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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7732_low_16 (Length: 240)

Name: NF7732_low_16
Description: NF7732
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7732_low_16
NF7732_low_16
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-210)||(2943764-2943973)
chr7 (1-206)||(30541203-30541408)
chr7 (1-226)||(11038882-11039108)
chr7 (1-192)||(23809405-23809597)
chr7 (1-226)||(1052756-1052986)
chr7 (1-208)||(5973196-5973404)
chr7 (16-226)||(33189541-33189752)
chr7 (30-226)||(36299040-36299236)
chr7 (16-226)||(7767217-7767428)
chr7 (1-208)||(22518891-22519097)
chr7 (61-199)||(38440134-38440273)
chr7 (7-104)||(15953894-15953991)
chr7 (30-226)||(47925072-47925268)
chr7 (115-221)||(27337319-27337426)
chr7 (30-132)||(25502328-25502431)
chr7 (60-182)||(2891189-2891312)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (1-226)||(28211611-28211837)
chr8 (1-206)||(7986919-7987125)
chr8 (1-226)||(9762623-9762849)
chr8 (8-208)||(8226955-8227156)
chr8 (53-210)||(7968174-7968332)
chr8 (36-226)||(36582628-36582818)
chr8 (1-226)||(31006239-31006466)
chr8 (1-195)||(6870328-6870530)
chr8 (1-226)||(11481625-11481852)
chr8 (153-201)||(13407236-13407284)
chr8 (1-50)||(13356010-13356059)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-226)||(38951830-38952056)
chr4 (6-207)||(29117217-29117421)
chr4 (1-205)||(17120000-17120206)
chr4 (1-226)||(19841938-19842164)
chr4 (1-226)||(40714518-40714743)
chr4 (1-199)||(33340807-33341006)
chr4 (45-226)||(8818987-8819169)
chr4 (45-226)||(36464497-36464679)
chr4 (2-225)||(23627073-23627297)
chr4 (18-199)||(51357423-51357599)
chr4 (31-205)||(42555575-42555750)
chr4 (57-208)||(41041702-41041854)
chr4 (16-181)||(43624569-43624732)
chr4 (67-196)||(22279277-22279406)
chr4 (113-226)||(40568633-40568747)
chr4 (69-225)||(47224075-47224232)
chr4 (159-204)||(48747921-48747966)
chr4 (56-104)||(50426059-50426107)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (1-226)||(27926330-27926554)
chr3 (2-226)||(13826260-13826485)
chr3 (30-226)||(3778674-3778870)
chr3 (1-208)||(21288298-21288507)
chr3 (1-226)||(25874398-25874626)
chr3 (61-208)||(5295481-5295629)
chr3 (1-210)||(48251200-48251410)
chr3 (38-226)||(12149229-12149418)
chr3 (69-166)||(36585000-36585098)
chr3 (3-108)||(26188076-26188181)
chr3 (139-199)||(25022412-25022472)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-226)||(47140995-47141220)
chr1 (1-194)||(15378943-15379143)
chr1 (1-221)||(2191491-2191712)
chr1 (38-226)||(31584934-31585123)
chr1 (1-208)||(11894467-11894675)
chr1 (38-226)||(25293746-25293935)
chr1 (30-208)||(29677324-29677498)
chr1 (36-208)||(48378798-48378971)
chr1 (4-165)||(38264084-38264247)
chr1 (64-133)||(33089058-33089127)
chr1 (38-104)||(17562610-17562676)
chr1 (108-199)||(52252886-52252978)
chr1 (105-199)||(25987659-25987754)
chr1 (169-226)||(42507314-42507371)
chr1 (169-226)||(36728560-36728617)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (30-226)||(10408638-10408835)
chr6 (2-208)||(641744-641950)
chr6 (31-226)||(7622540-7622736)
chr6 (1-226)||(35166983-35167207)
chr6 (1-208)||(28582372-28582580)
chr6 (1-181)||(8576946-8577127)
chr6 (8-208)||(10788691-10788891)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (8-199)||(45150962-45151153)
chr2 (1-226)||(5704805-5705031)
chr2 (8-226)||(5110423-5110642)
chr2 (63-206)||(5938947-5939091)
chr2 (8-204)||(13626031-13626228)
chr2 (60-226)||(31575637-31575804)
chr2 (1-161)||(13807753-13807914)
chr2 (115-226)||(42622365-42622477)
chr2 (56-121)||(42604571-42604636)
chr2 (1-65)||(45458345-45458409)
chr2 (70-195)||(14701446-14701572)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (1-226)||(3926402-3926628)
chr5 (1-199)||(42878674-42878872)
chr5 (38-226)||(39800141-39800330)
chr5 (8-210)||(26621578-26621782)
chr5 (61-226)||(42837777-42837942)
chr5 (1-226)||(39886874-39887100)
chr5 (105-226)||(35188320-35188442)
chr5 (115-226)||(40057173-40057285)
chr5 (1-226)||(39206829-39207039)
chr5 (1-101)||(33742521-33742621)
chr5 (60-226)||(23429508-23429669)
chr5 (33-157)||(2209793-2209917)
chr5 (60-92)||(35188439-35188471)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (38-226)||(22219-22408)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (38-226)||(8967-9156)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (60-208)||(6660-6809)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (30-226)||(66777-66972)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (146-199)||(885-938)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2943973 - 2943764
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2943973 ataactaataacattcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 2943874  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatcattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtatt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2943873 atccgcggatgtggataccattaaatctgcattcgtatcattaattagcgggtagttaaaatatccgtttattttacccataaatatccattaaggtatt 2943774  T
Q  201 cgctccgtat 210  Q
    ||||||||||    
T  2943773 cgctccgtat 2943764  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30541408 - 30541203
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30541408 ataactaataacactcacaataccaagggtttttgcttaggaagttgaaagttattag-gttatttatgtatcttactcggtttaataacggatatggat 30541310  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||| |||| ||  |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30541309 atctgcgggtgcaaataccattaaatcggcatccatatccattaattagcgggtagttaaaatattcgtttattttatccatggatatccattaaggtat 30541210  T
Q  200 tcgctcc 206  Q
     ||||||    
T  30541209 ccgctcc 30541203  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11039108 - 11038882
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11039108 ataacgaataacactcacaatacgtatggttttttcttaggaagtggaatggtattaagcttatttatgaaatttactcggtttaatagccggtatggat 11039009  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgta-tcattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||| | || | || |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11039008 atctgcgggtgtggataccattaaatccgtatccatattcattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatgaatatccattaaggtat 11038909  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
      ||||| | |  ||||||||||||||    
T  11038908 ctgctccatgtccgtggcggattttat 11038882  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23809597 - 23809405
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||  | ||| ||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  23809597 ataacttataacactcacaatacgtatcgtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcaagtatggat 23809498  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccatt 192  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23809497 atccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaacctgtttattttatccatgaatatccatt 23809405  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1052986 - 1052756
Alignment:
Q  1 ataactaataaca-ctcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatgga 99  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1052986 ataactaataacaactcagggtaccgattttttttgcttaggaatttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttattcggtataatagcgggtatgga 1052887  T
Q  100 tatccgc-gga--tgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaag 195  Q
    ||||||| |||  || | |||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1052886 tatccgcaggaggtgcggataccattaaatccacatccttatccattaattagcgggtagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccattaag 1052787  T
Q  196 gtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||| |||||||| |  |||||| |||||||    
T  1052786 gtatccgctccgtgtccgtggcgaattttat 1052756  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 5973196 - 5973404
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |  ||||  |||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5973196 ataactgataacactcacaatacctaggtgttttttttaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcgatttaatagcgggtatggat 5973295  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  5973296 atccgcgggtgtgaataccattaaatccgcatctgtatccattaattagtggatagttaaaaaattcgtttattttatcaatggatttccattaaggtat 5973395  T
Q  200 tcgctccgt 208  Q
     || |||||    
T  5973396 ccgttccgt 5973404  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Original strand, 33189541 - 33189752
Alignment:
Q  16 cacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaa 115  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||| |||| |    
T  33189541 cacaatacctaggattttttcttaggatgttgaatggtattaaggatatttatgtaatttactctgtgtaataacggatatgtttatccgcgggtgtgga 33189640  T
Q  116 taccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgt 214  Q
    ||||||| |||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  33189641 taccattgaattcgcatctgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgt 33189740  T
Q  215 ggcggattttat 226  Q
    ||||||||||||    
T  33189741 ggcggattttat 33189752  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Original strand, 36299040 - 36299236
Alignment:
Q  30 tttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctg 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| || || | |||||||||||||      
T  36299040 tttttgcttaggaatttgaaatgtattaaggttatttatgtaattta-ttggtttaatagcgggtatgaatatccgtgggtgcggataccattaaatcaa 36299138  T
Q  130 cattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  36299139 catttgtatccattaattagcgggtagttaaaatattcatttattttatccatggatatccattaagatatccgctccgtgtccgtggcagattttat 36299236  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 226
Target Start/End: Original strand, 7767217 - 7767428
Alignment:
Q  16 cacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaa 115  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||| |    
T  7767217 cacaatacctaggattttttcttaggaagttcaatgatattaaggttatttatgtaatttactcagtttaatagtgggtatggatatccgcaggtgtgga 7767316  T
Q  116 taccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgt 214  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| | |  ||    
T  7767317 taccattaaatctgaatccgtgtccattaattagggggtagttaaaaaatccgtttattttattcatggatatccattaaagtatccgctccatgtccgt 7767416  T
Q  215 ggcggattttat 226  Q
    ||||||||||||    
T  7767417 ggcggattttat 7767428  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22519097 - 22518891
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||| ||  |||||||    
T  22519097 ataactaataaccctcacaataccgaggttttttccttag-aagttgaaagatattaagtttatttatgtaatttattcaatttaataacgtgtatggat 22518999  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatcattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtatt 200  Q
    ||| || |||| | ||||||||||| |  ||| ||||||  | ||| || | |||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22518998 atctgctgatgcggataccattaaacccacatccgtatccattatttgcaggtagttaaaatatttgtttattttatctatggatatccattaaggtatt 22518899  T
Q  201 cgctccgt 208  Q
     |||||||    
T  22518898 tgctccgt 22518891  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38440273 - 38440134
Alignment:
Q  61 ttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaa 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || | |||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38440273 ttatttatgtaatttactcggtttaatagtgggtatggatatctgcaggtgtggataccatcaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaa 38440174  T
Q  160 aatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    || ||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38440173 aaaattcgtttattttatctatggatatccattaaggtat 38440134  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15953991 - 15953894
Alignment:
Q  7 aataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatcc 104  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15953991 aataacactcacattaccgaggttttatgcttaggaagttgcaaattattaaggttatttatgtaatttactcgatttaatagcgggtatggatatcc 15953894  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Original strand, 47925072 - 47925268
Alignment:
Q  30 tttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||||  ||||||||  | || || | |||||||||||||      
T  47925072 tttttgcttaagaagttgaaagatattaaggttatttatgta-tttagtaagtttaatagcgggcatggatatttgtgggtgcggataccattaaatcca 47925170  T
Q  130 cattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    | |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||    
T  47925171 ctttcgtatccattaattaatgggtagttaaaatatctatttattttatctaaggatatccattaaggtatccgttccgtgtccgtggcggattttat 47925268  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 27337319 - 27337426
Alignment:
Q  115 ataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttg 213  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  27337319 ataccattaaatccgcatccgtatctattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttattcgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccg 27337418  T
Q  214 tggcggat 221  Q
    ||||||||    
T  27337419 tggcggat 27337426  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 25502328 - 25502431
Alignment:
Q  30 tttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttat--ttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatc 127  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25502328 ttttttcttaggaagttgaatggtattgaggttatatttacataatttactcgatttaatagcggatataaatatccgcgg-tgtgaataccattaaatc 25502426  T
Q  128 tgcat 132  Q
     ||||    
T  25502427 cgcat 25502431  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 182
Target Start/End: Original strand, 2891189 - 2891312
Alignment:
Q  60 gttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagtta 158  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||| |||| ||||| ||   | || ||     
T  2891189 gttatttatgtagtttacttattttaatagcgggtatggatatccgcagatgtggatatcatcaaatatgcattcatatccattaaataataggtaattg 2891288  T
Q  159 aaatatctgattattttatccatg 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  2891289 aaatatctgtttattttatccatg 2891312  T

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Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28211837 - 28211611
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28211837 ataactaataacactcatagtaccgaggatttttgtttaggaagttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttacttggtttaatagcgaatatggat 28211738  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  28211737 atctgcgggtgtggatactattaaatccgcattcgtatccattaattagtgggtagttaaaatatccgtttattttatccatagatatccattaaagtat 28211638  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
      |||| || |  ||||||||||||||    
T  28211637 ctgctctgtgtccgtggcggattttat 28211611  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7987125 - 7986919
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7987125 ataactaataacattcacaatacctatgtttttttcttaataagttgaatggtattaaggttatttatgtaatttattcggtttaatagcgggtatggat 7987026  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||| | | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7987025 atccgcgggtgtgaataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcaggtagttgacaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtat 7986926  T
Q  200 tcgctcc 206  Q
     ||||||    
T  7986925 ccgctcc 7986919  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9762849 - 9762623
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | | ||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  9762849 ataactaataacactcacaatatctagggtgttttcttaggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttattcgatttaatagcgagtatggat 9762750  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| | ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9762749 atccgaggatgtggataccatcaaatccgcatccatatccattaattagcaggtagttaaaaaatctgtttattttatccatggatatccattaaggtat 9762650  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     ||||||||    ||||||||||||||    
T  9762649 ccgctccgtgcccgtggcggattttat 9762623  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8227156 - 8226955
Alignment:
Q  8 ataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcg 107  Q
    ||||||||||||||||  | | | ||| ||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8227156 ataacactcacaatacttagggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatgaatatccgcg 8227057  T
Q  108 gatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctcc 206  Q
    | |||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  8227056 ggtgtggataccattaaatccgcatccgtatctattaattagcgggtagttaaaagatccgtttattttatccatgtatatccattaaggtatccactcc 8226957  T
Q  207 gt 208  Q
    ||    
T  8226956 gt 8226955  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7968332 - 7968174
Alignment:
Q  53 tattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcgg 151  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  7968332 tattaaggttatttatgtaatttattcggtttaatagcgaatatggatatacgcgggtgtgaataccattaaatccgcatgcgtatccattaattagcgg 7968233  T
Q  152 atagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtat 210  Q
     ||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  7968232 gtagttgaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctacgtat 7968174  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36582818 - 36582628
Alignment:
Q  36 cttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcg 135  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||| ||    
T  36582818 cttaggaagttgaa-tatattgaggttatttatgtatcttactcggtttaataacgggtatggatattcgcgggtgtgtatactattaaatccgcatccg 36582720  T
Q  136 tatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  36582719 tatccattaattagtggatagttaaaaaatccgtttattttattcatggatatccattaagatatccgctccgtgttcgtggcggattttat 36582628  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 31006239 - 31006466
Alignment:
Q  1 ataactaataaca-ctcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatgga 99  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31006239 ataaataataacaactcagagtaccgatattttttgcttaggaatttgaatggtattaaagttatttatataattcactcggtttaatagctgatatgga 31006338  T
Q  100 tatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggta 198  Q
    |||  | || ||   ||||| ||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31006339 tatttgtgggtgcagataccgttaaatccgtgttcgtgtccattaattagcggatagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccattaagata 31006438  T
Q  199 ttcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    | |||||| | |  ||||||||||||||    
T  31006439 tccgctccatgtccgtggcggattttat 31006466  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6870530 - 6870328
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttattt-atgtaatttactcggtttaatagcggatatgga 99  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6870530 ataactaataatactcacactaccgatactttttgcttagaaagttgaaatgtattaaagttatttaatttaacttactcggtttaatagcgggtatgga 6870431  T
Q  100 tatccgcggatgtga------ataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccatt 192  Q
    |||  |||  || ||      ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  6870430 tatatgcgagtgcgagtgcggataccattaaatctgcatatgtatcaattaattaacgggtagttaaattatatgtttattttatccatggatatccatt 6870331  T
Q  193 aag 195  Q
    |||    
T  6870330 aag 6870328  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 11481625 - 11481852
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| | | | | ||| ||||||||||||||   |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11481625 ataactgataacactcacaatatctagggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttacataatttactcggtttaatagcgggtatggat 11481724  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagtt-aaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggta 198  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||   ||||| |||| ||| | |||||||||| ||| |||| ||| || |||    
T  11481725 attcgcggatgtggataccgttaaatccacatccatatccattaattagcaagtagttaaaaaaatccgtttattttatcgatggatattcatcaaagta 11481824  T
Q  199 ttcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    | |||||||||   ||||| ||||||||    
T  11481825 tccgctccgtacccgtggcagattttat 11481852  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 13407236 - 13407284
Alignment:
Q  153 tagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattc 201  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13407236 tagttaaaatgtctgtttattttatccatgaatattcattaaggtattc 13407284  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 13356010 - 13356059
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaa 50  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13356010 ataactaataatattcacaataccgacgatttttgcttaggaaattgaaa 13356059  T

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Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 38951830 - 38952056
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||   |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38951830 ataactgataacactcacaatacctaaggtgttttctcaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttcctcggtttaatagcggatatggat 38951929  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |   |||| |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38951930 aaatgcgggtgtgaataccattaaatccgcatctgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatctgtttattttatccgtgaatatccattaatgtat 38952029  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     |||||||||  |||||||||||||||    
T  38952030 ccgctccgtacctgtggcggattttat 38952056  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 29117217 - 29117421
Alignment:
Q  6 taataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaa--tgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||  |||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  29117217 taataacactcacaatatcgagggtttttgcttaggaaattgaaagttattaggttattatttatgtaatttattcagtttaatagcggaaatggatatc 29117316  T
Q  104 cgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcg 202  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| |||| |    
T  29117317 cgcggatgcggataccgttaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccgtttattttatccatgaatatttattaagttatttg 29117416  T
Q  203 ctccg 207  Q
    |||||    
T  29117417 ctccg 29117421  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17120206 - 17120000
Alignment:
Q  1 ataactaataaca-ctcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatgga 99  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17120206 ataactaattacaactcacaataccgatgttttttgcttaggaagttcaaagatattaagattacttatgtaatttactcggtttaatatcgggtatgga 17120107  T
Q  100 tatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggta 198  Q
    ||||||||  || | || ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| ||||||| |    
T  17120106 tatccgcgcgtgcggatgccattaagtccgcattcgtatccattaattagcggatagttaaaatattcgtttatttcatccacgaatatctattaaggca 17120007  T
Q  199 ttcgctc 205  Q
    | |||||    
T  17120006 tccgctc 17120000  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 19841938 - 19842164
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  19841938 ataactaataacactcacaatacctagggttttttcttagaaaattgaatgatattaaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcaggtattgat 19842037  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    || ||||| |||| | ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19842038 attcgcgggtgtggaaaccattaaatccgcatctttatccattaattagcgattagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtat 19842137  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     | |||||| |  ||||||||||||||    
T  19842138 ccactccgtgtccgtggcggattttat 19842164  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40714743 - 40714518
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40714743 ataactaataacactcacaatacttaggttttttgcttaaaaagttgaaaggtattaaagttatttatgtaatttactcggtttaatagcgagtatggat 40714644  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||  |||| || ||||||| || |||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  40714643 atccgcgggtgcggatgccattaaatctgcatctgtatccactaattagtgg-tagttaaaatatccatttattttatcgataaatatccattaatgtat 40714545  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     |||| |||   |||| ||||||||||    
T  40714544 ccgcttcgtgcctgtgacggattttat 40714518  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 33340807 - 33341006
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  33340807 ataactaataacactcacaacactgaggttttttgcttaggaagttgaaaggtattaatgttatttatatattttactctatttaatagtggatatggat 33340906  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||| |||| |    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||  || || ||||||||||    
T  33340907 atctgcgggtacatataccattaaatctgcatccgtatccattaattagtaggtagttaaaatatccgtttattttatccatagatgtctattaaggtat 33341006  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8819169 - 8818987
Alignment:
Q  45 ttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-catta 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| | ||| |||||    
T  8819169 ttgaaaggtattaatgttatttatgtaatttatttagtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgcggataccattaaatccgcatccatatccatta 8819070  T
Q  144 attagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |  ||| ||||||||||    
T  8819069 attaacagatagttaaaatatccgtttattttatccatgaatatccgttaaggtatccgcttcgtgtccgtgacggattttat 8818987  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36464679 - 36464497
Alignment:
Q  45 ttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-atta 143  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  || ||||||  |||| || | ||| ||||||||| |||| |||||| ||||    
T  36464679 ttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttattcagtttaatagcgagtaaggatatttgcgggtgcggatatcattaaatccgcatccgtatctatta 36464580  T
Q  144 attagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  36464579 attagcggatagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccgttaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 36464497  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 23627073 - 23627297
Alignment:
Q  2 taactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggata 101  Q
    ||||||||||||||||||| | | | | |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||    
T  23627073 taactaataacactcacaacatcaaggttttttgattagaaagttgaaaagtattaaggttatttatgtaatttactcggtttagtagcaagtatgcata 23627172  T
Q  102 tccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtatt 200  Q
    | || |||||   ||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||     
T  23627173 ttcgaggatgcagataccattatatatgcatatgtatccattaattagcaggtagttaaaatattcgtttattttatccatgtatttccattaaggtatc 23627272  T
Q  201 cgctccgtatttgtggcggatttta 225  Q
    | |||||| ||||| | ||||||||    
T  23627273 cactccgtgtttgttgaggatttta 23627297  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 51357423 - 51357599
Alignment:
Q  18 caataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaata 117  Q
    ||||||||| | |||| |||||  || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||    
T  51357423 caataccgaggtttttagcttaaaaatttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttattcagtttaatagcgggtatggatatccgtgggtgtggata 51357522  T
Q  118 ccattaaatctgcattcgtatcattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||||| ||||       |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51357523 ccattaaatccgcat-----caattaattagcagataattaaaatatccgtttattttatccataaatatccattaaggtat 51357599  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Original strand, 42555575 - 42555750
Alignment:
Q  31 ttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgc 130  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || || || | ||| |||||||||  |    
T  42555575 ttttacttaggaagttgaaaggtattaaggatatttatgtaatttacttggtttaatagcgagtatggatattcgtgggtgcggatatcattaaatccac 42555674  T
Q  131 attcgta-tcattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctc 205  Q
    |||| || |||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  42555675 attcatattcattaattagttggtagttaaaatatctgtttattttattcattgatatccattaaggtatccgctc 42555750  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 41041702 - 41041854
Alignment:
Q  57 aatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatag 155  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  ||||  ||||| |||||||||||| |||    
T  41041702 aatgatattgatgtaacttactcggtttaatagcgggtatggatgtccgcgggtgtggatatcattaaattcgcatctgtatctattaattagcgggtag 41041801  T
Q  156 ttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgt 208  Q
    |||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41041802 ttaaaaaatccatttattttatccataaatatccattaaggtatccgctccgt 41041854  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 181
Target Start/End: Original strand, 43624569 - 43624732
Alignment:
Q  16 cacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaa 115  Q
    ||||||||| | | |||||  |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |    
T  43624569 cacaatacctagggttttttgttaggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatggatatccgcgagtgtgga 43624668  T
Q  116 taccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccat 181  Q
    ||||||   ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  43624669 taccat---atccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttgttttatccat 43624732  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 196
Target Start/End: Original strand, 22279277 - 22279406
Alignment:
Q  67 atgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  22279277 atgtaatttactcggtttaatagcggatttggatatccgcgggtgtggatactattaaatctgcatctgtatccattaattaacgggtagttaaaa-atc 22279375  T
Q  166 tgattattttatccatgaatatccattaagg 196  Q
       |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22279376 catttattttatccatggatatcctttaagg 22279406  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40568747 - 40568633
Alignment:
Q  113 gaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatt 211  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |     
T  40568747 gaataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtc 40568648  T
Q  212 tgtggcggattttat 226  Q
     |||||| |||||||    
T  40568647 cgtggcgaattttat 40568633  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 225
Target Start/End: Original strand, 47224075 - 47224232
Alignment:
Q  69 gtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctg 167  Q
    ||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||  | ||| ||||| ||| ||||| || |||||||      
T  47224075 gtaatttacttaatttaataacgagtatggatatccgcaggtggaaataccatcaaatctgcatctgcatccattaaatagtggataattgaaatatcca 47224174  T
Q  168 attattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggatttta 225  Q
     ||||||||||  || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  47224175 cttattttatctttggatattcattaaggtatttgcttcgtgtttgttgcggatttta 47224232  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Original strand, 48747921 - 48747966
Alignment:
Q  159 aaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgct 204  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  48747921 aaatatccgtttattttatccttggatatccattaaggtattcgct 48747966  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 50426107 - 50426059
Alignment:
Q  56 taatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatcc 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  50426107 taatgttatttgtgtaatttacttagtttaatagcggatcaggatatcc 50426059  T

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Target: chr3 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27926554 - 27926330
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||  ||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  27926554 ataactaataacactcacaatacctaggttttt--cttaggaagttgaatggtattgaggttatttacataatttattcggtttaatagcgcatatagat 27926457  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||||||   |||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27926456 atccgcatgtgtggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatctatttattttatccatggatatccattaaggtat 27926357  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     |||||||| |  ||||||||||||||    
T  27926356 ccgctccgtgtccgtggcggattttat 27926330  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Original strand, 13826260 - 13826485
Alignment:
Q  2 taactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggata 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||   |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13826260 taactaataacactcacaatacctagggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttattaatgtaatttactcggtttaatagcgggtatggata 13826359  T
Q  102 tccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtatt 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||     
T  13826360 tccgcgggtgtggataccattaaatctgtatccatatccattaattagcgagtagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatctattaatgtatc 13826459  T
Q  201 cgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     |||||||    ||||||||||||||    
T  13826460 tgctccgtgcccgtggcggattttat 13826485  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3778870 - 3778674
Alignment:
Q  30 tttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctg 129  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| | || ||||| ||||||| |    
T  3778870 ttttttcttaggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttactctgtttaatagtgg-tatgaatatccgcgggtatggataccgttaaatccg 3778772  T
Q  130 cattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  3778771 catctgtatccattaattagcggatagttaaaaaatctgtttattttattcatggatatccattaaggtatccgctccgtgcccgtggcggattttat 3778674  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 21288298 - 21288507
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21288298 ataactgataacactcacaatacctagggtgttttctcaggaagttgaatgatattgaagttatttatgtaatttacttggtttaatagcgggtatggat 21288397  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagtt-aaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggta 198  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  21288398 atccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccctatccattaattagcgggtagttaaaaaaatccgtttattttatccatagatatccattaagata 21288497  T
Q  199 ttcgctccgt 208  Q
    | ||||||||    
T  21288498 tccgctccgt 21288507  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25874626 - 25874398
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| | | | | ||| ||| ||||||||||   |||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  25874626 ataactgataacactcacaatatctagggtgttttcttcggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatatattcggtttaataacgggtatggat 25874527  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattt--tatccatgaatatccattaaggt 197  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25874526 atccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatatccatggatatccattaaggt 25874427  T
Q  198 attcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    || ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  25874426 atccgctccgtgctcgtgacggattttat 25874398  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 208
Target Start/End: Original strand, 5295481 - 5295629
Alignment:
Q  61 ttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaa 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||    
T  5295481 ttatttatgtaatttactcagtttaatagcggatatggatatccgcaggtgtagataccattaaatctgcatctgtatccattaattagtgggtagttaa 5295580  T
Q  160 aatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgt 208  Q
    || ||  | ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5295581 aaaatacgtttattttattcatggatatccattaaggtatccgctccgt 5295629  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 48251410 - 48251200
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||| | || || ||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48251410 ataactaataacacccgcattatcgaagttttttgcttaggaagtttaatggtattaaggttatttatctaatttactcggtttaatagcggatatggat 48251311  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    || ||||| |  | ||||||||||||| | ||  | || ||||||||||| | || ||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  48251310 atacgcgggtagggataccattaaatccgtatctgcatccattaattagcagttaattaaaatatccatttattttatccatagatatccattaaagtat 48251211  T
Q  200 tcgctccgtat 210  Q
      |||||||||    
T  48251210 ctgctccgtat 48251200  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 12149229 - 12149418
Alignment:
Q  38 taggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgta 137  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||    
T  12149229 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaataacgggtgcggatatccgcgggtgcggataccattaaatcagcatccgta 12149328  T
Q  138 tc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  12149329 tccattaattaacgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 12149418  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 166
Target Start/End: Original strand, 36585000 - 36585098
Alignment:
Q  69 gtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatct 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36585000 gtaatttattcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgcggataccatttaatctgcatccgtatccattaattagcgggtagataaaatatct 36585098  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 108
Target Start/End: Original strand, 26188076 - 26188181
Alignment:
Q  3 aactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatat 102  Q
    |||||||||||  | ||||| | | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  26188076 aactaataacaaactcaatagctaggatttttgcttagaaagttgaagggtattaatgttatttatgtaatttactcagtataatagtgggtatggatat 26188175  T
Q  103 ccgcgg 108  Q
    | ||||    
T  26188176 ctgcgg 26188181  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25022472 - 25022412
Alignment:
Q  139 cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25022472 cattaaataacgggtagttaaaatatctatttatattatccatgaatatcaattaaggtat 25022412  T

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Target: chr1 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 47140995 - 47141220
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47140995 ataactaataacactcacaatac-gagggttttttcttaggaagttgaatggtattaagattatttatttaatttactcgatttaatagcgggtatggat 47141093  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||| ||   |||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47141094 atccgcgggtgctgataccattaaatatgtattcctatccattaattaacgggtagtaaaaaaatccgcttattttatccatggatatccattaaggtat 47141193  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     |||||||| |  ||||||||||||||    
T  47141194 ccgctccgtgtccgtggcggattttat 47141220  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 15378943 - 15379143
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  15378943 ataactaataacaatcacaatgccgaagatttttgtttaggaagttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttactcaatttaatagcgggtatggat 15379042  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-------cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccatta 193  Q
    ||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||       |||||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  15379043 atctgcgggtgtggatactattaaatctgcatccgtatccgtatccattaattagcgggcagttaaaatatccgtttatttgatccatggatatccatta 15379142  T
Q  194 a 194  Q
    |    
T  15379143 a 15379143  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2191712 - 2191491
Alignment:
Q  1 ataactaataaca-ctcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatgga 99  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  2191712 ataactaataacaactcacactaccgaggtttttt-cttagaaatttgaaaagtattaaggttatttatgtaatttattcggtttaatagcaggtatgga 2191614  T
Q  100 tatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggta 198  Q
    |||| |||| || | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | | ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2191613 tatctgcgggtgcggataccattaaatctgcatctgtatccattaattaacaggtagataaaatatccgtttattttatccatggatatccattaaagta 2191514  T
Q  199 ttcgctccgtatttgtggcggat 221  Q
    | |||||| |||  |||||||||    
T  2191513 tccgctccatatccgtggcggat 2191491  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31585123 - 31584934
Alignment:
Q  38 taggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgta 137  Q
    ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  31585123 taggaagttgaatgatattgatgttatttatgtaatttaatcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtggatatcattaaatccgcatccgta 31585024  T
Q  138 t-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| | |   |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |   |||||||||||||    
T  31585023 tccattaattagcgggtagttaaaaaacccatttattttatccatggatatccattaaggtatccgttccgtgtccatggcggattttat 31584934  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 11894467 - 11894675
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | | |||||  |||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  11894467 ataacaaataacactcacaatacataaggtttttttttaggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttactcggtttaatagtcggtatggat 11894566  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||| | ||||||||| ||    |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11894567 atccacgggtgtggataccgttaaatccgcatccatatccattaattagcaggtagttaaaaaattcatttattttatccattgatatccattaaggtat 11894666  T
Q  200 tcgctccgt 208  Q
     ||||||||    
T  11894667 ccgctccgt 11894675  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25293935 - 25293746
Alignment:
Q  38 taggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgta 137  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||| | |  |||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||    
T  25293935 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcaggtgcggatatccgcgggtgcggataccattaaatccgcatccgta 25293836  T
Q  138 tc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  25293835 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatctgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 25293746  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29677498 - 29677324
Alignment:
Q  30 tttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctg 129  Q
    ||||| |||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  29677498 ttttttcttaagaagttgaatgatattaaagttatttatgtaatttacctggtttaatagcgg-----gatatccgcgggtgtggataccattaaatccg 29677404  T
Q  130 cattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgt 208  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  29677403 catccgtatccattaatttgcgggtagttaaaaaatccatttattttatccatggatatccattaaggtatcagctccgt 29677324  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48378971 - 48378798
Alignment:
Q  36 cttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcg 135  Q
    ||||||||||||||   |||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||  |    
T  48378971 cttaggaagttgaatgatattgaggttattgatgtaacttactcagtttaatagagggtatggatgtccgcgggcgtgaatatcattaaatccgcatatg 48378872  T
Q  136 tatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgt 208  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  48378871 tatccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatggatattcattaagctatccgctccgt 48378798  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38264247 - 38264084
Alignment:
Q  4 actaataaca-ctcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatat 102  Q
    |||||||||| |||||| |||| | | |||||||||| ||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||    
T  38264247 actaataacaactcacattaccaaagttttttgcttaagaatttggatcgtattaaggttatttatgtaatttaattggtttaatagcgggtatagatat 38264148  T
Q  103 ccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatc 165  Q
    | |||| || | ||||||||||||   ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38264147 ctgcgggtgcggataccattaaattcacatccatatccattaattagcgggtagttaaaatatc 38264084  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 133
Target Start/End: Original strand, 33089058 - 33089127
Alignment:
Q  64 tttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcatt 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  33089058 tttatgtaatttactcgatttaatagcagatatgaatatccgctgatgtggataccattaaatctacatt 33089127  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17562676 - 17562610
Alignment:
Q  38 taggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatcc 104  Q
    ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17562676 taggaagttgaatgatattgatgttatttatgtaatttaatcggtttaatagcgggtatggatatcc 17562610  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 199
Target Start/End: Original strand, 52252886 - 52252978
Alignment:
Q  108 gatgtgaataccattaaatctgcattcgta-tcattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  52252886 gatgtgaataccatgatatctgcattcgtatttattaattagcatatagttgaaatatctatttattttatctatgaatatttattaaggtat 52252978  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 199
Target Start/End: Original strand, 25987659 - 25987754
Alignment:
Q  105 gcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||| |||| |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25987659 gcgggtgtggataccattaaatccacatttgtatccattaattagcgggtagttaaaaaattcatttattttatccatagatatccattaaggtat 25987754  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42507371 - 42507314
Alignment:
Q  169 ttattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  42507371 ttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtcagtggcagattttat 42507314  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36728617 - 36728560
Alignment:
Q  169 ttattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  36728617 ttattttatccatgtatgtccatgaagatatccgctccgtgtctgtggcggattttat 36728560  T

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Target: chr6 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10408835 - 10408638
Alignment:
Q  30 tttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctg 129  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||    
T  10408835 tttttgctttggaagttgaatggtattaacgttatttatgtaatttactcggtttaatagtgggtatggatatctgcggatgcggatgccaataaatctg 10408736  T
Q  130 cattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    |||  ||||| | || ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  10408735 catctgtatctactatttagcgggtagttgaaatatccgtttattttatccatgaatatccattaaggtatccgctccgtttccgtggcggattttat 10408638  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 641950 - 641744
Alignment:
Q  2 taactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggata 101  Q
    |||||| || ||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  641950 taactagtagcactcgcaataccgagggttttctcttaggaagttgaaagttattag-gttatttatgtaatttactcagtttaatagcggatatggata 641852  T
Q  102 tccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtatt 200  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  641851 tccgcggatgcggttaccattaaatcctcatatgtatccattaattagcggatagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccattaaaatatc 641752  T
Q  201 cgctccgt 208  Q
    ||||||||    
T  641751 cgctccgt 641744  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 226
Target Start/End: Original strand, 7622540 - 7622736
Alignment:
Q  31 ttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgc 130  Q
    |||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  7622540 tttttcttagaaagttgaatgatattaatgttatttacttaatttactcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatccgc 7622639  T
Q  131 attcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||    
T  7622640 atccgtatccattaattagcgggtaaataaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgcgtccgtggcggattttat 7622736  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35167207 - 35166983
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  35167207 ataactaataatactcataataccgacgatttttgcttaggaagttgaaagttaatag-gttacttatgtaatttactcagtttagtagcgggtatggat 35167109  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatca-ttaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||| ||   |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35167108 atccgcgg-tgcagataccattaaatccacatccgtatcaattaattagcgggtagttaaaatatccgtttattttatccatggatatctattaaggtat 35167010  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     ||||  || | ||||| |||||||||    
T  35167009 ccgctttgtgtctgtggtggattttat 35166983  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 28582372 - 28582580
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||    
T  28582372 ataactaataacactcacagtatcaacaatttttgcttaggaagttgaaaggtatcaaaattatttatgtaatttattttgtttaatagcgagtatggat 28582471  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||| | || |||| |||| |||||||| | ||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28582472 atctgagggtgtggatactattaaatccgtatttgtatccactaattaacgggtagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccatcaaggtat 28582571  T
Q  200 tcgctccgt 208  Q
     ||||||||    
T  28582572 ccgctccgt 28582580  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 8576946 - 8577127
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||   |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8576946 ataactgataacactcacaatacctaaggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttatataatttactcggtttaatagcgggtatggat 8577045  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccat 181  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| | ||||||| | | | |||||||||||||    
T  8577046 atccacgggtgtggataccattaaatctgcatctgtatccattaattaacggttggttaaaaaaaccgtttattttatccat 8577127  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 10788691 - 10788891
Alignment:
Q  8 ataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcg 107  Q
    |||||| |||||||||| | | | ||| ||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  10788691 ataacaatcacaatacctaaggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttagttggtttaatagcgaatatggatctcctcg 10788790  T
Q  108 gatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctcc 206  Q
    | |||| |||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10788791 ggtgtggatactattaaatccacatttgtatccattaattagcaggtagttaaaa-attcgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctcc 10788889  T
Q  207 gt 208  Q
    ||    
T  10788890 gt 10788891  T

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Target: chr2 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45151153 - 45150962
Alignment:
Q  8 ataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcg 107  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  45151153 ataacactcacaataccgaagtgtttt-ctaaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatctgtg 45151055  T
Q  108 gatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45151054 ggtgtggataccattaaatccgcatctgtatccattaattagcggatagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatctattaaggtat 45150962  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 5704805 - 5705031
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5704805 ataactaataacactcacaatacctagggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcagatatgaat 5704904  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||  |||| |||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  5704905 atttgcgggtgtggataccattaaatccacatccgtatccattaattagcggatagttaaaaaatccatttattttatccacggatatacattaaggtat 5705004  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     || |||||    ||||||||||||||    
T  5705005 ccgttccgtgcccgtggcggattttat 5705031  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 5110423 - 5110642
Alignment:
Q  8 ataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||| ||||| ||||||||   |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5110423 ataacactcacaatacctatcgtgttttcttagaaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttatttggtttaatagcgggtatggatatctgcg 5110522  T
Q  108 gatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctcc 206  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  5110523 ggtgtggataccattaaatccgcattcgtatccattaattagcgggtagttaaaaaattcatttattttatccatggatatccattaaggtatccgctct 5110622  T
Q  207 gtatttgtggcggattttat 226  Q
    || |  ||||| ||||||||    
T  5110623 gtgtccgtggcagattttat 5110642  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Original strand, 5938947 - 5939091
Alignment:
Q  63 atttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaa 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5938947 atttatgtaatatactcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtagataccattaaatccgcatttgtatccattaattagcgggtagttaaaa 5939046  T
Q  162 tatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctcc 206  Q
     |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5939047 aatccatttattatatccatgaatatccattaaggtattcgctcc 5939091  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13626228 - 13626031
Alignment:
Q  8 ataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcg 107  Q
    |||||||||| |||||| | | | ||| ||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13626228 ataacactcataatacctaaggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaacttatccggtttaatagagggtatggatattcgcg 13626129  T
Q  108 gatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgct 204  Q
    | |||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  13626128 ggtgtagataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatctgtttattttatccatagatatccattaaggtatccgct 13626031  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31575804 - 31575637
Alignment:
Q  60 gttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagtta 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31575804 gttatttatgtaatttacttggtttaatagcggatatggatatccgctggtgtggatacaattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagtta 31575705  T
Q  159 aaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     || ||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| || |  ||||||||||||||    
T  31575704 caaaattcgtttattttatccatgcatatccattaagatatccactctgtgtcagtggcggattttat 31575637  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 13807753 - 13807914
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||   |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13807753 ataactgataacactcacaatacctagggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttatataatttacttggtttaatagcgggtatggat 13807852  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaa 161  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  13807853 atccgcgggtgtggataccattaaatccacatccgtatccattaataagcgggtagttaaaa 13807914  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42622477 - 42622365
Alignment:
Q  115 ataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttg 213  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||| |  |    
T  42622477 ataccattaaatccgcatccgtattcattaattaacgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgttccgtgtccg 42622378  T
Q  214 tggcggattttat 226  Q
    || ||||||||||    
T  42622377 tgacggattttat 42622365  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 121
Target Start/End: Original strand, 42604571 - 42604636
Alignment:
Q  56 taatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccat 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||    
T  42604571 taatattatttatgtaatttacttagtttaatagcgaatacagatatccgcgggtgcgaataccat 42604636  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 45458409 - 45458345
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||  | || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  45458409 ataactaataacactcacaataccgaagtttttgacctacgaagttgaaaggtattaaggttatt 45458345  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Original strand, 14701446 - 14701572
Alignment:
Q  70 taatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctga 168  Q
    |||||||||  |||||||| ||| |||  |||||| ||  |||| ||||||| ||||| |||| |||||| || || |  ||||||||| |||| || |     
T  14701446 taatttacttagtttaataacgggtataaatatccacgagtgtggataccatcaaatccgcatccgtatccatcaaatcacggatagttgaaatgtccgt 14701545  T
Q  169 ttattttatccatgaatatccattaag 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14701546 ttattttatccatgaatatctattaag 14701572  T

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Target: chr5 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 3926402 - 3926628
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  3926402 ataactgataacactcacaatatctatggtgttttcttaggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcgattttatagcgggtatggat 3926501  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||| |  || ||||||| |||   ||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  3926502 atccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccacatccattaataagcatgtagttaaaaaatccgtttattttatccatagatatccattaagatat 3926601  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     ||||||||   |||||||||||||||    
T  3926602 ccgctccgtgcctgtggcggattttat 3926628  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42878872 - 42878674
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||| || ||||| || | | ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42878872 ataactaataacgctaacaatgcctaggtttttt-cttagaaagttgaatggtattaaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatggat 42878774  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  || || |||||| ||| | |||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  42878773 atccgcgggtgtggataccattaaatccgcattcatatccattaattaatgggtatttaaaaaatccgtttattttatctatggatattcattaaagtat 42878674  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39800330 - 39800141
Alignment:
Q  38 taggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgta 137  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||   ||||||||||||| |||| ||||    
T  39800330 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgcgggtgcagataccattaaatccgcatccgta 39800231  T
Q  138 tc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  39800230 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 39800141  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 210
Target Start/End: Original strand, 26621578 - 26621782
Alignment:
Q  8 ataacactcacaataccgatgatttttg-cttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgc 106  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  ||    
T  26621578 ataacactcacaataccgaggttttttttcttaggaagttgaaaggtattaaggttatttgtgtaatttactcgatttaatagtaggtatggatatatgc 26621677  T
Q  107 ggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctc 205  Q
    |||||   |||||||||||| |||||  || ||  |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  26621678 ggatggagataccattaaatatgcatctgtgtctgttaattagtgggtagttaaaatatttgtttattttatccatagacatccattaaggtatgcgctc 26621777  T
Q  206 cgtat 210  Q
     ||||    
T  26621778 tgtat 26621782  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Original strand, 42837777 - 42837942
Alignment:
Q  61 ttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||| |||||||||||| | || | ||||| ||| |||||||||||    
T  42837777 ttatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatagatatctgcgggtgtggatactattaaatctgca-tagtgtccattatttaacggatagttaa 42837875  T
Q  160 aatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    || ||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||||||    
T  42837876 aaaatccgtttattttatccatagatatccattaagatatccgctctgtgtctgtggcgggttttat 42837942  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 39886874 - 39887100
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | | || | |||||| ||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| || ||||    
T  39886874 ataactaataacacccacaatatcaaagcttatggcttagaaagataaaaagtattaatgttgtttgtgtaatttactctatataatagcgggtacggat 39886973  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    | |||||| |||  ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  39886974 acccgcgggtgtagataccatgaaatctgcatctgtatccattaattagcaggtagttgaaatattcgtttattttatccatgtatatccattaagatat 39887073  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     |  || || || ||||||||||||||    
T  39887074 ccattctgtgttcgtggcggattttat 39887100  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35188442 - 35188320
Alignment:
Q  105 gcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgc 203  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  35188442 gcgggtgtggataccactaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgc 35188343  T
Q  204 tccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    ||||| |  ||||||||||||||    
T  35188342 tccgtgtccgtggcggattttat 35188320  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Original strand, 40057173 - 40057285
Alignment:
Q  115 ataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttg 213  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |  |    
T  40057173 ataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatctatttattttatccgtagatatccattaaggtatccgctccgtgtccg 40057272  T
Q  214 tggcggattttat 226  Q
    |||||||||||||    
T  40057273 tggcggattttat 40057285  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39207039 - 39206829
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||   |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  39207039 ataactgataacactcacaatacctagggtgttttcttaggaagttgaatgatattgagattatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtgtggat 39206940  T
Q  101 atccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    |                |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39206939 a----------------ccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatcgatatccattaaggtat 39206856  T
Q  200 tcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     ||||| ||    ||||||||||||||    
T  39206855 ccgctctgtgcccgtggcggattttat 39206829  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 33742621 - 33742521
Alignment:
Q  1 ataactaataacactcacaataccgatgatttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | | ||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  33742621 ataactaataacacttacaatacctagggtgttttcttaggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttactctgtttaatagcgggtgtggat 33742522  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  33742521 a 33742521  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Original strand, 23429508 - 23429669
Alignment:
Q  60 gttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtatc-attaattagcggatagtta 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     ||  |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||  ||||||    
T  23429508 gttatttatgtaatttactcagtttaatagcgggtaa----at--gcgggtgtgaataccattaaatccgcatctgtatccattaattagcgagtagtta 23429601  T
Q  159 aaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    ||| ||| | |||| |||| |||| |||||||||||| ||| || ||||| |  || |||||||||||    
T  23429602 aaaaatccgtttatgttattcatggatatccattaagatatccgttccgtgtccgtagcggattttat 23429669  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Original strand, 2209793 - 2209917
Alignment:
Q  33 ttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcat 132  Q
    ||||||||||| |||||   |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  2209793 ttgcttaggaatttgaatgatattaaagttatttataaaatttactcgatttaatagcgg-gatagatatccccggatgcgggtaccattaaatctgcat 2209891  T
Q  133 tcgtat-cattaattagcggatagtt 157  Q
     ||||| |||||||||| || |||||    
T  2209892 ccgtatccattaattagtgggtagtt 2209917  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 35188471 - 35188439
Alignment:
Q  60 gttatttatgtaatttactcggtttaatagcgg 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35188471 gttatttatgtaatttactcggtttaatagcgg 35188439  T

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Target: scaffold0115 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 22219 - 22408
Alignment:
Q  38 taggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgta 137  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||| | |  |||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||    
T  22219 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcaggtgcggatatccgcgggtgcggataccattaaatccgcatccgta 22318  T
Q  138 tc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  22319 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 22408  T

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Target: scaffold0634 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9156 - 8967
Alignment:
Q  38 taggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgta 137  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||    
T  9156 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaataacgggtgcggatatccgcgggtgcggataccattaaatcagcatccgta 9057  T
Q  138 tc-attaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  9056 tccattaattaacgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 8967  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6809 - 6660
Alignment:
Q  60 gttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctgcattcgtat-cattaattagcggatagtta 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||  || ||||||    
T  6809 gttatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatgaatatccacgggtgtggataccattaaatccgcatctgtatccattaattaatggttagtta 6710  T
Q  159 aaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgt 208  Q
     || |||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||    
T  6709 gaaaatccatttattttatccatggatattcattaagatattcgttccgt 6660  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Original strand, 66777 - 66972
Alignment:
Q  30 tttttgcttaggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtgaataccattaaatctg 129  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||  || |||| |||||| ||| |  | |||||||||||| ||    
T  66777 tttttgcttaggaatttgaaaagtattaagggtatt-atgtaatttatttggtttaatactgg-tatgaatatccacgggtagggataccattaaatatg 66874  T
Q  130 cattcgtat-cattaattagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtattcgctccgtatttgtggcggattttat 226  Q
     || | ||| ||| |||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||    
T  66875 tatccatattcatcaattagagggtagataaaatatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtctgtgacagattttat 66972  T

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Target: scaffold1986 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 885
Alignment:
Q  146 tagcggatagttaaaatatctgattattttatccatgaatatccattaaggtat 199  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  938 tagcggataattgaaatatccgattattttatccatgaagattcattaaagtat 885  T

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