View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7703_low_17 (Length: 414)

Name: NF7703_low_17
Description: NF7703
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7703_low_17
NF7703_low_17
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (8-386)||(46482-46860)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (8-386)||(38195729-38196107)
chr3 (8-386)||(39373058-39373437)
chr3 (8-386)||(28323701-28324080)
chr3 (8-386)||(8775680-8776040)
chr3 (8-252)||(18485129-18485373)
chr3 (8-337)||(12248329-12248658)
chr3 (8-310)||(23758314-23758616)
chr3 (8-266)||(13382153-13382413)
chr3 (8-266)||(13392747-13393007)
chr3 (8-267)||(4744814-4745074)
chr3 (8-267)||(5546505-5546765)
chr3 (8-265)||(5511772-5512030)
chr3 (8-265)||(5626861-5627118)
chr3 (8-265)||(12295704-12295961)
chr3 (8-265)||(41684753-41685010)
chr3 (8-265)||(5875146-5875404)
chr3 (8-209)||(9992794-9992998)
chr3 (8-265)||(24660994-24661251)
chr3 (8-265)||(16477355-16477615)
chr3 (8-265)||(24392956-24393214)
chr3 (8-209)||(6499864-6500068)
chr3 (8-180)||(6219538-6219710)
chr3 (8-181)||(19779600-19779773)
chr3 (98-317)||(10654248-10654464)
chr3 (10-181)||(16390427-16390598)
chr3 (8-182)||(37867664-37867838)
chr3 (8-182)||(37876182-37876356)
chr3 (8-178)||(20682617-20682787)
chr3 (8-178)||(14466815-14466985)
chr3 (8-178)||(13122889-13123059)
chr3 (15-196)||(29470675-29470856)
chr3 (303-386)||(18485049-18485132)
chr3 (8-102)||(10635920-10636014)
chr3 (243-315)||(9993040-9993111)
chr3 (247-315)||(6500112-6500179)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (8-386)||(27222360-27222738)
chr2 (8-386)||(35253972-35254351)
chr2 (8-386)||(35264581-35264960)
chr2 (8-337)||(9907060-9907389)
chr2 (8-266)||(40223392-40223651)
chr2 (8-265)||(43346459-43346717)
chr2 (8-265)||(9772231-9772492)
chr2 (8-265)||(10268043-10268300)
chr2 (8-265)||(10278620-10278877)
chr2 (8-265)||(11404345-11404607)
chr2 (38-266)||(34803301-34803530)
chr2 (8-180)||(24337264-24337436)
chr2 (8-182)||(29245393-29245567)
chr2 (8-182)||(43083835-43084009)
chr2 (8-178)||(22959203-22959373)
chr2 (8-177)||(4211085-4211254)
chr2 (8-41)||(34799692-34799725)
chr2 (8-41)||(35759242-35759275)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (8-386)||(13687498-13687877)
chr8 (8-364)||(36078953-36079290)
chr8 (94-386)||(44482103-44482396)
chr8 (8-266)||(15766081-15766343)
chr8 (8-266)||(15790218-15790480)
chr8 (8-267)||(32087203-32087463)
chr8 (8-265)||(209087-209345)
chr8 (8-265)||(722710-722968)
chr8 (8-265)||(29077808-29078066)
chr8 (8-265)||(242911-243168)
chr8 (8-265)||(796281-796538)
chr8 (8-265)||(3358139-3358396)
chr8 (8-265)||(36294027-36294285)
chr8 (8-265)||(9342233-9342490)
chr8 (8-182)||(26112468-26112642)
chr8 (8-182)||(19129938-19130112)
chr8 (8-178)||(6152292-6152462)
chr8 (8-76)||(44482435-44482503)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (8-386)||(24641288-24641667)
chr4 (8-386)||(27657621-27658000)
chr4 (8-386)||(18761969-18762346)
chr4 (8-265)||(451670-451928)
chr4 (8-265)||(30935979-30936237)
chr4 (8-265)||(21997510-21997768)
chr4 (8-265)||(36019430-36019687)
chr4 (8-265)||(10750056-10750313)
chr4 (8-265)||(10963825-10964082)
chr4 (8-209)||(55754716-55754918)
chr4 (8-182)||(24026926-24027100)
chr4 (8-180)||(17919294-17919466)
chr4 (8-182)||(19953843-19954017)
chr4 (8-178)||(16257112-16257282)
chr4 (10-182)||(40469482-40469654)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (8-386)||(35400043-35400422)
chr1 (8-386)||(35647568-35647947)
chr1 (8-386)||(3172540-3172920)
chr1 (8-386)||(47617437-47617795)
chr1 (8-364)||(5834189-5834524)
chr1 (8-265)||(12731549-12731807)
chr1 (8-265)||(12742142-12742400)
chr1 (8-265)||(7508340-7508597)
chr1 (8-265)||(36245931-36246188)
chr1 (8-265)||(51655375-51655632)
chr1 (8-267)||(38096121-38096383)
chr1 (8-182)||(4168401-4168575)
chr1 (8-182)||(19180085-19180259)
chr1 (8-180)||(21864824-21864996)
chr1 (8-180)||(5649257-5649429)
chr1 (8-178)||(12622677-12622847)
chr1 (15-196)||(153158-153339)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (8-386)||(11006172-11006552)
chr7 (8-386)||(42866834-42867193)
chr7 (8-364)||(1988566-1988903)
chr7 (8-337)||(466541-466869)
chr7 (8-266)||(2715185-2715444)
chr7 (8-265)||(9086334-9086592)
chr7 (8-265)||(26698677-26698935)
chr7 (8-265)||(40051652-40051909)
chr7 (8-267)||(8011635-8011897)
chr7 (8-265)||(24735831-24736088)
chr7 (8-265)||(26399644-26399902)
chr7 (8-265)||(11097114-11097376)
chr7 (8-183)||(21001956-21002131)
chr7 (8-182)||(5686723-5686897)
chr7 (8-182)||(9434427-9434601)
chr7 (8-182)||(6876791-6876965)
chr7 (10-184)||(19992966-19993140)
chr7 (8-180)||(22090372-22090544)
chr7 (8-178)||(4213219-4213389)
chr7 (8-178)||(17959623-17959793)
chr7 (8-176)||(8618587-8618755)
chr7 (8-178)||(168090-168260)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (8-364)||(35225084-35225419)
chr5 (94-385)||(36697303-36697595)
chr5 (8-267)||(9345562-9345822)
chr5 (8-265)||(23371531-23371789)
chr5 (8-265)||(23706378-23706636)
chr5 (8-265)||(36583523-36583781)
chr5 (8-265)||(42052390-42052648)
chr5 (8-265)||(24589078-24589336)
chr5 (8-265)||(30228470-30228728)
chr5 (8-265)||(14559082-14559340)
chr5 (8-265)||(15994307-15994565)
chr5 (8-267)||(15768362-15768624)
chr5 (8-265)||(6985320-6985577)
chr5 (8-265)||(14039619-14039876)
chr5 (8-265)||(22685025-22685282)
chr5 (8-265)||(23305868-23306125)
chr5 (8-265)||(24817866-24818123)
chr5 (8-265)||(27469583-27469840)
chr5 (8-265)||(31842987-31843245)
chr5 (8-267)||(37730970-37731234)
chr5 (8-267)||(17728498-17728762)
chr5 (8-267)||(31358115-31358379)
chr5 (8-265)||(39491912-39492169)
chr5 (8-209)||(14448106-14448308)
chr5 (8-209)||(17616641-17616843)
chr5 (8-267)||(27043229-27043491)
chr5 (8-181)||(39361270-39361443)
chr5 (8-182)||(5291675-5291849)
chr5 (8-182)||(27604554-27604728)
chr5 (12-184)||(31447510-31447682)
chr5 (8-180)||(40399989-40400161)
chr5 (8-178)||(22156074-22156244)
chr5 (47-196)||(1110282-1110431)
chr5 (15-196)||(20796650-20796831)
chr5 (8-76)||(36697196-36697264)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (94-386)||(4631834-4632127)
chr6 (94-385)||(32310650-32310942)
chr6 (94-386)||(27385360-27385653)
chr6 (94-386)||(27475773-27476066)
chr6 (8-266)||(12856014-12856273)
chr6 (8-267)||(3662408-3662668)
chr6 (8-265)||(25788794-25789052)
chr6 (8-265)||(26865858-26866116)
chr6 (8-265)||(27342794-27343051)
chr6 (8-265)||(27403534-27403791)
chr6 (8-265)||(17983618-17983880)
chr6 (8-265)||(26026486-26026743)
chr6 (8-265)||(16931460-16931718)
chr6 (8-209)||(12726317-12726519)
chr6 (8-183)||(9122013-9122188)
chr6 (8-184)||(27373931-27374107)
chr6 (8-184)||(27464284-27464460)
chr6 (10-182)||(25590360-25590532)
chr6 (8-178)||(34816655-34816825)
chr6 (8-176)||(32971358-32971526)
chr6 (91-182)||(7669375-7669466)
chr6 (8-76)||(27385692-27385760)
chr6 (8-76)||(27476105-27476173)
chr6 (8-76)||(4632166-4632234)
chr6 (8-76)||(32310543-32310611)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (94-386)||(2243-2535)
scaffold0454 (8-76)||(2574-2642)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (8-265)||(32231-32489)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (8-385)||(3424-3793)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (10-182)||(267-439)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (15-183)||(52481-52649)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (94-337)||(23641-23892)
scaffold0199 (8-76)||(23931-23999)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (10-72)||(3567-3629)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (133-209)||(3366-3442)
scaffold0398 (133-209)||(11621-11697)


Alignment Details
Target: scaffold0105 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 46482 - 46860
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46482 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 46581  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 46681  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46682 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttattg 46781  T
Q  308 tttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
     ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46782 attttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 46860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 38196107 - 38195729
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38196107 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 38196008  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38196007 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 38195908  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38195907 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttattg 38195808  T
Q  308 tttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
     ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38195807 attttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 38195729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39373437 - 39373058
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373437 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 39373338  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373337 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 39373238  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39373237 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 39373138  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373137 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 39373058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 28323701 - 28324080
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323701 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatctcaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 28323800  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323801 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 28323900  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28323901 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 28324000  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28324001 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctactactctg 28324080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8776040 - 8775680
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776040 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 8775941  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775940 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 8775841  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||       ||||        || ||||||||||||||||||||||||    
T  8775840 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatatta----tgtt------ctatt--------tttttttaactctaatgatatttattg 8775759  T
Q  308 tttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
     ||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775758 attttaatgtcacatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 8775680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18485373 - 18485129
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485373 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 18485274  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485273 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 18485174  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485173 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatatt 18485129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 12248329 - 12248658
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  12248329 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgctagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12248428  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12248429 tcagaagaaggatgatcagatcaagcatctcttagaacagttgtttaagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12248528  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  12248529 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttatt 12248627  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttctt 337  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  12248628 gtttttaatgtcttatgctctaatacttctt 12248658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23758616 - 23758314
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  23758616 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 23758517  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  23758516 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactaacttgttttttacttttgt 23758417  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    |||  ||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  23758416 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttatttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatacttttaattctgataatatttatt 23758318  T
Q  307 gttt 310  Q
    ||||    
T  23758317 gttt 23758314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 266
Target Start/End: Original strand, 13382153 - 13382413
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382153 tggacatcactcctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13382252  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg--tttttacttttg 205  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  13382253 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttacttttg 13382352  T
Q  206 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctga 266  Q
    ||||  ||||  || |||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  13382353 ttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctga 13382413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 266
Target Start/End: Original strand, 13392747 - 13393007
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392747 tggacatcactcctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13392846  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg--tttttacttttg 205  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  13392847 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttacttttg 13392946  T
Q  206 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctga 266  Q
    ||||  ||||  || |||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  13392947 ttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctga 13393007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4745074 - 4744814
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4745074 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 4744975  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4744974 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 4744875  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4744874 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctgaa 4744814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 5546505 - 5546765
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5546505 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5546604  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5546605 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 5546704  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5546705 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctgaa 5546765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5512030 - 5511772
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5512030 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5511931  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5511930 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 5511831  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  5511830 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 5511772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 5626861 - 5627118
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5626861 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 5626960  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5626961 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 5627060  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5627061 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 5627118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 12295704 - 12295961
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12295704 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 12295803  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12295804 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 12295903  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12295904 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 12295961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41685010 - 41684753
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41685010 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 41684911  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41684910 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 41684811  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41684810 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 41684753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 5875146 - 5875404
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5875146 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacaaagaatgagggaaaaggatgagctact 5875245  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5875246 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 5875345  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  5875346 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 5875404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 9992794 - 9992998
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9992794 tggacatcactcctttctatcccgaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9992893  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactc---tagcttgtttttactttt 204  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||     
T  9992894 taagaagaaggatgatcatatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactcttagcttgtttttactttg 9992993  T
Q  205 gttct 209  Q
    |||||    
T  9992994 gttct 9992998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24661251 - 24660994
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661251 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24661152  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24661151 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 24661052  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24661051 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 24660994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16477615 - 16477355
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16477615 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 16477516  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16477515 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 16477416  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatt--tataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  16477415 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatatattatcattgtttctg 16477355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 24392956 - 24393214
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24392956 tggacatcactcctttctattcagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24393055  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg--tttttacttttg 205  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24393056 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttacttttg 24393155  T
Q  206 ttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    ||||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24393156 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 24393214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 6499864 - 6500068
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6499864 tggacatcactcctttctatcaagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6499963  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac---tctagcttgtttttactttt 204  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |    
T  6499964 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatcttttggaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacacttttagcttgtttttacttgt 6500063  T
Q  205 gttct 209  Q
    |||||    
T  6500064 gttct 6500068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 6219538 - 6219710
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6219538 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6219637  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 180  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6219638 taagcagaaggatgaacaaattaagtatctcttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 6219710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19779773 - 19779600
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19779773 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcataagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19779674  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 181  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19779673 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc 19779600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Original strand, 10654248 - 10654464
Alignment:
Q  98 atgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttt 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10654248 atgagctacttcagaagaaagatgatcaaatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttt 10654347  T
Q  198 tacttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatg 297  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||||||  |||  |||  ||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| ||| ||     
T  10654348 tacttttgttctctgtagctttgcctttgta--ttatactttctttataaatatcatcattgtttat-aaatcatatgttctatacttttaattctgata 10654444  T
Q  298 atatttattgtttttaatat 317  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  10654445 atatttactgtttttaatat 10654464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 16390427 - 16390598
Alignment:
Q  10 gacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctactta 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16390427 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcagccagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 16390526  T
Q  110 agaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 181  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16390527 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 16390598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37867838 - 37867664
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37867838 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37867739  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37867738 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 37867664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37876356 - 37876182
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37876356 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37876257  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876256 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 37876182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 20682617 - 20682787
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20682617 tggacatcactcctttctatacagaagaagagtacatcacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 20682716  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20682717 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 20682787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14466985 - 14466815
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14466985 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 14466886  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14466885 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 14466815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13123059 - 13122889
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| | ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13123059 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcattctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 13122960  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13122959 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 13122889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 196
Target Start/End: Original strand, 29470675 - 29470856
Alignment:
Q  15 cactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||| |||||||||||| |||||||   | ||| ||| |||| | ||||||||| | |||| |||||    
T  29470675 cactcctttctatccagaagatgaggacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 29470774  T
Q  115 aaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 196  Q
    || |||||  |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  29470775 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgcttgttt 29470856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 303 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18485132 - 18485049
Alignment:
Q  303 tattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    ||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485132 tattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 18485049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Original strand, 10635920 - 10636014
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgag 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  10635920 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaaatgagagaaaaggatgag 10636014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 315
Target Start/End: Original strand, 9993040 - 9993111
Alignment:
Q  243 tataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattgtttttaat 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993040 tataaatattatcattatttctgaaaaat-atgttctacagttttaactctaatgatatttattgtttttaat 9993111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 315
Target Start/End: Original strand, 6500112 - 6500179
Alignment:
Q  247 aatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattgtttttaat 315  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6500112 aatattatcattgtttctgaaaaat-atgttctacagttttaactctgatgatgtttattgtttttaat 6500179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27222738 - 27222360
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222738 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27222639  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222638 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 27222539  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27222538 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttattg 27222439  T
Q  308 tttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
     ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222438 attttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 27222360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 35254351 - 35253972
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254351 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35254252  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254251 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 35254152  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35254151 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 35254052  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254051 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 35253972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 35264960 - 35264581
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264960 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35264861  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264860 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 35264761  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35264760 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 35264661  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264660 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 35264581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 9907060 - 9907389
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  9907060 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 9907159  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9907160 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagtaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 9907259  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    |||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  9907260 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aaatcatatgttctatacttttaattctgataatatttatt 9907358  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttctt 337  Q
    ||||||||| || |||| ||| ||| |||||    
T  9907359 gtttttaatgtcttatgctctcatatttctt 9907389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40223651 - 40223392
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223651 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 40223552  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  40223551 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 40223452  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaa-ccttcatttataaatattatcattgtttctga 266  Q
    |||  ||||  || |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  40223451 tcttagtagctttgtctttgtatcttaatccttc-tttatatatattatcattgtttctga 40223392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43346717 - 43346459
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346717 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 43346618  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43346617 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 43346518  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  43346517 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 43346459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 9772231 - 9772492
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  9772231 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 9772330  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----tttttacttt 203  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||    
T  9772331 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttttacttt 9772430  T
Q  204 tgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    ||||||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  9772431 tgttcttcgtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgtttctg 9772492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10268300 - 10268043
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10268300 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10268201  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | |||| || |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10268200 tcagaaaaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 10268101  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10268100 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 10268043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10278877 - 10278620
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10278877 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10278778  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | |||| || |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10278777 tcagaaaaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 10278678  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10278677 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 10278620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 11404345 - 11404607
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404345 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 11404444  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttt-----actt 202  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  11404445 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttttttactt 11404544  T
Q  203 ttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||||||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  11404545 ttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 11404607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 266
Target Start/End: Original strand, 34803301 - 34803530
Alignment:
Q  38 agtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatct 137  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||    
T  34803301 agtacatcacaagggttgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgaactacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatct 34803400  T
Q  138 cttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaacc 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| ||||| |    
T  34803401 cttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatc 34803500  T
Q  237 ttcatttataaatattatcattgtttctga 266  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  34803501 tttctttatatatattatcattgtttctga 34803530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 24337264 - 24337436
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24337264 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 24337363  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 180  Q
     |||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24337364 caagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 24337436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29245567 - 29245393
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29245567 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 29245468  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245467 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 29245393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43084009 - 43083835
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43084009 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 43083910  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083909 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 43083835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 22959203 - 22959373
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22959203 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 22959302  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22959303 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 22959373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4211254 - 4211085
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4211254 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 4211155  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcac 177  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4211154 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac 4211085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 41
Target Start/End: Original strand, 34799692 - 34799725
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagta 41  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34799692 tggacatcactcctttctatccagaagaagagta 34799725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 41
Target Start/End: Original strand, 35759242 - 35759275
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagta 41  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35759242 tggacatcactcctttctatccagaagaagagta 35759275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 13687498 - 13687877
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687498 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13687597  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687598 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 13687697  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13687698 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 13687797  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687798 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 13687877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36079290 - 36078953
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36079290 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36079191  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36079190 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 36079091  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36079090 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaata--------------------ttatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 36079011  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttattt 364  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36079010 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttattt 36078953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 94 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44482396 - 44482103
Alignment:
Q  94 aaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44482396 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagctgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 44482297  T
Q  194 tttttacttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattctttt-aactc 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  44482296 ttcttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaactc 44482197  T
Q  293 taatgatatttattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44482196 taatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 44482103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 266
Target Start/End: Original strand, 15766081 - 15766343
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15766081 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaagaatgagctact 15766180  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----tttttacttt 203  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  15766181 ttagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttacttt 15766280  T
Q  204 tgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctga 266  Q
    ||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15766281 tgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctga 15766343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 266
Target Start/End: Original strand, 15790218 - 15790480
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15790218 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 15790317  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----tttttacttt 203  Q
    | ||||||| |||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  15790318 ttagaagaaggatgatcggatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttacttt 15790417  T
Q  204 tgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctga 266  Q
    ||||||  ||||  || |||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15790418 tgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctga 15790480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 32087203 - 32087463
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32087203 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 32087302  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32087303 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 32087402  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32087403 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctgaa 32087463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 209087 - 209345
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209087 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 209186  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  209187 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209286  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  209287 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 209345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 722710 - 722968
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  722710 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 722809  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  722810 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 722909  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  722910 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 722968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29078066 - 29077808
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078066 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 29077967  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29077966 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 29077867  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  29077866 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 29077808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 243168 - 242911
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  243168 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 243069  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  243068 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttactttgtt 242969  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    ||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  242968 cttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 242911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 796538 - 796281
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  796538 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 796439  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  796438 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttactttgtt 796339  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    ||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  796338 cttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 796281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 3358139 - 3358396
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358139 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 3358238  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3358239 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 3358338  T
Q  207 tctgtgtagtct-tatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||| ||| | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3358339 tcttcgta-tctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 3358396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36294285 - 36294027
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36294285 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagagaaaaggatgagctact 36294186  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36294185 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 36294086  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaa-ccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36294085 tctcagtagctgtgtctttgtatcttaatccttc-tttatatatattatcattgtttctg 36294027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9342490 - 9342233
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342490 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 9342391  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagc-ttgtttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9342390 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcatattttttacttttgt 9342291  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9342290 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 9342233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26112642 - 26112468
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26112642 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 26112543  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112542 taagcagaaggatgaacaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 26112468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19130112 - 19129938
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19130112 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19130013  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| ||| |  |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19130012 taagaagaaggatcagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 19129938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6152462 - 6152292
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6152462 tggacatcactcctttctatcgagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 6152363  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || |||||  ||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6152362 caaaaagaagaatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 6152292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 44482503 - 44482435
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcata 76  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  44482503 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcata 44482435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24641667 - 24641288
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641667 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 24641568  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641567 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 24641468  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24641467 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 24641368  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641367 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 24641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27658000 - 27657621
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27658000 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27657901  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657900 taaaaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 27657801  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27657800 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 27657701  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657700 gtttttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 27657621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 18761969 - 18762346
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18761969 tggacatcactcctttctatccagaagaggaatacatcacatgggctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 18762068  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18762069 taagaagaaagatgaacaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttactcttgtt 18762168  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattg 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18762169 ctgtgtagttttatctttgtaccttaaccttc-cttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctctattcttttaactctaatgatatttattg 18762267  T
Q  308 tttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18762268 tttttaatgtcctatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 18762346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 451928 - 451670
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  451928 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 451829  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  451828 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 451729  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  451728 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgtttctg 451670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 30935979 - 30936237
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  30935979 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 30936078  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30936079 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 30936178  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  30936179 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgtttctg 30936237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21997768 - 21997510
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  21997768 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 21997669  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21997668 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 21997569  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21997568 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgtttctg 21997510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36019687 - 36019430
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36019687 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 36019588  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36019587 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacaattgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 36019488  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36019487 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 36019430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 10750056 - 10750313
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750056 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10750155  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10750156 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 10750255  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10750256 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 10750313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 10963825 - 10964082
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10963825 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10963924  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10963925 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 10964024  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10964025 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 10964082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 55754716 - 55754918
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55754716 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 55754815  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55754816 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 55754915  T
Q  207 tct 209  Q
    |||    
T  55754916 tct 55754918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 24026926 - 24027100
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24026926 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 24027025  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24027026 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 24027100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17919466 - 17919294
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17919466 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17919367  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 180  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17919366 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagaaagcccaaccttagttgcacacc 17919294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 19953843 - 19954017
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19953843 tggacatcactcctttctacccagaagaatagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaataagggaaaaggatgagctact 19953942  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
     |||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19953943 caagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagtccaaccttagttgcacaccca 19954017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16257282 - 16257112
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16257282 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 16257183  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16257182 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 16257112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 40469482 - 40469654
Alignment:
Q  10 gacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctactta 109  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40469482 gacaacactcccttctatctagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 40469581  T
Q  110 agaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||| || || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40469582 agaagaaggatgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccca 40469654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 35400043 - 35400422
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400043 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35400142  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400143 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 35400242  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35400243 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 35400342  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400343 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 35400422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 35647568 - 35647947
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647568 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35647667  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647668 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 35647767  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35647768 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 35647867  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647868 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 35647947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3172920 - 3172540
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172920 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 3172821  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172820 taaaaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 3172721  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta--ttcttttaactctaatgatatttat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  3172720 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttttaactctaatgatatttat 3172621  T
Q  306 tgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172620 tgtttttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 3172540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 47617437 - 47617795
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47617437 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 47617536  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47617537 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-ttttacttttgtt 47617635  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47617636 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaat--------------------attatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 47617715  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47617716 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctactactctg 47617795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5834524 - 5834189
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5834524 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5834425  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5834424 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 5834325  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5834324 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaata--------------------ttatgttctatt-ttttaactctaatgatatttattg 5834246  T
Q  308 tttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttattt 364  Q
     ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5834245 attttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttattt 5834189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12731807 - 12731549
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  12731807 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12731708  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12731707 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12731608  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  12731607 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgtttctg 12731549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12742400 - 12742142
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  12742400 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12742301  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12742300 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12742201  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  12742200 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgtttctg 12742142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7508597 - 7508340
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508597 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 7508498  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7508497 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 7508398  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7508397 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 7508340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 36245931 - 36246188
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36245931 tggacatcactcctttctatccataagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36246030  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36246031 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 36246130  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  36246131 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 36246188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 51655375 - 51655632
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51655375 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 51655474  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51655475 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 51655574  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  51655575 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 51655632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38096383 - 38096121
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38096383 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 38096284  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | | ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38096283 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 38096184  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatt--tataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  38096183 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgtttctgaa 38096121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4168575 - 4168401
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4168575 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 4168476  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168475 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 4168401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19180259 - 19180085
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19180259 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19180160  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180159 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 19180085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21864996 - 21864824
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21864996 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaacaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 21864897  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 180  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21864896 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc 21864824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 5649257 - 5649429
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5649257 tggacatcactcctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5649356  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 180  Q
     || ||||| |||||  | || |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5649357 caataagaaggatgagcagattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 5649429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 12622677 - 12622847
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12622677 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 12622776  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| || ||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12622777 caaaaagaaggacgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 12622847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 196
Target Start/End: Original strand, 153158 - 153339
Alignment:
Q  15 cactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||   | ||| ||| |||| | |||| |||| | |||| |||||    
T  153158 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaagaatgaacaacttcagaag 153257  T
Q  115 aaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 196  Q
    || |||||  |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  153258 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgcttgttt 153339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11006552 - 11006172
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006552 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 11006453  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006452 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 11006353  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta--ttcttttaactctaatgatatttat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  11006352 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttttaactctaatgatatttat 11006253  T
Q  306 tgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    || ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11006252 tgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctactactctg 11006172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 42867193 - 42866834
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42867193 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 42867094  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42867093 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 42866994  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42866993 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaata--------------------ttatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 42866914  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42866913 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 42866834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1988903 - 1988566
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1988903 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 1988804  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988803 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 1988704  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttcta-ttcttttaactctaatgatatttatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1988703 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaata--------------------ttatgttctattttttttaactctaatgatatttatt 1988624  T
Q  307 gtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttattt 364  Q
    | ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1988623 gattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttattt 1988566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 337
Target Start/End: Original strand, 466541 - 466869
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  466541 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 466640  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466641 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 466740  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattg 307  Q
    ||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | || |  |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  466741 cttagtagctttctctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttat-aactcatatgttctatacttttaattctgataatatttattg 466839  T
Q  308 tttttaatatcctatgatctaatacttctt 337  Q
    |||||||| || |||| ||| ||| |||||    
T  466840 tttttaatgtcttatgctctcatatttctt 466869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 266
Target Start/End: Original strand, 2715185 - 2715444
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2715185 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 2715284  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | | ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2715285 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 2715384  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctga 266  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  2715385 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctga 2715444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9086592 - 9086334
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9086592 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 9086493  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9086492 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 9086393  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  9086392 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 9086334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 26698677 - 26698935
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26698677 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 26698776  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26698777 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacatccaactctagcttgttttttacttttgt 26698876  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  26698877 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 26698935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 40051652 - 40051909
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40051652 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaataatgagggaaaaggatgagctact 40051751  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40051752 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 40051851  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40051852 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 40051909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 8011635 - 8011897
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8011635 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 8011734  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8011735 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 8011834  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatt--tataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  8011835 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgtttctgaa 8011897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24736088 - 24735831
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24736088 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24735989  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24735988 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 24735889  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24735888 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 24735831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 26399644 - 26399902
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26399644 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 26399743  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26399744 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaactgttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 26399843  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  26399844 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 26399902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11097376 - 11097114
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaag-ggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctac 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11097376 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagtggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctac 11097277  T
Q  107 ttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt----ttttactt 202  Q
    || ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  11097276 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttactt 11097177  T
Q  203 ttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||||||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  11097176 ttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 11097114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 21001956 - 21002131
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21001956 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 21002055  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 183  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002056 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 21002131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5686897 - 5686723
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5686897 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5686798  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5686797 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 5686723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9434601 - 9434427
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9434601 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9434502  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434501 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 9434427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Original strand, 6876791 - 6876965
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6876791 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6876890  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876891 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 6876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 19992966 - 19993140
Alignment:
Q  10 gacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctactta 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19992966 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcatgctggattcaaaagaagaatgagagaaaaggatgagttactta 19993065  T
Q  110 agaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 184  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19993066 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 19993140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22090544 - 22090372
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090544 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaaccagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 22090445  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 180  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22090444 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc 22090372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4213389 - 4213219
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4213389 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaatgatgagctact 4213290  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4213289 caagaagaaggatgagaaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 4213219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 17959623 - 17959793
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17959623 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17959722  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17959723 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 17959793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8618755 - 8618587
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  8618755 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaataagaatgagggaaaaggatgagctact 8618656  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgca 176  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8618655 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca 8618587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 168260 - 168090
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  168260 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 168161  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  168160 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Original strand, 35225084 - 35225419
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35225084 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35225183  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35225184 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgtt 35225283  T
Q  208 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgatatttattg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35225284 ctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaat--------------------attatgttctatt-ttttaactctaatgatatttattg 35225362  T
Q  308 tttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttattt 364  Q
     ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35225363 attttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttattatgtttttattt 35225419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 94 - 385
Target Start/End: Original strand, 36697303 - 36697595
Alignment:
Q  94 aaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36697303 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 36697402  T
Q  194 tttttacttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattctttt-aactc 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  36697403 ttcttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaactc 36697502  T
Q  293 taatgatatttattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactct 385  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36697503 taatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactct 36697595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 9345562 - 9345822
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345562 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 9345661  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9345662 ttagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 9345761  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9345762 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctgaa 9345822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 23371531 - 23371789
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371531 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 23371630  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23371631 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 23371730  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  23371731 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 23371789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 23706378 - 23706636
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706378 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 23706477  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23706478 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 23706577  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  23706578 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 23706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36583781 - 36583523
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36583781 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36583682  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36583681 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 36583582  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  36583581 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 36583523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 42052390 - 42052648
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42052390 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 42052489  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42052490 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 42052589  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  42052590 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 42052648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24589336 - 24589078
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24589336 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgaggtaaaaggatgagctact 24589237  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24589236 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 24589137  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  24589136 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 24589078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30228728 - 30228470
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30228728 tggacattactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 30228629  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30228628 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 30228529  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  30228528 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 30228470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14559340 - 14559082
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14559340 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14559241  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14559240 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 14559141  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  14559140 tctcagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 14559082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15994565 - 15994307
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | |||||||| |||||||||||    
T  15994565 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaatgatgagctact 15994466  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15994465 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 15994366  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  15994365 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgtttctg 15994307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 15768362 - 15768624
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15768362 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 15768461  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15768462 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 15768561  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatt--tataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  15768562 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgtttctgaa 15768624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 6985320 - 6985577
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6985320 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 6985419  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6985420 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 6985519  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6985520 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 6985577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 14039619 - 14039876
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039619 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14039718  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14039719 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 14039818  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14039819 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 14039876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 22685025 - 22685282
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22685025 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 22685124  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22685125 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 22685224  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22685225 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 22685282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 23305868 - 23306125
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23305868 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 23305967  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23305968 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 23306067  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23306068 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 23306125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24818123 - 24817866
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818123 tggacatcaatcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24818024  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24818023 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 24817924  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24817923 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 24817866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 27469583 - 27469840
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27469583 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 27469682  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27469683 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 27469782  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27469783 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 27469840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 31842987 - 31843245
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  31842987 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 31843086  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31843087 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatttcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 31843186  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||  || |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31843187 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgtttctg 31843245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37731234 - 37730970
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37731234 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37731135  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37731134 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 37731035  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaa-ccttcatt---tataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  37731034 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgtttctgaa 37730970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 17728498 - 17728762
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17728498 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 17728597  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17728598 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 17728697  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaa-ccttcatt---tataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  17728698 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgtttctgaa 17728762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Original strand, 31358115 - 31358379
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31358115 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 31358214  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31358215 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 31358314  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaa-ccttcatt---tataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| ||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  31358315 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgtttctgaa 31358379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39492169 - 39491912
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39492169 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgaggaaaaaggatgagctact 39492070  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39492069 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 39491970  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39491969 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 39491912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14448308 - 14448106
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14448308 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14448209  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14448208 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 14448109  T
Q  207 tct 209  Q
    |||    
T  14448108 tct 14448106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 17616641 - 17616843
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17616641 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 17616740  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17616741 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 17616840  T
Q  207 tct 209  Q
    |||    
T  17616841 tct 17616843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27043491 - 27043229
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27043491 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 27043392  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27043391 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactccaacttgttttttacttttgt 27043292  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatt--tataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27043291 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgtttctgaa 27043229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Original strand, 39361270 - 39361443
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39361270 tggacatcactcctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 39361369  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 181  Q
     |||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39361370 caagaagaatgatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc 39361443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5291849 - 5291675
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5291849 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattataagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5291750  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5291749 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaatagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 5291675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27604728 - 27604554
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27604728 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaaggactgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27604629  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604628 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 27604554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 31447510 - 31447682
Alignment:
Q  12 catcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaag 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  31447510 catcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcag 31447609  T
Q  112 aagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 184  Q
    ||||| |||||  |||| |||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31447610 aagaaggatgagcaaattaagtatattttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 31447682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Original strand, 40399989 - 40400161
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40399989 tggacatcactcctttctatccagaagaagaatacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 40400088  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 180  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40400089 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccctagttgcacacc 40400161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 22156074 - 22156244
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22156074 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 22156173  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22156174 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 22156244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1110431 - 1110282
Alignment:
Q  47 caagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaaca 146  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||   | ||| ||| |||| | ||||||||| | |||| ||||||| |||||  |||| |||||||| || |||||    
T  1110431 caaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcaaattaagtatctattggaaca 1110332  T
Q  147 gctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 196  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  1110331 gttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgcttgttt 1110282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 196
Target Start/End: Original strand, 20796650 - 20796831
Alignment:
Q  15 cactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||  ||| ||||||||  || |||   | ||||||| |||| | ||||||||| | |||| |||||    
T  20796650 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaagaactgttagaattcaagccgggttgaaaagaagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 20796749  T
Q  115 aaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 196  Q
    || |||||  | || || ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  20796750 aaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgcttgttt 20796831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 36697196 - 36697264
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcata 76  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  36697196 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcata 36697264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 94 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4632127 - 4631834
Alignment:
Q  94 aaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632127 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 4632028  T
Q  194 tttttacttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattctttt-aactc 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  4632027 ttcttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaactc 4631928  T
Q  293 taatgatatttattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4631927 taatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 4631834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 94 - 385
Target Start/End: Original strand, 32310650 - 32310942
Alignment:
Q  94 aaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32310650 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 32310749  T
Q  194 tttttacttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattctttt-aactc 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  32310750 ttcttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaactc 32310849  T
Q  293 taatgatatttattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactct 385  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32310850 taatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactct 32310942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 94 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27385653 - 27385360
Alignment:
Q  94 aaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27385653 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 27385554  T
Q  194 tttttacttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattctttt-aactc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  27385553 tttttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcaatgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaactc 27385454  T
Q  293 taatgatatttattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27385453 taatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgattcttcttctgtttttatttggttatatgctctgctactctg 27385360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 94 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27476066 - 27475773
Alignment:
Q  94 aaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27476066 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 27475967  T
Q  194 tttttacttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattctttt-aactc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  27475966 tttttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcaatgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaactc 27475867  T
Q  293 taatgatatttattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27475866 taatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgattcttcttctgtttttatttggttatatgctctgctactctg 27475773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12856273 - 12856014
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856273 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 12856174  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12856173 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12856074  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaa-ccttcatttataaatattatcattgtttctga 266  Q
    |||  ||||  || |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12856073 tcttagtagctttgtctttgtatcttaatccttc-tttatatatattatcattgtttctga 12856014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3662668 - 3662408
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3662668 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 3662569  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3662568 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 3662469  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaa 267  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3662468 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctgaa 3662408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25789052 - 25788794
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25789052 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 25788953  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25788952 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 25788853  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  25788852 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 25788794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26866116 - 26865858
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866116 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 26866017  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26866016 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 26865917  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  26865916 tcttagtagctatgtccttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 26865858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27343051 - 27342794
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27343051 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27342952  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27342951 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 27342852  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27342851 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 27342794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27403791 - 27403534
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27403791 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27403692  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27403691 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 27403592  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27403591 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 27403534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Original strand, 17983618 - 17983880
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983618 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17983717  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttt-----actt 202  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  17983718 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttttttactt 17983817  T
Q  203 ttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||||||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  17983818 ttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 17983880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26026743 - 26026486
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26026743 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 26026644  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26026643 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 26026544  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26026543 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatattatcattgtttctg 26026486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16931718 - 16931460
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931718 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 16931619  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16931618 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagtngtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 16931519  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatat-tatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | || ||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  16931518 tcttagtagctgtgtccttgtatcttaatcttc-tttatatatatatatcattgtttctg 16931460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 12726317 - 12726519
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726317 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 12726416  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 206  Q
    | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12726417 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 12726516  T
Q  207 tct 209  Q
    |||    
T  12726517 tct 12726519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 9122013 - 9122188
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9122013 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9122112  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 183  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122113 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 9122188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27374107 - 27373931
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27374107 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27374008  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 184  Q
    | ||||||| |||||  |||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374007 tcagaagaaggatgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 27373931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27464460 - 27464284
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27464460 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27464361  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 184  Q
    | ||||||| |||||  |||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27464360 tcagaagaaggatgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 27464284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25590532 - 25590360
Alignment:
Q  10 gacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctactta 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||  || |||||| ||||| || |||||||| || ||||    
T  25590532 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgaacttctta 25590433  T
Q  110 agaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590432 agaagaaggatgagcaaattaagtacctcttagaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 25590360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 34816655 - 34816825
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34816655 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 34816754  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 178  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34816755 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 34816825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 32971358 - 32971526
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32971358 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaatgatgagctact 32971457  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgca 176  Q
     || ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32971458 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca 32971526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 182
Target Start/End: Original strand, 7669375 - 7669466
Alignment:
Q  91 gaaaaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7669375 gaaaaggatgagctactcaagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 7669466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 27385760 - 27385692
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcata 76  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  27385760 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcata 27385692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 27476173 - 27476105
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcata 76  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  27476173 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcata 27476105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4632234 - 4632166
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcata 76  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  4632234 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcata 4632166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 32310543 - 32310611
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcata 76  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  32310543 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcata 32310611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 94 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2535 - 2243
Alignment:
Q  94 aaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2535 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 2436  T
Q  194 tttttacttttgttctgtg-tagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattctttt-aact 291  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  2435 ttcttacttttgttctgtgttagt-ttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaact 2337  T
Q  292 ctaatgatatttattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactctg 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2336 ctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttcttgctctgatacttcttatg-ttttatttggttatatgctctgctactctg 2243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 2642 - 2574
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcata 76  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||    
T  2642 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcata 2574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32489 - 32231
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32489 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 32390  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 206  Q
    | | ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32389 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 32290  T
Q  207 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctg 265  Q
    |||  ||||   | |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  32289 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgtttctg 32231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 385
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3793
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctact 107  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  3424 tggatatcactcccttctacccagaggaagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagagaaaattaagggaaaaggatgagctact 3523  T
Q  108 taagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttt-------ac 200  Q
    | ||||||| |||||  | ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||       ||    
T  3524 tcagaagaaggatgatcagatcagatatctcttagagcagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattctagctttttttttttttttac 3623  T
Q  201 ttttgttctgtgtagtcttatctttgtaccttaac-cttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattcttttaactctaatgat 299  Q
    |||||||||  ||||  ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  3624 ttttgttcttagtagctttatccttgtatcttaactcttc-tttataaatattatcattgtttattaaatcatatgttctatacttttaattctgatgat 3722  T
Q  300 atttattgtttttaatatcctatgatctaatacttcttgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgctactct 385  Q
    |||||||||||||||| || ||||               || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3723 atttattgtttttaatgtcttatg---------------ctttgatacatcttatgtttttatatggttatatgctctgctactct 3793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 267
Alignment:
Q  10 gacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctactta 109  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  439 gacaacactcctttctatccataagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 340  T
Q  110 agaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 182  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||| || || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  339 agaagaaggatgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccca 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 183
Target Start/End: Original strand, 52481 - 52649
Alignment:
Q  15 cactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcatataagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||   | ||| ||| |||| | ||||||||| | |||| |||||    
T  52481 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 52580  T
Q  115 aaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 183  Q
    || |||||  |||| |||||||| || |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52581 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagatgtataagcaagtcaaaccttagttgcacacccaa 52649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23641
Alignment:
Q  94 aaggatgagctacttaagaagaaagatgaaaaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || |   |||||||||| ||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23892 aaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacatctcttagagcagttaaagaaacaagcccaaccttagttgcacacccaatactagcttg 23793  T
Q  194 tttttacttttgtt--ctgt-------gtagtcttatctttgtaccttaac-cttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattc 283  Q
    |||||  |||| ||  || |       ||||  ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| |    
T  23792 ttttttttttttttaactttgcttttagtagctttatccttgtaacttaactcttc-tttataaatattatcattgtttgttaaatcatatgttctatac 23694  T
Q  284 ttttaactctaatgatatttattgtttttaatatcctatgatctaatacttctt 337  Q
    |||||  ||| || |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  23693 ttttacttctgataatatttattg-ttttaatatcttatgctctgatatttctt 23641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 23999 - 23931
Alignment:
Q  8 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctgggcata 76  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  23999 tggatatcactcctttctatccagaggcagattacatcacaagatctgctagaattcgagctgggcata 23931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3629 - 3567
Alignment:
Q  10 gacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagggctgctagaattcgtgctggg 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  3629 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaatacatgctggg 3567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 3366 - 3442
Alignment:
Q  133 tatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgttct 209  Q
    ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||  | |||||||||    
T  3366 tatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgcttgtttagatttttgttct 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 11621 - 11697
Alignment:
Q  133 tatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttacttttgttct 209  Q
    ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||  | |||||||||    
T  11621 tatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgcttgtttagatttttgttct 11697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University