View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF7699_high_9 (Length: 496)
Name: NF7699_high_9
Description: NF7699
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF7699_high_9 |
 | |
|
| [»] scaffold0440 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 30406669 - 30406207
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30406669 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
30406570 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30406569 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
30406470 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30406469 |
gcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
30406370 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30406369 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
30406270 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30406269 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
30406207 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Original strand, 41949101 - 41949565
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41949101 |
agaacttgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtagtcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
41949200 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41949201 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
41949300 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41949301 |
gcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
41949400 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41949401 |
tatgaatgctctaattttattgtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
41949500 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41949501 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattgtt |
41949565 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 43808349 - 43807887
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43808349 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
43808250 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
43808249 |
agattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaat |
43808150 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
||| ||||| | |||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43808149 |
gcttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
43808050 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
43808049 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
43807950 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
43807949 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
43807887 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 198550 - 198088
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
198550 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgtaatagtaagcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
198451 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
198450 |
agattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacaatgcagtatggtattctatttcctaaat |
198351 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
198350 |
gtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
198251 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
198250 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
198151 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
198150 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
198088 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 313387 - 312925
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
313387 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgtaatagtaagcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
313288 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
313287 |
agattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacaatgcagtatggtattctatttcctaaat |
313188 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
313187 |
gtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
313088 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
313087 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
312988 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
312987 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
312925 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 468
Target Start/End: Original strand, 1290615 - 1291070
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1290615 |
agaacatgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcacaaaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggtataatcagc |
1290714 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1290715 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagggtgatgagatacatcaaatgaacactgcagtatggcattttatttcctaaat |
1290814 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
1290815 |
gtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctaatgttgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagagtacctattcaaatt |
1290914 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1290915 |
tatgaatgcttcaatttcagggtgtgctaagaagcaacctgttgtggtattgtcaacttgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
1291014 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctat |
468 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
1291015 |
acagtatgacttgaaaatatactcaaggagatggagatagaagttaacagacctat |
1291070 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 33 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 31474001 - 31473557
Alignment:
| Q |
33 |
tgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtaaaccaag |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
31474001 |
tgttcaagcaaatagttggatcactaaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcaattggtataatcagtatattcatgaatgaaccaag |
31473902 |
T |
|
| Q |
133 |
agtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaaaattctctt |
232 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | | |
|
|
| T |
31473901 |
agcatctcattttctagcaaccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcatcctatttcctaagggtttcaatgaaaattttatg |
31473802 |
T |
|
| Q |
233 |
gagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcat |
332 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31473801 |
aaactgattgcatattctgatgttgattggtatggagacaagcaggatagaaaaagcacttcaggttacctattcaagtttctaaatgccccaatttcat |
31473702 |
T |
|
| Q |
333 |
ggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggcttgagaatat |
432 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31473701 |
ggtgtgttaagaagcaaccagttgtggcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcaggatgtatggcagcatgccaggcagtatggcttgaaaatat |
31473602 |
T |
|
| Q |
433 |
actcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31473601 |
actcaaggagacggagatagaagttagcagacctattgcattgtt |
31473557 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 24 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27436036 - 27435595
Alignment:
| Q |
24 |
atcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgag |
123 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || |||||||| |
|
|
| T |
27436036 |
atcctacactattcaaacaaattgtgggatcactaaggtatctatacaatagtaggccagatattgcatatgcagtaggaatcataagcaggttcatgag |
27435937 |
T |
|
| Q |
124 |
taaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaa |
223 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
27435936 |
tgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactagagtttggcattctatttcctaggtgtctggatgaa |
27435837 |
T |
|
| Q |
224 |
aattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctc |
323 |
Q |
| |
|
|| ||| | || | ||||| || ||| |||| |||||||||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
27435836 |
aactctatggaattaatagcttactctaatgcagattggtgtggagataagcaggatagaaaaagtacctcaggttacctattcaagtttctgaatgccc |
27435737 |
T |
|
| Q |
324 |
caatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggct |
423 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
27435736 |
caatttcatggtgtgctaagaagcaactagttgtggcattgtcaacctttgaatctgagtatattgcagggtgtatgacagcatgtcaggcagtatggct |
27435637 |
T |
|
| Q |
424 |
tgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacc |
465 |
Q |
| |
|
| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
27435636 |
ttaaaacatactcaaggagatggagatagaagtgagcagacc |
27435595 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17782978 - 17782650
Alignment:
| Q |
53 |
tcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcag |
152 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17782978 |
tcactaaggtatttgtgcaatagtaggcctaatattgtttatgcagttagcat---caataggttcatgactgaaccaagagcttctcacttgctagcag |
17782882 |
T |
|
| Q |
153 |
ccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctga |
252 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| ||| || |||||||| | | | |||| ||| | | || | ||||| | |||||| |
|
|
| T |
17782881 |
ctaaaagagtgatgagatacattaagggaacactagaatatgacatattgtttcctaaatgtctgactgaagattatatggattttatagcttcttctga |
17782782 |
T |
|
| Q |
253 |
tgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaacca |
352 |
Q |
| |
|
||| | |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17782781 |
tgcataatggtgtggggataagcaagatagaaaaaggacctcaggctacctattcaagtttctgaatgctctaatctcttagtgtgctaagaagcaacca |
17782682 |
T |
|
| Q |
353 |
gttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagta |
384 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17782681 |
gtgttaccattgtcaacatgtgaatctgagta |
17782650 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 27760688 - 27761150
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27760688 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcattgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
27760787 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27760788 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
27760887 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27760888 |
gcttaaatgaaaactctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
27760987 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27760988 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
27761087 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27761088 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
27761150 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7940949 - 7940487
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7940949 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
7940850 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7940849 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
7940750 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7940749 |
gcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
7940650 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7940649 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
7940550 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7940549 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
7940487 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 13828971 - 13828506
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13828971 |
agaacctgtggatcttacattgttcaaagaaattgtgggttcactgaggtatctatgaaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggtataatcagt |
13828872 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
13828871 |
agattaatgagtgaaccaagagtatctcatctgctagtagccaaaagagtgatgagatatatcaaaggaacactacattatggcatcttatttcctaaat |
13828772 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcac-ttcagggtacctattcaagt |
311 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | || || ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13828771 |
gtttgaatgaaaattctatggaactaatatcatattatgatgttgattggtgtgtagataagcaggataggaagagcacactcaggttacctattcaagt |
13828672 |
T |
|
| Q |
312 |
ttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcc |
411 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13828671 |
tcctgaatgccccaatttcatggtgtgctaagaagaaaccagttgtggcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtca |
13828572 |
T |
|
| Q |
412 |
ggcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
13828571 |
gacaatatggcttgaaaatatactcaagaagatggagatagaagttagtatacctattgcattgtt |
13828506 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 468
Target Start/End: Original strand, 22580229 - 22580673
Alignment:
| Q |
24 |
atcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgag |
123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
22580229 |
atcctacattgttcaagaaaattgtgggatcactaaggtatttatgcaatagtaggcctgatattgcttatgcagttggtgtaattagtaggttcatgag |
22580328 |
T |
|
| Q |
124 |
taaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaa |
223 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||| | | | |||| |
|
|
| T |
22580329 |
tgaaccaagagcttctcacttgctagaagctaaaagagtgatgagatacatcaaggggacactagaatatggcattttgtttcctaaatgtctgactgaa |
22580428 |
T |
|
| Q |
224 |
aattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctc |
323 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||| | || || || |||||||||||||| || | ||| ||| ||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
22580429 |
gattctatggaattgatagcttattctgatgcagattgctacggggataagcaagatagaaagagtaccttaggctacatattcaaatttctaaatgctc |
22580528 |
T |
|
| Q |
324 |
caatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggct |
423 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||| |||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
22580529 |
caatctcttggtgtgcttagaagcaacaagtggtagtattttcaacctgtgaatctgagtacattgcatgttgcctagcagcttgtcaagcagtttggct |
22580628 |
T |
|
| Q |
424 |
tgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctat |
468 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||| || ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
22580629 |
tgaagttatacttgaggagatggaaattgaggttaacaaacctat |
22580673 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 30379902 - 30379942
Alignment:
| Q |
41 |
caaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcc |
81 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30379902 |
caaattgttggttcactaaggtacctatgcaatagtaggcc |
30379942 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0440 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:
Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 6797 - 7259
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6797 |
agaacctgtgaatcctacattattcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
6896 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6897 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
6996 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6997 |
gcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
7096 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7097 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
7196 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7197 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
7259 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27569049 - 27568587
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27569049 |
agaacgtgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
27568950 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27568949 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatgacattttatttcctaagt |
27568850 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27568849 |
gcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattatgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
27568750 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27568749 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccaattgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
27568650 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27568649 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
27568587 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8316370 - 8315908
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8316370 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
8316271 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8316270 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
8316171 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8316170 |
gcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
8316071 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8316070 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
8315971 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8315970 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
8315908 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 186 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 17887538 - 17887247
Alignment:
| Q |
186 |
tgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaa |
285 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17887538 |
tgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatatcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaa |
17887439 |
T |
|
| Q |
286 |
gagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtat |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17887438 |
gagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgatccaatttcaccgtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtat |
17887339 |
T |
|
| Q |
386 |
attgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17887338 |
attgcagggtgtatggaagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattgtt |
17887247 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 332
Target Start/End: Original strand, 3596021 - 3596327
Alignment:
| Q |
24 |
atcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgag |
123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| || || || ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3596021 |
atcctacattgttcaagcatattgtgggatcactaaggtatatgtgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggtataatcagacgattcatgag |
3596120 |
T |
|
| Q |
124 |
taaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaa |
223 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
3596121 |
tgaaccaagagcatctcacctgctagcagctaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactagagtat-gcattttgtttcctaaatgtataaatgaa |
3596219 |
T |
|
| Q |
224 |
aattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctc |
323 |
Q |
| |
|
|| ||| || | ||| | ||||||||||| ||||||| ||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3596220 |
aactctacggaatttataacttattctgatgcagattggt-tgggaataagcgagataggaagagcacatcaggttacctattcaagtttctgaatgctc |
3596318 |
T |
|
| Q |
324 |
caatttcat |
332 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
3596319 |
caatttcat |
3596327 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 23255807 - 23256140
Alignment:
| Q |
53 |
tcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcag |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23255807 |
tcactgaggtatttgtgcaatagaaggcctgatattgcttatgcacttggcataattagcatgttcgtgagtgaaccaagagcttctcacttgcaagcag |
23255906 |
T |
|
| Q |
153 |
ccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctga |
252 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| || || | |||||||| | | | | || ||||| | ||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23255907 |
ctaaaagggtgatgagatacatcaattgaatactagagtaaggtatactgtttcctaaatgtctgacttaagattctatggagttgatagcttattctga |
23256006 |
T |
|
| Q |
253 |
tgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaacca |
352 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| || || ||||||| ||||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23256007 |
tgcatattagtgtggggataagcaagatataaagagcaccttaggttacctatttaaatttctgaatgctccaatctcttggtgtgctaagaagcaacta |
23256106 |
T |
|
| Q |
353 |
gttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtata |
386 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23256107 |
gtggtagcattgtgaacatgtaaatctgagtata |
23256140 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15565558 - 15565406
Alignment:
| Q |
258 |
attggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgt |
357 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| | || | ||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| | | |
|
|
| T |
15565558 |
attggtgtggagataggcaagataggaaaagcacttcatgctaattgttcaaatttatgaatgctcttatatcatggtgtacaaagaagaaacctataat |
15565459 |
T |
|
| Q |
358 |
agcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtc |
410 |
Q |
| |
|
||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
15565458 |
ggcactttcaacttgtgaatctgagtacattgcagagtgtttagcagcatgtc |
15565406 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 54168210 - 54167748
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54168210 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
54168111 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54168110 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
54168011 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54168010 |
gcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
54167911 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
54167910 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
54167811 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54167810 |
gcaatatggcttgaaaatatacttaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
54167748 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 21849490 - 21849952
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21849490 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
21849589 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
21849590 |
agattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaat |
21849689 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21849690 |
gtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagtacttcagggtacctattcaagtt |
21849789 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21849790 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgaatatattgcagggtgtatggcagcatgttag |
21849889 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21849890 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
21849952 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Original strand, 43553585 - 43554047
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43553585 |
agaacatgtgagtcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatttatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
43553684 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| | |
|
|
| T |
43553685 |
ggattcatgagtgaaccaag--tatctcacctgctagtagccaaaagagtggtgagatacatcaaaggaacactgcaatatggtatcctatttcctaaat |
43553782 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43553783 |
gtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacaaataggatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
43553882 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43553883 |
tatgaatgctccaatttcacggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaa |
43553982 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
43553983 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaatagatggagatataggttagcagacctatggcattgtt |
43554047 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 53353837 - 53353384
Alignment:
| Q |
24 |
atcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgag |
123 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53353837 |
atcctacattgttcaagcaaattgtaggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcttgatattgcatatgcagttggtataatcagtagattcatgag |
53353738 |
T |
|
| Q |
124 |
taaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaa |
223 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
53353737 |
tgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagggtgatgagatacatcaaaggaacactacagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgat |
53353638 |
T |
|
| Q |
224 |
aattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctc |
323 |
Q |
| |
|
| |||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
53353637 |
agttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacaagcaggatagaaagagcacttcagggtacctatttaagttcttaaatgctc |
53353538 |
T |
|
| Q |
324 |
caatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggct |
423 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| || |
|
|
| T |
53353537 |
caatttcatggtgtgctaagaaacaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcaggatgtatgacagcatgtcaggcagtatgact |
53353438 |
T |
|
| Q |
424 |
tgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
53353437 |
tgaaaatatacttaaggaaatggagatagaggttagcagacctatagcattgtt |
53353384 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 474
Target Start/End: Original strand, 12022580 - 12023041
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12022580 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgtcggttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
12022679 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12022680 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
12022779 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12022780 |
gcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
12022879 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12022880 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
12022979 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaatt |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12022980 |
gcaatatggcttgaaaatatacttaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaatt |
12023041 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 474
Target Start/End: Original strand, 37681327 - 37681788
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37681327 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
37681426 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37681427 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
37681526 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37681527 |
gcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaaatt |
37681626 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37681627 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
37681726 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaatt |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
37681727 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagtagacctatagaatt |
37681788 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 7100240 - 7099778
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7100240 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
7100141 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7100140 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
7100041 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7100040 |
gcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
7099941 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7099940 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
7099841 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7099840 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
7099778 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 16797960 - 16798422
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16797960 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
16798059 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16798060 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
16798159 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16798160 |
gcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
16798259 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16798260 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
16798359 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16798360 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
16798422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 191 - 477
Target Start/End: Original strand, 10276673 - 10276959
Alignment:
| Q |
191 |
tatggcattttatttcctaagtacttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagca |
290 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10276673 |
tatgacattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagatca |
10276772 |
T |
|
| Q |
291 |
cttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgc |
390 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10276773 |
cttcatggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtggcattgtcaacttgtgaatctgagtatattgc |
10276872 |
T |
|
| Q |
391 |
agggtgtatggcagcatgtccggcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10276873 |
agggtgtatggcagcatgtcaaacaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatataattgtt |
10276959 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 26455101 - 26454678
Alignment:
| Q |
35 |
ttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtaaaccaagag |
134 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26455101 |
ttcaagcagattgttggatcactaaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatattcagttggtataattagtaggttcatgagtgaaccaagag |
26455002 |
T |
|
| Q |
135 |
tatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaaaattctcttga |
234 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | | ||||||| ||| | || |
|
|
| T |
26455001 |
tttctcatttgctagctgctaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactagagtatgtcattttgtttcctaaatgtctggatgaaaactctatgga |
26454902 |
T |
|
| Q |
235 |
gctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgc--tccaatttcat |
332 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
26454901 |
attgatatcttattctgatgcagattagtgtggggataagcaagataggaagagcacctcagattacctattcaagtttctaaatgcgatcca--ttcat |
26454804 |
T |
|
| Q |
333 |
ggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggcttgagaatat |
432 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||| | | |||||| ||||| |
|
|
| T |
26454803 |
ggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcactgtcaacttgtgaatctgagtacattgcaggatgtatgacagcttgtcaagcagtttagcttgaaaatat |
26454704 |
T |
|
| Q |
433 |
actcaaggagatggagatagaggtta |
458 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
26454703 |
actcaagaatatggaaatagaagtta |
26454678 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 367 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 40368112 - 40368004
Alignment:
| Q |
367 |
aacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacct |
466 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40368112 |
aacctgtgaatatgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacct |
40368013 |
T |
|
| Q |
467 |
attgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
40368012 |
atagaattg |
40368004 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Original strand, 10276578 - 10276674
Alignment:
| Q |
52 |
ttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgcta |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10276578 |
ttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgcta |
10276674 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 445
Target Start/End: Original strand, 25632030 - 25632450
Alignment:
| Q |
24 |
atcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgag |
123 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | || || || |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
25632030 |
atcctacattgttcaagaagatggtgggatcactgaggtatttgtgcaatattaggcgtgatattgcttatgcacatggtataattagtaggttcatgag |
25632129 |
T |
|
| Q |
124 |
taaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaa |
223 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||| ||| |||||| ||| || |||||||| | | | |||| |
|
|
| T |
25632130 |
tgaaccaagaacttctcacttgctagcagctaaaagggtcacgagatacattaagggaatactagagtatgacatattgtttcctaaatgtctgattgaa |
25632229 |
T |
|
| Q |
224 |
aattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctc |
323 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||| |||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||| | | | ||||| ||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
25632230 |
gatttcatggatttgatagcttatttcgatgcagattggtgtgga-ataagcaagatagaaagaacaccttatgctacctgttcaaatttctaaatgctc |
25632328 |
T |
|
| Q |
324 |
caatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggct |
423 |
Q |
| |
|
|| || ||||| ||||||||| ||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
25632329 |
tgatctcttggtgagctaagaagaaaccaatggcagccttgtcaacatgtgaatctgagtacattgcaggttgattggcagcctgtcaagcagtttggct |
25632428 |
T |
|
| Q |
424 |
tgagaatatactcaaggagatg |
445 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25632429 |
tgaatctatactaaaggagatg |
25632450 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 423
Target Start/End: Original strand, 30066763 - 30066935
Alignment:
| Q |
251 |
gatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaac |
350 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| | ||| | ||||| ||| |||||||||| || ||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
30066763 |
gatgcagattggtgtggagatatgcaagataggaaaagcacttcatgctacttgttcaaatttctgaatgctcctatatcatggtgtacaaaaaagcaac |
30066862 |
T |
|
| Q |
351 |
cagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggct |
423 |
Q |
| |
|
|| ||| | | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
30066863 |
ttgtattagtactttcaacttgtgaatctgagtacattgtagggtgtttagcagcatgtcaagcagtatggct |
30066935 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 36674342 - 36674804
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36674342 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
36674441 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36674442 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
36674541 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36674542 |
gcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
36674641 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
36674642 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
36674741 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36674742 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
36674804 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 35951304 - 35950840
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35951304 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
35951205 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35951204 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctactagcagccaaaagaatgatgagatatatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
35951105 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35951104 |
gcttaaatgaaaattctattgatctgatagcatattctgatgttgattggtgtggagacattcaagatagaaagagtacttcagggtacctattcaagtt |
35951005 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
35951004 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtggcattgtcaatctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
35950905 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35950904 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatataattgtt |
35950840 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 8054683 - 8055145
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8054683 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
8054782 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
8054783 |
agattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaat |
8054882 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8054883 |
gtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
8054982 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8054983 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
8055082 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8055083 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
8055145 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 26315304 - 26315766
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26315304 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
26315403 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26315404 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
26315503 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26315504 |
gcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
26315603 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26315604 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgagtctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
26315703 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26315704 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
26315766 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 43592686 - 43592223
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43592686 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcaccgaggtatttatgcaatagtcgacctgctattgcatatgcagttagcataatcagt |
43592587 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43592586 |
agattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagacaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttc-taagt |
43592488 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
43592487 |
gcttaaatgaaaattatattgagttgatagcatattataatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcatggtacctattcaaatt |
43592388 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
43592387 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtggcattgttaacctgtgaatttgagtatattacagggtgtatggcaacatgtcag |
43592288 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43592287 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatataattgtt |
43592223 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 396
Target Start/End: Original strand, 30646736 - 30647039
Alignment:
| Q |
92 |
tatgcagttggcataatcagtagattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagt |
191 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
30646736 |
tatgcaattggcata-tcagtagatttatgagtgaaccaagagcttctcacctaattgcagctaaaagggtgataagatacatcaagggaactatggagt |
30646834 |
T |
|
| Q |
192 |
atggcattttatttcctaagtacttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcac |
291 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||||| | |||||||| || | || |||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
30646835 |
atggcatatttttccctaaatgtataaatgaagcaactatggaattgatggcatactcatatgctgattggtgtggagataggcaagatagaaagagtac |
30646934 |
T |
|
| Q |
292 |
ttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgca |
391 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| | || || ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||| ||||||| |
|
|
| T |
30646935 |
ttgaggctacttgtttaaatttctaaatgctcaaatatcatggtgtgctaagaagcaaccggtggtagccttatcaacttgtgagtttgagtgtattgca |
30647034 |
T |
|
| Q |
392 |
gggtg |
396 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
30647035 |
tggtg |
30647039 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8893460 - 8893026
Alignment:
| Q |
40 |
gcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtaaaccaagagtatct |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8893460 |
gcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatct |
8893361 |
T |
|
| Q |
140 |
cacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtacttaaatgaaaattctcttgagctga |
239 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8893360 |
cacctgccagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttattttctaagtgcttaaataaaaattctattgagctga |
8893261 |
T |
|
| Q |
240 |
tagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgc |
339 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8893260 |
tagcatattctgatgttgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcaggatacctattcaagtttatgaatgctccaatttcatggtgtgc |
8893161 |
T |
|
| Q |
340 |
taagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccggcaatatggcttgagaatatactcaag |
439 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8893160 |
taagaagcacccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcaggcaatatagcttgaaaatatactcaaa |
8893061 |
T |
|
| Q |
440 |
gagatggagatagaggttagcagacctattgaatt |
474 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8893060 |
gagatggagatagaggttagcagacctatagaatt |
8893026 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Original strand, 44150849 - 44151311
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44150849 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgtaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
44150948 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
44150949 |
agattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaat |
44151048 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44151049 |
gtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
44151148 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
44151149 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
44151248 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44151249 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
44151311 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 50628797 - 50628332
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
50628797 |
agaacctgtgaatcctacacttttcaagcaaatagttggttcactgaagtatctatgtagtagttgacctgatattgtatatgcaattggcataatcagt |
50628698 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50628697 |
agattcatgagtgaaccaaaagtatctcacctactagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgacattttatttcctaagt |
50628598 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattct-gatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagt |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50628597 |
ggttaaatgaaaattctattgagctgataacatatttttgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagt |
50628498 |
T |
|
| Q |
312 |
ttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcc |
411 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50628497 |
ttatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtggcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtca |
50628398 |
T |
|
| Q |
412 |
ggcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
50628397 |
ggcaatatggcttgaaaatatactcaaggagatggagatagaagttagcagacctatagaattgtt |
50628332 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 477
Target Start/End: Original strand, 31358451 - 31358907
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31358451 |
agaacctgtgaatccaacattgttcaagcaaatagttggttcactaaggtatctatacaatagtatgcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
31358550 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31358551 |
agattca--------ccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgacattttatttcctaagt |
31358642 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31358643 |
gcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
31358742 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
31358743 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctaagtatattgcaggatgtatggcagtatgtcag |
31358842 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattgtt |
477 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
31358843 |
gcagtatggcttgaaaatatactcaatgagatggagatagaggttagcagacctatagcattgtt |
31358907 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 29258005 - 29258182
Alignment:
| Q |
33 |
tgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtaaaccaag |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29258005 |
tgttcaagcaaattgtgggatcactaaggtatcagtgcaatagtaaaccttatattgcttatgcagttggtataatcagtaggttcatgagtgaaccaag |
29258104 |
T |
|
| Q |
133 |
agtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaa |
210 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29258105 |
agcttctcacttgctagcagctaaaagagtgatgagatacatcaagggaacactatagtatggcattttgtttcctaa |
29258182 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 45731 - 45269
Alignment:
| Q |
13 |
agaacctgtgaatcctactctgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45731 |
agaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgtaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataatcagt |
45632 |
T |
|
| Q |
113 |
agattcatgagtaaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttatttcctaagt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
45631 |
agattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcctaaat |
45532 |
T |
|
| Q |
213 |
acttaaatgaaaattctcttgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
312 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45531 |
gtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcacttcagggtacctattcaagtt |
45432 |
T |
|
| Q |
313 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtccg |
412 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
45431 |
tatgaatgctccaatttcatggtgtgctaagaagcaaccagttgtagcattgtcaacctgtgaatctgagtatattgcagggtgtatggcagcatgtcag |
45332 |
T |
|
| Q |
413 |
gcaatatggcttgagaatatactcaaggagatggagatagaggttagcagacctattgaattg |
475 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45331 |
gcaatatggcttgaaaatatactcaaagagatggagatagaggttagcagacctatagaattg |
45269 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University