
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10780112 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10780211  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10780212 tgtaagtattgatgtgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10780305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 43445708 - 43445901
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43445708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 43445807  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  43445808 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 43445901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28257970 - 28257781
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28257970 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 28257871  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28257870 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcattttaactgttattttgattatgatgatgt 28257781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 22885041 - 22885234
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22885041 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggcgatcattgatgtgagatattggggtttga 22885140  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||    
T  22885141 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgatgactgttatttggattatgataatgt 22885234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 25211796 - 25211982
Alignment:
Q  148 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 246  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25211796 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25211895  T
Q  247 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25211896 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25211982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 25275948 - 25276134
Alignment:
Q  148 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 246  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25275948 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25276047  T
Q  247 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25276048 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25276134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 334
Target Start/End: Original strand, 17473704 - 17473892
Alignment:
Q  145 tatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgt 244  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17473704 tatatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacatatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttgatgt 17473803  T
Q  245 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| || ||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17473804 aagtat-tg-atgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17473892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19498120 - 19497952
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498120 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 19498021  T
Q  251 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
       | || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  19498020 tgatgtgtgaatattattaatgatcatgtacgtaatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatt 19497952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11582414 - 11582266
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11582414 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 11582315  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11582314 tgaataactgtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgatt 11582266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11580113 - 11579922
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 240  Q
    |||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||    
T  11580113 tgatgtatatgattggtgactgcgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattactgatgtgagatattggagttttg 11580014  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  11580013 atgtaagtata--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 11579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Original strand, 1170321 - 1170467
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1170321 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 1170420  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 214  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1170421 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatgtgatttgtga 1170467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 32967705 - 32967815
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32967705 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 32967804  T
Q  101 atgtatgcgtc 111  Q
    || ||||||||    
T  32967805 atttatgcgtc 32967815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23453454 - 23453184
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23453454 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23453355  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23453354 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23453258  T
Q  263 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23453257 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23453184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23460698 - 23460428
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23460698 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23460599  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23460598 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23460502  T
Q  263 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23460501 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23460428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23464959 - 23464689
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23464959 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23464860  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23464859 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23464763  T
Q  263 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23464762 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23464689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23492638 - 23492532
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23492638 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 23492539  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  23492538 atttatg 23492532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Original strand, 23986165 - 23986359
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatatt-ggggtttg 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| ||    
T  23986165 gatatatgtgaatgatgattgtgtatgaataactgtgaattaatatttgttcctgacacatatgattggtgattacttgatgtgaaacattgggggtatg 23986264  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23986265 atgtaagtattgatatgagagtattattatttatcaagtgcatgatgtttatatagaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23986359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 24227000 - 24227146
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24227000 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtacgacatgc 24227099  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 142  Q
    || |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24227100 atatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 24227146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21615647 - 21615535
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21615647 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 21615548  T
Q  101 atgtatgcgtcga 113  Q
    || |||| |||||    
T  21615547 atatatgtgtcga 21615535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 334
Target Start/End: Original strand, 1171320 - 1171464
Alignment:
Q  192 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 290  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1171320 ttcatgataaatgtgattgatgtttattaatgtgagatattggggctttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttt 1171419  T
Q  291 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  1171420 atattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgatgatgt 1171464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 7727212 - 7727112
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7727212 ttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgca 7727113  T
Q  102 t 102  Q
    |    
T  7727112 t 7727112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 9732592 - 9732782
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  9732592 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatctttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgcgagatattgggatgtga 9732691  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9732692 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatcttgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 9732782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19860868 - 19860756
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19860868 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgtatcgaaggtgacgaccttggggtgatttggtaccacatgc 19860769  T
Q  101 atgtatgcgtcga 113  Q
    || |||| |||||    
T  19860768 atatatgtgtcga 19860756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 1221638 - 1221826
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1221638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttga 1221737  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  1221738 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 1221826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 24184869 - 24185137
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  24184869 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaagtgtgattggtgattgtg 24184968  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||| | || |||| |  |||| | |||| |||      
T  24184969 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatggaattggtgattaattgatgtgagaaattgagattatgatatttgtatttatatgtgaa-- 24185066  T
Q  264 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24185067 -tattattgatcaattacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24185137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24470804 - 24470555
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||            
T  24470804 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttactgatatatgtgattgctg-------- 24470713  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
          |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||   | || |   |||||    
T  24470712 ------attgtgaattgataattgttcgtgacatatgtgattgattattattgttgtgagatattggggtgtgatgtaaatattattgtgtg---attat 24470622  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24470621 tattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaactattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 24470555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 37189661 - 37189767
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  37189661 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacttgc 37189760  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  37189761 atttatg 37189767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11964583 - 11964472
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11964583 cttttacttcggtgataatgtaatacgggtttgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtggtttggtaccacatgc 11964484  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    ||||||| ||||    
T  11964483 atgtatgtgtcg 11964472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 28888554 - 28888441
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaa---agtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28888554 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgatgatgaccttgaggtgattcggtaccaca 28888455  T
Q  98 tgcatgtatgcgtc 111  Q
    ||||| ||||||||    
T  28888454 tgcatttatgcgtc 28888441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 216
Target Start/End: Original strand, 1221426 - 1221584
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 157  Q
    |||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  1221426 gcatcgaaaggtgacgaacttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattgg 1221525  T
Q  158 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1221526 tgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 1221584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13793765 - 13793659
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13793765 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgagatcttatatacgatgtttttgttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 13793666  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  13793665 atttatg 13793659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 21653052 - 21653148
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21653052 gtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtcttattgataaatgtgattggtgattgt 21653148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Original strand, 22884887 - 22885017
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| |    
T  22884887 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaa 22884986  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22884987 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22885017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 164
Target Start/End: Original strand, 17473568 - 17473648
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17473568 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 17473648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23510473 - 23510313
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtat 182  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  23510473 gatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaat 23510374  T
Q  183 tgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    ||||| ||||||   |||    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23510373 tgataattgttc---aca----tgattgatgactattgatgtgagatattggggtatgatgcaagtat 23510313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 20455630 - 20455741
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20455630 cttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtaacgatcttgaggtgatttggtaccacatgc 20455729  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  20455730 atatatgtgtcg 20455741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 29192671 - 29192857
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  29192671 tgataaatgtgattggtgattgtgattgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgcgagatatcggggtttga 29192763  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  29192764 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 29192857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17908030 - 17907853
Alignment:
Q  146 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 244  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  17908030 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggttttggtgt 17907938  T
Q  245 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtta-ttggattatg 327  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  17907937 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatgattaactgttatttggattatg 17907853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 164
Target Start/End: Original strand, 110678 - 110785
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  110678 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattg 110777  T
Q  157 atgattgt 164  Q
    ||||||||    
T  110778 atgattgt 110785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16534881 - 16534750
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgt 166  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||  |||||||     
T  16534881 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattggagattgtga 16534782  T
Q  167 atgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16534781 atgaataattgtgaattgataattgttcatga 16534750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 35792770 - 35792964
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  35792770 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 35792864  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  35792865 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagatcgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 35792964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 35793162 - 35793345
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  35793162 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 35793254  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  35793255 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 35793345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 164
Target Start/End: Original strand, 11213297 - 11213404
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  11213297 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattg 11213396  T
Q  157 atgattgt 164  Q
    ||||||||    
T  11213397 atgattgt 11213404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10628 - 10554
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10628 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Original strand, 18779790 - 18779904
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||| | ||||| |||    
T  18779790 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaacatttgtgaatt 18779889  T
Q  184 gatatttgttcatga 198  Q
    |||| ||||||||||    
T  18779890 gataattgttcatga 18779904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 22368188 - 22368285
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22368188 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattgt 22368285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28258093 - 28257998
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  28258093 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttatcgataaatgtggttggtgattgt 28257998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 9732495 - 9732562
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9732495 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 9732562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 334
Target Start/End: Original strand, 11338584 - 11338802
Alignment:
Q  130 catgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaaga 228  Q
    |||||||||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  11338584 catgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtg-attgataattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagt 11338682  T
Q  229 tattggggt-------------ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 315  Q
    ||||||| |             |  || ||  ||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11338683 tattgggatcatgatatatatatatatatatatatatatatatgaatgttgttattgatcaagtacatgatcttttaattgaaatattcatgttaattgt 11338782  T
Q  316 tat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  11338783 tatgtggattatgatgatgt 11338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 25944566 - 25944750
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 240  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | ||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  25944566 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattaatgtgagatattagggtgtg 25944658  T
Q  241 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25944659 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 25944750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19498374 - 19498280
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19498374 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19498280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 10779883 - 10779980
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  10779883 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 10779980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11340782 - 11340599
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||        |||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  11340782 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataatcgttcata-------tgattgatgaatatttatgtgagatatcggggtgtga 11340690  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11340689 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 11340599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 18780052 - 18780235
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  18780052 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 18780144  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18780145 tgtaagtatta--atgtgta-attattattaatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18780235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25425206 - 25425102
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25425206 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 25425107  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  25425106 gtgat 25425102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11341085 - 11341018
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  11341085 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgaatggtgatt 11341018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10831
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10925 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 319
Target Start/End: Original strand, 110990 - 111157
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  110990 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 111082  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  111083 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 111157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Original strand, 5452432 - 5452511
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5452432 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 5452511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19498248 - 19498182
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19498248 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19498182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 9732360 - 9732464
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  9732360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattg 9732459  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  9732460 gtgat 9732464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11341220 - 11341116
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11341220 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 11341121  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  11341120 gtgat 11341116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16534574 - 16534391
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||  | ||||| |||    
T  16534574 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagacttcggggtgtga 16534482  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16534481 tgtaagtatta--atgtgta-attattgttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaattattatctggattatgataatgt 16534391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211719
Alignment:
Q  95 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 191  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25211719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275871
Alignment:
Q  95 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 191  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25275871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25424736 - 25424680
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  25424736 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatt 25424680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 25944472 - 25944536
Alignment:
Q  152 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25944472 gattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 25944536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 43445451 - 43445555
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  43445451 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattg 43445550  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  43445551 gtgat 43445555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 43445582 - 43445654
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  43445582 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggcgatt 43445654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 4201661 - 4201764
Alignment:
Q  60 catcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattga 157  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||     
T  4201661 catcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattgg 4201760  T
Q  158 tgat 161  Q
    ||||    
T  4201761 tgat 4201764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 21075192 - 21075286
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21075192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21075286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 21933863 - 21933957
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21933863 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21933957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 21940033 - 21940127
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21940033 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21940127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 22368337 - 22368411
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22368337 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcaggatacatgtaattggtgatt 22368411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 29192321 - 29192415
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  29192321 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggtgat 29192415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35580829 - 35580735
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35580829 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 35580735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 37010867 - 37010961
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37010867 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37010961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3672497 - 3672421
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  3672497 gtgacgaccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactagatgcatatcaagacatgagtcttatt 3672421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 10780011 - 10780082
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10780011 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 10780082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 22368602 - 22368674
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22368602 attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgataatgt 22368674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24595085 - 24594981
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  24595085 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 24594986  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  24594985 gtgat 24594981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27008596 - 27008492
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  27008596 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacctcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 27008497  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  27008496 gtgat 27008492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23327537 - 23327458
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  23327537 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtc 23327458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 212
Target Start/End: Original strand, 110888 - 110957
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 212  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  110888 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgata-ttgttcatgatacatgtaattggt 110957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7726993 - 7726919
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7726993 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttagctgttatctggattatgatgatgt 7726919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 25902021 - 25902123
Alignment:
Q  60 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 158  Q
    ||||||| |||||||||||   | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| |    
T  25902021 catcgaaggtgacgaccttatagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggt 25902120  T
Q  159 gat 161  Q
    |||    
T  25902121 gat 25902123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Original strand, 29192583 - 29192641
Alignment:
Q  158 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  29192583 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 29192641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37051559 - 37051465
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  37051559 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 37051465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 239
Target Start/End: Original strand, 21653228 - 21653265
Alignment:
Q  202 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21653228 atgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggttt 21653265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31304 - 31038
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31304 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 31205  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31204 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatttttatgagaatattat 31106  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31105 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 31038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12831 - 12488
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12831 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 12732  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgaca 200  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||    
T  12731 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaaatgtgattggtgattgtgtatgaataattttgaattaat-gttgttcatgaca 12633  T
Q  201 catgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg---tttgatgtaag------tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 290  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||   |||||||||||      ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  12632 catgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggggttttgatgtaagtatatatatatatatgagaatattattattcatcaagtgcatgatgtct 12533  T
Q  291 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12532 atattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 60207 - 59865
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  60207 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 60108  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||    
T  60107 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaatgtttgtt 60008  T
Q  194 catgacacatgtgattggtgat-tattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttta 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||| | | || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  60007 catgacacatgtgattggtgatgtattgatgtgagatattgggaatatgatataagtat-tatttgtggatattattattgatcaagtgcatgatgttta 59909  T
Q  292 tattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  59908 aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 59865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21128 - 20860
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  21128 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgtgta 21029  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatta 266  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21028 tgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttatgattggtgattattgatgtgagatattgggattatgatgtaagtatatgtatgagaatatta 20929  T
Q  267 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || || ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20928 ttgttaatcaaatgcatgatgcttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 67 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28719 - 28450
Alignment:
Q  67 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 166  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  28719 agtgacgaccttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgagt 28620  T
Q  167 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 265  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28619 atgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttgtgattggtgattattgatgtgagatattcagatcatgatgtaagtctatgtatgagaatatt 28520  T
Q  266 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28519 attgttgatcaaatgcatgatgtttcaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 28450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 129719 - 129877
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||   ||||| ||||| | |||| ||| ||  || |||||||||||||||    
T  129719 cttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacaatgttgagttgttccatcggaggtgaagacgttttggagatttggtaccacat 129818  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129819 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 334
Target Start/End: Original strand, 7012 - 7287
Alignment:
Q  67 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7012 agtgacgaccttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgt 7111  T
Q  167 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgag 259  Q
     ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||| ||||||    
T  7112 gtgaataattgaaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatgag 7211  T
Q  260 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  7212 aatatcattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaattattcatgttaacttttattttgattatgatgatgt 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 535
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  802 gtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtaattacgta 703  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  702 tgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattat 603  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  602 tattgatcaagtgcatgatgcttaaattgaaatattcatgctaactgttatttgtattatgatgatgt 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14311 - 13964
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14311 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtcaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 14212  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt---------attgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 191  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||  ||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||  |||    
T  14211 atttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgattggtgattgacgattgtgtatgaatgtctgtgatttgatgattg 14112  T
Q  192 ttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatat--gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatg 287  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14111 ttcatgacacatacgattgatgacttattaatgtgagatattggggttatgatataagtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatg 14012  T
Q  288 tttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    | |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14011 tctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1307
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1046 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgggta 1145  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   || | |||          
T  1146 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattgatacgtgaa------ 1239  T
Q  268 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  1240 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgataactattattttgattatgatgatgt 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4762 - 4425
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4762 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgc 4663  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgt 192  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||   ||||| |     ||||||| ||| ||||||||||||| | || ||| ||  ||||    
T  4662 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtattgttttggatatgtgattggtgattggtgaatgtgtatgaataactatgaattaatgattgt 4563  T
Q  193 tcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 290  Q
    |       |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4562 t-------catgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggagtatgatgtaagtattgatatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgttt 4470  T
Q  291 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4469 atattgacttattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 236597 - 236412
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  236597 gtgattggtgattgtgtatgaataatggtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtcagatattggggttcgatgtaagta 236498  T
Q  250 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  236497 tatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaattgttatttgaattatgatgatgt 236412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 270762 - 270545
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  270762 cttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgatcttttggagatttggtaccacat 270663  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 197  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  270662 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgata-ttattcatg 270564  T
Q  198 acacatgtgattggtgatt 216  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  270563 atacatgtaattggtgatt 270545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 270515 - 270329
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  270515 tgataaatgtgattggttattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtttga 270423  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270422 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 270329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 236814 - 236652
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||   || |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  236814 cttttacttcggagattatgtaagaaaggtgtgaaatcttacatacgatgttaaagtagcatcgaaggtgacgacctagaggtgataaggtaccacatgc 236715  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 163  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  236714 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg 236652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 255963 - 256007
Alignment:
Q  18 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 62  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  255963 atgtaagacgggtatgaaatcttacatttgatgtttttgttgcat 256007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28145 - 27950
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28145 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 28046  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28045 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 27950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28327 - 28179
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  28327 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttgatgattgagta 28228  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  28227 tgaataactgtgaattgatatttgttaatgatatatgtggttgatgatt 28179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28199 - 28125
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  28199 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatt 28125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3248 - 3055
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3248 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttga 3149  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3148 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatttttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 477 - 281
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 240  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  477 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattgttgaggtaagatattggggttttg 378  T
Q  241 atgtaag--tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  377 atgtaagtatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgataatgt 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3518 - 3430
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3518 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 3430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 577
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  720 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 621  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  620 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30843 - 30650
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-ga 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  30843 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggttttga 30744  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30743 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 30650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31090 - 31002
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31090 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 31002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 13548 - 13740
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13548 tgatatttgtgattggtgattgtgtataaataattgtgaattgatatt-gttcatgacacatgtgattagtgaatattgatgtgagatattggggtttga 13646  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13647 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 192
Target Start/End: Original strand, 13434 - 13557
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  13434 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtctt-ttgatatatgtgtttagtgattgtgta 13532  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgt 192  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||    
T  13533 tgagtaattgttaaatgatatttgt 13557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 15006 - 15271
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatga-ttgtgt 166  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||     
T  15006 gtgacgaccctgagatgattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatacatgtgactggtgatttgtga 15105  T
Q  167 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatat 264  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||     ||    
T  15106 atgaatattagtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgattattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtatg-----at 15200  T
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15201 tattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26642 - 26451
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  26642 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattatgaatgtgagatattgggg-ttgat 26544  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26543 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 23959 - 24009
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt 51  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23959 cttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgt 24009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 3828 - 4044
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3828 cttttacttcggagattatataagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 3927  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 197  Q
    || |||| |||||  || ||||| |||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  |||||||||    
T  3928 atatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtattattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatg 4025  T
Q  198 acacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4026 acacatgtgattggtgatt 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Original strand, 3707 - 3893
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||     
T  3707 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttgttgatatatgtgattgatgatggtgtg 3806  T
Q  168 tgaataattgtgtattgata-tttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatat 252  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3807 tgaataattgtgaattgatattttgttcatgacacatgtgattagtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatat 3893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Original strand, 3927 - 4014
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  3927 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattataatgatgt 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 4638 - 4831
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 4737  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4738 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 4269 - 4435
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4269 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 4368  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4369 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 4435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 49478 - 49671
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49478 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 49577  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49578 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 49671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 49109 - 49275
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  49109 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 49208  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49209 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 49275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3292 - 3129
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3292 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 3193  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  3192 atgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 3129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3101 - 2907
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 240  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||  ||  |    
T  3101 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattagtgactattgctgtgagatattggaattggg 3002  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3001 atataggtatatttatgtgaatactattattgttcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Original strand, 26416 - 26575
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26416 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 26515  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaag 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26516 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtaag 26575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 334
Target Start/End: Original strand, 66322 - 66592
Alignment:
Q  74 accttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg-------tgt 166  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||       |||    
T  66322 accttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattttgaagtgtgattggtgattgggaattgtgt 66421  T
Q  167 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatat 264  Q
    |||| ||| | || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||||||||||||   |||| ||||||    
T  66422 atgagtaactatggattgatgattgttcatgattcatgtgattggtgattaattgatatgagatattgagattatgatgtaagtattgatatgtgaatat 66521  T
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  66522 tattattgagcaagtacatgatgattatattgaattattcatgttaaatgtcatttggattatgatgatgt 66592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 70926 - 71003
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacctt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  70926 cttttacttcggagattatgtaagataggtgtgaaatcttccatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctt 71003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 334
Target Start/End: Original strand, 26590 - 26660
Alignment:
Q  265 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26590 tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 26660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 21633 - 21827
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 240  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21633 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacattttttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 21732  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21733 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatttatgctaactgttatttggattatgatgatgt 21827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 156183 - 156376
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  156183 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggagtttga 156282  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  156283 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 156376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 85966 - 86149
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  85966 tgataaatgtgattgttgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 86058  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| |||     || ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  86059 tgtaagtattaatgtgtga-----ttgttattgatcaaatgcatgatgtttatagtgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 86149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 156062 - 156129
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  156062 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 156129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 155937 - 156031
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  155937 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 156031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34916 - 34811
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34916 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 34817  T
Q  157 atgatt 162  Q
     |||||    
T  34816 gtgatt 34811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 249068 - 249313
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacg---accttgaggtgatttggtaccaca 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  249068 cttttacttaggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccaca 249167  T
Q  98 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 197  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||        
T  249168 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt---- 249263  T
Q  198 acacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
       |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  249264 ---catgtgattaatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 249313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7631 - 7453
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  7631 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtgattattgatgggagatattggggttttt 7532  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7531 gatgtaagtatatgtatgagaatattattcttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttat 7453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8065 - 7842
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8065 cttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 7966  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgt 192  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    | || |     ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  ||||    
T  7965 atttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgagtggtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgt 7866  T
Q  193 tcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  7865 tcatgacaaatgtgattggtgatt 7842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7682
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 219  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7759 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 7682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3258 - 3095
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3258 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgc 3159  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3158 atgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgt 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2811 - 2737
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2811 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2939 - 2865
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2939 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2683 - 2616
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2683 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 2993
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3067 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2475
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2561 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 7)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5866 - 5703
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5866 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgc 5767  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5766 atgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgt 5703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 813
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| |    
T  943 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgaagattgtgaa 844  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  843 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5547 - 5480
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5547 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5675 - 5601
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5675 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 511 - 328
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  511 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 419  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  418 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatggtaactgttatttggattatgataatgt 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5425 - 5339
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5425 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 641
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  715 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgatacatgtaattggtgatt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 13723 - 13884
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 13822  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  13823 atatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttggtgatt 13884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 13914 - 14007
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13914 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatgttggg 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16084 - 15922
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  16084 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttgataccacat 15986  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15985 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Original strand, 14078 - 14154
Alignment:
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  14078 gaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 14154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Original strand, 2474 - 2658
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2474 tgattggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 2573  T
Q  251 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  2574 tgatttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4346 - 4078
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  4346 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgtatatatgtgtcgggctaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 4247  T
Q  166 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
    ||||||||| ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||    
T  4246 tatgaataactgtgatttggtgagtgttcatgacacatgtgattggttattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatgtatatgtgaata 4147  T
Q  264 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4146 ctatt---gatcaagcacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 4078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 77793 - 77600
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||  |||    
T  77793 tgatatatgtgattggtgattgtgcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtggttatggatgtgagatattagggttttt 77694  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  77693 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaaatgttatttggattatgatgat 77600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 77977 - 77919
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  77977 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatt 77919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36047 - 35999
Alignment:
Q  189 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36047 ttgttcatgatacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggg 35999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15032 - 14849
Alignment:
Q  151 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 249  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15032 tgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 14933  T
Q  250 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  14932 tatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 14849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17928 - 17735
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttga 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |  |||    
T  17928 gatatatgtgattggtgattgtgtattaataactgttaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaggtattgggataatga 17829  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17828 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatggtgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattttgatgatgt 17735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18055
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 18055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Original strand, 499 - 683
Alignment:
Q  148 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 247  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  499 atgtgattggtgatggtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattggggtttgatgtaag 598  T
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  599 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 8)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20024 - 19799
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20024 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaat 19925  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 191  Q
    ||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  || || |     ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  19924 gcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttg 19825  T
Q  192 ttcatgacacatgtgattggtgatta 217  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19824 ttcctgatacatgtgattgctgatta 19799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17716 - 17526
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17716 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 17617  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17616 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 17526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19746 - 19556
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19746 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 19647  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  19646 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 19556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17940 - 17776
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17940 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaat 17841  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 163  Q
    ||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  17840 gcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattg 17776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 8183 - 8293
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8183 cttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 8282  T
Q  101 atgtatgcgtc 111  Q
    || ||||||||    
T  8283 atttatgcgtc 8293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 13572 - 13682
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13572 cttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 13671  T
Q  101 atgtatgcgtc 111  Q
    || ||||||||    
T  13672 atttatgcgtc 13682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 8466 - 8539
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8466 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 8539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 13855 - 13928
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13855 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 13928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29830 - 29653
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29830 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataacggtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 29731  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  29730 tgtaagtattgatttgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 29653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27207 - 27067
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  27207 cttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtactacatgc 27108  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 141  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27107 atttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttat 27067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26954 - 26889
Alignment:
Q  254 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 319  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26954 tatgtgaatattatttttgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatt 26889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 56572 - 56369
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  56572 cttttacttcagagattatgtaagacgggtttgaattcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgaccttttggtgatttggtaccacatgc 56473  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat-------tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgtt 193  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||       |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  56472 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgttgaatgatgattgtgtatgagtaactgtgaattgatgtttgtt 56373  T
Q  194 catg 197  Q
    ||||    
T  56372 catg 56369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 56370 - 56206
Alignment:
Q  162 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgag 259  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||             
T  56370 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgac-catgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat--------- 56281  T
Q  260 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  56280 -atatttatattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 56206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33580 - 33395
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  33580 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 33481  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  33480 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 33395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 32711 - 32869
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  32711 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 32810  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32811 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 32869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33848 - 33725
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  33848 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 33749  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttg 191  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  33748 tgaataattgtgaattgatgtttg 33725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 39264 - 39449
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  39264 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 39363  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  39364 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 39449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40133 - 39975
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  40133 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 40034  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40033 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 39975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Original strand, 38996 - 39119
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  38996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 39095  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttg 191  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  39096 tgaataattgtgaattgatgtttg 39119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 68960 - 68785
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  68960 cttttacttgggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgc 68861  T
Q  101 atgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 174  Q
    || |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  68860 atatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtatgaataa 68785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 68773 - 68597
Alignment:
Q  158 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat-tgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgta 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | ||    
T  68773 tgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacatgtgattggtgattaactgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttata 68674  T
Q  256 tgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 331  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  68673 tgcgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 68597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30531 - 30314
Alignment:
Q  117 gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 215  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| |||||||    
T  30531 gtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgattgataattgtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgat 30434  T
Q  216 t-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaatt 313  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||   ||| | |||| |||| | ||||||||||  ||| || | |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  30433 tgattgatgtgagata-tggggattatagtatgaatatatatgtg-atattattatcggattaaatgcatgatatttgaattgaattattcatgttaatt 30336  T
Q  314 gttat-tggattatgatgatgt 334  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  30335 attatatagattatgatgatgt 30314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7175 - 6984
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  7175 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacgtgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 7076  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 331  Q
    |  ||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7075 agataagtatacatgtatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 6984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7298 - 7214
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7298 gtgacgaccttgaggtgatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 7214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8711 - 8493
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8711 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgaatcggaggtgacggccttgaggtgatttggtaccacatgc 8612  T
Q  101 atgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    || |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  || ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |  ||||||||||    
T  8611 atatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgagattggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatga 8512  T
Q  199 cacatgtgattggtgatta 217  Q
     || ||||| |||||||||    
T  8511 tacgtgtgagtggtgatta 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8387
Alignment:
Q  279 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8443 tacatgacgtttatagtgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 8387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 185 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23190 - 23040
Alignment:
Q  185 atatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatg 284  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23190 atatttgttcagaacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatg 23091  T
Q  285 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23090 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16445 - 16376
Alignment:
Q  266 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16445 attattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 334
Target Start/End: Original strand, 19248 - 19489
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 183  Q
    |||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||    
T  19248 gatttgataccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtctttttgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaatt 19347  T
Q  184 gatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtac 281  Q
    |||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |    
T  19348 gataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgc 19435  T
Q  282 atgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19436 atgatgtttatattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 19489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 94495 - 94335
Alignment:
Q  144 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgat 242  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||    
T  94495 atatatgtgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattgggattatgat 94396  T
Q  243 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattatt 303  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  94395 ataattatatatatgagaatattattattgatccagtacatgatgtttgaattgaattatt 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 94742 - 94695
Alignment:
Q  117 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  94742 gtgcatatcatgacatgagtcttatatataaatgtgattggtgattgt 94695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 90600 - 90748
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  90600 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 90699  T
Q  168 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90700 agaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 90748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 78313 - 78228
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  78313 cttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgat 78228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 90802 - 91018
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-g 240  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  90802 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattggggttttg 90901  T
Q  241 atgtaag----------------------tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta- 317  Q
    |||||||                      ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  90902 atgtaagtatatacatatatatatatatatatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttat 91001  T
Q  318 ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  91002 ttggattatgatgatgt 91018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 129025 - 128867
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  129025 cttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 128931  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  128930 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgttataggtgattgatgat 128867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 128804 - 128730
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  128804 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 128730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 71812 - 71922
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  71812 cttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgaccttgaggtgatttggtaccacaggc 71911  T
Q  101 atgtatgcgtc 111  Q
    || ||||||||    
T  71912 atttatgcgtc 71922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 72093 - 72166
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  72093 tattatcattgattaagtatatgatatttgaaatgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 72166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1925 - 1652
Alignment:
Q  65 aaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgat 161  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  1925 aaagagacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgat 1826  T
Q  162 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgaga 260  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||| | |||| |||| |     
T  1825 tgtgcatgaataaatgtgatttgaagattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagatattgggattata-gtatgaatatatatgtg- 1728  T
Q  261 atattattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1727 atattattatcgaattaagtacatgatgtttaaattaaattactcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16961 - 16826
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16961 tgatgtatatgattggtgattgtgtgtgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 16862  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 277  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  16861 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaa 16826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17128 - 17070
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17128 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 17070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 106453 - 106559
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  106453 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 106552  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  106553 atttatg 106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Original strand, 113902 - 114150
Alignment:
Q  88 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 185  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||  |||     
T  113902 tggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcaagacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtataaataactatgatttgg 114001  T
Q  186 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacat 283  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  114002 tgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttatatgtgaatatt---attgatcaagtacat 114098  T
Q  284 gatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  114099 gatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 114150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 6668 - 6830
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  6668 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 6766  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6767 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 6830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 130520 - 130409
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130520 cttttacttcggtgataacgtaagaccggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 130421  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  130420 atatatgtgtcg 130409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 58955 - 59117
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||   ||||  ||||| | |||||||||||      ||||||||||||||    
T  58955 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacataagatgttgacttgtc-catcggaggtgacgacctttttaaaatttggtaccacat 59053  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  59054 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 59117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 108156 - 108058
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  108156 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaacttggtgcacatcatgacatgagtcttattgggaaatgtgattgatggttgt 108058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 7197 - 7303
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7197 cttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 7296  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  7297 atttatg 7303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7489
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7416 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 9930 - 10122
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9930 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttattcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10029  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| |   | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  10030 tgtaagtgttgatttgagaataatattatcgataaagtgcatgatg-ttaaattgaaaaatacatgttaactgtcatttggattatgataatgt 10122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3386 - 3244
Alignment:
Q  5 tacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgt 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  3386 tacttcggtgattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctagaggtgatttggtaccacatgcatat 3287  T
Q  105 atgcgtcga--tatgtgcatatcatg---acatgagtcttatt 142  Q
    ||| |||||  || ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3286 atgtgtcgaactaggtgcatatcatgttcacatgagtcttatt 3244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 2155 - 2262
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  2155 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgaatcgaaggtgacgatcttgaggtgatccggtaccacatgc 2254  T
Q  101 atgtatgc 108  Q
    || |||||    
T  2255 atttatgc 2262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2511
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2438 tattatcattgattaagtatatgaaatttggattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 2511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 2650 - 2869
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  2650 cttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 2749  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtg--catatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttca 195  Q
    |||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| ||  || ||||    
T  2750 gcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtg-attaatgattattca 2848  T
Q  196 tgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||| |||||| ||||||||||    
T  2849 tgatacatgtaattggtgatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 2899 - 3083
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 240  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  2899 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattgatgtgagatatcggggtgtg 2991  T
Q  241 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt-ggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2992 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattaatgatcaagtgcattatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6123
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6386 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 6287  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 263  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  | ||| | |||| | || | |||    
T  6286 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcataacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattata-gtatgaatatatgtgtg-ata 6189  T
Q  264 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatg 327  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6188 ttattatcggattaagtacatgatatttaaattgaattactcatgttaatttttatgtggattatg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 4886 - 4991
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4886 cttttacttcggagattatgtatgacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatc-aaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgc 4984  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  4985 atttatg 4991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 25145 - 25274
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25145 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatttaaggtgacgaccttgaggtgattttgtaccacatgc 25244  T
Q  101 atgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 128  Q
    || |||| |||||  || ||||||||||||    
T  25245 atatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 25274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 78366 - 78472
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  78366 cttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacaaccttgaggtgattcagtaccacatgc 78465  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  78466 atttatg 78472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 54279 - 54118
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  54279 cttttacttcagagattatgtaagctgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaagtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 54181  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  54180 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgatt 54118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 109601 - 109799
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  109601 cttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 109699  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 198  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  109700 gcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgatttgagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 109799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 109897 - 109971
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109897 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 54112 - 54011
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  54112 tgataaatgtgattggtgatagtgaattaataattgtgaattgataattgttcatg-------tgattggtgattattgatgtgagatattggagtgtga 54020  T
Q  242 tgtaagtat 250  Q
     ||||||||    
T  54019 cgtaagtat 54011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 196
Target Start/End: Original strand, 110002 - 110055
Alignment:
Q  143 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 196  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  110002 gatatatgtgattagtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 110055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 11553 - 11716
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  11553 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 11651  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    || |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  11652 atttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgattgt 11716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 250
Target Start/End: Original strand, 11796 - 11845
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  11796 catgtgattgatgattattgatgagaaatattggggtgtgatgtaagtat 11845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 145172 - 145016
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  145172 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatg 145073  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  145072 catatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 145016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 147431 - 147275
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  147431 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgatgaccttttggagatttggtaccacatg 147332  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  147331 catatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 147275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 144980 - 144926
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  144980 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 144926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 147239 - 147185
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  147239 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 147185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Original strand, 21158 - 21288
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-- 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  21158 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggttttt 21250  T
Q  240 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 21288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 20906 - 21002
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20906 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttaatgatatatgtgattggtgattgt 21002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 21030 - 21104
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 21104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 197623 - 197778
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||     
T  197623 cttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtcttttat-catcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgt 197721  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  197722 atttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 197778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 85053 - 84942
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85053 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 84954  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  84953 atatatgtgtcg 84942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26191 - 26080
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26191 cttttacttcggtgataatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacctttaggtgatttggtaccacatgc 26092  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  26091 atatatgtgtcg 26080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 334
Target Start/End: Original strand, 3125 - 3395
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||  || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| | |||||||     
T  3125 gtgacgaccttgaagtgaaatggtatcacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaattatgattgc 3223  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 262  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  3224 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgagattatg--gtatgaatatatatgtggat 3321  T
Q  263 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3322 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 217269 - 217426
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  217269 cttttacttcggagattatgtaaggcggg-gtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 217367  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  217368 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 217426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5396 - 5221
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5396 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 5304  T
Q  250 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  5303 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 5221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5755 - 5661
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  5755 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 118138 - 118244
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  118138 cttttacttcggtgattatgtaagatggctgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgaatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcagtaccacatgc 118237  T
Q  101 atgtatg 107  Q
    || ||||    
T  118238 atatatg 118244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 163901 - 163817
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163901 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 163817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 34104 - 34006
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34104 cttttacttcggtgattatgtaagacaggtgtgaaatgttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgactttgaggtgattcggtaccacatg 34006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 6410 - 6583
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
T  6410 tgataaatgtggttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgat------------------- 6490  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6491 -gtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 6583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6406
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6310 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattaatgattgt 6406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 238 - 334
Target Start/End: Original strand, 22 - 119
Alignment:
Q  238 ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22 ttgatgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 334
Target Start/End: Original strand, 75550 - 75727
Alignment:
Q  150 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  75550 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagatattggggttatgatgtaag 75649  T
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |         |||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  75650 tatatat---------ttatga-cgatcaagtacatgatgtttgaattaaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 75727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Original strand, 72106 - 72177
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  72106 gtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 72177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 5118 - 5274
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||  ||||||| ||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5118 cttttactttggagattatgtaaggcggcagtgaacccttacatacgatgtttacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 5216  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5217 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Original strand, 12788 - 12876
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12788 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 14145 - 14250
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14145 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtaacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 14244  T
Q  101 atgtat 106  Q
    ||||||    
T  14245 atgtat 14250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 218
Target Start/End: Original strand, 15935 - 16011
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15935 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaacaactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattat 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 164
Target Start/End: Original strand, 15833 - 15907
Alignment:
Q  90 gtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttattcataaatgtggttggtgattgt 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4320
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4482 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 4384  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4383 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25718 - 25594
Alignment:
Q  153 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 251  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  25718 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 25619  T
Q  252 tgtatgagaatattattattgatca 276  Q
      |||| ||||||| ||||||||||    
T  25618 gttatgtgaatatttttattgatca 25594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25799 - 25735
Alignment:
Q  152 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25799 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 25735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 322 - 211
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 223  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  222 atatatgtgtcg 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5377 - 5266
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5377 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 5278  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  5277 atatatgtgtcg 5266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32093 - 31925
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| |||||    
T  32093 gtgacgaccttgaggtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattgataattgt 31995  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 233  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31994 gtatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattg 31925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31850 - 31776
Alignment:
Q  259 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  31850 gaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatg-taaatgttatgtgggttatgatgatgt 31776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40098 - 40010
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40098 gtgacaaccctgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 40010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37697 - 37627
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  37697 attattattgatcaaatgcatgatgttaat--tgaattattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 37627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44443 - 44288
Alignment:
Q  146 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 244  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | || |||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  44443 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgtttattgatgtgagatattggggttttggtgt 44351  T
Q  245 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 307  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  44350 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 44288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 52597 - 52457
Alignment:
Q  161 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgag 259  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |    
T  52597 ttgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgattgatgactattgatctgagatattggggttttgatttaagtatatgcatgtg 52505  T
Q  260 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 307  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  52504 aatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatg 52457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 3910 - 3799
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3910 cttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 3811  T
Q  101 atgtatgcgtcg 112  Q
    || |||| ||||    
T  3810 atatatgtgtcg 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 51671 - 51511
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||| ||||||  || ||||||||||||| |||    
T  51671 cttttacttcggagattatgtcaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgatgaccttttggagatttggtaccacgtgc 51573  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51572 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 51511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 56023 - 55922
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  56023 cttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggggattttgtaccacatgc 55924  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  55923 at 55922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 145413 - 145283
Alignment:
Q  88 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 185  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | |||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145413 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgagtagtgattgtgtatgaataactgtgaattga 145314  T
Q  186 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  145313 tgatttttcatgacacatgtgattggtgatt 145283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 145060 - 144987
Alignment:
Q  262 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  145060 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattaatcatgttaattgttatgtggattatgataatgt 144987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14939 - 14779
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||| ||||||||    
T  14939 cttttatttcggagattatgtaaggtgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggttccacatgc 14841  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    || |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14840 atttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28460 - 28300
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  || |||||||| ||||||||    
T  28460 cttttaattcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttggagatttggtgccacatgc 28362  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    || |||| ||| |||  || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28361 atttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 28300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 307
Target Start/End: Original strand, 12989 - 13085
Alignment:
Q  212 tgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  12989 tgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 13085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31192 - 31120
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  31192 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31391 - 31333
Alignment:
Q  158 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 216  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  31391 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 31333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 4662 - 4568
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 96  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  4662 cttttacttcagagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacctggaggtgattcagtaccac 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 1311 - 1469
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  1311 cttttactttggagattatgtaag----gagtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgc 1405  T
Q  101 atgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattg 163  Q
    || |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  1406 atttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattg 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1509
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1587 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1427 - 1298
Alignment:
Q  201 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  1427 catgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 1335  T
Q  299 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  1334 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 1
Alignment:
Q  2 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  102 ttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgagcttttggagatttggtaccacatgc 3  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  2 at 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 804
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  987 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 895  T
Q  242 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  894 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 106641 - 106479
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  106641 cttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgatcccttacatatgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 106543  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  106542 gcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtgat 106479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27352 - 27169
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||| | ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  27352 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgctcata-------tgatcgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 27260  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27259 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 27169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 196 - 35
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatg 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||   || || |||||||||||||    
T  196 cttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgacctttttggagaattggtaccacatg 98  T
Q  100 catgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||| |||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  97 catttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtgat 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 161
Target Start/End: Original strand, 1 - 94
Alignment:
Q  69 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 264 - 448
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 240  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| |||| | ||    
T  264 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattggtcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcgggggtgtg 356  T
Q  241 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  357 atgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 15167 - 15239
Alignment:
Q  263 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15167 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6898
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6826 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatatgattg 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 334
Target Start/End: Original strand, 6934 - 7115
Alignment:
Q  142 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |       ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  6934 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattggt-------catatgattgatgactattgatgtgagatattgggatgtga 7026  T
Q  242 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 334  Q
     ||||||||  |||| ||     |||| |||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7027 agtaagtattaatgtgtg-----attactattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 7115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 334
Target Start/End: Original strand, 4639 - 4725
Alignment:
Q  248 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4639 tatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 4725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 217
Target Start/End: Original strand, 4528 - 4596
Alignment:
Q  149 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 217  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4528 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatta 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 9529 - 9607
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9529 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41348 - 41190
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttt--tgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||    |||| ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  41348 cttttacttcgtagattatgtaaggcaggggtgaacccttacatacgatgttgagctgttccatcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 41249  T
Q  99 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc-ttattgatatatgtgattg 156  Q
    | || |||| ||| ||| |||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  41248 gaatttatgtgtcaataagtgcatatccagacataagtctttttttatatatgtgattg 41190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37862 - 37768
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37862 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7538 - 7465
Alignment:
Q  84 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7538 gatttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 17667 - 17771
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  17667 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 17766  T
Q  157 atgat 161  Q
     ||||    
T  17767 gtgat 17771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 2839 - 2989
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  2839 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 2936  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 217  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  2937 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 26542 - 26692
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 164  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26542 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 26639  T
Q  165 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 217  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  26640 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 26692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3254
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  3160 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 12329 - 12285
Alignment:
Q  18 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 62  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12329 atgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcat 12285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29934 - 29855
Alignment:
Q  59 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 137  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  29934 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 29855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 4575 - 4532
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 44  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  4575 cttttacttcggagataatgtaagacggacgtgaaatcttacat 4532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 52794 - 52837
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  52794 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 52837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 56746 - 56789
Alignment:
Q  1 cttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  56746 cttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 56789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25476 - 25382
Alignment:
Q  68 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 161  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  25476 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 25382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7299
Alignment:
Q  293 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 334  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7341 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7125 - 7049
Alignment:
Q  87 ttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatat-atgtgattgatga 160  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  7125 ttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcataacatgagtctatttgatgtaatgtgattgatga 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University