View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7726_high_5 (Length: 492)

Name: NF7726_high_5
Description: NF7726
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7726_high_5
NF7726_high_5
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (1-472)||(37261320-37261789)
chr5 (1-472)||(25542526-25543007)
chr5 (1-472)||(14192545-14193026)
chr5 (1-472)||(39883188-39883669)
chr5 (1-472)||(3689982-3690463)
chr5 (1-472)||(3876324-3876805)
chr5 (1-468)||(17871375-17871851)
chr5 (1-472)||(27881089-27881570)
chr5 (7-472)||(37372947-37373422)
chr5 (7-472)||(8428318-8428782)
chr5 (197-472)||(30346362-30346637)
chr5 (207-472)||(10025199-10025464)
chr5 (197-472)||(24629686-24629954)
chr5 (1-122)||(24629954-24630075)
chr5 (1-122)||(30346637-30346758)
chr5 (1-122)||(10025068-10025189)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (1-472)||(10038645-10039116)
chr3 (1-472)||(10110605-10111086)
chr3 (1-472)||(13530044-13530525)
chr3 (1-472)||(10000412-10000893)
chr3 (1-472)||(10968515-10968995)
chr3 (1-472)||(50410177-50410654)
chr3 (7-472)||(32782-33257)
chr3 (1-472)||(10237561-10238040)
chr3 (8-472)||(11368659-11369125)
chr3 (1-406)||(11362263-11362681)
chr3 (1-251)||(52918071-52918330)
chr3 (292-472)||(52918332-52918512)
chr3 (1-163)||(46913076-46913238)
chr3 (1-142)||(47692974-47693115)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-472)||(186559-187040)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (1-472)||(5828288-5828769)
chr7 (1-472)||(21069795-21070276)
chr7 (1-472)||(9000878-9001359)
chr7 (7-472)||(7036731-7037206)
chr7 (7-472)||(12780881-12781356)
chr7 (1-468)||(22843809-22844285)
chr7 (7-404)||(12785790-12786186)
chr7 (197-472)||(42232210-42232486)
chr7 (1-122)||(42232089-42232210)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-472)||(1860682-1861163)
chr4 (7-472)||(35855918-35856393)
chr4 (1-472)||(49710178-49710658)
chr4 (7-463)||(38518107-38518573)
chr4 (81-472)||(13337320-13337721)
chr4 (7-404)||(49786640-49787036)
chr4 (163-472)||(617957-618266)
chr4 (197-472)||(55558856-55559131)
chr4 (1-122)||(55559131-55559252)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (1-472)||(24268803-24269284)
chr2 (1-472)||(27509379-27509860)
chr2 (1-463)||(24245830-24246302)
chr2 (1-472)||(27192494-27192975)
chr2 (1-472)||(27842308-27842789)
chr2 (1-472)||(21395375-21395856)
chr2 (1-437)||(17683597-17684043)
chr2 (7-404)||(28665984-28666380)
chr2 (7-404)||(37824818-37825214)
chr2 (7-403)||(41919986-41920381)
chr2 (200-472)||(35609867-35610139)
chr2 (1-163)||(35609690-35609852)
chr2 (314-465)||(3642920-3643071)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (1-472)||(36207220-36207701)
chr1 (1-472)||(2452850-2453331)
chr1 (1-472)||(16042030-16042511)
chr1 (1-461)||(2329174-2329641)
chr1 (7-472)||(37389885-37390360)
chr1 (1-472)||(48775068-48775549)
chr1 (7-468)||(6310731-6311202)
chr1 (1-372)||(18148693-18149074)
chr1 (116-472)||(48233498-48233864)
chr1 (197-472)||(52500795-52501063)
chr1 (1-163)||(48238529-48238691)
chr1 (1-122)||(52500674-52500795)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (1-472)||(19011-19491)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (1-472)||(2201912-2202393)
chr6 (1-427)||(10187549-10187985)
chr6 (1-472)||(18344130-18344611)
chr6 (1-468)||(30881332-30881808)
chr6 (1-362)||(15333648-15334019)
chr6 (232-472)||(12517520-12517760)
chr6 (7-286)||(29639947-29640236)
chr6 (7-286)||(31510118-31510407)
chr6 (2-130)||(12517394-12517522)
chr6 (294-439)||(18814054-18814199)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (2-472)||(17610-18082)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (1-472)||(21113477-21113958)
chr8 (1-472)||(25218298-25218779)
chr8 (7-472)||(25208780-25209240)
chr8 (7-472)||(7821849-7822324)
chr8 (7-384)||(30307188-30307575)
chr8 (1-163)||(31978579-31978741)
chr8 (388-472)||(30325877-30325961)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-463)||(314-786)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (1-472)||(31938-32418)
scaffold0073 (236-472)||(1-237)
scaffold0073 (1-199)||(19462-19670)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-472)||(182816-183297)
scaffold0003 (1-472)||(165535-166019)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-472)||(321069-321550)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-472)||(4993-5473)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (1-404)||(1005-1418)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (7-404)||(48748-49144)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (197-472)||(28452-28727)
scaffold0118 (1-122)||(28727-28848)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (167-405)||(39937-40175)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (3-191)||(16691-16889)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (320-472)||(14010-14162)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (9-87)||(30-108)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (3-51)||(1655-1703)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 37261320 - 37261789
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37261320 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcaagt 37261419  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  37261420 attcccctttcttgaaaaaataacgggtcattaaggttatcattcaaattgggatacacaaagacatcaacgg--ttgttgtgtccaatataagcaaatc 37261517  T
Q  201 ttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  37261518 ttcggaaatttataccttcgtttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgc 37261617  T
Q  301 tctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37261618 tctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgatcgagacatcaacaa 37261717  T
Q  401 tatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37261718 tatcctgcctcgttccttttcagacaacaggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 37261789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25543007 - 25542526
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25543007 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 25542908  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          ||||||||  |||||||||||||||||    
T  25542907 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacatatttgttgtgtccgata 25542808  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25542807 tgagaaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaagttagcaat 25542708  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25542707 ttctttctgctttgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgattgat 25542608  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25542607 gcatcaacaatattctgccacgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 25542526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14193026 - 14192545
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  14193026 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaattaagcgttggtgcgagt 14192927  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14192926 attcccctttcttggaaaaatagcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgata 14192827  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14192826 tgagcaaatcttcagaaatttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgtcaaaattagcaat 14192727  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  14192726 ttcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattataataagcccatatctttaatgaattaattggg 14192627  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  14192626 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgggcaacatgcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaactgtcattc 14192545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 39883188 - 39883669
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39883188 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 39883287  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  39883288 attcccctttcttggcaaaatagctgggcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgata 39883387  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||  | ||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39883388 tcagcaaatctttaggaatatctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 39883487  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  39883488 ttcttcatgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagccaatatctttgacgaattgactgag 39883587  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  |  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39883588 gcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactactgtcattc 39883669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 3689982 - 3690463
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  3689982 acaaactgaatcagagcttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagt 3690081  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||| | ||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||          ||||||||| ||||||||| || ||||    
T  3690082 attcacttttcttgaaaaaagagtgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggata 3690181  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3690182 tgagcaaatctttgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagtgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagt 3690281  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690282 ttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 3690381  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3690382 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattc 3690463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3876805 - 3876324
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  3876805 acaaactgaatcagagcttaaatactctttctctccacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagt 3876706  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||| | ||||||| ||||| || ||||| | || ||||||||||||||  ||||| ||||||          ||||||||| ||||||||| || ||||    
T  3876705 attcacttttcttgaaaaaagagtgggtccccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtccattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggata 3876606  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3876605 tgagcaaatctttgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagt 3876506  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876505 ttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 3876406  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3876405 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattc 3876324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17871851 - 17871375
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17871851 acaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaatcaagcgttggtgcgagt 17871752  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||||    
T  17871751 atttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgata 17871652  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17871651 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccatttgccaaaattagcaat 17871553  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17871552 ttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaactgattgag 17871453  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtc 468  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17871452 gcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtc 17871375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 27881089 - 27881570
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  27881089 acaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcagctgaatcaagcgttggtgcgagt 27881188  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27881189 attcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgggtccgata 27881288  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | | ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27881289 tcagcaaatcttcaggagtttctacctttatttcaccattgtcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 27881388  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27881389 ttctacctgctctgcatgtaccgaagatgcacccaatctcatattaacggtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgaccgag 27881488  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  || ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27881489 gcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 27881570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Original strand, 37372947 - 37373422
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37372947 agaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcataaattggttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 37373046  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  37373047 ctttcttcgaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttatgtctgatatcagca 37373146  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37373147 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 37373246  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  37373247 ctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgacgcatca 37373346  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  37373347 acaatatccggcctcgttcctcctcagacaacaggcaatatctgcttaaaatcaccacctaaaactactgtgattc 37373422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 8428782 - 8428318
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  8428782 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattccc 8428683  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8428682 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagca 8428583  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8428582 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 8428483  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  8428482 ctgctctgcaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 8428394  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||   ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||    
T  8428393 acaatatctggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgccattc 8428318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 197 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 30346637 - 30346362
Alignment:
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  30346637 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 30346538  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30346537 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtcttaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 30346438  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30346437 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgacatcaccacctaaaactattgtcattc 30346362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 207 - 472
Target Start/End: Original strand, 10025199 - 10025464
Alignment:
Q  207 aatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgca 306  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10025199 aatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttaccgtctctaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgca 10025298  T
Q  307 cgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 406  Q
     ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  10025299 ggtaccaaagatgcacccagtctcatattaacagtaagtctcaacacatcaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatatt 10025398  T
Q  407 acctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
     ||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  10025399 gcctcgttccttttcggacagcaggcaatatctgcctaatatcaccacctaaaactattgtcattc 10025464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 197 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24629954 - 24629686
Alignment:
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       ||||     
T  24629954 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt-------tcttt 24629862  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24629861 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 24629762  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24629761 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattc 24629686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24630075 - 24629954
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24630075 acaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 24629976  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaata 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24629975 attcccctttcttggaaaaata 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30346758 - 30346637
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30346758 acaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaacttaatcaagtgttggtgcgagt 30346659  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaata 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30346658 attcccctttcttggaaaaata 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 10025068 - 10025189
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10025068 acaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacttggaatcaatgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 10025167  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaata 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10025168 attcccctttcttggaaaaata 10025189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 10038645 - 10039116
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10038645 acaaacagaatgagagcttaaataatatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaattgaatcaagtgttggcgcgagt 10038744  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10038745 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaattgggatacacaaagacatcaacagatttgttgtgtctgatataagcaaatc 10038844  T
Q  201 ttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  10038845 ttcgaaaatttataccttcgtttcaccattctcatctaaagcgtcgttgccgtcttcaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgc 10038944  T
Q  301 tctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10038945 tctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaa 10039044  T
Q  401 tatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039045 tatcctgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatcttcttgaaatcaccacataaaactattgtcattc 10039116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 10110605 - 10111086
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10110605 acaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 10110704  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  10110705 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtgacatcaacagatttgttgcgtctgata 10110804  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10110805 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcatagtatccacttgccaaaattagcaat 10110904  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10110905 ttctttctgctctgtaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcattaacacattaaaataagctcatatctttgatgaattgattgat 10111004  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10111005 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 10111086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 13530044 - 13530525
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13530044 acaagcagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggactcagtgacatcatatattcgttaaaatgctcaactgaatgaagtgttggtgcgagt 13530143  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13530144 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgata 13530243  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||| |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13530244 tgaccaaatcttctagaatttctaccttcatttcaccattctcacctgatgcgtcgttgccgtctccaattgagagtatatacttgccaaaattagcaat 13530343  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13530344 ttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctctacacattacaataagcccatatctgtgatgaattgattgag 13530443  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  13530444 gcatcaacaatatcgtgcctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccagctaaaactactgtcattc 13530525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 10000412 - 10000893
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10000412 acaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 10000511  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac----------atcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| |          |||||| |||||||||  || ||||    
T  10000512 attcctctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtgatatcaacagatttgttgcatctgata 10000611  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10000612 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcctccgaagcgttgttgccgtctccaattcatagtatccacttgccaaaattaacaat 10000711  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10000712 ttctttctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaataagcccatatctttgatgaattgattgat 10000811  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10000812 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaacatctgcctgaaatccccacctaaaactattgtcattc 10000893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10968995 - 10968515
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  10968995 acaaacaaaataagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctaaactgaatcaagcgttggtgcgagt 10968896  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac----------atcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||    
T  10968895 attccccttgcttagaaaaatagcaggtcacgaagtttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtggcatcaacggatttgttgtgtccgata 10968796  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10968795 tcagcaaatct-cagaaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccatctccaattgagagtgtccacttgccaaaattagcaat 10968697  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10968696 ttcttcctgctctataggtactgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataaacccatatctttgatgaattgattgag 10968597  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| || | |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  10968596 gcatcaacaatatcctccctcgatccgtttcggactacagacaatatctgcctgaaatcaccatctaaaactactgtcattc 10968515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 50410177 - 50410654
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  50410177 acaaagagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatatttgttaacatgctcgactgaatcaagcgttggtgcgagt 50410276  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50410277 attcccctttcttgaaaaaatagtgggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcagcggatttgttgtgtccgata 50410376  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    |||| |||||||| | |||||    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50410377 tgagaaaatcttcaggaattt----cttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttaccgtctctaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 50410472  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50410473 ttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattagaataagccaatatctttgatgaattgattgag 50410572  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  50410573 gcatcaaaaatatcgtgcctcgttgctttacggacaacaggcagtatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 50410654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Original strand, 32782 - 33257
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32782 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 32881  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  32882 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtccataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagca 32981  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32982 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcattgttgccgtctctaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 33081  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  33082 ctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 33181  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||  | | ||||||  || ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33182 acaatatccggcgtcgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattc 33257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 10237561 - 10238040
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10237561 acaaacataatcaaagcttaa-tactctttctcttcacctggaatcagtaacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 10237659  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  10237660 attcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctgtaagtgacatcaacagatttgttgcgtctgata 10237759  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||| ||||| | ||||| |||| |  ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10237760 tgagcaattcttcaggaatttctaccgttatttcaccattccc-tccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaat 10237858  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10237859 ttctttctgctcagcaggtaccaaagatgcatccaatcttatattaacagtaagccttaacacattaaaataagcccatatctttgatgaattgattgat 10237958  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10237959 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 10238040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 472
Target Start/End: Original strand, 11368659 - 11369125
Alignment:
Q  8 gaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattcccc 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  11368659 gaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagtattccct 11368758  T
Q  108 tttcttggaaaaat-agcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11368759 tttcttggaaaaaagagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcgggatatacaaagtctatgagtgacatcaacggatttgttgtgtcggatatgagca 11368858  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||         |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  11368859 aatcttcgggaatttctacattcatttcaccattctcatc---------gttgtcctctccaattgagggtatccacttgccaaaattatcagtttcttc 11368949  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    || ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11368950 cttctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagtccatatctttgatgaattgattgaggcatca 11369049  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11369050 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatatgcctgaaatcaccacttaaaactactgtcattc 11369125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 11362263 - 11362681
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatac-tatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgag 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11362263 acaaactgaatcagagcttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgag 11362362  T
Q  100 tattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgat 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||||| ||||||          ||||||||| ||||||||| || |||    
T  11362363 tattcccttttcttggaaaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggat 11362462  T
Q  190 atgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtat--ccacatgccaaaattagc 287  Q
    ||||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  11362463 atgagtaaatcttcgggaatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgagagtatatccacttgccaaaattagc 11362562  T
Q  288 aatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgatt 387  Q
    | ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362563 agtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgatt 11362662  T
Q  388 gaggcatcaacaatatcct 406  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11362663 gaggcatcaacaatatcct 11362681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 52918071 - 52918330
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  52918071 acaaacaaaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgggt 52918170  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gacatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||          | ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  52918171 attcccctttcttggaaaaatagcgagtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacgaagtctataagtggcatcaacagatttgttgtgtccggta 52918270  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgcc 251  Q
       ||||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52918271 acggcaaatc-tcaggaatttctaccttcatttcaccattcccatccgaagcgtcgttgcc 52918330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 292 - 472
Target Start/End: Original strand, 52918332 - 52918512
Alignment:
Q  292 tcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgagg 391  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  52918332 tcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcgtatctttgatgaattgattgagg 52918431  T
Q  392 catcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  52918432 catcaacaatatcctccctcgatccttttcggactacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 52918512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 46913076 - 46913238
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46913076 acaaacataatcaaagcttaaatactatttttcttcacctggaattggtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 46913175  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46913176 attctcctttcttggaaaaatagcgggtcgccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaag 46913238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 47692974 - 47693115
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  47692974 acaaacagaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatgtattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagg 47693073  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatca 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  47693074 attcccctttcttgggaaaattgtgggtcaccaaggttatca 47693115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 186559 - 187040
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  186559 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcagctgaatcaagcgttggtgcgagt 186658  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||| |||||||||||| |||||    
T  186659 attcccctttattggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtacgata 186758  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  186759 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 186858  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  186859 ttctttctgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaggccttaaaacattacaataagcccatatctttgatgaattgattggt 186958  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  186959 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcttgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 187040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 5828769 - 5828288
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5828769 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgagtcaagtgttggtgcgagt 5828670  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5828669 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaaaagatttgttgtgtccgata 5828570  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5828569 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaat 5828470  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  5828469 ttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaatagtaagcctcaacacattaaaataaacccatatctttgatgaattgattgat 5828370  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  5828369 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactaatatcattc 5828288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 21070276 - 21069795
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21070276 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcaccaggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 21070177  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21070176 attcccctttcttggaaaaatagcaggttaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgata 21070077  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21070076 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaacgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgtcaaaattagcaat 21069977  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  21069976 ttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgatacattacaataaacccatatctttaatgaattgattgat 21069877  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  21069876 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactactgtgattc 21069795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9001359 - 9000878
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  9001359 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttagtgcgagt 9001260  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  9001259 attcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcaatcagatcgggataaacaaagtctataagagacatcaacggatttgttgtgtccgata 9001160  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | | |||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9001159 tcaacaaatcttcaagaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 9001060  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9001059 ttcttcctgctatgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgactgag 9000960  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||  |||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  9000959 gcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactactgtcattc 9000878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Original strand, 7036731 - 7037206
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7036731 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 7036830  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  7036831 ctttcttggaaaagtagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcg 7036930  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7036931 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 7037030  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||    
T  7037031 ttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcctatatctttgacgaattgaccgaggcatca 7037130  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7037131 acaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 7037206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 12781356 - 12780881
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12781356 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 12781257  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  12781256 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtcttatatcagca 12781157  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12781156 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcattgtcgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 12781057  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
     |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  12781056 ttgctctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgacgaattgaccgaggcatca 12780957  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||  ||| ||||||  |  ||| || ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12780956 acaatatccggcctcgttcctccttggactacaggcaacatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattc 12780881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 468
Target Start/End: Original strand, 22843809 - 22844285
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  22843809 acaaacagaaacagaacttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaatcaagcgttggtgcgagt 22843908  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22843909 attcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtcagata 22844008  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22844009 tgagcaaatcttcaagaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgacgttgccttctctaattaagagtatccaattgccaaaattagcaat 22844107  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    || |||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22844108 ttattcctgctctacaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaactgattgag 22844207  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtc 468  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22844208 gcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcatgaaatcaccacctaaaacttttgtc 22844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12786186 - 12785790
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  12786186 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattccc 12786087  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  12786086 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagca 12785987  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12785986 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 12785887  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  12785886 ctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 12785798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 197 - 472
Target Start/End: Original strand, 42232210 - 42232486
Alignment:
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42232210 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaaccgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 42232309  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42232310 ctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 42232409  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacat-aaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  42232410 acaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaaactattgtcattc 42232486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 42232089 - 42232210
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||    
T  42232089 acaaacaaaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgagagt 42232188  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaata 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42232189 attcccctttcttggaaaaata 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 1860682 - 1861163
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1860682 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacccagaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 1860781  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1860782 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgata 1860881  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1860882 tgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaat 1860981  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  1860982 ttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagcccatatctttaatgaattgattgat 1861081  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  1861082 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatttgcctgaaatcaccaccttacactattgtcattc 1861163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Original strand, 35855918 - 35856393
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35855918 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 35856017  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35856018 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagca 35856117  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35856118 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 35856217  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  35856218 ctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 35856317  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35856318 acaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 35856393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 49710178 - 49710658
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  49710178 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 49710277  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49710278 attcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaa-ggatttgttgtgtccgata 49710376  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49710377 tcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattttcatccgaagcatcgttgccgtgtccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 49710476  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||  |||    
T  49710477 ttctttctgttctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttaacgaattgacggag 49710576  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49710577 gcatcaacaatatctggcctcgttcctcctcgaacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattc 49710658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 463
Target Start/End: Original strand, 38518107 - 38518573
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38518107 agaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 38518206  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38518207 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagca 38518306  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38518307 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccaaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 38518406  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  38518407 ctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatta 38518506  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 463  Q
    |||||||||   || ||||||  ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  38518507 acaatatccggtctcgttcctcctcagacaacagttaatatctgcctaaaatcaccacctaaaacta 38518573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 472
Target Start/End: Original strand, 13337320 - 13337721
Alignment:
Q  81 aatcaagtgttggcgcgagtattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaa 170  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||| ||    
T  13337320 aatcaagcgttgatgcgagtattcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacataaa 13337419  T
Q  171 cggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatc 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13337420 cggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcatgaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatc 13337519  T
Q  271 cacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccata 370  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||    
T  13337520 cacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaaacctcaacacattacaataatatcata 13337619  T
Q  371 tctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcat 470  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  13337620 tctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcat 13337719  T
Q  471 tc 472  Q
    ||    
T  13337720 tc 13337721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49787036 - 49786640
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  49787036 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaatatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattccc 49786937  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  49786936 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagca 49786837  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49786836 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 49786737  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  49786736 ctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 49786648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 163 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 618266 - 617957
Alignment:
Q  163 gacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattg 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  618266 gacatgaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcttcgttgtcgtctccaattg 618167  T
Q  263 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 362  Q
    ||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  618166 agagtattcacttgttaaaattaggaatttcttcctgctctgcagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagttagcctcaacaaattacaata 618067  T
Q  363 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 462  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| |||| ||    
T  618066 agcctatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatctgcttgaaatcaccacctaaagct 617967  T
Q  463 attgtcattc 472  Q
    ||||||||||    
T  617966 attgtcattc 617957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 197 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 55559131 - 55558856
Alignment:
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  55559131 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 55559032  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55559031 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 55558932  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  55558931 acaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattc 55558856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 55559252 - 55559131
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55559252 acaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 55559153  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaata 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55559152 attcccctttcttggaaaaata 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24269284 - 24268803
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24269284 acaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 24269185  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24269184 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgata 24269085  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24269084 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaat 24268985  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  24268984 ttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacaataagcgtcaacacattaaaataagcacatatctgtgatgaattgattgat 24268885  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24268884 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattc 24268803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 27509379 - 27509860
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  27509379 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttgatgcgagt 27509478  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagac----------atcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |          ||||||| ||||||||||||||| |    
T  27509479 attcccctttcttggaaaaatagcaggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgatatcaacgaatttgttgtgtccgaca 27509578  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27509579 tgagcaaatctttaggaatttctaccttcatctcaccattctcatctgaagcgtcgttgctgtctccaattgagagtatctacttgccaaaattagcaat 27509678  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509679 ttcttcctgctctgcaggtagcaaagatgcacccaatcttatattaacagtaagcctcaatacattacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 27509778  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27509779 gcatcaacaatatcctgtctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 27509860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 24245830 - 24246302
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24245830 acaaacagaatcagatcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 24245929  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |          ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  24245930 attcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaggtctataagtgacatccacggatttgttgtgtccgtta 24246029  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24246030 tgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccaaagcgtcgttgccgtctccaattgagagaatccacatgccaacattagcaat 24246129  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246130 ttcttcctgctctgcaggtaccgaagattcacc-aatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 24246228  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttcc-ttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 463  Q
    |||||||||||||||| | |  |||| ||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  24246229 gcatcaacaatatcctgcatcattcctttttcggacaacatgcaatatctgccttaaatcaccacctaaaacta 24246302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 27192494 - 27192975
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27192494 acaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 27192593  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27192594 attcccctttcttggaaaaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgata 27192693  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||    
T  27192694 tgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtcaccagttgagagtatccacttgtcaaaattatgaat 27192793  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192794 ttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatcagcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 27192893  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27192894 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 27192975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 27842308 - 27842789
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27842308 acaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 27842407  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27842408 attcccctttcttggaaaaatagagggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgata 27842507  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||    
T  27842508 tgagcaaatctttaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtcaccagttgagagtatccacttgtcaaaattatgaat 27842607  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842608 ttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatcagcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 27842707  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27842708 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 27842789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 21395375 - 21395856
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21395375 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 21395474  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  21395475 attcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatatacaaagtctataagcgacatcaacggatttgttgtgtccgata 21395574  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21395575 tcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccgaaattagcaat 21395674  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||    
T  21395675 ttcttcctgatctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccataactttgacgaattgacggag 21395774  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  21395775 gcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactacggtcattc 21395856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 17684043 - 17683597
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  17684043 acaaacaaaatcatagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgttggagcgagt 17683944  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17683943 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccaata 17683844  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||| ||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17683843 tgagcgaatattcaggaatttctaccttcattttaccattctcatctgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaat 17683744  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17683743 ttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagccttaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattgag 17683644  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatat 437  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  17683643 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatat 17683597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 28666380 - 28665984
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  28666380 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattccc 28666281  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  28666280 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagca 28666181  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28666180 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 28666081  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  28666080 ctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 28665992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 37825214 - 37824818
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  37825214 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattccc 37825115  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||| ||          |||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  37825114 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagca 37825015  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37825014 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 37824915  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  37824914 ctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 37824826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41920381 - 41919986
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||| || || ||||||||||||    
T  41920381 agaatcagaggttaaatactctttatcttcacctggaatcaacgacatcataaattcgttaacatgcttaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattccc 41920282  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41920281 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagca 41920182  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  41920181 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattatcaatttcttc 41920082  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| | |||           || |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  41920081 ctgctctacaggtaccaaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 41919993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 200 - 472
Target Start/End: Original strand, 35609867 - 35610139
Alignment:
Q  200 cttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctg 299  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35609867 cttcagaaatttctaccttcatttcaccattctgatccgaaacttcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctg 35609966  T
Q  300 ctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaaca 399  Q
    ||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35609967 ctctaaaggtaccgaagatgcacccaatgtcatattaacagtaagcctcaacacattataataagtccatatctttaatgaattgattggggcatcaaca 35610066  T
Q  400 atatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  35610067 atatcctgcctcgttccttttcgggcaacaggcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaactgtcattc 35610139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 35609690 - 35609852
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35609690 acaaacataatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatactcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 35609789  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  35609790 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaatgttatcattcaaatcggaatacacaaag 35609852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 314 - 465
Target Start/End: Original strand, 3642920 - 3643071
Alignment:
Q  314 aagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagt 413  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3642920 aagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgt 3643019  T
Q  414 tccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactatt 465  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3643020 tccttttcgggcaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactatt 3643071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 36207220 - 36207701
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36207220 acaaacataatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaattgttggggcgagt 36207319  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36207320 attcccctttcttgaaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtcggata 36207419  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    |||| ||||| || | ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36207420 tgagaaaatcatcaggaatttctaccttcaattcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtcttcaattgagagtatccacttgccaaaattatcaat 36207519  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36207520 ttcttcctgctttgcaggtaccgaagatgaacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataaactcatatctttgatgaattgattgag 36207619  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36207620 gcatcaataatatcctgcctctttccttttcagacaacaggcaatatctgtctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 36207701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2453331 - 2452850
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  2453331 acaaatagaatcagagcctaaatactctttctcttcacctggaattagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactcaataaagcgttggtgcgagt 2453232  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||          ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2453231 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcggaattcacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgttcgata 2453132  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2453131 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgtcaaaattagcaat 2453032  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  2453031 ttcttcatgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaatatgcctatatctttgatgaattgattgaa 2452932  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2452931 gcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatcttcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 2452850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 16042030 - 16042511
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16042030 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 16042129  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  16042130 attcccctttcttggcaaaatagctgggcaccaaggttatcattcagattgggatacacaaagtctataagcgacatcaacggatttgttgtgtccgata 16042229  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16042230 tcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 16042329  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  16042330 ttcttcctgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagccaatatctttgacgaattaactgag 16042429  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  |  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16042430 gcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactactgtcattc 16042511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 461
Target Start/End: Original strand, 2329174 - 2329641
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  2329174 acaaagagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcgactgaatcaagcgttggtgcgagt 2329273  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacac-------aaagacatcaacggatttgttgtgtccgatatga 193  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||       |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329274 attcccctttcttgaaaaaatagtggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacgtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatga 2329373  T
Q  194 gcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttc 293  Q
    | |||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2329374 gaaaatcttcaggaatttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctctaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttc 2329473  T
Q  294 ttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggca 393  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2329474 ttcctgctctgcaggtaacgaagaggcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaataagcccatatctttgatgaattgattaaggca 2329573  T
Q  394 tcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaac 461  Q
    | ||||||||| | ||| ||| |||  | |||||| || | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2329574 ttaacaatatcgtgcctcgttgcttcacggacaacaggtagtatctgcctgaaatcaccacctaaaac 2329641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 37390360 - 37389885
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37390360 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 37390261  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37390260 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagca 37390161  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37390160 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatctttgccgtctccaattgagaatatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 37390061  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  37390060 ctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 37389961  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37389960 acaatatccagcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattc 37389885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 48775549 - 48775068
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  48775549 acaaactgaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcatttacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagt 48775450  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||  ||||| ||||||          ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  48775449 attcccttttcttggaaaaagagcaggtcaccaatgttatcattctaatcgggatatacaaagtgtattagtgacatcaaagaatttgttgtgtcggata 48775350  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  48775349 tgagcaaatcttcgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagt 48775250  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48775249 ttctttctgctctgtaggtcccgaagatgcacccaatctgatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatatttgatgaattgattgag 48775150  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   |||||| |  ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  48775149 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatacaatatttgtctgaaatcaccacctaaaactaccgtcattc 48775068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6311202 - 6310731
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6311202 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 6311103  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  6311102 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgatatcagcg 6311003  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6311002 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaatggagactatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 6310903  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  6310902 ctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 6310803  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtc 468  Q
    ||||||||   |||  |||||  || |||||| | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6310802 acaatatcaggcctcattcctcctcggacaacagacaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtc 6310731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 18148693 - 18149074
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  18148693 acaaacagaataagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaaatgaatcaagcgttggtgcgagt 18148792  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gacatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18148793 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaattgagatacacaaagtcgataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgata 18148892  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18148893 tgagaaaatcttcataaatttctaccttcatttcaccattctccttcgaagcgttattgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaat 18148992  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatc 372  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||    
T  18148993 ttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaataagtccatatc 18149074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 116 - 472
Target Start/End: Original strand, 48233498 - 48233864
Alignment:
Q  116 aaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcgg 205  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  48233498 aaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcagcggatttgttgtgttcgatatgagtaaatcttcag 48233597  T
Q  206 aaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgc 305  Q
     ||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48233598 gaatttctaccttcatttccccattctcatctgaagcgtcgttgtcgtctcaagttgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgc 48233697  T
Q  306 acgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 405  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233698 aggtaccaaagatgcacccaatctcatatcaacagtaagcctcaacaaattacaataaacacatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 48233797  T
Q  406 tacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |  || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48233798 tgtctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 48233864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 197 - 472
Target Start/End: Original strand, 52500795 - 52501063
Alignment:
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||       ||||     
T  52500795 aatcttcaggaatttctaccttcatttaaccattctcatccgaagcgttgttgtcgtctccaattcagagtatccacttgccgaaatt-------tcttt 52500887  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52500888 ctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 52500987  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52500988 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattc 52501063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48238691 - 48238529
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48238691 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 48238592  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48238591 attcctctttcttggaaaaatagagggtcgccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaag 48238529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 52500674 - 52500795
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  52500674 acaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 52500773  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaata 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  52500774 attcccctttcttggaaaaata 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 19011 - 19491
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19011 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 19110  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          ||||||||  |||||||||||||||||    
T  19111 attccccttttttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtgacatcaacatatttgttgtgtccgata 19210  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  19211 tgagcaaatcttcagaaatttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcaaagtatccccttgccaaa-ttagcaat 19309  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19310 ttctttctgctctgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagcccatatctttgatgaattgattgat 19409  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19410 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaattaccacctaaaactattgtcattc 19491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2202393 - 2201912
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  2202393 acaaatagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttctactgaattaagcgttggtgcgagt 2202294  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||| |||||| |||||    
T  2202293 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttattgtgttcgata 2202194  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2202193 tgagcaaatcttcgggaatttctacattcatttcaccattctcatttgaagcgtcgttgccttctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 2202094  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2202093 ttcttcatgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaatatgcctatatctttgatgaattgatcgag 2201994  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  2201993 gcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatctgcctgaagtcaccacctaaaactactgtcattc 2201912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 10187549 - 10187985
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10187549 acaaacagaatcatagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaattgaatcaagtgttggagcgagt 10187648  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||| |||||||| |||    
T  10187649 attcccttttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggattttttgtgtccaata 10187748  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  10187749 tgagcaaatattcaggaatttctaccttcattttaccattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagcatccacgtgcgaaaattagcaat 10187848  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10187849 ttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattgag 10187948  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaa 427  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  10187949 gcatcaacaatatcctgtctcgttccttttcggacaa 10187985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 18344130 - 18344611
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  18344130 acaaatagaatcaaagcttaaatactctttctcttcgcctggaatcagcgacatcatatattcgtcaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcaagt 18344229  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18344230 attcccctttcttggaaaaatagatggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatgaacggatttgttgtgtccgata 18344329  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||    
T  18344330 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcactattctcatctgaagcttcgttgtcgtctccaattgagagtattcacttgtcaaaattaggaat 18344429  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||| |  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18344430 ttcttcctgctctgtagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaataagcccatatctttgataaattgattgag 18344529  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18344530 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattc 18344611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 468
Target Start/End: Original strand, 30881332 - 30881808
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  30881332 acaaacagaaccagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaacagaatcaagcgttggtgcgagt 30881431  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||||    
T  30881432 atttccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcatttaaatcgagatacacaatgtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgata 30881531  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30881532 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccatct-catccgaagcgccgttgccttctctaattgagagtatccatttgccaaaattagcaat 30881630  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30881631 ttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaactgattgag 30881730  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtc 468  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30881731 gcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtc 30881808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 15333648 - 15334019
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15333648 acaaacagaatcagagcctaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagtgttggtgcgagt 15333747  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||  || |||||    
T  15333748 attcccatttgttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctattagtgacatcaacggatttgttacgtacgata 15333847  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | | ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15333848 tcaacaaatcttcaggaatttctaccttcatttcactattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 15333947  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 362  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15333948 ttcttcttgctctgcaggtatcgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcttcaacacattacaata 15334019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 232 - 472
Target Start/End: Original strand, 12517520 - 12517760
Alignment:
Q  232 tcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctca 331  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  12517520 tcatccgaagtgtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggaacagaagatgcacccaatctca 12517619  T
Q  332 tattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacggg 431  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| ||    
T  12517620 tattaacagtaagcttcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacagg 12517719  T
Q  432 caatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12517720 caatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 12517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29640236 - 29639947
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29640236 agaattagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 29640137  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||||||| |||||||||||   ||||| ||||    
T  29640136 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcaggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtggttgatatcagca 29640037  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattag 286  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29640036 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattag 29639947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31510407 - 31510118
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31510407 agaattagaggttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 31510308  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||          ||||||||| |||||||||||   ||||| ||||    
T  31510307 ctttcttgaaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagattaggatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtggttgatatcagca 31510208  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattag 286  Q
    ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31510207 aatcttaagaaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaaacatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattag 31510118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 12517394 - 12517522
Alignment:
Q  2 caaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagta 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||    
T  12517394 caaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcaaata 12517493  T
Q  102 ttcccctttcttggaaaaatagcgggtca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12517494 ttcccctttcttggaaaaatagctggtca 12517522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 439
Target Start/End: Original strand, 18814054 - 18814199
Alignment:
Q  294 ttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggca 393  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18814054 ttcctgctctacaggtaccaacgatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattaaggga 18814153  T
Q  394 tcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatct 439  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  18814154 tcaacaatatcatgtctcgttccttttcggacaacatgcaatatct 18814199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 2 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18082 - 17610
Alignment:
Q  2 caaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  18082 caaacagaatcaaagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactaaatcaagcgttggtgcgagta 17983  T
Q  102 ttcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatat 191  Q
    |||||||||||||       ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982 ttcccctttcttg-------agcggatcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatat 17890  T
Q  192 gagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatt 291  Q
    |||||||||||| | || || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17889 gagcaaatcttcaggaacttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcttcgttgctgtctccaattgagagtatccacttgctaaaattagcaatt 17790  T
Q  292 tcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgagg 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17789 tcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa-aagcccatatctttgatgaattgattgagg 17691  T
Q  392 catcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17690 catcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatagctgcctgaaatcaccacataaaactcttgtcattc 17610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 21113958 - 21113477
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  21113958 acaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcaagt 21113859  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21113858 attccccttttttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcaagatacacaaagtctataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgata 21113759  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21113758 taagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgccgtctccaattcagagtatccacttgccaaaattagcaat 21113659  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  21113658 ttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacagtaagcgtcaacacattaaaataagcacatatctgtgatgaattgattgat 21113559  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21113558 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattc 21113477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25218779 - 25218298
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25218779 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 25218680  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25218679 attcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtctgata 25218580  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25218579 tcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaat 25218480  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  25218479 ttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgaccgag 25218380  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25218379 gcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 25218298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25209240 - 25208780
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25209240 agaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 25209141  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaagacatcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcgga 206  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || | |  |||   |  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |     
T  25209140 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattaaagtct--ata---agtgacatcaacggatttgttgtgtctgacatcagcaaatcttcagg 25209046  T
Q  207 aatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgca 306  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25209045 aatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagtaatttcgtcctgctctgca 25208946  T
Q  307 cgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 406  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||     
T  25208945 ggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacattaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccg 25208846  T
Q  407 acctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
     ||| ||||||  || || ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25208845 gcctcgttcctcctcggaaaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 25208780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 472
Target Start/End: Original strand, 7821849 - 7822324
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7821849 agaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 7821948  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||          |||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  7821949 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcggaatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagca 7822048  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  7822049 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttacaaaaattcgcaatttcttc 7822148  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  7822149 ctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgacgaattgaccgaggcatca 7822248  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||  |  ||| ||||||  || |||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7822249 acaataatcggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 7822324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 30307188 - 30307575
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30307188 agaatcggagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagtattccc 30307287  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30307288 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcgttcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatatcagca 30307387  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  30307388 aatcttcaggaatttctacattcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgtcgtctccaattgagagtatctacttgcaaaaattagcaatttcttc 30307487  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattg 384  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30307488 ccactctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattg 30307575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31978741 - 31978579
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  31978741 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgctcaactgaatcaagcgttgatgcgagt 31978642  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  31978641 attcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaag 31978579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 472
Target Start/End: Original strand, 30325877 - 30325961
Alignment:
Q  388 gaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||  |||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||    
T  30325877 gaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactactgtcattc 30325961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 786 - 314
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  786 acaaacagaatcagaggttaaatactctttcttttcacctggaatcagcgacatcataaattcattaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 687  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||          |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  686 attcccctttattggaaaaatagctggtcaccaaggttatcatttagatcgggatacacaaagtttataagtgacatcaacgggtttgttgtgtctgata 587  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  586 tcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcatcattctcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 487  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  486 ttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgacgaattgattgag 387  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 463  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  386 gcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacta 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 31938 - 32418
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  31938 acaaacagaatcagagtttaaatactctttctcttcacctggaatcagcaacatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcaagt 32037  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  32038 at-cccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgata 32136  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32137 tcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccgtatccaattgagagtatccacttgccaaaattagcaat 32236  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  32237 ttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcacatatctttgacgaattgactgag 32336  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32337 gcatcaacaatatctggcctcgttcctcgtcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattc 32418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 472
Target Start/End: Original strand, 1 - 237
Alignment:
Q  236 ccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatatt 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 ccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatatt 100  T
Q  336 aacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaat 435  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||  ||| ||||||  || || ||  ||||||    
T  101 aacagtaagcctcaaaacattacaataagccaatatatttgacgaattgaccgagacatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggaaaaaaggcaat 200  T
Q  436 atcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  201 atctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattc 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 19462 - 19670
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  19462 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctggaatcagcgacatcataaatttgttgacatgctcaactgaatcaagcgttgatgcgagt 19561  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gacatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19562 attcccctttcttggaaaaatagctggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacaaagtttataagtgacatcaacagatttgttgtgtccgata 19661  T
Q  191 tgagcaaat 199  Q
    | |||||||    
T  19662 tcagcaaat 19670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 182816 - 183297
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  182816 acaaactgaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgagt 182915  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||  ||||| ||||||          ||||||||| ||||||||| || ||||    
T  182916 attcccttttcttggaaaaagagtgggtcaccaatgatatcattcaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggata 183015  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  183016 tgagcaaatcttcgggaatttctaccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagcagt 183115  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  183116 ttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatatcatattaactgtaagcctcaacacattacaataaggccatatctttgatgaattgattgat 183215  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  183216 gcatcaacaatatcctgcctcattccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattc 183297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Original strand, 165535 - 166019
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatac-tatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgag 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  165535 acaaactgaatcagagcttaaaaaaatctttctcttcacctggaatcactgacatcatatattcgttaacatgctcaaccgaatcaagcgttggtgcgag 165634  T
Q  100 tattcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgat 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  ||||| ||||||          ||||||||| ||||||||| || |||    
T  165635 tattcccttttcttggaaaaatagtgggtcaccaatgttatcatttaaatcgggatatacaaagtctattagtgacatcaacgaatttgttgtatcggat 165734  T
Q  190 atgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtat--ccacatgccaaaattagc 287  Q
    ||||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  165735 atgagtaaatcttcgggaatttcccccttcatttcaccattctcattcgaagcgtcgttgtcgtctccaattgagagtatatccacttgccaaaattagc 165834  T
Q  288 aatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgatt 387  Q
    | ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165835 agtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcccatatctttgatgaattgatt 165934  T
Q  388 gaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  165935 gaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattc 166019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 321550 - 321069
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  321550 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagcgatatcataaattcgttaacatgctcaactgaatcaagcattggtgcgagt 321451  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||          ||||||||||||||||| |||||||||    
T  321450 attcccctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacaaaaagtctataagtgacatcaacggatttgttttgtccgata 321351  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  321350 tcagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattatcaaccgaagcataattgccgtctcaaattgagaatatccacttgcaaaaattagcaat 321251  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  321250 ttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaaaagtaagcctcaacacattacaataagcccatatcgttgatgaattgattaag 321151  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  321150 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactcttgtcattc 321069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 5473 - 4993
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5473 acaaacagaatcagagcttaaatactctttctcttcacctgaaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 5374  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||          |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5373 attcccctttcttggaaaa-tagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgagatacacaaagtctataagtgacatcaatagatttgttgtgtccgata 5275  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5274 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatctgaagcgctgttgtcgtctccaagtcagagtatccacttgccaaaattagcaat 5175  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||| ||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  5174 ttctttctgctttgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagcacatatcttttatgaattgattgat 5075  T
Q  391 gcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  5074 gcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgaacaataggcaatatctgcctaaaatcaccatctaaaactattgtcattc 4993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1418
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  1005 acaaacaaaatcagagcttaaatactctttctcttcacttggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgctcgactgaattaagcgttggtgcgagt 1104  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgata 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  1105 attcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaggttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgata 1204  T
Q  191 tgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaat 290  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1205 tgagcaaatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagagtcgttgtcgtctccaattgagagtatccacttgccaaaattagaaat 1304  T
Q  291 ttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgag 390  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1305 ttcttcctgctatacatgtacctaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattgat 1404  T
Q  391 gcatcaacaatatc 404  Q
    |||| || ||||||    
T  1405 gcataaataatatc 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49144 - 48748
Alignment:
Q  7 agaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtattccc 106  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  49144 agaatcagaggttaaatactctttctcttcacctagaatcagcgacatcataaattcgttaacatgctcaattgaatcaagcgtgggtgcgagtattccc 49045  T
Q  107 ctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaag----------acatcaacggatttgttgtgtccgatatgagca 196  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||          |||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  49044 ctttcttggaaaaatagttggtcaccaaggttatcattcagatcgggatacacagagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtttgatatcagca 48945  T
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48944 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattgtcacccgaagcatcgttgccgtctccaattgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttc 48845  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||           || |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  48844 ctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaataagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatca 48756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 197 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 28727 - 28452
Alignment:
Q  197 aatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttc 296  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28727 aatcttcaggaatttctaccttcatttcaccattctcatccgaagcgttgttgctgtcttcaattcagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttt 28628  T
Q  297 ctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatca 396  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28627 ctgctctgcaggtaccaaagatgcatccaatctcatattaacagtaagtctcaactcattaaaataagcacatatctttgatgaattgattgatgcatca 28528  T
Q  397 acaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28527 acaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccaccttaaactattgtcattc 28452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28848 - 28727
Alignment:
Q  1 acaaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28848 acaaacagaatcagagtttaaatactttttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcgttaacatgttcaactgaatcaagcgttggtgcgagt 28749  T
Q  101 attcccctttcttggaaaaata 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28748 attcccctttcttggaaaaata 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 167 - 405
Target Start/End: Original strand, 39937 - 40175
Alignment:
Q  167 tcaacggatttgttgtgtccgatatgagcaaatcttcggaaatttataccttcgtttcaccattttcatccgaagcgtcgttgccgtctccaattgagag 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  39937 tcaacggatttgttgtgtccgatatcagcaaatcttcaagaatttctacctttatttcaccattctcatccgaagcatcgttgccatctccaattgagag 40036  T
Q  267 tatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcc 366  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40037 tattcacttgccaaagttagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcacacaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagcc 40136  T
Q  367 catatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 405  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40137 catatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatcc 40175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Original strand, 16691 - 16889
Alignment:
Q  3 aaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaagtgttggcgcgagtat 102  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| || ||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  16691 aaacagaatcatagcttaaaaactctttctcttcacctagaatcagtgaaatcatatatgcgttaacatactccactaaattaagcgttggtgcgagtat 16790  T
Q  103 tcccctttcttggaaaaatagcgggtcactaaggttatcattcaaatttggatacacaaa----------gacatcaacggatttgttgtgtccgatat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16791 tcccctttcttggaaaaatagcgggtcaccaaagttatcattcaaatcgggatacacaaagtctataagtgacatcaacggatttgttgtgtccgatat 16889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 320 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14162 - 14010
Alignment:
Q  320 cacctaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttt 419  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  14162 cacccaatctcatattaatagtaagcctcaacatattaaaataagcccatatatttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcttgcctcgttccttt 14063  T
Q  420 tcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattc 472  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14062 tcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattatcattc 14010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 108 - 30
Alignment:
Q  9 aatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtgacatcatatattcattaatatgctcaactgaatcaag 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  108 aatcagagcttaaatactctttctcgccacctgaaatcagtgacatcgtatattcgttaacatgctcaactgaatcaag 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Original strand, 1655 - 1703
Alignment:
Q  3 aaacagaatcagagcttaaatactatttctcttcacctggaatcagtga 51  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1655 aaacataatcagagtttaaatacgctttctcttcacctggaatcagtga 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University