View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7725_high_6 (Length: 297)

Name: NF7725_high_6
Description: NF7725
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7725_high_6
NF7725_high_6
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (18-279)||(54686509-54686770)
chr3 (22-228)||(9304652-9304857)
chr3 (38-232)||(38166220-38166421)
chr3 (38-218)||(6148531-6148716)
chr3 (38-279)||(19944812-19945060)
chr3 (38-232)||(11812808-11813008)
chr3 (38-214)||(30204703-30204883)
chr3 (38-216)||(17098920-17099103)
chr3 (38-157)||(7851690-7851807)
chr3 (38-212)||(18908686-18908854)
chr3 (38-212)||(22273041-22273209)
chr3 (38-228)||(30140991-30141187)
chr3 (41-228)||(49230256-49230439)
chr3 (47-196)||(17958141-17958289)
chr3 (38-228)||(19230325-19230509)
chr3 (38-216)||(18737981-18738163)
chr3 (38-216)||(51160146-51160328)
chr3 (38-164)||(50113860-50113984)
chr3 (38-154)||(319363-319479)
chr3 (40-212)||(2451267-2451433)
chr3 (38-232)||(16819050-16819248)
chr3 (132-202)||(2048418-2048488)
chr3 (132-202)||(19262744-19262814)
chr3 (38-157)||(12796730-12796847)
chr3 (76-156)||(17936500-17936578)
chr3 (38-152)||(47786618-47786728)
chr3 (38-144)||(54045593-54045696)
chr3 (38-123)||(14296737-14296820)
chr3 (38-123)||(14302364-14302447)
chr3 (132-213)||(45581194-45581275)
chr3 (69-112)||(11199335-11199378)
chr3 (38-202)||(25057042-25057200)
chr3 (132-228)||(33340130-33340227)
chr3 (38-76)||(8630064-8630102)
chr3 (91-148)||(8630102-8630157)
chr3 (38-112)||(12351629-12351702)
chr3 (38-111)||(11062941-11063013)
chr3 (138-224)||(15860926-15861014)
chr3 (38-164)||(19572567-19572686)
chr3 (38-110)||(14523200-14523271)
chr3 (134-202)||(23490865-23490933)
chr3 (208-254)||(8630275-8630322)
chr3 (135-202)||(15940182-15940249)
chr3 (38-109)||(17536846-17536916)
chr3 (38-112)||(14287330-14287403)
chr3 (166-232)||(7851981-7852049)
chr3 (38-102)||(35121928-35121991)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (38-279)||(15762199-15762438)
chr7 (38-216)||(26071941-26072124)
chr7 (38-216)||(26095728-26095911)
chr7 (39-215)||(44863451-44863632)
chr7 (38-215)||(141876-142057)
chr7 (38-215)||(47287983-47288165)
chr7 (38-157)||(15824248-15824364)
chr7 (60-157)||(12545677-12545774)
chr7 (38-232)||(16480822-16481022)
chr7 (38-232)||(7286314-7286515)
chr7 (38-279)||(7290915-7291161)
chr7 (38-232)||(2192592-2192792)
chr7 (38-228)||(13038923-13039107)
chr7 (38-212)||(16416516-16416684)
chr7 (132-213)||(3055076-3055157)
chr7 (38-232)||(14253057-14253256)
chr7 (38-204)||(369150-369320)
chr7 (38-232)||(15952845-15953043)
chr7 (38-202)||(18305659-18305824)
chr7 (136-228)||(11582649-11582743)
chr7 (38-157)||(13867956-13868073)
chr7 (136-228)||(122867-122961)
chr7 (38-111)||(12753179-12753251)
chr7 (216-279)||(7286218-7286282)
chr7 (138-195)||(32496294-32496352)
chr7 (38-97)||(2024699-2024757)
chr7 (217-279)||(7286168-7286231)
chr7 (208-254)||(11285579-11285626)
chr7 (136-228)||(16210072-16210165)
chr7 (135-202)||(18255546-18255613)
chr7 (216-277)||(11285513-11285575)
chr7 (38-102)||(16571983-16572046)
chr7 (38-102)||(16593616-16593679)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (38-279)||(1553937-1554176)
chr6 (38-227)||(35017442-35017638)
chr6 (38-228)||(16827807-16827996)
chr6 (40-216)||(31626748-31626929)
chr6 (38-273)||(18843654-18843893)
chr6 (38-157)||(25646662-25646779)
chr6 (38-157)||(23151713-23151829)
chr6 (38-216)||(35011127-35011309)
chr6 (38-232)||(18128347-18128546)
chr6 (39-214)||(14628374-14628553)
chr6 (39-157)||(18775514-18775629)
chr6 (38-157)||(18578841-18578957)
chr6 (38-232)||(33316399-33316599)
chr6 (138-228)||(18740746-18740838)
chr6 (65-228)||(4989021-4989181)
chr6 (38-212)||(25173525-25173693)
chr6 (38-164)||(19627505-19627628)
chr6 (38-279)||(13622872-13623114)
chr6 (38-157)||(18004927-18005043)
chr6 (38-151)||(22428480-22428593)
chr6 (38-232)||(23975715-23975916)
chr6 (38-152)||(16104857-16104969)
chr6 (99-157)||(18825717-18825774)
chr6 (208-279)||(18128570-18128642)
chr6 (136-228)||(19984905-19984999)
chr6 (135-213)||(17343973-17344051)
chr6 (38-202)||(13016530-13016695)
chr6 (166-225)||(16238717-16238776)
chr6 (60-112)||(18397191-18397243)
chr6 (38-102)||(18422122-18422185)
chr6 (175-215)||(18422184-18422224)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (22-228)||(17907837-17908042)
chr5 (38-157)||(21392439-21392554)
chr5 (38-228)||(11340606-11340792)
chr5 (38-212)||(21661407-21661586)
chr5 (38-232)||(10314-10514)
chr5 (38-228)||(29192661-29192850)
chr5 (38-229)||(19497943-19498140)
chr5 (38-214)||(25944572-25944743)
chr5 (38-228)||(110980-111166)
chr5 (38-157)||(10780182-10780298)
chr5 (38-232)||(25211778-25211975)
chr5 (38-232)||(25275930-25276127)
chr5 (38-216)||(34937578-34937760)
chr5 (38-228)||(18780042-18780228)
chr5 (38-152)||(22885116-22885227)
chr5 (38-228)||(35793152-35793338)
chr5 (38-232)||(43445694-43445894)
chr5 (38-164)||(1171333-1171457)
chr5 (38-212)||(25424671-25424839)
chr5 (38-164)||(11579929-11580050)
chr5 (60-228)||(16534419-16534584)
chr5 (38-157)||(17473771-17473885)
chr5 (38-228)||(22368481-22368667)
chr5 (132-214)||(23510326-23510408)
chr5 (38-157)||(27185579-27185692)
chr5 (99-227)||(28257844-28257979)
chr5 (38-232)||(1221624-1221819)
chr5 (115-157)||(4863641-4863682)
chr5 (38-105)||(23986286-23986352)
chr5 (175-230)||(29192555-29192612)
chr5 (239-279)||(17908028-17908068)
chr5 (38-102)||(24185067-24185130)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (22-228)||(44250-44455)
scaffold0066 (22-228)||(52419-52625)
scaffold0066 (239-279)||(52611-52651)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (38-227)||(21149-21337)
scaffold0039 (166-228)||(21020-21084)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (59-161)||(12985-13086)
scaffold0130 (38-212)||(31127-31295)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (38-228)||(270336-270525)
scaffold0009 (38-157)||(236419-236535)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (38-228)||(41508917-41509115)
chr8 (38-157)||(41243955-41244071)
chr8 (38-157)||(25120752-25120868)
chr8 (38-228)||(3433525-3433711)
chr8 (38-231)||(13664537-13664736)
chr8 (38-231)||(13723812-13724011)
chr8 (38-228)||(43375300-43375486)
chr8 (38-273)||(24108411-24108650)
chr8 (38-216)||(16041381-16041562)
chr8 (38-216)||(16043057-16043238)
chr8 (38-180)||(23631030-23631166)
chr8 (38-157)||(37605290-37605406)
chr8 (38-157)||(22008425-22008541)
chr8 (38-212)||(28835987-28836155)
chr8 (38-228)||(22909332-22909528)
chr8 (38-153)||(6776303-6776415)
chr8 (38-216)||(18610435-18610617)
chr8 (135-216)||(16204001-16204082)
chr8 (38-154)||(20655822-20655936)
chr8 (132-228)||(29758652-29758750)
chr8 (38-108)||(17343487-17343556)
chr8 (132-228)||(24930817-24930915)
chr8 (132-227)||(22323216-22323320)
chr8 (132-228)||(24387402-24387500)
chr8 (38-157)||(24719393-24719506)
chr8 (115-157)||(16416625-16416666)
chr8 (115-157)||(20479981-20480022)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (38-227)||(34393392-34393589)
chr4 (38-216)||(12838002-12838185)
chr4 (38-228)||(53909545-53909743)
chr4 (38-232)||(18166881-18167081)
chr4 (38-228)||(15211522-15211708)
chr4 (38-228)||(19998524-19998710)
chr4 (38-232)||(7134296-7134496)
chr4 (38-216)||(13244613-13244783)
chr4 (38-212)||(18246185-18246353)
chr4 (38-164)||(18294616-18294739)
chr4 (38-157)||(15274540-15274656)
chr4 (38-216)||(19699417-19699599)
chr4 (38-216)||(19710002-19710184)
chr4 (38-232)||(8372614-8372814)
chr4 (39-155)||(45460770-45460886)
chr4 (166-279)||(55378474-55378588)
chr4 (38-232)||(26678186-26678384)
chr4 (132-202)||(109841-109911)
chr4 (38-228)||(16520808-16520995)
chr4 (38-109)||(21961363-21961433)
chr4 (38-215)||(33738484-33738652)
chr4 (136-228)||(54120004-54120098)
chr4 (134-202)||(10642471-10642539)
chr4 (38-202)||(9293719-9293877)
chr4 (38-232)||(22356410-22356609)
chr4 (115-157)||(44345148-44345189)
chr4 (38-155)||(20813769-20813883)
chr4 (91-164)||(47355564-47355636)
chr4 (132-202)||(53706656-53706733)
chr4 (60-106)||(55378691-55378737)
chr4 (38-106)||(8874272-8874339)
chr4 (38-102)||(30236341-30236404)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (38-227)||(41217551-41217748)
chr1 (38-212)||(5676350-5676528)
chr1 (38-228)||(15863315-15863501)
chr1 (38-157)||(22408038-22408155)
chr1 (38-228)||(22352292-22352478)
chr1 (38-228)||(17146827-17147013)
chr1 (38-214)||(2422813-2422990)
chr1 (38-216)||(20252349-20252531)
chr1 (38-228)||(21857760-21857944)
chr1 (99-228)||(44036601-44036730)
chr1 (132-279)||(20529838-20529986)
chr1 (132-195)||(20444098-20444161)
chr1 (60-129)||(20895590-20895659)
chr1 (208-279)||(20589760-20589832)
chr1 (138-214)||(20929844-20929920)
chr1 (134-202)||(22365040-22365108)
chr1 (132-180)||(37846225-37846273)
chr1 (38-227)||(9786114-9786308)
chr1 (38-108)||(35053148-35053217)
chr1 (208-279)||(20589810-20589882)
chr1 (38-152)||(35524234-35524343)
chr1 (38-109)||(21716437-21716507)
chr1 (93-154)||(20589990-20590050)
chr1 (233-277)||(20589886-20589930)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (38-216)||(27957-28141)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (38-215)||(37767-37949)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (38-216)||(31045-31226)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (38-216)||(256638-256820)
scaffold0011 (38-228)||(72126-72310)
scaffold0011 (132-228)||(76507-76605)
scaffold0011 (38-228)||(192775-192959)
scaffold0011 (134-228)||(125107-125203)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (60-227)||(7464-7640)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (38-228)||(335-521)
scaffold0383 (166-230)||(661-727)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (38-216)||(36892438-36892621)
chr2 (38-228)||(34822322-34822508)
chr2 (38-228)||(3801113-3801299)
chr2 (38-214)||(25210900-25211070)
chr2 (134-228)||(9654605-9654701)
chr2 (38-228)||(38706800-38706986)
chr2 (38-212)||(19888745-19888913)
chr2 (132-228)||(43644703-43644801)
chr2 (38-212)||(8941719-8941887)
chr2 (38-157)||(12638064-12638180)
chr2 (38-157)||(21140146-21140262)
chr2 (132-228)||(20629132-20629230)
chr2 (38-216)||(25877696-25877875)
chr2 (137-214)||(460978-461055)
chr2 (132-192)||(23806331-23806391)
chr2 (38-216)||(42180213-42180395)
chr2 (38-231)||(21276329-21276528)
chr2 (133-213)||(22861891-22861971)
chr2 (38-225)||(24966432-24966620)
chr2 (38-213)||(8886457-8886624)
chr2 (38-232)||(12643798-12643993)
chr2 (166-230)||(25211126-25211192)
chr2 (132-202)||(22282491-22282561)
chr2 (143-202)||(22273269-22273328)
chr2 (60-119)||(22691823-22691882)
chr2 (60-119)||(22696470-22696529)
chr2 (38-108)||(4450095-4450164)
chr2 (115-232)||(15631702-15631826)
chr2 (38-111)||(25600180-25600252)
chr2 (38-111)||(28972279-28972350)
chr2 (136-180)||(460929-460973)
chr2 (38-74)||(15631638-15631674)
chr2 (166-227)||(25600347-25600410)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (38-227)||(77605-77802)
scaffold0034 (208-279)||(36128-36200)
scaffold0034 (216-277)||(36062-36124)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (38-153)||(13621-13733)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-228)||(27176-27362)
scaffold0026 (135-202)||(106370-106437)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (38-228)||(811-997)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (38-230)||(252-441)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (38-157)||(21703-21820)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (38-232)||(4624-4824)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (38-232)||(49464-49664)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (38-232)||(156169-156369)
scaffold0023 (132-228)||(85956-86054)
scaffold0023 (174-227)||(58329-58384)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (38-230)||(29644-29842)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (38-216)||(542-724)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (38-157)||(138550-138666)
scaffold0021 (38-216)||(76596-76775)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (38-228)||(2889-3076)
[»] scaffold0269 (2 HSPs)
scaffold0269 (38-232)||(288-491)
scaffold0269 (38-157)||(3062-3179)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (38-157)||(14856-14971)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (39-157)||(5853-5968)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (38-164)||(23047-23170)
scaffold0158 (38-101)||(16383-16445)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (38-157)||(30657-30774)
scaffold0049 (135-202)||(44517-44584)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (38-215)||(20867-21049)
scaffold0008 (38-157)||(28457-28574)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (38-216)||(19310-19482)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (38-216)||(26458-26639)
scaffold0138 (38-164)||(15144-15264)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (38-229)||(2454-2651)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (38-212)||(5228-5396)
scaffold0003 (132-228)||(217445-217543)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (38-129)||(22-112)
scaffold0407 (38-129)||(6486-6576)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (132-228)||(144892-144990)
scaffold0025 (132-228)||(147151-147249)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (38-228)||(33402-33590)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (38-228)||(39254-39442)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (38-214)||(1305-1473)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (38-180)||(15096-15232)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (38-154)||(13971-14087)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (132-214)||(249218-249300)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (135-232)||(54027-54126)
scaffold0032 (146-216)||(110005-110075)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (38-225)||(488-676)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (38-227)||(6988-7184)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (134-228)||(6924-7020)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (38-111)||(59872-59944)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (38-200)||(4432-4593)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (38-228)||(2914-3111)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (39-108)||(3938-4006)
scaffold0673 (115-157)||(3852-3893)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (38-232)||(17533-17730)
scaffold0195 (38-232)||(19563-19760)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (38-150)||(68601-68711)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (138-229)||(7380-7471)
scaffold0498 (138-211)||(12655-12728)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (132-211)||(41073-41152)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (132-228)||(39886-39984)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (38-109)||(90941-91011)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (115-157)||(7157-7198)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (132-202)||(4208-4278)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (216-277)||(17951-18013)
scaffold0292 (41-157)||(17745-17859)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (38-157)||(16777-16891)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (91-164)||(25594-25666)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (38-154)||(12495-12617)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (138-229)||(5268-5359)
scaffold0266 (138-229)||(12870-12961)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (38-112)||(26880-26953)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (132-214)||(197813-197895)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (38-99)||(56213-56273)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (174-227)||(1244-1299)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (69-157)||(94340-94427)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (38-102)||(26590-26653)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (38-102)||(114080-114143)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Original strand, 54686509 - 54686770
Alignment:
Q  18 acatagataagcaggaatagcataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54686509 acatagataagcaggaatagcataatccaaataacagttactcatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcata 54686608  T
Q  118 tacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54686609 tacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatc 54686708  T
Q  218 atgaacaatcaccaacacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54686709 atgaacaatcaccaacacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 54686770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9304857 - 9304652
Alignment:
Q  22 agataagcaggaatagcataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9304857 agataagcaggaatagcataatccaaataatagttaatcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatact 9304758  T
Q  122 tacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatga 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9304757 tacatc-aaaacctcaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatatcatga 9304659  T
Q  222 acaatca 228  Q
    |||||||    
T  9304658 acaatca 9304652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 38166220 - 38166421
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  38166220 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaactcca 38166317  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  38166318 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 38166417  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  38166418 ccaa 38166421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6148716 - 6148531
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  6148716 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacacatacttacatc-aaaacccca 6148619  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatca 218  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  6148618 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaagtattcacacacaatcaccaatcacatatca 6148531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 19944812 - 19945060
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  19944812 cataatccaaataacagttag-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 19944908  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  19944909 atatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 19945008  T
Q  229 cc-aacacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    || | || ||  ||| ||||||||||  | |||||  |||||||||||||||    
T  19945009 ccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatcataagccatgaacaatcacc 19945060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 11812808 - 11813008
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||  ||||||||    
T  11812808 cataatccaaataacaattaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatttatacttacatc--aaacccca 11812904  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  11812905 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 11813004  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  11813005 ccaa 11813008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 30204703 - 30204883
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  30204703 cataatccaaataaaagttaat-atggatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatgttctcatacatatacttacatc--aaacccca 30204799  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30204800 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacat 30204883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 17098920 - 17099103
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  17098920 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcataaatatacttacatc-aaaacccca 17099017  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  17099018 atatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatat 17099103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 7851690 - 7851807
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  | |||||||    
T  7851690 cataatccaaataacagttagt-atgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttatat-gacaacccca 7851787  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7851788 atatctcacatcaataatca 7851807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 18908686 - 18908854
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  18908686 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 18908779  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  18908780 atatctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 18908854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 22273041 - 22273209
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  22273041 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 22273134  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  22273135 atatctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 22273209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 30140991 - 30141187
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||| ||||    
T  30140991 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaatccca 30141087  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  30141088 atatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 30141187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 228
Target Start/End: Original strand, 49230256 - 49230439
Alignment:
Q  41 aatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcata-tacttacatcaaaaaccccaat 139  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| | |||||   || ||||||||||| |  |||||||    
T  49230256 aatccaaataacagttaa-catgaatatttcaattaaaacatcatggacttgatcaataataat-tacacat---tagtacttacatcaca--ccccaat 49230348  T
Q  140 atctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  49230349 atctcacatcaatcttcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 49230439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17958289 - 17958141
Alignment:
Q  47 aataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcac 146  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||    |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  17958289 aataacagttaa-catggatatttcaaagtaaacatcatgtacttgatcaataataatactcccatattaatacttacatcatatcccccaatatctcac 17958191  T
Q  147 atcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcata 196  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  17958190 atcaataatcaccaatcacatgaaccatcatcaattcacagttgttcata 17958141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 19230325 - 19230509
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||    ||||     |||||||||||| |  |||||    
T  19230325 cataatccaaataacagtta-tcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataac---cacacattaatacttacatcaca--cccca 19230416  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||  ||||||||| |||||    
T  19230417 atatctcacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatcatgaataatca 19230509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 18737981 - 18738163
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||| | || ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  18737981 cataatccaaataacagttaa-catgaatattccaatataaacatcatgcacttgatcaatagtactattctcatacatatacttacatc--aaacccca 18738077  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||        |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18738078 atatctcacatcaataatcttcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaattacatat 18738163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51160328 - 51160146
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||| ||    
T  51160328 cataatccaaataacagttaa-catgaatatctcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatc--aaacctca 51160232  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51160231 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatat 51160146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 50113984 - 50113860
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||    
T  50113984 cataatccaaataatagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacattca-atacttacat-tagaacccca 50113888  T
Q  138 atatctcacatcaa-taatcatcgatca 164  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50113887 atatctcacatcaattaatcatcaatca 50113860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 319479 - 319363
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatat--tcacatgcatatacttacatcaaaaaccc 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  319479 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatc-aaaaccc 319382  T
Q  136 caatatctcacatcaataa 154  Q
    |||||||||| || |||||    
T  319381 caatatctcatattaataa 319363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2451433 - 2451267
Alignment:
Q  40 taatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaat 139  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  |||| ||    
T  2451433 taatccagataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatacacttgatcattaataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccgat 2451340  T
Q  140 atctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  2451339 atctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacacttattcattcacaatcaccaatcac 2451267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 16819050 - 16819248
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||  |||||    
T  16819050 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaa--cccca 16819144  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatg-------aaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| |||       ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  16819145 atatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 16819244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 2048418 - 2048488
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  2048418 acccccatatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaat 2048488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19262814 - 19262744
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  19262814 acccccatatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaat 19262744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 12796730 - 12796847
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatatt---cacatgcatatacttacatcaaaaacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||   ||||| || |||||||||||  |||||    
T  12796730 cataatccaaataacagtta-acatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatttcccacat-ca-atacttacatc--aaacc 12796824  T
Q  135 ccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12796825 ccaatatctcacatcaataatca 12796847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 156
Target Start/End: Original strand, 17936500 - 17936578
Alignment:
Q  76 taaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatc 156  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17936500 taaacatcatgcacttgatcaattataatattcccatacatatacttatatcaaa--ccccaatatctcacatcaataatc 17936578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 47786728 - 47786618
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||| | || ||||    
T  47786728 cataatccaaataactgtta-tcatgaatatatcaatt--aacatcatgtacttgatcaataatagttttcacatatatatacttatatc-acaatccca 47786633  T
Q  138 atatctcacatcaat 152  Q
    |||||||||||||||    
T  47786632 atatctcacatcaat 47786618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54045696 - 54045593
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  54045696 cataatccaaataatagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 54045600  T
Q  138 atatctc 144  Q
    |||||||    
T  54045599 atatctc 54045593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 123
Target Start/End: Original strand, 14296737 - 14296820
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatactta 123  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14296737 cataatccaaataatagttaa-catgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatactta 14296820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 123
Target Start/End: Original strand, 14302364 - 14302447
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatactta 123  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14302364 cataatccaaataatagttaa-catgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatactta 14302447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 45581194 - 45581275
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||| || ||||||    
T  45581194 acccccatatctcacatcaataatcatcaatctcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcataattgccaatcaca 45581275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11199378 - 11199335
Alignment:
Q  69 ttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacat 112  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11199378 ttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacat 11199335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Original strand, 25057042 - 25057200
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |   ||||    
T  25057042 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacat--ccca 25057135  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  25057136 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgagcagttatcagttcacaaatattcattcacaat 25057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 33340130 - 33340227
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  33340130 accccaatatctaacatcaataatcattaatcatatgaacaatttccaattcacaa-tattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 33340227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Original strand, 8630064 - 8630102
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaattt 76  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8630064 cataatccaaataacagttaatcatggatatttcaattt 8630102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Original strand, 8630102 - 8630157
Alignment:
Q  91 tgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacat 148  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8630102 tgatcaataacaatatccacatacatatacttacatc--aaaccccaatatctcacat 8630157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12351702 - 12351629
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacat 112  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||| ||||||    
T  12351702 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcagttgatcaacaataatactcacat 12351629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11063013 - 11062941
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcaca 111  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11063013 cataatccacataacaattaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 11062941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15861014 - 15860926
Alignment:
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaaca 224  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| | ||||  |||||||||||    
T  15861014 atatctcacatcaacaatcatcaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcaatcacaatcaccaaccacatttatcatgaaca 15860926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19572686 - 19572567
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |  |||||    
T  19572686 cataatccaaataacagttag-catgaatatttcaatttaa-catcatgtgtttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca--cccca 19572594  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19572593 atatctcacatcaataatcatcaatca 19572567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14523271 - 14523200
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcac 110  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14523271 cataatccacataacaattaa-catgaatattccaatttaaccatcatgtacttgatcaataataatattcac 14523200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 202
Target Start/End: Original strand, 23490865 - 23490933
Alignment:
Q  134 cccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  23490865 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacataaacagttaacaattcacaaatattcattcacaat 23490933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 8630275 - 8630322
Alignment:
Q  208 atcacatatcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcat 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8630275 atcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcat 8630322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15940249 - 15940182
Alignment:
Q  135 ccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||| | ||||||| ||||||    
T  15940249 ccaatatctcacaccaataatcatcaatcatatgaataattaacaagtcacgaatattcattcacaat 15940182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17536916 - 17536846
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattca 109  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  17536916 cataatccacataacatttaa-catgaatatttcaatttaaacttcatgcacttgatcaataataatattca 17536846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 112
Target Start/End: Original strand, 14287330 - 14287403
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacat 112  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  14287330 cataatccacataacaattaa-catgaatagttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataacgttcacat 14287403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 232
Target Start/End: Original strand, 7851981 - 7852049
Alignment:
Q  166 atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatcaccaa 232  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  7851981 atgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaa 7852049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Original strand, 35121928 - 35121991
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataata 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  35121928 cataatccaaataacagtta-acatgaataattcaatataaacatcgtgtacttgatcaataata 35121991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15762438 - 15762199
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15762438 cataatcaaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaa-cctca 15762341  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaatcaccaacacat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15762340 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatatcatgaacaatcaccaacacat 15762241  T
Q  238 ttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||    
T  15762240 ttatcatgaacaatcattaatcatatcccatgaacaatcacc 15762199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26072124 - 26071941
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26072124 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aagacccca 26072027  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcata-------tgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |       ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26072026 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatat 26071941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26095911 - 26095728
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26095911 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aagacccca 26095814  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcata-------tgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |       ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26095813 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatat 26095728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 215
Target Start/End: Original strand, 44863451 - 44863632
Alignment:
Q  39 ataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaa 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  44863451 ataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacttatacttacatc-aaaaccccaa 44863548  T
Q  139 tatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacata 215  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||     |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  44863549 tatctcacatcaataatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacata 44863632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 141876 - 142057
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  141876 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaatcatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaacccca 141972  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacata 215  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||     |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  141973 atatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaattattcatacacaataaccaatcacata 142057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 47287983 - 47288165
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  47287983 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcgtacatatacttacatcaaaaa-ccca 47288080  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacata 215  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  47288081 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaattacata 47288165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15824364 - 15824248
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15824364 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaacccca 15824268  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15824267 atatctcacatcaataatca 15824248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12545774 - 12545677
Alignment:
Q  60 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12545774 catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcttatacatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaacaatca 12545677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16481022 - 16480822
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  16481022 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacatgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 16480926  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  16480925 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 16480826  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  16480825 ccaa 16480822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7286515 - 7286314
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||| | ||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  7286515 cataatcaacataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaacccca 7286418  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  7286417 atatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 7286318  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  7286317 ccaa 7286314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 7290915 - 7291161
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||| ||||    
T  7290915 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaatccca 7291011  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||    
T  7291012 atatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcaagaacaatca 7291111  T
Q  229 ccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
      || ||||||  || ||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||    
T  7291112 ttaatcacatt--tcatgaacaatcaccaatcatattccatgaacaaccacc 7291161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2192792 - 2192592
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  2192792 cataatccaaataacatataa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 2192696  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  2192695 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 2192596  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  2192595 ccaa 2192592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13039107 - 13038923
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |  ||||| ||||||||   ||||     |||||||||||| |  || ||    
T  13039107 cataatccaaataacagtta-tcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatccataataat---cacacattaatacttacatcaca--cctca 13039016  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  13039015 atatctcacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatgttcattcacaatcaccgatcacatttgtcatgaacaatca 13038923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 16416516 - 16416684
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  16416516 cataatccaaataacaggtaa-catgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 16416609  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  16416610 atatctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 16416684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Original strand, 3055076 - 3055157
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  3055076 acccccatatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 3055157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14253256 - 14253057
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  14253256 cataatccaaataacagttaa-catgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcaaatcaatacttacatc--aaacccca 14253160  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatg------aaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatcac 229  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| |||       || | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  14253159 atatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatgacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcac 14253060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 369150 - 369320
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||   |  |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  369150 cataatccaaataacagtta-acatgaatatttcaatataaacatcatacatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 369246  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaatta 204  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||        |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  369247 atatctcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatta 369320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15953043 - 15952845
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||  |||||    
T  15953043 cataatccaaataatagttaa-catgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaa--cccca 15952949  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  15952948 atatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 15952849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18305824 - 18305659
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||   |||||||    ||||||||| ||||  |||||    
T  18305824 cataatccaaataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacaccaaa--cccca 18305731  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18305730 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaat 18305659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11582743 - 11582649
Alignment:
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||  |||||||||||||||    
T  11582743 caatatctcacatcaataatcatcaatcacatggacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatca 11582649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13868073 - 13867956
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| | || | ||    
T  13868073 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatc-ataatctca 13867976  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  13867975 atatctcacattaataatca 13867956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Original strand, 122867 - 122961
Alignment:
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| |||| || |||||| ||| || |||  ||||||||| |||||    
T  122867 caatatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacaattatcaattcacaactattaattcacaatcaccaattacatttatcatgaataatca 122961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Original strand, 12753179 - 12753251
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcaca 111  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12753179 cataatccaaataacatttaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 12753251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7286282 - 7286218
Alignment:
Q  216 tcatgaacaatcaccaac-acatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  7286282 tcatgaataatcaccaaccacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatcacc 7286218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32496352 - 32496294
Alignment:
Q  138 atatctcacatcaataatca-tcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcat 195  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  32496352 atatctcacatcaataatcaatcaatcatatgaacaattatcaattcataattattcat 32496294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 97
Target Start/End: Original strand, 2024699 - 2024757
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaa 97  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  2024699 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7286231 - 7286168
Alignment:
Q  217 catgaacaatcaccaac-acatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||    
T  7286231 catgaacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcacc 7286168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 11285579 - 11285626
Alignment:
Q  208 atcacatatcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcat 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11285579 atcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcat 11285626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Original strand, 16210072 - 16210165
Alignment:
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  16210072 caatatctcacattaataatcattaaacatatgaacaattaccaattcacaa-tattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 16210165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18255613 - 18255546
Alignment:
Q  135 ccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || |||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  18255613 ccaatatctcacaccaataaccatcaattatatgaataattatcaattcacaaatattcattcacaat 18255546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 11285513 - 11285575
Alignment:
Q  216 tcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatca 277  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11285513 tcatgaacaatcattaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatca 11285575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16572046 - 16571983
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataata 102  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16572046 cataatccacataacaattaa-catgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16571983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Original strand, 16593616 - 16593679
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataata 102  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16593616 cataatccacataacaattaa-catgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 1553937 - 1554176
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1553937 cataatcaaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaa-cctca 1554034  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaatcaccaacacat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1554035 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatatcatgaacaatcaccaacacat 1554134  T
Q  238 ttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||    
T  1554135 ttatcatgaacaatcattaatcatatcccatgaacaatcacc 1554176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35017638 - 35017442
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  35017638 cataatccaaataacagttaa-catgaatatatcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatagatatacttacatc-aaaacccca 35017541  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  35017540 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 35017442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16827996 - 16827807
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||    
T  16827996 cataatccaaataacagttaat-atggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacgtcaatacttacatcaaa--cccca 16827900  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||| ||||||| |||||| |||  |||||  ||||||||| |||||    
T  16827899 ttatctcacatcaataatcatcaatcatatgaacagttatcaatttacaaatattcattcacaatcaccagtcacatttatcatgaataatca 16827807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Original strand, 31626748 - 31626929
Alignment:
Q  40 taatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaat 139  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  31626748 taatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aagaccccaat 31626845  T
Q  140 atctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||| | ||||        |||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31626846 atctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatattaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatat 31626929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18843893 - 18843654
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18843893 cataatccaaataacagttaa-catgaatattttaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa-cccca 18843798  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  18843797 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 18843698  T
Q  229 ccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaaca 273  Q
    |||| ||||||  || ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18843697 ccaatcacatt--tcatgaacaatcaccagtcatattccatgaaca 18843654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25646779 - 25646662
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25646779 cataatccaaataacatttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatacatatacttacatc-aaaacccca 25646682  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  25646681 atatttcacattaataatca 25646662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 23151713 - 23151829
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  23151713 cataatccaaataacagttag-catggatatttcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 23151809  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23151810 atatctcacatcaataatca 23151829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35011309 - 35011127
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  35011309 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 35011213  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35011212 atatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatat 35011127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 18128347 - 18128546
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||| | || ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  18128347 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttca-tctaaacatcatgcacttgatcaataattacattcccatacatatacttacatc--aaacccca 18128442  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcat-------atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||       |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  18128443 atatctcacatcaataatctccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcacatatatcatgaacaatcc 18128542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14628553 - 14628374
Alignment:
Q  39 ataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaa 138  Q
    |||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     |||||||||||  |||||||||    
T  14628553 ataatccaaataacatataa-catgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcattaataatattcccacatcaatacttacatc--aaaccccaa 14628457  T
Q  139 tatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14628456 tatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 14628374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 18775514 - 18775629
Alignment:
Q  39 ataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaa 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |   | |||||||||||  |||||||||    
T  18775514 ataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataaaattcaaaaaaaaatacttacatc--aaaccccaa 18775610  T
Q  139 tatctcacatcaataatca 157  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18775611 tatctcacatcaataatca 18775629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 18578841 - 18578957
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  18578841 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcatatgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 18578937  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18578938 atatctcacattaataatca 18578957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33316599 - 33316399
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  33316599 cataaaccaaatagcagttaa-catggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 33316503  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatca--catatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||   | ||||||||||||||    
T  33316502 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatttacatcatgaacaatca 33316403  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  33316402 ccaa 33316399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Original strand, 18740746 - 18740838
Alignment:
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  18740746 atatctcacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcaaaaatattcattcacaattaccaatcacatttatcatgaataatca 18740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 228
Target Start/End: Original strand, 4989021 - 4989181
Alignment:
Q  65 atatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||  |||||  |||  ||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4989021 atatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataataa-cacattaata--cttacatcaca--ccccgatatctcacatcaatattcatcaatca 4989115  T
Q  165 tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    ||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  4989116 tatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 4989181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 25173525 - 25173693
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||    |||||||||||  | |||||     
T  25173525 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatc--acaccccg 25173618  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||  |||||||  | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  25173619 atatctcacatcaatatttgtcaatcatatgaataattatcagtttacaattattcattcacaatcaccaatcac 25173693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Original strand, 19627505 - 19627628
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||   ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  19627505 cataatccaaataacagttaa-cattattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 19627601  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  19627602 atatctcccattaataatcatcaatca 19627628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13623114 - 13622872
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||| ||||||||| | || ||||||||||||   |||||||    ||||||||||||||  |||||    
T  13623114 cataatccaaataacagttaa-catgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaa--cccca 13623021  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaac-aatcac 229  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  13623020 atatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcacatttcatgaacaaatcac 13622921  T
Q  230 caa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||| ||||||  || ||||||||||| | ||| | | |||||| |||||||    
T  13622920 caatcacatt--tcatgaacaatcattaatcacatttcatgaataatcacc 13622872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18005043 - 18004927
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||  |||||    
T  18005043 cataatccaaataatagttaa-catgaacatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaa--cccca 18004947  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18004946 atatctcacatcaataatca 18004927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 151
Target Start/End: Original strand, 22428480 - 22428593
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcat--atacttacatcaaaaaccc 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||  ||  ||||||||||| | | |||    
T  22428480 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaacaataatactcaaatatatcaatacttacatc-atatccc 22428577  T
Q  136 caatatctcacatcaa 151  Q
    ||| ||||||||||||    
T  22428578 caacatctcacatcaa 22428593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 23975715 - 23975916
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatatt---cacatgcatatacttacatcaaaaacc 134  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||   ||||| || ||||||||||||||  ||    
T  23975715 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatttcccacat-ca-atacttacatcaaa--cc 23975809  T
Q  135 ccaatatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||     
T  23975810 ccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacac 23975909  T
Q  226 tcaccaa 232  Q
    |||||||    
T  23975910 tcaccaa 23975916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Original strand, 16104857 - 16104969
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | | |||||    
T  16104857 cataatccaaataacagttaa-catgaataattcgttataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacataacaatacttacatc-ataccccca 16104954  T
Q  138 atatctcacatcaat 152  Q
    |||||||||||||||    
T  16104955 atatctcacatcaat 16104969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18825774 - 18825717
Alignment:
Q  99 aataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18825774 aataatattctcatatatatacttacatcaaaa-ccccaatatctcacatcaataatca 18825717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 18128570 - 18128642
Alignment:
Q  208 atcacatatcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||    
T  18128570 atcacatttcatgaacaatcaccaatcacatttatcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcacc 18128642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19984999 - 19984905
Alignment:
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  19984999 caatatctcacatcaatcgtcatcaatcatgtgaacaattatcgattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 19984905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17344051 - 17343973
Alignment:
Q  135 ccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||||| |||||| ||||||| |||| | ||| ||||||    
T  17344051 ccaatatctcacatcaataaccatcaatcatatgaataactatcaattcacaaatattcattcacattcaccaatcaca 17343973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13016695 - 13016530
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||   |||||    
T  13016695 cataatccaaata-cagttaa-catgaatatttcaatttaa-catcaagcatttgatcaataataatattctaaaaaatatacttacatcaa---cccca 13016602  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||||||||| |||| ||| | ||||        |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13016601 atatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaat 13016530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 225
Target Start/End: Original strand, 16238717 - 16238776
Alignment:
Q  166 atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaa 225  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  16238717 atgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcatgaacaa 16238776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Original strand, 18397191 - 18397243
Alignment:
Q  60 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacat 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  18397191 catgaatatttcaatttaaacttcgtgtacttggtcaataataatattcacat 18397243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Original strand, 18422122 - 18422185
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataata 102  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  18422122 cataattcaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataata 18422185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Original strand, 18422184 - 18422224
Alignment:
Q  175 tatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacata 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18422184 tatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacata 18422224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Original strand, 17907837 - 17908042
Alignment:
Q  22 agataagcaggaatagcataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17907837 agataagcaggaatagcataatccaaataacagttaatcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatact 17907936  T
Q  122 tacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatga 221  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17907937 taca-ccaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatatcatga 17908035  T
Q  222 acaatca 228  Q
    |||||||    
T  17908036 acaatca 17908042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 21392439 - 21392554
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||    
T  21392439 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataaaaatattctcatacatatacttacatc---aacccca 21392534  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21392535 atatctcacatcaataatca 21392554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 11340606 - 11340792
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  11340606 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 11340699  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  11340700 atatctcacataaatattcatcaatcatatgaacgattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 11340792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21661586 - 21661407
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  21661586 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcatacatatgcttacatc-aagacccca 21661489  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21661488 atatctcacaacaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcac 21661407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 10314 - 10514
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  10314 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 10410  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  10411 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 10510  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  10511 ccaa 10514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29192850 - 29192661
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||  ||||     
T  29192850 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaa--ccccg 29192754  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  29192753 atatctcgcatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcaatcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 29192661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 229
Target Start/End: Original strand, 19497943 - 19498140
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     |||||||||||  ||||||||    
T  19497943 cataatgcaaataacagataa-catgaatatttcaatttaaacattacgtacatgatcattaataatattcacacatcaatacttacatc--aaacccca 19498039  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacata--tcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||    
T  19498040 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacttcatgaacaatca 19498139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25944743 - 25944572
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||   |||||     |||||||||||  | |||| |    
T  25944743 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa---tcacacattaatacttacatc--acacccta 25944650  T
Q  138 atatctcacatcaataatc-atcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  25944649 atatctcacattaataatcaatcaatcatatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacat 25944572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 111166 - 110980
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |  ||||     
T  111166 cataattcaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca--ccccg 111073  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  111072 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 110980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10780298 - 10780182
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||  |||||    
T  10780298 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcacatcaatacttacatcaaa--cccca 10780202  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10780201 atatctcacatcaataatca 10780182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25211975 - 25211778
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  25211975 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaactcca 25211880  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaatcacc 230  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  25211879 atatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcacatttcatgaaaaatcacc 25211780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25276127 - 25275930
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  25276127 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaactcca 25276032  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaatcacc 230  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  25276031 atatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcacatttcatgaaaaatcacc 25275932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 34937578 - 34937760
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  34937578 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 34937674  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34937675 atatctaacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatat 34937760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18780228 - 18780042
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  || |     
T  18780228 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgattaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--cctcg 18780135  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  18780134 atatctcacatcaatcttcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 18780042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22885227 - 22885116
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  22885227 cataatccaaataacagtca-tcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 22885131  T
Q  138 atatctcacatcaat 152  Q
    |||||||||||||||    
T  22885130 atatctcacatcaat 22885116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35793338 - 35793152
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  || |     
T  35793338 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--cctcg 35793245  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  35793244 atatctcacatcaatcttcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 35793152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43445894 - 43445694
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  43445894 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 43445798  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||| |||    
T  43445797 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacagtca 43445698  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  43445697 ccaa 43445694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1171457 - 1171333
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  1171457 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaagcccca 1171360  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  1171359 atatctcacattaataaacatcaatca 1171333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 25424671 - 25424839
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  25424671 cataattcaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 25424764  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  25424765 atatttcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 25424839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Original strand, 11579929 - 11580050
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||    
T  11579929 cataattcaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattctcat--atatacttacatcaaaa-ctcca 11580023  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11580024 atatctcacatcagtaatcatcaatca 11580050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 228
Target Start/End: Original strand, 16534419 - 16534584
Alignment:
Q  60 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatc 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||| | |||||  |||  ||||||||| |  |||| |  ||||||||||||| |||||    
T  16534419 catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaacaataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccgaagtctcacatcaatattcatc 16534513  T
Q  160 gatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
     ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  16534514 aatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 16534584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17473885 - 17473771
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  17473885 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacat-ca-atacttacatc--aaacccca 17473791  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17473790 atagctcacatcaataatca 17473771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22368667 - 22368481
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||   |||| |   |||||||||||| |  ||||     
T  22368667 cataatccaaataacagttaa-cattaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat---cacacgttaatacttacatcaca--ccccg 22368574  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  22368573 atatctcacatcgatatccatcaatcatatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 22368481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 23510326 - 23510408
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  23510326 accccaatatctcacatcaatagtcatcaatcatgtgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacat 23510408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27185692 - 27185579
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||   |||||||    ||||||||||||||  |||||    
T  27185692 cataatccaattaacagttaa-catggatatttcaatataaacattatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaa--cccca 27185599  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27185598 atatctcacatcaataatca 27185579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Original strand, 28257844 - 28257979
Alignment:
Q  99 aataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatg-------aaccattatcaactcacaattat 191  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       ||| | |||||| ||||||||||    
T  28257844 aataatattcacatatcaatacttacatcaca--ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattat 28257941  T
Q  192 tcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatc 227  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  28257942 tcatacacaatcaccaatcacatacatcatgaacaatc 28257979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1221819 - 1221624
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| | |  |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  1221819 cataatccaaataacagtta-tcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacat-ca-atacttacatcaaa--cccca 1221728  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  1221727 atagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 1221628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 4863641 - 4863682
Alignment:
Q  115 atatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4863641 atatacttacatcaaaa-ccccaatatctcacatcaataatca 4863682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23986352 - 23986286
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataata 105  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  23986352 cataatccaaataacagttaa-catggatatttctatataaacatcatgcacttgataaataataata 23986286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29192612 - 29192555
Alignment:
Q  175 tatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatcacc 230  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  29192612 tatcaattcacagttattcatacacaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcacc 29192555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Original strand, 17908028 - 17908068
Alignment:
Q  239 tatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17908028 tatcatgaacaatcattaatcatactccatgaacaatcacc 17908068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24185130 - 24185067
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataata 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  24185130 cataatccaaataacagtta-acatgaataattcaatataaacatcatgtaattgatcaataata 24185067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Original strand, 44250 - 44455
Alignment:
Q  22 agataagcaggaatagcataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44250 agataagcaggaatagcataatccgaataacagtcaatcatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatact 44349  T
Q  122 tacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatga 221  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44350 taca-ccaaaaccccaatatctcacatcaataaacatcgatcatatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatatcatga 44448  T
Q  222 acaatca 228  Q
    |||||||    
T  44449 acaatca 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Original strand, 52419 - 52625
Alignment:
Q  22 agataagcaggaatagcataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatact 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52419 agataagcaggaatagcataattcgaataacagtcaatcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatact 52518  T
Q  122 tacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacac-aattaccgatcacatatcatg 220  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52519 taaatc-aaaaccccaatatctcagatcaatagtcatcaatcatatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaaatcaccgatcacatatcatg 52617  T
Q  221 aacaatca 228  Q
    ||||||||    
T  52618 aacaatca 52625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Original strand, 52611 - 52651
Alignment:
Q  239 tatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52611 tatcatgaacaatcattaatcatactccatgaacaatcacc 52651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21337 - 21149
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  |||||||   |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21337 cataatccaaatagtagtta-tcatgaatatttcaatt--aacatcatacatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaacccca 21241  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21240 atatctcacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 21149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21084 - 21020
Alignment:
Q  166 atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatca 228  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  21084 atgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatca 21020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13086 - 12985
Alignment:
Q  59 tcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13086 tcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatc-aaaaccccaatatctcacatcaataatcat 12988  T
Q  159 cga 161  Q
    |||    
T  12987 cga 12985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 31127 - 31295
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||    |||||||||||  | |||||     
T  31127 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatc--acaccccg 31220  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  31221 atatctcacatcaatattcgtcaaacatatgaacaataatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 31295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 270336 - 270525
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||  |||||    
T  270336 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaa--cccca 270432  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  270433 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaataaccaatcacatttatcatgaataatca 270525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 236419 - 236535
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||    
T  236419 cataattcaaataacaattaa-catgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--gaacccca 236515  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  236516 atatctgacatcaataatca 236535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41509115 - 41508917
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41509115 cataatccaaataacagttaat-atggatatttcaattcaaacatcaggcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaacccca 41509017  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||        |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  41509016 atatctcacatcaataatcaccactcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatca 41508917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 41243955 - 41244071
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  41243955 cataatccaaataacagttaa-catgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaacccca 41244051  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41244052 atatctcacatcaataatca 41244071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 25120752 - 25120868
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  25120752 cataatccaaataacagttaa-catgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaacccca 25120848  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  25120849 atatctcacataaataatca 25120868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3433711 - 3433525
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  3433711 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 3433618  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  3433617 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 3433525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13664736 - 13664537
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  13664736 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 13664640  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  13664639 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 13664540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13724011 - 13723812
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  13724011 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 13723915  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  13723914 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 13723815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43375486 - 43375300
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |  |||||    
T  43375486 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca--cccca 43375393  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  43375392 atatcccacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 43375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24108650 - 24108411
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||    
T  24108650 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaactcca 24108555  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  24108554 atatgtcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 24108455  T
Q  229 ccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaaca 273  Q
    |||| ||||||  || ||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  24108454 ccaatcacatt--tcatgaacaatcaccaatcatattccatgaaca 24108411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16041562 - 16041381
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  16041562 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa-cccca 16041467  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16041466 atatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatat 16041381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16043238 - 16043057
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  16043238 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa-cccca 16043143  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16043142 atatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatat 16043057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23631166 - 23631030
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||    |||||||||||  | |||||     
T  23631166 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatc--acaccccg 23631073  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaa 180  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23631072 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaa 23631030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 37605290 - 37605406
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||    
T  37605290 cataatctaaataacagttaa-catgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc--aaacccca 37605386  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  37605387 atatttcacatcaataatca 37605406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22008541 - 22008425
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  22008541 cataatccaaataacagttaa-cataaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 22008445  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22008444 atatctcacatcaataatca 22008425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 28835987 - 28836155
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  28835987 cataatccaaataacagttaacc-tgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 28836080  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  28836081 atatctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 28836155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22909528 - 22909332
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||| ||||    
T  22909528 cataatccaaataatagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaatccca 22909432  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  22909431 atatctcaaattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 22909332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6776415 - 6776303
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  6776415 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 6776319  T
Q  138 atatctcacatcaata 153  Q
    ||||||||||||||||    
T  6776318 atatctcacatcaata 6776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 18610435 - 18610617
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  18610435 cataatccaaataacagttaa-catgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 18610531  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18610532 atatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatat 18610617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16204082 - 16204001
Alignment:
Q  135 ccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16204082 ccaatatctcacatcaataatcattaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatat 16204001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20655936 - 20655822
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| |  | ||||    
T  20655936 cataatccaaataacagttag-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatatccacatatgtatacttatatc-atgatccca 20655839  T
Q  138 atatctcacatcaataa 154  Q
    |||||||||||||||||    
T  20655838 atatctcacatcaataa 20655822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 29758652 - 29758750
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| || |||  ||||||||| |||||    
T  29758652 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacattaacaattatcaattcacaactattcattcacaatcaccaattacatttatcatgaataatca 29758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Original strand, 17343487 - 17343556
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattc 108  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  17343487 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 17343556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24930915 - 24930817
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  24930915 accccaatatttcacatcaatattcatcaatcatatgaataattatcaattcacaaatattcgttcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 24930817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22323320 - 22323216
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccat-------tatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||       |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  22323320 accccaatatctcacatcaatattcatcaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcatgaa 22323221  T
Q  223 caatc 227  Q
    |||||    
T  22323220 caatc 22323216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24387500 - 24387402
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||| |||  |||||  ||||||||| |||||    
T  24387500 accccgatatttcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcgttcacaatcaccactcacatgtatcatgaataatca 24387402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24719506 - 24719393
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||   |||||||    |||||| |||||||  |||||    
T  24719506 cataatccaaataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttgcatcaaa--cccca 24719413  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  24719412 atatctcacattaataatca 24719393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 16416625 - 16416666
Alignment:
Q  115 atatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16416625 atatactcacatcaaaa-ccccaatatctcacatcaataatca 16416666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 20479981 - 20480022
Alignment:
Q  115 atatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20479981 atatacttacatcaaaa-cccaaatatctcacatcaataatca 20480022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Original strand, 34393392 - 34393589
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34393392 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaacccca 34393490  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||    
T  34393491 atatctcacatcaataatcaccaatcacatctgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcgccaatcacatatatcatgaacaatc 34393589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12838185 - 12838002
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  12838185 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttatatc-aaaacccca 12838088  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||       ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12838087 atagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatat 12838002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53909743 - 53909545
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53909743 cataatccaaataatagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaacacccca 53909645  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  53909644 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttatcatgaacaatca 53909545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 18166881 - 18167081
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  18166881 cataatccaaataacaattaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 18166977  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  18166978 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 18167077  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  18167078 ccaa 18167081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 15211522 - 15211708
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  | |||| |  |||||||||||  | ||| ||    
T  15211522 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatcat-acattc--atacttacatc--acacctca 15211615  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  15211616 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaattcgcaaatattcattaacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 15211708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 19998524 - 19998710
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  || |||||| |  |||||    
T  19998524 cataatccaaataacagtcaa-catagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--ctcacatcaca--cccca 19998617  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  19998618 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 19998710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7134496 - 7134296
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     ||| |||||||  ||||||||    
T  7134496 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaataattacatc--aaacccca 7134400  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  7134399 atatcccacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 7134300  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  7134299 ccaa 7134296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 13244613 - 13244783
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |  || ||    
T  13244613 cataatccaaataacagtta-tcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca--cctca 13244704  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13244705 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatat 13244783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 18246185 - 18246353
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  18246185 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 18246278  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  18246279 atatctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacgattattcattcacaatcaccaatcac 18246353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18294739 - 18294616
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||    ||||||||||   ||| ||||    
T  18294739 cataatccaaataacagttag-catggatatttcaattcaaatatcatctacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacat--taaatccca 18294643  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18294642 atatctcacatcaataatcaccgatca 18294616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15274656 - 15274540
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  15274656 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataaaattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 15274560  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15274559 atatctcacatcaataatca 15274540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19699599 - 19699417
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  19699599 cataatccaaataacagttaa-catgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 19699503  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19699502 atatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatat 19699417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19710184 - 19710002
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  19710184 cataatccaaataacagttaa-catgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 19710088  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19710087 atatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatat 19710002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 8372614 - 8372814
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  8372614 cataatccaaataacagttaa-caagaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 8372710  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||| |||    
T  8372711 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacagtca 8372810  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  8372811 ccaa 8372814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45460886 - 45460770
Alignment:
Q  39 ataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcac--atgcatatacttacatcaaaaacccc 136  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  45460886 ataatccaaataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatgataatattcacatatgtatatacttatatc-ataacccc 45460789  T
Q  137 aatatctcacatcaataat 155  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  45460788 aatatttcacatcaataat 45460770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 55378588 - 55378474
Alignment:
Q  166 atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatact 264  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |    
T  55378588 atgaacaatcatcaaatcacaaatattcatacacaatcatcaatcacctttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattaatcacatt 55378489  T
Q  265 ccatgaacaatcacc 279  Q
     ||||||||||||||    
T  55378488 tcatgaacaatcacc 55378474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 26678186 - 26678384
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  26678186 cataatccaaataacagtta-acatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccatatcaatacttacatc--aaacccca 26678280  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  26678281 atatgtcacatcaatattcacctatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 26678380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 109841 - 109911
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  109841 acccccatatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaat 109911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 16520808 - 16520995
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaa-catcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccc 136  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |  ||||    
T  16520808 cataatctaaataatagttaa-catggatatttcaatttaaaacatcatgcacttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca--cccc 16520901  T
Q  137 aatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
     |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  16520902 gatatcttacatctatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 16520995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21961433 - 21961363
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21961433 cataatccaaataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattca 21961363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 33738484 - 33738652
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||              |||||||||||||||||| |||||    
T  33738484 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaata--------------catatacttacatcaaaa-cccca 33738567  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccat-------tatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacata 215  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  |||  ||||       |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33738568 atatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgccatgagcaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacata 33738652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54120098 - 54120004
Alignment:
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| | || |  |||||||||||||||    
T  54120098 caatatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcaatcacaatcaccaaccatatttatcatgaacaatca 54120004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 202
Target Start/End: Original strand, 10642471 - 10642539
Alignment:
Q  134 cccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  10642471 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacagttatcacttcacaaatattcattcacaat 10642539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 202
Target Start/End: Original strand, 9293719 - 9293877
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |   ||||    
T  9293719 cataatccaaataacagataa-catggatatttcaacataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacat--ccca 9293812  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||| | ||||| ||||||    
T  9293813 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacagttatcatttcacaaattttcattcacaat 9293877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22356609 - 22356410
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||| |||| ||||||    |||||| |||||| | |||||    
T  22356609 cataatccaaataacagttaacaata-atatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacataacaatacttgcatcaaga-cccca 22356514  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcat-------atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||       |||||| | |||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  22356513 atatctcacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 22356414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 44345148 - 44345189
Alignment:
Q  115 atatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44345148 atatacttacatcaaaa-ccccaatatctcacatcaataatca 44345189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20813883 - 20813769
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||   |||||| ||||||||| ||| | || ||||    
T  20813883 cataatccaaataatagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataat-attcacacatgtatatacttatatc-ataatccca 20813787  T
Q  138 atatctcacatcaataat 155  Q
    |||| |||||||||||||    
T  20813786 atatttcacatcaataat 20813769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Original strand, 47355564 - 47355636
Alignment:
Q  91 tgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  47355564 tgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaa-ccccaatatctcacattaataatcatctatca 47355636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53706733 - 53706656
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53706733 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaat 53706656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 55378737 - 55378691
Alignment:
Q  60 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  55378737 catggatatttcaatttaaacatcatgcacttaatcaataataatat 55378691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8874339 - 8874272
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatat 106  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  8874339 cataatccaaataacagtta-acatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatat 8874272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30236404 - 30236341
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataata 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  30236404 cataatccaaataacagtta-acatgaataattcaattcagacatcatgtacctgatcaataata 30236341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Original strand, 41217551 - 41217748
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  41217551 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaaacccca 41217649  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  41217650 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 41217748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5676528 - 5676350
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| | ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5676528 cataatccaaataatagttaa-catgaatatttcattataaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatgcatatacttacatc--aaacccca 5676432  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5676431 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatcac 5676350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15863501 - 15863315
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |  ||||     
T  15863501 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaccatcatgcacttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca--ccccg 15863408  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  15863407 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 15863315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22408155 - 22408038
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  22408155 cataatccaaataacaattaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaacccca 22408058  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  22408057 atatctcacattaataatca 22408038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 22352292 - 22352478
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcat--atacttacatcaaaaaccc 135  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||     || ||||  |||||||||||| |  |||    
T  22352292 cataatccaaataatagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-----cacgcattaatacttacatcaca--ccc 22352383  T
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  22352384 caatatctcatatcaatattcatcaatcatatgaacaattttcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 22352478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 17146827 - 17147013
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  17146827 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 17146920  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatca 228  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||| |||||    
T  17146921 atatttcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtatatcatgaataatca 17147013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2422990 - 2422813
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  2422990 cataatccaaataacaattaa-catggatatttcaatataaacatcatacacttgatcaat---aatattctcatacatatacttacatc--aaacccca 2422897  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2422896 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacat 2422813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 20252349 - 20252531
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||  |||    |||||||||||  ||||||||    
T  20252349 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattatcatatcaatacttacatc--aaacccca 20252445  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20252446 atatctcacattaataatcatcaatcacatgtatcatgaacgaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatat 20252531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 21857760 - 21857944
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |  |||||    
T  21857760 cataatccaaataacagtta-tcatgaataattcaatt--aacatcatgtatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca--cccca 21857851  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||| || ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  21857852 atatctcacatcaataatcatcaatcatgtgaacaattatcaatgcacaaatattcattcataatcaccaatcacatttatcatgaataatca 21857944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44036730 - 44036601
Alignment:
Q  99 aataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcataca 198  Q
    ||||||| ||||||  | |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||    
T  44036730 aataataatcacatataaatacttacatcaca--ccccgatatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcattca 44036633  T
Q  199 caattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||| ||| || ||||  |||||||| |||||    
T  44036632 caatcaccaattacattcatcatgaataatca 44036601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 279
Target Start/End: Original strand, 20529838 - 20529986
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatcac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | ||| ||||||  ||||||||| |||||     
T  20529838 accccaatatctcacatcaataatcattaattatatgaacaattatcaattcacaattattcattcatagtcaccaatcacatttatcatgaataatcat 20529937  T
Q  230 caa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
     || ||||||  || ||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||    
T  20529938 taatcacatt--tcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcacc 20529986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Original strand, 20444098 - 20444161
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20444098 accccaatatctcacatcaataatcattaattatatgaacaattatcaattcacaattattcat 20444161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20895659 - 20895590
Alignment:
Q  60 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaa 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  20895659 catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttacatcaa 20895590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20589832 - 20589760
Alignment:
Q  208 atcacatatcatgaacaatcaccaac-acatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  20589832 atcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattagtcacatttcatgaacaatcacc 20589760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Original strand, 20929844 - 20929920
Alignment:
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| || ||| ||| |||||||    
T  20929844 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaattaacaaatattcattcaaaatcaccaatcacat 20929920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 202
Target Start/End: Original strand, 22365040 - 22365108
Alignment:
Q  134 cccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  22365040 cccaatatctcacgtcaataatcatccatcacatgaacagttatcaattcacaaatattcattcacaat 22365108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37846273 - 37846225
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37846273 accccaatatctcacatcaatgatcatcaatcatatgaacaattatcaa 37846225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9786308 - 9786114
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||   |||||||||   || |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||   |||||||    
T  9786308 cataatccacataacagttaa-catgaacatttcatcataaacatcatacacttgatcaataataatatcctcatacatgtacttacatc---aacccca 9786213  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    || ||||||||||||||||  | ||||        |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  9786212 atgtctcacatcaataatctccaatcacatttgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattacccatcacatatatcatgaacaatc 9786114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Original strand, 35053148 - 35053217
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattc 108  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||    
T  35053148 cataattcaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacaccatgtacttgatcaataataacattc 35053217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20589882 - 20589810
Alignment:
Q  208 atcacatatcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||    
T  20589882 atcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttaccatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcacc 20589810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 35524343 - 35524234
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||  | ||||||||||| | || ||||    
T  35524343 cataatccaaagaacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacatataaatacttacatc-ataatccca 35524249  T
Q  138 atatctcacatcaat 152  Q
    || ||||||||||||    
T  35524248 atttctcacatcaat 35524234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Original strand, 21716437 - 21716507
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattca 109  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21716437 cataatccaaataatagttaa-catgaataattcattataaacatcatgtacttgatcaataataatattca 21716507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20590050 - 20589990
Alignment:
Q  93 atcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataa 154  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||    
T  20590050 atcaataataatatccacatgtatatacttatatc-ataatcacaatatctcacatcaataa 20589990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20589930 - 20589886
Alignment:
Q  233 cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatca 277  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  20589930 cacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatca 20589886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 27957 - 28141
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27957 cataatccaaataacagttag-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaacacccca 28055  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28056 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatat 28141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 37767 - 37949
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  37767 cataatccaaataacagttac-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aagacccca 37864  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacata 215  Q
    |||||||||||||||||||| | || |        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37865 atatctcacatcaataatcaccaataacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacata 37949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 31045 - 31226
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||   |||||||    
T  31045 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaaaatacttacatc---aacccca 31140  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31141 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatat 31226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 256820 - 256638
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  256820 cataatccaaataacagttaat-atgaatatttcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaacccca 256724  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  256723 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcacatat 256638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 72310 - 72126
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||| | |  |||||    
T  72310 cataatccaaataacagtta-tcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacattaca--cccca 72219  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  72218 atatctcacatcaataatcatcaatcacttgaacaattatcaaatcacaaatattcattcacaatcacctatcacatttgtcatgaacaatca 72126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 76605 - 76507
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  76605 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacttgaacaattatcaaatcacaaatattcattcacaatcacctatcacatttgtcatgaacaatca 76507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 192775 - 192959
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||| | |  |||||    
T  192775 cataatccaaataacagtta-tcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacattaca--cccca 192866  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||| ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  192867 atatctcacatcaataatcatcaattacatgaacaattatcaattcacaaatgttcattcacaatcacctatcacatttgtcatgaacaatca 192959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 125203 - 125107
Alignment:
Q  134 cccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||| ||| | ||||  |||||||||||||||    
T  125203 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcaagtgaacaattatcaattcataaatattcattcacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatca 125107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Original strand, 7464 - 7640
Alignment:
Q  60 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatc 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7464 catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaagaataatattctcatacatatacttacatcaaaaaccccaatatctcccatcaataatcacc 7563  T
Q  160 gatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
     ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  7564 aatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 7640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 335 - 521
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  335 cataatccaaataacagttac-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 428  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  429 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Original strand, 661 - 727
Alignment:
Q  166 atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatcacc 230  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  661 atgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcacc 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36892621 - 36892438
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36892621 cataatcaaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aaaacccca 36892524  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||| || ||||||||||||| | ||||       ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36892523 atagcttacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatat 36892438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 34822322 - 34822508
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  34822322 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 34822415  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  34822416 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 34822508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3801299 - 3801113
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  3801299 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 3801206  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  3801205 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 3801113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 25210900 - 25211070
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  25210900 cataattcaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 25210993  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  25210994 atatctcacatcagtattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacat 25211070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9654701 - 9654605
Alignment:
Q  134 cccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  9654701 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaattaccaatcacatttatcatgaataatca 9654605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38706986 - 38706800
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcata-tacttacatcaaaaacccc 136  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| | |||||   || ||||||||||| | |||      
T  38706986 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat---tagtacttacatcacacacc-- 38706894  T
Q  137 aatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| | | ||||||  ||||||||| |||||    
T  38706893 aatatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatcatgaataatca 38706800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19888913 - 19888745
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||    |||||||||||  | |||||     
T  19888913 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatc--acaccccg 19888820  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  19888819 atatctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcataatcaccaatcac 19888745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43644801 - 43644703
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  43644801 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcgcaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 43644703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 8941719 - 8941887
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||    |||||||||||  | |||||     
T  8941719 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatc--acaccccg 8941812  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    || | ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  8941813 atgtttcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 8941887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12638180 - 12638064
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  12638180 cataaaccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 12638084  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    || |||||||||||||||||    
T  12638083 atgtctcacatcaataatca 12638064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 21140146 - 21140262
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  21140146 cataatccaaataacagataa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatc--aaacccca 21140242  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21140243 atatctcacatcaataatca 21140262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20629230 - 20629132
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  20629230 accccattatctcacatcaataattatcaatcacatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 20629132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25877875 - 25877696
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||   |||||||    |||||||||||||   |||||    
T  25877875 cataatccaaataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatacttacatcaat--cccca 25877782  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25877781 atatctcgcatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatat 25877696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 460978 - 461055
Alignment:
Q  137 aatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  460978 aatatttcacatcaatagtcatcaatcatatgaacaattatcaagtcacaattattcattcacaatcaccaatcacat 461055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23806391 - 23806331
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattatt 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23806391 accccaatatcccacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaattatt 23806331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42180395 - 42180213
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||    ||||||||||||||  |||||    
T  42180395 cataatccaaataacagttaa-catgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcatatcaatacttacatcaaa--cccca 42180299  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42180298 atatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatat 42180213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21276528 - 21276329
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |  ||||||||||| |||||| ||     ||||||||||||||  |||||    
T  21276528 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataagcatcatgcatttgatcaataatcatattcccacatcaatacttacatcaaa--cccca 21276432  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatg-------aaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| |||       ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  21276431 atatctcacatcgataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 21276332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Original strand, 22861891 - 22861971
Alignment:
Q  133 ccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  22861891 ccccgatatctcacatcaataatcattaatcacatgaacgattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 22861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Original strand, 24966432 - 24966620
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||  ||||| ||||||||| | || ||||||||||||   |||||||    ||||||||||||||  |||||    
T  24966432 cataatccaaataaaagttaa-catgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaa--cccca 24966525  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcat-------atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaa 225  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||       |||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  24966526 atatctcacattaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcacatttcatgaacaa 24966620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Original strand, 8886457 - 8886624
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||||||   ||||| || |||| ||||||| |  | |||    
T  8886457 cataatccaaataacagtta-tcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatca-cacat-ca-atacctacatcaca--ctcca 8886548  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca 213  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||| ||| ||||||    
T  8886549 atatctcgcatcaataatcattaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcactcacaatcaccaatcaca 8886624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12643993 - 12643798
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| | |  |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  12643993 cataatccaaataacagtta-tcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacat-ca-atacttacatcaaa--cccca 12643902  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  12643901 atgtctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 12643802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Original strand, 25211126 - 25211192
Alignment:
Q  166 atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatcacc 230  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  25211126 atgaacaattatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcacc 25211192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 22282491 - 22282561
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  22282491 accccgatatttcacatcaatactcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcgttcacaat 22282561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 22273269 - 22273328
Alignment:
Q  143 tcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  22273269 tcacatcaatactcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcgttcacaat 22273328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22691882 - 22691823
Alignment:
Q  60 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatata 119  Q
    |||| |||||||||||||||| | | | || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22691882 catgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacatacatata 22691823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22696529 - 22696470
Alignment:
Q  60 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatata 119  Q
    |||| |||||||||||||||| | | | || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22696529 catgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacatacatata 22696470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4450164 - 4450095
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattc 108  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||    
T  4450164 cataatccaaataacagtta-acatgaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattc 4450095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 232
Target Start/End: Original strand, 15631702 - 15631826
Alignment:
Q  115 atatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatg-------aaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccg 207  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | |||| |||       ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| |     
T  15631702 atatacttacatcaaa--ctccaatatctcacatcaataatctccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaacttacaattattcatacaccattatca 15631799  T
Q  208 atc--acatatcatgaacaatcaccaa 232  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||    
T  15631800 atcatatatatcatgaacaatcaccaa 15631826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Original strand, 25600180 - 25600252
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcaca 111  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||    
T  25600180 cataatccacataacagttaa-catgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattcaca 25600252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Original strand, 28972279 - 28972350
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcaca 111  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28972279 cataatccacataacaattaa-catgaatagttcaatt-aaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 28972350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 460929 - 460973
Alignment:
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaa 180  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  460929 caatatttcacatcaatagtcatcaatcatatgaacaattatcaa 460973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 15631638 - 15631674
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaat 74  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15631638 cataattcaaataacagttaatcatggatatttcaat 15631674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 227
Target Start/End: Original strand, 25600347 - 25600410
Alignment:
Q  166 atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25600347 atgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 25600410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Original strand, 77605 - 77802
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  77605 cataatccaaataacatttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaacccta 77703  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||        |||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  77704 atatctcacatccataaccaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatgcacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 77802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 36128 - 36200
Alignment:
Q  208 atcacatatcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcacc 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||| | | ||||||||||||||    
T  36128 atcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaacagtcattaatcacatttcatgaacaatcacc 36200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 36062 - 36124
Alignment:
Q  216 tcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatca 277  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  36062 tcatgaacaatcattaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatca 36124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13733 - 13621
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  13733 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aaacccca 13637  T
Q  138 atatctcacatcaata 153  Q
    ||||||||||||||||    
T  13636 atatctcacatcaata 13621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 27176 - 27362
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |  ||||     
T  27176 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca--ccccg 27269  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  27270 atatctcacatcaatattcatcgatcatatgagcaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 27362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 202
Target Start/End: Original strand, 106370 - 106437
Alignment:
Q  135 ccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  106370 ccaatatctcacaccaatagtcatcaatcatatgaataattaacaagtcacaaatattcattcacaat 106437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 811 - 997
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  811 cataatccaaataacagttaa-catagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 904  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  905 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 441 - 252
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  441 cataatccaaataacagttaa-catagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcacac-ccccg 347  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatcacc 230  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  346 atatctcacatcaatattcatcaatcatatgaccaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcacc 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21820 - 21703
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  21820 cataatccaaataacagttag-cataaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaacccca 21723  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21722 atatctcacatcaataatca 21703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4824 - 4624
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  4824 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 4728  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||     |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  4727 atatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 4628  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  4627 ccaa 4624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49664 - 49464
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  49664 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 49568  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||     |||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  49567 atatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 49468  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  49467 ccaa 49464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 156369 - 156169
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  |||| |||    
T  156369 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaactcca 156273  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||     |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  156272 atatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 156173  T
Q  229 ccaa 232  Q
    ||||    
T  156172 ccaa 156169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 86054 - 85956
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| | | ||||||  ||||||||| |||||    
T  86054 accccaatatcccacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaacaatcacatttatcatgaataatca 85956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 58384 - 58329
Alignment:
Q  174 ttatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  58384 ttatcaattcacaaagattcatacacaatcaccgatcacatatatcatgaacaatc 58329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 230
Target Start/End: Original strand, 29644 - 29842
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||     |||||||||||  ||||||||    
T  29644 cataatcaaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacaaatcaatacttacatc--aaacccca 29740  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  29741 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcaccgttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 29840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 542 - 724
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||  |||||    
T  542 cataatacaaataacagttag-catgaatatttcaatttaagcatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaa--cccca 638  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  639 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacgtaattaccaatcacatat 724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 138666 - 138550
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  138666 cataatccaaataacagttaa-cattaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattttcatacttatacttacatc--aaacccca 138570  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  138569 atatctcacatcaataatca 138550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 76596 - 76775
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || ||||   |||||||||||| ||    ||||||||||||||  |||||    
T  76596 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgat---taataatattcatatatcaatacttacatcaaa--cccca 76689  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||        |||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  76690 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatgcacaatcaccaatcacatat 76775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3076 - 2889
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |||||||   ||||     |||||||||||| |  ||||     
T  3076 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacataatgcacttgatcattaataat---cacacattaatacttacatcaca--ccccg 2983  T
Q  138 atatctcacatcaataatca-tcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  2982 atatctcacatcaataatcaatcaatcatatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatcatgaataatca 2889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 288 - 491
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatat--tcacatgcatatacttacatcaaaaaccc 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  288 cataatccaaataacagttag-catggatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatc-aaaaccc 385  T
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaat 226  Q
    |||||||| || |||| ||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||    
T  386 caatatcttacctcaacaatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaat 485  T
Q  227 caccaa 232  Q
    ||||||    
T  486 caccaa 491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 3062 - 3179
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  3062 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaatataaaaatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaacccca 3159  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3160 atatctcacattaataatca 3179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 14856 - 14971
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  14856 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaacccca 14951  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14952 atatctcacatcaataatca 14971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 5853 - 5968
Alignment:
Q  39 ataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaa 138  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||   |||||||||    
T  5853 ataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaattcaaacatcatgtatttgatcaataataacattctcatacatatagttacat--taaaccccaa 5949  T
Q  139 tatctcacatcaataatca 157  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5950 tatctcacatcaataatca 5968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Original strand, 23047 - 23170
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||  ||||||||    
T  23047 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc--aaacccca 23143  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23144 atatctcacattaataatcatcaatca 23170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 101
Target Start/End: Original strand, 16383 - 16445
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataat 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  16383 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataat 16445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 30657 - 30774
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  30657 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatc-aaaacccca 30754  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  30755 atatctcacattaataatca 30774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 202
Target Start/End: Original strand, 44517 - 44584
Alignment:
Q  135 ccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44517 ccaatatctcacatcaataaccatcaatcatatgaataattatcaattcacaaatattcattcacaat 44584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Original strand, 20867 - 21049
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | |  |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||    
T  20867 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaagcatcatgcatttgattaacaataatattctcatacatatacttacatc-ataatccca 20964  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcat-------atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacata 215  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||       |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  20965 atatctcacatcaataatcaccaatcataagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaacaccaatcacata 21049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 28457 - 28574
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | |  ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |  | |  |    
T  28457 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaattgaaacatcatgcatttgatcaacaataatattctcatacatagacttacatc-atgatctga 28554  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28555 atatctcacatcaataatca 28574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19482 - 19310
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||||| |   ||||    
T  19482 cataatccaaataacatttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacat--ccca 19389  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  19388 atatctcacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatat 19310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 216
Target Start/End: Original strand, 26458 - 26639
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| |||    |||||||||||   |||||||    
T  26458 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatc---aacccca 26553  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26554 atatctcacattcataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatat 26639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15264 - 15144
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcat--atacttacatcaaaaaccc 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||     ||| |||  |||||||||||  | ||||    
T  15264 cataatccaaataacagttaa-catgaataattcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataat-----catacattaatacttacatc--acaccc 15173  T
Q  136 caatatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15172 caatatctcacatcaataataatcaatca 15144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2651 - 2454
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||     |||||||||||  ||||||||    
T  2651 cataatccaaataacatttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatc--aaacccca 2555  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  2554 atatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattaccaatcatatacaccatgaacaatca 2455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Original strand, 5228 - 5396
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||| |  ||||     
T  5228 cataatccaaataacaggtaa-catgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattaata--cttacatcaca--ccccg 5321  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac 212  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  5322 atatctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcac 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 217543 - 217445
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  217543 accccaatatttcacatcaatattcatcaatcatatgaataattatcaattcacaaatattcgttcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 217445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 112 - 22
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaa 129  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  112 cataatccaattaacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttacatcaa 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6576 - 6486
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaa 129  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  6576 cataatccaattaacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttacatcaa 6486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 144892 - 144990
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  144892 accccaatttcccacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 144990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 147151 - 147249
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  147151 accccaatttcccacatcaataatcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 147249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 33402 - 33590
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||        |||||||||||  ||| ||||    
T  33402 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc--------atacttacatc--aaatccca 33490  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  33491 atatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 33590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39442 - 39254
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||        |||||||||||  ||| ||||    
T  39442 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc--------atacttacatc--aaatccca 39354  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||        |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  39353 atatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 39254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 1305 - 1473
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| | |  ||||||||||||||   ||||     |||||||||| | |  |||||    
T  1305 cataatccaaataacagtta-tcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacattaca--cccca 1396  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  1397 atatctcacatcaataatcatcaatcacatgaacagttatcaattcacaaatattcattcacaatcacctatcacat 1473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15232 - 15096
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||    |||||||||||  | |||||     
T  15232 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatc--acaccccg 15139  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaa 180  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  15138 atatctcacatcaatattcgtcaatcatatgaacaattatcaa 15096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 13971 - 14087
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcac--atgcatatacttacatcaaaaaccc 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| | |||||    
T  13971 cataatccaaataacagttaa-catgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatatacttatatc-ataaccc 14068  T
Q  136 caatatctcacatcaataa 154  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  14069 caatatctcacattaataa 14087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 249300 - 249218
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  249300 accccaatatctcacatcaataatcattaatcacatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacat 249218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Original strand, 54027 - 54126
Alignment:
Q  135 ccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatcaccaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  54027 ccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgaacaattatcaattcacaattattaattcactatcaccaatcacatttatcatgaagaatcaccaa 54126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 110075 - 110005
Alignment:
Q  146 catcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 216  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  110075 catcaatattcatcaatcatatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcactaatcacatat 110005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 676 - 488
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||   |||||||    ||||||||||||||  |||||    
T  676 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaa--cccca 583  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaa 225  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||        |||||| | |||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  582 atatctcatattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacaccatcaccaatcacatttcatgaacaa 488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Original strand, 6988 - 7184
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    ||||||||  || | || |||     
T  6988 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcatacatgtatacttatctc-ataatcccg 7085  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  7086 atatctcacatcaataatcaccaatcacacgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 7184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7020 - 6924
Alignment:
Q  134 cccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||| | | ||||||  ||||||||| |||||    
T  7020 cccaatatctcacatcaatagtcatcaatcatatgaccaattatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcacatttatcatgaataatca 6924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Original strand, 59872 - 59944
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcaca 111  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||    
T  59872 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatccaca 59944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 4432 - 4593
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||  ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |  ||||    
T  4432 cataatccaaataacaattaa-catgaataagtcaatataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacatatcaatacttacatc-atactccca 4529  T
Q  138 atatctcacatcaa-taatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacaca 200  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| |||||| || || || ||| | |||||||||||||    
T  4530 atatctcacatcaattaatcaccaatcacatgaacaatcattaattcatagttattcatacaca 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 228
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3111
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||  |||||| || |||   ||  |||    
T  2914 cataatccaaataatagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgaacaataatagtattcacataaatatacctatatc-ccaattcca 3011  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcat-------atgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||| ||||| |||   |||||       |||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  3012 atatctcacagcaatagtcactaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaattaccaatcacatatatcatgaacaatca 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4006 - 3938
Alignment:
Q  39 ataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattc 108  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  4006 ataatccaaataatagttaa-catgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 3938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3893 - 3852
Alignment:
Q  115 atatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3893 atatacttacatcaaaa-ccccaatatctcacattaataatca 3852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 17533 - 17730
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||||||| | | || | ||||||||||   |||||||    ||||||||||||||  |||||    
T  17533 cataatccaattaacagttaa-catggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaa--cccca 17626  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  17627 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 17726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 19563 - 19760
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||||||| | | || | ||||||||||   |||||||    ||||||||||||||  |||||    
T  19563 cataatccaattaacagttaa-catggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaa--cccca 19656  T
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat--atcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  19657 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatca 19756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Original strand, 68601 - 68711
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||| | || ||||    
T  68601 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcgcatataaatacttatatc-ataatccca 68698  T
Q  138 atatctcacatca 150  Q
    || ||||||||||    
T  68699 atttctcacatca 68711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Original strand, 7380 - 7471
Alignment:
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaatcac 229  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  7380 atatctcacatcaacattcatcaatcatatgaacaattattaattcacagatattcattcacaatcaccaatcacatttcatagacaatcac 7471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 211
Target Start/End: Original strand, 12655 - 12728
Alignment:
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatca 211  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||| ||| ||||    
T  12655 atatctcacatcaacattcatcaatcatatgaacaattattaattcacagatattcattcacaatcaccaatca 12728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Original strand, 41073 - 41152
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatca 211  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| ||||    
T  41073 accccaatatttcacatcaatatccatcaatcatatgaacaattatcaattcacaaatattcgttcacaatcaccaatca 41152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 39886 - 39984
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcaca--tatcatgaacaatca 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| || |||||| ||||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  39886 accccaatatgtcacatcaataatcatcaatcatataaataattatgaattcacaaatattcattcacaaccaccaatcacatttatcatgaataatca 39984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 91011 - 90941
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattca 109  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  91011 cataatccaaataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattca 90941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 7157
Alignment:
Q  115 atatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7198 atatacttacatcaaaa-ccccaatatctcacatcaataatca 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 4208 - 4278
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaat 202  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  4208 accccaatacctcacttcaataatcatcaatcatatgtacaattatcaattcataaatattcattcacaat 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 277
Target Start/End: Original strand, 17951 - 18013
Alignment:
Q  216 tcatgaacaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatca 277  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17951 tcatgaacaatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatca 18013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 157
Target Start/End: Original strand, 17745 - 17859
Alignment:
Q  41 aatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaata 140  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |  | |||||||    
T  17745 aatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacaccatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatc-attatcccaata 17842  T
Q  141 tctcacatcaataatca 157  Q
     ||||||| ||||||||    
T  17843 cctcacattaataatca 17859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Original strand, 16777 - 16891
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 137  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||  ||| ||| | |  |||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||  |||||    
T  16777 cataatctaaataacagtta-tcatgaacatttcaatt--aacgtcatgcatttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaa--cccca 16871  T
Q  138 atatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  16872 atatctcacatcaatgatca 16891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Original strand, 25594 - 25666
Alignment:
Q  91 tgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatcatcgatca 164  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25594 tgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaa-ccccaatatctcacattaataatcatctatca 25666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 12495 - 12617
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattc------acatgcatatacttacatcaaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||| | || |||| |||||||||||||      | ||  |||||||||||||||||    
T  12495 cataatccaaataacagttaa-catgaatatttcaatatagacatcatgcacttgatgaataataatattctcatatatatatatatacttacatcaaaa 12593  T
Q  132 -accccaatatctcacatcaataa 154  Q
      |||||||||||||||| |||||    
T  12594 ccccccaatatctcacattaataa 12617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5359 - 5268
Alignment:
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaatcac 229  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  5359 atatctcacatcaacatacatcaatcatatgaacaattattaattcacagattttcattcacaatcaccaatcacatttcataaacaatcac 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12961 - 12870
Alignment:
Q  138 atatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatatcatgaacaatcac 229  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||| ||| |||| || |||| |||||||||    
T  12961 atatctcacatcaacatacatcaatcatatgaacaattattaattcacaaattttcattcacaatcaccaatcatatttcataaacaatcac 12870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 112
Target Start/End: Original strand, 26880 - 26953
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacat 112  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26880 catagtccaaataacagttaa-catgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaaaaataatattcacat 26953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 197895 - 197813
Alignment:
Q  132 accccaatatctcacatcaataatcatcgatcatatgaaccattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacat 214  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| | |||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  197895 accccgatatttcacatcaatactcatcaattatatgaacaattatcgattcacaaatattcgttcacaatcaccaatcacat 197813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Original strand, 56213 - 56273
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  56213 cataatccaaataacagtta-acatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaata 56273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Original strand, 1244 - 1299
Alignment:
Q  174 ttatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 227  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  1244 ttatcaattcacaaagattcatacacaatcaccgatcacatatatcatgaacaatc 1299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 157
Target Start/End: Original strand, 94340 - 94427
Alignment:
Q  69 ttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaaccccaatatctcacatcaataatca 157  Q
    ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||| | || |||||||||||| || ||||||||    
T  94340 ttcaattcaaacatcatgtactggatcaataataatattctcatatatataattatatc-ataatcccaatatctcatattaataatca 94427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 26653 - 26590
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  26653 cataatccaaagaacagttaa-catgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata 26590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 114143 - 114080
Alignment:
Q  38 cataatccaaataacagttactcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataata 102  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  114143 cataattcaaataacagttaa-catgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata 114080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University