View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7727_low_21 (Length: 402)

Name: NF7727_low_21
Description: NF7727
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7727_low_21
NF7727_low_21
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (7-386)||(29273820-29274199)
chr8 (41-267)||(31903728-31903954)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (7-386)||(268394-268775)
chr1 (7-310)||(28164399-28164702)
chr1 (7-283)||(28127716-28127993)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (7-308)||(18731541-18731842)
chr4 (7-310)||(18699437-18699740)
chr4 (7-310)||(18724122-18724425)
chr4 (7-308)||(18679604-18679905)
chr4 (7-308)||(18655514-18655815)
chr4 (7-102)||(17989090-17989185)
chr4 (7-102)||(18073804-18073899)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (15-386)||(26646227-26646608)
chr6 (15-386)||(26752195-26752576)
chr6 (7-386)||(26622739-26623113)
chr6 (7-386)||(26728717-26729091)
chr6 (15-312)||(31284120-31284417)
chr6 (7-310)||(27677664-27677967)
chr6 (16-306)||(26861454-26861744)
chr6 (7-310)||(27718429-27718732)
chr6 (7-308)||(27611052-27611353)
chr6 (7-312)||(27706452-27706757)
chr6 (7-312)||(27678778-27679083)
chr6 (7-308)||(27724895-27725196)
chr6 (7-310)||(27698544-27698847)
chr6 (15-310)||(27593078-27593373)
chr6 (15-284)||(26823700-26823969)
chr6 (15-308)||(26802278-26802571)
chr6 (15-308)||(28780975-28781268)
chr6 (15-306)||(28786116-28786407)
chr6 (15-306)||(28792237-28792528)
chr6 (29-310)||(27229066-27229347)
chr6 (15-310)||(27604763-27605064)
chr6 (7-310)||(27338115-27338418)
chr6 (7-310)||(27398855-27399158)
chr6 (15-310)||(26655823-26656118)
chr6 (15-310)||(26761794-26762089)
chr6 (20-284)||(26884023-26884287)
chr6 (18-262)||(27531258-27531502)
chr6 (7-200)||(25579663-25579856)
chr6 (7-200)||(26142809-26143002)
chr6 (16-308)||(28139377-28139669)
chr6 (7-200)||(25481686-25481879)
chr6 (7-200)||(26055870-26056063)
chr6 (7-200)||(26075840-26076033)
chr6 (9-288)||(28180970-28181249)
chr6 (16-179)||(28234529-28234692)
chr6 (9-237)||(28242711-28242939)
chr6 (16-288)||(28185222-28185494)
chr6 (15-226)||(28226868-28227079)
chr6 (7-200)||(25538484-25538677)
chr6 (7-200)||(26048789-26048982)
chr6 (7-200)||(26069958-26070151)
chr6 (15-312)||(26341992-26342292)
chr6 (9-170)||(28149912-28150072)
chr6 (9-103)||(28297765-28297859)
chr6 (9-103)||(28514214-28514308)
chr6 (26-225)||(25506978-25507171)
chr6 (9-105)||(28325520-28325616)
chr6 (15-105)||(2184327-2184417)
chr6 (19-78)||(26937160-26937219)
chr6 (16-267)||(26893530-26893781)
chr6 (15-62)||(26975134-26975181)
chr6 (7-102)||(27427656-27427751)
chr6 (15-105)||(28098427-28098517)
chr6 (15-63)||(26848741-26848789)
chr6 (15-62)||(2184980-2185027)
chr6 (15-62)||(25071741-25071788)
chr6 (18-63)||(27214498-27214543)
chr6 (18-63)||(27234685-27234730)
chr6 (152-198)||(27665312-27665358)
chr6 (15-60)||(26949745-26949790)
chr6 (15-63)||(27665175-27665223)
chr6 (15-60)||(26635774-26635819)
chr6 (15-60)||(26741740-26741785)
chr6 (15-60)||(26959250-26959295)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (7-308)||(3471-3773)
scaffold0349 (7-310)||(14406-14708)
scaffold0349 (218-310)||(8062-8154)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (7-306)||(4721-5020)
scaffold0277 (15-308)||(13690-13983)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (15-310)||(7359-7654)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (50-310)||(10-270)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (9-179)||(34690-34860)
scaffold0038 (9-237)||(42873-43101)
scaffold0038 (15-226)||(27366-27577)
scaffold0038 (9-105)||(116835-116931)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (9-282)||(58334-58607)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (15-166)||(3279666-3279817)
chr2 (15-62)||(17993742-17993789)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (7-102)||(59612-59707)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 29273820 - 29274199
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29273820 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgaca 29273919  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29273920 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaa 29274019  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29274020 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 29274119  T
Q  307 gagattgagaagaaattaatggaagatagaggaatgtttgagaatatagaatatggatgagtaggtgtatgttattgttg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29274120 gagattgagaagaaattaatggaagatagaggattgtttgagaatatagaatatggatgagtaggtgtatgttattgttg 29274199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31903954 - 31903728
Alignment:
Q  41 caaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttc 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||  |||   |||||||||||||||||| || |     ||||||| | |||||||||  ||||||     
T  31903954 caaaatgaagaagaagcatagtttttagagagcacaataatggcaatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtgatttcatgtcctcttt 31903855  T
Q  141 gaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagtt 240  Q
    |||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |  ||||||||   |||||||||| |    
T  31903854 gaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtctaagcctctaaagct 31903755  T
Q  241 gaggaagacctggtaagtgaatccata 267  Q
    |||||| || | ||| |||||||||||    
T  31903754 gaggaacacatcgtaggtgaatccata 31903728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 268394 - 268775
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268394 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 268493  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268494 ttgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 268593  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268594 taaaaccctcacgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 268693  T
Q  307 gag-attgagaagaaattaatggaagata-gaggaatgtttgagaatatagaatatggatgagtaggtgtatgttattgttg 386  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  268694 gagaactgagaagaaattaatggaagataggaggattgtttgagaatatagaatatggatgagtaggtgtatactattgttg 268775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 28164399 - 28164702
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||||||     
T  28164399 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggcc 28164498  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||  || ||| | | ||||||| || |||||   ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||     
T  28164499 ttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccag 28164598  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  28164599 tgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccat 28164698  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  28164699 gaga 28164702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 283
Target Start/End: Original strand, 28127716 - 28127993
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  28127716 gtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcc 28127815  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttga-tttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggcca 205  Q
    ||    ||||| | | ||| |||  || |||||   ||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  28127816 tttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggcca 28127915  T
Q  206 ataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaa 283  Q
     | ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  28127916 gtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaa 28127993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 18731541 - 18731842
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18731541 gtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggca 18731640  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  18731641 ttgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccag 18731740  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18731741 taaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccat 18731840  T
Q  307 ga 308  Q
    ||    
T  18731841 ga 18731842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 18699437 - 18699740
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18699437 gtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggca 18699536  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18699537 ttgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccag 18699636  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18699637 taaaaccgtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccat 18699736  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  18699737 gaga 18699740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 18724122 - 18724425
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18724122 gtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggca 18724221  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18724222 ttgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccag 18724321  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18724322 taaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccat 18724421  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  18724422 gaga 18724425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 18679604 - 18679905
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18679604 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggca 18679703  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18679704 ttgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccag 18679803  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| ||| || | ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18679804 taaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccat 18679903  T
Q  307 ga 308  Q
    ||    
T  18679904 ga 18679905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 18655514 - 18655815
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18655514 gtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggca 18655613  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  18655614 ttgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccag 18655713  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18655714 taaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccat 18655813  T
Q  307 ga 308  Q
    ||    
T  18655814 ga 18655815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Original strand, 17989090 - 17989185
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||    
T  17989090 gtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 18073899 - 18073804
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||    
T  18073899 gtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26646608 - 26646227
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  26646608 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgag 26646509  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26646508 tgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccg 26646409  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaaga------ggaaggtgattgcatagccatga 308  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||      |||||| ||||||||||||||||    
T  26646408 tcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaataggaaggagattgcatagccatga 26646309  T
Q  309 g-attgagaagaaattaatggaagata-gagg--aatgtttgagaatatagaatatggatgagtaggtgtatgttattgttg 386  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26646308 gaattgaaaggaaattaatggaagataggaggatattgtttaagaatacagaatatggatgagttggtgtatgttattgttg 26646227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26752576 - 26752195
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  26752576 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgag 26752477  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||   ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26752476 tgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccg 26752377  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaaga------ggaaggtgattgcatagccatga 308  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||      |||||| ||||||||||||||||    
T  26752376 tcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaataggaaggagattgcatagccatga 26752277  T
Q  309 g-attgagaagaaattaatggaagata-gagg--aatgtttgagaatatagaatatggatgagtaggtgtatgttattgttg 386  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26752276 gaattgaaaggaaattaatggaagataggaggatattgtttaagaatacagaatatggatgagttggtgtatgttattgttg 26752195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26623113 - 26622739
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26623113 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagca 26623014  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  26623013 ttgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccag 26622914  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    | |||||||  |||||||||| |||||| ||  | ||||| || |||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26622913 tgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccat 26622814  T
Q  307 ga-gattgagaagaaattaatggaagatagaggaatgtttgagaatatagaatatggatgagtaggtgtatgttattgttg 386  Q
    ||  ||||| || |||||| | |||||||    | | ||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26622813 gataattgataacaaattagttgaagata----agtatttgagagtatagaatagggatgagt--gcgtatgttattgttg 26622739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26729091 - 26728717
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  26729091 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcgatagca 26728992  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  26728991 ttgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccag 26728892  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    | |||||||  |||||||||| |||||| ||  | ||||| || |||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26728891 tgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccat 26728792  T
Q  307 ga-gattgagaagaaattaatggaagatagaggaatgtttgagaatatagaatatggatgagtaggtgtatgttattgttg 386  Q
    ||  ||||| || |||||| | |||||||    | | ||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26728791 gataattgataacaaattagttgaagata----agtatttgagagtatagaatagggatgagt--gcgtatgttattgttg 26728717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31284417 - 31284120
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 31284318  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||     
T  31284317 tgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaacca 31284218  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagatt 312  Q
    |  ||||||||||  || || ||  | ||||| || |||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31284217 taccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaagaggaagatgattgcatagccatgagatt 31284120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 27677664 - 27677967
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27677664 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggcc 27677763  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||   ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||      
T  27677764 ttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccgg 27677863  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    | |||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||  || |  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27677864 tgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccat 27677963  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  27677964 gaga 27677967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26861744 - 26861454
Alignment:
Q  16 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 115  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26861744 aatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagt 26861645  T
Q  116 gatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgt 215  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| |    
T  26861644 gatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccat 26861545  T
Q  216 cacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
      ||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26861544 accgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccat 26861454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 27718429 - 27718732
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  27718429 gtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcc 27718528  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||  |||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  27718529 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccgg 27718628  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    |||||| ||  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27718629 taaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccat 27718728  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  27718729 gaga 27718732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 27611052 - 27611353
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  27611052 gtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcc 27611151  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||  |||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  27611152 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccgg 27611251  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    |||||||||  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  27611252 taaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaagaagaggaagctaattgcatagccat 27611351  T
Q  307 ga 308  Q
    ||    
T  27611352 ga 27611353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 312
Target Start/End: Original strand, 27706452 - 27706757
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27706452 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcc 27706551  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||   ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||      
T  27706552 ttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctg 27706651  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    | |||||||  ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||  || |  |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27706652 tgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagagaaaggtgattgcatagccat 27706751  T
Q  307 gagatt 312  Q
    ||||||    
T  27706752 gagatt 27706757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27679083 - 27678778
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27679083 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcc 27678984  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||   ||||||| | |||||||||| |||||| ||||  ||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  27678983 ttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccgg 27678884  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    | |||||||  ||||||||||  ||||| ||  ||||||| || |||||  || |  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27678883 tgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccat 27678784  T
Q  307 gagatt 312  Q
    ||||||    
T  27678783 gagatt 27678778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 27724895 - 27725196
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  27724895 gtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcc 27724994  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||  |||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  27724995 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccgg 27725094  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    |||||||||  |||||||||  ||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27725095 taaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccat 27725194  T
Q  307 ga 308  Q
    ||    
T  27725195 ga 27725196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 27698544 - 27698847
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  27698544 gtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcc 27698643  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||  |||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  27698644 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccgg 27698743  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    |||||||||  |||||||||  ||| |||||  ||| ||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27698744 taaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccat 27698843  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  27698844 gaga 27698847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 27593078 - 27593373
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||    
T  27593078 gaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaag 27593177  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||  |||||| ||||  ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||    
T  27593178 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccg 27593277  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 310  Q
    |  ||||||||||  ||||| ||  ||||||| || |||||  || |  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593278 taccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 27593373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26823969 - 26823700
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26823969 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgag 26823870  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||  || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||  |     
T  26823869 tgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattca 26823770  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaag 284  Q
    |  ||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||  ||||  ||||||| | |||||||||||    
T  26823769 taccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaactgaagaggaag 26823700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26802571 - 26802278
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||    
T  26802571 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgag 26802472  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26802471 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccg 26802372  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatga 308  Q
    |  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  26802371 taccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatga 26802278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28781268 - 28780975
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  28781268 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 28781169  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28781168 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 28781069  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatga 308  Q
    |  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || |||||||||||| || | || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28781068 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatga 28780975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28786407 - 28786116
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  28786407 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 28786308  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  28786307 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 28786208  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    |  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28786207 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccat 28786116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28792528 - 28792237
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  28792528 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 28792429  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  28792428 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 28792329  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    |  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28792328 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccat 28792237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229066
Alignment:
Q  29 agttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgattt 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  129 catcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcacc 228  Q
    | || |||||| |||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||      
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  229 gcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 310  Q
    ||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27229147 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgaga 27229066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 27604763 - 27605064
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||   ||    
T  27604763 gaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaag 27604862  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    || || | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27604863 tgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 27604962  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaa------gaggaagaggaaggtgattgcatagccatga 308  Q
    |  |||||||||  ||| |||||  | ||||| || |||||||||||| |||| || | ||||      ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27604963 tatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagaggatgaggatgaggaaggtaattgcatagccatga 27605062  T
Q  309 ga 310  Q
    ||    
T  27605063 ga 27605064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 27338115 - 27338418
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27338115 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggcc 27338214  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||| | ||||||| | || ||||||| ||||||  ||| ||    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||      
T  27338215 ttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccgg 27338314  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||||| | ||||||||  | | |||||  ||||||| || |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27338315 taaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccat 27338414  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  27338415 gaga 27338418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 27398855 - 27399158
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27398855 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggcc 27398954  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    ||| | ||||||| | || ||||||| ||||||  ||| ||    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||      
T  27398955 ttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccgg 27399054  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    ||||||||| | ||||||||  | | |||||  ||||||| || |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27399055 taaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccat 27399154  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  27399155 gaga 27399158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26656118 - 26655823
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||    
T  26656118 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgag 26656019  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26656018 tgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 26655919  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 310  Q
    |  || ||||||  ||| |||||  ||||||| || |||||  | || ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26655918 tgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgaga 26655823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26762089 - 26761794
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||    
T  26762089 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgag 26761990  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26761989 tgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 26761890  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 310  Q
    |  || ||||||  ||| |||||  ||||||| || |||||  | || ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26761889 tgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgaga 26761794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26884287 - 26884023
Alignment:
Q  20 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  26884287 atgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 26884188  T
Q  120 atttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgtcacg 219  Q
     | |||||||    |||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |  ||    
T  26884187 gtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccg 26884088  T
Q  220 agtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaag 284  Q
    ||||||||  ||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  26884087 agtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggaag 26884023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 27531258 - 27531502
Alignment:
Q  18 tgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtga 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||    
T  27531258 tgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtga 27531357  T
Q  118 tgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgtca 217  Q
    || | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||      
T  27531358 tggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgg 27531457  T
Q  218 cgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaat 262  Q
    ||||||||  |||| |||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  27531458 cgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 27531502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25579856 - 25579663
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25579856 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 25579757  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 200  Q
    ||| | ||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||  |||||||| ||||||  | ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  25579756 ttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagat 25579663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26143002 - 26142809
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26143002 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 26142903  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 200  Q
    ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  26142902 ttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagat 26142809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28139669 - 28139377
Alignment:
Q  16 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  28139669 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagt 28139570  T
Q  116 gatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgt 215  Q
    || | |   ||||| || |||| | |||| || | ||||||||| || |||||||||||   ||||  |||||| ||||||||||  ||| | ||||||     
T  28139569 gacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaaccga 28139470  T
Q  216 cacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatga 308  Q
     ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  28139469 aacgagtgtcactgcctctgaagctgagaaagacatcgtatgtgaagccataggagaaagaagtagaagaagaaggtggttgcaaagccatga 28139377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25481879 - 25481686
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||     
T  25481879 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatggcc 25481780  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 200  Q
    ||| | ||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||| ||  | ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  25481779 ttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagat 25481686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26056063 - 26055870
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  26056063 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggcc 26055964  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 200  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||| || |  ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  26055963 ttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagat 26055870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26076033 - 26075840
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  26076033 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattcttcgatggcc 26075934  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 200  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||   ||||||||||| || |  ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  26075933 ttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagat 26075840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28181249 - 28180970
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcatt 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28181249 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28181150  T
Q  109 gtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaata 208  Q
    |   ||||||||| | ||||| || |||| | |||| || |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | |||||  ||| ||    
T  28181149 gaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagta 28181050  T
Q  209 aaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagagga 288  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||  | |  || ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  28181049 aaaccataacgagtgtcaccacctctaaagctaaggaacgcgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28180970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28234692 - 28234529
Alignment:
Q  16 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  28234692 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28234593  T
Q  116 gatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgt 179  Q
    |||| | | |||||||| |||| | |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28234592 gatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgt 28234529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28242939 - 28242711
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcatt 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28242939 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28242840  T
Q  109 gtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaata 208  Q
    |   ||||||| | | ||||  || |||| | ||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||| | |  |||| | ||||||||||  ||| ||    
T  28242839 gaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagta 28242740  T
Q  209 aaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaa 237  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  28242739 aaaccataacgagtgtcactacctctaaa 28242711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28185494 - 28185222
Alignment:
Q  16 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  28185494 aatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagt 28185395  T
Q  116 gatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgt 215  Q
    |||||| | ||||| || |||| | |||| || |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | |||||  ||| ||||||  |    
T  28185394 gatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacgat 28185295  T
Q  216 cacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagagga 288  Q
     |||||||||||  ||||||||| | ||||| || |  || ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  28185294 aacgagtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28227079 - 28226868
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||   ||    
T  28227079 gaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaag 28226980  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | |||| || | |||||||| ||| ||||| |||||||| | |  |||| |  |||||||||  ||| |||||||     
T  28226979 tgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaacca 28226880  T
Q  215 tcacgagtgtca 226  Q
    | ||||||||||    
T  28226879 taacgagtgtca 28226868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25538677 - 25538484
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| |||||     
T  25538677 gtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggcc 25538578  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 200  Q
    ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||| ||    ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  25538577 ttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagat 25538484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26048982 - 26048789
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  26048982 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggcc 26048883  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 200  Q
    ||| | |||   | | |||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||||||| ||    |||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  26048882 ttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagat 26048789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26070151 - 26069958
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  26070151 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggcc 26070052  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 200  Q
    ||| | |||   | | |||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||||||| ||    |||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  26070051 ttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagat 26069958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 312
Target Start/End: Original strand, 26341992 - 26342292
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||    
T  26341992 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggctttgacaag 26342091  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||  | ||||||  || ||||   |||| || | |||||||||||||||| ||| |||   ||||   |||||  | |||| || |||| |||||||     
T  26342092 tgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcggactccaccgtcacatagagctctatagatattgccagtaaaacca 26342191  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgatt---gcatagccatgagat 311  Q
    |  |||||| ||  ||| ||||| |||||||| || |  || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||   |||||||||||||||    
T  26342192 tagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacacatcatatgtgaatccatatgagaatgaagagaaagaggacgatgattggagcatagccatgagat 26342291  T
Q  312 t 312  Q
    |    
T  26342292 t 26342292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28150072 - 28149912
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcatt 108  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  28150072 agcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggactcttcaatggcctt 28149973  T
Q  109 gtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtgga 170  Q
    |  |||||||| | ||||||| ||||||| |  ||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  28149972 g-agagtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtgga 28149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Original strand, 28297765 - 28297859
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28297765 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28297859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 28514308 - 28514214
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28514308 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28514214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 25506978 - 25507171
Alignment:
Q  26 acaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttga 125  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| | |||    
T  25506978 acaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtga 25507077  T
Q  126 tttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtc 225  Q
    ||||||| ||||||   || |||| ||||||||      |||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| |  |||||||||    
T  25507078 tttcatctcctcttttcagatcacaatcatcaa------tgtgaattcccttgtcatatagagccgtgtagagatggctagtaaaacggctacgagtgtc 25507171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325520
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggc 28325520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2184417 - 2184327
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  2184417 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattctggactcttcaatggc 2184327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26937219 - 26937160
Alignment:
Q  19 gatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagg 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  26937219 gatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacagg 26937160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 267
Target Start/End: Original strand, 26893530 - 26893781
Alignment:
Q  16 aatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagt 115  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |  || |||||  | ||| ||||||||||||| || |||   |||    
T  26893530 aatgattttgacgagttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagt 26893629  T
Q  116 gatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgt 215  Q
    |||| |  |||||| || |||||  |||| ||   |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| || || ||||| ||  |||||||      
T  26893630 gatggtgagatttcgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattccactatcacaaagagctttataaagatgacccgtaaaaccaa 26893729  T
Q  216 cacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccata 267  Q
     ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  26893730 aacgagtgtcagagcctctaaaattgaggaagacatcgtaggtgaatccata 26893781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 26975181 - 26975134
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26975181 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 26975134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Original strand, 27427656 - 27427751
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||    
T  27427656 gtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 28098427 - 28098517
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  28098427 gaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggc 28098517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26848789 - 26848741
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26848789 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagtt 26848741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2185027 - 2184980
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 62  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2185027 gaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagt 2184980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 25071788 - 25071741
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 62  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25071788 gaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27214543 - 27214498
Alignment:
Q  18 tgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27214543 tgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27214498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Original strand, 27234685 - 27234730
Alignment:
Q  18 tgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27234685 tgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Original strand, 27665312 - 27665358
Alignment:
Q  152 tcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27665312 tcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagag 27665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26949790 - 26949745
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcata 60  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26949790 gaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcata 26949745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Original strand, 27665175 - 27665223
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 63  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  27665175 gaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27665223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26635819 - 26635774
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcata 60  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26635819 gaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26635774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26741785 - 26741740
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcata 60  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  26741785 gaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcata 26741740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 26959295 - 26959250
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcata 60  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  26959295 gaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcata 26959250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 3471 - 3773
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatag-ttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggc 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3471 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggc 3570  T
Q  106 attgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggcca 205  Q
     |||  |||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  3571 cttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccg 3670  T
Q  206 ataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagcca 305  Q
     |||||||||  |||||||||  ||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3671 gtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagcca 3770  T
Q  306 tga 308  Q
    |||    
T  3771 tga 3773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 14406 - 14708
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  14406 gtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcc 14504  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||  |||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  14505 ttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccgg 14604  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    |||||||||  |||||||||  ||| |||||  ||| ||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14605 taaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccat 14704  T
Q  307 gaga 310  Q
    ||||    
T  14705 gaga 14708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 310
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8154
Alignment:
Q  218 cgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 310  Q
    |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8062 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgaga 8154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Original strand, 4721 - 5020
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggca 106  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  4721 gtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcc 4820  T
Q  107 ttgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaa 206  Q
    |||  ||| |||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  4821 ttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccgg 4920  T
Q  207 taaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 306  Q
    |||||||||  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4921 taaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccat 5020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 13690 - 13983
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  13690 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 13789  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  13790 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 13889  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatga 308  Q
    |  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || |||||||||||| || | || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13890 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatga 13983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7654 - 7359
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||    
T  7654 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 7555  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||| | |||||||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  7554 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 7455  T
Q  215 tcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 310  Q
    |  |||||||||  ||| |||||  | ||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7454 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgaga 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 310
Target Start/End: Original strand, 10 - 270
Alignment:
Q  50 gaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcac 149  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||     
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  150 gatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagac 249  Q
      |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||  ||| |||||  | ||||| ||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 209  T
Q  250 ctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 310  Q
     |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  210 ttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgaga 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34860 - 34690
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcatt 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  34860 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 34761  T
Q  109 gtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgt 179  Q
    |   ||||||| | | |||||||| |||| | |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34760 gaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgt 34690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43101 - 42873
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcatt 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  43101 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 43002  T
Q  109 gtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaata 208  Q
    |   ||||||| | | ||||  || |||| | ||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||| | |  |||| | ||||||||||  ||| ||    
T  43001 gaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttacaaagatctttgtagagatttccagta 42902  T
Q  209 aaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaa 237  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  42901 aaaccataacgagtgtcactacctctaaa 42873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27577 - 27366
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||   ||    
T  27577 gaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaag 27478  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccg 214  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | |||| || | |||||||| ||| ||||| |||||||| | |  |||| |  |||||||||  ||| |||||||     
T  27477 tgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttccagtaaaacca 27378  T
Q  215 tcacgagtgtca 226  Q
    | ||||||||||    
T  27377 taacgagtgtca 27366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116835
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggc 105  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggc 116835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58607
Alignment:
Q  9 agcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcatt 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  109 gtcgagtgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaata 208  Q
    |   ||||||| | | ||||| || |||| | |||| || |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||  ||| ||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  209 aaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagagga 282  Q
    ||||| |  ||||||||||  ||||||||| | ||||| || || || ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  58534 aaaccatagcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccataggagaaggaagagga 58607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3279817 - 3279666
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||| ||| | ||    
T  3279817 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggccttgacaag 3279718  T
Q  115 tgatgatttgatttcatcccctcttcgaagttcacgatcatcaatgaaggtg 166  Q
    ||||  | |||||||||| ||||   |||| || | ||||||||||||||||    
T  3279717 tgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtg 3279666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 62
Target Start/End: Original strand, 17993742 - 17993789
Alignment:
Q  15 gaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 62  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17993742 gaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 17993789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 59707 - 59612
Alignment:
Q  7 gtagcagagaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaat 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||    
T  59707 gtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University