View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7704_low_13 (Length: 440)

Name: NF7704_low_13
Description: NF7704
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7704_low_13
NF7704_low_13
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (64-334)||(23320324-23320595)
chr3 (120-402)||(20001724-20002011)
chr3 (120-329)||(26633433-26633646)
chr3 (131-334)||(30155214-30155423)
chr3 (131-306)||(3780907-3781082)
chr3 (187-333)||(28154952-28155101)
chr3 (189-333)||(3328883-3329030)
chr3 (165-333)||(26628095-26628268)
chr3 (165-400)||(32314982-32315219)
chr3 (165-333)||(36311213-36311385)
chr3 (165-333)||(48907362-48907535)
chr3 (165-307)||(27852851-27852994)
chr3 (187-402)||(1743334-1743553)
chr3 (120-333)||(22500665-22500885)
chr3 (120-401)||(40836181-40836469)
chr3 (187-333)||(4522039-4522188)
chr3 (120-274)||(10743422-10743579)
chr3 (187-332)||(31039048-31039196)
chr3 (165-306)||(8339040-8339183)
chr3 (165-306)||(8542671-8542814)
chr3 (135-306)||(33104970-33105145)
chr3 (120-247)||(49657939-49658067)
chr3 (165-331)||(23428691-23428862)
chr3 (120-333)||(46673117-46673337)
chr3 (186-287)||(4775934-4776036)
chr3 (131-336)||(22416356-22416571)
chr3 (187-306)||(25179663-25179780)
chr3 (165-273)||(25336418-25336527)
chr3 (120-333)||(33279655-33279875)
chr3 (187-333)||(28173799-28173948)
chr3 (184-307)||(35201094-35201216)
chr3 (190-306)||(13080982-13081098)
chr3 (187-333)||(25022733-25022882)
chr3 (165-306)||(9496316-9496458)
chr3 (187-333)||(22447810-22447963)
chr3 (131-215)||(3820941-3821026)
chr3 (121-263)||(18388842-18388989)
chr3 (238-333)||(32960713-32960810)
chr3 (189-306)||(34878629-34878746)
chr3 (126-274)||(48860723-48860874)
chr3 (165-275)||(26127037-26127146)
chr3 (9-54)||(23320251-23320296)
chr3 (165-333)||(26177026-26177196)
chr3 (120-265)||(27668128-27668272)
chr3 (238-333)||(6927606-6927704)
chr3 (120-177)||(31039223-31039280)
chr3 (186-306)||(46387681-46387794)
chr3 (231-306)||(3821011-3821086)
chr3 (236-306)||(32463519-32463590)
chr3 (165-215)||(43668501-43668552)
chr3 (190-254)||(34296531-34296596)
chr3 (353-402)||(36311152-36311201)
chr3 (257-306)||(43668583-43668632)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (120-334)||(2260447-2260665)
chr1 (187-332)||(16551714-16551863)
chr1 (120-306)||(29182100-29182289)
chr1 (123-334)||(4455111-4455332)
chr1 (120-306)||(21185221-21185407)
chr1 (131-332)||(22786055-22786260)
chr1 (187-401)||(48471864-48472082)
chr1 (165-333)||(19077995-19078167)
chr1 (165-333)||(19125885-19126057)
chr1 (120-333)||(24196274-24196495)
chr1 (186-336)||(18606751-18606904)
chr1 (165-333)||(24749859-24750032)
chr1 (187-333)||(4059592-4059741)
chr1 (165-306)||(24962014-24962157)
chr1 (120-273)||(10684807-10684965)
chr1 (165-333)||(3616860-3617033)
chr1 (186-402)||(16971934-16972154)
chr1 (188-333)||(27092922-27093070)
chr1 (120-333)||(46432286-46432507)
chr1 (120-333)||(2657583-2657802)
chr1 (165-333)||(43706724-43706896)
chr1 (186-402)||(9387776-9387999)
chr1 (122-249)||(21147992-21148126)
chr1 (187-334)||(29676164-29676314)
chr1 (131-333)||(2425249-2425458)
chr1 (235-333)||(9554271-9554372)
chr1 (120-332)||(28920727-28920942)
chr1 (120-304)||(26605379-26605563)
chr1 (165-274)||(51719254-51719364)
chr1 (186-333)||(47685185-47685335)
chr1 (120-155)||(28637120-28637155)
chr1 (190-246)||(39386494-39386551)
chr1 (120-156)||(14601747-14601783)
chr1 (231-306)||(16858459-16858535)
chr1 (344-400)||(28552307-28552363)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (120-333)||(28365525-28365744)
chr2 (120-399)||(36464289-36464572)
chr2 (120-275)||(26829220-26829376)
chr2 (120-333)||(38716207-38716427)
chr2 (120-402)||(2986699-2986990)
chr2 (187-336)||(9787644-9787796)
chr2 (165-402)||(18537829-18538071)
chr2 (131-306)||(9051128-9051307)
chr2 (165-306)||(11175968-11176111)
chr2 (187-333)||(15735149-15735298)
chr2 (120-333)||(15700760-15700981)
chr2 (186-402)||(25884178-25884398)
chr2 (165-402)||(30714275-30714517)
chr2 (131-306)||(6763817-6763997)
chr2 (200-333)||(17368314-17368450)
chr2 (190-334)||(4104893-4105040)
chr2 (165-333)||(22191107-22191279)
chr2 (165-307)||(25298900-25299044)
chr2 (165-274)||(4587922-4588033)
chr2 (186-305)||(331796-331916)
chr2 (190-302)||(12350101-12350211)
chr2 (165-249)||(43301716-43301802)
chr2 (186-306)||(22387167-22387288)
chr2 (186-274)||(2190616-2190705)
chr2 (186-306)||(14743401-14743522)
chr2 (190-271)||(1020478-1020559)
chr2 (244-336)||(21773399-21773493)
chr2 (126-159)||(9780947-9780980)
chr2 (122-212)||(15147762-15147854)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (110-306)||(51291269-51291469)
chr4 (120-402)||(20919335-20919619)
chr4 (120-332)||(4098670-4098890)
chr4 (131-402)||(35475315-35475592)
chr4 (131-334)||(6209308-6209521)
chr4 (165-306)||(13397775-13397918)
chr4 (131-306)||(5304447-5304625)
chr4 (165-333)||(13826489-13826661)
chr4 (189-402)||(24626222-24626438)
chr4 (165-306)||(15058918-15059061)
chr4 (187-333)||(1588484-1588631)
chr4 (165-333)||(27018276-27018448)
chr4 (192-306)||(2715817-2715930)
chr4 (165-402)||(43793631-43793874)
chr4 (190-306)||(4357340-4357456)
chr4 (165-333)||(19232413-19232587)
chr4 (165-274)||(9195796-9195906)
chr4 (120-333)||(45633451-45633670)
chr4 (120-274)||(55780400-55780558)
chr4 (120-274)||(55844580-55844738)
chr4 (193-305)||(41034727-41034839)
chr4 (120-217)||(36729246-36729346)
chr4 (165-333)||(25011796-25011969)
chr4 (131-332)||(41877099-41877304)
chr4 (231-332)||(36729159-36729263)
chr4 (187-333)||(6789028-6789177)
chr4 (131-306)||(52838255-52838431)
chr4 (131-274)||(4433315-4433462)
chr4 (165-402)||(9397252-9397493)
chr4 (187-332)||(2931406-2931553)
chr4 (231-333)||(25618698-25618802)
chr4 (165-217)||(14804413-14804465)
chr4 (258-306)||(47869811-47869858)
chr4 (120-154)||(13826280-13826314)
chr4 (197-306)||(15795412-15795521)
chr4 (344-402)||(25011735-25011793)
chr4 (186-239)||(48158680-48158734)
chr4 (186-215)||(7540250-7540279)
chr4 (189-217)||(25618785-25618813)
chr4 (127-159)||(43335949-43335981)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (120-304)||(17825599-17825785)
chr5 (190-336)||(38476537-38476686)
chr5 (120-402)||(2373160-2373449)
chr5 (165-319)||(23040035-23040191)
chr5 (129-336)||(34125081-34125297)
chr5 (120-334)||(41663592-41663813)
chr5 (131-402)||(18695028-18695306)
chr5 (120-269)||(20653833-20653987)
chr5 (165-333)||(16901067-16901239)
chr5 (120-333)||(25556945-25557165)
chr5 (165-306)||(245656-245798)
chr5 (101-248)||(23040196-23040346)
chr5 (120-306)||(37961348-37961539)
chr5 (188-399)||(40428642-40428857)
chr5 (120-307)||(35302013-35302204)
chr5 (165-307)||(26639136-26639280)
chr5 (186-329)||(462850-462996)
chr5 (165-306)||(19169404-19169547)
chr5 (165-333)||(31055384-31055557)
chr5 (165-332)||(36641204-36641376)
chr5 (187-274)||(10379367-10379453)
chr5 (165-306)||(23765492-23765632)
chr5 (165-306)||(23815340-23815480)
chr5 (99-399)||(16307480-16307789)
chr5 (165-333)||(38408690-38408861)
chr5 (187-307)||(7835795-7835914)
chr5 (187-274)||(10293219-10293306)
chr5 (122-302)||(7187206-7187388)
chr5 (131-254)||(32465987-32466112)
chr5 (186-275)||(17704718-17704806)
chr5 (120-155)||(31576615-31576650)
chr5 (187-236)||(8645882-8645932)
chr5 (120-156)||(15885143-15885179)
chr5 (187-306)||(15885265-15885383)
chr5 (120-156)||(38476732-38476768)
chr5 (188-217)||(8674014-8674043)
chr5 (349-402)||(26639288-26639341)
chr5 (353-402)||(31648239-31648288)
chr5 (344-400)||(15885409-15885465)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (165-335)||(1824668-1824840)
chr8 (165-335)||(1859113-1859285)
chr8 (120-334)||(3207996-3208214)
chr8 (165-329)||(18252960-18253127)
chr8 (165-333)||(19391457-19391630)
chr8 (123-334)||(7117183-7117401)
chr8 (102-333)||(5192341-5192580)
chr8 (131-333)||(33895399-33895607)
chr8 (187-333)||(4807670-4807819)
chr8 (131-306)||(38630079-38630259)
chr8 (165-307)||(4518966-4519110)
chr8 (165-306)||(15869438-15869578)
chr8 (165-333)||(30784335-30784507)
chr8 (186-306)||(41688210-41688331)
chr8 (187-333)||(12723331-12723480)
chr8 (190-332)||(22452244-22452389)
chr8 (165-329)||(17648304-17648473)
chr8 (187-306)||(8802500-8802618)
chr8 (165-306)||(19924326-19924469)
chr8 (120-333)||(18881573-18881792)
chr8 (197-308)||(41385588-41385700)
chr8 (238-336)||(23565225-23565326)
chr8 (186-306)||(21666374-21666494)
chr8 (186-334)||(4423099-4423251)
chr8 (188-334)||(31268365-31268514)
chr8 (165-306)||(44147033-44147174)
chr8 (165-306)||(32400422-32400565)
chr8 (213-274)||(17857064-17857127)
chr8 (131-234)||(21929974-21930081)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (132-402)||(39181962-39182237)
chr7 (186-381)||(26385345-26385544)
chr7 (139-273)||(9157183-9157318)
chr7 (186-293)||(26126338-26126445)
chr7 (106-302)||(4193552-4193750)
chr7 (165-306)||(24464638-24464780)
chr7 (168-402)||(25002773-25003009)
chr7 (99-273)||(29051619-29051789)
chr7 (120-275)||(5111455-5111612)
chr7 (120-400)||(13577789-13578075)
chr7 (131-336)||(42271357-42271569)
chr7 (166-333)||(19493383-19493552)
chr7 (187-333)||(21224422-21224571)
chr7 (165-287)||(4571462-4571585)
chr7 (193-334)||(15681720-15681865)
chr7 (120-402)||(19195214-19195504)
chr7 (166-333)||(31493973-31494144)
chr7 (119-334)||(3403120-3403342)
chr7 (187-336)||(36746570-36746722)
chr7 (130-307)||(43251293-43251471)
chr7 (128-333)||(11843248-11843460)
chr7 (165-402)||(27869196-27869438)
chr7 (165-333)||(35337592-35337765)
chr7 (165-306)||(3562533-3562675)
chr7 (187-333)||(48176033-48176181)
chr7 (165-333)||(7365282-7365457)
chr7 (131-306)||(20636643-20636823)
chr7 (131-329)||(2331038-2331243)
chr7 (231-336)||(5087125-5087233)
chr7 (165-333)||(41452319-41452492)
chr7 (231-402)||(6650639-6650814)
chr7 (131-331)||(44077942-44078151)
chr7 (213-334)||(9822169-9822292)
chr7 (213-334)||(10724094-10724217)
chr7 (135-246)||(6798074-6798186)
chr7 (187-331)||(21225621-21225766)
chr7 (134-306)||(33237513-33237689)
chr7 (199-307)||(39440219-39440328)
chr7 (131-274)||(20638515-20638663)
chr7 (187-306)||(24597615-24597734)
chr7 (120-274)||(18754398-18754557)
chr7 (131-306)||(14624632-14624806)
chr7 (120-247)||(15681608-15681743)
chr7 (186-307)||(23439677-23439799)
chr7 (186-307)||(23461120-23461242)
chr7 (193-277)||(6798011-6798095)
chr7 (187-333)||(10655415-10655563)
chr7 (165-336)||(17305826-17306002)
chr7 (221-402)||(42303266-42303450)
chr7 (187-402)||(8526881-8527098)
chr7 (187-306)||(10023885-10024003)
chr7 (131-306)||(19919703-19919881)
chr7 (190-302)||(47113202-47113315)
chr7 (186-307)||(3148007-3148128)
chr7 (231-336)||(5348156-5348265)
chr7 (120-182)||(9822294-9822357)
chr7 (120-182)||(10724219-10724282)
chr7 (126-217)||(6650563-6650656)
chr7 (186-307)||(23473073-23473195)
chr7 (166-307)||(3769467-3769609)
chr7 (130-275)||(24448174-24448319)
chr7 (344-402)||(26385263-26385321)
chr7 (165-210)||(1920994-1921039)
chr7 (119-155)||(4436135-4436171)
chr7 (224-307)||(9154397-9154481)
chr7 (258-306)||(24730888-24730936)
chr7 (353-401)||(25002712-25002760)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (165-333)||(29779-29950)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (103-334)||(9919-10156)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (131-333)||(19309-19516)
scaffold0025 (165-333)||(61875-62050)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (120-334)||(26239970-26240192)
chr6 (165-275)||(4013797-4013909)
chr6 (191-306)||(9241742-9241856)
chr6 (165-333)||(14572248-14572420)
chr6 (130-306)||(24603384-24603565)
chr6 (187-306)||(35102591-35102710)
chr6 (131-307)||(18791382-18791562)
chr6 (165-307)||(22269469-22269611)
chr6 (131-333)||(31210818-31211028)
chr6 (165-306)||(15298546-15298688)
chr6 (165-333)||(24051069-24051242)
chr6 (187-336)||(34528237-34528385)
chr6 (187-306)||(26710407-26710526)
chr6 (186-269)||(4370982-4371065)
chr6 (165-306)||(25819746-25819888)
chr6 (187-399)||(4597408-4597624)
chr6 (165-334)||(32451787-32451961)
chr6 (165-306)||(34833986-34834129)
chr6 (213-307)||(12291516-12291610)
chr6 (120-334)||(22968225-22968444)
chr6 (120-334)||(23819949-23820168)
chr6 (165-332)||(24615764-24615933)
chr6 (120-273)||(16415463-16415621)
chr6 (187-296)||(8412843-8412952)
chr6 (187-334)||(3118764-3118914)
chr6 (165-334)||(2636839-2637013)
chr6 (231-333)||(20863798-20863903)
chr6 (131-274)||(19282343-19282490)
chr6 (193-333)||(18749166-18749309)
chr6 (131-245)||(18749288-18749408)
chr6 (187-265)||(32682419-32682497)
chr6 (135-236)||(2058991-2059096)
chr6 (344-401)||(4013911-4013968)
chr6 (120-217)||(23124878-23124977)
chr6 (165-271)||(12427292-12427402)
chr6 (231-274)||(23124852-23124895)
chr6 (131-273)||(8149043-8149186)
chr6 (175-274)||(14195631-14195732)
chr6 (103-155)||(29473073-29473125)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (120-334)||(112140-112362)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (165-306)||(43924-44065)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (131-333)||(142017-142226)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (186-401)||(455110-455331)
scaffold0002 (120-274)||(454942-455103)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (165-333)||(2119-2292)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (187-333)||(66259-66408)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (160-303)||(5753-5897)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (165-402)||(2961-3203)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (131-333)||(2021-2225)
[»] scaffold0062 (2 HSPs)
scaffold0062 (120-333)||(49672-49893)
scaffold0062 (120-333)||(62211-62432)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (165-306)||(3668-3809)
[»] scaffold1202 (1 HSPs)
scaffold1202 (120-274)||(1906-2064)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (187-306)||(25064-25183)
[»] scaffold1875 (1 HSPs)
scaffold1875 (131-402)||(756-1036)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (187-306)||(5916-6035)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (165-334)||(2996-3170)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (233-334)||(9163-9268)
scaffold0171 (120-184)||(9101-9167)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (165-217)||(35262-35314)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (238-306)||(250618-250686)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (231-306)||(54499-54573)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (236-307)||(128450-128520)
[»] scaffold0474 (2 HSPs)
scaffold0474 (256-306)||(8080-8130)
scaffold0474 (184-216)||(8151-8183)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 64 - 334
Target Start/End: Original strand, 23320324 - 23320595
Alignment:
Q  64 aaaaaagtagtgatctactcatgaaaggttataaaataataaaggttaaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccattt 163  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  23320324 aaaatagttgtgatctactcatgaaaggttataaaataataaaggttaaagtataattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgacccctat 23320423  T
Q  164 gaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  23320424 gaaaa-atgacaaaagtgatcccatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtctgatatattgacttcttatcttctcaaaaag 23320522  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    |||| ||||||| || | |||||| ||| |||||||||| |   ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23320523 ttgctattatggcccct-ttttgggacatgtggcgtcttttcagcaattttgggacgaaaggggccaaaattgt 23320595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 20001724 - 20002011
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatga-caaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || | | |||||| |  ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20001724 ttttaaccccctaagtttcaaaatgttgcgattttgacccctattaaaaaaagtgcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacccc 20001823  T
Q  217 -taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattttt 312  Q
     ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  20001824 ctaacataagggaaatatgatctcttg-ccccttatattctcaaaaagttgcgactatggcccctgttttggaacacgtggcgtcttctcaacaattttg 20001922  T
Q  313 ggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    ||| |||||||| ||||||||  |       |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20001923 ggatgaaaaggggcaaaattgctatttttttaatagggggccaaaatcgcaacattttgaaacttagggga-gaaaagtgcagtttagcc 20002011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26633646 - 26633433
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26633646 ttttcaccccctaagtttctaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaatggcaaaaatgaccccatctttagggaaatatgctcttttgacccct 26633547  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttgg 314  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||  |||||   ||||||||||    
T  26633546 aacataagagaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttggggcacgtggcaccttctcggcaatttttgg 26633448  T
Q  315 acgaaaagggccaaa 329  Q
    |||||| ||||||||    
T  26633447 acgaaaggggccaaa 26633433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30155423 - 30155214
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataaga 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30155423 taagttttaaaatgttgcgattttgatcccctattaaaaaatggcaaaagtgatcccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagg 30155324  T
Q  227 gaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagg 323  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||    |||||||| || |||| ||    
T  30155323 gaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacacatggcgtcttcgcagcaattttttgatgaaaggg 30155225  T
Q  324 gccaaaattgt 334  Q
    |||||||||||    
T  30155224 gccaaaattgt 30155214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Original strand, 3780907 - 3781082
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccat-ttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaa 229  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3780907 taagtttcaaaatgttgcgattttgacccctattaaaaaaatggcaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagggaa 3781006  T
Q  230 gtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
     |||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||  || | |||||| |||||||| |||||||||    
T  3781007 atatgct-ttttgaccctttatctttacaaaaagttgcgaatatgaccccttttttgggacacgtggtgtcttctca 3781082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28155101 - 28154952
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28155101 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgacctcttatctttacaaaaagttgcgattatggcccttttttt 28155003  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28155002 gggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 28154952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3329030 - 3328883
Alignment:
Q  189 gtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttgg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  3329030 gtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgc-cttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttgg 3328932  T
Q  288 aacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
     ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3328931 gacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 3328883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26628268 - 26628095
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  26628268 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 26628170  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  26628169 agttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 26628095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 400
Target Start/End: Original strand, 32314982 - 32315219
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  32314982 aaaaaatgacaaaagtgactccatgtttagggaaatatgttcttttgaccccctaacatgagggaaatattatattttgaccccttatctcctcaaaaag 32315081  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaacc 360  Q
     ||||| ||||| || |||||| | ||| ||||||||||||   ||||||| |||||||| |  ||||||||||||       |||| ||||| |||| |    
T  32315082 ctgcga-tatggcccatgttttaggacatgtggcgtcttctcaacaattttgggacgaaaggacccaaaattgtcatttttttaata-gggacgaaaatc 32315179  T
Q  361 gcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttag 400  Q
    ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  32315180 gcaacattttaaaacttaagggacgaaaagtgcagtttag 32315219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 36311213 - 36311385
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||    
T  36311213 aaaaaatggcaaaagtgaccccatatttaggaaaatatactcttttgaccccataacataagggaaatatgacattttaaccccttatcttctcaaatag 36311312  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||| || || | |||||| ||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36311313 ttgcgattacggcccatattttgggacacgtggcttcttctcaacaattttgggacgaaaggggccaaaattg 36311385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 48907535 - 48907362
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||   ||||    
T  48907535 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttaaaaaa 48907437  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  48907436 agttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 48907362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27852994 - 27852851
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  27852994 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 27852896  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  27852895 agttgcgattatggcccct-ttttgggacacgtggcgtcttctcaa 27852851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 402
Target Start/End: Original strand, 1743334 - 1743553
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||    
T  1743334 atgtttaggaaaatatactcttttgaccccctaacataag-gaaatgtgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgataagggccattgtttt 1743432  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg-tcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttaggg 381  Q
    || ||| ||||||||||||   |||||||  ||| ||| || | ||||||| |         |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  1743433 gggacatgtggcgtcttctcagcaattttgtgacaaaagggactaaaattgctattttttataataggggaccaaaatcgcaacattttaaaacttaggg 1743532  T
Q  382 aatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  1743533 agcgaaaagtgcagtttagcc 1743553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22500885 - 22500665
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc- 214  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||  |  | |||||||| ||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  22500885 ttttcaccctttaaattttaaaatgttgcaattttgaccccctattaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttaggaaaatatgctcttttgacct 22500786  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   ||||||    
T  22500785 cctaacataagggaaatatgct-ttttgatcccttatatttacaaaaagttgcgattatggtccctttttttggacacgtggcgtcttctcagaaatttt 22500687  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||| |||| |||| |||||||    
T  22500686 tggatgaaaggggctaaaattg 22500665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40836469 - 40836181
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaa-tgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttga-cc 214  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||   |||  |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40836469 ttttcgccccctaagttttaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaaatggcaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgttcttttgaccc 40836370  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatct-tctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattt 310  Q
    ||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||   ||||||    
T  40836369 cctaatataagggaaatatg-ttttttgaccccttatatctcaaaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcggcttctcagcaattt 40836271  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagc 401  Q
    | | |||||| |||||||||| | ||       ||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  40836270 tggaacgaaaggggccaaaatcg-catttttttaatagaggaccaaaatcgcaacattttaaaacttaggggacgaaaagtgtagtttagc 40836181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Original strand, 4522039 - 4522188
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccct-aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || | ||||    
T  4522039 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcttaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattattgcccctttttt 4522137  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  4522138 gggacacgtggcgtcttctcagcaattttaggatgaaaggggccaaaattg 4522188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 274
Target Start/End: Original strand, 10743422 - 10743579
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtga-tcac-atgtttagggaaatatgctcttttgaccc 215  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||  |  | |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10743422 ttttcgccccctaagttttaaaatgttgcgattttggccccctattaaaaaaatgacaaaagtgactccctatgtttagggaaatatgctcttttaaccc 10743521  T
Q  216 ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10743522 ctaacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatg 10743579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31039196 - 31039048
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttg 286  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||     
T  31039196 atgttaaggaaaacatgctcttttgacccctaacatatgggaaatatgatctaatgaccctttatcttcttaaaaagttgcgattatagcccctttttta 31039097  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaatt 332  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31039096 gaacatgtggcgtcttctcagcaatttttggacgaaagaggccaaaatt 31039048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8339183 - 8339040
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  8339183 aaaaaatggcaaaagtgaccccttatgtttagggaaatatgcttttttgacctcctaacataatagaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 8339085  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  8339084 agttgcgattatggcctcttttttgggacacgtggcgtcttctca 8339040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 8542671 - 8542814
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  8542671 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 8542769  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||| ||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||    
T  8542770 agttgcaattatggccccttttttgtgacacgtggcgtcttctca 8542814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 306
Target Start/End: Original strand, 33104970 - 33105145
Alignment:
Q  135 ttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaag 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |  | |||||||| | ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  33104970 ttttaaaatgttgcgattttgatcccctgttaaaaaaatggctaaagtgaccccccatgtttagggaaatatgctcttttgatctctatcataagagaaa 33105069  T
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33105070 tatgttattttgatcccttttcttcccaaaaagtttcgattatttcccatgttttgggacacgtggcgtcttctca 33105145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49658067 - 49657939
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccat-ttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccccta 218  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||| || |||||||  ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49658067 ttttcaccacctaagttttaaaatgttgcaattttgacccatattaaaaaaattgcaaaagtgacccaatatttagggaaatatgctcttttgaccccta 49657968  T
Q  219 acataagagaagtatgatcttttgacccc 247  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||    
T  49657967 acataaggaaaatatgatcttttgacccc 49657939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23428862 - 23428691
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  23428862 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaa 23428764  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaat 331  Q
    |||||||||||||  || | || ||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  23428763 agttgcgattatgaccccttttctgggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaaggggccaaaat 23428691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46673337 - 46673117
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgac-c 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46673337 ttttcgccccttaagttttcaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaatggcaaaagtgatcccctatgtttagggaaatatgctcttttgactc 46673238  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctc-aaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattt 310  Q
    ||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  || | || | | ||||||||| ||||||   ||||||    
T  46673237 cctaacataagggaaatatg--tttttgaccccttatctttacaaaaaagttgcgattatgaccccttttctaggacacgtggcatcttctgagcaattt 46673140  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | ||| |||| ||||||||||||    
T  46673139 tgggatgaaaggggccaaaattg 46673117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 287
Target Start/End: Original strand, 4775934 - 4776036
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4775934 catgtttagggaaatatgctattttgaccccctcacatacgggaaatatgatcctttgatcccttatcttcttaaaaagttgcgattatggcccttgttt 4776033  T
Q  285 tgg 287  Q
    |||    
T  4776034 tgg 4776036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 336
Target Start/End: Original strand, 22416356 - 22416571
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac---atgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacata 223  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| ||||||||| | |   ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  22416356 taagttttataatgttgcaattttgatcccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccccaatgtttagggatatatgctcttttgaccttctaacata 22416455  T
Q  224 agagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaa 320  Q
    ||  || |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||  || |  ||||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||     
T  22416456 aggtaaatatgctcttttgacccattatctttacaaaaagttgcaattatgaccccttatttgggacacgtggcgtcttctcaacaattttgggacgaag 22416555  T
Q  321 agggccaaaattgtca 336  Q
     |||||||||||||||    
T  22416556 ggggccaaaattgtca 22416571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Original strand, 25179663 - 25179780
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||    
T  25179663 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacgtaagagaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccctttttt 25179761  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    || ||||  ||||||||||||    
T  25179762 gggacac--ggcgtcttctca 25179780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 273
Target Start/End: Original strand, 25336418 - 25336527
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  25336418 aaaaaatgacaaaagtgaacctatatttagggaattatgctcttttgaccccctaacataagggaaatatgaccttttgaccttttaacttctcaaaaag 25336517  T
Q  264 ttgcgattat 273  Q
    ||||||||||    
T  25336518 ttgcgattat 25336527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33279875 - 33279655
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatca-catgtttagggaaatatgctcttttga-cc 214  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||  |  | |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33279875 ttttcgccccctaagttttaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtggccctcttgtttaggaaaatatgctcttttgaccc 33279776  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| || |  ||||||| ||||||||  |||| |||||  ||||||||||||||||   |||||||    
T  33279775 cctaacataagggaaatatgctcttttgatcccttatatt-tacaaaagttacgattatgaccctttttttgagacacgtggcgtcttctcagcaatttt 33279677  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||    
T  33279676 tggaccaaaggggtcaaaattg 33279655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28173948 - 28173799
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || |    
T  28173948 atgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttct 28173850  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || ||||||||| |||||    ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  28173849 gggacacgtggcatcttccgagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 28173799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35201216 - 35201094
Alignment:
Q  184 cacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtt 283  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||    
T  35201216 cacatgttttgggaaacatgctcttttgaccc-taacataaaggaaatatgatattttgaccccttatcttctcaaaaagttacgatcatggctcctgtt 35201118  T
Q  284 ttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    || | ||| ||||| |||||||||    
T  35201117 ttaggacatgtggcatcttctcaa 35201094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 306
Target Start/End: Original strand, 13080982 - 13081098
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttgga 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||     
T  13080982 tttagggaaatatgctcttttgacctcataacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttggg 13081080  T
Q  289 acacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  13081081 acatgtggagtcttctca 13081098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25022882 - 25022733
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || |    
T  25022882 atgtttagggaaatatgctcttttgaccccataacataagggatatatg-ttttttgaacccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttct 25022784  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25022783 gggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 25022733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9496458 - 9496316
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctc-aaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| | ||||| |||||||||||  | |||||    
T  9496458 aaaaaatggcaaaagtgaccacatgtttagggaaatatgctcttttgaccctctaacataaaggaaatatgct-ttttgtccccttatctttacaaaaaa 9496360  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||  |||  |||||||||||  || |||||||| |||||    
T  9496359 gttgcgaggatgacccttgttttggggcatgtggcgtcctctca 9496316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22447963 - 22447810
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttat----cttctcaaaaagttgcgattatggtccttg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    |||  ||||||||||||||||||| || |     
T  22447963 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatatatctttacaaaaagttgcgattatggcccctt 22447865  T
Q  282 ttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||| | | |||||||||||||||   |||||||||| |||| || |||||||||    
T  22447864 tttttggatacgtggcgtcttctcagaaatttttggatgaaagggtccaaaattg 22447810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 215
Target Start/End: Original strand, 3820941 - 3821026
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccat-ttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3820941 taagttttaaaatgttgcgattttgacccctattaaaaaaatggcaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgctcttttgaccc 3821026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18388989 - 18388842
Alignment:
Q  121 tttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttga-ccc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||   |||  |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18388989 tttcaccccttaagttttaaaatattgtgattttggtcccctattaaaaaaaatgacaaaagtgacccccatgttaagggaaatatgctcttttgacccc 18388890  T
Q  216 ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    ||| ||||||| || |||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||    
T  18388889 ctaccataagataaatatgttcttctgatcccttagcttctaaaaaag 18388842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32960810 - 32960713
Alignment:
Q  238 ttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||   |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  32960810 ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgg-cctttttttgggacacgtggcgtcttctcagtaattttgggatgaaaggggccaaaattg 32960713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34878746 - 34878629
Alignment:
Q  189 gtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttgg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||  | | ||||||    
T  34878746 gtttagggaaatatgctcttttgaccccctaatataagggaaatatgct-ttttgatcccttatctttacaaaaagtttcaattatggcaccttttttgg 34878648  T
Q  288 aacacgtggcgtcttctca 306  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34878647 gacacgtggcgtcttctca 34878629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 274
Target Start/End: Original strand, 48860723 - 48860874
Alignment:
Q  126 ccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaaca 221  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||| || || | ||||||||| |||| ||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  48860723 ccccctaagttttaaaatgttgtaattttgaccccttattaaaaaatgataaaaatgaccccttatgtttagggaaatatgctattttgaccttctaaca 48860822  T
Q  222 taagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48860823 taagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatg 48860874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26127146 - 26127037
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||| |||| | ||||| |||||||||||  |||||||    
T  26127146 aaaaaatg-caaaagtgaccccatgtttagggaaatatgttattttgaccctctaacataggggaaatatgct-ttttggccccttatctttacaaaaag 26127049  T
Q  264 ttgcgattatgg 275  Q
    ||||||||||||    
T  26127048 ttgcgattatgg 26127037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Original strand, 23320251 - 23320296
Alignment:
Q  9 agtttggtgtttataaatggtatattcaatgtaatgcttttgcact 54  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23320251 agtttggtatttataaatggtatattcaatgtaatgcttttgcact 23320296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26177196 - 26177026
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||| | ||||| | | |||||||  |||||||    
T  26177196 aaaaaatg-caaaagtgaccccatgttcagggaaatatgctattttgaccctctaacataggggaaatatgct-ttttggctcattatctttacaaaaag 26177099  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||| |  | |||||| ||  ||||| ||||||   ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  26177098 ttgcgattatggcctcttttttgggacttgtggcttcttctcagcaattttgggacgaaataggccaaaattg 26177026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27668272 - 27668128
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||  |  |||||||| |||||||||||    |||||||   ||||||||| ||||||||| |    
T  27668272 ttttcgcccattaaattttaaaaagttacgattttaaccc--taaaaaaaatggcaaaagtgatccgctatgtttaaaaaaatatgctattttgaccctt 27668175  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagtt 265  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  27668174 aacataagggaa-tatgatcttttgacccattatcttattaaaaagtt 27668128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 333
Target Start/End: Original strand, 6927606 - 6927704
Alignment:
Q  238 ttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  6927606 ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaaggggctaaaattg 6927704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31039280 - 31039223
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatgacaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || | |||||||||||||||    
T  31039280 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgtgactttggcccttatgaaaaaatgacaaa 31039223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46387794 - 46387681
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||        |||||||||||  |||||| | || ||||||| || | |||    
T  46387794 catgtttaaggaaacatgctcttttgatcccctaacataagggaaatatga--------ccccttatctttccaaaaactagcaattatggccccttttt 46387703  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  46387702 tggaacacatggcgtcttctca 46387681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Original strand, 3821011 - 3821086
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  || | |||||| ||| |||| |||||||||    
T  3821011 tatgctcttttgaccctttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttttgggacatgtggtgtcttctca 3821086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32463590 - 32463519
Alignment:
Q  236 tcttttgaccccttatcttctcaaaaa-gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  32463590 tcttttgaccccttatctttacaaaaaagttgcgattttgaccctttttttgggacacgtggcggcttctca 32463519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Original strand, 43668501 - 43668552
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgt-ttagggaaatatgctcttttgaccc 215  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43668501 aaaaaatggcaaaagtgaccccatgtgttagggaaatatgctcttttgaccc 43668552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34296596 - 34296531
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatctt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  34296596 tttagggaaatatgctcttttgaccctctaactttatggaaatatgctcttttgaccctttatctt 34296531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36311201 - 36311152
Alignment:
Q  353 ccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36311201 ccaaaatcgcaacattttaaaacttaggggacgaaaagtgcagtttagcc 36311152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 306
Target Start/End: Original strand, 43668583 - 43668632
Alignment:
Q  257 caaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43668583 caaaaagttgcgattatgacccctgttttgggacatgtggcgtcttctca 43668632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2260665 - 2260447
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-ta 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  2260665 ttttcatcccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccctatgaaaaaatgacaaaagtgaccccatgtttagtgaaatatgcttttttgaccccata 2260566  T
Q  219 acataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttttgga 315  Q
    | ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||| | |||||||||||||||   |||||| | |    
T  2260565 atataagggaaatatgatattttaaccccttatcttctcaaaaagttgcgattctgaccccttttttgggatacgtggcgtcttctcagtaattttagaa 2260466  T
Q  316 cgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  2260465 cgaaatggaccaaaattgt 2260447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16551863 - 16551714
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16551863 atgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacatcagacaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggcccttgtttt 16551764  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaatt 332  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||| |||||||| | |||||||||    
T  16551763 gggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggacgaaaggtgccaaaatt 16551714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29182289 - 29182100
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaa-tgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||   |||||||| |||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29182289 ttttcacctcttaaattttaaaaagttacgattttggtccccatgaaaaaaatgacaaaagtgaccccttatgtttagagaaatatgctcttttgacccc 29182190  T
Q  217 taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||  |||||| |||||||||||    
T  29182189 taacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcataaagttgcgattatggcccattttttgagacacgttgcgtcttctca 29182100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 123 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4455332 - 4455111
Alignment:
Q  123 tcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaaaaa---tgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||||||   |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4455332 tcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttggccctctatgaaaaaaaattgacaaaagtgatccccaatgtttaggaaaatatgctcttttgacccc 4455233  T
Q  217 -taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattttt 312  Q
     ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||| ||||||   |||||||     
T  4455232 gtaacataagggaaatatgattttttgaccacttatcttctcaaaaagttgcgattatggccatttttttgggacatgtggcatcttctcagcaattttg 4455133  T
Q  313 ggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    ||||||||| | ||||||||||    
T  4455132 ggacgaaaaagaccaaaattgt 4455111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Original strand, 21185221 - 21185407
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga--tccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||  |  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21185221 ttttcatcccttaagttttaaaaagttgcgcttttggcctcctatgaaaaaaatgataaaagtgaccccatgtttagggaaatatgttcttttgaccctt 21185320  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  21185321 aacataaga-aaatatgatcttttgaccccctatcttctcaaaaagttgcgattatgaccctt-ttttggaacacgaggcggcttctca 21185407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 332
Target Start/End: Original strand, 22786055 - 22786260
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataaga 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  22786055 taagttttaaaatgttgcgattttgacccctattaaaaaaaatggcaaaagtgagcccccatgtttagggaaatatgctcttttgacatctaacataagt 22786154  T
Q  227 gaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagg 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| || |||||||| |||| |||||||||||   |||||||  ||||||| ||    
T  22786155 gaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttg---tgatggcccctgttttgggacacttggcgtcttctcagcaattttgagacgaaatgg 22786251  T
Q  324 gccaaaatt 332  Q
    |||||||||    
T  22786252 gccaaaatt 22786260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 48472082 - 48471864
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  48472082 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagagaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggtccctttttt 48471984  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttaggg 381  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||  |||||||||||| ||        |||| ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  48471983 gggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaagggggccaaaattgccattttttttaatagggggccaaaatcgcaacattttgaaacataggg 48471884  T
Q  382 aatgaaaagtgcagtttagc 401  Q
     | |||||||||| ||||||    
T  48471883 gacgaaaagtgcactttagc 48471864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19078167 - 19077995
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  19078167 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaa 19078069  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19078068 gttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 19077995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19126057 - 19125885
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  19126057 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaa 19125959  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19125958 gttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 19125885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Original strand, 24196274 - 24196495
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcacat--gtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| ||||||||| | |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  24196274 ttttcgccccctaagtttcaaaatgttgcgattttggccctctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccatatgtttagagaaatatgctcttttgacc 24196373  T
Q  215 -cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattt 310  Q
     ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  24196374 tcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgaatatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattt 24196472  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  24196473 ttggacgaaaggggccaaaattg 24196495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18606904 - 18606751
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  18606904 catgtttagggaaatatgctcttttgaccccataacataaggaaaatacgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgtgattatcacccttgttt 18606805  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctca--atttttggacgaaaagggccaaaattgtca 336  Q
    ||| |||||| |||||| ||||  | ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  18606804 tgggacacgtagcgtctgctcagcaattcgggacgaaaggggccaaaattgtca 18606751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 24749859 - 24750032
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  24749859 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcataacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 24749957  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  24749958 agttgcgattatggcccattttttggaacacgtggcgtcttcttagcaatttttagatgaaaggggccaaaattg 24750032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4059741 - 4059592
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4059741 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataaggaaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggtccatttttt 4059643  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  4059642 gggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 4059592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 24962014 - 24962157
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  24962014 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 24962112  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  24962113 agttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 24962157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 273
Target Start/End: Original strand, 10684807 - 10684965
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcacat-gtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||  |  | |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10684807 ttttcgccccttaagttttaaaatgttgcaattttagtcccctattaaaaaaatggcaaaagtgaccccattgtttagggaaatatactctattgacccc 10684906  T
Q  217 --taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattat 273  Q
      |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684907 cctaacataagaaaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattat 10684965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 3616860 - 3617033
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgaccccta-acataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  3616860 aaaaaatggcaaaagtgacctcctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcttcacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaa 3616958  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3616959 agttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggataaaaggggccaaaattg 3617033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 402
Target Start/End: Original strand, 16971934 - 16972154
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||  || | |||    
T  16971934 catgtttagggatatatgctctttagaccccctaacataagggaaatatgaccttttgactctttatcttctcaaaatattgcgattatgacccctattt 16972033  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttaggg 381  Q
    ||| |||| |||||| ||||   ||||||| | |||||| |||||||||||||||       |||| ||| | |||| |||||||| || ||||||||||    
T  16972034 tgggacacatggcgttttcttagcaattttggaacgaaatgggccaaaattgtcatttttttaatagggggctaaaatcgcaacattttaaaacttaggg 16972133  T
Q  382 aatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
       ||||||||||||||||||    
T  16972134 ggcgaaaagtgcagtttagcc 16972154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27093070 - 27092922
Alignment:
Q  188 tgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || | |||||    
T  27093070 tgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaatatatgtgaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcaattatggccccttttttg 27092972  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  27092971 gaacacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaatgggccaaaattg 27092922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46432507 - 46432286
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432507 ttttcgccccttaagtttcaaaatgttgcgattttggccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacc 46432408  T
Q  215 cc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaattt 310  Q
    || ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || ||| ||||||||| |||||    ||||||    
T  46432407 ccctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttctgggacacgtggcatcttccgagcaattt 46432309  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | ||| |||| ||||||||||||    
T  46432308 tgggatgaaaggggccaaaattg 46432286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2657802 - 2657583
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc--atttgaaaaaatgacaaaagtga-tcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc- 214  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2657802 ttttcgccccctaagtttcaaaatattgcgattttgacccctattaaaaaaaatggcaaaagtgactccctatgtttagggaaatatgctctattgaccg 2657703  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||| |||| | ||||||||||| ||||   |||||||    
T  2657702 cctaacataag-gaaatatgctcttttgaccccttatcttttaaaaaagttgtgattatgaccctttttttaggacacgtggcgt-ttctcaacaatttt 2657605  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
     |||| ||| ||||||||||||    
T  2657604 gggacaaaaggggccaaaattg 2657583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43706896 - 43706724
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  43706896 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacccataacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaa 43706798  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||  || | ||  || ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  43706797 gttgcgattatgaccccttttccgggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 43706724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 402
Target Start/End: Original strand, 9387776 - 9387999
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccc--taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtt 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | ||||    
T  9387776 catgtttaaggaaatatgctcttttgacccccctaacataagggaaatataatcttttgaccctttatcttctcaaaaatttgcgattatgacacctgtt 9387875  T
Q  284 ttggaacacgtggcg--tcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaactt 377  Q
    |||| ||| ||||||  |||||   |||||||| |||||||| |  ||||||||||||        |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  9387876 ttgggacatgtggcgtctcttctcatcaattttgggacgaaaggaaccaaaattgtcatcttttttaata-ggggccaaaattgcaacattttgaaactt 9387974  T
Q  378 agggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    || | |||||| |||||||||||||    
T  9387975 agtggatgaaaggtgcagtttagcc 9387999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 249
Target Start/End: Original strand, 21147992 - 21148126
Alignment:
Q  122 ttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttg----aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttga-cc 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||     |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21147992 ttcaccccttaagtttttaaaagttgcgattttggcccccttatgaaaaaaaatgacaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccc 21148091  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgacccctt 249  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21148092 cctaacataagggaaatatgatcttttgacccctt 21148126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Original strand, 29676164 - 29676314
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || | ||||    
T  29676164 atgtttagggaaatatgctcttgtgatctcctaacataagtgaaatatgct-ttttgaccccttatctttataaaaagttgcgattatggcccctttttt 29676262  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    || |||||||||| |||||   |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  29676263 gggacacgtggcgccttctcaacaattttttgatgaaaggggccaaaattgt 29676314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Original strand, 2425249 - 2425458
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataag 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2425249 taagtttcaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaa-tatgctcttttgaccctctaacataag 2425347  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaag 322  Q
     ||| |||| | |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || ||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| |    
T  2425348 ggaaatatgttttttttaacccttatctttacaaaaagttgcgattatgacccattttctgggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaatg 2425447  T
Q  323 ggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||    
T  2425448 ggccaaaattg 2425458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9554372 - 9554271
Alignment:
Q  235 atcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||| |||||   ||||||| ||||||||   ||||||||    
T  9554372 atcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgactatggcccctgttttgagacacgtggcgccttctctacaattttgggacgaaagaagccaaaat 9554273  T
Q  332 tg 333  Q
    ||    
T  9554272 tg 9554271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28920942 - 28920727
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28920942 ttttcgccccctaagtttcaaaatgttgcgattttggccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacc 28920843  T
Q  215 -cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgg-tccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatt 309  Q
     ||||||||||      |||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  || | |||||| ||| ||||||||||||   |||||    
T  28920842 tcctaacataa------tatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagtggcgattatggcccccttttttgggacatgtggcgtcttctcagcaatt 28920750  T
Q  310 tttggacgaaaagggccaaaatt 332  Q
    |||||| |||| ||| |||||||    
T  28920749 tttggatgaaaggggtcaaaatt 28920727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26605563 - 26605379
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaaaaatgacaaaagtga-tcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    ||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||   | | ||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26605563 ttttcgcctcttaagttttaaaatattacgattttgatcttctattaaaaaattataaaaatgactcacatgtttagggaaatatgctattttgacccct 26605464  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct 304  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||   ||||| ||  ||||||||| |||||||| ||  | |||||| |||||| |||||||||    
T  26605463 aacataaga-aaatatg-ttttttgatatcttatttttacaaaaagttacgattatgatcgattttttgggacacgtagcgtcttct 26605379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51719364 - 51719254
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||   |||| ||||||||||||  |||||    
T  51719364 aaaaaatggcaaaagtgaccccttatgtttagggaaatatgctcttttgatcccctaacataaggaaaatatg--ttttttaccccttatctttacaaaa 51719267  T
Q  262 agttgcgattatg 274  Q
    |||||||||||||    
T  51719266 agttgcgattatg 51719254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 333
Target Start/End: Original strand, 47685185 - 47685335
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  |  | |||    
T  47685185 catgtttaaggaaatatgctattttgatcccctaacataaggaaaatatgtt-ttttgaccccttacctttacaaaaagttgcgataatgacctcttttt 47685283  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | | ||||||||||||||||   ||||||| || ||||| |||| |||||||    
T  47685284 taggacacgtggcgtcttcttagcaattttgggccgaaaggggcaaaaattg 47685335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 155
Target Start/End: Original strand, 28637120 - 28637155
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttg 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28637120 ttttcaccccttatgttttaaaaagttgcgattttg 28637155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 246
Target Start/End: Original strand, 39386494 - 39386551
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||| |||||||||    
T  39386494 tttagggaaatatgctcttttgaccctctaactttacagaaatatgatattttgaccc 39386551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14601783 - 14601747
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14601783 ttttcaccccctaagttttaaaatgttgcgattttga 14601747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Original strand, 16858459 - 16858535
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa-agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||| |||||| |||||||    
T  16858459 tatgctcttttggccccttatctttacaaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacatgtggcggcttctca 16858535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28552363 - 28552307
Alignment:
Q  344 aatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttag 400  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  28552363 aataggggaccaaaatcgcaacattttgaaacttagggggcgaaaagtgcactttag 28552307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Original strand, 28365525 - 28365744
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaa--tgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28365525 ttttcaccccttaaattttaaaaagttgcgattttgacccctatgaaaaaaaatgacaaaagtgacccctatatttagggaaatatgctcgtttgacccc 28365624  T
Q  217 taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttg 313  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||||||||   ||||||| |    
T  28365625 taacatgagggaaatatgatcttttaaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgaccctttttttgggacgcatggcgtcttctcagcaattttgg 28365724  T
Q  314 gacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  28365725 gacgaaagggggcaaaattg 28365744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 399
Target Start/End: Original strand, 36464289 - 36464572
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccat-ttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-t 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  36464289 ttttcgccccttaagttttaaaatgttgcgattttgacccctatttaaaaaatggcaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgatcttttgaccccct 36464388  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttgg 314  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||  ||||||| | ||||||   ||||||| ||    
T  36464389 aacataagggaaatataatcttttgactccttatcttctcaaaaagttgcga-tatggccccttttttgagacacgtgacatcttctcagcaattttggg 36464487  T
Q  315 acgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagttta 399  Q
    |||||| || ||||||||||||       |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||    
T  36464488 acgaaatggaccaaaattgtcatttttttaataagggatcaaaatcgcaacattttgaaacttaggaggcgaaaagtgcagttta 36464572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26829376 - 26829220
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccccta 218  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26829376 ttttcatcccttaagttttaaaatgttgcgattttggccccctatgaaaaaatgacaaaagtgacctcatgtttaaggaaatatgctctttggaccccta 26829277  T
Q  219 acataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgg 275  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26829276 acataagggaaatatgatcttttgaccccttatcatctcaaaaagttgtgattatgg 26829220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Original strand, 38716207 - 38716427
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcacat--gtttagggaaatatgctcttttgacc- 214  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  38716207 ttttcaccctctaagttttaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaatggcaaaagtgaccccatatgtttagggaaatatgctcttttgacct 38716306  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  38716307 cctaacataagagaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttt 38716405  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  38716406 tggatgaaaggggccaaaattg 38716427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 2986699 - 2986990
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2986699 ttttcgccctttaagtttcaaaatgttgcgattttggccccctattaaaaaaaatgacaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacc 2986798  T
Q  215 -cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattt 310  Q
     ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||   ||||||    
T  2986799 tcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccctttttttggacacatggcgtcttctcagcaattt 2986897  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    | ||| |||  |||||||||||| ||        |||| ||| |||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||||||    
T  2986898 tgggatgaagggggccaaaattgccattttttttaatagggggccaaaatcgcaacattttgaaacatagagagtgaaaagtgcactttagcc 2986990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 336
Target Start/End: Original strand, 9787644 - 9787796
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || | ||||    
T  9787644 atgtttagggaaatatgctcttttgacctgctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttacgattatggcccctttttt 9787742  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca 336  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9787743 gggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattgtca 9787796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18538071 - 18537829
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  18538071 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgcttttttgacctcataacattagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 18537973  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaa 358  Q
    |||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||  |       |||| ||||||||||    
T  18537972 agttgcaattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattgctatttttttaataggggaccaaaa 18537873  T
Q  359 ccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
      ||||||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  18537872 ttgcaacattttaaaacataggggacgaaaagtgcagtttagcc 18537829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9051307 - 9051128
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtga-tcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataa 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9051307 taagttttaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgactccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataa 9051208  T
Q  225 gagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    | ||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  9051207 gggaaatatgct-ttttgacctcttatctttacaaaaagttgcgattatggccctt-ttttgggacacggggcgtcttctca 9051128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 11175968 - 11176111
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  11175968 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 11176066  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  11176067 agttgtgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 11176111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Original strand, 15735149 - 15735298
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||    
T  15735149 atgttttgggaaatatgctcttttgacctcgtaacataagggaaatatg-tattttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccctttttt 15735247  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  15735248 gggacacgtggcgtcttctcaacaattttgggatgaaaggggccaaaattg 15735298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Original strand, 15700760 - 15700981
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| || |||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15700760 ttttcgccccttaagttttaaaatgttgcgattttggacccctattaaaaaaaatggcacaagtgaccccctatgtttcgggaaatatgctcttttgacc 15700859  T
Q  215 cc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattt 310  Q
    || ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || ||| ||||||||| ||||||   ||||||    
T  15700860 ccctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttctgggacacgtggcatcttctgagcaattt 15700958  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | ||| |||| ||||||||||||    
T  15700959 tgggatgaaaggggccaaaattg 15700981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25884398 - 25884178
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  25884398 catgtttagagaaatatgttattttaatcccctaacataagggaaatatgatattttaaccccttatcttctcaaaaagttgcgattattgcccctgttt 25884299  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttaggg 381  Q
    ||| ||  || | || ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  ||       |||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25884298 tgggacgtgtagtgttttctcagcaattttgggacgaaaagggccaaaattaccatttttttaatagggggccaaaatcgcaacattttaaaacttaggg 25884199  T
Q  382 aatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
       |||| |||||||||||||    
T  25884198 ggcgaaatgtgcagtttagcc 25884178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30714517 - 30714275
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||  |||||    
T  30714517 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttcgggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgacccgttatctttacaaaa 30714419  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaa 358  Q
    ||||| |||||||| || | |||||| ||| ||||||||||||   ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||       |||| ||| ||||||    
T  30714418 agttgtgattatggccccttttttgggacatgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaaggggccaaaattgccatttttttaatagggggccaaaa 30714319  T
Q  359 ccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
     |||||||| || |||| |||||   |||||||||| |||||||    
T  30714318 tcgcaacattttaaaacatagggggcgaaaagtgcactttagcc 30714275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6763997 - 6763817
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataa 224  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||   |||  |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6763997 taagtttcaaaatgttgcgattttggtcccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataa 6763898  T
Q  225 gagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |  || |||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  6763897 ggaaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagtagcgattacggccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 6763817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 333
Target Start/End: Original strand, 17368314 - 17368450
Alignment:
Q  200 tatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcg 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||    
T  17368314 tatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcaattatggccccttttttgggacacgtggcg 17368412  T
Q  299 tcttctcaa---tttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17368413 tcttctcaacattttttggatgaaaggggccaaaattg 17368450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4105040 - 4104893
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaa 289  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||  || | ||| ||||    
T  4105040 tttagggaaatatattcttttgacctctaacataaggggaatatgctcttttgacaccttatatttacaaaaagttgcgattatgacccctttttaggaa 4104941  T
Q  290 cacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  4104940 cacgtggcgtcttctcagcaattttgggacgaaatgggtcaaaattgt 4104893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 22191107 - 22191279
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgac-ccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  22191107 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacttcctaacataagggaaatatg-ccttttgaccccttatctttacaaaa 22191205  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22191206 agttacgattatgaccctt-ttttgggacacgtggcgccttctcagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 22191279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25299044 - 25298900
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccct-aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| | |||||| ||||||||||  |||||    
T  25299044 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcttaacataaaggaaatatgtt-ttttgatcccttatctttacaaaa 25298946  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  25298945 agttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcatcttctcaa 25298900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Original strand, 4587922 - 4588033
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||||||  |||||    
T  4587922 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataagggaaatatg-ttttttaaccccttatctttacaaaa 4588020  T
Q  262 agttgcgattatg 274  Q
    |||||||||||||    
T  4588021 agttgcgattatg 4588033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 305
Target Start/End: Original strand, 331796 - 331916
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| | |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||  || | |||    
T  331796 catgtttagggaaatatgctcttttgaccctctaacttaagggaaatatgcttttttgatccattatctttgcaaaaagttgcgattatgacccctattt 331895  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctc 305  Q
    | ||||| |||||| ||||||    
T  331896 ttgaacatgtggcggcttctc 331916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 302
Target Start/End: Original strand, 12350101 - 12350211
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgatt--atggtccttgttttgg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | ||||||    
T  12350101 tttagggaaatatgctcttttgacccctaaggtaagggaaatatgatattttga----ttatcttctcaaaaagttgcgattaaatgatctcttttttgg 12350196  T
Q  288 aacacgtggcgtctt 302  Q
    |||| ||||||||||    
T  12350197 aacatgtggcgtctt 12350211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 249
Target Start/End: Original strand, 43301716 - 43301802
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacat--gtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgacccctt 249  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  43301716 aaaaaatgacaaaagtgaccccatatgtttagggaagtatgttcttttgacccctaacttaagggaaatatgatcttttgaaccctt 43301802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22387288 - 22387167
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgg-tccttgtt 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||  || | ||    
T  22387288 catgtttagtgaaatatgctcttttgaccccctaacatatgagaaatatg-ttttttgaccccttatctatacaaagagttgtgattatggccccctttt 22387190  T
Q  284 ttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    
T  22387189 ttgggacaagtggcgtcttctca 22387167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 274
Target Start/End: Original strand, 2190616 - 2190705
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| || |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  2190616 catgtttagggaaatatgctcttttgaccctctaacttaaggaaaatatgctcgtttggccccttatctttacaaaaagttgcggttatg 2190705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 306
Target Start/End: Original strand, 14743401 - 14743522
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||| | || | |||    
T  14743401 catgttttgggaaatatgatcttttgaccctataacttaagagaaatatgctcttttggccccttatttttgcaaaaatttgcgattatagcccctattt 14743500  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||| |||||||| | |||||||    
T  14743501 tgggacacgtggtggcttctca 14743522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 271
Target Start/End: Original strand, 1020478 - 1020559
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgatt 271  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1020478 tttatggaaatatgctattttgaccctctaacataagagaaatatgat-ttttgtccctttatcttttcaaaaagttgtgatt 1020559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21773493 - 21773399
Alignment:
Q  244 ccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca 336  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||| ||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21773493 ccccttatcttctaaaaaagttgcgattttagcccctgttctgggacacgtggcttcttctcaacaattttgggacg-aaagggccaaaattgtca 21773399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9780980 - 9780947
Alignment:
Q  126 ccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9780980 ccccttatgttttaaaaagttgcgattttgatcc 9780947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 212
Target Start/End: Original strand, 15147762 - 15147854
Alignment:
Q  122 ttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttga 212  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||  || | |||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15147762 ttcaccctctaagtttgaaaaagtagcggttttgatcgcttattaaaaaaaggcaaaagtgacccccatgtttagggaaatatgctcttttga 15147854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 51291469 - 51291269
Alignment:
Q  110 taaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaa--aaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctc 206  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  51291469 taaagtccaattttcaccccttaagttttaaaaagttgcaattttggcccctaatgaaagaaaatgacaaaagtgacctcatgtttagggaaatatgttc 51291370  T
Q  207 ttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc 305  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| |||||||||||||    
T  51291369 ttttgaccccctaacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgtgattatggccccttttttgggacatgtggcgtcttctc 51291270  T
Q  306 a 306  Q
    |    
T  51291269 a 51291269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20919619 - 20919335
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaa-tgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccccta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       
T  20919619 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgactcctatgaaaaaaatgacaaaagtgatccaatgtttagggaaatatgctcttttgaccctat 20919520  T
Q  219 acataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttgga 315  Q
    | ||| || || |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||| ||| ||| ||||||||   ||||||| |||    
T  20919519 aaatagga-aaatatgatcttaggaccccttatcttctc-aaaagttgtgattatgatccctcttttgggacatgtgacgtcttctcagcaattttggga 20919422  T
Q  316 cgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||||   ||||||||||| |       ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20919421 cgaaactagccaaaattgtaatttttttaatagagaaccaaaatcgcaacattttgaaacttaggggtcgaaaagtgcagtttagcc 20919335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 332
Target Start/End: Original strand, 4098670 - 4098890
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgaccc 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |  | |||||| ||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4098670 ttttcacctcttaagttttaaaaaattgtgattttgaccccctattaaaaaaacgacaaaagtgaccccctatgttttgggaaatatgctcttttgaccc 4098769  T
Q  216 c-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttt 311  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || | |||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  4098770 cctaacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcaattaaggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcgtcaatttt 4098869  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaatt 332  Q
     |||||||| |||||| ||||    
T  4098870 gggacgaaaggggccataatt 4098890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 402
Target Start/End: Original strand, 35475315 - 35475592
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttga-tcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataaga 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||  |||  |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35475315 taagttttaaaatgttgcgattttggctccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagg 35475414  T
Q  227 gaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagg 323  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||    
T  35475415 gaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagtagcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattttaggatgaaatgg 35475513  T
Q  324 gccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||||||||||||       | || |||||||||| |||||||| || |||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  35475514 gccaaaattgtcatttttttattaagggaccaaaatcgcaacattttaaaacataggggacaaaaagtgcagtttagcc 35475592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6209521 - 6209308
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatc--acatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataag 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||   |||  ||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  6209521 taagttttaaaatgttgcgattttggtcccctattaaaaaaaattacaaaagtgaccccacatgtttagggaattatgcatttttgacccctaacataag 6209422  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgg--tccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaa 320  Q
     |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||| | ||||||    
T  6209421 ggaaaaatgatcttatgaccccttatcttctcaaaaagttgcaactatggccacctttttttgggacacgtggtgtcttctcagcaattttggaacgaaa 6209322  T
Q  321 agggccaaaattgt 334  Q
     |||||||||||||    
T  6209321 ggggccaaaattgt 6209308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13397918 - 13397775
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  13397918 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 13397820  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  13397819 agttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 13397775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5304625 - 5304447
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataaga 226  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5304625 taagtttcaaaatgttgcgattttgaccctctattaaaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagg 5304526  T
Q  227 gaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
     || |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  5304525 aaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccattttttgggacacgtggcgtcttctca 5304447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13826661 - 13826489
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  13826661 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttcgggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaa 13826563  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  13826562 gttgcgattatagccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 13826489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24626438 - 24626222
Alignment:
Q  189 gtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttgg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  24626438 gtttagggaaatatgctcttttgactcaataacataagggaaatatgatcttttgactccttatcttctcaaaaagttgtgattatgacccatgttttgg 24626339  T
Q  288 aacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaat 384  Q
     ||| |||| |||||||   ||||||| |||||||  ||||||||| |||||       |||| |||  ||||| |||||||| || |||||||| |       
T  24626338 gacatgtggtgtcttcttaacaattttgggacgaatggggccaaaaatgtcatttttttaata-ggggtcaaaatcgcaacattttaaaacttagagggc 24626240  T
Q  385 gaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24626239 gaaaagtgcagtttagcc 24626222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15059061 - 15058918
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  15059061 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 15058963  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  15058962 agttgcgattatagccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 15058918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1588631 - 1588484
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  1588631 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatag-cctctttttg 1588534  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | ||||||| ||||||||   || |||| | | |||||||||||||||||    
T  1588533 ggacacgtgacgtcttcttagcagttttggaaagaaaagggccaaaattg 1588484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 27018276 - 27018448
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatc-acatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||||||||||||||| |  ||||||    
T  27018276 aaaaaatggcaaaagtgacccatatgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacaaaagggaaatatgtt-ttttgaccccttatccttacaaaaa 27018374  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  27018375 gttgcaattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaatgggccaaaattg 27018448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2715930 - 2715817
Alignment:
Q  192 tagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaaca 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  2715930 tagggaaatatgatcttttgacccctaacatatgggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccattttttgggaca 2715832  T
Q  292 cgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||||    
T  2715831 cgtggcgtcttctca 2715817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 43793874 - 43793631
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacat--gtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||  |||||    
T  43793874 aaaaaatggcaaaagtgaccccatatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatatttacaaaa 43793776  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaa 357  Q
    |||||||| ||||  || | |||||| ||| ||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||| ||        |||| ||| |||||    
T  43793775 agttgcgaatatgaccccttttttgggacatgtggcgtcttctcagcaattttgggacgaaatgggccaaaattgccattttttttaatagggggccaaa 43793676  T
Q  358 accgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    | |||||||| || |||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  43793675 atcgcaacattttaaaacatagggggcgaaaagtgcagtttagcc 43793631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 306
Target Start/End: Original strand, 4357340 - 4357456
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttgga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  4357340 tttagggaaatatgctcttttgaccttctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccctttttttggg 4357438  T
Q  289 acacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4357439 acacctggcgtcttctca 4357456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19232587 - 19232413
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacat--gtttagggaaatatgctcttttgac-ccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||| | |||| ||||||||||||  |||||    
T  19232587 aaaaaatggcaaaagtgatcccatatgtttagggaaatatgctcttttgactccctaacataaggaaaatatgttttttttaccccttatctttacaaaa 19232488  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||  || | || ||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19232487 agttgcgattatgaccccttttctgggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 19232413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9195906 - 9195796
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  9195906 aaaaaatgacaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacccataacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaa 9195808  T
Q  263 gttgcgattatg 274  Q
    ||||||||||||    
T  9195807 gttgcgattatg 9195796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Original strand, 45633451 - 45633670
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc--atttgaaaaaatgacaaaagtga-tcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc- 214  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  45633451 ttttcgccccctaagtttcaaaatattgcgattttgacccctattaaaaaaaatggcaaaagtgactccctatgtttagggaaatatgctctattgaccg 45633550  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||| |||| | ||||||||||| ||||   |||||||    
T  45633551 cctaacataag-gaaatatgctcttttgaccccttatcttttaaaaaagttgtgattatgaccctttttttaggacacgtggcgt-ttctcaacaatttt 45633648  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
     |||| ||| ||||||||||||    
T  45633649 gggacaaaaggggccaaaattg 45633670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 274
Target Start/End: Original strand, 55780400 - 55780558
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55780400 ttttcgccccttaagttttcaaatgttgcgattttggccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacc 55780499  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||||| ||||  || |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  55780500 cctaacctaaggaaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatg 55780558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 274
Target Start/End: Original strand, 55844580 - 55844738
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55844580 ttttcgccccttaagttttcaaatgttgcgattttggccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacc 55844679  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||||| ||||  || |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  55844680 cctaacctaaggaaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatg 55844738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Original strand, 41034727 - 41034839
Alignment:
Q  193 agggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaaca 291  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  41034727 agggaaatatgatcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatttttacaaaaagttgcgattatagtcccttttttggaaca 41034825  T
Q  292 cgtggcgtcttctc 305  Q
    ||||||||||||||    
T  41034826 cgtggcgtcttctc 41034839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36729346 - 36729246
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga-tccatttgaaaaaa-tgacaaaagtga-tcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36729346 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgactccctatgaaaaaattgacaaaagtgaccctcatgtttagggaaatatgatcttttgacccc 36729247  T
Q  217 t 217  Q
    |    
T  36729246 t 36729246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 25011796 - 25011969
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  25011796 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataagggggatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaa 25011894  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||   ||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  25011895 agttgggattatgatcccttttttgggacacgtggcatcttctgagcaattttggaatgaaaggggccaaaattg 25011969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41877304 - 41877099
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttga-tccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataaga 226  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  ||| | | |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  41877304 taagtttcaaaatgttgcgattttggctccctattaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagg 41877205  T
Q  227 gaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagg 323  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||  || | |||| | |||||||||||||| |   |||||||| || |||| ||    
T  41877204 gaaatatgct-ttttgaccccttatct--ttacaaagttgcgattatgaccccttttttaggacacgtggcgtcttttcagcaattttttgatgaaaggg 41877108  T
Q  324 gccaaaatt 332  Q
    |||||||||    
T  41877107 gccaaaatt 41877099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36729263 - 36729159
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaagggcca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||| ||| |||||||||||||   |||||| ||| |||| ||||||    
T  36729263 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagtttcgattatgaccttttttttgggacatgtggcgtcttctcagtaattttgggatgaaaggggcca 36729164  T
Q  328 aaatt 332  Q
    |||||    
T  36729163 aaatt 36729159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6789177 - 6789028
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||  ||| | ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||  |||| ||||    
T  6789177 atgtttagggaaatatgctgtttcgacctcctaacatgagagaaaaatgtt-ttttgacccgttatctttacaaaaaattgcgattatgccccttttttt 6789079  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  6789078 gggacacgtggcgtcttcttagcaattttgggatgaagggggccaaaattg 6789028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Original strand, 52838255 - 52838431
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccat-ttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataaga 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  | || |||||||| ||||| ||| | |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  52838255 taagttttaaaatgttgcgattttgacctctattaaaaaaatggcaaaaatgaccccctatgtttagg-aaatatgctcttttgacctcctaacatacgg 52838353  T
Q  227 gaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||| |||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| ||||||||||    
T  52838354 gaaatatgct-ttttgaccc-ttatctttacaaaaagttgcgattatggtcccttttttgagacacgtgtcgtcttctca 52838431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4433462 - 4433315
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataag 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||  |||  |||||| | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4433462 taagttttaaaatgttgcgattttggcccctattaaaaaaaaaggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataag 4433363  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
      || |||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4433362 gaaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagttgtgattatg 4433315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 402
Target Start/End: Original strand, 9397252 - 9397493
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| | |||| |||| |||||||  |||||    
T  9397252 aaaaaatggcaaaagtgatctcccatgtatagggaaatatgctcttttgaccctctaacataaaggaaatatgtttttttaaccctttatctttacaaaa 9397351  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaa 358  Q
    |||||  ||||| | |||| |||| | ||||||| ||| ||||   ||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||       |||| ||| ||||||    
T  9397352 agttgtcattat-gacctttttttcggacacgtgccgtgttctcaacaattttgggactaaaggggcc-aaattttcatttttttaatagggggccaaaa 9397449  T
Q  359 ccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
     | |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9397450 tcccaacattttaaaacttagggggtgaaaagtgcagtttagcc 9397493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 332
Target Start/End: Original strand, 2931406 - 2931553
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||   ||||    
T  2931406 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcataacataaaggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaaattgcgattgtggccccgttttt 2931504  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca---atttttggacgaaaagggccaaaatt 332  Q
     | || |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||    
T  2931505 tggac-cgtggcgtcttctcagacatttttggatgaaaggggccaaaatt 2931553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25618802 - 25618698
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggcca 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| || |||    
T  25618802 tatgctcttttgaccccttatctttacaaaaagtggcgattatggcccct-ttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaagggacca 25618704  T
Q  328 aaattg 333  Q
    ||||||    
T  25618703 aaattg 25618698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Original strand, 14804413 - 14804465
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14804413 aaaaaatggcaaaagtgatcccatgtttagggaaatatactcttttgacccct 14804465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 47869811 - 47869858
Alignment:
Q  258 aaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47869811 aaaaagttgcgattatgaccctt-ttttggaacacgtggcgtcttctca 47869858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13826314 - 13826280
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgatttt 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13826314 ttttaaccccttaagttttaaaaagttgcgatttt 13826280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 306
Target Start/End: Original strand, 15795412 - 15795521
Alignment:
Q  197 aaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtg 295  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || | | ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||  || | |||| | ||| |||    
T  15795412 aaatatgctcttttgaactcctaacataagggaaataggct-ttttgaccttttatcttttcaaaaagttgggattatgacccattttttaggacatgtg 15795510  T
Q  296 gcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||    
T  15795511 gcgtcttctca 15795521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25011793 - 25011735
Alignment:
Q  344 aatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  25011793 aatagggggccaaaatcgcaacattttgaaacttaggggacgaaaagtggagtttagcc 25011735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Original strand, 48158680 - 48158734
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatctt 239  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  48158680 catgtttagggaaatatgatcttttgaccctctaacataagggaaatatgctctt 48158734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7540279 - 7540250
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7540279 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc 7540250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25618813 - 25618785
Alignment:
Q  189 gtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25618813 gtttagggaaatatgctcttttgacccct 25618785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 159
Target Start/End: Original strand, 43335949 - 43335981
Alignment:
Q  127 cccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43335949 cccttaacttttaaaaagttgcgattttgatcc 43335981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17825785 - 17825599
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatgacaaaagtgat--cacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |  ||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17825785 ttttcatcccataagttttaaaaagttgcgattttggccctctgaaaaaaatgacaaatgtgacacctcatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 17825686  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct 304  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  17825685 aacataagagaaatatgttcttttgaccctttatcttgtcaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttct 17825599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38476686 - 38476537
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttgga 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||     
T  38476686 tttagggaaatatgctcttttgaccccataacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgaccctt-ttttggg 38476588  T
Q  289 acacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca 336  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38476587 acacgtggcgtcttctcagcaattttgggacgaaatgggccaaaattgtca 38476537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 2373160 - 2373449
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgatttt-gatccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||| |||| | |  ||||||| | |||||||||||||||||||     
T  2373160 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttagccccatatgaaaaaaagacaaacgtgaccccctatgtttaagaaaatatgctcttttgaccca 2373259  T
Q  217 taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttg 313  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || | ||| || ||||||||||||||||   ||||||| |    
T  2373260 taacataagggaaatatgatattatgaccccttattttctcaaaaatttgcgattatgacccctttttggggacacgtggcgtcttcttagcaattttgg 2373359  T
Q  314 gacgaaaagggccaaaattgt-cannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    ||||| | ||||||||||||| |        |||| | | |||||| |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2373360 gacgacaggggccaaaattgtcctttttttaaataggaggccaaaatcgcaactttttgaaacttaggggttgaaaagtgcagtttagcc 2373449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23040191 - 23040035
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacc---cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040191 aaaaaatgacaaaagtgacc-catgtttagggaaatatgctcttttgacctcccctaacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 23040093  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaatttttggacgaa 319  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||   ||||||| |||||||    
T  23040092 agttgcgattatgaccctttttttggaaaacgtggcttctcagcaattttgggacgaa 23040035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 336
Target Start/End: Original strand, 34125081 - 34125297
Alignment:
Q  129 cttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatca--catgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacat 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||  |||||| || |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34125081 cttaagttttaaaatgttgcgattttgaccctttattaaaaaaaaggataaaagtgacccttcatgtttagggaaatatgctcttttgatcccctaacat 34125180  T
Q  223 aagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaa 319  Q
    |||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||| |||    
T  34125181 aaggaaaatatgatcatttgacctcttatcttctcaaaaagttgcgattatgacccatgttttggaacacgtggcgtattctcagtaattttgggatgaa 34125280  T
Q  320 aagggccaaaattgtca 336  Q
      |||||||||||||||    
T  34125281 gggggccaaaattgtca 34125297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41663813 - 41663592
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttg---aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |     ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41663813 ttttcaccctttaagttttaaaaagttgcgattttggccccctaagaaaaaaaattacaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgctcttttgacccc 41663714  T
Q  217 -taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattttt 312  Q
     ||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||   |||||||     
T  41663713 ataacataagggaaatatgattttttgactctttattttctcaaaaaattgcgattatggccccttttttgggacacgtggcatcttcttagcaattttg 41663614  T
Q  313 ggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    |||||||| ||| |||||||||    
T  41663613 ggacgaaatgggtcaaaattgt 41663592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 402
Target Start/End: Original strand, 18695028 - 18695306
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataag 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18695028 taagttttaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataag 18695127  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaag 322  Q
     ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   |||||||  || |||| |    
T  18695128 ggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattttgagatgaaagg 18695226  T
Q  323 ggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    ||||||||||| ||       |||| ||| |||||| ||||| || ||||||| |||||   |||||||||| |||||||    
T  18695227 ggccaaaattgccatttttttaatagggggccaaaatcgcaatattttgaaacatagggggcgaaaagtgcactttagcc 18695306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 20653833 - 20653987
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tg--aaaaaatgacaaaagtga--tcacatgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20653833 ttttcatctcttaagttttaaaaagttgcgattttgaccccttatgaaaaaaaatgacaaaagtgacctttcatgtttagggaaatatgctcttttgacc 20653932  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcga 269  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  20653933 cctaacataagtgaaatatgaactttttatctcttatcttctcaaaaagttgcga 20653987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16901239 - 16901067
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  16901239 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaa 16901141  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  16901140 gttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaatgggccaaaattg 16901067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25557165 - 25556945
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgaccc 215  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25557165 ttttcgccccctaagtttcaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccc 25557066  T
Q  216 c-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
    | ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  25557065 cctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcaattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttt 25556967  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
     ||| |||| ||||||||||||    
T  25556966 gggatgaaaggggccaaaattg 25556945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 245656 - 245798
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  245656 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaa 245754  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  245755 gttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 245798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23040346 - 23040196
Alignment:
Q  101 aataaaggttaaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaat-gacaaaagtgatcacatgtttagggaaa 199  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  23040346 aatataggctaaagtacacttttcatcccttaagttttaaaaagttgcgattttgacccctataaaaaaaaagacaaaagtgaccccatatttagggaaa 23040247  T
Q  200 tatgctcttttga--cccctaacataagagaagtatgatcttttgacccct 248  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  23040246 tatgctcttttgacccccctaacataagggaaatatgaccttttgacccct 23040196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37961539 - 37961348
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga-tcc-atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc- 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||  ||| |||  |||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  37961539 ttttcaccccctaagtttcaaaatgttgcaattttggctcctattaaaaaaaatagcaaaagtgatcccccatgtttagggaaatacgctcttttgaccg 37961440  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||  || |||||||| |||||||||    
T  37961439 cctaacataagggaaaaatgatcttttgaccccttaacttctcaaaaagttgcaattatggccccttttaagggacacgtggtgtcttctca 37961348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40428857 - 40428642
Alignment:
Q  188 tgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttg 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  || | |||||    
T  40428857 tgtttagggaaatatgttcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaaattgcgattatgaccccttttttg 40428759  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttaggga 382  Q
    | ||||||||||||||||   ||||||| |||||||  |||||||||||| ||        |||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||     
T  40428758 ggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggacgaagggggccaaaattgccattttttttaataggggaccaaaatcgcaacattttgaaacatagggg 40428659  T
Q  383 atgaaaagtgcagttta 399  Q
      |||||||||| ||||    
T  40428658 gcgaaaagtgcacttta 40428642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35302204 - 35302013
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  |  |  ||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  35302204 ttttctccccttaagtttcaaaatgttgcgattttgaccctctattataaaaatggcaaaagtgacccccatatttagggaaatatgctcttttgacccc 35302105  T
Q  217 -taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
     ||||||||   || |||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  35302104 ctaacataatgtaaatatgatctttttgacccttatcttctaaaaaagctgcgattatggcccctgttctgggacacgtggcgtctgctcaa 35302013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26639280 - 26639136
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacat--gtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||  |||||    
T  26639280 aaaaaatggcaaaagtgaccccatatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgcg-ttttgaccccttatctttacaaaa 26639182  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    |||||| ||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||    
T  26639181 agttgcaattatggcctcttttttgggacacgtggcgtcttctcaa 26639136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 462850 - 462996
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  462850 catgtttagggaaatatgcctttttgacctataatataagagaaatatgttcttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattat-gaccttctttt 462948  T
Q  286 gga-acacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaa 329  Q
      | |||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||    
T  462949 ttagacacgtggcgtcttttcaacaatttttggaccaaaagggccaaa 462996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 19169404 - 19169547
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccct-aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  19169404 aaaaaatggcaaaagtgatcccctatgtttaggaaaatatgctcatttgacctcttaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 19169502  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  19169503 agttgcaattatggcccatttttttgaacacgtggcgtcttctca 19169547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31055557 - 31055384
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  31055557 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccccttaacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaa 31055459  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | |||||||||||  || | || ||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  31055458 aattgcgattatgaccccttttctgggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 31055384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 332
Target Start/End: Original strand, 36641204 - 36641376
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||   ||||    
T  36641204 aaaaaatggcaaaagtgagcccctatgtttagagaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgacccgttatctttataaaa 36641302  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaatt 332  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||   |||||||| || |||| |||||||||||    
T  36641303 agttgcgattatgatcccttttttgggacacatggcgtcttctcagcaattttttgatgaaaggggccaaaatt 36641376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Original strand, 10379367 - 10379453
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10379367 atgtttaggaaaatatgctcttttgacccctaacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatg 10379453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23765632 - 23765492
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||| |  |||||||  ||||||    
T  23765632 aaaaaatgataaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgatcatttatctttacaaaaa 23765534  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23765533 gttgcgattatggt-ctttttttgg-acacgtggcgtcttctca 23765492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23815480 - 23815340
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||| |  |||||||  ||||||    
T  23815480 aaaaaatgataaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgatcatttatctttacaaaaa 23815382  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23815381 gttgcgattatggt-ctttttttgg-acacgtggcgtcttctca 23815340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16307789 - 16307480
Alignment:
Q  99 ataataaaggttaaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgatttt-gatcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgttta 193  Q
    |||||||||| ||| || |  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||  |||||||  ||||||||| | |  |||||||    
T  16307789 ataataaaggctaaggtccacttttcgccctttaagttttaaaatgttgcgattttagctccctattaaaaaaaattgcaaaagtgaccccctatgttta 16307690  T
Q  194 gggaaatatgctcttttga--cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaaca 291  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||  || | |||| | |||    
T  16307689 gggaaatatgctcttttgacccccctaacataaggaaaatatg-ttttttgactccttatctttacaaaaagttgcaattatgacccctttttttggaca 16307591  T
Q  292 cgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaa 388  Q
     ||||||||||||   |||||||  || |||| |||||||||||| ||       |||| |||||||||| | |||||| || |||| |||||  |||||    
T  16307590 tgtggcgtcttctcagcaattttaagatgaaaggggccaaaattgccatttttttaataggggaccaaaatcacaacattttaaaacatagggggtgaaa 16307491  T
Q  389 agtgcagttta 399  Q
    |||||||||||    
T  16307490 agtgcagttta 16307480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 38408690 - 38408861
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  38408690 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagagaaatatgctcttttgaccactaacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaa 38408788  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||| ||||||  || | || ||| ||||||||| ||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  38408789 gttgctattatgacccattttctgggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatg-aaagggccaaaattg 38408861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 307
Target Start/End: Original strand, 7835795 - 7835914
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| | |||||||||||||||||  |||| || || |||||||| |||| ||||     
T  7835795 atgtttagggaaatatgctcttttgacccataacataaggaaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaagaggtgggattatggccctttttttt 7835893  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
      ||| |||||||||||||||    
T  7835894 agacatgtggcgtcttctcaa 7835914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10293306 - 10293219
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10293306 atgttttgggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgactccttatctttccaaaaagttgcgattatg 10293219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 302
Target Start/End: Original strand, 7187206 - 7187388
Alignment:
Q  122 ttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga-tcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ct 217  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||   ||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  7187206 ttcaccccttaagtttgcaaaagtagcgattttgactccctttttaaaaaattggcaaaattgaccccatgtttagggaaatatattcttttgaccctct 7187305  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtctt 302  Q
    |||||||| ||| |||| | || |||||  |||| ||  ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  7187306 aacataagggaaatatg-ttttatgaccaattatttttacaaaaagttgcgattatgaccctt-ttttgggacatgtggcgtctt 7187388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32466112 - 32465987
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgat-cacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagag 227  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  |  | ||||| || ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  32466112 taagtttcaaaatgttgcgattttgatcccctattaaaaaagtggcaaaaatgattctcatgtttaggaaaatatgctcttttgacccctaatataagat 32466013  T
Q  228 aagtatgatcttttgaccccttatctt 254  Q
    || || | | |||||||||||||||||    
T  32466012 aattaag-ttttttgaccccttatctt 32465987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17704806 - 17704718
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgg 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||    
T  17704806 catgtttaggaaaatatgctcttttgacccataacataagggaaatat-actttttgaccctttatctttacaaaaagttgaaattatgg 17704718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31576650 - 31576615
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31576650 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttg 31576615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Original strand, 8645882 - 8645932
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  8645882 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgat 8645932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 156
Target Start/End: Original strand, 15885143 - 15885179
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15885143 ttttcaccccttaagtttcaaaaagttgcgattttga 15885179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15885383 - 15885265
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccct-aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||| | | ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  15885383 atgtttatggaaatattctcttttgacctcttaacataagggaaatatgtt-tgttgaccc-ttatctttacaaaaagtttcgattatggtcattttttt 15885286  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    || ||| |||| || ||||||    
T  15885285 gggacatgtggtgttttctca 15885265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38476768 - 38476732
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38476768 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgtgattttga 38476732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8674043 - 8674014
Alignment:
Q  188 tgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8674043 tgtttagggaaatatgctcttttgacccct 8674014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Original strand, 26639288 - 26639341
Alignment:
Q  349 gggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||    
T  26639288 gggaccaaaatcgcaacattttgaaacttagaggacgaaaagtgaagtttagcc 26639341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 402
Target Start/End: Original strand, 31648239 - 31648288
Alignment:
Q  353 ccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  31648239 ccaaaatcgcaacattttgaaacataggggacgaaaagtgcagtttagcc 31648288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 400
Target Start/End: Original strand, 15885409 - 15885465
Alignment:
Q  344 aatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttag 400  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  15885409 aataagggaccaaaatagcaacattttgaaacttaggggacaaaaagtgcagtttag 15885465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 165 - 335
Target Start/End: Original strand, 1824668 - 1824840
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagt 264  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1824668 aaaaaatggcaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataaggaaaatatgatcttttaacttcttatcttctcaaaaagt 1824767  T
Q  265 tgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtc 335  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1824768 tgcgagtatgg-ccttgttttgggacacgtggcgtcttctcaacaattttgagacgaaaggggccaaaattgtc 1824840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 165 - 335
Target Start/End: Original strand, 1859113 - 1859285
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagt 264  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1859113 aaaaaatggcaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataaggaaaatatgatcttttaacttcttatcttctcaaaaagt 1859212  T
Q  265 tgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtc 335  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1859213 tgcgagtatgg-ccttgttttgggacacgtggcgtcttctcaacaattttgagacgaaaggggccaaaattgtc 1859285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 334
Target Start/End: Original strand, 3207996 - 3208214
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |  | ||||||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3207996 ttttcacctcttaagttttaaaaagttgtgattttggcctctatgaaaaagtgacaaaagtgaacctctatgtttagggaaatatgttcttttgacccct 3208095  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttttgg 314  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  3208096 aacataagggaaatatgatattttgaccccttatcttcttaaaaagttgcgattatgacccattttttgggacacgtggcgtcttctcagtaattttggg 3208195  T
Q  315 acgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  3208196 acg-aaagagccaaaattgt 3208214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18253127 - 18252960
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagt 264  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18253127 aaaaaatggtaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgtttttttgacccataacataagggaaatatgattttttgaccccttatcttctcaaaaagt 18253028  T
Q  265 tgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaa 329  Q
    || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||    
T  18253027 tgtgattatggccactgttttgggacacgtggcgtcttctcagcaattttgggacgaaaggggccaaa 18252960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19391630 - 19391457
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  19391630 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaa 19391532  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19391531 agttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 19391457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7117401 - 7117183
Alignment:
Q  123 tcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc-cta 218  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    |||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7117401 tcaccacttaagtttcaaaaagttgcgattttgaccacctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccatgtttagagaaatatgctcttttgacccacta 7117302  T
Q  219 acataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttgga 315  Q
    ||| ||| | | | || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||   || |||| |||    
T  7117301 acagaaggggaatgtgttcttttaaccccttatctttacaaaaagttgcaattatggccctttttttgggacatgtggcgtcttctcagcagttttagga 7117202  T
Q  316 cgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  7117201 cgaaaggggccaaaattgt 7117183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5192580 - 5192341
Alignment:
Q  102 ataaaggttaaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttaggg 196  Q
    |||||||||||| | |  ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| |||   |||  |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||    
T  5192580 ataaaggttaaacttcacttttcgccctctaagttttaaaatgttgcgattttggtcctctattaaaaaaaatggcaaaagtgacctcctatgtttaggg 5192481  T
Q  197 aaatatgctcttttgacccct-aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtg 295  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||    
T  5192480 aaatatgctcttttgacctcttaacataagggaaatatgtt-ttttgacctcttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacacgtg 5192382  T
Q  296 gcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||   |||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  5192381 gcgtcttctcagcaatttttggataaaaggggccaaaattg 5192341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Original strand, 33895399 - 33895607
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgat-ccatttgaaaaaatga-caaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataag 225  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |||| | ||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33895399 taagttttaaaatgttgcaattttggttccatattaaaaaaaaagcaaaagtgatcccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataag 33895498  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaag 322  Q
     ||| |||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||| |    
T  33895499 ggaaatatg-ttttttaaccccttatctttacaaaaagttgcaattatggccctttttttgg-acacgtggcgtcttctcagaaatttttggatgaaagg 33895596  T
Q  323 ggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||    
T  33895597 ggccaaaattg 33895607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4807819 - 4807670
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||    
T  4807819 atgtttaaggaaatatgttcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccctttttt 4807721  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  4807720 ggaacacgtggcgtcttctcagtaatttttggatgaaatgtgccaaaattg 4807670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Original strand, 38630079 - 38630259
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtga-tcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataa 224  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||   |||  ||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38630079 taagtttcaaaatgttgcgattttgatcccctattaaaaaaaatggtaaaagtgactccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataa 38630178  T
Q  225 gagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    | ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  38630179 gggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 38630259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4519110 - 4518966
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  4519110 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgatctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaa 4519012  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  4519011 agttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcaa 4518966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15869578 - 15869438
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagt 264  Q
    ||||||||  |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  15869578 aaaaaatgctaaaagtgaccttatgtttagagaaatatgctcttttgacctctaac-taagagaaatatgatcttttgaccatctgtcttctcaaaaagt 15869480  T
Q  265 tgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  15869479 tgcgattatgacccctgttttgggacacgtggcgacttctca 15869438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30784507 - 30784335
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  30784507 aaaaaatggcaaaagtgaccccgtatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaa 30784409  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||   ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  30784408 agttgcgattatggccctt-ttttgggacacgtgacttcttctcagcaatttttggatgaatggggccaaaattg 30784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41688331 - 41688210
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccct-aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  41688331 catgtttagagaaatatgttcttttgaccccttaacataagaaaaatctgatattttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgacccatgttt 41688232  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||| |||||| | |||||||||    
T  41688231 tgggacacgtagtgtcttctca 41688210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12723480 - 12723331
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12723480 atgtttagagaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgacccgttatctttacaaaaagttgcgattatggtccctttttt 12723382  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || |||| |||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  12723381 gggacacatggcgtcttctcagcaatttttgcatgaaaggggccaaaattg 12723331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22452389 - 22452244
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttgga 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| | |||| ||||||     
T  22452389 tttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgacctcttatctttacaaaaagttgcgaatatagccctttttttggg 22452291  T
Q  289 acacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaatt 332  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22452290 acacgtggcgtcttctcagcaattttgggacgaaatgggccaaaatt 22452244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 329
Target Start/End: Original strand, 17648304 - 17648473
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  17648304 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 17648402  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaa 329  Q
    |||||||||||||| ||   |||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||| |||| ||||||||    
T  17648403 agttgcgattatggccccctttttaggacacgtggcctcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaa 17648473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8802618 - 8802500
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||    
T  8802618 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaata-gct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccctttttt 8802521  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  8802520 ggaacatgtggcgtcttctca 8802500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 19924326 - 19924469
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  19924326 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatactcttctgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 19924424  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  19924425 agttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 19924469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18881792 - 18881573
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc- 215  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |      
T  18881792 ttttcgccccctaagttttataatgttgcaattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgacc-catgtttagggaaatatgctattttgagctt 18881694  T
Q  216 ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattttt 312  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  || |  ||||| |||| ||| |||||||   |||||||     
T  18881693 ctaacataagggaaatacgctcttttgaccccttatctttacaaaaagttgcaattatgaccccttatttgggacacttggtgtcttctcaacaattttg 18881594  T
Q  313 ggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  18881593 ggacgaagggggccaaaattg 18881573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41385700 - 41385588
Alignment:
Q  197 aaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtg 295  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||| |||| |||||||    
T  41385700 aaatatactcttttgactctctaacataagggaaatatgattttttgaccccttatcatctcaaaaagttgtgattatggcacctgtcttgggacacgtg 41385601  T
Q  296 gcgtcttctcaat 308  Q
    |||| ||||||||    
T  41385600 gcgtattctcaat 41385588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 336
Target Start/End: Original strand, 23565225 - 23565326
Alignment:
Q  238 ttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23565225 ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccttttttttaaacatgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattgt 23565324  T
Q  335 ca 336  Q
    ||    
T  23565325 ca 23565326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21666494 - 21666374
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| || | |||    
T  21666494 catgtttagggaaatatgctctcttgaccccctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttagataaagttgcaattatggccccttttt 21666396  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  21666395 tgggacacatggcgtcttctca 21666374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4423251 - 4423099
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccc--taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtt 283  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||    
T  4423251 catgtttatggaaatatgttcttttaacctccataacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttttcaaaaaattgcgattatgaccctt-tt 4423153  T
Q  284 ttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    ||  |||| ||||| ||||||   ||||||| |||||||  || ||||||||||    
T  4423152 ttttaacatgtggcatcttctcagcaattttgggacgaaggggaccaaaattgt 4423099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 334
Target Start/End: Original strand, 31268365 - 31268514
Alignment:
Q  188 tgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggt-ccttgttttg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||   ||||||||| ||||||| | || | |||||    
T  31268365 tgtttagggaaatatgctcttttgccccataacataagggaa-tatgctctttagaccctttatctttataaaaagttgtgattatgatccccttttttg 31268463  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    | ||| | ||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31268464 ggacatgcggcgtcttcttagcaattttaggacgaaaggggccaaaattgt 31268514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 44147033 - 44147174
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  44147033 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctattttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctt-tacaaaa 44147130  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||||  || | |||||| | || |||||||||||||    
T  44147131 gttgcgattatgaccccttttttgggatacatggcgtcttctca 44147174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32400565 - 32400422
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||  |||||||  |||||    
T  32400565 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagtgaaatatgcgcttttgaccccctaacataagggaaatatgc-cttttgaccatttatctttacaaaa 32400467  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||| ||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  32400466 agttgcaattatgaccccttttttggaacacgtggtgtcttctca 32400422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17857127 - 17857064
Alignment:
Q  213 cccctaacataagagaag--tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17857127 cccctaacataagaaaaaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgtgattatg 17857064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21930081 - 21929974
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataaga 226  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21930081 taagtttcaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagg 21929982  T
Q  227 gaagtatg 234  Q
    ||| ||||    
T  21929981 gaaatatg 21929974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 402
Target Start/End: Original strand, 39181962 - 39182237
Alignment:
Q  132 aagttttaaaaagttgcgattttga--tcc-atttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagaga 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||| |||  |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  39181962 aagttttaaaatgttgcgattttggcctcctattaaaaaaaatggcaaaaatgaccccatgtttagggaaatatgctcttttgacca-taacataaggga 39182060  T
Q  229 agtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggc 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || ||||   ||||||| |||| ||| ||||    
T  39182061 aatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggcctctgttttgggacacgtggtgttttctcagcaattttgggacaaaaggggc 39182160  T
Q  326 caaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||||||||||       |||| |||  |||||  ||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  39182161 caaaattgtcatttttttaatagggggtcaaaattgcaacatttttaaacttagggggcgaaaagtgcagtttagcc 39182237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 186 - 381
Target Start/End: Original strand, 26385345 - 26385544
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26385345 catgtttagggaaatatgctattttgacccctaacataagagaaatatgatattttgacctcttatcttctcaaaaagttgcgattatggcccatgtttt 26385444  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttaggg 381  Q
    || ||| |||||||||| |   ||||||| |||| ||| |||||||||||||||        |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26385445 gggacatgtggcgtcttattagcaattttaggacaaaaggggccaaaattgtcatttttataaatagggggccaaaatcgcaacattttgaaacttaggg 26385544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9157318 - 9157183
Alignment:
Q  139 aaaaagttgcgattttgatccat-ttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatc 237  Q
    |||| |||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9157318 aaaatgttgtgattttgatccctattaaaaaaatggcaaaagtgaccaaatgtttaggaaaatatgctcttttgacccctaacataagtgaaatatgatc 9157219  T
Q  238 ttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattat 273  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9157218 ttttgaccacttatcttctcaaaaagttgcgattat 9157183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 293
Target Start/End: Original strand, 26126338 - 26126445
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26126338 catgtttagggaaatatgcttttttgacccctaacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggcccctgtttt 26126437  T
Q  286 ggaacacg 293  Q
    || |||||    
T  26126438 gggacacg 26126445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 302
Target Start/End: Original strand, 4193552 - 4193750
Alignment:
Q  106 aggttaaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga-tccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcacat-gtttagggaaatatg 203  Q
    |||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||| |||||||||| | |   |||||||||||||||    
T  4193552 aggttaaagtgcactttacactccttaaattttaaaaagttgcgattttggcttcatataaaaaaataacaaaagtgacccctgcgtttagggaaatatg 4193651  T
Q  204 ctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtctt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||||  ||||||| ||||||    
T  4193652 ctcttttgacccttaacataagagaaatatgatcttttgaccccttatcttttcaaaaagttgcaattatggccccttttttgagacacgtgacgtctt 4193750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 24464638 - 24464780
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24464638 aaaaaattgcaagagtgaccccatgtttagggaaatatgttcttttgaccccctaacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaatg 24464737  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  24464738 ttgcgattatggtcattgttttgtgacatgtggcgtcttctca 24464780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 168 - 402
Target Start/End: Original strand, 25002773 - 25003009
Alignment:
Q  168 aaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgc 267  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25002773 aaatggcaaaaatgaccccatgtttagggaaacatgctcttttgacccctaacataaaggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcataaatttgc 25002872  T
Q  268 gattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaa 364  Q
    |||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||   ||| ||| |||  ||| |||||||||||||||       |||| |||||||||| |||||    
T  25002873 gattatgacccgtgttttgggacacatggcgtcctcttagcaactttgggataaaaggggccaaaattgtca-ttttttaataagggaccaaaatcgcaa 25002971  T
Q  365 catcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    ||| || ||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  25002972 cattttaaaacttagggggcgaaaagtacagtttagcc 25003009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Original strand, 29051619 - 29051789
Alignment:
Q  99 ataataaaggttaaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaa 198  Q
    |||| ||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |  |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  29051619 ataaaaaaggttaaggtgcacttttcaacccttaagttttaaaaagttgtgattttgatc---tgaaaaaaatgacgaaagtgatcccatgtttagaaaa 29051715  T
Q  199 atatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattat 273  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29051716 atatgctcctttgacccataatataagagaaaaatgat-ttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattat 29051789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 275
Target Start/End: Original strand, 5111455 - 5111612
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttga--tccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||   |||  |  |||||| || |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5111455 ttttcaccccttaagtttcaaaaacttgtgattttggcctcctgtgaaaaaaaggataaaagtgaccccatgtttaggaaaatatgttcttttgacccct 5111554  T
Q  218 aacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgg 275  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5111555 aacataagggaaatatgatattttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgg 5111612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 120 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13578075 - 13577789
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgaccc 215  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13578075 ttttcgccccctaagtttcaaaatgttgcgattttgaccctctattaaaaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttaaggaaatatgctcttttgaccc 13577976  T
Q  216 ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattttt 312  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  13577975 ctaacataagggaaatatgct-ttttgaccctttatctatacaaaaagttgaaattatggccccttttttggaacacgtggcgtcttctcagcaattttg 13577877  T
Q  313 ggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttag 400  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||       |||| ||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||  || |||||||||||||    
T  13577876 ggatgaaaggggccaaaattgccatttttttaatagggggccaaaatcgcaacattttgaaacatagagagcgagaagtgcagtttag 13577789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 336
Target Start/End: Original strand, 42271357 - 42271569
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttga--tccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataag 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||   |||  || |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42271357 taagtttcaaaatgttgcgattttggcctcctattaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataag 42271456  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaag 322  Q
     ||| |||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||  |    
T  42271457 ggaaatatgct-ttttgaccccttatgtttacaaaaagttgcgattatggccctttttttggaacacgtggcgtcttctcagcaattttcggatgaaggg 42271555  T
Q  323 ggccaaaattgtca 336  Q
    ||||||||||||||    
T  42271556 ggccaaaattgtca 42271569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 333
Target Start/End: Original strand, 19493383 - 19493552
Alignment:
Q  166 aaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagtt 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19493383 aaaaatgacaaaagtgaccccatgtttatggaaatatgctattttgaccccaaacataaggaaaatatgattttttgaccctttatcttctcaaaaag-t 19493481  T
Q  266 gcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca---atttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||   ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19493482 gtgattatggcccctgttttaggacacgtggcgtcttctcagccattttgggatgaaaggggccaaaattg 19493552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21224571 - 21224422
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21224571 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccttttttt 21224473  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |  ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21224472 gagacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 21224422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4571585 - 4571462
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4571585 aaaaaatggcaaaagtgacccaatgtttagggaaatatgctctttttaccccataacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 4571486  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttgg 287  Q
    |||||||| ||| || ||||||||    
T  4571485 ttgcgattgtggcccctgttttgg 4571462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 15681720 - 15681865
Alignment:
Q  193 agggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaaca 291  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||| |||    
T  15681720 agggaactatgatcttttgaccccctaacataagggaactatgatcttttgaccccttatcttgtcaaaaagttgcgattatggcctcttttttgggaca 15681819  T
Q  292 cgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15681820 cgtggcgtcttctcataaattttgggacgaaaggggccaaaattgt 15681865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19195504 - 19195214
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19195504 ttttcaccctctaagttttaaaatgttgcaattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatacgctcttttgacc 19195405  T
Q  215 -cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattt 310  Q
     ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || | |||||| ||| ||||||||||||   ||||||    
T  19195404 tcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgtgattatggccccttttttgggacatgtggcgtcttctcaacaattt 19195306  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |       |||| ||||||||||  |||| || ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  19195305 ttggatgaaaggggccaaaattgctatttttttaataggggaccaaaattgcaatattttgaaacatagggggtgaaaaatgcagtttagcc 19195214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 333
Target Start/End: Original strand, 31493973 - 31494144
Alignment:
Q  166 aaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  31493973 aaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccctctaacataaggaaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaag 31494071  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  31494072 ttgcgattatggccccttttttggaacacgtggcgtcttctcagcaattttaggatgaaaggggccaaaattg 31494144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3403342 - 3403120
Alignment:
Q  119 attttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaa--tgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |  ||||||  |||||||||||| | |  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3403342 attttcacctcttaagttttaaaa-gttgcgattttgaccccctataaaaaaaatgacaaaagtgacccctcatgtataggaaaatatgctcttttgacc 3403244  T
Q  215 cc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aattt 310  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |  | |||||| ||| ||||||||| |||   |||||    
T  3403243 ccctaacataagggaaatatgatcttttgatcccttatgttctcaaaaacttgcgattatgaccacttttttgggacatgtggcgtctcctcaggaattt 3403144  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  3403143 tgggacgaaaggggccaaaattgt 3403120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36746722 - 36746570
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||    
T  36746722 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagagaaatatgc-cttttaaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgacccctttttt 36746624  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca 336  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36746623 gggacacgtggcgtcttctcaacaattttgggatgaaaggggccaaaattgtca 36746570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 307
Target Start/End: Original strand, 43251293 - 43251471
Alignment:
Q  130 ttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagaga 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||    
T  43251293 ttaagttttaaaaagtggcgattttgaccctctagaaaaaatgataaa-gtgatctcatgtttaggaaaatgtactcttttgaccctctaacataaggga 43251391  T
Q  229 agtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgt-ggcgtcttctcaa 307  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |  |||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  43251392 aatatgatcttttgactctttatcttctcaaaaagttacgattaagacccttttttttggacacgtgggcgtcttctcaa 43251471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11843460 - 11843248
Alignment:
Q  128 ccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacat 222  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11843460 ccttaagtttcaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgacctcctatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacat 11843361  T
Q  223 aagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaa 319  Q
    |||  || |||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||   ||||||| ||| |||    
T  11843360 aaggaaaatatgct-ttttgaccccttatccttacaaaaagttgcaattatggcccctttttttgaatacgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaa 11843262  T
Q  320 aagggccaaaattg 333  Q
    | ||||||||||||    
T  11843261 aggggccaaaattg 11843248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27869438 - 27869196
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  27869438 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 27869340  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaa 358  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||   ||||||| ||| |||   ||||||||||||||       |||| |||  |||||    
T  27869339 agttgcgattatggccccttttttgggacacatggcgtcttctcagcaattttgggatgaaggaggccaaaattgtcatttttttaatagggggtcaaaa 27869240  T
Q  359 ccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
     |||||||| ||||||| |||||   |||||||||| |||||||    
T  27869239 tcgcaacattttgaaacatagggggcgaaaagtgcactttagcc 27869196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35337765 - 35337592
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  35337765 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 35337667  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||  || | |||||| |||||||||||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  35337666 agttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgtcttctcaataattttttgatgaaaggggccaaaattg 35337592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3562675 - 3562533
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  3562675 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaa 3562577  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||    
T  3562576 gttgcgattatggccccttttttaggacacgtggcgtcttctca 3562533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 48176181 - 48176033
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || ||    
T  48176181 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttctg 48176083  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  48176082 ggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 48176033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 7365282 - 7365457
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccccta----acataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaa 260  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||     |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7365282 aaaaaatggcaaaagtgacccaatgttttggcaaatatgctctattgacccctaccatgcataagggaaatatgatattttgactccttatcttctcaaa 7365381  T
Q  261 aagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||| ||||||| | ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7365382 aagttgcgattattgcctctgttttgggacacgtgacatcttctcagcaattttgggacgaaaagggccaaaattg 7365457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Original strand, 20636643 - 20636823
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataa 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20636643 taagttttaaaatgttgcgattttggccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataa 20636742  T
Q  225 gagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    | ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  20636743 gggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgttttctca 20636823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Original strand, 2331038 - 2331243
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataag 225  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  || ||  | |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2331038 taagttttaaaatgttgcaattttggccccttattaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataag 2331137  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaag 322  Q
     ||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |  | |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| |||| |    
T  2331138 ggaaatatgct-ttttgactccttatctttacaaaaagttgcgattatggcctattttttgggacaagtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaagg 2331236  T
Q  323 ggccaaa 329  Q
    |||||||    
T  2331237 ggccaaa 2331243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 336
Target Start/End: Original strand, 5087125 - 5087233
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggcca 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  5087125 tatgattttttgaccccttatcttttcaaaaagttgcgattatgatccctattttgggacacgtggcgtcttctcatcaattttgggacgaaaggggcca 5087224  T
Q  328 aaattgtca 336  Q
    |||||||||    
T  5087225 aaattgtca 5087233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41452492 - 41452319
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  41452492 aaaaaatggcaaaagtgaccccttatgtttagggaaatatactcttctgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 41452394  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||  || | |||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41452393 agttgcgattatgaccccttttttgggacacgtgtcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 41452319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 402
Target Start/End: Original strand, 6650639 - 6650814
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggcca 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||||||||||   |||||||| |||||||| |||| |    
T  6650639 tatgctcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggcccctgttttgagacatgtggcgtcttctcatcaattttgggacgaaaggggcta 6650738  T
Q  328 aaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||||||||        |||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  6650739 aaattgtcatattttttaataagggaccacaatcgcaacattttaaaacttagggagaaaaaagttcagtttagcc 6650814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44078151 - 44077942
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatca--catgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataa 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| |||||||| | ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44078151 taagttttaaaacgttgcgattttgaccccctatttaaaaaaatggcgaaagtgacctatcatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataa 44078052  T
Q  225 gagaagtatgatcttttgaccccttatcttctc-aaaaagttgcgattatg--gtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacga 318  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||   ||||  |||||| |||| |||||||||||   ||||||| ||||||    
T  44078051 gagaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaaagttgcgattatgacatcct--ttttgggacacatggcgtcttcttagcaattttgggacga 44077955  T
Q  319 aaagggccaaaat 331  Q
    || || |||||||    
T  44077954 aagggaccaaaat 44077942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9822292 - 9822169
Alignment:
Q  213 cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatt 309  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||   |||||    
T  9822292 cccctaacataagggaaatacgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgacccct-ttttgggacacatggcgtcttctcagcaatt 9822194  T
Q  310 tttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    || |||||||| |||| ||||||||    
T  9822193 ttgggacgaaaggggctaaaattgt 9822169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10724217 - 10724094
Alignment:
Q  213 cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatt 309  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||   |||||    
T  10724217 cccctaacataagggaaatacgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgacccct-ttttgggacacatggcgtcttctcagcaatt 10724119  T
Q  310 tttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    || |||||||| |||| ||||||||    
T  10724118 ttgggacgaaaggggctaaaattgt 10724094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6798186 - 6798074
Alignment:
Q  135 ttttaaaaagttgcgattttgatccat-ttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagta 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  6798186 ttttaaaatgttgcgattttgatccctattaaaaaaatgacaatattgatctcatgtttagggaaatatgctcttttgaccctctaacataagggaaata 6798087  T
Q  233 tgatcttttgaccc 246  Q
    |||| |||||||||    
T  6798086 tgat-ttttgaccc 6798074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21225766 - 21225621
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttg 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| | || | |||||    
T  21225766 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagggaaatatgct-atttgacccctcgtctttacaaaaagttgcgattat-gaccattttttg 21225669  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaat 331  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||| || |||||||    
T  21225668 gaacacgtgacgtcttctcaacaattttaggacgaaagggaccaaaat 21225621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33237689 - 33237513
Alignment:
Q  134 gttttaaaaagttgcgattttga-tcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaa 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |||  |||| ||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| | |    
T  33237689 gttttaaaatgttgcgattttgactccctattaaaaaatatggcaaaagtcaccccatgtttagggcaatatgctcttttcaccccctaaaataagggta 33237590  T
Q  230 gtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33237589 atatgatattttgaccccttaccttctaaaaaagttgtgattatgaccactgttttgggacacgtggcgtcttctca 33237513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 39440328 - 39440219
Alignment:
Q  199 atatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggc 297  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| | ||| |||||    
T  39440328 atatgatcttttgacctcctaacataagggaaatatgatcttttgatcccttatcttttcaaaaagttgcgattatgacccctgttttaggacatgtggc 39440229  T
Q  298 gtcttctcaa 307  Q
    ||||||||||    
T  39440228 gtcttctcaa 39440219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 274
Target Start/End: Original strand, 20638515 - 20638663
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataa 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20638515 taagttttaaaatgttgcgattttggccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataa 20638614  T
Q  225 gagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    | ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20638615 gggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatg 20638663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24597734 - 24597615
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |  |||    
T  24597734 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttctctttacaaaaagttgcgattatggccccttgttt 24597636  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  24597635 gagacacgtggcgtcttctca 24597615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18754557 - 18754398
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttga-c 213  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||   |||  |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18754557 ttttcgccccctaagtttcaaaatgttgcgattttggtcccctattaaaaaaaatggcaaaagtgatcctctatgtttagggaaatatgctcttttgacc 18754458  T
Q  214 ccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  18754457 ccctaacataagggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaatgttgcgattatg 18754398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Original strand, 14624632 - 14624806
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaag 230  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||  || | | |||||||| ||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  14624632 taagtttcaaaatattgcgattttggcccctattaaaaaatggcaaaagtaacccaatgtttaggaaaatatgctcttttgacccataacataagggaaa 14624731  T
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||| | ||||||    
T  14624732 tat-actttttgaccctttatctttacaaaaagttgcaattatggccccttttttgggacacgtggcatgttctca 14624806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 247
Target Start/End: Original strand, 15681608 - 15681743
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaa----aaaatgacaaaagtgat--cacatgtttagggaaatatgctcttttga 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||    |||| |||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15681608 ttttcacccattaagttttaaaaagttgcgattttggtcccctatgaagaaaaaaaagacaaatgtgacacctcatgtttagggaaatatgctcttttga 15681707  T
Q  213 -cccctaacataagagaagtatgatcttttgacccc 247  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15681708 ccccctaacataagggaactatgatcttttgacccc 15681743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 23439677 - 23439799
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||    
T  23439677 catgtttaaggaaatatgatattttgactctctaacttaagggaaatatgctcttttgatcccttatcttttaaaaaagttgcgattatgacccctgttt 23439776  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  23439777 tgggacacgtggcggcttctcaa 23439799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23461242 - 23461120
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||    
T  23461242 catgtttaaggaaatatgttattttgaccctctaacttaagagaaatattctcttttgatcctttatcatttcaaaaagttgcgattatgacccctgttt 23461143  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  23461142 tgggacacgtggcggcttctcaa 23461120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6798095 - 6798011
Alignment:
Q  193 agggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtc 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6798095 agggaaatatgat-ttttgaccctctaacataaggaaaatatgatcttttgaccccttatcttctaaaaaagttgcgattatggtc 6798011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Original strand, 10655415 - 10655563
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || |    
T  10655415 atgtttagggaaatatgctcttttaatcccctaatataagagaaatat--ttttttaaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgacccattttct 10655512  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    || ||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  10655513 gggacacgtggcatcttctgagcaattttgggatgaaaggggccaaaattg 10655563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 336
Target Start/End: Original strand, 17305826 - 17306002
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||  ||||||    
T  17305826 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttaggaaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatttttacaaaaa 17305924  T
Q  263 gttgcgattatg-gtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattgtca 336  Q
    |||| |||||||   || | |||||| ||| |||||||||||   |||||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  17305925 gttgtgattatgacccccttttttgggacatgtggcgtcttctcatcaattttgggatgaaagggcccaaaattgtca 17306002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 402
Target Start/End: Original strand, 42303266 - 42303450
Alignment:
Q  221 ataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacg 317  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | |||||| |||||||| |||||||   |||||||  |||     
T  42303266 ataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaacttgcgatcatgacccct-ttttgggacacgtggtgtcttctcagcaattttgagaca 42303364  T
Q  318 aaaagggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    ||| |||||||||||||||        ||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  42303365 aaaggggccaaaattgtcatttttttaaatagaggaccaaaatcgcaactttttgaaacttaggggtcgagaagtgcagtttagcc 42303450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 402
Target Start/End: Original strand, 8526881 - 8527098
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  8526881 atgtttaggaaaatatgctcatttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgacccct-atttttacaaaaagttgcaattatggcccctttttt 8526978  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttaggga 382  Q
    |  ||||||||| ||||||   ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||       |||| ||| |||||| |||||||| ||||||  |||||     
T  8526979 gagacacgtggcatcttctcagcaattttgggatgaagagggccaaaattgccatttttttaatagggggccaaaatcgcaacattttgaaatatagggg 8527078  T
Q  383 atgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
      |||||||||| |||||||    
T  8527079 gcgaaaagtgcactttagcc 8527098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10024003 - 10023885
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  || |||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  10024003 atgtttagggaaatatgctcttttgacccccttacataaggaaaatatttt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgaatatggcccct-tttt 10023906  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  10023905 gggacacgtggtgtcttctca 10023885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19919881 - 19919703
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataag 225  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||   |||  |||||| | ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19919881 taagtttcaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaaaggcaaaagtgacccccatgtttagg-aaatatgctcttttgacctcctaacataag 19919783  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
      || |||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | || | |||||| |||||| |||| ||||||    
T  19919782 gaaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgtgattatagccccttttttgggacacgtagcgttttctca 19919703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 302
Target Start/End: Original strand, 47113202 - 47113315
Alignment:
Q  190 tttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttgga 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| | | || ||| || ||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||     
T  47113202 tttagggaaatatgctcttttggccctctatctttagggaaataagatcttttggccctttatctttataaaaagttgcgattttggcccctgttttggg 47113301  T
Q  289 acacgtggcgtctt 302  Q
    ||||||||||||||    
T  47113302 acacgtggcgtctt 47113315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 3148007 - 3148128
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  ||| |||| || |||||||| ||| |||  |||||| |||| ||||| | |||| |||    
T  3148007 catgtttagggatatatgctcttttgatcccctaaaataatggaaatatgctcctttgaccctttaactttacaaaaaattgcaattatagccctt-ttt 3148105  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  3148106 tgggacacgaggcgtcttctcaa 3148128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 336
Target Start/End: Original strand, 5348156 - 5348265
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttct-caaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggcc 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||| | | ||| ||||||||   ||||||| ||||||||  || |    
T  5348156 tatgctcttttgaccccttatcttctaaaaaaagttgcgattatggctcctgttttgggatatgtgacgtcttctcagcaattttgggacgaaagaggtc 5348255  T
Q  327 aaaattgtca 336  Q
    ||||||||||    
T  5348256 aaaattgtca 5348265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9822357 - 9822294
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgatttt-gatccatttgaaaaaatgacaaaagtga 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || | ||||||||||||||||||||    
T  9822357 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgtgattttagcaccctatgaaaaaatgacaaaagtga 9822294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10724282 - 10724219
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgatttt-gatccatttgaaaaaatgacaaaagtga 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || | ||||||||||||||||||||    
T  10724282 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgtgattttagcaccctatgaaaaaatgacaaaagtga 10724219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 217
Target Start/End: Original strand, 6650563 - 6650656
Alignment:
Q  126 ccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||  || ||  | |||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6650563 ccccctaagttttaaaattttgcgattttggccccttattaaaaaaatggcaaaagggaccccatatttagggaaatatgctcttttgacccct 6650656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 307
Target Start/End: Original strand, 23473073 - 23473195
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||| |||||| || | ||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||    |||||||| ||||||||||| |||||||  |  |||||    
T  23473073 catgtttaaggaaatgtgttattttgaccctctaacttaagggaaatatgctcttttggtatcttatcttttcaaaaagttgtgattatgacctctgttt 23473172  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  23473173 tgggacacgtggcggcttctcaa 23473195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 307
Target Start/End: Original strand, 3769467 - 3769609
Alignment:
Q  166 aaaaatgacaaaagtga-tcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctc-aaaaa 262  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||| | ||||||||  | |||||    
T  3769467 aaaaatgaaaaatgtgactcccatgtttagagaaatatgcttttttgaccccttaacatatgagaaatatgct-ttttgatctcttatctttacaaaaaa 3769565  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    |||||||||||| ||| | ||| || ||| ||||| |||||||||    
T  3769566 gttgcgattatgatccct-tttcgggacatgtggcatcttctcaa 3769609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24448319 - 24448174
Alignment:
Q  130 ttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataaga 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| | |   |||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  24448319 ttaagttttaaaatgttgcgattttgaccccttattaaaaaaatggcaaaaataacaccatgt---gggaaatatgcttttttgaccccctaacataagg 24448223  T
Q  227 gaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgg 275  Q
    ||| |||| | || ||||||||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  24448222 gaaatatgtttttatgaccccttatctttacaaaaaaatgtgattatgg 24448174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26385321 - 26385263
Alignment:
Q  344 aatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    |||| |||||||||| ||||| || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  26385321 aataggggaccaaaaacgcaatattttgaaatttaggggacgaaaagtgcagtttagcc 26385263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Original strand, 1920994 - 1921039
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctctttt 210  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  1920994 aaaaaatggcaaaagtgactccatgtttagggaaatatgctctttt 1921039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4436171 - 4436135
Alignment:
Q  119 attttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttg 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4436171 atttttaccccttaagttttaaaaagtagcgattttg 4436135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9154481 - 9154397
Alignment:
Q  224 agagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa-gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||| || | || ||| |||||||||| ||||||||    
T  9154481 agagaaatatgctcttttggtcccttatctttgcaaaaaagttgcgattatggccccttttatgggacacgtggcggcttctcaa 9154397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 24730888 - 24730936
Alignment:
Q  258 aaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  24730888 aaaaagttgcgaccatggtcccttttttggaacacgtggcggcttctca 24730936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25002760 - 25002712
Alignment:
Q  353 ccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagc 401  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25002760 ccaaaatcacaacattttgaaacttagggcacgaaaagtgcagtttagc 25002712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 29779 - 29950
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagt 264  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29779 aaaaaatgaaaaaagtgaccccatgtttggggaaatatgctctttggacccctaacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagt 29878  T
Q  265 tgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||| ||||||| |  || ||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29879 tgcaattatggcctctgatttggaacctgtggcgtcttctcagcaattttgggacgaaaggggccaaaattg 29950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 334
Target Start/End: Original strand, 9919 - 10156
Alignment:
Q  103 taaaggttaaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttg--aaaaaatgacaaaagtga-tcacatgtttagggaaa 199  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | ||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  9919 taaaggctaaagtgcattttttaccccttaagttttaaatagttgtgattttggcccctatgaaaaaaaatgacaaaagtgaccctcatgtttagggaaa 10018  T
Q  200 tatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgt 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||  ||| |||||||    
T  10019 tatgctcttttgacccataacataaggaaaatatgatctttagaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatttccccttttttgtgacatgtggcgt 10118  T
Q  300 cttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    |||||   ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  10119 cttctcaacaattttgggacgaaagggaccaaaattgt 10156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Original strand, 19309 - 19516
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagag 227  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19309 taagtttcaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataaggg 19408  T
Q  228 aagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaaggg 324  Q
    || |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||    
T  19409 aaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaatggg 19507  T
Q  325 ccaaaattg 333  Q
    |||||||||    
T  19508 ccaaaattg 19516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 61875 - 62050
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgac-ccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  61875 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacatcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 61973  T
Q  262 agttgcgattatggtcc--ttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||| ||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  61974 agttgcaattatggccccttttttttgggacacgtggcgtcttctcaacaatttttggatgaaaggggccaaaattg 62050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 334
Target Start/End: Original strand, 26239970 - 26240192
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  | |||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26239970 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgtgattttgtcccgctatgaaaaaatgacaaaagtgacccctcatgtttacggaaatatgctcttttgacccc 26240069  T
Q  217 --taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || | || | | ||||||||||||||||   || ||||    
T  26240070 cttaacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctaaaaaagttgcaattatgaccccttttataggacacgtggcgtcttctcggcagtttt 26240169  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
     | |||||| |||||||||||||    
T  26240170 ggaacgaaatgggccaaaattgt 26240192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4013909 - 4013797
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4013909 aaaaaatgtcaaaagtgacccccatgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaatataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaat 4013810  T
Q  263 gttgcgattatgg 275  Q
    |||||||||||||    
T  4013809 gttgcgattatgg 4013797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 306
Target Start/End: Original strand, 9241742 - 9241856
Alignment:
Q  191 ttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaac 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||    
T  9241742 ttagggaaatatgttcttttgaccc-taacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatgccctctgttttgggac 9241840  T
Q  291 acgtggcgtcttctca 306  Q
    || ||||| |||||||    
T  9241841 acatggcgccttctca 9241856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14572420 - 14572248
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||   |||||    
T  14572420 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacatcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttataaaaa 14572322  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14572321 gttgcgattatggccctttttttgggacatgtggcatcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 14572248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 306
Target Start/End: Original strand, 24603384 - 24603565
Alignment:
Q  130 ttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacata 223  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||   |||  |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24603384 ttaagtttcaaaatgttgcgattttgctcccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacata 24603483  T
Q  224 agagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    || ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||    
T  24603484 agggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccctttttttggacacatggcgtcttctca 24603565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35102710 - 35102591
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  35102710 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcaattatggcccctttttt 35102612  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  35102611 gggacacgtggcgtcttctca 35102591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 307
Target Start/End: Original strand, 18791382 - 18791562
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataag 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||  |  | |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18791382 taagttttaaaatgttgcgattttggccctctattaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataag 18791481  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
     ||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||    
T  18791482 ggaaatatgct-ttttgacccctcatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttaggacacgtggcgtcttctcaa 18791562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Original strand, 22269469 - 22269611
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  22269469 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgttcttttgacccttaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaag 22269567  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    ||| | |||||| || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  22269568 ttgtgtttatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctcaa 22269611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Original strand, 31210818 - 31211028
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttga--tcc-atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataa 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||| |||  |||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31210818 taagttttaaaatgttgcgattttggcctcctattaaaaaaaatgacaaaagtgaccccctatgtttaggaaaatatgctcttttgacctcctaacataa 31210917  T
Q  225 gagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaa 321  Q
    | ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  | | |||||| |||||||| |||||||   ||||||| ||| ||||     
T  31210918 gggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatagcaccttttttgggacacgtggtgtcttctcagcaattttgggatgaaag 31211016  T
Q  322 gggccaaaattg 333  Q
    ||||||||||||    
T  31211017 gggccaaaattg 31211028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 15298546 - 15298688
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| | |||||| ||||||||||  |||||    
T  15298546 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataaggaaaatatgtt-ttttgatcccttatctttacaaaa 15298644  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  15298645 agttgcgattatggtcctt-ttttgggacaagtggcgtcttctca 15298688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Original strand, 24051069 - 24051242
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||  |||||    
T  24051069 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagagaaatat-actttttgaccccttatatttacaaaa 24051167  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  24051168 agttgcgattatgacctcttttttgggacacgtggcgtcttctcatcaattttgggatgaaatgggccaaaattg 24051242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 336
Target Start/End: Original strand, 34528237 - 34528385
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttg 286  Q
    ||||||||||||||||    ||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  34528237 atgtttagggaaatat----tttggccccctaacataaatgaaatatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggcgactgttttg 34528332  T
Q  287 gaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgtca 336  Q
    | ||| |||  |||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34528333 ggacatgtgatgtcttctcagcaattttgggacgaaaggggccaaaattgtca 34528385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26710526 - 26710407
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||    
T  26710526 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataaggaaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccctttttt 26710428  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  26710427 gggacacgtggcatcttctca 26710407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 4370982 - 4371065
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcga 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4370982 catgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagggaaatatgctcctttgaccccttatctttacaaaaagttgcga 4371065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 25819746 - 25819888
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaa 262  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  25819746 aaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatactcttctgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaa 25819844  T
Q  263 gttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  25819845 gttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 25819888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4597624 - 4597408
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  4597624 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcaattatggcccctttttt 4597526  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaagggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttaggg 381  Q
    || ||| |||||||||| ||   |||||| ||  |||  |||||||||||||||        |||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  4597525 gggacatgtggcgtcttttcagtaattttgggttgaagggggccaaaattgtcattttttttaataggggaccaaaatcgcaacattttgaaacataggg 4597426  T
Q  382 aatgaaaagtgcagttta 399  Q
       |||||||||| ||||    
T  4597425 ggcgaaaagtgcacttta 4597408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 334
Target Start/End: Original strand, 32451787 - 32451961
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  32451787 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttatagaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 32451885  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    |||||||||||||  || | |||||  ||| ||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32451886 agttgcgattatgaccccttttttgagacatgtggcgtcttctcaacaatttttggatgaaaggggccaaaattgt 32451961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Original strand, 34833986 - 34834129
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||  |||||    
T  34833986 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgacccgttatctttacaaaa 34834084  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||| | ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  34834085 agttacaattatggccccttttttgggacacgtggcgtcttctca 34834129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12291610 - 12291516
Alignment:
Q  213 cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12291610 cccctaacataagggaaatatgatcttttgaccctttatcttctcaaaaagttgcgattatgacatctgttttgggacacatggcgtcttctcaa 12291516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22968444 - 22968225
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttga-cc 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||  |||  |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22968444 ttttcgccccttaagtttcaaaatgttgcgattttggcccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccc 22968345  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || ||  ||||||| | ||||||   |||||||    
T  22968344 cctaacataagggaaatatg-ttttttga-cccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccctt-ttctgagacacgtgacatcttctgagcaatttt 22968248  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
     ||| |||| |||||||||||||    
T  22968247 gggatgaaaggggccaaaattgt 22968225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 334
Target Start/End: Original strand, 23819949 - 23820168
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttga-cc 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||  |||  |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23819949 ttttcgccccttaagtttcaaaatgttgcgattttggcccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgaccc 23820048  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| || ||  ||||||| | ||||||   |||||||    
T  23820049 cctaacataagggaaatatg-ttttttga-cccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccctt-ttctgagacacgtgacatcttctgagcaatttt 23820145  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
     ||| |||| |||||||||||||    
T  23820146 gggatgaaaggggccaaaattgt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24615933 - 24615764
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagt 264  Q
    ||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| || ||||  | ||||||    
T  24615933 aaaaaatga-aaaagtgaccccacgattagggaaatatgctcttttgacccctaacatatgagaaatatgct-ttttgacccattctctttactaaaagt 24615836  T
Q  265 tgcgattatggtcctt-gttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaatt 332  Q
    ||||||||||  ||||  |||||| ||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24615835 tgcgattatgacccttatttttgggacatgtggcgttttctcagcaatttttggacgaaagaggccaaaatt 24615764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16415621 - 16415463
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tga--aaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc- 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||       | |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  16415621 ttttcaccccttaaattttaaaaagttgcgattttgaccccttatgatttttttttacaaaagtgacccctatgtttagggaaatatattcttttgaccg 16415522  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattat 273  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16415521 cctaacataagggaaatatgatattttgaccgcttatcttctaaaaaagttgcgattat 16415463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 296
Target Start/End: Original strand, 8412843 - 8412952
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||    
T  8412843 atgtttagagaaatatgctcttttgaccccctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgacccctttttt 8412941  T
Q  286 ggaacacgtgg 296  Q
    || ||||||||    
T  8412942 gggacacgtgg 8412952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Original strand, 3118764 - 3118914
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||  || | || |    
T  3118764 atgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataagggaaatatg-ttttttgacctcttatctttacaaaaatttgcgattatgaccccttttct 3118862  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    || ||||||| | |||||   |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  3118863 gggacacgtgacatcttctgatcaattttgggatgaaaggggccaaaattgt 3118914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 334
Target Start/End: Original strand, 2636839 - 2637013
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatc-acatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || |||| | |||||||||||||| ||  |||||||    
T  2636839 aaaaaatggcaaaagttatccacatatttaggaaaatatgtttttttgtcccctaacataaggtaaatatgctattttgaccccttatttttacaaaaag 2636938  T
Q  264 ttgcgattatg-gtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    |||||||||||   || | | | |||||| |||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2636939 ttgcgattatgaccccctttctaggaacatgtggcgtcttctcttcaattttaggacgaaaggggccaaaattgt 2637013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20863903 - 20863798
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggcca 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||   ||||||| | ||||||||||||     
T  20863903 tatgctcttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatggccccttttttgggacacatggcgtcttctcagcaattttggaacgaaaagggccg 20863804  T
Q  328 aaattg 333  Q
    ||||||    
T  20863803 aaattg 20863798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19282490 - 19282343
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc--atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataag 225  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||| ||  |||  |||||||||||||||||| | |  ||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  19282490 taagttttaaaatattgcaattttgacccctattaaaaaaaatgacaaaagtgaccccttatgtttaagtaaatatgctattttgaactcctaacataag 19282391  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
     ||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19282390 ggaaatatgca-ttttgaccccttatcttttcaaaaagttgcgattatg 19282343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18749309 - 18749166
Alignment:
Q  193 agggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaaca 291  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  || | |||||| |||    
T  18749309 agggaaatatgttcatttgacctcataacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgtgattatgtccccttttttgggaca 18749211  T
Q  292 cgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
     ||||| |||||   |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  18749210 tgtggcttcttcttatcaatttttgtatgaaaggggccaaaattg 18749166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18749408 - 18749288
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataa 224  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18749408 taagtttcaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcttaacataa 18749309  T
Q  225 gagaagtatgatcttttgacc 245  Q
    | ||| |||| || |||||||    
T  18749308 gggaaatatgttcatttgacc 18749288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32682497 - 32682419
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||    
T  32682497 atgtttagggaaatatgctcttttgacctcataacataaaggaaatatg-ttttttgaccccttatctttacaaaaagtt 32682419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2059096 - 2058991
Alignment:
Q  135 ttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tgaaaaaatgacaaaagtgatca--catgtttagggaaatatgctcttttgac-ccctaacataagagaag 230  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  | | |||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||     
T  2059096 ttttaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaatggcaaaagtgacccttcatgtttagggaaatatgctattttgacaccctaacataagggaaa 2058997  T
Q  231 tatgat 236  Q
    ||||||    
T  2058996 tatgat 2058991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 401
Target Start/End: Original strand, 4013911 - 4013968
Alignment:
Q  344 aatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagc 401  Q
    |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4013911 aatagggggccaaaatcgcaacattttgaaacttaggggacgaaaagtgcagtttagc 4013968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23124977 - 23124878
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| |||  |  |  |||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23124977 ttttcacctcctaaattttaaaatgttgcgattttggtcccctattataaaaatgaaaatagtgaccccatgtttaggaaaatatgctcttttgacccct 23124878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Original strand, 12427292 - 12427402
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttg-acccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctc-aaa 260  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||| |||| | |||| |||| |||||||  | |||    
T  12427292 aaaaaatggcaaaagtgatcccccatgtttagggaaatatgctcttttgaaccattaacataaaggaaatatgttttttttaccctttatctttacaaaa 12427391  T
Q  261 aagttgcgatt 271  Q
    |||||||||||    
T  12427392 aagttgcgatt 12427402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23124895 - 23124852
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23124895 tatgctcttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatg 23124852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8149186 - 8149043
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatccatt--tgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct-aacataagag 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   || |  | |||||||  ||||||||| | ||| |||| ||||||||  ||||||||||| | |||||| | |    
T  8149186 taagttttaaaatgttgcgattttggctcactattaaaaaaattgcaaaagtgacc-catatttaaggaaatataatcttttgaccctttaacatagggg 8149088  T
Q  228 aagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattat 273  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  8149087 aaatatgatcttttgactccttatctt-ttaaaaagttacgattat 8149043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 274
Target Start/End: Original strand, 14195631 - 14195732
Alignment:
Q  175 aaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctctttt-gaccc-ctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgatta 272  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||||| || ||| |||| ||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14195631 aaaagtgaccccatgttaagggaaatatgttctttttgactctctaacatgagggaaatatggtcttttagccccttatttttacaaaaagttgcgatta 14195730  T
Q  273 tg 274  Q
    ||    
T  14195731 tg 14195732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 29473073 - 29473125
Alignment:
Q  103 taaaggttaaagtacgattttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttg 155  Q
    |||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29473073 taaaggttcaagtgcacttttccccccttaagttttaaaaagttgcaattttg 29473125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 334
Target Start/End: Original strand, 112140 - 112362
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaa--tgacaaaagtga--tcacatgtttagggaaatatgctcttttgacc- 214  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||  | |||||||||   || ||  |||||||||||||||  ||||||||     
T  112140 ttttcacctcataagttttaaaaagttgcgattttggtcccctataaaaaaaattacaaaagtgtcctcccagatttagggaaatatgcctttttgacct 112239  T
Q  215 cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   |||||||    
T  112240 cctaacataagggaaatatgatcttttgactccttatcttctcaaaaagttgcggttatggtccattttttgggacatgtggcgtcttctctgcaatttt 112339  T
Q  312 tggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
     ||||||||| ||||||||||||    
T  112340 aggacgaaaaaggccaaaattgt 112362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44065 - 43924
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagt 264  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44065 aaaaaatggcaaaagtgcccccatgtttaggaaaatatgcttttttgacccctaacgaaagggaaatatgatcttttgaccttttatcttctcaaaaagt 43966  T
Q  265 tgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43965 tgcgactatggtccctgttttgggacacgtggcgtcttctca 43924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 142226 - 142017
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac-atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataag 225  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||   |||  |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  142226 taagttttaaaatgttgcaattttggtcccctattaaaaaaaatggcaaaagtgacccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataag 142127  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaag 322  Q
     ||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||   |||||||| || |||| |    
T  142126 ggaaatatgct-ttttgacctcttatctttacaaaaagttgcgattatggcccattttttgggacacgtggcgtcttctaagcaatttttagatgaaagg 142028  T
Q  323 ggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||    
T  142027 ggccaaaattg 142017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 401
Target Start/End: Original strand, 455110 - 455331
Alignment:
Q  186 catgtttagggaaatatgctcttttgacccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||    
T  455110 catgtttaggaaaatatgttcttttaaccccctaacataagggaaatatgatcttttgaccccttatcttctctaaaagttgcgattatgacccattttt 455209  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattgt--cannnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttag 379  Q
    ||| ||| ||||||||||||   ||||||| ||| |||| ||||| |||||||   |       |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  455210 tgggacatgtggcgtcttctcagcaattttgggatgaaaggggccgaaattgtaaaaaaaaattaatagggggccaaaatcgcaacattttgaaacttag 455309  T
Q  380 ggaatgaaaagtgcagtttagc 401  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  455310 ggttcgaaaagtgcagtttagc 455331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 274
Target Start/End: Original strand, 454942 - 455103
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatt-tg---aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgac 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||  | ||   |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  454942 ttttcacccattaagttttaaaaagttgtgattttggccccctatggaaaaaaaatgacaaaagtgaccccccatgtttagggaaatatgctcttttaac 455041  T
Q  214 ccc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    ||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  455042 cccctaacataaaggaaatacgatcttttgaccccttatcttctctaaaagttttgattatg 455103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2292 - 2119
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  2292 aaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggcaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaa 2194  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    |||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2193 agttgcgattatgaccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggggccaaaattg 2119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Original strand, 66259 - 66408
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||    
T  66259 atgtttagggaaatatgctattttgacctcctaacataagggaactatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgacccctttttt 66357  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctc---aatttttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
     |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  66358 tgaacacgtggcgtcttctcagaaatttttggatgaaaggggccaaaattg 66408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5897 - 5753
Alignment:
Q  160 atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttct 256  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||      
T  5897 atttaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatcttta 5799  T
Q  257 caaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttc 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  5798 caaaaagttgcgattatggccctt-ttttgggacacgtggcgtcttc 5753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3203 - 2961
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||||||||  |||||    
T  3203 aaaaaatggcaaaagtgacctcctatgtttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagggaaatatgtt-ttttgacctcttatctttacaaaa 3105  T
Q  262 agttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattgtcannnnnnnaatacgggaccaaaa 358  Q
    |||||| ||||||| |  | |||||| |||||||||||||||   |||||||| ||| |||  |||||||||||| ||       |||| ||| ||||||    
T  3104 agttgcaattatggcctcttttttgggacacgtggcgtcttctcatcaattttgggatgaagggggccaaaattgccatttttttaatagggggccaaaa 3005  T
Q  359 ccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
     |||||||| ||||||| |||||   |||||||||| |||||||    
T  3004 tcgcaacattttgaaacatagggggcgaaaagtgcactttagcc 2961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Original strand, 2021 - 2225
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacc-cctaacataaga 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||   |||  |||||||| ||||||||| | |    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  2021 taagttttaaaatgttgcgattttgaccccctattaaaaaaaatggcaaaagtgacccc----ttagggaaatatgctcttttgacctcctaacataagg 2116  T
Q  227 gaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagg 323  Q
    |||  ||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||    
T  2117 gaaacatgct-ttttgaccccatatctttacaaaaagttgcgattatagccccttttttgggacacgtggcgtcttctcagcaatttttggatgaaaggg 2215  T
Q  324 gccaaaattg 333  Q
    ||||||||||    
T  2216 gccaaaattg 2225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Original strand, 49672 - 49893
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| || |||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  49672 ttttcgccccttaagttttaaaatgttgcgattttggacccctattaaaaaaaatggcacaagtgaccccctatgtttcgggaaatatgctcttttgacc 49771  T
Q  215 cc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattt 310  Q
    || ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || ||| ||||||||| ||||||   ||||||    
T  49772 ccctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttctgggacacgtggcatcttctgagcaattt 49870  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | ||| |||| ||||||||||||    
T  49871 tgggatgaaaggggccaaaattg 49893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Original strand, 62211 - 62432
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgacc 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   |||  |||||||| || |||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  62211 ttttcgccccttaagttttaaaatgttgcgattttggacccctattaaaaaaaatggcacaagtgaccccctatgtttcgggaaatatgctcttttgacc 62310  T
Q  215 cc-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caattt 310  Q
    || ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || | || ||| ||||||||| ||||||   ||||||    
T  62311 ccctaacataagggaaatatgtt-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatgaccccttttctgggacacgtggcatcttctgagcaattt 62409  T
Q  311 ttggacgaaaagggccaaaattg 333  Q
    | ||| |||| ||||||||||||    
T  62410 tgggatgaaaggggccaaaattg 62432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3809 - 3668
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  3809 aaaaaatggcaaaagtgaccccatgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaag 3711  T
Q  264 ttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    || ||||||| | || | |||||| ||||| || |||||||||    
T  3710 tttcgattatagccccttttttgggacacgaggtgtcttctca 3668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1202 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1202
Description:

Target: scaffold1202; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2064 - 1906
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttgaaaaaa--tgacaaaagtgatcac--atgtttagggaaatatgctcttttgaccc 215  Q
    |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2064 ttttcaccctctaagtttcaaaatgttgcgattttgatcccttttaaaaaaaatggcaaaagtgaccccctatgtttagggaaatatgctattttgaccc 1965  T
Q  216 c-taacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg 274  Q
    | ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1964 cctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttacaaaaagttgcgattatg 1906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25183 - 25064
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttga-cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgtttt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||    |||||||| |||||||| || | ||||    
T  25183 atgtttagggaaatatgctcttttgaccccctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttaacaaaagttgtgattatggcccctttttt 25085  T
Q  286 ggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  25084 gggacacgtggcgtcttctca 25064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1875 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1875
Description:

Target: scaffold1875; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 756
Alignment:
Q  131 taagttttaaaaagttgcgattttgatcc---atttgaaaaaatgacaaaagtgatcaca-tgtttagggaaatatgctcttttgaccc-ctaacataag 225  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  1036 taagttttataatgttgcaattttgatcccctattaaaaaaaatggcaaaagtgaccccaatgtttagggatatatgctattttgaccttctaacataag 937  T
Q  226 agaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaag 322  Q
      || |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  || |  ||||| |||  |||||||||||   ||||||| |||||||  |    
T  936 gtaaatatgctcttttgaccccttatctttacaaaaagttgcaattatgaccccttatttgggacatctggcgtcttctcaacaattttgggacgaaggg 837  T
Q  323 ggccaaaattgtca-nnnnnnnaatacgggaccaaaaccgcaacatcttgaaacttagggaatgaaaagtgcagtttagcc 402  Q
    ||||||||||| ||        |||| ||| |||||| |||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  836 ggccaaaattgccattttttttaatagggggccaaaatcgcaacatttcgaaacttaaggggtgaaaagtgcagtttagcc 756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Original strand, 5916 - 6035
Alignment:
Q  187 atgtttagggaaatatgctcttttga--cccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttt 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||| |||    
T  5916 atgtttagggaaatatgctattttgacccccctaacataagggaaatatgct-ttttgaccccttatctttataaaaagttgcgattat-gacctttttt 6013  T
Q  285 tggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  6014 tgggacacgtggcatcttctca 6035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3170 - 2996
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatc-acatgtttagggaaatatgctcttttgacccctaacataagagaagtatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaag 263  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || |||| | |||||||||||||| ||  |||||||    
T  3170 aaaaaatggcaaaagttatccacatatttaggaaaatatgtttttttgtcccctaacataaggtaaatatgctattttgaccccttatttttacaaaaag 3071  T
Q  264 ttgcgattatg-gtccttgttttggaacacgtggcgtcttc---tcaatttttggacgaaaagggccaaaattgt 334  Q
    |||||||||||   || | | | |||||| |||||||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3070 ttgcgattatgaccccctttctaggaacatgtggcgtcttctcttcaattttaggacgaaaggggccaaaattgt 2996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 334
Target Start/End: Original strand, 9163 - 9268
Alignment:
Q  233 tgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatg-gtccttgttttggaacacgtggcgtcttct---caatttttggacgaaaagggccaa 328  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   || | |||||| ||||||| ||||||||   ||||||| |||||||| |||||||    
T  9163 tgatcttttgacccattatcttttcaaaaagttgcgattatgacccccttttttgggacacgtgacgtcttctaagcaattttgggacgaaaggggccaa 9262  T
Q  329 aattgt 334  Q
    ||||||    
T  9263 aattgt 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Original strand, 9101 - 9167
Alignment:
Q  120 ttttcaccccttaagttttaaaaagttgcgattttgatccatttg--aaaaaatgacaaaagtgatc 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||    
T  9101 ttttcacctcttaagttttaaaaagttgcgattttgacccctaagaaaaaaaatgacaaaagtgatc 9167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 35314 - 35262
Alignment:
Q  165 aaaaaatgacaaaagtgatcacatgtttagggaaatatgctcttttgacccct 217  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35314 aaaaaatggcaaaagtgatcccatgtttagggaaatatactcttttgacccct 35262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 250686 - 250618
Alignment:
Q  238 ttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||    
T  250686 ttttgaccccttatctttacaaaaagttgtgattatggccccttttttggggcacgtggcgtcttctca 250618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Original strand, 54499 - 54573
Alignment:
Q  231 tatgatcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||| |||||| |||||||    
T  54499 tatgctcttttggccccttatctttacaaaaagttgcgattatggcccct-ttttgggacatgtggcggcttctca 54573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 128520 - 128450
Alignment:
Q  236 tcttttgaccccttatcttctcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctcaa 307  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  128520 tcttttgaccccttatctaca-aaaaagttgcgattttgaccccttttttggaacacgtggcggcttctcaa 128450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8130 - 8080
Alignment:
Q  256 tcaaaaagttgcgattatggtccttgttttggaacacgtggcgtcttctca 306  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8130 tcaaaaatttgcgattatggcccctgttttgggacacgtggcatcttctca 8080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8183 - 8151
Alignment:
Q  184 cacatgtttagggaaatatgctcttttgacccc 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8183 cacatgtttaggaaaatatgctcttttgacccc 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University