View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7721_high_37 (Length: 394)

Name: NF7721_high_37
Description: NF7721
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7721_high_37
NF7721_high_37
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (13-394)||(22838545-22838926)
chr7 (33-394)||(22874421-22874782)
chr7 (16-386)||(22808121-22808491)
chr7 (16-394)||(22829524-22829902)
chr7 (16-388)||(22803835-22804207)
chr7 (16-394)||(22887791-22888169)
chr7 (16-293)||(22813621-22813898)
chr7 (16-293)||(22892547-22892824)
chr7 (109-388)||(22870333-22870612)
chr7 (33-272)||(22879252-22879491)
chr7 (33-293)||(22896863-22897123)
chr7 (17-215)||(22912331-22912529)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (18-263)||(21151845-21152090)
chr1 (310-394)||(21152092-21152176)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22838926 - 22838545
Alignment:
Q  13 aatatgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22838926 aatatgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgttggaaaagaggtgatattcttgaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatgtgtc 22838827  T
Q  113 tgaagaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggg 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  22838826 tgaagaggtggagttggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttgtgcagtatttggagacg 22838727  T
Q  213 gatataccttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtatactt 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22838726 gatataccctttccagatttgtcttcgcttagtttatctacttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtatactt 22838627  T
Q  313 ctgtgtctattgctgaatccgttctctccggtggtcattgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattggtgcattt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22838626 ctgtgtctattgctgaatccgttctctctggtggtcgttgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattggtgcattt 22838545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 33 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22874782 - 22874421
Alignment:
Q  33 gttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctgaagaggtggaattggtgt 132  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22874782 gttgattgtgtatttgagtgttggaaaagaggtgatattcttgaggcaaaagatgtaaattttgggacaaattatgtgtctgaagaggtggaattggttt 22874683  T
Q  133 tgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggatataccttttccagattt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22874682 tgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagcatgaggcaagttgtgcagtatttggagagggatatacctttgccagattt 22874583  T
Q  233 gtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtatacttctgtgtctattgctgaatcc 332  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22874582 ttcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtatacttctgtgtctatttctgaatcc 22874483  T
Q  333 gttctctccggtggtcattgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattggtgcattt 394  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22874482 gttctctccggtggtcgttgattttaaaatgtacgtgaaattgatttttaattggtgcattt 22874421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22808491 - 22808121
Alignment:
Q  16 atgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||    
T  22808491 atgagagtctaattctagttgattatgtgtttgaatgttggaaaagaggtgaaattcttgaggcaaaagatgtatatttaggaacaaattatgtgtctga 22808392  T
Q  116 agaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggat 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22808391 agaggttgaattggtgttgaaacttggcttgttgtgtttgcattcagagcctctggttagaccaagtatgagacaagttgtgcagtatttggagagggat 22808292  T
Q  216 ataccttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtatacttctg 315  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22808291 atagctttgccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttctggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaagacaagacaatgccatatacttctg 22808192  T
Q  316 tgtctattgctgaatccgttctctccggtggtcattgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattg 386  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  22808191 tgtctattgctgagtctgttctctctggtggtcgttgatttcaaaaggcacgtgaaattgatgcttgattg 22808121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22829902 - 22829524
Alignment:
Q  16 atgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  22829902 atgagagtctaattctagttgattatgtgtttgaatgttggcaaagaggtgagattcttgaggcaaaagatgtaaatttgggcactgattatgtgtctga 22829803  T
Q  116 agaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggat 215  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22829802 ggaggtcgagttggtgttgaaacttggattgttgtgttcacattcagaacctttggctagaccaggtatgagacaagttgtgcagtatttggagagggat 22829703  T
Q  216 ataccttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtatacttctg 315  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22829702 atacctttgccatatttgttttcgcttagtttatcttcttctggtttattttttgggtaccaagtatctgttgaggacaagacaatgccgtatacttctg 22829603  T
Q  316 tgtctattgctgaatccgttctctccggtggtcattgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattggtgcattt 394  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22829602 tatctattgctgagtctgttctctctggtggtcgttgatttcaaaaggcacgtgaaattgatgcttaattggtccattt 22829524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22804207 - 22803835
Alignment:
Q  16 atgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||    
T  22804207 atgagagtctagttctagttgatcatgtgtttgaatgtttgaaaagaggtgaaattcttgaggctaaagatgtatatttaggaacaaattatgtgtctga 22804108  T
Q  116 agaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22804107 agaggtggaattggtgttgaaacttggcttgatgtgttcacattcagagcctttggctagaccaagtatgagacaagttgtgcagtatttggagagggat 22804008  T
Q  216 ataccttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtatacttctg 315  Q
     ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22804007 ttacctttaccagatttgtcattgcttagtttatcttcctatggattaacttttgggcaccaagaacttgttgaggacaagacagtgccatatacttctg 22803908  T
Q  316 tgtctattgctgaatccgttctctccggtggtcattgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattggt 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  22803907 tgtctattgctgaatctgttctctctggtggtcgttgatttcaaaaggcacatgaaattggtgcttaattggt 22803835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22888169 - 22887791
Alignment:
Q  16 atgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||| || ||| ||||| |||||||    
T  22888169 atgagagtctaattctagttgattctgtgtttgaatgttggcaaagaggtgagattcttgaggcaaaagatgttcatttaggaacaaattatgtgtctga 22888070  T
Q  116 agaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||    
T  22888069 agaggtggaattggtgttgaaacttggcttgttgtgttcacattcagagcctttggctagaccaagtatgagacaagttgtacagtatttggagagggat 22887970  T
Q  216 ataccttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtatacttctg 315  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||| |||||||| |    
T  22887969 acacctttgccagatttttcttcgcttagtttatcttcttctggtttaacttttgggtaccaattatttgttgaggacaggagaatgccatatacttcag 22887870  T
Q  316 tgtctattgctgaatccgttctctccggtggtcattgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattggtgcattt 394  Q
     ||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22887869 cgttaattgctgaatctgttctctcgggtggtcgttgatttcaaaagacacgtctaattgatgcttaattggtgcattt 22887791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22813898 - 22813621
Alignment:
Q  16 atgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctga 115  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22813898 atgaaagtgtaattttggttgattgtgtatttgagtgttggaaaagaggtgatattcttgaggcaaaagatgtaaatttggggacaaattatgtgtctga 22813799  T
Q  116 agaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggat 215  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22813798 agaggttgagttggtgttgaaacttggtttgttgtgttcacattcagaacctttggctagaccaggtatgagacaagttgtgcagtatttggagcgggat 22813699  T
Q  216 ataccttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggac 293  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22813698 atacctttgccagatttgccttcgcttagtttatcttcttctggattaacttttgggtaccaagaatattttgaggac 22813621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22892824 - 22892547
Alignment:
Q  16 atgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctga 115  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||    
T  22892824 atgaaagtgtaattttggttgattgtgtatttgagtgttggaaaagaggtgatattcttgaggcaaaagatgtaaatttggggacaaactttgtgtctga 22892725  T
Q  116 agaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggat 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22892724 agaggtggagttggtgttgaaacttggattgttgtgttcacattcagaacctttggctagaccatgtatgagacaagttgtgcagtatttggagagggat 22892625  T
Q  216 ataccttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggac 293  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22892624 atacctttgccagatttgtctttgcttagtttatcttcttctggattaacttttgggtaccaagaattttttgaggac 22892547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 109 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22870612 - 22870333
Alignment:
Q  109 tgtctgaagaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttgga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22870612 tgtctgaagaggtggaattggtgttgaaacttggcttgatgtgttcacattcagagcctttggctagaccaagtatgagacaagttgtgcagtatttgga 22870513  T
Q  209 gggggatataccttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggacaagacaatgccgtat 308  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  22870512 gagggatatacctttaccagctttgtcattgcttagtttatcttcctatggattaacttttgggcaccaagaacttgttgaggacaagacagtgccatat 22870413  T
Q  309 acttctgtgtctattgctgaatccgttctctccggtggtcattgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattggt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  22870412 acttctgtgtctattgctgaatctgttctctctggtggtcgttgatttcaaaaggcacatgaaattggtgcttaattggt 22870333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22879491 - 22879252
Alignment:
Q  33 gttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctgaagaggtggaattggtgt 132  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22879491 gttgatagtgtgtttgagtgttggaaaagaggtgatattcttgaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatgtgtctgaagaggtggaattggtgt 22879392  T
Q  133 tgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggatataccttttccagattt 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22879391 tgaaacttggtttgttgtgttcacattcagaacctttggctagaccaggtatgagacaagttgtgcagtatttggagagggatatacctttgccagattt 22879292  T
Q  233 gtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttggg 272  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22879291 gtctttgcctagtttatcttcttctggattaacttttggg 22879252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22897123 - 22896863
Alignment:
Q  33 gttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctgaagaggtggaattggtgt 132  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22897123 gttgattgtgtctttgagtgttggaaaaggggtaatattcttgaggcaaaagatgtaaatttggggacaaactatgtgtctgaagaggttgaattggtgt 22897024  T
Q  133 tgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggatataccttttccagattt 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22897023 tgaaacttggtttgttgtgttcacattcagaacctttggctagaccaggtatgagacaagttgtacagtatttggaaagggatatacctttaccagattt 22896924  T
Q  233 gtcttcgcttagtttatcttcttttggtttaacttttgggtaccaagaatgtgttgaggac 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22896923 gtctttgcttagtttatcttcttctggtttaacttttgggtaccaagaattttttgaggac 22896863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22912529 - 22912331
Alignment:
Q  17 tgagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctgaa 116  Q
    ||||||| ||||| | ||||||| ||| | ||| |||| ||||| |||||| ||| || |||| |||||||| ||||| ||    |||||| ||  ||||    
T  22912529 tgagagtataattttggttgattatgtttatgattgttggaaaagaggtgagattattgaggctaaagatgtgaatttaggtgtggattatgtggttgaa 22912430  T
Q  117 gaggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggat 215  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||    
T  22912429 gaagttgaattggttttgaaacttggtttgttatgttcacattgtgaggctttggctagaccaagtatgagacaagttttgaggtatttggagagggat 22912331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Original strand, 21151845 - 21152090
Alignment:
Q  18 gagagtctaattctagttgattgtgtgtttgagtgtttgaaaaaaggtgatattcttcaggcaaaagatgtaaatttggggacagattatctgtctgaag 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||| || ||| | ||| |||||||||    
T  21151845 gagagtctaattctagttgattatgtgtttgaatgttggaaaagaggtgaaattcttgaggcaaaagatgcatatttaggaacaaaatatgtgtctgaag 21151944  T
Q  118 aggtggaattggtgttgaaacttggattgttgtgttctcattcagagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttttgcagtatttggagggggatat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21151945 aggtggaattggtgttgaaacttggcttgttgtgttcacattccgagcctttggctagaccaagtatgaggcaagttgtgcagtatttggagagggatat 21152044  T
Q  218 accttttccagatttgtcttcgcttagtttatcttcttttggttta 263  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21152045 acctttgccagatttgtcttcacttagtttatcttcttctggttta 21152090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 394
Target Start/End: Original strand, 21152092 - 21152176
Alignment:
Q  310 cttctgtgtctattgctgaatccgttctctccggtggtcattgattttaaaacgtacgtgaaattgatgcttaattggtgcattt 394  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||| |||| | || |||||||  |||||||| ||| |||||    
T  21152092 cttctgtgtctattgctgaatctgttctctctggtggttgatgatttcaaaaggcacatgaaattagtgcttaatcggtccattt 21152176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University