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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF7699_low_11 (Length: 546)
Name: NF7699_low_11
Description: NF7699
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF7699_low_11 |
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Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 511; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 37903073 - 37902543
Alignment:
| Q |
1 |
ttcccctgatgatcggaaaactatatttattgacaataatggtaacaaactttaaaatttacttttcttgtccccctctctggcagtgcatagaaagtat |
100 |
Q |
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| T |
37903073 |
ttcccctgatgatcggaaaactatatttattgacaataatggtaacaaactttaaaatttattttttttgtccccctctctggcagtgcatagaaagtat |
37902974 |
T |
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| Q |
101 |
ttttaatcactatgctgctaaatcttcaggattagaactgctgttgaatcttctccaatctacaaacccaaagcagaaaggtgatgcttcagcagcgctt |
200 |
Q |
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| T |
37902973 |
ttttaatcactatgctgctaaattttcaggattagaactgctgttgaatcttctccaatctacaaacccaaagcagaaaggtgatgcttcagcagcgctt |
37902874 |
T |
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| Q |
201 |
cacacaatggctatgaaagacatgtgttcctctattgttgatcctgcacctacatcaccaactccccaggtattttgcattttatttatcaaatgggctc |
300 |
Q |
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| T |
37902873 |
cacacaatggctatgaaagacatgtgttcctctattgttgatcctgctcctacatcaccaactccccaggtattttgcattttatttatcaaatgggctc |
37902774 |
T |
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| Q |
301 |
atcatatctagtttggttttttgttcttcacttgttgaagcatttgttccaagttatcataattgcacaattcaattgaagtttgaacttcttgtctttg |
400 |
Q |
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| T |
37902773 |
atcatatctagtttggttttttgttcttcacttgttgaagcatttgttccaagttatcataattgcacaattcaattgaagtttgaacttcttgtctttg |
37902674 |
T |
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| Q |
401 |
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500 |
Q |
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| T |
37902673 |
aaactgagttgttcatattctattttctatatattacggggatgaaaatggaaaatgagatctttgttttgtgttgtatgcaggtttacttgggtgagca |
37902574 |
T |
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| Q |
501 |
atatgtaaacaatcctaaactttctgatgtc |
531 |
Q |
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| T |
37902573 |
atacgtaaacaatcctaaactttctgatgtc |
37902543 |
T |
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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 37909584 - 37909054
Alignment:
| Q |
1 |
ttcccctgatgatcggaaaactatatttattgacaataatggtaacaaactttaaaatttacttttcttgtccccctctctggcagtgcatagaaagtat |
100 |
Q |
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37909584 |
ttcccctgatgatcggaaaactatatttattgacaataatggtaacaaactttaaaatttattttttttgtccccctctctggcagtgcatagaaagtat |
37909485 |
T |
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| Q |
101 |
ttttaatcactatgctgctaaatcttcaggattagaactgctgttgaatcttctccaatctacaaacccaaagcagaaaggtgatgcttcagcagcgctt |
200 |
Q |
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| T |
37909484 |
ttttaatcactatgctgctaaattttcaggattagaactgctgttgaatcttctccaatctacaaacccaaagcagaaaggtgatgcttcagcagcgctt |
37909385 |
T |
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| Q |
201 |
cacacaatggctatgaaagacatgtgttcctctattgttgatcctgcacctacatcaccaactccccaggtattttgcattttatttatcaaatgggctc |
300 |
Q |
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| T |
37909384 |
cacacaatggctatgaaagacatgtgttcctctattgttgatcctgctcctacatcaccaactccccaggtattttgcattttatttatcaaatgggctc |
37909285 |
T |
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| Q |
301 |
atcatatctagtttggttttttgttcttcacttgttgaagcatttgttccaagttatcataattgcacaattcaattgaagtttgaacttcttgtctttg |
400 |
Q |
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37909284 |
atcatatctagtttggttttttgttcttcacttgttgaagcatttgttccaagttatcataattgcacaattcaattgaagtttgaacttcttgtctttg |
37909185 |
T |
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| Q |
401 |
aaactgagttgttcatattctattttctatatattacggggatgaaaatggaaaatgagatctttgttttgtgttgtatgcaggtttacttgggtgagca |
500 |
Q |
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| T |
37909184 |
aaactgagttgttcatattctattttctatatattacggggatgaaaatggaaaatgagatctttgttttgtgttgtatgcaggtttacttgggtgagca |
37909085 |
T |
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501 |
atatgtaaacaatcctaaactttctgatgtc |
531 |
Q |
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| T |
37909084 |
atacgtaaacaatcctaaactttctgatgtc |
37909054 |
T |
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