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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF7723_low_5 (Length: 779)
Name: NF7723_low_5
Description: NF7723
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF7723_low_5 |
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Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 745; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 745; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 763
Target Start/End: Original strand, 56168525 - 56169285
Alignment:
| Q |
3 |
gatcagagggagattagtcttgaaggatttaggaccaagagatataatgtgcttgttgcaaccgatgttgctggacgtggtattgacattcctgatgtgg |
102 |
Q |
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| T |
56168525 |
gatcagagggagattagtcttgaaggatttaggaccaagagatataatgtgcttgttgcaaccgatgttgctggacgtggtattgacattcctgatgtgg |
56168624 |
T |
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| Q |
103 |
ctcatgttatcaactatgatatgcctgggaatattgaaatgtacacccatcgtattgggcgtactggtcgtgcaggaaagacaggtgtggctacaacatt |
202 |
Q |
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| T |
56168625 |
ctcatgttatcaactatgatatgcctgggaatattgaaatgtacacccatcgtattgggcgtactggtcgtgcaggaaagacaggtgtggctacaacatt |
56168724 |
T |
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| Q |
203 |
cctgactcttcaggacactgatgtcttttatgaacttaagcagatgctcattcagagtaacagtcctgttccacctgaattggcaaggcatgaagcttcc |
302 |
Q |
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| T |
56168725 |
cctgactcttcaggacactgatgtcttttatgaacttaagcagatgctcattcagagtaacagtcctgttccacctgaattggcaaggcatgaagcttcc |
56168824 |
T |
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| Q |
303 |
aaattcaagccaggatctattcctgacagaccacctaggcgaaatgacactgtttttgcccattagagaactttcttttgaggtttaaaggcatatatgc |
402 |
Q |
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| T |
56168825 |
aaattcaagccaggatctattcctgacagaccacctaggcgaaatgacactgtttttgcccattaaagaactttcttttgaggtttaaaggcatatatgc |
56168924 |
T |
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| Q |
403 |
gtattgcaggtaataatatcaatgaacattttgctagtgatgcttaggagcctaatatgtgcggttatatataggatcgtgtataaagttcaattaaggc |
502 |
Q |
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| T |
56168925 |
gtattgcaggtaataatatcaatgaacattttactagtgatgcttaggagcctaatatgtgcggttatatataggatcgtgtataaagttcaattaaggc |
56169024 |
T |
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| Q |
503 |
attccttttgtcctgatatcattgtcattgctattgttatgcctgactagagttgctacctgtttattatatttctaacaagaattgataattttagatg |
602 |
Q |
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| T |
56169025 |
attccttttgtcctgatatcattgtcattgctattgttatggctgactagagttgctacctgtttattatatttctaacaagaattgataattttagatg |
56169124 |
T |
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| Q |
603 |
acaatcttttgattggtcttgttatttggcattaacgtttgtcttatgcctattatgatataatgctttttatcatttaactttagtgtttgtcttttat |
702 |
Q |
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| T |
56169125 |
acaatcttttgattggtcttgttatttggcattaacgtttgtcttatgcctattatgatataatgctttttatcatttcactttagtgtttgtcttttat |
56169224 |
T |
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| Q |
703 |
gattttgtttatcactttctctaggctgtgctaacctattttatgtaaatttgctgatgtc |
763 |
Q |
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| T |
56169225 |
gattttgtttatcactttctctaggctgtgctaacctattttatgtaaatttgctgatgtc |
56169285 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 556; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 707187 - 706522
Alignment:
| Q |
1 |
aggatcagagggagattagtcttgaaggatttaggaccaagagatataatgtgcttgttgcaaccgatgttgctggacgtggtattgacattcctgatgt |
100 |
Q |
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| T |
707187 |
aggatcagagggaaattagtcttgaaggatttaggaccaagagatataatgtgcttgttgcaaccgatgttgctggacgtggtattgacattcctgatgt |
707088 |
T |
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| Q |
101 |
ggctcatgttatcaactatgatatgcctgggaatattgaaatgtacacccatcgtattgggcgtactggtcgtgcaggaaagacaggtgtggctacaaca |
200 |
Q |
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| T |
707087 |
ggctcatgttatcaactatgatatgcctgggaatattgaaatgtacacccatcgtattgggcgtaccggccgtgcaggaaagacgggtgtggctacaaca |
706988 |
T |
|
| Q |
201 |
ttcctgactcttcaggacactgatgtcttttatgaacttaagcagatgctcattcagagtaacagtcctgttccacctgaattggcaaggcatgaagctt |
300 |
Q |
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| T |
706987 |
ttcctgactcttcaggacactgatgtcttttatgaacttaagcagatgctcattcagagtaacagtcctgttccacatgaattggcaaggcatgaagctt |
706888 |
T |
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| Q |
301 |
ccaaattcaagccaggatctattcctgacagaccacctaggcgaaatgacactgtttttgcccattagagaactttcttttgaggtttaaaggcatatat |
400 |
Q |
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| T |
706887 |
ccaaattcaagccaggatctattcccgacagaccacctaggcgaaacgacactgtttttacccattagagaactttc--ttgaggtttaaaggcatatat |
706790 |
T |
|
| Q |
401 |
gcgtattgcaggtaataatatcaatgaacattttgctagtgatgcttaggagcctaatatgtgcggttatatataggatcgtgtataaagttcaattaag |
500 |
Q |
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| T |
706789 |
gcatattgcaggta--aatatcaatgaatattttgcaagtgatgcttaggagcctaatatgtgcgattatatataggatcttgtatgaaattcaattaag |
706692 |
T |
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| Q |
501 |
gcattccttttgtcctgatatcattgtcattgctattgttatgcctgactagagttgctacctgtttattatatttctaacaagaattgataattttaga |
600 |
Q |
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| T |
706691 |
gcattccttttgtcctgatatcattgccattgctattgttatgcctgactagagttgctacctgtttattatatttctaacaagaattgatagttttaga |
706592 |
T |
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| Q |
601 |
tgacaatcttttgattggtcttgttatttggcattaacgtttgtcttatgcctattatgatataatgctt |
670 |
Q |
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| T |
706591 |
tgacaatcttttgattggtcttgttatttggtgttaatctttgttttatgcttattatgatataatgctt |
706522 |
T |
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