View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7687_low_5 (Length: 586)

Name: NF7687_low_5
Description: NF7687
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7687_low_5
NF7687_low_5
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (5-573)||(25277171-25277738)
chr1 (5-573)||(37345097-37345656)
chr1 (21-573)||(45045323-45045866)
chr1 (133-544)||(26224477-26224887)
chr1 (133-544)||(27088078-27088478)
chr1 (133-533)||(33600076-33600475)
chr1 (149-544)||(6817664-6818050)
chr1 (133-525)||(50555035-50555417)
chr1 (133-533)||(15105247-15105638)
chr1 (186-533)||(46582573-46582911)
chr1 (264-533)||(51895228-51895488)
chr1 (243-533)||(31237556-31237829)
chr1 (264-533)||(3012516-3012776)
chr1 (320-533)||(2870400-2870612)
chr1 (263-533)||(52642698-52642959)
chr1 (408-544)||(4855164-4855300)
chr1 (408-544)||(34777335-34777471)
chr1 (393-533)||(8168514-8168654)
chr1 (133-238)||(37087316-37087421)
chr1 (21-135)||(51894979-51895094)
chr1 (21-135)||(6817291-6817406)
chr1 (21-135)||(37087699-37087814)
chr1 (29-135)||(52642324-52642431)
chr1 (29-131)||(15105917-15106020)
chr1 (21-134)||(3012267-3012381)
chr1 (21-133)||(31237231-31237344)
chr1 (21-135)||(2870639-2870753)
chr1 (381-494)||(9120813-9120926)
chr1 (381-494)||(1443400-1443513)
chr1 (381-494)||(47012213-47012326)
chr1 (21-129)||(50554592-50554701)
chr1 (173-247)||(42558842-42558916)
chr1 (30-135)||(8169095-8169202)
chr1 (30-135)||(46582405-46582512)
chr1 (21-93)||(4854809-4854882)
chr1 (21-93)||(27088849-27088922)
chr1 (21-93)||(34776981-34777054)
chr1 (30-93)||(8168396-8168460)
chr1 (174-247)||(3369962-3370035)
chr1 (30-93)||(26224042-26224106)
chr1 (30-84)||(1443761-1443816)
chr1 (21-93)||(33599630-33599704)
chr1 (30-84)||(47011910-47011965)
chr1 (30-93)||(20944660-20944724)
chr1 (29-68)||(27952162-27952201)
chr1 (173-207)||(5784211-5784245)
chr1 (528-573)||(2870338-2870382)
chr1 (528-573)||(3012794-3012838)
chr1 (29-89)||(42558337-42558398)
chr1 (441-525)||(3370338-3370422)
chr1 (541-573)||(4855319-4855351)
chr1 (541-573)||(34777490-34777522)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (5-573)||(32517632-32518191)
chr6 (133-544)||(18644063-18644473)
chr6 (133-544)||(7371915-7372316)
chr6 (133-544)||(32438014-32438414)
chr6 (186-544)||(20524177-20524526)
chr6 (135-533)||(11356010-11356385)
chr6 (263-533)||(7050560-7050821)
chr6 (133-494)||(33267810-33268155)
chr6 (263-544)||(10569192-10569462)
chr6 (137-308)||(9399135-9399306)
chr6 (263-485)||(6901999-6902212)
chr6 (21-135)||(20524897-20525012)
chr6 (21-128)||(11356722-11356830)
chr6 (29-134)||(33277200-33277306)
chr6 (29-135)||(6902479-6902586)
chr6 (21-135)||(33267435-33267547)
chr6 (381-484)||(32455022-32455125)
chr6 (63-135)||(9399638-9399710)
chr6 (479-533)||(6900287-6900341)
chr6 (81-135)||(7371584-7371638)
chr6 (20-135)||(13611091-13611208)
chr6 (21-134)||(32437573-32437688)
chr6 (179-247)||(17935548-17935616)
chr6 (21-64)||(7371544-7371587)
chr6 (528-573)||(7050498-7050542)
chr6 (528-573)||(7372323-7372367)
chr6 (528-573)||(20524126-20524170)
chr6 (133-165)||(20524587-20524619)
chr6 (541-573)||(32438433-32438465)
[»] chr8 (52 HSPs)
chr8 (21-573)||(5037198-5037741)
chr8 (133-544)||(41041517-41041918)
chr8 (133-544)||(40338605-40339014)
chr8 (186-533)||(27691967-27692305)
chr8 (186-544)||(33707795-33708144)
chr8 (133-533)||(29237995-29238386)
chr8 (133-533)||(15307094-15307484)
chr8 (133-533)||(15487463-15487853)
chr8 (133-525)||(27405075-27405458)
chr8 (264-533)||(22273060-22273328)
chr8 (154-533)||(3152484-3152862)
chr8 (264-533)||(42942595-42942855)
chr8 (263-533)||(26239504-26239765)
chr8 (176-514)||(13485112-13485417)
chr8 (263-535)||(41824733-41824996)
chr8 (326-544)||(9672292-9672509)
chr8 (408-544)||(8609005-8609141)
chr8 (408-544)||(13107571-13107707)
chr8 (408-533)||(38548028-38548153)
chr8 (263-533)||(7744193-7744454)
chr8 (393-533)||(35510217-35510357)
chr8 (408-544)||(13283186-13283317)
chr8 (393-533)||(33761642-33761782)
chr8 (394-533)||(600809-600948)
chr8 (21-135)||(22273462-22273577)
chr8 (21-135)||(41041124-41041239)
chr8 (21-135)||(13484922-13485041)
chr8 (21-135)||(41824352-41824467)
chr8 (179-530)||(11720354-11720697)
chr8 (29-135)||(26239128-26239237)
chr8 (21-131)||(42942992-42943103)
chr8 (182-301)||(12515887-12516006)
chr8 (21-135)||(8608650-8608766)
chr8 (21-135)||(27692366-27692482)
chr8 (21-135)||(33707618-33707734)
chr8 (21-135)||(40338225-40338333)
chr8 (30-135)||(33761524-33761631)
chr8 (30-135)||(33762244-33762351)
chr8 (173-247)||(28432930-28433004)
chr8 (29-97)||(3152384-3152453)
chr8 (21-93)||(38548435-38548508)
chr8 (21-135)||(13107216-13107332)
chr8 (30-93)||(27404641-27404705)
chr8 (30-93)||(35509669-35509733)
chr8 (37-93)||(29693932-29693989)
chr8 (30-68)||(29238783-29238821)
chr8 (173-221)||(10770934-10770982)
chr8 (41-135)||(13283556-13283652)
chr8 (528-573)||(27691905-27691949)
chr8 (528-573)||(42942533-42942577)
chr8 (29-92)||(15562807-15562871)
chr8 (541-573)||(38547966-38547998)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (21-544)||(49523922-49524436)
chr4 (133-544)||(35402600-35403002)
chr4 (133-533)||(41760659-41761050)
chr4 (133-544)||(11254862-11255264)
chr4 (133-544)||(51012717-51013119)
chr4 (186-544)||(43520228-43520577)
chr4 (133-544)||(2692218-2692620)
chr4 (202-544)||(42981410-42981743)
chr4 (263-533)||(48645809-48646070)
chr4 (263-533)||(54386942-54387203)
chr4 (242-525)||(834096-834370)
chr4 (393-544)||(41782312-41782463)
chr4 (133-302)||(11641112-11641281)
chr4 (242-525)||(5438593-5438863)
chr4 (393-533)||(319845-319985)
chr4 (393-533)||(4172685-4172825)
chr4 (393-533)||(33265386-33265526)
chr4 (393-533)||(43508029-43508169)
chr4 (21-135)||(35402160-35402275)
chr4 (320-531)||(11640853-11641068)
chr4 (22-132)||(41760140-41760251)
chr4 (456-544)||(52867414-52867502)
chr4 (133-240)||(41760532-41760638)
chr4 (21-135)||(11254470-11254585)
chr4 (29-135)||(54387464-54387571)
chr4 (30-135)||(42982065-42982172)
chr4 (449-533)||(11602478-11602562)
chr4 (30-135)||(2691785-2691891)
chr4 (173-247)||(32652936-32653010)
chr4 (36-106)||(11641602-11641673)
chr4 (173-247)||(7150491-7150565)
chr4 (179-247)||(4614587-4614655)
chr4 (21-135)||(43520638-43520754)
chr4 (21-135)||(51013447-51013563)
chr4 (158-301)||(28101463-28101606)
chr4 (30-135)||(43508180-43508287)
chr4 (30-93)||(833654-833718)
chr4 (30-93)||(5439241-5439305)
chr4 (30-135)||(319727-319834)
chr4 (173-236)||(13449561-13449624)
chr4 (30-135)||(33265537-33265644)
chr4 (30-93)||(4173309-4173374)
chr4 (30-93)||(33264838-33264902)
chr4 (30-135)||(4172567-4172674)
chr4 (173-234)||(27385571-27385632)
chr4 (29-68)||(44793324-44793363)
chr4 (29-68)||(47942408-47942447)
chr4 (30-93)||(320469-320534)
chr4 (528-573)||(41761068-41761112)
chr4 (528-573)||(42981359-42981403)
chr4 (441-525)||(7150221-7150305)
chr4 (541-573)||(11255283-11255315)
chr4 (541-573)||(35403021-35403053)
chr4 (528-572)||(43520178-43520221)
chr4 (541-573)||(48646098-48646130)
chr4 (541-573)||(49523871-49523903)
chr4 (541-573)||(51012666-51012698)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (21-533)||(39455979-39456483)
chr2 (133-544)||(14388026-14388436)
chr2 (137-544)||(16763755-16764153)
chr2 (133-544)||(6798315-6798717)
chr2 (133-533)||(2767734-2768125)
chr2 (133-544)||(17697016-17697418)
chr2 (133-533)||(24206463-24206864)
chr2 (133-533)||(6784220-6784612)
chr2 (229-544)||(19907308-19907613)
chr2 (264-532)||(40561046-40561305)
chr2 (141-370)||(44708762-44708983)
chr2 (133-421)||(34401115-34401394)
chr2 (133-298)||(42518360-42518525)
chr2 (423-544)||(39663994-39664115)
chr2 (21-135)||(42517969-42518084)
chr2 (449-544)||(44708996-44709091)
chr2 (21-135)||(6798995-6799110)
chr2 (21-135)||(34400720-34400837)
chr2 (21-135)||(39663555-39663669)
chr2 (21-135)||(19907128-19907244)
chr2 (21-135)||(2768403-2768518)
chr2 (381-494)||(37021388-37021501)
chr2 (173-301)||(4047377-4047505)
chr2 (173-247)||(26581539-26581613)
chr2 (173-302)||(20941734-20941862)
chr2 (31-134)||(31474647-31474751)
chr2 (29-135)||(17697696-17697809)
chr2 (21-93)||(14387795-14387868)
chr2 (263-326)||(19581960-19582023)
chr2 (21-93)||(40561482-40561555)
chr2 (173-301)||(161432-161560)
chr2 (21-99)||(16764175-16764255)
chr2 (30-84)||(2577060-2577115)
chr2 (173-247)||(38149341-38149415)
chr2 (486-531)||(37646238-37646283)
chr2 (36-93)||(24206035-24206094)
chr2 (441-525)||(161216-161300)
chr2 (30-93)||(6783785-6783849)
chr2 (29-68)||(15373549-15373588)
chr2 (173-207)||(11022246-11022280)
chr2 (227-301)||(11313399-11313473)
chr2 (34-82)||(10715502-10715550)
chr2 (541-573)||(14388455-14388487)
chr2 (541-573)||(17696965-17696997)
chr2 (501-533)||(42518524-42518556)
chr2 (541-573)||(42518586-42518618)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (21-544)||(9059-9575)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (137-533)||(54899254-54899649)
chr3 (133-544)||(27898047-27898448)
chr3 (133-533)||(30599140-30599530)
chr3 (133-533)||(17516131-17516520)
chr3 (133-533)||(43765942-43766333)
chr3 (133-544)||(46198530-46198931)
chr3 (133-533)||(21349515-21349906)
chr3 (133-533)||(2377817-2378201)
chr3 (135-533)||(44275152-44275539)
chr3 (186-544)||(44795009-44795358)
chr3 (202-544)||(2225165-2225506)
chr3 (186-544)||(2661024-2661373)
chr3 (133-473)||(53188632-53188963)
chr3 (154-544)||(610404-610785)
chr3 (178-533)||(46113288-46113634)
chr3 (264-533)||(23292232-23292492)
chr3 (333-544)||(35904849-35905059)
chr3 (263-533)||(48829886-48830147)
chr3 (133-302)||(35904681-35904850)
chr3 (263-533)||(51685412-51685673)
chr3 (320-533)||(42280308-42280521)
chr3 (408-544)||(7884091-7884227)
chr3 (408-544)||(41978538-41978674)
chr3 (393-533)||(38192456-38192596)
chr3 (393-533)||(53093196-53093336)
chr3 (396-533)||(46609724-46609861)
chr3 (401-533)||(46309812-46309944)
chr3 (21-134)||(43766612-43766726)
chr3 (21-135)||(30598749-30598864)
chr3 (21-135)||(21350184-21350299)
chr3 (21-135)||(2378503-2378618)
chr3 (21-135)||(27897604-27897719)
chr3 (23-135)||(23291983-23292098)
chr3 (21-105)||(44268393-44268476)
chr3 (385-531)||(24845686-24845833)
chr3 (29-135)||(51685940-51686047)
chr3 (21-109)||(17516561-17516650)
chr3 (29-135)||(42282062-42282169)
chr3 (180-299)||(13466205-13466324)
chr3 (173-246)||(23876214-23876287)
chr3 (29-97)||(610816-610884)
chr3 (469-544)||(53190118-53190196)
chr3 (29-135)||(24846136-24846243)
chr3 (29-97)||(46113689-46113758)
chr3 (30-135)||(53093078-53093185)
chr3 (179-247)||(32843436-32843504)
chr3 (173-285)||(35862434-35862546)
chr3 (30-93)||(38193080-38193144)
chr3 (21-134)||(7883740-7883855)
chr3 (173-247)||(41945414-41945488)
chr3 (30-135)||(46609604-46609710)
chr3 (21-93)||(3150683-3150756)
chr3 (21-93)||(41978956-41979029)
chr3 (21-93)||(44795462-44795535)
chr3 (30-93)||(38192338-38192402)
chr3 (30-93)||(53093843-53093907)
chr3 (25-92)||(23876057-23876124)
chr3 (30-135)||(46309963-46310070)
chr3 (21-93)||(53188188-53188261)
chr3 (30-93)||(46309262-46309328)
chr3 (21-99)||(54899671-54899751)
chr3 (21-68)||(2661504-2661551)
chr3 (196-247)||(2976359-2976410)
chr3 (441-530)||(22219218-22219308)
chr3 (21-135)||(35904236-35904353)
chr3 (528-573)||(2660973-2661017)
chr3 (320-357)||(13466155-13466192)
chr3 (528-573)||(21349453-21349497)
chr3 (528-573)||(23292510-23292554)
chr3 (528-573)||(30599548-30599592)
chr3 (528-573)||(48830165-48830209)
chr3 (449-525)||(35862699-35862775)
chr3 (541-573)||(41978487-41978519)
chr3 (541-573)||(44275569-44275601)
chr3 (541-573)||(46198479-46198511)
chr3 (541-573)||(53190215-53190247)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (133-538)||(22154696-22155092)
chr7 (133-538)||(22210611-22211007)
chr7 (133-539)||(34775894-34776290)
chr7 (133-531)||(38473056-38473445)
chr7 (149-544)||(6604315-6604701)
chr7 (133-544)||(35692283-35692684)
chr7 (133-544)||(45360127-45360528)
chr7 (181-533)||(23905232-23905575)
chr7 (133-544)||(24227353-24227755)
chr7 (133-533)||(46438441-46438833)
chr7 (186-544)||(27665031-27665380)
chr7 (186-544)||(29995501-29995850)
chr7 (133-539)||(47385139-47385539)
chr7 (229-544)||(39858271-39858576)
chr7 (264-533)||(37114591-37114851)
chr7 (133-316)||(69133-69316)
chr7 (320-544)||(13168873-13169096)
chr7 (263-533)||(38550316-38550593)
chr7 (133-326)||(48310947-48311140)
chr7 (21-176)||(23905009-23905165)
chr7 (325-532)||(37792150-37792356)
chr7 (393-544)||(35402544-35402694)
chr7 (385-544)||(48851499-48851657)
chr7 (401-503)||(69032-69134)
chr7 (21-135)||(22155420-22155536)
chr7 (21-135)||(22211335-22211451)
chr7 (21-135)||(38472663-38472779)
chr7 (21-132)||(24226966-24227078)
chr7 (21-135)||(6604959-6605074)
chr7 (21-135)||(47384696-47384811)
chr7 (29-135)||(48850967-48851075)
chr7 (21-131)||(37114342-37114453)
chr7 (21-135)||(45360856-45360971)
chr7 (21-135)||(39858091-39858207)
chr7 (21-135)||(46438047-46438163)
chr7 (29-135)||(38549941-38550048)
chr7 (21-135)||(34775453-34775567)
chr7 (21-135)||(13169226-13169344)
chr7 (381-494)||(20478921-20479034)
chr7 (173-301)||(11683621-11683749)
chr7 (21-99)||(35691839-35691918)
chr7 (173-247)||(34691873-34691947)
chr7 (21-135)||(27664854-27664970)
chr7 (173-237)||(32840551-32840615)
chr7 (30-135)||(77577-77684)
chr7 (385-531)||(48310767-48310914)
chr7 (173-247)||(4321791-4321865)
chr7 (196-299)||(23168648-23168751)
chr7 (185-256)||(34784575-34784646)
chr7 (21-135)||(29995323-29995440)
chr7 (173-301)||(7402914-7403042)
chr7 (20-95)||(37792054-37792130)
chr7 (179-259)||(40360948-40361028)
chr7 (30-135)||(35403146-35403253)
chr7 (499-544)||(66870-66915)
chr7 (30-135)||(35402425-35402533)
chr7 (441-525)||(13035621-13035705)
chr7 (174-247)||(13035937-13036010)
chr7 (173-246)||(48302864-48302936)
chr7 (29-68)||(8421806-8421845)
chr7 (229-268)||(13169123-13169162)
chr7 (29-68)||(35342816-35342855)
chr7 (387-420)||(63302-63335)
chr7 (528-573)||(6604264-6604308)
chr7 (528-573)||(23905593-23905637)
chr7 (528-573)||(24227762-24227806)
chr7 (528-573)||(29995857-29995901)
chr7 (528-573)||(37114869-37114913)
chr7 (541-573)||(22154639-22154671)
chr7 (541-573)||(22210554-22210586)
chr7 (541-573)||(35692703-35692735)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (133-544)||(21841791-21842193)
chr5 (136-544)||(2180564-2180960)
chr5 (186-533)||(2853253-2853591)
chr5 (133-525)||(42472415-42472798)
chr5 (229-539)||(12800723-12801023)
chr5 (229-539)||(12737900-12738200)
chr5 (243-533)||(30464679-30464960)
chr5 (264-533)||(8540472-8540732)
chr5 (264-533)||(32134897-32135157)
chr5 (134-363)||(28821364-28821585)
chr5 (382-544)||(28821170-28821332)
chr5 (408-544)||(7268635-7268771)
chr5 (133-280)||(17575700-17575848)
chr5 (133-280)||(17577011-17577159)
chr5 (133-280)||(17574980-17575128)
chr5 (133-284)||(18624247-18624398)
chr5 (21-135)||(34328393-34328508)
chr5 (448-544)||(24540429-24540525)
chr5 (21-135)||(32134648-32134763)
chr5 (21-132)||(8540867-8540982)
chr5 (320-509)||(41494553-41494741)
chr5 (21-135)||(12738264-12738379)
chr5 (21-135)||(12801087-12801202)
chr5 (29-133)||(18623865-18623970)
chr5 (381-494)||(40781430-40781543)
chr5 (21-133)||(30464355-30464467)
chr5 (29-135)||(41494254-41494361)
chr5 (382-494)||(29620912-29621024)
chr5 (21-103)||(2181289-2181372)
chr5 (182-247)||(1344283-1344348)
chr5 (179-245)||(28036377-28036443)
chr5 (21-135)||(7269016-7269132)
chr5 (21-134)||(21842520-21842635)
chr5 (30-135)||(17576175-17576281)
chr5 (173-247)||(18341214-18341288)
chr5 (21-135)||(24540208-24540325)
chr5 (173-299)||(1343735-1343861)
chr5 (30-93)||(42471979-42472044)
chr5 (30-135)||(17577486-17577593)
chr5 (30-84)||(40781791-40781846)
chr5 (21-135)||(17575455-17575571)
chr5 (185-256)||(27349968-27350039)
chr5 (528-573)||(8540410-8540454)
chr5 (528-573)||(30464978-30465022)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (133-544)||(107518-107919)
scaffold0004 (29-135)||(107084-107191)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (135-533)||(363-746)
scaffold0345 (21-128)||(1083-1191)
[»] scaffold0058 (5 HSPs)
scaffold0058 (381-544)||(4094-4257)
scaffold0058 (381-544)||(5266-5429)
scaffold0058 (21-91)||(6808-6880)
scaffold0058 (545-573)||(4043-4071)
scaffold0058 (545-573)||(5215-5243)
[»] scaffold0920 (2 HSPs)
scaffold0920 (133-326)||(1452-1643)
scaffold0920 (381-446)||(1686-1751)
[»] scaffold1712 (1 HSPs)
scaffold1712 (30-67)||(1413-1450)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 488; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 573
Target Start/End: Original strand, 25277171 - 25277738
Alignment:
Q  5 ttcctcattaagggctatgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277171 ttcctcattaagggctatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattgtttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgt 25277270  T
Q  105 tgaagattcgatgtttagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgat 204  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277271 tgaagattcggtgttcagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgat 25277370  T
Q  205 ggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtc 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277371 ggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtc 25277470  T
Q  305 aagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaatt 404  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||    
T  25277471 aagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttatgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtccttcaatt 25277569  T
Q  405 atatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatac 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25277570 atatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatac 25277669  T
Q  505 atttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277670 atttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 25277738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 37345656 - 37345097
Alignment:
Q  5 ttcctcattaagggctatgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345656 ttcctcattaagggctatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattgtttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgt 37345557  T
Q  105 tgaagattcgatgtttagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgat 204  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345556 tgaagattcggtgttcataaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatatgggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgat 37345457  T
Q  205 ggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtc 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37345456 ggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtc 37345357  T
Q  305 aagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaatt 404  Q
    ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||    
T  37345356 aagtccat--------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttatgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtccttcaatt 37345266  T
Q  405 atatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatac 504  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37345265 atatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatac 37345166  T
Q  505 atttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345165 atttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 37345097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 573
Target Start/End: Original strand, 45045323 - 45045866
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgttt 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45045323 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttatttaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgttc 45045422  T
Q  121 agaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45045423 agaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcaaagaagaggtttggagggcaagcttgatggataaagttgattgt 45045522  T
Q  221 gtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgtt 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  45045523 gtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtcca--------t 45045614  T
Q  321 gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatca 420  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045615 gtaatgttgtaatgaaaagaagttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatca 45045713  T
Q  421 tatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt 520  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45045714 tatcgatcttcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagt 45045813  T
Q  521 aaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045814 aaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 45045866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 26224477 - 26224887
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26224477 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagacaaaagataggggaagagaagaggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 26224576  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26224577 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtac 26224676  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |        |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26224677 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctca 26224775  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224776 aattagtgaaaagaccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 26224875  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  26224876 acagacactttg 26224887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27088478 - 27088078
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27088478 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgttaggggcagagaagaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 27088379  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  27088378 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccat--------gtaatgttgtaa 27088287  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27088286 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc---aaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctca 27088190  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088189 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 27088090  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  27088089 acagacactttg 27088078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Original strand, 33600076 - 33600475
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  33600076 tggaagaaatgcaaggttgatagagaaggcaaatgataggggcagggaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaaggcag 33600175  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33600176 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaaagttgtaa 33600275  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| || || |        ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33600276 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatc-aacctttctgtcaaaaaaaattcaatcaaatcggtccttgaattatatgcatatccatcctttcgatcctca 33600374  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33600375 aattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 33600474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 149 - 544
Target Start/End: Original strand, 6817664 - 6818050
Alignment:
Q  149 ttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaaga 248  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6817664 ttgatggagaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaagaagtgagcttaggttgattaaga 6817763  T
Q  249 tattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtca 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||        | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6817764 tattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtaca--------tataatgttgtaatgaaaagaggttgtca 6817855  T
Q  349 atgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatc 448  Q
    ||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6817856 atgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatacc 6817954  T
Q  449 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6817955 atcaaataggtccttggtttttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtgaaagacagacactttg 6818050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 133 - 525
Target Start/End: Original strand, 50555035 - 50555417
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50555035 tggaagaaatgcaagattgatggagaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 50555134  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  50555135 tttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgatggagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 50555225  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50555226 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaatcattctgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 50555324  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50555325 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttactgaacaaggtaaaaa 50555417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15105638 - 15105247
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  15105638 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgatagtgtcagagaagaggtttggatgacaaggttgatggatgaagttgattgtgtaggaaatgag 15105539  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||      |||||||||||||    
T  15105538 cttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtc--tg------tgtaatgttgtaa 15105447  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||          |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15105446 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatccaaccattctg-ttaagaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcccca 15105348  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15105347 aattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 15105248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 186 - 533
Target Start/End: Original strand, 46582573 - 46582911
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582573 tttggaggacaaggttgatggataaacttgattttgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaa 46582672  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |        |||||    
T  46582673 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtat--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatat-ttcaa 46582763  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582764 tcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 46582863  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46582864 tgtgatccttggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 46582911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 264 - 533
Target Start/End: Original strand, 51895228 - 51895488
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51895228 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattatgtcatgtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 51895319  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
    | ||||| |        |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895320 ctttatgtcaaaaaaa-ttcaatcaaattggcccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 51895418  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895419 gaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 51895488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 243 - 533
Target Start/End: Original strand, 31237556 - 31237829
Alignment:
Q  243 ttaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagagg 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||                ||||||||||    
T  31237556 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtaccaagtccatgtaa----------------tgaaaagagg 31237639  T
Q  343 ttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaa 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  31237640 ttgtcaatgaatgaatcaaacccttctatcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccattatatcgatcctcaaattagtgat 31237738  T
Q  443 aatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237739 aataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 31237829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 264 - 533
Target Start/End: Original strand, 3012516 - 3012776
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||        |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3012516 tttgtttgattgagttatttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtgatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaac 3012607  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
    | || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3012608 ctttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcctt 3012706  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3012707 ggattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 3012776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 2870612 - 2870400
Alignment:
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatc 419  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2870612 tgtaatgttgtaacgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatc 2870514  T
Q  420 atatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 519  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870513 atatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 2870414  T
Q  520 taaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||    
T  2870413 taaaaagtaaaaga 2870400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Original strand, 52642698 - 52642959
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  52642698 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgcattgtgccaagtc--tgt------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaa 52642789  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| || |        |||||||||||||||| ||| |||  |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52642790 cccttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtctttctattgcatgtctatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtcct 52642888  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52642889 tgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 52642959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Original strand, 4855164 - 4855300
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4855164 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtaatccttggtgcatacatt 4855263  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4855264 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacaatttg 4855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Original strand, 34777335 - 34777471
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777335 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 34777434  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34777435 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 34777471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Original strand, 8168514 - 8168654
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  8168514 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatc 8168613  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8168614 ctttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaaga 8168654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37087421 - 37087316
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37087421 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 37087322  T
Q  233 cttagg 238  Q
    ||||||    
T  37087321 cttagg 37087316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 51894979 - 51895094
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51894979 atgtcaatgttcttccccaattcagaaaacttaaaaccctaacttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 51895078  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  51895079 tagaaatgatgggtgg 51895094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 6817291 - 6817406
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6817291 atgtcaatgttcttccccaattcaaaagacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgta 6817390  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  6817391 tagaaatgatgggtgg 6817406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37087814 - 37087699
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37087814 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttgttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgggcattgttgaagattcggtgtt 37087715  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  37087714 cagaaatgatgggtgg 37087699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 52642324 - 52642431
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52642324 gttcttcctcaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagatttgatgtttagaaatg 52642423  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  52642424 atgggtgg 52642431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15106020 - 15105917
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15106020 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagatttggtgtttagaaatg 15105921  T
Q  128 atgg 131  Q
    ||||    
T  15105920 atgg 15105917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Original strand, 3012267 - 3012381
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3012267 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgatttaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagactcggtgtt 3012366  T
Q  120 tagaaatgatgggtg 134  Q
     | ||||||||||||    
T  3012367 caaaaatgatgggtg 3012381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 31237231 - 31237344
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31237231 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgtt 31237330  T
Q  120 tagaaatgatgggt 133  Q
     | |||||||||||    
T  31237331 caaaaatgatgggt 31237344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2870753 - 2870639
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2870753 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaa-cttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaataagtggtcattgttgaagattcggtgtt 2870655  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  2870654 cagaaatgatgggtgg 2870639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Original strand, 9120813 - 9120926
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  9120813 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 9120912  T
Q  481 atcactgtgatcct 494  Q
    |||| |||||||||    
T  9120913 atcaatgtgatcct 9120926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 1443513 - 1443400
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  1443513 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 1443414  T
Q  481 atcactgtgatcct 494  Q
    |||| ||| |||||    
T  1443413 atcaatgtaatcct 1443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Original strand, 47012213 - 47012326
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  47012213 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatcaatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 47012312  T
Q  481 atcactgtgatcct 494  Q
    |||| |||||||||    
T  47012313 atcaatgtgatcct 47012326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 50554592 - 50554701
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  50554592 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaatttgaaattcaaaaactagtggtcattgttgaagattcggtgtt 50554691  T
Q  120 tagaaatgat 129  Q
     | |||||||    
T  50554692 cataaatgat 50554701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 42558842 - 42558916
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42558842 ggcaatgaagaggtttggagggcatggttgatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 42558916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8169202 - 8169095
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  8169202 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaattg 8169103  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  8169102 atgggtgg 8169095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 46582405 - 46582512
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||| |||| ||    
T  46582405 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctaccttgtagattcggtgttcagaattg 46582504  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  46582505 atgggtgg 46582512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 4854809 - 4854882
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  4854809 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 4854882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 27088922 - 27088849
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  27088922 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 27088849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 34776981 - 34777054
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  34776981 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 34777054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 8168396 - 8168460
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8168396 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 8168460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 247
Target Start/End: Original strand, 3369962 - 3370035
Alignment:
Q  174 gcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  3369962 gcaatgaagaggtttggaggacaaggttgatggacaaagttgactacgtagggagtgagctttggttgattaag 3370035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 26224042 - 26224106
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  26224042 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttttattaaattcgaaattcataaatca 26224106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1443816 - 1443761
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaatt 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1443816 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaatt 1443761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 33599630 - 33599704
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  33599630 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctgattttttttgattaaattcgaaattcataaatca 33599704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 47011910 - 47011965
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaatt 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  47011910 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaatt 47011965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20944724 - 20944660
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  20944724 ttcttccccaattcaacaaacttagaaccctaatttttttgattaaatttgaaattcataaatca 20944660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 27952201 - 27952162
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27952201 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttt 27952162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5784245 - 5784211
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatgga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5784245 ggcaatgaagaggtttggagggcaaggttgatgga 5784211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2870382 - 2870338
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870382 aaaagacagacattttc-ataccatcataagtcatatatttgatgt 2870338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 3012794 - 3012838
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3012794 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 3012838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Original strand, 42558337 - 42558398
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaa 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  42558337 gttctttcccaattctaaaaacttcaaaccctaattcttttgattgaatccaaaatccaaaa 42558398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 441 - 525
Target Start/End: Original strand, 3370338 - 3370422
Alignment:
Q  441 aaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||    
T  3370338 aaaataccatcaaataagtctttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcataataaagtaaaaa 3370422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 4855319 - 4855351
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4855319 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 4855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 34777490 - 34777522
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777490 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 34777522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 32518191 - 32517632
Alignment:
Q  5 ttcctcattaagggctatgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32518191 ttcctcattaagggctatgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattgtttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgt 32518092  T
Q  105 tgaagattcgatgtttagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgat 204  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32518091 tgaagattcggtgttcataaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatatgggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgat 32517992  T
Q  205 ggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtc 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32517991 ggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtc 32517892  T
Q  305 aagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaatt 404  Q
    ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||    
T  32517891 aagtccat--------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttatgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtccttcaatt 32517801  T
Q  405 atatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatac 504  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32517800 atatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatac 32517701  T
Q  505 atttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517700 atttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 32517632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18644473 - 18644063
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  18644473 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaatgctaggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgagtaggaagtgaa 18644374  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  18644373 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgttgtaa 18644274  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  18644273 tgaaaagagattgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccattatttcgatcatca 18644175  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644174 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 18644075  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  18644074 acagacactttg 18644063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 7371915 - 7372316
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7371915 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataaggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 7372014  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  7372015 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatggtattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 7372106  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |         |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7372107 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaata-tcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctca 7372205  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7372206 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatcga-atcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaag 7372304  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  7372305 acagacactttg 7372316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 32438014 - 32438414
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32438014 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagc-aaatgctaggggcaaagaag-ggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 32438111  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  32438112 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgcattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 32438203  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32438204 tgaaaagagattgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcatattggtcctttaattatatgcatatccatcatttcgatcctca 32438302  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438303 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactatgatccttggtccatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 32438402  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  32438403 acagacactttg 32438414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 186 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20524526 - 20524177
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20524526 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattatgatattgatatgagtattttgttttattgagttgtttaa 20524427  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||          |||||    
T  20524426 aatgctattgtattgtgccaagttcatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgt-aaaaaaaattcaa 20524336  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524335 tcaaattggtccttgaattatatatgtatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 20524236  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20524235 tatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 20524177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 135 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 11356385 - 11356010
Alignment:
Q  135 gaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagct 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             |||||| ||||| ||||    
T  11356385 gaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgat-------------tgtgtaggaagtcagct 11356299  T
Q  235 taggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatg 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11356298 taggttgattacgatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgttgtaatg 11356199  T
Q  335 aaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaa 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |        ||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||    
T  11356198 aaaagaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtc-aaaaagtttcaatcaaattggtccttgaattatatg---------catatcgatcctcaaa 11356109  T
Q  435 ttagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356108 ttagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 11356010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 7050821 - 7050560
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||    
T  7050821 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtc--tgt------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatggatgaatttaa 7050730  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| || |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  7050729 cccttttgtcaaaaaaa-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcat 7050631  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050630 tgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 7050560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 133 - 494
Target Start/End: Original strand, 33267810 - 33268155
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||| || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33267810 tggaagaaatgcaaggttgatgaagaaggcaaaggatagtggcagagtataggtttgg-ggtcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 33267908  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||        |||||||||||||||    
T  33267909 cttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgaatgagctgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtc-------tgttgtaatgttgtaa 33268001  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |         ||||||  |||||||||        ||||  ||||||||||||||||||  |    
T  33268002 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttct-ctcaaaaaatttcaattgaattggtcc-------gtatgtctatccatcatatcgatcccta 33268093  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 494  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33268094 aattattgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaatgtgatcct 33268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 263 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 10569462 - 10569192
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  10569462 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaa 10569371  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| |  |        ||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10569370 cccttctatcaaaaaat-ttcaatcaaattgatccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcct 10569272  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  10569271 tgaatttt--caacatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaaaacagacactttg 10569192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 137 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9399306 - 9399135
Alignment:
Q  137 agaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagctta 236  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9399306 agaaaagcaaggttgatggagaagccaaaggatagtggcagagaagaggtttggaaggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaaatgagctta 9399207  T
Q  237 ggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagt 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  9399206 ggttgattaagatattgataggagtgatttgtttgtttgagttgtttagaatgttattttattgtgccaagt 9399135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 263 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6902212 - 6901999
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  6902212 ttttgtgtgattgagttgtttaaaaagttattgtattgtgtcaagtc--tgc------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaa 6902121  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| || |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6902120 cccttctgtcaaaaaaa-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtcct 6902022  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  6902021 tgaattttcacaacatatatcac 6901999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 20525012 - 20524897
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20525012 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcagtgtt 20524913  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  20524912 cagaaatgatgggtgg 20524897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11356830 - 11356722
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11356830 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaatttaagaccctaatttttttgattcaattcaaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaagattcggtgtt 11356731  T
Q  120 tagaaatga 128  Q
     ||||||||    
T  11356730 cagaaatga 11356722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Original strand, 33277200 - 33277306
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||    
T  33277200 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaatttgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagatttggtgttcataaatg 33277299  T
Q  128 atgggtg 134  Q
    |||||||    
T  33277300 atgggtg 33277306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6902586 - 6902479
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||    
T  6902586 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattaaaaaatcagtggtcattgttgaagatttggtgttcataaatg 6902487  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  6902486 atgggtgg 6902479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 33267435 - 33267547
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    ||||||| |||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  33267435 atgtcaaagttcttccccaatt---aaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcaatggtcattgttgaagatttggtgtt 33267531  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  33267532 cagaaatgatgggtgg 33267547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 484
Target Start/End: Original strand, 32455022 - 32455125
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  32455022 ttcaattacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 32455121  T
Q  481 atca 484  Q
    ||||    
T  32455122 atca 32455125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9399710 - 9399638
Alignment:
Q  63 ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatgatgggtgg 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  9399710 ttttttgattcaatttgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagatttggtgttcagaaatgatgggtgg 9399638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 479 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 6900341 - 6900287
Alignment:
Q  479 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6900341 atatcactgtgatccttggttcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 6900287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 135
Target Start/End: Original strand, 7371584 - 7371638
Alignment:
Q  81 aattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatgatgggtgg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7371584 aattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgttcagaaatgatgggtgg 7371638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 13611091 - 13611208
Alignment:
Q  20 tatgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatg 117  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| ||    
T  13611091 tatgtcgaagttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtg 13611190  T
Q  118 tttagaaatgatgggtgg 135  Q
    || |||| ||||||||||    
T  13611191 ttcagaattgatgggtgg 13611208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Original strand, 32437573 - 32437688
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  32437573 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 32437672  T
Q  119 ttagaaatgatgggtg 134  Q
    | |||| |||||||||    
T  32437673 tcagaattgatgggtg 32437688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17935616 - 17935548
Alignment:
Q  179 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||    
T  17935616 gaagagttttggagggtaaggttgagggacaaagttgactgagtaggatgtgagcttaggttgattaag 17935548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 7371544 - 7371587
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt 64  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7371544 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatt 7371587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7050542 - 7050498
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050542 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 7050498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 7372323 - 7372367
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372323 aaaagacagacattttc-ataccatcataagtcatatatttgatgt 7372367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 20524170 - 20524126
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524170 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 20524126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20524619 - 20524587
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaa 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20524619 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaa 20524587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 32438433 - 32438465
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438433 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 32438465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5037741 - 5037198
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5037741 atgtcaatgttcttcctcaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttaaagattcggtgtt 5037642  T
Q  120 tagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattg 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5037641 cagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgatggataagccaaatgataggggaagagaagaggtttggaaggcaaggttgatcgataaagttgattg 5037542  T
Q  220 tgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgt 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  5037541 tgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccat------- 5037449  T
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatc 419  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5037448 -gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtc-aaagaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatc 5037351  T
Q  420 atatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5037350 atatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaag 5037251  T
Q  520 taaaaagtaaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037250 taaaaagtaaaagacagaca-tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 5037198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 41041517 - 41041918
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41041517 tggaagaaatgcaaggttgatggagaaggcaaaggatagggggagagaagaggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 41041616  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        |||||||||||||    
T  41041617 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattttgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 41041708  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |        ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41041709 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctgtc--caaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctca 41041806  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041807 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagataccattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 41041906  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  41041907 acagacactttg 41041918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 40338605 - 40339014
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagt--- 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       
T  40338605 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccagaggatacggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagttag 40338704  T
Q  230 -----gagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaa 324  Q
         ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||    
T  40338705 gaagtgagcttaggctgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcc---------tgtaa 40338795  T
Q  325 tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||    
T  40338796 tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcgtatc 40338894  T
Q  425 gatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaa 524  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40338895 gatcctcaaattagtgaaaatacaatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgttgcatacatttgctgaacaaagtaaaa 40338994  T
Q  525 agtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  40338995 agtaaaagacagacactttg 40339014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 186 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 27692305 - 27691967
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27692305 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttaaa 27692206  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |        |||||    
T  27692205 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatat-ttcaa 27692115  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692114 tcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 27692015  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692014 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 27691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 186 - 544
Target Start/End: Original strand, 33707795 - 33708144
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33707795 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaa 33707894  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |        |||||    
T  33707895 aatgatattgtattgtgccaagtctatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatat-ttcaa 33707985  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33707986 tcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 33708085  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33708086 tgtgttccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttg 33708144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 29238386 - 29237995
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  29238386 tggaagaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttgaagggcaaggttggtggataaagttgattgtgtaggaagtaag 29238287  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  29238286 cttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttggttgagttatttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccat--------gtaatgttgtaa 29238195  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  29238194 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctca 29238096  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29238095 aattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 29237996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15307484 - 15307094
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15307484 tggaagaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 15307385  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  15307384 cttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccat--------gtaatgttgtaa 15307293  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  15307292 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctta 15307194  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15307193 aattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaag 15307095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15487853 - 15487463
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15487853 tggaagaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 15487754  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  15487753 cttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccat--------gtaatgttgtaa 15487662  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  15487661 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctta 15487563  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15487562 aattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaag 15487464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 133 - 525
Target Start/End: Original strand, 27405075 - 27405458
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  27405075 tggaagaaatgcaaggttgatcaagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaagtgaa 27405174  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  27405175 cttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 27405266  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  27405267 tgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctta 27405365  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  27405366 aattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagaaaaaa 27405458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 264 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 22273328 - 22273060
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22273328 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatcaaac 22273229  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
    | || |  |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22273228 ctttctatcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcgtatcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcctt 22273130  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273129 gaattttcacaacagatatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 22273060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 154 - 533
Target Start/End: Original strand, 3152484 - 3152862
Alignment:
Q  154 ggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattg 253  Q
    |||||||||||| ||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3152484 ggagaagccaaaggatagtgttagagaagaggcttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtataggaagtgagcttaggttgattaaaatattg 3152583  T
Q  254 ataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaa 353  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3152584 ataggagtaatttgtttgattaagtcgtttaaaatgttattttattgtgtcaagtgtgtgtaatgttgtaatgttataatgaaaagaagttgtcaatgaa 3152683  T
Q  354 tgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaa 453  Q
    ||||   ||||||| || |        ||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||| ||  |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  3152684 tgaattcaacccttctgtc-aaaaaaattcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcacattcatccccaaattagtgaaattaccatcaa 3152782  T
Q  454 ataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||  || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3152783 atcagttcttgaattttcacaacataaatcaatgtgatccttggtgcatacatctactgaacaaagtaaaaagtaaaaga 3152862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 264 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 42942855 - 42942595
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42942855 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 42942764  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
    | || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42942763 ctttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattattgaaaataccatcaaataggtcctt 42942665  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42942664 gaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaaga 42942595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Original strand, 26239504 - 26239765
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  26239504 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtatcaagtc--tgt------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaa 26239595  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| || |        ||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  26239596 cccttctgtcaaaaaat-ttcaatccaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcat 26239694  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26239695 tgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctcaacaaagtaaaaagtaaaaga 26239765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 514
Target Start/End: Original strand, 13485112 - 13485417
Alignment:
Q  176 aaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattg 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  13485112 aaagaaaaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagcgaacttatgttgattaagatattgatatgagtattttattcgattg 13485211  T
Q  276 agttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnn 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |       
T  13485212 agttgtttaaaatgctattgtattgtaccaagtcca--------tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaa 13485303  T
Q  376 nnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaa 475  Q
            |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||                    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13485304 aaa-----aatcaaattggtccttgaattatgtacatatccatcatatcga--------------------tcatcaaataggtccttcaattttcacaa 13485378  T
Q  476 cagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaa 514  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13485379 cagatatcactgtgatccttgaggcatacatttgctgaa 13485417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 263 - 535
Target Start/End: Original strand, 41824733 - 41824996
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |  |||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  41824733 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagcc--tgt------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaa 41824824  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| || |        |||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41824825 cccttctgtcaaaaaaa-ttcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtcct 41824923  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagata 535  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824924 tgaattttcacaacatatatcaccgtgatgcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagata 41824996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 326 - 544
Target Start/End: Original strand, 9672292 - 9672509
Alignment:
Q  326 gttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcg 425  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||    
T  9672292 gttgtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatccaacccttctgtcgaaaaaa-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgtatcg 9672390  T
Q  426 atcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9672391 atccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaactaaaaa 9672490  T
Q  526 gtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  9672491 gtaaaagacagacactttg 9672509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Original strand, 8609005 - 8609141
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609005 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 8609104  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8609105 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 8609141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Original strand, 13107571 - 13107707
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107571 tgcatatccatcatttcgattctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 13107670  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13107671 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 13107707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 408 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38548153 - 38548028
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548153 tgcatatccatcattttgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 38548054  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38548053 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 38548028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Original strand, 7744193 - 7744454
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||    
T  7744193 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtc--tgta------taatgttgtaatgaaaagaggctgtcaatgaatgaatttaa 7744284  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| || |        ||||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  7744285 cccttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaacaccatcaaataagtcct 7744383  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||||||||||| || || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7744384 tgaattttcacatcatatttcacttttattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 7744454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 35510357 - 35510217
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||    
T  35510357 ggtccttaaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtggtc 35510258  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35510257 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 35510217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 13283317 - 13283186
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283317 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatacgatcaaataggtccttgaattttcac-----atatcactgtgatccttggtgcatacatt 13283223  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13283222 tgctcaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 13283186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Original strand, 33761642 - 33761782
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  33761642 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatc 33761741  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33761742 ctttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaaga 33761782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 394 - 533
Target Start/End: Original strand, 600809 - 600948
Alignment:
Q  394 gtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 493  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  600809 gtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcc 600908  T
Q  494 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  600909 tttgtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaaga 600948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22273577 - 22273462
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22273577 atgtcaatgttcttccccaattcaagaaacttaaaatcctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 22273478  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     ||||||| |||||||    
T  22273477 cagaaatggtgggtgg 22273462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 41041124 - 41041239
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41041124 atgtcaatgttcttccccaattcaaataacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgttgtt 41041223  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||| ||||||    
T  41041224 cagaaatgacgggtgg 41041239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 13484922 - 13485041
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaa-----aattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcga 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13484922 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttttttaattcaatttgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgg 13485021  T
Q  116 tgtttagaaatgatgggtgg 135  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  13485022 tgttcagaaatgatgggtgg 13485041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 41824352 - 41824467
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41824352 atgtcaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatgagtggtcattattgaagatttgatgtt 41824451  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     | |||||||||||||    
T  41824452 cataaatgatgggtgg 41824467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 530
Target Start/End: Original strand, 11720354 - 11720697
Alignment:
Q  179 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagt 278  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||| || |||    
T  11720354 gaagaggtttgaaggacaaggttgatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttaataggagtaatttgtttgtttaagt 11720453  T
Q  279 tgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnn 378  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  || ||  ||      |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||   |||| || || |          
T  11720454 tgtttaacatgctactgtattgtgctaattc--tg------tgtaatattgtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaatgcaaccattttgtc-aaaat 11720544  T
Q  379 nnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtg-aaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaaca 477  Q
      ||| ||||||||||||||| |||| | ||  |||  |||| |||||| |  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||   || |    
T  11720545 ctttccatcaaattggtccttaaattgtttgtctatatatcaaatcgattcctacattagtgaaaaatatcatcaaataagtccttgaagtttttaaaaa 11720644  T
Q  478 gatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 530  Q
     ||  || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  11720645 tatgacaatgtgatccttggtgcatatatgtgttgaacaaagtaaaaagtaaa 11720697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 26239128 - 26239237
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg---attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  26239128 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttttattcaattcaaaattaaaaaattagtggtcattgttgaagatttggtgttcagaaa 26239227  T
Q  126 tgatgggtgg 135  Q
    ||||||||||    
T  26239228 tgatgggtgg 26239237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42943103 - 42942992
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  42943103 atgtcaatgttcttctccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcgttgttaaagattcagtgtt 42943004  T
Q  120 tagaaatgatgg 131  Q
     | |||||||||    
T  42943003 caaaaatgatgg 42942992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 301
Target Start/End: Original strand, 12515887 - 12516006
Alignment:
Q  182 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgt 281  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | || |||    || |||| ||| ||||||| |    
T  12515887 gaggtttggagggaaatgttgatggacaaagttgattgtatgggaagtgagcttaggttgattaagtttttaatagtcataatttgcttgtttgagtttt 12515986  T
Q  282 ttaaaatgctattgtattgt 301  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  12515987 ttaacatgctattgtattgt 12516006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 8608650 - 8608766
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  8608650 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgcattgtagattcggtgt 8608749  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  8608750 tcagaattgatgggtgg 8608766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 27692482 - 27692366
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  27692482 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 27692383  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  27692382 tcagaattgatgggtgg 27692366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 33707618 - 33707734
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  33707618 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 33707717  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  33707718 tcagaattgatgggtgg 33707734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 40338225 - 40338333
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||      |||||||||||||||| | ||||    
T  40338225 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaatttaaaaccctaatttttttgatttaattcgaaattcaaaaa------gtcattgttgaagatttggtgtt 40338318  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     || ||||||||||||    
T  40338319 cag-aatgatgggtgg 40338333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 33761524 - 33761631
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  33761524 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaattg 33761623  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  33761624 atgggtgg 33761631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33762351 - 33762244
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  33762351 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttttattaaattcaaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaattg 33762252  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  33762251 atgggtgg 33762244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 28432930 - 28433004
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  28432930 ggcaatgacgaggtttggagggcaaggttgatgggcaaagttgattgtataagaagtgagctgagggtgattaag 28433004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 97
Target Start/End: Original strand, 3152384 - 3152453
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtgg 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3152384 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcttaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgg 3152453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 38548508 - 38548435
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  38548508 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 38548435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 13107216 - 13107332
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccct-aattttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  13107216 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctgatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 13107315  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  13107316 tcagaattgatgggtgg 13107332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 27404641 - 27404705
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  27404641 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 27404705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 35509669 - 35509733
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  35509669 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 35509733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29693989 - 29693932
Alignment:
Q  37 ccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29693989 ccaatttaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcaaaatccaaaaatca 29693932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 29238821 - 29238783
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 68  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29238821 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 29238783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Original strand, 10770934 - 10770982
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtg 221  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10770934 ggcaatgaagaggtttggaaggcaaggttgatggacaaagttgactgtg 10770982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13283652 - 13283556
Alignment:
Q  41 ttcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatgatgggtgg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  13283652 ttcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgtaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgttcagaattgatgggtgg 13283556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 27691949 - 27691905
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27691949 aaaagacagacattttc-ataccatcataagtcatatatttgatgt 27691905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 42942577 - 42942533
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942577 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 42942533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 15562807 - 15562871
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc 92  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  15562807 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaacctaatttttttgattgaatttgaaatccaaaaatc 15562871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 38547998 - 38547966
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38547998 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38547966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 49524436 - 49523922
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49524436 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-gtggtcattgttgaagattcggtgtt 49524338  T
Q  120 tagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattg 219  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524337 cagaaatgatggatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattg 49524238  T
Q  220 tgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgt 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||            
T  49524237 tgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatattattgtattgtgccaagttca-------- 49524146  T
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |        |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49524145 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtc-aaaatatttcaatcaaattggtcattgaattatatgcatatccatc 49524047  T
Q  420 atatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524046 atatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatataactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 49523947  T
Q  520 taaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  49523946 taaaaagtaaaagacagacactttg 49523922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 35402600 - 35403002
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35402600 tggaagaaatgcaaggttgatggagaaggcaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 35402699  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||         |||||||||||||    
T  35402700 cttaggttgattaagatattgataggagtattttttttgattgagttgtttaaaatgctattgtactgtgccaagtcc--------gtgtaatgttgtaa 35402791  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402792 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtc-aaaaaatttcaatcaaattggttcttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 35402890  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35402891 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaacg 35402990  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  35402991 acagacactttg 35403002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Original strand, 41760659 - 41761050
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41760659 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 41760758  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  41760759 cttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgttgaaaatgctattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 41760850  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41760851 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctggc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctca 41760949  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760950 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataccagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 41761049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 11254862 - 11255264
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11254862 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgttggataaagttaattgtgtaggaagtgag 11254961  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  11254962 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattatattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 11255053  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |        ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11255054 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtc-aaaaaatttcaatcaaattgatcgttgaattatatacatatccatcatatcgatcctca 11255152  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11255153 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattagtgcatacatttgctgagcaaagtaaaaagtaaaag 11255252  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  11255253 acagacactttg 11255264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 51013119 - 51012717
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  51013119 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtaag 51013020  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  51013019 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgggttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccat--------gtaatgttgtaa 51012928  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |        |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51012927 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctatc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcaatcctca 51012829  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012828 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttaaattttcacaacagatattactgcgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 51012729  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  51012728 acagacactttg 51012717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 186 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 43520577 - 43520228
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520577 tttggaggacaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 43520478  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |        |||||    
T  43520477 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatat-ttcaa 43520387  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43520386 tcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatagatccttgaattttcacaacagatatcac 43520287  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43520286 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 43520228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 2692218 - 2692620
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2692218 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagctaaaggatagtggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtcag 2692317  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||        |  |||||||||||||    
T  2692318 cttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattaagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagt--------ctctgtaatgttgtaa 2692409  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    | ||||||||||||||| |||||||   || |||| || |        ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||    
T  2692410 ttaaaagaggttgtcaacgaatgaattcaatccttctgtc-aaaaaatttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatcccca 2692508  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2692509 aattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggttcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaag 2692608  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  2692609 acagacactttg 2692620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 202 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 42981743 - 42981410
Alignment:
Q  202 gatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42981743 gatggataaagttgattgtgtaggaaatgagcttagattgattaagatattgataggagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgttattgtattgt 42981644  T
Q  302 gtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttca 401  Q
    | ||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |    
T  42981643 gccaagttcatgtat--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcgatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttga 42981553  T
Q  402 attatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgca 501  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42981552 attatatacatatctatcatatcgatccttaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaggtatcactgtgatccttggtgca 42981453  T
Q  502 tacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42981452 tacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 42981410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Original strand, 48645809 - 48646070
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||    
T  48645809 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatttaa 48645900  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| || |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48645901 cccttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcct 48645999  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48646000 tgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaaga 48646070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 54387203 - 54386942
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  54387203 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtc--tgt------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaa 54387112  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    ||||| || |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  54387111 cccttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttcgattgtatgtctctccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcct 54387013  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54387012 tgaattttcacaacatatatcactgcaattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 54386942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 242 - 525
Target Start/End: Original strand, 834096 - 834370
Alignment:
Q  242 attaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagag 341  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||| ||    
T  834096 attaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaaaag 834187  T
Q  342 gttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtga 441  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  834188 gttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaata-ttcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaa 834286  T
Q  442 aaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  834287 aaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagaaaaaa 834370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 41782463 - 41782312
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41782463 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgatttttcacaacagatatcaccgtgatc 41782364  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41782363 cttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 41782312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 133 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11641281 - 11641112
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11641281 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaaggatactagcaaagaagaggattggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgaa 11641182  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtg 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11641181 cttaggttgattaagatgttgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtg 11641112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 242 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5438863 - 5438593
Alignment:
Q  242 attaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagag 341  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||| ||    
T  5438863 attaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccat--------gtaatgttgtaatgaaaaaag 5438772  T
Q  342 gttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtga 441  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  5438771 gttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaa 5438673  T
Q  442 aaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    ||| | |||||||    |||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  5438672 aaaaaacatcaaa----tccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagaaaaaa 5438593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Original strand, 319845 - 319985
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  319845 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 319944  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  319945 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 319985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Original strand, 4172685 - 4172825
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4172685 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 4172784  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4172785 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 4172825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 33265526 - 33265386
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  33265526 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 33265427  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33265426 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 33265386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 43508169 - 43508029
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  43508169 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaagataccatcaaattggtccttgaattatcataacaaatatcaatgtgatc 43508070  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43508069 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 43508029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 35402160 - 35402275
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35402160 atgtcaatgttcttccccaattaaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 35402259  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  35402260 cagaaatgatgggtgg 35402275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 320 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11641068 - 11640853
Alignment:
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatcc--- 416  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||| || || |        ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||       
T  11641068 tgtaatgttgtaaagaaaagatgttgtcaatgaatgaattcaaccattctgtc-aaaatatttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatc 11640970  T
Q  417 --atcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaa 514  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11640969 atatcatatcgatctccaaattagtgaaaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaa 11640870  T
Q  515 caaagtaaaaagtaaaa 531  Q
    |||||||||||||||||    
T  11640869 caaagtaaaaagtaaaa 11640853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 132
Target Start/End: Original strand, 41760140 - 41760251
Alignment:
Q  22 tgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgttt 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41760140 tgtcaatgttcttccccaattcaaaaaaattaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgttc 41760239  T
Q  121 agaaatgatggg 132  Q
    ||||||||||||    
T  41760240 agaaatgatggg 41760251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 456 - 544
Target Start/End: Original strand, 52867414 - 52867502
Alignment:
Q  456 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  52867414 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttg 52867502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 240
Target Start/End: Original strand, 41760532 - 41760638
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41760532 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggg-agagaagaggtttggagggcaaggttgatgcataaagttgattgggtaggaagtgag 41760630  T
Q  233 cttaggtt 240  Q
    ||||||||    
T  41760631 cttaggtt 41760638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 11254470 - 11254585
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  11254470 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaactcaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaattagtggtcattgttgaagattcagtgtt 11254569  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     | |||||||||||||    
T  11254570 caaaaatgatgggtgg 11254585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 54387571 - 54387464
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  54387571 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattatttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagatttggtgttcagaaatg 54387472  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  54387471 atgggtgg 54387464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 42982172 - 42982065
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg--attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42982172 ttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtagtcattgttgaagattcggtgttcagaaatg 42982073  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    | ||||||    
T  42982072 acgggtgg 42982065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 449 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 11602562 - 11602478
Alignment:
Q  449 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11602562 atcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctaaacaaagtaaaaagtaaaaga 11602478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 2691785 - 2691891
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatga 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  2691785 ttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcaaagtccaaaaatcactggtaattgttgaagatttggtgttcagaaatga 2691884  T
Q  129 tgggtgg 135  Q
    |||||||    
T  2691885 tgggtgg 2691891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32653010 - 32652936
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  32653010 ggcaatgacgaggtttggagggcaaggttgatggaaaaagttgattgtataggaagtgagcttagggtgattaag 32652936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11641673 - 11641602
Alignment:
Q  36 cccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttg 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  11641673 cccaattcaaaaaacttaaaaccctaacttttttgattcaattcgaaatccaaaaatcagtggttattgttg 11641602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7150565 - 7150491
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7150565 ggcaatgaagaggtttagagggcaaggttgatggacaaagttgactatgtaagaagtgaggttaggttgattaag 7150491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4614655 - 4614587
Alignment:
Q  179 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4614655 gaagaggtttggagggcatggttgatggacaaagttgactatgtaggaagtgagcttaagttgattaag 4614587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43520754 - 43520638
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  43520754 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 43520655  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  43520654 tcagaattgatgggtgg 43520638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 51013563 - 51013447
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  51013563 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctaccttgtagattcggtgt 51013464  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  51013463 tcagaattgatgggtgg 51013447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 301
Target Start/End: Original strand, 28101463 - 28101606
Alignment:
Q  158 aagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataa 257  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||   ||||||     
T  28101463 aagcctaatgaaagtggaaatgaagaggtttggagggcaaggtcgatggacaaagttgactgtgtagaaaatgaacttaggttgattaagtatttgatag 28101562  T
Q  258 gagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgt 301  Q
       || | | | || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28101563 tcataatatatctgtttgagttgtttaacatgctattgtattgt 28101606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43508287 - 43508180
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  43508287 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaattg 43508188  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  43508187 atgggtgg 43508180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 833654 - 833718
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  833654 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 833718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5439305 - 5439241
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5439305 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 5439241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 319727 - 319834
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| ||||||||| ||    
T  319727 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttggttaaatttgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgtttagaattg 319826  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  319827 atgggtgg 319834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Original strand, 13449561 - 13449624
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagctta 236  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  13449561 ggcaatgatgaggtttggagggcaaagttgatggacaaagttgattgcatatgaagtgagctta 13449624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33265644 - 33265537
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  33265644 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaatttgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaattg 33265545  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  33265544 atgggtgg 33265537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4173374 - 4173309
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt--ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  4173374 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttttgattaaattcgaaattcataaatca 4173309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 33264838 - 33264902
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  33264838 ttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 33264902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 4172567 - 4172674
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  4172567 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttggttaaatttgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaattg 4172666  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  4172667 atgggtgg 4172674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27385632 - 27385571
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagct 234  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||    
T  27385632 ggcaatgaagaggtttggaagacaaggttgatggacaaagttgattgtataggaactgagct 27385571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 44793324 - 44793363
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44793324 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttt 44793363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 47942447 - 47942408
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47942447 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttt 47942408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 320534 - 320469
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  320534 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaacccaattttttttgattaaattcgaaattcataaatca 320469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 41761068 - 41761112
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41761068 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 41761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 42981403 - 42981359
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981403 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 42981359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 441 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 7150305 - 7150221
Alignment:
Q  441 aaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| |   ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  7150305 aaaataccatcaaataagtcctttaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggcgcatatatgtgtagaacaaagtaaaaa 7150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 11255283 - 11255315
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255283 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 11255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 35403021 - 35403053
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35403021 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 35403053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 528 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 43520221 - 43520178
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatg 572  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43520221 aaaagacagacattttc-ataccatcataagtcatatatttgatg 43520178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 48646098 - 48646130
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48646098 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 48646130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 49523903 - 49523871
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49523903 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 49523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 51012698 - 51012666
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012698 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 51012666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 39456483 - 39455979
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39456483 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctgatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 39456384  T
Q  120 tagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattg 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39456383 cagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgatggaaaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattg 39456284  T
Q  220 tgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgt 319  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||           
T  39456283 tgtaggaagtgagcttaggttaattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccat------- 39456191  T
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatc 419  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |        |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  39456190 -gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttttgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtcattgaattatatgcatattcatc 39456093  T
Q  420 atatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 519  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39456092 atattgattctcaaatgagtgaaaatatcatcaaataggtccttaaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 39455993  T
Q  520 taaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||    
T  39455992 taaaaagtaaaaga 39455979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 14388026 - 14388436
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14388026 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagctaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 14388125  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14388126 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaa 14388225  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||          ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14388226 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatg-taaaaaaacttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctca 14388324  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388325 aattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 14388424  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    ||||||| ||||    
T  14388425 atagacactttg 14388436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 137 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16764153 - 16763755
Alignment:
Q  137 agaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagctta 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16764153 agaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttagagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgaactta 16764054  T
Q  237 ggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaa 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||    
T  16764053 ggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccat--------gtaatgttgtaatgaa 16763962  T
Q  337 aagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatt 436  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |        |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16763961 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaatt 16763863  T
Q  437 agtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatag 536  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16763862 agtgaaaataccatcaaataggtcattgaatttacacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacagagtaaaaagtaaaagatag 16763763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 6798717 - 6798315
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6798717 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaagagatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgag 6798618  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  6798617 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccat--------gtaatgttgtaa 6798526  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |        |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  6798525 tgaaaagaggttgtcaatgaatgagtcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattgtatacatattcatcaaatcgatcctca 6798427  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6798426 aattagtgaaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgatgaacaaagtaaaaagtaaaag 6798327  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  6798326 acagacactttg 6798315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 2768125 - 2767734
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2768125 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtaag 2768026  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||        |||||||||||||    
T  2768025 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattaagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaaaccca--------tgtaatgttgtaa 2767934  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |        ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2767933 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaataaaacctttatgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctca 2767835  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2767834 atttagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacattttctgaacaaagtaaaaagtaaaag 2767735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 17697418 - 17697016
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17697418 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 17697319  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||        |||||||||| |    
T  17697318 cttaagttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgaattgtttaaaatgctattgtattatgccaagtccat--------gtaatgttgtta 17697227  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |        |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  17697226 tgaaaagaggttgtcaacgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaatttcaatcaaactggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctaa 17697128  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  17697127 aattggtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatacatcactatgatccttggtggatacatttgttgaacaaagtaaaaagtagaag 17697028  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  17697027 acagacactttg 17697016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Original strand, 24206463 - 24206864
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24206463 tggaaaaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattatgtaggaagtgag 24206562  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24206563 cttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgttctaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaa 24206662  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  24206663 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctta 24206761  T
Q  433 aattagt--gaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 530  Q
    |||||||   |||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206762 aattagtaaaaaaaaatcatcaaattggtccttgaattattataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 24206861  T
Q  531 aga 533  Q
    |||    
T  24206862 aga 24206864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Original strand, 6784220 - 6784612
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  6784220 tggaagaaatgcaaagttgatcgagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtttaggaagtgaa 6784319  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  6784320 cttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 6784411  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| | |    
T  6784412 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcttta 6784510  T
Q  433 aattagt-gaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 531  Q
    |||||||  |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6784511 aattagtaaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaattggatcctttggacatacatttgctgaacaaagtcaaaagtaaaa 6784610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 229 - 544
Target Start/End: Original strand, 19907308 - 19907613
Alignment:
Q  229 tgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgtt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||        ||||    
T  19907308 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaa--------tgtt 19907398  T
Q  329 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatc 428  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907399 gtaatgaaaagaggttatcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatc 19907497  T
Q  429 ctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagta 528  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19907498 ctcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaacta 19907597  T
Q  529 aaagatagacattttg 544  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  19907598 aaagacagacactttg 19907613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 264 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 40561305 - 40561046
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40561305 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatcaaac 40561214  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
    | || ||          |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40561213 ctttttgt-taaaaaatttcaattaaattggtccttaaattatatgcacatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcctt 40561115  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561114 gaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 40561046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 141 - 370
Target Start/End: Original strand, 44708762 - 44708983
Alignment:
Q  141 atgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggtt 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  44708762 atgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttaattgtgtaggaagtgggcttaggtt 44708861  T
Q  241 gattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaaga 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  44708862 gattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgcgccaagtcca--------tgtaatgttgtaatgaaaaga 44708953  T
Q  341 ggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatg 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44708954 ggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatg 44708983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 133 - 421
Target Start/End: Original strand, 34401115 - 34401394
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34401115 tggaagaaatagaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgagtaggaagtgag 34401214  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||        |||||||||||||    
T  34401215 cttaggttgattaagatattgataggattattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgcattgtgccaagttca--------tgtaatgttgtaa 34401306  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcat 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||          ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34401307 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttttg-ttaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcat 34401394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 133 - 298
Target Start/End: Original strand, 42518360 - 42518525
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  42518360 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaagtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaagaagtgat 42518459  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtat 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42518460 cttaggtttattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtat 42518525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 423 - 544
Target Start/End: Original strand, 39663994 - 39664115
Alignment:
Q  423 tcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 522  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39663994 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 39664093  T
Q  523 aaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||    
T  39664094 aaactaaaagacagacactttg 39664115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 42517969 - 42518084
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  42517969 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagatttggtgtt 42518068  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     | |||||||||||||    
T  42518069 caaaaatgatgggtgg 42518084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 449 - 544
Target Start/End: Original strand, 44708996 - 44709091
Alignment:
Q  449 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  44708996 atcaaattggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtcaaagacagacactttg 44709091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6799110 - 6798995
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  6799110 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccttaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgatcattgttgaagattcagtgtt 6799011  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  6799010 cagaaatgatgggtgg 6798995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 34400720 - 34400837
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt--gattcaattcaaaatt-caaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatg 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34400720 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttggattcaattcgaaattaaaaaaatcagtggtcattgttgaagattcagtg 34400819  T
Q  118 tttagaaatgatgggtgg 135  Q
    || |||||||||||||||    
T  34400820 ttcagaaatgatgggtgg 34400837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 39663555 - 39663669
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgttt 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |     
T  39663555 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctattttttttattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaaaattcggtgctc 39663654  T
Q  121 agaaatgatgggtgg 135  Q
    |||||||||| ||||    
T  39663655 agaaatgatgagtgg 39663669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 19907128 - 19907244
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt--ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19907128 atgtcaatgttcttcaccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaatattcggtgt 19907227  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||||||||| ||||    
T  19907228 tcagaaatgatgagtgg 19907244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2768518 - 2768403
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2768518 atgtcaatgttcttccccaatttaaataatttaaagccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcagtgtt 2768419  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||| ||||    
T  2768418 cagaaatgatgagtgg 2768403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 37021501 - 37021388
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  37021501 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagat 37021402  T
Q  481 atcactgtgatcct 494  Q
    |||| |||||||||    
T  37021401 atcaatgtgatcct 37021388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4047505 - 4047377
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttga 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||    || |||| |||     
T  4047505 ggcaatgaagaggtttggagggcaaagttaatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgt 4047406  T
Q  273 ttgagttgtttaaaatgctattgtattgt 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4047405 ttgagttgtttaacatgctattgtattgt 4047377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 26581539 - 26581613
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26581539 ggcaatgaagaggtttagaggggaaggttgatggacaaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 26581613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20941862 - 20941734
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttga 272  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||    || |||| |||     
T  20941862 ggcaatgaagaggtttggatg-caaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgt 20941764  T
Q  273 ttgagttgtttaaaatgctattgtattgtg 302  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  20941763 ttgagttgtttaacatgttactgtattgtg 20941734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31474751 - 31474647
Alignment:
Q  31 tctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatgat 129  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| || | |||| |||||||||    
T  31474751 tctttcccaattcaaaaaacctaaaaccctaatttttttggttcaattcgaaatccaaaaatcagtggttattgttcaagctttggtgttcagaaatgat 31474652  T
Q  130 gggtg 134  Q
    |||||    
T  31474651 gggtg 31474647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17697809 - 17697696
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-------ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgttta 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  17697809 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaaccctaatttttttgattcaatttgaaattcaaaaattagtggtcattgttcaagattcggtgttca 17697710  T
Q  122 gaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||    
T  17697709 taaatgatgggtgg 17697696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 14387795 - 14387868
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14387795 atgtcaattttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 14387868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 326
Target Start/End: Original strand, 19581960 - 19582023
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatg 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  19581960 ttttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctctgtaatgttgtaatg 19582023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 40561555 - 40561482
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  40561555 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 40561482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 161560 - 161432
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttga 272  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||| || |||||||||||   ||||||    || |||| |||     
T  161560 ggcaatgaagaggtttagagggcaaggttgatggacaaagttgactatgtagaaagtgaggtttggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgt 161461  T
Q  273 ttgagttgtttaaaatgctattgtattgt 301  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  161460 ttgagttgtttaacatgctactctattgt 161432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16764255 - 16764175
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtc 99  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16764255 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtc 16764175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2577115 - 2577060
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaatt 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2577115 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcaaaatt 2577060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38149415 - 38149341
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| || || ||||||||    
T  38149415 ggcaatgacgaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataaaaagtgagattggggtgattaag 38149341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 486 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 37646283 - 37646238
Alignment:
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 531  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37646283 tgtgatctttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 37646238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 93
Target Start/End: Original strand, 24206035 - 24206094
Alignment:
Q  36 cccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  24206035 cccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttttgattaaattcgaaattcataaatca 24206094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 161300 - 161216
Alignment:
Q  441 aaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  161300 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcataacaaagtaaaaa 161216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 6783785 - 6783849
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  6783785 ttcttccctaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaatttgaaattcataaatca 6783849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15373588 - 15373549
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15373588 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttt 15373549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Original strand, 11022246 - 11022280
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatgga 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11022246 ggcaatgaagaggtttggagggcaaggttgatgga 11022280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 301
Target Start/End: Original strand, 11313399 - 11313473
Alignment:
Q  227 agtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||   || |||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  11313399 agtgagcttaggttgattaagtttttgataattataatttgcttgtttgagttttttaacatgctactgtattgt 11313473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Original strand, 10715502 - 10715550
Alignment:
Q  34 ttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaa 82  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  10715502 ttcccaattcaaaaaacttcaaaccctaatttttttattgaatccaaaa 10715550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 14388455 - 14388487
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388455 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 14388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 17696997 - 17696965
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17696997 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 17696965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 533
Target Start/End: Original strand, 42518524 - 42518556
Alignment:
Q  501 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42518524 atacatttgctgaacaaagtaaaaaataaaaga 42518556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 42518586 - 42518618
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42518586 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42518618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 9575 - 9059
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt--gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9575 atgtcaatgtttttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttgattcaattataaattcaaaaatcagtggtcattgttaaagattcggtgt 9476  T
Q  119 ttagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgatt 218  Q
    | |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9475 tcagaaatgatggaaggaagaaatgtaaggttgatggagaagccaaatgataggagcagagaagaggtttggagggcaaggttgatcgataaagttgatt 9376  T
Q  219 gtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacg 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  9375 gtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccat------ 9282  T
Q  319 ttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccat 418  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9281 --gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtc-aaaaaaattcaatcaaattagtccttgaattatatgcatatccat 9185  T
Q  419 catatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9184 catatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatctgccgaacaaa 9085  T
Q  519 gtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9084 gtaaaaagtaaaagacagacactttg 9059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 137 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 54899649 - 54899254
Alignment:
Q  137 agaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagctta 236  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54899649 agaaatacaaggttgatggagaagccaaatgataagggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatgggtaaagttgattgtgtaggaagtgagctta 54899550  T
Q  237 ggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaa 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54899549 ggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaa 54899450  T
Q  337 aagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatt 436  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |        |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54899449 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttccgtc-aaaaaaattcaatcacatcggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaatt 54899351  T
Q  437 agtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899350 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 54899254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 27898047 - 27898448
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27898047 tggaagaaatgcaaggttgatggagaaggcaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 27898146  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  27898147 cttaggttgattaatatattgataggagtattttgtttgattaagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 27898237  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |        ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898238 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttttgtc-aaaaaaattcaatcaagttggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 27898336  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27898337 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccctggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaag 27898436  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  27898437 acagacactttg 27898448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Original strand, 30599140 - 30599530
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30599140 tggaagaaatgcaagattgatggagaagtcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 30599239  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  30599240 cttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 30599331  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  30599332 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc--aaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatattgatcctca 30599429  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30599430 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgcagaacaaagtaaaaagtaaaag 30599529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 17516520 - 17516131
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17516520 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatggggg-agagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 17516422  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||        |||||||||||||    
T  17516421 cttaggttgattaagatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaattcca--------tgtaatgttgtaa 17516330  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17516329 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatat-catatccatcatatcgatactca 17516232  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17516231 aattagtaaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgcttaacaaagtaaaaagtaaaag 17516132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 43766333 - 43765942
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43766333 tggatgaaatgcaagattgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagctgattgtgtaggaagtgag 43766234  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||         ||||||    
T  43766233 cttagattgattaatatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattttattgtgtcaagttcatgtaac--------attgtaa 43766142  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |        ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43766141 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctatc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcatca 43766043  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43766042 aattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 43765943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 46198931 - 46198530
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  46198931 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgga 46198832  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  46198831 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattatattgtgtcaagtccat--------gtaatgttgtaa 46198740  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |        ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46198739 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttatgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcctca 46198641  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198640 aattagtaaaaataccatcaaataggtcc-tggatttttacaacagatatcattgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 46198542  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  46198541 acagacactttg 46198530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21349906 - 21349515
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21349906 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaagttttgagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgag 21349807  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||        ||||||||||||    
T  21349806 cttatgttgattaagacattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgcgccaagtccat--------gtaatgttgtaa 21349715  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||           ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21349714 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctg-taaaaaaaaatcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctca 21349616  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21349615 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaattatcactgtggtccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 21349516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 2378201 - 2377817
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  2378201 tggaagaaatgcaaggttgatggataagtcaaaggataggggcagagaagaggtttggagagcaaggttgatggataaagttgattgcgtaggaaatgag 2378102  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||        ||||||||    
T  2378101 cttaggttgattaagatattgataggagtatttt-tttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaa 2378012  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||     |||||| ||||||||||||          ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2378011 tgaaaagaggttgt-----aatgaatcaaacccttatgt-taaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcataacgatcctca 2377918  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2377917 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaag 2377818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 135 - 533
Target Start/End: Original strand, 44275152 - 44275539
Alignment:
Q  135 gaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagct 234  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||    
T  44275152 gaagaaatggaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagacgtttggagggcaaggttgatggataaatttgattgtgaaggaagggagct 44275251  T
Q  235 taggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatg 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||        |||||||||||||||    
T  44275252 taggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatggtattgtattgtgccaagttca--------tgtaatgttgtaatg 44275343  T
Q  335 aaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaa 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||          ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44275344 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctg---aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatacacatatccatcatatcgatcctcaaa 44275440  T
Q  435 ttagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44275441 ttagtgaaaataccatcaaataggttcttgaattttcacaatagatatcattgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaattaaaaga 44275539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 186 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 44795358 - 44795009
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795358 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 44795259  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||  ||||||||| || |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |        |||||    
T  44795258 aataatattgtattatgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcgatgaatgaaccaaaccattatgtcaaaatat-ttcaa 44795168  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795167 tcaaattggttcttgaattatatccatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 44795068  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44795067 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 44795009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 202 - 544
Target Start/End: Original strand, 2225165 - 2225506
Alignment:
Q  202 gatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2225165 gatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaatatattgataggagtattttgcttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgt 2225264  T
Q  302 gtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttca 401  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |        |||| ||  |||||||||| |    
T  2225265 gccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctgtcaaaaaaa-ttcattcgcattggtccttga 2225363  T
Q  402 attatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgca 501  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225364 attatatacatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgca 2225463  T
Q  502 tacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2225464 tacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 2225506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 186 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2661373 - 2661024
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2661373 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggggtattttgtttgattgagttgtttaa 2661274  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |        || ||    
T  2661273 aatgatattgtattgtgccatgtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttt-aa 2661183  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661182 tcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattggtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 2661083  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2661082 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 2661024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 133 - 473
Target Start/End: Original strand, 53188632 - 53188963
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53188632 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 53188731  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  53188732 cttagattgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 53188823  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| || || |        |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53188824 tgaaaataggttgtcaatgaatgaatgaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctca 53188922  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcac 473  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  53188923 aattagtgaaaatgtcatcaaataggtcattgaattttcac 53188963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 154 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 610785 - 610404
Alignment:
Q  154 ggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattg 253  Q
    |||||||||||| ||||| |  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  610785 ggagaagccaaaagatagtgttagagaaaaggcttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggtttattaagatattg 610686  T
Q  254 ataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaa 353  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  610685 ataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagt--atgt------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaa 610594  T
Q  354 tgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaa 453  Q
    ||||   ||||||| || |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  610593 tgaattcaacccttctgtcaaaaaaa-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgcatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaa 610495  T
Q  454 ataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  610494 ataagtccttgaattttcacaacataaatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 610404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 178 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 46113634 - 46113288
Alignment:
Q  178 agaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgag 277  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46113634 agaagaggcttggagggcaaggctgatggataaagttgattgtgcgggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattgag 46113535  T
Q  278 ttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnn 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |         
T  46113534 ttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtc--tg------tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaaggaatgaatccaacccttctgtc-aaaa 46113444  T
Q  378 nnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaaca 477  Q
       |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46113443 aatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtttatccatcacatcaatccctaaattagtgaagataccatcaaacaagtccttgaattttcacaaca 46113344  T
Q  478 gatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46113343 taaatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 46113288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 264 - 533
Target Start/End: Original strand, 23292232 - 23292492
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23292232 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgacaagtccatataa--------tgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaac 23292323  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
      || || |        ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292324 ttttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 23292422  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292423 gaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 23292492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 333 - 544
Target Start/End: Original strand, 35904849 - 35905059
Alignment:
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35904849 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaa-ttcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctca 35904947  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904948 aattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 35905047  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  35905048 acagacactttg 35905059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Original strand, 48829886 - 48830147
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  48829886 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtc--tgt------gtaatgttgtaatgaaaagtggttgtcaatgaatgaatttaa 48829977  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    |||||||| |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  48829978 cccttatgtcaaaaaaa-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaataccatcaaacaagtcct 48830076  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48830077 tgaattttcacaacatatatcactgtgatccttagtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 48830147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 133 - 302
Target Start/End: Original strand, 35904681 - 35904850
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35904681 tggaagaaatgcaaggttgatggagaaggcaaacgataggggcagagaacaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 35904780  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtg 302  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35904781 tttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtg 35904850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 51685673 - 51685412
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaa 362  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  51685673 ttttgtgtgattgagttgtttgaaatgttattgtattgtgtcaagtc--tgt------gtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaa 51685582  T
Q  363 cccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcct 462  Q
    || || || |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51685581 cctttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatcgatcatatcaatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcct 51685483  T
Q  463 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51685482 tgaattttcacaacatatatcactgtgatcgttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 51685412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 320 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 42280521 - 42280308
Alignment:
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |        |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  42280521 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatc 42280423  T
Q  420 atatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 519  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42280422 atatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 42280323  T
Q  520 ta-aaaagtaaaaga 533  Q
    || ||||||||||||    
T  42280322 taaaaaagtaaaaga 42280308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Original strand, 7884091 - 7884227
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884091 tgcatatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 7884190  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7884191 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttg 7884227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 41978674 - 41978538
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978674 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 41978575  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41978574 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 41978538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Original strand, 38192456 - 38192596
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  38192456 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 38192555  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38192556 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 38192596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Original strand, 53093196 - 53093336
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  53093196 ggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 53093295  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53093296 ctttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 53093336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 396 - 533
Target Start/End: Original strand, 46609724 - 46609861
Alignment:
Q  396 ccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcctt 495  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46609724 ccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctt 46609823  T
Q  496 ggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46609824 tgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 46609861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 401 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 46309944 - 46309812
Alignment:
Q  401 aattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 500  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  46309944 aattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcatttgtgc 46309845  T
Q  501 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46309844 atacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaaga 46309812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43766726 - 43766612
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43766726 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcagttcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcaatgtt 43766627  T
Q  120 tagaaatgatgggtg 134  Q
    |||||||||||||||    
T  43766626 tagaaatgatgggtg 43766612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 30598749 - 30598864
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30598749 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattattgaagattcggtgtt 30598848  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  30598849 cagaaatgatgggtgg 30598864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21350299 - 21350184
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21350299 atgtcaatgtacttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcatcgttgaagattcggtgtt 21350200  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  21350199 cagaaatgatgggtgg 21350184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2378618 - 2378503
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  2378618 atgtcaatgttcttccctaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaagattcggtggt 2378519  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||| ||||    
T  2378518 cagaaatgatgagtgg 2378503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 27897604 - 27897719
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27897604 atgtcaatgttcttccccaattaaaaaaacttaaaaccataatttttttgattcaattcgaaattcaaaaactagtggtcattgttgaagattcggtgtt 27897703  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
    ||||||||||| ||||    
T  27897704 tagaaatgatgagtgg 27897719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 135
Target Start/End: Original strand, 23291983 - 23292098
Alignment:
Q  23 gtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg---attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23291983 gtcaatgttcttccccaattcaaaagacttaaaaccctaattttttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 23292082  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     ||||||||| |||||    
T  23292083 cagaaatgataggtgg 23292098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Original strand, 44268393 - 44268476
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44268393 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaactta-aaccctatttttttgattcaattcaaaattcaaaaaccagtggtcattgtt 44268476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 385 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 24845833 - 24845686
Alignment:
Q  385 atcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa-tatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 483  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||  ||| ||||| |||| |||  |||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  24845833 atcaaattggtccttctattgtttgtctatgcatcaaatcgttccctaaattagttaaaaataccatcaaataagtctttgaattatcacaacatatatc 24845734  T
Q  484 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 531  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24845733 aatgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 24845686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 51686047 - 51685940
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | |||||    
T  51686047 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgatcatcgttgaagatttgatgttcataaatg 51685948  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  51685947 atgggtgg 51685940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17516650 - 17516561
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaag 109  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516650 atgtcaatgttcttccctaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaag 17516561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 42282169 - 42282062
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  42282169 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagcggtcattgttgaagatttggtgttcagaaatg 42282070  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    || |||||    
T  42282069 ataggtgg 42282062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13466324 - 13466205
Alignment:
Q  180 aagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagata-ttgataagagtattttgtttgattgagt 278  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||  |    
T  13466324 aagaggattggagggaaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagtttaggttgattaa-atatttgataggtgtaatttgtttgattggat 13466226  T
Q  279 tgtttaaaatgctattgtatt 299  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  13466225 tgtttaacatgctactgtatt 13466205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 23876214 - 23876287
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaa 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23876214 ggcaatgaagaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgactctgtatgaagtgagtttaggttgattaa 23876287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 610884 - 610816
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtgg 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  610884 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtgg 610816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 469 - 544
Target Start/End: Original strand, 53190118 - 53190196
Alignment:
Q  469 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaa---agtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  53190118 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaattattaaaaagtaaaagacagacactttg 53190196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24846243 - 24846136
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| || | |||| |||||||    
T  24846243 gttcttccccaattcaaaaaatttaaaatcctaatttttttgattcaattcgaaatccaaaaatcagtggttattgttcaagctttggtgttcagaaatg 24846144  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  24846143 atgggtgg 24846136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 46113758 - 46113689
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccct-aattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtgg 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46113758 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaacccttaattttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgg 46113689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 53093078 - 53093185
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||  | ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  53093078 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgtcttgtagattcagtgtttagaattg 53093177  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  53093178 atgggtgg 53093185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Original strand, 32843436 - 32843504
Alignment:
Q  179 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32843436 gaagagttttggagggcaaggttgatcgacaaagttgactgtgtaggatgtgagcttaggttgattaag 32843504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Original strand, 35862434 - 35862546
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttga 272  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||   |||||||   || |||| |||     
T  35862434 ggcaatgaagaggtttgcatggcaaggttgatgaacaaagttgattgtgtaggaagcgagcttaagttgattaagtatttgataatcataatttgcttgt 35862533  T
Q  273 ttgagttgtttaa 285  Q
    |||||||||||||    
T  35862534 ttgagttgtttaa 35862546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 38193144 - 38193080
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttt-tgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38193144 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttctgattaaattcaaaattcataaatca 38193080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Original strand, 7883740 - 7883855
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  7883740 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 7883839  T
Q  119 ttagaaatgatgggtg 134  Q
    | |||| |||||||||    
T  7883840 tcagaattgatgggtg 7883855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41945488 - 41945414
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  41945488 ggcaatgacgaggtttagaggacaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtgagcttagggtgattaag 41945414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 46609604 - 46609710
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| |||    
T  46609604 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttattaaatttgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaattga 46609703  T
Q  129 tgggtgg 135  Q
    |||||||    
T  46609704 tgggtgg 46609710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 3150683 - 3150756
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  3150683 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 3150756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41979029 - 41978956
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  41979029 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 41978956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 44795535 - 44795462
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44795535 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttataaccctaatttttttgattaaattcaaaattcataaatca 44795462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 38192338 - 38192402
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  38192338 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 38192402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 53093907 - 53093843
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  53093907 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatca 53093843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 23876057 - 23876124
Alignment:
Q  25 caatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatc 92  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23876057 caatcttcttccccaattcaaaaaacttcaaaacctaattttttgattgaattcaaaatccaaaaatc 23876124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 46310070 - 46309963
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  46310070 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaatttgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaattg 46309971  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  46309970 atgggtgg 46309963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 53188188 - 53188261
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  53188188 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaatttgaaattcataaatca 53188261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 46309262 - 46309328
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa---ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  46309262 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttttgattaaattcgaaattcataaatca 46309328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 54899751 - 54899671
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtc 99  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  54899751 atgtcaaatttcttccccaattaaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtc 54899671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2661551 - 2661504
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 68  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661551 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 2661504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 247
Target Start/End: Original strand, 2976359 - 2976410
Alignment:
Q  196 aaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2976359 aaggttgatggacaaagttgagtgtgtaggaattgagcttaggttgattaag 2976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 530
Target Start/End: Original strand, 22219218 - 22219308
Alignment:
Q  441 aaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaaa 530  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |   ||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  22219218 aaaatatcatcaaataaatccttgaattatttaaacagatgtcaatgcgatccttggtgcatatatgtgcagaacaaagtacaaaagtaaa 22219308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 35904236 - 35904353
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatg 117  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||    ||| ||||||||||    
T  35904236 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttcgaaccttaattttttttgattaaattcgaaattcataaatcaaatggtctgccttgtagattcgatg 35904335  T
Q  118 tttagaaatgatgggtgg 135  Q
    || |||| ||||||||||    
T  35904336 ttcagaattgatgggtgg 35904353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2661017 - 2660973
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661017 aaaagacagacattttc-ataccatcataagtcatatatttgatgt 2660973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13466192 - 13466155
Alignment:
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13466192 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaa 13466155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21349497 - 21349453
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21349497 aaaagatagacattt-gcatactatcataagtcatatatttgatgt 21349453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 23292510 - 23292554
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292510 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 23292554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 30599548 - 30599592
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599548 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 30599592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 48830165 - 48830209
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48830165 aaaagacagacattt-gtatatcatcataagtcatatatttgatgt 48830209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 525
Target Start/End: Original strand, 35862699 - 35862775
Alignment:
Q  449 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    |||| ||| ||||||||||| |   ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  35862699 atcagataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttgttgcatatatgtgcagaacaaagtaaaaa 35862775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 41978519 - 41978487
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978519 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 44275569 - 44275601
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275569 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 44275601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 46198511 - 46198479
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198511 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 46198479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 53190215 - 53190247
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53190215 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 53190247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 133 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22155092 - 22154696
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22155092 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgatcgtgtaggaagtgag 22154993  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  22154992 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccat--------gtaatgttgtaa 22154901  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154900 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 22154802  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22154801 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaag 22154702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 133 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 22211007 - 22210611
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22211007 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgatcgtgtaggaagtgag 22210908  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  22210907 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccat--------gtaatgttgtaa 22210816  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210815 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 22210717  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22210716 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaag 22210617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 133 - 539
Target Start/End: Original strand, 34775894 - 34776290
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34775894 tggaagaaatgtaaggttgatggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgag 34775993  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||        |||||||||||||    
T  34775994 cttaggttgattaagatattgataggtgtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtcccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 34776084  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |        || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34776085 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaactcttctgtcaaattttttt-aatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 34776183  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34776184 aattagtgaaaataccatcaaatagatctttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaactaaaag 34776283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 133 - 531
Target Start/End: Original strand, 38473056 - 38473445
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38473056 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgaa 38473155  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        |||||||||||||    
T  38473156 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattttgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 38473247  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38473248 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttttgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatactcatcatatcgatcctca 38473346  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 531  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38473347 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaa 38473445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 149 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 6604701 - 6604315
Alignment:
Q  149 ttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaaga 248  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  6604701 ttgatggagaagccaaaggataggggcaaagaagaggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtataggaagtgagcttaggttgattgaga 6604602  T
Q  249 tattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtca 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604601 tattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagttca--------tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtca 6604510  T
Q  349 atgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatc 448  Q
    ||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6604509 atgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatacc 6604411  T
Q  449 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6604410 atcaaataggtccttgacttttcacaacatatatcactgtgatcattggtgcatacatttactgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 6604315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 35692283 - 35692684
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35692283 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaatgatggggacagagaagaggtttggagggcaaggttggtggataaagttgattgtgtaggaagtgag 35692382  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  35692383 cttaggttgattaagatattgataaaagtattttgtttgattgtgttgttt-aaatgctattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 35692473  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692474 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 35692572  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  35692573 aattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatatatttgccgaacgaagtaaaaagcaaaag 35692672  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  35692673 acagacactttg 35692684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 45360528 - 45360127
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  45360528 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaaggataggggcggagaagaggtttggagggcaaggttgatggaaaaagttgattgtataggaagtgag 45360429  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||        ||||||||    
T  45360428 tttaggttgattaagatattgataggagtattttgttggattgagttgtttaaaatgctaatg-attgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaa 45360338  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45360337 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaa 45360239  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45360238 aattagtgaaaataccatcaaataggtctttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaag 45360139  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    ||| ||| ||||    
T  45360138 ataaacactttg 45360127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 181 - 533
Target Start/End: Original strand, 23905232 - 23905575
Alignment:
Q  181 agaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttg 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23905232 agaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattcagttg 23905331  T
Q  281 tttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnn 380  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |            
T  23905332 tttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaat- 23905422  T
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905423 ttaaatcaaattggtcattgaattatatgcatatcaatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 23905522  T
Q  481 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905523 atcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 23905575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 24227353 - 24227755
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24227353 tggaagaaatgcaagtttgatggagaagtcaaacgataaggggagagaagaagtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 24227452  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||| ||    
T  24227453 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgcaa 24227544  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || |        |||||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  24227545 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccttgttgtc-aaaaaatttcaatcaaatatgtccttaaattatatacacatccatcatatcaatcctca 24227643  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24227644 aattagtgaaaataccatcaaataggacatttaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 24227743  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  24227744 acagacactttg 24227755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 133 - 533
Target Start/End: Original strand, 46438441 - 46438833
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaa-agaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtga 231  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  46438441 tggaagaaatgcaaggttgatagagaagccaaaggataggggggagagaagaagtttggaggacaaggttgatggataaagttgactgtgtaggaagtga 46438540  T
Q  232 gcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||    
T  46438541 gcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttggttgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgta 46438632  T
Q  332 atgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctc 431  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| |        ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46438633 ctgaaaagaggttgtcaacgaatgaatcaaacctatatgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctc 46438731  T
Q  432 aaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 531  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  46438732 aaataagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactttgatccttggtggatacatttgctgaatagagtaaaaagtagaa 46438831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 186 - 544
Target Start/End: Original strand, 27665031 - 27665380
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665031 tttggaggacaaggttgatggataaaattaactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 27665130  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |        || ||    
T  27665131 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttt-aa 27665221  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665222 tcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcac 27665321  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27665322 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 27665380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 186 - 544
Target Start/End: Original strand, 29995501 - 29995850
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995501 tttggaggacaaggttgatggataaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 29995600  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || || |        |||||    
T  29995601 aatgatattgtattgtgccaagtctatgtaa--------tgttgtaatgaacagaggttttcaatgaatgaaccaaacatttctgtcaaaatat-ttcaa 29995691  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29995692 tcaaattgatccttaaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacaaatatcac 29995791  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29995792 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 29995850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 133 - 539
Target Start/End: Original strand, 47385139 - 47385539
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47385139 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagtggcagagaagaggtttggaaggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 47385238  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  47385239 cttaggttgattaagatattgataggagtgatttgtttgattgagttgtttagaattttattttattgtgccaagtctgtgtaatgctgtaatgttgtaa 47385338  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    |||| || |||||||||||||||||   |||| || || |        |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  47385339 tgaacagtggttgtcaatgaatgaattcaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcaaattggtccttctattatatgtctatccatcatatcgatcccca 47385437  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47385438 aattagtgaaattaccatcaaataagtccttgaattttcacaacatacatca-tgtgatc----atgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 47385532  T
Q  533 atagaca 539  Q
    | |||||    
T  47385533 acagaca 47385539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 229 - 544
Target Start/End: Original strand, 39858271 - 39858576
Alignment:
Q  229 tgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgtt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||        ||||    
T  39858271 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaa--------tgtt 39858361  T
Q  329 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatc 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858362 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatc 39858460  T
Q  429 ctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagta 528  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39858461 ctcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaacta 39858560  T
Q  529 aaagatagacattttg 544  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  39858561 aaagacagacactttg 39858576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 264 - 533
Target Start/End: Original strand, 37114591 - 37114851
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  37114591 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaa--------tgttgtattgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaat 37114682  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
    | || || |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37114683 ctttttgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcctt 37114781  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114782 gaattttcacaacagatatcattgtaatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 37114851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 133 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 69316 - 69133
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  69316 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttcattgtgtaggaagtgag 69217  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaa 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  69216 cttaggttgattaagatattaatatgagtattttgtttgattgagttgttttaaatactattgtactgtgccaagtccatgtaa 69133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 320 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 13169096 - 13168873
Alignment:
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13169096 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatc 13168998  T
Q  420 atatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13168997 atatcgatcctcaaattagtgaacataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcatacattcgctgaacaaaa 13168898  T
Q  520 taaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  13168897 taaaaactaaaagacagacactttg 13168873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 263 - 533
Target Start/End: Original strand, 38550316 - 38550593
Alignment:
Q  263 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaat 354  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||| |||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38550316 ttttgtgttattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgcaaagtctgtgtaatgttgtaaagttgttatgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaat 38550415  T
Q  355 gaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaa 454  Q
    |||   ||||||||||          |||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38550416 gaatttaacccttatgt-aaaaaaaattcaatcaaattagtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaa 38550514  T
Q  455 taggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38550515 taagtccttgaatttttacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaaataaaaagtaaaaga 38550593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 48311140 - 48310947
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||  |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  48311140 tggaaggaatgcaaggttaatggagaagcctaagaatagtggcggagaagaggtttggagggcaatgttgatggataaagtcgattgtgtaggaagtgaa 48311041  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  48311040 cttaggttgattaagatattgacatgagtaatttgtttgattgaattgtttaaaatgctattatattatgtcaagtctgtgtaatgttgtaatg 48310947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 23905009 - 23905165
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaat-tttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  23905009 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatattttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttaaagattaggtgtt 23905108  T
Q  120 tagaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggca 176  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23905109 caaaaatgatgggtggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggca 23905165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 325 - 532
Target Start/End: Original strand, 37792150 - 37792356
Alignment:
Q  325 tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatc 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |        ||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||     
T  37792150 tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaatat-ttccatcaaattggtccttctattgcatgtctatccatcatatt 37792248  T
Q  425 gatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaa 524  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37792249 gatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaccatatatcactgtgatcattggtgcatacatttgttgtacaaagtaaaa 37792348  T
Q  525 agtaaaag 532  Q
    ||||||||    
T  37792349 agtaaaag 37792356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 393 - 544
Target Start/End: Original strand, 35402544 - 35402694
Alignment:
Q  393 ggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 492  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  35402544 ggtccttgaattatattca-atccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatc 35402642  T
Q  493 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  35402643 ctttgagcatatatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagataaacactttg 35402694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 385 - 544
Target Start/End: Original strand, 48851499 - 48851657
Alignment:
Q  385 atcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatca 484  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||  || ||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48851499 atcaaattggtccctctattgtatgtctacccatcatattgatcca-aaattagtgaaaatctcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatca 48851597  T
Q  485 ctgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48851598 ttgtgatccttggggcatacatttgctgaccaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 48851657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 69134 - 69032
Alignment:
Q  401 aattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 500  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  69134 aattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttggtgc 69035  T
Q  501 ata 503  Q
    |||    
T  69034 ata 69032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22155536 - 22155420
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  22155536 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaactttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtagtcatcgttgaagattcggtgt 22155437  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | | |||||||||||||    
T  22155436 tcaaaaatgatgggtgg 22155420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22211451 - 22211335
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  22211451 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaactttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtagtcatcgttgaagattcggtgt 22211352  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | | |||||||||||||    
T  22211351 tcaaaaatgatgggtgg 22211335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 38472663 - 38472779
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg--attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38472663 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgt 38472762  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | | |||||||||||||    
T  38472763 tcacaaatgatgggtgg 38472779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Original strand, 24226966 - 24227078
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24226966 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaagaccctaatttttttgattcaattcgaaattcgaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 24227065  T
Q  120 tagaaatgatggg 132  Q
     ||||||||||||    
T  24227066 cagaaatgatggg 24227078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6605074 - 6604959
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6605074 atgtcaatgtttttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaagattcggtgtt 6604975  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
      ||||||||||||||    
T  6604974 cggaaatgatgggtgg 6604959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 47384696 - 47384811
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47384696 atgtcaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagatttggtgtt 47384795  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  47384796 cagaaatgatgggtgg 47384811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 48850967 - 48851075
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt--ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48850967 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtgatcattgttgaagattcggtgttcagaaat 48851066  T
Q  127 gatgggtgg 135  Q
    |||||||||    
T  48851067 gatgggtgg 48851075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Original strand, 37114342 - 37114453
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37114342 atgtcaatgttcttccccaatttaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaatttgaaattgaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 37114441  T
Q  120 tagaaatgatgg 131  Q
     |||||||||||    
T  37114442 cagaaatgatgg 37114453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45360971 - 45360856
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  45360971 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaatttaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcagtgtt 45360872  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     | |||||||| ||||    
T  45360871 cataaatgatgagtgg 45360856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 39858091 - 39858207
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt--ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  39858091 atgtcaatgttcttcaccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaatattcggtgt 39858190  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||||||||| ||||    
T  39858191 tcagaaatgatgagtgg 39858207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 46438047 - 46438163
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttccc-aattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  46438047 atgtcaatgttcttcccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaatttgaaattcaaaaatcaatggtcattgttgaagattcggtgt 46438146  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | | |||||||||||||    
T  46438147 tcataaatgatgggtgg 46438163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 38549941 - 38550048
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||    
T  38549941 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaatcctaattttttttattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattattgaagatttggtgttcagaaatg 38550040  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  38550041 atgggtgg 38550048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 34775453 - 34775567
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgttt 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34775453 atgtcaatgttcttccccaattcagaaaacttaaaaccctattttttttattcaatttgaaattaaaaaaccagtggtcattgttgaagattcggtgttc 34775552  T
Q  121 agaaatgatgggtgg 135  Q
    |||||||||| ||||    
T  34775553 agaaatgatgagtgg 34775567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13169344 - 13169226
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt----gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgat 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  13169344 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttttgattcaattcgaaattcaaaaactagtggtcattgttgaatattcggt 13169245  T
Q  117 gtttagaaatgatgggtgg 135  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  13169244 gttcagaaatgatgagtgg 13169226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20479034 - 20478921
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  20479034 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 20478935  T
Q  481 atcactgtgatcct 494  Q
    |||| |||||||||    
T  20478934 atcaatgtgatcct 20478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11683749 - 11683621
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttga 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||    || |||  |||     
T  11683749 ggcaatgaagaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgagtgtataggaagtgagcttaggttgattaagtttttgatagtcataatttacttgt 11683650  T
Q  273 ttgagttgtttaaaatgctattgtattgt 301  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11683649 ttgagttttttaacatgctattgtattgt 11683621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 35691839 - 35691918
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtc 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  35691839 atgtcaaagttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaatccgaaattcaaaaatcagtggtc 35691918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34691947 - 34691873
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34691947 ggcaatgacgaggtttggagggcaacgttgatggacaaagttgattgtatatgaagtgaacttaggttgattaag 34691873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 27664854 - 27664970
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  27664854 atgtcaaatttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattccaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 27664953  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  27664954 tcagaattgatgggtgg 27664970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32840615 - 32840551
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttag 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32840615 ggcaaagaataggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgaacttag 32840551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 77684 - 77577
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||| |||| ||    
T  77684 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcaaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgttcagaattg 77585  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  77584 atgggtgg 77577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 48310914 - 48310767
Alignment:
Q  385 atcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa-tatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 483  Q
    |||||||||||| ||| ||| | ||  ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  48310914 atcaaattggtcattctattgtttgtctatgcatcaaatcgattcctaaattagtgaaaaatatcatcaaataagtcattgaattatcacaacatatatc 48310815  T
Q  484 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 531  Q
    | | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  48310814 aatatgatctttgctacatatatttgctgaacaaagtagaaaataaaa 48310767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 4321791 - 4321865
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  4321791 ggcaatgacgaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtaagcttagggtgattaag 4321865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23168751 - 23168648
Alignment:
Q  196 aaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   ||||||  |||| || |||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  23168751 aaggttgacggataaagttgattgtgtacgaagtgagtttagattgattaagtatttgatagaagtaattcgtttgattggattgtttaacatgttattg 23168652  T
Q  296 tatt 299  Q
    ||||    
T  23168651 tatt 23168648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Original strand, 34784575 - 34784646
Alignment:
Q  185 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgata 256  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34784575 gtttgaagggcaatgttgatggacaaagttgattgtataagaagtgagcttaggttgattaagtttttgata 34784646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 29995323 - 29995440
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatg 117  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| ||    
T  29995323 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtg 29995422  T
Q  118 tttagaaatgatgggtgg 135  Q
    || |||| ||||||||||    
T  29995423 ttcagaattgatgggtgg 29995440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7403042 - 7402914
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttga 272  Q
    ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||   ||||||    || ||||||||     
T  7403042 ggcaatgaagacatttgaagagcaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggatgtaagattaggttgattaagtatttgatagtcataatttgtttgt 7402943  T
Q  273 ttgagttgtttaaaatgctattgtattgt 301  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  7402942 ttgggttgtttaacatgctactgtattgt 7402914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Original strand, 37792054 - 37792130
Alignment:
Q  20 tatgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagt 95  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  37792054 tatggcaaagttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaatccaaaaatcagt 37792130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 179 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40361028 - 40360948
Alignment:
Q  179 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataaga 259  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  40361028 gaagaagtttggagagcaaggttgatggacaaagttgattgtttagaaagtgagcttagattgataaagtaattgataaga 40360948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35403253 - 35403146
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa-ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |  ||| ||| || |||||||||| ||    
T  35403253 ttcttccccaattcaaaaaacttataaccctaacttttttaattaaattcgaaattcataaatcaagtggtcttccttgtagaatcaatgtttagaattg 35403154  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  35403153 atgggtgg 35403146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 66915 - 66870
Alignment:
Q  499 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  66915 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 66870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Original strand, 35402425 - 35402533
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaat 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||  ||||||||| |    
T  35402425 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttttattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcagtgtttagaatt 35402524  T
Q  127 gatgggtgg 135  Q
    |||||||||    
T  35402525 gatgggtgg 35402533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13035705 - 13035621
Alignment:
Q  441 aaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  13035705 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcaaaacaaagtaaaaa 13035621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13036010 - 13035937
Alignment:
Q  174 gcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    |||| ||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13036010 gcaatgaataggtttaaaggggaaggttgatggagaaagttgactatgtaggaagtgagattaggttgattaag 13035937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 246
Target Start/End: Original strand, 48302864 - 48302936
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaa 246  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  48302864 ggcaatgacgaggtttggagg-caacgttgatggacaaagttgattgtacaggaagtgagcttagggtgattaa 48302936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 8421806 - 8421845
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8421806 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttt 8421845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13169162 - 13169123
Alignment:
Q  229 tgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13169162 tgagcttaggttgattaagatattgataggaatattttgt 13169123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 35342816 - 35342855
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt 68  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35342816 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttt 35342855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 63335 - 63302
Alignment:
Q  387 caaattggtccttcaattatatgcatatccatca 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  63335 caaaatggtccttcaattatatgcatatccatca 63302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6604308 - 6604264
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604308 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 6604264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 23905593 - 23905637
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905593 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 23905637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 24227762 - 24227806
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24227762 aaaagacagacattt-gtataccatcataaatcatatatttgatgt 24227806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 29995857 - 29995901
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995857 aaaagacagacattttc-ataccatcataagtcatatatttgatgt 29995901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 37114869 - 37114913
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114869 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 37114913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22154671 - 22154639
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154671 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22210586 - 22210554
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210586 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 573
Target Start/End: Original strand, 35692703 - 35692735
Alignment:
Q  541 tttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692703 tttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 35692735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21842193 - 21841791
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21842193 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaatgctaggggcagagaagaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 21842094  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  21842093 cttaggttgactaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtggcaagtccat--------gtaatgttgtaa 21842002  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21842001 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctca 21841903  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21841902 aattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgattcttagtgcatacatttgctgaagaaagtaaaaagtaaaag 21841803  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  21841802 acagacactttg 21841791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 136 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2180960 - 2180564
Alignment:
Q  136 aagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagctt 235  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2180960 aagaaatgcaaggttaatggagaagtcaaaggacaggggcaaagaagaggtttggaggacaaggttgatcgataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 2180861  T
Q  236 aggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatga 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||        |||||||||||    
T  2180860 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagtt--ttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatga 2180772  T
Q  336 aaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaat 435  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180771 aaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttgtgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaat 2180673  T
Q  436 tagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagata 535  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2180672 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagaca 2180573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 186 - 533
Target Start/End: Original strand, 2853253 - 2853591
Alignment:
Q  186 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaa 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2853253 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaagaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgaatattttgtttgattgagttgtttaa 2853352  T
Q  286 aatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaa 385  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||        |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |        |||||    
T  2853353 aatgatattgtaatgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaatagattgtcaatgaatgaaccaaacctttatgtcaaaatat-ttcaa 2853443  T
Q  386 tcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 485  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2853444 tgaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtctttgaattttcacaacagatatcac 2853543  T
Q  486 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853544 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 2853591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 133 - 525
Target Start/End: Original strand, 42472415 - 42472798
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42472415 tggaagaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaagtgag 42472514  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  42472515 cttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcca--------tgtaatgttgtaa 42472606  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |        |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  42472607 tgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctta 42472705  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 525  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  42472706 aattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagaaaaaa 42472798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 229 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 12801023 - 12800723
Alignment:
Q  229 tgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgtt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||        ||||    
T  12801023 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaa--------tgtt 12800933  T
Q  329 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatc 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800932 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatc 12800834  T
Q  429 ctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagta 528  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12800833 atcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaacta 12800734  T
Q  529 aaagatagaca 539  Q
    ||||| |||||    
T  12800733 aaagacagaca 12800723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 229 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 12738200 - 12737900
Alignment:
Q  229 tgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgtt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||        ||||    
T  12738200 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaa--------tgtt 12738110  T
Q  329 gtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatc 428  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || || |        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738109 gtaataaaaagaggttgtcgatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatc 12738011  T
Q  429 ctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagta 528  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12738010 atcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaacta 12737911  T
Q  529 aaagatagaca 539  Q
    ||||| |||||    
T  12737910 aaagacagaca 12737900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 243 - 533
Target Start/End: Original strand, 30464679 - 30464960
Alignment:
Q  243 ttaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagagg 342  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  30464679 ttaagatattcataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaa--------tgttgtaatgaaaagagg 30464770  T
Q  343 ttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaa 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  30464771 ttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgat 30464869  T
Q  443 aatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464870 aataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 30464960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 264 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 8540732 - 8540472
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8540732 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaaatccatgtaa--------tgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaac 8540641  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
    | || || |        ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540640 ctttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 8540542  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540541 gaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 8540472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 264 - 533
Target Start/End: Original strand, 32134897 - 32135157
Alignment:
Q  264 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32134897 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtcgatgtaa--------tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 32134988  T
Q  364 ccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtcctt 463  Q
    | || || |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32134989 ctttctgtcaaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcctt 32135087  T
Q  464 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 533  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135088 gaattttcacaacggagatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 32135157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 134 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28821585 - 28821364
Alignment:
Q  134 ggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagc 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28821585 ggaagaaatgcaaggttgatggagaaaccaaaggatagagggatataagaggtttggagggaaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagc 28821486  T
Q  234 ttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | ||||||||||||    
T  28821485 ttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcca--------tctaatgttgtaat 28821394  T
Q  334 gaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaac 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28821393 gaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 28821364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 382 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28821332 - 28821170
Alignment:
Q  382 tcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 481  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821332 tcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 28821233  T
Q  482 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28821232 tcactgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacattttg 28821170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 7268771 - 7268635
Alignment:
Q  408 tgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268771 tgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatt 7268672  T
Q  508 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7268671 tgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 7268635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17575848 - 17575700
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatg-aagtga 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17575848 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtga 17575749  T
Q  232 gcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17575748 gcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttg 17575700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17577159 - 17577011
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatg-aagtga 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17577159 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtga 17577060  T
Q  232 gcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttg 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17577059 gcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttg 17577011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17575128 - 17574980
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatg-aagtga 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17575128 tggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtga 17575029  T
Q  232 gcttaggttgattaag-atattgataagagtattttgtttgattgagttg 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  17575028 gcttaggttgattaagtatattgataggagta-tttgtttgactgagttg 17574980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Original strand, 18624247 - 18624398
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18624247 tggaagaaatgcaaggttgatagagaatccaaaggatagtgtcagagaagaggtttggatgacaaggttgatggatgaagttgattgtgtaggaagtgag 18624346  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgttta 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18624347 cttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgttta 18624398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34328508 - 34328393
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34328508 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 34328409  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     |||||||||||||||    
T  34328408 cagaaatgatgggtgg 34328393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 448 - 544
Target Start/End: Original strand, 24540429 - 24540525
Alignment:
Q  448 catcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24540429 catcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 24540525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 32134648 - 32134763
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32134648 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggtgtt 32134747  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     | |||||||||||||    
T  32134748 cataaatgatgggtgg 32134763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8540982 - 8540867
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg----attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgat 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8540982 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttttttattcaattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcggt 8540883  T
Q  117 gtttagaaatgatggg 132  Q
    ||| ||||||||||||    
T  8540882 gttcagaaatgatggg 8540867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 320 - 509
Target Start/End: Original strand, 41494553 - 41494741
Alignment:
Q  320 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatc 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |  |        ||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  41494553 tgtaatgtagtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttttatcaaaatct-ttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatc 41494651  T
Q  420 atatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttg 509  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41494652 atattgatccccaaatttgtgaaaataccatcaaataattccttgaattttcacaacatatatcactgtaatccttagtgcatatatttg 41494741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12738379 - 12738264
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12738379 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaatattcggtgtt 12738280  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     | |||||||| ||||    
T  12738279 aaaaaatgatgagtgg 12738264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12801202 - 12801087
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12801202 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaatattcggtgtt 12801103  T
Q  120 tagaaatgatgggtgg 135  Q
     | |||||||| ||||    
T  12801102 caaaaatgatgagtgg 12801087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 18623865 - 18623970
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18623865 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaatttttttgattcaatttgaaattcaaaaatcagcggtcattgttgaagatttgttgtttagaaatg 18623964  T
Q  128 atgggt 133  Q
    ||||||    
T  18623965 atgggt 18623970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 40781543 - 40781430
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  40781543 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 40781444  T
Q  481 atcactgtgatcct 494  Q
    |||| |||||||||    
T  40781443 atcaatgtgatcct 40781430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 30464355 - 30464467
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttt-ttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  30464355 atgtcaatgttctt-cccaattaaataaacttaacaccctaatttttttgattcaattcgaaattcaaaaaccaatggtcattgttgaagattcggtgtt 30464453  T
Q  120 tagaaatgatgggt 133  Q
     |||||||||||||    
T  30464454 cagaaatgatgggt 30464467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 41494254 - 41494361
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  41494254 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctgattttttttattcaattagaaatccaaaaatcagtggttattgttgaagatttaatgtttagaaatg 41494353  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  41494354 atgggtgg 41494361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 382 - 494
Target Start/End: Original strand, 29620912 - 29621024
Alignment:
Q  382 tcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 481  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  29620912 tcaatcacattggtccttgaattacaatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaga 29621011  T
Q  482 tcactgtgatcct 494  Q
    ||| |||||||||    
T  29621012 tcaatgtgatcct 29621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2181372 - 2181289
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2181372 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaacttaaaaccctaattttttttattcaattcgaaattcaaaaaccagtggtcattg 2181289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1344348 - 1344283
Alignment:
Q  182 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  1344348 gaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtgagcttaggctgattaag 1344283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 245
Target Start/End: Original strand, 28036377 - 28036443
Alignment:
Q  179 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgatta 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28036377 gaagaagtttggagggcaaggttgatggacaaaattgattgtgtaggaagtgagcttagattgatta 28036443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 7269132 - 7269016
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  7269132 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 7269033  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  7269032 tcagaattgatgggtgg 7269016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21842635 - 21842520
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  21842635 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattctaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 21842536  T
Q  119 ttagaaatgatgggtg 134  Q
    | |||| |||||||||    
T  21842535 tcagaattgatgggtg 21842520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17576281 - 17576175
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatga 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||| |||| |||    
T  17576281 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttgattaaaatcgaacttcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgttcagaattga 17576182  T
Q  129 tgggtgg 135  Q
    |||||||    
T  17576181 tgggtgg 17576175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18341288 - 18341214
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 247  Q
    ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  18341288 ggcaatgaatagatttggagggcaatgttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagcttaaattgattaag 18341214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 24540208 - 24540325
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatg 117  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| ||    
T  24540208 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttttgattaaattcgaaattcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtg 24540307  T
Q  118 tttagaaatgatgggtgg 135  Q
    || |||| ||||||||||    
T  24540308 ttcagaattgatgggtgg 24540325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 299
Target Start/End: Original strand, 1343735 - 1343861
Alignment:
Q  173 ggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttga 272  Q
    ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||| | ||||||    || |||| |||     
T  1343735 ggcaatgatgaggtttgaaggacaaggttgatggacaaagttgattgtatagaaagtgagcttatgctgattaagtttttgatagtcataatttgcttgt 1343834  T
Q  273 ttgagttgtttaaaatgctattgtatt 299  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  1343835 ttgagttttttaacatgctactgtatt 1343861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 42471979 - 42472044
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaa--ttttttgattcaattcaaaattcaaaaatca 93  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42471979 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttttgattaaattcgaaattcataaatca 42472044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17577593 - 17577486
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||| |||| ||    
T  17577593 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaaatcgaacttcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgttcagaattg 17577494  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  17577493 atgggtgg 17577486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 40781846 - 40781791
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaatt 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  40781846 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttttgattaaattcgaaatt 40781791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17575571 - 17575455
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt-ttttgattcaattcaaaattcaaaaatc-agtggtcattgttgaagattcgatgt 118  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||| ||||| |||||||    ||| ||||||| |||    
T  17575571 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaatttagaaccctaatttttttgattaaaatcgaacttcataaatcaagtggtctgccttgtagattcggtgt 17575472  T
Q  119 ttagaaatgatgggtgg 135  Q
    | |||| ||||||||||    
T  17575471 tcagaattgatgggtgg 17575455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27350039 - 27349968
Alignment:
Q  185 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaagatattgata 256  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27350039 gtttggagggtgaggttgatggacaaagttgatactttaggaattgagcttaggttgattaagtttttgata 27349968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8540454 - 8540410
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540454 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 8540410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 573
Target Start/End: Original strand, 30464978 - 30465022
Alignment:
Q  528 aaaagatagacattttgtataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464978 aaaagacagacattt-gcataccatcataagtcatatatttgatgt 30465022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 133 - 544
Target Start/End: Original strand, 107518 - 107919
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  107518 tggaagaaatgcaaggttgatgaagaagccaaaggatagtgtcagcgaagaggttttgagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 107617  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||      |||||||| ||||    
T  107618 cttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagt--ttg------tgtaatgtagtaa 107709  T
Q  333 tgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctca 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |        |||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||  |    
T  107710 tgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatc-aacccttctgtc-aaaaaatttcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatatcgatcccta 107807  T
Q  433 aattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 532  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107808 aattagtgaaaataccatcaaataagtccttaaattttcacaatataaatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaag 107907  T
Q  533 atagacattttg 544  Q
    | ||||| ||||    
T  107908 acagacactttg 107919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 107084 - 107191
Alignment:
Q  29 gttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttg-attcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtttagaaatg 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  107084 gttcttccccaattcaaaaaacttaaaactctaattttttttattccattcgaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaacatttggtgtttagaaatg 107183  T
Q  128 atgggtgg 135  Q
    ||||||||    
T  107184 atgggtgg 107191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 135 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 746 - 363
Alignment:
Q  135 gaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgagct 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||             |||||| ||||| ||||    
T  746 gaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggtagagaagaggtttggagggcaaggttgat-------------tgtgtaggaagtcagct 660  T
Q  235 taggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatgttgtaatg 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  659 taggttgattacgatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgttgtaatg 560  T
Q  335 --------aaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacccttatgccnnnnnnnnttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcga 426  Q
            ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||    
T  559 ttgtaatgaaaagaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagt-ttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatc---------ga 470  T
Q  427 tcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaag 526  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  469 tcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgccgaacaaagtaaaaag 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1191 - 1083
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatttttt-gattcaattcaaaattcaaaaatcagtggtcattgttgaagattcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1191 atgtcaatgttcttccccaattcaaaaaatttaagaccctaatttttttgattcaattcaaaattcaaaaaccagtggtcattgttgaagattcggtgtt 1092  T
Q  120 tagaaatga 128  Q
     ||||||||    
T  1091 cagaaatga 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 5)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 381 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4094
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4257 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 4158  T
Q  481 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4157 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 4094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 381 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5429 - 5266
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 480  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 5330  T
Q  481 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacattttg 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5329 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 5266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6880 - 6808
Alignment:
Q  21 atgtcaatgttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaatt--ttttgattcaattcaaaattcaaaaat 91  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  6880 atgtcaaatttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttttttgattaaattcgaaattcataaat 6808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 545 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 4071 - 4043
Alignment:
Q  545 tataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4071 tataccatcataagtcatatatttgatgt 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 545 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5243 - 5215
Alignment:
Q  545 tataccatcataagtcatatatttgatgt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5243 tataccatcataagtcatatatttgatgt 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 326
Target Start/End: Original strand, 1452 - 1643
Alignment:
Q  133 tggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtatgaagtgag 232  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1452 tggaagaaatgcaaggttgatgcagaagtcaaaggatacttgcaaagaagaggtttggagggcaaggt--atggataaagttgattgtgtaggaagtgaa 1549  T
Q  233 cttaggttgattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaacgttgtaatg 326  Q
     ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  1550 tttaggctgattaagatgttgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattatgccaagtctatgtaatgttgtaatg 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 446
Target Start/End: Original strand, 1686 - 1751
Alignment:
Q  381 ttcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaata 446  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1686 ttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaata 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1712 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1712
Description:

Target: scaffold1712; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Original strand, 1413 - 1450
Alignment:
Q  30 ttctttcccaattcaaaaaacttagaaccctaattttt 67  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1413 ttcttccccaattcaaaaaacttagaaccctaattttt 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University